View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3396_low_4 (Length: 282)

Name: NF3396_low_4
Description: NF3396
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3396_low_4
NF3396_low_4
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (16-275)||(6311179-6311443)
chr8 (16-275)||(7289865-7290130)
chr8 (18-275)||(36979262-36979524)
chr8 (18-271)||(4760029-4760288)
chr8 (18-271)||(33037761-33038019)
chr8 (18-275)||(30655525-30655793)
chr8 (18-275)||(18870511-18870772)
chr8 (17-275)||(18853117-18853382)
chr8 (16-275)||(25328218-25328481)
chr8 (19-271)||(10689097-10689354)
chr8 (16-249)||(39784789-39785027)
chr8 (97-212)||(26287866-26287985)
chr8 (97-212)||(26301123-26301242)
chr8 (97-212)||(26313117-26313236)
chr8 (72-254)||(10684224-10684410)
chr8 (94-225)||(1261954-1262089)
chr8 (34-249)||(35745294-35745511)
chr8 (97-225)||(31071229-31071362)
chr8 (132-215)||(26403240-26403327)
chr8 (132-213)||(4456028-4456113)
chr8 (98-213)||(7412305-7412426)
chr8 (132-215)||(23799587-23799674)
chr8 (132-213)||(19175766-19175851)
chr8 (132-212)||(4696609-4696693)
chr8 (135-215)||(6127224-6127308)
chr8 (134-193)||(9765852-9765914)
chr8 (132-212)||(19752407-19752491)
chr8 (132-215)||(5702493-5702580)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (16-275)||(1457101-1457365)
chr5 (16-275)||(43592160-43592425)
chr5 (56-275)||(31180138-31180360)
chr5 (16-275)||(27449695-27449960)
chr5 (16-275)||(27444851-27445116)
chr5 (16-275)||(43598605-43598870)
chr5 (16-275)||(43604097-43604362)
chr5 (16-275)||(43609589-43609854)
chr5 (16-275)||(30631289-30631553)
chr5 (16-275)||(15044568-15044831)
chr5 (16-275)||(28807514-28807778)
chr5 (53-249)||(37556588-37556788)
chr5 (53-249)||(37561410-37561610)
chr5 (34-225)||(38192077-38192270)
chr5 (34-225)||(38219302-38219495)
chr5 (66-254)||(31396953-31397144)
chr5 (94-225)||(35387624-35387759)
chr5 (66-254)||(31401810-31402001)
chr5 (34-215)||(2785278-2785461)
chr5 (94-225)||(24135809-24135945)
chr5 (34-249)||(33791219-33791436)
chr5 (122-249)||(33768169-33768299)
chr5 (132-213)||(9353344-9353429)
chr5 (132-213)||(36932362-36932447)
chr5 (132-215)||(10281751-10281838)
chr5 (132-213)||(15464532-15464617)
chr5 (132-215)||(19588746-19588833)
chr5 (133-215)||(11916982-11917068)
chr5 (132-213)||(14520230-14520315)
chr5 (132-215)||(3880299-3880386)
chr5 (132-215)||(17003970-17004057)
chr5 (135-213)||(12084187-12084269)
chr5 (132-212)||(28832259-28832343)
chr5 (132-212)||(42127423-42127507)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (17-275)||(9583-9842)
scaffold0355 (17-106)||(1-89)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (16-275)||(51520338-51520603)
chr4 (17-275)||(3813906-3814168)
chr4 (18-275)||(24741825-24742087)
chr4 (16-275)||(9224346-9224610)
chr4 (16-249)||(56146677-56146915)
chr4 (16-275)||(9229133-9229397)
chr4 (16-249)||(18855608-18855845)
chr4 (18-225)||(29760527-29760738)
chr4 (16-275)||(45357236-45357500)
chr4 (16-275)||(45347756-45348021)
chr4 (16-275)||(5732543-5732809)
chr4 (97-212)||(28468542-28468660)
chr4 (98-225)||(31985634-31985764)
chr4 (132-215)||(10047379-10047466)
chr4 (132-215)||(16623303-16623390)
chr4 (132-215)||(39245994-39246081)
chr4 (132-213)||(5396683-5396768)
chr4 (132-213)||(36315241-36315326)
chr4 (132-213)||(36329450-36329535)
chr4 (132-215)||(38152449-38152536)
chr4 (137-215)||(6743425-6743507)
chr4 (133-214)||(5143260-5143345)
chr4 (132-212)||(5269204-5269288)
chr4 (132-215)||(3796529-3796616)
chr4 (133-214)||(5147678-5147763)
chr4 (133-213)||(3777550-3777634)
chr4 (136-215)||(16630690-16630773)
chr4 (132-215)||(24333809-24333896)
chr4 (132-214)||(54867184-54867269)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (18-275)||(7167129-7167391)
chr3 (18-275)||(28503814-28504067)
chr3 (16-275)||(22173134-22173398)
chr3 (17-225)||(2671586-2671800)
chr3 (17-271)||(8739017-8739278)
chr3 (17-271)||(9091255-9091516)
chr3 (94-225)||(40372795-40372929)
chr3 (34-225)||(8477267-8477459)
chr3 (16-275)||(18656313-18656579)
chr3 (117-254)||(8512202-8512342)
chr3 (117-254)||(8517082-8517222)
chr3 (34-275)||(2672870-2673114)
chr3 (34-275)||(2677026-2677270)
chr3 (97-225)||(1305914-1306045)
chr3 (173-275)||(28501647-28501750)
chr3 (72-254)||(32475424-32475608)
chr3 (72-254)||(32480282-32480466)
chr3 (34-249)||(24968010-24968227)
chr3 (98-225)||(26928591-26928721)
chr3 (98-225)||(32143287-32143418)
chr3 (98-212)||(27986449-27986567)
chr3 (98-225)||(27452924-27453055)
chr3 (132-213)||(8370488-8370573)
chr3 (132-213)||(27974954-27975039)
chr3 (34-178)||(10207836-10207981)
chr3 (132-215)||(18552883-18552970)
chr3 (133-215)||(36029094-36029180)
chr3 (132-213)||(16264350-16264435)
chr3 (132-213)||(21711223-21711308)
chr3 (135-215)||(1736305-1736389)
chr3 (132-212)||(33386669-33386753)
chr3 (97-156)||(1309819-1309878)
chr3 (132-215)||(3716002-3716089)
chr3 (132-215)||(30709790-30709877)
chr3 (132-215)||(40592782-40592869)
chr3 (132-215)||(48438214-48438301)
chr3 (132-213)||(6794715-6794800)
chr3 (132-215)||(40844652-40844738)
chr3 (132-212)||(1417493-1417577)
chr3 (132-212)||(39039995-39040079)
chr3 (132-215)||(25795781-25795868)
chr3 (132-215)||(26298988-26299075)
chr3 (132-215)||(47923906-47923993)
chr3 (132-212)||(3328359-3328443)
chr3 (132-212)||(37466291-37466375)
chr3 (132-215)||(24695164-24695251)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (16-275)||(22010636-22010900)
chr6 (16-275)||(11856853-11857120)
chr6 (18-275)||(28184388-28184650)
chr6 (16-275)||(14737516-14737780)
chr6 (16-275)||(14742376-14742639)
chr6 (19-249)||(6438385-6438619)
chr6 (53-275)||(28155510-28155735)
chr6 (34-275)||(5674719-5674962)
chr6 (34-275)||(16838647-16838890)
chr6 (34-249)||(6005320-6005537)
chr6 (67-275)||(33330384-33330596)
chr6 (67-275)||(33335881-33336093)
chr6 (132-213)||(5757490-5757575)
chr6 (98-212)||(22708984-22709102)
chr6 (132-210)||(21356036-21356118)
chr6 (132-213)||(31086485-31086570)
chr6 (67-169)||(5343416-5343519)
chr6 (132-215)||(5572251-5572338)
chr6 (132-214)||(4629954-4630040)
chr6 (132-214)||(10077176-10077262)
chr6 (132-215)||(22963700-22963786)
chr6 (132-215)||(23824607-23824693)
chr6 (132-215)||(31979513-31979600)
chr6 (35-82)||(30125940-30125987)
chr6 (132-212)||(5017482-5017566)
chr6 (132-193)||(31936587-31936651)
chr6 (144-215)||(21801354-21801429)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (16-275)||(44312563-44312827)
chr2 (18-275)||(11098877-11099139)
chr2 (18-271)||(14291372-14291631)
chr2 (18-225)||(9296401-9296614)
chr2 (16-275)||(32246666-32246933)
chr2 (16-275)||(39811928-39812191)
chr2 (34-225)||(25398399-25398592)
chr2 (34-225)||(25403537-25403730)
chr2 (97-225)||(3491716-3491847)
chr2 (34-249)||(19344323-19344541)
chr2 (34-249)||(19349181-19349399)
chr2 (98-212)||(40738810-40738926)
chr2 (132-215)||(21629944-21630030)
chr2 (132-215)||(8040060-8040147)
chr2 (135-215)||(13569331-13569415)
chr2 (132-213)||(28259189-28259274)
chr2 (132-216)||(20522220-20522308)
chr2 (132-215)||(10445454-10445541)
chr2 (132-215)||(17865203-17865290)
chr2 (132-215)||(34682344-34682431)
chr2 (133-215)||(34388859-34388945)
chr2 (132-215)||(14699018-14699104)
chr2 (170-225)||(25407663-25407719)
chr2 (132-215)||(31056044-31056131)
chr2 (132-215)||(33528631-33528718)
chr2 (133-215)||(10707262-10707348)
chr2 (135-215)||(8390160-8390244)
chr2 (132-210)||(42039684-42039766)
chr2 (132-215)||(16940219-16940306)
chr2 (132-215)||(17010884-17010971)
chr2 (132-215)||(39482931-39483018)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (16-275)||(24024266-24024531)
chr7 (16-275)||(12396793-12397057)
chr7 (16-275)||(12406213-12406477)
chr7 (34-271)||(20357501-20357741)
chr7 (16-249)||(19992194-19992432)
chr7 (16-275)||(31109523-31109786)
chr7 (16-218)||(4866611-4866819)
chr7 (17-271)||(2057842-2058108)
chr7 (17-224)||(21812229-21812441)
chr7 (94-225)||(21639770-21639905)
chr7 (72-254)||(24266162-24266348)
chr7 (94-275)||(1533393-1533579)
chr7 (94-225)||(18408726-18408860)
chr7 (94-225)||(21645968-21646103)
chr7 (97-225)||(18413606-18413736)
chr7 (72-254)||(24261283-24261469)
chr7 (72-254)||(16880012-16880197)
chr7 (72-254)||(16884868-16885053)
chr7 (132-215)||(29159803-29159890)
chr7 (133-214)||(21983285-21983370)
chr7 (132-215)||(46516320-46516407)
chr7 (132-215)||(49091661-49091748)
chr7 (132-209)||(47263678-47263757)
chr7 (132-215)||(55948-56034)
chr7 (133-214)||(21988909-21988992)
chr7 (132-213)||(44848696-44848781)
chr7 (132-212)||(9190021-9190105)
chr7 (132-212)||(20284089-20284173)
chr7 (132-213)||(2479337-2479421)
chr7 (132-215)||(2647706-2647793)
chr7 (132-215)||(33332460-33332547)
chr7 (132-212)||(2580390-2580474)
chr7 (132-213)||(35960816-35960901)
chr7 (132-212)||(9185178-9185262)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (16-275)||(35001-35265)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (16-249)||(25445055-25445293)
chr1 (16-249)||(39445381-39445618)
chr1 (34-275)||(41398143-41398381)
chr1 (16-249)||(44023840-44024076)
chr1 (40-275)||(24787314-24787552)
chr1 (34-275)||(41390488-41390726)
chr1 (16-249)||(1054978-1055215)
chr1 (94-225)||(24202769-24202904)
chr1 (17-254)||(43988424-43988668)
chr1 (97-225)||(19361432-19361564)
chr1 (97-225)||(19380072-19380204)
chr1 (97-225)||(19358843-19358975)
chr1 (132-215)||(47703946-47704033)
chr1 (132-213)||(26644909-26644994)
chr1 (132-215)||(9476261-9476348)
chr1 (132-215)||(19072928-19073015)
chr1 (132-215)||(19120818-19120905)
chr1 (132-215)||(13598398-13598485)
chr1 (132-215)||(16124526-16124613)
chr1 (132-215)||(27104382-27104469)
chr1 (132-215)||(29651811-29651898)
chr1 (132-213)||(3281708-3281793)
chr1 (132-213)||(37069770-37069855)
chr1 (132-215)||(775672-775759)
chr1 (132-212)||(47098837-47098921)
chr1 (132-213)||(13604635-13604720)
chr1 (132-213)||(21536581-21536666)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (16-249)||(244-481)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (94-225)||(17952-18087)
scaffold0188 (94-225)||(24045-24180)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (34-254)||(2211-2433)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (34-254)||(148916-149138)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (72-254)||(14269-14455)
