View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3388_low_11 (Length: 417)

Name: NF3388_low_11
Description: NF3388
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3388_low_11
NF3388_low_11
[»] chr5 (125 HSPs)
chr5 (11-417)||(18308249-18308655)
chr5 (13-417)||(1400114-1400518)
chr5 (11-417)||(4723886-4724292)
chr5 (11-417)||(35565261-35565666)
chr5 (11-417)||(36350137-36350523)
chr5 (92-417)||(1694859-1695185)
chr5 (11-299)||(7162-7447)
chr5 (11-409)||(8537943-8538339)
chr5 (18-409)||(30709594-30709983)
chr5 (11-409)||(11346698-11347094)
chr5 (11-299)||(8576074-8576359)
chr5 (11-264)||(6793351-6793604)
chr5 (11-299)||(19036607-19036892)
chr5 (11-299)||(27661310-27661595)
chr5 (11-299)||(28880980-28881265)
chr5 (11-409)||(3601330-3601728)
chr5 (13-409)||(1971356-1971752)
chr5 (14-409)||(38854150-38854542)
chr5 (11-293)||(541574-541853)
chr5 (11-409)||(19400352-19400750)
chr5 (14-293)||(11027769-11028045)
chr5 (13-230)||(33370645-33370862)
chr5 (12-227)||(40009518-40009733)
chr5 (11-185)||(3169593-3169766)
chr5 (13-196)||(35927470-35927653)
chr5 (14-413)||(17366547-17366950)
chr5 (137-409)||(7082336-7082608)
chr5 (168-417)||(12742818-12743081)
chr5 (13-190)||(2599210-2599387)
chr5 (237-417)||(33371169-33371349)
chr5 (238-417)||(10398006-10398185)
chr5 (168-417)||(12805636-12805899)
chr5 (243-394)||(36349987-36350141)
chr5 (14-127)||(3458828-3458941)
chr5 (155-299)||(22283704-22283845)
chr5 (247-394)||(25498398-25498547)
chr5 (331-417)||(33370938-33371024)
chr5 (23-100)||(1693382-1693459)
chr5 (215-311)||(7082793-7082889)
chr5 (243-394)||(35565662-35565816)
chr5 (232-293)||(1171725-1171786)
chr5 (243-394)||(1399967-1400118)
chr5 (167-267)||(18920879-18920975)
chr5 (243-394)||(1695181-1695335)
chr5 (11-65)||(7082281-7082335)
chr5 (243-367)||(18308679-18308804)
chr5 (167-275)||(17195316-17195421)
chr5 (172-409)||(3458940-3459177)
chr5 (349-411)||(12806168-12806230)
chr5 (354-417)||(6793288-6793351)
chr5 (247-293)||(4723682-4723728)
chr5 (13-111)||(12742706-12742804)
chr5 (349-411)||(12743349-12743411)
chr5 (249-364)||(4723742-4723859)
chr5 (247-319)||(25498635-25498707)
chr5 (123-267)||(25360549-25360690)
chr5 (13-106)||(12805524-12805617)
chr5 (249-293)||(34683533-34683577)
chr5 (243-394)||(34683587-34683742)
chr5 (247-319)||(35565824-35565896)
chr5 (237-293)||(40012157-40012213)
chr5 (246-299)||(1971853-1971908)
chr5 (246-299)||(3170021-3170076)
chr5 (243-364)||(6793138-6793261)
chr5 (167-267)||(36311911-36312007)
chr5 (246-299)||(40012104-40012159)
chr5 (237-319)||(1971906-1971988)
chr5 (237-319)||(28881529-28881611)
chr5 (238-319)||(22284110-22284191)
chr5 (237-293)||(6841-6897)
chr5 (237-293)||(3459331-3459387)
chr5 (237-293)||(19400904-19400960)
chr5 (373-417)||(25498719-25498763)
chr5 (246-299)||(3601829-3601884)
chr5 (246-299)||(19400851-19400906)
chr5 (247-293)||(1399913-1399959)
chr5 (379-417)||(1972006-1972044)
chr5 (343-405)||(3169857-3169918)
chr5 (379-417)||(6793002-6793040)
chr5 (247-293)||(6793084-6793130)
chr5 (237-319)||(8538492-8538574)
chr5 (237-319)||(8575727-8575809)
chr5 (167-267)||(13131044-13131140)
chr5 (237-319)||(30710136-30710218)
chr5 (243-394)||(33371345-33371499)
chr5 (343-409)||(40011939-40012004)
chr5 (246-301)||(40011838-40011895)
chr5 (373-417)||(1171824-1171868)
chr5 (343-407)||(8575966-8576029)
chr5 (237-297)||(19036282-19036342)
chr5 (343-407)||(27661202-27661265)
chr5 (373-417)||(35565908-35565952)
chr5 (238-319)||(7082982-7083065)
chr5 (250-293)||(18308815-18308858)
chr5 (237-319)||(38854695-38854778)
chr5 (379-417)||(6759-6797)
chr5 (247-293)||(1695343-1695389)
chr5 (379-417)||(8575671-8575709)
chr5 (247-293)||(11347260-11347306)
chr5 (341-394)||(12743077-12743131)
chr5 (341-394)||(12805895-12805949)
chr5 (344-393)||(12806232-12806282)
chr5 (379-417)||(19401004-19401042)
chr5 (243-315)||(20196549-20196623)
chr5 (379-417)||(20196721-20196759)
chr5 (379-417)||(27660907-27660945)
chr5 (237-319)||(27660963-27661045)
chr5 (379-417)||(28881629-28881667)
chr5 (379-417)||(38854796-38854834)
chr5 (379-417)||(40012257-40012295)
chr5 (380-417)||(11347351-11347388)
chr5 (380-417)||(22284210-22284247)
chr5 (343-407)||(7054-7117)
chr5 (373-417)||(1399831-1399875)
chr5 (245-312)||(1972080-1972148)
chr5 (237-293)||(3601882-3601938)
chr5 (381-417)||(4723600-4723636)
chr5 (243-293)||(7082714-7082766)
chr5 (373-413)||(7082909-7082949)
chr5 (373-417)||(18308896-18308940)
chr5 (343-407)||(19036499-19036562)
chr5 (343-407)||(22283890-22283953)
chr5 (343-407)||(28881310-28881373)
chr5 (237-299)||(34683338-34683402)
chr5 (239-267)||(40012378-40012406)
[»] chr2 (118 HSPs)
chr2 (11-417)||(35491629-35492035)
chr2 (11-417)||(10364443-10364849)
chr2 (11-415)||(41498902-41499306)
chr2 (11-415)||(19471442-19471846)
chr2 (13-417)||(37312301-37312705)
chr2 (11-417)||(2919171-2919577)
chr2 (13-414)||(27130318-27130719)
chr2 (11-417)||(6976832-6977236)
chr2 (11-384)||(34521522-34521896)
chr2 (71-417)||(40677181-40677527)
chr2 (14-417)||(33404012-33404411)
chr2 (167-414)||(43491600-43491847)
chr2 (14-299)||(29067726-29068008)
chr2 (16-409)||(10360014-10360406)
chr2 (14-300)||(29111155-29111438)
chr2 (11-299)||(3936991-3937276)
chr2 (11-299)||(43982850-43983135)
chr2 (12-299)||(17424784-17425068)
chr2 (11-409)||(42240913-42241311)
chr2 (11-409)||(16581816-16582216)
chr2 (13-293)||(5420465-5420742)
chr2 (11-409)||(12968116-12968514)
chr2 (13-300)||(17796033-17796314)
chr2 (11-299)||(22001828-22002113)
chr2 (11-290)||(3941731-3942007)
chr2 (13-417)||(6901962-6902378)
chr2 (11-301)||(22493265-22493554)
chr2 (11-227)||(39393885-39394101)
chr2 (19-300)||(42120014-42120294)
chr2 (19-409)||(29906584-29906974)
chr2 (11-409)||(32734641-32735039)
chr2 (14-170)||(39799895-39800051)
chr2 (13-230)||(20148114-20148331)
chr2 (16-159)||(18392032-18392179)
chr2 (11-145)||(34638960-34639093)
chr2 (167-417)||(16253605-16253852)
chr2 (123-263)||(27650391-27650527)
chr2 (243-364)||(43491877-43492000)
chr2 (243-367)||(10364293-10364419)
chr2 (243-394)||(35492031-35492184)
chr2 (154-409)||(18393486-18393742)
chr2 (250-367)||(19471297-19471416)
chr2 (331-417)||(20148444-20148529)
chr2 (15-135)||(16253474-16253594)
chr2 (249-367)||(40677037-40677157)
chr2 (167-267)||(31991896-31991992)
chr2 (351-417)||(29111468-29111534)
chr2 (243-367)||(41498750-41498876)
chr2 (11-75)||(40678763-40678827)
chr2 (243-394)||(6977232-6977386)
chr2 (243-394)||(37312151-37312305)
chr2 (167-265)||(15891609-15891703)
chr2 (268-394)||(2919047-2919175)
chr2 (14-81)||(31770360-31770427)
chr2 (247-293)||(6977394-6977440)
chr2 (167-267)||(18036122-18036218)
chr2 (343-409)||(42120339-42120404)
chr2 (248-293)||(2918972-2919017)
chr2 (246-409)||(39799685-39799849)
chr2 (237-363)||(33404439-33404567)
chr2 (243-361)||(34521402-34521520)
chr2 (332-394)||(6902374-6902437)
chr2 (246-299)||(10359858-10359913)
chr2 (335-409)||(22493590-22493663)
chr2 (247-293)||(34521348-34521394)
chr2 (247-293)||(41498696-41498742)
chr2 (257-293)||(17538550-17538586)
chr2 (246-297)||(22493767-22493819)
chr2 (246-299)||(16582316-16582371)
chr2 (246-299)||(18393842-18393897)
chr2 (246-299)||(42120505-42120560)
chr2 (237-292)||(42120558-42120613)
chr2 (237-319)||(18393895-18393977)
chr2 (247-293)||(19471231-19471277)
chr2 (215-269)||(42240815-42240869)
chr2 (11-56)||(26617652-26617697)
chr2 (331-394)||(16253848-16253912)
chr2 (120-172)||(17112399-17112451)
chr2 (373-417)||(19471149-19471193)
chr2 (237-293)||(22493817-22493873)
chr2 (343-407)||(29068053-29068116)
chr2 (237-293)||(29073588-29073644)
chr2 (342-398)||(29111807-29111863)
chr2 (246-299)||(8557385-8557440)
chr2 (237-319)||(17425333-17425415)
chr2 (379-417)||(17425433-17425471)
chr2 (341-394)||(20148525-20148579)
chr2 (379-417)||(22002478-22002516)
chr2 (379-417)||(22493917-22493955)
chr2 (379-417)||(28476149-28476187)
chr2 (379-417)||(29073688-29073726)
chr2 (345-394)||(29111530-29111580)
chr2 (247-293)||(35492192-35492238)
chr2 (247-293)||(37312097-37312143)
chr2 (379-417)||(39799394-39799432)
chr2 (237-319)||(39799450-39799532)
chr2 (247-293)||(40676977-40677023)
chr2 (379-417)||(41498614-41498652)
chr2 (379-417)||(42120658-42120696)
chr2 (247-293)||(43492008-43492054)
chr2 (379-417)||(43492098-43492136)
chr2 (379-416)||(3942054-3942091)
chr2 (239-294)||(8557138-8557195)
chr2 (380-417)||(16582470-16582507)
chr2 (381-417)||(2918893-2918929)
chr2 (343-407)||(3936883-3936946)
chr2 (381-417)||(5420788-5420824)
chr2 (381-417)||(6977486-6977522)
chr2 (237-293)||(10359804-10359860)
chr2 (237-293)||(16582369-16582425)
chr2 (343-407)||(17425113-17425176)
chr2 (343-395)||(22002158-22002209)
chr2 (237-293)||(22002378-22002434)
chr2 (237-299)||(24108209-24108273)
chr2 (373-417)||(32736726-32736770)
chr2 (239-267)||(32736853-32736881)
chr2 (239-267)||(42120779-42120807)
chr2 (343-407)||(43983180-43983243)
[»] chr1 (175 HSPs)
chr1 (11-417)||(13972914-13973320)
chr1 (11-417)||(14173568-14173974)
chr1 (11-417)||(38046244-38046650)
chr1 (12-417)||(36909552-36909957)
chr1 (11-415)||(6435762-6436166)
chr1 (11-417)||(35586742-35587145)
chr1 (11-417)||(49926190-49926595)
chr1 (14-417)||(23342634-23343037)
chr1 (11-417)||(24270175-24270579)
chr1 (11-417)||(41780683-41781089)
chr1 (14-364)||(49396697-49397047)
chr1 (11-417)||(17686168-17686577)
chr1 (14-417)||(35184963-35185367)
chr1 (51-417)||(37778109-37778475)
chr1 (13-417)||(13283697-13284097)
chr1 (11-409)||(18170015-18170413)
chr1 (11-409)||(12791092-12791489)
chr1 (11-417)||(17372717-17373120)
chr1 (23-409)||(3658475-3658860)
chr1 (13-417)||(35526007-35526391)
chr1 (137-417)||(40533096-40533376)
chr1 (11-400)||(17697036-17697422)
chr1 (11-409)||(49427377-49427773)
chr1 (11-409)||(42571594-42571992)
chr1 (13-301)||(35576331-35576618)
chr1 (14-300)||(21484573-21484856)
chr1 (11-299)||(19160307-19160592)
chr1 (24-417)||(24363623-24364003)
chr1 (14-409)||(13635117-13635510)
chr1 (11-406)||(39224018-39224413)
chr1 (13-319)||(39856817-39857120)
chr1 (12-410)||(29762039-29762436)
chr1 (14-227)||(48215191-48215404)
chr1 (13-417)||(18842431-18842849)
chr1 (11-409)||(51269792-51270189)
chr1 (11-409)||(27486509-27486906)
chr1 (11-409)||(44597691-44598088)
chr1 (11-409)||(27035136-27035534)
chr1 (11-409)||(44337138-44337535)
chr1 (13-417)||(5765198-5765597)
chr1 (11-227)||(29435963-29436179)
chr1 (14-409)||(45689114-45689507)
chr1 (19-409)||(47487855-47488245)
chr1 (13-301)||(49262915-49263202)
chr1 (14-298)||(48568334-48568617)
chr1 (43-409)||(46180098-46180465)
chr1 (14-301)||(41874811-41875097)
chr1 (14-405)||(30309654-30310039)
chr1 (11-301)||(50068186-50068475)
chr1 (11-181)||(49598921-49599090)
chr1 (34-417)||(16081298-16081679)
chr1 (13-417)||(16531904-16532304)
chr1 (147-410)||(29707355-29707621)
chr1 (243-394)||(37778471-37778625)
chr1 (253-417)||(16097898-16098063)
chr1 (243-394)||(35525857-35526011)
chr1 (240-367)||(49926038-49926166)
chr1 (243-394)||(14173418-14173572)
chr1 (243-394)||(24270025-24270179)
chr1 (243-394)||(36909953-36910106)
chr1 (67-152)||(13148365-13148450)
chr1 (243-394)||(24363472-24363627)
chr1 (243-363)||(13973348-13973470)
chr1 (243-394)||(35185363-35185517)
chr1 (13-81)||(16098078-16098146)
chr1 (243-384)||(35586592-35586736)
chr1 (194-299)||(22527680-22527782)
chr1 (266-367)||(41781113-41781215)
chr1 (232-293)||(18170606-18170667)
chr1 (243-384)||(6436174-6436318)
chr1 (243-394)||(23343033-23343186)
chr1 (232-293)||(18170765-18170826)
chr1 (243-364)||(40532946-40533069)
chr1 (343-409)||(48226860-48226925)
chr1 (247-293)||(49397198-49397244)
chr1 (343-409)||(49598709-49598774)
chr1 (237-394)||(13284093-13284253)
chr1 (315-394)||(49397049-49397129)
chr1 (250-293)||(13973481-13973524)
chr1 (246-299)||(47487699-47487754)
chr1 (246-299)||(51270289-51270344)
chr1 (165-264)||(14772499-14772594)
chr1 (247-293)||(23343194-23343240)
chr1 (343-409)||(29436295-29436360)
chr1 (247-293)||(35586525-35586571)
chr1 (247-293)||(38044798-38044844)
chr1 (247-293)||(42571382-42571428)
chr1 (237-319)||(50067841-50067923)
chr1 (240-394)||(17686015-17686172)
chr1 (249-299)||(3658961-3659013)
chr1 (247-319)||(12790853-12790925)
chr1 (123-211)||(19262429-19262517)
chr1 (341-417)||(21484263-21484339)
chr1 (246-299)||(29707201-29707256)
chr1 (238-293)||(46179888-46179943)
chr1 (246-299)||(49262659-49262714)
chr1 (246-299)||(50067921-50067976)
chr1 (341-394)||(5765593-5765647)
chr1 (247-293)||(6436326-6436372)
chr1 (237-319)||(13634881-13634963)
chr1 (341-394)||(21484213-21484267)
chr1 (237-319)||(29436513-29436595)
chr1 (247-293)||(36910114-36910160)
chr1 (247-293)||(40532892-40532938)
chr1 (343-409)||(41874703-41874767)
chr1 (237-319)||(47487619-47487701)
chr1 (379-417)||(49262523-49262561)
chr1 (331-388)||(14772337-14772394)
chr1 (250-319)||(24269945-24270014)
chr1 (236-293)||(48227077-48227134)
chr1 (238-319)||(49427927-49428008)
chr1 (373-417)||(17685883-17685927)
chr1 (247-319)||(17685939-17686010)
chr1 (343-407)||(19160637-19160700)
chr1 (237-293)||(29761757-29761813)
chr1 (373-417)||(36910198-36910242)
chr1 (243-297)||(38044852-38044908)
chr1 (307-394)||(38046160-38046248)
chr1 (373-417)||(39223708-39223752)
chr1 (237-293)||(45689661-45689717)
chr1 (237-293)||(48568014-48568070)
chr1 (238-363)||(17373148-17373275)
chr1 (370-417)||(18170861-18170908)
chr1 (246-299)||(30309495-30309550)
chr1 (250-293)||(35185540-35185583)
chr1 (243-293)||(41781216-41781267)
chr1 (246-299)||(45689608-45689663)
chr1 (379-417)||(13634825-13634863)
chr1 (379-417)||(13973568-13973606)
chr1 (247-293)||(14173364-14173410)
chr1 (13-71)||(15471510-15471568)
chr1 (341-394)||(16531854-16531908)
chr1 (243-299)||(18170514-18170572)
chr1 (243-299)||(18170673-18170731)
chr1 (379-417)||(19160957-19160995)
chr1 (379-417)||(24269889-24269927)
chr1 (237-267)||(27034786-27034816)
chr1 (379-417)||(29436613-29436651)
chr1 (379-417)||(29761675-29761713)
chr1 (255-293)||(35525803-35525841)
chr1 (379-417)||(39856761-39856799)
chr1 (379-417)||(41874416-41874454)
chr1 (379-417)||(46179809-46179847)
chr1 (379-417)||(46924800-46924838)
chr1 (379-417)||(47487563-47487601)
chr1 (379-417)||(48567932-48567970)
chr1 (13-55)||(48707090-48707132)
chr1 (245-297)||(49397134-49397188)
chr1 (379-417)||(49428026-49428064)
chr1 (237-291)||(49598498-49598552)
chr1 (379-417)||(50067785-50067823)
chr1 (343-409)||(50068077-50068142)
chr1 (237-319)||(51270342-51270424)
chr1 (379-417)||(51270442-51270480)
chr1 (239-279)||(3659308-3659349)
chr1 (237-286)||(27034933-27034982)
chr1 (379-416)||(29707066-29707103)
chr1 (13-81)||(14772687-14772755)
chr1 (237-299)||(17685770-17685834)
chr1 (241-299)||(17697508-17697568)
chr1 (237-293)||(19160857-19160913)
chr1 (343-407)||(22527827-22527890)
chr1 (237-293)||(22528047-22528103)
chr1 (246-299)||(27034980-27035036)
chr1 (237-293)||(29707147-29707203)
chr1 (331-363)||(31451845-31451877)
chr1 (381-417)||(38044716-38044752)
chr1 (239-267)||(39223614-39223642)
chr1 (373-417)||(41781305-41781349)
chr1 (249-299)||(42571442-42571494)
chr1 (381-417)||(45689762-45689798)
chr1 (249-299)||(46179945-46179997)
chr1 (239-267)||(46924689-46924717)
chr1 (237-293)||(49262605-49262661)
chr1 (373-417)||(49598414-49598458)
[»] chr3 (191 HSPs)
chr3 (11-417)||(51013087-51013493)
chr3 (11-417)||(55206693-55207099)
chr3 (11-417)||(2428491-2428897)
chr3 (11-417)||(41803906-41804312)
chr3 (19-417)||(41577918-41578315)
chr3 (11-417)||(46414143-46414549)
chr3 (14-417)||(34471885-34472288)
chr3 (11-417)||(30192542-30192948)
chr3 (14-414)||(51015284-51015684)
chr3 (14-417)||(7246101-7246504)
chr3 (11-417)||(43569914-43570320)
chr3 (11-417)||(52569218-52569623)
chr3 (14-417)||(45100274-45100677)
chr3 (13-417)||(34647076-34647480)
chr3 (106-417)||(46346421-46346732)
chr3 (11-417)||(14631449-14631855)
chr3 (12-417)||(49273404-49273809)
chr3 (13-417)||(7954209-7954614)
chr3 (50-417)||(42323199-42323565)
chr3 (14-409)||(37281459-37281854)
chr3 (14-409)||(36721206-36721601)
chr3 (14-417)||(33448964-33449351)
chr3 (12-409)||(13895687-13896084)
chr3 (13-417)||(8633174-8633572)
chr3 (13-417)||(6754210-6754612)
chr3 (13-409)||(44927469-44927865)
chr3 (11-393)||(50458541-50458906)
chr3 (13-409)||(34693107-34693503)
chr3 (14-409)||(24702089-24702483)
chr3 (14-299)||(2268424-2268706)
chr3 (11-292)||(3494966-3495244)
chr3 (11-299)||(2646806-2647091)
chr3 (12-299)||(36135013-36135296)
chr3 (11-409)||(19453046-19453444)
chr3 (11-299)||(4004017-4004302)
chr3 (15-415)||(6464158-6464556)
chr3 (12-265)||(10053236-10053485)
chr3 (11-299)||(49139984-49140269)
chr3 (11-299)||(54390446-54390731)
chr3 (11-299)||(34049731-34050016)
chr3 (11-299)||(46403007-46403292)
chr3 (11-409)||(42949837-42950235)
chr3 (11-238)||(47759879-47760106)
chr3 (14-409)||(39416764-39417160)
chr3 (11-409)||(25576409-25576806)
chr3 (12-409)||(49218554-49218950)
chr3 (11-409)||(43477061-43477458)
chr3 (11-406)||(47065691-47066086)
chr3 (14-409)||(48087369-48087764)
chr3 (11-409)||(42383055-42383453)
chr3 (11-293)||(49610493-49610772)
chr3 (13-406)||(774162-774551)
chr3 (72-299)||(50997453-50997677)
chr3 (12-409)||(44835304-44835701)
chr3 (11-227)||(51695605-51695821)
chr3 (11-301)||(53826622-53826911)
chr3 (18-417)||(20375694-20376090)
chr3 (11-227)||(42382275-42382491)
chr3 (11-237)||(27186952-27187178)
chr3 (237-417)||(27187543-27187723)
chr3 (135-417)||(18440873-18441152)
chr3 (135-417)||(19485947-19486226)
chr3 (40-417)||(25887420-25887796)
chr3 (11-267)||(14265412-14265661)
chr3 (243-367)||(2428921-2429047)
chr3 (243-394)||(14631851-14632005)
chr3 (243-364)||(7246531-7246654)
chr3 (243-364)||(49273840-49273963)
chr3 (215-293)||(37282040-37282118)
chr3 (243-367)||(41578339-41578465)
chr3 (235-333)||(55268753-55268851)
chr3 (243-394)||(34471735-34471889)
chr3 (243-362)||(41804341-41804462)
chr3 (215-319)||(36720916-36721020)
chr3 (242-394)||(8633023-8633178)
chr3 (243-391)||(51015686-51015837)
chr3 (331-417)||(7954976-7955062)
chr3 (14-96)||(15637031-15637113)
chr3 (243-394)||(42323049-42323203)
chr3 (243-367)||(52569068-52569194)
chr3 (13-64)||(11378906-11378957)
chr3 (171-417)||(15637155-15637398)
chr3 (243-394)||(10053045-10053199)
chr3 (243-394)||(34646926-34647080)
chr3 (243-367)||(46346271-46346397)
chr3 (332-417)||(8632850-8632935)
chr3 (237-394)||(27187719-27187879)
chr3 (243-364)||(55206543-55206666)
chr3 (243-367)||(30192972-30193098)
chr3 (243-394)||(46413993-46414147)
chr3 (215-319)||(34646794-34646899)
chr3 (12-61)||(46346745-46346794)
chr3 (11-54)||(42328288-42328331)
chr3 (247-293)||(43570478-43570524)
chr3 (247-293)||(45100080-45100126)
chr3 (247-312)||(51015845-51015910)
chr3 (255-361)||(43570350-43570458)
chr3 (247-319)||(46413900-46413972)
chr3 (246-299)||(13895532-13895587)
chr3 (254-293)||(14632020-14632059)
chr3 (246-299)||(24701934-24701989)
chr3 (247-293)||(10052991-10053037)
chr3 (243-299)||(19452806-19452864)
chr3 (247-293)||(46346217-46346263)
chr3 (247-293)||(49273971-49274017)
chr3 (246-297)||(44927967-44928020)
chr3 (248-368)||(51012951-51013065)
chr3 (237-293)||(34692898-34692954)
chr3 (237-293)||(39416555-39416611)
chr3 (237-293)||(42383606-42383662)
chr3 (311-367)||(45100194-45100250)
chr3 (240-390)||(6464002-6464156)
chr3 (240-394)||(6754608-6754766)
chr3 (246-299)||(11378639-11378694)
chr3 (246-299)||(25576253-25576308)
chr3 (331-394)||(25887361-25887424)
chr3 (246-299)||(44835149-44835204)
chr3 (247-293)||(2429055-2429101)
chr3 (237-319)||(3494612-3494694)
chr3 (282-394)||(7954610-7954723)
chr3 (255-293)||(34471681-34471719)
chr3 (243-299)||(37281955-37282013)
chr3 (247-293)||(42322995-42323041)
chr3 (237-319)||(47066241-47066323)
chr3 (379-417)||(49274061-49274099)
chr3 (247-293)||(52569014-52569060)
chr3 (247-292)||(30193106-30193151)
chr3 (244-394)||(33448815-33448968)
chr3 (380-417)||(34471599-34471636)
chr3 (237-293)||(2268103-2268159)
chr3 (343-407)||(2646698-2646761)
chr3 (237-293)||(4003696-4003752)
chr3 (343-407)||(4003909-4003972)
chr3 (237-293)||(11378585-11378641)
chr3 (342-394)||(15637394-15637446)
chr3 (237-293)||(25576199-25576255)
chr3 (373-417)||(42383700-42383744)
chr3 (237-293)||(43477593-43477649)
chr3 (373-417)||(45099998-45100042)
chr3 (382-417)||(10053195-10053230)
chr3 (246-299)||(34692952-34693007)
chr3 (250-293)||(41578476-41578519)
chr3 (379-417)||(2268021-2268059)
chr3 (379-417)||(2646403-2646441)
chr3 (237-319)||(2646459-2646541)
chr3 (255-293)||(7246670-7246708)
chr3 (379-417)||(11378503-11378541)
chr3 (379-417)||(13895409-13895447)
chr3 (379-417)||(14632103-14632141)
chr3 (341-394)||(18441148-18441202)
chr3 (379-417)||(19452670-19452708)
chr3 (341-394)||(19486222-19486276)
chr3 (379-417)||(24701798-24701836)
chr3 (237-319)||(34050281-34050363)
chr3 (379-417)||(34050381-34050419)
chr3 (379-417)||(34692816-34692854)
chr3 (379-417)||(39416473-39416511)
chr3 (379-417)||(44835013-44835051)
chr3 (237-291)||(44835097-44835151)
chr3 (237-319)||(44928018-44928100)
chr3 (237-319)||(46403557-46403639)
chr3 (379-417)||(46403657-46403695)
chr3 (379-417)||(49139581-49139619)
chr3 (237-319)||(49139637-49139719)
chr3 (379-417)||(49218262-49218300)
chr3 (379-417)||(49610816-49610854)
chr3 (255-289)||(51012896-51012930)
chr3 (379-417)||(51695460-51695498)
chr3 (379-417)||(52568936-52568974)
chr3 (237-319)||(54390996-54391078)
chr3 (379-417)||(54391096-54391134)
chr3 (247-293)||(55206489-55206535)
chr3 (379-417)||(55268584-55268622)
chr3 (379-416)||(2429145-2429182)
chr3 (380-417)||(36720860-36720897)
chr3 (239-294)||(44834902-44834959)
chr3 (247-299)||(55268660-55268713)
chr3 (343-407)||(2268316-2268379)
chr3 (343-407)||(3494851-3494914)
chr3 (379-415)||(4003616-4003652)
chr3 (237-293)||(24701880-24701936)
chr3 (343-407)||(34050061-34050124)
chr3 (373-417)||(34646738-34646782)
chr3 (239-267)||(42949656-42949684)
chr3 (243-297)||(45100134-45100190)
chr3 (343-407)||(46403337-46403400)
chr3 (246-297)||(47066191-47066243)
chr3 (239-267)||(47066462-47066490)
chr3 (343-407)||(49139876-49139939)
chr3 (343-407)||(50997722-50997785)
chr3 (343-407)||(54390776-54390839)
[»] chr7 (116 HSPs)
chr7 (11-417)||(48270640-48271046)
chr7 (11-417)||(43350909-43351314)
chr7 (12-416)||(41048776-41049180)
chr7 (11-417)||(21187108-21187514)
chr7 (11-417)||(46862003-46862409)
chr7 (11-417)||(48314989-48315395)
chr7 (14-417)||(36393634-36394036)
chr7 (29-417)||(30354624-30355012)
chr7 (11-417)||(42735255-42735660)
chr7 (11-417)||(28114202-28114608)
chr7 (11-417)||(15337714-15338120)
chr7 (13-417)||(21650518-21650921)
chr7 (14-409)||(30360512-30360905)
chr7 (13-289)||(21614700-21614973)
chr7 (11-409)||(39477057-39477455)
chr7 (11-399)||(17839315-17839702)
chr7 (11-409)||(18237556-18237954)
chr7 (11-299)||(20564751-20565036)
chr7 (12-409)||(40588542-40588938)
chr7 (13-417)||(1642401-1642800)
chr7 (12-409)||(2356282-2356676)
chr7 (12-301)||(17183205-17183496)
chr7 (12-409)||(34140858-34141254)
chr7 (12-299)||(10523061-10523346)
chr7 (11-319)||(20378613-20378918)
chr7 (11-300)||(47268891-47269178)
chr7 (19-409)||(48220561-48220949)
chr7 (14-188)||(28979060-28979234)
chr7 (14-409)||(41217609-41218003)
chr7 (11-409)||(45363070-45363458)
chr7 (103-299)||(9367050-9367243)
chr7 (11-165)||(26603266-26603420)
chr7 (112-300)||(2205964-2206151)
chr7 (252-417)||(20877861-20878026)
chr7 (244-417)||(21614269-21614442)
chr7 (167-409)||(26601596-26601837)
chr7 (144-299)||(13920431-13920583)
chr7 (11-135)||(13916825-13916949)
chr7 (243-394)||(46861853-46862007)
chr7 (245-394)||(21186960-21187112)
chr7 (11-115)||(42682948-42683052)
chr7 (243-364)||(21650948-21651071)
chr7 (345-417)||(21614594-21614666)
chr7 (155-293)||(17320137-17320272)
chr7 (243-394)||(28114052-28114206)
chr7 (243-367)||(48271070-48271196)
chr7 (248-367)||(36393489-36393610)
chr7 (237-362)||(21614113-21614240)
chr7 (123-230)||(28066359-28066466)
chr7 (243-364)||(30354474-30354597)
chr7 (243-394)||(20877711-20877865)
chr7 (185-277)||(34139332-34139421)
chr7 (243-394)||(15337564-15337718)
chr7 (343-409)||(34157130-34157195)
chr7 (247-293)||(36393430-36393476)
chr7 (173-267)||(3380637-3380727)
chr7 (123-263)||(150192-150328)
chr7 (243-320)||(10224536-10224615)
chr7 (246-299)||(17183706-17183761)
chr7 (130-237)||(18149638-18149745)
chr7 (167-237)||(11824841-11824911)
chr7 (335-409)||(17183532-17183605)
chr7 (237-319)||(39476823-39476905)
chr7 (237-293)||(26601386-26601442)
chr7 (237-293)||(48220352-48220408)
chr7 (238-319)||(17183926-17184009)
chr7 (246-299)||(18238055-18238110)
chr7 (250-293)||(21186904-21186947)
chr7 (250-293)||(46861799-46861842)
chr7 (247-289)||(10224623-10224665)
chr7 (237-319)||(13920848-13920930)
chr7 (237-319)||(20565301-20565383)
chr7 (341-394)||(21614544-21614598)
chr7 (247-293)||(28113998-28114044)
chr7 (14-63)||(8726381-8726430)
chr7 (373-417)||(10224707-10224751)
chr7 (343-407)||(13920628-13920691)
chr7 (237-293)||(17839852-17839908)
chr7 (241-299)||(21614442-21614502)
chr7 (373-417)||(26601304-26601348)
chr7 (237-293)||(34157347-34157403)
chr7 (237-293)||(41218156-41218212)
chr7 (252-327)||(21651111-21651186)
chr7 (246-299)||(26601440-26601495)
chr7 (246-299)||(28978980-28979035)
chr7 (238-293)||(34141409-34141464)
chr7 (246-299)||(48220406-48220461)
chr7 (379-417)||(9366646-9366684)
chr7 (379-417)||(13920948-13920986)
chr7 (379-417)||(18238208-18238246)
chr7 (379-417)||(20378557-20378595)
chr7 (247-293)||(20877657-20877703)
chr7 (379-417)||(21186822-21186860)
chr7 (379-417)||(28978729-28978767)
chr7 (379-417)||(30354338-30354376)
chr7 (379-417)||(30361159-30361197)
chr7 (239-299)||(30361246-30361308)
chr7 (379-417)||(34141508-34141546)
chr7 (247-277)||(34157032-34157062)
chr7 (379-417)||(39476767-39476805)
chr7 (379-417)||(45362779-45362817)
chr7 (237-311)||(45362843-45362917)
chr7 (379-417)||(48220270-48220308)
chr7 (379-417)||(48271294-48271332)
chr7 (379-416)||(17839952-17839989)
chr7 (247-292)||(30354421-30354466)
chr7 (239-294)||(39476656-39476713)
chr7 (12-52)||(3924805-3924845)
chr7 (343-407)||(9366942-9367005)
chr7 (237-293)||(10523611-10523667)
chr7 (237-293)||(17183759-17183815)
chr7 (237-293)||(18238108-18238164)
chr7 (343-407)||(20565081-20565144)
chr7 (239-267)||(26500410-26500438)
chr7 (239-267)||(26592275-26592303)
chr7 (381-417)||(42683058-42683094)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (11-417)||(13402527-13402933)
chr6 (11-417)||(32027437-32027843)
chr6 (11-417)||(12396770-12397176)
chr6 (11-417)||(32037496-32037902)
chr6 (11-417)||(34802705-34803111)
chr6 (76-417)||(30257388-30257729)
chr6 (11-417)||(801160-801564)
chr6 (179-417)||(35021046-35021284)
chr6 (11-299)||(27640174-27640459)
chr6 (12-299)||(11692446-11692730)
chr6 (13-297)||(14115033-14115313)
chr6 (11-299)||(6205478-6205763)
chr6 (11-409)||(29066547-29066944)
chr6 (11-408)||(29075560-29075956)
chr6 (11-408)||(29110531-29110928)
chr6 (11-409)||(29108134-29108531)
chr6 (29-409)||(35058552-35058932)
chr6 (14-201)||(22305793-22305980)
chr6 (233-417)||(4495119-4495304)
chr6 (155-299)||(24021027-24021168)
chr6 (320-417)||(14122904-14123001)
chr6 (155-293)||(2192535-2192670)
chr6 (243-367)||(12397200-12397326)
chr6 (243-367)||(13403239-13403365)
chr6 (147-301)||(3765713-3765867)
chr6 (341-417)||(23911074-23911150)
chr6 (243-364)||(35020896-35021019)
chr6 (233-394)||(30257228-30257392)
chr6 (215-293)||(30257133-30257211)
chr6 (268-367)||(13402957-13403057)
chr6 (268-367)||(13403098-13403198)
chr6 (243-394)||(32027287-32027441)
chr6 (243-394)||(32037346-32037500)
chr6 (246-394)||(14122997-14123148)
chr6 (146-267)||(17465298-17465415)
chr6 (165-299)||(34134799-34134931)
chr6 (243-394)||(4495300-4495453)
chr6 (237-294)||(14123421-14123479)
chr6 (243-300)||(801654-801713)
chr6 (237-319)||(6206028-6206110)
chr6 (255-293)||(32027233-32027271)
chr6 (255-293)||(32037292-32037330)
chr6 (343-407)||(2192721-2192784)
chr6 (373-417)||(7821227-7821271)
chr6 (331-394)||(23911146-23911209)
chr6 (237-293)||(27640723-27640779)
chr6 (373-417)||(32027151-32027195)
chr6 (373-417)||(32037210-32037254)
chr6 (11-46)||(3765901-3765936)
chr6 (246-291)||(35058397-35058444)
chr6 (379-417)||(2193035-2193073)
chr6 (123-189)||(2402306-2402372)
chr6 (379-417)||(6206128-6206166)
chr6 (379-417)||(11693095-11693133)
chr6 (247-293)||(12397334-12397380)
chr6 (379-417)||(13403463-13403501)
chr6 (130-208)||(18743995-18744073)
chr6 (247-293)||(35020842-35020888)
chr6 (238-319)||(2192936-2193017)
chr6 (341-410)||(14123250-14123319)
chr6 (238-319)||(24020680-24020761)
chr6 (237-299)||(4495616-4495680)
chr6 (343-407)||(6205808-6205871)
chr6 (381-417)||(12397426-12397462)
chr6 (237-293)||(14123146-14123202)
chr6 (237-265)||(20192534-20192562)
chr6 (237-265)||(20242092-20242120)
chr6 (237-265)||(22136076-22136104)
chr6 (237-265)||(22143429-22143457)
chr6 (381-417)||(24020624-24020660)
chr6 (351-407)||(24020919-24020974)
chr6 (343-407)||(27640504-27640567)
chr6 (239-267)||(34132140-34132168)
chr6 (237-293)||(35058343-35058399)
[»] chr4 (160 HSPs)
chr4 (11-417)||(34153097-34153503)
chr4 (11-407)||(22436901-22437297)
chr4 (13-417)||(957266-957670)
chr4 (11-417)||(21169441-21169847)
chr4 (11-417)||(49791747-49792153)
chr4 (11-417)||(34529607-34530013)
chr4 (14-402)||(6282149-6282537)
chr4 (11-402)||(44560006-44560397)
chr4 (11-416)||(47657167-47657572)
chr4 (12-417)||(2773000-2773405)
chr4 (14-417)||(49423568-49423972)
chr4 (14-417)||(36776330-36776733)
chr4 (11-359)||(43889368-43889716)
chr4 (12-417)||(49817454-49817860)
chr4 (11-414)||(4785236-4785639)
chr4 (13-417)||(17211258-17211660)
chr4 (13-417)||(42886255-42886662)
chr4 (12-409)||(14330514-14330910)
chr4 (11-299)||(21017109-21017394)
chr4 (11-299)||(40353705-40353990)
chr4 (11-409)||(51428011-51428409)
chr4 (11-400)||(1226150-1226537)
chr4 (16-299)||(55796738-55797018)
chr4 (11-409)||(28082228-28082624)
chr4 (14-300)||(32937833-32938116)
chr4 (11-409)||(33163363-33163761)
chr4 (16-299)||(20778800-20779081)
chr4 (11-299)||(41794494-41794779)
chr4 (11-409)||(51027586-51027984)
chr4 (11-299)||(6177247-6177532)
chr4 (11-301)||(49063969-49064258)
chr4 (11-299)||(56138900-56139185)
chr4 (13-417)||(18412587-18412988)
chr4 (11-299)||(49094735-49095020)
chr4 (13-300)||(24606744-24607028)
chr4 (11-405)||(37866396-37866791)
chr4 (13-301)||(25762590-25762877)
chr4 (11-235)||(26591678-26591902)
chr4 (11-302)||(242343-242633)
chr4 (40-409)||(21711549-21711918)
chr4 (14-400)||(39588922-39589307)
chr4 (13-417)||(3393296-3393695)
chr4 (19-409)||(31824448-31824838)
chr4 (14-293)||(11288288-11288562)
chr4 (14-409)||(1042744-1043136)
chr4 (13-409)||(9489671-9490065)
chr4 (13-417)||(10312264-10312663)
chr4 (14-301)||(20901596-20901882)
chr4 (14-300)||(45939518-45939804)
chr4 (11-301)||(46816453-46816740)
chr4 (68-409)||(27759374-27759715)
chr4 (14-300)||(31324167-31324451)
chr4 (11-267)||(13850739-13850991)
chr4 (11-265)||(13866253-13866503)
chr4 (244-417)||(24607276-24607449)
chr4 (142-417)||(49817012-49817283)
chr4 (243-367)||(22437331-22437457)
chr4 (243-394)||(34529457-34529611)
chr4 (243-394)||(49423418-49423572)
chr4 (344-417)||(24607051-24607124)
chr4 (245-394)||(34152949-34153101)
chr4 (225-293)||(49064563-49064631)
chr4 (243-367)||(49791597-49791723)
chr4 (243-367)||(49571525-49571655)
chr4 (243-367)||(957116-957242)
chr4 (345-406)||(20778714-20778775)
chr4 (243-365)||(21169873-21169997)
chr4 (243-417)||(43889162-43889336)
chr4 (243-394)||(42886658-42886812)
chr4 (217-293)||(14330250-14330326)
chr4 (167-264)||(17292108-17292201)
chr4 (243-328)||(26591576-26591663)
chr4 (343-409)||(242255-242320)
chr4 (243-367)||(2773429-2773555)
chr4 (13-106)||(21412647-21412740)
chr4 (345-417)||(32937736-32937809)
chr4 (243-394)||(49817304-49817458)
chr4 (247-293)||(44559893-44559939)
chr4 (247-293)||(49423364-49423410)
chr4 (247-293)||(49791543-49791589)
chr4 (332-417)||(32937412-32937497)
chr4 (247-319)||(36776100-36776172)
chr4 (246-299)||(20901339-20901394)
chr4 (123-267)||(23124490-23124630)
chr4 (332-394)||(32937353-32937416)
chr4 (247-293)||(957062-957108)
chr4 (247-293)||(2773563-2773609)
chr4 (343-409)||(20901495-20901560)
chr4 (247-293)||(34529403-34529449)
chr4 (243-394)||(36776180-36776334)
chr4 (335-409)||(45939841-45939914)
chr4 (215-293)||(4784978-4785058)
chr4 (369-417)||(4784896-4784944)
chr4 (237-293)||(46816134-46816190)
chr4 (247-293)||(34152892-34152939)
chr4 (246-299)||(39589416-39589471)
chr4 (341-394)||(32937686-32937740)
chr4 (255-293)||(49571671-49571709)
chr4 (247-289)||(51427803-51427845)
chr4 (243-299)||(51427853-51427911)
chr4 (237-319)||(56139450-56139532)
chr4 (240-293)||(51027376-51027429)
chr4 (249-293)||(242044-242088)
chr4 (237-293)||(885348-885404)
chr4 (237-293)||(1043289-1043345)
chr4 (331-394)||(17211656-17211720)
chr4 (343-407)||(21017001-21017064)
chr4 (373-417)||(21170088-21170132)
chr4 (241-299)||(24607216-24607276)
chr4 (237-293)||(28082777-28082833)
chr4 (249-299)||(38132786-38132838)
chr4 (373-417)||(49423282-49423326)
chr4 (381-417)||(49571755-49571791)
chr4 (246-299)||(21712018-21712073)
chr4 (246-299)||(27759816-27759871)
chr4 (246-299)||(37866895-37866950)
chr4 (238-293)||(38132729-38132784)
chr4 (237-299)||(51027232-51027295)
chr4 (379-417)||(956980-957018)
chr4 (379-417)||(1043389-1043427)
chr4 (341-394)||(3393691-3393745)
chr4 (379-417)||(6176844-6176882)
chr4 (237-319)||(6176900-6176982)
chr4 (243-291)||(14330355-14330405)
chr4 (379-417)||(21016706-21016744)
chr4 (237-319)||(21016762-21016844)
chr4 (379-417)||(21712171-21712209)
chr4 (247-293)||(22437465-22437511)
chr4 (379-417)||(22437555-22437593)
chr4 (341-394)||(24607120-24607174)
chr4 (237-319)||(27759869-27759951)
chr4 (379-417)||(28082877-28082915)
chr4 (379-417)||(31824215-31824253)
chr4 (379-417)||(40353302-40353340)
chr4 (379-417)||(45940167-45940205)
chr4 (243-299)||(49064468-49064526)
chr4 (373-415)||(49064669-49064711)
chr4 (237-319)||(49095285-49095367)
chr4 (379-417)||(49095385-49095423)
chr4 (379-417)||(49791461-49791499)
chr4 (247-292)||(21170005-21170049)
chr4 (380-417)||(36776044-36776081)
chr4 (247-292)||(42886833-42886878)
chr4 (249-290)||(43889111-43889152)
chr4 (379-416)||(49571463-49571500)
chr4 (381-417)||(885450-885486)
chr4 (241-319)||(885515-885595)
chr4 (239-267)||(1226898-1226926)
chr4 (343-407)||(6177139-6177202)
chr4 (381-417)||(9490124-9490160)
chr4 (237-312)||(20901120-20901196)
chr4 (237-319)||(37867202-37867286)
chr4 (237-293)||(39589469-39589525)
chr4 (343-407)||(40353597-40353660)
chr4 (253-319)||(42886990-42887058)
chr4 (381-417)||(47870740-47870776)
chr4 (343-407)||(49095065-49095128)
chr4 (253-299)||(51027437-51027485)
chr4 (381-417)||(51427717-51427753)
chr4 (343-407)||(56139230-56139293)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (11-417)||(41856780-41857188)
chr8 (11-417)||(18440103-18440509)
chr8 (11-417)||(44942889-44943295)
chr8 (11-417)||(40702360-40702767)
chr8 (11-417)||(42603454-42603857)
chr8 (12-416)||(19241971-19242375)
chr8 (12-416)||(19315155-19315559)
chr8 (11-299)||(15032253-15032538)
chr8 (11-409)||(26452325-26452722)
chr8 (13-301)||(42168885-42169172)
chr8 (11-384)||(43693137-43693511)
chr8 (11-299)||(485187-485472)
chr8 (11-409)||(2416915-2417311)
chr8 (12-409)||(24861344-24861740)
chr8 (14-409)||(38033741-38034136)
chr8 (19-301)||(33799476-33799757)
chr8 (11-301)||(40415257-40415546)
chr8 (13-312)||(41363658-41363955)
chr8 (11-409)||(40414610-40415006)
chr8 (13-409)||(34614955-34615351)
chr8 (11-227)||(41275394-41275610)
chr8 (11-301)||(28706067-28706356)
chr8 (185-417)||(26486847-26487079)
chr8 (19-298)||(43638605-43638883)
chr8 (13-416)||(31171627-31172028)
chr8 (14-190)||(26484580-26484756)
chr8 (13-416)||(3589075-3589478)
chr8 (14-300)||(16575695-16575966)
chr8 (11-128)||(22548263-22548380)
chr8 (244-417)||(16576214-16576387)
chr8 (244-367)||(18439954-18440079)
chr8 (345-417)||(16575990-16576062)
chr8 (243-367)||(28167268-28167394)
chr8 (243-364)||(42603884-42604007)
chr8 (243-364)||(41856630-41856753)
chr8 (237-394)||(26487075-26487235)
chr8 (250-367)||(37780574-37780693)
chr8 (161-409)||(22549232-22549476)
chr8 (237-293)||(2417523-2417579)
chr8 (241-394)||(16576058-16576214)
chr8 (335-409)||(40415582-40415655)
chr8 (243-367)||(40702791-40702917)
chr8 (247-293)||(41856576-41856622)
chr8 (237-293)||(38033532-38033588)
chr8 (241-320)||(28705721-28705800)
chr8 (374-417)||(37780507-37780550)
chr8 (238-293)||(43637371-43637426)
chr8 (350-409)||(43637580-43637638)
chr8 (239-319)||(28705555-28705637)
chr8 (237-319)||(33799332-33799414)
chr8 (343-409)||(42168776-42168841)
chr8 (247-293)||(42604015-42604061)
chr8 (237-293)||(15031932-15031988)
chr8 (237-293)||(22549629-22549685)
chr8 (16-124)||(22843424-22843532)
chr8 (237-293)||(40415808-40415864)
chr8 (239-294)||(40416000-40416056)
chr8 (250-293)||(18439899-18439942)
chr8 (246-299)||(22549576-22549631)
chr8 (246-299)||(40415755-40415810)
chr8 (379-417)||(484784-484822)
chr8 (237-319)||(484840-484922)
chr8 (379-417)||(2417623-2417661)
chr8 (379-417)||(15031850-15031888)
chr8 (379-417)||(22549729-22549767)
chr8 (237-319)||(24861893-24861975)
chr8 (343-409)||(28705958-28706023)
chr8 (379-417)||(38033450-38033488)
chr8 (255-293)||(40702933-40702971)
chr8 (379-417)||(41275717-41275755)
chr8 (379-417)||(42604105-42604143)
chr8 (239-319)||(43637179-43637261)
chr8 (379-417)||(44051090-44051128)
chr8 (380-417)||(24861994-24862031)
chr8 (238-319)||(41017330-41017411)
chr8 (343-407)||(485079-485142)
chr8 (343-407)||(15032145-15032208)
chr8 (331-394)||(16576383-16576447)
chr8 (381-417)||(26452964-26453000)
chr8 (256-288)||(28167412-28167444)
chr8 (381-417)||(28705666-28705702)
chr8 (249-299)||(28705805-28705857)
chr8 (239-267)||(33776051-33776079)
chr8 (249-293)||(37780710-37780754)
chr8 (381-417)||(40415910-40415946)
[»] scaffold0589 (3 HSPs)
scaffold0589 (13-301)||(2261-2548)
scaffold0589 (237-319)||(4828-4910)
scaffold0589 (335-384)||(2584-2633)
[»] scaffold0176 (3 HSPs)
scaffold0176 (12-409)||(1783-2179)
scaffold0176 (238-293)||(2334-2389)
scaffold0176 (379-417)||(2433-2471)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-409)||(17734-18123)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (13-230)||(24899-25115)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (11-139)||(63968-64095)
scaffold0004 (168-300)||(64098-64227)
scaffold0004 (345-400)||(64251-64306)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (155-299)||(85462-85603)
scaffold0031 (343-407)||(85648-85711)
[»] scaffold0268 (2 HSPs)
scaffold0268 (155-299)||(14604-14745)
scaffold0268 (343-407)||(14790-14853)
[»] scaffold0861 (3 HSPs)
scaffold0861 (237-410)||(2497-2670)
scaffold0861 (274-409)||(2208-2343)
scaffold0861 (246-298)||(2445-2499)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (331-394)||(1054-1117)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (237-293)||(11371-11427)
scaffold0199 (381-417)||(11289-11325)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-230)||(5453-5560)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (237-364)||(108003-108132)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (130-210)||(36775-36855)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 18308249 - 18308655
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18308249 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 18308348  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18308349 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 18308448  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308449 cagtagattgacattaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 18308548  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18308549 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaagctggtttaaatgaaggtattgaagtttcaaggaatggacctcattc 18308648  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  18308649 ttttgac 18308655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1400518 - 1400114
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1400518 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1400419  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400418 gacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 1400319  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  1400318 gaagatcgtcattaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaaacttgccaaacgataggtctctaa 1400219  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1400218 tattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaggattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattctt 1400119  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  1400118 ttgac 1400114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4724292 - 4723886
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  4724292 cagagacacaaggaaagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4724193  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724192 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 4724093  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4724092 cagaagatcgtcattaggtaccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 4723993  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4723992 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 4723893  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  4723892 ttttgac 4723886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 35565261 - 35565666
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |    
T  35565261 cagagacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-c 35565359  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35565360 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgc 35565459  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | || |    
T  35565460 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgacttc 35565559  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35565560 aatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattc 35565659  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  35565660 ttttgac 35565666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36350523 - 36350137
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  36350523 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaac 36350424  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36350423 gtgacgagcatg---------cacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 36350333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||   | | ||||    
T  36350332 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt-----------tggggtaattcaaacttgccaaacaacatgactcc 36350244  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36350243 aatgttctaccaacattctcattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattc 36350144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 92 - 417
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1695185
Alignment:
Q  92 attaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatc 191  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  192 atcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaact 1695058  T
Q  292 tgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtg 390  Q
    | |||||||| | | | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1695059 ttccaaacggcatgacaccaatgttcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgaaggtattgaagtg 1695158  T
Q  391 tcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1695159 tcaatgaatggacctcattcttttgac 1695185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 7162
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7447 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 7348  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7347 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 7248  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7247 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaatttgtcaaac 7162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 8537943 - 8538339
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8537943 cagagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 8538042  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538043 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8538142  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  8538143 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 8538239  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  8538240 gagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttgggttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaagaaatgaacctcat 8538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 409
Target Start/End: Original strand, 30709594 - 30709983
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacga 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30709594 acaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacga 30709693  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtaga 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30709694 ccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaaga 30709793  T
Q  218 tcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaata-t 315  Q
    |||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||| |  | |    
T  30709794 tcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatt 30709890  T
Q  316 tcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||  || |||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30709891 tcgctcggcattcatttttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 30709983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 11346698 - 11347094
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  11346698 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaac 11346797  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346798 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 11346897  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  11346898 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 11346994  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11346995 gagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 11347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8576359 - 8576074
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  8576359 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaac 8576260  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8576259 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8576160  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8576159 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 8576074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6793604 - 6793351
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6793604 cagagacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaat 6793505  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6793504 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagc 6793405  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6793404 cagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 6793351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19036892 - 19036607
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19036892 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19036793  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036792 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19036693  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19036692 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 19036607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27661595 - 27661310
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27661595 cagagacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27661496  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27661495 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27661396  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27661395 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 27661310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 28880980 - 28881265
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28880980 cagagacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28881079  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28881080 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 28881179  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28881180 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 28881265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 3601330 - 3601728
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3601330 cagagacacaaggagggtagaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3601429  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3601430 gtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 3601529  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || | || |  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | | |    
T  3601530 cagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccatgac 3601626  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || || | |||| ||  | |||   || ||||| | ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3601627 tcaaacatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgctatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 3601725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 1971356 - 1971752
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1971356 gagacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1971455  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1971456 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 1971555  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctc 309  Q
    | | ||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||    
T  1971556 gaaaatcatcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttgcctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccatgactc 1971652  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  1971653 aagcatttcgcccagctttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgccaaggaatgaacctcat 1971751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854542
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
     ||| ||||||||| || | || |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   | | ||| |     
T  38854350 aagaccgtcattagttaggtaagg--tgca--ttccaaccacaacaattgtcttcctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacatgactcgag 38854445  T
Q  313 ta-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
     | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  38854446 catttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aggtgtgaaggaatgaacctcatt 38854542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 541853 - 541574
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  541853 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 541754  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||    
T  541753 gggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgc 541654  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  541653 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttg 541574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 19400352 - 19400750
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  19400352 cagagacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 19400451  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19400452 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 19400551  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg-ggaggtc 307  Q
    ||| | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||   | | |    
T  19400552 cagaatatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaatttgccaaacgaccatgac 19400648  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattc-tcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 405  Q
    || |  | |||| || |||||| | ||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19400649 tcaagcatttcgcccaacattcatgatt-ttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacct 19400746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11028045
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||| |||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||    
T  11027969 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaaccacaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttg 11028045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 33370645 - 33370862
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  33370645 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 33370744  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  33370745 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 33370844  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  33370845 gaagatcatgattaggta 33370862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40009518 - 40009733
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  40009518 agagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 40009617  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |     
T  40009618 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccaca 40009717  T
Q  212 agtagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||||    
T  40009718 agaagatcgtcattag 40009733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 3169593 - 3169766
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3169593 cagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3169691  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaa 185  Q
     |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3169692 gtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35927653 - 35927470
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  35927653 gagacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35927554  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35927553 gacgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366547
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatg--------------aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
     | ||||| ||||| || |||  |              ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||         |||||    
T  17366751 aatatcgtgattagttaaggatcgtgattaggtagggaaatgcaccttccaactataacaattgtcttcctttggatgcagtaatt---------caaac 17366661  T
Q  300 gggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaat 399  Q
    || || || | |  ||||  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17366660 ggcagttcccaagcattcacccgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaagctggtttagatgaaggtattgaattgtcaaggaat 17366561  T
Q  400 ggacctcattcttt 413  Q
    | ||||||||||||    
T  17366560 gcacctcattcttt 17366547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 409
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082608
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgacattctcat 332  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |  | ||||  || |||||   |    
T  7082436 g-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaaaggggtaattcaaacttgccaaacggatagaactcaagcatttcgctcggcattcatgt 7082532  T
Q  333 tgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7082533 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 7082608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 417
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12743081
