View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3388_low_12 (Length: 416)

Name: NF3388_low_12
Description: NF3388
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3388_low_12
NF3388_low_12
[»] chr2 (104 HSPs)
chr2 (11-364)||(35491629-35491981)
chr2 (11-364)||(41498954-41499306)
chr2 (11-364)||(10364497-10364849)
chr2 (11-364)||(19471494-19471846)
chr2 (13-364)||(37312355-37312705)
chr2 (13-364)||(27130369-27130719)
chr2 (11-365)||(2919224-2919577)
chr2 (11-389)||(34521519-34521896)
chr2 (11-364)||(6976832-6977182)
chr2 (71-364)||(40677235-40677527)
chr2 (16-271)||(10360154-10360406)
chr2 (14-310)||(29067726-29068018)
chr2 (11-310)||(39393885-39394182)
chr2 (11-310)||(3936981-3937276)
chr2 (14-291)||(33404012-33404284)
chr2 (11-310)||(43982850-43983145)
chr2 (12-310)||(17424784-17425078)
chr2 (13-227)||(5420465-5420679)
chr2 (11-227)||(3941731-3941947)
chr2 (14-291)||(29111155-29111428)
chr2 (11-276)||(42241049-42241311)
chr2 (11-276)||(12968252-12968514)
chr2 (11-310)||(22001828-22002123)
chr2 (13-298)||(17796036-17796314)
chr2 (11-227)||(16581816-16582034)
chr2 (19-276)||(42120014-42120268)
chr2 (11-269)||(22493265-22493520)
chr2 (13-230)||(6901962-6902179)
chr2 (19-276)||(29906584-29906838)
chr2 (11-227)||(32734641-32734857)
chr2 (243-416)||(43491826-43492000)
chr2 (14-170)||(39799895-39800051)
chr2 (249-416)||(40677037-40677205)
chr2 (243-416)||(10364293-10364467)
chr2 (13-230)||(20148114-20148331)
chr2 (250-416)||(19471297-19471464)
chr2 (243-416)||(35492011-35492184)
chr2 (167-364)||(43491600-43491796)
chr2 (243-413)||(41498750-41498921)
chr2 (16-159)||(18392032-18392179)
chr2 (11-145)||(34638960-34639093)
chr2 (243-412)||(37312151-37312321)
chr2 (266-413)||(2919044-2919192)
chr2 (243-413)||(6977215-6977386)
chr2 (237-416)||(33404387-33404567)
chr2 (123-276)||(27650378-27650527)
chr2 (243-362)||(34521402-34521520)
chr2 (334-416)||(16253828-16253910)
chr2 (167-276)||(31991887-31991992)
chr2 (15-135)||(16253474-16253594)
chr2 (167-269)||(16253605-16253703)
chr2 (11-75)||(40678763-40678827)
chr2 (167-276)||(18036113-18036218)
chr2 (167-265)||(15891609-15891703)
chr2 (339-416)||(20148505-20148582)
chr2 (14-81)||(31770360-31770427)
chr2 (246-310)||(8557385-8557450)
chr2 (246-310)||(10359858-10359923)
chr2 (246-298)||(22493767-22493819)
chr2 (349-416)||(29111510-29111577)
chr2 (334-416)||(6902354-6902436)
chr2 (154-227)||(18393486-18393559)
chr2 (246-310)||(18393832-18393897)
chr2 (246-310)||(42120495-42120560)
chr2 (215-291)||(42240792-42240869)
chr2 (372-416)||(40676886-40676930)
chr2 (375-416)||(2918876-2918917)
chr2 (246-310)||(16582306-16582371)
chr2 (375-416)||(17425447-17425488)
chr2 (11-56)||(26617652-26617697)
chr2 (375-416)||(34521249-34521290)
chr2 (246-310)||(39799785-39799849)
chr2 (375-416)||(41498597-41498638)
chr2 (372-416)||(6977498-6977542)
chr2 (120-172)||(17112399-17112451)
chr2 (237-312)||(19471036-19471112)
chr2 (236-291)||(34521152-34521208)
chr2 (334-365)||(16253768-16253799)
chr2 (378-416)||(39799380-39799418)
chr2 (239-320)||(42120725-42120807)
chr2 (237-266)||(6902199-6902228)
chr2 (375-416)||(8557232-8557273)
chr2 (375-416)||(10359705-10359746)
chr2 (246-310)||(17425270-17425335)
chr2 (375-416)||(17538451-17538492)
chr2 (375-416)||(19471132-19471173)
chr2 (237-270)||(20148351-20148384)
chr2 (254-310)||(22002315-22002372)
chr2 (375-416)||(23408373-23408414)
chr2 (375-416)||(24108305-24108346)
chr2 (375-416)||(28476163-28476204)
chr2 (375-416)||(29073702-29073743)
chr2 (375-416)||(35492248-35492289)
chr2 (246-310)||(39799530-39799595)
chr2 (375-416)||(43492112-43492153)
chr2 (237-312)||(5420861-5420937)
chr2 (380-416)||(16582483-16582519)
chr2 (237-269)||(22493817-22493849)
chr2 (239-314)||(22493990-22494066)
chr2 (237-312)||(24108209-24108285)
chr2 (239-267)||(32736853-32736881)
chr2 (237-312)||(35492309-35492385)
chr2 (237-269)||(42120558-42120590)
chr2 (380-416)||(42120672-42120708)
[»] chr4 (145 HSPs)
chr4 (11-404)||(43889324-43889716)
chr4 (11-364)||(34153151-34153503)
chr4 (11-364)||(22436901-22437253)
chr4 (11-364)||(47657220-47657572)
chr4 (11-364)||(21169441-21169793)
chr4 (11-364)||(34529661-34530013)
chr4 (13-364)||(957320-957670)
chr4 (14-364)||(6282188-6282537)
chr4 (11-364)||(44560045-44560397)
chr4 (11-364)||(49791801-49792153)
chr4 (14-365)||(36776383-36776733)
chr4 (14-364)||(49423622-49423972)
chr4 (12-396)||(2773000-2773382)
chr4 (12-328)||(49817545-49817860)
chr4 (11-310)||(21017099-21017394)
chr4 (11-310)||(40353695-40353990)
chr4 (12-276)||(14330649-14330910)
chr4 (11-310)||(28082228-28082524)
chr4 (16-310)||(55796738-55797028)
chr4 (16-304)||(20778796-20779081)
chr4 (11-300)||(51027697-51027984)
chr4 (11-276)||(51428147-51428409)
chr4 (11-310)||(41794484-41794779)
chr4 (11-365)||(4785286-4785639)
chr4 (14-291)||(32937843-32938116)
chr4 (11-271)||(49063969-49064226)
chr4 (11-310)||(6177237-6177532)
chr4 (11-235)||(26591678-26591902)
chr4 (11-310)||(56138900-56139195)
chr4 (13-271)||(25762590-25762845)
chr4 (13-269)||(17211258-17211511)
chr4 (14-310)||(39588922-39589216)
chr4 (11-271)||(1226150-1226406)
chr4 (11-310)||(49094735-49095030)
chr4 (13-310)||(9489671-9489965)
chr4 (11-227)||(242417-242633)
chr4 (14-290)||(1042744-1043016)
chr4 (11-227)||(37866396-37866613)
chr4 (13-291)||(24606744-24607018)
chr4 (13-264)||(42886255-42886509)
chr4 (19-276)||(31824584-31824838)
chr4 (11-267)||(33163508-33163761)
chr4 (14-276)||(20901623-20901882)
chr4 (13-270)||(3393296-3393549)
chr4 (14-291)||(11288288-11288559)
chr4 (40-276)||(21711549-21711782)
chr4 (14-227)||(45939518-45939731)
chr4 (13-269)||(18412587-18412839)
chr4 (11-271)||(46816485-46816740)
chr4 (13-270)||(10312264-10312517)
chr4 (243-413)||(34529457-34529628)
chr4 (68-276)||(27759374-27759579)
chr4 (14-276)||(31324167-31324425)
chr4 (245-416)||(34152949-34153121)
chr4 (243-413)||(49791597-49791768)
chr4 (243-416)||(21169823-21169997)
chr4 (243-413)||(2773384-2773555)
chr4 (11-271)||(13850739-13850995)
chr4 (11-276)||(13866253-13866514)
chr4 (243-416)||(957116-957290)
chr4 (243-413)||(22437286-22437457)
chr4 (243-416)||(49423418-49423592)
chr4 (243-412)||(49571481-49571655)
chr4 (243-396)||(43889162-43889316)
chr4 (245-416)||(4785087-4785257)
chr4 (243-416)||(49817304-49817478)
chr4 (243-416)||(42886638-42886812)
chr4 (243-413)||(36776180-36776351)
chr4 (238-416)||(24607425-24607604)
chr4 (243-336)||(26591576-26591670)
chr4 (241-416)||(24607100-24607276)
chr4 (142-270)||(49817159-49817283)
chr4 (167-276)||(17292108-17292213)
chr4 (334-416)||(32937678-32937760)
chr4 (334-416)||(17211636-17211718)
chr4 (334-416)||(32937354-32937436)
chr4 (225-291)||(49064563-49064628)
chr4 (334-416)||(49816954-49817036)
chr4 (13-106)||(21412647-21412740)
chr4 (243-310)||(49064458-49064526)
chr4 (339-402)||(3393685-3393748)
chr4 (246-304)||(21712014-21712073)
chr4 (123-271)||(23124486-23124630)
chr4 (246-310)||(20901339-20901404)
chr4 (250-310)||(46816192-46816253)
chr4 (372-413)||(241942-241983)
chr4 (246-310)||(1043226-1043291)
chr4 (243-280)||(14330355-14330392)
chr4 (243-416)||(18412964-18413137)
chr4 (246-310)||(39589406-39589471)
chr4 (246-310)||(45940004-45940069)
chr4 (372-416)||(4784876-4784920)
chr4 (372-416)||(10312639-10312683)
chr4 (372-416)||(21170108-21170152)
chr4 (372-416)||(51427697-51427741)
chr4 (243-310)||(51427853-51427921)
chr4 (217-291)||(14330253-14330326)
chr4 (249-310)||(38132786-38132848)
chr4 (375-416)||(22437569-22437610)
chr4 (246-310)||(27759806-27759871)
chr4 (375-416)||(27759983-27760024)
chr4 (246-310)||(28082714-28082779)
chr4 (375-416)||(31824198-31824239)
chr4 (375-416)||(49571767-49571808)
chr4 (375-416)||(49791444-49791485)
chr4 (246-310)||(56139387-56139452)
chr4 (250-310)||(242105-242165)
chr4 (246-278)||(885318-885350)
chr4 (240-276)||(3393810-3393846)
chr4 (378-416)||(6176830-6176868)
chr4 (375-413)||(6282013-6282051)
chr4 (378-416)||(21016692-21016730)
chr4 (240-270)||(32937558-32937588)
chr4 (247-304)||(32937590-32937648)
chr4 (253-310)||(51027437-51027495)
chr4 (246-310)||(6176980-6177045)
chr4 (375-416)||(14289951-14289992)
chr4 (375-416)||(14330151-14330192)
chr4 (240-310)||(17211767-17211839)
chr4 (246-310)||(21016842-21016907)
chr4 (375-416)||(21712185-21712226)
chr4 (246-310)||(25763077-25763142)
chr4 (237-313)||(36775931-36776008)
chr4 (246-310)||(37866885-37866950)
chr4 (237-278)||(37867024-37867065)
chr4 (375-416)||(38132630-38132671)
chr4 (246-310)||(49095222-49095287)
chr4 (246-310)||(55797220-55797285)
chr4 (237-269)||(885348-885380)
chr4 (380-416)||(885462-885498)
chr4 (241-320)||(885515-885595)
chr4 (380-416)||(1043403-1043439)
chr4 (239-267)||(1226898-1226926)
chr4 (215-267)||(4785006-4785058)
chr4 (380-416)||(9490136-9490172)
chr4 (240-276)||(9717842-9717878)
chr4 (336-364)||(10314947-10314975)
chr4 (237-269)||(20901120-20901152)
chr4 (380-416)||(40353290-40353326)
chr4 (372-412)||(42886941-42886981)
chr4 (380-416)||(45940181-45940217)
chr4 (237-269)||(46816158-46816190)
chr4 (380-416)||(47870752-47870788)
chr4 (380-416)||(49095399-49095435)
chr4 (237-269)||(51027232-51027264)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (11-364)||(13402527-13402879)
chr6 (11-364)||(32027491-32027843)
chr6 (11-364)||(32037550-32037902)
chr6 (11-364)||(12396770-12397122)
chr6 (11-364)||(34802759-34803111)
chr6 (11-310)||(29066547-29066844)
chr6 (11-310)||(29075560-29075857)
chr6 (11-310)||(27640174-27640469)
chr6 (76-364)||(30257442-30257729)
chr6 (12-310)||(11692446-11692740)
chr6 (11-310)||(29110531-29110829)
chr6 (11-310)||(6205478-6205773)
chr6 (11-291)||(801160-801435)
chr6 (11-310)||(29108134-29108431)
chr6 (13-300)||(14115033-14115315)
chr6 (14-201)||(22305793-22305980)
chr6 (29-271)||(35058693-35058932)
chr6 (243-413)||(12397155-12397326)
chr6 (243-413)||(32027287-32027458)
chr6 (243-413)||(32037346-32037517)
chr6 (243-413)||(35020896-35021067)
chr6 (243-409)||(13403198-13403365)
chr6 (179-364)||(35021100-35021284)
chr6 (233-413)||(30257228-30257409)
chr6 (243-416)||(4495280-4495453)
chr6 (280-416)||(13402909-13403045)
chr6 (246-416)||(14122977-14123148)
chr6 (280-409)||(13403057-13403186)
chr6 (155-310)||(24021017-24021168)
chr6 (147-271)||(3765745-3765867)
chr6 (146-276)||(17465289-17465415)
chr6 (155-291)||(2192535-2192667)
chr6 (334-416)||(23911126-23911207)
chr6 (165-276)||(34134799-34134906)
chr6 (233-364)||(4495119-4495250)
chr6 (237-301)||(14123415-14123479)
chr6 (215-267)||(30257159-30257211)
chr6 (243-291)||(801664-801713)
chr6 (372-416)||(7821247-7821291)
chr6 (372-416)||(32027131-32027175)
chr6 (372-416)||(32037190-32037234)
chr6 (246-291)||(35058397-35058443)
chr6 (246-310)||(6205965-6206030)
chr6 (375-416)||(12397438-12397479)
chr6 (375-416)||(13403477-13403518)
chr6 (246-310)||(29067034-29067099)
chr6 (246-310)||(29108621-29108686)
chr6 (246-310)||(27640661-27640725)
chr6 (11-46)||(3765901-3765936)
chr6 (123-189)||(2402306-2402372)
chr6 (378-416)||(6206142-6206180)
chr6 (378-416)||(11693109-11693147)
chr6 (130-208)||(18743995-18744073)
chr6 (237-271)||(20192534-20192568)
chr6 (237-271)||(20242086-20242120)
chr6 (237-271)||(22136070-22136104)
chr6 (237-271)||(22143423-22143457)
chr6 (334-404)||(34135033-34135102)
chr6 (246-310)||(11692932-11692997)
chr6 (375-416)||(35058244-35058285)
chr6 (380-416)||(2193049-2193085)
chr6 (237-312)||(4495604-4495680)
chr6 (237-277)||(14482775-14482815)
chr6 (380-416)||(24020612-24020648)
chr6 (380-416)||(29067155-29067191)
chr6 (380-416)||(29108742-29108778)
chr6 (239-267)||(34132140-34132168)
[»] chr5 (105 HSPs)
chr5 (11-363)||(18308249-18308600)
chr5 (13-364)||(1400168-1400518)
chr5 (11-364)||(4723940-4724292)
chr5 (11-365)||(35565261-35565613)
chr5 (11-310)||(8537943-8538239)
chr5 (11-310)||(11346698-11346994)
chr5 (11-278)||(7184-7447)
chr5 (11-264)||(6793351-6793604)
chr5 (11-310)||(8576064-8576359)
chr5 (18-310)||(30709594-30709883)
chr5 (11-264)||(36350279-36350523)
chr5 (11-310)||(19036597-19036892)
chr5 (14-310)||(38854150-38854442)
chr5 (11-276)||(3601330-3601592)
chr5 (11-227)||(541637-541853)
chr5 (13-276)||(1971356-1971616)
chr5 (14-227)||(11027769-11027982)
chr5 (11-310)||(27661300-27661595)
chr5 (11-310)||(28880980-28881275)
chr5 (11-276)||(19400352-19400614)
chr5 (92-396)||(1694859-1695162)
chr5 (243-416)||(18308631-18308804)
chr5 (13-230)||(33370645-33370862)
chr5 (12-227)||(40009518-40009733)
chr5 (249-416)||(4723742-4723910)
chr5 (11-185)||(3169593-3169766)
chr5 (13-196)||(35927470-35927653)
chr5 (243-413)||(36349987-36350158)
chr5 (247-412)||(25498382-25498547)
chr5 (243-416)||(1399967-1400138)
chr5 (243-413)||(1695164-1695335)
chr5 (243-413)||(35565645-35565816)
chr5 (14-227)||(17366738-17366950)
chr5 (243-416)||(34683587-34683762)
chr5 (13-190)||(2599210-2599387)
chr5 (243-413)||(6793138-6793309)
chr5 (137-276)||(7082336-7082472)
chr5 (14-127)||(3458828-3458941)
chr5 (23-100)||(1693382-1693459)
chr5 (167-276)||(17195316-17195421)
chr5 (243-405)||(33371336-33371499)
chr5 (167-269)||(18920879-18920977)
chr5 (238-416)||(17366388-17366567)
chr5 (11-65)||(7082281-7082335)
chr5 (238-413)||(10398164-10398340)
chr5 (336-416)||(12743057-12743137)
chr5 (336-416)||(12805875-12805955)
chr5 (246-310)||(19400841-19400906)
chr5 (13-111)||(12742706-12742804)
chr5 (168-230)||(12742818-12742880)
chr5 (123-269)||(25360547-25360690)
chr5 (172-298)||(3458940-3459064)
chr5 (155-310)||(22283704-22283855)
chr5 (167-276)||(36311902-36312007)
chr5 (246-310)||(1971843-1971908)
chr5 (246-310)||(3170011-3170076)
chr5 (215-276)||(7082793-7082853)
chr5 (13-106)||(12805524-12805617)
chr5 (246-310)||(40012094-40012159)
chr5 (167-277)||(13131034-13131140)
chr5 (372-416)||(25498739-25498783)
chr5 (334-413)||(33371003-33371082)
chr5 (168-230)||(12805636-12805698)
chr5 (336-416)||(12806212-12806291)
chr5 (243-314)||(20196551-20196623)
chr5 (372-416)||(35565928-35565972)
chr5 (232-291)||(1171725-1171783)
chr5 (246-304)||(33371112-33371171)
chr5 (375-416)||(1695447-1695488)
chr5 (250-310)||(3459268-3459329)
chr5 (246-290)||(3601839-3601884)
chr5 (375-416)||(6792985-6793026)
chr5 (375-416)||(19401018-19401059)
chr5 (375-416)||(20196735-20196776)
chr5 (283-364)||(36350191-36350272)
chr5 (372-416)||(1171844-1171888)
chr5 (378-416)||(11347364-11347402)
chr5 (246-310)||(6895-6960)
chr5 (375-416)||(1972020-1972061)
chr5 (375-416)||(3459445-3459486)
chr5 (237-278)||(3602096-3602137)
chr5 (243-291)||(7082717-7082766)
chr5 (246-310)||(8575807-8575872)
chr5 (246-310)||(19036340-19036405)
chr5 (375-416)||(34683434-34683475)
chr5 (375-416)||(40012271-40012312)
chr5 (380-416)||(6747-6783)
chr5 (237-269)||(3459331-3459363)
chr5 (237-269)||(3601882-3601914)
chr5 (372-416)||(4723580-4723624)
chr5 (372-416)||(7082929-7082973)
chr5 (380-416)||(8575659-8575695)
chr5 (243-310)||(11347184-11347252)
chr5 (237-269)||(12742900-12742932)
chr5 (240-276)||(12743532-12743568)
chr5 (240-276)||(12806353-12806389)
chr5 (237-269)||(19400904-19400936)
chr5 (237-301)||(20196807-20196871)
chr5 (380-416)||(22284223-22284259)
chr5 (380-416)||(27660895-27660931)
chr5 (238-313)||(35565988-35566064)
chr5 (376-416)||(36349836-36349876)
chr5 (380-416)||(38854810-38854846)
chr5 (237-269)||(40012157-40012189)
chr5 (239-267)||(40012378-40012406)
[»] chr3 (167 HSPs)
chr3 (11-364)||(46414197-46414549)
chr3 (14-364)||(34471939-34472288)
chr3 (11-364)||(51013141-51013493)
chr3 (11-364)||(30192542-30192894)
chr3 (14-364)||(51015284-51015633)
chr3 (11-364)||(43569914-43570266)
chr3 (13-364)||(34647130-34647480)
chr3 (19-397)||(41577918-41578293)
chr3 (11-364)||(2428491-2428843)
chr3 (11-364)||(55206747-55207099)
chr3 (11-364)||(41803906-41804258)
chr3 (14-364)||(45100328-45100677)
chr3 (11-364)||(14631449-14631801)
chr3 (11-364)||(52569272-52569623)
chr3 (14-364)||(7246101-7246450)
chr3 (13-364)||(7954209-7954560)
chr3 (12-364)||(49273404-49273755)
chr3 (13-271)||(44927469-44927724)
chr3 (14-264)||(37281459-37281709)
chr3 (12-265)||(10053236-10053485)
chr3 (14-264)||(36721351-36721601)
chr3 (12-276)||(13895823-13896084)
chr3 (50-364)||(42323253-42323565)
chr3 (11-310)||(2646796-2647091)
chr3 (13-276)||(34693243-34693503)
chr3 (14-310)||(2268414-2268706)
chr3 (11-291)||(3494968-3495244)
chr3 (11-310)||(49139974-49140269)
chr3 (12-310)||(49218654-49218950)
chr3 (11-310)||(54390446-54390741)
chr3 (12-310)||(36135013-36135306)
chr3 (11-238)||(47759879-47760106)
chr3 (11-276)||(19453182-19453444)
chr3 (11-265)||(50458652-50458906)
chr3 (11-304)||(43477061-43477352)
chr3 (11-310)||(4004007-4004302)
chr3 (11-310)||(34049731-34050026)
chr3 (11-310)||(46403007-46403302)
chr3 (14-276)||(24702225-24702483)
chr3 (14-271)||(39416906-39417160)
chr3 (11-227)||(49610493-49610709)
chr3 (11-276)||(42949973-42950235)
chr3 (106-364)||(46346475-46346732)
chr3 (11-298)||(47065691-47065976)
chr3 (11-227)||(51695605-51695821)
chr3 (13-365)||(8633227-8633572)
chr3 (13-269)||(6754210-6754463)
chr3 (11-276)||(25576545-25576806)
chr3 (14-271)||(48087510-48087764)
chr3 (11-227)||(42382275-42382491)
chr3 (11-276)||(53826649-53826911)
chr3 (14-364)||(33449018-33449351)
chr3 (11-227)||(42383055-42383271)
chr3 (15-269)||(6464305-6464556)
chr3 (72-227)||(50997453-50997608)
chr3 (12-276)||(44835440-44835701)
chr3 (243-413)||(41578294-41578465)
chr3 (13-276)||(774292-774551)
chr3 (243-416)||(7246480-7246654)
chr3 (243-416)||(2428873-2429047)
chr3 (11-237)||(27186952-27187178)
chr3 (243-416)||(46346271-46346445)
chr3 (243-413)||(41804291-41804462)
chr3 (243-413)||(52569068-52569239)
chr3 (243-413)||(55206543-55206714)
chr3 (243-413)||(14631834-14632005)
chr3 (242-407)||(8633023-8633189)
chr3 (255-416)||(43570296-43570458)
chr3 (243-413)||(10053045-10053216)
chr3 (243-413)||(42323049-42323220)
chr3 (243-413)||(46413993-46414164)
chr3 (243-416)||(30192924-30193098)
chr3 (243-413)||(34471735-34471906)
chr3 (18-269)||(20375843-20376090)
chr3 (243-413)||(49273788-49273963)
chr3 (243-413)||(34646926-34647097)
chr3 (243-416)||(51015663-51015837)
chr3 (243-413)||(45100134-45100295)
chr3 (11-271)||(14265412-14265665)
chr3 (248-413)||(51012951-51013108)
chr3 (135-269)||(18440873-18441003)
chr3 (135-269)||(19485947-19486077)
chr3 (40-276)||(25887562-25887796)
chr3 (237-416)||(27187699-27187879)
chr3 (253-416)||(7954590-7954754)
chr3 (240-416)||(6464002-6464180)
chr3 (240-416)||(6754588-6754766)
chr3 (14-96)||(15637031-15637113)
chr3 (13-64)||(11378906-11378957)
chr3 (334-416)||(8632792-8632874)
chr3 (244-412)||(25887271-25887440)
chr3 (306-412)||(33448878-33448984)
chr3 (12-61)||(46346745-46346794)
chr3 (246-298)||(47066191-47066243)
chr3 (11-54)||(42328288-42328331)
chr3 (246-310)||(44927955-44928020)
chr3 (243-310)||(19452806-19452874)
chr3 (215-291)||(37282040-37282115)
chr3 (337-416)||(18441128-18441207)
chr3 (337-416)||(19486202-19486281)
chr3 (321-416)||(20375623-20375718)
chr3 (334-416)||(15637374-15637455)
chr3 (246-303)||(24701934-24701992)
chr3 (246-310)||(13895532-13895597)
chr3 (246-310)||(25576253-25576318)
chr3 (246-310)||(44835149-44835214)
chr3 (235-332)||(55268755-55268851)
chr3 (215-291)||(36720945-36721020)
chr3 (243-310)||(37281945-37282013)
chr3 (241-320)||(53826437-53826517)
chr3 (243-289)||(36721047-36721094)
chr3 (239-313)||(44834902-44834977)
chr3 (239-313)||(47066415-47066490)
chr3 (246-310)||(2268157-2268222)
chr3 (375-416)||(7246766-7246807)
chr3 (246-310)||(11378639-11378704)
chr3 (171-269)||(15637155-15637249)
chr3 (375-416)||(34471582-34471623)
chr3 (372-413)||(34646718-34646759)
chr3 (246-310)||(36135498-36135563)
chr3 (375-416)||(39416456-39416497)
chr3 (375-416)||(42322904-42322945)
chr3 (246-310)||(42383543-42383608)
chr3 (375-416)||(42383720-42383761)
chr3 (375-416)||(46413827-46413868)
chr3 (375-416)||(47066355-47066396)
chr3 (375-416)||(49274075-49274116)
chr3 (246-310)||(50997879-50997944)
chr3 (375-416)||(52568919-52568960)
chr3 (340-416)||(7955038-7955114)
chr3 (215-267)||(34646847-34646899)
chr3 (372-416)||(45099978-45100022)
chr3 (237-272)||(7954882-7954917)
chr3 (237-364)||(27187543-27187669)
chr3 (378-416)||(34050395-34050433)
chr3 (375-413)||(41578580-41578618)
chr3 (239-320)||(42383773-42383855)
chr3 (375-413)||(46346118-46346156)
chr3 (378-416)||(46403671-46403709)
chr3 (378-416)||(49139567-49139605)
chr3 (306-364)||(50458571-50458629)
chr3 (378-416)||(54391110-54391148)
chr3 (378-416)||(55268570-55268608)
chr3 (246-310)||(3494692-3494757)
chr3 (246-310)||(4003750-4003815)
chr3 (375-416)||(14632117-14632158)
chr3 (375-416)||(19452653-19452694)
chr3 (246-310)||(34050218-34050283)
chr3 (246-310)||(34692952-34693017)
chr3 (246-310)||(39416609-39416674)
chr3 (375-416)||(43477707-43477748)
chr3 (375-416)||(44834996-44835037)
chr3 (246-310)||(49139717-49139782)
chr3 (375-416)||(49610830-49610871)
chr3 (246-310)||(54390933-54390998)
chr3 (380-416)||(2268009-2268045)
chr3 (380-416)||(2646391-2646427)
chr3 (380-416)||(11378491-11378527)
chr3 (380-416)||(13895397-13895433)
chr3 (380-416)||(24701786-24701822)
chr3 (237-269)||(25576223-25576255)
chr3 (380-416)||(34692804-34692840)
chr3 (237-269)||(42383606-42383638)
chr3 (239-267)||(42949656-42949684)
chr3 (237-269)||(44835119-44835151)
chr3 (380-416)||(49218250-49218286)
chr3 (380-416)||(51695448-51695484)
[»] chr7 (108 HSPs)
chr7 (12-364)||(41048776-41049127)
chr7 (11-397)||(43350931-43351314)
chr7 (11-364)||(21187162-21187514)
chr7 (11-364)||(48270640-48270992)
chr7 (11-364)||(48315043-48315395)
chr7 (11-364)||(46862057-46862409)
chr7 (14-364)||(36393688-36394036)
chr7 (11-364)||(28114256-28114608)
chr7 (11-364)||(42735255-42735606)
chr7 (29-364)||(30354678-30355012)
chr7 (11-364)||(15337768-15338120)
chr7 (13-364)||(21650518-21650867)
chr7 (12-310)||(40588542-40588838)
chr7 (13-290)||(21614700-21614973)
chr7 (11-310)||(17839315-17839612)
chr7 (11-310)||(20564751-20565046)
chr7 (11-277)||(18237556-18237819)
chr7 (11-227)||(39477239-39477455)
chr7 (12-219)||(17183205-17183412)
chr7 (12-227)||(34140858-34141073)
chr7 (12-276)||(2356282-2356543)
chr7 (13-272)||(1642545-1642800)
chr7 (14-227)||(30360512-30360724)
chr7 (11-310)||(45363170-45363458)
chr7 (12-291)||(10523061-10523337)
chr7 (11-226)||(47268891-47269105)
chr7 (14-188)||(28979060-28979234)
chr7 (11-227)||(20378702-20378918)
chr7 (14-271)||(41217609-41217863)
chr7 (19-227)||(48220743-48220949)
chr7 (243-416)||(48271022-48271196)
chr7 (243-412)||(46861853-46862023)
chr7 (245-416)||(21186960-21187132)
chr7 (243-413)||(30354474-30354645)
chr7 (11-165)||(26603266-26603420)
chr7 (248-416)||(36393489-36393658)
chr7 (103-310)||(9367040-9367243)
chr7 (243-413)||(21650900-21651071)
chr7 (112-276)||(2205990-2206151)
chr7 (243-413)||(28114052-28114223)
chr7 (11-135)||(13916825-13916949)
chr7 (243-416)||(20877711-20877885)
chr7 (237-416)||(21614113-21614293)
chr7 (243-416)||(15337564-15337738)
chr7 (11-115)||(42682948-42683052)
chr7 (144-310)||(13920431-13920593)
chr7 (123-230)||(28066359-28066466)
chr7 (334-416)||(21614536-21614618)
chr7 (167-276)||(26601731-26601837)
chr7 (185-302)||(34139332-34139446)
chr7 (173-276)||(3380628-3380727)
chr7 (243-314)||(10224543-10224615)
chr7 (123-271)||(150192-150336)
chr7 (339-416)||(1642348-1642425)
chr7 (246-310)||(17183696-17183761)
chr7 (155-267)||(17320163-17320272)
chr7 (241-304)||(21614442-21614506)
chr7 (130-237)||(18149638-18149745)
chr7 (167-237)||(11824841-11824911)
chr7 (246-310)||(18238045-18238110)
chr7 (246-310)||(41218093-41218158)
chr7 (372-416)||(10224727-10224771)
chr7 (372-416)||(39476747-39476791)
chr7 (249-291)||(34141364-34141407)
chr7 (246-291)||(39476903-39476949)
chr7 (375-413)||(42735639-42735677)
chr7 (375-413)||(43350892-43350930)
chr7 (14-63)||(8726381-8726430)
chr7 (246-310)||(10523548-10523613)
chr7 (237-313)||(20877462-20877539)
chr7 (375-416)||(20877558-20877599)
chr7 (375-416)||(21186805-21186846)
chr7 (375-416)||(26601287-26601328)
chr7 (246-310)||(26601440-26601505)
chr7 (246-290)||(30361016-30361061)
chr7 (375-416)||(30361173-30361214)
chr7 (246-310)||(48220406-48220471)
chr7 (375-416)||(48271308-48271349)
chr7 (238-278)||(17183969-17184009)
chr7 (247-302)||(34157032-34157087)
chr7 (239-313)||(26500363-26500438)
chr7 (239-313)||(26592275-26592350)
chr7 (239-313)||(30361233-30361308)
chr7 (239-313)||(39476656-39476731)
chr7 (378-416)||(9366632-9366670)
chr7 (378-416)||(20378543-20378581)
chr7 (378-416)||(30354324-30354362)
chr7 (372-402)||(34353300-34353330)
chr7 (375-413)||(41622741-41622779)
chr7 (246-310)||(9366783-9366848)
chr7 (246-310)||(17839789-17839854)
chr7 (237-313)||(18238282-18238359)
chr7 (246-310)||(20565238-20565303)
chr7 (246-310)||(34157285-34157349)
chr7 (375-412)||(41218274-41218311)
chr7 (237-270)||(42683174-42683207)
chr7 (237-313)||(46861609-46861686)
chr7 (240-276)||(1642247-1642283)
chr7 (12-52)||(3924805-3924845)
chr7 (380-416)||(13920962-13920998)
chr7 (237-269)||(26601410-26601442)
chr7 (380-416)||(28978717-28978753)
chr7 (237-269)||(39476873-39476905)
chr7 (380-416)||(42683070-42683106)
chr7 (237-320)||(45362666-45362750)
chr7 (380-416)||(45362767-45362803)
chr7 (380-416)||(48220258-48220294)
chr7 (237-269)||(48220376-48220408)
[»] chr1 (159 HSPs)
chr1 (14-364)||(49396697-49397046)
chr1 (11-364)||(13972914-13973266)
chr1 (11-364)||(14173622-14173974)
chr1 (11-396)||(38046267-38046650)
chr1 (12-364)||(36909552-36909903)
chr1 (11-364)||(24270229-24270579)
chr1 (11-364)||(6435762-6436114)
chr1 (11-364)||(35586796-35587145)
chr1 (11-362)||(49926246-49926595)
chr1 (11-264)||(17686324-17686577)
chr1 (14-363)||(35184963-35185312)
chr1 (14-364)||(23342634-23342983)
chr1 (11-364)||(41780683-41781035)
chr1 (13-298)||(35576331-35576614)
chr1 (51-364)||(37778109-37778421)
chr1 (11-310)||(49427377-49427673)
chr1 (11-254)||(18170015-18170258)
chr1 (12-310)||(29762140-29762436)
chr1 (11-276)||(12791227-12791489)
chr1 (14-227)||(48215191-48215404)
chr1 (13-365)||(13283697-13284044)
chr1 (14-310)||(13635217-13635510)
chr1 (11-310)||(29435963-29436260)
chr1 (11-310)||(51269792-51270089)
chr1 (11-309)||(44597691-44597987)
chr1 (11-304)||(27486615-27486906)
chr1 (13-269)||(39856867-39857120)
chr1 (11-310)||(44337238-44337535)
chr1 (11-267)||(17697036-17697288)
chr1 (11-276)||(39224151-39224413)
chr1 (11-276)||(42571730-42571992)
chr1 (14-298)||(21484576-21484856)
chr1 (11-310)||(19160307-19160602)
chr1 (23-364)||(3658475-3658814)
chr1 (14-276)||(48568358-48568617)
chr1 (14-276)||(45689114-45689371)
chr1 (13-276)||(49262942-49263202)
chr1 (13-268)||(5765198-5765449)
chr1 (11-397)||(17372717-17373098)
chr1 (19-276)||(47487991-47488245)
chr1 (13-210)||(35526194-35526391)
chr1 (243-416)||(13973296-13973470)
chr1 (11-276)||(27035272-27035534)
chr1 (13-230)||(18842431-18842648)
chr1 (24-361)||(24363680-24364003)
chr1 (11-227)||(50068259-50068475)
chr1 (14-271)||(30309791-30310039)
chr1 (14-276)||(41874838-41875097)
chr1 (43-276)||(46180234-46180465)
chr1 (11-181)||(49598921-49599090)
chr1 (240-413)||(49926038-49926211)
chr1 (243-416)||(14173418-14173592)
chr1 (137-360)||(40533154-40533376)
chr1 (243-416)||(37778451-37778625)
chr1 (243-416)||(35525857-35526031)
chr1 (13-270)||(16532051-16532304)
chr1 (280-416)||(41781065-41781201)
chr1 (243-413)||(35185346-35185517)
chr1 (243-413)||(35586592-35586763)
chr1 (34-269)||(16081298-16081529)
chr1 (243-416)||(23343013-23343186)
chr1 (240-416)||(17686015-17686192)
chr1 (243-413)||(24270025-24270196)
chr1 (243-416)||(6436144-6436318)
chr1 (243-416)||(36909933-36910106)
chr1 (243-413)||(40532946-40533117)
chr1 (306-413)||(38046158-38046265)
chr1 (243-416)||(24363472-24363647)
chr1 (67-152)||(13148365-13148450)
chr1 (147-224)||(29707544-29707621)
chr1 (237-408)||(13284081-13284253)
chr1 (238-413)||(17373099-17373275)
chr1 (336-416)||(5765573-5765653)
chr1 (13-81)||(16098078-16098146)
chr1 (238-413)||(18842828-18843004)
chr1 (333-416)||(21484204-21484287)
chr1 (340-416)||(16531852-16531928)
chr1 (165-271)||(14772492-14772594)
chr1 (246-310)||(22527984-22528049)
chr1 (246-310)||(47487699-47487764)
chr1 (245-397)||(49397048-49397188)
chr1 (246-310)||(51270279-51270344)
chr1 (246-310)||(39223861-39223925)
chr1 (235-313)||(35586328-35586407)
chr1 (246-304)||(44336983-44337042)
chr1 (249-310)||(3658951-3659013)
chr1 (247-304)||(27486355-27486413)
chr1 (249-310)||(46179945-46180007)
chr1 (246-298)||(29436462-29436515)
chr1 (246-310)||(30309495-30309560)
chr1 (246-310)||(41874548-41874613)
chr1 (246-310)||(49262659-49262724)
chr1 (246-310)||(50067921-50067986)
chr1 (243-310)||(18170504-18170572)
chr1 (123-211)||(19262429-19262517)
chr1 (372-416)||(24269869-24269913)
chr1 (372-416)||(36910218-36910262)
chr1 (372-416)||(42571279-42571323)
chr1 (334-413)||(16081658-16081737)
chr1 (232-291)||(18170606-18170664)
chr1 (243-301)||(38044852-38044911)
chr1 (372-414)||(41781327-41781369)
chr1 (246-280)||(48568068-48568102)
chr1 (375-416)||(13973582-13973623)
chr1 (246-310)||(29707201-29707266)
chr1 (246-310)||(29761827-29761892)
chr1 (375-416)||(37778764-37778805)
chr1 (375-416)||(38044699-38044740)
chr1 (246-310)||(45689598-45689663)
chr1 (375-416)||(46179792-46179833)
chr1 (375-416)||(49598397-49598438)
chr1 (334-416)||(16097843-16097922)
chr1 (237-320)||(17685770-17685854)
chr1 (372-416)||(17685863-17685907)
chr1 (237-313)||(37778824-37778900)
chr1 (250-313)||(48227012-48227076)
chr1 (239-278)||(3659310-3659349)
chr1 (243-305)||(18170668-18170731)
chr1 (232-291)||(18170765-18170823)
chr1 (246-304)||(21484440-21484499)
chr1 (246-310)||(27034980-27035046)
chr1 (233-364)||(35526061-35526191)
chr1 (239-313)||(46924689-46924764)
chr1 (13-71)||(15471510-15471568)
chr1 (241-310)||(17697498-17697568)
chr1 (237-267)||(27034786-27034816)
chr1 (375-413)||(27034882-27034920)
chr1 (249-298)||(42571442-42571492)
chr1 (13-55)||(48707090-48707132)
chr1 (249-310)||(49427863-49427925)
chr1 (246-310)||(49598550-49598618)
chr1 (246-310)||(19160794-19160859)
chr1 (194-310)||(22527680-22527792)
chr1 (375-416)||(30309357-30309398)
chr1 (375-416)||(35185641-35185682)
chr1 (375-416)||(35586426-35586467)
chr1 (375-416)||(39223728-39223769)
chr1 (375-416)||(45689774-45689815)
chr1 (375-416)||(46924783-46924824)
chr1 (375-416)||(47487546-47487587)
chr1 (375-416)||(48567915-48567956)
chr1 (375-416)||(49262506-49262547)
chr1 (243-310)||(12790933-12791001)
chr1 (380-416)||(13634813-13634849)
chr1 (13-81)||(14772687-14772755)
chr1 (238-278)||(15356228-15356268)
chr1 (380-416)||(19160971-19161007)
chr1 (237-277)||(24269777-24269817)
chr1 (237-269)||(27034950-27034982)
chr1 (380-416)||(29436627-29436663)
chr1 (380-416)||(29761663-29761699)
chr1 (239-267)||(39223614-39223642)
chr1 (380-416)||(39856749-39856785)
chr1 (237-269)||(45689661-45689693)
chr1 (372-416)||(49397302-49397346)
chr1 (380-416)||(49428040-49428076)
chr1 (237-269)||(49598520-49598552)
chr1 (380-416)||(50067773-50067809)
chr1 (237-269)||(50067891-50067923)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (11-364)||(41856836-41857188)
chr8 (11-362)||(44942945-44943295)
chr8 (11-364)||(18440157-18440509)
chr8 (11-364)||(42603454-42603803)
chr8 (12-364)||(19242024-19242375)
chr8 (12-364)||(19315208-19315559)
chr8 (11-364)||(40702360-40702713)
chr8 (11-310)||(15032243-15032538)
chr8 (11-310)||(26452325-26452622)
chr8 (12-310)||(24861344-24861640)
chr8 (13-276)||(42168912-42169172)
chr8 (14-276)||(38033877-38034136)
chr8 (13-267)||(41363658-41363909)
chr8 (11-276)||(43693137-43693399)
chr8 (11-310)||(485177-485472)
chr8 (11-227)||(40415257-40415473)
chr8 (11-227)||(41275394-41275610)
chr8 (11-280)||(2416915-2417181)
chr8 (19-276)||(33799503-33799757)
chr8 (11-227)||(40414610-40414826)
chr8 (13-271)||(34614955-34615210)
chr8 (11-269)||(28706101-28706356)
chr8 (19-276)||(43638629-43638883)
chr8 (14-190)||(26484580-26484756)
chr8 (13-276)||(31171769-31172028)
chr8 (13-271)||(3589224-3589478)
chr8 (244-416)||(18439954-18440127)
chr8 (243-413)||(41856630-41856801)
chr8 (243-413)||(42603836-42604007)
chr8 (243-402)||(28167234-28167394)
chr8 (14-298)||(16575695-16575963)
chr8 (243-413)||(40702746-40702917)
chr8 (237-413)||(26487058-26487235)
chr8 (250-413)||(37780529-37780693)
chr8 (11-128)||(22548263-22548380)
chr8 (256-416)||(44942751-44942913)
chr8 (185-364)||(26486847-26487025)
chr8 (161-310)||(22549232-22549376)
chr8 (241-416)||(16576038-16576214)
chr8 (239-320)||(28705555-28705637)
chr8 (246-310)||(24861830-24861895)
chr8 (246-310)||(38033586-38033651)
chr8 (246-304)||(40415751-40415810)
chr8 (334-416)||(16576363-16576445)
chr8 (246-310)||(44050927-44050992)
chr8 (372-416)||(28167450-28167494)
chr8 (340-414)||(31171575-31171648)
chr8 (239-313)||(40415982-40416056)
chr8 (249-310)||(43637428-43637490)
chr8 (246-310)||(26452812-26452877)
chr8 (237-313)||(38033337-38033414)
chr8 (375-416)||(38033433-38033474)
chr8 (254-310)||(40415096-40415153)
chr8 (375-416)||(40415922-40415963)
chr8 (375-416)||(41856478-41856519)
chr8 (16-124)||(22843424-22843532)
chr8 (249-280)||(41017413-41017444)
chr8 (378-416)||(484770-484808)
chr8 (249-310)||(28705805-28705867)
chr8 (378-416)||(42604119-42604157)
chr8 (246-310)||(484920-484985)
chr8 (246-310)||(2417460-2417525)
chr8 (246-310)||(15031986-15032051)
chr8 (237-309)||(18439704-18439777)
chr8 (375-412)||(18439800-18439837)
chr8 (375-416)||(33799259-33799300)
chr8 (380-416)||(15031838-15031874)
chr8 (380-416)||(22549743-22549779)
chr8 (380-416)||(24862007-24862043)
chr8 (380-416)||(26452976-26453012)
chr8 (380-416)||(28705654-28705690)
chr8 (239-267)||(33776051-33776079)
chr8 (237-269)||(38033556-38033588)
chr8 (380-416)||(41275731-41275767)
chr8 (380-416)||(42168472-42168508)
chr8 (239-267)||(43637179-43637207)
chr8 (380-416)||(44051104-44051140)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (13-276)||(2261-2521)
scaffold0589 (246-278)||(4798-4830)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (12-227)||(1783-1998)
scaffold0176 (249-291)||(2289-2332)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (19-276)||(17870-18123)
scaffold0192 (372-404)||(17449-17481)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (13-230)||(24899-25115)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (11-139)||(63968-64095)
scaffold0004 (168-298)||(64098-64224)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (237-364)||(108003-108131)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (155-310)||(85462-85613)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (246-310)||(2434-2499)
[»] scaffold0268 (2 HSPs)
scaffold0268 (155-310)||(14604-14755)
scaffold0268 (246-310)||(14947-15012)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (240-291)||(1158-1209)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-230)||(5453-5560)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (130-210)||(36775-36855)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 104)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 35491629 - 35491981
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35491629 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 35491728  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491729 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35491828  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  35491829 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 35491927  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35491928 caatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 35491981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41499306 - 41498954
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  41499306 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41499207  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499206 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41499107  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  41499106 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctc 41499008  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41499007 caatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 41498954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10364849 - 10364497
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10364849 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 10364750  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364749 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 10364650  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagc-aacaagact 309  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | ||    
T  10364649 cagaagatcgtcattacgta-ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgggcaggtct 10364552  T
Q  310 ccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10364551 ccaatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 10364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19471846 - 19471494
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19471846 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19471747  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471746 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19471647  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |  ||||||||| || |||    || | |||    
T  19471646 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggtaattcaaacttgtcaaatggcagggctc 19471548  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19471547 caatattcgaccagcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttag 19471494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37312705 - 37312355
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  37312705 gagacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 37312606  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37312605 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 37312506  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||| ||    
T  37312505 gaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattgactt-cctatgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactaca 37312407  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37312406 atgttcgaccgacattcccattgttcctctcaaaagattaaattcttgttag 37312355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27130719 - 27130369
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  27130719 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 27130620  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130619 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 27130520  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||  ||||||   ||| |||||||    
T  27130519 gaagatagtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaatttgccaaatgacatgactcca 27130421  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||    
T  27130420 atgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttcttag 27130369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2919577 - 2919224
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2919577 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2919478  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2919477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgc 2919378  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  2919377 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacgacatgactc 2919279  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    |||| ||  |||||||||| || || ||   |||||| | |||||||||||||||    
T  2919278 caatgtttaaccgacattctcattgatcgtgtcaaaagagtaaattcttgttaga 2919224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34521896 - 34521519
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34521896 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34521797  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34521796 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccct 34521697  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | |||||    
T  34521696 cataagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggtaggactc 34521598  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaa 389  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  34521597 caatattcgattggcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaa 34521519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 6976832 - 6977182
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  6976832 cagagacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaac 6976929  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976930 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6977029  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  6977030 gagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 6977128  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||| | |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6977129 caatgttcgactggcattcccattaatcctttcaaaatattaaattcttgttag 6977182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677235
Alignment:
Q  71 agtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttg 170  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtatt-cc 40677329  T
Q  271 tttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  40677328 tttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 40677235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10360154
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    |||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10360206 gatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 10360154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29068018
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  29067926 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 29068018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 39393885 - 39394182
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  39393885 cagagacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaac 39393984  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||     
T  39393985 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgt 39394084  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  39394085 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacatgact 39394181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3937276 - 3936981
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3937276 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3937177  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937176 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 3937077  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  3937076 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 3936981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404284
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
     ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  33404212 aagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 33404284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 43982850 - 43983145
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43982850 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43982949  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982950 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 43983049  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  43983050 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 43983145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 17424784 - 17425078
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17424784 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17424883  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17424884 tgacgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 17424983  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  17424984 acaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 17425078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 5420465 - 5420679
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5420465 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgt 5420564  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5420565 gacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacct 5420664  T
Q  213 gtagatcgtcattag 227  Q
    | |||||||||||||    
T  5420665 gaagatcgtcattag 5420679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 3941731 - 3941947
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3941731 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3941830  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  3941831 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 3941930  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3941931 cagaagatcgtcattag 3941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111428
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
     | | ||||| |||||| || |  | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  29111355 aataacgtcactaggtagggta-aagtgca--ttccaactacaacaattatctt-cctttgaatgtggtaattcaaac 29111428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42241311 - 42241049
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  42241311 cagagacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaac 42241212  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  42241211 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgc 42241112  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42241111 cataagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 42241049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12968514 - 12968252
