View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3395-Insertion-7 (Length: 794)

Name: NF3395-Insertion-7
Description: NF3395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3395-Insertion-7
NF3395-Insertion-7
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (144-348)||(40542909-40543113)
chr7 (148-348)||(22119890-22120090)
chr7 (144-347)||(7275275-7275478)
chr7 (144-348)||(2751269-2751473)
chr7 (144-348)||(7175861-7176065)
chr7 (143-347)||(18044104-18044308)
chr7 (147-348)||(21835152-21835353)
chr7 (143-348)||(10091185-10091389)
chr7 (144-348)||(11997847-11998051)
chr7 (144-348)||(21217832-21218036)
chr7 (143-347)||(17196950-17197154)
chr7 (145-348)||(2103054-2103255)
chr7 (163-348)||(22703503-22703688)
chr7 (144-333)||(17212051-17212240)
chr7 (143-347)||(27009356-27009561)
chr7 (148-348)||(23012507-23012707)
chr7 (143-348)||(27312149-27312354)
chr7 (144-348)||(2344297-2344501)
chr7 (144-348)||(42913512-42913716)
chr7 (147-348)||(28089817-28090021)
chr7 (188-348)||(654704-654863)
chr7 (144-348)||(31197589-31197792)
chr7 (145-346)||(19421230-19421431)
chr7 (144-346)||(22638290-22638488)
chr7 (148-347)||(27704004-27704202)
chr7 (198-348)||(29861722-29861872)
chr7 (155-347)||(28950877-28951072)
chr7 (143-347)||(39145652-39145856)
chr7 (147-346)||(9683827-9684026)
chr7 (186-348)||(16374034-16374196)
chr7 (144-346)||(32849589-32849791)
chr7 (168-348)||(31273936-31274115)
chr7 (201-347)||(41907514-41907659)
chr7 (144-348)||(43785298-43785502)
chr7 (217-348)||(23092167-23092298)
chr7 (147-348)||(9717986-9718187)
chr7 (148-292)||(13332480-13332622)
chr7 (144-347)||(31712902-31713098)
chr7 (178-347)||(36772303-36772471)
chr7 (229-347)||(3851840-3851958)
chr7 (145-279)||(7799900-7800034)
chr7 (144-347)||(28646967-28647170)
chr7 (145-348)||(21574101-21574305)
chr7 (145-348)||(23330738-23330941)
chr7 (144-347)||(25333417-25333603)
chr7 (165-301)||(14199713-14199848)
chr7 (174-347)||(22643342-22643515)
chr7 (143-347)||(22696317-22696522)
chr7 (149-274)||(42814867-42814992)
chr7 (162-243)||(22299865-22299946)
chr7 (225-324)||(21373789-21373888)
chr7 (144-218)||(23854394-23854468)
chr7 (147-303)||(8435741-8435895)
chr7 (144-243)||(40332097-40332196)
chr7 (144-221)||(21370595-21370672)
chr7 (223-347)||(33137825-33137948)
chr7 (143-347)||(38864446-38864650)
chr7 (145-348)||(9769585-9769786)
chr7 (148-348)||(3950788-3950988)
chr7 (148-212)||(28003838-28003902)
chr7 (204-342)||(1766149-1766286)
chr7 (249-339)||(8943409-8943500)
chr7 (147-258)||(12211625-12211735)
chr7 (208-346)||(35476403-35476541)
chr7 (214-283)||(6491675-6491744)
chr7 (260-347)||(25102809-25102895)
chr7 (148-284)||(1469114-1469250)
chr7 (147-339)||(36173036-36173229)
chr7 (144-334)||(47541382-47541571)
chr7 (148-242)||(3951095-3951190)
chr7 (144-227)||(22264622-22264705)
chr7 (149-334)||(37056217-37056393)
chr7 (266-316)||(40332193-40332243)
chr7 (148-193)||(577681-577726)
chr7 (168-244)||(29385717-29385794)
chr7 (154-244)||(48125149-48125241)
chr7 (145-217)||(37693692-37693764)
chr7 (302-348)||(22299958-22300004)
chr7 (225-318)||(23636594-23636687)
chr7 (295-345)||(30345511-30345561)
chr7 (189-247)||(35173132-35173190)
chr7 (270-347)||(3771267-3771344)
chr7 (169-245)||(5934147-5934224)
chr7 (201-329)||(11909972-11910100)
chr7 (144-193)||(33137950-33137998)
chr7 (278-311)||(43617356-43617389)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (143-347)||(35492904-35493108)
chr3 (143-348)||(46576341-46576546)
chr3 (144-348)||(8456149-8456353)
chr3 (144-348)||(25289714-25289917)
chr3 (141-348)||(30807152-30807359)
chr3 (144-348)||(40133448-40133652)
chr3 (143-347)||(49258262-49258466)
chr3 (146-348)||(53424176-53424377)
chr3 (143-348)||(40940818-40941023)
chr3 (143-347)||(21362936-21363140)
chr3 (144-348)||(30257618-30257822)
chr3 (144-348)||(45529754-45529957)
chr3 (143-348)||(45272415-45272620)
chr3 (149-346)||(25379760-25379957)
chr3 (151-348)||(26174114-26174311)
chr3 (144-348)||(15566499-15566701)
chr3 (144-348)||(48977382-48977586)
chr3 (144-347)||(18176887-18177090)
chr3 (149-347)||(52821636-52821833)
chr3 (144-347)||(34492575-34492778)
chr3 (145-348)||(52455648-52455851)
chr3 (162-348)||(53233910-53234095)
chr3 (167-348)||(10190741-10190922)
chr3 (172-347)||(39041852-39042027)
chr3 (167-348)||(10083818-10083999)
chr3 (143-347)||(32151418-32151621)
chr3 (144-347)||(31537838-31538041)
chr3 (157-303)||(26108299-26108445)
chr3 (147-348)||(25344057-25344257)
chr3 (144-318)||(7470245-7470418)
chr3 (144-347)||(7485531-7485728)
chr3 (190-348)||(8097278-8097436)
chr3 (143-329)||(29915288-29915473)
chr3 (143-329)||(29964441-29964626)
chr3 (143-347)||(4462626-4462829)
chr3 (144-348)||(51532783-51532987)
chr3 (195-348)||(2511296-2511449)
chr3 (144-329)||(19857047-19857230)
chr3 (174-347)||(33398468-33398641)
chr3 (179-347)||(1692863-1693030)
chr3 (173-348)||(8958034-8958210)
chr3 (198-347)||(24407309-24407458)
chr3 (149-348)||(11390601-11390800)
chr3 (143-339)||(55371302-55371489)
chr3 (147-347)||(53288713-53288912)
chr3 (164-333)||(49167070-49167242)
chr3 (142-342)||(26158810-26159003)
chr3 (244-348)||(24165714-24165817)
chr3 (144-339)||(4252404-4252599)
chr3 (203-348)||(17579134-17579280)
chr3 (249-347)||(54475780-54475878)
chr3 (144-271)||(38732960-38733087)
chr3 (144-261)||(55287797-55287914)
chr3 (206-348)||(1178228-1178368)
chr3 (204-347)||(48972714-48972854)
chr3 (213-316)||(1242036-1242139)
chr3 (258-346)||(48104985-48105073)
chr3 (249-348)||(33698705-33698804)
chr3 (168-318)||(34844396-34844545)
chr3 (144-236)||(9842915-9843006)
chr3 (157-277)||(14343358-14343478)
chr3 (280-348)||(53848433-53848501)
chr3 (144-318)||(50582986-50583159)
chr3 (157-236)||(9853623-9853702)
chr3 (162-347)||(50731237-50731418)
chr3 (162-347)||(50781436-50781617)
chr3 (144-252)||(25017510-25017617)
chr3 (148-342)||(27887426-27887622)
chr3 (148-347)||(6041670-6041871)
chr3 (285-347)||(4048085-4048147)
chr3 (281-347)||(25017620-25017685)
chr3 (299-348)||(3747730-3747779)
chr3 (263-348)||(32094756-32094841)
chr3 (261-348)||(7195918-7196005)
chr3 (148-218)||(36660768-36660838)
chr3 (259-348)||(39890605-39890693)
chr3 (295-347)||(14997755-14997807)
chr3 (171-234)||(30311334-30311398)
chr3 (150-197)||(50195429-50195476)
chr3 (143-193)||(24703697-24703747)
chr3 (176-245)||(52769956-52770026)
chr3 (169-245)||(10445112-10445189)
chr3 (145-242)||(16140292-16140389)
chr3 (277-318)||(33793579-33793620)
chr3 (145-238)||(51390948-51391041)
chr3 (168-241)||(53863845-53863918)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (144-348)||(44946052-44946256)
chr2 (143-347)||(11941210-11941414)
chr2 (144-348)||(15037953-15038157)
chr2 (144-348)||(33827572-33827776)
chr2 (143-347)||(30466830-30467034)
chr2 (141-348)||(24195995-24196200)
chr2 (144-347)||(25293160-25293356)
chr2 (181-348)||(35171831-35171998)
chr2 (148-328)||(44976172-44976353)
chr2 (167-340)||(36242319-36242492)
chr2 (148-347)||(17324764-17324961)
chr2 (143-348)||(41313985-41314189)
chr2 (167-348)||(43374329-43374505)
chr2 (144-347)||(36390569-36390769)
chr2 (162-348)||(27290600-27290772)
chr2 (163-325)||(10582014-10582174)
chr2 (141-348)||(4567428-4567643)
chr2 (166-348)||(34516413-34516589)
chr2 (149-347)||(41329842-41330039)
chr2 (146-348)||(19054021-19054224)
chr2 (167-348)||(1191530-1191711)
chr2 (167-348)||(5394034-5394215)
chr2 (145-348)||(8192351-8192553)
chr2 (167-347)||(13266507-13266686)
chr2 (201-348)||(3943791-3943938)
chr2 (149-348)||(8258896-8259095)
chr2 (144-347)||(27269344-27269553)
chr2 (222-348)||(28668945-28669071)
chr2 (167-328)||(45271401-45271562)
chr2 (196-348)||(2140485-2140634)
chr2 (164-335)||(19849847-19850018)
chr2 (144-328)||(32845085-32845254)
chr2 (144-343)||(5608038-5608237)
chr2 (144-247)||(18976526-18976628)
chr2 (162-299)||(23787056-23787193)
chr2 (145-278)||(40997419-40997552)
chr2 (250-347)||(44610139-44610236)
chr2 (144-348)||(28194137-28194337)
chr2 (228-347)||(714125-714244)
chr2 (143-347)||(6714295-6714485)
chr2 (145-347)||(14946774-14946975)
chr2 (167-318)||(19525429-19525576)
chr2 (169-347)||(29361573-29361745)
chr2 (143-235)||(4852551-4852643)
chr2 (204-347)||(19174817-19174959)
chr2 (152-348)||(4618691-4618880)
chr2 (163-340)||(18708490-18708667)
chr2 (162-347)||(19605846-19606030)
chr2 (228-347)||(31778105-31778228)
chr2 (148-262)||(918782-918898)
chr2 (243-334)||(4769259-4769350)
chr2 (273-348)||(14486948-14487023)
chr2 (261-340)||(45132398-45132477)
chr2 (270-347)||(44929846-44929923)
chr2 (280-348)||(18692090-18692158)
chr2 (281-348)||(18976454-18976521)
chr2 (261-347)||(9400961-9401047)
chr2 (167-347)||(29698164-29698343)
chr2 (224-347)||(30472269-30472392)
chr2 (143-300)||(1845701-1845861)
chr2 (269-347)||(4852649-4852726)
chr2 (283-348)||(39957891-39957956)
chr2 (143-223)||(32526209-32526289)
chr2 (168-274)||(13747578-13747684)
chr2 (208-303)||(19517000-19517095)
chr2 (162-346)||(12543156-12543339)
chr2 (145-303)||(3405195-3405354)
chr2 (149-240)||(38784286-38784377)
chr2 (154-245)||(42327368-42327462)
chr2 (225-318)||(35943758-35943852)
chr2 (166-216)||(44610090-44610140)
chr2 (299-348)||(1501463-1501511)
chr2 (143-188)||(31536201-31536246)
chr2 (143-183)||(20297556-20297596)
chr2 (168-318)||(26176227-26176376)
chr2 (168-258)||(40591201-40591290)
chr2 (295-348)||(1845048-1845101)
chr2 (167-244)||(6099493-6099570)
chr2 (282-347)||(13089012-13089077)
chr2 (168-245)||(26482118-26482195)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (143-348)||(4718642-4718847)
chr8 (144-348)||(34237654-34237858)
chr8 (144-348)||(3734622-3734826)
chr8 (144-348)||(39349254-39349458)
chr8 (143-346)||(28193471-28193674)
chr8 (144-348)||(2618184-2618388)
chr8 (144-348)||(32879277-32879481)
chr8 (157-347)||(21603241-21603431)
chr8 (147-346)||(15259407-15259606)
chr8 (142-348)||(20305904-20306110)
chr8 (142-348)||(21092537-21092743)
chr8 (142-347)||(42643118-42643323)
chr8 (145-348)||(19471608-19471812)
chr8 (145-348)||(19542532-19542736)
chr8 (145-348)||(19589960-19590164)
chr8 (145-348)||(42328004-42328206)
chr8 (169-348)||(8765525-8765704)
chr8 (147-348)||(27746334-27746535)
chr8 (167-348)||(14632975-14633156)
chr8 (154-348)||(4698722-4698916)
chr8 (144-348)||(18532105-18532300)
chr8 (149-347)||(264400-264597)
chr8 (149-347)||(651324-651521)
chr8 (149-347)||(837059-837256)
chr8 (201-347)||(6953008-6953153)
chr8 (169-347)||(20469940-20470117)
chr8 (144-334)||(28088284-28088474)
chr8 (146-348)||(28964033-28964234)
chr8 (142-328)||(21667546-21667731)
chr8 (144-348)||(24018380-24018585)
chr8 (144-340)||(26168856-26169051)
chr8 (144-347)||(2166695-2166897)
chr8 (165-348)||(34610686-34610869)
chr8 (199-347)||(10292108-10292255)
chr8 (144-346)||(7557952-7558146)
chr8 (143-306)||(24999239-24999394)
chr8 (145-347)||(18128512-18128714)
chr8 (204-347)||(25248407-25248547)
chr8 (259-348)||(2639410-2639499)
chr8 (147-348)||(34694574-34694776)
chr8 (206-348)||(1219409-1219551)
chr8 (147-347)||(34639208-34639406)
chr8 (148-334)||(28908823-28909011)
chr8 (147-340)||(36848757-36848949)
chr8 (152-260)||(41070767-41070874)
chr8 (142-347)||(3403502-3403707)
chr8 (163-348)||(9047278-9047462)
chr8 (167-318)||(13749077-13749228)
chr8 (147-348)||(8042655-8042844)
chr8 (148-348)||(22200559-22200758)
chr8 (147-257)||(8387535-8387644)
chr8 (147-260)||(3794792-3794904)
chr8 (208-348)||(33746944-33747084)
chr8 (156-253)||(11714914-11715010)
chr8 (261-334)||(43817762-43817835)
chr8 (208-348)||(26261846-26261986)
chr8 (144-190)||(775938-775984)
chr8 (144-190)||(781592-781638)
chr8 (301-347)||(9713609-9713655)
chr8 (154-244)||(16852349-16852442)
chr8 (142-345)||(24339625-24339829)
chr8 (200-245)||(29858022-29858067)
chr8 (250-347)||(42332012-42332108)
chr8 (204-347)||(13579903-13580046)
chr8 (144-191)||(7373482-7373529)
chr8 (148-219)||(39317022-39317093)
chr8 (286-348)||(33534566-33534628)
chr8 (169-245)||(968388-968465)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (147-348)||(8484660-8484861)
chr5 (143-347)||(11926501-11926706)
chr5 (142-348)||(15641105-15641310)
chr5 (142-348)||(32059439-32059645)
chr5 (143-348)||(27498730-27498935)
chr5 (144-348)||(38684202-38684405)
chr5 (144-348)||(30485822-30486026)
chr5 (144-347)||(34310136-34310339)
chr5 (167-348)||(19456210-19456389)
chr5 (144-348)||(7085625-7085829)
chr5 (169-348)||(18207226-18207405)
chr5 (143-348)||(33709502-33709704)
chr5 (144-348)||(31287945-31288149)
chr5 (147-348)||(4603774-4603975)
chr5 (143-339)||(13038463-13038658)
chr5 (143-339)||(13108458-13108653)
chr5 (143-342)||(11464913-11465111)
chr5 (154-347)||(6014280-6014473)
chr5 (144-347)||(23270522-23270725)
chr5 (162-348)||(37495059-37495252)
chr5 (147-347)||(27487554-27487755)
chr5 (144-348)||(22392695-22392886)
chr5 (152-348)||(10869564-10869760)
chr5 (144-284)||(25586926-25587066)
chr5 (148-348)||(26009263-26009463)
chr5 (148-318)||(15971151-15971321)
chr5 (146-347)||(19145412-19145612)
chr5 (167-348)||(12398447-12398628)
chr5 (145-339)||(36954813-36955007)
chr5 (144-303)||(15931053-15931211)
chr5 (143-333)||(42193478-42193666)
chr5 (147-348)||(38630978-38631161)
chr5 (147-347)||(10399770-10399971)
chr5 (147-347)||(25750613-25750811)
chr5 (144-347)||(34049816-34050008)
chr5 (143-348)||(21236361-21236566)
chr5 (144-347)||(5049131-5049333)
chr5 (144-348)||(12317154-12317353)
chr5 (225-348)||(35425088-35425211)
chr5 (143-261)||(1827616-1827734)
chr5 (229-347)||(9659311-9659429)
chr5 (253-348)||(41351103-41351197)
chr5 (130-347)||(28614486-28614700)
chr5 (144-318)||(15485320-15485495)
chr5 (269-347)||(22693054-22693132)
chr5 (147-347)||(22253144-22253345)
chr5 (233-347)||(13659245-13659359)
chr5 (147-347)||(930486-930685)
chr5 (163-347)||(36895438-36895622)
chr5 (167-258)||(7151346-7151437)
chr5 (144-240)||(37397707-37397803)
chr5 (144-234)||(5067295-5067385)
chr5 (201-348)||(31206293-31206441)
chr5 (202-347)||(24158166-24158311)
chr5 (204-347)||(10813851-10813994)
chr5 (167-346)||(17015420-17015593)
chr5 (296-348)||(10631288-10631340)
chr5 (143-274)||(33025473-33025605)
chr5 (148-234)||(14302812-14302898)
chr5 (167-342)||(3639788-3639962)
chr5 (144-201)||(3715055-3715112)
chr5 (281-334)||(5067392-5067445)
chr5 (259-348)||(8821093-8821182)
chr5 (149-332)||(2499193-2499376)
chr5 (264-348)||(25548533-25548617)
chr5 (204-348)||(41568868-41569011)
chr5 (250-348)||(21377248-21377346)
chr5 (145-242)||(40330628-40330725)
chr5 (148-193)||(42006791-42006836)
chr5 (169-244)||(21589314-21589390)
chr5 (210-245)||(12647791-12647826)
chr5 (286-329)||(20508849-20508892)
chr5 (143-217)||(16616112-16616186)
chr5 (143-193)||(21042679-21042729)
chr5 (150-193)||(204178-204221)
chr5 (284-347)||(7151437-7151500)
chr5 (168-318)||(16247030-16247180)
chr5 (273-348)||(37972906-37972981)
chr5 (286-348)||(33737878-33737939)
chr5 (200-245)||(16773865-16773910)
chr5 (169-245)||(29075807-29075884)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (144-348)||(4621236-4621440)
chr1 (143-347)||(24674386-24674590)
chr1 (143-347)||(24122016-24122220)
chr1 (144-348)||(15059401-15059605)
chr1 (143-348)||(7766726-7766931)
chr1 (143-345)||(8077640-8077841)
chr1 (143-348)||(27454863-27455070)
chr1 (144-347)||(7197247-7197449)
chr1 (162-348)||(7578421-7578607)
chr1 (144-348)||(46607804-46608008)
chr1 (163-346)||(17935782-17935965)
chr1 (144-348)||(30677170-30677374)
chr1 (144-346)||(34778336-34778535)
chr1 (168-347)||(45859043-45859222)
chr1 (169-347)||(9500355-9500533)
chr1 (143-348)||(23734109-23734315)
chr1 (143-348)||(23741301-23741507)
chr1 (144-348)||(32729539-32729742)
chr1 (143-342)||(18646846-18647045)
chr1 (144-318)||(168195-168369)
chr1 (143-318)||(7946837-7947011)
chr1 (143-342)||(21726722-21726921)
chr1 (144-343)||(1378892-1379090)
chr1 (167-348)||(33905509-33905690)
chr1 (174-347)||(36155888-36156061)
chr1 (148-348)||(2272342-2272542)
chr1 (163-339)||(8779744-8779920)
chr1 (144-308)||(23232300-23232468)
chr1 (198-348)||(8254751-8254901)
chr1 (150-342)||(32930749-32930941)
chr1 (165-346)||(37351454-37351643)
chr1 (143-347)||(18533724-18533928)
chr1 (144-312)||(29057373-29057540)
chr1 (145-347)||(1486415-1486617)
chr1 (149-254)||(46113495-46113600)
chr1 (143-347)||(40802069-40802271)
chr1 (143-318)||(2537697-2537861)
chr1 (144-240)||(20487297-20487393)
chr1 (222-347)||(45331621-45331747)
chr1 (146-335)||(16899507-16899688)
chr1 (250-347)||(26513148-26513244)
chr1 (149-339)||(40145889-40146079)
chr1 (254-348)||(22909975-22910069)
chr1 (251-348)||(48699859-48699957)
chr1 (167-347)||(16539625-16539804)
chr1 (144-308)||(25237028-25237192)
chr1 (154-347)||(26820196-26820384)
chr1 (144-236)||(14258538-14258630)
chr1 (145-241)||(24216973-24217069)
chr1 (149-318)||(1095033-1095193)
chr1 (249-318)||(12876965-12877034)
chr1 (143-318)||(1138572-1138746)
chr1 (154-318)||(37046994-37047160)
chr1 (147-347)||(52135127-52135323)
chr1 (143-347)||(809215-809419)
chr1 (148-238)||(1378743-1378833)
chr1 (145-347)||(9926146-9926350)
chr1 (143-311)||(25496528-25496692)
chr1 (164-260)||(19034474-19034569)
chr1 (146-221)||(1818730-1818805)
chr1 (168-259)||(39964530-39964621)
chr1 (265-347)||(50202661-50202742)
chr1 (168-348)||(39714649-39714829)
chr1 (168-314)||(19480552-19480700)
chr1 (214-348)||(27159150-27159283)
chr1 (249-347)||(1818808-1818905)
chr1 (142-347)||(31162742-31162947)
chr1 (278-347)||(23041650-23041719)
chr1 (144-193)||(47091684-47091733)
chr1 (148-311)||(17447272-17447434)
chr1 (301-348)||(14603947-14603994)
chr1 (280-347)||(35138118-35138185)
chr1 (297-347)||(5315478-5315528)
chr1 (271-347)||(6776201-6776277)
chr1 (177-318)||(20999192-20999333)
chr1 (142-347)||(37349515-37349719)
chr1 (144-193)||(6776139-6776187)
chr1 (145-305)||(10059050-10059210)
chr1 (169-245)||(31383771-31383848)
chr1 (143-252)||(36476851-36476960)
chr1 (154-234)||(15786304-15786387)
chr1 (168-244)||(39012316-39012392)
chr1 (143-191)||(43770120-43770168)
chr1 (201-260)||(20907349-20907407)
chr1 (147-193)||(52592557-52592603)
chr1 (271-308)||(47091742-47091779)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (144-348)||(5081-5285)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (144-348)||(15360097-15360301)
chr6 (143-348)||(34147339-34147544)
chr6 (143-348)||(34159955-34160160)
chr6 (144-346)||(9238969-9239171)
chr6 (150-347)||(11448871-11449068)
chr6 (144-347)||(654146-654349)
chr6 (143-348)||(3222635-3222838)
chr6 (146-348)||(21982320-21982521)
chr6 (143-348)||(21148510-21148714)
chr6 (144-347)||(5360071-5360274)
chr6 (147-348)||(1344934-1345133)
chr6 (147-348)||(9843935-9844136)
chr6 (143-348)||(11007158-11007363)
chr6 (144-348)||(17081053-17081257)
chr6 (143-347)||(28672060-28672264)
chr6 (142-347)||(9208244-9208449)
chr6 (152-347)||(9690638-9690833)
chr6 (190-325)||(12390465-12390600)
chr6 (144-279)||(12591631-12591766)
chr6 (143-348)||(14212885-14213080)
chr6 (164-347)||(11840915-11841097)
chr6 (142-347)||(33499466-33499672)
chr6 (144-334)||(33718482-33718661)
chr6 (144-256)||(13753234-13753346)
chr6 (166-345)||(17149458-17149637)
chr6 (142-233)||(22576059-22576150)
chr6 (149-345)||(10377714-10377911)
chr6 (167-311)||(28968078-28968222)
chr6 (248-347)||(15730495-15730594)
chr6 (165-348)||(17706318-17706489)
chr6 (146-242)||(8479308-8479404)
chr6 (144-308)||(31039014-31039177)
chr6 (259-347)||(14504082-14504170)
chr6 (261-348)||(21903618-21903706)
chr6 (168-292)||(6383930-6384053)
chr6 (145-260)||(17420860-17420975)
chr6 (149-242)||(21182325-21182418)
chr6 (282-338)||(27866212-27866268)
chr6 (285-318)||(32596211-32596244)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (144-348)||(40058851-40059055)
chr4 (144-346)||(52983613-52983815)
chr4 (144-348)||(34844757-34844961)
chr4 (144-348)||(27528794-27528998)
chr4 (144-348)||(32986191-32986395)
chr4 (144-348)||(46714386-46714591)
chr4 (477-764)||(9811628-9811904)
chr4 (144-348)||(5609201-5609405)
chr4 (143-347)||(33696279-33696483)
chr4 (144-348)||(54127341-54127545)
chr4 (143-348)||(19660531-19660736)
chr4 (147-347)||(20566346-20566547)
chr4 (144-347)||(25852208-25852412)
chr4 (148-348)||(45787703-45787902)
chr4 (168-345)||(20077986-20078163)
chr4 (143-348)||(44343506-44343712)
chr4 (203-348)||(32990488-32990633)
chr4 (143-348)||(36131509-36131714)
chr4 (199-347)||(34723848-34723996)
chr4 (145-325)||(13873317-13873497)
chr4 (144-347)||(1985830-1986031)
chr4 (149-332)||(32942369-32942552)
chr4 (154-347)||(35229172-35229365)
chr4 (144-347)||(35674749-35674944)
chr4 (148-347)||(51535611-51535818)
chr4 (144-293)||(33992620-33992769)
chr4 (147-346)||(13550205-13550404)
chr4 (164-347)||(49287872-49288054)
chr4 (475-612)||(9805928-9806064)
chr4 (143-348)||(18875516-18875720)
chr4 (144-311)||(22625097-22625273)
chr4 (148-347)||(34835527-34835726)
chr4 (201-334)||(9517654-9517787)
chr4 (167-348)||(7391964-7392143)
chr4 (147-348)||(13584253-13584454)
chr4 (150-348)||(55961753-55961939)
chr4 (188-348)||(27574356-27574516)
chr4 (195-348)||(21387486-21387637)
chr4 (174-347)||(12500059-12500231)
chr4 (144-347)||(13771482-13771686)
chr4 (168-346)||(20527035-20527212)
chr4 (154-348)||(4911926-4912124)
chr4 (148-258)||(43719154-43719264)
chr4 (157-277)||(2351020-2351140)
chr4 (167-348)||(30879165-30879345)
chr4 (228-348)||(53787056-53787177)
chr4 (150-346)||(25969504-25969700)
chr4 (229-348)||(22488027-22488146)
chr4 (149-346)||(9646217-9646414)
chr4 (517-671)||(9798739-9798886)
chr4 (162-346)||(12710191-12710373)
chr4 (214-347)||(12824464-12824597)
chr4 (143-260)||(41621684-41621800)
chr4 (369-446)||(9805773-9805852)
chr4 (223-347)||(51595095-51595219)
chr4 (284-347)||(23639758-23639821)
chr4 (284-347)||(23645416-23645479)
chr4 (285-347)||(52494623-52494685)
chr4 (281-347)||(55158343-55158409)
chr4 (148-221)||(42245744-42245817)
chr4 (271-347)||(4064981-4065057)
chr4 (271-347)||(9978509-9978585)
chr4 (223-290)||(29875832-29875899)
chr4 (144-202)||(34722164-34722222)
chr4 (147-347)||(40252295-40252486)
chr4 (279-348)||(43719086-43719155)
chr4 (273-348)||(13017836-13017910)
chr4 (201-347)||(28929730-28929876)
chr4 (286-348)||(23131435-23131497)
chr4 (255-328)||(4585732-4585803)
chr4 (475-550)||(9785624-9785696)
chr4 (202-304)||(10125872-10125973)
chr4 (225-347)||(13716450-13716572)
chr4 (168-284)||(37455594-37455710)
chr4 (169-234)||(38869794-38869860)
chr4 (283-348)||(8442049-8442114)
chr4 (147-260)||(17415678-17415790)
chr4 (286-347)||(17637852-17637912)
chr4 (201-242)||(22630291-22630332)
chr4 (173-245)||(28635726-28635799)
chr4 (149-348)||(28791113-28791312)
chr4 (286-347)||(33289190-33289251)
chr4 (286-347)||(37302623-37302684)
chr4 (151-232)||(43352439-43352520)
chr4 (151-223)||(31334545-31334617)
chr4 (148-240)||(45302837-45302929)
chr4 (166-253)||(13017745-13017831)
chr4 (204-346)||(24273276-24273418)
chr4 (201-240)||(38740901-38740940)
chr4 (208-279)||(39288917-39288987)
chr4 (169-245)||(7949427-7949504)
chr4 (143-240)||(40307535-40307631)
chr4 (261-346)||(41621583-41621668)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (144-348)||(40319-40522)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (144-347)||(7309-7512)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (148-348)||(9299-9498)
scaffold0366 (148-329)||(12019-12199)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (148-347)||(1057-1255)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (169-348)||(161828-162007)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (145-348)||(52870-53073)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (144-347)||(97366-97569)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (143-348)||(41644-41848)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (148-348)||(10694-10892)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (144-334)||(14985-15174)
scaffold0328 (209-347)||(13047-13182)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (144-347)||(66756-66951)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (189-348)||(39131-39290)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (204-348)||(32342-32485)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (155-304)||(1-150)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (174-347)||(20246-20418)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (142-242)||(8512-8612)
scaffold0199 (285-347)||(8451-8513)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (144-346)||(27770-27966)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (238-347)||(2426-2535)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (144-240)||(8286-8382)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (149-347)||(29143-29340)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (144-240)||(26650-26746)
scaffold0200 (295-340)||(26609-26654)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (143-217)||(12884-12958)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (281-347)||(123066-123131)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (154-245)||(15296-15390)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (251-348)||(11419-11517)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (206-312)||(72561-72670)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40543113 - 40542909
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40543113 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 40543014  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40543013 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 40542914  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  40542913 ttttc 40542909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120090
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 22120089  T
Q  348 c 348  Q
    |    
T  22120090 c 22120090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 7275275 - 7275478
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7275275 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7275374  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7275375 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 7275474  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  7275475 tttt 7275478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 2751269 - 2751473
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2751269 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 2751368  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2751369 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 2751468  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  2751469 ttttc 2751473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7176065 - 7175861
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7176065 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7175966  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  7175965 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgag 7175866  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  7175865 ttttc 7175861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 18044104 - 18044308
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18044104 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggc 18044203  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18044204 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 18044303  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  18044304 gtttt 18044308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 21835152 - 21835353
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21835152 ccatttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 21835251  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21835252 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 21835351  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  21835352 tc 21835353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 10091185 - 10091389
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10091185 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 10091284  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  10091285 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt-gatccgataccga 10091383  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  10091384 gttttc 10091389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 11997847 - 11998051
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11997847 aacccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggct 11997946  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11997947 aagtccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgag 11998046  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  11998047 ttttc 11998051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21218036 - 21217832
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21218036 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 21217937  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  21217936 aagtccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggataccgag 21217837  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  21217836 ttttc 21217832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17197154 - 17196950
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17197154 taacccatttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagc 17197055  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17197054 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 17196955  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  17196954 gtttt 17196950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 2103054 - 2103255
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2103054 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggcta 2103153  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  2103154 agtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-gatcggataccgagt 2103251  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  2103252 tttc 2103255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 348
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703688
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggatacccagttttc 22703688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 333
Target Start/End: Original strand, 17212051 - 17212240
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  17212051 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 17212150  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatc 333  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17212151 aagtccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatc 17212240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 27009356 - 27009561
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27009356 taacccatttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 27009455  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgc-aagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  27009456 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccg 27009555  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  27009556 agtttt 27009561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23012707 - 23012507
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23012707 catttagggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 23012608  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||| ||||||||||||    
T  23012607 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggataccgagtttt 23012508  T
Q  348 c 348  Q
    |    
T  23012507 c 23012507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 27312149 - 27312354
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  27312149 taacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgc 27312248  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
     |||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27312249 caagtccatacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 27312348  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  27312349 gttttc 27312354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 2344297 - 2344501
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  2344297 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggct 2344396  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  2344397 aagtccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgag 2344496  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  2344497 ttttc 2344501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42913716 - 42913512
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| |    
T  42913716 aacccattttcggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggat 42913617  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  42913616 aagtccatacggaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggataccgag 42913517  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  42913516 ttttc 42913512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 28089817 - 28090021
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28089817 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 28089916  T
Q  247 ttcataca----gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    | ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28089917 tccatacaaagtgagcttgctctggctttaaa-tgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 28090015  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  28090016 gttttc 28090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654704
Alignment:
Q  188 tttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgca 287  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccgca 654765  T
Q  288 agtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  654764 agtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccgagttttc 654704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 31197589 - 31197792
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||||||||  |    
T  31197589 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggatt 31197687  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31197688 aagtccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgag 31197787  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  31197788 ttttc 31197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Original strand, 19421230 - 19421431
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||    
T  19421230 acccatttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggcta 19421329  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  19421330 agtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagataccgagt 19421429  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  19421430 tt 19421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 22638290 - 22638488
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  22638290 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 22638389  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22638390 aagtt----cagagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggataccgag 22638485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Original strand, 27704004 - 27704202
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27704004 catttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagt 27704103  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  27704104 ccatagagagcttgctttggctttaaa-tggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagataccgagtttt 27704202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 198 - 348
Target Start/End: Original strand, 29861722 - 29861872
Alignment:
Q  198 cagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29861722 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 29861821  T
Q  298 gggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29861822 gggattgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttttc 29861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951072
Alignment:
Q  155 ggttggtctagtggttggcttgggatcttggagt---ttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  252 acagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||| ||||||||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggataccgagtttt 28951072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39145856 - 39145652
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39145856 taacccatttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggc 39145757  T
Q  243 taagttcat-acagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||     
T  39145756 taagtcaataacagagcttgctctggctttaaac-gggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagatacca 39145658  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  39145657 agtttt 39145652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Original strand, 9683827 - 9684026
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9683827 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 9683926  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9683927 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcgattaccgagttt 9684026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 348
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374196
Alignment:
Q  186 agtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccg 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 16374196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 32849589 - 32849791
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| ||||||||    
T  32849589 aacccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggct 32849688  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32849689 aagtccacactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgag 32849788  T
Q  344 ttt 346  Q
    |||    
T  32849789 ttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 168 - 348
Target Start/End: Original strand, 31273936 - 31274115
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctgg 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31273936 gttgacttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctgg 31274035  T
Q  268 ctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  31274036 ctttaaacgggg-ctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggataccgagttttc 31274115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907514
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 41907514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43785502 - 43785298
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||| |||| ||    
T  43785502 aacccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggact 43785403  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  43785402 aagtccatacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggataccgag 43785303  T
Q  344 ttttc 348  Q
     ||||    
T  43785302 ctttc 43785298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 348
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092298
Alignment:
Q  217 tccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggat 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  317 tactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23092267 tagtcgattcatggatcggataccgagttttc 23092298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9718187 - 9717986
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  9718187 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 9718088  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  9718087 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttgaatcgaatactgagttt 9717988  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  9717987 tc 9717986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13332622 - 13332480
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13332622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 13332523  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgg 292  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  13332522 ccatacagagcttactctggctttaaacagg--ccccgcaagtgg 13332480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31713098 - 31712902
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||        | |    
T  31713098 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gat 31713006  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31713005 aagtccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 31712906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 178 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772303
Alignment:
Q  178 gatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 277  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  278 ggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggataccgagtttt 36772303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 3851840 - 3851958
Alignment:
Q  229 caatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3851840 caatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 3851939  T
Q  329 ggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  3851940 ggatcggataccgagtttt 3851958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7800034 - 7799900
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  7800034 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggtta 7799935  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg 279  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  7799934 agtccatagagagcttgctatggctttaaatgggg 7799900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 28646967 - 28647170
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28646967 aacctatttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc- 28647065  T
Q  244 aagttcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  | ||||||||| ||| |||    
T  28647066 aagtcaatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggatatcga 28647165  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  28647166 gtttt 28647170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21574305 - 21574101
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccc-tttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  21574305 acccatttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggc- 21574207  T
Q  244 aagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||  |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  21574206 aagtccatacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccga 21574107  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  21574106 gttttc 21574101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23330941 - 23330738
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||   ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  23330941 acccatttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-a 23330843  T
Q  245 agttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||||||    
T  23330842 agtccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggataccgag 23330743  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  23330742 ttttc 23330738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 25333417 - 25333603
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |    
T  25333417 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttgggtt 25333516  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||                ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  25333517 aa----------------ctctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga-accgag 25333599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14199848 - 14199713
Alignment:
Q  165 gtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctc 264  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  14199848 gtggttgatttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctc 14199749  T
Q  265 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggga 301  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14199748 tgcctttaaacgggg-ccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643342
Alignment:
Q  174 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| || | | |||||||| | |||||||| ||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  274 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagataccaagtttt 22643342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 22696317 - 22696522
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  22696317 taactcattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg- 22696415  T
Q  243 taagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccc--cgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
      | | |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  22696416 -gactccatacagagctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcggtccttggatcggatac 22696514  T
Q  340 cgagtttt 347  Q
    ||||||||    
T  22696515 cgagtttt 22696522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 274
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814992
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaa 274  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  42814967 catacaaagcttgctctgactttaaa 42814992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Original strand, 22299865 - 22299946
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22299865 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 22299946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 324
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373888
Alignment:
Q  225 gtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtcgat 21373888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 23854394 - 23854468
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattc 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23854394 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8435895 - 8435741
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8435895 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggc-aag 8435797  T
Q  247 ttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    | |||||| ||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  8435796 tccatacaaagctttgttttggctttaa--tgggcccccgcaagtgggcagtgggatt 8435741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 243
Target Start/End: Original strand, 40332097 - 40332196
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  40332097 aacccatttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatgggct 40332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Original strand, 21370595 - 21370672
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  21370595 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccct 21370672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33137948 - 33137825
Alignment:
Q  223 tggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcg 322  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  33137948 tggtgtcaattttagtgggctaagtccatacagagctcgctctagctttaaatgggg-ccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagtcg 33137850  T
Q  323 attcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  33137849 attcttagatcggatatcgagtttt 33137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38864650 - 38864446
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  38864650 taactcatttggggttgacctagtggttgacttgagatctttgagtttgtttttccagaagtctcacgtttgattccttttagtgccaatttcggtggac 38864551  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
     ||||  |    |||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||  ||||  |||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||| |||    
T  38864550 caagtgtaccgcgagcttgctctgactttaaacggaatccctgcaaatggacggtgatattggtcctctcgaattagtcaattcttggatcggatatcga 38864451  T
Q  343 gtttt 347  Q
     ||||    
T  38864450 atttt 38864446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 9769585 - 9769786
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||   | || || |||| ||||| || || || ||||||| |||||| |    
T  9769585 acccatttggggttgggctaatggttgatttggaatcttggagtgtgctcctctcaatgtttcgggtttgattctctctgatgtcaatttcagtgggc-a 9769683  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |||| ||| | |||| | ||||||||||||    
T  9769684 agttcattcagagcttgttctgtcttagaacggggcccccgcaaatgac-ggtgggattggtccccttgaattagtcggtccttgaaccgaataccgagt 9769782  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  9769783 tttc 9769786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3950988 - 3950788
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttg-ggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||   | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  3950988 catttggggttggtctagtggttggcttgagaatcttggagcgtgctcctctcaatgtctcatgttcgattccctttggtgctaattttggtggac-aag 3950890  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||| || | |||  | |||||||||||| |||| ||||| |||| | ||| ||||| |||||||  | || ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3950889 tccatgcataactttgtttggctttaaacgaggcctccgcatgtggctagtgagattgatcccctcaaaatagtcggttattggatcggatacctagttt 3950790  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  3950789 tc 3950788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 28003838 - 28003902
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggtt 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  28003838 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1766286 - 1766149
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  1766286 tctcaagttcgattcccttttgtgtcaatttcggtggg-taagtccatacagaactttgccttggcttagaacggggcccca-caagtgggcggttggat 1766189  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||    
T  1766188 tggtcccctcggattagtcggtacttgaatcggataccga 1766149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8943500 - 8943409
Alignment:
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccc-gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  8943500 catacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggatac 8943409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12211735 - 12211625
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||   || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  12211735 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aag 12211637  T
Q  247 ttcatacagagc 258  Q
    | ||||||||||    
T  12211636 tccatacagagc 12211625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 346
Target Start/End: Original strand, 35476403 - 35476541
Alignment:
Q  208 aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggt 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||| ||   ||||| ||||||    
T  35476403 aggttcgattctctttggtgccaattttggtggg-taagttcatacagagctttgctctggcttagaacgggacccctgcaaatgaccggtggaattggt 35476501  T
Q  307 cccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||| |||||| ||| |  || ||||| |||||||||||    
T  35476502 ctccttggattagtcggtctttagatcggataccgagttt 35476541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491744
Alignment:
Q  214 gattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc 283  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgctttggctttaaacggtgcccc 6491744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25102895 - 25102809
Alignment:
Q  260 tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25102895 tgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgac-ggtgggattggttccttcggattagtcgattcttggatcagataccgattttt 25102809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Original strand, 1469114 - 1469250
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  1469114 catttggggttggcctagtggttgacttgaaatcttggagtttgttcatctcaaggtctcaggttcgatttcctttaatgccaatttcgatgggc-aagt 1469212  T
Q  248 tcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggccccc 284  Q
     |||||| ||| || || |||||||||| | |||||||    
T  1469213 ccatacaaagctttactttggctttaaatgaggccccc 1469250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 339
Target Start/End: Original strand, 36173036 - 36173229
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||    
T  36173036 ccatttggggttggccttatgattgacttgggattttggagtttgttcatctcaaggtttcaggttcgattccctcttgtgccaattttggtgggc-aag 36173134  T
Q  247 ttcatacagagct-tgctctggctttaaacggg-gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    | |||||||||||  ||||| | || ||| |||  |||||| |||| || | |||||||||||| |||| |||| || |||||| |||| |||||    
T  36173135 tccatacagagctaagctcttgtttaaaatgggcccccccgtaagttggcgctgggattggtcctctcgaattagtcaattcttcgatcaaatac 36173229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 47541382 - 47541571
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||| |||   |||| | | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |     
T  47541382 aacctatttgggattggcctaatggttggtttcagatcttggagtgtgctcctctcaaggttttaagtttgattctctttggtgtcaatttcggtggac- 47541480  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    |||||||| |||   ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||    
T  47541481 aagttcatccaggctttgctttggcttagaacgggccccccgcaagtggacagtggaattggtccccttagattagtcgatccttagatcg 47541571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3951190 - 3951095
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggctt-gggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||   | ||||| |||||| ||  || || ||| |||||||||||||    
T  3951190 catttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcgggttcgcttttctctgatgctaatttcggtgggc 3951095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22264705 - 22264622
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtg 227  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22264705 aacccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 37056217 - 37056393
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||   |||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||     
T  37056217 atttggggttgatttagtggttggtttgtgatcttggagtgtgctcctctcaaggtttgagattcgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aagtc 37056315  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    ||||||      ||||||||||  |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||| | |||||||||    
T  37056316 cataca------gctctggcttagaacgggg--cccgcaagtgggctgtgggattggtcccatcgaatcagtcggtccttggatcg 37056393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Original strand, 40332193 - 40332243
Alignment:
Q  266 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggat 316  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40332193 ggctttagacggggcctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggat 40332243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Original strand, 577681 - 577726
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  577681 catttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgct 577726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29385794 - 29385717
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29385794 gttggcttgggactttggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggtttgattctctttggtgccaatttgggtgggcta 29385717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48125241 - 48125149
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||  |   |||||||||||||||||||||    
T  48125241 gggttggtctggtggtgttggcttgggaccttggagtgtgctcctccgaaggtctcaggttcaattttccccggtgccaatttcggtgggcta 48125149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37693764 - 37693692
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgatt 217  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||||||||    
T  37693764 acccatttgggtttagtctagttgttggtttgggatcttggagtgtgctcctcttaatgtctcaggttcgatt 37693692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 348
Target Start/End: Original strand, 22299958 - 22300004
Alignment:
Q  302 ttggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22299958 ttggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 22300004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23636687 - 23636594
Alignment:
Q  225 gtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |  ||||||||||| |  |||||||||    
T  23636687 gtgccaatttcggtgggtta-gtccatatagagctttgctctggctttaaatggggccctcacaagtagacggtgggattggacttctcggatta 23636594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30345561 - 30345511
Alignment:
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30345561 ggtgggattggtcccctcgggttagtcggttcttagatcggataccgagtt 30345511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35173190 - 35173132
Alignment:
Q  189 ttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  35173190 ttgctcctccaaaggtctcaggtttgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 35173132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Original strand, 3771267 - 3771344
Alignment:
Q  270 ttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3771267 ttaaatgggacctccgcaaatggatggtgggattggtctcctcgaaatagttgattcttggatcgaatatcaagtttt 3771344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 5934147 - 5934224
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  5934147 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctccttgaggtttcatgttcgattccctctggtgtcaatttaggtggactaa 5934224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11910100 - 11909972
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgg 299  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||| |||||| ||||| | |||| |||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||  |||||||  |||||    
T  11910100 aggtctcaggttcaattttctctggtgtcaattttggtggtc-aagtccatacgaagctttgttctagctttaaacgaggcccctacaagtggacggtgg 11910002  T
Q  300 gattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  11910001 gattggtcctctcgaattagtcgatccttg 11909972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33137998 - 33137950
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  33137998 aacccatttggggttggcctagt-gttggcttgggaatttggagtttgct 33137950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43617389 - 43617356
Alignment:
Q  278 ggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43617389 ggcccccgcaagtgggtggtggaattggtcccct 43617356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 35492904 - 35493108
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35492904 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 35493003  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35493004 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattgaataccga 35493103  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  35493104 gtttt 35493108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 46576341 - 46576546
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46576341 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggc 46576440  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46576441 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccga 46576540  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  46576541 gttttc 46576546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8456353 - 8456149
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8456353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 8456254  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  8456253 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgag 8456154  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  8456153 ttttc 8456149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25289917 - 25289714
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25289917 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 25289818  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25289817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgag 25289719  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  25289718 ttttc 25289714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30807359 - 30807152
Alignment:
Q  141 gataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30807359 gataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 30807260  T
Q  241 gctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30807259 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggatac 30807161  T
Q  340 cgagttttc 348  Q
    |||||||||    
T  30807160 cgagttttc 30807152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40133652 - 40133448
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40133652 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggct 40133553  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40133552 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgag 40133453  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  40133452 ttttc 40133448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49258466 - 49258262
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  49258466 taacccatttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc 49258367  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49258366 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 49258267  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  49258266 gtttt 49258262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53424377 - 53424176
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53424377 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 53424278  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53424277 gtccatacagagtttgctatggctttaaac-gggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 53424179  T
Q  346 ttc 348  Q
    |||    
T  53424178 ttc 53424176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 40940818 - 40941023
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40940818 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggac 40940917  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  40940918 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagataccga 40941017  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  40941018 gttttc 40941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 21362936 - 21363140
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  21362936 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggc 21363035  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21363036 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggataccga 21363135  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  21363136 gtttt 21363140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 30257618 - 30257822
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30257618 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggact 30257717  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  30257718 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgaa 30257817  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  30257818 ttttc 30257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45529957 - 45529754
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  45529957 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggct 45529858  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  45529857 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgag 45529759  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  45529758 ttttc 45529754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45272620 - 45272415
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45272620 taacccatttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 45272521  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||    
T  45272520 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggataccga 45272421  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  45272420 gttttc 45272415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 149 - 346
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379957
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||     
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgagttt 25379957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 151 - 348
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174311
Alignment:
Q  151 ttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttca 250  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  251 tacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 26174311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15566701 - 15566499
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15566701 aacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 15566603  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15566602 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgag 15566504  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  15566503 ttttc 15566499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 48977382 - 48977586
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  48977382 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggtt 48977481  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  48977482 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgag 48977581  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  48977582 ttttc 48977586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18177090 - 18176887
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18177090 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggact 18176991  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  18176990 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggatacagag 18176891  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  18176890 tttt 18176887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821636
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacgggg-ccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 52821636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34492778 - 34492575
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  34492778 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggct 34492679  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  34492678 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgataccgag 34492579  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  34492578 tttt 34492575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52455851 - 52455648
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  52455851 acccatttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggcta 52455752  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  52455751 agtctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagt 52455652  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  52455651 tttc 52455648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233910
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 53233910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190741
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10190741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 172 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39042027 - 39041852
Alignment:
Q  172 gcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggcttt 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39042027 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggcttt 39041928  T