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga-----at--------gaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||     ||        ||||||| ||||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtagggatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaacta 12742917  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaa 352  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| || || | |   |||  |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12742918 caacaattgtcttactacgaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagttcccaagctttcacccgacagttct-attgttccattcaaaagattaa 12743016  T
Q  353 attcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12743017 attcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgac 12743081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 2599210 - 2599387
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||   ||||    
T  2599210 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacat 2599309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  2599310 gaagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatat 2599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 417
Target Start/End: Original strand, 33371169 - 33371349
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgtt 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| | | ||| || ||||| | ||||||   ||||||    
T  33371169 gaatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttaaattaggtaattcaaacttgttaaacggcacgactcaaacattcgcctgacatttctattgtt 33371268  T
Q  337 cctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  33371269 cctttcaaaagattaaattcatgttaggccagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgcaactcattattttgac 33371349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 417
Target Start/End: Original strand, 10398006 - 10398185
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttc 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | || || |  | ||||  ||||||||   ||||| |    
T  10398006 aatgcaccttccaactacacaaattgtcttcctttggatggggtaattcaaacttgttaaacagcagttcccagacattcacccgacatttctattgtac 10398105  T
Q  338 ctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10398106 ctttcaaaagattaaattcttgttagattggtttagatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgac 10398185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 417
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805899
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga-----at--------gaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||| |||||||| |||     ||        ||||||| |||||||||     
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggtagggatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactg 12805735  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaa 352  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| || || | |   |||  |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12805736 caacaattgtcttactacgaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagttcccaagctttcacccgacagttct-attgttccattcaaaagattaa 12805834  T
Q  353 attcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12805835 attcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgac 12805899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 36349987 - 36350141
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  36349987 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 36350086  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36350087 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 36350141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| ||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  114 acgagcatgttttg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283845
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| || |  | |  ||||  |||||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttagttaggataagg-tgca--ttccaacta 22283800  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22283801 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 22283845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25498547 - 25498398
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | | |   |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  25498547 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcaatactccaatattcgaccgacattcccaatgttccattcaaa 25498448  T
Q  346 agattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  25498447 agattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 25498398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 417
Target Start/End: Original strand, 33370938 - 33371024
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33370938 attgttcatttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgac 33371024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693459
Alignment:
Q  23 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 311
Target Start/End: Original strand, 7082793 - 7082889
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  7082793 agatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaacgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcca 7082889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35565816 - 35565662
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||| | ||||| |||||||| ||| |||||      
T  35565816 accttccaactacaataattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccattgttcgatcgacattcccatagttccat 35565717  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||| |||||||||    
T  35565716 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacagtattcaagtgtcaa 35565662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Original strand, 1171725 - 1171786
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171725 ggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 1171786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 1399967 - 1400118
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttc-ctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  1399967 acctcccaactacaacaattgtgttaactttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcatga---ctccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 1400063  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  1400064 tcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 1400118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Original strand, 18920879 - 18920975
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920879 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 18920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1695335 - 1695181
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | | | | | ||| ||  |||||||||||||| ||| |||||      
T  1695335 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcatagcagcatgactcgaacgttcgaccgacattcccatagttccat 1695236  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  1695235 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 1695181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 7082281 - 7082335
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082281 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18308804 - 18308679
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |   | | |||||||||||||||||||||| || | || |  |    
T  18308804 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaatattcgaccgacattcccaatttttcatt 18308705  T
Q  342 caaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18308704 caaaatattaaattcttgttaggctg 18308679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17195421 - 17195316
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17195421 gttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcatcttccaactacaacaattgtct 17195326  T
Q  267 t-cctttgaa 275  Q
    | ||||||||    
T  17195325 tacctttgaa 17195316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 409
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459177
Alignment:
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 3459036  T
Q  271 ttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggg-aggtctccaatattcgaccga-cattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||   | | ||| | ||||   || | | |||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  3459037 ctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacgaccatgactcaagtattaagcccagcgttcatatttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctg 3459136  T
Q  368 atttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3459137 gtttagatgaaggtatt-aagtgtcaatgaatgaacctcatt 3459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 411
Target Start/End: Original strand, 12806168 - 12806230
Alignment:
Q  349 ttaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12806168 ttaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct 12806230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6793351 - 6793288
Alignment:
Q  354 ttcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6793351 ttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggaccttattcttttgac 6793288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4723728 - 4723682
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4723728 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 4723682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 12742706 - 12742804
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12742706 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataaca 12742804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 411
Target Start/End: Original strand, 12743349 - 12743411
Alignment:
Q  349 ttaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12743349 ttaaattcttgttaggctggtttagatggaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct 12743411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 364
Target Start/End: Original strand, 4723742 - 4723859
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaa 346  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | | | ||||||||| |||||| | ||| || ||||||  ||||||    
T  4723742 caactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatatacgaccggcgttcccaatgttccattcaaaa 4723841  T
Q  347 gattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4723842 gattaaattcttgttagg 4723859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Original strand, 25498635 - 25498707
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  25498635 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 25498707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360549
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgtt-gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||| |||||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  222 cattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
     ||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25360590 gattaggta--ga--gaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 25360549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 12805524 - 12805617
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacga 106  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  12805524 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacga 12805617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34683577 - 34683533
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34683577 caactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 34683533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 34683587 - 34683742
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt--aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcct 339  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||  | ||||| || |||| |     
T  34683587 acctcccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaatggcattcccaatgtttca 34683686  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  34683687 ttcaaaagattaaattcttgttaagctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 34683742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Original strand, 35565824 - 35565896
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  35565824 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 35565896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 40012157 - 40012213
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  40012157 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttg 40012213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1971908 - 1971853
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1971908 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 1971853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3170076 - 3170021
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3170076 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 3170021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 6793138 - 6793261
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | | |||  |||||  |||||||| ||||| ||| ||||       
T  6793138 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagtaggattccaaggttcgaccggcattcccatagttcaat 6793237  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  6793238 tcaaaagattaaattctttttagg 6793261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36312007 - 36311911
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  36312007 gttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgtct 36311912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40012159 - 40012104
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40012159 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 40012104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 1971906 - 1971988
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||    
T  1971906 gaatgcacattccaactacaacaattgtcatactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgggaggactccaacattcga 1971988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 28881529 - 28881611
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  28881529 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgccaatcggcaggactccagtattcga 28881611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Original strand, 22284110 - 22284191
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||    
T  22284110 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgccaatcagcaggaccccaatattcga 22284191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6897 - 6841
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6897 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttg 6841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3459331 - 3459387
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  3459331 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 3459387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19400904 - 19400960
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  19400904 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 19400960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 25498719 - 25498763
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25498719 aatgatggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 25498763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3601884 - 3601829
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3601884 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaaac 3601829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19400906 - 19400851
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19400906 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaac 19400851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1399959 - 1399913
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1399959 tccaactgcaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 1399913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 1972006 - 1972044
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1972006 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 1972044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 405
Target Start/End: Original strand, 3169857 - 3169918
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  3169857 aaaagattaaattcttgttaggttgatttagatgaatgtatt-aagtgtcaatgaatgaacct 3169918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6793040 - 6793002
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6793040 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 6793002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6793130 - 6793084
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6793130 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgagataattcaaacttg 6793084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 8538492 - 8538574
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  8538492 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 8538574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8575809 - 8575727
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  8575809 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 8575727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13131140 - 13131044
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||  || || ||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131140 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagcta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 13131045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 30710136 - 30710218
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||    
T  30710136 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgctaatcggcaggactccagtattcga 30710218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33371499 - 33371345
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||   | | |||||| ||||| | ||||||   ||||||||      
T  33371499 accttccaactacaacaattattttacctctgaatgaggtaaattcaagcttgctaaacaccaagactccaacattcgtctgacatttctattgttccat 33371400  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||    
T  33371399 tcaaaagattaaattcatgttaggcttggtttaaataatggtattcaagtgtcaa 33371345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 40011939 - 40012004
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  40011939 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaagaatgaacatcatt 40012004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 40011838 - 40011895
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40011838 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgg 40011895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 1171824 - 1171868
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1171824 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 1171868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8576029 - 8575966
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  8576029 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 8575966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19036342 - 19036282
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaa 297  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||    
T  19036342 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgccaa 19036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27661265 - 27661202
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27661265 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 27661202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 35565908 - 35565952
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35565908 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 35565952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7083065 - 7082982
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  7083065 aatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaactgcaggactccaatattcga 7082982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Original strand, 18308815 - 18308858
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  18308815 aactacaacaattgtcttcctcagaatgaggtaattcaaacttg 18308858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 38854695 - 38854778
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  38854695 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttacccttggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 38854778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6797 - 6759
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6797 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 6759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 1695343 - 1695389
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  1695343 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttg 1695389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8575709 - 8575671
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8575709 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 8575671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 11347260 - 11347306
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11347260 tccaactgcaaaaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 11347306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12743131 - 12743077
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  12743131 tcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 12743077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12805949 - 12805895
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  12805949 tcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 12805895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12806282 - 12806232
Alignment:
Q  344 aaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtca 393  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12806282 aaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtca 12806232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 19401004 - 19401042
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19401004 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 19401042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20196623 - 20196549
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatat 315  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||    
T  20196623 accttccaactacaaaaaccgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatat 20196549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 20196721 - 20196759
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20196721 ggtatttaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 20196759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27660945 - 27660907
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27660945 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 27660907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27661045 - 27660963
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  27661045 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 27660963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 28881629 - 28881667
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28881629 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgac 28881667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 38854796 - 38854834
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38854796 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 38854834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 40012257 - 40012295
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40012257 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 40012295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Original strand, 11347351 - 11347388
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11347351 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 11347388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Original strand, 22284210 - 22284247
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22284210 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 22284247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7117 - 7054
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  7117 aaaatattaaattcttgttatggtggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 7054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1399875 - 1399831
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1399875 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcaccacattcttttgac 1399831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1972148 - 1972080
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  1972148 cttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 1972080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3601882 - 3601938
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||  ||||||||||||    
T  3601882 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttactctagatgggacaattcaaacttg 3601938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4723636 - 4723600
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4723636 tatttaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 4723600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7082766 - 7082714
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7082766 accttccaactacaaaaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 7082714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Original strand, 7082909 - 7082949
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7082909 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttt 7082949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 18308896 - 18308940
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18308896 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcatctcattcttttgac 18308940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19036562 - 19036499
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  19036562 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 19036499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 22283890 - 22283953
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  22283890 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aattgtcaaggattgaacctca 22283953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 28881310 - 28881373
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  28881310 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 28881373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 34683338 - 34683402
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34683338 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttactcttgaatggggtaaattcaaacttgctaaac 34683402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40012406 - 40012378
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012406 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40012378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 118)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 35491629 - 35492035
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35491629 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 35491728  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491729 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35491828  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35491829 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 35491928  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491929 aatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 35492028  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  35492029 ttttgac 35492035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10364849 - 10364443
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10364849 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 10364750  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364749 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 10364650  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggg-aggtctc 309  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10364649 cagaagatcgtcattacgta-ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgggcaggtctc 10364551  T
Q  310 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10364550 caatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 10364451  T
Q  410 cttttgac 417  Q
    ||||||||    
T  10364450 cttttgac 10364443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41499306 - 41498902
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  41499306 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41499207  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499206 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41499107  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41499106 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctcc 41499007  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41499006 aatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattc 41498907  T
Q  411 ttttg 415  Q
    |||||    
T  41498906 ttttg 41498902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19471846 - 19471442
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19471846 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19471747  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471746 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19471647  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||||    
T  19471646 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaacttgtcaaatggcagggctcc 19471547  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471546 aatattcgaccagcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 19471447  T
Q  411 ttttg 415  Q
    |||||    
T  19471446 ttttg 19471442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37312705 - 37312301
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  37312705 gagacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 37312606  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37312605 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 37312506  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||    
T  37312505 gaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattgacttcctatgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaa 37312406  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37312405 tgttcgaccgacattcccattgttcctctcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcagtaaatggacctcattctt 37312306  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  37312305 ttgac 37312301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2919577 - 2919171
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2919577 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2919478  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2919477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgc 2919378  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  2919377 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacgacatgactcc 2919278  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2919277 aatgtttaaccgacattctcattgatcgtgtcaaaagagtaaattcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattc 2919178  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  2919177 ttttgac 2919171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27130719 - 27130318
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  27130719 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 27130620  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130619 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 27130520  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | | ||||||    
T  27130519 gaagatagtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaatttgccaaatgacatgactccaa 27130420  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27130419 tgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttcttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatagacctcattctt 27130320  T
Q  413 tt 414  Q
    ||    
T  27130319 tt 27130318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 6976832 - 6977236
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  6976832 cagagacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaac 6976929  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976930 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6977029  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6977030 gagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 6977129  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||| | ||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6977130 aatgttcgactggcattcccattaatcctttcaaaatattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcattc 6977229  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  6977230 ttttgac 6977236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34521896 - 34521522
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34521896 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34521797  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34521796 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccct 34521697  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34521696 cataagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggtaggactcc 34521597  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtatt 384  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  34521596 aatattcgattggcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatt 34521522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 71 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677181
Alignment:
Q  71 agtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttg 170  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtattcct 40677328  T
Q  271 ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40677327 ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtt 40677228  T
Q  371 taaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40677227 taaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 40677181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404411
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||     
T  33404212 aagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttttaaacggcaggactcaaac 33404307  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||| | ||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33404308 atttgtccggcatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttt 33404407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 167 - 414
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491847
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattgcct 43491699  T
Q  267 tcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491700 tcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcagatctccaatatttgaccggaattcccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct 43491799  T
Q  367 gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctttt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491800 gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctttt 43491847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29068008
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29067926 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 29068008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10360014
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaat 313  Q
    |||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |      
T  10360206 gatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagc 10360110  T
Q  314 a-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    | |||| || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  10360109 atttcgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctagtttagatgaaggtaat-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 10360014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111438
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     | | ||||| |||||| || |  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29111355 aataacgtcactaggtagggta-aagtgca--ttccaactacaacaattatcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgtcaaacg 29111438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3937276 - 3936991
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3937276 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3937177  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937176 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 3937077  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3937076 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 3936991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 43982850 - 43983135
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43982850 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43982949  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982950 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 43983049  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43983050 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 43983135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 17424784 - 17425068
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17424784 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17424883  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17424884 tgacgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 17424983  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17424984 acaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 17425068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42241311 - 42240913
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  42241311 cagagacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaac 42241212  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  42241211 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgc 42241112  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  42241111 cataagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggccaggac 42241015  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || || || | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  42241014 tcaagcatttcgctcggcattcatgttttttctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgacaaggaatgaacctc 42240916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 16581816 - 16582216
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  16581816 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaat 16581915  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc--gatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16581916 gtgtcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattcc 16582015  T
Q  209 gccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gagg 305  Q
    || || ||||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16582016 gctagaagatcttcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattggcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccagg 16582112  T
Q  306 tctccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacc 404  Q
     ||| | || ||||  || |||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16582113 actcaagtatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagaatggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacc 16582211  T
Q  405 tcatt 409  Q
    |||||    
T  16582212 tcatt 16582216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 293
Target Start/End: Original strand, 5420465 - 5420742
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5420465 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgt 5420564  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5420565 gacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacct 5420664  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  5420665 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 5420742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12968514 - 12968116
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  12968514 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 12968415  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  12968414 gttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 12968315  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg-ggaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||   | | |    
T  12968314 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgaccatgac 12968218  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12968217 tcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctaatttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 12968119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17796314 - 17796033
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  17796314 gagacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 17796215  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17796214 gaagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtca 17796118  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    | || ||||||||||||| |||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17796117 gaagctcgtcattaggtaggga---aatgtgtcttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacg 17796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 22001828 - 22002113
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22001828 cagagacacaaggatggtagaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaac 22001927  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001928 gtgacgaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22002027  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| |||| |||||||| ||  | | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22002028 cagaagattgtcattagttattgtaag-ttgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 22002113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Original strand, 3941731 - 3942007
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3941731 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3941830  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  3941831 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 3941930  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaac 290  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||    
T  3941931 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaac 3942007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 6901962 - 6902378
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  6901962 gagacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6902061  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  6902062 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcga 6902161  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacgga--at-----------gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    | ||||| | |||||||| |||  ||           ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||   || |||||||||| || ||||    
T  6902162 gaagatcatgattaggtagggatcatgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctgaccctgaa-atggaaattcaaactggctaaac 6902260  T
Q  300 gggaggtctccaatattcgacc-gacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaa 398  Q
    |  ||||||  |  ||||  || ||  |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6902261 gtcaggtctgaagcattcacccggaagttct-attgttcaattcaaaagattaaattcttgttagtctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaa 6902359  T
Q  399 tggacctcattcttttgac 417  Q
    || ||||||||||||||||    
T  6902360 tgcacctcattcttttgac 6902378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 22493265 - 22493554
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||    
T  22493265 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaac 22493364  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22493365 gtgacgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgc 22493464  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt-tg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| || || | | |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22493465 cagaagatcgtcattagttagggtaag-atgca--ttccaactacaacaactgtcttacttctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 22493554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 39393885 - 39394101
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  39393885 cagagacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaac 39393984  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||     
T  39393985 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgt 39394084  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39394085 cagaagatcgtcattag 39394101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 42120014 - 42120294
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  42120014 caaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 42120113  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  42120114 catgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 42120213  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42120214 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacgattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacg 42120294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Original strand, 29906584 - 29906974
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| |||| |     
T  29906584 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaa 29906683  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||    
T  29906684 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagat 29906783  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata- 314  Q
    |  |||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |  |     
T  29906784 cagcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaactgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcat 29906880  T
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29906881 ttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 29906974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 32734641 - 32735039
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||     
T  32734641 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaat 32734740  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32734741 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 32734840  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||  |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  32734841 caaaagatagtcattagttaaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaacagtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggccaggac 32734937  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||| |||||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32734938 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattattgttaggttggtttagattaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctc 32735036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799895
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttg 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttg 39799895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 20148114 - 20148331
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  20148114 gagacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacat 20148213  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  20148214 gactagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgcca 20148313  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  20148314 gaagatcgtgattaggta 20148331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgtt----cggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 34638960 - 34639093
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34638960 cagagacacaaggagg-tggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 34639058  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcca 145  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34639059 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 417
Target Start/End: Original strand, 16253605 - 16253852
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  16253605 gttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaata----caccttccaactacaacaattgtct 16253700  T
Q  267 tcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    | || || |||| |||||||||||||||  |||||  || || | |   |||  ||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||     
T  16253701 tactctgaaatgaggtaattcaaacttgttaaacgatagttcccaagctttcacccggcagttct-attgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 16253799  T
Q  365 ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16253800 ctggcttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 16253852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650391
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||     
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattg 263  Q
    |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27650427 attaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattg 27650391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43492000 - 43491877
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||      
T  43492000 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 43491901  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43491900 tcaaaagattaaattcttgttagg 43491877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 10364293 - 10364419
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | | | | |||||||||||||| | ||||| || ||||||      
T  10364293 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgactggcattcccaatgttccat 10364392  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10364393 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 10364419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35492184 - 35492031
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| || ||||| || ||||||      
T  35492184 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgatcggcattcccaatgttccat 35492085  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| || ||||||    
T  35492084 tcaaaagattaaattcttgttaggcgggattaaatgatggtattcaaatgtcaa 35492031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 409
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393742
Alignment:
Q  154 atatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaact 253  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||||||||  | || | |  ||||  ||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaagg-tgca--ttccaact 18393582  T
Q  254 acaacaattgtctt-cctttgaa--tggggtaattcaaacttgccaaacggg-aggtctccaatatt-cgaccgacattctcattgttcctgtcaaaaga 348  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| | |||| ||  || |||||   || ||||| | ||||||    
T  18393583 acaaaaattgtcttacctctgaaatnggggtaattcaaacttgccaaacgactaggactcaagtatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaaga 18393682  T
Q  349 ttaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18393683 ttaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 18393742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 367
Target Start/End: Original strand, 19471297 - 19471416
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaag 347  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||  |||||||    
T  19471297 aactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcatttccaatgttccattcaaaag 19471396  T
Q  348 attaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19471397 attaaattcttgttaggctg 19471416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 331 - 417
Target Start/End: Original strand, 20148444 - 20148529
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20148444 attgttcctttcaaaatattaaattcttgttaggcttgtttaaatgaag-tattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 20148529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatga 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcaca 135  Q
      |||||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Original strand, 40677037 - 40677157
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaa 346  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||| | | | | ||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||    
T  40677037 caactacaacaattgtgttacccttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaa 40677136  T
Q  347 gattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40677137 gattaaattcttgttaggctg 40677157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31991992 - 31991896
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991992 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 31991897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 417
Target Start/End: Original strand, 29111468 - 29111534
Alignment:
Q  351 aaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29111468 aaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtatttaagtgtcaaggaatacacctcattcttttgac 29111534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 41498750 - 41498876
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| ||| | | | | |||||||||||||||  ||||| || ||||||      
T  41498750 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtcaagcagcaagactccaatattcgaccagcattcccaatgttccat 41498849  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41498850 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 41498876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40678827 - 40678763
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40678827 cagagacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6977386 - 6977232
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||  || |||||||| ||  | |||      
T  6977386 accttccaactcaaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatatgatcgacattcccacagctccat 6977287  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  6977286 ttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 6977232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 37312151 - 37312305
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  ||| | | | | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||       
T  37312151 accttccaactataacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttttcaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttcaat 37312250  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  37312251 tcaaaagattaatttcctgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 37312305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15891703 - 15891609
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891703 gttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 15891609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 394
Target Start/End: Original strand, 2919047 - 2919175
Alignment:
Q  268 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg-c 365  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | | | ||||||| |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  2919047 cctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatgttcgaccagcattctcatagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtt 2919146  T
Q  366 tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    || ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  2919147 tggtttaaatgacggtattcaagcgtcaa 2919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 6977394 - 6977440
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6977394 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 6977440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18036218 - 18036122
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18036218 gttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggta-ggaa---atgcaccttccaactacaacaattgtct 18036123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 42120339 - 42120404
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42120339 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 42120404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2919017 - 2918972
Alignment:
Q  248 ccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2919017 ccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 2918972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39799849 - 39799685
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatatt-cgaccgacattctcattgttcctgtca 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||   ||| ||| |  ||| ||  || |||||   || ||||| | |    
T  39799849 ttccaaccacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttga 39799750  T
Q  344 aaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  39799749 aaagattaaattcttgttaggctggtttagatgtaggtatt-aagtgtgaaggaatgaacctcatt 39799685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33404567 - 33404439
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattg 334  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||| ||| || ||| | ||||||||   ||||    
T  33404567 gaatgtaccttccaaatacaacaattgtcttacctctgaattgggtaaattcaaacttgctaaacatcaggactcaaacatttgtccgacatttctattg 33404468  T
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 363  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33404467 ttccattcaaaagattaaattcttgttag 33404439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 34521402 - 34521520
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| || ||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||      
T  34521402 acctcccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattgaaacttgccaagcagcaggactccaatat-cgaccgacattc-caatgttccat 34521499  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgtt 361  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34521500 tcaaaagattaaattcttgtt 34521520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6902437 - 6902374
Alignment:
Q  332 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  6902437 ttgttccgttcaaaagattaaattcttgttaggctcgacttaaatgagggtattgaagtgtcaa 6902374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 10359858 - 10359913
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10359858 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 10359913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Original strand, 22493590 - 22493663
Alignment:
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22493590 ttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 22493663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34521394 - 34521348
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34521394 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttg 34521348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41498742 - 41498696
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41498742 tccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 41498696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17538586 - 17538550
Alignment:
Q  257 acaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538586 acaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 17538550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22493819 - 22493767
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22493819 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggaaaattcaaacttgccaa 22493767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16582371 - 16582316
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16582371 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcagttcaaacttgccaaac 16582316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18393897 - 18393842
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18393897 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaac 18393842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42120560 - 42120505
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42120560 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaaac 42120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 292
Target Start/End: Original strand, 42120558 - 42120613
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  42120558 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaactt 42120613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 18393895 - 18393977
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  18393895 gaattcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 18393977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19471277 - 19471231
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19471277 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggagtaattcaaacttg 19471231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42240869 - 42240815
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcc 269  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  42240869 agatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaacaacattaattgtcttcc 42240815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26617697 - 26617652
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26617697 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacg 26617652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16253912 - 16253848
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||||    
T  16253912 attgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaa 16253848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  120 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgct 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19471193 - 19471149
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19471193 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 19471149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 22493817 - 22493873
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  22493817 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttg 22493873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 29068053 - 29068116
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  29068053 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 29068116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 29073588 - 29073644
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  29073588 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 29073644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 398
Target Start/End: Original strand, 29111807 - 29111863
Alignment:
Q  342 caaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaa 398  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  29111807 caaaaggttaaattcatgttaggctggtttagatgattgtattgaagtgtcaaggaa 29111863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 8557385 - 8557440
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8557385 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgccaaac 8557440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 17425333 - 17425415
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  17425333 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 17425415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 17425433 - 17425471
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17425433 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 17425471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20148579 - 20148525
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  20148579 tcaaaagattaaattctttttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 20148525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 22002478 - 22002516
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22002478 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 22002516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 22493917 - 22493955
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22493917 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 22493955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 28476149 - 28476187
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28476149 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 28476187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 29073688 - 29073726
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29073688 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 29073726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29111580 - 29111530
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  29111580 aagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 29111530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 35492192 - 35492238
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35492192 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatttggtaattcaaacttg 35492238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37312143 - 37312097
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37312143 tccaactgcaacaattgttttcctctaaatggggtaattcaaacttg 37312097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39799432 - 39799394
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39799432 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 39799394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39799532 - 39799450
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  39799532 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 39799450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40677023 - 40676977
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  40677023 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatgaggtaattccaacttg 40676977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41498652 - 41498614
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41498652 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 41498614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 42120658 - 42120696
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42120658 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 42120696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 43492008 - 43492054
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43492008 tccaactgcaataattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttg 43492054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 43492098 - 43492136
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43492098 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattattttgac 43492136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 416
Target Start/End: Original strand, 3942054 - 3942091
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3942054 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 3942091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 8557138 - 8557195
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8557138 atgcatcttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggtaaattcaaacttgc 8557195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Original strand, 16582470 - 16582507
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16582470 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 16582507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2918929 - 2918893
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2918929 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2918893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3936946 - 3936883
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  3936946 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 3936883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 5420788 - 5420824
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5420788 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 5420824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 6977486 - 6977522
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6977486 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 6977522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10359860 - 10359804
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  10359860 gaatgcatattcgaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 10359804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16582369 - 16582425
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  16582369 gaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttg 16582425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 17425113 - 17425176
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  17425113 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 17425176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 22002158 - 22002209
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaag 395  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22002158 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaag 22002209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 22002378 - 22002434
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||    
T  22002378 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttg 22002434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 24108209 - 24108273
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24108209 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaac 24108273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 32736726 - 32736770
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32736726 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatacacctcattcttttgac 32736770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32736881 - 32736853
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32736881 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 32736853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42120807 - 42120779
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42120807 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42120779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 43983180 - 43983243
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  43983180 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 43983243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 175)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 13972914 - 13973320
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13972914 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 13973013  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973014 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 13973113  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13973114 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 13973213  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973214 aatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 13973313  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  13973314 ttttgac 13973320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14173974 - 14173568
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14173974 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 14173875  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173874 gtgacgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 14173775  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  14173774 cagaagatcgtcattaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactct 14173675  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173674 aatgttcaaccggcatttccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggtcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 14173575  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  14173574 ttttgac 14173568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38046650 - 38046244
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38046650 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 38046551  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38046550 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 38046451  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38046450 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctcc 38046351  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  38046350 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattatactcttgttagtctggtttaaatgaaggtattaaaatgtcaacgaatggacctcattc 38046251  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  38046250 ttttgac 38046244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Original strand, 36909552 - 36909957
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  36909552 agagacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36909651  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909652 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36909751  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  36909752 agaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattcca 36909851  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909852 aggttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttattaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 36909951  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  36909952 tttgac 36909957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 415
Target Start/End: Original strand, 6435762 - 6436166
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6435762 cagagacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6435861  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435862 gtgacgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6435961  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6435962 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 6436061  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436062 aatattcgaccgacaattccattgtttatgtcaaaagattaaattcttattaggctggtttaaatgaagatattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 6436161  T
Q  411 ttttg 415  Q
    |||||    
T  6436162 ttttg 6436166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35587145 - 35586742
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35587145 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 35587046  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587045 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35586946  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||    
T  35586945 cagaagatcgtcatta-gtacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttgt-ttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgaca-aactcc 35586849  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35586848 aatgttcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattc 35586749  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  35586748 ttttgac 35586742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49926595 - 49926190
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  49926595 cagagacagaagg-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaac 49926497  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49926496 gtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49926397  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49926396 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaaccattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctcc 49926297  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49926296 aatattcgaccagcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattattgttgtgctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatagacctcattc 49926197  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  49926196 ttttgac 49926190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23343037
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || ||||    
T  23342834 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaat 23342933  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23342934 attcgaccggcattcccatttttcttgtcaaaagattaaagtcttgttaggccgatttaaatgaagatattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 23343033  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  23343034 tgac 23343037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24270579 - 24270175
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24270579 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 24270480  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270479 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 24270380  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |  |||    
T  24270379 cagaagatcatcaataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaatagcacg--tcc 24270282  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  24270281 aatgtttgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaaatgtcaatgaatgaacctcattc 24270182  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  24270181 ttttgac 24270175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 41780683 - 41781089
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41780683 cagagacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41780782  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41780783 gtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgc 41780882  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41780883 cagaagttcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 41780982  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780983 aatattcaaccagcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 41781082  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  41781083 ttttgac 41781089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49397047
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  49396897 aagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaat 49396996  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49396997 gttcgatcgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 49397047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17686577 - 17686168
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17686577 cagagacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaac 17686478  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686477 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17686378  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17686377 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttcctctggatagggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 17686278  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc---tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |  || || ||| ||||| | |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17686277 agcatacgtccggcattcccgttgttccttttaaaagaataaattcatgttaggcgtgtaatttagatgaaggtattgaagtttcaaggaatgcacctca 17686178  T
Q  408 ttcttttgac 417  Q
    || |||||||    
T  17686177 tttttttgac 17686168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 35184963 - 35185367
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35184963 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35185062  T
Q  114 acgagcatgttttggg-agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185063 acgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35185162  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  35185163 gaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaa 35185262  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    | ||||||| | ||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35185263 tgttcgaccaagattccgattgttcttgtcaaaatattatgttcttgttatggcggtttaaatgaaagtattgaagtgtcaatgaatggatctcattctt 35185362  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  35185363 ttgac 35185367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 417
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778475
Alignment:
Q  51 ccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgga 150  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  151 tcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcca 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccg 37778308  T
Q  251 actacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagatt 350  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  37778309 cctacaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaatattcgaccgacattcctattgttccattcaaaagatt 37778408  T
Q  351 aaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    || ||| ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37778409 aagttcatgttaggatggtttagattaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgac 37778475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 13283697 - 13284097
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  13283697 gagacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacat 13283796  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  13283797 gacgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgcca 13283896  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | | ||| ||    
T  13283897 gaagatcgtgattaggta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaatggcaagactcgaa 13283992  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13283993 tattcgtccgacattcccattgttcctttcaaacgattaaattcttgttagactggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaaatgacctcattctt 13284092  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  13284093 ttgac 13284097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 18170015 - 18170413
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  18170015 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18170114  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18170115 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgc 18170214  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | |||  |    
T  18170215 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgcatgcaccttccaactaaaacttttgtgttcctctggatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctc 18170314  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
       ||||| || ||||||   || || || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  18170315 cgcattcgcccaacattcatgttttttctttgaaaggattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcatgaaatgaacctcatt 18170413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12791489 - 12791092
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12791489 cagagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12791390  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791389 gtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 12791290  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  12791289 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcc 12791193  T
Q  309 ccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
      |  ||||| |||||||||   || ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12791192 ttagcattcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattctttttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaattaacctcat 12791093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 17372717 - 17373120
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||     
T  17372717 cagagacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaat 17372816  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17372817 gtgaagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgc 17372916  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  17372917 cagaagatcgtcattaggtatggaa---atgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactca 17373013  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    || ||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17373014 aacattcgcccgacatttcaattgttcctttcacaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattc 17373113  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  17373114 ttttgac 17373120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 409
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658860
Alignment:
Q  23 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgac 320  Q
    |||||||| || | |  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||||| |    
T  3658675 attaggtagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctcaacattcgcc 3658771  T
Q  321 cgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3658772 cgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggatggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 3658860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35526391 - 35526007
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||      
T  35526391 gagacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacga 35526292  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35526291 gacgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcta 35526192  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
                        |||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  35526191 --------------------gaatgaatgcaccttatagctacaacaaaggtcttcttttgaatggggtaattcaaactttccaaacggcaggactccaa 35526112  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35526111 tatttgaccggcattcccattattcctgtcaaaagattaaattcttgttagtccggtttaaatgaaggtattgaattgtcaaggaatagacctcattctt 35526012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 137 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533096
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgtt 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgttttcctctaactggggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattctcattgtt 40533177  T
Q  337 cctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40533176 cctgtcaaaagattaaattcttgataggccgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgac 40533096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 17697036 - 17697422
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||    
T  17697036 cagagacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaac 17697135  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17697136 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgc 17697235  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaat-ggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||| |||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||     
T  17697236 cagaagatcgtgattaggt----aaggaatgcaccttccaactacaacagttgtcttcctttaaatgggggtaattcaaacttgtcaaacgacaagtctt 17697331  T
Q  310 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 400  Q
    ||  |||||  |   ||||   || || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17697332 catcattcgctcatgattcatgttttttctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 17697422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 49427377 - 49427773
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  49427377 cagagatacaaggatggtgttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaac 49427476  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49427576  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  49427577 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 49427673  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49427674 gagcatttcgctcggcattcatgtttttcgtttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 49427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42571992 - 42571594
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42571992 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42571893  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42571892 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42571793  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||  || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | |    
T  42571792 cagaagatcgtcattacttaaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagac 42571696  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || || | ||||  ||||||||   || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42571695 tcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcatttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 42571597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 35576331 - 35576618
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  35576331 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35576430  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576431 gacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35576530  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35576531 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacgg 35576618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484573
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     |||||||||||||||| || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatatggtaattcaaacttgccaaacg 21484573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 19160307 - 19160592
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19160307 cagagacacgaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19160406  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19160407 gtgacgactatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19160506  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19160507 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 19160592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363623
Alignment:
Q  24 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgt 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtca 223  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| |    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  224 ttaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccga 323  Q
    ||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |  | ||| |||||||| ||||    
T  24363803 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactt---------gttgactcaaatattcgcccga 24363717  T
Q  324 cattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  24363716 cattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgtgaggctggtataaatgaaggtattgaagtgttaaggaatgcacctcattctgttgac 24363623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13635117
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||   ||| ||| |     
T  13635310 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaaccacaacaattgtcttcctttgaatgagatcaatttaaacctgccaaacaacaggactcgag 13635214  T
Q  313 ta-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
     | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||| ||||||||    
T  13635213 catttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aggcgtgaaggaatgaacctcatt 13635117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39224413 - 39224018
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39224413 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaac 39224314  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||    
T  39224313 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgc 39224214  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  39224213 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggac 39224117  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  39224116 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttccgttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaagatatt-aagtgtcgaggaatgaacctc 39224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39857120 - 39856817
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  39857120 gagacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 39857021  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39857020 gacgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 39856921  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||||    
T  39856920 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 39856824  T
Q  313 tattcga 319  Q
     ||||||    
T  39856823 cattcga 39856817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29762436 - 29762039
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  29762436 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 29762337  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  29762336 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgcc 29762237  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    || ||||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  29762236 agaagatcatcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 29762140  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  ||  ||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29762139 aagcatttcgctcggaattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 29762041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 48215191 - 48215404
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48215191 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatg 48215290  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48215291 acgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48215390  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     |||| ||||||||    
T  48215391 aagatagtcattag 48215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 18842431 - 18842849
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  18842431 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 18842530  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  18842531 gacgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgcca 18842630  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatg--------------aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaa 298  Q
    | ||||||  |||||||| |||  |              |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||    
T  18842631 gaagatcgggattaggtagggatcgtgattaggtagtgaaatgcaccttccaactacaataattgtcttcctttggatgtggtaattcaatcttgttaaa 18842730  T
Q  299 cgggaggtctccaa-tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaagga 397  Q
    ||| | || |||||  ||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  18842731 cggca-gtttccaagcattcacccgacatttatattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagataaaggtattgaagtgtcaaaga 18842829  T
Q  398 atggacctcattcttttgac 417  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  18842830 atgcacctcattcttgtgac 18842849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 51269792 - 51270189
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51269792 cagagacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 51269891  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51269892 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51269991  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||| ||||   ||| ||    
T  51269992 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgctaaacaacaggact 51270088  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51270089 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattattgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 51270187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27486906 - 27486509
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27486906 cagagacacaaggagggtagatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 27486807  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  27486806 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 27486707  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    | | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||| ||||||||   ||  ||    
T  27486706 ctgaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgccaaacaacagaact 27486610  T
Q  309 ccaatatt-cgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  ||| ||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27486609 caagcattccgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 27486511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 44597691 - 44598088
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44597691 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44597790  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  44597791 gtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 44597890  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    | | ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||    
T  44597891 cggaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 44597987  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
         | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44597988 tttgcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 44598086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27035534 - 27035136
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27035534 cagagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaac 27035435  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |    
T  27035434 gtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccac 27035335  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaac-gggaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  27035334 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacagccaggac 27035238  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || || | ||||  ||||||||   || ||||| | || | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27035237 tcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaacaaattaaattctttttaggctggtttaaataaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctc 27035139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44337535 - 44337138
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  44337535 cagagacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaac 44337436  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  44337435 gtgacgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgc 44337336  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  || ||| | ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||    
T  44337335 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaaatgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 44337239  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  ||||||||   || ||||| | |||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44337238 caagcatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaatactaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 44337140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 5765198 - 5765597
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  5765198 gagatacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaactt 5765297  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  5765298 gatgagcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgcca 5765397  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||   |  ||||||||||||  |||||  || ||   ||    
T  5765398 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttatcctgaa-atgaaaattcaaacttgttaaacgccagttcctaaa 5765492  T
Q  313 tattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
     ||||  ||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5765493 cattcacccggcagttct-attgttccattcaaaagattaaatttcttttaggctgatttagatgaaggtattaaagtgtcaaggaatgcacctcattct 5765591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 29435963 - 29436179
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29435963 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 29436062  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||    
T  29436063 gtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagc 29436162  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29436163 cagaagatcgtcattag 29436179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689507
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||||  | | |||     
T  45689312 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattggataattcaaacttgccaaacggccatgactca 45689408  T
Q  311 aata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  | |||| || || |||   || |||||   |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45689409 agcatttcgcccaacgttcatgtttttccttcgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 45689507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47488245 - 47487855
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  47488245 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 47488146  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  47488145 catgttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagat 47488046  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata- 314  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |  |     
T  47488045 cgtcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcat 47487949  T
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47487948 ttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgagggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 47487855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49263202 - 49262915
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  49263202 gagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgt 49263103  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |    
T  49263102 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctcta 49263003  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    | | ||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49263002 gaatatcttcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtgattcaaacttgccaaacgg 49262915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48568334
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaa 298  Q
     |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  48568417 aagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaactcaaacttgccaaa 48568334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180098
Alignment:
Q  43 ataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcact-tgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatg 241  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| || || | |  ||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtg 46180267  T
Q  242 caccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgacattctcattgttc 337  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |  | |||| ||  | |||   || |||    
T  46180266 ca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttc 46180169  T
Q  338 ctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46180168 ctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaagtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 46180098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874811
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||  ||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||||||||||||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
     ||||||| ||||| || || | |  ||||  ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41874897 aagatcgttattagttagggtaag-gtgca--ttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 41874811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309654
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtga------cgagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||     
T  30309845 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttacctccgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccaggactca 30309749  T
Q  311 aatattcgac-cgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 405  Q
    |  |||  || || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30309748 agcatttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattattgttagactggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacct 30309654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50068475 - 50068186
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||     
T  50068475 cagagacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaat 50068376  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  50068375 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgc 50068276  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || | || |  | ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50068275 cagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttagctctgaaatggggtaatgcaaacttgtcaaacgg 50068186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49599090 - 49598921
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49599090 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaac 49598992  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaac 181  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49598991 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 417
Target Start/End: Original strand, 16081298 - 16081679
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16081298 acgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttggagca 16081397  T
Q  134 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgg 233  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||  |||||||||  ||||  | || ||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| |     
T  16081398 caacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggtagg- 16081496  T
Q  234 aatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccga-cattctc 330  Q
       |||||||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| |||| ||||||| |||| |  || || | || |||| ||| |  | ||      
T  16081497 ---gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttactctaaaatggggtaaatttaaacttgtcaaatgacagttcccaaacattc-acctagaagtcct 16081592  T
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16081593 attgttcctttcaaaaaattaaattttttttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgac 16081679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16532304 - 16531904
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  16532304 gagacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 16532205  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||| || |||||||| | |||| || | ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  16532204 gatgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgcta 16532105  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||   || ||||||||||||  ||||   || || | ||    
T  16532104 gaagatcgtgattaggtatg----gaatgcatcttccaactacaacaattgtcttaccctgaa-atggaaattcaaacttgttaaacaccagttcccaaa 16532010  T
Q  313 -tattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
     | |||  ||  || |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16532009 cttttcacccagcagttct-attgttccattcaaaagattaaattcattttaggctagtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattc 16531911  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  16531910 ttttgac 16531904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707355
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacct 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || || | |  ||||  |    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcataagttagggcaag-gtgca--t 29707525  T
Q  247 tccaactacaacaattgtctt----cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgacattctcattgttcct 339  Q
    | ||||| |||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  | ||||  || |||||   || |||||    
T  29707524 tacaactgcaacaattgtcttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggtcaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcct 29707425  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  29707424 ttgaaaagattaaattcttgttagactggtttagatgaatgtatt-aagtgtcaaggaatgaacttcattc 29707355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37778625 - 37778471
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||      
T  37778625 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccat 37778526  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  37778525 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 37778471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 253 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16098063 - 16097898
Alignment:
Q  253 tacaacaattgtcttcctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagatta 351  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || | |  ||||   | ||||||   |||||| | |||||||||||    
T  16098063 tacaacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacgggagttcccaagcattcactcaacattcatgttgttcttttcaaaagatta 16097964  T
Q  352 aattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16097963 aattcttgttaggctggtttagatgaaagtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 16097898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 35525857 - 35526011
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||      
T  35525857 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgtttgaccgacattcccatagttccat 35525956  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  35525957 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 35526011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 367
Target Start/End: Original strand, 49926038 - 49926166
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcc 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  49926038 tgcacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacatttccaatgttcc 49926137  T
Q  339 tgtcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
      |||||||||||||||||||||||||||    
T  49926138 attcaaaagattaaattcttgttaggctg 49926166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 14173418 - 14173572
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||      
T  14173418 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgcagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccggcattcccatagttccat 14173517  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14173518 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 14173572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 24270025 - 24270179
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||      
T  24270025 accttccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccatagttccat 24270124  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||| |||||||||    
T  24270125 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgactgtattcaagtgtcaa 24270179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36910106 - 36909953
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||      
T  36910106 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaaattgccaagcagcaggactccaatgttcgatcgacattc-catagttccat 36910008  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  36910007 tcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacagtattcaagtgtcaa 36909953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  67 ggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 24363472 - 24363627
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttc-ctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| | | |||||||| ||||||||| ||||||| |      
T  24363472 accttccaactacaacaattgtcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggacacaaatattcgtccgacattcccattgtttcat 24363571  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggct--gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  24363572 tcaaaagattaaattattgttaggcttggttttaaatgatggtattgacgtgtcaa 24363627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13973470 - 13973348
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  13973470 accttccaactacaacaattgttttacctttgaatgtagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 13973371  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13973370 tcaaaagattaaattcttgttag 13973348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35185517 - 35185363
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||      
T  35185517 accttccaactacaacaattgtgtcacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacgttcgaccaacattcccatagttccat 35185418  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  35185417 tcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 35185363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16098146 - 16098078
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16098146 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 384
Target Start/End: Original strand, 35586592 - 35586736
