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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3395-Insertion-5 (Length: 913)

Name: NF3395-Insertion-5
Description: NF3395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3395-Insertion-5
NF3395-Insertion-5
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (7-838)||(1722393-1723226)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 726; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 726; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 1723226 - 1722393
Alignment:
Q  7 acatcattccttgatggtgcaataaacttttttgaaaacttattatgaatcat--tacgtgatccaattttaacatctacctacattttttcagtnnnnn 104  Q
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T  1723226 acatcattccttgatggtgcaataaacttttttgaaaacttattatgaataatattacgtgatccaattttaacatctacctacattttttccgtaaaaa 1723127  T
Q  105 nntctacattttaattcaagaatattttaaaattattagagtgtacactaatactttaaaattattgcacataacgaaatattgtgtatatattaattca 204  Q
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T  1723126 aatctacattttaattcaagaatattttaaaattattagagtgtacactaatactttaaaattattgcacataacgacatattgtgtatatattaattca 1723027  T
Q  205 agaatatttttaataagtttatataaaccttccatgtgtcagccagttgtcttttccattgattaaattatacgggaatatatcttgacccaatagaaaa 304  Q
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T  1723026 agaatatttttaataagtttatataaaccttccatgtgtcagccagttgtcttttccattggttaaattatacgggaatatatcttgacccaatagaaaa 1722927  T
Q  305 tacatgaaaataaaataaacaaagtgatccatccactcgtcctaataagaagtaatggcttgatttgctttatcctttacaagataacaattaaaatttg 404  Q
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T  1722926 tacatgaaaataaaataaacaaagtgatccatccactcgtcctaataagaagtaatggcttgatttgctttatcctttacaagataacaattaaaatttg 1722827  T
Q  405 tgagaatctttcttgaagagatgatataaaaactacgttactcaaatttcaacaatatattattctccatcttcc-aagcatctcatgaatatggaatca 503  Q
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T  1722826 tgagaatctttcttgaagagatgatataaaaactacgttactcaaatttcaacaatatattattctccatcttccaaagcatctcatgaatatggaatca 1722727  T
Q  504 agggaacaattcacgttttatgccacctagaaacatgtgatatattagcacctatgtatattctccaccccacaatcccctattttttctgcaaacaaga 603  Q
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T  1722726 agggaacaattcacgttttatgccacctagaaacatgtgatatattagcacctatgtatattctccaccccacaatcccctattttttctgcaaacaaga 1722627  T
Q  604 cggatccaaagagttaagacttgagattaggagcacaacatttttagatgaaagatcatnnnnnnntttagattttaagttggtagattatattcctcta 703  Q
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T  1722626 cggatccaaagagttaagacttgagattaggagcacaacatttttagatgaaagatcataaaaaagtttagattttaagttggtagattatattcctcta 1722527  T
Q  704 aacaaaagttgggaaattaaagtgaagcctgacttttagacatactatatagtgtaaccaacaaggtcatccttgagtgcaaaaagctcacccgagttta 803  Q
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T  1722526 aacaaaagttgggaaattaaagtgaagcctgacttttagacatagtatatagtgtaaccaacaaggttgtccttgagtgcagaaagctcacccgagtcta 1722427  T
Q  804 actgggcctccaaaagtgacgggtctccattcaaa 838  Q
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T  1722426 gct-ggcctccaaaagtgacgggtctccattcaaa 1722393  T

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