View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3431_low_2 (Length: 639)

Name: NF3431_low_2
Description: NF3431
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3431_low_2
NF3431_low_2
[»] chr1 (83 HSPs)
chr1 (132-430)||(12481060-12481355)
chr1 (132-431)||(31703768-31704063)
chr1 (132-432)||(49140142-49140439)
chr1 (133-432)||(26707195-26707491)
chr1 (152-430)||(44322831-44323109)
chr1 (132-431)||(37576335-37576631)
chr1 (152-431)||(23476341-23476620)
chr1 (152-428)||(49643674-49643950)
chr1 (152-419)||(37304199-37304466)
chr1 (152-432)||(16024068-16024348)
chr1 (132-429)||(6797809-6798103)
chr1 (132-428)||(9006194-9006487)
chr1 (132-431)||(1762674-1762970)
chr1 (132-432)||(12127056-12127349)
chr1 (132-431)||(27547669-27547965)
chr1 (152-432)||(4696881-4697161)
chr1 (152-432)||(20306173-20306453)
chr1 (132-428)||(37585696-37585989)
chr1 (132-432)||(45052689-45052985)
chr1 (132-419)||(37284740-37285024)
chr1 (152-428)||(35612085-35612361)
chr1 (269-438)||(1762962-1763131)
chr1 (269-426)||(45843405-45843562)
chr1 (269-432)||(12481347-12481510)
chr1 (275-431)||(16023897-16024053)
chr1 (193-419)||(39486214-39486440)
chr1 (152-327)||(25995955-25996130)
chr1 (269-432)||(45052977-45053140)
chr1 (269-431)||(27547957-27548119)
chr1 (275-432)||(37304027-37304184)
chr1 (275-428)||(20306005-20306158)
chr1 (275-432)||(23476635-23476792)
chr1 (275-419)||(6798101-6798245)
chr1 (269-432)||(2064499-2064662)
chr1 (269-419)||(49140431-49140580)
chr1 (275-432)||(3089341-3089498)
chr1 (271-428)||(38000492-38000649)
chr1 (269-432)||(8762687-8762850)
chr1 (275-426)||(35612376-35612527)
chr1 (262-432)||(8760271-8760441)
chr1 (275-432)||(26723095-26723252)
chr1 (275-426)||(25995789-25995940)
chr1 (269-426)||(12127341-12127501)
chr1 (269-432)||(49643959-49644121)
chr1 (269-431)||(37576181-37576343)
chr1 (269-426)||(4330125-4330282)
chr1 (269-430)||(38127710-38127871)
chr1 (269-385)||(31703660-31703776)
chr1 (269-431)||(37285016-37285177)
chr1 (269-432)||(9006479-9006641)
chr1 (292-432)||(23598071-23598213)
chr1 (286-432)||(34967026-34967173)
chr1 (286-432)||(46593535-46593681)
chr1 (269-409)||(37585981-37586121)
chr1 (280-432)||(10831130-10831281)
chr1 (269-409)||(39486481-39486620)
chr1 (303-426)||(5537126-5537249)
chr1 (269-372)||(27400712-27400815)
chr1 (283-426)||(46592817-46592959)
chr1 (303-432)||(5536397-5536526)
chr1 (303-426)||(34966308-34966431)
chr1 (132-268)||(27400587-27400720)
chr1 (286-385)||(49837417-49837516)
chr1 (132-255)||(2064387-2064507)
chr1 (132-266)||(8762564-8762695)
chr1 (330-426)||(10831935-10832031)
chr1 (152-255)||(3089513-3089616)
chr1 (324-431)||(37467563-37467670)
chr1 (308-432)||(32047742-32047866)
chr1 (345-431)||(13109191-13109277)
chr1 (345-404)||(4697163-4697222)
chr1 (308-428)||(28884020-28884140)
chr1 (308-429)||(28884750-28884871)
chr1 (308-429)||(32048509-32048630)
chr1 (132-242)||(38127863-38127970)
chr1 (351-431)||(49838756-49838835)
chr1 (345-431)||(13183766-13183852)
chr1 (358-428)||(46289327-46289397)
chr1 (288-432)||(37466801-37466943)
chr1 (152-225)||(4330043-4330116)
chr1 (350-432)||(52412903-52412985)
chr1 (282-321)||(33332287-33332326)
chr1 (282-325)||(46015766-46015809)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (132-431)||(41453005-41453301)
chr7 (132-431)||(7578872-7579168)
chr7 (132-431)||(48626063-48626359)
chr7 (132-431)||(6356919-6357215)
chr7 (152-431)||(35146699-35146977)
chr7 (132-432)||(28286116-28286413)
chr7 (152-429)||(8542670-8542946)
chr7 (152-432)||(21391189-21391469)
chr7 (132-431)||(1114208-1114495)
chr7 (152-432)||(6356456-6356736)
chr7 (152-428)||(31637946-31638222)
chr7 (132-411)||(36423523-36423799)
chr7 (152-432)||(8936848-8937128)
chr7 (132-430)||(19681496-19681791)
chr7 (132-432)||(10526465-10526761)
chr7 (182-431)||(17749935-17750184)
chr7 (132-411)||(41191702-41191981)
chr7 (132-409)||(28297973-28298247)
chr7 (152-432)||(41751821-41752102)
chr7 (184-428)||(17363437-17363683)
chr7 (269-432)||(10526310-10526473)
chr7 (132-334)||(17359335-17359538)
chr7 (269-426)||(41453293-41453450)
chr7 (132-403)||(33716742-33717005)
chr7 (269-431)||(44332807-44332969)
chr7 (269-432)||(6356764-6356927)
chr7 (269-419)||(33716600-33716750)
chr7 (269-432)||(19681783-19681946)
chr7 (269-426)||(1114059-1114216)
chr7 (269-407)||(17359205-17359343)
chr7 (269-442)||(8937137-8937309)
chr7 (269-410)||(28297840-28297981)
chr7 (269-426)||(41191973-41192130)
chr7 (277-432)||(8542498-8542653)
chr7 (269-432)||(48626351-48626514)
chr7 (275-432)||(31075487-31075644)
chr7 (275-431)||(21391484-21391640)
chr7 (275-426)||(4931567-4931718)
chr7 (274-411)||(7909459-7909596)
chr7 (269-428)||(6356289-6356447)
chr7 (275-428)||(7909290-7909442)
chr7 (269-426)||(28286405-28286562)
chr7 (278-431)||(31638240-31638393)
chr7 (277-419)||(35146985-35147127)
chr7 (298-431)||(16867707-16867840)
chr7 (309-430)||(36673976-36674097)
chr7 (132-429)||(40673014-40673301)
chr7 (275-419)||(41751662-41751806)
chr7 (132-273)||(44332677-44332815)
chr7 (269-407)||(27738953-27739090)
chr7 (269-419)||(34037199-34037349)
chr7 (280-432)||(8416484-8416635)
chr7 (269-432)||(43247414-43247577)
chr7 (269-419)||(7579160-7579310)
chr7 (286-431)||(41891966-41892111)
chr7 (303-431)||(36282786-36282914)
chr7 (303-432)||(4155597-4155726)
chr7 (269-409)||(36423391-36423531)
chr7 (132-295)||(34037047-34037207)
chr7 (132-273)||(43247569-43247707)
chr7 (288-426)||(36283512-36283651)
chr7 (269-354)||(40673293-40673378)
chr7 (308-432)||(29277670-29277794)
chr7 (330-419)||(8417285-8417374)
chr7 (309-396)||(32946669-32946756)
chr7 (345-429)||(29276877-29276961)
chr7 (283-407)||(41893379-41893501)
chr7 (280-407)||(28264587-28264714)
chr7 (345-432)||(36674095-36674180)
chr7 (301-432)||(28263495-28263626)
chr7 (301-407)||(4156509-4156615)
chr7 (275-337)||(38447600-38447661)
chr7 (371-432)||(36423790-36423851)
chr7 (330-383)||(46540017-46540070)
chr7 (350-432)||(10625389-10625471)
chr7 (337-428)||(38447691-38447778)
chr7 (308-385)||(29276950-29277027)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (132-432)||(5900422-5900719)
chr3 (132-432)||(1994168-1994464)
chr3 (132-432)||(42591938-42592235)
chr3 (132-432)||(4757493-4757789)
chr3 (132-432)||(51509118-51509415)
chr3 (132-432)||(39664183-39664480)
chr3 (132-438)||(22151999-22152304)
chr3 (132-429)||(54752317-54752611)
chr3 (132-428)||(10505951-10506244)
chr3 (132-432)||(54107901-54108198)
chr3 (132-431)||(26318182-26318478)
chr3 (132-431)||(47669413-47669709)
chr3 (152-432)||(27801660-27801940)
chr3 (132-428)||(44893894-44894187)
chr3 (132-411)||(8473866-8474142)
chr3 (132-438)||(21969783-21970088)
chr3 (132-438)||(21992219-21992524)
chr3 (132-431)||(24428721-24429017)
chr3 (152-432)||(11256274-11256554)
chr3 (152-432)||(53716464-53716744)
chr3 (152-429)||(29818348-29818625)
chr3 (152-431)||(12203551-12203830)
chr3 (152-431)||(15986406-15986684)
chr3 (153-432)||(21568917-21569196)
chr3 (152-431)||(22201787-22202066)
chr3 (132-432)||(4773396-4773693)
chr3 (132-430)||(16931760-16932055)
chr3 (152-432)||(18464627-18464907)
chr3 (152-400)||(41834957-41835205)
chr3 (222-432)||(1999327-1999537)
chr3 (152-411)||(19883410-19883670)
chr3 (132-432)||(47303018-47303314)
chr3 (152-403)||(46152784-46153032)
chr3 (132-364)||(39241512-39241741)
chr3 (269-449)||(4757781-4757960)
chr3 (132-353)||(32633143-32633361)
chr3 (269-429)||(1994456-1994616)
chr3 (269-432)||(5900711-5900874)
chr3 (152-376)||(39951528-39951748)
chr3 (280-431)||(45306991-45307142)
chr3 (269-431)||(10506236-10506398)
chr3 (269-426)||(39241363-39241520)
chr3 (269-431)||(54108190-54108352)
chr3 (271-426)||(29818182-29818337)
chr3 (269-431)||(39664472-39664634)
chr3 (269-419)||(44893752-44893902)
chr3 (275-432)||(18464455-18464612)
chr3 (269-426)||(47669264-47669421)
chr3 (280-428)||(47303315-47303463)
chr3 (276-432)||(53716294-53716449)
chr3 (269-431)||(42591784-42591946)
chr3 (269-426)||(21969634-21969791)
chr3 (269-426)||(21992070-21992227)
chr3 (275-411)||(21568766-21568902)
chr3 (272-432)||(28986433-28986592)
chr3 (269-432)||(22151844-22152007)
chr3 (275-426)||(22201621-22201772)
chr3 (269-432)||(26318470-26318633)
chr3 (269-432)||(32633353-32633516)
chr3 (278-419)||(12791473-12791614)
chr3 (275-432)||(24428566-24428723)
chr3 (275-432)||(46152614-46152771)
chr3 (269-432)||(16931605-16931768)
chr3 (269-432)||(4773242-4773404)
chr3 (275-426)||(27801494-27801645)
chr3 (269-426)||(8474134-8474291)
chr3 (270-418)||(12203840-12203988)
chr3 (269-411)||(15986255-15986397)
chr3 (196-330)||(28986261-28986395)
chr3 (269-419)||(54752175-54752325)
chr3 (286-431)||(45306832-45306977)
chr3 (280-431)||(44317514-44317665)
chr3 (275-432)||(11256102-11256259)
chr3 (269-426)||(41835214-41835371)
chr3 (269-426)||(51509407-51509562)
chr3 (280-432)||(49528148-49528300)
chr3 (280-428)||(13866023-13866171)
chr3 (320-431)||(28985509-28985620)
chr3 (309-432)||(7681451-7681575)
chr3 (269-405)||(39951383-39951519)
chr3 (313-418)||(7163463-7163568)
chr3 (314-419)||(15790691-15790796)
chr3 (330-432)||(30681766-30681868)
chr3 (326-432)||(15791454-15791555)
chr3 (280-432)||(20963525-20963676)
chr3 (312-432)||(30681028-30681148)
chr3 (301-426)||(49529076-49529201)
chr3 (345-432)||(42853245-42853331)
chr3 (301-431)||(13866920-13867050)
chr3 (301-434)||(44316624-44316756)
chr3 (330-419)||(43844384-43844473)
chr3 (330-407)||(43839984-43840061)
chr3 (396-430)||(42853340-42853374)
chr3 (286-407)||(8327680-8327801)
chr3 (275-307)||(19883363-19883395)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (132-431)||(24316-24612)
scaffold0186 (269-443)||(24150-24324)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (132-431)||(8592123-8592419)
chr4 (132-432)||(16037793-16038090)
chr4 (132-432)||(25181811-25182108)
chr4 (132-432)||(46849668-46849965)
chr4 (132-431)||(44991279-44991574)
chr4 (152-431)||(623679-623958)
chr4 (132-432)||(42855338-42855635)
chr4 (132-428)||(43734289-43734582)
chr4 (132-431)||(53994934-53995230)
chr4 (152-429)||(50768992-50769269)
chr4 (152-432)||(6505536-6505815)
chr4 (132-432)||(14985485-14985782)
chr4 (132-428)||(19088344-19088637)
chr4 (132-430)||(53750903-53751198)
chr4 (132-431)||(38339646-38339942)
chr4 (152-429)||(43566380-43566657)
chr4 (132-430)||(30683527-30683824)
chr4 (132-431)||(33091453-33091749)
chr4 (152-432)||(24898360-24898640)
chr4 (132-430)||(1433272-1433567)
chr4 (156-432)||(15477644-15477920)
chr4 (132-432)||(6712117-6712412)
chr4 (152-432)||(12817977-12818257)
chr4 (152-432)||(41877859-41878138)
chr4 (152-417)||(39448502-39448767)
chr4 (132-431)||(19508413-19508709)
chr4 (132-431)||(21763180-21763477)
chr4 (132-411)||(37206447-37206723)
chr4 (154-429)||(36122435-36122710)
chr4 (152-429)||(52557089-52557366)
chr4 (152-385)||(53259184-53259417)
chr4 (152-411)||(23755438-23755697)
chr4 (197-431)||(8398031-8398264)
chr4 (132-432)||(41751817-41752112)
chr4 (132-376)||(50508512-50508753)
chr4 (269-432)||(16038082-16038245)
chr4 (269-432)||(6711962-6712125)
chr4 (269-432)||(8591968-8592131)
chr4 (269-431)||(53751190-53751352)
chr4 (269-432)||(14985330-14985493)
chr4 (269-432)||(19088629-19088792)
chr4 (269-432)||(25182100-25182263)
chr4 (269-431)||(39448776-39448938)
chr4 (275-432)||(623973-624130)
chr4 (269-426)||(33091741-33091898)
chr4 (275-419)||(53259432-53259576)
chr4 (269-432)||(1433559-1433722)
chr4 (269-432)||(21763469-21763632)
chr4 (275-426)||(24898194-24898345)
chr4 (269-431)||(38339492-38339654)
chr4 (269-426)||(30683816-30683973)
chr4 (276-431)||(15477940-15478095)
chr4 (269-419)||(43734574-43734724)
chr4 (269-419)||(46849957-46850107)
chr4 (275-432)||(44957388-44957545)
chr4 (288-432)||(25269307-25269451)
chr4 (275-426)||(23756094-23756245)
chr4 (273-432)||(36122725-36122883)
chr4 (269-432)||(42855627-42855790)
chr4 (269-418)||(41752104-41752253)
chr4 (275-432)||(50768820-50768977)
chr4 (275-419)||(52557381-52557525)
chr4 (269-432)||(12817805-12817968)
chr4 (275-410)||(20888164-20888299)
chr4 (285-432)||(44125774-44125921)
chr4 (269-432)||(44991566-44991729)
chr4 (269-432)||(53995222-53995386)
chr4 (269-392)||(19508701-19508824)
chr4 (269-431)||(37206715-37206877)
chr4 (287-432)||(55022283-55022427)
chr4 (276-409)||(49135928-49136065)
chr4 (269-409)||(50508745-50508885)
chr4 (269-432)||(41878147-41878309)
chr4 (269-395)||(43566666-43566792)
chr4 (292-431)||(44957668-44957807)
chr4 (319-432)||(4513254-4513367)
chr4 (298-429)||(44125624-44125755)
chr4 (286-432)||(47602942-47603088)
chr4 (280-431)||(52692740-52692889)
chr4 (330-432)||(47603710-47603812)
chr4 (333-411)||(52692044-52692122)
chr4 (152-253)||(44957560-44957661)
chr4 (152-246)||(23755985-23756079)
chr4 (343-432)||(31214161-31214250)
chr4 (345-411)||(55022424-55022490)
chr4 (74-131)||(37210896-37210953)
chr4 (350-426)||(44432929-44433005)
chr4 (356-432)||(48209947-48210023)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (152-432)||(21856554-21856834)
chr6 (132-431)||(35167490-35167788)
chr6 (132-428)||(5937816-5938109)
chr6 (152-429)||(25176665-25176936)
chr6 (155-432)||(6235920-6236197)
chr6 (132-432)||(9046240-9046537)
chr6 (132-429)||(5310980-5311274)
chr6 (132-452)||(3423150-3423466)
chr6 (132-432)||(18053110-18053404)
chr6 (152-431)||(2517173-2517452)
chr6 (132-432)||(34890798-34891094)
chr6 (132-432)||(7270783-7271080)
chr6 (132-431)||(31237900-31238196)
chr6 (155-428)||(34994383-34994656)
chr6 (173-429)||(32753365-32753621)
chr6 (152-431)||(26957133-26957411)
chr6 (152-431)||(31247287-31247566)
chr6 (132-432)||(6137378-6137674)
chr6 (132-432)||(7270107-7270404)
chr6 (132-429)||(32993017-32993311)
chr6 (132-411)||(26600511-26600777)
chr6 (255-429)||(15932830-15933004)
chr6 (132-431)||(24744482-24744770)
chr6 (268-432)||(978414-978578)
chr6 (269-432)||(21856843-21857006)
chr6 (269-431)||(32753177-32753339)
chr6 (269-432)||(18052955-18053118)
chr6 (269-432)||(32993303-32993466)
chr6 (269-431)||(9046086-9046248)
chr6 (269-426)||(2517007-2517164)
chr6 (269-432)||(26600356-26600519)
chr6 (269-431)||(6532192-6532354)
chr6 (276-429)||(10412796-10412949)
chr6 (152-307)||(5639297-5639452)
chr6 (269-419)||(21540265-21540415)
chr6 (269-411)||(24744348-24744490)
chr6 (269-426)||(5938101-5938258)
chr6 (269-426)||(31237751-31237908)
chr6 (269-429)||(6137666-6137825)
chr6 (269-432)||(34890643-34890806)
chr6 (275-431)||(34994674-34994830)
chr6 (269-419)||(5310838-5310988)
chr6 (275-429)||(6236215-6236369)
chr6 (269-432)||(7269950-7270115)
chr6 (269-426)||(5639461-5639618)
chr6 (275-426)||(31247121-31247272)
chr6 (280-431)||(17244664-17244815)
chr6 (280-431)||(34517991-34518142)
chr6 (320-432)||(7438803-7438915)
chr6 (296-428)||(14276402-14276534)
chr6 (269-385)||(3423458-3423574)
chr6 (287-385)||(3035926-3036025)
chr6 (286-432)||(29261255-29261402)
chr6 (275-378)||(26957015-26957118)
chr6 (269-387)||(7270673-7270791)
chr6 (270-356)||(25176946-25177032)
chr6 (331-432)||(15932729-15932830)
chr6 (280-431)||(6228730-6228880)
chr6 (283-426)||(15286350-15286492)
chr6 (303-426)||(29260536-29260658)
chr6 (330-432)||(34517271-34517373)
chr6 (352-432)||(25180219-25180299)
chr6 (359-432)||(35167833-35167906)
chr6 (132-224)||(21540184-21540273)
chr6 (308-431)||(27829292-27829414)
chr6 (282-432)||(17245561-17245711)
chr6 (327-432)||(34251553-34251656)
chr6 (301-407)||(6229643-6229748)
chr6 (269-326)||(35167780-35167837)
chr6 (350-431)||(1158588-1158669)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (132-428)||(19862-20155)
scaffold0182 (269-426)||(19713-19870)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (152-432)||(7495979-7496258)
chr2 (132-428)||(8173888-8174181)
chr2 (132-431)||(15744611-15744897)
chr2 (152-432)||(15405755-15406035)
chr2 (132-430)||(12860381-12860663)
chr2 (152-432)||(13193159-13193439)
chr2 (132-432)||(24371966-24372263)
chr2 (152-428)||(19815707-19815983)
chr2 (132-432)||(34735342-34735639)
chr2 (132-428)||(2147888-2148182)
chr2 (152-432)||(29472413-29472693)
chr2 (132-430)||(26181701-26181996)
chr2 (152-431)||(41474253-41474532)
chr2 (132-385)||(10992005-10992255)
chr2 (132-411)||(16305179-16305455)
chr2 (132-426)||(17052212-17052499)
chr2 (132-428)||(7469320-7469605)
chr2 (132-419)||(36713742-36714023)
chr2 (217-432)||(24138067-24138282)
chr2 (261-428)||(30898581-30898748)
chr2 (269-432)||(7496267-7496430)
chr2 (269-426)||(7469171-7469328)
chr2 (269-432)||(33470211-33470374)
chr2 (269-432)||(19847606-19847769)
chr2 (269-432)||(24372255-24372418)
chr2 (275-432)||(13192987-13193144)
chr2 (269-426)||(15744462-15744619)
chr2 (269-432)||(8174173-8174336)
chr2 (269-432)||(10991850-10992013)
chr2 (275-431)||(29472242-29472398)
chr2 (273-429)||(38332972-38333128)
chr2 (269-431)||(34735631-34735793)
chr2 (269-431)||(26181988-26182150)
chr2 (269-431)||(38332704-38332866)
chr2 (269-432)||(16305024-16305187)
chr2 (275-411)||(15406050-15406186)
chr2 (269-428)||(2148174-2148333)
chr2 (269-432)||(19815992-19816155)
chr2 (275-401)||(42834452-42834578)
chr2 (269-385)||(12860655-12860771)
chr2 (269-431)||(24138794-24138957)
chr2 (269-431)||(36713588-36713750)
chr2 (269-426)||(41474087-41474244)
chr2 (302-428)||(8444825-8444951)
chr2 (132-260)||(19847490-19847614)
chr2 (280-419)||(8962372-8962510)
chr2 (321-432)||(17032592-17032703)
chr2 (321-432)||(17050928-17051039)
chr2 (132-227)||(24138710-24138802)
chr2 (315-426)||(8445123-8445234)
chr2 (330-431)||(8963166-8963267)
chr2 (132-223)||(38332858-38332946)
chr2 (301-406)||(23992162-23992267)
chr2 (282-321)||(13810489-13810528)
chr2 (269-324)||(17052164-17052220)
chr2 (342-410)||(19847297-19847361)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (132-432)||(72916-73212)
scaffold0029 (269-432)||(72761-72924)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (132-432)||(27186027-27186324)
chr5 (152-432)||(36440199-36440479)
chr5 (152-431)||(37424262-37424541)
chr5 (152-431)||(38958724-38959003)
chr5 (152-419)||(16860315-16860582)
chr5 (152-429)||(35569777-35570059)
chr5 (132-411)||(9989477-9989753)
chr5 (152-429)||(24040087-24040366)
chr5 (132-430)||(32288079-32288373)
chr5 (132-419)||(2183097-2183381)
chr5 (153-411)||(29198972-29199230)
chr5 (152-403)||(11316129-11316376)
chr5 (237-429)||(39325414-39325606)
chr5 (238-428)||(25182910-25183100)
chr5 (269-437)||(9989317-9989485)
chr5 (132-387)||(34264406-34264644)
chr5 (275-431)||(38959018-38959173)
chr5 (269-431)||(24040375-24040537)
chr5 (275-431)||(39325649-39325805)
chr5 (269-432)||(2182942-2183105)
chr5 (269-432)||(36440488-36440651)
chr5 (269-426)||(37424553-37424709)
chr5 (269-431)||(27185874-27186035)
chr5 (275-407)||(11315982-11316114)
chr5 (285-431)||(1140077-1140215)
chr5 (269-426)||(32288365-32288521)
chr5 (275-411)||(35570074-35570210)
chr5 (275-432)||(25567282-25567439)
chr5 (269-431)||(34264636-34264802)
chr5 (280-430)||(19184598-19184748)