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  12968514 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 12968415  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  12968414 gttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 12968315  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12968314 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcttacctctgaa 12968252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 22001828 - 22002123
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22001828 cagagacacaaggatggtagaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaac 22001927  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001928 gtgacgaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22002027  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||| ||  | | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  22002028 cagaagattgtcattagttattgtaag-ttgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 22002123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17796314 - 17796036
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  17796314 gagacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 17796215  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17796214 gaagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtca 17796118  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    | || ||||||||||||| |||   ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  17796117 gaagctcgtcattaggtaggga---aatgtgtcttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaa 17796036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 16581816 - 16582034
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  16581816 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaat 16581915  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc--gatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16581916 gtgtcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattcc 16582015  T
Q  209 gccagtagatcgtcattag 227  Q
    || || ||||| |||||||    
T  16582016 gctagaagatcttcattag 16582034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 42120014 - 42120268
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  42120014 caaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 42120113  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  42120114 catgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 42120213  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42120214 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacgattgtcttacctctgaa 42120268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Original strand, 22493265 - 22493520
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||    
T  22493265 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaac 22493364  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22493365 gtgacgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgc 22493464  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||| ||||||||||||| || || | | |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22493465 cagaagatcgtcattagttagggtaag-atgca--ttccaactacaacaactgtcttac 22493520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 6901962 - 6902179
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  6901962 gagacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6902061  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  6902062 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcga 6902161  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  6902162 gaagatcatgattaggta 6902179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 29906584 - 29906838
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| |||| |     
T  29906584 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaa 29906683  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||    
T  29906684 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagat 29906783  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |  |||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29906784 cagcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaactgtcttacctctgaa 29906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 32734641 - 32734857
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||     
T  32734641 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaat 32734740  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32734741 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 32734840  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||  |||| ||||||||    
T  32734841 caaaagatagtcattag 32734857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43492000 - 43491826
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43492000 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 43491901  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43491900 tcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgatggtattcaaatgtgaaaagaatgaggtccattcctt 43491826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799895
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttg 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttg 39799895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 249 - 416
Target Start/End: Original strand, 40677037 - 40677205
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40677037 caactacaacaattgtgttacccttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaa 40677136  T
Q  348 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40677137 gattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 40677205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 10364293 - 10364467
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaa-ttcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  10364293 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgactggcattcccaatgttccat 10364392  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10364393 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattcctt 10364467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 20148114 - 20148331
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  20148114 gagacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacat 20148213  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  20148214 gactagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgcca 20148313  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  20148314 gaagatcgtgattaggta 20148331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 416
Target Start/End: Original strand, 19471297 - 19471464
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaat 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  19471297 aactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcatttccaatgttccattcaaaag 19471396  T
Q  349 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19471397 attaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatggcaaaagaatgaggtccattcctt 19471464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35492184 - 35492011
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  35492184 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgatcggcattcccaatgttccat 35492085  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35492084 tcaaaagattaaattcttgttag-gcgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 35492011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 364
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491796
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattgcct 43491699  T
Q  267 tacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||   ||||||| || |||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43491700 t-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcagatctccaatatttgaccggaattcccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 43491796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 41498750 - 41498921
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  41498750 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtcaagcagcaagactccaatattcgaccagcattcccaatgttccat 41498849  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41498850 tcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtactcaaatgccaaaagaatgaggtccattc 41498921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgtt----cggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 34638960 - 34639093
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34638960 cagagacacaaggagg-tggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 34639058  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcca 145  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34639059 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Original strand, 37312151 - 37312321
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  37312151 accttccaactataacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttttcaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttcaat 37312250  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37312251 tcaaaagattaatttcctgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccatt 37312321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 413
Target Start/End: Original strand, 2919044 - 2919192
Alignment:
Q  266 ttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2919044 ttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatgttcgaccagcattctcatagttccattcaaaagattaaattcttgttag 2919143  T
Q  365 attgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
     || || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2919144 gtttggtttaaatgacggtattcaagcgtcaaaagaatgaggtccattc 2919192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6977386 - 6977215
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |  || |||||||||||  | |||||    
T  6977386 accttccaactcaaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatatgatcgacattcccacagctccat 6977287  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    | |||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6977286 ttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc 6977215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33404567 - 33404387
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || ||||| ||  || | |||||||| | | ||    
T  33404567 gaatgtaccttccaaatacaacaattgtcttacctctgaattgggtaaattcaaacttgctaaacatcaggactcaaacatttgtccgacatttctattg 33404468  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33404467 ttccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 33404387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650378
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||     
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27650427 attaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgacttacctctgaa 27650378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Original strand, 34521402 - 34521520
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  34521402 acctcccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattgaaacttgccaagcagcaggactccaatat-cgaccgacattcc-aatgttccat 34521499  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgtt 362  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  34521500 tcaaaagattaaattcttgtt 34521520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16253910 - 16253828
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16253910 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 16253828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31991992 - 31991887
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991992 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 31991897  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||| ||||    
T  31991896 tacctctgaa 31991887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatga 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcaca 135  Q
      |||||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 16253605 - 16253703
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  16253605 gttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaata----caccttccaactacaacaattgtct 16253700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40678827 - 40678763
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40678827 cagagacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18036218 - 18036113
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| |||||||||| || ||||  |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18036218 gttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggta-ggaa---atgcaccttccaactacaacaattgtct 18036123  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||| ||||    
T  18036122 tacctctgaa 18036113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15891703 - 15891609
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891703 gttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtc 15891609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20148582 - 20148505
Alignment:
Q  339 cattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20148582 cattcaaaagattaaattctttttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 20148505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 8557385 - 8557450
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8557385 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 8557450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 10359858 - 10359923
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  10359858 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 10359923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22493819 - 22493767
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22493819 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggaaaattcaaacttgccaa 22493767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29111577 - 29111510
Alignment:
Q  349 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  29111577 attaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgtattcctt 29111510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6902436 - 6902354
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |  |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6902436 tgttccgttcaaaagattaaattcttgttaggctcgacttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6902354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393559
Alignment:
Q  154 atatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattag 18393559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18393897 - 18393832
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  18393897 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 18393832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42120560 - 42120495
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  42120560 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 42120495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42240869 - 42240792
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  42240869 agatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaacaacattaattgtcttccccttgaatggagcaaattcaaac 42240792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 40676886 - 40676930
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40676886 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 40676930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 2918876 - 2918917
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2918876 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 2918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16582371 - 16582306
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16582371 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcagttcaaacttgccaaacaacatgactc 16582306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17425488 - 17425447
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17425488 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 17425447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26617697 - 26617652
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26617697 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacg 26617652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 34521249 - 34521290
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34521249 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 34521290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39799849 - 39799785
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39799849 ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 39799785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 41498597 - 41498638
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41498597 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 41498638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6977542 - 6977498
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6977542 ttaaatgatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6977498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  120 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgct 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Original strand, 19471036 - 19471112
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  19471036 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggagtaaattcaaacttgctaaacaacaggactcca 19471112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 291
Target Start/End: Original strand, 34521152 - 34521208
Alignment:
Q  236 tgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaac 291  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34521152 tgaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggtaaattcaaac 34521208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 365
Target Start/End: Original strand, 16253768 - 16253799
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253768 tgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 16253799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 39799380 - 39799418
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39799380 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 39799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42120807 - 42120725
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||| ||| ||||| || || |||||| |||||    
T  42120807 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggacaaattcaaacttgctaagcagcaggaatccaatattcga 42120725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 266
Target Start/End: Original strand, 6902199 - 6902228
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902199 gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 6902228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 8557232 - 8557273
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  8557232 aatgatggtattcaattgtcaaaagaatgaggcgcattcctt 8557273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 10359705 - 10359746
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10359705 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtgcattcctt 10359746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17425335 - 17425270
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  17425335 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 17425270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 17538451 - 17538492
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17538451 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattcctt 17538492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 19471132 - 19471173
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19471132 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 19471173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 270
Target Start/End: Original strand, 20148351 - 20148384
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20148351 gaatgctccttccaactacaacaattgtcttacc 20148384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22002372 - 22002315
Alignment:
Q  254 acaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  22002372 acaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacatgactc 22002315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23408414 - 23408373
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  23408414 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattcctt 23408373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 24108305 - 24108346
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  24108305 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagggacattcctt 24108346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28476204 - 28476163
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28476204 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 28476163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29073743 - 29073702
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29073743 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 29073702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35492289 - 35492248
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  35492289 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcaatcctt 35492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 39799530 - 39799595
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  39799530 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 39799595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43492153 - 43492112
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  43492153 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattcctt 43492112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5420937 - 5420861
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  5420937 gaatgtaccttccaactgcaacaattgtcttgcctctgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactcca 5420861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16582519 - 16582483
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16582519 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 16582483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 22493817 - 22493849
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22493817 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 22493849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22494066 - 22493990
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat 314  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||| | | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  22494066 atgcactttccaactacaaaaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcaacaggactccaat 22493990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Original strand, 24108209 - 24108285
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  24108209 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactcca 24108285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32736881 - 32736853
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32736881 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 32736853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35492385 - 35492309
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | | |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  35492385 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactcca 35492309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 42120558 - 42120590
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42120558 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 42120590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42120708 - 42120672
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42120708 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42120672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 145)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43889716 - 43889324
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43889716 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43889617  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43889616 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgc 43889517  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  43889516 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctctaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggactc 43889418  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatga 404  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  43889417 caatgttcgaacgacattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgatagatttggtttaaatgacggtattcaagcgtcaaaagaatga 43889324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34153503 - 34153151
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34153503 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34153404  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34153403 gtgacgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 34153304  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  34153303 cagaagatcgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctc 34153205  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34153204 caatattcgaccgacattcccattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttag 34153151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 22436901 - 22437253
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22436901 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaac 22437000  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22437001 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22437100  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||  |||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  22437101 cggaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-ccttcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 22437199  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  22437200 caatattcgaccggcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 22437253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47657572 - 47657220
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  47657572 cagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaac 47657473  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47657472 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 47657373  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || |||||    
T  47657372 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcacattccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactc 47657274  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  47657273 caatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaaaattaaatttttgttag 47657220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 21169441 - 21169793
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||| ||    
T  21169441 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatac 21169540  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21169541 gcgacgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 21169640  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  21169641 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 21169739  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  21169740 caatattcgaccggcattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttag 21169793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34530013 - 34529661
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  34530013 cagagacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaat 34529914  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529913 gtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34529814  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||    
T  34529813 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacattaaagctacaacaattgtatt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactc 34529715  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||| |  |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34529714 caatattcgaacagcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 34529661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 957670 - 957320
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  957670 gagacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 957571  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  957570 gacgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 957471  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| |||||| |  || | |||||    
T  957470 gaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattgaaacttgccaaacggcaggtctcca 957372  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  957371 atattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 957320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282188
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | |||||| |  || | || |||    
T  6282337 aagatcgtcattagttacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaagcttgccaaacggcaggtcttcaa 6282239  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | |||||| ||||||  || |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  6282238 tattcgactgacattttcattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttag 6282188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44560397 - 44560045
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  44560397 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 44560298  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44560297 gtgacaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctc 44560198  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  44560197 cttaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 44560099  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  44560098 caatattcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 44560045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49792153 - 49791801
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49792153 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 49792054  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49792053 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49791954  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| || ||| |  || | |||    
T  49791953 caaaagatcatcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctc 49791855  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49791854 caatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 49791801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36776383
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  36776533 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaa 36776435  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    | ||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||| |||||||||||    
T  36776434 tgttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaagttcttgttaga 36776383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423622
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||  || ||| |  || ||||||||    
T  49423772 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttacctttgaatggggtaattcaaatttgtcaaacggcaggactccaa 49423673  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | ||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  49423672 tcttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 49423622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 396
Target Start/End: Original strand, 2773000 - 2773382
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  2773000 agagacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 2773099  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  2773100 tgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgcc 2773199  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| |  ||   ||||    
T  2773200 agaagatcgtcatcaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcagttctcc 2773298  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaa 396  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||||||    
T  2773299 aatattcgaccggcattcccattattcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtt-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaa 2773382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 49817860 - 49817545
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  49817860 agagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 49817761  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49817760 ttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcc 49817661  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| || || ||||||    
T  49817660 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgtctt-catttgaatggggtaattcaaacttgccaaacagcaggactcc 49817562  T
Q  312 aattttcgaccgacatt 328  Q
    | | ||||| |||||||    
T  49817561 agtattcgatcgacatt 49817545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21017394 - 21017099
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21017394 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 21017295  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017294 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 21017195  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  21017194 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 21017099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40353990 - 40353695
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40353990 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40353891  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353890 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 40353791  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  40353790 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 40353695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14330910 - 14330649
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||     
T  14330910 agagacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacg 14330811  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330810 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 14330711  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14330710 agaagatcgtcattagttaaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 14330649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 28082228 - 28082524
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28082228 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28082327  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28082328 atgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 28082427  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28082428 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 28082523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55797028
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  55796938 gatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggctaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 55797028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20779081 - 20778796
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20779081 acacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 20778982  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20778981 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaa 20778882  T
Q  216 gatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    ||||||||||||||| || | |  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  20778881 gatcgtcattaggtagggtaag-gtgca--ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaacaaca 20778796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51027984 - 51027697
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51027984 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51027885  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  51027884 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccac 51027785  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaagc 300  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |  ||||||||| ||||||||    
T  51027784 cataagatcgtcattagttagggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaagc 51027697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51428409 - 51428147
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  51428409 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaac 51428310  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51428309 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 51428210  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51428209 aagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 51428147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41794779 - 41794484
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41794779 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41794680  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794679 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41794580  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  41794579 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 41794484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4785639 - 4785286
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  4785639 cagagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaac 4785540  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4785539 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgc 4785440  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| || ||| |  ||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  4785439 cacaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcatctttcagctacaacaattgtgtt-cctctagatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 4785341  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    ||   | || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  4785340 cagcatacgtccgacattcccattgtttctttcaaaatattaaattcatgttaga 4785286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937843
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32937916 aagatcgtcattagatagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 32937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 49063969 - 49064226
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  49063969 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 49064068  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064069 gtgacgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49064168  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49064169 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 49064226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6177532 - 6177237
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6177532 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6177433  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177432 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6177333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  6177332 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 6177237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26591902 - 26591678
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26591902 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 26591803  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26591802 gtgacgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26591703  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaa 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  26591702 cagaagatcgtcattaggtacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 56138900 - 56139195
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  56138900 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 56138999  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56139000 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 56139099  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  56139100 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 56139195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 25762590 - 25762845
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  25762590 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 25762689  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25762690 gacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 25762789  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  25762790 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacct 25762845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 17211258 - 17211511
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||| |    
T  17211258 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgt 17211357  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  17211358 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgcca 17211457  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    | ||||||| |||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17211458 gaagatcgtgattaggtaggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtcttac 17211511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589216
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     ||||||||||||| |  || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39589122 aagatcgtcattagttggggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 39589216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 1226150 - 1226406
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  1226150 cagagacaca-ggagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaat 1226248  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226249 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 1226348  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1226349 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 1226406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 49094735 - 49095030
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  49094735 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 49094834  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49094835 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgc 49094934  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  49094935 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 49095030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 9489671 - 9489965
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  |    
T  9489671 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 9489770  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9489771 gacgagcatgtttt-ggagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 9489869  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    | ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  9489870 gaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 9489965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 242633 - 242417
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||    
T  242633 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaac 242534  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  242533 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 242434  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  242433 cagaagatcgtcattag 242417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 1042744 - 1043016
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1042744 agacacaaggagggtggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1042841  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  1042842 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccag 1042941  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaa 290  Q
     ||||||||||||| || ||    || | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1042942 aagatcgtcattagttaggg---taaggtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaa 1043016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 37866396 - 37866613
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  37866396 cagagacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaac 37866495  T
Q  111 atgacgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  37866496 gtgatgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccg 37866595  T
Q  210 ccagtagatcgtcattag 227  Q
    | || |||||||||||||    
T  37866596 ctagaagatcgtcattag 37866613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Original strand, 24606744 - 24607018
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |    
T  24606744 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgt 24606843  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24606844 gacgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgcca 24606943  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    | ||||||| |||||||| |   | |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  24606944 gaagatcgtgattaggtagg---taaatgtacattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 24607018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Original strand, 42886255 - 42886509
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagta---tcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42886255 gagacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaa 42886354  T
Q  110 catgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42886355 catgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccg 42886454  T
Q  210 ccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  42886455 ccagaagatcatcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgt 42886509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31824838 - 31824584
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  31824838 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 31824739  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  31824738 catgttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagat 31824639  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31824638 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacatttgaa 31824584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33163761 - 33163508
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||     