Q  272 aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39041927 aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 39041852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083818
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10083818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 32151418 - 32151621
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  32151418 taacccatttggg-ttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggc 32151516  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32151517 taagctcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 32151616  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  32151617 gtttt 32151621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31538041 - 31537838
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31538041 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggct 31537942  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  31537941 aagtctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggatatcgag 31537842  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  31537841 tttt 31537838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 303
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  157 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacaga 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  257 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25344257 - 25344057
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  25344257 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaag 25344158  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25344157 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcgaataccgagttt 25344059  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  25344058 tc 25344057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7470418 - 7470245
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  7470418 aacccatttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 7470319  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  7470318 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-ccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagatta 7470245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7485728 - 7485531
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7485728 aacccatttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 7485629  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7485628 aagttcat----agcttgatctggctttaaac-aggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 7485535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097278
Alignment:
Q  190 tgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaag 289  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  290 tgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 8097278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29915473 - 29915288
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  29915473 taacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggc 29915374  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  29915373 taagtacatacagagcttgccctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29964626 - 29964441
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  29964626 taacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggc 29964527  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  29964526 taagtacatacagagcttgccctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 4462626 - 4462829
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  4462626 taactcatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggc 4462725  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  4462726 taagttcatacagagcttactctagctttaaacgggg-ccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggataccga 4462824  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  4462825 gtttt 4462829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 51532783 - 51532987
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  51532783 aacccatttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggct 51532882  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||||||||    
T  51532883 aagtccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttgatccgaataccgag 51532982  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  51532983 ttttc 51532987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2511449 - 2511296
Alignment:
Q  195 ctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggt 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||     
T  2511449 ctccataggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggc 2511350  T
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  2511349 ggtgggattggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggataccaagttttc 2511296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Original strand, 19857047 - 19857230
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19857047 aacccatttggg-ttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggct 19857144  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    |||||||   ||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19857145 aagttcagttagagcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttg 19857230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398468
Alignment:
Q  174 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaa 273  Q
    ||||||||||| ||||||||  || | || ||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  274 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 33398468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693030
Alignment:
Q  179 atcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  |    
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagac-ag 1692961  T
Q  279 gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1692962 gcccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagtttt 1693030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958034
Alignment:
Q  173 cttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggcttta 272  Q
    |||||||||||||||| |||| || || |||||| | |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  273 aac-ggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagataccgagttttc 8958034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407458
Alignment:
Q  198 cagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggt 297  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  298 gggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 24407458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390800
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||  | ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgagttttc 11390800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 55371489 - 55371302
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  55371489 taacctatttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac 55371390  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
     |||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  55371389 -aagttcata--------gctctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggatac 55371302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53288912 - 53288713
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53288912 ccattttgcgttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaag 53288813  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||| |||||    
T  53288812 tccatacaaagcttgctttggctttaaacgggg-ccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggttaccaagttt 53288714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 333
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167242
Alignment:
Q  164 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc---tt 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||   ||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtggactaagtccatacatagcgtttt 49167169  T
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatc 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||| ||| ||||||    
T  49167170 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggtggtggggttggttcccttgaattagtcggttcatggatc 49167242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Original strand, 26158810 - 26159003
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26158810 ataactcatttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg 26158909  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
     ||||| ||||||      ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  26158910 -taagtccataca------gctctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggataccg 26159002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 244 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24165817 - 24165714
Alignment:
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24165817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 24165719  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  24165718 ttttc 24165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4252599 - 4252404
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||  |     
T  4252599 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtgatc- 4252501  T
Q  244 aagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    |||| |||||| ||| || |||||| ||  |||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  4252500 aagtccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggatac 4252404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579134
Alignment:
Q  203 gtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggccc-ccgcaagtgggtggtggga 301  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  302 ttggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcgaatatcgagttttc 17579134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Original strand, 54475780 - 54475878
Alignment:
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  54475780 catacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagataccgagtttt 54475878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 271
Target Start/End: Original strand, 38732960 - 38733087
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||    
T  38732960 aacccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggct 38733059  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggcttt 271  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38733060 gagttcatacagaggttgctctgacttt 38733087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Original strand, 55287797 - 55287914
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55287797 aacccatttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggct 55287896  T
Q  244 aagttcatacagagcttg 261  Q
    | || |||||| ||||||    
T  55287897 aggtccatacaaagcttg 55287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178368
Alignment:
Q  206 tcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattg 304  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggcccca-cacgtgggcggtgggattg 1178325  T
Q  305 gtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1178326 gtccc-tcggattagtcgaatcttggatcggataccgagttttc 1178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972714
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||   |||||||| ||||  |||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc---caagtggggggtgaaatt 48972758  T
Q  304 ggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||  ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48972757 ggtccattcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagtttt 48972714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  213 cgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacgggg-tcccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 1242134  T
Q  312 cggat 316  Q
     ||||    
T  1242135 tggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 346
Target Start/End: Original strand, 48104985 - 48105073
Alignment:
Q  258 cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48104985 cttgctctggctttaaacagggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33698804 - 33698705
Alignment:
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  33698804 catatagagtttgctctggctttaaacggggctcccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcgattctcggatcggatgccgagttttc 33698705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Original strand, 34844396 - 34844545
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctg 266  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||    
T  34844396 gttggcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggacta-gtacatacagagctttgctatg 34844494  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34844495 gctttaaatggg-cccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggatta 34844545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Original strand, 9842915 - 9843006
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  9842915 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14343478 - 14343358
Alignment:
Q  157 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacaga 256  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||  |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14343478 ttggtctattggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacaga 14343379  T
Q  257 gcttgctctggctttaaacgg 277  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  14343378 acttgctctgcctttaaacgg 14343358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848433
Alignment:
Q  280 cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 53848433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 50582986 - 50583159
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |    
T  50582986 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-t 50583084  T
Q  244 aagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||| |||||| | | ||| | || ||||||| || | ||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  50583085 aagtccatacaaaactttgatttgactttaaatggag-ccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaatta 50583159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  157 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcg 236  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50731418 - 50731237
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||   |||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||  |    
T  50731418 ctagtggttgacttgagatcttgaagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccgtt-ggtaccaatttcggtggac-aagtccatatagagca-g 50731322  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| |||  || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  50731321 ctctgacttataa-ggggcccacacaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagtttt 50731237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Original strand, 50781436 - 50781617
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||   |||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||  |    
T  50781436 ctagtggttgacttgagatcttgaagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccgtt-ggtaccaatttcggtggac-aagtccatatagagca-g 50781532  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| |||  || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  50781533 ctctgacttataa-ggggcccacacaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagtttt 50781617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 25017510 - 25017617
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  25017510 aacccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtgggct 25017608  T
Q  244 aagttcata 252  Q
    |||| ||||    
T  25017609 aagtccata 25017617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 342
Target Start/End: Original strand, 27887426 - 27887622
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||   |  || |||||| ||||||||||||    
T  27887426 catttggggttgatctagtggttggcttgagatattggagtgtgcttctctcaatgtcttaggttcgattcctccttatgtcaattttggtgggctaagt 27887525  T
Q  248 tcatacagagct-tgctctggctttaaacg-gggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
     |||||  |||| |||| || ||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  27887526 ccatacgcagctatgctttgcctttaaatgagagctcccgtaagtgggtggtaggattggtctaatcggattagtcggttcttagatcggataccga 27887622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6041871 - 6041670
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||   |||  ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||  |||||    
T  6041871 catttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagt 6041772  T
Q  248 tcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccg-caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  6041771 ccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcggttcttggatcagataccgagtt 6041672  T
Q  346 tt 347  Q
    ||    
T  6041671 tt 6041670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048147
Alignment:
Q  285 gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagtttt 4048147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017685
Alignment:
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggttcctt-ggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 25017685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747779
Alignment:
Q  299 ggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 3747779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32094841 - 32094756
Alignment:
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32094841 tctgcctttaaatggggctcccgtaagcgggtggtgggattggtcctctcatattagtcggttcttggatcggataccgagttttc 32094756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Original strand, 7195918 - 7196005
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  7195918 gctctgactttaaatgggccccccacatgtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattctttgattagataccgagttttc 7196005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 218
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660838
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattc 218  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39890693 - 39890605
Alignment:
Q  259 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | || || || |||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39890693 ttgctctggctttaaacgggacccc-gcaggaggatgatgagattggtccaatcggactagtcgattcttggatcggataccgaattttc 39890605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 14997755 - 14997807
Alignment:
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  14997755 ggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttgtatcagataccgagtttt 14997807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Original strand, 30311334 - 30311398
Alignment:
Q  171 ggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaattt 234  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30311334 ggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctttggtgccaattt 30311398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50195476 - 50195429
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctc 197  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50195476 tttggggttagcatagtggttgtcttgggatcttggagtttgcttctc 50195429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Original strand, 24703697 - 24703747
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  24703697 taactcatttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttagaatttgct 24703747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52770026 - 52769956
Alignment:
Q  176 gggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  52770026 gggatctgggagtgtgctcctccttgaggtctcaggttcgattctctttagtgtcaatttaggtgggctaa 52769956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10445189 - 10445112
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||    
T  10445189 ttggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgctaatttgagtgggctaa 10445112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Original strand, 16140292 - 16140389
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||| |||   | |||||| ||||||||  || | ||| |||||| |||||||    
T  16140292 acccatttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcctctcaaagtctcatgttcgattttctctagtgtcaattttggtgggc 16140389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 33793579 - 33793620
Alignment:
Q  277 gggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33793579 gggctcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 33793620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51391041 - 51390948
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggt 238  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   || |||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  51391041 acccatttgaggctgtcctagtggttggcttgagatcttagagtttgctcctctcaagatctcaatttcaattccctcttgtgccaatttcggt 51390948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 53863918 - 53863845
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  53863918 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcaattctctctggtgccaatttcgttggg 53863845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44946256 - 44946052
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44946256 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 44946157  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44946156 aagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 44946057  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  44946056 ttttc 44946052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11941414 - 11941210
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||     
T  11941414 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggt 11941315  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11941314 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 11941215  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  11941214 gtttt 11941210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 15037953 - 15038157
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15037953 aacccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 15038052  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15038053 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgag 15038152  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  15038153 ttttc 15038157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33827776 - 33827572
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33827776 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggct 33827677  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33827676 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgag 33827577  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  33827576 ttttc 33827572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30467034 - 30466830
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  30467034 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggc 30466935  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30466934 taagtccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccga 30466835  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  30466834 gtttt 30466830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Original strand, 24195995 - 24196200
Alignment:
Q  141 gataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24195995 gataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgg 24196094  T
Q  241 gctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||    
T  24196095 gctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggg--ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggatacc 24196192  T
Q  341 gagttttc 348  Q
    ||||||||    
T  24196193 gagttttc 24196200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 25293160 - 25293356
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25293160 aacccatttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25293259  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25293260 aagttcata--------gctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 25293351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 348
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171998
Alignment:
Q  181 cttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 35171998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44976353 - 44976172
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44976353 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagt 44976254  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  44976253 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242319
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggatacc 36242319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Original strand, 17324764 - 17324961
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17324764 catttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 17324863  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  17324864 ccatacagagcttgctctggctttaaa-tgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggatatcgagtttt 17324961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 41313985 - 41314189
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41313985 taacccatttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggc 41314084  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  41314085 taagtctatacagagcttgctctgactttaaac-gggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggataccaa 41314183  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  41314184 gttttc 41314189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374329
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||     ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43374405 gctttaa-----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 43374329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36390769 - 36390569
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36390769 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggact 36390672  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  36390671 aagtccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggataccgag 36390573  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  36390572 tttt 36390569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 27290600 - 27290772
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290600 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 27290699  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290700 ctctggctttaaacgggccccccgcaagt--------------gtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 27290772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582014
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgatt 325  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10582074 tctagctttaaac-gggccctcgcaagtggg-cgtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 10582014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4567643 - 4567428
Alignment:
Q  141 gataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4567643 gataatccatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgg 4567544  T
Q  241 gctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggg--------tggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggat 332  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        | ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4567543 gctaaatccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggat 4567444  T
Q  333 cgaataccgagttttc 348  Q
    || ||||| |||||||    
T  4567443 cggatacccagttttc 4567428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516413
Alignment:
Q  166 tggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctct 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  266 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34516494 cgctttaaacggg-cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaagttttc 34516413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330039
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||     
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggataccgagtttt 41330039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 19054021 - 19054224
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||  || |||||||||||||    
T  19054021 cccatttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaa 19054120  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacgg-ggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  19054121 gtccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagataccgagt 19054220  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  19054221 tttc 19054224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191711
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||   ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttggaccgaataccgaattttc 1191711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394215
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||| ||||||| |||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggataccgaattttc 5394215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8192553 - 8192351
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  8192553 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtgggc-a 8192455  T
Q  245 agttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||  ||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  8192454 agtccatatagagctttgctctggcttagaac-ggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgag 8192356  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  8192355 ttttc 8192351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266686
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13266607 gctttaaacgggg-ccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 13266686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943938
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  3943891 attggtccccttggattagtcggttattggatcggataccaagttttc 3943938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259095
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||   || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||     
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggatactgagttttc 8259095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27269553 - 27269344
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcc------aatttcgg 237  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| | ||||| |||||||| ||||| |      ||||||||    
T  27269553 aacccatttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcgg 27269454  T
Q  238 tgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaat 337  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  27269453 tgggctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggat 27269354  T
Q  338 accgagtttt 347  Q
    ||||||||||    
T  27269353 accgagtttt 27269344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 28668945 - 28669071
Alignment:
Q  222 ttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactc 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28668945 ttggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 28669044  T
Q  322 gattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  28669045 gatttttggatcggataccgagttttc 28669071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271562
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| | || | ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctt 45271562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2140634 - 2140485
Alignment:
Q  196 tccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggccccc-gcaagtgggt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  2140634 tccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggc 2140539  T
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2140538 ggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttttc 2140485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 335
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850018
Alignment:
Q  164 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgct 263  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  264 ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcga 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatcga 19850018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 32845085 - 32845254
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32845085 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32845184  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    |||| ||||               |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  32845185 aagtccata---------------ctttaaacagggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5608237 - 5608038
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  5608237 aacccatttcgggttggtctagcagttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggct 5608138  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||  || ||||||| |||| || ||| | |||||| ||| |||| ||||||||    
T  5608137 aagtccatatagagcttgctctgactttaaacggagctcccacaaatggtcggcgggattgatcccttcagatgagtcgattattgaatcggataccgag 5608038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18976628 - 18976526
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||    
T  18976628 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctct-gagccaatttcggtggact 18976530  T
Q  244 aagt 247  Q
    ||||    
T  18976529 aagt 18976526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23787193 - 23787056
