View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3395_low_3 (Length: 347)

Name: NF3395_low_3
Description: NF3395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3395_low_3
NF3395_low_3
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (9-343)||(12497799-12498133)
chr3 (9-343)||(14876744-14877078)
chr3 (9-347)||(17489401-17489739)
chr3 (9-347)||(16492422-16492760)
chr3 (9-346)||(9522270-9522607)
chr3 (9-343)||(16370964-16371298)
chr3 (9-343)||(16807171-16807505)
chr3 (9-343)||(16691711-16692045)
chr3 (21-347)||(10905773-10906099)
chr3 (9-347)||(15348486-15348824)
chr3 (21-347)||(10005163-10005489)
chr3 (9-347)||(15402751-15403089)
chr3 (21-347)||(48425010-48425336)
chr3 (9-346)||(15208442-15208779)
chr3 (21-347)||(13252253-13252579)
chr3 (21-347)||(15589633-15589959)
chr3 (21-347)||(16635336-16635662)
chr3 (21-347)||(43162660-43162986)
chr3 (9-346)||(15338820-15339157)
chr3 (21-347)||(20062295-20062621)
chr3 (9-347)||(53385259-53385597)
chr3 (16-347)||(26792640-26792971)
chr3 (9-347)||(5425171-5425508)
chr3 (9-326)||(15725195-15725512)
chr3 (9-347)||(16412523-16412861)
chr3 (9-347)||(6600298-6600636)
chr3 (36-346)||(15247725-15248035)
chr3 (9-347)||(16756826-16757164)
chr3 (27-317)||(15227228-15227518)
chr3 (36-311)||(13972386-13972661)
chr3 (9-313)||(14571409-14571713)
chr3 (45-343)||(15953202-15953500)
chr3 (10-313)||(47123506-47123809)
chr3 (27-311)||(13322918-13323202)
chr3 (10-313)||(10383531-10383834)
chr3 (148-346)||(15015986-15016184)
chr3 (36-311)||(14086261-14086536)
chr3 (27-317)||(18134606-18134896)
chr3 (9-326)||(10420296-10420613)
chr3 (75-313)||(12850543-12850781)
chr3 (9-342)||(11304008-11304341)
chr3 (24-313)||(16329923-16330212)
chr3 (45-317)||(8759342-8759614)
chr3 (45-317)||(13941621-13941893)
chr3 (45-317)||(41177119-41177391)
chr3 (27-313)||(12360806-12361092)
chr3 (24-313)||(11961298-11961587)
chr3 (45-343)||(16381164-16381459)
chr3 (36-340)||(16836747-16837045)
chr3 (9-317)||(44776808-44777116)
chr3 (170-345)||(8274642-8274817)
chr3 (170-343)||(16742948-16743121)
chr3 (246-334)||(17192892-17192980)
chr3 (9-153)||(31945033-31945177)
chr3 (9-151)||(31689049-31689191)
chr3 (170-343)||(15576472-15576645)
chr3 (170-345)||(13975288-13975463)
chr3 (184-331)||(18748401-18748548)
chr3 (269-334)||(6712663-6712728)
chr3 (6-62)||(320781-320836)
chr3 (300-343)||(6153096-6153139)
chr3 (9-70)||(12854365-12854426)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (9-343)||(23573606-23573940)
chr5 (9-347)||(23440089-23440427)
chr5 (9-347)||(23516405-23516743)
chr5 (9-346)||(25423053-25423390)
chr5 (9-343)||(18775641-18775975)
chr5 (9-346)||(21984490-21984827)
chr5 (44-343)||(20798659-20798958)
chr5 (23-346)||(26738890-26739213)
chr5 (9-347)||(14999923-15000261)
chr5 (9-343)||(22134532-22134866)
chr5 (9-347)||(19769824-19770162)
chr5 (9-343)||(22333075-22333409)
chr5 (9-347)||(27610218-27610556)
chr5 (21-347)||(40708656-40708982)
chr5 (9-347)||(27668674-27669012)
chr5 (9-347)||(27685584-27685922)
chr5 (21-347)||(34566370-34566696)
chr5 (9-346)||(23471093-23471430)
chr5 (21-347)||(16356378-16356704)
chr5 (9-347)||(27518271-27518609)
chr5 (9-347)||(41770706-41771044)
chr5 (9-343)||(37291684-37292018)
chr5 (9-347)||(20468280-20468618)
chr5 (34-347)||(22348314-22348625)
chr5 (9-343)||(29476261-29476595)
chr5 (91-346)||(21498221-21498476)
chr5 (9-250)||(20573385-20573626)
chr5 (21-223)||(21343666-21343868)
chr5 (27-312)||(24735830-24736115)
chr5 (27-312)||(24749773-24750058)
chr5 (27-343)||(21890947-21891263)
chr5 (36-343)||(23442481-23442788)
chr5 (46-317)||(21564180-21564451)
chr5 (9-271)||(21662300-21662561)
chr5 (27-305)||(24737011-24737289)
chr5 (27-345)||(22461816-22462134)
chr5 (9-317)||(28923982-28924290)
chr5 (10-313)||(37545714-37546018)
chr5 (10-313)||(14887209-14887512)
chr5 (9-317)||(28895156-28895464)
chr5 (10-313)||(25847922-25848225)
chr5 (9-343)||(20773606-20773940)
chr5 (45-271)||(21665761-21665986)
chr5 (10-313)||(20342129-20342432)
chr5 (6-317)||(22236134-22236445)
chr5 (24-343)||(22381060-22381379)
chr5 (24-313)||(24798615-24798904)
chr5 (24-232)||(21404715-21404923)
chr5 (24-313)||(22502540-22502829)
chr5 (27-343)||(20821317-20821633)
chr5 (221-346)||(21339471-21339596)
chr5 (24-343)||(23080277-23080596)
chr5 (45-317)||(17269547-17269819)
chr5 (170-331)||(11210894-11211055)
chr5 (170-345)||(21937374-21937549)
chr5 (170-345)||(27011091-27011266)
chr5 (245-343)||(23503525-23503623)
chr5 (170-334)||(24581218-24581382)
chr5 (264-343)||(21404939-21405018)
chr5 (9-97)||(21625382-21625470)
chr5 (279-313)||(21831961-21831995)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (9-343)||(24675052-24675386)
chr2 (9-341)||(22757011-22757343)
chr2 (9-346)||(21325809-21326146)
chr2 (9-343)||(24708028-24708362)
chr2 (9-343)||(23188571-23188905)
chr2 (33-346)||(23063664-23063977)
chr2 (15-347)||(21145572-21145904)
chr2 (9-320)||(23138600-23138911)
chr2 (9-320)||(23550390-23550701)
chr2 (21-347)||(16924835-16925161)
chr2 (21-347)||(16998575-16998901)
chr2 (21-347)||(16981727-16982053)
chr2 (21-347)||(17063292-17063618)
chr2 (9-347)||(24709596-24709934)
chr2 (9-347)||(44386111-44386449)
chr2 (21-347)||(9609711-9610037)
chr2 (9-347)||(22325398-22325736)
chr2 (9-347)||(24261933-24262271)
chr2 (9-347)||(24878537-24878875)
chr2 (21-347)||(27217591-27217917)
chr2 (9-347)||(27370832-27371170)
chr2 (9-259)||(27377101-27377351)
chr2 (21-347)||(10868425-10868751)
chr2 (21-347)||(17066953-17067276)
chr2 (24-343)||(30211463-30211782)
chr2 (9-317)||(23087013-23087321)
chr2 (108-347)||(24825824-24826063)
chr2 (29-343)||(45529100-45529408)
chr2 (36-312)||(27365656-27365932)
chr2 (10-313)||(31830222-31830525)
chr2 (24-313)||(11358450-11358739)
chr2 (9-186)||(41609047-41609224)
chr2 (10-313)||(20832549-20832852)
chr2 (9-317)||(23276339-23276647)
chr2 (27-313)||(23293539-23293825)
chr2 (10-313)||(1063315-1063618)
chr2 (45-317)||(27787340-27787612)
chr2 (189-345)||(22276022-22276178)
chr2 (45-317)||(12573952-12574224)
chr2 (47-286)||(24653946-24654185)
chr2 (24-106)||(24833356-24833438)
chr2 (269-330)||(27368391-27368452)
chr2 (45-217)||(24944966-24945138)
chr2 (170-345)||(12640463-12640638)
chr2 (170-345)||(24831731-24831906)
chr2 (189-331)||(25128390-25128532)
chr2 (9-53)||(45676685-45676729)
chr2 (184-343)||(24570214-24570373)
chr2 (246-331)||(23817611-23817696)
chr2 (9-52)||(23599834-23599877)
chr2 (200-334)||(22762124-22762258)
chr2 (267-334)||(14708908-14708975)
chr2 (30-70)||(17967577-17967617)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (9-347)||(21166982-21167320)
chr8 (9-343)||(19977965-19978299)
chr8 (9-343)||(30313593-30313927)
chr8 (9-343)||(15533378-15533712)
chr8 (9-343)||(16408494-16408828)
chr8 (9-347)||(21250940-21251277)
chr8 (9-343)||(32600142-32600476)
chr8 (9-347)||(21394310-21394648)
chr8 (9-347)||(21788803-21789141)
chr8 (9-347)||(22164636-22164974)
chr8 (9-347)||(23650039-23650377)
chr8 (9-343)||(22046372-22046705)
chr8 (9-347)||(22133486-22133824)
chr8 (9-347)||(21922180-21922518)
chr8 (9-347)||(17674468-17674806)
chr8 (9-318)||(22032030-22032339)
chr8 (21-347)||(19112700-19113026)
chr8 (9-347)||(20018195-20018533)
chr8 (9-347)||(19485315-19485653)
chr8 (9-346)||(22987199-22987536)
chr8 (9-343)||(22120623-22120957)
chr8 (9-250)||(15441179-15441420)
chr8 (24-346)||(20396571-20396893)
chr8 (9-276)||(23948887-23949154)
chr8 (156-346)||(22377899-22378089)
chr8 (156-346)||(22384074-22384264)
chr8 (45-317)||(20388133-20388405)
chr8 (27-313)||(20010379-20010665)
chr8 (9-343)||(21681919-21682253)
chr8 (27-343)||(20007866-20008182)
chr8 (9-343)||(23654925-23655259)
chr8 (27-336)||(19851427-19851736)
chr8 (27-336)||(19857463-19857772)
chr8 (10-313)||(6679110-6679413)
chr8 (9-313)||(22061912-22062216)
chr8 (10-313)||(804152-804455)
chr8 (27-313)||(1266255-1266541)
chr8 (9-343)||(21840415-21840749)
chr8 (10-313)||(14565141-14565444)
chr8 (27-343)||(21324858-21325175)
chr8 (10-313)||(6603657-6603960)
chr8 (24-313)||(29303905-29304194)
chr8 (27-343)||(31416923-31417239)
chr8 (45-317)||(31571317-31571589)
chr8 (9-283)||(16265127-16265401)
chr8 (24-313)||(12304771-12305060)
chr8 (10-286)||(28982356-28982632)
chr8 (10-286)||(28987576-28987852)
chr8 (249-347)||(23949158-23949256)
chr8 (170-343)||(20652782-20652955)
chr8 (10-221)||(27347225-27347436)
chr8 (170-313)||(22051022-22051165)
chr8 (170-331)||(21196963-21197124)
chr8 (170-345)||(16877542-16877717)
chr8 (184-345)||(22315364-22315525)
chr8 (170-334)||(22982595-22982759)
chr8 (170-345)||(21850784-21850959)
chr8 (287-347)||(18856853-18856913)
chr8 (244-334)||(24818074-24818164)
chr8 (269-334)||(23157469-23157534)
chr8 (9-41)||(22179309-22179341)
chr8 (269-337)||(25282389-25282457)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (11-343)||(278839-279171)
scaffold0005 (9-346)||(164715-165052)
scaffold0005 (9-343)||(308622-308956)
scaffold0005 (9-340)||(260271-260602)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (9-343)||(19864483-19864817)
chr6 (11-346)||(12497824-12498159)
chr6 (11-346)||(12510742-12511077)
chr6 (11-343)||(12505153-12505485)
chr6 (9-343)||(25765441-25765774)
chr6 (9-347)||(25610008-25610346)
chr6 (9-343)||(16963518-16963852)
chr6 (9-346)||(22078836-22079173)
chr6 (9-303)||(21833172-21833466)
chr6 (9-346)||(18408091-18408428)
chr6 (9-346)||(27331581-27331918)
chr6 (9-346)||(27392321-27392658)
chr6 (15-347)||(1543231-1543563)
chr6 (9-343)||(5839370-5839704)
chr6 (9-346)||(23078265-23078602)
chr6 (9-328)||(16927806-16928125)
chr6 (9-347)||(16626864-16627202)
chr6 (9-347)||(25112348-25112686)
chr6 (9-347)||(24313315-24313653)
chr6 (9-347)||(28263344-28263682)
chr6 (9-347)||(28342093-28342431)
chr6 (21-347)||(29592067-29592393)
chr6 (9-346)||(22762603-22762940)
chr6 (9-347)||(2874950-2875288)
chr6 (9-347)||(27187232-27187570)
chr6 (9-347)||(27261670-27262008)
chr6 (9-347)||(28292519-28292857)
chr6 (9-233)||(17032358-17032582)
chr6 (35-343)||(18197698-18198006)
chr6 (24-313)||(21471412-21471701)
chr6 (9-304)||(25750605-25750900)
chr6 (45-346)||(25768023-25768324)
chr6 (9-146)||(22433793-22433930)
chr6 (36-312)||(14131361-14131637)
chr6 (27-343)||(15459150-15459466)
chr6 (9-343)||(22796783-22797117)
chr6 (36-312)||(21564314-21564590)
chr6 (24-313)||(10469030-10469319)
chr6 (27-312)||(18794504-18794789)
chr6 (63-310)||(34645770-34646017)
chr6 (27-312)||(19879112-19879397)
chr6 (85-313)||(17415358-17415586)
chr6 (24-313)||(24364223-24364512)
chr6 (38-310)||(11287782-11288054)
chr6 (38-310)||(11280689-11280961)
chr6 (27-343)||(8766299-8766615)
chr6 (45-316)||(27560795-27561066)
chr6 (219-319)||(11291818-11291918)
chr6 (141-343)||(18800870-18801072)
chr6 (170-345)||(16382522-16382697)
chr6 (156-317)||(1640715-1640876)
chr6 (170-291)||(25750903-25751024)
chr6 (271-343)||(22433927-22433999)
chr6 (170-343)||(25743238-25743411)
chr6 (111-343)||(14381618-14381850)
chr6 (170-334)||(16098007-16098171)
chr6 (45-317)||(28282990-28283262)
chr6 (170-345)||(23996205-23996380)
chr6 (184-345)||(1648933-1649094)
chr6 (170-343)||(18838059-18838232)
chr6 (184-345)||(21413087-21413248)
chr6 (27-134)||(18787702-18787809)
chr6 (189-331)||(25655459-25655601)
chr6 (170-343)||(15078515-15078688)
chr6 (244-345)||(18571682-18571783)
chr6 (171-343)||(16233167-16233339)
chr6 (27-124)||(1640613-1640710)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (9-343)||(16355191-16355525)
chr4 (9-343)||(16252191-16252525)
chr4 (9-347)||(7090365-7090702)
chr4 (9-347)||(12523608-12523946)
chr4 (9-343)||(18227192-18227526)
chr4 (42-343)||(15149752-15150053)
chr4 (9-343)||(14680499-14680833)
chr4 (9-346)||(14652240-14652577)
chr4 (9-347)||(19778535-19778873)
chr4 (9-343)||(14159424-14159758)
chr4 (21-347)||(23955691-23956017)
chr4 (9-346)||(14851109-14851446)
chr4 (21-347)||(18297149-18297475)
chr4 (21-347)||(8386356-8386682)
chr4 (9-347)||(27711268-27711606)
chr4 (21-347)||(12476544-12476870)
chr4 (9-347)||(14266641-14266979)
chr4 (21-347)||(29039146-29039472)
chr4 (9-347)||(40472972-40473310)
chr4 (9-343)||(14303724-14304057)
chr4 (9-347)||(8053365-8053703)
chr4 (21-274)||(15364330-15364583)
chr4 (27-343)||(15003370-15003686)
chr4 (9-197)||(14927151-14927339)
chr4 (10-313)||(3264830-3265133)
chr4 (24-343)||(15070360-15070679)
chr4 (10-313)||(11207267-11207570)
chr4 (27-313)||(1649313-1649599)
chr4 (9-336)||(15245856-15246183)
chr4 (10-313)||(29453573-29453876)
chr4 (27-313)||(16145862-16146148)
chr4 (24-313)||(20890930-20891218)
chr4 (24-313)||(33222865-33223154)
chr4 (24-313)||(44661902-44662191)
chr4 (212-343)||(16676449-16676580)
chr4 (192-316)||(15415059-15415183)
chr4 (45-317)||(51606213-51606485)
chr4 (221-346)||(1640168-1640293)
chr4 (9-96)||(18607823-18607910)
chr4 (126-343)||(15359096-15359313)
chr4 (168-345)||(55375362-55375539)
chr4 (244-345)||(13247812-13247913)
chr4 (149-346)||(16752665-16752862)
chr4 (170-345)||(14997409-14997584)
chr4 (170-334)||(16445227-16445391)
chr4 (246-345)||(9291004-9291103)
chr4 (184-343)||(12132415-12132574)
chr4 (170-345)||(15293161-15293336)
chr4 (45-256)||(42702871-42703082)
chr4 (170-343)||(27900479-27900652)
chr4 (64-206)||(18164332-18164474)
chr4 (144-337)||(9849490-9849683)
chr4 (267-343)||(15077825-15077901)
chr4 (27-119)||(15415209-15415301)
chr4 (238-313)||(8706079-8706154)
chr4 (9-142)||(15319515-15319648)
chr4 (9-41)||(15351934-15351966)
chr4 (269-334)||(12342878-12342943)
chr4 (27-80)||(15359326-15359379)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (9-343)||(65369-65702)
scaffold0042 (9-217)||(39924-40132)
scaffold0042 (265-347)||(39824-39906)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (9-343)||(64040-64374)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (9-343)||(17331-17665)
chr7 (9-347)||(11553113-11553451)
chr7 (9-346)||(15154664-15155001)
chr7 (9-343)||(12687422-12687756)
chr7 (9-343)||(14954541-14954875)
chr7 (9-347)||(14332318-14332656)
chr7 (9-346)||(8707526-8707863)
chr7 (9-346)||(14037728-14038065)
chr7 (9-346)||(14347758-14348095)
chr7 (21-347)||(8198561-8198887)
chr7 (9-347)||(10870916-10871254)
chr7 (9-347)||(15161068-15161406)
chr7 (9-347)||(11237224-11237562)
chr7 (9-347)||(18551769-18552107)
chr7 (9-347)||(18177663-18178001)
chr7 (9-347)||(23516780-23517118)
chr7 (21-347)||(44791362-44791688)
chr7 (9-347)||(15203800-15204138)
chr7 (9-347)||(13685984-13686323)
chr7 (75-346)||(15624539-15624810)
chr7 (27-318)||(12206818-12207109)
chr7 (27-343)||(19147151-19147467)
chr7 (27-343)||(20746550-20746866)
chr7 (9-343)||(15102594-15102928)
chr7 (9-313)||(14264267-14264571)
chr7 (27-337)||(16072293-16072603)
chr7 (27-312)||(11388452-11388736)
chr7 (10-313)||(11306286-11306589)
chr7 (27-313)||(8212151-8212437)
chr7 (24-331)||(21661900-21662204)
chr7 (10-313)||(49152224-49152527)
chr7 (177-346)||(35964862-35965031)
chr7 (27-346)||(13665493-13665807)
chr7 (45-343)||(16950464-16950762)
chr7 (24-343)||(13021294-13021613)
chr7 (45-340)||(14286372-14286667)
chr7 (238-346)||(11772253-11772361)
chr7 (45-317)||(18053972-18054244)
chr7 (9-340)||(14129795-14130126)
chr7 (9-340)||(14433613-14433944)
chr7 (45-316)||(23199763-23200034)
chr7 (45-316)||(23505890-23506161)
chr7 (6-343)||(6413430-6413767)
chr7 (24-313)||(12455640-12455928)
chr7 (170-345)||(7823982-7824157)
chr7 (170-345)||(27107787-27107962)
chr7 (45-343)||(1400-1698)
chr7 (184-334)||(14936443-14936593)
chr7 (45-313)||(26288060-26288327)
chr7 (267-343)||(9596236-9596312)
chr7 (170-343)||(4440010-4440183)
chr7 (9-70)||(12254326-12254387)
chr7 (184-334)||(15364036-15364186)
chr7 (129-311)||(26118630-26118812)
chr7 (170-334)||(12368600-12368764)
chr7 (45-160)||(15340454-15340569)
chr7 (170-329)||(21674562-21674721)
chr7 (269-345)||(12193737-12193813)
chr7 (248-313)||(12456940-12457005)
chr7 (27-151)||(15479323-15479447)
chr7 (246-313)||(15340590-15340657)
chr7 (184-331)||(45146652-45146798)
chr7 (24-103)||(26118817-26118896)
chr7 (269-343)||(13378879-13378953)
chr7 (193-334)||(17145282-17145423)
chr7 (247-334)||(20466941-20467028)
chr7 (177-291)||(41213-41327)
chr7 (184-334)||(13353247-13353397)
chr7 (269-331)||(17923862-17923924)
chr7 (9-41)||(13634038-13634070)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (9-343)||(14323-14657)
scaffold0044 (9-336)||(583-910)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (9-346)||(639-976)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (9-343)||(17045093-17045427)
chr1 (9-346)||(20249797-20250134)
chr1 (9-347)||(19106314-19106652)
chr1 (9-347)||(20136725-20137063)
chr1 (9-346)||(21747482-21747818)
chr1 (9-345)||(50620320-50620656)
chr1 (9-347)||(16350673-16351011)
chr1 (9-347)||(33391103-33391441)
chr1 (9-343)||(16078730-16079045)
chr1 (9-347)||(19760940-19761278)
chr1 (9-347)||(21830250-21830588)
chr1 (9-347)||(51333567-51333905)
chr1 (9-347)||(41354543-41354881)
chr1 (9-346)||(21836897-21837234)
chr1 (32-346)||(16369267-16369581)
chr1 (9-235)||(50612602-50612828)
chr1 (9-163)||(21163227-21163381)
chr1 (27-343)||(19664954-19665270)
chr1 (45-346)||(20940138-20940439)
chr1 (10-313)||(37677027-37677331)
chr1 (27-345)||(20856837-20857155)
chr1 (27-343)||(19854279-19854595)
chr1 (24-313)||(20294374-20294663)
chr1 (24-313)||(31550289-31550578)
chr1 (9-331)||(22433206-22433528)
chr1 (24-313)||(20075167-20075456)
chr1 (128-313)||(41307891-41308076)
chr1 (144-313)||(11382676-11382845)
chr1 (170-345)||(20831468-20831643)
chr1 (45-299)||(20244183-20244437)
chr1 (75-343)||(20835966-20836237)
chr1 (10-220)||(20395194-20395404)
chr1 (170-345)||(46518829-46519004)
chr1 (170-343)||(20914318-20914491)
chr1 (184-337)||(21202371-21202524)
chr1 (9-103)||(24476927-24477021)
chr1 (269-331)||(22135648-22135710)
chr1 (170-230)||(22142232-22142292)
chr1 (244-328)||(20184364-20184448)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (9-346)||(5986-6323)
scaffold0120 (45-313)||(1563-1831)
scaffold0120 (170-343)||(22818-22991)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (9-347)||(5977-6315)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (9-343)||(33582-33916)
scaffold0109 (9-343)||(8559-8893)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (9-343)||(4414-4748)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (9-346)||(32758-33095)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-346)||(127205-127542)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (9-346)||(219423-219760)
scaffold0012 (9-346)||(229006-229343)
scaffold0012 (170-345)||(33002-33177)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-347)||(6335-6673)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (9-346)||(1102-1439)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (9-346)||(700-1036)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (9-347)||(5184-5522)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (9-343)||(180180-180514)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (9-346)||(829-1165)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (15-347)||(43123-43455)
scaffold0028 (9-343)||(8448-8782)
scaffold0028 (212-343)||(13832-13963)
scaffold0028 (36-311)||(50555-50830)
scaffold0028 (170-345)||(106580-106755)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (9-347)||(14002-14340)
scaffold0106 (9-346)||(31373-31710)
scaffold0106 (264-343)||(17660-17739)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-346)||(9306-9643)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (9-346)||(16471-16808)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (9-345)||(3995-4331)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (9-346)||(16950-17287)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (9-346)||(15456-15792)
scaffold0333 (223-346)||(15832-15955)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-346)||(3115-3440)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (21-346)||(26539-26864)
scaffold0011 (27-313)||(148551-148837)
scaffold0011 (9-343)||(195712-196045)
scaffold0011 (9-217)||(68575-68783)
scaffold0011 (170-334)||(121968-122132)
scaffold0011 (269-345)||(180147-180223)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (9-343)||(7340-7674)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (9-310)||(27930-28231)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (9-346)||(14840-15177)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (22-347)||(265-590)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (9-346)||(448022-448359)
scaffold0001 (9-329)||(162076-162396)
scaffold0001 (45-343)||(90941-91239)
scaffold0001 (170-343)||(78638-78811)
scaffold0001 (135-210)||(175352-175427)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (15-347)||(109816-110148)
scaffold0029 (27-312)||(112540-112825)
scaffold0029 (9-316)||(96038-96345)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (9-308)||(26-325)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (9-347)||(377-715)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (9-346)||(15085-15422)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (9-346)||(111984-112321)
scaffold0004 (9-310)||(203510-203811)
scaffold0004 (24-343)||(385797-386116)
scaffold0004 (10-343)||(117532-117865)
scaffold0004 (45-343)||(322703-323001)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-347)||(6900-7240)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (9-347)||(12982-13320)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (9-346)||(968-1304)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (24-347)||(116910-117233)
scaffold0037 (170-345)||(98139-98314)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (45-343)||(1-299)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (9-346)||(16422-16759)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (110-343)||(7854-8087)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (59-346)||(49506-49793)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (111-343)||(21932-22164)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (24-347)||(886-1209)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-347)||(25724-26047)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (9-231)||(16920-17142)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (24-346)||(5597-5918)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (123-346)||(9047-9270)
scaffold0507 (9-121)||(6940-7052)
scaffold0507 (170-331)||(354-515)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (24-343)||(86513-86832)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (24-317)||(25106-25399)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (36-343)||(26132-26439)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (27-317)||(10774-11064)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (171-347)||(7522-7698)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (45-343)||(3874-4172)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (9-343)||(9761-10090)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (45-346)||(5920-6220)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (45-343)||(47123-47421)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-343)||(13910-14244)
scaffold0034 (81-343)||(4962-5224)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (45-346)||(51869-52170)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (147-347)||(785-985)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (45-316)||(28805-29076)
scaffold0064 (45-316)||(40796-41067)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (9-343)||(18546-18880)
scaffold0326 (9-70)||(3637-3698)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (27-343)||(27500-27816)
scaffold0139 (9-313)||(1188-1491)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (9-343)||(14049-14382)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (36-343)||(21680-21987)
scaffold0235 (244-345)||(26004-26105)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (27-313)||(79-365)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (36-310)||(7078-7352)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (91-313)||(58445-58667)
scaffold0058 (46-313)||(19120-19387)
scaffold0058 (24-82)||(59042-59100)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (27-312)||(18830-19115)
scaffold0090 (129-312)||(23094-23277)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (45-337)||(5017-5309)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (9-313)||(39702-40006)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (45-313)||(2750-3018)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (36-343)||(1178-1485)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (9-343)||(13370-13704)
scaffold0298 (36-313)||(19973-20250)
scaffold0298 (9-343)||(17140-17474)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (45-343)||(37201-37499)
scaffold0026 (126-343)||(38183-38400)