T  33163761 cagagacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaat 33163662  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33163661 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 33163562  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33163561 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 33163508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901623
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20901682 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 20901623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 3393296 - 3393549
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  3393296 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 3393395  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  3393396 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 3393495  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    | ||||| | |||||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3393496 gaagatcatgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacatttgtattacc 3393549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288559
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttag 11288486  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
     ||||||| |||| ||| |    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  11288487 aagatcgtgattaagtagg----gaatgcaccttccaactaccataattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 11288559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711782
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |      
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-g 21711747  T
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21711748 tgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaa 21711782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45939731
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     |||||||||||||    
T  45939718 aagatcgtcattag 45939731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 18412587 - 18412839
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  18412587 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgt 18412686  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||    
T  18412687 gaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgcca 18412786  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    | ||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412787 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 18412839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46816740 - 46816485
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  46816740 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaac 46816641  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46816640 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgc 46816543  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46816542 cagaagatcgtcattagttagggcaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 46816485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 10312264 - 10312517
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  10312264 gagacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 10312363  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||      
T  10312364 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctg 10312463  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    | ||||||| |||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312464 gaagatcgtgattaggtagggaatt----caccttccaactacaacaattgtcttacc 10312517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 34529457 - 34529628
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34529457 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcgacattcccaatgttccat 34529556  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34529557 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattgaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 34529628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759579
Alignment:
Q  68 gagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatg 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  || |||||||||||||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtctt 27759570  T
Q  268 acctttgaa 276  Q
    |||| ||||    
T  27759571 acctctgaa 27759579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324425
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |  || ||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||| | |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324367 aagatcatgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 31324425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 34152949 - 34153121
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattc 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  34152949 cttccaacaacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaaccgacattcccaatgttccattc 34153048  T
Q  344 aaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34153049 aaaagattaaattgttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccgttcctt 34153121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 49791597 - 49791768
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  49791597 acctcccaactacaacaattggcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgatcggcattcccaatgttccat 49791696  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49791697 tcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 49791768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21169997 - 21169823
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  21169997 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaatttaaactttccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccat 21169898  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21169897 tcaaaagattaaattcttgttaggcggggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattcctt 21169823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2773555 - 2773384
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  2773555 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaacttgccaagcatcatgactccaatattcgaccagcactcccaatgttccat 2773456  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2773455 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatggcggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 2773384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 13850739 - 13850995
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||  || ||||||| || |||||  ||    
T  13850739 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgac 13850838  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || |  ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  13850839 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgc 13850938  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13850939 cagaagaccgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattatcttacct 13850995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 13866253 - 13866514
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||| |||  |||||||||| || |||||  ||    
T  13866253 cagagacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgac 13866352  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  13866353 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 13866452  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13866453 cagaagaccgtgattaggtagg----gaatgcacctttcaactacaacaattgtcatacctctgaa 13866514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 957116 - 957290
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  957116 acctcccaactacaaaaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtaaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 957215  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  957216 tcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtgttcaaatgtcaaaagaatgaggttcattcctt 957290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22437457 - 22437286
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22437457 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccattgttccat 22437358  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  22437357 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgacaaaattctgaggtccattc 22437286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 49423418 - 49423592
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||    
T  49423418 accttcaaactacaacaattgtgttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaaacggcacgactccaatgttcgaccgacattcccatagtttcat 49423517  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49423518 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 49423592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 49571655 - 49571481
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc--- 338  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||       
T  49571655 acctcccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccattgttcctg 49571556  T
Q  339 -cattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
     |  |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49571555 tctgtcaaaagattaaattcttcttaggctgggattaaataatggtattcaaatatcaaaagaatgaggtacatt 49571481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 396
Target Start/End: Original strand, 43889162 - 43889316
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  43889162 accttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaggactccaatatacgaccgacattcccatagttccat 43889261  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaa 396  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  43889262 tcaaaagattaaattcttgatagatttggtttaaatgacggtattcaaacgtcaa 43889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 4785087 - 4785257
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattc 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||| || |||||||   | ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  4785087 cttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagcaggactccagcgtacgtacgacattcccattgttccattc 4785186  T
Q  344 aaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4785187 aaaat--taaattcctgttaggctgggattaaatgatggtattcaagtgttaaaagaatgaggtgcattcctt 4785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 49817304 - 49817478
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||| || || |||| |||| |||||||    || | | ||||||||    
T  49817304 accttccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactacaatgttcgaccagtgtttctattgttccat 49817403  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    || |||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49817404 tcgaaagtttaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49817478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42886812 - 42886638
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||| || || |||||||   | || ||| || ||||| ||||||||    
T  42886812 accttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactccagcatacgtccggcactcccattgttccat 42886713  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  42886712 tcaaaagattaaattcttgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtatattcctt 42886638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 36776180 - 36776351
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  || |||  | || ||||| ||| || ||| | ||||||||  |||||||    
T  36776180 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaatttgtcaattagcaggactctaatgtttgactggcattcccatagttccat 36776279  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  36776280 tcaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaatgaatgaggttcattc 36776351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24607604 - 24607425
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||  |||  |||| || |||| ||   || | |||||||| | | |||    
T  24607604 aatgtaccttccaactacaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaagttgctgagcagcaggacttcagcatttgtccgacatttctattgt 24607505  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24607504 tccattcaaaagattaaattcatgttaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccgttcctt 24607425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 336
Target Start/End: Original strand, 26591576 - 26591670
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26591576 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgt 26591670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24607276 - 24607100
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 339  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||   || |   |||  |||| | |   | |||| |    
T  24607276 gcaccttccaactaaaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaactatcaagcattcacccgaaagttttattgtttc 24607177  T
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24607176 attcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagagtcaaaagaatgaggtgcattcctt 24607100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817159
Alignment:
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatg 241  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||  ||||||| |||||||| |    |||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagg----gaatg 49817188  T
Q  242 caccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49817187 caccttccaactacaataattgtcttacc 49817159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Original strand, 17292108 - 17292213
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17292108 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgttt 17292203  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||| ||||    
T  17292204 tacctctgaa 17292213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 32937678 - 32937760
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32937678 tgtttcattcaaaagattaaattcttgttaggctgggtttaaatgatggtatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 32937760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17211718 - 17211636
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17211718 tgttccattcaaaagatttaattattgttaggcttgatttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 17211636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 32937354 - 32937436
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32937354 tgttcctttcaaaatattaaattcttgttaggctcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 32937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 291
Target Start/End: Original strand, 49064563 - 49064628
Alignment:
Q  225 taggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  49064563 taggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 49064628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 49816954 - 49817036
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49816954 tgtttcattcaaaagattaaaatcttgttaggtttggtttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49817036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21412740 - 21412647
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacga 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| |||||    
T  21412740 gagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49064526 - 49064458
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  49064526 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacttgccaaacaacaggactc 49064458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3393748 - 3393685
Alignment:
Q  339 cattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3393748 cattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaat 3393685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21712073 - 21712014
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  21712073 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacgtgccaaacaaca 21712014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124486
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||||||||   | |||||||  |||| | ||||||| |||||| |||| ||     
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    |||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23124530 attaggtagggaatg----cacctttcaactacaacaattgtcttacct 23124486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 20901339 - 20901404
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20901339 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 20901404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Original strand, 46816192 - 46816253
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  46816192 aactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcgaaacaacaagactc 46816253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 413
Target Start/End: Original strand, 241942 - 241983
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  241942 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattc 241983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1043291 - 1043226
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  1043291 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 1043226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Original strand, 14330355 - 14330392
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330355 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 14330392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18413137 - 18412964
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa--tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||| ||| |||  |||  | |   | |||||||    
T  18413137 accttccaactacaacaattatcttacctctgaaattaggtaaattcaaacttgctaaacaacaactctcaaatattcacccggaagttttattgttcca 18413038  T
Q  341 ttcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||  || || |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18413037 ttcaaaagattaaatttttgttagcttgg--tttaaagatgataatcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 18412964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39589471 - 39589406
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39589471 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactc 39589406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45940069 - 45940004
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  45940069 ttccaactacaacaattgtcttaccttcgaatgaggtaaagtcaaacttgccaaacaacaggactc 45940004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 4784876 - 4784920
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4784876 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 4784920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10312683 - 10312639
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10312683 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 10312639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21170152 - 21170108
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21170152 ttaaatgatggtattcaactgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 21170108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 51427697 - 51427741
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51427697 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 51427741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 51427853 - 51427921
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  51427853 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 51427921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14330326 - 14330253
Alignment:
Q  217 atcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  14330326 atcgtcagtaagtacggaacaaatgcaccttccaactgtaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 14330253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 38132786 - 38132848
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38132786 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 38132848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22437610 - 22437569
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22437610 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 22437569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27759871 - 27759806
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  27759871 ttccaactacagcaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactc 27759806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27760024 - 27759983
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27760024 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 27759983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28082779 - 28082714
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  28082779 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactc 28082714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 31824198 - 31824239
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31824198 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 31824239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49571808 - 49571767
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49571808 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49571767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 49791444 - 49791485
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49791444 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49791485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 56139452 - 56139387
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  56139452 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 56139387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Original strand, 242105 - 242165
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  242105 aactacaacaattgtgttacctttgaaggggtaatttcaaacttgccaaacaacatgactc 242165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 885350 - 885318
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885350 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 885318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3393846 - 3393810
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3393846 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctttgaa 3393810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 6176830 - 6176868
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6176830 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6176868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Original strand, 6282013 - 6282051
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6282013 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 6282051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 21016692 - 21016730
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21016692 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 21016730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32937588 - 32937558
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32937588 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 32937558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Original strand, 32937590 - 32937648
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  32937590 tccaactacaacaattatcttaccgttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaacaaca 32937648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Original strand, 51027437 - 51027495
Alignment:
Q  253 tacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  51027437 tacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcaaaacaacaggactc 51027495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 6176980 - 6177045
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6176980 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6177045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 14289951 - 14289992
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14289951 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattcctt 14289992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 14330151 - 14330192
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14330151 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattcctt 14330192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17211839 - 17211767
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa--tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  17211839 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatgactc 17211767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 21016842 - 21016907
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  21016842 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 21016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21712226 - 21712185
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21712226 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 21712185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25763142 - 25763077
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  25763142 ttccaactccaacaattgtcttaccttcgaatggggtaaagtcaaacttgtcaaacaacaagactc 25763077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Original strand, 36775931 - 36776008
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  36775931 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 36776008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37866950 - 37866885
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  37866950 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 37866885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37867065 - 37867024
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37867065 gaatgtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatg 37867024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 38132630 - 38132671
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  38132630 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattcctt 38132671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49095287 - 49095222
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  49095287 ttccaaccccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaagactc 49095222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55797285 - 55797220
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  55797285 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 55797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 885348 - 885380
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  885348 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 885380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 885498 - 885462
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  885498 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 885462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 885595 - 885515
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| | | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  885595 gcaccttccaactacaacaattgccttgcctctaaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaatattcga 885515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1043439 - 1043403
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1043439 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 1043403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1226926 - 1226898
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226926 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 1226898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4785058 - 4785006
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  4785058 agatcatcagtaggtacgaaatgaatgcatcttccaagtgcaacaattgtctt 4785006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9490172 - 9490136
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9490172 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 9490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9717878 - 9717842
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9717878 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaa 9717842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10314975 - 10314947
Alignment:
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10314975 ttccattcaaaatattaaattcttgttag 10314947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 20901120 - 20901152
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20901120 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttac 20901152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 40353290 - 40353326
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40353290 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 40353326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42886981 - 42886941
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  42886981 ttaaatgatggtattcaagtgtcagaagaatgaggtgcatt 42886941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45940217 - 45940181
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45940217 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 45940181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 46816190 - 46816158
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46816190 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 46816158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 47870788 - 47870752
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47870788 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 47870752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49095435 - 49095399
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49095435 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49095399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 51027232 - 51027264
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51027232 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttac 51027264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 13402527 - 13402879
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13402527 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 13402626  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13402627 gtgacgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 13402726  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  13402727 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctc 13402825  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13402826 caattttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 13402879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32027843 - 32027491
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027843 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32027744  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027743 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32027644  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||    
T  32027643 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactc 32027545  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32027544 caatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 32027491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32037902 - 32037550
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32037902 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32037803  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037802 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32037703  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||    
T  32037702 cagaagatcgtcattaggtaaggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactc 32037604  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32037603 caatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 32037550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 12396770 - 12397122
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12396770 cagagacataaggagggtggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12396869  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12396870 atgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 12396969  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || | |||    
T  12396970 caaaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctc 12397068  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  12397069 caatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 12397122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34803111 - 34802759
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34803111 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34803012  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34803011 gtgatgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 34802912  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  34802911 caaaagatcgtcattaggtaaggaatgaatgcgctttcgagctacaaaaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 34802813  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| |||||||| |||| ||| ||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  34802812 taatgttcgaccggcattaccattgtttttgtcaaaagattaaattcttgttag 34802759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 29066547 - 29066844
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29066547 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29066646  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29066647 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29066746  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||||||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  29066747 cagtagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatctttgaatgatataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29066843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 29075560 - 29075857
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29075560 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29075659  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29075660 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29075759  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  29075760 cagcagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29075856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 27640174 - 27640469
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27640174 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27640273  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640274 gtgacgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27640373  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27640374 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 27640469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257442
Alignment:
Q  76 cattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgag 175  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  176 atcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttga 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctaa 30257531  T
Q  276 atgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30257530 atggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttag 30257442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 11692446 - 11692740
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11692446 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 11692545  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692546 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 11692645  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  11692646 acaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 11692740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 29110531 - 29110829
Alignment:
Q  11 cagagacacaagga-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29110531 cagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaa 29110630  T
Q  110 catgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  29110631 cgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccg 29110730  T
Q  210 ccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagac 308  Q
    |||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  29110731 ccagcagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgac 29110827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 6205478 - 6205773
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6205478 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6205577  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205578 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6205677  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  6205678 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 6205773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Original strand, 801160 - 801435
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  801160 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaac 801258  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801259 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 801358  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  801359 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 801435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 29108134 - 29108431
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29108134 cagagacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29108233  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29108234 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29108333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  29108334 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29108430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 14115033 - 14115315
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  14115033 gagacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgt 14115132  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  14115133 gacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgcca 14115232  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagc 300  Q
    | |||| || |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |  ||||||||| ||||||||    
T  14115233 gaagatagtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttaaatagggtaattcaaacttgccaagc 14115315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305980
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 22305980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058693
Alignment:
Q  29 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| | || |||||||||||||     
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagt 35058733  T
Q  229 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    || ||    || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35058732 taggg---taaggtacattccaactacaacaattgtcttacct 35058693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12397326 - 12397155
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  12397326 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgatccat 12397227  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12397226 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaataacggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattc 12397155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 32027287 - 32027458
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  32027287 accttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 32027386  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32027387 tcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc 32027458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 32037346 - 32037517
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  32037346 accttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 32037445  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32037446 tcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc 32037517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 35020896 - 35021067
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35020896 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgacaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 35020995  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35020996 tcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattacggtattcaaatgtcaaaagaaagaggtccattc 35021067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13403365 - 13403198
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||    
T  13403365 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccagcattctcaatgttctat 13403266  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 409  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403265 tcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 13403198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021100
Alignment:
Q  179 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatg 35021186  T
Q  279 agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     |  ||||||||| || ||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35021185 gggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 35021100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 413
Target Start/End: Original strand, 30257228 - 30257409
Alignment:
Q  233 gaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccc 331  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||    
T  30257228 gaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtgttatctttgaatagggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgatcggcattccc 30257327  T
Q  332 aatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |  |||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  30257328 atagttccactcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggttcattc 30257409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 4495453 - 4495280
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||| || ||||||||| | | || | ||||||||  |||||||    
T  4495453 accttcaaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtcaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaacgg-cattcccatagttccat 4495355  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4495354 tcaaaatattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcctt 4495280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13403045 - 13402909
Alignment:
Q  280 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 379  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  13403045 gtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataa 13402946  T
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13402945 tggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattcctt 13402909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14123148 - 14122977
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattca 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||| | | || ||| |||||||| |||||||||||    
T  14123148 ttccaactacaaaaattgtcttacctttaaatggggtaaattcaaacttggcaagcagcaagactccagtatccgtccggcattcccattgttccattca 14123049  T
Q  345 aaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||| ||||||||| ||||||  |  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14123048 aaagattaaattcatgttaggctttgtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtccattcctt 14122977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13403186 - 13403057
Alignment:
Q  280 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 379  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  13403186 gtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataa 13403087  T
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403086 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 13403057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021017
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 24021072  T
Q  255 caacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  24021071 caacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 24021017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765745
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt-gattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||| || || | |  ||||      
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaag-gtgca-- 3765771  T
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  3765770 ttccaactgcaacaattgtcttacct 3765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465289
Alignment:
Q  146 gtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 245  Q
    |||||||||||||   || | ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||  |||| ||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggta--ga--gaatacacc 17465320  T
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17465319 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 17465289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 291
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192667
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 2192631  T
Q  255 caacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  2192632 caacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaac 2192667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23911207 - 23911126
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23911207 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtatt-aagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 23911126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Original strand, 34134799 - 34134906
Alignment:
Q  165 atgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34134799 atgttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagg----gaatgcacctttcaactacaacaattgt 34134894  T
Q  265 cttacctttgaa 276  Q
    ||||||| ||||    
T  34134895 cttacctctgaa 34134906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Original strand, 4495119 - 4495250
Alignment:
Q  233 gaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccca 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |  ||||| |     ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4495119 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaatctggccaaacggttggactccaatgttcgaccgacatttcca 4495217  T
Q  333 atgttcc-attcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4495218 ttgttccttttcaaaagattaaattcttgttag 4495250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14123479 - 14123415