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    ||||||||||| |||  || ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  23787193 ctagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagtttg 23787094  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgg 299  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  23787093 ctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40997552 - 40997419
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  | || |||||||||||| | ||    
T  40997552 acccatttgaggtgggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagata 40997453  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggg 278  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40997452 agtcaatacagagcttgctctgactttaaacggg 40997419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 347
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610236
Alignment:
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttggaccgaataccgagtttt 44610236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28194337 - 28194137
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggtt-ggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||   |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194337 aacccatttggggttggcgtagtgatttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 28194238  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
     |||| ||||||||    ||    ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  28194237 -aagtccatacaga----gcaaaagcttagaacggggcccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcggtccttggatcggataccga 28194143  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  28194142 gttttc 28194137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 714244 - 714125
Alignment:
Q  228 ccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattct 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  714244 ccaatttcggtgggctaagtccatagagagtttgctctgactttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattct 714145  T
Q  328 tggatcgaataccgagtttt 347  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  714144 tagattggataccgagtttt 714125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6714485 - 6714295
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |    |||||||||||||    
T  6714485 taacccatttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtgggc 6714386  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||              |||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6714385 taagt--------------ctctcgctttaaacgggactcccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccga 6714300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 14946774 - 14946975
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||   |||| | ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||    
T  14946774 acccatttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggcta 14946873  T
Q  245 agttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||  || |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| | ||||||    
T  14946874 agtccatacggagctatgctctagctttaaac--ggaccccccaagtaggcagtgggattggtcccctcagattagtcagtttttggatcggagaccgag 14946971  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  14946972 tttt 14946975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19525576 - 19525429
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||     ||    
T  19525576 ggttggcttgggatcttgaagtgtgtttctctcaagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacaatgct---aatg 19525481  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19525480 gctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattggtccccttggatta 19525429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 347
Target Start/End: Original strand, 29361573 - 29361745
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| || || |||||||||||| |||||| ||    ||||||||  ||||    
T  29361573 ttggattgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggc 29361667  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  29361668 tttaaacggagcccc-gcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggatatcgagtttt 29361745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 4852551 - 4852643
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttc 235  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4852551 taactcatttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174959
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | || |||| ||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagcccc-gtaaatgggcggtgggat 19174914  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  19174915 tgatcccctcggattaatcggtccttggatcggataccgaatttt 19174959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618691
Alignment:
Q  152 tggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||   |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcggcgggc-aagtccat 4618782  T
Q  252 acagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||         ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  4618781 acaaaactttgctctggctttaaatgggtcccccgcaa-------tagggattggtaccctcggattagtcagttcttggatcaaatactgagttttc 4618691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 18708490 - 18708667
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttg 261  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || | |||   ||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||    
T  18708490 tagtggttgaattgggatcttggagtgtgttcctctcaaggtctcaggttcgactccctctgataccaatttcagtgggc-atgttcatacagagctttg 18708588  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||| |||||||    
T  18708589 ctctgacttaaaacgggacccccgcaaatggacggtgggattgatcccctcagattagtcggtacttagattgaatacc 18708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19606030 - 19605846
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagag-ctt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  19606030 ctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtgggc-aagtccatacagagtctt 19605932  T
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||  |||  || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  19605931 gctctcacttagaaagggg-gcccacaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttgacacttggatcggatatcgagtttt 19605846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 347
Target Start/End: Original strand, 31778105 - 31778228
Alignment:
Q  228 ccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt----gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcga 323  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||| ||      
T  31778105 ccaattttagtgggttaagttcatacagagcttgcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcag 31778204  T
Q  324 ttcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  31778205 ttcttggatcggataccgagtttt 31778228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 918898 - 918782
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcg---attccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| |||||   ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  918898 catttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgctcctct-gaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggcta 918800  T
Q  245 agttcatacagagcttgc 262  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  918799 agtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 334
Target Start/End: Original strand, 4769259 - 4769350
Alignment:
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  4769259 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggggccccgcaagtggacggtgaggttggtcccctcaaattagtcgattcttagatcg 4769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 348
Target Start/End: Original strand, 14486948 - 14487023
Alignment:
Q  273 aacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14486948 aacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttttc 14487023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Original strand, 45132398 - 45132477
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45132398 gctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggatacc 45132477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44929923 - 44929846
Alignment:
Q  270 ttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44929923 ttaaacgggacccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 44929846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692158
Alignment:
Q  280 cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 18692158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976454
Alignment:
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaattttc 18976454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9401047 - 9400961
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9401047 gctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggatactgagtttt 9400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698343
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctct 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aagttcatacagagctttactct 29698262  T
Q  266 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    | ||| ||||  || |||||||| |||| | || |||||||||||||| || | | | | ||| ||||| ||||||||||||    
T  29698263 gacttaaaac-aggaccccgcaaatgggcgatgagattggtcccctcgaataagttggtccttagatcgtataccgagtttt 29698343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30472392 - 30472269
Alignment:
Q  224 ggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcga 323  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||    
T  30472392 ggtgtcaatttcagtgagttaagttcatacaaagcttgctctgattttaaacgaggcctttgcaagtgggtggtgggattgatccatttgaattagtcga 30472293  T
Q  324 ttcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||    
T  30472292 ttctgagatcgaataccgaatttt 30472269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1845861 - 1845701
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  | |||| ||||||||  | || || |||||||| | |||    
T  1845861 taacccacttggggttggtacattggttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaaaatttcagattcgattcattctgatgtcaatttcgataggc 1845762  T
Q  243 ---taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
       ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  1845761 taataagtccatacaaaacttgctttggctttaaacgaagcccctgcaagtgggcggtggg 1845701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 4852649 - 4852726
Alignment:
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  4852649 tttaaacggggcccc-gcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggatgccaagtttt 4852726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957956
Alignment:
Q  283 ccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttttc 39957956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32526289 - 32526209
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattcccttt 223  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  32526289 taacccatttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattcccttt 32526209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13747684 - 13747578
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctg 266  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  13747684 gttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtgggct-agtccatacagtgctttgctctg 13747586  T
Q  267 gctttaaa 274  Q
    ||||||||    
T  13747585 gctttaaa 13747578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 303
Target Start/End: Original strand, 19517000 - 19517095
Alignment:
Q  208 aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||    
T  19517000 aggttcgatttcctatgctgttaattttgatgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggtcctcgtaagtgggcagtgggatt 19517095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 12543156 - 12543339
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttc-tccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||| | | || |||||| || |||||||  || | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  12543156 ctagtggttagcttgggatcttggaatgtgctacataca-aggtctgagattcgattttctctagtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagctt 12543253  T
Q  261 -gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
     ||||| | |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| |||| | |||||||||    
T  12543254 tgctctag-tttagaaagggcccccgcaagtggatggtgggattgctccccttgaattagtcggtccttgaatcggagaccgagttt 12543339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3405354 - 3405195
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |    
T  3405354 acccattttgagttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattttaatgggc-a 3405256  T
Q  245 agttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccg-caagtgggtggtgggatt 303  Q
    ||| |||||| ||| || |||| ||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||    
T  3405255 agtccatacaaagctttactctagctttaaacaggccctccgacaagtgagtggtgggatt 3405195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38784377 - 38784286
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||   || ||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  38784377 atttggggttgatctagtgtttgggttaggatcttggagtttgctcctctcaagttctaaggttcgattgcctttggtcacgatttcggtgg 38784286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42327462 - 42327368
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42327462 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctcttcggtgccaatttgggtgggctaa 42327368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Original strand, 35943758 - 35943852
Alignment:
Q  225 gtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||  | ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35943758 gtgccaattttggtaggctaagtccatacagtgctatgatttggctttaaattgagcccctgcaagtggacggtgggattggacccctcggatta 35943852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 44610090 - 44610140
Alignment:
Q  166 tggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgat 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  44610090 tggttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1501511 - 1501463
Alignment:
Q  299 ggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1501511 ggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 1501463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 188
Target Start/End: Original strand, 31536201 - 31536246
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagt 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31536201 taacccatttgggattagtctagcggttggcttgggatcttggagt 31536246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 20297556 - 20297596
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatctt 183  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20297556 taacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatctt 20297596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26176376 - 26176227
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctg 266  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||| |||   ||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||| ||| ||    
T  26176376 gttgacttgggaccttggggtgtgctcctctcaaggtctcagattcgattctccctggtgccaattttggtggccta-gtccatacagacctttgctttg 26176278  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||    
T  26176277 gatttaaatggg-cccccgcaagtggacggtgggattggacccttcagatta 26176227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 258
Target Start/End: Original strand, 40591201 - 40591290
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||   | |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40591201 gttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcaggtttgatttcttctggtggcaatttcggtgggc-aagtccatacagagc 40591290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1845101 - 1845048
Alignment:
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1845101 ggtggaattggtcccctcaaattagtcgattcttggctcggataccgagttttc 1845048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6099570 - 6099493
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||    
T  6099570 ggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattctccccgctgccaatatcggtgggcta 6099493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 347
Target Start/End: Original strand, 13089012 - 13089077
Alignment:
Q  282 cccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  13089012 cccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcagattattcggtttttgggtcggataccgagtttt 13089077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 26482118 - 26482195
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||   |||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||    
T  26482118 gttggcttgggacctaggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattctcctcagtgccaatttcagtgggctaa 26482195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 4718642 - 4718847
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4718642 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 4718741  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4718742 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 4718841  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  4718842 gttttc 4718847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34237858 - 34237654
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34237858 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 34237759  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34237758 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 34237659  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  34237658 ttttc 34237654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3734826 - 3734622
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3734826 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 3734727  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3734726 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 3734627  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  3734626 ttttc 3734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 39349254 - 39349458
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39349254 aacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 39349353  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39349354 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaag 39349453  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  39349454 ttttc 39349458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 143 - 346
Target Start/End: Original strand, 28193471 - 28193674
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28193471 taacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggt 28193570  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28193571 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 28193670  T
Q  343 gttt 346  Q
    ||||    
T  28193671 gttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 2618184 - 2618388
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2618184 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 2618283  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2618284 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggattccgag 2618383  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  2618384 ttttc 2618388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 32879277 - 32879481
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32879277 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32879376  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  32879377 aagttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgag 32879476  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  32879477 ttttc 32879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603431
Alignment:
Q  157 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacaga 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  257 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 21603431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15259606 - 15259407
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15259606 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 15259507  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15259506 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatgccgagttt 15259407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 20305904 - 20306110
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20305904 ataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatggg 20306003  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  20306004 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccg 20306103  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  20306104 agttttc 20306110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 21092537 - 21092743
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  21092537 ataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatggg 21092636  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21092637 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccg 21092736  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  21092737 agttttc 21092743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42643323 - 42643118
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42643323 ataacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtggg 42643224  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  42643223 ctaagtccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggataccg 42643124  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  42643123 agtttt 42643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 19471608 - 19471812
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19471608 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19471707  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  19471708 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgag 19471807  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  19471808 ttttc 19471812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 19542532 - 19542736
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19542532 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19542631  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  19542632 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgag 19542731  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  19542732 ttttc 19542736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19590164 - 19589960
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19590164 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19590065  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  19590064 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgag 19589965  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  19589964 ttttc 19589960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 42328004 - 42328206
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42328004 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggcta 42328102  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42328103 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagt 42328202  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  42328203 tttc 42328206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 169 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8765704 - 8765525
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8765704 ttggcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 8765605  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8765604 tttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 8765525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27746535 - 27746334
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27746535 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 27746436  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagt-gggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27746435 tccatacagagcttgctctggctttaaaagggg-ccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcgaatatcgattt 27746337  T
Q  346 ttc 348  Q
    |||    
T  27746336 ttc 27746334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633156
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| ||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccaagttttc 14633156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4698916 - 4698722
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    ||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  4698916 gggttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatga 4698817  T
Q  254 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4698816 agaacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggataccgagttttc 4698722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 18532105 - 18532300
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  18532105 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggct 18532204  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18532205 aagtccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagatt---------ggattagtcgattcttggatcggataccgag 18532295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264400
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 264400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651521
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 651521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837256
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 837256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953008
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 6953008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 169 - 347
Target Start/End: Original strand, 20469940 - 20470117
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20469940 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 20470039  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20470040 tttaaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggataccgagtttt 20470117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 28088284 - 28088474
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28088284 aacccatctggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggtt 28088383  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||    
T  28088384 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcg 28088474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 28964033 - 28964234
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||   |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28964033 cccatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaa 28964132  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28964133 gtccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtggg-cgtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcgaatactgagtt 28964231  T
Q  346 ttc 348  Q
    |||    
T  28964232 ttc 28964234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Original strand, 21667546 - 21667731
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21667546 ataatccatttgaggttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtggg 21667645  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21667646 ctaagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 24018380 - 24018585
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||    
T  24018380 aacctatttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggct 24018479  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| || ||| |||    
T  24018480 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggatatcga 24018579  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  24018580 gttttc 24018585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26169051 - 26168856
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||     
T  26169051 aacccatttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtgggc- 26168953  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26168952 aagttcatacagagcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcgaatacc 26168856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 2166695 - 2166897
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtg--gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  2166695 aacccatttggggttggcccagtgcagttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccc--tcgtgccaatttcagtagg 2166792  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||    
T  2166793 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa-taagaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggataccg 2166891  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  2166892 agtttt 2166897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610686
Alignment:
Q  165 gtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctc 264  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  265 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 34610686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292255
Alignment:
Q  199 agaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  299 ggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttggatcgaataccgagtttt 10292255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7558146 - 7557952
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7558146 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggct 7558047  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |       ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  7558046 aagtcc-------gcttgttctggctttaaac-ggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggataccgag 7557955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Original strand, 24999239 - 24999394
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||       |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  24999239 taacccatttgggg--ggtctagtggttgacttgggatcatggagtttgcta------aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggc 24999330  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24999331 taagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt 24999394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 18128512 - 18128714
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||| ||||   | |||||| |||||||||||| ||| |||| ||    |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  18128512 acccatttgggattggctcattggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcga 18128611  T
Q  245 agttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18128612 a-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcagattagtcggttcttggatcgaataccgag 18128710  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  18128711 tttt 18128714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248547
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacggg-ccctcgcaagtgggcggtgggatt 25248504  T
Q  304 ggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  25248505 ggtcccctcggattagtcgatt-tttgatcggataccgagtttt 25248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2639499 - 2639410
Alignment:
Q  259 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2639499 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 2639410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34694776 - 34694574
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||     
T  34694776 ccatttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtgggcaaa- 34694678  T
Q  247 ttcatacagagctt-gctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||  |||||   ||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||| |||||    
T  34694677 ttcatacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagt 34694578  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  34694577 tttc 34694574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 1219409 - 1219551
Alignment:
Q  206 tcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattgg 305  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  1219409 tcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcgg 1219508  T
Q  306 tcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1219509 tcccttcggattagtcgattcttagatcgaataccgaattttc 1219551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34639406 - 34639208
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34639406 ccatttggggttagtctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taag 34639309  T
Q  247 ttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    | |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||| || | ||||| ||||    
T  34639308 tccatacagagctttgctctggcttagaac-gggcctctgcaagtggacggtaggattggtcccttcgaattaatcggtccttgaattggataccaagtt 34639210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 28908823 - 28909011
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct--tctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||| ||  || |||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||    
T  28908823 catttggagttggtctagtggttggtttggaattttggagtttgctcctctcaaggtgtttcaggttcaattccctctggtgtcaattacagtgggc-aa 28908921  T
Q  246 gttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  28908922 gtccatacagagctttgttctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcgatgtgattgatcccctcagattagtcggtccttggatcg 28909011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36848949 - 36848757
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||   |||| | || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36848949 ccatttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaag 36848850  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||||||| | || | || |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||| || |||||||| |||||    