scaffold0197 (34-275)||(19104-19347)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (18-164)||(300-449)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (72-198)||(181980-182110)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (132-213)||(8431-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (133-213)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (132-215)||(5683-5770)
scaffold0006 (132-215)||(2492-2579)
scaffold0006 (132-213)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (132-213)||(43973-44058)
scaffold0087 (132-213)||(36844-36929)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (132-215)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (132-212)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (135-215)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 6311179 - 6311443
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6311179 acaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa 6311278  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311279 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 6311378  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagacagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6311379 aaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagacaaaccctagattctaccctttg 6311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7290130 - 7289865
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagc-ataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||    
T  7290130 acaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaa 7290031  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290030 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 7289931  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  7289930 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttg 7289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 36979262 - 36979524
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36979262 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 36979360  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36979361 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 36979460  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36979461 aagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 36979524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4760288 - 4760029
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4760288 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg 4760189  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4760188 aagaacaaaacatcaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 4760089  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  4760088 aagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 4760029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33038019 - 33037761
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  33038019 aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaa 33037921  T
Q  114 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037920 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 33037821  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33037820 aagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 33037761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 30655525 - 30655793
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30655525 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaag 30655624  T
Q  114 gaagaacaaaa----caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtg 206  Q
    |||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30655625 gaagaacaaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtg 30655724  T
Q  207 ttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30655725 ttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 30655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18870772 - 18870511
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaaacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18870772 aaatggtttccaagcaaacaacaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa 18870674  T
Q  117 gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18870673 gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaa 18870574  T
Q  214 a-ggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    | |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18870573 agggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 18870511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18853382 - 18853117
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaaaacca---gccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18853382 caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa 18853284  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18853283 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgtta 18853184  T
Q  210 caaaa-ggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  18853183 caaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttaccctttg 18853117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25328481 - 25328218
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |   |||    
T  25328481 acaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaa 25328384  T
Q  113 ggaa--gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328383 ggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 25328284  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25328283 acaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 25328218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10689354 - 10689097
Alignment:
Q  19 aatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagga 115  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10689354 aatggtttccaagcaacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaagga 10689256  T
Q  116 agaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10689255 agaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacag 10689156  T
Q  213 aaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    | |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  10689155 agggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 10689097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39785027 - 39784789
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||  || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  39785027 acaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa 39784929  T
Q  113 gg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 207  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39784928 aggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgt 39784830  T
Q  208 tacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  39784829 tacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 39784789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287985
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301242
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313236
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10684410 - 10684224
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10684410 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 10684313  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10684312 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 10684224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1262089 - 1261954
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1262089 aaacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 1261990  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1261989 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 1261954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 35745294 - 35745511
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||    
T  35745294 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccga 35745389  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  35745390 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 35745488  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  35745489 -tctagcttttcaagctttacaca 35745511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071229
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  193 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 31071229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456113
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 4456113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412426
Alignment:
Q  98 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 192  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  193 aatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaa 7412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799587
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23799587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175766
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 19175766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127308
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  134 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702493
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaag 5702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1457365 - 1457101
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1457365 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa 1457266  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457265 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 1457166  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  1457165 aaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 1457101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 43592160 - 43592425
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  43592160 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 43592259  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592260 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 43592359  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43592360 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180360
Alignment:
Q  56 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 154  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  155 aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga 252  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaaga 31180337  T