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  14123479 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttgcctctgaatgggcaaattcaaacttgctaagca 14123415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30257211 - 30257159
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30257211 agatcgtcggtaggtacggaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtctt 30257159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 801713 - 801664
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  801713 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaac 801664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7821291 - 7821247
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7821291 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 7821247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 32027131 - 32027175
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32027131 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 32027175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 32037190 - 32037234
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32037190 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 32037234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 35058397 - 35058443
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35058397 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaac 35058443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6206030 - 6205965
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6206030 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6205965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12397479 - 12397438
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12397479 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 12397438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13403518 - 13403477
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13403518 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 13403477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29067099 - 29067034
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  29067099 ttccaactgcaacaattgtcttacatttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 29067034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29108686 - 29108621
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  29108686 ttccaactgcaacaattgtcttacatttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 29108621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27640725 - 27640661
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  27640725 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgagataattcaaacctgcaaaacaacaggactc 27640661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3765936 - 3765901
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3765936 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 3765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402372
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagata 189  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||  |||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagata 2402372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6206180 - 6206142
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6206180 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6206142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11693147 - 11693109
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11693147 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 11693109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18744073 - 18743995
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||    
T  18744073 agcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcatgttgctgagatcgtctgaagatattctcgacagtttgattcc 18743995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Original strand, 20192534 - 20192568
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20192534 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcctacct 20192568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20242120 - 20242086
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20242120 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcctacct 20242086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22136104 - 22136070
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22136104 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcctacct 22136070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22143457 - 22143423
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22143457 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcctacct 22143423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34135102 - 34135033
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatga 404  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34135102 tgttcctttcagaagattaaattcttgtaagtttggt-ttagatgatggtattcaagtgtcaaaagaatga 34135033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11692997 - 11692932
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  11692997 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 11692932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 35058244 - 35058285
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  35058244 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattcctt 35058285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2193085 - 2193049
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2193085 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 2193049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4495680 - 4495604
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  4495680 gaatgtaccttccaactgcaataattgtcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactcca 4495604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14482815 - 14482775
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14482815 gaatgcaccttcccactacaacaattgtcttgcctctgaat 14482775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 24020612 - 24020648
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24020612 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 24020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29067191 - 29067155
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29067191 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 29067155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29108778 - 29108742
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29108778 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 29108742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34132168 - 34132140
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132168 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 34132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 105)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Original strand, 18308249 - 18308600
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18308249 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 18308348  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18308349 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 18308448  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | | |||    
T  18308449 cagtagattgacattaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctc 18308547  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgtta 363  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18308548 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgtta 18308600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1400518 - 1400168
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1400518 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1400419  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400418 gacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 1400319  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||| | | | | ||| |    
T  1400318 gaagatcgtcattaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-ccttttaatggggtaattcaaacttgccaaacgataggtctcta 1400220  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  1400219 atattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaggattaaattcttgttag 1400168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4724292 - 4723940
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  4724292 cagagacacaaggaaagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4724193  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724192 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 4724093  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  4724092 cagaagatcgtcattaggtaccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 4723994  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4723993 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 4723940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Original strand, 35565261 - 35565613
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |    
T  35565261 cagagacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-c 35565359  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35565360 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgc 35565459  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| ||||     
T  35565460 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactt 35565558  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35565559 caatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaga 35565613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 8537943 - 8538239
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8537943 cagagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 8538042  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538043 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8538142  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8538143 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 8538238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 11346698 - 11346994
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  11346698 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaac 11346797  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346798 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 11346897  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11346898 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 11346993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 7184
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7447 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 7348  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7347 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 7248  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7247 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatg 7184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6793604 - 6793351
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6793604 cagagacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaat 6793505  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6793504 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagc 6793405  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6793404 cagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 6793351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8576359 - 8576064
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  8576359 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaac 8576260  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8576259 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8576160  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8576159 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaagactc 8576064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 30709594 - 30709883
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacga 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30709594 acaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacga 30709693  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtaga 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30709694 ccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaaga 30709793  T
Q  218 tcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30709794 tcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacaggactc 30709883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36350523 - 36350279
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  36350523 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaac 36350424  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36350423 gtgacgagcatg---------cacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 36350333  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36350332 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 36350279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19036892 - 19036597
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19036892 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19036793  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036792 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19036693  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  19036692 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 19036597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854442
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     ||| ||||||||| || | || |  ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38854350 aagaccgtcattagttaggtaagg--tgca--ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacatgactc 38854442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 3601330 - 3601592
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3601330 cagagacacaaggagggtagaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3601429  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3601430 gtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 3601529  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || | || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3601530 cagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaa 3601592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 541853 - 541637
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  541853 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 541754  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||    
T  541753 gggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgc 541654  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  541653 cagaagatcgtcattag 541637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 1971356 - 1971616
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1971356 gagacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1971455  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1971456 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 1971555  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | | ||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1971556 gaaaatcatcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttgcctctgaa 1971616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11027982
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     |||||||||||||    
T  11027969 aagatcgtcattag 11027982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27661595 - 27661300
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27661595 cagagacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27661496  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27661495 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27661396  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27661395 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 27661300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 28880980 - 28881275
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28880980 cagagacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28881079  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28881080 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 28881179  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  28881180 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-tctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 28881275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 19400352 - 19400614
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  19400352 cagagacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 19400451  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19400452 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 19400551  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19400552 cagaatatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 19400614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1695162
Alignment:
Q  92 attaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatc 191  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  192 atcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |  |||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggtaattcaaac 1695057  T
Q  292 atgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaat 391  Q
     | |||| |  || ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || |    
T  1695058 tttccaaacggcatgacaccaatgttcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgaaggtattgaagt 1695157  T
Q  392 gtcaa 396  Q
    |||||    
T  1695158 gtcaa 1695162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18308804 - 18308631
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  18308804 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaatattcgaccgacattcccaatttttcatt 18308705  T
Q  343 caaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308704 caaaatattaaattcttgttaggctgggattaaatgatagtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 18308631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 33370645 - 33370862
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  33370645 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 33370744  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  33370745 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 33370844  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  33370845 gaagatcatgattaggta 33370862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40009518 - 40009733
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  40009518 agagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 40009617  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |     
T  40009618 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccaca 40009717  T
Q  212 agtagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||||    
T  40009718 agaagatcgtcattag 40009733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 249 - 416
Target Start/End: Original strand, 4723742 - 4723910
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4723742 caactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatatacgaccggcgttcccaatgttccattcaaaa 4723841  T
Q  348 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4723842 gattaaattcttgttaggttgggattaaataatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 4723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 3169593 - 3169766
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3169593 cagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3169691  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaa 185  Q
     |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3169692 gtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35927653 - 35927470
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  35927653 gagacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35927554  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35927553 gacgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 36349987 - 36350158
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  36349987 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 36350086  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36350087 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 36350158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25498547 - 25498382
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25498547 tccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcaatactccaatattcgaccgacattcccaatgttccattcaa 25498449  T
Q  346 aatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25498448 aagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 25498382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 1399967 - 1400138
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1399967 acctcccaactacaacaattgtgttaactttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcat---gactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 1400063  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1400064 tcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattcctt 1400138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1695335 - 1695164
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  1695335 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcatagcagcatgactcgaacgttcgaccgacattcccatagttccat 1695236  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1695235 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 1695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35565816 - 35565645
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||    
T  35565816 accttccaactacaataattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccattgttcgatcgacattcccatagttccat 35565717  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35565716 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 35565645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366738
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     | ||||| |||||    
T  17366751 aatatcgtgattag 17366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 34683587 - 34683762
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag--taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 340  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||    
T  34683587 acctcccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaatggcattcccaatgtttca 34683686  T
Q  341 ttcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34683687 ttcaaaagattaaattcttgttaagctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaataaggtacattcctt 34683762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 2599210 - 2599387
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||   ||||    
T  2599210 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacat 2599309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  2599310 gaagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatat 2599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 6793138 - 6793309
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  | || |||||  |||||||| ||||||||  |||| ||    
T  6793138 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagtaggattccaaggttcgaccggcattcccatagttcaat 6793237  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6793238 tcaaaagattaaattctttttaggtttggtttaaatgacagtattcaactgtcaaaagaataaggtccattc 6793309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 276
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082472
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7082436 g-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaa 7082472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| ||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  114 acgagcatgttttg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693459
Alignment:
Q  23 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17195421 - 17195316
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17195421 gttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcatcttccaactacaacaattgtct 17195326  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||||||||    
T  17195325 tacctttgaa 17195316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33371499 - 33371336
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| || || |||||||||||  |||| | |||||| | | ||||||||    
T  33371499 accttccaactacaacaattattttacctctgaatgaggtaaattcaagcttgctaaacaccaagactccaacattcgtctgacatttctattgttccat 33371400  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgag 405  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33371399 tcaaaagattaaattcatgttaggcttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaataatgag 33371336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 18920879 - 18920977
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920879 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 18920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 416
Target Start/End: Original strand, 17366388 - 17366567
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || ||   ||| |   |||  |||||||| | | |||    
T  17366388 aatgcatctaccaactacaacaattatcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacatcagctctcaagcattcacccgacatttctattgt 17366487  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17366488 tccattcaaaacattaaattcttgctaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtctaaagaatgaggtgcattcctt 17366567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 7082281 - 7082335
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082281 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10398340 - 10398164
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||| || |||||   ||| |   |||  |||||||| | | |||    
T  10398340 aatgcatctaccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagcattcacccgacatttctattgt 10398241  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10398240 tccattcaaaacattaaattcttgttaggcttggtttaaataatggcattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 10398164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12743137 - 12743057
Alignment:
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12743137 ttccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattcctt 12743057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12805955 - 12805875
Alignment:
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12805955 ttccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattcctt 12805875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19400906 - 19400841
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19400906 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaagactc 19400841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 12742706 - 12742804
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12742706 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataaca 12742804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742880
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggta 12742880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360547
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgtt-gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||| |||||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  222 cattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
     ||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25360590 gattaggta--ga--gaatgcacctttcaactacaacaattgtcttac 25360547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459064
Alignment:
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 3459036  T
Q  272 ttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
     || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  3459037 ctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 3459064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283855
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| || |||   || |  | |||||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttagtta-gga--taaggtgcattccaacta 22283800  T
Q  255 caacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  22283801 caacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 22283855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36312007 - 36311902
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  36312007 gttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgtct 36311912  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||| ||||    
T  36311911 tacctctgaa 36311902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1971908 - 1971843
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1971908 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 1971843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3170076 - 3170011
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3170076 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 3170011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 7082793 - 7082853
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7082793 agatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt-cctttgaa 7082853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 12805524 - 12805617
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacga 106  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  12805524 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacga 12805617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40012159 - 40012094
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40012159 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 40012094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13131140 - 13131034
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||  || || ||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131140 gttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagcta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtct 13131045  T
Q  267 tacctttgaat 277  Q
    ||||| |||||    
T  13131044 tacctctgaat 13131034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25498783 - 25498739
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25498783 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 25498739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33371082 - 33371003
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33371082 tgtttcattcaaaagattaaattattgttagccttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 33371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805698
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggta 12805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12806291 - 12806212
Alignment:
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||    
T  12806291 ttccattctaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtc-acagaatgaggtgcattcctt 12806212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20196623 - 20196551
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat 314  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20196623 accttccaactacaaaaaccgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaat 20196551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35565972 - 35565928
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35565972 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 35565928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Original strand, 1171725 - 1171783
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  1171725 ggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaac 1171783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33371171 - 33371112
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  33371171 ttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaaacaaca 33371112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1695488 - 1695447
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1695488 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 1695447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3459329 - 3459268
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||    
T  3459329 aactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaactggccaaacaacatgactc 3459268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3601884 - 3601839
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3601884 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaa 3601839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 6792985 - 6793026
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6792985 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6793026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19401059 - 19401018
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19401059 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 19401018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20196776 - 20196735
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20196776 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 20196735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36350272 - 36350191
Alignment:
Q  283 aattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  36350272 aattcaaacttgccaaacaacatgactccaatgttctaccaacattctcattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 36350191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1171888 - 1171844
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1171888 ttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 1171844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11347402 - 11347364
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11347402 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 11347364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 6895 - 6960
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6895 ttccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1972061 - 1972020
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1972061 aatgatggtatttaactgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 1972020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3459486 - 3459445
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  3459486 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaagtgcattcctt 3459445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3602137 - 3602096
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3602137 gaatgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatg 3602096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7082766 - 7082717
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  7082766 accttccaactacaaaaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaac 7082717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 8575807 - 8575872
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  8575807 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 8575872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 19036340 - 19036405
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  19036340 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 19036405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 34683434 - 34683475
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  34683434 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaagtgcattcctt 34683475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40012312 - 40012271
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40012312 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 40012271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 6747 - 6783
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6747 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 3459331 - 3459363
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3459331 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 3459363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 3601882 - 3601914
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3601882 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttac 3601914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 4723580 - 4723624
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  4723580 ttaaatgatggtatttaagcgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 4723624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7082973 - 7082929
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  7082973 ttaaatgacggtattcaagtgtctaaagaatgaggtgcattcctt 7082929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 8575659 - 8575695
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8575659 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 8575695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11347252 - 11347184
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| || ||| ||||| |||||    
T  11347252 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaatttaaacctgtcaaacaacaggactc 11347184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 12742900 - 12742932
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12742900 gaatgcatcttccaactacaacaattgtcttac 12742932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12743568 - 12743532
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12743568 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaa 12743532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12806389 - 12806353
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12806389 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaa 12806353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 19400904 - 19400936
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19400904 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 19400936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20196871 - 20196807
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagca 301  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  20196871 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaattcaaacttgctaagca 20196807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22284259 - 22284223
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22284259 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 22284223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 27660895 - 27660931
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27660895 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 27660931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35566064 - 35565988
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  35566064 aatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcacgactccaa 35565988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 416
Target Start/End: Original strand, 36349836 - 36349876
Alignment:
Q  376 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  36349836 atgatggtattcaagtatcaaaagaatgaggtgcattcctt 36349876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 38854846 - 38854810
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38854846 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 38854810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 40012157 - 40012189
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40012157 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 40012189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40012406 - 40012378
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012406 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40012378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 167)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46414549 - 46414197
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46414549 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46414450  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46414449 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46414350  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||| |||||| |  || |||||    
T  46414349 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtagttcaaacttgccaaacggcatgactc 46414251  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  46414250 caatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttag 46414197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34471939
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  34472088 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaa 34471990  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  34471989 tgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttag 34471939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51013493 - 51013141
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51013493 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51013394  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013393 gtgacgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 51013294  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  51013293 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 51013195  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  51013194 caatattcgaccggcattcctattgttcttgtcaaaagattaaatttttgttag 51013141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 30192542 - 30192894
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30192542 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 30192641  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     || | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192642 gtgtctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 30192741  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| |  || || ||    
T  30192742 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttctt-cctttgaatgaggtatttcaaacttgccaaacggcaggagtc 30192840  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |  ||||||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  30192841 caatatctgaccgacattctcattgttcctatcaaaggattaaattcttgttag 30192894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015633
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| ||| |||||| |  || ||||||||    
T  51015484 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-tctttgaatggggtaattcgaacttgccaaacggcaggactccaa 51015582  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  51015583 tattcgacccgcattcccattgtccctgtcaaaagattaaattcttgttag 51015633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 43569914 - 43570266
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  43569914 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaac 43570013  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43570014 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 43570113  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  43570114 cagaagatcgtctttatgtacggaatgactgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcacgtctc 43570212  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43570213 caatattcgactggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 43570266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34647480 - 34647130
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  34647480 gagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 34647381  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34647380 gacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcta 34647281  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||| ||  || ||||| |||||||    
T  34647280 gaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttctagctgcaacaattgtctt-cctctgaatgtggtaattcgaacttgttaaacaacacgactcca 34647182  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || |||||||||||||| || ||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  34647181 atgttcgaccgacattctcattgttcctgtcgaaagattaaattcttgttag 34647130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 397
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578293
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 41578117  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||    
T  41578118 catcattaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattc 41578216  T
Q  319 gaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 397  Q
    |||| ||| || || | ||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||||||    
T  41578217 gaccaaca-tctcattattcctgtcaaaatattaaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaa 41578293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 2428491 - 2428843
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2428491 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2428590  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428591 gtgacgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2428690  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  2428691 tagaagatcgtcattaggtacataatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgtt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 2428789  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  2428790 caatattcgaccgacattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttag 2428843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55207099 - 55206747
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  55207099 cagagacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 55207000  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55206999 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 55206900  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||| || ||| |  || | |||    
T  55206899 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaatacaaacttgtcaaacggcaggtctc 55206801  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  55206800 taatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 55206747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 41803906 - 41804258
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41803906 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41804005  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41804006 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgc 41804105  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | | |||    