scaffold0026 (126-313)||(27376-27563)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (27-343)||(10092-10408)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (56-343)||(4760-5047)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (9-343)||(10851-11185)
scaffold0124 (36-343)||(408-715)
scaffold0124 (170-334)||(7828-7992)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (9-343)||(49042-49376)
scaffold0053 (9-313)||(57856-58159)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (60-210)||(4567-4717)
scaffold0023 (246-346)||(4460-4560)
scaffold0023 (9-124)||(36974-37089)
scaffold0023 (264-345)||(58972-59053)
scaffold0023 (45-97)||(18993-19045)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (27-343)||(3872-4188)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (27-343)||(25874-26190)
scaffold0113 (24-313)||(16654-16943)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (36-311)||(33718-33993)
scaffold0076 (170-345)||(40382-40557)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (27-317)||(172-462)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (27-313)||(49246-49532)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (9-343)||(61222-61556)
scaffold0067 (9-343)||(52188-52522)
scaffold0067 (45-343)||(67610-67908)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (27-312)||(509-794)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (27-343)||(27207-27522)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (27-343)||(6164-6481)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (27-328)||(14275-14576)
scaffold0203 (27-160)||(9069-9202)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (36-254)||(1167-1385)
scaffold0165 (9-70)||(26203-26264)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (9-343)||(42342-42676)
scaffold0010 (9-343)||(47408-47742)
scaffold0010 (148-226)||(2252-2330)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (27-328)||(20103-20404)
scaffold0114 (12-331)||(43471-43790)
scaffold0114 (12-331)||(44483-44802)
scaffold0114 (27-210)||(36036-36219)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (24-313)||(16752-17041)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (10-313)||(38926-39229)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (24-313)||(26239-26528)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (45-313)||(248612-248880)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (45-340)||(12793-13088)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (47-313)||(42784-43050)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (9-256)||(4235-4482)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (261-347)||(3724-3810)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (170-343)||(1918-2091)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (170-345)||(3882-4057)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (170-345)||(46278-46453)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (45-187)||(2031-2173)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (45-225)||(13380-13560)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (9-205)||(136082-136278)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-106)||(6238-6333)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (170-345)||(23518-23693)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (189-343)||(395-549)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (177-343)||(1-167)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (45-342)||(7248-7543)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (144-313)||(5311-5480)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (170-334)||(3283-3447)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (184-343)||(1063-1222)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (170-345)||(28273-28448)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (170-343)||(13032-13205)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (9-70)||(7498-7559)
scaffold0101 (261-313)||(5491-5543)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (170-345)||(14744-14919)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (189-343)||(8238-8392)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (201-343)||(1243-1385)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (184-330)||(14661-14807)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (245-343)||(43737-43835)
scaffold0132 (170-343)||(14781-14954)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (170-322)||(940-1092)
scaffold1710 (264-343)||(107-186)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (170-334)||(24004-24168)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (184-343)||(13389-13548)
scaffold0021 (269-343)||(71442-71516)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (269-343)||(8900-8974)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (244-345)||(26164-26265)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (184-316)||(10493-10625)
scaffold0447 (184-316)||(5879-6011)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (184-343)||(9125-9284)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (244-343)||(1433-1532)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (184-334)||(3962-4112)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (36-133)||(45835-45932)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (184-316)||(8488-8620)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (171-331)||(10781-10941)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (264-343)||(3364-3443)
scaffold0222 (9-133)||(3487-3611)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (297-343)||(12738-12784)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (9-114)||(9182-9287)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (269-334)||(18332-18397)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (144-343)||(10867-11066)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (27-103)||(886-962)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (276-331)||(14367-14422)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498133
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12498133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876744
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 14876744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489739
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17489700  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17489701 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 17489739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492422
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16492461  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16492460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 16492422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522607
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 9522569  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9522570 atcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttg 9522607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371298
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16371263  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16371264 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 16371298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807171
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagt 16807171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692045
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 16692010  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16692011 attttctcttgaatcatcttaactttttcagtagt 16692045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906099
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10906072  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10906073 atcatctgaactttctcagtagtttgc 10906099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348486
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15348525  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15348524 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 15348486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005489
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10005462  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10005463 atcatctgaactttctcagtagtttgc 10005489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402751
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15402790  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15402789 attttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgc 15402751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425336
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 48425309  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48425310 atcatctgaactttctcagtagtttgc 48425336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208779
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||| |||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 15208779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252579
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||     
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttgg 13252552  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13252553 atcatctgaactttctcagtagtttgc 13252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589633
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 15589660  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15589659 atcatctgaactttctcagtagtttgc 15589633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635662
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16635635  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16635636 atcatctgaactttctcagtagtttgc 16635662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162986
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 43162959  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43162960 atcatctgaactttctcagtagtttgc 43162986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339157
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15339119  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15339120 atttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttg 15339157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062295
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 20062322  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20062321 atcatctgaactttctcagtagtttgc 20062295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385259
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 53385298  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53385297 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 53385259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792640
Alignment:
Q  16 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcg 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  116 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacagga 215  Q
     || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  216 gtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct 315  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  316 cttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 26792640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425171
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 5425171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725195
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 15725213  T
Q  309 atcttctcttgaatcatc 326  Q
    || |||||||| ||||||    
T  15725212 attttctcttggatcatc 15725195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412523
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttc 16412562  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16412561 attttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgc 16412523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600636
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 6600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 346
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248035
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      |||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  336 tcagtagtttg 346  Q
    |||||||||||    
T  15248025 tcagtagtttg 15248035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756826
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 16756826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227518
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972386
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
      |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571713
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||| || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  14571709 atctt 14571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953202
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||||| |||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| || ||  |||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagt 15953202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123809
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||  | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 47123805  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  47123806 tctt 47123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322918
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || |  | ||| ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    |||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13322918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383834
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| |||| || ||||| || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||  | ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 10383830  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  10383831 tctt 10383834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15015986
Alignment:
Q  148 gatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttg 247  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||| |||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  248 aaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttg 15015986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086536
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
      |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134606
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||| ||  |  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 18134606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420296
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | | || ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 10420314  T
Q  309 atcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||||||  |||||||    
T  10420313 atcttctctctaatcatc 10420296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850543
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtca 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||  ||| |||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  175 acttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  || | ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  275 atggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatctt 12850543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304008
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||    ||||||| ||| || ||  | || ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtag 342  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||    
T  11304041 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtag 11304008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329923
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||| | | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatctt 16329923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759342
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 8759342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941893
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 13941893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177391
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 41177391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360806
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||  | || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | || || || |||||||| ||||  |||| || ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatctt 12360806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961298
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || ||  | |||| ||| ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||| | ||||| || |||||||  ||||  |||| ||||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatctt 11961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381164
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  | || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgtagt 16381164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16837045 - 16836747
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |      | || ||||| || || |||| ||| | |||||||||||  |    
T  16837045 ggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaaccaactctatatgtcaccgttccaatcc 16836952  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||    
T  16836951 tctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatg 16836852  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      | || || |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||||    
T  16836851 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttc 16836752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777116
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |  || || || ||||||||||| ||||| ||  ||| ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||||||||| | ||| || ||  | || ||||| ||||||||  | || || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 44777107  T
Q  309 atcttctct 317  Q
    |||||||||    
T  44777108 atcttctct 44777116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8274817 - 8274642
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  8274817 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 8274718  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  8274717 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 8274642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16743121 - 16742948
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  ||||| |||||| ||| ||||| | |    
T  16743121 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctc 16743022  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16743021 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 16742948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 334
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192980
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 17192980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg 153  Q
    | |||  ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgata 151  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 15576472 - 15576645
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  15576472 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 15576571  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  15576572 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 15576645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13975463 - 13975288
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  13975463 agtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 13975364  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  13975363 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 13975288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748548
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||  | ||  ||||||||||||  |  || || | ||||||||| |||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaac 18748548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6712728 - 6712663
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6712728 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaacctt 6712663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 62  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6153139 - 6153096
Alignment:
Q  300 gacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6153139 gacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 6153096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573940
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23573905  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23573906 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 23573940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440427
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgc 23440427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516743
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgc 23516743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423390
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 25423352  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25423353 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 25423390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775975
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 18775940  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18775941 attctctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 18775975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984490
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 21984528  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21984527 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 21984490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798958
Alignment:
Q  44 aacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  144 atctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcctt 243  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738890
Alignment:
Q  23 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  123 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 222  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  223 tcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 322  Q
    ||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 26738914  T
Q  323 catcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagtttg 26738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999923
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14999962  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14999961 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 14999923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134866
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22134831  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22134832 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 22134866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770162
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 19770162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333075
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22333110  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||   || |||||||||||    
T  22333109 attttctcttggatcatccggactttctcagtagt 22333075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610556
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27610556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708982
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 40708955  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40708956 atcatctgaactttctcagtagtttgc 40708982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668674
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27668674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685584
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 27685623  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27685622 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27685584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566696
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 34566669  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34566670 atcatctgaactttctcagtagtttgc 34566696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471430
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttg 23471430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356704
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16356677  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16356678 atcatctgaactttctcagtagtttgc 16356704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518609
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27518570  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27518571 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27518609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41771044
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttc 41771005  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41771006 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 41771044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291684