T  36848849 tccatacggagtttgctcgggctttaaatgagg-caccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggatacc 36848757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070874
Alignment:
Q  152 tggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggc-aagttcat 41070865  T
Q  252 acagagctt 260  Q
    ||| |||||    
T  41070866 acatagctt 41070874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3403707 - 3403502
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||  ||   |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3403707 ataacccatttgaggttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtggg 3403608  T
Q  242 ctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    | |||| |||||| | ||| | | |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||| |||| || |||||| || |  |||||    
T  3403607 c-aagtccatacaaaactttgttttggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattcttagaccagatacc 3403509  T
Q  341 gagtttt 347  Q
    |||||||    
T  3403508 gagtttt 3403502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9047462 - 9047278
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgc 262  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| | | ||| |||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |    
T  9047462 tagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggttttaagtttgattccctctaatgccaattttggtggactaagtccatacaaagcttac 9047363  T
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  9047362 tctgactttaaacggaacccccgcatgtggacagtggaattggt-cccttgaattagtcggttcttggatcggataccgaattttc 9047278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Original strand, 13749077 - 13749228
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctct 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||   |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  13749077 ggttgacttgggat-ttggagtctgctcctctcaaggtttcaggttcgatttccttcggtgccaattttggtgggc-aagttcatacaaagctttgctct 13749174  T
Q  266 ggctttaaacggggcccc-cgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  13749175 ggcttagaacggggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggatta 13749228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 8042655 - 8042844
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||| |    
T  8042655 ccatttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatg 8042747  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||| |||  |||||||| ||   || |||||||| ||   |||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8042748 tccatacagagtttg--ctggcttttaa--tggtccccgcaaatgaacggtgggattggt-cccttgaattaatcggttcttggatcggatactgagttt 8042842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22200758 - 22200559
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||  ||||    
T  22200758 catttgaggttggcct-gtggttggtttgggatcttggagtttacttctctcaaagtctcaggttcgattccctctagtgccaatttc-gagggaaaagt 22200661  T
Q  248 tcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |   || |||||||| |||||| |||| ||| | ||| ||||| | ||| |||||    
T  22200660 tcatacagagctttgctctggcttagaacggagcccctgcaagtagacagtaggattggtaccctcgaattaatcggtccttagatcggacaccaagttt 22200561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8387644 - 8387535
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctc-cagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  8387644 ccatttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc-aa 8387547  T
Q  246 gttcatacagag 257  Q
    || |||||||||    
T  8387546 gtccatacagag 8387535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 3794792 - 3794904
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  3794792 ccatttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcggcgggc-aag 3794890  T
Q  247 ttcatacagagctt 260  Q
    |||||||| |||||    
T  3794891 ttcatacaaagctt 3794904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 348
Target Start/End: Original strand, 33746944 - 33747084
Alignment:
Q  208 aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggt 306  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33746944 aggttcgattccctctagtgttaatttcggtgggcaaa-ttcatataaagctttgttctggtttagaacggagcccccgcaagtggacggtggaattggt 33747042  T
Q  307 cccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
     | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33747043 tctctcggattagtcgatccttggatcggataccgagttttc 33747084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11715010 - 11714914
Alignment:
Q  156 gttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  11715010 gttggcctagtggttggtttgagatcttggagtttgcttctctcaagatttcaggttcgattccccctgatgccaatttcagcgggc-aagttcatac 11714914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43817835 - 43817762
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  43817835 gctctagctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcg 43817762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 348
Target Start/End: Original strand, 26261846 - 26261986
Alignment:
Q  208 aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtc 307  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| |||||  | ||| || | ||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  26261846 aggtttgattccctctggtgtcaatttcagtggattaagtccatacgaaacttactttagctttaaacagagcccacataagtaggtggtgggattggtc 26261945  T
Q  308 ccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |  ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  26261946 cattcgaattagtcggttcttgaatcgaataccgatttttc 26261986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 775984 - 775938
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagttt 190  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  775984 aaccaatttggggttggtccaatggttggcttgggatcttggagttt 775938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 781638 - 781592
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagttt 190  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  781638 aaccaatttggggttggtccaatggttggcttgggatcttggagttt 781592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 347
Target Start/End: Original strand, 9713609 - 9713655
Alignment:
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9713609 attggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 9713655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 16852349 - 16852442
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||    
T  16852349 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctccttagtgccaatttaggtgggcta 16852442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24339829 - 24339625
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttggga-tcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || || |||| | ||||||||   |||||| ||||||||||  || | || |||||||||||||    
T  24339829 ataatccatttgaggttggcctagtagttgggttgtgagtcctggattgtgcttctctcaaggtcttaggttcgattttctcttgtaccaatttcggtgg 24339730  T
Q  241 gctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
      |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||| || | |||| |||| ||| | ||| ||| | ||||    
T  24339729 a-taagttcatacaaagctttgctttggctttaaacggggtctccataagtgggcggtaggatttgttctctcgtattaatcggtccttagattggatac 24339631  T
Q  340 cgagtt 345  Q
    ||||||    
T  24339630 cgagtt 24339625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29858067 - 29858022
Alignment:
Q  200 gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  29858067 gaggtctcaggttcgattcccctcggtgccaatttaggtgggctaa 29858022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42332108 - 42332012
Alignment:
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | | ||||||||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  42332108 atacagagtttgttctggctttaaacggt-cctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcgaataccaagtttt 42332012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13580046 - 13579903
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| | || || |||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||  |||| |||    
T  13580046 tctcatgttcgattctctctggtgccaattttgttgagc-aagttcataccgagctttgctctagcttagaacggagcccccacaagtggacggtgagat 13579948  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| || |||||||| | | | ||| ||||| |||| |||||||    
T  13579947 tggttccatcggattaattggtccttagatcggatactgagtttt 13579903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7373529 - 7373482
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttg 191  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  7373529 aacccatttggggttggtcgaatggttggtttgggatcttagagtttg 7373482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Original strand, 39317022 - 39317093
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||    
T  39317022 catttgaggttggtctagtggttgacttgagatattggagtgtgcttctctcaagctctcaggttcaattcc 39317093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33534628 - 33534566
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  33534628 caagtggatcgtgggattggtcccttcggattagtcggtccttggatcggttaccgagttttc 33534566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 968388 - 968465
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||    
T  968388 ttggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctccgatgccaatttaggtgggctaa 968465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8484861 - 8484660
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8484861 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 8484762  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8484761 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8484662  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  8484661 tc 8484660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11926706 - 11926501
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11926706 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggc 11926607  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11926606 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccg 11926507  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  11926506 agtttt 11926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15641310 - 15641105
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15641310 ataacccatttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtggg 15641211  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15641210 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccg 15641112  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  15641111 agttttc 15641105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32059645 - 32059439
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32059645 ataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg 32059546  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  32059545 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccg 32059446  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  32059445 agttttc 32059439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27498935 - 27498730
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27498935 taacccatttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 27498836  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27498835 taagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 27498736  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  27498735 gttttc 27498730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 38684202 - 38684405
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38684202 aacccacttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 38684301  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  38684302 aagtccatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgat 38684400  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  38684401 ttttc 38684405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 30485822 - 30486026
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  30485822 aacccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggct 30485921  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  30485922 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggataccgag 30486021  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  30486022 ttttc 30486026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 34310136 - 34310339
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34310136 aacccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggct 34310235  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34310236 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggataccgag 34310335  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  34310336 tttt 34310339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456210
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456290 gctttaaacgggg-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 19456210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7085829 - 7085625
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  7085829 aacccatttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggct 7085730  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  7085729 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgag 7085630  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  7085629 ttttc 7085625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 169 - 348
Target Start/End: Original strand, 18207226 - 18207405
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18207226 ttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggc 18207325  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18207326 tttaaacgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 18207405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33709704 - 33709502
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33709704 taacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 33709606  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  33709605 taagtccatacagag--agctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgt 33709508  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  33709507 gttttc 33709502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31288149 - 31287945
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31288149 aacccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggtt 31288050  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  31288049 aagtccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggataccgag 31287950  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  31287949 ttttc 31287945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 4603774 - 4603975
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  4603774 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaag 4603873  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4603874 tccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 4603973  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  4603974 tc 4603975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13038658 - 13038463
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  13038658 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 13038559  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13038558 taagttcatacagagcaag-tatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 13038463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13108653 - 13108458
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  13108653 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 13108554  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13108553 taagttcatacagagcaag-tctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 13108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11465111 - 11464913
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11465111 taacccatttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc 11465012  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11465011 taagttcatacagagcttactctggctttaaacgggg-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 11464913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014280
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  254 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 6014280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23270725 - 23270522
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  23270725 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggct 23270626  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||    
T  23270625 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattggataccaag 23270526  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  23270525 tttt 23270522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 37495059 - 37495252
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37495059 ctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagcttg 37495158  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcc-------cccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||   ||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37495159 ctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 37495252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27487755 - 27487554
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  27487755 ccatttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaag 27487656  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaac-ggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27487655 tccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatacagagtt 27487556  T
Q  346 tt 347  Q
    ||    
T  27487555 tt 27487554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 22392695 - 22392886
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  22392695 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccct---ctgccaatttcggtgggct 22392791  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22392792 aagt----------cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggataccgag 22392881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10869760 - 10869564
Alignment:
Q  152 tggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||     
T  10869760 tggggttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccac 10869661  T
Q  252 acagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10869660 actgagcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccaagttttc 10869564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 284
Target Start/End: Original strand, 25586926 - 25587066
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25586926 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggct 25587025  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggccccc 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25587026 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccc 25587066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26009463 - 26009263
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26009463 catttgggttttgcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagt 26009364  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  26009363 ccatgcagagcttactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcgaatatcgagtttt 26009264  T
Q  348 c 348  Q
    |    
T  26009263 c 26009263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15971321 - 15971151
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  15971321 catttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 15971222  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  15971221 ccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggatta 15971151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19145612 - 19145412
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19145612 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aa 19145514  T
Q  246 gttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  19145513 gtccatacagagctttgctctggctttaaa-tggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggataccgagt 19145415  T
Q  345 ttt 347  Q
    |||    
T  19145414 ttt 19145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398447
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggataccgagttttc 12398447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Original strand, 36954813 - 36955007
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||    
T  36954813 acccatttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgcta 36954912  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  36954913 agtccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggatac 36955007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 303
Target Start/End: Original strand, 15931053 - 15931211
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15931053 aacccatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt-ggct 15931151  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  15931152 aagtccatacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 333
Target Start/End: Original strand, 42193478 - 42193666
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  42193478 taacccatttattgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggc 42193577  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatc 333  Q
    |||||  |||||||| ||||| ||||||||||   || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42193578 taagtctatacagagtttgctttggctttaaa--tggaccccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatc 42193666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38631161 - 38630978
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38631161 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaag 38631062  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||||                   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38631061 tccatacagagc------------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 38630980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 10399770 - 10399971
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  10399770 ccatttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaag 10399869  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtc-ccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  10399870 tccatacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttggatcaaatagcgagtt 10399969  T
Q  346 tt 347  Q
    ||    
T  10399970 tt 10399971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25750811 - 25750613
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcg--attccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  25750811 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggtta 25750712  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25750711 agtccatatagagcttgctctggctt--aacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggataccgagt 25750616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 34049816 - 34050008
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |           |||||||    
T  34049816 aacccatttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctag-----------gtgggct 34049904  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||   |||| ||||||||    
T  34049905 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattctcaaatcggataccgag 34050004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21236566 - 21236361
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||  |||||||||| || | ||| |||||||  |||||    
T  21236566 taacccatttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggc 21236467  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21236466 taagtccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccga 21236367  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  21236366 gttttc 21236361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 5049131 - 5049333
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||   || || |||  |||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  5049131 aacccatttggggttgacttaatgattgatttggaatcttgaagtttgcttttctaaaggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtct 5049230  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5049231 aagttcatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccatcgaattagtcgattcttggatcgaataccaag 5049329  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  5049330 tttt 5049333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12317353 - 12317154
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||| | | ||||| ||||||||||||| |    
T  12317353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggtt 12317254  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||    | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  12317253 aag----tccagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattcttagatcggataccgag 12317159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Original strand, 35425088 - 35425211
Alignment:
Q  225 gtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35425088 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggattagtcgat 35425187  T
Q  325 tcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  35425188 tcttggatcggataccgaattttc 35425211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1827734 - 1827616
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||     
T  1827734 taacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggt 1827635  T
Q  243 taagttcatacagagcttg 261  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  1827634 taagtccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9659429 - 9659311
Alignment:
Q  229 caatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  9659429 caatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattctt 9659330  T
Q  329 ggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  9659329 ggatgggataccgagtttt 9659311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41351197 - 41351103
Alignment:
Q  253 cagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41351197 cagagcttgctctggctttaaacggggctcc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 41351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28614700 - 28614486
Alignment:
Q  130 ttaattttttggataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcc 229  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  28614700 ttaagtttttgtttaacccatttggggttggtg-agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtc 28614602  T
Q  230 aatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||| |||  |||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  28614601 aatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgttctgactttaaacgggatccc-gcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttg 28614504  T
Q  330 gatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28614503 gatcggataccgagtttt 28614486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15485495 - 15485320
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtgg-ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||     
T  15485495 aacccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattcccct-gacaccaatttcggtgggt 15485397  T
Q  243 taagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15485396 taagtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggatta 15485320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 22693054 - 22693132
Alignment:
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22693054 tttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 22693132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22253345 - 22253144
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   || |||||||||||| |  || | |||||||||||| |||||||||    
T  22253345 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaag 22253246  T
Q  247 ttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||| | ||||||| ||| |||   | |||||| ||||||||  |||| |||  |||||||||||||| ||||||    
T  22253245 tccatacaaagctatgttctggatttaaatgaggcccccacaactggacagcgggattcgtcccctcaaattagtcggatcttggatcgaataacgagtt 22253146  T
Q  346 tt 347  Q
    ||    
T  22253145 tt 22253144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13659359 - 13659245
Alignment:
Q  233 ttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggat 332  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13659359 ttcgatgggttaagtccatagagaacttgctttgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggat 13659260  T
Q  333 cgaataccgagtttt 347  Q
    || ||||||| ||||    
T  13659259 cggataccgaatttt 13659245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 930685 - 930486
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccc-tttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||   | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  930685 ccatttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggtggac-aa 930587  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
     |||||||| ||||||||| |||||  |||   |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  930586 attcatacatagcttgctccggcttagaac-aagccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagtt 930488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Original strand, 36895438 - 36895622
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-g 261  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |    
T  36895438 tagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtggtc-aagtccatacaaagctttg 36895536  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||  ||||  ||| ||||||||||| || ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36895537 ctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggataccgagtttt 36895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 258
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Original strand, 37397707 - 37397803
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  37397707 aacctatttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Original strand, 5067295 - 5067385
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaattt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  5067295 aacccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtgtcaattt 5067385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Original strand, 31206293 - 31206441
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgg 299  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  31206293 aggtctcaggttttattccccctggtgccaatttcattggcctaagtccatacagagctatgctcttgctttaaatgggacccccacaagtggacggtgg 31206392  T
Q  300 gattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| | |||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||||    
T  31206393 gattggactcctcggattagtcggtccttgggccggataccgagttttc 31206441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24158311 - 24158166
Alignment:
Q  202 ggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg-ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  24158311 ggtctcaggttcgattccttctggtgtcaatttcgatggg-taagtccatacatagctttactctggcttagaacggggcctctgcaagtgggcggtgag 24158213  T
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| ||||||| ||||    
T  24158212 attggtcccctcagattagtcggtccttgaatcggataccgaatttt 24158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10813994 - 10813851
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  10813994 tctcaagtttgatcccctctggtgtcaatttttttgggctaagtccatacggagctttgctctggctttaaacagggcccca-caagtaggtggtgggat 10813896  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    | ||||||| |||||| ||  |||||| | |||||||||||||||    
T  10813895 ttgtccccttggattagtcagttcttgaaccgaataccgagtttt 10813851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||     |||||| ||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccata-----cttgctttg 17015499  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||    
T  17015498 gctttaaac-ggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631288
Alignment:
Q  296 gtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10631288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Original strand, 33025473 - 33025605
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |||   || |||||  || ||||||| ||| |||| |||||| |||      
T  33025473 taacccatttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaactttgattccccttgatgccgatttcgatggat 33025572  T
Q  243 taagttcatacagagct-tgctctggctttaaa 274  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33025573 taagtccatacaaagctatgctctggctttaaa 33025605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14302898 - 14302812
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaattt 234  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  14302898 catttgagtttgatctagtggttgacttgggatcttagagtgtgcttctctagaggtctcaggtttgatttcatttggtgtcaattt 14302812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 342
Target Start/End: Original strand, 3639788 - 3639962
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctct 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||   |||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3639788 ggttggcttgagattttggagtttgctcttctccaggtcttaggttcgattatctttggtggtaatttcggtggactaagtccatacggagctatgctct 3639887  T
Q  266 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||||     |  ||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||    
T  3639888 ggctttagctcag--ccccgcaagtggacagtgagattgatcccctcagattagtcgattcttgaatagaataccga 3639962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3715112 - 3715055