T  41804106 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcactttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggaaggtctc 41804204  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  41804205 caatattcgaccgacattcccattgtttctgttaaaagattaaattcttgttag 41804258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100328
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||  ||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| |||||||||||  ||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||||    
T  45100477 aatatcgtcattaggtactgaatgaatgcactttttagctactacaattgtctt-tctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggaatccaa 45100379  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  45100378 tgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttattag 45100328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 14631449 - 14631801
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  14631449 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaac 14631548  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14631549 gtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgc 14631648  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| | |  ||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  14631649 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccatccagctacaacaactgtctt-cctttgaacggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactc 14631747  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||    
T  14631748 caatgttctaccggcattcccattgttcctatcaaaagattaagtttttgttag 14631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52569623 - 52569272
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  52569623 cagagacaaaaggatggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaag 52569524  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52569523 -tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgc 52569425  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  52569424 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 52569326  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  52569325 caatattcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 52569272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Original strand, 7246101 - 7246450
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7246101 agacacaagaagagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7246200  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246201 acgagcatgttttgggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7246300  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||    || | ||||||    
T  7246301 aagatcgtcattaggtatggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctccaa 7246399  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7246400 tattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 7246450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 7954209 - 7954560
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaagggg-agagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||      
T  7954209 gagacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 7954308  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||     
T  7954309 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgct 7954408  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  7954409 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaagactcc 7954507  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||  ||||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7954508 aacattcgatcgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttag 7954560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 49273404 - 49273755
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||     
T  49273404 agagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacg 49273503  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  49273504 tgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttcc 49273603  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||     || ||||||    
T  49273604 agaatatcgtcattaggtcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacatgccatatggcatgactcc 49273702  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||    
T  49273703 aatgttcgactgacattcccattgttcatgtcaaaagattaagttcttgttag 49273755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 44927469 - 44927724
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  44927469 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 44927568  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927569 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 44927668  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  44927669 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacct 44927724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 37281459 - 37281709
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  37281459 agacacaaggatgatggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 37281558  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37281559 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccag 37281658  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37281659 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgt 37281709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10053485 - 10053236
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  10053485 agagacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 10053386  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10053385 tgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgcc 10053290  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10053289 agaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 10053236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721351
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36721401 aagatcgtcatttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgt 36721351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13896084 - 13895823
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  13896084 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacg 13895985  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13895984 tgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 13895885  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13895884 agaagatcgtcattagttaaggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaa 13895823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323253
Alignment:
Q  50 tccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgg 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  150 atcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcc 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttcc 42323366  T
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaata 349  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |  |||||| |    
T  42323365 agctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttggcaaacgacatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttactgtcaaaa-a 42323268  T
Q  350 ttaaattcttgttag 364  Q
    ||||||| |||||||    
T  42323267 ttaaatttttgttag 42323253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2647091 - 2646796
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2647091 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2646992  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2646991 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2646892  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  2646891 tagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-catttgaatggggtaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 2646796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34693503 - 34693243
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |    
T  34693503 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgt 34693404  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34693403 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgcca 34693304  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34693303 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaa 34693243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2268414
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  2268506 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 2268414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3495244 - 3494968
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3495244 cagagacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3495145  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3495144 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgc 3495045  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  3495044 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaac 3494968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49140269 - 49139974
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  49140269 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 49140170  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140169 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49140070  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  49140069 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 49139974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49218950 - 49218654
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||     
T  49218950 agagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacg 49218851  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49218850 tgacgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgcc 49218751  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    || ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  49218750 agaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacaggactc 49218654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 54390446 - 54390741
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54390446 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 54390545  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54390546 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 54390645  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  54390646 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 54390741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 36135013 - 36135306
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  36135013 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36135111  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36135112 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36135211  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    || |||| |||||||| ||  | | | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  36135212 agaagattgtcattagttagagtaag-atgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 36135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47760106 - 47759879
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  47760106 cagagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 47760007  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47760006 gtgacaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 47759907  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatga 238  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47759906 cagaagatcgtcattaggtaccgaatga 47759879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19453444 - 19453182
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19453444 cagagatagaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19453345  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19453344 gtgacgagcatgttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccac 19453245  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||| ||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19453244 cagaagatcatcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaa 19453182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50458906 - 50458652
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  50458906 cagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaac 50458807  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50458806 ttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 50458707  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtc 265  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50458706 ctgaagatcgtcattaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 50458652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 43477061 - 43477352
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43477061 cagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43477160  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  43477161 gtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgc 43477260  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacgg-aatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    ||| ||||||||||||  || || ||||  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  43477261 cagaagatcgtcattaattagggtaatg--tgca--ttccaacttcaacaactgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 43477352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4004302 - 4004007
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  4004302 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4004203  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4004202 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 4004103  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || | || |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  4004102 cagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 4004007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 34049731 - 34050026
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34049731 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34049830  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049831 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34049930  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  34049931 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 34050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 46403007 - 46403302
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46403007 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46403106  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46403107 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46403206  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  46403207 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 46403302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702225
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatta-cgaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24702284 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaa 24702225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416906
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39416960 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 39416906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 49610493 - 49610709
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  49610493 cagagacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 49610592  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49610593 gtgacgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49610692  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  49610693 cagaagatcgtcattag 49610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42950235 - 42949973
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  42950235 cagagacgcaagaagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaac 42950136  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42950135 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42950036  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42950035 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 42949973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346475
Alignment:
Q  106 aaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  206 tccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaa 305  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||| |  ||     
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcag 46346534  T
Q  306 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  46346533 gtctccaatattcgaccggcattctcattgttcctgtcaaacgattaaattcttgttag 46346475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 47065691 - 47065976
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||     
T  47065691 cagagacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaat 47065790  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  47065791 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgc 47065890  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  47065891 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 47065976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51695821 - 51695605
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  51695821 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatac 51695722  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51695721 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51695622  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  51695621 cagaagatcatcattag 51695605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8633572 - 8633227
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  8633572 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 8633473  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||  || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  8633472 gacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgcca 8633373  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | |||||||||||||||||     |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || |||||||    
T  8633372 gaagatcgtcattaggtac----cgaatgcacc--ccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcca 8633280  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
       ||||| || |||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  8633279 gcattcgatcggcatttctattgttcctttcaaaagattaaatttttgttaga 8633227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 6754210 - 6754463
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  6754210 gagacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6754309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |    
T  6754310 gacgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcta 6754409  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    | ||||||| |||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6754410 gaagatcgtgattatgtaggga---aatgcaccttccaactacaacaactgtcttac 6754463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25576806 - 25576545
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  25576806 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 25576707  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  25576706 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgt 25576608  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||  || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25576607 cagaagatcgtcattatttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 25576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087510
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
     ||||||||||||  || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48087564 aagatcgtcattaattagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 48087510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 42382275 - 42382491
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42382275 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42382374  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42382375 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42382474  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42382475 cagaagatcgtcattag 42382491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53826911 - 53826649
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  53826911 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaat 53826812  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  53826811 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 53826712  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53826711 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 53826649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33449018
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| |  ||||||||| || ||| |  || ||||| ||    
T  33449163 aagatcgtaattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt-tttcctctggatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcaaa 33449069  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
      |||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33449068 cattcgtcagacatttccattgttcctttcaaaagattaaattgttgttag 33449018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 42383055 - 42383271
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42383055 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42383154  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42383155 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42383254  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42383255 cagaagatcgtcattag 42383271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464305
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatga 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagt 214  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||     
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||||||| ||||  || |||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6464356 agatcgtgattatataggga---aatgcaccttccaactacaacaactctcttac 6464305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 227
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997608
Alignment:
Q  72 gtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattag 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 50997608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44835701 - 44835440
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||     
T  44835701 agagacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 44835602  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |    
T  44835601 tgacgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtc 44835502  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835501 agaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 44835440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41578465 - 41578294
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  41578465 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcggcatttccaatgttccat 41578366  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41578365 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 41578294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 774551 - 774292
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||| |    
T  774551 gagacacgaggagagtggaatgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgt 774452  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  774451 gaagaacatgttttcggagcactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccacca 774352  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  774351 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttacctctgaa 774292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7246654 - 7246480
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7246654 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcgaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 7246555  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246554 tcaaaaaattaaattcttgttagggtgggattaaatgatgatattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 7246480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2429047 - 2428873
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2429047 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 2428948  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428947 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 2428873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 27186952 - 27187178
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27186952 cagagacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27187051  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||    
T  27187052 atgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgc 27187151  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatg 237  Q
    ||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  27187152 cataatatcgtgattaggtagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 46346271 - 46346445
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  46346271 accttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagcatgactccaatatttgatcggcattcccaatgttccat 46346370  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46346371 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaacgaatgaggtccattcctt 46346445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41804462 - 41804291
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41804462 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttccat 41804363  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41804362 tcaaaagattaaattcttgttaagttggggttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 41804291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 52569068 - 52569239
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  52569068 acctcccaactacaacaattgtcttacctgtgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgttcggcattcccaatgttccat 52569167  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52569168 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgactgtattcaaatgtcaaaagaacgaggtccattc 52569239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 55206543 - 55206714
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  55206543 acctcccaactacaacaattgtgttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcagaactccaatattcgactgccattcccaatgttccat 55206642  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55206643 tcaaatgattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 55206714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14632005 - 14631834
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  14632005 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacatgccaagcagcaggactccaatgttcgacctacattcccatagttccat 14631906  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14631905 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaaccaggtccattc 14631834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 8633023 - 8633189
Alignment:
Q  242 caccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||| ||| |||||||    
T  8633023 caccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacattcgatcggcatttccattgttcca 8633122  T
Q  341 ttcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggt 407  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8633123 ttcaaaagtttaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggt 8633189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43570458 - 43570296
Alignment:
Q  255 caacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaa 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43570458 caacaattgtcttgcctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaattagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccattcaaaagattaa 43570359  T
Q  354 attcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43570358 attgttgttggactgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattcctt 43570296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 10053045 - 10053216
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||    
T  10053045 accttccaactacaacaattttgttacctttcaataggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattcccataattccat 10053144  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10053145 tcaaaagattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 10053216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 42323049 - 42323220
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  42323049 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccggcattcccatagttccat 42323148  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42323149 tcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattc 42323220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 46413993 - 46414164
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  46413993 accttacaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcagaacttcaatgttcgaccgacattcccatagttccat 46414092  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    | |||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414093 ttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 46414164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 30193098 - 30192924
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30193098 acctcccaactccaacaattgtgttacatttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcaacaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccat 30192999  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30192998 tcaaaagattaaattattgttaggctgtgattaaatgatgatatttaaatgtcaaacgaataaggtccattcctt 30192924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 34471735 - 34471906
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||    
T  34471735 accttccaactacaacaattgtgtttcctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattctcatagttccat 34471834  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34471835 tgaaaagattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 34471906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375843
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacga 117  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtaga 217  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||||  | |||  ||||||||||||||  | |    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaata 20375891  T
Q  218 tcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20375890 tcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaaaaattgtcttac 20375843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 49273963 - 49273788
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||    
T  49273963 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattctcatagtttcat 49273864  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatga----tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49273863 tcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtcggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 49273788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 34646926 - 34647097
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||| ||    
T  34646926 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacatgactccaatgtttaaccgacattcccatagttctat 34647025  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34647026 tcaaaagattaaatttttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 34647097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 51015837 - 51015663
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  51015837 acctcccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccat 51015738  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51015737 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatttaagtgtgaaaagaatgaggttcattcctt 51015663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 45100134 - 45100295
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||          || | ||||||||||||||||||||||||    
T  45100134 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcaa----------atatacgaccgacattcccaatgttccat 45100223  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45100224 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 45100295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 14265412 - 14265665
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||  || |||||| ||| |||||   |    
T  14265412 cagagacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---c 14265508  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || | || | ||| ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  14265509 gtgacgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgc 14265608  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    | | ||||||| |||||||| |    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14265609 ctgaagatcgtgattaggtagg----gattgcactttccaactacatcaattgtcttacct 14265665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 248 - 413
Target Start/End: Original strand, 51012951 - 51013108
Alignment:
Q  248 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||        | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  51012951 ccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgc--------aggactccaatattcgaccggcattccgaatgttccattcaaa 51013042  T
Q  347 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013043 aaattaaattcttgttaggctgagattaaatga-cgtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 51013108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18441003
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga 18440970  T
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440971 --gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 18441003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486077
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga 19486044  T
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486045 --gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 19486077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887562
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||  |  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaa 239  Q
    ||||  ||||||| ||||| | |  | |||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| || | ||||| ||||  || | |  |||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgatta-ttaggtagggaa 25887599  T
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25887598 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctatgaa 25887562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27187879 - 27187699
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||  | || ||||| ||| || | |||||||| | | ||    
T  27187879 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaatagcaggactcaaatattagtccgacatttctattg 27187780  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187779 ttccattccaaagattaaattcttgttaggcttggtataaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 27187699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7954754 - 7954590
Alignment:
Q  253 tacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatatt 351  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||| |  | || | | ||||||||||||||  ||    
T  7954754 tacaacaattttcttacccctgaatagggtaaattcaaacttgccaaacagcaagactccaacattcgatccgcgtttctattgttccattcaaaagttt 7954655  T
Q  352 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7954654 aaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 7954590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 416
Target Start/End: Original strand, 6464002 - 6464180
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat--gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgtt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||| | | || | ||| ||||| ||  |||  |||||||  | | ||||    
T  6464002 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaactttctaaacgacatgactcaaacattcatccgacatctctattgtt 6464101  T
Q  338 ccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6464102 ccattcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgacaaaagaatgaggttcattcctt 6464180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6754766 - 6754588
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgtt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||| | ||| || || || ||||| ||  |||  |||||||  | | ||||    
T  6754766 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctccgaaatgtggtaaattcaatcttgctaaacagcaggactcaaacattcatccgacatctctattgtt 6754667  T
Q  338 ccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6754666 ccattcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcctt 6754588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637113
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaa 15637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11378957 - 11378906
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378957 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 8632792 - 8632874
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8632792 tgttccaatcaaaatattaaattcttgttagactttgtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 8632874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 412
Target Start/End: Original strand, 25887271 - 25887440
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || | ||||  ||| ||  |||  |||  | | | | ||||||||    
T  25887271 ccttccaactacaacaattatcttacctttgaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacgacaactctcaaacattcacccggaagttctattgttccat 25887370  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  25887371 tcaaaagattaaattcttgttag-tttggtttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcatt 25887440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 412
Target Start/End: Original strand, 33448878 - 33448984
Alignment:
Q  306 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgag 405  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33448878 gactccaacattcgtccgacatttctattgttccattcaaaagattaaattgttgttaggattggtttagatgatggtattcaagtgtcaaaagaataag 33448977  T
Q  406 gtccatt 412  Q
    |||||||    
T  33448978 gtccatt 33448984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 46346794 - 46346745
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346794 agagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47066243 - 47066191
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47066243 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaatttaaacatgccaa 47066191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42328331 - 42328288
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42328331 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44928020 - 44927955
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44928020 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaagcaacaggactc 44927955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 19452806 - 19452874
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19452806 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 19452874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 37282040 - 37282115
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |  |||||||||    
T  37282040 agatcgttagtaggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgt-tttcctttgaatggggtaattcaaac 37282115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18441207 - 18441128
Alignment:
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  18441207 tccattcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatccctt 18441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19486281 - 19486202
Alignment:
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  19486281 tccattcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatccctt 19486202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 416
Target Start/End: Original strand, 20375623 - 20375718
Alignment:
Q  321 ccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20375623 ccgacatttctattgtaccattcaaaagattaaattattgttagacttgatttaaatgataatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 20375718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15637455 - 15637374
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15637455 tgttctatacaaaagattaaattcttgttagtttggt-ttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 15637374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Original strand, 24701934 - 24701992
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  24701934 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac 24701992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 13895532 - 13895597
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  13895532 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactc 13895597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 25576253 - 25576318
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  25576253 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactc 25576318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 44835149 - 44835214
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  44835149 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactc 44835214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55268851 - 55268755
Alignment:
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccca 332  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  55268851 atgaatgcaccttttagctataacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccggcattccca 55268755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36721020 - 36720945
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  36721020 agattgtcagtaggtacgaaatgaattcacctttcaactgcaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 36720945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37282013 - 37281945
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  37282013 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactc 37281945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 320
Target Start/End: Original strand, 53826437 - 53826517
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  53826437 gcaccttccaactacaacaattgtcttacccatgaatggggcaaactcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcga 53826517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Original strand, 36721047 - 36721094
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaa 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36721047 acctttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaa 36721094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 44834902 - 44834977
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44834902 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgctcctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcaacaagactccaa 44834977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47066490 - 47066415
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  47066490 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatagggcaaattcaaacttgcgaagcagcaagactccaa 47066415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 2268157 - 2268222
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  2268157 ttccaactacgacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 2268222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7246807 - 7246766
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7246807 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 7246766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 11378639 - 11378704
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11378639 ttccaactccaacaattgtcttgcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 11378704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 269
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637249
Alignment:
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||  | ||||||| ||| |||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaatt----caccttccaactacaacaattgtcttac 15637249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 34471582 - 34471623
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34471582 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 34471623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 413
Target Start/End: Original strand, 34646718 - 34646759
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34646718 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 34646759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36135563 - 36135498
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  36135563 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaagactc 36135498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 39416456 - 39416497
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39416456 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 39416497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 42322904 - 42322945
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42322904 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42322945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42383608 - 42383543
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  42383608 ttccaactacaacaattgtcttatctttgaattggataaattcaaacttgccaaacaacaggactc 42383543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42383761 - 42383720
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42383761 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42383720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 46413827 - 46413868
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46413827 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 46413868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 47066396 - 47066355
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47066396 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 47066355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49274116 - 49274075
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49274116 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49274075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50997944 - 50997879