Q  253 cagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  31180338 caaaccctagattctaccctttg 31180360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27449695 - 27449960
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaaaac--cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  27449695 acaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 27449794  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449795 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 27449894  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  27449895 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27449960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27444851 - 27445116
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaaaac--cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  27444851 acaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 27444950  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444951 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 27445050  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  27445051 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27445116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 43598605 - 43598870
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  43598605 acaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 43598704  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598705 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 43598804  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43598805 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43598870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 43604097 - 43604362
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  43604097 acaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 43604196  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604197 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 43604296  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43604297 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 43609589 - 43609854
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  43609589 acaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 43609688  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609689 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 43609788  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43609789 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43609854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 30631289 - 30631553
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30631289 acaaatggttttcaagcaacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaa 30631387  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631388 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 30631487  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  30631488 aaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttg 30631553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 15044568 - 15044831
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15044568 acaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaa 15044666  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044667 aggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 15044766  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15044767 caaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 15044831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28807778 - 28807514
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  28807778 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaa 28807679  T
Q  113 gg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 207  Q
     |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28807678 aggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgt 28807580  T
Q  208 tacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  28807579 tacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 28807514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37556788 - 37556588
Alignment:
Q  53 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 149  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556788 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37556689  T
Q  150 cagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttac 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||    
T  37556688 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttac 37556591  T
Q  247 aca 249  Q
    |||    
T  37556590 aca 37556588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37561610 - 37561410
Alignment:
Q  53 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 149  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37561610 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37561511  T
Q  150 cagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttac 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||    
T  37561510 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttac 37561413  T
Q  247 aca 249  Q
    |||    
T  37561412 aca 37561410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 38192077 - 38192270
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  38192077 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaa 38192173  T
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 38192270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 38219302 - 38219495
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  38219302 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaa 38219398  T
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 38219495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31397144 - 31396953
Alignment:
Q  66 caaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa---acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgg 161  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31397144 caaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgg 31397048  T
Q  162 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31397047 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31396953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387759
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 35387759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31402001 - 31401810
Alignment:
Q  66 caaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgg 161  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31402001 caaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgg 31401905  T
Q  162 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31401904 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31401810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 2785278 - 2785461
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||    
T  2785278 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccga 2785373  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2785374 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 2785461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 24135809 - 24135945
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 189  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24135809 aaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaa 24135908  T
Q  190 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | || || || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24135909 tgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 24135945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 33791219 - 33791436
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||    
T  33791219 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccga 33791314  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  33791315 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 33791413  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  33791414 -tctagcttttcaagctttacaca 33791436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 249
Target Start/End: Original strand, 33768169 - 33768299
Alignment:
Q  122 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  33768169 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 33768268  T
Q  218 tgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    | ||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  33768269 tacaagaa--tctagcttttcaagctttacaca 33768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353344
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932362
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281838
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464617
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 15464617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588833
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 19588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916982
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 11916982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520315
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaa 14520315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880386
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084187
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 12084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9842 - 9583
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9842 caaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 9744  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9743 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 9644  T
Q  213 aaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  9643 aaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 1
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  89 caaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 51520338 - 51520603
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  51520338 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 51520437  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520438 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 51520537  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  51520538 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 51520603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 3813906 - 3814168