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 37291719  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  37291718 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 37291684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468280
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgc 20468280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 347
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348625
Alignment:
Q  34 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  134 tctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacg 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  234 tggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacct 333  Q
    ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  334 tctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||    
T  22348612 tctcagtagtttgc 22348625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476261
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttc 29476296  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||  ||| || ||||||||    
T  29476295 attttctcttggatcatccgaactttttcagtagt 29476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21498476 - 21498221
Alignment:
Q  91 aaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaa 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21498476 aaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 21498377  T
Q  191 agcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgt 290  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||  |||| ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21498376 ttcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttttgt 21498277  T
Q  291 cgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21498276 cgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 21498221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaa 250  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  221 tct 223  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735830
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 24735830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749773
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 24749773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890947
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||| ||| || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagt 21890947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442481
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||   || ||||| |||||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||| ||||||||||||||| ||  | | ||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      |||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  336 tcagtagt 343  Q
    || |||||    
T  23442488 tctgtagt 23442481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564180
Alignment:
Q  46 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || | |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttct 245  Q
    |||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctct 21564180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    || |||||||||||| | |||||| ||  || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737011
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgct 305  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462134
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  327 ttaaccttctcagtagttt 345  Q
    || || ||||| |||||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagttt 22462134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28923982
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28923991  T
Q  309 atcttctct 317  Q
    |||||||||    
T  28923990 atcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545714
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  210 acaggagtgactctca-aaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    | ||||||||| |||| |||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttc 37545719  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  37545718 atctt 37545714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887209
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 14887213  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  14887212 tctt 14887209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895156
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28895165  T
Q  309 atcttctct 317  Q
    |||||||||    
T  28895164 atcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848225
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     ||||  || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||||||||||||||| || ||  | || || |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 25848221  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  25848222 tctt 25848225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773940
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||| | ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20773905  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||| |||||    
T  20773906 atcttctctctaatcatcttgactttctctgtagt 20773940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| ||  || ||||    
T  21665886 tctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342432
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||| |||||||||| ||| || ||  | |  || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 20342428  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  20342429 tctt 20342432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236134
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggta 105  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  106 atcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacacc 205  Q
    | || |||| ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  206 agtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgct 305  Q
     |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  306 ttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||    
T  22236145 ttcatcttctct 22236134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381379
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 22381359  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||||||||||||    
T  22381360 attttgaccttctcagtagt 22381379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798615
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || ||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatctt 24798615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404923
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | || |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  224 caaaaacac 232  Q
     ||||||||    
T  21404915 aaaaaacac 21404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502829
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 22502829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821633
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || || | || ||||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 20821616  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
     |||| ||||| |||||    
T  20821617 ctaactttctctgtagt 20821633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339471
Alignment:
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttg 21339471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080277
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||  ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    |||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatc 23080297  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23080296 atcttgactttctcagtagt 23080277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269547
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 17269547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11211055 - 11210894
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| |||||| || | |    
T  11211055 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctc 11210956  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11210955 ttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 11210894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21937549 - 21937374
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  21937549 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 21937450  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21937449 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 21937374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 27011091 - 27011266
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  27011091 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 27011190  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27011191 ttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 27011266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 343
Target Start/End: Original strand, 23503525 - 23503623
Alignment:
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23503525 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 23503623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 24581218 - 24581382
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || | |||||||||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  24581218 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 24581317  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24581318 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 24581382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Original strand, 21404939 - 21405018
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21404939 ctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagt 21405018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatg 97  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21831995 - 21831961
Alignment:
Q  279 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21831995 taactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 21831961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675386
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 24675351  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24675352 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 24675386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22757011
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagta 341  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagta 22757011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325809
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttg 21325809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708028
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttc 24708063  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24708062 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 24708028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188905
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23188870  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23188871 attttctcttgaatctatttaaccttctcagtagt 23188905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 346
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063977
Alignment:
Q  33 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 132  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  133 ctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  233 gtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  333 ttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||    
T  23063964 ttctcggtagtttg 23063977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145572
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  115 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacagg 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  315 tcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgc 21145572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138911
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23138899  T
Q  309 atcttctcttga 320  Q
    ||||| ||||||    
T  23138900 atcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550701
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23550689  T
Q  309 atcttctcttga 320  Q
    ||||| ||||||    
T  23550690 atcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925161
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16925134  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16925135 atcatctgaactttctcagtagtttgc 16925161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998901
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16998874  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16998875 atcatctgaactttctcagtagtttgc 16998901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982053
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16982026  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16982027 atcatctgaactttctcagtagtttgc 16982053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063618
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17063591  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17063592 atcatctgaactttctcagtagtttgc 17063618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709934
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24709895  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24709896 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 24709934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386111
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
     | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 44386111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9610037
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 9610010  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9610011 atcatctgaactttctcagtagtttgc 9610037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325398
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22325437  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22325436 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 22325398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262271
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24262232  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24262233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 24262271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878537
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24878576  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  24878575 attttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgc 24878537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217917
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgt 27217890  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27217891 atcatctgaactttctcagtagtttgc 27217917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371170
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| |||||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 27371131  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27371132 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27371170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868751
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||     
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttgg 10868724  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10868725 atcatctgaactttctcagtagtttgc 10868751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067276
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaag-tgcgacacatgaaaaacgt-gtgc-aattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17067249  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17067250 atcatctgaactttctcagtagtttgc 17067276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211463
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    ||   |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  30211482 aacttaaccttctcagtagt 30211463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087321
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  309 atcttctct 317  Q
    |||||||||    
T  23087313 atcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24826063 - 24825824
Alignment:
Q  108 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24826063 cccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccag 24825964  T
Q  208 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgcttt 307  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |   ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24825963 tcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgcttt 24825864  T
Q  308 catcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24825863 catcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgc 24825824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529408
Alignment:
Q  29 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtt 128  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  129 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  229 acacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 328  Q
    |||| |||      |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatgg------tcttcaaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  329 aaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| ||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagt 45529408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365656
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
      |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 27365656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830525
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||  | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 31830521  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  31830522 tctt 31830525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358450
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||| | || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11358450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgact 186  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832852
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttca 20832848  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  20832849 tctt 20832852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276647
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| ||||  | ||||| || |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| | ||||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 23276638  T
Q  309 atcttctct 317  Q
    |||||||||    
T  23276639 atcttctct 23276647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293825
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 23293825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063618
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 1063614  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  1063615 tctt 1063618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787612
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 27787612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 345
Target Start/End: Original strand, 22276022 - 22276178
Alignment:
Q  189 aaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctttt 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  22276022 aaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttct 22276121  T
Q  289 gtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  22276122 gtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 22276178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574224
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  || || || || | ||| || ||  | || ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 12574224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 286
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  47 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  |  | || |||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  147 tgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctt 286  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833356
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaa 24833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945138
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || |  || |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 217  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 24945138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12640638 - 12640463
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| ||  ||||  | |||||||||| ||| || || | |    
T  12640638 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctc 12640539  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  12640538 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 12640463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24831906 - 24831731
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||  | | |    
T  24831906 agtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctc 24831807  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  24831806 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 24831731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 331
Target Start/End: Original strand, 25128390 - 25128532
Alignment:
Q  189 aaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctttt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||  || || || |  | |||||| |||||||| |    
T  25128390 aaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactcttct 25128489  T
Q  289 gtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128490 gtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 25128532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570214
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagt 24570214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23817696 - 23817611
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23817696 tgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaac 23817611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 52  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22762258 - 22762124
Alignment:
Q  200 aacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 299  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||||||  | | ||| ||||| |||||||| |  | ||||||     
T  22762258 aacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctga 22762159  T
Q  300 gacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762158 gacgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 22762124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 334
Target Start/End: Original strand, 14708908 - 14708975
Alignment:
Q  267 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14708908 cgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaacctt 14708975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  30 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166982
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 21166982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978299
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19978264  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19978265 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 19978299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313593
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 30313628  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313627 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 30313593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533712
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15533677  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15533678 atcttctcttgtatcattttaactttctcagtagt 15533712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408494
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 16408529  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16408528 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 16408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251277
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 21251239  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21251240 atc-tctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 21251277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600476
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 32600441  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600442 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 32600476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394310
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21394349  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21394348 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 21394310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788803
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21788842  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21788841 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 21788803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164636