chr5 (152-264)||(16860587-16860699)
chr5 (308-428)||(31756629-31756749)
chr5 (362-431)||(19128434-19128503)
chr5 (301-432)||(19185504-19185635)
chr5 (356-410)||(33817659-33817713)
chr5 (152-223)||(25567196-25567267)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (132-432)||(81857-82154)
scaffold0032 (325-426)||(90782-90883)
scaffold0032 (269-354)||(82146-82231)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (132-432)||(349227-349523)
scaffold0003 (152-431)||(113537-113816)
scaffold0003 (269-411)||(349093-349235)
scaffold0003 (302-432)||(113392-113522)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (152-432)||(14134-14414)
scaffold0134 (269-432)||(14423-14586)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (132-429)||(50478-50772)
scaffold0019 (269-431)||(50764-50927)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (132-427)||(8582-8874)
scaffold0221 (269-432)||(8428-8590)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (132-429)||(15048553-15048847)
chr8 (152-431)||(27473072-27473350)
chr8 (152-431)||(34470715-34470994)
chr8 (152-432)||(37569313-37569594)
chr8 (132-431)||(45276597-45276892)
chr8 (132-429)||(38588741-38589035)
chr8 (132-431)||(15871621-15871917)
chr8 (152-429)||(5434902-5435179)
chr8 (152-432)||(1870104-1870386)
chr8 (152-430)||(5152536-5152813)
chr8 (152-432)||(11707749-11708029)
chr8 (152-428)||(40048226-40048501)
chr8 (132-432)||(1646500-1646803)
chr8 (132-427)||(1739952-1740244)
chr8 (132-411)||(27669570-27669850)
chr8 (152-428)||(44594604-44594880)
chr8 (241-432)||(33819784-33819975)
chr8 (269-426)||(1432136-1432293)
chr8 (152-428)||(7534845-7535112)
chr8 (132-431)||(45077221-45077499)
chr8 (275-432)||(27473365-27473522)
chr8 (275-432)||(33295978-33296135)
chr8 (231-431)||(40659983-40660183)
chr8 (269-411)||(38588607-38588749)
chr8 (269-431)||(15048399-15048561)
chr8 (269-428)||(1651860-1652018)
chr8 (269-428)||(1740236-1740394)
chr8 (269-432)||(45077491-45077654)
chr8 (269-432)||(45276884-45277047)
chr8 (269-419)||(7949424-7949574)
chr8 (269-431)||(15871909-15872071)
chr8 (275-428)||(40660180-40660333)
chr8 (279-411)||(1869953-1870085)
chr8 (282-426)||(11173935-11174079)
chr8 (269-411)||(5152822-5152964)
chr8 (269-419)||(5435188-5435338)
chr8 (275-432)||(7535127-7535284)
chr8 (280-432)||(22763232-22763384)
chr8 (275-411)||(44594895-44595031)
chr8 (269-432)||(1646795-1646957)
chr8 (269-407)||(27669440-27669578)
chr8 (309-428)||(33295739-33295858)
chr8 (132-290)||(7949566-7949721)
chr8 (152-255)||(33295860-33295963)
chr8 (132-284)||(1651719-1651868)
chr8 (275-363)||(18298523-18298611)
chr8 (308-432)||(24666005-24666129)
chr8 (152-271)||(1432302-1432421)
chr8 (345-432)||(11920136-11920223)
chr8 (152-261)||(24659366-24659475)
chr8 (349-432)||(24652822-24652905)
chr8 (282-409)||(37569616-37569743)
chr8 (330-431)||(22762513-22762614)
chr8 (275-409)||(40048089-40048215)
chr8 (282-431)||(15740613-15740760)
chr8 (193-261)||(18298410-18298478)
chr8 (372-432)||(11920075-11920135)
chr8 (343-411)||(33819975-33820043)
chr8 (356-431)||(12643891-12643966)
chr8 (356-431)||(15741607-15741682)
chr8 (132-207)||(11173858-11173930)
chr8 (356-432)||(30650189-30650265)
chr8 (350-426)||(39912224-39912300)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (132-431)||(18427-18723)
scaffold0340 (269-426)||(18278-18435)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (132-431)||(15602-15898)
scaffold0072 (269-411)||(15473-15610)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (165-407)||(6179-6420)
scaffold0246 (275-385)||(6044-6154)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (240-411)||(56395-56566)
scaffold0037 (240-411)||(63520-63691)
scaffold0037 (269-432)||(45755-45918)
scaffold0037 (132-245)||(45910-46020)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (269-432)||(20750-20913)
scaffold0220 (132-317)||(20905-21086)
[»] scaffold0115 (3 HSPs)
scaffold0115 (269-432)||(21511-21673)
scaffold0115 (279-432)||(22451-22604)
scaffold0115 (132-284)||(21665-21814)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (275-392)||(14231-14347)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (275-386)||(147134-147245)
scaffold0001 (284-411)||(144040-144166)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (280-432)||(9781-9932)
scaffold0225 (284-407)||(10860-10982)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 83)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12481355 - 12481060
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12481355 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 12481259  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12481258 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 12481159  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12481158 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 12481060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 31703768 - 31704063
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31703768 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 31703864  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31703865 tatggttca-atgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacataaagcctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagt 31703963  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31703964 aacagtgagaaacttataggtccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 31704063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49140439 - 49140142
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  49140439 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggttatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 49140343  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49140342 tatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagt 49140243  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  49140242 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 49140143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 133 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707195
Alignment:
Q  133 atgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgtt 232  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 26707395  T
Q  233 atggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagta 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26707394 atggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcagatacccacataacacaaactccaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagta 26707295  T
Q  333 acggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  26707294 acggggagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccgatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtatttaagcct 26707195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 152 - 430
Target Start/End: Original strand, 44322831 - 44323109
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44322831 tttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 44322930  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322931 gaaacaggaggtcacgtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 44323030  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44323031 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 44323109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 37576335 - 37576631
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37576335 tatgtgggtcctctaactt---tatttataagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 37576431  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37576432 tatgattcatatgtatgtgtgaaacagggggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagt 37576531  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37576532 aacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 37576631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23476620 - 23476341
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476620 tttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 23476521  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23476520 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacagattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtgg 23476421  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23476420 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 23476341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49643950 - 49643674
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |    
T  49643950 tttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatattattggtaactgctatggttcatatgtatgtat 49643851  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49643850 gaaacaggaggtcaaatacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 49643751  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49643750 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 49643674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 419
Target Start/End: Original strand, 37304199 - 37304466
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37304199 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 37304298  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304299 gaaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 37304398  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37304399 accgaaataaatcaatttttagttataggatcaatccgataccaattaaatagttagagggccaaaaa 37304466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 16024068 - 16024348
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16024068 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 16024167  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024168 gaaacaggaggtcaggcacccacataacataaaccctaacgtttatttgaataaaactaccagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 16024267  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16024268 accgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcct 16024348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6798103 - 6797809
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6798103 tatgagggtcctctaattt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaattgt 6798007  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6798006 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggcacccacataacacaaactctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatggagt 6797907  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6797906 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaagatcaatctgatatcaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaattaag 6797809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9006487 - 9006194
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  9006487 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 9006391  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9006390 tatagttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtact 9006291  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  9006290 aacggtgataaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 9006194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1762970 - 1762674
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1762970 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 1762874  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  1762873 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaaatacccacataatacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacataaatgattaaatgttgt 1762774  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1762773 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 1762674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12127349 - 12127056
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  12127349 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgt 12127253  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||    |||||| | ||| |||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  12127252 tatggttcatatgt----gtgaaacaagaggtcagatattcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaga 12127157  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12127156 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 12127057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27547965 - 27547669
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  27547965 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtactatgctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatactattggtaactgt 27547869  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  27547868 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcaggtacccacatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaaggactaaatgtatt 27547769  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  27547768 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaagaccaaaaaggtaattaagcc 27547669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4697161 - 4696881
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4697161 tttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgt 4697062  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4697061 gaaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 4696962  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||| |||||    
T  4696961 accaaaataaatcaatttttagttataggaccaatccgataccaattaaatagttagaggactaaaaagataatttagcct 4696881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 20306173 - 20306453
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20306173 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 20306272  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20306273 gaaacatgaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaagg 20306372  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20306373 accaaaataaatcaatctttagttggaggatcaatctgataccaattaactagttagaggaccaaagaggtaattaagcct 20306453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37585989 - 37585696
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  37585989 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgt 37585893  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  37585892 tatggttcatatgtatgtgtgaaacatgaggtcaggtagctacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatataat 37585793  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37585792 aacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaa 37585696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45052985 - 45052689
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  45052985 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 45052889  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45052888 tatggtttatatgtatgtgtgaaacaagaggtcaaatatccacataaca-aaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagt 45052790  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||  ||||||||||    
T  45052789 aacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagtttgaagatcaaaaagataattaagcc 45052690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37285024 - 37284740
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37285024 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 37284928  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  37284927 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtaccaacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagt 37284828  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  37284827 aacggtgagaaacttaaatgaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaa 37284740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35612361 - 35612085
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35612361 tttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgttatgattcatatgtatgtgt 35612262  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| || || |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35612261 gaaacagaaggtcaagtacacacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 35612162  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  35612161 aacaaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatacttagaggaccaaaaaggtaattaa 35612085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 269 - 438
Target Start/End: Original strand, 1762962 - 1763131
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762962 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1763061  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgttaaa 438  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1763062 tttagttagaggaccaatttgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccttttaaa 1763131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 45843405 - 45843562
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45843405 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 45843504  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45843505 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 45843562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 12481347 - 12481510
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481347 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 12481446  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  12481447 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 12481510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16024053 - 16023897
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024053 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 16023954  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16023953 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 16023897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39486440 - 39486214
Alignment:
Q  193 tattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacg 292  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  39486440 tattatgattaaatagtgattgatattattagtaactattatggttcatatatatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacg 39486341  T
Q  293 tttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 392  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39486340 tttatttgaatagaactaacagaaaagaccaaatgcagtaaatgtgagaaacttaaacgaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaata 39486241  T
Q  393 ccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||    
T  39486240 ccaattaaatagttagagaaccaaaaa 39486214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 327
Target Start/End: Original strand, 25995955 - 25996130
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25995955 tttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtaatatgattaaatagtggctgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgt 25996054  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatg 327  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  25996055 gaaataggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatg 25996130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 45052977 - 45053140
