View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3398-Insertion-3 (Length: 740)

Name: NF3398-Insertion-3
Description: NF3398
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3398-Insertion-3
NF3398-Insertion-3
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (8-588)||(11049728-11050329)
chr5 (13-566)||(10609484-10610051)
chr5 (13-327)||(10742570-10742884)
chr5 (370-566)||(10749253-10749450)
chr5 (380-566)||(10719146-10719333)
chr5 (380-564)||(10765363-10765548)
chr5 (77-322)||(10748947-10749192)
chr5 (371-566)||(9838567-9838763)
chr5 (644-732)||(11050385-11050473)
chr5 (403-566)||(10562801-10562965)
chr5 (402-564)||(10742972-10743135)
chr5 (77-340)||(10563041-10563304)
chr5 (77-351)||(10718830-10719104)
chr5 (644-736)||(10218579-10218669)
chr5 (135-340)||(10765105-10765310)
chr5 (374-461)||(19608107-19608195)
chr5 (381-464)||(7190878-7190962)
chr5 (437-565)||(10548578-10548706)
chr5 (161-253)||(10548894-10548986)
chr5 (380-491)||(10556769-10556881)
chr5 (211-281)||(10593832-10593902)
chr5 (8-50)||(10764960-10765002)
chr5 (13-50)||(10557224-10557261)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (380-562)||(12897343-12897526)
chr6 (380-562)||(12904964-12905147)
chr6 (380-562)||(12946419-12946602)
chr6 (380-562)||(12955856-12956039)
chr6 (69-322)||(12956110-12956363)
chr6 (380-562)||(12930054-12930237)
chr6 (69-322)||(12905218-12905471)
chr6 (69-322)||(12946673-12946926)
chr6 (69-322)||(12897597-12897850)
chr6 (69-322)||(12930308-12930561)
chr6 (462-562)||(12955578-12955678)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (380-562)||(17925654-17925837)
chr2 (69-322)||(17925330-17925583)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (371-461)||(31469398-31469483)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 588
Target Start/End: Original strand, 11049728 - 11050329
Alignment:
Q  8 gaggtgacatatttcttgtggaatatctccttct-------aagttgttatacacaaatgaaaaatcggttaagcttgaaagattccctatgaatgaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049728 gaggtgacatatttcttgtggaatatctccttctaagttctaagttgttatacacaaatgaaaaatcggttaagcttgaaagattccctatgaatgaagg 11049827  T
Q  101 gattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049828 gattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagccaatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctccc 11049927  T
Q  201 aaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagttgttccaattgtagcaacc 300  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049928 aaatacaagtctttaagattggagcaatgtgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagttgttccaattgtagcaacc 11050027  T
Q  301 gacccaactcttgtggaatttcaccatgaaagctattgttcatgagattgaattcagtcata-------------taactaagggtgatattgatccatg 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |              |||  |||||||||||||||||||    
T  11050028 gacccaactcttgtggaatttctccatagaagctgttgttcatgagattgaattctgtcaaaaaagtgagattgccaacatagggtgatattgatccatg 11050127  T
Q  388 caactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050128 caactgatatccttctaggttcaactttgtaactctttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagat 11050227  T
Q  487 tcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgcttgtgccacaattctgtttg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11050228 tcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgcttgtgcaacaactctgtttg 11050327  T
Q  587 gg 588  Q
    ||    
T  11050328 gg 11050329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 10610051 - 10609484
Alignment:
Q  13 gacatatttcttgtggaatatctccttctaagttgttatacacaaatgaaaaatcggttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |   || |||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  10610051 gacatgtttcttgtggaatatccccttctaagttgtttgaagtaactgaaaaacgcgttaagcatgaaagattccctacgaatgaaggaattcctccggt 10609952  T
Q  113 taatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtct 212  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||    
T  10609951 taatttgtttttccaaatggtcacatattgaagctttttcaaagagccaatttcaatcggtattttgccaatcaaattgtttcctcccaaacgtaactct 10609852  T
Q  213 ttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactctt 312  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  10609851 ttgagattggagcaatgtgtcaggtttgtaggaatttctcctgcaaaagagttattgatgagataaagttgttgcaattgtagcaactgacccaactcct 10609752  T
Q  313 gtggaatttcaccatgaaagctattgttcatgagattgaattcagtcatataactaag-------------ggtgatattgatccatgcaactgatatcc 399  Q
    | || |||   ||||  ||||| |||||||||||||| ||    || | | || ||||             |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10609751 gcgggattgttccatagaagctgttgttcatgagattcaaggttgtaagaaaagtaagattgcctacatatggtgatatggatccatgcaactgatatcc 10609652  T
Q  400 ttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagattc-aagagctcc 497  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||| |||||   ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  10609651 ttcaaggttcaactctataactctttgttgcatagagctgcatgtgactccacgccacttacataaatggatggaaaaattccaagaatctaaga-ctcc 10609553  T
Q  498 atttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgc 566  Q
    |||||| |||  | |||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10609552 atttggatcattggatattgattctttgaatttaagcaatgacaaataatcagtttggtttcctaatgc 10609484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Original strand, 10742570 - 10742884