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22164675  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22164674 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 22164636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650377
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttt 23650338  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650339 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 23650377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046705
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttc 22046670  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22046671 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 22046705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133486
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22133525  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22133524 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 22133486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922180
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttc 21922219  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21922218 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgc 21922180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674468
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 17674468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032339
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22032329  T
Q  309 atcttctctt 318  Q
    || |||||||    
T  22032330 attttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19113026
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 19112999  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19113000 atcatctgaactttctcagtagtttgc 19113026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018195
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20018234  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20018233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 20018195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485315
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgc 19485315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987536
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttg 22987536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120623
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||||||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22120658  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  22120657 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagt 22120623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396571
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |  || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttg 20396571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949154
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcat 23949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377899
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttg 22377899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384074
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttg 22384074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388405
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||| ||| ||||||||||| |  |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010379
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 20010379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681919
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 21681954  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  21681953 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 21681919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008182
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||  | | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagt 20008182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655259
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||| |  |||  |||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||  ||  |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttc 23655224  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  23655225 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 23655259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 336
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851736
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatc 19851726  T
Q  327 ttaaccttct 336  Q
    || |||||||    
T  19851727 ttgaccttct 19851736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 336
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857772
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatc 19857762  T
Q  327 ttaaccttct 336  Q
    || |||||||    
T  19857763 ttgaccttct 19857772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679413
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6679409  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  6679410 tctt 6679413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061912
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| |||||| ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22061917  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  22061916 atctt 22061912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804152
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 804156  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  804155 tctt 804152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266541
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 1266541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840749
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||  || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
     | |||||| ||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttt 21840714  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  21840715 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 21840749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565444
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 14565440  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  14565441 tctt 14565444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324858
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaa-gatgcggtggtaatcccactcgatacgccacc 125  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || || |||| ||| |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  126 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 225  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  226 aaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcat 21324876  T
Q  326 cttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  21324875 cttgactttctctgtagt 21324858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603960
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || || |||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6603956  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  6603957 tctt 6603960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303905
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||| ||| || || |||||||||||||| || |   | | |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatctt 29303905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416923
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  | |||| ||| ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    ||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatc 31416940  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || |||||||||||    
T  31416939 ttgactttctcagtagt 31416923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571317
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || ||  | || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 31571317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    || ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305060
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||| |||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     | ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12305060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctt 286  Q
    |  |||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 286
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctt 286  Q
    |  |||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949256
Alignment:
Q  249 aactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgc 23949256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20652955 - 20652782
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| || ||  | ||  |||||||||| | ||| ||||| | |    
T  20652955 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctc 20652856  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20652855 ttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagt 20652782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||  ||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  210 acaggagtgact 221  Q
    | ||||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 22051022 - 22051165
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| || ||  | || ||||||||||||||  | || || |||    
T  22051022 agtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgc 22051121  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051122 ttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 22051165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21197124 - 21196963
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||  | ||| | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  21197124 agtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctc 21197025  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||| |||||| | || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21197024 ttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 21196963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16877717 - 16877542
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| ||  ||||  | |||||||||| ||| || || | |    
T  16877717 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctc 16877618  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16877617 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 16877542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315525
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || || || | ||||||||| |||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagttt 22315525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 22982595 - 22982759
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||| || | ||||| |||||| | ||  | ||  | |||||||||| ||||||||  |      
T  22982595 agtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacctt 22982694  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22982695 ttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 22982759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21850959 - 21850784
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||  | | |    
T  21850959 agtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctc 21850860  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21850859 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 21850784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856913
Alignment:
Q  287 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgc 18856913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24818164 - 24818074
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||||||  |||||| || | || ||||||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24818164 cttgaaactcagtatctttccttctctcatcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaacctt 24818074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157469
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||| |||||| | | || | |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaacctt 23157469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 337
Target Start/End: Original strand, 25282389 - 25282457
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 337  Q
    ||||| ||| |||||||| || | |||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25282389 cttattatgataactcttctgcctactccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttctc 25282457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278839
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 278839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164715
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 164715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308956
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 308921  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  308922 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagt 308956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260602
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  ||||| || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
      |||| ||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||| ||||||||||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 260570  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
    ||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  260571 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagt 260602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864817
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 19864817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498159
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccc 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12498123  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12498124 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 12498159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510742
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccc 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12510778  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12510777 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 12510742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505485
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccc 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12505452  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12505453 attctcttgaatcatcttaacattctcagtagt 12505485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765441
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagt 25765441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25610008
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 25610047  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25610046 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 25610008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963518
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagt 16963518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078836
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 22078874  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22078873 atcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttg 22078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833172
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408091
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttc 18408129  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18408128 atcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttg 18408091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331581
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27331619  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27331618 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttg 27331581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392321
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27392359  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27392358 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttg 27392321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543231
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  115 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacagg 214  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 314  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  315 tcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 1543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839370
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagt 5839370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078602
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttc 23078564  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23078565 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 23078602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927806
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  309 atcttctcttgaatcatctt 328  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctt 16927806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626864
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16626903  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  16626902 attttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgc 16626864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112686
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttta 25112647  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25112648 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgc 25112686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313315
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 24313354  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24313353 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 24313315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263344
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 28263344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342093
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 28342093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592067
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29592094  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29592093 atcatctgaactttctcagtagtttgc 29592067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762603
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttc 22762641  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22762640 atcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttg 22762603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874950
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 2874989  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2874988 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgc 2874950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187570
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27187570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261670
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27261670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292519
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 28292519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacg 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197698
Alignment:
Q  35 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaact 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  135 ctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgt 234  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  235 ggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |   ||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  335 ctcagtagt 343  Q
    |||||||||    
T  18197706 ctcagtagt 18197698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471701
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||| || || || |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 21471701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750900
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgc 304  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768324
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 344  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||| ||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagtt 25768322  T
Q  345 tg 346  Q
    ||    
T  25768323 tg 25768324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 146
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433930
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131361
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
      ||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459466
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 15459449  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
     | || ||||| |||||    
T  15459450 ctgactttctccgtagt 15459466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796783
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttc 22796818  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| ||    ||||||||||||||||| |||||    
T  22796817 atcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagt 22796783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564314
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
      |||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatct 21564314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469030
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 10469030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794789
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 18794789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645770
Alignment:
Q  63 gacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 162  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  163 atctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttt 262  Q
    |  | | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  263 tctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
     |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879397
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||||| || || || ||||| || ||||| | || |||||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatct 19879397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 17415358 - 17415586
Alignment:
Q  85 aattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttga 184  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||    
T  17415358 aattcagaagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttaga 17415457  T
Q  185 ctttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactc 284  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||    
T  17415458 cttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactc 17415557  T
Q  285 ttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||    
T  17415558 ttctgtcgactctacgacgctttcatctt 17415586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364512
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| |  ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 24364512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287782
Alignment:
Q  38 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctt 137  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  138 tccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgga 237  Q
    || ||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||      
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  238 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280689
Alignment:
Q  38 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctt 137  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  138 tccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgga 237  Q
    || ||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||||| ||||| ||      
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  238 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766299
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| || |  |||| || ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagt 8766299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560795
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 27560795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  219 actctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  319 g 319  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 343
Target Start/End: Original strand, 18800870 - 18801072
Alignment:
Q  141 gatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactc 240  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||  ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  | |    
T  18800870 gatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccc 18800969  T
Q  241 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||| ||    
T  18800970 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 18801069  T
Q  341 agt 343  Q
    |||    
T  18801070 agt 18801072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16382697 - 16382522
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  16382697 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 16382598  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16382597 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 16382522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640876