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccaga 201  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3715112 aaccaatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 334
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067445
Alignment:
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcg 5067445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Original strand, 8821093 - 8821182
Alignment:
Q  259 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  8821093 ttgctctggctttaaattgggctccaacaagtgggtggtgggattggtcacttcgaattagtctattcttggatcagataccgagttttc 8821182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2499376 - 2499193
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||| ||    | |||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||     
T  2499376 atttggggttggcttagtggctgacttgggatcttggaatttgctcctttcaaagtctcaggttcgattctccctgttgtcaatttcgatgggc-aagtc 2499278  T
Q  249 catacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggat 332  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |||  | ||||||  |||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  2499277 catatagagccttactctggctttaaatgggacccttgaaagtggacggtgagattggtcccctcggaatagtcgactattggat 2499193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25548617 - 25548533
Alignment:
Q  264 ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||  | |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25548617 ctggctttaaaagaggttcccgcaagtacgcggtgggattggtcatctcgaattagtcgattcttggatcgaataccgagttttc 25548533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41569011 - 41568868
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||| | || |||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  41569011 tctcaggttcgatttcctcttgtgtcaatttcggtggactaagtccatacagaatttgttttgtctttaaa-tggaaccccgcaaatgggtggtgggatt 41568913  T
Q  304 ggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||  ||||| | |||| || ||||  ||| |||||||||    
T  41568912 ggtcccctaagattagttgattattcgatcagatatcgagttttc 41568868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21377346 - 21377248
Alignment:
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  21377346 atacagagtttgctcaggcttagaacggggcctctgcaagtgggtggtgagattggtctctttggattagtcggtctttggatcggataccgagttttc 21377248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Original strand, 40330628 - 40330725
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||| || |||||| ||||||| |||||    
T  40330628 acccatttgaggttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttgggc 40330725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Original strand, 42006791 - 42006836
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42006791 catttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgct 42006836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Original strand, 21589314 - 21589390
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21589314 ttggcttgggacctgggagtctgctactcctcgatgtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtgggcta 21589390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 245
Target Start/End: Original strand, 12647791 - 12647826
Alignment:
Q  210 gttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647791 gttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 12647826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 329
Target Start/End: Original strand, 20508849 - 20508892
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20508849 caagtgggtggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttg 20508892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Original strand, 16616112 - 16616186
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgatt 217  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||    
T  16616112 taacccatttgagattggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21042729 - 21042679
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21042729 taactcatttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgct 21042679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 204221 - 204178
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  204221 tttggagttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgct 204178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Original strand, 7151437 - 7151500
Alignment:
Q  284 cgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7151437 cgcaagcgggtgatgaaattggtcccctagaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 7151500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16247180 - 16247030
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctg 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| ||    ||||||||||||| || |||   ||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||| ||| ||    
T  16247180 gttggcttgggaccttgcagtgtgctcctatcaaggtctcaggttcaatcccccccggtgccaatcttggtgggcta-gtccatacagaactttgctttg 16247082  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    | |||||| |||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  16247081 ggtttaaatgggctccccacaagtggacggtgggattggacccctcggatta 16247030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 348
Target Start/End: Original strand, 37972906 - 37972981
Alignment:
Q  273 aacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  37972906 aacggagctcccgcaagtgggcagtgagattgatcccctcgaattaatcgacccttagatcgaataccgagttttc 37972981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737939
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttgattcttgaatcggataccgagttttc 33737939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Original strand, 16773865 - 16773910
Alignment:
Q  200 gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  16773865 gaggtctcaggttcgattctctctgatgccaatttaggtgggctaa 16773910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 29075807 - 29075884
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  29075807 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgagatctcatgttcgattctctctggtgccaatttagatgggctaa 29075884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4621440 - 4621236
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4621440 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 4621341  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4621340 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 4621241  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  4621240 ttttc 4621236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 24674386 - 24674590
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24674386 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 24674485  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24674486 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccga 24674585  T
Q  343 gtttt 347  Q
     ||||    
T  24674586 atttt 24674590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 24122016 - 24122220
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24122016 taactcatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 24122115  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24122116 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 24122215  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  24122216 gtttt 24122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15059605 - 15059401
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15059605 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 15059506  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15059505 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgag 15059406  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  15059405 ttttc 15059401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7766931 - 7766726
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7766931 taacccattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggc 7766832  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||    
T  7766831 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcga 7766732  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  7766731 gttttc 7766726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 143 - 345
Target Start/End: Original strand, 8077640 - 8077841
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8077640 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 8077739  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  8077740 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcggagaccga 8077838  T
Q  343 gtt 345  Q
    |||    
T  8077839 gtt 8077841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27455070 - 27454863
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  27455070 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagc 27454971  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggg--gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27454970 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatacc 27454871  T
Q  341 gagttttc 348  Q
     |||||||    
T  27454870 tagttttc 27454863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7197449 - 7197247
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  7197449 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-t 7197351  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  7197350 aagtcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggataccgag 7197251  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  7197250 tttt 7197247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 7578421 - 7578607
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7578421 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttg 7578520  T
Q  262 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  7578521 ctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggataccgagttttc 7578607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 46607804 - 46608008
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46607804 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 46607903  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||    
T  46607904 aagtccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgag 46608003  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  46608004 ttttc 46608008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 163 - 346
Target Start/End: Original strand, 17935782 - 17935965
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgc 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17935782 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgc 17935881  T
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17935882 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 30677170 - 30677374
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30677170 aacccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggct 30677269  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||| ||||    
T  30677270 aagtccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggatatcgag 30677369  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  30677370 ttttc 30677374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 34778336 - 34778535
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |    
T  34778336 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt 34778435  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
       | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34778436 ---tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgag 34778532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45859222 - 45859043
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctgg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  45859222 gttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttg 45859123  T
Q  268 ctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  45859122 ctttaaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggataccgaatttt 45859043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9500533 - 9500355
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9500533 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 9500434  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9500433 tttaaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 9500355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 23734109 - 23734315
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23734109 taacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggc 23734208  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||     
T  23734209 taagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggatacca 23734308  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  23734309 agttttc 23734315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 23741301 - 23741507
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23741301 taacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggc 23741400  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||     
T  23741401 taagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggatacca 23741500  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  23741501 agttttc 23741507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 32729539 - 32729742
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32729539 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggc- 32729637  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| |  |||||||| ||||||||    
T  32729638 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggataccgag 32729737  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  32729738 ttttc 32729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 18646846 - 18647045
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18646846 taacctatttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 18646945  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  18646946 taagtctatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccga 18647045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 168195 - 168369
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  168195 aacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 168294  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  168295 aagttcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggatta 168369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 7946837 - 7947011
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7946837 taacccatttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 7946936  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7946937 taagtctatacagagcttgctctcgctttaaatgggg-ccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 21726722 - 21726921
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21726722 taacccatttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggt 21726821  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21726822 taagtccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggataccga 21726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 343
Target Start/End: Original strand, 1378892 - 1379090
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1378892 aacccatttaaggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggct 1378991  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  1378992 aagtccatacagaacttgctctggctttaaac-gggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggataccgag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905509
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggataccgagttttc 33905509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155888
Alignment:
Q  174 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  274 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 36155888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 2272342 - 2272542
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  2272342 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagt 2272441  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  2272442 tcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggatactgagtttt 2272541  T
Q  348 c 348  Q
    |    
T  2272542 c 2272542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8779920 - 8779744
Alignment:
Q  163 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgc 262  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  8779920 tagtggttgatttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttac 8779821  T
Q  263 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  8779820 tctagctttaaacggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggatac 8779744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23232468 - 23232300
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23232468 aacccatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggct 23232369  T
Q  244 aagttcatacagagctt----gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 308  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23232368 aagtccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 23232300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254751
Alignment:
Q  198 cagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggt 297  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  298 gggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 8254751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 342
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930941
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttc 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggataccga 32930941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351454
Alignment:
Q  165 gtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgct- 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  264 --------ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
            |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaac-gggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18533928 - 18533724
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||| || | |||||||||||| ||| |    
T  18533928 taacccatttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggac 18533829  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  18533828 taagtccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggataccaa 18533729  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  18533728 gtttt 18533724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29057540 - 29057373
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||      
T  29057540 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgat-ggta 29057442  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctc 312  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  29057441 aagtctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctc 29057373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 1486415 - 1486617
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1486415 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-ta 1486511  T
Q  245 agttcatacagagc-ttgctctggctttaaacgggg--cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  1486512 agtccatacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggataccg 1486611  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  1486612 agtttt 1486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113495
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  249 cataca 254  Q
    ||||||    
T  46113500 cataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40802271 - 40802069
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   |||||||| ||| ||||| |  |||||||||||| | || ||    
T  40802271 taacccatttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgagc 40802172  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40802171 -aagtccatacagagcttgctctgactttaaacgggtcccc-gcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcgattcttgaatcgaataccga 40802074  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  40802073 gtttt 40802069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 2537697 - 2537861
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||      |||| |||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2537697 taacccatttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggc 2537790  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    || || ||     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2537791 tatgtcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggatta 2537861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20487393 - 20487297
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20487393 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45331747 - 45331621
Alignment:
Q  222 ttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggc-ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattact 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| |    
T  45331747 ttggtggcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaat 45331648  T
Q  321 cgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  45331647 cgattcttgaatcggataccgagtttt 45331621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 335
Target Start/End: Original strand, 16899507 - 16899688
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  16899507 cccatttggggttggcctagtggttgacttgtaatcttggagtgtgctgctc--------tcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcca- 16899597  T
Q  246 gttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcga 335  Q
    || |||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  16899598 gtccatacaaagctttgctctggtttagaacggggcccctgcaagtggacggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcga 16899688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26513244 - 26513148
Alignment:
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26513244 atacaaagcttgctctgactttaaacggg-cccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 26513148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40146079 - 40145889
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||| ||||  ||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || |||     |||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||     
T  40146079 atttggagttgacctagtggttgatttgtgatcttgaagtttgctccttcag-----tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtc 40145985  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggccc-----ccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||     || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40145984 catacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgagtttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatac 40145889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 22909975 - 22910069
Alignment:
Q  254 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  22909975 agagcttgctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggataccgagttttc 22910069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 348
Target Start/End: Original strand, 48699859 - 48699957
Alignment:
Q  251 tacagagcttgctctgg-ctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48699859 tacagagcttgctctgggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttttc 48699957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Original strand, 16539625 - 16539804
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctct 265  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  16539625 ggttggtttgggatcttggagtgagctccttgcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagctttgcgct 16539723  T
Q  266 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  16539724 ggcttagaacggggccct-gtaagtgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcgatacttgtatcggataccgaatttt 16539804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25237192 - 25237028
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  25237192 aacccatttagagttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc- 25237094  T
Q  244 aagttcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 308  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||  || || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25237093 aagtccatacagagttttgctctgacttagaatggtgcctccgcaagtggacggtggaattggtcc 25237028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Original strand, 26820196 - 26820384
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||      ||||||| ||||||||||| || || ||||||   |||| ||||| |||||    
T  26820196 gggttgatctagtgattgacttgagatcttagagtttgctccta-----gtctcagattcgattccctatgatgtcaatttttatgggttaagtccatac 26820290  T
Q  254 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26820291 agaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtggatggtggaattgatcgcttcggattagtcgattcttggattgaataccgagtttt 26820384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14258630 - 14258538
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcg 236  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14258630 aacccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Original strand, 24216973 - 24217069
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24216973 acccatttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtggg 24217069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1095193 - 1095033
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||        ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||     
T  1095193 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtgttcttc--------tctcaagttcgatttcttctggtgccaatttcggtgggc-aagta 1095103  T
Q  249 catacagagctt----gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||||||||||    ||||||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  1095102 catacagagctttgcagctctggcttagaacgggg-ccccgcaagtg---ggtgggattggttccctcggatta 1095033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12877034 - 12876965
Alignment:
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12877034 catacagagcttgctctagctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 1138572 - 1138746
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||||| |||||||| || || | |||||||||||||||| |    
T  1138572 taacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtggac 1138671  T
Q  243 taagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
     |||| |||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  1138672 -aagtccatacagagctttgctctgacttagaacagggcccttgcaagtgggcagtggaattggt-ccctcggatta 1138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 318
Target Start/End: Original strand, 37046994 - 37047160
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||  |||| | ||||| ||||||||| || |||    
T  37046994 gggttggtctggtggtgttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccccctggtacaaattttggtgggcta-gtccat 37047092  T
Q  252 acagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  37047093 acagagctttgctctagctttaaatggggcccccacaagtggacggtgggattggacccctaggatta 37047160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 52135127 - 52135323
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| ||     
T  52135127 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtgggc-aaa 52135225  T
Q  247 ttcatacagagc-ttgctctggc-tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    | ||     ||| |||||||||| |||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  52135226 tcca-----agctttgctctggcttttaaatggagccactgcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggatactgagt 52135320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 809215 - 809419
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||   |||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||    
T  809215 taacccatctagggttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtgggc 809314  T
Q  243 taagttcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
     |||| |||||| || |||| ||||||||| || |||||    |||| |||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| | |||| |    
T  809315 -aagtccatacaaagccttgatctggctttgaatggggcatttgcaaatgggcggtgggattggttccttcggagtagtcgattcttggattggatactg 809413  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  809414 agtttt 809419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Original strand, 1378743 - 1378833
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  1378743 catttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9926350 - 9926146
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctc--aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||   |||||||  || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  9926350 acccatttggagctggtctagtagttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctctcagattcgattccttctggtgtcaattttggtgggc 9926251  T
Q  243 taagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
     || | |||||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |  ||||| ||| | ||| ||||| ||||||    
T  9926250 aaa-tccatacaaagttttgctctggcttagaacggagcccccgcaactgggcggtgggattgatccctttagattagtcggtccttcgatcggataccg 9926152  T
Q  342 agtttt 347  Q
    ||||||    
T  9926151 agtttt 9926146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25496692 - 25496528
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||    
T  25496692 taacctatttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgagc 25496593  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
     |||||||||  ||||||   ||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  25496592 -aagttcatattgagctt--actggcttaaaatgggg-ctccgcaagtggacggtgggattgatcccct 25496528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034474
Alignment:
Q  164 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctt 19034474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Original strand, 1818730 - 1818805
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccct 221  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1818730 cccatttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccct 1818805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 259
Target Start/End: Original strand, 39964530 - 39964621
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct 259  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39964530 gttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcacacagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 50202661 - 50202742
Alignment:
Q  265 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  50202661 tggctttaaacgggaccctcgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggatatcgagtttt 50202742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39714829 - 39714649
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||| ||| ||||| | | |||||| |||||||||||||| || ||    |||||| ||||||    
T  39714829 gttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattctcctcggtgccgatttcggtgggcta-gtccaaggggagctttgctctg 39714731  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    | |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||   | |||||||||||||    
T  39714730 gatttaaatgggccccccacaagtggatggtgggattggactcctcggattagtcggtccttgggctggataccgagttttc 39714649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 19480552 - 19480700
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctg 266  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||  ||||||||||   |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  19480552 gttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcacattcgattccccgcggtgccaattttagtgggctaagtccatatagagctatgctctg 19480651  T
Q  267 gctttaaacggg-gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgg 314  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||    
T  19480652 gctttaaatgggtacccccgcacgtggacggtgggattggatccctcgg 19480700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 348
Target Start/End: Original strand, 27159150 - 27159283
Alignment:
Q  214 gattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctc 312  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||| | || || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27159150 gattccttttggtgccaattatggtgga-taagttcatgcagaactttgttcgggttttaaacggg-cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctc 27159247  T
Q  313 ggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
     ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  27159248 agattagtcgatctttggatcggatatcgagttttc 27159283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Original strand, 1818808 - 1818905
Alignment:
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    |||||||| | |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  1818808 catacagagcttgctttggctttaaac-gggcccccgcaagtaggtgacatgattggtcacatcggattagtcaattattggatcggataccgagtttt 1818905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 31162742 - 31162947
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||   |||| | ||| ||||||| || |||| |||||||||||||     
T  31162742 ataactcatttggggttgacctagtggttggtttgagatcttggattgtgtttctcttaaggttttaggctcgattcactctggtaccaatttcggtgga 31162841  T
Q  242 ctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    | | || ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |  ||| ||||||||  |||  |||| ||||| |||| |||| |||||    
T  31162842 c-aggtacatacagtgctttgctctagctttaaatggggcccacacaagtgagcagtgagattggtcatctctaattagtcgatccttgaatcggatacc 31162940  T
Q  341 gagtttt 347  Q
    |||||||    
T  31162941 gagtttt 31162947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 23041650 - 23041719
Alignment:
Q  278 ggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23041650 ggcctccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23041719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 47091684 - 47091733