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45052977 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacactgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatt 45053076  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  45053077 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcct 45053140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 27547957 - 27548119
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547957 acccacataccataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27548056  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27548057 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggacaaaaaaggtaatttagcc 27548119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37304184 - 37304027
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37304184 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagt 37304085  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  37304084 tagaggaccaatccgataccaattaaatggttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 37304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20306158 - 20306005
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20306158 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacggtgggaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagt 20306059  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20306058 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 20306005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 23476635 - 23476792
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476635 ataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgaagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 23476734  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23476735 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 23476792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 6798101 - 6798245
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6798101 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaatttttagt 6798200  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6798201 tagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaagaccaaaaa 6798245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 2064499 - 2064662
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2064499 acccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatt 2064598  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  2064599 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaatttagcct 2064662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 49140431 - 49140580
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  49140431 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaa-t 49140529  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49140530 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 49140580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3089498 - 3089341
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089498 ataacacaaaccctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 3089399  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  3089398 tagagtaccaatccgatgccaattaaatagttagaggacccaaaaggtaatttagcct 3089341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 271 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38000649 - 38000492
Alignment:
Q  271 ccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38000649 ccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 38000550  T
Q  371 tagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38000549 taattagaagaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 38000492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 8762687 - 8762850
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762687 acccacataacacaactcttaacgtttatttgaataaagctaacagaaaggactaaatgtagtaccgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 8762786  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  8762787 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcct 8762850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 35612376 - 35612527
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35612376 ataacacagaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacagtgataaacttagaggactgaaataaatcaatttttagt 35612475  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35612476 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 35612527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8760441 - 8760271
Alignment:
Q  262 atcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataa 361  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8760441 atcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaagctaacataaatgactaaatgtagtaacactgaaaaacttagaggatcgaaataa 8760342  T
Q  362 atcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8760341 atcaatttttagttagagggtcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 8760271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 26723095 - 26723252
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26723095 ataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 26723194  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  26723195 tagatgatcaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcct 26723252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25995940 - 25995789
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25995940 ataacacaaatctcaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttaat 25995841  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25995840 taaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 25995789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 12127341 - 12127501
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127341 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 12127440  T
Q  369 tttagttagagg---accaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||| |||||||   || |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12127441 tttaattagaggagaactaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaatgtaatt 12127501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 49643959 - 49644121
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49643959 acccacataacacaaacc-taacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggatggaaacttagaggaccgaattaaatcaatt 49644057  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  49644058 tttaattagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 49644121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37576343 - 37576181
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37576343 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactttgataaatttagaggaccgaaataaatcaatt 37576244  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  37576243 tttagttagaggactaatccgataccaatttaatagttaaaggaccaaaaaggtaatttagcc 37576181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 4330125 - 4330282
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4330125 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaagagaaaggactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 4330224  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  4330225 tttagttagagggttaatccgataccaattaaataattagaggacaaaaaaggtaatt 4330282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38127871 - 38127710
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38127871 acccacataaaacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagcaaggactaaatatagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38127772  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  38127771 tttagttagatgaccaatccgaaaccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaattaagc 38127710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31703776 - 31703660
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31703776 acccacataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 31703677  T
Q  369 tttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||    
T  31703676 tttagttagaggaccaa 31703660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 37285016 - 37285177
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  37285016 acccacataacacaaaccctaacatttatttaaataaaactaacataag-gactaaatgtagtaattgtgagaaatttagagaatcgaaataaatcaatt 37285114  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37285115 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttaaaggaccaaaaatgtaatttagcc 37285177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 9006479 - 9006641
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  9006479 acccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaa-ggtgagaaacttggaggatccaaataaatcaatt 9006577  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||    
T  9006578 tttagttagaggaccaatccgataacgattaaatagttagaagaccaaaaagataatttagcct 9006641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 292 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23598213 - 23598071
Alignment:
Q  292 gtttatttgaata--aaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctg 389  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23598213 gtttatttgaatataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcg 23598114  T
Q  390 ataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  23598113 ataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 23598071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 34967026 - 34967173
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaatt-aacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 384  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967026 cctaacgttttttttaattaaatttaacggaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttaatggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 34967125  T
Q  385 atctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  34967126 atccgataccaattaaatagttagagaatcaaaaatgtaatttagcct 34967173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 46593535 - 46593681
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaatt-aacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 384  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46593535 cctaacgttttttttaattaaatttaacggaaatgactaaatatagtaacagtgagaaactta-aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 46593633  T
Q  385 atctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  46593634 atccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcct 46593681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 37585981 - 37586121
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37585981 acccacataatataaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaagaccgaaataaattaatt 37586080  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  37586081 tttaattagaggatcaatccgataccaattaagtagttaga 37586121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10831281 - 10831130
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10831281 acaaaccctaacgttt-tttaattaaatttaacgaaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaaccgaaataaatcaatttttagttagag 10831183  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  10831182 gaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 39486481 - 39486620
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||    
T  39486481 acccatataacacaaaccctaacgttt-tttgaataaaactaactgaaaggactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaaaacggaaataaatcaatt 39486579  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||    
T  39486580 tttagttagaggaacaattcaataccaattaaatagttaga 39486620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 426
Target Start/End: Original strand, 5537126 - 5537249
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  5537126 taaatttaacggaaatgactaaatgtagtaacagtgagaatcttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccgattaaat 5537225  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  5537226 agttagaggaccaaaaatataatt 5537249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 372
Target Start/End: Original strand, 27400712 - 27400815
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  27400712 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaacaaaataaatcaatt 27400811  T
Q  369 ttta 372  Q
    ||||    
T  27400812 ttta 27400815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 283 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 46592959 - 46592817
Alignment:
Q  283 aaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 382  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  46592959 aaccctaacgttt-tttaattaaatttaacggaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggatcgaaataaatcattttttagttagaggat 46592861  T
Q  383 caatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46592860 caatctgatatcaattaaatagttagagggccaaaaaggtaatt 46592817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5536526 - 5536397
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5536526 taaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagagacccaaataaatcaaattttaggtagaggaccaatccgataccaattaaat 5536427  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5536426 agttagagggccaaaaatgtaatttagcct 5536397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 303 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 34966431 - 34966308
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34966431 taaatttaacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggactgaaataaatcaagttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 34966332  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  34966331 agttagaggtccaaaaaggtaatt 34966308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27400720 - 27400587
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  27400720 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 27400624  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27400623 tatggttcatatgtatgtgtgaaacagaaggtcagat 27400587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 286 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 49837516 - 49837417
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    ||||| |||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49837516 cctaatgtttttttaattaaatttaacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 49837417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2064507 - 2064387
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||    
T  2064507 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactactattattggtaactgt 2064411  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2064410 tatggttcatatgtatgtgtgaaa 2064387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8762695 - 8762564
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  8762695 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatattattggtaaatgt 8762599  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcag 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8762598 tatagttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcag 8762564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 426
Target Start/End: Original strand, 10831935 - 10832031
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10831935 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccagttaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 10832031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Original strand, 3089513 - 3089616
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  3089513 tttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatgattcatatgtatatgt 3089612  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  3089613 gaaa 3089616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 324 - 431
Target Start/End: Original strand, 37467563 - 37467670
Alignment:
Q  324 aatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgta 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||    
T  37467563 aatgtagtaacagtgagaaacttaagggacctaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggta 37467662  T
Q  424 attaagcc 431  Q
    ||| ||||    
T  37467663 atttagcc 37467670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 308 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32047866 - 32047742
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||||  || |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  32047866 ttaacagaaagaacgaaatatggtaacggtgatgaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagtta 32047767  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  32047766 gaggaccaaaaaggtaattaagcct 32047742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 345 - 431
Target Start/End: Original strand, 13109191 - 13109277
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  13109191 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatcggataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaatttagcc 13109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 4697163 - 4697222
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4697163 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatag 4697222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28884140 - 28884020
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||    
T  28884140 ttaacagaaatgatgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaattattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaataatta 28884041  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  28884040 gaggaccaaaaaggtaattaa 28884020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 429
Target Start/End: Original strand, 28884750 - 28884871
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  28884750 ttaacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggactaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgtaaccaattaaatagtta 28884849  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  28884850 gaggaccaaaaaagcaattaag 28884871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 429
Target Start/End: Original strand, 32048509 - 32048630
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||| ||  |||| | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||    
T  32048509 ttaacagaaaggatgaaatatggtaactgtgataaagttagaggacaaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttatcaaataaatagtta 32048608  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  32048609 gaggaccaaaaaagtaattaag 32048630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 38127863 - 38127970
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |||    
T  38127863 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttattaaggtattatgattaaatagtgaatgatattattagtaactgt 38127959  T
Q  232 tatggttcata 242  Q
    ||| |||||||    
T  38127960 tatagttcata 38127970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 431
Target Start/End: Original strand, 49838756 - 49838835
Alignment:
Q  351 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  49838756 gaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaataatta-aaggccaaaaaggtaatttagcc 49838835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13183852 - 13183766