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813906 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaag 3814005  T
Q  114 gaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3814006 gaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttac 3814105  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  3814106 aaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 3814168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 24741825 - 24742087
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24741825 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 24741923  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24741924 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 24742023  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24742024 aagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 24742087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9224610 - 9224346
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||    
T  9224610 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa 9224512  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224511 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 9224412  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  9224411 caaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9224346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 56146915 - 56146677
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  56146915 acaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaa 56146816  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146815 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 56146716  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56146715 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacaca 56146677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9229397 - 9229133
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||    
T  9229397 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa 9229299  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229298 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 9229199  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  9229198 caaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9229133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 18855608 - 18855845
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  18855608 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaag 18855707  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18855708 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgtta 18855806  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  18855807 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 18855845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 29760527 - 29760738
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29760527 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaacaa-ccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 29760624  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29760625 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 29760724  T
Q  212 aaaggttgcaagaa 225  Q
    || |||| ||||||    
T  29760725 aagggttacaagaa 29760738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45357500 - 45357236
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  45357500 acaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa 45357402  T
Q  113 gg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357401 aggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 45357302  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  45357301 acaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45357236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45348021 - 45347756
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  45348021 acaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa 45347923  T
Q  113 gg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347922 aggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 45347823  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  45347822 acaaaaggttacaag-acctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45347756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 5732543 - 5732809
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   |||    
T  5732543 acaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa 5732640  T
Q  113 ggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaag 204  Q
    |||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732641 ggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 5732740  T
Q  205 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  5732741 tgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 5732809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468542
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985634
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccac 31985666  T
Q  195 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31985665 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047466
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10047466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623303
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16623303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246081
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 39246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396683
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaa 5396683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315241
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36315241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329450
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36329450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  137 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796529
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3796529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777634
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630690
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 7167129 - 7167391
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167129 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaac-agccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg 7167227  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167228 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 7167327  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7167328 aagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 7167391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28504067 - 28503814
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||         ||||    
T  28504067 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaac-agcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aagg 28503978  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503977 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 28503878  T
Q  213 aaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  28503877 aaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttg 28503814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22173398 - 22173134
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   |||    
T  22173398 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaa 22173300  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173299 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 22173200  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  22173199 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22173134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2671800 - 2671586
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2671800 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa 2671702  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2671701 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 2671602  T
Q  210 caaaaggttgcaagaa 225  Q
    |||| |||| ||||||    
T  2671601 caaagggttacaagaa 2671586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8739278 - 8739017
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaa---caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8739278 caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaa 8739180  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8739179 aggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt 8739080  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    ||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8739079 acaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctaccc 8739017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9091516 - 9091255
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaa---caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9091516 caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaa 9091418  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9091417 aggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt 9091318  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    ||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  9091317 acaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctaccc 9091255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372795
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  192 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 40372795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 8477267 - 8477459
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |  ||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  8477267 aacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccacaaagataa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaga 8477363  T
Q  133 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  8477364 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 8477459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 18656313 - 18656579
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   |||    
T  18656313 acaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa 18656410  T
Q  113 ggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaag 204  Q
    |||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656411 ggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaag 18656510  T