Alignment:
Q  156 ccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaa 255  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 291
Target Start/End: Original strand, 25750903 - 25751024
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||| ||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25750903 agtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgc 25751002  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtc 291  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  25751003 ttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22433999
Alignment:
Q  271 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 22433999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25743411 - 25743238
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  25743411 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 25743312  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25743311 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 25743238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14381850 - 14381618
Alignment:
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  14381850 actctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 14381751  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
     |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14381750 taggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcat 14381651  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  14381650 cttttctcttatcatcttgactttctctgtagt 14381618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 16098007 - 16098171
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  16098007 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 16098106  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16098107 ttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 16098171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282990
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 28282990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 23996205 - 23996380
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  23996205 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 23996304  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  23996305 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 23996380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648933
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 1648933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18838232 - 18838059
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| ||||||||| | || | ||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  18838232 agtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 18838133  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| | |  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18838132 ttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 18838059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21413087
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||  ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagttt 21413087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787809
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactg 18787801  T
Q  127 ttccaact 134  Q
    ||||||||    
T  18787802 ttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 331
Target Start/End: Original strand, 25655459 - 25655601
Alignment:
Q  189 aaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctttt 288  Q
    |||||||| ||||||||||| |   || | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||| ||| |||||||| |    
T  25655459 aaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttct 25655558  T
Q  289 gtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655559 gtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 25655601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15078688 - 15078515
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || ||  | ||  | |||||||| | ||| |||||   |    
T  15078688 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctcttc 15078589  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  15078588 ttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagt 15078515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 18571682 - 18571783
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18571682 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagt 18571781  T
Q  344 tt 345  Q
    ||    
T  18571782 tt 18571783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 343
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233339
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||| |  |||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  271 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagt 16233339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640710
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccac 124  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355191
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 16355191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252191
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttt 16252226  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252225 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 16252191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090702
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttc 7090663  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090664 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 7090702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523946
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12523907  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12523908 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 12523946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227192
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18227227  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18227226 attttctcttgaatcatcttaactttcttagtagt 18227192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149752
Alignment:
Q  42 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  142 atatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  242 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagta 341  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  342 gt 343  Q
    ||    
T  15149753 gt 15149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680833
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 14680798  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14680799 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 14680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652577
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 14652577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778535
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 19778535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159758
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagt 14159758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23956017
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 23955990  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23955991 atcatctgaactttctcagtagtttgc 23956017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851109
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttg 14851109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297475
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 18297448  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18297449 atcatctgaactttctcagtagtttgc 18297475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386682
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8386655  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8386656 atcatctgaactttctcagtagtttgc 8386682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711606
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27711567  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27711568 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 27711606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476870
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 12476843  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  12476844 atcatctgaacttcctcagtagtttgc 12476870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266641
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgc 14266641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039146
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29039173  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29039172 atcatctgaactttctcagtagtttgc 29039146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473310
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 40473271  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  40473272 attttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgc 40473310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303724
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 14303759  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  14303758 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagt 14303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053365
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8053404  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8053403 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 8053365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003370
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagt 15003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgt 197  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264830
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 3264834  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  3264833 tctt 3264830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070679
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  || ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||| ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    || |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15070659  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  15070660 atcttgaccttctccgtagt 15070679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207267
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11207271  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  11207270 tctt 11207267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649313
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || || ||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 1649313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246183
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||  || ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||| || ||||||| ||| || ||  |||| || ||||||||||   | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15246155  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttct 336  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||    
T  15246156 atcttttctcttatcatctttaccttct 15246183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453573
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 29453577  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  29453576 tctt 29453573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146148
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  |  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16146148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891218
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || ||||  | ||| ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaa-cccatcctatatgcca 20891028  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | |||||||| || || || |||||||||| |||||||||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20891218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223154
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 33223154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661902
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| |  ||||| |||||||| |||| |||||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 44661902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676449
Alignment:
Q  212 aggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagt 16676449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15415183 - 15415059
Alignment:
Q  192 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtc 291  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15415183 gcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 15415084  T
Q  292 gactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15415083 gactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606213
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 51606213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640168
Alignment:
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttg 1640168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagat 96  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359096
Alignment:
Q  126 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 225  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  226 aaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || ||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcat 15359114  T
Q  326 cttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  15359113 ctttaccttctccgtagt 15359096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 55375539 - 55375362
Alignment:
Q  168 gaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctac 267  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  55375539 gaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 55375440  T
Q  268 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  55375439 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagttt 55375362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 13247812 - 13247913
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13247812 cttgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 13247911  T
Q  344 tt 345  Q
    ||    
T  13247912 tt 13247913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 346
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752862
Alignment:
Q  149 atacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttga 248  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||  | || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  249 aactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtttg 16752862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 14997409 - 14997584
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  14997409 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 14997508  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14997509 ttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 14997584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16445391 - 16445227
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| || || |||||||||||| | || || |||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  16445391 agtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 16445292  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16445291 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 16445227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 345
Target Start/End: Original strand, 9291004 - 9291103
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  9291004 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 9291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132415
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||  ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 12132415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15293336 - 15293161
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| || || ||| |||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || |      
T  15293336 agtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctt 15293237  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15293236 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagttt 15293161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  245 ttgaaactcaag 256  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 27900479 - 27900652
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| | ||||  |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27900479 agtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgc 27900578  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  27900579 ttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 27900652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  64 acacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 163  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  164 tctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacacca 206  Q
      | | ||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9849683 - 9849490
Alignment:
Q  144 atctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcctt 243  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  ||  ||||      
T  9849683 atctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccga 9849584  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 337  Q
    ||||||| |||| ||| || ||  | ||||||||  ||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9849583 cttgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctc 9849490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 343
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077901
Alignment:
Q  267 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 15077901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415209
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatac 119  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || |||| ||||| || ||||||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctatac 15415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 8706079 - 8706154
Alignment:
Q  238 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8706079 ctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatctt 8706154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319648
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| |||  ||||||| | ||| || |    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccga 142  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaactctctccga 15319648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12342943 - 12342878
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  12342943 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaacctt 12342878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatca 80  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65702
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 65667  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65668 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 65702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  209 cacaggagt 217  Q
    |||||||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39824
Alignment:
Q  265 tacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgc 39824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64040
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 64040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17331
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 17366  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17365 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 17331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553113
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 11553152  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11553151 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 11553113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154664
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttc 15154702  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15154701 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 15154664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687756
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12687721  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12687722 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12687756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954875
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14954840  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14954841 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 14954875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332656
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14332617  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14332618 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 14332656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707863
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8707825  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8707826 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 8707863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038065
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14038027  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14038028 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttg 14038065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348095
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14348057  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14348058 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttg 14348095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198887
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8198860  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8198861 atcatctgaactttctcagtagtttgc 8198887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871254
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 10871254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161068
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15161107  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15161106 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 15161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237224
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 11237263  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||  ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11237262 attctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgc 11237224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551769
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18551808  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18551807 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 18551769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18178001
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18177962  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18177963 attttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgc 18178001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516780
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgc 23516780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791362
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 44791389  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44791388 atcatctgaactttctcagtagtttgc 44791362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204138
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15204099  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  15204100 atcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgc 15204138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686323
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaa-catcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaat 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||  |||||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  108 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccag 207  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  208 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgcttt 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgcttt 13686283  T
Q  308 catcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13686284 cattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 13686323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 346
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624810
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtca 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  175 acttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 274  Q
    | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  275 atggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttg 15624810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206818
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    || ||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 318  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 12206818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147467