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47091684 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgct 47091733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Original strand, 17447272 - 17447434
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  |||| | || |    
T  17447272 catttggggttggcccaatggttgatttgagatcttggagtgtgcttctctgaaggtctctggtttgattctctctggtgccaattttagtggac-aatt 17447370  T
Q  248 tcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
     |||||| || |||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17447371 ccatacaaagccttgctctggatttaaa-tggacccccgcaagtgggaggtgggatttgtcccct 17447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 348
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603994
Alignment:
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 14603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138185
Alignment:
Q  280 cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagtttt 35138185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315528
Alignment:
Q  297 tgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgattcttggatcggataccgagtttt 5315528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 6776201 - 6776277
Alignment:
Q  271 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  6776201 taaacggggcccccgcaagtaggcggtggaattgatccactcagattagtcgattattgtatcgaataccgaatttt 6776277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20999333 - 20999192
Alignment:
Q  177 ggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaac 275  Q
    |||||||||||| ||||| ||   || ||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||     
T  20999333 ggatcttggagtgtgcttttctcaagatctcaggctcaattctctgtggtaccaatttcggtgggct-agtccatacagagctttacgctggctttaaat 20999235  T
Q  276 ggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
      ||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20999234 aaggctccctcaagtggacggtggtattggacccctcggatta 20999192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 37349515 - 37349719
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||    | |||||||||||||| ||| |  |  |||||| ||||||    
T  37349515 ataactcatttggggttggtttagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctctcatgatctcaggttcgatttcctataatatcaattttggtggg 37349614  T
Q  242 ctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    | ||||| || ||||| |  |||||  ||||||| ||| ||| | ||||| || |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  37349615 c-aagtttattcagagttcagctctaactttaaatgggacccacacaagt-ggcggtgagattggtctcctcaaattaatcggttcttggatcgtatagc 37349712  T
Q  341 gagtttt 347  Q
    |||||||    
T  37349713 gagtttt 37349719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 6776139 - 6776187
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6776139 aacccatttggg-ttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgct 6776187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 305
Target Start/End: Original strand, 10059050 - 10059210
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||| |||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||   | ||||||||||  |||| || |  || |||||||| ||||| |    
T  10059050 acccttttgggattagcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctcaaagtctcaggtttaattctctctaatgtcaatttcgatgggc-a 10059148  T
Q  245 agttcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattgg 305  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || || ||||||||  ||||| |||||    
T  10059149 agttcatacagagttttgttttggctttaaacggagctcctgcaagtggacggtggaattgg 10059210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31383848 - 31383771
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31383848 ttggcttgggacctgggagtgtgctcctccttggggtctcaggttcgattctcttaggtgccaatttgggtgggctaa 31383771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Original strand, 36476851 - 36476960
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  || ||||||||  ||   |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  36476851 taactcatttggggttagtctagtggtttgtttgggattatgaagtttgctgatctcaaggtcctaggttcgatttcctttggtgtcaattttagtgggc 36476950  T
Q  243 taagttcata 252  Q
    ||| ||||||    
T  36476951 taaattcata 36476960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15786387 - 15786304
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaattt 234  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15786387 gggttggtctagtagtattggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctttggtgtcaattt 15786304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Original strand, 39012316 - 39012392
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||   |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39012316 gttggcttgggaccttggagtgtgctcttctcaaggtcttaggtttgattcccctcggtgccaatttcggtgggcta 39012392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43770168 - 43770120
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttg 191  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43770168 taacccatttgtggttgatctagtggttggcttgaaatcttggagtttg 43770120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20907407 - 20907349
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt 260  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20907407 aggtctcacgttcaattcactttggtgccaatttcagtggg-taagtccatacagagctt 20907349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 193
Target Start/End: Original strand, 52592557 - 52592603
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct 193  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52592557 ccatttagagttggtctagtggttggcttgagatcttagagtttgct 52592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 308
Target Start/End: Original strand, 47091742 - 47091779
Alignment:
Q  271 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47091742 taaacggagcccccgcaagtggggggtgggattggtcc 47091779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5285 - 5081
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5285 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 5186  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5185 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 5086  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  5085 ttttc 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15360301 - 15360097
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15360301 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 15360202  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15360201 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 15360102  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  15360101 ttttc 15360097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 34147339 - 34147544
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34147339 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 34147438  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34147439 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 34147538  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  34147539 gttttc 34147544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 34159955 - 34160160
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34159955 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 34160054  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34160055 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 34160154  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  34160155 gttttc 34160160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 9238969 - 9239171
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9238969 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggtt 9239068  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9239069 aagtccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 9239168  T
Q  344 ttt 346  Q
    |||    
T  9239169 ttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 347
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449068
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttc 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagtttt 11449068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 654349 - 654146
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  654349 aacccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 654250  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  654249 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgag 654150  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  654149 tttt 654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3222838 - 3222635
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3222838 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 3222740  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3222739 taagtccatacagagcttgctctgtctttaaacgggg-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 3222641  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  3222640 gttttc 3222635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21982521 - 21982320
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21982521 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaa 21982422  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21982421 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 21982323  T
Q  346 ttc 348  Q
    |||    
T  21982322 ttc 21982320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21148714 - 21148510
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21148714 taacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggc 21148615  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21148614 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacgggg-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccga 21148516  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  21148515 gttttc 21148510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5360274 - 5360071
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5360274 aacccatttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 5360175  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5360174 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgag 5360075  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  5360074 tttt 5360071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 1344934 - 1345133
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1344934 ccatttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 1345031  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1345032 tccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 1345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 9843935 - 9844136
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  9843935 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaag 9844034  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9844035 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9844134  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  9844135 tc 9844136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 11007158 - 11007363
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||    
T  11007158 taacccatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggc 11007257  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  11007258 taagtccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggataccta 11007357  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  11007358 gttttc 11007363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17081257 - 17081053
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17081257 aacccatttgaggttagtctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggct 17081158  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||    
T  17081157 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcgaataccgag 17081058  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  17081057 ttttc 17081053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Original strand, 28672060 - 28672264
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28672060 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggc 28672159  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  28672160 taagtccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccga 28672259  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  28672260 gtttt 28672264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 9208244 - 9208449
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9208244 ataacccatttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtggg 9208343  T
Q  242 ctaagttcatacagag-cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  9208344 c-aagtccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatcaaatacc 9208442  T
Q  341 gagtttt 347  Q
    |||||||    
T  9208443 gagtttt 9208449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690638
Alignment:
Q  152 tggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcat 251  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  252 acagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 9690638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390600
Alignment:
Q  190 tgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaag 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  290 tgggtggtgggattggtcccctcggattactcgatt 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 12390600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Original strand, 12591631 - 12591766
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  12591631 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggct 12591730  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591731 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggg 12591766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 14212885 - 14213080
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  14212885 taactcatttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggc 14212984  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||| |||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14212985 taagtccatataga----------gctttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccga 14213074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 11840915 - 11841097
Alignment:
Q  164 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgct 263  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  11840915 agtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaagcttgct 11841014  T
Q  264 ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11841015 ttggttttaaacgggg-ccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggataccgagtttt 11841097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 33499466 - 33499672
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttc-gattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33499466 ataacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgg 33499565  T
Q  241 gctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    ||| ||| |||||| | | ||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| || ||||    
T  33499566 gct-agtccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcagttgatggaccggatac 33499664  T
Q  340 cgagtttt 347  Q
    ||||||||    
T  33499665 cgagtttt 33499672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33718661 - 33718482
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||  ||    
T  33718661 aacccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaact 33718562  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    |||| |||||||||           ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33718561 aagtacatacagag-----------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcg 33718482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 13753234 - 13753346
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  13753234 aacccatttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 13753333  T
Q  244 aagttcatacaga 256  Q
    || | ||||||||    
T  13753334 aaatccatacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17149637 - 17149458
Alignment:
Q  166 tggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagag-cttgctc 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||     
T  17149637 tggttggtttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttggc-aagtccatacagagccttgctt 17149539  T
Q  265 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||  ||||||||||    
T  17149538 tggctttaaatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtcggtccttgaatcagataccgagtt 17149458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 22576059 - 22576150
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatt 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22576059 ataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Original strand, 10377714 - 10377911
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  10377714 atttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtc 10377812  T
Q  249 catacagagc-ttgctctggctttaaacgggg-cccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||    
T  10377813 catacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggataccgagtt 10377911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968078
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacagaacttactctg 28968123  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
     |||||||||| ||||  | || | || |||||||||||||||||    
T  28968122 cctttaaacggtgcccatgtaaataggcggtgggattggtcccct 28968078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15730594 - 15730495
Alignment:
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15730594 tcatacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggatatcgagtttt 15730495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17706489 - 17706318
Alignment:
Q  165 gtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctc 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||             ||||||    
T  17706489 gtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaa------------tttgctc 17706402  T
Q  265 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17706401 tggctttaaactgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggataccgaattttc 17706318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Original strand, 8479308 - 8479404
Alignment:
Q  146 cccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   || | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8479308 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggc 8479404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Original strand, 31039014 - 31039177
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  31039014 aacccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggct 31039113  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 308  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| | ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31039114 aagtccatacagagtttgctatggctatgaa-tggacccccacaagtgggcggtgtgattggtcc 31039177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14504170 - 14504082
Alignment:
Q  259 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  14504170 ttgctctggttttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatccttgtatcggataccgagtttt 14504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21903706 - 21903618
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggt-cccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  21903706 gctctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggatgcagagttttc 21903618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6384053 - 6383930
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctg 266  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||    
T  6384053 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttc-aatccctcgggtgccaatttcagtgggct-agtccataaagagctttgctttg 6383956  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgg 292  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6383955 gctttaaatgggacccccacaagtgg 6383930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 17420860 - 17420975
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgatt-ccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||    ||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  17420860 acccattcggggttggtctaatggttgacttgggatcttggagtgtactcctttcaaggtctttggtttgattcccctcttgtgccaatttcggtggg-t 17420958  T
Q  244 aagttcatacagagctt 260  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17420959 aagttcatacatagctt 17420975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 21182325 - 21182418
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||| |||| |||   || ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21182325 atttggggttgatctgattgttggcttgggattttggagtgtgctcctctcaagctctgagattcgattccctgtgatgccaatttcggtgggc 21182418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866212
Alignment:
Q  282 cccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaata 338  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatttttggatcaaata 27866212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 318
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596244
Alignment:
Q  285 gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 32596244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40059055 - 40058851
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40059055 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 40058956  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40058955 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 40058856  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  40058855 ttttc 40058851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 52983613 - 52983815
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52983613 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 52983712  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52983713 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 52983812  T
Q  344 ttt 346  Q
    |||    
T  52983813 ttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34844961 - 34844757
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34844961 aacccatttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 34844862  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34844861 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 34844762  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  34844761 ttttc 34844757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27528998 - 27528794
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27528998 aacccatctggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 27528899  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27528898 aagtccatacagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 27528799  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  27528798 ttttc 27528794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 32986191 - 32986395
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32986191 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggct 32986290  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  32986291 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggataccgag 32986390  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  32986391 ttttc 32986395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 46714386 - 46714591
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgatt-ccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46714386 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggc 46714485  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  46714486 taagtccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggataccga 46714585  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  46714586 gttttc 46714591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 477 - 764
Target Start/End: Original strand, 9811628 - 9811904
Alignment:
Q  477 tttcagctaagtattaacgtgatgaatactcaaaaattcagaaactcaaattaaaataagagtaatgagataacaaggagaaaatccaattaaaatattt 576  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811628 tttcaactaattattaacgtgatgaatactccgaaagtcagaaactcaagttaaaataagagtaatgagataacaaggagaaaatccaattaaaatattt 9811727  T
Q  577 cactatgtaaattgatacaagtcttggtacaagagggataggggccaccacatataagatgaatctccatcacacctcattcttattcttaataggcatt 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  9811728 cactatgtaaattgatacaagtctt-gtacaaga-ggata-gggccaccacatataagatgaacctccatcaca-ctcattcttattcttaata-gca-t 9811821  T
Q  677 taaattggcactctcagaggcaggttacatttaatcttgggagccgtaacatcatcttcaaggccctgatactgtaaatatcaccaac 764  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9811822 taaatt-gcactctcaggagcagttacca--taatctt-ggagccgtaacatcatcttcaa-gccctgatactgtaaatatcaccaac 9811904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5609405 - 5609201
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5609405 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 5609306  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5609305 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 5609206  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  5609205 ttttc 5609201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33696483 - 33696279
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33696483 taacccatttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggc 33696384  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  33696383 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggatatcga 33696284  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  33696283 gtttt 33696279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54127545 - 54127341
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54127545 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggct 54127446  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||    
T  54127445 aagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggatactgag 54127346  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  54127345 ttttc 54127341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19660736 - 19660531
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||     
T  19660736 taacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtggga 19660637  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19660636 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 19660537  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  19660536 gttttc 19660531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 20566346 - 20566547
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtc-tcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20566346 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaa 20566445  T
Q  246 gttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20566446 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagtt 20566545  T
Q  346 tt 347  Q
    ||    
T  20566546 tt 20566547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 25852208 - 25852412
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25852208 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25852307  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggcttt-aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  25852308 aagtccatacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggataccga 25852407  T
Q  343 gtttt 347  Q
    |||||    
T  25852408 gtttt 25852412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45787902 - 45787703
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  45787902 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagt 45787804  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45787803 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 45787704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20078163 - 20077986
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctgg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20078163 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 20078064  T
Q  268 ctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20078063 ctttaaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Original strand, 44343506 - 44343712
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggtt-ggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  44343506 taacctatttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtggg 44343605  T
Q  242 ctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccg 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  44343606 ctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccg 44343705  T
Q  342 agttttc 348  Q
    |||||||    
T  44343706 agttttc 44343712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990633
Alignment:
Q  203 gtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcgaatactgagttttc 32990633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36131714 - 36131509
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36131714 taacccatttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcc 36131615  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||    
T  36131614 taagtccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagataccga 36131515  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  36131514 gttttc 36131509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723996
Alignment:
Q  199 agaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  299 ggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 34723996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13873497 - 13873317
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13873497 acccatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggcta 13873398  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgatt 325  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||    
T  13873397 agttcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtcgatt 13873317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 1985830 - 1986031
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1985830 aacccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggct 1985929  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  1985930 aagtccatacagagtaaactctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat-ggataccgag 1986027  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  1986028 tttt 1986031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 332
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942552
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  249 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggat 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggat 32942552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229365
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatt-ccttctatgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  254 agagcttgctctggctttaaacggg-gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 35229365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35674944 - 35674749
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35674944 aacccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 35674845  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||       ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  35674844 aagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat-------ctcggattagtcgattctt-gatcggataccgag 35674753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Original strand, 51535611 - 51535818
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc----t 243  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    |    
T  51535611 catttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaatt 51535710  T
Q  244 aagttcatacagagctt---gctctggctttaaacggggccccc-gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatac 339  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  51535711 aagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggatac 51535810  T
Q  340 cgagtttt 347  Q
    ||| ||||    
T  51535811 cgaatttt 51535818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 144 - 293
Target Start/End: Original strand, 33992620 - 33992769
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33992620 aacccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 33992719  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggg 293  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33992720 aagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggg 33992769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Original strand, 13550205 - 13550404
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13550205 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 13550304  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13550305 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcgattaccgagttt 13550404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288054
Alignment:
Q  164 agtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgct 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  264 ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  49287972 atggctttaaac-gggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagatactgagtttt 49288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 612
Target Start/End: Original strand, 9805928 - 9806064
Alignment:
Q  475 tttttcagctaagtattaacgtgatgaatactcaaaaattcagaaactcaaattaaaataagagtaatgagataacaaggagaaaatccaattaaaatat 574  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9805928 tttttcaacaaattattaacgtgatgaatactcagaaattcagaaactcaaattaaaataagagtaatgagataaccaggagaaaatccaattaaaatat 9806027  T