Q  205 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  18656511 tgttacaaaaggttacaaga--ctctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 18656579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 254
Target Start/End: Original strand, 8512202 - 8512342
Alignment:
Q  117 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8512202 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8512301  T
Q  214 ag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512302 agagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8512342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 254
Target Start/End: Original strand, 8517082 - 8517222
Alignment:
Q  117 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8517082 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8517181  T
Q  214 ag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8517182 agagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8517222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2673114 - 2672870
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| |    
T  2673114 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaa 2673018  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  2673017 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 2672919  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttg 275  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  2672918 -tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttg 2672870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2677270 - 2677026
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| |    
T  2677270 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaa 2677174  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  2677173 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 2677075  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttg 275  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  2677074 -tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttg 2677026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306045
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
     || || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1306013 ctacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 1306045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501647
Alignment:
Q  173 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  272 tttg 275  Q
    ||||    
T  28501650 tttg 28501647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Original strand, 32475424 - 32475608
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32475424 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 32475521  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32475522 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32475608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Original strand, 32480282 - 32480466
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32480282 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 32480379  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32480380 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32480466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 24968010 - 24968227
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||    
T  24968010 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccga 24968105  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  24968106 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 24968204  T
Q  227 ctctagcta-tcaagctttacaca 249  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  24968205 -tctagctattcaagctttacaca 24968227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928591
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaa 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  195 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 26928591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143418
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  32143386 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 32143418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986449
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453055
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 27453055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370488
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8370488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974954
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27974954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Original strand, 10207836 - 10207981
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| |    
T  10207836 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaa 10207932  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggagagag 178  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10207933 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagag 10207981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552883
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 18552883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029180
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagaga--gcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 36029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264435
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711308
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21711308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736305
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 1736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716002
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 3716002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709790
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaag 30709790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592782
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaag 40592782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438301
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 48438301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794715
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844738
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 40844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795868
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaag 25795868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299075
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 26299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923906
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaag 47923906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttca-gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695164
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaag 24695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22010900 - 22010636
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||    
T  22010900 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaa 22010802  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010801 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 22010702  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  22010701 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22010636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 11856853 - 11857120
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||| | |||    
T  11856853 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaa 11856951  T
Q  113 -ggaagaacaaaa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 206  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856952 aggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtg 11857051  T
Q  207 ttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  11857052 ttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 11857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 28184388 - 28184650
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||    
T  28184388 aaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaa 28184486  T
Q  113 ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28184487 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttac 28184586  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||| ||| |  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  28184587 aaaaggttacaaca--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 28184650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14737780 - 14737516
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||   ||    
T  14737780 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaa 14737682  T
Q  112 aggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737681 aagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 14737582  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14737581 acaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14737516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14742639 - 14742376
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaa 111  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||    
T  14742639 acaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaa 14742541  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742540 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 14742441  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14742440 caaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14742376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 6438385 - 6438619
Alignment:
Q  19 aatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--a 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  |    
T  6438385 aatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaa 6438484  T
Q  116 agaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6438485 agaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaa 6438583  T
Q  213 aaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    |||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  6438584 aaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacaca 6438619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28155735 - 28155510
Alignment:
Q  53 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 149  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28155735 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 28155636  T
Q  150 cagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttaca 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  28155635 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tttagctttcaagctttaca 28155538  T
Q  248 caag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  28155537 catgaacaaaccctaga-tctaccctttg 28155510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5674962 - 5674719
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |      
T  5674962 aacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaag 5674866  T
Q  133 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |      
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 5674766  T
Q  230 tagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||  ||||| |||||||||  |||   ||||||||||||||||||    
T  5674765 tagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttg 5674719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 16838647 - 16838890
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||    
T  16838647 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccga 16838742  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  16838743 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 16838841  T
Q  227 ctctagcta-tcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
     |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  16838842 -tctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 16838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 6005320 - 6005537
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||    
T  6005320 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccga 6005415  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  6005416 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 6005514  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  6005515 -tctagcttttcaagctttacaca 6005537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33330596 - 33330384
Alignment:
Q  67 aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggc 162  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33330596 aaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggc 33330499  T
Q  163 ctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agac 257  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  33330498 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaac 33330401  T
Q  258 cctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33330400 cctaga-tctaccctttg 33330384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33336093 - 33335881
Alignment:
Q  67 aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggc 162  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33336093 aaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgac 33335996  T
Q  163 ctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agac 257  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  33335995 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaac 33335898  T
Q  258 cctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33335897 cctaga-tctaccctttg 33335881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757490
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709102
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaa 212  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356118
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 210  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 21356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Original strand, 5343416 - 5343519
Alignment:
Q  67 aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggc 162  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5343416 aaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggc 5343512  T
Q  163 ctaatct 169  Q
    |||||||    
T  5343513 ctaatct 5343519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572251
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5572251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963786
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 22963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824607
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23824607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979600
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaag 31979600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30125987 - 30125940
Alignment:
Q  35 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagag 82  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30125987 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggaga--gagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801354
Alignment:
Q  144 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagag--agcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaag 21801354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44312827 - 44312563
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||    
T  44312827 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaa 44312729  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312728 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 44312629  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  44312628 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11099139 - 11098877
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  11099139 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaagg 11099041  T
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11099040 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 11098941  T
Q  212 aaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    || |||| |||||| |  |||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11098940 aagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 11098877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 14291372 - 14291631
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaaacaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14291372 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaag 14291470  T
Q  114 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14291471 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 14291570  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  14291571 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 14291631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9296614 - 9296401
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaaacaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9296614 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaag 9296516  T
Q  114 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9296515 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9296416  T
Q  211 aaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| |||| ||||||    
T  9296415 aaagggttacaagaa 9296401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 32246666 - 32246933
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32246666 acaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaa 32246764  T
Q  113 ----ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 205  Q
        ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246765 aaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagt 32246864  T
Q  206 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  32246865 gttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttg 32246933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39812191 - 39811928
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  39812191 acaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaa 39812093  T
Q  113 ggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812092 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 39811993  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  39811992 caaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 39811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 25398399 - 25398592
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  25398399 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaa 25398495  T
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 25398592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 25403537 - 25403730
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  25403537 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaa 25403633  T
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 25403730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491847
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  194 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 3491847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 19344323 - 19344541
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||    
T  19344323 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccga 19344419  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  19344420 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 19344518  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  19344519 -tctagcttttcaagctttacaca 19344541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 19349181 - 19349399
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||    
T  19349181 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccga 19349277  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  19349278 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 19349376  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  19349377 -tctagcttttcaagctttacaca 19349399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40738926
Alignment:
Q  98 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaat 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggggagagcagctctccaatccact 40738908  T
Q  196 atga-gaaagtgttacaa 212  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40738909 atgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630030
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 21630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569415
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259189
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522308