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 19147450  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  19147451 ttgaccttctccgtagt 19147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746866
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20746849  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  20746850 ttgaccttctccgtagt 20746866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102594
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 15102629  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  15102628 attttttctcttatcatcttgactttctctgtagt 15102594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264267
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14264272  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  14264271 atctt 14264267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072293
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 16072304  T
Q  327 ttaaccttctc 337  Q
    || ||||||||    
T  16072303 ttgaccttctc 16072293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388452
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11388536 gaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 11388452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306286
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11306290  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  11306289 tctt 11306286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212151
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 8212151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 331
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662204
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||   |||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |  |||||||| ||||  || ||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctc---cttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  324 atcttaac 331  Q
    | ||||||    
T  21662197 aacttaac 21662204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152527
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||  | || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 49152523  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  49152524 tctt 49152527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35965031 - 35964862
Alignment:
Q  177 ttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    |||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35965031 ttctttgattttagcgcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcat 35964932  T
Q  277 ggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35964931 gataactcttttgtctactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttg 35964862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665807
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||     | ||  | | |||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  || | ||||||||||||||  | || |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13665787  T
Q  327 ttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  13665788 ttgactttctctgtagtttg 13665807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950464
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  | || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| || |||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagt 16950464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021613
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||||||  | | |||| ||||| | ||||| || ||||||   || || |||| ||||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    || ||| || ||  | || ||||||||||| ||  | ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 13021593  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13021594 atcttgaccttctcagtagt 13021613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286372
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  || |  || |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||  | || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagt 14286372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11772361 - 11772253
Alignment:
Q  238 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11772361 ctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttctc 11772262  T
Q  338 agtagtttg 346  Q
    |||||||||    
T  11772261 agtagtttg 11772253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053972
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || ||  | || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 18053972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130126
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||  || ||  | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || ||  | || || |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14130094  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
    ||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  14130095 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagt 14130126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433944
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||  || ||  | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || ||  | || || |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14433912  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
    ||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  14433913 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagt 14433944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199763
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505890
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||  | || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413767
Alignment:
Q  6 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggta 105  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  106 atcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacacc 205  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||| || || || ||||||| || |||||| ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  206 agtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgct 305  Q
     |||| |||||| || |||| |||||| ||  | || || ||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T
Q  306 ttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| || ||    |||||||| || |||||||||||    
T  6413730 ttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagt 6413767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455928
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || || | || ||| ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | |||| |||||| || || ||||||||| ||||||| ||  | | | |||||||| | ||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 12455928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 7823982 - 7824157
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  7823982 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 7824081  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7824082 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 7824157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27107962 - 27107787
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  27107962 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 27107863  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27107862 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 27107787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1400
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| |||||  | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||| ||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| || ||  | || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagt 1400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936593
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 14936593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288060
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| || |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||||| |||||| ||| | | |||||||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 26288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 343
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596312
Alignment:
Q  267 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagt 9596312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 4440010 - 4440183
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || || || | |    
T  4440010 agtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctc 4440109  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4440110 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 4440183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364186
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 15364186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118630
Alignment:
Q  129 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 228  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  229 acacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    | || ||  | || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatc 26118630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12368764 - 12368600
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||| | |||||||  |||||| || | |||||||||||||||||  | ||  | ||||| |||| ||| ||||| | |    
T  12368764 agtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctc 12368665  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12368664 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaacctt 12368600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  145 tctgatacggaccaat 160  Q
    ||||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21674721 - 21674562
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| ||  | ||  ||||||| ||||  || || || | |    
T  21674721 agtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctc 21674622  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctta 329  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674621 ttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 12193737 - 12193813
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||| |||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12193737 cttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagttt 12193813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457005
Alignment:
Q  248 aaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12457005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479323
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgata 151  Q
    |||||||||| || || ||||||||    
T  15479347 ttccaactctctcagagatctgata 15479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340657
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 15340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146798
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||| ||  | ||  |||||||| |||  || || |||| ||||| ||| |||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||| | |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 45146798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118817
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgg 26118817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 13378879 - 13378953
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13378879 cttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 13378953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17145423 - 17145282
Alignment:
Q  193 cacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcg 292  Q
    ||||||||||||| || |||  | | ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||| ||| ||  | | ||||||||| |||||||| || |     
T  17145423 cacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttctgcct 17145324  T
Q  293 actctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17145323 actctgagaagctttcatattttcttgaatcatcttcacctt 17145282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 334
Target Start/End: Original strand, 20466941 - 20467028
Alignment:
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20466941 gaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataactattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt 20467028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41213
Alignment:
Q  177 ttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  277 ggtaactcttttgtc 291  Q
    | || ||||| ||||    
T  41227 gatagctcttctgtc 41213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353397
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||  |  | ||   ||| |||||||  || || || | ||||||||| |||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||| ||   |||||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaacctt 13353397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 17923862 - 17923924
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||  ||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17923862 cttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 17923924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14657
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14622  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14623 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 14657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Original strand, 583 - 910
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 882  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttct 336  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  883 attttctcttggatcatctgaactttct 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 639 - 976
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 938  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  939 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045093
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17045128  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045127 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 17045093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250134
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 20250096  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20250097 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 20250134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106652
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19106613  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19106614 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 19106652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137063
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 20137024  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137025 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 20137063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747818
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21747780  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747781 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 21747818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620320
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 50620357  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620356 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 50620320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350673
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16350712  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16350711 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 16350673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391103
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 33391142  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33391141 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 33391103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078730
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||                   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc-------------------ctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16078765  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16078764 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 16078730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760940
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgc 19760940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830588
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21830549  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21830550 attttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgc 21830588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333567
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 51333606  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51333605 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 51333567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354543
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    || |||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgc 41354543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837234
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttc 21837196  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    || |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  21837197 attttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttg 21837234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 346
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369581
Alignment:
Q  32 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttcca 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  132 actctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 231  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  232 cgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    | ||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  332 cttctcagtagtttg 346  Q
    ||| ||| |||||||    
T  16369567 cttttcaatagtttg 16369581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 163  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664954
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagt 19664954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940138
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  | || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 344  Q
     |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || |||||  |||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtt 20940140  T
Q  345 tg 346  Q
    ||    
T  20940139 tg 20940138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677331
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     ||||  || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  210 acaggagtgactctcaa-aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    | ||||||||| ||||| ||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 37677326  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  37677327 atctt 37677331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856837
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||| | ||||| |||||| |||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatc 20856856  T
Q  327 ttaaccttctcagtagttt 345  Q
    || || ||||| |||||||    
T  20856855 ttgactttctccgtagttt 20856837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854595
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19854578  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  19854579 ttgactttctctgtagt 19854595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294663
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20294663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550289
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatctt 31550289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433206
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||| || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| ||| |||| || || || |||||||||| ||| || ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || ||||  ||||| ||  | || || |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22433229  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||| |||   |||||||||||    
T  22433228 atcttttctctgatcatcttaac 22433206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075167
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||  ||| ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     | ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatctt 20075167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308076
Alignment:
Q  128 tccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaa 227  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| || |||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  228 aacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 41308076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 313
Target Start/End: Original strand, 11382676 - 11382845
Alignment:
Q  144 atctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcctt 243  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||  | || |    
T  11382676 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccct 11382775  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11382776 cctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11382845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20831643 - 20831468
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  20831643 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 20831544  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20831543 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 20831468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || || |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| ||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgc 299  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835966
Alignment:
Q  75 acatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtca 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  175 acttcttt---gactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 271  Q
    |||||||    ||||| || | |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  | || || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  272 atcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 20835966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| |||||  |||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | | |||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  210 acaggagtgac 220  Q
    | |||||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 46518829 - 46519004
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  46518829 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 46518928  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  46518929 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 20914318 - 20914491
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| |      
T  20914318 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctccat 20914417  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||| ||| |||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20914418 ttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 20914491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||| |||||||||||| || | |||| | |||||||||||||  ||  | ||  | |||||||||| ||| ||| | | ||||||||| |||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 337  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477021
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtgg 103  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtgg 24477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135648
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaac 22135648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22142292 - 22142232
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaac 230  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22142292 agtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 328
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184448
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 328  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||  |||||||| || | |||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatctt 20184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6323
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttc 6285  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6286 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 6323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1563
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||| || ||  || |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 22818 - 22991
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||  |||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  22818 agtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 22917  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22918 ttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 22991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6315
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33582