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  50997944 ttccaactccaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 50997879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 52568919 - 52568960
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  52568919 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 52568960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7955114 - 7955038
Alignment:
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||  | || |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7955114 attcaaaagattaaattagtgttaggcttggtttaaataatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 7955038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34646899 - 34646847
Alignment:
Q  215 agatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34646899 agatcctcagtaggtgcagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt 34646847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 45099978 - 45100022
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45099978 ttaaatgattgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 45100022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 272
Target Start/End: Original strand, 7954882 - 7954917
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7954882 gaatgcaccttccaactacaacaattgtattacctt 7954917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Original strand, 27187543 - 27187669
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  || |  || ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    
T  27187543 gaatgcacattgcaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcgcccgacatttctattgt 27187641  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27187642 tcatttctaaagattaaattcttgttag 27187669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 34050433 - 34050395
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34050433 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 34050395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41578618 - 41578580
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41578618 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 41578580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42383855 - 42383773
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| | | |||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||    
T  42383855 atgcaccttccaactacaagaattgtcttgcccctgaatagggcaaattcaaacatgctaagccgcaggactccaatattcga 42383773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Original strand, 46346118 - 46346156
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46346118 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 46346156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 46403709 - 46403671
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46403709 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 46403671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 49139567 - 49139605
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49139567 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49139605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50458629 - 50458571
Alignment:
Q  306 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  50458629 gactccaatattcgaccgacattcgcattgttcctgtcaaaagattaaatttttgttag 50458571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 54391148 - 54391110
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54391148 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 54391110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 55268570 - 55268608
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  55268570 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 55268608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 3494692 - 3494757
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  3494692 ttccaacaacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgcaaaacaacatgactc 3494757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 4003750 - 4003815
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  4003750 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacatgactc 4003815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14632158 - 14632117
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14632158 aatgatggtattcaattgtcaaaagaatggggtgcattcctt 14632117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 19452653 - 19452694
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19452653 aatgatggtattaaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 19452694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34050283 - 34050218
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  34050283 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 34050218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 34692952 - 34693017
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  34692952 ttccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactc 34693017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 39416609 - 39416674
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  39416609 ttccaactacaacaattatcttacctttgaatggggcaaattcaaacttcccaaacaacatgactc 39416674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43477748 - 43477707
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43477748 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 43477707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 44834996 - 44835037
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44834996 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 44835037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 49139717 - 49139782
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  49139717 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 49139782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49610871 - 49610830
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49610871 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49610830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 54390998 - 54390933
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  54390998 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 54390933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 2268009 - 2268045
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2268009 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 2268045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 2646391 - 2646427
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2646391 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 2646427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 11378491 - 11378527
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11378491 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 11378527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 13895397 - 13895433
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13895397 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 13895433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 24701786 - 24701822
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24701786 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 24701822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25576255 - 25576223
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25576255 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 25576223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 34692804 - 34692840
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34692804 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 34692840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 42383606 - 42383638
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42383606 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 42383638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 42949656 - 42949684
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42949684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44835151 - 44835119
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44835151 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 44835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 49218250 - 49218286
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49218250 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49218286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 51695448 - 51695484
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51695448 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 51695484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 108)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 41048776 - 41049127
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  41048776 agagacagaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 41048875  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41048876 cgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 41048975  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||| || |  |||| |||     
T  41048976 agaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgcaaaacggcaagtctct 41049074  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41049075 aatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 41049127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43351314 - 43350931
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43351314 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43351215  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  43351214 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccac 43351116  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  43351115 cagaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 43351017  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 397  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||||||    
T  43351016 caatattcgaccgacatttccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaa 43350931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21187514 - 21187162
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  21187514 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaac 21187415  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21187414 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 21187315  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || | |||    
T  21187314 cagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcacctttcagctacaataattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctc 21187216  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  21187215 aaatattcgaccggcattcccattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttag 21187162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 48270640 - 48270992
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48270640 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48270739  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48270740 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48270839  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |  ||||||||| |||||  |  || | |||    
T  48270840 cagaagatcgtcgttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctt-tcttttaatggggtaattcaaacttgccagacggcaggtctc 48270938  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| |||||   |||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  48270939 aaatattcgatgaacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 48270992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48315395 - 48315043
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48315395 cagagatagaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 48315296  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48315295 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48315196  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  48315195 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgtctt-catttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 48315097  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  48315096 caatattcgaccggcattcccattgttcctatcaaaagattaaattcttgttag 48315043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46862409 - 46862057
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  46862409 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 46862310  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46862309 gtgacgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgc 46862210  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  46862209 cagaagatcgtcataaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtctt-cttttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctc 46862111  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  46862110 caatattcgaccggcattctcattgctcctgtcaaaagattaaattcttgttag 46862057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393688
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| |  |||||    
T  36393836 aagatcttcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtttccaa 36393738  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | || ||||| |||||||  |||| |  || ||| ||||||||||||||||    
T  36393737 tatttgaccggcattcccgttgtttctgtc-aaagattaaattcttgttag 36393688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28114608 - 28114256
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28114608 cagagaaacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28114509  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  28114508 atgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgt 28114409  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| | |||| |  || |||||    
T  28114408 caaaagattgtcattaggtaccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaactttccaaacggcacgactc 28114310  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  28114309 caatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 28114256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 42735255 - 42735606
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42735255 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42735353  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42735354 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 42735453  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | |||||    
T  42735454 aagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggaaggactc 42735552  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  42735553 caattttcgactagcattctcattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttag 42735606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30355012 - 30354678
Alignment:
Q  29 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30355012 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 30354913  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30354912 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattagg 30354813  T
Q  229 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacatt 328  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| ||||    
T  30354812 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcatt 30354714  T
Q  329 cccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30354713 tccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 30354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15338120 - 15337768
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15338120 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 15338021  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  15338020 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgc 15337921  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  15337920 cagaagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgtctc 15337822  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || | ||||| || |||| | | | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15337821 cagtattcgatcggcatttctatttttccattcaaaagattaaattcatgttag 15337768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 21650518 - 21650867
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  21650518 gagacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgt 21650617  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21650618 gacgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 21650717  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
      ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| || || |||||||    
T  21650718 taagatcatcattagttaccgaatgaatgaacctaccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgggt-aattcaaacttgccaaacagcaggactcca 21650815  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    || ||| ||||||||||||| |||| | ||||| | ||| |||| |||||||    
T  21650816 atattcaaccgacattcccattgtttctttcaagagattcaatttttgttag 21650867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 40588542 - 40588838
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40588542 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaaca 40588641  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  40588642 tgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggcc 40588741  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    || |||||||||||||  | || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40588742 agaagatcgtcattagtcagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 40588838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21614973 - 21614700
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||      
T  21614973 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgc 21614874  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21614873 gacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgcca 21614774  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaa 290  Q
    | || |||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21614773 gaagttcgtgattaggtaggga---aatgcacctttcaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaa 21614700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 17839315 - 17839612
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17839315 cagagacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 17839414  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839415 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17839514  T
Q  211 c-agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagac 308  Q
    | |  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  17839515 caaaaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggac 17839610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 20564751 - 20565046
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20564751 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 20564850  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564851 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 20564950  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  20564951 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 20565046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 18237556 - 18237819
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  18237556 cagagacgcaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18237655  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18237656 atgacgagcatattttgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgc 18237755  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat 277  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18237756 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaat 18237819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39477455 - 39477239
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  39477455 cagatacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 39477356  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||    
T  39477355 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgc 39477256  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39477255 cagaagatcgtcattag 39477239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17183205 - 17183412
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17183205 agagacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17183304  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17183305 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcc 17183404  T
Q  212 agtagatc 219  Q
    || |||||    
T  17183405 agaagatc 17183412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 34140858 - 34141073
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||     
T  34140858 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 34140957  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34140958 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 34141057  T
Q  212 agtagatcgtcattag 227  Q
    |  |||||||||||||    
T  34141058 ataagatcgtcattag 34141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Original strand, 2356282 - 2356543
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||      
T  2356282 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatg 2356381  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2356382 tgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgct 2356481  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    |  ||| ||| |||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2356482 ataagaccgtgattaggtaggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 2356543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1642800 - 1642545
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  1642800 gagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgt 1642701  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1642700 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgcca 1642601  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctt 272  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642600 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctt 1642545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30360724
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtg-cgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     |||||||||||||    
T  30360711 aagatcgtcattag 30360724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45363458 - 45363170
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45363458 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 45363359  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  45363358 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 45363268  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  45363267 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggact 45363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 10523061 - 10523337
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||     
T  10523061 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacg 10523160  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatg-ttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523161 tgacgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 10523260  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    | | | ||||||||||| || || | |  || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  10523261 ctgaaaatcgtcattagttagggtaag-gtgta--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaac 10523337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 47268891 - 47269105
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  47268891 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 47268989  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  47268990 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgc 47269089  T
Q  211 cagtagatcgtcatta 226  Q
    ||  ||||||||||||    
T  47269090 caaaagatcgtcatta 47269105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20378918 - 20378702
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  20378918 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 20378819  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||    
T  20378818 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgc 20378719  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  20378718 cagaagatcatcattag 20378702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41217863
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41217809 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacagcaattgtcttacct 41217863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48220949 - 48220743
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  48220949 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 48220850  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||    
T  48220849 catg--ttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagat 48220752  T
Q  219 cgtcattag 227  Q
    |||||||||    
T  48220751 cgtcattag 48220743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 48271196 - 48271022
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48271196 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactctaatattcgaccgatattcccaatgttccat 48271097  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48271096 tcaaaatattaaattcttgttaggctgggattacatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattcctt 48271022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Original strand, 46861853 - 46862023
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46861853 accttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 46861952  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46861953 tcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 46862023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 21186960 - 21187132
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21186960 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttcccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgatccattc 21187059  T
Q  344 aaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21187060 aaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 21187132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 30354474 - 30354645
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30354474 acctcccaactacaacaactgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttctat 30354573  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30354574 tcaaaagattaaatttttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 30354645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26603420 - 26603266
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  26603420 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaac 26603321  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtga 165  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26603320 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtga 26603266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 416
Target Start/End: Original strand, 36393489 - 36393658
Alignment:
Q  248 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaa 346  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36393489 ccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagatgtaggactccaatattcgaccgacattcccagtgttccattcaaa 36393588  T
Q  347 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393589 agattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 36393658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367040
Alignment:
Q  103 acgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 202  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  203 gattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaa 9367048  T
Q  303 caagactc 310  Q
    || |||||    
T  9367047 caggactc 9367040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21651071 - 21650900
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21651071 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgaccgacattctcattgttccat 21650972  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21650971 tcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattc 21650900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2206151 - 2205990
Alignment:
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2206151 tgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcc 2206052  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    || ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2206051 agaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaa 2205990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 28114052 - 28114223
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||    
T  28114052 accttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcaacatgactccaatgttcgaccggcattctcatagttccat 28114151  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28114152 tcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtcaattc 28114223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 13916825 - 13916949
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  13916825 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaat 13916924  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcaca 135  Q
     ||| || |||||||||||||||||    
T  13916925 gtgatgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 20877711 - 20877885
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||   | || ||| ||||||||  |||||||    
T  20877711 accttccaactacaacaattgtgttacctctgcatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccagcgtacgtccggcattcccatagttccat 20877810  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20877811 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattgaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattcctt 20877885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Original strand, 21614113 - 21614293
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| || || || ||||||||  | || |||||||||||| ||    
T  21614113 gaatgtaccttccacctacaacaattatcatacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatgcgtccgacattcccattg 21614212  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||  || || | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21614213 ttccattcaaaagattaaattattgttaagtttggttcaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 21614293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 15337564 - 15337738
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| || || ||||||||| | || | |||  | | | ||||| ||    
T  15337564 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaatttaaacttgccaaacagcaggactccaatatacgtctgacgcttctagtgttcaat 15337663  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||  |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15337664 tcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 15337738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 42682948 - 42683052
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  42682948 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaac 42683047  T
Q  111 atgac 115  Q
     ||||    
T  42683048 gtgac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 310
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920593
Alignment:
Q  144 cagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgca 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| || || | | |||||    
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaag-atgca 13920529  T
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  13920530 --ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 13920593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  223 attaggta 230  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 21614536 - 21614618
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21614536 tgtttcattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 21614618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26601837 - 26601731
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  26601837 gttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatct 26601741  T
Q  267 tacctttgaa 276  Q
    ||||| ||||    
T  26601740 tacctctgaa 26601731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 302
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139446
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataa 34139427  T
Q  284 attcaaacatgccaagcaa 302  Q
    |||||||| || |||||||    
T  34139428 attcaaacctgtcaagcaa 34139446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380628
Alignment:
Q  173 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctt 272  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaacgacaacaattgtcttacctc 3380632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10224615 - 10224543
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  10224615 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaat 10224543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 271
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150336
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||||     
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    |||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  150292 attaggtagggaat----gcaccttccaactacaacaattggcttacct 150336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 416
Target Start/End: Original strand, 1642348 - 1642425
Alignment:
Q  339 cattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1642348 cattcaaaagattaaatttttgttaggcttggtttaaatgatggtattcgagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 1642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17183761 - 17183696
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  17183761 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 17183696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17320272 - 17320163
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  17320272 tatgcggttgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 17320176  T
Q  255 caacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||    
T  17320175 caacaattgtctt 17320163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 21614442 - 21614506
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  21614442 gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaaacaaca 21614506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149745
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  230 acggaatg 237  Q
    | ||||||    
T  18149738 agggaatg 18149745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Original strand, 11824841 - 11824911
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  11824841 gttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatg 11824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18238110 - 18238045
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  18238110 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactagccaaacaacaggactc 18238045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41218158 - 41218093
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  41218158 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggccaaatttaaacttgccaagcaacatgactc 41218093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10224771 - 10224727
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10224771 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 10224727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 39476747 - 39476791
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39476747 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcctt 39476791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34141407 - 34141364
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34141407 caactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaac 34141364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 39476903 - 39476949
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39476903 ttccaactataacaattgtcttacctttgaatgatgtaaattcaaac 39476949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42735677 - 42735639
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42735677 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 42735639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Original strand, 43350892 - 43350930
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43350892 aatgatgatattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 43350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726381
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgaca 63  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgaca 8726381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10523613 - 10523548
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  10523613 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgtgataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 10523548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Original strand, 20877462 - 20877539
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  20877462 gaatgtaccttccaactacaacaattatcttacctctaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 20877539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 20877558 - 20877599
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20877558 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 20877599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 21186805 - 21186846
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21186805 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcctt 21186846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 26601287 - 26601328
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26601287 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 26601328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 26601440 - 26601505
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  26601440 ttccaagtacaacaattgtcttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 26601505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30361061 - 30361016
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgagtaaattcaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30361061 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaattgggtaaattcaaa 30361016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 30361214 - 30361173
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30361214 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 30361173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 48220406 - 48220471
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  48220406 ttccaactacaacaattgtctcacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaataagactc 48220471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 48271349 - 48271308
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48271349 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 48271308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17184009 - 17183969
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17184009 aatgtaccttccaactacaacaattgtcttgcctttgaatg 17183969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 34157032 - 34157087
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34157032 tccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgtcaagcaa 34157087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26500438 - 26500363
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  26500438 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctaaatgaggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 26500363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 26592275 - 26592350
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  26592275 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctaaatgaggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 26592350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30361308 - 30361233
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | | |||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  30361308 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaagactccaa 30361233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 39476656 - 39476731
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  39476656 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 39476731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 9366632 - 9366670
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9366632 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 9366670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 20378543 - 20378581
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20378543 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 20378581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 30354324 - 30354362
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30354324 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 30354362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34353330 - 34353300
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353330 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat 34353300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41622779 - 41622741
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41622779 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 41622741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 9366783 - 9366848
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  9366783 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 9366848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17839854 - 17839789
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  17839854 ttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactc 17839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18238359 - 18238282
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  18238359 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 18238282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20565303 - 20565238
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  20565303 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 20565238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34157349 - 34157285
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  34157349 ttccaactacaacaatt-tgttacctttgaatgagatagattcaaacttgtcaaacaacaagactc 34157285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41218311 - 41218274
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41218311 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcatt 41218274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42683207 - 42683174
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42683207 gaatgcaccttccaactacaacaattatcttacc 42683174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Original strand, 46861609 - 46861686
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| || | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  46861609 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaattgggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaa 46861686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 276
Target Start/End: Original strand, 1642247 - 1642283
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1642247 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctatgaa 1642283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 3924805 - 3924845
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtcc 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  3924805 agagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgtcc 3924845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13920998 - 13920962
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13920998 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 13920962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26601442 - 26601410
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26601442 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 26601410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 28978717 - 28978753
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28978717 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcctt 28978753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39476905 - 39476873
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39476905 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 39476873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42683106 - 42683070
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42683106 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42683070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Original strand, 45362666 - 45362750
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||    
T  45362666 gaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcaagactccaatattcga 45362750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 45362767 - 45362803
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45362767 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 45362803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 48220258 - 48220294
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48220258 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 48220294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48220408 - 48220376
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48220408 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 48220376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 159)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49397046
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  49396897 aagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaa 49396995  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49396996 tgttcgatcgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 49397046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 13972914 - 13973266