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  13183852 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagactaattcaataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 13183766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46289397 - 46289327
Alignment:
Q  358 ataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  46289397 ataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataattaa 46289327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37466943 - 37466801
Alignment:
Q  288 taacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 387  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  37466943 taacgtttttttaattaaatttaacagaaaagactaaatgtagtaacaatgaaaaacttgg--gacggaaataaatcaatttttagttagagcagtaatc 37466846  T
Q  388 tgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
     |||||||| |||||  ||||||    |||||||||||| |||||    
T  37466845 cgataccaattaaatgattagagaataaaaaatgtaatttagcct 37466801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4330116 - 4330043
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgat 225  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  4330116 tttatttattagtatcattttaatcatattccttgttaaggtattatggttaaatagtggctgatatcattgat 4330043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 52412903 - 52412985
Alignment:
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  52412903 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 52412985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33332326 - 33332287
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgac 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33332326 aaaccctaacgtttttttgaataaaattaacggaaatgac 33332287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 325
Target Start/End: Original strand, 46015766 - 46015809
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaa 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46015766 aaaccctaacgtttttttgaataaaattaacggaaaggactaaa 46015809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41453301 - 41453005
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41453301 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 41453205  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41453204 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 41453105  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41453104 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 41453005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7579168 - 7578872
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  7579168 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgt 7579072  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7579071 tatggttcatatgtatgtgtaaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgaagt 7578972  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7578971 aacattgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 7578872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48626359 - 48626063
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  48626359 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 48626263  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48626262 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 48626163  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48626162 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 48626063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 6356919 - 6357215
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  6356919 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatattattgataactgt 6357015  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6357016 tatggttcatatgtatgtgtgaaagaggaggtcaggtatccacatagcacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 6357115  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  6357116 aactgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatactaactaaataattagaggatcaaaaatgtaattaagcc 6357215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35146977 - 35146699
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35146977 tttatttatcaatatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtaagtgt 35146878  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35146877 gaaacag-aggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 35146779  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35146778 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatactaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 35146699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28286413 - 28286116
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||    
T  28286413 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggaactattccttcttaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggcaactgt 28286317  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28286316 aatggttcatatctatgtgtgaaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 28286217  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  28286216 aacgatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaagaccaaaaatataattaagcc 28286117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Original strand, 8542670 - 8542946
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8542670 tttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatattactggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 8542769  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8542770 gaaataggaggtcagatatccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaact-acagaaaggattaaatgtagtcacagtgagaaacttagagg 8542868  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8542869 accaaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 8542946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21391469 - 21391189
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21391469 tttatttattagtatcattttgatcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgt 21391370  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21391369 gaaacaggaggtcaggtatccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtagcggtgagaaacttagagg 21391270  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21391269 accgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 21391189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 1114208 - 1114495
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1114208 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattgtggtcctattcct---------attatgattaaatagtgacgggtattattggtaactgt 1114295  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  1114296 tatggttcatatatatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagagtaaatgtagt 1114395  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1114396 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataacaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 1114495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 6356456 - 6356736
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6356456 tttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatgtttcatttgtatgtgt 6356555  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6356556 gaaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 6356655  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  6356656 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttataggaccaaaaaggtaattaagcct 6356736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31638222 - 31637946
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31638222 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 31638123  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31638122 gaaataggaggtcaggtatccacgtaacacaaaccctaacgtttatatgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtgg 31638023  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  31638022 ttcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaattaa 31637946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 36423523 - 36423799
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||| |||    
T  36423523 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatcaaatagtgactgatactatcggtaactgt 36423619  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  36423620 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagatcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaat 36423719  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36423720 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagagg 36423799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8937128 - 8936848
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8937128 tttatttattaatatcatgttggtcatattccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatattattggtaactgttttggttcatatgtatgtgt 8937029  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8937028 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagagg 8936929  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  8936928 accaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaagataattaagcct 8936848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19681791 - 19681496
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  19681791 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatattattggtaactgt 19681695  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  19681694 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaaatacccacataacacaaaccctaacgtttattcgactaaaactaacagaaaggaataaatgtagt 19681595  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19681594 aacggcaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 19681496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 10526465 - 10526761
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  10526465 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtccaatgcct-gttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgt 10526560  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10526561 tatgtttcatatgtatttgtgaaacaagaggccaggtacccacataacacaaaacttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 10526660  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  10526661 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacaaaaaagataattaagcc 10526760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 182 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17750184 - 17749935
Alignment:
Q  182 ccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacac 281  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||    
T  17750184 ccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgataacttttatagttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcatgtacccatataacac 17750085  T
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 381  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17750084 aaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagagaa 17749985  T
Q  382 ccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17749984 ccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 17749935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41191981 - 41191702
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattatt---gataat 228  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||     
T  41191981 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatttcttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattattggtaac 41191885  T
Q  229 tgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgt 328  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41191884 tattatggttcatatgtatgtgtgaaacatgaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgt 41191785  T
Q  329 agtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  41191784 agtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaaccaatttttagttagaggaccaatccaatatcaactaaatagttagagg 41191702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 409
Target Start/End: Original strand, 28297973 - 28298247
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  28297973 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattaataacttt 28298069  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28298070 tatggttcatatgtatctgtgaaacaggaggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 28298169  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28298170 aacggtgagaaacttagagaatcgaaataaatcaatttttaattagagggtaaatctgataccaattaaatagttaga 28298247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 41751821 - 41752102
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41751821 tttatttattagtattattttggtcctatgtcttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgt 41751920  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| | ||||| |  |||||||||||||    
T  41751921 gaaacaggaggtcatatacccacatagcataaaccctaatgtttatttgattaaaactaacagaaagaactaaatatggtaacagatagaaacttagagg 41752020  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa-tgtaattaagcct 432  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  41752021 actgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggataaaaaattgtaattaagcct 41752102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 428
Target Start/End: Original strand, 17363437 - 17363683
Alignment:
Q  184 ttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatat----gtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataac 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  17363437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatatccatataac 17363536  T
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363537 acaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacatt--gaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 17363634  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||| ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17363635 gacaaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaatataattaa 17363683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10526473 - 10526310
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526473 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10526374  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  10526373 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 10526310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 132 - 334
Target Start/End: Original strand, 17359335 - 17359538
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17359335 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 17359431  T
Q  232 tatggttcatat----gtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatg 327  Q
    ||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17359432 tatggttcatatatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatg 17359531  T
Q  328 tagtaac 334  Q
    |||||||    
T  17359532 tagtaac 17359538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 41453293 - 41453450
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41453293 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 41453392  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41453393 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 41453450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 403
Target Start/End: Original strand, 33716742 - 33717005
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  33716742 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgt 33716838  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33716839 tatggttca----tatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacaccaaccctaacgtttatttgaacaaaattaacataaatgact-aatgtagt 33716933  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaata 403  Q
    |||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||    
T  33716934 aacaatgagaaacttaaatgaccgaaataaattaatttttagttagatgatcaatccgatatcaattaaata 33717005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 44332807 - 44332969
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332807 acccacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44332906  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44332907 tttagttagaggaccaatttgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 44332969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6356927 - 6356764
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356927 acccacataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6356828  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6356827 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 6356764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 33716750 - 33716600
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716750 acccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 33716651  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33716650 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 33716600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 19681783 - 19681946
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681783 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19681882  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19681883 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagcct 19681946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1114216 - 1114059
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114216 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactgtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1114117  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1114116 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 1114059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17359343 - 17359205
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359343 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 17359244  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  17359243 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagtta 17359205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 442
Target Start/End: Original strand, 8937137 - 8937309
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8937137 acccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaact 8937236  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgttaaattat 442  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  8937237 tttaattagaggacaaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttagcct-ttaaattat 8937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28297981 - 28297840
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28297981 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaatcaatt 28297882  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagag 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28297881 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagag 28297840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 41191973 - 41192130
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41191973 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatt 41192072  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41192073 tttacttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 41192130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8542653 - 8542498