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagg 20522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445454
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaag 10445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865290
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682344
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 34682344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388945
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 34388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699018
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaag 14699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 25407663 - 25407719
Alignment:
Q  170 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  25407663 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 25407719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528631
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 33528631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707262
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10707262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390160
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaag 8390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039684
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 210  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac 42039684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483018
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaag 39483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24024531 - 24024266
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaag-aaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||   ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24024531 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaa 24024432  T
Q  113 ggaagaac-aaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024431 ggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 24024332  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24024331 acaaaatgttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 24024266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 12396793 - 12397057
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||   |||    
T  12396793 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa 12396891  T
Q  113 gg-aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396892 gggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 12396991  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  12396992 caaaaggttacaagaa-ctctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12397057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 12406213 - 12406477
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||    
T  12406213 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa 12406311  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406312 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 12406411  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  12406412 caaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12406477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20357741 - 20357501
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaag 20357644  T
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |      
T  20357643 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 20357544  T
Q  230 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20357543 tagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctaccc 20357501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 19992194 - 19992432
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  19992194 acaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaag 19992293  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19992294 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgtta 19992393  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  19992394 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 19992432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31109786 - 31109523
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31109786 acaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaa 31109689  T
Q  113 -ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109688 aggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 31109589  T
Q  209 acaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  31109588 acaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttg 31109523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4866611 - 4866819
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagactagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aaga 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    |    
T  4866611 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaa 4866709  T
Q  111 aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866710 aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtt 4866809  T
Q  209 acaaaaggtt 218  Q
    ||||||||||    
T  4866810 acaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 2057842 - 2058108
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaa----caagataagcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||    ||||||||||||    
T  2057842 caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaa 2057941  T
Q  109 gaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 204  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2057942 taaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 2058041  T
Q  205 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc 271  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2058042 tgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 2058108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21812441 - 21812229
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagga 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| ||    
T  21812441 caaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaaga 21812342  T
Q  116 a--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  21812341 aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttac 21812243  T
Q  211 aaaaggttgcaaga 224  Q
    |||||||| |||||    
T  21812242 aaaaggttccaaga 21812229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21639905
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21639870 ccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 21639905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24266348 - 24266162
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24266348 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 24266251  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24266250 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1533579 - 1533393
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1533579 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaat 1533480  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||||  |||   ||||||||||||||||||    
T  1533479 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttg 1533393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408860
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 18408860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646103
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaat 21646067  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  21646068 ccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaa 21646103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413736
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaa 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggagagagcagctctccaatccac 18413704  T
Q  195 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18413705 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 18413736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24261469 - 24261283
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24261469 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 24261372  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261371 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Original strand, 16880012 - 16880197
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16880012 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 16880109  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16880110 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Original strand, 16884868 - 16885053
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16884868 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 16884965  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16884966 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159890
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29159890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516320
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 46516320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091748
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 49091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56034
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 56034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848696
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647706
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2647706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332460
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 33332460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35265 - 35001
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||    
T  35265 acaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa 35167  T
Q  112 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35166 aggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 35067  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  35066 caaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 35001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25445293 - 25445055
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |    
T  25445293 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaag 25445194  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445193 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 25445094  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25445093 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 25445055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 39445381 - 39445618