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13972914 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 13973013  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973014 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 13973113  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  13973114 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 13973212  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13973213 caatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 13973266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14173974 - 14173622
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14173974 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 14173875  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173874 gtgacgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 14173775  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  14173774 cagaagatcgtcattaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 14173676  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     ||| ||| |||| |||| ||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  14173675 taatgttcaaccggcatttccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttag 14173622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38046650 - 38046267
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38046650 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 38046551  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38046550 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 38046451  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  38046450 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctc 38046352  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaa 396  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| |||| | ||||||||| |  || |||||||| |||||| |||||||||    
T  38046351 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattatactcttgttag-tctggtttaaatgaaggtattaaaatgtcaa 38046267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 36909552 - 36909903
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  36909552 agagacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36909651  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909652 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36909751  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||    
T  36909752 agaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattcc 36909850  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  36909851 aaggttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttattag 36909903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24270579 - 24270229
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24270579 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 24270480  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270479 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 24270380  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||||  | || |  ||    
T  24270379 cagaagatcatcaataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaatagcacg--tc 24270283  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24270282 caatgtttgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttag 24270229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 6435762 - 6436114
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6435762 cagagacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6435861  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435862 gtgacgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6435961  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  6435962 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 6436060  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| ||||||||||| ||||    
T  6436061 caatattcgaccgacaattccattgtttatgtcaaaagattaaattcttattag 6436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35587145 - 35586796
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35587145 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 35587046  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587045 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35586946  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||| |  ||||||||| |||||| | |||| ||||    
T  35586945 cagaagatcgtcatta-gtacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttg--tttcctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaa-actc 35586850  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  35586849 caatgttcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttag 35586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49926595 - 49926246
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  49926595 cagagacagaagg-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaac 49926497  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49926496 gtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49926397  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||    || | |||    
T  49926396 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaaccattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctc 49926298  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgtt 362  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  49926297 caatattcgaccagcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattattgtt 49926246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17686577 - 17686324
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17686577 cagagacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaac 17686478  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686477 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17686378  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17686377 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 17686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 35184963 - 35185312
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35184963 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35185062  T
Q  114 acgagcatgttttggg-agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185063 acgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35185162  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || |||||||    
T  35185163 gaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactcca 35185261  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgtta 363  Q
    || ||||||| | ||||| | |||||   |||||||||||  |||||||||    
T  35185262 atgttcgaccaagattccgattgttcttgtcaaaatattatgttcttgtta 35185312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23342983
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||| |  || |||| |||    
T  23342834 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaa 23342932  T
Q  314 ttttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    | |||||||| |||||||| | |||   |||||| |||||| |||||||||    
T  23342933 tattcgaccggcattcccatttttcttgtcaaaagattaaagtcttgttag 23342983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 41780683 - 41781035
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41780683 cagagacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41780782  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41780783 gtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgc 41780882  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||    
T  41780883 cagaagttcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactc 41780981  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||| |||  |||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  41780982 caatattcaaccagcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 41781035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 35576331 - 35576614
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  35576331 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35576430  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576431 gacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35576530  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  35576531 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 35576614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778421
Alignment:
Q  51 ccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgga 150  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  151 tcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcca 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccg 37778308  T
Q  251 actacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatat 350  Q
     ||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  37778309 cctacaacaattttctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaatattcgaccgacattcctattgttccattcaaaagat 37778407  T
Q  351 taaattcttgttag 364  Q
    ||| ||| ||||||    
T  37778408 taagttcatgttag 37778421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 49427377 - 49427673
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  49427377 cagagatacaaggatggtgttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaac 49427476  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49427576  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  49427577 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 49427672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 18170015 - 18170258
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  18170015 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18170114  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18170115 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgc 18170214  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18170215 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgcatgcaccttccaacta 18170258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29762436 - 29762140
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  29762436 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 29762337  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  29762336 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgcc 29762237  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    || ||||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29762236 agaagatcatcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 29762140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12791489 - 12791227
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12791489 cagagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12791390  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791389 gtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 12791290  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12791289 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaa 12791227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 48215191 - 48215404
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48215191 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatg 48215290  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48215291 acgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48215390  T
Q  214 tagatcgtcattag 227  Q
     |||| ||||||||    
T  48215391 aagatagtcattag 48215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 13283697 - 13284044
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  13283697 gagacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacat 13283796  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  13283797 gacgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgcca 13283896  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 312  Q
    | ||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||  ||    |||||||| |    
T  13283897 gaagatcgtgattaggta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgttaaatggcaagactcga 13283991  T
Q  313 attttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttaga 365  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  13283992 atattcgtccgacattcccattgttcctttcaaacgattaaattcttgttaga 13284044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13635217
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  13635310 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaatttaaacctgccaaacaacaggactc 13635217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 29435963 - 29436260
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29435963 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 29436062  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||    
T  29436063 gtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagc 29436162  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  29436163 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattttcttacctttgaatgaaataaattcaaacctgccaaacaacatgact 29436259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 51269792 - 51270089
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51269792 cagagacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 51269891  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51269892 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51269991  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  51269992 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgctaaacaacaggact 51270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 44597691 - 44597987
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44597691 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44597790  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  44597791 gtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 44597890  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    | | ||||||||||||| || || |  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  44597891 cggaagatcgtcattagttagggta-aagtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 44597987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27486906 - 27486615
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27486906 cagagacacaaggagggtagatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 27486807  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  27486806 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 27486707  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    | | ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27486706 ctgaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 27486615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39857120 - 39856867
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  39857120 gagacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 39857021  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39857020 gacgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 39856921  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39856920 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttac 39856867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44337535 - 44337238
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  44337535 cagagacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaac 44337436  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  44337435 gtgacgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgc 44337336  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  44337335 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaaatgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 44337239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 17697036 - 17697288
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||    
T  17697036 cagagacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaac 17697135  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17697136 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgc 17697235  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||| ||||||| |||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17697236 cagaagatcgtgattaggt----aaggaatgcaccttccaactacaacagttgtctt 17697288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39224413 - 39224151
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39224413 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaac 39224314  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||    
T  39224313 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgc 39224214  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39224213 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaa 39224151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42571992 - 42571730
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  42571992 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42571893  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  42571892 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42571793  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||  || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42571792 cagaagatcgtcattacttaaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 42571730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484576
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
     |||||||||||||||| || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| ||||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatatggtaattcaaacttgccaa 21484576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 19160307 - 19160602
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19160307 cagagacacgaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19160406  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19160407 gtgacgactatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19160506  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  19160507 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 19160602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658814
Alignment:
Q  23 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  223 attaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgac 321  Q
    |||||||| || | |  ||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |  ||||||||| |||||| | ||||| |  |||  |||| |    
T  3658675 attaggtagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctcaacattcgcc 3658771  T
Q  322 cgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||||    | |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  3658772 cgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttag 3658814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48568358
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     |||| |||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48568417 aagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 48568358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689371
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45689312 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 45689371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49263202 - 49262942
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  49263202 gagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgt 49263103  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |    
T  49263102 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctcta 49263003  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | | ||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49263002 gaatatcttcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 49262942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 5765198 - 5765449
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  5765198 gagatacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaactt 5765297  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  5765298 gatgagcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgcca 5765397  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctta 268  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765398 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctta 5765449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 397
Target Start/End: Original strand, 17372717 - 17373098
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||| ||||||||     
T  17372717 cagagacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaat 17372816  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17372817 gtgaagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgc 17372916  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  || |  || |||||    
T  17372917 cagaagatcgtcattaggtatgga---aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactc 17373012  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 397  Q
     ||  |||| |||||||| | | |||||| |||| || ||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||||||    
T  17373013 aaacattcgcccgacatttcaattgttcctttcacaagattaaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaa 17373098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47488245 - 47487991
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  47488245 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 47488146  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  47488145 catgttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagat 47488046  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47488045 cgtcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 47487991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35526391 - 35526194
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||      
T  35526391 gagacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacga 35526292  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35526291 gacgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35526194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13973470 - 13973296
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13973470 accttccaactacaacaattgttttacctttgaatgtagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccaatgttccat 13973371  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973370 tcaaaagattaaattcttgttagtctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 13973296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27035534 - 27035272
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27035534 cagagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaac 27035435  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |    
T  27035434 gtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccac 27035335  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27035334 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaa 27035272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 18842431 - 18842648
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  18842431 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 18842530  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  18842531 gacgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgcca 18842630  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  18842631 gaagatcgggattaggta 18842648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363680
Alignment:
Q  24 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgt 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtca 223  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| |    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  224 ttaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccg 323  Q
    ||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||           ||||| ||| |||| |||    
T  24363803 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttg---------ttgactcaaatattcgcccg 24363718  T
Q  324 acattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgt 361  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24363717 acattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgt 24363680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50068475 - 50068259
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||     
T  50068475 cagagacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaat 50068376  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  50068375 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgc 50068276  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  50068275 cagaagatcgtcattag 50068259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309791
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtga------cgagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30309845 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttacct 30309791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874838
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||  ||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||||||||||||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||||| ||||| || || | |  ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41874897 aagatcgttattagttagggtaag-gtgca--ttcaaactacaacaattgtcttacctctgaa 41874838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180234
Alignment:
Q  43 ataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcact-tgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatg 241  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| || || | |  ||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtg 46180267  T
Q  242 caccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46180266 ca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 46180234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49599090 - 49598921
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49599090 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaac 49598992  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaac 181  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49598991 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 240 - 413
Target Start/End: Original strand, 49926038 - 49926211
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49926038 tgcacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacatttccaatgttcc 49926137  T
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49926138 attcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacagtatacaaatgtcaaaagaatgaggtctattc 49926211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 14173418 - 14173592
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  14173418 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgcagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccggcattcccatagttccat 14173517  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14173518 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 14173592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533154
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | | || |  ||||||||| || ||| |  || ||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgt-tttcctctaactggggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattctcattgt 40533178  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttg 360  Q
    |||  |||||| ||||||||||||    
T  40533177 tcctgtcaaaagattaaattcttg 40533154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37778625 - 37778451
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37778625 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccat 37778526  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37778525 tcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcctt 37778451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 35525857 - 35526031
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  35525857 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgtttgaccgacattcccatagttccat 35525956  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35525957 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtctattcctt 35526031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16532304 - 16532051
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  16532304 gagacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 16532205  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || |||||| || |||||||| | |||| || | ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  16532204 gatgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgcta 16532105  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacc 270  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16532104 gaagatcgtgattaggtatg----gaatgcatcttccaactacaacaattgtcttacc 16532051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 280 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41781201 - 41781065
Alignment:
Q  280 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 379  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  41781201 gtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttattaagctgggattaaatga 41781102  T
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781101 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 41781065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35185517 - 35185346
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  35185517 accttccaactacaacaattgtgtcacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacgttcgaccaacattcccatagttccat 35185418  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35185417 tcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatccattc 35185346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 35586592 - 35586763
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  35586592 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaatttaaatttgtcaagctgcaggactccaatgttcgaccgacattcccatagttccat 35586691  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35586692 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaaagtcaaaagaatgaggtccattc 35586763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 269
Target Start/End: Original strand, 16081298 - 16081529
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16081298 acgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttggagca 16081397  T
Q  134 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgg 233  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||  |||||||||  ||||  | || ||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| |     
T  16081398 caacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggtagg- 16081496  T
Q  234 aatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16081497 ---gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttac 16081529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23343186 - 23343013
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  23343186 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccaatatacgaccgacatttccaatgttccat 23343087  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    | |||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23343086 taaaaa-attaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaggtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 23343013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 416
Target Start/End: Original strand, 17686015 - 17686192
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||   | || |||  ||||||  |||||    
T  17686015 tgcaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcatcaggactccagcgtacgtccggtattcccgttgttc 17686114  T
Q  339 cattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17686115 cattcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattcctt 17686192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 24270025 - 24270196
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||    
T  24270025 accttccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccatagttccat 24270124  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24270125 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc 24270196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6436318 - 6436144
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  6436318 acctcccaactacaacaattgttttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagtaggaggactctaaaattcgaccggcattcccaatgtttcat 6436219  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||| || |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6436218 tcataagattaaatttttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgccaaaagaatgaggtccattcctt 6436144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36910106 - 36909933
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  36910106 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaaattgccaagcagcaggactccaatgttcgatcgacattccata-gttccat 36910008  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36910007 tcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcctt 36909933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 40532946 - 40533117
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||   |||| |    
T  40532946 accttccaactacaacaatcgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcagcacgactccaatatacgaccggcattctcataattccgt 40533045  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40533046 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 40533117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 413
Target Start/End: Original strand, 38046158 - 38046265
Alignment:
Q  306 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgag 405  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38046158 gactccaatattcgaccggcattcccaatatttcattcaaaagattaaattcttgttaggctcggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgag 38046257  T
Q  406 gtccattc 413  Q
    ||||||||    
T  38046258 gtccattc 38046265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 416
Target Start/End: Original strand, 24363472 - 24363647
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| || || || ||| | ||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  24363472 accttccaactacaacaattgtcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggacacaaatattcgtccgacattcccattgtttcat 24363571  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgtta-gattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  24363572 tcaaaagattaaattattgttaggcttggttttaaatgatggtattgacgtgtcaacagaatgaggtgcattcctt 24363647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  67 ggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707544
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcat 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcat 29707544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13284253 - 13284081
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagt-aaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||| || || ||  |||| ||| | || ||| ||||| || ||    
T  13284253 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcatcactcaaatatccgtccggcattctcattg 13284154  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtc 408  Q
    |||||||||||| ||| | || || || |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284153 ttccattcaaaagattcagttatttttgggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtc 13284081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17373275 - 17373099
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||| || || || ||||||||  |||| | |||||| | | | |    
T  17373275 aatgtaccttccaactacaataattgtctaacccctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacattcgtctgacatttctatttt 17373176  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17373175 tccattcgaaagattaaattcttgttagacttcgtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 17373099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5765653 - 5765573
Alignment:
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5765653 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 5765573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16098146 - 16098078
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16098146 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18843004 - 18842828
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 336  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||| || |||||   ||| |   |||  |||||||| | | |||    
T  18843004 aatgcatctaccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagcattcacccgacatttctattgt 18842905  T
Q  337 tccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  18842904 tccattcaaaatattaaattcttgttaggcttggtttagataatggtattcaagtgtcacaagaatgaggtgcattc 18842828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 416
Target Start/End: Original strand, 21484204 - 21484287
Alignment:
Q  333 atgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21484204 atgttccattcaaaagattaaattcttgttagactcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 21484287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 416
Target Start/End: Original strand, 16531852 - 16531928
Alignment:
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16531852 attcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 16531928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14772594 - 14772492
Alignment:
Q  165 atgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 264  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |  |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  14772594 atgttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaagaattgt 14772499  T
Q  265 cttacct 271  Q
     ||||||    
T  14772498 gttacct 14772492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22528049 - 22527984
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22528049 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacaagactc 22527984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 47487699 - 47487764
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  47487699 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 47487764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 49397188 - 49397048
Alignment:
Q  245 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattc 343  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||             || |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  49397188 cttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaag-------------atgttcgactgacattcccatagttccattc 49397102  T
Q  344 aaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 397  Q
    |||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  49397101 aaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacggtattcaagtgtcaaa 49397048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51270344 - 51270279
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51270344 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactc 51270279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 39223861 - 39223925
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  39223861 ttccaactacaacaattgtcttacatttgaatgggtaaattcaaacctgtcaaacaacatgactc 39223925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Original strand, 35586328 - 35586407
Alignment:
Q  235 atgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  35586328 atgaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggagaaaattcaaacttgctaaacaacaagactccaa 35586407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 44336983 - 44337042
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  44336983 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 44337042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3659013 - 3658951
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3659013 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 3658951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Original strand, 27486355 - 27486413
Alignment:
Q  247 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27486355 tccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 27486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 46179945 - 46180007
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  46179945 caactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactc 46180007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29436515 - 29436462
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaa 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29436515 ttccaactacaacaattgttttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaa 29436462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 30309495 - 30309560
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30309495 ttccaactacaacaattgtcttacctgtgaatggggtaaattcaaacctgccaaacaacatgactc 30309560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 41874548 - 41874613
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  41874548 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggagcaaattcaaacttgctaaacaacatgactc 41874613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 49262659 - 49262724
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  49262659 ttccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 49262724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 50067921 - 50067986
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  50067921 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 50067986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18170572 - 18170504
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18170572 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaagactc 18170504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262429
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcc 19262429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 24269869 - 24269913
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24269869 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 24269913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36910262 - 36910218
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36910262 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 36910218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 42571279 - 42571323
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42571279 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42571323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16081737 - 16081658
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  | |  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16081737 tgttccattcaaaagattaaatttttgttaggattgatttagatgatgacattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattc 16081658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Original strand, 18170606 - 18170664
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  18170606 ggaatgaatgcaccttccaacaacaacaattgtctt-tctttgaatgaggtaattcaaac 18170664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 301
Target Start/End: Original strand, 38044852 - 38044911
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagca 301  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  38044852 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagca 38044911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41781369 - 41781327
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcc 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41781369 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcc 41781327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 280
Target Start/End: Original strand, 48568068 - 48568102
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568068 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 48568102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13973623 - 13973582
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13973623 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 13973582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 29707201 - 29707266
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  29707201 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgctaaacaacatgactc 29707266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 29761827 - 29761892
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  29761827 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaagcctgccaaacaacaggactc 29761892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37778805 - 37778764
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37778805 aatgatggtattcaactgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 37778764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 38044699 - 38044740
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38044699 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 38044740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45689663 - 45689598
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  45689663 ttcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacaggactc 45689598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 46179792 - 46179833
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46179792 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 46179833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 49598397 - 49598438
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49598397 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49598438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Original strand, 16097843 - 16097922
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||  | || ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16097843 tgttccattcaaaagattgaattattgttaggcttggtttaaatgatggtat---agtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 16097922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Original strand, 17685770 - 17685854
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||| || || ||  |||||||| |||||    
T  17685770 gaatgtaccttccaactacaacaattatcttacctctgaatgggataaattcaaacttgctaaacagcagaactccaatgttcga 17685854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 17685863 - 17685907
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17685863 ttaaatgatggtaatcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 17685907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37778900 - 37778824