Alignment:
Q  13 gacatatttcttgtggaatatctccttctaagttgttatacacaaatgaaaaatcggttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   ||  ||||||    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10742570 gacatatttcttgtggaatatccccttctaagttgtttgaaggaaccgaaaaaagcattaaacttgaaagattccctatggatgaagagattcctccagt 10742669  T
Q  113 taatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtct 212  Q
    ||| || || |||||||    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||  || | ||    
T  10742670 taaattgttattccaaacactcaatgattgaagttttttcaaatagccaatttcaattggtattttgccaatcaacttgttccctgccaaagttatgact 10742769  T
Q  213 ttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactctt 312  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10742770 ttcagatttgagcaatatgtcaagtttgtaggaatttcacctgcaaaagagttattagtaagaaaaagttgttgcaattgtagcaactgacccaactctt 10742869  T
Q  313 gtggaatttcaccat 327  Q
    |||||||||| ||||    
T  10742870 gtggaatttctccat 10742884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 370 - 566
Target Start/End: Original strand, 10749253 - 10749450
Alignment:
Q  370 gggtgatattgatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactcttg-atgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatgg 468  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10749253 gggtgataaagatccatgtaaatgatatccttctaagttcaactttgtaactctttcatgcatgggtttgcatgtgattccatgccacttgcagaagtgg 10749352  T
Q  469 atggaagaattccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgc 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||| |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10749353 atggaagaattccaagattcaagagctttatttgggtcactcgatattgattctttaaatttgtgcaatgccaaatgatctgtttggtttcctaatgc 10749450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 380 - 566
Target Start/End: Original strand, 10719146 - 10719333
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactcttg-atgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10719146 gatccatgtaacagatatcctcctaggttcaactctgtaactctttcatgcatggggctgcatgtgattccatgccacttgcagaagtggatggaagaat 10719245  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgc 566  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10719246 tccaagattcaagagcttcatatggatcactggttattcattctttgaatttgagcaatgctaaatgatctgtttggttacctaatgc 10719333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 380 - 564
Target Start/End: Original strand, 10765363 - 10765548
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  10765363 gatccatgtaactgatatcctgctaggttcaactctgtaaccctttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccactttcaaaagtggatggaagaat 10765462  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaat 564  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||   |||||| |||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  10765463 tccaagattcaagagctttatatggatcacttgatattgattctttgaatttgagcaatgccaattgatctgattggtttcctaat 10765548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 322
Target Start/End: Original strand, 10748947 - 10749192
Alignment:
Q  77 tgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||  |||||     | |  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  10748947 tgaaagattccctatgaatgaaggaaatccaccagttaaattgtttccccaaacatttattagttgaagctttttcaaagagccaatttcaattggtatt 10749046  T
Q  177 ttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagta 276  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||      
T  10749047 ttgccaatcacattgttccctcccacatttaagcctttgagattggagcaatatgtcaagtttgaaggaatttctcctgcgaacgagttattgatgagat 10749146  T
Q  277 aaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10749147 caagttgttgcaattgtagcaaccgacccaactcttctgggatttc 10749192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 566
Target Start/End: Original strand, 9838567 - 9838763
Alignment:
Q  371 ggtgatattgatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatgga 469  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9838567 ggtgacatggatccatgcaacttgtatccttgtaagttcaattttgtaactctttgatgcatggggttgcatgtgattccatgccagttgcagaagtgga 9838666  T
Q  470 tggaagaattccaagattc-aagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgc 566  Q
    | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9838667 tagaagaattccaagaatctaaga-ctccatttgggtcactggatattgattctttgaattggagcaatgcaagatgatcagtttggtttcctaatgc 9838763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 644 - 732
Target Start/End: Original strand, 11050385 - 11050473
Alignment:
Q  644 gcttcattcggtttaggagaaaggtttatgctgtatagttttgtttgtgtggaaaaattatgttggaatagagaagaaacatatgcatt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050385 gcttcattcggtttaggagaaaggtttatgctgtatatttttgtttgtgtggaaaaattatgttggaatagagaagaaacatatgcatt 11050473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 403 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 10562965 - 10562801
Alignment:
Q  403 taggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagattcaagagctccattt 501  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    | |    
T  10562965 taggttcaactctataactctttgatgcatggggttgcaagtgattccctgccacttgcagaagtggatggaagaattccaagattcaagagcattgtat 10562866  T