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||| ||| ||| | | ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  35586592 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaatttaaatttgtcaagctgcaggactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 35586691  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtatt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  35586692 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatt 35586736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Original strand, 22527680 - 22527782
Alignment:
Q  194 caaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527680 caaaagtttgatttcgccagaagatcatcattagttagggtaagg-tgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 22527776  T
Q  294 ccaaac 299  Q
     |||||    
T  22527777 tcaaac 22527782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41781215 - 41781113
Alignment:
Q  266 ttcctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  41781215 ttcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttattaag 41781116  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  41781115 ctg 41781113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Original strand, 18170606 - 18170667
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18170606 ggaatgaatgcaccttccaacaacaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttg 18170667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6436318 - 6436174
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||| ||||| || |||| |      
T  6436318 acctcccaactacaacaattgttttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagtaggaggactctaaaattcgaccggcattcccaatgtttcat 6436219  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtatt 384  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  6436218 tcataagattaaatttttgttaggctgagattaaatgatggtatt 6436174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23343186 - 23343033
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||||| |||||||||||  || ||||||      
T  23343186 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccaatatacgaccgacatttccaatgttcc-a 23343088  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    | |||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| | |||||||    
T  23343087 ttaaaaaattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaggtgtcaa 23343033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Original strand, 18170765 - 18170826
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18170765 ggaatgaatgcaccttccaacagcaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttg 18170826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 40532946 - 40533069
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | | | | ||||||||| |||||| |||||||||  ||||      
T  40532946 accttccaactacaacaatcgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcagcacgactccaatatacgaccggcattctcataattccgt 40533045  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40533046 tcaaaagattaaattcttgttagg 40533069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 48226860 - 48226925
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48226860 aaaagattaaattcttgttaggctagtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 48226925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 49397198 - 49397244
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397198 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 49397244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 49598774 - 49598709
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  49598774 aaaagattaaattcttgttatgctggtttaaatgaaggtatt-aagtgttaaggaatgaacctcatt 49598709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13284253 - 13284093
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattg 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||| | |   ||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  13284253 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcatcactcaaatatccgtccggcattctcattg 13284154  T
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||  |||||||||| | || || || ||| || ||||||||| |||||| || ||||||    
T  13284153 ttccattcaaaagattcagttatttttgggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaa 13284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49397129 - 49397049
Alignment:
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49397129 ttcgactgacattcccatagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacggtattcaagtgtcaa 49397049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Original strand, 13973481 - 13973524
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13973481 aactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 13973524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 47487699 - 47487754
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47487699 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 47487754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51270344 - 51270289
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51270344 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaac 51270289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14772594 - 14772499
Alignment:
Q  165 atgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |  |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  14772594 atgttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaagaattgt 14772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 23343194 - 23343240
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23343194 tccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttg 23343240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 29436295 - 29436360
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29436295 aaaagattaaattcttgtcaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtctaggaatgaacctcatt 29436360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35586571 - 35586525
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35586571 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 35586525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38044844 - 38044798
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38044844 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 38044798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42571428 - 42571382
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42571428 tccaactgcaacaattgtcttcctttgagtggggtaattcaaacttg 42571382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50067923 - 50067841
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  50067923 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaaccggcaggactccaacattcga 50067841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 394
Target Start/End: Original strand, 17686015 - 17686172
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |   ||| |||||   | || |||  |||| | ||||||    
T  17686015 tgcaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcatcaggactccagcgtacgtccggtattcccgttgttc 17686114  T
Q  338 ctgtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  17686115 cattcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaa 17686172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3659013 - 3658961
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3659013 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 3658961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12790925 - 12790853
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  12790925 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 12790853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262429
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcc 19262429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21484339 - 21484263
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| || |||||| ||||||| || |||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21484339 tcaaaaaatcaaattcatgttaggttggtttagatgaaggcaataaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 21484263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 29707201 - 29707256
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29707201 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgctaaac 29707256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46179943 - 46179888
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  46179943 aatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 46179888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 49262659 - 49262714
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49262659 ttccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 49262714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 50067921 - 50067976
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50067921 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaac 50067976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5765647 - 5765593
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  5765647 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 5765593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 6436326 - 6436372
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6436326 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcaaacttg 6436372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13634963 - 13634881
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  13634963 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 13634881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 21484213 - 21484267
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21484213 tcaaaagattaaattcttgttagactcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaa 21484267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 29436513 - 29436595
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  29436513 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 29436595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 36910114 - 36910160
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36910114 tccaactgcaacaatcgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 36910160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40532938 - 40532892
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  40532938 tccaactacaacaattgtcttcctctaaatgaggtaattcaaacttg 40532892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41874767 - 41874703
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41874767 aaaagaataaatt-ttgttaggatgatttagacgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatt 41874703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47487701 - 47487619
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| | | |||||||||||||    
T  47487701 gaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcatgactccaatattcga 47487619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49262561 - 49262523
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49262561 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49262523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 388
Target Start/End: Original strand, 14772337 - 14772394
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaag 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||    
T  14772337 attgttcctttcaaaagattaaattcttgttagtttggtttagatgatggtattgaag 14772394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24270014 - 24269945
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  24270014 aactgcaacaattgtcttcttttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 24269945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Original strand, 48227077 - 48227134
Alignment:
Q  236 tgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  48227077 tgaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttg 48227134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Original strand, 49427927 - 49428008
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  49427927 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggtaggactccaacattcga 49428008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17685927 - 17685883
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17685927 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 17685883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17686010 - 17685939
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||    
T  17686010 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaat-gagtaattcaaatttgttaaacggaaggactccagtattcga 17685939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 19160637 - 19160700
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  19160637 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 19160700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29761813 - 29761757
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  29761813 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 29761757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 36910198 - 36910242
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36910198 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 36910242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 297
Target Start/End: Original strand, 38044852 - 38044908
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38044852 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 38044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 394
Target Start/End: Original strand, 38046160 - 38046248
Alignment:
Q  307 ctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | || |  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| || ||||||    
T  38046160 ctccaatattcgaccggcattcccaatatttcattcaaaagattaaattcttgttaggctcggattaaatgacggtattcaaatgtcaa 38046248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 39223708 - 39223752
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39223708 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 39223752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 45689661 - 45689717
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  45689661 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttg 45689717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48568070 - 48568014
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  48568070 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctagatggggcaattcaaacttg 48568014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17373275 - 17373148
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtct-tcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgt 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | ||||||   ||| |    
T  17373275 aatgtaccttccaactacaataattgtctaacccctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacattcgtctgacatttctatttt 17373176  T
Q  336 tcctgtcaaaagattaaattcttgttag 363  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||    
T  17373175 tccattcgaaagattaaattcttgttag 17373148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 417
Target Start/End: Original strand, 18170861 - 18170908
Alignment:
Q  370 ttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18170861 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgac 18170908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 30309495 - 30309550
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30309495 ttccaactacaacaattgtcttacctgtgaatggggtaaattcaaacctgccaaac 30309550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Original strand, 35185540 - 35185583
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35185540 aactgcaacaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaaacttg 35185583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 41781216 - 41781267
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41781216 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaacggggtaattcaaacttg 41781267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45689663 - 45689608
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45689663 ttcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaac 45689608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13634863 - 13634825
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13634863 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 13634825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 13973568 - 13973606
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13973568 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 13973606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14173410 - 14173364
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  14173410 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgcggtaattcaaacttg 14173364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 15471510 - 15471568
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggaga 71  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  15471510 gagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgttcgacgaggggaga 15471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 16531854 - 16531908
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||    
T  16531854 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaa 16531908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18170572 - 18170514
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18170572 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaac 18170514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18170731 - 18170673
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18170731 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaac 18170673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 19160957 - 19160995
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19160957 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 19160995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24269927 - 24269889
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24269927 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 24269889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 267
Target Start/End: Original strand, 27034786 - 27034816
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27034786 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 27034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 29436613 - 29436651
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29436613 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 29436651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29761713 - 29761675
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29761713 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 29761675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35525841 - 35525803
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35525841 caacagttgtcttcctttgaatggggtgattcaaacttg 35525803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39856799 - 39856761
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39856799 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 39856761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41874454 - 41874416
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41874454 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 41874416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46179847 - 46179809
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46179847 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 46179809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46924838 - 46924800
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46924838 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 46924800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47487601 - 47487563
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47487601 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 47487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48567970 - 48567932
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48567970 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 48567932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 48707132 - 48707090
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaac 55  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48707132 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 49397188 - 49397134
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaa 297  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49397188 cttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaa 49397134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 49428026 - 49428064
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49428026 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49428064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 49598552 - 49598498
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaact 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||    
T  49598552 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaact 49598498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 50067823 - 50067785
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50067823 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 50067785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 50068142 - 50068077
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50068142 aaaatattaaattcttgttatgctagttttgatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 50068077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 51270342 - 51270424
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  51270342 gaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 51270424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 51270442 - 51270480
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51270442 ggtattcaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgac 51270480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3659349 - 3659308
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3659349 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggg 3659308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27034982 - 27034933
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattc 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  27034982 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattc 27034933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29707103 - 29707066
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29707103 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 29707066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14772755 - 14772687
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  14772755 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttca 14772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 17685770 - 17685834
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17685770 gaatgtaccttccaactacaacaattatcttacctctgaatgggataaattcaaacttgctaaac 17685834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17697568 - 17697508
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  17697568 gcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggataaattcaaactcgccaaac 17697508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19160857 - 19160913
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||    
T  19160857 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttg 19160913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 22527827 - 22527890
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22527827 aaaatataaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 22527890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 22528047 - 22528103
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  22528047 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttg 22528103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 27034980 - 27035036
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27034980 ttccaactacaataattgtcttacctttgaaatggggtaaattcaaacttgccaaac 27035036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29707203 - 29707147
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  29707203 gaatgcacattccaactccaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttg 29707147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 363
Target Start/End: Original strand, 31451845 - 31451877
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31451845 attgttcctttcaaaagattaaattcttgttag 31451877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38044752 - 38044716
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38044752 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 38044716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 39223614 - 39223642
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223614 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 41781305 - 41781349
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41781305 aatgatggtattcaagtgtcatggaatgcacctcattcttttgac 41781349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 42571442 - 42571494
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42571442 caactacaacaattgtgttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaaac 42571494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 45689762 - 45689798
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45689762 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 45689798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 46179945 - 46179997
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  46179945 caactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaac 46179997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 46924689 - 46924717
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46924689 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 46924717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49262661 - 49262605
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||    
T  49262661 gaatgcacgtttcaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaacttg 49262605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49598458 - 49598414
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49598458 aatgatggtattcatgtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49598414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 191)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51013493 - 51013087
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51013493 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51013394  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013393 gtgacgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 51013294  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51013293 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 51013194  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51013193 aatattcgaccggcattcctattgttcttgtcaaaagattaaatttttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattc 51013094  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  51013093 ttttgac 51013087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 55207099 - 55206693
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  55207099 cagagacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 55207000  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55206999 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 55206900  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||     
T  55206899 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaatacaaacttgtcaaacggcaggtctct 55206800  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55206799 aatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattc 55206700  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  55206699 ttttgac 55206693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 2428491 - 2428897
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2428491 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2428590  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428591 gtgacgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2428690  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2428691 tagaagatcgtcattaggtacataatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 2428790  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428791 aatattcgaccgacattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 2428890  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  2428891 ttttgac 2428897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 41803906 - 41804312
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41803906 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41804005  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41804006 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgc 41804105  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41804106 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcactttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggaaggtctcc 41804205  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41804206 aatattcgaccgacattcccattgtttctgttaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattc 41804305  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  41804306 ttttgac 41804312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 417
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578315
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 41578117  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcg 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41578118 catcattaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcg 41578217  T
Q  319 accgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41578218 accaaca-tctcattattcctgtcaaaatattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgac 41578315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46414549 - 46414143
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46414549 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46414450  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46414449 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46414350  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||    
T  46414349 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtagttcaaacttgccaaacggcatgactcc 46414250  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46414249 aatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcgatgaatggacctcattc 46414150  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  46414149 ttttgac 46414143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34471885
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  34472088 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaat 34471989  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34471988 gttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttt 34471889  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  34471888 tgac 34471885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 30192542 - 30192948
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30192542 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 30192641  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     || | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192642 gtgtctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 30192741  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||    
T  30192742 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttcttcctttgaatgaggtatttcaaacttgccaaacggcaggagtcc 30192841  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30192842 aatatctgaccgacattctcattgttcctatcaaaggattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggaccttattc 30192941  T
Q  411 ttttgac 417  Q
     ||||||    
T  30192942 gtttgac 30192948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 414
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015684
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  51015484 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcgaacttgccaaacggcaggactccaat 51015583  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51015584 attcgacccgcattcccattgtccctgtcaaaagattaaattcttgttagtccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttt 51015683  T
Q  414 t 414  Q
    |    
T  51015684 t 51015684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 7246101 - 7246504
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7246101 agacacaagaagagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7246200  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246201 acgagcatgttttgggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7246300  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7246301 aagatcgtcattaggtatggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctccaat 7246400  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7246401 attcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgttaaggaatggacctcattcttt 7246500  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  7246501 tgac 7246504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 43569914 - 43570320
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  43569914 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaac 43570013  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43570014 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 43570113  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43570114 cagaagatcgtctttatgtacggaatgactgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcacgtctcc 43570213  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43570214 aatattcgactggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggcttgtttaaatgaaagtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattc 43570313  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  43570314 ttttgac 43570320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52569623 - 52569218
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  52569623 cagagacaaaaggatggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaag 52569524  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52569523 -tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgc 52569425  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52569424 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 52569325  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  52569324 aatattcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcgttc 52569225  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  52569224 ttttgac 52569218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100274
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||  ||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  45100477 aatatcgtcattaggtactgaatgaatgcactttttagctactacaattgtctttctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggaatccaat 45100378  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45100377 gttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttattaggccggtttaaataaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttt 45100278  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  45100277 tgac 45100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34647480 - 34647076
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  34647480 gagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 34647381  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34647380 gacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcta 34647281  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||   | | ||||||    
T  34647280 gaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttctagctgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcgaacttgttaaacaacacgactccaa 34647181  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34647180 tgttcgaccgacattctcattgttcctgtcgaaagattaaattcttgttagggcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattctt 34647081  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  34647080 ttgac 34647076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 106 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346421
Alignment:
Q  106 aaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  206 tccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggagg 305  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcagg 46346533  T
Q  306 tctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346532 tctccaatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaacgattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 46346433  T
Q  406 cattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||    
T  46346432 cattcgtttgac 46346421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 14631449 - 14631855
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  14631449 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaac 14631548  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14631549 gtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgc 14631648  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  14631649 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccatccagctacaacaactgtcttcctttgaacggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactcc 14631748  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  14631749 aatgttctaccggcattcccattgttcctatcaaaagattaagtttttgttaggccggtttaaatgaagtaattgaagtgtcaatgaatggacctggttc 14631848  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  14631849 ttttgac 14631855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Original strand, 49273404 - 49273809
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||     
T  49273404 agagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacg 49273503  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  49273504 tgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttcc 49273603  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || | | |||||    
T  49273604 agaatatcgtcattaggtcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacatgccatatggcatgactcca 49273703  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49273704 atgttcgactgacattcccattgttcatgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaatgaatggacctcattct 49273803  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  49273804 tttgac 49273809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 7954209 - 7954614
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaagggg-agagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||      
T  7954209 gagacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 7954308  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||     
T  7954309 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgct 7954408  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  7954409 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaagactcca 7954508  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    | |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7954509 acattcgatcgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgatggtaatcaagtgtcaaggaatgcacctcattct 7954608  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  7954609 tttgac 7954614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 50 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323199
Alignment:
Q  50 tccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgg 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  150 atcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcc 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttcc 42323366  T
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagat 349  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  42323365 agctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttggcaaacgacatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttactgtcaaaa-at 42323267  T
Q  350 taaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42323266 taaatttttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgtacctcattcttttgac 42323199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 37281459 - 37281854
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  37281459 agacacaaggatgatggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 37281558  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37281559 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccag 37281658  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||  | |||  ||      
T  37281659 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtgttcctatggatgaggtaattcaaacttgtcaaacgacaagtcatcagc 37281758  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  37281759 attcgcccgacattcatatttttcctttgaaaagattaaattattgttaagctgatttagatgaaggtattgaaatgtcaagaaatgaacctcatt 37281854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721206
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||  | |||  ||      
T  36721401 aagatcgtcatttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtgttcctctggatgaggtaattcaaactagccaaacgacaagtcctcagc 36721302  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| ||  |||||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36721301 attcgcccatcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaagctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 36721206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33448964
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc------------tgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||     
T  33449163 aagatcgtaattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgttttcctctggatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcaaac 33449068  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  33449067 attcgtcagacatttccattgttcctttcaaaagattaaattgttgttaggttgatttagatgacagtattgaagtgtcaataaatggaccttattcttt 33448968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13896084 - 13895687
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  13896084 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacg 13895985  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13895984 tgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 13895885  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtct 308  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  13895884 agaagatcgtcattagttaaggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccaggact 13895788  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  13895787 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacttca 13895689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8633572 - 8633174
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  8633572 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 8633473  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||  || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  8633472 gacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgcca 8633373  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | |||||||||||||||||     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8633372 gaagatcgtcattaggtac----cgaatgcacc--ccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccag 8633279  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
     |||||| || ||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8633278 cattcgatcggcatttctattgttcctttcaaaagattaaatttttgttagaccagtttaaataaaggtattgaagtgtcaatgattgcacctcattctt 8633179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 6754210 - 6754612
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  6754210 gagacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6754309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |    
T  6754310 gacgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcta 6754409  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||| |||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||  || | || |    
T  6754410 gaagatcgtgattatgtaggga---aatgcaccttccaactacaacaactgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacgacagttttcaa 6754506  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    | ||||  | ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6754507 acattcaccagacatgcctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaatgtattgaagtgttaaggaatgaacctcattct 6754606  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  6754607 tttgac 6754612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 44927469 - 44927865
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  44927469 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 44927568  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927569 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 44927668  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt--tgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctc 309  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  44927669 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctaaaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggtcaggactc 44927765  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44927766 aagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttaggatggtttagatgaatgtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 44927864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 50458906 - 50458541
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  50458906 cagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaac 50458807  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50458806 ttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 50458707  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||                 |  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  50458706 ctgaagatcgtcattaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaattgtc-----------------aaacaaacttggcaaacggcaggactcc 50458624  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtca 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  50458623 aatattcgaccgacattcgcattgttcctgtcaaaagattaaatttttgttaggccggtttaaatgaaggtatagaagtgtca 50458541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34693503 - 34693107
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |    
T  34693503 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgt 34693404  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34693403 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgcca 34693304  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctc 309  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||    
T  34693303 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagactc 34693207  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  ||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34693206 aagcatttcgcgcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagactggtttatatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 34693108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702089
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatta-cgaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  24702284 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactca 24702188  T
Q  311 aata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24702187 agcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 24702089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2268424
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2268506 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 2268424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3495244 - 3494966
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3495244 cagagacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3495145  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3495144 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgc 3495045  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495044 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 3494966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2647091 - 2646806
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2647091 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2646992  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2646991 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2646892  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
     || ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2646891 tagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacctgtcaaac 2646806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 36135013 - 36135296
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  36135013 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36135111  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36135112 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36135211  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    || |||| |||||||| ||  | | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36135212 agaagattgtcattagttagagtaag-atgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 36135296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19453444 - 19453046
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19453444 cagagatagaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19453345  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19453344 gtgacgagcatgttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccac 19453245  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||| ||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||  | | |    
T  19453244 cagaagatcatcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgac 19453148  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  ||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19453147 tcaagcatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaagaatgaacctc 19453049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4004302 - 4004017
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  4004302 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4004203  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4004202 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 4004103  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || | || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4004102 cagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 4004017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464158
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagt 214  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||     
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
    ||||||| ||||  || |||   ||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||  |||| | || | || ||     
T  6464356 agatcgtgattatataggga---aatgcaccttccaactacaacaactctcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacagcagttttctaac 6464260  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6464259 attcatccgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattctttttaggctagtttagatgaaggtattaaagtgttaaggaatgaacctcattcttt 6464160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10053485 - 10053236
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  10053485 agagacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 10053386  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10053385 tgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgcc 10053290  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10053289 agaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 10053236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49140269 - 49139984
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  49140269 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 49140170  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140169 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49140070  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49140069 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 49139984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 54390446 - 54390731
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54390446 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 54390545  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54390546 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 54390645  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54390646 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 54390731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 34049731 - 34050016
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34049731 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34049830  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049831 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34049930  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34049931 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 34050016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 46403007 - 46403292
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46403007 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46403106  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46403107 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46403206  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46403207 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 46403292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42950235 - 42949837
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  42950235 cagagacgcaagaagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaac 42950136  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42950135 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42950036  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg-ggaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||   ||| |    
T  42950035 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacgcctaggac 42949939  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  |  ||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42949938 tcaagcatttcgctcagcatttatatttttcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 42949840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47760106 - 47759879
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  47760106 cagagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 47760007  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47760006 gtgacaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 47759907  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatga 238  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47759906 cagaagatcgtcattaggtaccgaatga 47759879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416764
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  39416960 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggccaggactca 39416864  T
Q  311 a--atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
    |  || ||||  |  ||||    || ||||| | |||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39416863 agcattttcgctcagcattaatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgctaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcat 39416765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25576806 - 25576409
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  25576806 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 25576707  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  25576706 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgt 25576608  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||  || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | |    
T  25576607 cagaagatcgtcattatttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgac 25576511  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25576510 tcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 25576412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 49218950 - 49218554