Alignment:
Q  277 aacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 376  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8542653 aacacaaactctgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagtta 8542554  T
Q  377 gaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||    
T  8542553 gaggaccaatccgataccaactaaatagttagaagacgaaaaaggtaatttagcct 8542498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 48626351 - 48626514
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  48626351 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtcagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatt 48626450  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  48626451 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 48626514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 31075487 - 31075644
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31075487 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaat 31075586  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31075587 tggaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcct 31075644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 21391484 - 21391640
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21391484 ataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagt 21391583  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  21391584 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcc 21391640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 4931567 - 4931718
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4931567 ataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactgaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataattcaatttttagt 4931666  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4931667 tagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 4931718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 274 - 411
Target Start/End: Original strand, 7909459 - 7909596
Alignment:
Q  274 tataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7909459 tataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtactaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 7909558  T
Q  374 ttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  7909559 ttagaggaccaatccaatatcaattaaatagttagagg 7909596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6356447 - 6356289
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356447 acccatataacacaaaatctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6356349  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6356348 tttaattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaa 6356289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7909442 - 7909290
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7909442 ataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 7909343  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  7909342 tagaaaaccaatctgataccaattaaatagtta-aaggacaaaaaagtaattaa 7909290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 28286405 - 28286562
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28286405 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatataaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaatcaatcaatt 28286504  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28286505 tttagttaaaggactaatccgataccaattaaaaagttagaggaccaaaaatgtaatt 28286562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 31638240 - 31638393
Alignment:
Q  278 acacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttag 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638240 acacaaaccataacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaatttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttag 31638339  T
Q  378 aggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  31638340 aggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaatttagcc 31638393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 419
Target Start/End: Original strand, 35146985 - 35147127
Alignment:
Q  277 aacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 376  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35146985 aacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagtta 35147084  T
Q  377 gaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35147085 gaggactaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 35147127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 298 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16867840 - 16867707
Alignment:
Q  298 ttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaac 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16867840 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaat 16867741  T
Q  398 taaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16867740 tatatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 16867707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 309 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36674097 - 36673976
Alignment:
Q  309 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttag 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36674097 taacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttag 36673998  T
Q  409 agggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||    
T  36673997 aggaccataaaggtaattaagc 36673976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40673301 - 40673014
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  40673301 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactgatattattggtaagtgt 40673207  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaac--gtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgta 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||    
T  40673206 tatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagacacccacataacacaaatcctaacgtgtttatttg---aaaactaacagaaaggactaaatgta 40673110  T
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||  ||| ||||||| || ||  |||||||| || |||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  40673109 gtaacaatgaaaaacttacagaactcaaataaattaaattttagttagaggatcaa---gataccaattaaatagataga-ggacaaaaatgtaattaag 40673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41751806 - 41751662
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41751806 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggattaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataagtcaatttttagt 41751707  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  41751706 tagaggactaatccaatatcaattaaatagttaaaggaccaaaaa 41751662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44332815 - 44332677
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  44332815 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 44332719  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagataccca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44332718 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtaccca 44332677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 27738953 - 27739090
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27738953 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaa-gattaaatatagtaacggtgagaaactaaaaggaccgaaataaatcaatt 27739051  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27739052 tttagttaggggatcaatctgataccaaataaatagtta 27739090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 34037199 - 34037349
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037199 acccacataacataaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgcagtaacggagataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34037298  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34037299 tttagtcagaggactaatcatataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 34037349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8416635 - 8416484
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8416635 acaaaccctaacgttt-tttaattaaatttaatggaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 8416537  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  8416536 gatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 8416484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43247577 - 43247414
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatg-actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 367  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43247577 acccacataacataaacc-taatgtttatttgaataaaactaatagaaagggagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaat 43247479  T
Q  368 ttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  43247478 ttttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttagaggacaaaaaatataattcagcct 43247414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 7579160 - 7579310
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  7579160 acccacataacaaaaaccataacgtttatttgaatataactaaaataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaaattagatgatcgaaataaatcaatt 7579259  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7579260 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaa 7579310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41892111 - 41891966
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41892111 cctaacgtttttttaaataaatttaacagaaaggactaaatgtagtaacattaagaaacttaagggaccgaaagaaatcaatttttagttagaggaccaa 41892012  T
Q  386 tctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41892011 tccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 41891966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 303 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36282914 - 36282786
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36282914 taaatttaacggaaaagaccaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaat 36282815  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  36282814 agttagaggactaaaaatgtaatttagcc 36282786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4155726 - 4155597
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  4155726 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgataccaattaaat 4155627  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4155626 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 4155597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36423531 - 36423391
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36423531 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaaccaaaagtggcaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatt 36423432  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  36423431 tttagttagaggaccaatctaatgccaattaaatagttaga 36423391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34037207 - 34037047
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  34037207 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaatatcattttggtcatattttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgt 34037111  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  34037110 tatgattcatatgtatgtgtaaaacaggaggtcaggtactcacataacacaaaccctaacgttt 34037047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 273
Target Start/End: Original strand, 43247569 - 43247707
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||     
T  43247569 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattactggtaactgg 43247665  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagataccca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  43247666 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtaccca 43247707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 288 - 426
Target Start/End: Original strand, 36283512 - 36283651
Alignment:
Q  288 taacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga-ccaat 386  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36283512 taacgtttttttaattaaatttaacaaaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttaagggacggaaataaatcaatttttagttagaggatcaaat 36283611  T
Q  387 ctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    | |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  36283612 ccgataccaattaaatagttagagaacaaaaaatgtaatt 36283651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 40673293 - 40673378
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 354  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40673293 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggacc 40673378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 432
Target Start/End: Original strand, 29277670 - 29277794
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  29277670 ttaacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaaataaatagtta 29277769  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  29277770 gaggaccaaaaaggtaattaagcct 29277794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 419
Target Start/End: Original strand, 8417285 - 8417374
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8417285 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 8417374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 396
Target Start/End: Original strand, 32946669 - 32946756
Alignment:
Q  309 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaa 396  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32946669 taacagaaaggactaaatgtactaacagtgaaaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagagtaccaatctgataccaa 32946756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29276961 - 29276877
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29276961 ttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaag 29276877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 407
Target Start/End: Original strand, 41893379 - 41893501
Alignment:
Q  283 aaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 382  Q
    ||||||||||||| ||  ||| || ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41893379 aaccctaacgtttttt--aattaatttaacggaaaagattaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaatcgaaataaataaatttttagttagatgac 41893476  T
Q  383 caatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||    
T  41893477 caatccgatattaattaaatagtta 41893501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Original strand, 28264587 - 28264714
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| || |||| ||||||||   ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |     
T  28264587 acaaaccctaacgtttttttaaataaaactaatggaaaggattaaaagtagtaacatagagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaa 28264686  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||  |||||| || ||||||||||    
T  28264687 gaccaaattgatactaattaaatagtta 28264714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 432
Target Start/End: Original strand, 36674095 - 36674180
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  36674095 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt--aagactaacccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagcct 36674180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28263626 - 28263495
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||  ||||| |||  | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || |||    
T  28263626 aataaaactaacggaaacgactaaaggtggtaacgggaagaaatttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 28263527  T
Q  401 atagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||  ||  |||||| |||||| |||||    
T  28263526 atagttaagggatcaaaaaagtaatttagcct 28263495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 407
Target Start/End: Original strand, 4156509 - 4156615
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||   |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||| || |||    
T  4156509 aataaaattaacgaaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaa 4156608  T
Q  401 atagtta 407  Q
    |||||||    
T  4156609 atagtta 4156615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38447661 - 38447600
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggt 337  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  38447661 ataacacaaaccc-aatatttatttgaataaaatttaaagaaatgattaaatgtagtaacggt 38447600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Original strand, 36423790 - 36423851
Alignment:
Q  371 tagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  36423790 tagttagaggacaaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 36423851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 383
Target Start/End: Original strand, 46540017 - 46540070
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacc 383  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46540017 gtaacggtgagaaacttaagggattgaaatgaatcaatttttagttagaggacc 46540070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 10625389 - 10625471
Alignment:
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||  || ||||||||| |||| |||||    
T  10625389 ggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10625471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 428
Target Start/End: Original strand, 38447691 - 38447778
Alignment:
Q  337 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  38447691 tgagaaacttaagggactgaaataaatcaatttttaat----ggatcaatctaatatcaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 38447778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29277027 - 29276950
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    ||||| |||| ||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  29277027 ttaactgaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaagaaatcattttttaattagaggaccaa 29276950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5900719 - 5900422
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5900719 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatttttggtaattgt 5900623  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5900622 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagt 5900523  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5900522 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagcc 5900423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1994464 - 1994168
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  1994464 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgattaaatagtgagcgatattattgataactgt 1994369  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  1994368 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagc 1994269  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1994268 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 1994169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 42591938 - 42592235