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 33582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8893
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8858  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8859 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 8893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4414
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 4449  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4448 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 4414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32758
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttc 32796  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32795 atcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttg 32758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127205
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttc 127243  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127242 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 127205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219423
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 219423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229343
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||| |||||||||||||||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
     | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 229305  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229306 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 229343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33177 - 33002
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  33177 agtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 33078  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  33077 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 33002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6673
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6634  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6635 atctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgc 6673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1439
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttc 1401  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1402 atcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 700
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 738  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  737 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5522
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 5483  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5484 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgc 5522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180514
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 180479  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  180480 atcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagt 180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 829
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||||||||  ||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttg 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43455
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  115 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacagg 214  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 314  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  315 tcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8782
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8747  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8748 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 343
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13963
Alignment:
Q  212 aggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50555
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
      |||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 106755 - 106580
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  106755 agtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 106656  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| ||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  106655 ttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagttt 106580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14340
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14301  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14302 atcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgc 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31710
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 31672  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||  ||||||||    
T  31673 atcttttctctgatcatcttgactttctatgtagtttg 31710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Original strand, 17660 - 17739
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagt 17739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9643
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttc 9605  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9606 atcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttg 9643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16471
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 16509  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16508 atcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 16471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4331
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17287
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttc 17249  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17250 atcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtttg 17287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15792
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15754  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15755 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttg 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15955
Alignment:
Q  223 tcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 322  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  323 catcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttg 15955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 346
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3440
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgg 3414  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3415 atcatcttaaccttctcagtagtttg 3440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26539
Alignment:
Q  21 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  121 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 220  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  221 tctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 320  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 26565  T
Q  321 atcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26564 atcatcttaaccttctcagtagtttg 26539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148837
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  | || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 148837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195712
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttc 195747  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  195746 atcttctctatgatcatcttgactttctctgtagt 195712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68575
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  209 cacaggagt 217  Q
    || ||||||    
T  68583 cataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 122132 - 121968
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  122132 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 122033  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  122032 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaacctt 121968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180223
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 180223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7674
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 7639  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7640 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 7674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15177
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 15177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 265
Alignment:
Q  22 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  122 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 221  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  222 ctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 321  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  322 tcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagtttgc 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448359
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 448359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162396
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 162375  T
Q  309 a-tcttctcttgaatcatctta 329  Q
    | |||| |||| ||||||||||    
T  162376 actctt-tcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90941
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||| ||| |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 90941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 78811 - 78638
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  78811 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 78712  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||| || || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  78711 ttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagt 78638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  135 ctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109816
Alignment:
Q  15 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactc 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  115 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacagg 214  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  215 agtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 314  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttc 109849  T
Q  315 tcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  109848 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 109816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112825
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96038
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||  | | |||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 96046  T
Q  309 atcttctc 316  Q
    ||||||||    
T  96045 atcttctc 96038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 26
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 377 - 715
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
     | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15085
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttg 15085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112321
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttg 112321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203510
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttc 203512  T
Q  309 at 310  Q
    ||    
T  203511 at 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386116
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||  || ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    || ||| |  ||  |||| ||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 386096  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  386097 atcttaaccttctccgtagt 386116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117865
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttca 117831  T
Q  310 tcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  117832 tcttctctctgatcatcttgactttctccgtagt 117865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323001
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| || || ||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  | || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagt 323001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7240
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaaga-tgcggtggtaat 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  108 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccag 207  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  208 tcacaggagtgactctcaaaa-acacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 7199  T
Q  307 tcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7200 tcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgc 7240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 12982
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13021  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13020 atcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgc 12982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 968 - 1304
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttc 1267  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    |  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1268 actttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagtttg 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116910
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    |||||| || ||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgc 116910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 98139 - 98314
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  98139 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctc 98238  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  98239 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 98314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 1 - 299
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagt 299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16422
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | ||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||   |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 16422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8087
Alignment:
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  310 tcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 8087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 59 - 346
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49793
Alignment:
Q  59 ttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacca 158  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  159 ataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagat 258  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  259 cttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttg 49793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 343
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22164
Alignment:
Q  111 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  211 caggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  311 cttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagt 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Original strand, 886 - 1209
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
      ||||| ||||||||||||||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgc 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25724
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |  ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
     ||||| || |||  |||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgc 25724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaaca 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5597
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | || ||||||||||  || || ||||||| |||| |||| |||| || ||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
    | |||||||||||| || |||||    
T  5619 aacttaaccttctctgttgtttg 5597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 123 - 346
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9270
Alignment:
Q  123 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 222  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  223 tcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 322  Q
    ||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  323 catcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttg 9270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7052
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  109 ccactcgatacgc 121  Q
    |||||||||||||    
T  7040 ccactcgatacgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 354
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| || || | |    
T  515 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctc 416  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  415 ttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86513
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 323  Q
     |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  324 atcttaaccttctcagtagt 343  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  86532 aacttaaccttctcagtagt 86513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25106
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
     | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 25106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26439
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  336 tcagtagt 343  Q
    || |||||    
T  26432 tccgtagt 26439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10774
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| ||| ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7698
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  271 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgc 7698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4172
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||  |||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10090
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||| |     | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 10055  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  10056 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5920
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||| || |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 344  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||| || ||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtt 5922  T
Q  345 tg 346  Q
    ||    
T  5921 tg 5920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47421
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || | |||||| || |||| |||||| ||  |||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 47421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13910
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13945  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| ||    |||||||| || |||||||||||    
T  13944 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagt 13910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4962
Alignment:
Q  81 tgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttct 180  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  181 ttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggta 280  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  |  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  281 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 4962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51869
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| |||||| ||||  | | |||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 344  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  345 tg 346  Q
    ||    
T  51870 tg 51869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 785
Alignment:
Q  147 tgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  347 c 347  Q
    |    
T  785 c 785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28805
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40796
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18546
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||||||||||  |||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 18581  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  18580 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 18546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27816
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  27800 ttgactttctctgtagt 27816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1188
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||   || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||| ||| ||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 1193  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  1192 atctt 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14382
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||   || ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14347  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  14348 atcttttctcttatcatcttgacattctccgtagt 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21680
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||  ||| | |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
    |   || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || |||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  336 tcagtagt 343  Q
    ||||||||    
T  21687 tcagtagt 21680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26105
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 26103  T
Q  344 tt 345  Q
    ||    
T  26104 tt 26105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Original strand, 79 - 365
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||| || ||  |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatctt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7078
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 310  Q
      |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 58667 - 58445
Alignment:
Q  91 aaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |     
T  58667 aaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttcag 58568  T
Q  191 agcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgt 290  Q
     ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  58567 tgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttgt 58468  T
Q  291 cgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  58467 ctactatgcgacgctttcatctt 58445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19387
Alignment:
Q  46 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  146 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttct 245  Q
    |||||||| |||||| ||| | | |||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||  | || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatctt 19387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatg 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19115
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    | |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatct 19115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 312
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23277
Alignment:
Q  129 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 228  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  229 acacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatct 23277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5017
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||   || ||||  |||||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||  |||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 337  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctc 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Original strand, 39702 - 40006
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||  |||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 40001  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  40002 atctt 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3018
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatctt 3018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1178
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || | |   || ||||| |||||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   || ||||| ||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttattatcttgaccttc 1186  T
Q  336 tcagtagt 343  Q
    || |||||    
T  1185 tccgtagt 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13370
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| ||||| | ||| || ||  | || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13405  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  13404 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 13370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20250
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | | ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