Q  575 ttcactatgtaaattgatacaagtcttggtacaagagg 612  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9806028 tttactatgtaaattgatacaagtctt-gtacaagagg 9806064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18875720 - 18875516
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| || || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18875720 taacccatttgtggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggc 18875621  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||    
T  18875620 taagtccatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtcaatttttggatcagataccga 18875522  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  18875521 gttttc 18875516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22625273 - 22625097
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22625273 aacccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 22625174  T
Q  244 aagttcatacagagctt---------gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccct 311  Q
    |||| ||||||||||||         |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22625173 aagtccatacagagcttgctcagccagctctgcctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 22625097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Original strand, 34835527 - 34835726
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34835527 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 34835626  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaa-cggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
     ||||| |||||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34835627 ccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtggg-cgtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcgaatactgagttt 34835725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517654
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  301 attggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcg 9517654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391964
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| ||| |||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  7392044 gctttaaatgggaccccc-atagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggataccgagttttc 7391964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13584454 - 13584253
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  13584454 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 13584355  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  13584354 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttgaatcgaatactgagttt 13584255  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  13584254 tc 13584253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961753
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttc 249  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  250 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacgggg-ccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcgaataccgaattttc 55961753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574516
Alignment:
Q  188 tttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgca 287  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  || |  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  288 agtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggatactgagttttc 27574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21387637 - 21387486
Alignment:
Q  195 ctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggt 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  21387637 ctccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggc 21387538  T
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21387537 ggtggg--tggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccaagttttc 21387486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500059
Alignment:
Q  174 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  274 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||| | | ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagtttt 12500059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13771686 - 13771482
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||   ||||||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  13771686 aacccatttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtgggct 13771587  T
Q  244 aagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  13771586 aagtccatacgaagctatgctctggctttaaacggggctcccgcaagtggatgatgagattggtcccctataattagtcggttcttggatcggataccga 13771487  T
Q  343 gtttt 347  Q
     ||||    
T  13771486 atttt 13771482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20527212 - 20527035
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctgg 267  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |    
T  20527212 gttggtttgagattttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcg 20527113  T
Q  268 ctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
     ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20527112 gtttaaacaggg-ccccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatcaaataccgagttt 20527035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Original strand, 4911926 - 4912124
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||| || ||||     
T  4911926 gggttggcttagtggttgacttaagatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatat 4912025  T
Q  254 agagctt----gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4912026 agagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 4912124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43719264 - 43719154
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  43719264 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagt 43719165  T
Q  248 tcatacagagc 258  Q
     ||||||||||    
T  43719164 ccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 277
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351140
Alignment:
Q  157 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacaga 256  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  257 gcttgctctggctttaaacgg 277  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  2351120 gcttgttccggctttaaacgg 2351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30879345 - 30879165
Alignment:
Q  167 ggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctg 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||| || ||||||||    
T  30879345 ggttggtttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctg 30879246  T
Q  267 gctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  30879245 gctttaaa-gggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagataccgaattttc 30879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53787177 - 53787056
Alignment:
Q  228 ccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattc 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||     
T  53787177 ccaatttcggtgggctaagtccatgcggagctatgctctggctttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggattagtcccctcagattagtcggttt 53787078  T
Q  327 ttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  53787077 ttggatcgaataccgggttttc 53787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25969700 - 25969504
Alignment:
Q  150 tttggggttggtctagtggttggcttggg-atcttggagtttgcttctccagaggtctcag--gttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||   ||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  25969700 tttggggttggcctactggttgatttggggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aag 25969602  T
Q  247 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  25969601 tccatacagaacttgctctggctttaaac-gggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttgaatcggatactgagttt 25969504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22488146 - 22488027
Alignment:
Q  229 caatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| ||| | |||    
T  22488146 caatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtcctt 22488047  T
Q  329 ggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  22488046 ggatcggataccaagttttc 22488027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9646414 - 9646217
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    |||||||| ||| ||||| || || || |||||||  ||||| |||||    
T  9646414 atttggggttggtctagtggttggtttgggatctttgagtgtgctcctgtcaaggtctcatgtttgattctctctgatgacaatttcaatgggc-aagtt 9646316  T
Q  249 catacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  9646315 catacagtgctttgctctggcttagaaccgggccaccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcggtcattggatcgggtaccgagttt 9646217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 517 - 671
Target Start/End: Original strand, 9798739 - 9798886
Alignment:
Q  517 gaaactcaaattaaaataagagtaatgagataacaaggagaaaatccaattaaaatatttcactatgtaaattgatacaagtcttggtacaagagggata 616  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9798739 gaaactcaacttaaaataagagtaatgagataacaaggcaataacataattcaaatatttcactttgtaaactgatacaagtctt-gtacaaga-ggata 9798836  T
Q  617 ggggccaccacatataagatgaatctccatcacacctcattcttattcttaatag 671  Q
    |||    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  9798837 ggg----ccacgtataagatgaacctccatcac-tctcattattattcttaatag 9798886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 12710191 - 12710373
Alignment:
Q  162 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-tt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| || ||    
T  12710191 ctagtggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccctttaatgtcaatttcggtggac-aagtccatacagtgcttt 12710289  T
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    ||||||||||  |||   || |  ||||||| | || |||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  12710290 gctctggcttagaac--tgctctggcaagtgagcggagggattggtcacctcagattaatcggtccttggatcggataccgagttt 12710373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 347
Target Start/End: Original strand, 12824464 - 12824597
Alignment:
Q  214 gattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcg 313  Q
    |||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || || || ||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  12824464 gattccctcttgtgtcaattttgatgggctaagttcatatagagtttgctctagctttaaatggagctcctgcaagtggacggtgggattggtctcatcg 12824563  T
Q  314 gattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12824564 aattagtcgattcttggatcggatacggagtttt 12824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41621800 - 41621684
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  41621800 taacccatttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtgggc 41621701  T
Q  243 taagttcatacagagctt 260  Q
     || | ||||||||||||    
T  41621700 -aaatccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 446
Target Start/End: Original strand, 9805773 - 9805852
Alignment:
Q  369 cttgtttttatattctcattgttctc--tctccattgtttttgtcacaaaagaaaaaggaagaaaatattgtcctaaaat 446  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9805773 cttgtttctatattctcattgctctctctctccattgtttttatcacaaaagaaaaaggaagaaaatattgttctaaaat 9805852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 51595095 - 51595219
Alignment:
Q  223 tggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcg 322  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||| |||    
T  51595095 tggtgccaatttcgatggactaaatcaatagagaacttgctctgactttaaacgggatccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatcg 51595194  T
Q  323 attcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  51595195 attcttggatcggataccgagtttt 51595219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639821
Alignment:
Q  284 cgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645479
Alignment:
Q  284 cgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23645479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494685
Alignment:
Q  285 gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 52494685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158343
Alignment:
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggaaaccgagtttt 55158343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Original strand, 42245744 - 42245817
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccct 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  42245744 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccct 42245817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 4064981 - 4065057
Alignment:
Q  271 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  4064981 taaacggagcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggatatcgaatttt 4065057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9978585 - 9978509
Alignment:
Q  271 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9978585 taaatgggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggataccgagtttt 9978509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29875899 - 29875832
Alignment:
Q  223 tggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  29875899 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctgactttaaatggaacccccgcaagt 29875832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Original strand, 34722164 - 34722222
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagag 202  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34722164 aacctatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 40252295 - 40252486
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||          ||||||  |||||| |||    
T  40252295 ccatttggggttggtctagtagttgacttggaatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaagttcgattc---------tcaattttcgtgggc-aag 40252384  T
Q  247 ttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtt 345  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| || || |||||||||  |||||    
T  40252385 ttcatacagagcacaactctggctttaaatgggtcacccgcaagtgggcggtgagattggtctcctcaaattagtcggtttttagatcgaatattgagtt 40252484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43719155 - 43719086
Alignment:
Q  279 gcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43719155 gcccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggataccgaattttc 43719086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 348
Target Start/End: Original strand, 13017836 - 13017910
Alignment:
Q  273 aacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13017836 aacgggacccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatcg-ataccgagttttc 13017910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 28929730 - 28929876
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||||   |||||||  ||| |    
T  28929730 aggtctcaggttcgattcccctta-tgccaatttgggtggtctaagttcatacaaagctatgctttggctttaaatgaggcccattcaagtggacggttg 28929828  T
Q  300 gattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| | ||| |||   ||||||||||||    
T  28929829 gattggacccctcagattagtcggtccttagattagataccgagtttt 28929876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131435
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggataccgagttttc 23131435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4585803 - 4585732
Alignment:
Q  255 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattctt 328  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4585803 gagcttgctttggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgattctt 4585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 475 - 550
Target Start/End: Original strand, 9785624 - 9785696
Alignment:
Q  475 tttttcagctaagtattaacgtgatgaatactcaaaaattcagaaactcaaattaaaataagagtaatgagataac 550  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9785624 tttttcagctaattaataacgtga---atactcagaaattcatgaactcaaattaaaataagagtaatgacataac 9785696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 10125872 - 10125973
Alignment:
Q  202 ggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtggg 300  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  10125872 ggtcttaggtttgattccccctggtgccaatttcagtgggc-aaggccatacagagctttgctctagctttaaacgggg-ccctgcaagtgggcagtggg 10125969  T
Q  301 attg 304  Q
    ||||    
T  10125970 attg 10125973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13716572 - 13716450
Alignment:
Q  225 gtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcga 323  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||      
T  13716572 gtgccaatttcagtgggc-aagtccatacggaactttgctatgtctttaaacagggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcag 13716474  T
Q  324 ttcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||| |||| |||| |||||||    
T  13716473 ttcttgaatcggatactgagtttt 13716450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 284
Target Start/End: Original strand, 37455594 - 37455710
Alignment:
Q  168 gttggcttgggatctt-ggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctct 265  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| | |||| |||| || |||||    
T  37455594 gttggcttgggacctttggagtatgctcctctcaaggtctcaggttcgattcccct-ggtgccaatttcaatgggctaa-tccatatagagatttgctct 37455691  T
Q  266 ggctttaaacggggccccc 284  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  37455692 ggctttaaatggggccccc 37455710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 38869794 - 38869860
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaattt 234  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38869794 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8442114 - 8442049
Alignment:
Q  283 ccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||    
T  8442114 ccgcaagtgagttgtgggattggtctcctcggattagtcgattcctagatcggataccgaattttc 8442049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 17415678 - 17415790
Alignment:
Q  147 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 246  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||   | ||||| ||||||||  | | ||||| |||||| ||||||| |||    
T  17415678 ccatttaggcttggtctagtggttgacttgggatcttggagtgtgtcactcacaatgtctcgggttcgataacatctggtgtcaattttggtgggc-aag 17415776  T
Q  247 ttcatacagagctt 260  Q
    ||||||||||||||    
T  17415777 ttcatacagagctt 17415790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637852
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 17637852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630291
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc 22630291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Original strand, 28635726 - 28635799
Alignment:
Q  173 cttgggatcttggagtttgcttctccag-aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  28635726 cttgggatctgggagtgtgctcctcctggaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtgggctaa 28635799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 28791113 - 28791312
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgct-tctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    |||||||||||||||||||  ||  || |||| ||||||| |||| ||||   |||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  28791113 atttggggttggtctagtgactgatttaggatattggagtatgctctctcttaaggtcttaggttccattacctctggtgtcaatttcggtggg-taagt 28791211  T
Q  248 tcatacagagc-ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
      ||||| | | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||| ||||||| |  ||| |||| ||| | |||| |||| ||| |||||||    
T  28791212 ctatacaaaactttgctctggctttaaac-gggtctccacaagtgggcggtgagattggttctttcgaattagtcggtccttgaatcggatatcgagttt 28791310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 33289190 - 33289251
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33289190 caagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgggtttt 33289251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302684
Alignment:
Q  286 caagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggataccgaatttt 37302684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43352520 - 43352439
Alignment:
Q  151 ttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||   ||  |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  43352520 ttggggttggtctaatggttggcttgagatcatggagtttgctcctctcaagaactcaggttcgattctctctggtgtcaat 43352439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 31334545 - 31334617
Alignment:
Q  151 ttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattcccttt 223  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  31334545 ttggggttcgcctagtggttgatttgggatattggagtgtgcttctcttaaggtctcaagttcgattcccttt 31334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 45302837 - 45302929
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||| || | |||| |||||||||||    
T  45302837 catttggtgtttgtctaatggttggtttgagatcttggagtttgcttctctcaagttttcaggtttgattctctctagtgcaaatttcggtgg 45302929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Original strand, 13017745 - 13017831
Alignment:
Q  166 tggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatac 253  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13017745 tggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtctcaggttccattccctctgttgccaattttggtgggc-aagttcatac 13017831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 346
Target Start/End: Original strand, 24273276 - 24273418
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||||||||||||  || |||||| || |||||||||| || | |||||| | ||| ||| | | |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  24273276 tctcaggttcgattttctctggtgctaagttcggtgggcaaa-tccatacaaaactttgctatagttttaaatggggctctcgcaagtgggtggtaggat 24273374  T
Q  303 tggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    || |||| || ||||| ||| | ||||||||  |||||||||||    
T  24273375 tgatcccatcagattagtcggtccttggatcagataccgagttt 24273418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38740940
Alignment:
Q  201 aggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg 38740940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 39288917 - 39288987
Alignment:
Q  208 aggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggg 279  Q
    |||||| ||||||  || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39288917 aggttcaattcccactgatgtcaatttcggtgggc-aagtccatacagagcttgctctggcttagaacgggg 39288987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7949504 - 7949427
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccaga-ggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  7949504 ttggcttgggacctcggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgtcaatttaggtgggctaa 7949427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 40307535 - 40307631
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||||||||  |||  |||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||   ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40307535 taacccatttggaattgacctagtgtttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtctcatatttgattcc-tttggtgccaatttcggtgg 40307631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41621668 - 41621583
Alignment:
Q  261 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttt 346  Q
    |||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  41621668 gctctgactttaaatggggtccctacaagtgggtggtgggactaatcccctcagattagtcggtccttggatcggataacgagttt 41621583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 40319 - 40522
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40319 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 40418  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40419 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 40517  T
Q  344 ttttc 348  Q
    |||||    
T  40518 ttttc 40522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7512 - 7309
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7512 aacctatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggct 7413  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  7412 aagtccatacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaag 7313  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  7312 tttt 7309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9498 - 9299
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9498 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 9399  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9398 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 9300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12199 - 12019
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12199 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 12100  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttg 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  12099 ccatacagagcttgctctggctttaaatgggg-ccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1057
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1255 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 1156  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1155 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 348
Target Start/End: Original strand, 161828 - 162007
Alignment:
Q  169 ttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  161828 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 161927  T
Q  269 tttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161928 ttttaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 162007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53073 - 52870
Alignment:
Q  145 acccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggcta 244  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  53073 acccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaa 52974  T
Q  245 agttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagt 344  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  52973 aatccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagt 52874  T
Q  345 tttc 348  Q
    ||||    
T  52873 tttc 52870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 97569 - 97366
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  97569 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 97470  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||| || ||||||||    
T  97469 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggataccgag 97370  T
Q  344 tttt 347  Q
    ||||    
T  97369 tttt 97366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41848 - 41644
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||    
T  41848 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgc 41749  T
Q  243 taagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccga 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  41748 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggatacaga 41650  T
Q  343 gttttc 348  Q
    ||||||    
T  41649 gttttc 41644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10892 - 10694
Alignment:
Q  148 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10892 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 10793  T
Q  248 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10792 ccatacagagcttgctctggctttaaatgggg-ccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggataccgagtttt 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 14985 - 15174
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  14985 aacccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggtt 15084  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcg 334  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  15085 aagtccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtcaattcttggatcg 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13047
Alignment:
Q  209 ggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta---ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcc 13086  T
Q  309 cctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13085 cctcagattagttgattcttggatcggataccgagtttt 13047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 347
Target Start/End: Original strand, 66756 - 66951
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  66756 aacccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggct 66855  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  66856 aagt--------cgcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgag 66947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39290
Alignment:
Q  189 ttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaa 288  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  289 gtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 39290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32485
Alignment:
Q  204 tctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggatt 303  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  304 ggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 32485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 150 - 1
Alignment:
Q  155 ggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcataca 254  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  150 ggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccataca 51  T
Q  255 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattg 304  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  50 gagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 347
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20418
Alignment:
Q  174 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  274 acggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||| | | ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagtttt 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8612 - 8512
Alignment:
Q  142 ataacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  8612 ataacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 8513  T
Q  242 c 242  Q
    |    
T  8512 c 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8451
Alignment:
Q  285 gcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggataccgagtttt 8451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27966
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  27770 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggct 27869  T
Q  244 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgag 343  Q
    |||| |||||  ||||       ||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  27870 aagtccatacgaagct-----atgctttaaataggg-cgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagataccgag 27963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2426
Alignment:
Q  238 tgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaat 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||| ||    
T  2535 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggat 2436  T
Q  338 accgagtttt 347  Q
    ||||||||||    
T  2435 accgagtttt 2426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8382 - 8286
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8382 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29143
Alignment:
Q  149 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtt 248  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| || | |||   |||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||     
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcgg-taagtc 29242  T
Q  249 catacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatgga-cccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggataccgagtttt 29143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26746 - 26650
Alignment:
Q  144 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || |  |||||||||||||||    
T  26746 aacccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26654 - 26609
Alignment:
Q  295 ggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaatacc 340  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  26654 ggtggaattggtcccctcgaattagtcgatttttggatcgaatacc 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12958 - 12884
Alignment:
Q  143 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgatt 217  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12958 taacctatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 123131 - 123066
Alignment:
Q  281 ccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagtttt 347  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  123131 ccccacaagtgtgtggtgggattggtcccctcggattaatcga-tcttggatcggataccaagtttt 123066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15390 - 15296
Alignment:
Q  154 gggttggtctagtggt--tggcttgggatcttggagtttgcttctcca-gaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 245  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||    
T  15390 gggttggtctggtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctcggatgccaatttaggtgggctaa 15296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11517 - 11419
Alignment:
Q  251 tacagagctt-gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattactcgattcttggatcgaataccgagttttc 348  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||  |||| | | | ||||||||| ||||| |||||||    
T  11517 tacagagctttgccctggctttaaatggggtccccgcaagtggaagatgggattgatcccctcaaattagttggtccttggatcggataccaagttttc 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 72670 - 72561
Alignment:
Q  206 tcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagct-tgctctggctttaaacggggc--ccccgcaagtgggtggtgggat 302  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||   ||||||||    
T  72670 tcaggttcgattcccctttatgtcaattttggtgggctaagtccatacagagttatgctctggttttaaatagggcctccccacaagtgaacggtgggat 72571  T
Q  303 tggtcccctc 312  Q
    ||| ||||||    
T  72570 tggacccctc 72561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University