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  39445381 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaag 39445480  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39445481 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgtta 39445579  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  39445580 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 39445618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 41398143 - 41398381
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  41398143 aacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacaccga 41398235  T
Q  131 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  41398236 gaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ct 41398333  T
Q  229 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  41398334 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41398381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44024076 - 44023840
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  44024076 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaagg 44023977  T
Q  115 -aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 210  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44023976 aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttac 44023878  T
Q  211 aaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  44023877 aaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacaca 44023840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24787552 - 24787314
Alignment:
Q  40 aaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagatt 137  Q
    |||| ||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24787552 aaaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagatt 24787455  T
Q  138 gttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagcta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||      
T  24787454 gttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct 24787355  T
Q  236 tcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  24787354 tcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttg 24787314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 41390488 - 41390726
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||    
T  41390488 aacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatcga 41390580  T
Q  131 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  41390581 gaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ct 41390678  T
Q  229 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 275  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  41390679 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41390726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1055215 - 1054978
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  1055215 acaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaag 1055116  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1055115 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgtta 1055017  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1055016 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 1054978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24202904 - 24202769
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24202904 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24202805  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24202804 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 24202769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43988668 - 43988424
Alignment:
Q  17 caaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |    
T  43988668 caaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaag 43988569  T
Q  115 aa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
    ||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43988568 aaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgtta 43988469  T
Q  210 caaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988468 caaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 43988424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361432
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  193 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 19361432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19380072
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  193 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 19380072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358843
Alignment:
Q  97 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  193 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 19358843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644909
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073015
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19073015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120905
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124526
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16124526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104382
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 27104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281793
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaa 3281793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069855
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604635
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 13604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536581
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 244 - 481
Alignment:
Q  16 acaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |    
T  244 acaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaag 343  T
Q  115 --aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 209  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  344 gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgtta 442  T
Q  210 caaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 249  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  443 caaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18087 - 17952
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18087 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 17988  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17987 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24180 - 24045
Alignment:
Q  94 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24180 aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24081  T
Q  191 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 225  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24080 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 24045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2433 - 2211
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||    
T  2433 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccga 2338  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  2337 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 2239  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2238 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 2211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 149138 - 148916
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||    
T  149138 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccga 149043  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  149042 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa- 148944  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  148943 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 148916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14455 - 14269
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14455 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 14358  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 254  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14357 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19347 - 19104
Alignment:
Q  34 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccga 130  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||    
T  19347 aacaacaaaac-agcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccga 19252  T
Q  131 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||     
T  19251 gcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaa- 19153  T
Q  227 ctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttg 275  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  19152 -tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttg 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 300
Alignment:
Q  18 aaatggtttccaagcaa--acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaag 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  449 aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaag 351  T
Q  114 gaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 164  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  350 aaagaacaaaacaccaagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 182110 - 181980
Alignment:
Q  72 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  182110 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 182013  T
Q  168 ct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 198  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  182012 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8431
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85768
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133292
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 133292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43973
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36844
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaa 36844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10816
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 10816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 212  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17350
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 215  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaag 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University