      |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatctt 20250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17140
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || || | ||| || ||  | || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17175  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  17174 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 17140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37499
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||   | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||| |||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagt 37499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38183
Alignment:
Q  126 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 225  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  226 aaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  326 cttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  38200 cttgactttctccgtagt 38183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27376
Alignment:
Q  126 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 225  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  226 aaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     ||| || ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatctt 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10092
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  | || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  10108 ttgactttctctgtagt 10092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 343
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5047
Alignment:
Q  56 aagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgga 155  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  156 ccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaa 255  Q
    ||||| ||  | | |||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||  |||| |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  256 gatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagt 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11185
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || || | ||| || ||  | || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 11150  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  11151 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 11185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 408
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 335  Q
      | || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  336 tcagtagt 343  Q
    || |||||    
T  415 tctgtagt 408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7992 - 7828
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  7992 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 7893  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7892 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49042
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| ||||| || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||   || ||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || ||| || ||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttc 49077  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  49076 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 49042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57856
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| |||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    ||  ||||| ||||||||||| || ||  | || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttc 57861  T
Q  309 atctt 313  Q
    |||||    
T  57860 atctt 57856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  60 tgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaa 159  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  160 taaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4460
Alignment:
Q  246 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  346 g 346  Q
    |    
T  4460 g 4460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  109 ccactcgatacgccac 124  Q
    | ||| ||||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59053
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttt 59053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatg 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4188
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| || || ||  | |||   || ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  4172 ttgactttctccgtagt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25874
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatc 25891  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||| |||||    
T  25890 tttaccttctccgtagt 25874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16943
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    |  ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 16943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33718
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  236 gactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
      |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 40382 - 40557
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  40382 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 40481  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  40482 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 40557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || || |||| ||| ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||  |||| || |||||||| | ||| |||| |||||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 317  Q
    ||| || ||| | || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49246
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    |||||| ||  | || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 49246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61222
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 61257  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  61256 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 61222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52188
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 52223  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  52222 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 52188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67610
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||| ||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| || ||  | || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 67610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 509 - 794
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 312  Q
     ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatct 794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27522
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||   ||| |||||||| |||||  | || |||||||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  327 ttaaccttctcagtagt 343  Q
    || || ||||| |||||    
T  27506 ttgactttctccgtagt 27522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6481
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| | | ||| || || | || ||| ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  227 -aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 325  Q
     ||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  326 cttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| || |||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagt 6481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14275
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    ||| || ||  | || || | |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  327 tt 328  Q
    ||    
T  14276 tt 14275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9069
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaat 160  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaat 9069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 254
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  136 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 235  Q
    | |  |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  236 gactccttcttgaaactca 254  Q
      |||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42342
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 42377  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  42376 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 42342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47408
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 308  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||  | || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 47443  T
Q  309 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  47442 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 47408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  148 gatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 328
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20404
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 226  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  227 aaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 326  Q
    |||||| ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  327 tt 328  Q
    ||    
T  20403 tt 20404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43790
Alignment:
Q  12 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  112 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcac 211  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | || || || |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  212 aggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    |||||| || |||| |||||| ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    || |||   |||||||||||    
T  43771 ttttctctgatcatcttaac 43790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44802
Alignment:
Q  12 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  112 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcac 211  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | || || || |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  212 aggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 311  Q
    |||||| || |||| |||||| ||  | || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  312 ttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    || |||   |||||||||||    
T  44783 ttttctctgatcatcttaac 44802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  127 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtca 210  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16752
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||  | | |||||||||  | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatctt 16752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38926
Alignment:
Q  10 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcc 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  110 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtc 209  Q
     |||| ||| ||||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  210 acaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttca 309  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||  | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  310 tctt 313  Q
    ||||    
T  38929 tctt 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 313
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26528
Alignment:
Q  24 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 123  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||  ||| ||| ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  124 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 223  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  224 caaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    || ||| || ||  | || || |||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 26528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248880
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  |||||||| | || || |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || ||  | || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 248880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12793
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||| ||| |||||| |||| || ||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||  | || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagt 340  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagt 12793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 313
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43050
Alignment:
Q  47 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  | || || |||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  147 tgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttctt 246  Q
    |||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| || ||  | || || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  247 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatctt 43050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagt 208  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || |  || |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  209 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaag 256  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3724
Alignment:
Q  261 tttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgc 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgc 3724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 1918 - 2091
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || ||| ||    
T  1918 agtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctatgc 2017  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||| ||| |||| |||||    
T  2018 ttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctcttatcatcttgaccctctccgtagt 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4057 - 3882
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  |  |  | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  4057 agtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcctc 3958  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3957 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 3882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 46278 - 46453
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  46278 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 46377  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  46378 ttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2031
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactt 187  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagactt 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || | ||| |||||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 225  Q
    ||||||||  |||||| ||  | | |||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacacc 205  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6333
Alignment:
Q  11 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaa 106  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23693
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||||||  | |   |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 23693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 549 - 395
Alignment:
Q  189 aaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctttt 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  549 aaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttct 450  T
Q  289 gtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  449 gtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 1 - 167
Alignment:
Q  177 ttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 276  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  277 ggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| |||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagt 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7248
Alignment:
Q  45 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  | ||| || |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  145 tctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttc 244  Q
    |||||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| |||||  ||| || ||| || |||| ||| || ||  | || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtag 342  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtag 7248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 313
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5480
Alignment:
Q  144 atctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcctt 243  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||  | || |    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    | |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 3283 - 3447
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||  | |||||||| |  || ||||| | |    
T  3283 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctc 3382  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3383 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1063
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||  | ||  |  ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagt 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28448 - 28273
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| ||  | ||| |||| ||||||| ||| ||||| | |    
T  28448 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctc 28349  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28348 ttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 28273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 13032 - 13205
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  13032 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 13131  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  13132 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagt 13205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5491
Alignment:
Q  261 tttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14919 - 14744
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||  |||||| || | || ||||||||||| ||  | ||  | ||||| |||| ||| ||||| | |    
T  14919 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctc 14820  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14819 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 14744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 8238 - 8392
Alignment:
Q  189 aaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactctttt 288  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |    
T  8238 aaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataagtcttct 8337  T
Q  289 gtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8338 gtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1243
Alignment:
Q  201 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcg 300  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  301 acgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagt 1243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14807
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || || || | ||||||||| |||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 330  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaa 14807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 343
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43835
Alignment:
Q  245 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 43835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 14781 - 14954
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  14781 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 14880  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  14881 ttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagt 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 940
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  1092 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 993  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 322  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  992 ttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Original strand, 107 - 186
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  107 ctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagt 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 24004 - 24168
Alignment:
Q  170 agtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 269  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | |    
T  24004 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctc 24103  T
Q  270 ttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24104 ttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaacctt 24168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Original strand, 13389 - 13548
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| || ||    
T  13389 actttaacgcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagct 13488  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13489 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagt 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71516
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 71516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8974 - 8900
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8974 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26164
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 26166  T
Q  344 tt 345  Q
    ||    
T  26165 tt 26164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9284
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || ||  | ||  | |||||||||| ||| |||||   ||||||||| || ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagt 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1433
Alignment:
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||| ||| |||||   ||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3962
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 3962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45932
Alignment:
Q  36 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 133  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  184 actttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaact 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  284 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 316  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Original strand, 10781 - 10941
Alignment:
Q  171 gtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 270  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||  || || || | ||    
T  10781 gtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 10880  T
Q  271 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    |||||||||||||||| || | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10881 tatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaac 10941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3364
Alignment:
Q  264 ctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagt 3364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3487
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  109 ccactcgatacgccaccgttccaac 133  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3511 caactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12784
Alignment:
Q  297 tgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 12784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9287
Alignment:
Q  9 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 108  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatc 9281  T
Q  109 ccactc 114  Q
    ||||||    
T  9282 ccactc 9287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 334
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18397
Alignment:
Q  269 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 334  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 18397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 343
Target Start/End: Original strand, 10867 - 11066
Alignment:
Q  144 atctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttgactttaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggactcctt 243  Q
    |||||||||||||| || ||  | | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||  |||| || ||| || || | |||||| ||  | || |    
T  10867 atctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccct 10966  T
Q  244 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 343  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  10967 cctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagt 11066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 886
Alignment:
Q  27 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcaaaagatgcggtgg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 14367 - 14422
Alignment:
Q  276 tggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 331  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14367 tggtaactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaac 14422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University