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  42591938 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 42592034  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42592035 tatggttcatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatatccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 42592134  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42592135 aacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 42592234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4757789 - 4757493
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  4757789 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggttctattccttgataaga-attatgatcaaatagtgaccgatattattggtaactgt 4757694  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4757693 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagaataaatgtagt 4757594  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4757593 aatggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgattccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 4757494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51509415 - 51509118
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  51509415 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 51509319  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  51509318 tatggttcatatgtacgtgtgaaataggaggtcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagg 51509219  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  51509218 aacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 51509119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39664480 - 39664183
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  39664480 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaaatgt 39664384  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39664383 tatagttcatatgtatgtgtgaaataagaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 39664284  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39664283 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 39664184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 132 - 438
Target Start/End: Original strand, 22151999 - 22152304
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  22151999 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 22152095  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22152096 tatggttcatatgtatgtgtgaaacagaaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaacgactaaatgtagt 22152195  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa--atagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22152196 aacagtgagaaactcagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 22152295  T
Q  430 cctgttaaa 438  Q
    ||| |||||    
T  22152296 cctattaaa 22152304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Original strand, 54752317 - 54752611
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  54752317 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 54752413  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54752414 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 54752513  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54752514 aacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 54752611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10506244 - 10505951
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10506244 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgt 10506148  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10506147 tatggttcatatgtatatgtgaaacaggaggtcaggtacccatatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 10506048  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10506047 aatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 10505951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 54108198 - 54107901
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  54108198 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 54108102  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54108101 tatggttcataggtatgtgtgaaacaggagctcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 54108002  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  54108001 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaataaagcc 54107902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26318478 - 26318182
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  26318478 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgt 26318382  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26318381 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcaaatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 26318282  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  26318281 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaaggtaattaagcc 26318182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 47669413 - 47669709
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  47669413 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagatattatgattaaatagtgatagatattattgataactgt 47669509  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  47669510 tatggttcatatgtgtgtgtgaaacaggaggtcaggtgcccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagtaaggactaaatgtagt 47669609  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  47669610 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagagaaccaatccgataccaaataaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 47669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 27801660 - 27801940
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801660 tttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 27801759  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27801760 gaaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 27801859  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27801860 accgaaataaatcattttttaattagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 27801940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Original strand, 44893894 - 44894187
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  44893894 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagatattatgatcaaatagtgactgatatcattggtaattgt 44893990  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  44893991 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcagatatccacataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagt 44894090  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44894091 aacggtgagaaacttagaggtccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 44894187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8474142 - 8473866
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8474142 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgt 8474046  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8474045 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 8473946  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8473945 aacagtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagg 8473866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 132 - 438
Target Start/End: Original strand, 21969783 - 21970088
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  21969783 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactat 21969879  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21969880 tatggttcatatgtatgtgtgaaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 21969979  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa--atagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21969980 aacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 21970079  T
Q  430 cctgttaaa 438  Q
     || |||||    
T  21970080 tctattaaa 21970088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 132 - 438
Target Start/End: Original strand, 21992219 - 21992524
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  21992219 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactat 21992315  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21992316 tatggttcatatgtatgtgtgaaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 21992415  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa--atagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21992416 aacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 21992515  T
Q  430 cctgttaaa 438  Q
     || |||||    
T  21992516 tctattaaa 21992524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 24428721 - 24429017
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    ||||||| |||||||| |||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  24428721 tatgtggatcctctaactta---atttattagtatcattttgctcctatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 24428817  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  24428818 tatgcttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagt 24428917  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  24428918 aacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaagcc 24429017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 11256274 - 11256554
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11256274 tttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 11256373  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||  | |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11256374 gaaataggaggtcaagtgcccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatttagtaacggtgagaaacttaaagg 11256473  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11256474 accgaaataaatcattttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattacgcct 11256554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 53716464 - 53716744
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53716464 tttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 53716563  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  53716564 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgttaatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaatgatgataaacttaaagg 53716663  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  53716664 accgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaagcct 53716744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Original strand, 29818348 - 29818625
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29818348 tttatttattagtatcattttggtcatatgttttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 29818447  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29818448 gaaacaggaggtcaaatacccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagg 29818547  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  29818548 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaataattagaagatcaaaaaggtaattaag 29818625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12203830 - 12203551
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||   |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12203830 tttatttattagtatcattttggtaatatgttttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 12203731  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12203730 gaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 12203631  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  12203630 accgaaatataccaatttttagttagatgaccaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaaggtaattaagcc 12203551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 15986406 - 15986684
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  15986406 tttatttattagtatcattttggtcctattcgt-gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgt 15986504  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    || | ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986505 gatacaggaggtcaggtacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacttattgaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 15986604  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15986605 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaataattagaggaccaaaaagttaattaagcc 15986684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 432
Target Start/End: Original strand, 21568917 - 21569196
Alignment:
Q  153 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtg 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  21568917 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactaatattattggtaactataatggttcatatgtatgtgtg 21569016  T
Q  253 aaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 352  Q
    ||| || || |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569017 aaacagaaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 21569116  T
Q  353 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  21569117 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatcaagcct 21569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 22201787 - 22202066
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  22201787 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactattatggttcatatgtatgtat 22201886  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||  |||  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22201887 gaaacaggatgtcatgtacccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaaccgtgagaaacttagagg 22201986  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22201987 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 22202066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 4773396 - 4773693
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4773396 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgt 4773492  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  4773493 tatgtttcatttgtatgtgtgaaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagt 4773592  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  4773593 aacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagatgattaagcc 4773692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Original strand, 16931760 - 16932055
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||  |||    
T  16931760 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatattattggtagctgt 16931856  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  16931857 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatagccatatgacacaaactctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagt 16931956  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16931957 aacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttagttagaggacaaatccgataccaattaaaaagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 16932055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 18464627 - 18464907
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  18464627 tttatttattagtatcattttggtcatatgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcctatgtatatgt 18464726  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18464727 gaaacagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagagg 18464826  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18464827 accgaaataaatcaatttttagttagaagaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 18464907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41835205 - 41834957
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41835205 tttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaatgtattttgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 41835106  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835105 gaaacaggaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaatacaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 41835006  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835005 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 41834957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1999537 - 1999327
Alignment:
Q  222 tgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgac 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1999537 tgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggac 1999438  T
Q  322 taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatg 421  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1999437 taaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatg 1999338  T
Q  422 taattaagcct 432  Q
    |||||||||||    
T  1999337 taattaagcct 1999327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Original strand, 19883410 - 19883670
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatatta-ttgataattgttatggttcatatgtatgtg 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19883410 tttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattaattggtaaatgttatggttcatatgtatgtg 19883509  T
Q  251 tgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 350  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19883510 tgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaataaaaacgattaaatgtagtaactgtgagaaacttagag 19883609  T
Q  351 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19883610 gaccgaaataaatcattttttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagagg 19883670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47303314 - 47303018
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  47303314 tatgtgggtcctctaactt---tatttattat-atcattttgatcatatgccttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 47303219  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47303218 tatgattcatatgtatatgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 47303119  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||   ||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  47303118 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttaattagaggactgattcaataccaattaaatagttagatgatcaaaaaagtaattaagcc 47303019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 152 - 403
Target Start/End: Original strand, 46152784 - 46153032
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  46152784 tttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaacggttatggttcatatgtacgtgt 46152883  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  46152884 gaaagaggaggtcagatactcacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagta---gtgagaaacttatagg 46152980  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaata 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  46152981 accgaaataaatcaatttttagttagagaaccaattcgataccaactaaata 46153032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 364
Target Start/End: Original strand, 39241512 - 39241741
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39241512 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgt 39241608  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39241609 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 39241708  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241709 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 39241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 269 - 449
Target Start/End: Original strand, 4757781 - 4757960
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757781 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 4757880  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgttaaattatatagaaa 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  4757881 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct-ttaaactataaagaaa 4757960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32633361 - 32633143