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||     
T  49218950 agagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacg 49218851  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49218850 tgacgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgcc 49218751  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    || ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| || |||||   ||| |||    
T  49218750 agaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacaggactc 49218654  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49218653 gagcatttcgctcggcattcatgtttttcttttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 49218555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 43477061 - 43477458
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43477061 cagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43477160  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  43477161 gtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgc 43477260  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacgg-aatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||  || || ||||  ||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   |||      
T  43477261 cagaagatcgtcattaattagggtaatg--tgca--ttccaacttcaacaactgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggag 43477356  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || || || | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43477357 tcaagcatttcgctcggcattcatgttttttctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 43477455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Original strand, 47065691 - 47066086
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||     
T  47065691 cagagacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaat 47065790  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  47065791 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgc 47065890  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||  |   |    
T  47065891 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacggccataac 47065987  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | |||| ||  | |||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47065988 tcgagcatttcgtccagcgttcatatttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 47066086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087369
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||  || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  48087564 aagatcgtcattaattagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactca 48087468  T
Q  311 aata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  | ||||  |  |||||   || || || | |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48087467 agcatttcgctcagcattcatgttttttctttgaaaagaataaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatt 48087369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 42383055 - 42383453
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42383055 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42383154  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42383155 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42383254  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||   || |  | |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  | | |    
T  42383255 cagaagatcgtcatta-gttggga--caaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgac 42383351  T
Q  308 tccaatattcgac-cgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || || |||  || || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42383352 tcaaacatttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggcttgtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 42383450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 49610493 - 49610772
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  49610493 cagagacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 49610592  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49610593 gtgacgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49610692  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||    
T  49610693 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggacaattcaaacttg 49610772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 774551 - 774162
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||| |    
T  774551 gagacacgaggagagtggaatgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgt 774452  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  774451 gaagaacatgttttcggagcactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccacca 774352  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||   || ||||||||||||| ||| |  ||||| |||    
T  774351 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttacctctgaa-atggaaattcaaacttgctaaatgccaggtcccca 774257  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    | ||||| || ||||||   || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  774256 acattcgcccaacattcatgtttttcttttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctc 774162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997677
Alignment:
Q  72 gtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt 271  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcttt 50997649  T
Q  272 tgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50997650 tgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 50997677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44835701 - 44835304
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  44835701 agagacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 44835602  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |    
T  44835601 tgacgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtc 44835502  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtct 308  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  44835501 agaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccaggact 44835405  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44835404 caagcacttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 44835306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51695821 - 51695605
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  51695821 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatac 51695722  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51695721 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51695622  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  51695621 cagaagatcatcattag 51695605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53826911 - 53826622
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  53826911 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaat 53826812  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  53826811 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 53826712  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53826711 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgg 53826622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375694
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacga 117  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtaga 217  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||||  | |||  ||||||||||||||  | |    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaata 20375891  T
Q  218 tcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatatt 316  Q
    |||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||  |||||| || || | |   ||    
T  20375890 tcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaaaaattgtcttactctgaaatgggttaattcaaacttgttaaacggcagttcccaagcttt 20375795  T
Q  317 cgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    |  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20375794 cacccggcatttttattgttcctttcaaaagattaaatacttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 20375695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 42382275 - 42382491
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42382275 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42382374  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42382375 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42382474  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42382475 cagaagatcgtcattag 42382491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 27186952 - 27187178
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27186952 cagagacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27187051  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||    
T  27187052 atgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgc 27187151  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatg 237  Q
    ||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  27187152 cataatatcgtgattaggtagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 417
Target Start/End: Original strand, 27187543 - 27187723
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgtt 336  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||   ||||||    
T  27187543 gaatgcacattgcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcgcccgacatttctattgtt 27187642  T
Q  337 cctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27187643 catttctaaagattaaattcttgttaggccgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 27187723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 417
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18441152
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga 18440970  T
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgacc-gacattctcat 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||  ||||||  | || | |   |||  || |   |||| ||    
T  18440971 --gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggccgttcccaagccttcacccggtggttct-at 18441067  T
Q  333 tgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18441068 tgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgac 18441152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 417
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486226
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga 19486044  T
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgacc-gacattctcat 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||  ||||||  | || | |   |||  || |   |||| ||    
T  19486045 --gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggccgttcccaagccttcacccggtggttct-at 19486141  T
Q  333 tgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19486142 tgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgac 19486226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887420
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||  |  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaa 239  Q
    ||||  ||||||| ||||| | |  | |||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| || | ||||| ||||  || | |  |||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgattat-taggtagggaa 25887599  T
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| | | |  || || | |  ||||  |||  | | | |||||||    
T  25887598 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctatgaaatgggataattcaaacttgctatatgacag-tcccaagcattcacccggaagttttattgttc 25887500  T
Q  338 ctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25887499 ctttcaaaagattaaattcttgttagtttggtttatatgaaagtattgaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgac 25887420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 14265412 - 14265661
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||  || |||||| ||| |||||   |    
T  14265412 cagagacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---c 14265508  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || | || | ||| ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  14265509 gtgacgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgc 14265608  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    | | ||||||| |||||||| |    || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14265609 ctgaagatcgtgattaggtagg----gattgcactttccaactacatcaattgtctt 14265661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2429047 - 2428921
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||      
T  2429047 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 2428948  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2428947 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 2428921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14632005 - 14631851
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||      
T  14632005 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacatgccaagcagcaggactccaatgttcgacctacattcccatagttccat 14631906  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14631905 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 14631851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7246654 - 7246531
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||      
T  7246654 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcgaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 7246555  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  7246554 tcaaaaaattaaattcttgttagg 7246531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49273963 - 49273840
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |      
T  49273963 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattctcatagtttcat 49273864  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  49273863 tcaaaatattaaattcttgttagg 49273840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Original strand, 37282040 - 37282118
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37282040 agatcgttagtaggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttg 37282118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41578465 - 41578339
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  || ||||||      
T  41578465 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcggcatttccaatgttccat 41578366  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41578365 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 41578339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 55268851 - 55268753
Alignment:
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcatt 333  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  55268851 atgaatgcaccttttagctataacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccggcattcccatt 55268753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 34471735 - 34471889
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||      
T  34471735 accttccaactacaacaattgtgtttcctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattctcatagttccat 34471834  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34471835 tgaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 34471889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41804462 - 41804341
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||      
T  41804462 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 41804363  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgtta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41804362 tcaaaagattaaattcttgtta 41804341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36721020 - 36720916
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaata 314  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |    
T  36721020 agattgtcagtaggtacgaaatgaattcacctttcaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaaca 36720921  T
Q  315 ttcga 319  Q
    |||||    
T  36720920 ttcga 36720916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 394
Target Start/End: Original strand, 8633023 - 8633178
Alignment:
Q  242 caccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||| |||||| || ||||  |||||||||     
T  8633023 caccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacattcgatcggcatttccattgttcca 8633122  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  8633123 ttcaaaagtttaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaa 8633178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 51015837 - 51015686
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||      
T  51015837 acctcccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccat 51015738  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||    
T  51015737 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatttaagtgt 51015686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 417
Target Start/End: Original strand, 7954976 - 7955062
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7954976 attgttccattcaaaatattaaattcatgttacgctggtttaaataaaggtattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 7955062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637113
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaa 15637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 42323049 - 42323203
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | | | ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||      
T  42323049 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccggcattcccatagttccat 42323148  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  42323149 tcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 42323203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 52569068 - 52569194
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||  || ||||| || ||||||      
T  52569068 acctcccaactacaacaattgtcttacctgtgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgttcggcattcccaatgttccat 52569167  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52569168 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 52569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11378957 - 11378906
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378957 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 417
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637398
Alignment:
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcct 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||  | ||||||| ||| |||| |||||     |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaatt----caccttccaactacaacaattgtcttact 15637250  T
Q  271 ttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctga 368  Q
     |||| || ||||||||||||||   || ||  || |||| |  ||||  |||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||     
T  15637251 ctgaaatgaggtaattcaaacttattaagcgacagttctcaagcattcacccgacagttctaat-gttcctttcaaaagattaagttctagttagtttgg 15637349  T
Q  369 tttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15637350 ttttgatgatcgtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 15637398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 10053045 - 10053199
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||| || ||| |||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||      
T  10053045 accttccaactacaacaattttgttacctttcaataggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattcccataattccat 10053144  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttag-gctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  10053145 tcaaaagattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 10053199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 34646926 - 34647080
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||   | | ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||       
T  34646926 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacatgactccaatgtttaaccgacattcccatagttctat 34647025  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34647026 tcaaaagattaaatttttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 34647080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 46346271 - 46346397
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | | | | |||||||||| || || ||||| || ||||||      
T  46346271 accttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagcatgactccaatatttgatcggcattcccaatgttccat 46346370  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46346371 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 46346397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8632935 - 8632850
Alignment:
Q  332 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8632935 ttgttccattcaaaagattaaattcaggttaggctggtttagatgaaaatattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 8632850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27187879 - 27187719
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattg 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  | ||| ||| |||||| | ||||||||   ||||    
T  27187879 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaatagcaggactcaaatattagtccgacatttctattg 27187780  T
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||| || | ||||| | |||||| |||||||||    
T  27187779 ttccattccaaagattaaattcttgttaggcttggtataaataatggtattcaagtgtcaa 27187719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 55206543 - 55206666
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| | ||||| || ||||||      
T  55206543 acctcccaactacaacaattgtgttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcagaactccaatattcgactgccattcccaatgttccat 55206642  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  55206643 tcaaatgattaaattcttgttagg 55206666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30193098 - 30192972
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttcc-tttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||| |||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||| |   ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||      
T  30193098 acctcccaactccaacaattgtgttacatttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcaacaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccat 30192999  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30192998 tcaaaagattaaattattgttaggctg 30192972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 46413993 - 46414147
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| || | | ||  || |||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  46413993 accttacaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcagaacttcaatgttcgaccgacattcccatagttccat 46414092  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| || ||||||    
T  46414093 ttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaatgtcaa 46414147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34646899 - 34646794
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaat-ggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||     
T  34646899 agatcctcagtaggtgcagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaac 34646800  T
Q  314 attcga 319  Q
    ||||||    
T  34646799 attcga 34646794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 46346794 - 46346745
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346794 agagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42328331 - 42328288
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42328331 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 43570478 - 43570524
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43570478 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 43570524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45100126 - 45100080
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100126 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 45100080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Original strand, 51015845 - 51015910
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||    
T  51015845 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaa 51015910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43570458 - 43570350
Alignment:
Q  255 caacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaa 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  43570458 caacaattgtcttgcctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaattagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccattcaaaagattaa 43570359  T
Q  353 attcttgtt 361  Q
    ||| |||||    
T  43570358 attgttgtt 43570350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46413972 - 46413900
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  46413972 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 46413900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 13895532 - 13895587
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13895532 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaac 13895587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 293
Target Start/End: Original strand, 14632020 - 14632059
Alignment:
Q  254 acaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14632020 acaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 14632059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 24701934 - 24701989
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24701934 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 24701989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10053037 - 10052991
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10053037 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttg 10052991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Original strand, 19452806 - 19452864
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19452806 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 19452864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46346263 - 46346217
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46346263 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 46346217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 49273971 - 49274017
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49273971 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 49274017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44928020 - 44927967
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44928020 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaa 44927967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 368
Target Start/End: Original strand, 51012951 - 51013065
Alignment:
Q  248 ccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaa 345  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||        ||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||  |||||    
T  51012951 ccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgc--------aggactccaatattcgaccggcattccgaatgttccattcaaa 51013042  T
Q  346 agattaaattcttgttaggctga 368  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  51013043 aaattaaattcttgttaggctga 51013065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34692954 - 34692898
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  34692954 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttg 34692898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39416611 - 39416555
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  39416611 gaatgcacatttcaactacaacaattgtcttgctctggatggggtaattcaaacttg 39416555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 42383606 - 42383662
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  42383606 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 42383662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Original strand, 45100194 - 45100250
Alignment:
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45100194 aatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctg 45100250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 390
Target Start/End: Original strand, 6464002 - 6464156
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctc-attgt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||  | | ||| || ||||  ||||||| ||| |||||    
T  6464002 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaactttctaaacgacatgactcaaacattcatccgacat-ctctattgt 6464100  T
Q  336 tcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtg 390  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  6464101 tccattcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtg 6464156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6754766 - 6754608
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctc-attgt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || ||||  ||||||| ||| |||||    
T  6754766 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctccgaaatgtggtaaattcaatcttgctaaacagcaggactcaaacattcatccgacat-ctctattgt 6754668  T
Q  336 tcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  6754667 tccattcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 6754608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 11378639 - 11378694
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11378639 ttccaactccaacaattgtcttgcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 11378694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 25576253 - 25576308
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25576253 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaac 25576308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Original strand, 25887361 - 25887424
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  25887361 attgttccattcaaaagattaaattcttgttagtttggtttagatgatggtattgaagtgtcaa 25887424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 44835149 - 44835204
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44835149 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaaac 44835204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 2429055 - 2429101
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2429055 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaatttaaacttg 2429101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3494694 - 3494612
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||    
T  3494694 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgctaatcggcaggactccagtattcga 3494612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7954723 - 7954610
Alignment:
Q  282 aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga-ccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaag 379  Q
    |||||||||||||||||| | | | |||||| |||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  7954723 aattcaaacttgccaaacagcaagactccaacattcgatccgcgtttct-attgttccattcaaaagtttaaattcttgttaggctgagattaaatgatg 7954625  T
Q  380 gtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  7954624 gtattcaagtgtcaa 7954610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34471719 - 34471681
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34471719 caacaattgtcttcctttgaatggggtgattcaaacttg 34471681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37282013 - 37281955
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37282013 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaac 37281955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42323041 - 42322995
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42323041 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 42322995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 47066241 - 47066323
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  47066241 gaatgcacattccgactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 47066323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 49274061 - 49274099
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49274061 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49274099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 52569060 - 52569014
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52569060 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgaggtaattcaaacttg 52569014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 30193106 - 30193151
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30193106 tccaactgcaacaattgtcttcttttgaatggggtaattcatactt 30193151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 394
Target Start/End: Original strand, 33448815 - 33448968
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||| ||| |  |||| |  || |||||| ||||| ||||||||   ||||||||  |    
T  33448815 ccttccaactacaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcacactcgtaaaactgccggactccaacattcgtccgacatttctattgttccatt 33448914  T
Q  342 caaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||    
T  33448915 caaaagattaaattgttgttaggattggtttagatgatggtattcaagtgtcaa 33448968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34471636 - 34471599
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34471636 gtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 34471599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2268159 - 2268103
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  2268159 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 2268103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2646761 - 2646698
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  2646761 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 2646698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4003752 - 4003696
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  4003752 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 4003696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4003972 - 4003909
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  4003972 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 4003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11378641 - 11378585
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  11378641 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 11378585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15637446 - 15637394
Alignment:
Q  342 caaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15637446 caaaagattaaattcttgttagtttggtttagatgatggtattgaagtgtcaa 15637394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25576255 - 25576199
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||    
T  25576255 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggattgggcaattcaaacttg 25576199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 42383700 - 42383744
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42383700 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 42383744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 43477593 - 43477649
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  43477593 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 43477649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45100042 - 45099998
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45100042 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 45099998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10053230 - 10053195
Alignment:
Q  382 attgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10053230 attgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgac 10053195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 34692952 - 34693007
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34692952 ttccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttgccaaac 34693007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Original strand, 41578476 - 41578519
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41578476 aactgcaacaattgtgttcctctgaatggggtaattcaaacttg 41578519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2268059 - 2268021
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2268059 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2268021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2646441 - 2646403
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2646441 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2646403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2646541 - 2646459
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  2646541 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttgccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 2646459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Original strand, 7246670 - 7246708
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7246670 caacaattgtcttccactgaatggggtaattcaaacttg 7246708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11378541 - 11378503
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11378541 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 11378503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13895447 - 13895409
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13895447 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 13895409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 14632103 - 14632141
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14632103 ggtattgaagtgtcaaggaatgcaccccattcttttgac 14632141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18441202 - 18441148
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18441202 tcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 18441148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19452708 - 19452670
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19452708 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 19452670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19486276 - 19486222
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  19486276 tcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 19486222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24701836 - 24701798
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24701836 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 24701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 34050281 - 34050363
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  34050281 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 34050363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 34050381 - 34050419
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34050381 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 34050419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34692854 - 34692816
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34692854 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 34692816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39416511 - 39416473
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39416511 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 39416473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44835051 - 44835013
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44835051 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 44835013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44835151 - 44835097
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaact 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||    
T  44835151 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaact 44835097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 44928018 - 44928100
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  44928018 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcagttcaaacttgttaatcggaaggactccaacattcga 44928100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 46403557 - 46403639
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  46403557 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 46403639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 46403657 - 46403695
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46403657 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 46403695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49139619 - 49139581
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49139619 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49139581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49139719 - 49139637
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  49139719 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 49139637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49218300 - 49218262
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49218300 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49218262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 49610816 - 49610854
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49610816 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49610854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51012930 - 51012896
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51012930 caacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaa 51012896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51695498 - 51695460
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51695498 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 51695460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52568974 - 52568936
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52568974 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 52568936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 54390996 - 54391078
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  54390996 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 54391078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 54391096 - 54391134
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54391096 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 54391134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55206535 - 55206489
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  55206535 tccaactgcagcaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 55206489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 55268622 - 55268584
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55268622 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 55268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 416
Target Start/End: Original strand, 2429145 - 2429182
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2429145 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 2429182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36720897 - 36720860
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36720897 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 36720860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 44834902 - 44834959
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttcct-ttgaatgggg-taattcaaacttgc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||    
T  44834902 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgctcctgaatggggcaaattcaaacttgc 44834959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55268713 - 55268660
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  55268713 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggcaaattcaaacttgctaaac 55268660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2268379 - 2268316
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  2268379 aaaatattaaattcttgttatgttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 2268316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3494914 - 3494851
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  3494914 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgttaaggattgaacctca 3494851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4003652 - 4003616
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttg 415  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4003652 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttg 4003616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24701936 - 24701880
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  24701936 gaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttg 24701880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 34050061 - 34050124
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  34050061 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 34050124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34646782 - 34646738
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34646782 aatgatggtattcaagtgtcaacgaatgcacctcattcttttgac 34646738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 42949656 - 42949684
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42949684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 297
Target Start/End: Original strand, 45100134 - 45100190
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45100134 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaa 45100190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 46403337 - 46403400
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  46403337 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 46403400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47066243 - 47066191
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  47066243 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaatttaaacatgccaa 47066191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47066490 - 47066462
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066490 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 47066462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 49139939 - 49139876
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  49139939 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 49139876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 50997722 - 50997785
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  50997722 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaatgattgaacctca 50997785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 54390776 - 54390839
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  54390776 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 54390839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 48270640 - 48271046
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48270640 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48270739  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48270740 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48270839  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  48270840 cagaagatcgtcgttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctttcttttaatggggtaattcaaacttgccagacggcaggtctca 48270939  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48270940 aatattcgatgaacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacatcattc 48271039  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  48271040 ttttgac 48271046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43351314 - 43350909
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43351314 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43351215  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  43351214 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccac 43351116  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43351115 cagaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 43351016  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43351015 aatattcgaccgacatttccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattc 43350916  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  43350915 ttttgac 43350909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Original strand, 41048776 - 41049180
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  41048776 agagacagaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 41048875  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41048876 cgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 41048975  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |    
T  41048976 agaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgcaaaacggcaagtctcta 41049075  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41049076 atattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggaccgcattct 41049175  T
Q  412 tttga 416  Q
    |||||    
T  41049176 tttga 41049180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21187514 - 21187108
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  21187514 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaac 21187415  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21187414 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 21187315  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  21187314 cagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcacctttcagctacaataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctca 21187215  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21187214 aatattcgaccggcattcccattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 21187115  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  21187114 ttttgac 21187108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46862409 - 46862003
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  46862409 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 46862310  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46862309 gtgacgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgc 46862210  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  46862209 cagaagatcgtcataaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtcttcttttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctcc 46862110  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46862109 aatattcgaccggcattctcattgctcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaagaaatggacctcattc 46862010  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  46862009 ttttgac 46862003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48315395 - 48314989
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48315395 cagagatagaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 48315296  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48315295 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48315196  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48315195 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 48315096  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48315095 aatattcgaccggcattcccattgttcctatcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattc 48314996  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  48314995 ttttgac 48314989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393634
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  36393836 aagatcttcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtttccaat 36393737  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393736 atttgaccggcattcccgttgtttctgtc-aaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 36393638  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  36393637 tgac 36393634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 29 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30355012 - 30354624
Alignment:
Q  29 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30355012 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 30354913  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30354912 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattagg 30354813  T
Q  229 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattc 328  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  30354812 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattt 30354713  T
Q  329 tcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30354712 ccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgac 30354624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 42735255 - 42735660
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42735255 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42735353  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42735354 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 42735453  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42735454 aagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggaaggactcc 42735553  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42735554 aattttcgactagcattctcattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattc 42735653  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  42735654 ttttgac 42735660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28114608 - 28114202
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28114608 cagagaaacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28114509  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  28114508 atgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgt 28114409  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||    
T  28114408 caaaagattgtcattaggtaccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaactttccaaacggcacgactcc 28114309  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28114308 aatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaatgaattgacctcattc 28114209  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  28114208 ttttgac 28114202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15338120 - 15337714
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15338120 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 15338021  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  15338020 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgc 15337921  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  15337920 cagaagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgtctcc 15337821  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    | ||||||| || ||||   ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15337820 agtattcgatcggcatttctatttttccattcaaaagattaaattcatgttaggccggtttagatgaaggttttgaagtgtcaaggaatgtacctcattc 15337721  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  15337720 ttttgac 15337714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 21650518 - 21650921
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  21650518 gagacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgt 21650617  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21650618 gacgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 21650717  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
      ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21650718 taagatcatcattagttaccgaatgaatgaacctaccagctacaacaattgtcttcctttgaat-gggtaattcaaacttgccaaacagcaggactccaa 21650816  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  21650817 tattcaaccgacattcccattgtttctttcaagagattcaatttttgttaggccagtttaaatgaaggtattgaactgtcaaagaatgtacctcattctt 21650916  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  21650917 ttgac 21650921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30360905
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtg-cgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacgg-aatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || ||||  ||||  ||||||||| ||| |||||||| | | || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||  |    
T  30360711 aagatcgtcattagttagggtaatg--tgca--ttccaactataactattgtcttacatctgaaattgggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctc 30360806  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    || ||||| || ||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30360807 aacattcgcccaacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtaaaggaatgaacctcatt 30360905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21614973 - 21614700
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||      
T  21614973 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgc 21614874  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21614873 gacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgcca 21614774  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 289  Q