Q  502 gggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaatgc 566  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10562865 ggatcactggatattgattctttgaatttgagcaatgctaaatgatctgtttggtttcctaatgc 10562801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 402 - 564
Target Start/End: Original strand, 10742972 - 10743135
Alignment:
Q  402 ctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagattcaagagctccatt 500  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||     
T  10742972 ctaggtccaactctataactctttgatgcatggggttgcatgtgattccataccacttgcagaagtggatggaagaattccaagactcaagagctttata 10743071  T
Q  501 tgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcctaat 564  Q
    ||| ||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10743072 tggatcacttgatattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatctgattggtttcctaat 10743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10563304 - 10563041
Alignment:
Q  77 tgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatc 176  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||     ||| |   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  10563304 tgaaaggttccctatggatgaagggatccctccagttaaattgttaccaaaaaggtggaatgaatgaagctttttcaaagagccaatttcaattggtatt 10563205  T
Q  177 ttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagta 276  Q
    || ||||| || |||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||      
T  10563204 ttcccaatcaatttgttccctcccaaaatcaagtctatgagattggagcaatatgtcaagtttgtaggaatttctcctacaaacgagttattaaggagat 10563105  T
Q  277 aaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttcaccatgaaagctattgtt 340  Q
    |||| |||| || |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||  ||| ||||||||    
T  10563104 aaaggtgttgcagttgtagcaactgacccaactccggtgggatttctccagaaaaactattgtt 10563041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 351
Target Start/End: Original strand, 10718830 - 10719104
Alignment:
Q  77 tgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatc 176  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||    ||||||  |||||||||||| || |||   |||||      
T  10718830 tgaaagatttcccatgaatgaagggattcctccagttaaattgttttttccaatggccagaatttgaagccttttcaaagagccaacttctactggtaat 10718929  T
Q  177 ttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagta 276  Q
    |||||||| |  || ||||||  |||   ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||      
T  10718930 ttgccaatgagcttattcccttgcaaggataactctttgagattggagcaatacgtcaggtttgtaggaattttacctgcaaaagagttattgttaagat 10719029  T
Q  277 aaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttcaccatgaaagctattgttcatgagattga 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||| || |||||||    
T  10719030 aaagttgttgcaattgtagcaacttgcccaactcatgtggaatttctccaaagaagctgttgtttataagattga 10719104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 644 - 736
Target Start/End: Original strand, 10218579 - 10218669
Alignment:
Q  644 gcttcattcggtttaggagaaaggtttatgctgtatagttttgtttgtgtggaaaaattatgttggaatagagaagaaacatatgcattcaaa 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10218579 gcttcattcggtttaggagaaaggtttatgctatata-ttttgtttgtgtggaaaaattatg-tggaacagagaagaagcatatgcgttcaaa 10218669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 340
Target Start/End: Original strand, 10765105 - 10765310
Alignment:
Q  135 aatgattgaagttttttcaaagagctaatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtga 234  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| || ||  | || |||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||| || |    
T  10765105 aatgaatgaaggtttttcaaagagccaatttcaattagtattttccctgtcaatttgttccctcccaaaatcaagtctatgagattggagcaatacgtca 10765204  T
Q  235 ggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttcaccatgaaagct 334  Q
     |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||   |||  ||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  ||| ||    
T  10765205 agtttataggaatttctcctgtaaacgagttattaaggagataaagttgttgcagttgtagcaactgaccgaactcctgtggaatttctccagaaaaact 10765304  T
Q  335 attgtt 340  Q
    ||||||    
T  10765305 attgtt 10765310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 461
Target Start/End: Original strand, 19608107 - 19608195
Alignment:
Q  374 gatattgatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgca 461  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19608107 gatattgatccatgcaattcatatccttgtaggttcaattctataactctttgatgcatggggctgcatgtgattccatgccaattgca 19608195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7190962 - 7190878
Alignment:
Q  381 atccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaa 464  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||  | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7190962 atccatgcagctgatatccttccaagtttaactcggcaactctttgatgcatgggactgcatgtgattccataccacttgcagaa 7190878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10548706 - 10548578
Alignment:
Q  437 tgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaattccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaa 536  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||   || || |||||||| |  ||| | ||| |||||||||| |||    
T  10548706 tgcacgtgattccatgccagttgcaaaaatggatagaaccattccaagaatcaagcattctatgtgggtcactggttatagattccttgaatttaagcaa 10548607  T
Q  537 tgcaaaatgatctgtttggtttcctaatg 565  Q