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  32633361 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 32633265  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32633264 tatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacatatcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 32633165  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggac 353  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  32633164 aacggtgagaaacttaaaggac 32633143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 269 - 429
Target Start/End: Original strand, 1994456 - 1994616
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994456 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1994555  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1994556 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 1994616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 5900711 - 5900874
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900711 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 5900810  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5900811 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 5900874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 376
Target Start/End: Original strand, 39951528 - 39951748
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39951528 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatatatgtgt 39951627  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| |    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  39951628 gaaacaggaggtcagatacccacataactcaaaacctaatgtttattcgaatga----aacagaaatgactaaatgtaataacgttgaaaaacttagaga 39951723  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagtta 376  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  39951724 attgaaataaatcaatttttagtta 39951748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Original strand, 45306991 - 45307142
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306991 acaaaccctaacatttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 45307090  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45307091 gatcaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 45307142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 10506236 - 10506398
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506236 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10506335  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10506336 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 10506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 39241520 - 39241363
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241520 acccacataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 39241421  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39241420 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 39241363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 54108190 - 54108352
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108190 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacactgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 54108289  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  54108290 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 54108352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 271 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29818337 - 29818182
Alignment:
Q  271 ccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29818337 ccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttt 29818238  T
Q  371 tagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29818237 tatttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 29818182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 39664472 - 39664634
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39664472 acccacataacagaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 39664571  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39664572 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 39664634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44893902 - 44893752
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44893902 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44893803  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  44893802 tttagttagaagaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaa 44893752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18464612 - 18464455
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464612 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 18464513  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  18464512 tagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggagcaaaaatgtaatttagcct 18464455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47669421 - 47669264
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47669421 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 47669322  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47669321 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 47669264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 280 - 428
Target Start/End: Original strand, 47303315 - 47303463
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47303315 acaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttacttagag 47303414  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47303415 gaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 47303463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 276 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 53716449 - 53716294
Alignment:
Q  276 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716449 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 53716350  T
Q  376 agaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  53716349 agaggaccaatctgataccaattaaatagttaga-ggacaaaaaagtaatttagcct 53716294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42591946 - 42591784
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42591946 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 42591847  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42591846 tttagttagaggacaaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 42591784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21969791 - 21969634
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21969791 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 21969692  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21969691 tttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21969634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21992227 - 21992070
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21992227 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 21992128  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21992127 tttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21992070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21568902 - 21568766
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21568902 ataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaat 21568803  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21568802 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagagg 21568766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 272 - 432
Target Start/End: Original strand, 28986433 - 28986592
Alignment:
Q  272 catataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986433 catataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaat-tagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 28986531  T
Q  372 agttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28986532 agttaaaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaatttagcct 28986592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22152007 - 22151844
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22152007 acccacataacacaaactctatcgtttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaataaatcaatt 22151908  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22151907 tttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttataggaccaaaaatgtaatttagcct 22151844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22201772 - 22201621
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22201772 ataacacaaaccttaacgtttatttgaataaacctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttatt 22201673  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22201672 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 22201621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 26318470 - 26318633
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318470 acccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 26318569  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||    
T  26318570 tttagttagaggattaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatttagcct 26318633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 32633353 - 32633516
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32633353 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 32633452  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  32633453 tttagttaaaggaccaatccgataacaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 32633516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 278 - 419
Target Start/End: Original strand, 12791473 - 12791614
Alignment:
Q  278 acacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttag 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12791473 acacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttaattag 12791572  T
Q  378 aggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12791573 aggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 12791614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24428723 - 24428566
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24428723 ataacacaaatcccaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagt 24428624  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  24428623 tagaggaccaatctgataccaattgaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 24428566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46152771 - 46152614
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46152771 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtgatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 46152672  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  46152671 tagaggactaattcgatgccaattaaatagttagaggaccaaagatgtaatttagcct 46152614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16931768 - 16931605
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931768 acccacataacacaaaccctaacgtatatttgtataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 16931669  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgatacc-aactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16931668 tttagttagagcaccaatccg-taccaaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 16931605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4773404 - 4773242
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773404 acccacataacaaaaaacctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 4773306  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4773305 tttaattagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 4773242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27801645 - 27801494
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801645 ataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatctagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 27801546  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27801545 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataatt 27801494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 8474134 - 8474291
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474134 acccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 8474233  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8474234 tttaattagaggactaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 8474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 270 - 418
Target Start/End: Original strand, 12203840 - 12203988
Alignment:
Q  270 cccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 369  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203840 cccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactatcagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 12203939  T
Q  370 ttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaa 418  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12203940 ttaattagaggatcaatccgataccaattaaatagttaggggaccaaaa 12203988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15986397 - 15986255
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986397 acccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15986298  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15986297 tttagctaggggactaatccgataccaattaaatagttagagg 15986255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28986395 - 28986261
Alignment:
Q  196 tatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgttt 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28986395 tatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatacccacataatacaaactctaacgttt 28986296  T
Q  296 atttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtag 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28986295 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 28986261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 54752325 - 54752175
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54752325 acccacataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacagaaaggatcaaatgtagtaacggtgagaaacttatatgaccgaaataaatcaatt 54752226  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54752225 tttagttacaggaccaatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 54752175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45306977 - 45306832
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45306977 cctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaa 45306878  T
Q  386 tctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  45306877 tccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 45306832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Original strand, 44317514 - 44317665
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44317514 acaaaccctaacgtttcttctattaaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagag 44317613  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44317614 gaccaaaccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44317665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11256259 - 11256102
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||    
T  11256259 ataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactatcaaaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaattattttttagt 11256160  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  11256159 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaattaagcct 11256102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 41835214 - 41835371
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835214 acccatgtaacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 41835313  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||| ||| || || |||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41835314 tttaattaaagaactaattcaatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 41835371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 51509407 - 51509562
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51509407 acccacataatacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatt 51509506  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  51509507 tttagttaga-gactaatccaataccaattaaatagttgga-ggacaaaaatgtaatt 51509562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49528300 - 49528148
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49528300 acaaaccctaacgtttcttctattaaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagctagag 49528201  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49528200 gaccaaaccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 49528148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 280 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13866171 - 13866023
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13866171 acaaaccctaacgtttcttctattaaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagag 13866072  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13866071 gaccaaaccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 13866023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 320 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28985620 - 28985509
Alignment:
Q  320 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  28985620 actaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaaattttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaag 28985521  T
Q  420 tgtaattaagcc 431  Q
     |||||||||||    
T  28985520 ggtaattaagcc 28985509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 309 - 432
Target Start/End: Original strand, 7681451 - 7681575
Alignment:
Q  309 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga-ggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  7681451 taacagaaaggactgaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagggactaatccgataccaattaaataatta 7681550  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||    
T  7681551 gaggaccaaaagtgtaatttagcct 7681575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39951519 - 39951383
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39951519 acccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacataaagaactaaatatagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatt 39951420  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagt 405  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  39951419 tttaattagaggactaatccgataccaattaaatagt 39951383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 313 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7163568 - 7163463
Alignment:
Q  313 agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggg 412  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  7163568 agaaaggactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagatgaccaatccaataccaattaaatagttagagga 7163469  T
Q  413 ccaaaa 418  Q
    ||||||    
T  7163468 ccaaaa 7163463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15790796 - 15790691
Alignment:
Q  314 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggc 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  15790796 gaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggatggaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgac 15790697  T
Q  414 caaaaa 419  Q
    ||||||    