    | || |||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21614773 gaagttcgtgattaggtaggga---aatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaa 21614700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39477455 - 39477057
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  39477455 cagatacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 39477356  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||    
T  39477355 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgc 39477256  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  39477255 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttaccgctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggac 39477159  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39477158 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattctttttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 39477060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 17839315 - 17839702
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17839315 cagagacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 17839414  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839415 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17839514  T
Q  211 c-agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    | |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||    
T  17839515 caaaaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 17839611  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaat 399  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17839612 cgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaat 17839702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 18237556 - 18237954
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  18237556 cagagacgcaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18237655  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18237656 atgacgagcatattttgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgc 18237755  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  | | |    
T  18237756 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaattggggtaactcaaacttgccaaacggccatgac 18237852  T
Q  308 tccaatattcgaccga-cattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  ||| | || | | |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18237853 tcaagcatttggcccatcgttcatatttttcctttcaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaacgaatgaacctc 18237951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 20564751 - 20565036
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20564751 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 20564850  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564851 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 20564950  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20564951 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 20565036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 40588542 - 40588938
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40588542 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaaca 40588641  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  40588642 tgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggcc 40588741  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    || |||||||||||||  | || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  40588742 agaagatcgtcattagtcagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 40588838  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||  ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40588839 aagcatttcgctcggcattcatatttttcctttgaaaagattaaattcatgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 40588937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1642800 - 1642401
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  1642800 gagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgt 1642701  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1642700 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgcca 1642601  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||  |||||  || || | |     
T  1642600 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttaccttgaaatggg-aattcaaacttgttaaacgacagttcccaag 1642506  T
Q  313 tattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
      |||  |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1642505 ctttcacccgacagttct-attgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctcgtttagataaaagtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct 1642407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 2356282 - 2356676
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||      
T  2356282 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatg 2356381  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2356382 tgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgct 2356481  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    |  ||| ||| |||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   || ||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  2356482 ataagaccgtgattaggtaggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtcttacctctgaa-atggaaattcaaacttgctaaacgccaggtcccc 2356577  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  ||||| ||  |||||   || ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  2356578 agcattcgcccatcattcatttttttcctttgaaaaaattaaattcttgttaggctggtttagatgaatgtattaaagtgacaaggaatgaacctcatt 2356676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Original strand, 17183205 - 17183496
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17183205 agagacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17183304  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17183305 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcc 17183404  T
Q  212 agtag---atcgtcattaggtacggaatga-atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    || ||   ||||||||||| || ||  |||  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17183405 agaagatcatcgtcattagttaggg--tgaggtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 17183496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 34140858 - 34141254
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||     
T  34140858 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 34140957  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34140958 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 34141057  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtct 308  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  | | ||    
T  34141058 ataagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgact 34141154  T
Q  309 ccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
    | |  |||   ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  34141155 caagcatttcgccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaagcaatgaacctcat 34141253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 10523061 - 10523346
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||     
T  10523061 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacg 10523160  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatg-ttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523161 tgacgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 10523260  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    | | | ||||||||||| || || | |  || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10523261 ctgaaaatcgtcattagttagggtaag-gtgta--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgtcaaac 10523346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20378918 - 20378613
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  20378918 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 20378819  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  20378818 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgc 20378719  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||| ||||||| ||  || | || |  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||    
T  20378718 cagaagatcatcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactcc 20378622  T
Q  311 aatattcga 319  Q
    || ||||||    
T  20378621 aacattcga 20378613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 47268891 - 47269178
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  47268891 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 47268989  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  47268990 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgc 47269089  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    ||  ||||||||||||  || || | | |||||  |||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  47269090 caaaagatcgtcattaattagggtaag-atgca--ttccaactacaacaattagcttacctgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 47269178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48220949 - 48220561
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  48220949 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 48220850  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||    
T  48220849 catg--ttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagat 48220752  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata- 314  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| ||||  || || |||||| ||||||||||||| |||||||  | | ||| |  |     
T  48220751 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttagctctgaaatgggctaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat 48220655  T
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48220654 ttcgtccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 48220561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41218003
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttga-atggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||   || |||     
T  41217809 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacagcaattgtcttacctctgatatggggtaattcaaacttaccaaagggcctggactca 41217905  T
Q  311 aata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  | ||||  |  |||||   || ||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41217906 agcatttcgctcagcattcatgtt-ttcctttgaaaagaataaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatggacctcatt 41218003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45363458 - 45363070
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45363458 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 45363359  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  45363358 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 45363268  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| || |||||   ||| ||    
T  45363267 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggact 45363171  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  45363170 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattgaattcttgttaggctggtttagaagaaggtatt-aagtgtcaaggaatcaacctca 45363072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367050
Alignment:
Q  103 acgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 202  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  203 gattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 9367050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26603420 - 26603266
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  26603420 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaac 26603321  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtga 165  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26603320 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtga 26603266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2206151 - 2205964
Alignment:
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2206151 tgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcc 2206052  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    || ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2206051 agaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacg 2205964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20878026 - 20877861
Alignment:
Q  252 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagatta 351  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   | || ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  20878026 ctacaacaattgtgttcctttggatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccagcgtacgtccgacattcccattgttccttttaaaagatta 20877927  T
Q  352 aattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20877926 aattcatgttaggcaggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcatttttttgac 20877861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21614442 - 21614269
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||| | | ||| || ||||  ||||||||   ||||||||| |||    
T  21614442 ccttccaactacaacaattgtcttcctctagatggggtaattcaaacttgttaaacggcaagactcaaacattcatccgacatttctattgttcctttca 21614343  T
Q  344 aaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    | |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21614342 agagatcaaattcttgttatgccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 21614269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26601837 - 26601596
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  26601837 gttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaactacaacaattatct 26601741  T
Q  267 t-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||  ||| ||||| || ||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26601740 tacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgaaaagtcctcaacattcgcccaacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagg 26601641  T
Q  365 ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26601640 ctggtttatattaaggtattgaagtgtcaaggaatgaatctcatt 26601596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920583
Alignment:
Q  144 cagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgca 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| || || | | |||||    
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaag-atgca 13920529  T
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13920530 --ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 13920583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 13916825 - 13916949
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  13916825 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaat 13916924  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcaca 135  Q
     ||| || |||||||||||||||||    
T  13916925 gtgatgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 46861853 - 46862007
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  46861853 accttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 46861952  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  46861953 tcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 46862007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 21186960 - 21187112
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || || |||  ||    
T  21186960 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttcccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgatccattc 21187059  T
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  21187060 aaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 21187112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 42682948 - 42683052
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  42682948 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaac 42683047  T
Q  111 atgac 115  Q
     ||||    
T  42683048 gtgac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21651071 - 21650948
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  21651071 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgaccgacattctcattgttccat 21650972  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21650971 tcaaaagattaaattcttgttagg 21650948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21614666 - 21614594
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21614666 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 21614594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17320272 - 17320137
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  17320272 tatgcggttgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaacta 17320176  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17320175 caacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttg 17320137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 28114052 - 28114206
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |   | | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||      
T  28114052 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcaacatgactccaatgttcgaccggcattctcatagttccat 28114151  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  28114152 tcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgactgtattcaagtgtcaa 28114206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48271196 - 48271070
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||| |||| || ||||||      
T  48271196 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactctaatattcgaccgatattcccaatgttccat 48271097  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48271096 tcaaaatattaaattcttgttaggctg 48271070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 367
Target Start/End: Original strand, 36393489 - 36393610
Alignment:
Q  248 ccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaa 345  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  36393489 ccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagatgtaggactccaatattcgaccgacattcccagtgttccattcaaa 36393588  T
Q  346 agattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36393589 agattaaattcttgttaggctg 36393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Original strand, 21614113 - 21614240
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattg 334  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| || || ||||||||| |||||    
T  21614113 gaatgtaccttccacctacaacaattatcatacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatgcgtccgacattcccattg 21614212  T
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgtta 362  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21614213 ttccattcaaaagattaaattattgtta 21614240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  223 attaggta 230  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 30354474 - 30354597
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||       
T  30354474 acctcccaactacaacaactgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttctat 30354573  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  30354574 tcaaaagattaaatttttgttagg 30354597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 20877711 - 20877865
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||   | || ||| ||||| ||| |||||      
T  20877711 accttccaactacaacaattgtgttacctctgcatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccagcgtacgtccggcattcccatagttccat 20877810  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20877811 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattgaagtgtcaa 20877865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139421
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 34139421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 15337564 - 15337718
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgac-attctcattgttcct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| || | |||  |||| | |||||      
T  15337564 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaatttaaacttgccaaacagcaggactccaatatacgtctgacgcttct-agtgttcaa 15337662  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  15337663 ttcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 15337718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 34157130 - 34157195
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34157130 aaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aaatgtcaaggaatgaacctcatt 34157195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36393476 - 36393430
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393476 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 36393430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380637
Alignment:
Q  173 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaacgacaacaattgtctt 3380637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150328
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||||     
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattg 263  Q
    |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  150292 attaggtagggaat----gcaccttccaactacaacaattg 150328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10224615 - 10224536
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgac 320  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||    
T  10224615 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgac 10224536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17183761 - 17183706
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17183761 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 17183706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149745
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  230 acggaatg 237  Q
    | ||||||    
T  18149738 agggaatg 18149745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Original strand, 11824841 - 11824911
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  11824841 gttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatg 11824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Original strand, 17183532 - 17183605
Alignment:
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17183532 ttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 17183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39476905 - 39476823
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  39476905 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggtaggactccaacattcga 39476823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26601442 - 26601386
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  26601442 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 26601386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48220408 - 48220352
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  48220408 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggagcaattcaaacttg 48220352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17184009 - 17183926
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || | | ||| ||||| |||||||    
T  17184009 aatgtaccttccaactacaacaattgtcttgcctttgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcga 17183926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18238110 - 18238055
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18238110 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactagccaaac 18238055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21186947 - 21186904
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21186947 aactgcaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 21186904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46861842 - 46861799
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46861842 aactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 46861799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Original strand, 10224623 - 10224665
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10224623 tccaactgcaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaa 10224665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 13920848 - 13920930
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  13920848 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 13920930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 20565301 - 20565383
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||    
T  20565301 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgccaatctgcaggactccagtattcga 20565383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 21614544 - 21614598
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  21614544 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 21614598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28114044 - 28113998
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28114044 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 28113998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726381
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgaca 63  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgaca 8726381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 10224707 - 10224751
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10224707 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 10224751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 13920628 - 13920691
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13920628 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 13920691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17839852 - 17839908
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  17839852 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 17839908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Original strand, 21614442 - 21614502
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21614442 gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaaac 21614502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26601348 - 26601304
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26601348 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 26601304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 34157347 - 34157403
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  34157347 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 34157403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 41218156 - 41218212
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||    
T  41218156 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctggatggggcaatttaaacttg 41218212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 327
Target Start/End: Original strand, 21651111 - 21651186
Alignment:
Q  252 ctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacatt 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||| || ||  |||||| |||||||    
T  21651111 ctacaataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaatttgtaaaacggtaggacttcagcattcgatcgacatt 21651186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 26601440 - 26601495
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26601440 ttccaagtacaacaattgtcttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaaac 26601495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28979035 - 28978980
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28979035 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaac 28978980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 34141409 - 34141464
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  34141409 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 34141464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 48220406 - 48220461
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtct-tcctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48220406 ttccaactacaacaattgtctcacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaac 48220461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9366684 - 9366646
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9366684 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 9366646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 13920948 - 13920986
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13920948 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 13920986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 18238208 - 18238246
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18238208 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 18238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20378595 - 20378557
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20378595 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 20378557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20877703 - 20877657
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20877703 tccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttg 20877657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21186860 - 21186822
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21186860 ggtattcaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgac 21186822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28978767 - 28978729
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28978767 ggtattcaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgac 28978729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30354376 - 30354338
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30354376 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 30354338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 30361159 - 30361197
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30361159 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 30361197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30361308 - 30361246
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  30361308 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaaac 30361246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 34141508 - 34141546
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34141508 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 34141546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 277
Target Start/End: Original strand, 34157032 - 34157062
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157032 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatg 34157062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39476805 - 39476767
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39476805 ggtattcaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 39476767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45362817 - 45362779
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45362817 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 45362779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45362917 - 45362843
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  45362917 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggattgggcaattcaaacttgttaatcggcaggtctcca 45362843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48220308 - 48220270
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48220308 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 48220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 48271294 - 48271332
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48271294 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 48271332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 416
Target Start/End: Original strand, 17839952 - 17839989
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17839952 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 17839989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30354466 - 30354421
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  30354466 tccaactgcaacaattgtctttctctgaatggggcaattcaaactt 30354421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 39476656 - 39476713
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||    
T  39476656 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgc 39476713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 3924805 - 3924845
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtcc 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  3924805 agagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgtcc 3924845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9367005 - 9366942
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  9367005 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 9366942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10523611 - 10523667
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||    
T  10523611 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatttaaacttg 10523667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17183759 - 17183815
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  17183759 gaatgcacattctaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 17183815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18238108 - 18238164
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||||||||    
T  18238108 gaatgcacattccaactacaacaattgtcctactctggattgggcaattcaaacttg 18238164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 20565081 - 20565144
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20565081 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 20565144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26500438 - 26500410
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26500438 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26500410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 26592275 - 26592303
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26592275 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26592303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 42683058 - 42683094
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42683058 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 42683094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 13402527 - 13402933
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13402527 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 13402626  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13402627 gtgacgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 13402726  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13402727 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctcc 13402826  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13402827 aattttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatta 13402926  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  13402927 ttttgac 13402933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32027843 - 32027437
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027843 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32027744  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027743 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32027644  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  32027643 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactcc 32027544  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  32027543 aatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagttaaaatgaaggtattgaagtgccaatgaatgaacctcattc 32027444  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  32027443 ttttgac 32027437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 12396770 - 12397176
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12396770 cagagacataaggagggtggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12396869  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12396870 atgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 12396969  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12396970 caaaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctcc 12397069  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12397070 aatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacatcattc 12397169  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  12397170 ttttgac 12397176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32037902 - 32037496
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32037902 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32037803  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037802 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32037703  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  32037702 cagaagatcgtcattaggtaaggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactcc 32037603  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  32037602 aatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagttaaaatgaaggtattgaagtgccaatgaatgaacctcattc 32037503  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  32037502 ttttgac 32037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34803111 - 34802705
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34803111 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34803012  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34803011 gtgatgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 34802912  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  34802911 caaaagatcgtcattaggtaaggaatgaatgcgctttcgagctacaaaaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggactct 34802812  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34802811 aatgttcgaccggcattaccattgtttttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattc 34802712  T
Q  411 ttttgac 417  Q
     ||||||    
T  34802711 atttgac 34802705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 76 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257388
Alignment:
Q  76 cattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgag 175  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  176 atcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctaaa 30257530  T
Q  276 tggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaat 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30257529 tggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaat 30257430  T
Q  376 gaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  30257429 gaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcatttttttgac 30257388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 801160 - 801564
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  801160 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaac 801258  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801259 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 801358  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | | |||    
T  801359 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgcgaaacggccaagactc 801455  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  801456 aagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgacggtattgaagtgtcgaggaatgcacctcat 801555  T
Q  409 tcttttgac 417  Q
    |||||||||    
T  801556 tcttttgac 801564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 179 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021046
Alignment:
Q  179 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatgg 35021185  T
Q  279 ggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaa 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35021184 ggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaa 35021085  T
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35021084 ggtattgaagtgtcaacgaatggacctctttcttttgac 35021046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 27640174 - 27640459
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27640174 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27640273  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640274 gtgacgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27640373  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27640374 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 27640459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 11692446 - 11692730
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11692446 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 11692545  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692546 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 11692645  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11692646 acaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 11692730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 14115033 - 14115313
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  14115033 gagacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgt 14115132  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  14115133 gacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgcca 14115232  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaa 297  Q
    | |||| || |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14115233 gaagatagtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatagggtaattcaaacttgccaa 14115313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 6205478 - 6205763
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6205478 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6205577  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205578 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6205677  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6205678 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 6205763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 29066547 - 29066944
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29066547 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29066646  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29066647 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29066746  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||||||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||  |||||||||   | ||||||||| ||||||||   | | ||    
T  29066747 cagtagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatctttgaatgatataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29066843  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29066844 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 29066942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 408
Target Start/End: Original strand, 29075560 - 29075956
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29075560 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29075659  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29075660 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29075759  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||  | ||||||| | | ||||||||| ||||||||   | | ||    
T  29075760 cagcagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29075856  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29075857 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 29075955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 408
Target Start/End: Original strand, 29110531 - 29110928
Alignment:
Q  11 cagagacacaagga-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29110531 cagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaa 29110630  T
Q  110 catgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  29110631 cgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccg 29110730  T
Q  210 ccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtc 307  Q
    |||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||  | ||||||| | | ||||||||| ||||||||   | | |    
T  29110731 ccagcagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgac 29110827  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29110828 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 29110926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 29108134 - 29108531
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29108134 cagagacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29108233  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29108234 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29108333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||  | ||||||| | | ||||||||| ||||||||   | | ||    
T  29108334 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29108430  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29108431 caagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctca 29108529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058552
Alignment:
Q  29 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| | || |||||||||||||     
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagt 35058733  T
Q  229 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgac 324  Q
    || ||    || | || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||    
T  35058732 taggg---taaggtacattccaactacaacaattgtcttacctctcaaattgggtaattcaaacttgccaaacggccagggctctagcatttcgctcgac 35058636  T
Q  325 attctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35058635 attcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 35058552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305980
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 22305980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 417
Target Start/End: Original strand, 4495119 - 4495304
Alignment:
Q  233 gaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcat 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||| |||||||||||||  |||    
T  4495119 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaatctggccaaacggttggactccaatgttcgaccgacatttccat 4495218  T
Q  333 tgttcc-tgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4495219 tgttccttttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgac 4495304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021027
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaacta 24021072  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24021071 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 24021027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 417
Target Start/End: Original strand, 14122904 - 14123001
Alignment:
Q  320 ccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14122904 ccgacattcccattgttcctttcaaaagattaaatttttgttaggcttgtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggaccttattcttttgac 14123001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 293
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192670
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaacta 2192631  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192632 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 2192670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12397326 - 12397200
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || || |||      
T  12397326 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgatccat 12397227  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12397226 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 12397200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13403365 - 13403239
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||       
T  13403365 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccagcattctcaatgttctat 13403266  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13403265 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 13403239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765713
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt-gattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||| || || | |  ||||      
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaag-gtgca-- 3765771  T
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3765770 ttccaactgcaacaattgtcttacctctcaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 3765713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 417
Target Start/End: Original strand, 23911074 - 23911150
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23911074 tcaaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 23911150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 35020896 - 35021019
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||      
T  35020896 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgacaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 35020995  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35020996 tcaaaagattaaattcttgttagg 35021019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 394
Target Start/End: Original strand, 30257228 - 30257392
Alignment:
Q  233 gaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttc-ctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctc 330  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||| | | | | ||||||| ||||| || ||||| |    
T  30257228 gaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtgttatctttgaatagggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgatcggcattccc 30257327  T
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  30257328 atagttccactcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 30257392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30257211 - 30257133
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  30257211 agatcgtcggtaggtacggaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtctttctttaaatgaggtaattcaaacttg 30257133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13403057 - 13402957
Alignment:
Q  268 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  13403057 cctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggct 13402958  T
Q  367 g 367  Q
    |    
T  13402957 g 13402957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13403198 - 13403098
Alignment:
Q  268 cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  13403198 cctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggct 13403099  T
Q  367 g 367  Q
    |    
T  13403098 g 13403098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 32027287 - 32027441
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |   | | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  32027287 accttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 32027386  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  32027387 tcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 32027441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 32037346 - 32037500
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |   | | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||      
T  32037346 accttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 32037445  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  32037446 tcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 32037500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14123148 - 14122997
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtca 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| | | | | ||||| ||| || ||| ||||| |||||||||  |||    
T  14123148 ttccaactacaaaaattgtcttacctttaaatggggtaaattcaaacttggcaagcagcaagactccagtatccgtccggcattcccattgttccattca 14123049  T
Q  344 aaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14123048 aaagattaaattcatgttaggctttgtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 14122997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465298
Alignment:
Q  146 gtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 245  Q
    |||||||||||||   || | ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||  |||| ||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggta--ga--gaatacacc 17465320  T
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17465319 ttccaactacaacaattgtctt 17465298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 299
Target Start/End: Original strand, 34134799 - 34134931
Alignment:
Q  165 atgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34134799 atgttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagg----gaatgcacctttcaactacaacaattgt 34134894  T
Q  265 ctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| ||| || |||||  |||||||||||||| ||||    
T  34134895 cttacctctgaaatggaataattcaaacttgctaaac 34134931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4495453 - 4495300
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| | || | ||||| ||| |||||      
T  4495453 accttcaaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtcaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaacgg-cattcccatagttccat 4495355  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttag-gctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  4495354 tcaaaatattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 4495300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14123479 - 14123421
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14123479 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttgcctctgaatgggcaaattcaaacttgc 14123421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 801713 - 801654
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  801713 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggcaaaacg 801654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 6206028 - 6206110
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  6206028 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 6206110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32027271 - 32027233
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027271 caacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 32027233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32037330 - 32037292
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037330 caacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 32037292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 2192721 - 2192784
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  2192721 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 2192784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 7821227 - 7821271
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7821227 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 7821271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23911209 - 23911146
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  23911209 attgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtatt-aagtgtcaa 23911146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27640723 - 27640779
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  27640723 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 27640779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32027195 - 32027151
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32027195 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 32027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32037254 - 32037210
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32037254 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 32037210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3765936 - 3765901
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3765936 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 3765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 35058397 - 35058444
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35058397 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaact 35058444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 2193035 - 2193073
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2193035 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2193073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402372
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagata 189  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||  |||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagata 2402372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 6206128 - 6206166