    ||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  10548606 tgatagatgatcagtttggtttcctaatg 10548578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10548986 - 10548894
Alignment:
Q  161 aatttcatttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcc 253  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  10548986 aatttcaattggtatttttccaatcaaattgttccctctcaaggataagtatttaaggttgaaacaatttgtcaagtttgtaggaatttctcc 10548894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 10556881 - 10556769
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactctt-gatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||  |||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  ||    
T  10556881 gatccatgcaacttatatccaggtaacttcaactcagtaactctttgatgcatggtgttgcatgtgattccataccagttgcaaaaatggatagaaccat 10556782  T
Q  479 tccaagattcaag 491  Q
    ||||||| |||||    
T  10556781 tccaagaatcaag 10556769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10593902 - 10593832
Alignment:
Q  211 ctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttattgctgagtaaaagt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  10593902 ctttaagattggagcaatttgtcaagttcgtagggatttctcctgtaaacgagttattactgagaaaaagt 10593832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Original strand, 10764960 - 10765002
Alignment:
Q  8 gaggtgacatatttcttgtggaatatctccttctaagttgtta 50  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10764960 gaggcgacatatttcttgtggaatatctcctcctaatttgtta 10765002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10557261 - 10557224
Alignment:
Q  13 gacatatttcttgtggaatatctccttctaagttgtta 50  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10557261 gacatatttcttggggaatatctccctctaagttgtta 10557224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12897526 - 12897343
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12897526 gatccatgtaactgatatctttttaggctcaactctgtaactcgttcatgcatggggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 12897427  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    ||||||||||||||||    | |||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12897426 tccaagattcaagagcattgtatgggtcactggaaattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttccta 12897343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12905147 - 12904964
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12905147 gatccatgtaactgatatctttctaggctcaactctgtaactcgttcatgcatggggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 12905048  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    ||||||||||||||||    | ||||||||    ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12905047 tccaagattcaagagcattgtatgggtcactagttattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttccta 12904964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12946602 - 12946419
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12946602 gatccatgtaactgatatctttctagagtcaactgtgtaactcgttcatgcatggggctgcatgtgattccatgccacttgcagaagtgaatggatgaat 12946503  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12946502 tccaagattcaagagctttgtatgggtcactggaaattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttccta 12946419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12956039 - 12955856
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12956039 gatccatgtaactgatatctttttaggctcaactctgtaactcgttcatgcatggggctgcatgtgattccttgccacttgcagaaatggatggaagaat 12955940  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    ||||||||||||||||    | ||||||||   | |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12955939 tccaagattcaagagcattgtatgggtcacttgaaattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttccta 12955856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12956363 - 12956110
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||  | || |  |||||| |||||||||||||  ||||||     
T  12956363 gttaagcttgaaagatttcctatgaatgaagggattccaccagttaacttgtttctccaaacagtcattctttgaagctttttcaaagagccgatttcag 12956264  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || ||| | | || ||||||   ||||   ||   ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||| ||| |||||||||    
T  12956263 ttggtattttaccattgagatggttcccattcaaaaacaataatttgagattggagcaatatgtcaagtttgttggaatctcacctacaaaagagttatt 12956164  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    ||||||  ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12956163 gctgagagaaagtcgttgcaaatgtagcaactgacccaactcctgtggaatttc 12956110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12930237 - 12930054
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12930237 gatccatgtaactgatatctttttaggctcaactctgtaactcgttcatgcatggggctacatgtgattccatgccacttgcagaagtggatggaagaat 12930138  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    |||||||||||||||     | ||||||||    ||||| |||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  12930137 tccaagattcaagagtattgtatgggtcactagttattgattctttgaatttgagcaatgccagatgatcagtttgctttccta 12930054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12905471 - 12905218
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||    || || |||||| |||||||||||||  ||||||     