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  37778900 gaatgcaccttccaaccacaacaattatcttacctctaaataggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 37778824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48227076 - 48227012
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  48227076 aactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactccaa 48227012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3659349 - 3659310
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3659349 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatg 3659310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18170731 - 18170668
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18170731 accttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaa 18170668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Original strand, 18170765 - 18170823
Alignment:
Q  232 ggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  18170765 ggaatgaatgcaccttccaacagcaacaattgtctt-tctttgaatgaggtaattcaaac 18170823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 21484440 - 21484499
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| |||||    
T  21484440 ttccaactacaacaattgtcttacctttaaatgaggcaaattcaaaattgccaaacaaca 21484499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 27034980 - 27035046
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa--tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  27034980 ttccaactacaataattgtcttacctttgaaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 27035046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35526191 - 35526061
Alignment:
Q  233 gaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccca 332  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| | |||||||| |  ||||||||| | |||| |  || ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  35526191 gaatgaatgcaccttatagctacaacaaaggtctt-cttttgaatggggtaattcaaactttccaaacggcaggactccaatatttgaccggcattccca 35526093  T
Q  333 atgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
     | ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35526092 ttattcctgtcaaaagattaaattcttgttag 35526061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 46924689 - 46924764
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  46924689 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgtggcaaattcaaacttgctaagcagcatgactccaa 46924764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 15471510 - 15471568
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggaga 71  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  15471510 gagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgttcgacgaggggaga 15471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17697568 - 17697498
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  17697568 gcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggataaattcaaactcgccaaacaacatgactc 17697498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 267
Target Start/End: Original strand, 27034786 - 27034816
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27034786 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 27034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 413
Target Start/End: Original strand, 27034882 - 27034920
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27034882 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 27034920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Original strand, 42571442 - 42571492
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaa-tgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  42571442 caactacaacaattgtgttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaa 42571492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 48707132 - 48707090
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaac 55  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48707132 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49427925 - 49427863
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  49427925 caactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactc 49427863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 49598550 - 49598618
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgt---cttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  49598550 ttccaactacaacaattgttgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactc 49598618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19160859 - 19160794
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  19160859 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 19160794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Original strand, 22527680 - 22527792
Alignment:
Q  194 caaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacat 293  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |    
T  22527680 caaaagtttgatttcgccagaagatcatcattagttagggtaagg-tgca--ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaactt 22527775  T
Q  294 gccaagcaacaagactc 310  Q
    | ||| ||||| |||||    
T  22527776 gtcaaacaacaggactc 22527792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 30309357 - 30309398
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30309357 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaacgaggtgcattcctt 30309398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35185682 - 35185641
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35185682 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 35185641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 35586426 - 35586467
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35586426 aatgatggtatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 35586467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39223769 - 39223728
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39223769 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 39223728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45689815 - 45689774
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45689815 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 45689774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 46924783 - 46924824
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46924783 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 46924824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 47487546 - 47487587
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47487546 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 47487587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 48567915 - 48567956
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48567915 aatgatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 48567956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 49262506 - 49262547
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49262506 aatgatgttattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49262547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 12790933 - 12791001
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  12790933 accttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactc 12791001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 13634813 - 13634849
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13634813 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 13634849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14772755 - 14772687
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  14772755 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttca 14772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 15356228 - 15356268
Alignment:
Q  238 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15356228 aatgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatg 15356268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19161007 - 19160971
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19161007 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 19160971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Original strand, 24269777 - 24269817
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat 277  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24269777 gaatgtaccttccaacttcaacaattatcttacctttgaat 24269817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27034982 - 27034950
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27034982 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 27034950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29436663 - 29436627
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29436663 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 29436627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 29761663 - 29761699
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29761663 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 29761699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 39223614 - 39223642
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223614 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 39856749 - 39856785
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39856749 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 39856785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Original strand, 45689661 - 45689693
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45689661 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 45689693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49397346 - 49397302
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  49397346 ttaaatgatggtattcaagtatcaaaagaacgaggtgcattcctt 49397302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49428076 - 49428040
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49428076 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 49428040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 49598552 - 49598520
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49598552 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 49598520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 50067773 - 50067809
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50067773 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 50067809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 50067923 - 50067891
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50067923 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 50067891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41857188 - 41856836
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41857188 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 41857089  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41857088 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41856989  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | |||    
T  41856988 cagaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctc 41856890  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  41856889 caatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattattgttag 41856836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44943295 - 44942945
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44943295 cagagacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44943196  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44943195 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 44943096  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | |||    
T  44943095 cagaagattgtcattaggtacggaatgtatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cgtttgaatgagataattcaaacttgccaaacgacaggtctc 44942997  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgtt 362  Q
    |||| |||   || |||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||    
T  44942996 caatattcagacggcattcccattgctcctgtcaaaagattaaattcttgtt 44942945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18440509 - 18440157
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  18440509 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaac 18440410  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18440409 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgc 18440310  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||  | |||| |  || | |||    
T  18440309 gagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatctt-cctttgaatggggtaattcaaattttccaaacggcaggtctc 18440211  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  18440210 caatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattattgttag 18440157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 42603454 - 42603803
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42603454 cagagacagaaggagggcggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42603553  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42603554 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 42603653  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||   |||| | |||    
T  42603654 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgcca---aacaggtctc 42603749  T
Q  311 caattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  42603750 caatattcgaccggcattcccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 42603803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19242375 - 19242024
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||     
T  19242375 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19242276  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  19242275 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19242176  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  | ||||||| |||||| |  ||  |||||    
T  19242175 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-tctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactcc 19242077  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  19242076 aatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaacttcttgttag 19242024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19315559 - 19315208
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||     
T  19315559 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19315460  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  19315459 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19315360  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcc 311  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  | ||||||| |||||| |  ||  |||||    
T  19315359 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-tctctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactcc 19315261  T
Q  312 aattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  19315260 aatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaacttcttgttag 19315208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 40702360 - 40702713
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40702360 cagagacagaaggagagtggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40702459  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40702460 gtgacgagcatgttttgggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 40702559  T
Q  211 cagtagatc-gtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||    
T  40702560 caaaagatcggtcattaggtacggaatgaatgcacattttagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtct 40702658  T
Q  310 ccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  40702659 ccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttag 40702713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15032538 - 15032243
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15032538 cagagacacaagtatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 15032439  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032438 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 15032339  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  15032338 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacatttgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 15032243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Original strand, 26452325 - 26452622
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26452325 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 26452424  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26452425 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26452524  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
     || ||||||||||||| || || | |  || |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26452525 tagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgta--ttccaactgcaacaattgtcatacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 26452621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 24861344 - 24861640
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  24861344 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 24861443  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  24861444 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgcc 24861543  T
Q  212 agtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    || ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  24861544 agaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccatctgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 24861640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42169172 - 42168912
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  42169172 gagacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgt 42169073  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42169072 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 42168973  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | ||||||||||||| || |||    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168972 gaagatcgtcattagtta-ggataagatgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 42168912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033877
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
     ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38033936 aagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 38033877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 41363658 - 41363909
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  41363658 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 41363757  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  41363758 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctcca 41363857  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    | ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41363858 gaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtctt 41363909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 43693137 - 43693399
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  43693137 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 43693236  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  43693237 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 43693336  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43693337 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattttcttacctctgaa 43693399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 485472 - 485177
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  485472 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 485373  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485372 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 485273  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||  ||||||||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  485272 cacaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 485177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 40415257 - 40415473
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40415257 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40415356  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  40415357 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgt 40415456  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  40415457 cagaagatcgtcattag 40415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 41275394 - 41275610
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41275394 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 41275493  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  41275494 gtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 41275593  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41275594 cagaagatcgtcattag 41275610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 2416915 - 2417181
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2416915 cagaaacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2417014  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |    
T  2417015 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccac 2417114  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 280  Q
    ||| ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2417115 cagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgag 2417181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33799757 - 33799503
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  33799757 caaggagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 33799658  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  33799657 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagat 33799558  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33799557 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 33799503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 40414610 - 40414826
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40414610 cagagacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40414709  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  40414710 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccac 40414809  T
Q  211 cagtagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  40414810 cagaagatcgtcattag 40414826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 34614955 - 34615210
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  34614955 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgt 34615054  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  34615055 gacgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacca 34615154  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    | |||| || ||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34615155 gaagatagtaattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 34615210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28706356 - 28706101
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  28706356 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaac 28706257  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28706256 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgc 28706157  T
Q  211 cagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    ||| |||| |||||||| || || | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28706156 cagaagattgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttac 28706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43638883 - 43638629
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  43638883 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 43638784  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||    
T  43638783 catgttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagat 43638684  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43638683 cgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaataattgtcttacctctgaa 43638629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484756
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31172028 - 31171769
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||  ||||    
T  31172028 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacat 31171929  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||| | ||| |||  | |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  31171928 gacaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgcca 31171829  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    | ||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31171828 gaagatcgtgattaggtatg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 31171769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3589478 - 3589224
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | | | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  3589478 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgt 3589379  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3589378 gatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgcca 3589279  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct 271  Q
    | ||||||| |||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3589278 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttcaaactacaacaattgtcttacct 3589224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 244 - 416
Target Start/End: Original strand, 18439954 - 18440127
Alignment:
Q  244 ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18439954 ccttccaactacaacaattgtcttatctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactctaatattcgaccgacattcacaatgttccatt 18440053  T
Q  343 caaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440054 caaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 18440127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 41856630 - 41856801
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  41856630 acctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaagcagcaggactctaatattcaaccggcattcccaatgttccat 41856729  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41856730 tcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 41856801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42604007 - 42603836
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  42604007 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcaaccgacatttccaatgttccgt 42603908  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42603907 tcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 42603836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28167394 - 28167234
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  28167394 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccagcattcccaatgttccat 28167295  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat 402  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28167294 tcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat 28167234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575963
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 213  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||            || ||  || |||||||||||||||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttgttga------------atttcgccagaagtttgattccgccag 16575882  T
Q  214 tagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
     || |||| |||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  16575883 aagttcgtgattaggcaggga---aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcatacttgccaa 16575963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40702917 - 40702746
Alignment:
Q  243 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  40702917 acctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcaacatgactccaatattcgaccggcattcccaatgttacat 40702818  T
Q  342 tcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||  ||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40702817 tcaaaggattaaattctctttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 40702746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26487235 - 26487058
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  26487235 gaatgtaccttccaactgcaacatttatcttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgacaggcattcccaatg 26487136  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26487135 ttccattcaaaagattaaattattgttaggctaggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattc 26487058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37780693 - 37780529
Alignment:
Q  250 aactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaat 348  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  37780693 aactacaaaaattgtgttacatttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattctcaatgttccattcaaaag 37780594  T
Q  349 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 413  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37780593 aataaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 37780529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 22548263 - 22548380
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22548263 cagagacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 22548362  T
Q  111 atgacgagcatgttttgg 128  Q
     |||||||||||||||||    
T  22548363 gtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 44942751 - 44942913
Alignment:
Q  256 aacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgtt-ccattcaaaatattaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||  ||| |||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  44942751 aacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaatttgccaagtagcacaacttcaatattcgaccagcattctcaatgtttccattcaaaagattaa 44942850  T
Q  354 attcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44942851 attgttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 44942913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 364
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26487025
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaa 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcatctcttagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaa 26486945  T
Q  285 ttcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    ||||||| || ||| |  || | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  26486946 ttcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggtattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttag 26487025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Original strand, 22549232 - 22549376
Alignment:
Q  161 ggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaa 260  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| || || | |  || |  |||||||| ||||||    
T  22549232 ggtgacgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaagg-tgta--ttccaacttcaacaa 22549325  T
Q  261 ttgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22549326 ttgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 22549376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16576214 - 16576038
Alignment:
Q  241 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    || | | |||  |||| | |   | |||| |    
T  16576214 gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaatagctatcaagtattcacccgaaagttttattgtttc 16576115  T
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16576114 attcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatggtggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 16576038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Original strand, 28705555 - 28705637
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28705555 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcga 28705637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24861895 - 24861830
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  24861895 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaaccttccaaacaacaggactc 24861830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 38033586 - 38033651
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  38033586 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtagtaaattcaaacttaccaaacaacaggactc 38033651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40415810 - 40415751
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaaca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  40415810 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaaca 40415751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16576445 - 16576363
Alignment:
Q  334 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  16576445 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttatataatggtattcaagtgtcaaaagaacgaggtgaattcctt 16576363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44050992 - 44050927
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  44050992 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaagactc 44050927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28167494 - 28167450
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28167494 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 28167450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 414
Target Start/End: Original strand, 31171575 - 31171648
Alignment:
Q  340 attcaaaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcc 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  31171575 attcaaaagattaaattcttgttagtttggt-ttagatgatggtattgaactatcaaaagaatgaggtgcattcc 31171648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40416056 - 40415982
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  40416056 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaattgggaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 40415982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 43637428 - 43637490
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43637428 caactataacaattgccttacctttgaatgcggtaaattcaaacctgccaaacaacaagactc 43637490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26452877 - 26452812
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  26452877 ttccaactgcaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacatgactc 26452812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Original strand, 38033337 - 38033414
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  38033337 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaaggaggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactccaa 38033414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 38033433 - 38033474
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38033433 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 38033474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40415153 - 40415096
Alignment:
Q  254 acaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40415153 acaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaacaggactc 40415096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40415963 - 40415922
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40415963 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 40415922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 41856478 - 41856519
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41856478 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 41856519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22843532 - 22843424
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgac 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | |||| |||| |||| |||||||| |||||  || |||     
T  22843532 acacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggagaataacgttcagttgattggagttaacgaaggacgacgacttgag 22843433  T
Q  116 gagcatgtt 124  Q
    |||||||||    
T  22843432 gagcatgtt 22843424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 280
Target Start/End: Original strand, 41017413 - 41017444
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41017413 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag 41017444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 484770 - 484808
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  484770 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 484808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 28705805 - 28705867
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  28705805 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 28705867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42604157 - 42604119
Alignment:
Q  378 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42604157 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42604119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 484920 - 484985
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  484920 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 484985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2417525 - 2417460
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||| |||||    
T  2417525 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattaaaacttgtcaaacaacaggactc 2417460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 15031986 - 15032051
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  15031986 ttccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacacgactc 15032051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 18439704 - 18439777
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagact 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18439704 gaatgtaccttccaactacaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagact 18439777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 412
Target Start/End: Original strand, 18439800 - 18439837
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatt 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18439800 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacatt 18439837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 416
Target Start/End: Original strand, 33799259 - 33799300
Alignment:
Q  375 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33799259 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 33799300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 15031838 - 15031874
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15031838 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 15031874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22549779 - 22549743
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22549779 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 22549743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24862043 - 24862007
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24862043 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 24862007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26453012 - 26452976
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26453012 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 26452976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 28705654 - 28705690
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28705654 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 28705690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 33776051 - 33776079
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776051 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 33776079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38033588 - 38033556
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38033588 gaatgcacattccaactacaacaattgtcttac 38033556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41275767 - 41275731
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41275767 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 41275731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Original strand, 42168472 - 42168508
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42168472 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 42168508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 267
Target Start/End: Original strand, 43637179 - 43637207
Alignment:
Q  239 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637179 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 43637207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44051140 - 44051104
Alignment:
Q  380 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44051140 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctt 44051104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2521
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  2261 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 2360  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2361 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 2460  T
Q  213 gtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
      ||||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2461 aaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 2521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4830 - 4798
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4830 ttccaactacaacaattgtcttaccttagaatg 4798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 1783 - 1998
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||     
T  1783 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 1882  T
Q  112 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1883 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 1982  T
Q  212 agtagatcgtcattag 227  Q
    |  |||||||||||||    
T  1983 ataagatcgtcattag 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2332 - 2289
Alignment:
Q  249 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2332 caactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaac 2289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18123 - 17870
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacatgacgag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  18123 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgag 18025  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18024 catgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 17925  T
Q  219 cgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 276  Q
    ||||||||| || || | |  ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17924 cgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtcttacctctgaa 17870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Original strand, 17449 - 17481
Alignment:
Q  372 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatga 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17449 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatga 17481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 24899 - 25115
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||  |    
T  24899 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgt 24998  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||    
T  24999 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgcca 25097  T
Q  213 gtagatcgtcattaggta 230  Q
     |||||||| ||||||||    
T  25098 atagatcgtgattaggta 25115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 63968 - 64095
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaatgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  63968 cagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaac 64066  T
Q  111 atgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  64067 gtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64224
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    || | || ||||||||||||||||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtaggg---taaggtacattccaactacaacaattgtctt 64194  T
Q  268 acctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 298  Q
     |||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  64195 -cctttgaatgaagtaattcaaacttgccaa 64224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Original strand, 108003 - 108131
Alignment:
Q  237 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | | | | ||    
T  108003 gaatgcaccttccaactacaacaattatcttacctttaaatgaagtaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcgtccgagacttctactg 108102  T
Q  336 ttccattcaaaatattaaattcttgttag 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  108103 ttccattcaaaatattaaattcctgttag 108131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85613
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaacta 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || || | |  ||||  |||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaacta 85558  T
Q  255 caacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  85559 caacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 85613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2499 - 2434
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  2499 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaaaacaagactc 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 14604 - 14755
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtcattaggtacgg-aatgaatgcaccttccaact 253  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||| || || || |  ||||  ||||||||    
T  14604 tatgtgggtgaagttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacg--tgca--ttccaact 14699  T
Q  254 acaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  14700 acaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 14755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15012 - 14947
Alignment:
Q  246 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  15012 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggttaaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 14947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 1158
Alignment:
Q  240 tgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  1209 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggtaaattcaaac 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5560
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagtagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||      
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  223 attaggta 230  Q
    ||||||||    
T  5553 attaggta 5560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36855
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgc 36855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University