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6206128 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 6206166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 11693095 - 11693133
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11693095 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 11693133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 12397334 - 12397380
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12397334 tccaactgcaacaattatcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 12397380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 13403463 - 13403501
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13403463 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 13403501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18744073 - 18743995
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||    
T  18744073 agcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcatgttgctgagatcgtctgaagatattctcgacagtttgattcc 18743995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35020888 - 35020842
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  35020888 tccaactgcaacaattgtcttcctcagaatggggcaattcaaacttg 35020842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Original strand, 2192936 - 2193017
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||    
T  2192936 aatgcacattccaactgcaaaaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggaccccaatattcga 2193017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 14123250 - 14123319
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  14123250 tcaaaaggttaaattcatgttgggttcgtttaaatgatggtattgaggtgtcaaggtctggacctcattc 14123319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24020761 - 24020680
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||    
T  24020761 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttacgctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggaccccaatattcga 24020680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4495680 - 4495616
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4495680 gaatgtaccttccaactgcaataattgtcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaac 4495616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 6205808 - 6205871
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  6205808 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 6205871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 12397426 - 12397462
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12397426 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 12397462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 14123146 - 14123202
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||    
T  14123146 gaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactatggatggggcaatttaaacttg 14123202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Original strand, 20192534 - 20192562
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20192534 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20192562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20242120 - 20242092
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242120 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20242092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22136104 - 22136076
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136104 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22136076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22143457 - 22143429
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143457 gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22143429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24020660 - 24020624
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24020660 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 24020624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24020974 - 24020919
Alignment:
Q  351 aaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  24020974 aaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 24020919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 27640504 - 27640567
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27640504 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 27640567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34132168 - 34132140
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132168 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 34132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35058399 - 35058343
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || || ||| || ||||||||||||    
T  35058399 gaatgcacattccaactacaacaaatgtcttactctggatgaggcaattcaaacttg 35058343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 160)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34153503 - 34153097
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34153503 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34153404  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34153403 gtgacgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 34153304  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34153303 cagaagatcgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctcc 34153204  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34153203 aatattcgaccgacattcccattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaacggacctcattc 34153104  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  34153103 ttttgac 34153097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 407
Target Start/End: Original strand, 22436901 - 22437297
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22436901 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaac 22437000  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22437001 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22437100  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22437101 cggaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttccttcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 22437200  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22437201 aatattcgaccggcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctca 22437297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 957670 - 957266
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  957670 gagacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 957571  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  957570 gacgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 957471  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  957470 gaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattgaaacttgccaaacggcaggtctccaa 957371  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  957370 tattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctagtttaaataaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattctt 957271  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  957270 ttgac 957266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 21169441 - 21169847
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||| ||    
T  21169441 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatac 21169540  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21169541 gcgacgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 21169640  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21169641 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 21169740  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21169741 aatattcgaccggcattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattc 21169840  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  21169841 ttttgac 21169847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49792153 - 49791747
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49792153 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 49792054  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49792053 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49791954  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49791953 caaaagatcatcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctcc 49791854  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49791853 aatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgtagtgtcaacgaatggacctcattc 49791754  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  49791753 ttttgac 49791747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34530013 - 34529607
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  34530013 cagagacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaat 34529914  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529913 gtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34529814  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  34529813 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacattaaagctacaacaattgtattcctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactcc 34529714  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34529713 aatattcgaacagcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattc 34529614  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  34529613 ttttgac 34529607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282149
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  6282337 aagatcgtcattagttacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaagcttgccaaacggcaggtcttcaat 6282238  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgga 402  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6282237 attcgactgacattttcattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtaaacgaatgga 6282149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 44560397 - 44560006
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  44560397 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 44560298  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44560297 gtgacaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctc 44560198  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44560197 cttaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 44560098  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgga 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44560097 aatattcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgga 44560006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 47657572 - 47657167
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  47657572 cagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaac 47657473  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47657472 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 47657373  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  47657372 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcacattccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcc 47657273  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47657272 aatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaaaattaaatttttgttaggcaggtttaaatgaaggtattgaagtgttaaggaatggacctcattc 47657173  T
Q  411 ttttga 416  Q
    ||||||    
T  47657172 ttttga 47657167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Original strand, 2773000 - 2773405
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  2773000 agagacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 2773099  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  2773100 tgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgcc 2773199  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  2773200 agaagatcgtcatcaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcagttctcca 2773299  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2773300 atattcgaccggcattcccattattcctgtcaaaagattaaattcttgttaggttggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattct 2773399  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  2773400 tttgac 2773405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423568
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  49423772 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttacctttgaatggggtaattcaaatttgtcaaacggcaggactccaa 49423673  T
Q  313 tattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 412  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49423672 tcttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 49423573  T
Q  413 ttgac 417  Q
    |||||    
T  49423572 ttgac 49423568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36776330
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaat 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  36776533 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaat 36776434  T
Q  314 attcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttt 413  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  36776433 gttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaagttcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcattcatt 36776334  T
Q  414 tgac 417  Q
    ||||    
T  36776333 tgac 36776330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43889716 - 43889368
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43889716 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43889617  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43889616 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgc 43889517  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  43889516 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggactcc 43889417  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttg 359  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43889416 aatgttcgaacgacattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttg 43889368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49817860 - 49817454
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  49817860 agagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 49817761  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49817760 ttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcc 49817661  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  49817660 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgccaaacagcaggactcca 49817561  T
Q  312 atattcgaccgacattct--cattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
     ||||||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  49817560 gtattcgatcgacatttttatattgttcctttcaaaagattaaattcttg-taggccgatttaaaagatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcatt 49817462  T
Q  410 cttttgac 417  Q
    ||||||||    
T  49817461 cttttgac 49817454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4785639 - 4785236
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  4785639 cagagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaac 4785540  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4785539 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgc 4785440  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4785439 cacaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcatctttcagctacaacaattgtgttcctctagatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactcc 4785340  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |  || || ||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4785339 agcatacgtccgacattcccattgtttctttcaaaatattaaattcatgttagacaggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattc 4785240  T
Q  411 tttt 414  Q
    ||||    
T  4785239 tttt 4785236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 17211258 - 17211660
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| |    
T  17211258 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgt 17211357  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  17211358 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgcca 17211457  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||  |||| | || |||| |    
T  17211458 gaagatcgtgattaggtaggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttgttaaactgcagttctcaa 17211554  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
      ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211555 tcattcacccgacattcctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagataaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 17211654  T
Q  412 tttgac 417  Q
    ||||||    
T  17211655 tttgac 17211660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 42886255 - 42886662
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagta---tcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42886255 gagacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaa 42886354  T
Q  110 catgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42886355 catgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccg 42886454  T
Q  210 ccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||    
T  42886455 ccagaagatcatcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgtattcctctggatggggtaatttaaacttaccaaacggcaggactc 42886554  T
Q  310 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||  || || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42886555 cagcatacgtccgacattaccattattcctttcaaaagattaaattcatgttaggcgggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatatacctcatt 42886654  T
Q  410 cttttgac 417  Q
    ||||||||    
T  42886655 cttttgac 42886662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14330910 - 14330514
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||     
T  14330910 agagacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacg 14330811  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330810 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 14330711  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||  | ||||     
T  14330710 agaagatcgtcattagttaaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttatcaaacgacaagtctt 14330614  T
Q  310 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||  ||||| ||  |||||   || ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14330613 cagcattcgcccatcattcatgtttttcctttgaaaagattaaactcttgttaggctggtttagatgaaagtattgaagtgtcagggaatgaacctcatt 14330514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21017394 - 21017109
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21017394 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 21017295  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017294 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 21017195  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21017194 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 21017109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40353990 - 40353705
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40353990 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40353891  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353890 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 40353791  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40353790 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacctgtcaaac 40353705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51428409 - 51428011
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  51428409 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaac 51428310  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51428309 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 51428210  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
     || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  51428209 aagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttggcaaacggccaggac 51428113  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||| || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51428112 tcaagcatttcgatcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagtctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 51428014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 1226150 - 1226537
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  1226150 cagagacaca-ggagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaat 1226248  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226249 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 1226348  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt--tgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  1226349 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcataaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcc 1226445  T
Q  309 ccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 400  Q
     ||  ||||| ||||||||    || || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1226446 tcagcattcgcccgacattaatgttttttctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 1226537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55797018
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  55796938 gatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggctaattcaaacttgtcaaac 55797018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 28082228 - 28082624
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28082228 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28082327  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28082328 atgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 28082427  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  28082428 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 28082524  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  28082525 gagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacatcat 28082623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937833
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32937916 aagatcgtcattagatagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacg 32937833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33163761 - 33163363
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||     
T  33163761 cagagacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaat 33163662  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33163661 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 33163562  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  33163561 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttgcctcttaaatggggtatttcaaacttgccaaacggccaggac 33163465  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || || | ||||  ||||||||   || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  33163464 tcaaacatttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaataaacctc 33163366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20779081 - 20778800
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20779081 acacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 20778982  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20778981 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaa 20778882  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatg-gggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||| || | |  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  20778881 gatcgtcattaggtagggtaag-gtgca--ttccaaccacaacaattgtcttcctttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaac 20778800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41794779 - 41794494
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41794779 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41794680  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794679 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41794580  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41794579 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 41794494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51027984 - 51027586
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51027984 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51027885  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  51027884 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccac 51027785  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc-ttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  |||||  ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||  | | |    
T  51027784 cataagatcgtcattagttagggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaagcggccatgac 51027688  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | |||| ||  |||||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  51027687 tcaagcatttcgcccagcattcatgtttttcctttaaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgccaaagaatgaacctc 51027589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6177532 - 6177247
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6177532 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6177433  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177432 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6177333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6177332 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 6177247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 49063969 - 49064258
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  49063969 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 49064068  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064069 gtgacgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49064168  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064169 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 49064258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 56138900 - 56139185
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  56138900 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 56138999  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56139000 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 56139099  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  56139100 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 56139185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 18412587 - 18412988
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  18412587 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgt 18412686  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||    
T  18412687 gaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgcca 18412786  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||| || |  | |    
T  18412787 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagtttccaa 18412882  T
Q  312 atattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    | ||||  |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  18412883 acattcacccgacagttct-atttttcctttcaaaagattaaattattgttagcttggtttagatgaaggtattgcagtctcaaggaatgcacctcattc 18412981  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  18412982 ttttgac 18412988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 49094735 - 49095020
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  49094735 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 49094834  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49094835 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgc 49094934  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49094935 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 49095020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 24606744 - 24607028
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |    
T  24606744 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgt 24606843  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24606844 gacgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgcca 24606943  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    | ||||||| |||||||| |   | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24606944 gaagatcgtgattaggtagg---taaatgtacattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttccaaacg 24607028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 405
Target Start/End: Original strand, 37866396 - 37866791
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  37866396 cagagacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaac 37866495  T
Q  111 atgacgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  37866496 gtgatgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccg 37866595  T
Q  210 ccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggt 306  Q
    | || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  37866596 ctagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacagtcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccagga 37866692  T
Q  307 ctccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacct 405  Q
    ||| |  | ||||  || |||||   || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37866693 ctcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctgtgaaaatattaaattattgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacct 37866791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 25762590 - 25762877
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  25762590 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 25762689  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25762690 gacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 25762789  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25762790 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgg 25762877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26591902 - 26591678
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26591902 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 26591803  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26591802 gtgacgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26591703  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaa 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  26591702 cagaagatcgtcattaggtacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 242633 - 242343
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||    
T  242633 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaac 242534  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  242533 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 242434  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacggg 302  Q
    ||| ||||||||||||| ||   ||  || |  | ||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  242433 cagaagatcgtcattagtta---aagtaaggtgcattccaactataacaattgtcttacctctgaaatagggtaattcaaacttgccaaacggg 242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 409
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711918
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |      
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-g 21711747  T
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgacattctcattgt 335  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  | ||||  || |||||   || |    
T  21711748 tgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttt 21711845  T
Q  336 tcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  21711846 tcctttgaaaagattaaatttttgttagggtgatttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaatctcatt 21711918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589307
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
     ||||||||||||| |  || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||| |    
T  39589122 aagatcgtcattagttggggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaa 39589218  T
Q  312 atattcgac-cgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 400  Q
      |||  || || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39589219 gcatttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatg 39589307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 3393296 - 3393695
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  3393296 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 3393395  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  3393396 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 3393495  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    | ||||| | |||||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||| ||||||||||||  ||||   | || |||||    
T  3393496 gaagatcatgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacatttgtattaccctgaaatggg-aattcaaacttgttaaacaaca-gtttccaa 3393589  T
Q  313 -tattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
       |||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  3393590 gctttcggctgacagttct-attgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctcatttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcatttaattc 3393688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31824838 - 31824448
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  31824838 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 31824739  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  31824738 catgttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagat 31824639  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata- 314  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |   ||| |  |     
T  31824638 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacatttgaaatagggtaatttaaacttgccaaacggccattactcaagcat 31824542  T
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| || || |||   || ||||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31824541 ttcgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaaatcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 31824448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288562
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttag 11288486  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
     ||||||| |||| ||| |    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11288487 aagatcgtgattaagtagg----gaatgcaccttccaactaccataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 11288562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Original strand, 1042744 - 1043136
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1042744 agacacaaggagggtggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1042841  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  1042842 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccag 1042941  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
     ||||||||||||| || ||    || | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||   |||||||   | | ||| |    
T  1042942 aagatcgtcattagttaggg---taaggtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaatcggccaaacaacatgactcaa 1043038  T
Q  312 ata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
      | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1043039 gcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 1043136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 9489671 - 9490065
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  |    
T  9489671 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 9489770  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9489771 gacgagcatgtttt-ggagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 9489869  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    | ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| |||     
T  9489870 gaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactca 9489966  T
Q  311 aatattcgac-cgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  |||  || ||||||||   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  9489967 agcatttcactcgacattcatgtttttcctttgaaaaaattaaattcttgttaggttggtttatatgaaggta-taaagtgtcaaggaatgaacctcatt 9490065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 10312264 - 10312663
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  10312264 gagacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 10312363  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||      
T  10312364 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctg 10312463  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||| || |  |||  || ||||||||||||  | |||  || || | |    
T  10312464 gaagatcgtgattaggtagggaatt----caccttccaactacaacaattgtcttaccctaaaat--ggaaattcaaacttgttatacgctagttcccaa 10312557  T
Q  312 atattcgaccgaca-ttctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    | ||||  | |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10312558 acattcacctgacagttct-attgttccattcaaaagattaaatttatgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattc 10312656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901596
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20901682 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaactttccaaacgg 20901596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45939804
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaac-aattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45939718 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaactaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacg 45939804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46816740 - 46816453
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  46816740 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaac 46816641  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46816640 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgc 46816543  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttga-atggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46816542 cagaagatcgtcattagttagggcaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaattcaaacttgccaaacgg 46816453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 409
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759715
Alignment:
Q  68 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  || |||||||||||||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtctt 27759570  T
Q  268 -cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 363  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |  | |||| ||  | |||   || ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27759571 acctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggctatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttat 27759670  T
Q  364 gctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27759671 gctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 27759715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324451
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |  || ||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     ||||| | |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||    
T  31324367 aagatcatgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatgagataattcaaacttgctaaacg 31324451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 13850739 - 13850991
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||  || ||||||| || |||||  ||    
T  13850739 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgac 13850838  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || |  ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  13850839 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgc 13850938  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13850939 cagaagaccgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattatctt 13850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 13866253 - 13866503
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||| |||  |||||||||| || |||||  ||    
T  13866253 cagagacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgac 13866352  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  13866353 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 13866452  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13866453 cagaagaccgtgattaggtagg----gaatgcacctttcaactacaacaattgtc 13866503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Original strand, 24607276 - 24607449
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtca 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||   ||||||| | |||    
T  24607276 ccttccaactacaacaattgtcctcctctggatggagtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacattcgtccgacatttctattgttcttttca 24607375  T
Q  344 aaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24607376 aaagattaaattcttgtttggccggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaaggaacggacctcattcttttgac 24607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817012
Alignment:
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatg 241  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||        
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagggaatg---- 49817188  T
Q  242 caccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgacc--gacattctcattgttcct 339  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||  |||||  ||||||| |  ||||| ||  ||  |||| ||||||||     
T  49817187 caccttccaactacaataattgtcttaccctgaaatgga-aattcaaacttgttaaacgctaggtctctagcattcggcccggaagttct-attgttcca 49817090  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49817089 ttcaaaagataaaattcatgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49817012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22437457 - 22437331
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  22437457 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccattgttccat 22437358  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22437357 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 22437331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 34529457 - 34529611
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||      
T  34529457 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcgacattcccaatgttccat 34529556  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  34529557 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattgaaatgtcaa 34529611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 49423418 - 49423572
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |      
T  49423418 accttcaaactacaacaattgtgttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaaacggcacgactccaatgttcgaccgacattcccatagtttcat 49423517  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  49423518 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 49423572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 344 - 417
Target Start/End: Original strand, 24607051 - 24607124
Alignment:
Q  344 aaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24607051 aaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 24607124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 34152949 - 34153101
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtc 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||  ||    
T  34152949 cttccaacaacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaaccgacattcccaatgttccattc 34153048  T
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  34153049 aaaagattaaattgttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaa 34153101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Original strand, 49064563 - 49064631
Alignment:
Q  225 taggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49064563 taggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 49064631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 49791597 - 49791723
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||||||||| || ||||| || ||||||      
T  49791597 acctcccaactacaacaattggcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgatcggcattcccaatgttccat 49791696  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  49791697 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 49791723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49571655 - 49571525
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcc-- 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  49571655 acctcccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccattgttcctg 49571556  T
Q  339 --tgtcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49571555 tctgtcaaaagattaaattcttcttaggctg 49571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Original strand, 957116 - 957242
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||  || | | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  957116 acctcccaactacaaaaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtaaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 957215  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  957216 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 957242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20778775 - 20778714
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20778775 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctc 20778714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21169997 - 21169873
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || |||||| |||| | | ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||      
T  21169997 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaatttaaactttccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccat 21169898  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21169897 tcaaaagattaaattcttgttaggc 21169873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 417
Target Start/End: Original strand, 43889162 - 43889336
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||      
T  43889162 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaggactccaatatacgaccgacattcccatagttccat 43889261  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttag-gctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  43889262 tcaaaagattaaattcttgatagatttggtttaaatgacggtattcaaacgtcaatgaatgg---tcattcttttgac 43889336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42886812 - 42886658
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||  || || ||| || || |||||||||      
T  42886812 accttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactccagcatacgtccggcactcccattgttccat 42886713  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  42886712 tcaaaagattaaattcttgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 42886658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14330326 - 14330250
Alignment:
Q  217 atcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14330326 atcgtcagtaagtacggaacaaatgcaccttccaactgtaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 14330250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 17292108 - 17292201
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17292108 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 17292201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Original strand, 26591576 - 26591663
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  26591576 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattc 26591663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 242320 - 242255
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  242320 aaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 242255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2773555 - 2773429
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |   | | |||||||||||||||  || || || ||||||      
T  2773555 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaacttgccaagcatcatgactccaatattcgaccagcactcccaatgttccat 2773456  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2773455 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 2773429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21412740 - 21412647
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacga 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| |||||    
T  21412740 gagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32937809 - 32937736
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaa-ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32937809 aagattaaattcttattcggctggtttaaattaaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 32937736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 49817304 - 49817458
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgacc-gacattctcattgttcct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| | | | || |||| ||||||| |   |||| ||||||||     
T  49817304 accttccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactacaatgttcgaccagtgtttct-attgttcca 49817402  T
Q  340 gtcaaaagattaaattcttgttaggctga-tttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  49817403 ttcgaaagtttaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaa 49817458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44559939 - 44559893
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44559939 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 44559893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49423410 - 49423364
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49423410 tccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 49423364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49791589 - 49791543
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49791589 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 49791543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32937497 - 32937412
Alignment:
Q  332 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||  |||||||||||| ||  | ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32937497 ttgttccattcaaaagattaattttatattaagctggtttagatggaggtattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgac 32937412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36776172 - 36776100
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||    
T  36776172 tccaactgaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcga 36776100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 20901339 - 20901394
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20901339 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 20901394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124490
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||||||||   | |||||||  |||| | ||||||| |||||| |||| ||     
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  23124530 attaggtagggaatg----cacctttcaactacaacaattgtctt 23124490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Original strand, 32937353 - 32937416
Alignment:
Q  332 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32937353 ttgttcctttcaaaatattaaattcttgttaggctcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaa 32937416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 957108 - 957062
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  957108 tccaactgcaacaattgtcatcctttgaatggggtaattcaaacttg 957062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 2773563 - 2773609
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2773563 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 2773609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20901560 - 20901495
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20901560 aaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtagt-aagtgccaaggaatgaacctcatt 20901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34529449 - 34529403
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34529449 tccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 34529403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 36776180 - 36776334
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||| |||   | ||| ||| ||| || ||| | ||||| ||| |||||      
T  36776180 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaatttgtcaattagcaggactctaatgtttgactggcattcccatagttccat 36776279  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg-ctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36776280 tcaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaa 36776334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Original strand, 45939841 - 45939914
Alignment:
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  45939841 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacatcatt 45939914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4785058 - 4784978
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc--ttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4785058 agatcatcagtaggtacgaaatgaatgcatcttccaagtgcaacaattgtctttttctttgaatggggtgattcaaacttg 4784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4784944 - 4784896
Alignment:
Q  369 tttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4784944 tttaaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 4784896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46816190 - 46816134
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  46816190 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 46816134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34152939 - 34152892
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattg-tcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34152939 tccaactgcaacaattgatcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 34152892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39589471 - 39589416
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39589471 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaac 39589416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 32937686 - 32937740
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  32937686 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggtttaaatgatggtatttaagtgtcaa 32937740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Original strand, 49571671 - 49571709
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49571671 caacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 49571709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51427845 - 51427803
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaa 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51427845 tccaactgcaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaaa 51427803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Original strand, 51427853 - 51427911
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51427853 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac 51427911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 56139450 - 56139532
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  56139450 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 56139532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51027429 - 51027376
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  51027429 tgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 51027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 242088 - 242044
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  242088 caactgcaacaactgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttg 242044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 885348 - 885404
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||||||||||||    
T  885348 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggagcaattcaaacttg 885404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 1043289 - 1043345
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  1043289 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 1043345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17211720 - 17211656
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17211720 attgttccattcaaaagatttaattattgttaggcttgatttaaatgatggtattcaagtgtcaa 17211656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21017064 - 21017001
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  21017064 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 21017001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 21170088 - 21170132
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21170088 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 21170132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24607276 - 24607216