T  12905471 gttaagcttgaaatatttcctatgaatgaagggattccaccggttaacttgtttctccaaacactcattgtttgaagctttttcaaagagccgatttcag 12905372  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || ||||| | || ||||||   |||||  ||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  12905371 ttggtattttaccaatgagatggttcccattcaaatacaataacttgagattggagcaatatgtcaggtttgtaggaatctcacctacaaaagaattatt 12905272  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    |||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  12905271 gctgagaataagttgttgcaaatgtagcaactgacccaaatcctgaggaatttc 12905218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12946926 - 12946673
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||  ||  | || || |||||  || ||||||||||  ||||||     
T  12946926 gttaagcttgaaagatttccaatgaatgaagggattcctccgattaaattgtttttcgcaacagtcattgcttgaaccttcttcaaagagccgatttcag 12946827  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || || || | || |||||| | ||||   ||   ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  12946826 ttggtattttaccgatgagatggttcccactcaaaaacaaaaatttgagtttggaacaatatgtcaggtttgtaggaatctcacctgcaaaagagttatt 12946727  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    | |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12946726 gttgagaaaaagttgttgcaaatgtagcaactgacccaactcctgtggaatttc 12946673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12897850 - 12897597
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||    || ||||||||| |||||||||||||  | ||||     
T  12897850 gttaagcttgaaagatttccaatgaatgaagggattcctccggttaaattgttattccgaacaaacattgattgaagctttttcaaagagccgaattcag 12897751  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || ||||| | || ||||||   |||||  ||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  12897750 ttggtattttaccaatgagatggttcccattcaaatacaataacttgagattggagcaatatgtcaggtttgtaggaatctcacctacaaaagaattatt 12897651  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    | |||| | ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  12897650 ggtgagaataaggtgttgcaaatgtagcaactgacccaaatcctgaggaatttc 12897597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12930561 - 12930308
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |  || |||| ||  |  | || |||||| ||||||||||||| |||||||     
T  12930561 gttaagcatgaaagatttcctataaatgaagggattccttcggttaaatggttattcccaacagatattgcttgaagctttttcaaagagccaatttcaa 12930462  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || ||| | | || ||||||   |||||  ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  12930461 ttggtattttaccattgagatggttcccattcaaatacaataatttgagattggagcaatatgtcaggtttgtaggaatctcacctacaaaagaattatt 12930362  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    | |||| | ||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12930361 ggtgagaataagatgttgcaaatgtagcaactgacccaactcctgtggaatttc 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12955678 - 12955578
Alignment:
Q  462 gaaatggatggaagaattccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttcct 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||   | |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12955678 gaaatggatggaagaattccaagattcaagagcattgtatgggtcactagaaattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttcct 12955579  T
Q  562 a 562  Q
    |    
T  12955578 a 12955578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 562
Target Start/End: Original strand, 17925654 - 17925837
Alignment:
Q  380 gatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 478  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17925654 gatccatgtaactgatatctttttaggctcaactctgtaactcgttcatgcatggggctgcatgtgattccatgccacttgcagaaatggatggaagaat 17925753  T
Q  479 tccaagattcaagagctccatttgggtcacggtatattgtttctttgaatttaatcaatgcaaaatgatctgtttggtttccta 562  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||   | |||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17925754 tccaagattcaagagctttgtatgggtcactagaaattgattctttgaatttgagcaatgccaaatgatcagtttggtttccta 17925837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Original strand, 17925330 - 17925583
Alignment:
Q  69 gttaagcttgaaagattccctatgaatgaagggattcctccagttaatttatttttccaaatggccaatgattgaagttttttcaaagagctaatttcat 168  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||  | ||  | ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  17925330 gttaagcatgaaagatttcctatgaatgaagggattcctccagttaaattgttatgcgcaacagtcatggcttgaagttttttcaaagagccgatttcag 17925429  T
Q  169 ttggtatcttgccaattaaattgttccctcccaaatctaagtctttaagattggagcaatatgtgaggtttgtaggaatttctcctgcaagagagttatt 268  Q
    ||||||| || ||||| | || |||||| | ||||   ||   ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  17925430 ttggtattttaccaatgagatggttcccactcaaaaacaataatttgagattagaacaatatgtcaggtttgtaggaatctcacctacaaaagaattatt 17925529  T
Q  269 gctgagtaaaagttgttccaattgtagcaaccgacccaactcttgtggaatttc 322  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17925530 gctgagaaaaagttgctgcaaatgtagcaactgacccaactcctgtggaatttc 17925583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 31469398 - 31469483
Alignment:
Q  371 ggtgatattgatccatgcaactgatatccttctaggttcaactttgtaactc-ttgatgcatgaggctgcatgtgattccatgccacttgca 461  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  31469398 ggtgatatagatccatgcaacttatatccttctagtttcaattctgtaactctttgattca------tgcatgtgattccatgccacttgca 31469483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University