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24607276 gcaccttccaactaaaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaac 24607216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 28082777 - 28082833
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  28082777 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactgtggatggggcaattcaaacttg 28082833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 38132786 - 38132838
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38132786 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaac 38132838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49423326 - 49423282
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49423326 aatgacggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49423282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 49571755 - 49571791
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49571755 tattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49571791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21712073 - 21712018
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  21712073 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacgtgccaaac 21712018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27759871 - 27759816
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27759871 ttccaactacagcaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaac 27759816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37866950 - 37866895
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37866950 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgtcaaac 37866895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38132784 - 38132729
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  38132784 aatgcacattccaactacaacagttgtcttgctatggatggggcaattcaaacttg 38132729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 51027232 - 51027295
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  51027232 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttgctaaac 51027295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 957018 - 956980
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  957018 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacatcattcttttgac 956980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 1043389 - 1043427
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1043389 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 1043427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3393745 - 3393691
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  3393745 tcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaa 3393691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6176882 - 6176844
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6176882 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 6176844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6176982 - 6176900
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  6176982 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 6176900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Original strand, 14330355 - 14330405
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatg-gggtaattcaaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  14330355 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggttaattcaaact 14330405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21016744 - 21016706
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21016744 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 21016706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21016844 - 21016762
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  21016844 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 21016762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 21712171 - 21712209
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21712171 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 21712209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 22437465 - 22437511
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22437465 tccaactgcaacaattgtcttcatctgaattgggtaattcaaacttg 22437511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 22437555 - 22437593
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22437555 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 22437593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24607174 - 24607120
Alignment:
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  24607174 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagagtcaa 24607120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 27759869 - 27759951
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  27759869 gaatgcacatttcaactacaacaattgtcctactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 27759951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 28082877 - 28082915
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28082877 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 28082915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31824253 - 31824215
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31824253 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 31824215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40353340 - 40353302
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40353340 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 40353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 45940167 - 45940205
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45940167 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 45940205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49064526 - 49064468
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  49064526 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacttgccaaac 49064468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 415
Target Start/End: Original strand, 49064669 - 49064711
Alignment:
Q  373 aatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttg 415  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49064669 aatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttg 49064711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 49095285 - 49095367
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  49095285 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 49095367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 49095385 - 49095423
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49095385 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49095423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49791499 - 49791461
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49791499 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 49791461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 21170005 - 21170049
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21170005 tccaactgcaacaattgttttcctttgaat-gggtaattcaaactt 21170049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36776081 - 36776044
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36776081 gtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgac 36776044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 42886833 - 42886878
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 292  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42886833 tccaactgcaacggttgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactt 42886878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43889152 - 43889111
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaac 290  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43889152 caactgcaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaac 43889111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 416
Target Start/End: Original strand, 49571463 - 49571500
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttga 416  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49571463 ggtattgaagtgtcaagaaatgtacctcattcttttga 49571500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 885450 - 885486
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  885450 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 885486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 885595 - 885515
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||  ||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||    
T  885595 gcaccttccaactacaacaattgccttgcctctaaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaatattcga 885515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1226926 - 1226898
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226926 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 1226898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6177202 - 6177139
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  6177202 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 6177139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 9490124 - 9490160
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9490124 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 9490160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Original strand, 20901120 - 20901196
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||  ||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  20901120 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 20901196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37867286 - 37867202
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||    
T  37867286 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagtattcga 37867202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 39589469 - 39589525
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  39589469 gaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 39589525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40353660 - 40353597
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  40353660 aaaatattaaattcttgttatgctggttttgatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 40353597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42887058 - 42886990
Alignment:
Q  253 tacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  42887058 tacaacaattatcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaatattcga 42886990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 47870740 - 47870776
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47870740 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 47870776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 49095065 - 49095128
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  49095065 aaaatattaaattcttgttatgctggttttgatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 49095128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Original strand, 51027437 - 51027485
Alignment:
Q  253 tacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51027437 tacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcaaaac 51027485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51427753 - 51427717
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51427753 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 51427717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 56139230 - 56139293
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  56139230 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 56139293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41857188 - 41856780
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41857188 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 41857089  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41857088 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41856989  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41856988 cagaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctcc 41856889  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggta--ttgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  41856888 aatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattattgttaggctgatttaaatgaaggtattttgaagtgtcaacgaatggacctcat 41856789  T
Q  409 tcttttgac 417  Q
    |||||||||    
T  41856788 tcttttgac 41856780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18440509 - 18440103
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  18440509 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaac 18440410  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18440409 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgc 18440310  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18440309 gagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaattttccaaacggcaggtctcc 18440210  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440209 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattattgttaggctagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 18440110  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  18440109 ttttgac 18440103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44943295 - 44942889
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44943295 cagagacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44943196  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44943195 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 44943096  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44943095 cagaagattgtcattaggtacggaatgtatgcaccttccagctacaacaattgtcttcgtttgaatgagataattcaaacttgccaaacgacaggtctcc 44942996  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||   || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44942995 aatattcagacggcattcccattgctcctgtcaaaagattaaattcttgttcggctgttttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 44942896  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  44942895 ttttgac 44942889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 40702360 - 40702767
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40702360 cagagacagaaggagagtggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40702459  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40702460 gtgacgagcatgttttgggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 40702559  T
Q  211 cagtagatcg-tcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40702560 caaaagatcggtcattaggtacggaatgaatgcacattttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 40702659  T
Q  310 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40702660 caatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcatt 40702759  T
Q  410 cttttgac 417  Q
    ||||||||    
T  40702760 cttttgac 40702767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 417
Target Start/End: Original strand, 42603454 - 42603857
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42603454 cagagacagaaggagggcggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42603553  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42603554 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 42603653  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  42603654 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac---aggtctcc 42603750  T
Q  311 aatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42603751 aatattcgaccggcattcccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaaggatcaacgaatggacctcattc 42603850  T
Q  411 ttttgac 417  Q
    |||||||    
T  42603851 ttttgac 42603857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19242375 - 19241971
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||     
T  19242375 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19242276  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  19242275 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19242176  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||    
T  19242175 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactcca 19242076  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19242075 atgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaacttcttgttaggccggtttatatgaatgtattgaagtgtcaataaatgaacctcattct 19241976  T
Q  412 tttga 416  Q
    |||||    
T  19241975 tttga 19241971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19315559 - 19315155
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||     
T  19315559 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19315460  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  19315459 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19315360  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||    
T  19315359 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactcca 19315260  T
Q  312 atattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattct 411  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19315259 atgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaacttcttgttaggccggtttatatgaatgtattgaagtgtcaataaatgaacctcattct 19315160  T
Q  412 tttga 416  Q
    |||||    
T  19315159 tttga 19315155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15032538 - 15032253
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15032538 cagagacacaagtatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 15032439  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032438 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 15032339  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15032338 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 15032253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 26452325 - 26452722
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26452325 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 26452424  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26452425 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26452524  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc-ttcctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
     || ||||||||||||| || || | |  || |  |||||||| ||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   ||| ||    
T  26452525 tagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgta--ttccaactgcaacaattgtcatacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 26452621  T
Q  309 ccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | || | ||||  |||||||    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26452622 caaacatttcgctcgacatttatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctagtttagatgaaggtatt-aagtgtcaagaaatggacctca 26452720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42169172 - 42168885
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  42169172 gagacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgt 42169073  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42169072 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 42168973  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    | ||||||||||||| || |||    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168972 gaagatcgtcattagtta-ggataagatgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 42168885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Original strand, 43693137 - 43693511
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  43693137 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 43693236  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  43693237 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 43693336  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  43693337 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaaggac 43693433  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtatt 384  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  43693434 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtatt 43693511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 485472 - 485187
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  485472 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 485373  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485372 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 485273  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  485272 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtattcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac 485187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 2416915 - 2417311
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2416915 cagaaacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2417014  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |    
T  2417015 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccac 2417114  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||| ||||||||   ||| |||    
T  2417115 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattaaacctgccaaacaataggactc 2417211  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2417212 aagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 2417310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 24861344 - 24861740
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  24861344 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 24861443  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  24861444 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgcc 24861543  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctc 309  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||   | | |||    
T  24861544 agaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccatctgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 24861640  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | ||||  || |||||   || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24861641 aagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcat 24861739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033741
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctcc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||  | | |||     
T  38033936 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaattcaaacttgataaacggccatgactca 38033840  T
Q  311 aata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  | |||| ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38033839 agcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttattatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 38033741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33799757 - 33799476
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  33799757 caaggagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 33799658  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  33799657 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagat 33799558  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33799557 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 33799476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 40415257 - 40415546
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40415257 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40415356  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  40415357 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgt 40415456  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  || |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40415457 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattctcttacctatgaaatggggtaattcaaacttaccaaacgg 40415546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Original strand, 41363658 - 41363955
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  41363658 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 41363757  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  41363758 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctcca 41363857  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatg-gggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcca 311  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  41363858 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctttctctggatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactcca 41363954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 40414610 - 40415006
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40414610 cagagacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40414709  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  40414710 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccac 40414809  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtc 307  Q
    ||| |||||||||||||  | || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |    
T  40414810 cagaagatcgtcattag--agggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttatcaaacggccaggac 40414904  T
Q  308 tccaata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctc 406  Q
    || |  | ||||  || |||||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40414905 tcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctc 40415003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 34614955 - 34615351
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  34614955 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgt 34615054  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  34615055 gacgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacca 34615154  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg-ggaggtctc 309  Q
    | |||| || ||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||   | | |||    
T  34615155 gaagatagtaattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgacaaacgaccatgactc 34615251  T
Q  310 caata-ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
     |  | |||| || || |||   || ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  34615252 aagcatttcgcccaacgttcatgtttttcatttgaaaagattaaattcttgttatgctgatttagatgaaggtatt-aagtgtaaaggaatgaacctcat 34615350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 41275394 - 41275610
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41275394 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 41275493  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  41275494 gtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 41275593  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41275594 cagaagatcgtcattag 41275610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28706356 - 28706067
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  28706356 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaac 28706257  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28706256 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgc 28706157  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctt-tg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28706156 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacttgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg 28706067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 417
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26487079
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaat 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcatctcttagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaat 26486946  T
Q  285 tcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtatt 384  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26486947 tcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggtattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtatt 26487046  T
Q  385 gaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  26487047 gaagtttcaaagaatggacctcattattttgac 26487079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43638883 - 43638605
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  43638883 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 43638784  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||    
T  43638783 catgttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagat 43638684  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaa 298  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43638683 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaataattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaa 43638605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31172028 - 31171627
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||  ||||    
T  31172028 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacat 31171929  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||| | ||| |||  | |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  31171928 gacaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgcca 31171829  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctcc 310  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||  ||||   || ||||     
T  31171828 gaagatcgtgattaggtatg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgagataattcaaacttgttaaacaacagttctca 31171733  T
Q  311 aatattcgacc-gacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |  ||||  || ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||  ||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31171732 agcattcacccggaagttct-attgttcctttcaaaagattaaattcttgttagtttggtttggatgatcatattgaagtgtcacggaatgcacctcatt 31171634  T
Q  410 cttttga 416  Q
    |||||||    
T  31171633 cttttga 31171627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484756
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3589478 - 3589075
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | | | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  3589478 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgt 3589379  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3589378 gatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgcca 3589279  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct---ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtct 308  Q
    | ||||||| |||||||| |    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |  |||| | |||||||||||||| ||||   || |||    
T  3589278 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctctgaaatgagataattcaaacttgctaaacaacagttct 3589183  T
Q  309 ccaatattcgacc-gacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    | |  ||||  || || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||   || | || |||  ||||||||||||||| |||||| || |||    
T  3589182 caagcattcacccggaaattct-gttgttcctttcaaaagattaaattcttgttattttggtgtagatgttggtattgaagtgtcacggaatgaacatca 3589084  T
Q  408 ttcttttga 416  Q
    |||||||||    
T  3589083 ttcttttga 3589075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575966
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||            || ||  || |||||||||||||||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttgttga------------atttcgccagaagtttgattccgccag 16575882  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
     || |||| |||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16575883 aagttcgtgattaggcaggga---aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcatacttgccaaacg 16575966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 22548263 - 22548380
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22548263 cagagacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 22548362  T
Q  111 atgacgagcatgttttgg 128  Q
     |||||||||||||||||    
T  22548363 gtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Original strand, 16576214 - 16576387
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||| |  |||||   || ||| || | |    
T  16576214 ccttccaactacaacaattgtcttcctctggatggggtaatccaaacttgctaaacggcaggactcaaacattcgcctaacatttctatcgtttctttta 16576313  T
Q  344 aaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16576314 aaaggttaaattcttcttaggccgatttaaatgaaggtattcaagtgtcaaggaattcacctcgttcttttgac 16576387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 367
Target Start/End: Original strand, 18439954 - 18440079
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttc-ctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||  |    
T  18439954 ccttccaactacaacaattgtcttatctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactctaatattcgaccgacattcacaatgttccatt 18440053  T
Q  342 caaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18440054 caaaagattaaattcttgttaggctg 18440079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 16575990 - 16576062
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16575990 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 16576062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28167394 - 28167268
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||  ||||| || ||||||      
T  28167394 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccagcattcccaatgttccat 28167295  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28167294 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 28167268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42604007 - 42603884
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||      
T  42604007 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcaaccgacatttccaatgttccgt 42603908  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42603907 tcaaaagattaaattcttgttagg 42603884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 41856630 - 41856753
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||      
T  41856630 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaagcagcaggactctaatattcaaccggcattcccaatgttccat 41856729  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41856730 tcaaaagattaaattcttgttagg 41856753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26487235 - 26487075
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattg 334  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| | ||||| || ||    
T  26487235 gaatgtaccttccaactgcaacatttatcttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgacaggcattcccaatg 26487136  T
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||| || ||||||    
T  26487135 ttccattcaaaagattaaattattgttaggctaggattaaatgacggtattcaaatgtcaa 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37780693 - 37780574
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcc-tttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaag 347  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  37780693 aactacaaaaattgtgttacatttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattctcaatgttccattcaaaag 37780594  T
Q  348 attaaattcttgttaggctg 367  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  37780593 aataaattcttgttaggctg 37780574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 409
Target Start/End: Original strand, 22549232 - 22549476
Alignment:
Q  161 ggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaa 260  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  || |  |||||||| ||||||    
T  22549232 ggtgacgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaagg-tgta--ttccaacttcaacaa 22549325  T
Q  261 ttgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatatt-cgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattct 357  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||   ||| ||| |  ||| ||  |  |||||   || ||||| | |||||||||||||||    
T  22549326 ttgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactcaagcatttcgctcagcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattct 22549425  T
Q  358 tgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22549426 tgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 22549476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 2417523 - 2417579
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2417523 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 2417579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16576214 - 16576058
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcc 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || | || | |||||  |||| | | | |||||| |    
T  16576214 gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaatagctatcaagtattcacccgaaagttttattgtttc 16576115  T
Q  339 tgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||    
T  16576114 attcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatggtggtattcaagtgtcaa 16576058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Original strand, 40415582 - 40415655
Alignment:
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  40415582 ttcctttgaaaagattaaattcttgttagactggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaagaatgaacctcatt 40415655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40702917 - 40702791
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaa-ttcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctg 340  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| |   | | |||||||||||||||| ||||| || |||| |      
T  40702917 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcaacatgactccaatattcgaccggcattcccaatgttacat 40702818  T
Q  341 tcaaaagattaaattcttgttaggctg 367  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  40702817 tcaaaggattaaattctctttaggctg 40702791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41856622 - 41856576
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41856622 tccaactgcaacaattgtcttcctatgaatggggtaattcaaacttg 41856576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38033588 - 38033532
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  38033588 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 38033532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28705800 - 28705721
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgac 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| |||||||    
T  28705800 gcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtaaatcggcaggactccaacattcgac 28705721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 417
Target Start/End: Original strand, 37780507 - 37780550
Alignment:
Q  374 atgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37780507 atgaaggtattaaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgac 37780550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43637426 - 43637371
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  43637426 aatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 43637371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43637638 - 43637580
Alignment:
Q  350 taaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  43637638 taaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaatgaatgaacctcatt 43637580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Original strand, 28705555 - 28705637
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| || | | | | |||||||||||||    
T  28705555 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcga 28705637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33799414 - 33799332
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  33799414 gaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 33799332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42168841 - 42168776
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  42168841 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtggcaatgaatgaacctcatt 42168776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 42604015 - 42604061
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42604015 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgggacaattcaaacttg 42604061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15031988 - 15031932
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  15031988 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 15031932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 22549629 - 22549685
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  22549629 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 22549685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22843532 - 22843424
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | |||| |||| |||| |||||||| |||||  || |||     
T  22843532 acacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggagaataacgttcagttgattggagttaacgaaggacgacgacttgag 22843433  T
Q  116 gagcatgtt 124  Q
    |||||||||    
T  22843432 gagcatgtt 22843424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 40415808 - 40415864
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  40415808 gaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 40415864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40416056 - 40416000
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  40416056 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaattgggaaattcaaacttgc 40416000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18439942 - 18439899
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18439942 aactgcaacaattgtctttctctgaatggggtaattcaaacttg 18439899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22549631 - 22549576
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22549631 ttccaactgcaacaattgtcttacctttaaatggggtcaattcaaacttgccaaac 22549576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40415810 - 40415755
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  40415810 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaac 40415755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 484822 - 484784
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  484822 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 484784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 484922 - 484840
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||    
T  484922 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 484840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 2417623 - 2417661
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2417623 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2417661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 15031888 - 15031850
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15031888 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 15031850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 22549729 - 22549767
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22549729 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 22549767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 24861893 - 24861975
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  24861893 gaatgcacattccaactgcaacaattttcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 24861975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28706023 - 28705958
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28706023 aaaagattaaattatttttatgctggtttagatgaaggtatt-aaatgtcaaggaatgaacctcatt 28705958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38033488 - 38033450
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38033488 ggtattaaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 38033450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 293
Target Start/End: Original strand, 40702933 - 40702971
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40702933 caacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttg 40702971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 41275717 - 41275755
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41275717 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 41275755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 42604105 - 42604143
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42604105 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 42604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Original strand, 43637179 - 43637261
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatg-gggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||  ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  43637179 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaaagtggcaaattcaaacttgctaaactgcaggactccaatattcga 43637261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 44051090 - 44051128
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44051090 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 44051128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 417
Target Start/End: Original strand, 24861994 - 24862031
Alignment:
Q  380 gtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24861994 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 24862031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41017411 - 41017330
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  41017411 aatgcacattcaaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 41017330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 485142 - 485079
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  485142 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 485079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15032208 - 15032145
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15032208 aaaatattaaattcttgttatgttggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 15032145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16576447 - 16576383
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc-tgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||| |||||||||    
T  16576447 attgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttatataatggtattcaagtgtcaa 16576383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 26452964 - 26453000
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26452964 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 26453000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 288
Target Start/End: Original strand, 28167412 - 28167444
Alignment:
Q  256 aacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167412 aacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaa 28167444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28705702 - 28705666
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28705702 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 28705666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 28705805 - 28705857
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtctt-cctttgaatgggg-taattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  28705805 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgtcaaac 28705857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 33776051 - 33776079
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776051 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 33776079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Original strand, 37780710 - 37780754
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  37780710 caactgcaacaattgtcttcctctgaattgggcaattcaaacttg 37780754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 40415910 - 40415946
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40415910 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 40415946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2548
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  2261 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 2360  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2361 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 2460  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg 301  Q
      ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2461 aaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaaattaccaaacgg 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 319
Target Start/End: Original strand, 4828 - 4910
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcga 319  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||||    
T  4828 gaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcga 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 384
Target Start/End: Original strand, 2584 - 2633
Alignment:
Q  335 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtatt 384  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  2584 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt 2633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 409
Target Start/End: Original strand, 1783 - 2179
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||     
T  1783 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 1882  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1883 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 1982  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtct 308  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  | | ||    
T  1983 ataagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgact 2079  T
Q  309 ccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 408  Q
    | |  |||   ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  2080 caagcatttcgccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaagcaatgaacctcat 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 2334 - 2389
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  2334 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 2389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 2433 - 2471
Alignment:
Q  379 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2433 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18123 - 17734
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  18123 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgag 18025  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18024 catgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 17925  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-gaggtctccaata- 314  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  || ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| |  |     
T  17924 cgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacggttaggactcaagcat 17828  T
Q  315 ttcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    ||||  || |||||   || ||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17827 ttcgctcggcattcatgtttttcctttggaaaaattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaacctcatt 17734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 24899 - 25115
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||  |    
T  24899 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgt 24998  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||    
T  24999 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgcca 25097  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
     |||||||| ||||||||    
T  25098 atagatcgtgattaggta 25115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 63968 - 64095
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  63968 cagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaac 64066  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  64067 gtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 300
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64227
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    || | || ||||||||||||||||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtaggg---taaggtacattccaactacaacaattgtctt 64194  T
Q  268 cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacg 300  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  64195 cctttgaatgaagtaattcaaacttgccaaacg 64227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 400
Target Start/End: Original strand, 64251 - 64306
Alignment:
Q  345 aagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  64251 aagattaaattcttgttaggctgatttcaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 64306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85603
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaacta 85558  T
Q  255 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  85559 caacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 85603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 85648 - 85711
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  85648 aaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 85711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Original strand, 14604 - 14745
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgg-aatgaatgcaccttccaact 253  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||| || || || |  ||||  ||||||||    
T  14604 tatgtgggtgaagttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacg--tgca--ttccaact 14699  T
Q  254 acaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14700 acaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac 14745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 14790 - 14853
Alignment:
Q  343 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctca 407  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14790 aaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggattgaacctca 14853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 410
Target Start/End: Original strand, 2497 - 2670
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgtt 336  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||  || ||| ||| |||||| ||||| |||| | |    |||||    
T  2497 gaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactcttgatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgcccgaaagtgcttttgtt 2596  T
Q  337 cctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattc 410  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  2597 ccattcaaaaggttaaattcttgttggcatcgtttaaatgaaggtattgaggtgtcaaggtctagacctcattc 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 409
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2343
Alignment:
Q  274 aatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaa 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |  ||  ||  ||||| |||||||||   || ||| | | |||| ||||||||||||||||| || || |     
T  2208 aatggggtaattcaaactttccaaacgaaaattcctcagcattcgcccgacattcatgtttttcgtttgaaaatattaaattcttgttaggatggttcag 2307  T
Q  374 atgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2308 atgaaggtattgaagtatcaaggaatgaacctcatt 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2499 - 2445
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2499 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaa 2445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 1054
Alignment:
Q  331 attgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1117 attgttccattcaaaagattaaattcttgttagtttgatttagatgaaggtattgaagtgtcaa 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11427 - 11371
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  11427 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 11371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11325 - 11289
Alignment:
Q  381 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgac 417  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11325 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5560
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||      
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  223 attaggta 230  Q
    ||||||||    
T  5553 attaggta 5560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Original strand, 108003 - 108132
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggt-aattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgaca-ttctcatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||| || | | | | |||||||||||| |||| | |||| | |    
T  108003 gaatgcaccttccaactacaacaattatcttacctttaaatgaagtaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcgtccgagacttct-act 108101  T
Q  334 gttcctgtcaaaagattaaattcttgttagg 364  Q
    |||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  108102 gttccattcaaaatattaaattcctgttagg 108132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36855
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgc 36855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University