T  15790696 caaaaa 15790691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 30681766 - 30681868
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  30681766 gtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaactgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaag 30681865  T
Q  430 cct 432  Q
    |||    
T  30681866 cct 30681868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 432
Target Start/End: Original strand, 15791454 - 15791555
Alignment:
Q  326 tgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15791454 tgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag-----atccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataat 15791548  T
Q  426 taagcct 432  Q
    | |||||    
T  15791549 ttagcct 15791555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 20963525 - 20963676
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| | |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20963525 acaaatcctaactttttttt-aataaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagag 20963623  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || ||| | ||||| || ||||||||||  || ||||||| | ||||||||||    
T  20963624 gatcaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattaagcct 20963676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30681148 - 30681028
Alignment:
Q  312 cagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||| |    
T  30681148 cagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatatttttttagttagagaaccaaaccgttaccaattaaatagttagatg 30681049  T
Q  412 gccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  30681048 accaaaaatgtaattaagcct 30681028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 426
Target Start/End: Original strand, 49529076 - 49529201
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || |||    
T  49529076 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 49529175  T
Q  401 atagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||  || ||||||||| ||||    
T  49529176 atagttaagggaccaaaaatgcaatt 49529201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42853331 - 42853245
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||    
T  42853331 ttagaggacccacataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaactaaatagataga-gaccaaaaaggtaatttagcct 42853245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Original strand, 13866920 - 13867050
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || |||    
T  13866920 aataaaattaacggaaaggattaaaagtagtaactgagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 13867019  T
Q  401 atagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  13867020 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 13867050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44316756 - 44316624
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||| || |||    
T  44316756 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggacc-aaataaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaa 44316658  T
Q  401 atagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgt 434  Q
    |||||||  || ||||||||| |||| |||||||    
T  44316657 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctgt 44316624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 419
Target Start/End: Original strand, 43844384 - 43844473
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  43844384 gtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaa 43844473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43840061 - 43839984
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||    
T  43840061 gtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagtta 43839984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 430
Target Start/End: Original strand, 42853340 - 42853374
Alignment:
Q  396 actaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42853340 actaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 42853374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 407
Target Start/End: Original strand, 8327680 - 8327801
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||||  | ||||||  |||||||    
T  8327680 cctaacgtttcttctattaaaactaatagaaataactaaatgtggtaacaaagataaatttaaaggaccaaaataaatcaaaatatagttaagggaccaa 8327779  T
Q  386 tctgataccaactaaatagtta 407  Q
     | |||||||| ||||||||||    
T  8327780 accgataccaaataaatagtta 8327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19883395 - 19883363
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19883395 ataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaa 19883363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 24316 - 24612
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24316 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaacatcattttggtcctgttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 24412  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24413 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggatatcagatatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 24512  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24513 aacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagtaccaaaaatgtaattaagcc 24612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24324 - 24150
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24324 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaaaaaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 24225  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgttaaattata 443  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  24224 tttagttagaggaccaattcaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcctataaaattata 24150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 8592123 - 8592419
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8592123 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 8592219  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8592220 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagt 8592319  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8592320 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 8592419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16038090 - 16037793
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16038090 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatattattggtaattgt 16037994  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16037993 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggttaggtacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 16037894  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16037893 aacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 16037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25182108 - 25181811
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25182108 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaacatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 25182012  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25182011 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaat 25181912  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25181911 aacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgatacaaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 25181812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46849965 - 46849668
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  46849965 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 46849869  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  46849868 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggggttcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagt 46849769  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  46849768 aacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggacgaaaaaggtaattaagcc 46849669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44991574 - 44991279
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  44991574 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 44991478  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44991477 tatggttcatatgtatgtgtgaaacag-aggtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 44991379  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44991378 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44991279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 623958 - 623679
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  623958 tttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgt 623859  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  623858 gaaataggaggtcaggtacccatataacataaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttatagg 623759  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  623758 accaaaataaaacaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttaaaggaccaaaaatataattaagcc 623679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42855635 - 42855338
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  42855635 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctattcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgt 42855539  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42855538 tgtggttcatatatatgtgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacctttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 42855439  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  42855438 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccactccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattacgcc 42855339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43734582 - 43734289
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  43734582 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgt 43734486  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  43734485 tatggtttatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagt 43734386  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43734385 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatctatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 43734289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 53995230 - 53994934
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  53995230 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaatatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactga 53995134  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  53995133 tatggttcatatgtatgtgtgaaatagaaggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagt 53995034  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  53995033 aacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 53994934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Original strand, 50768992 - 50769269
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50768992 tttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 50769091  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50769092 gaaacaggaggtcagatacacacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 50769191  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50769192 atcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 50769269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6505815 - 6505536
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6505815 tttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 6505716  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6505715 gaaacaggaagtcaggtacccacataacacaaaccctaac-tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 6505617  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6505616 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaattaagcct 6505536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 14985485 - 14985782
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  14985485 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactct 14985581  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14985582 tatggctcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 14985681  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14985682 aacagtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 14985781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19088637 - 19088344
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  19088637 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttgatcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 19088541  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19088540 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 19088441  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  19088440 aacggtattaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcattccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 19088344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 53751198 - 53750903
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  53751198 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtataattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggtaactgt 53751102  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  53751101 tatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 53751002  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  53751001 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaatttaatagttagaggactaaaaaggtaattaagc 53750903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 38339646 - 38339942
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  38339646 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacacatattattggtaactgt 38339742  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  38339743 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagt 38339842  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38339843 aacagtgtgaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38339942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43566657 - 43566380
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43566657 tttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgt 43566558  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43566557 gaaacaggaggtcaagtagccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaattgtagtaacggtgagaaacttagagg 43566458  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  43566457 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaagaccaaaaagataattaag 43566380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30683824 - 30683527
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||    
T  30683824 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggcaactgt 30683728  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacc-catataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaat-taacagaaatgactaaatgta 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30683727 tatggttcatatgtatgtgtgaaacagaagatcaggtacctcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaactaacagaaatgactaaatgta 30683628  T
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30683627 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattggaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 30683528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33091749 - 33091453
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  33091749 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 33091653  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  33091652 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcatgtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagt 33091553  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33091552 aatggtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaatactgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 33091453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 24898360 - 24898640
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24898360 tttatttattagtatcattttggtcacatgtcttgttaatgtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 24898459  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898460 gaaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 24898559  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24898560 atcaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggacaaaaaaagtaattaagcct 24898640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1433567 - 1433272
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  1433567 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 1433471  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1433470 tatggttcatatgtatgtgtgaaataagaggtcagatactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaat 1433371  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  1433370 aacgatgagaaacttagagaaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaatgaaatagttagaggaccaaaaagataattaagc 1433272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 156 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15477920 - 15477644
Alignment:
Q  156 tttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15477920 tttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtatgaaa 15477821  T
Q  256 taggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccg 355  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15477820 cagaaggtcaggtacccacataacacaaacactaacgtttattttaataaaactaacagaatggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccg 15477721  T
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15477720 aaataaatcaatgtttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 15477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 6712117 - 6712412
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  6712117 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctgtgccttattaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgt 6712213  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6712214 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 6712313  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  6712314 aacagtga-aaatttagaggaccgaaataaatcaatttgtagttagaggatcaatccattaccaattaaatagttaga-gaccaaaaaggtaattaagcc 6712411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 12817977 - 12818257
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12817977 tttatttatcagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgttaaatgttatggttcatatatatgtgt 12818076  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12818077 gaaagagaaggtcagagacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagagg 12818176  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  12818177 accgaaataaatcaagttttagttagagcaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataagtaagcct 12818257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41878138 - 41877859
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41878138 tttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 41878039  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||  |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41878038 gaaacaggatgtcaggtacctacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgag-aacttagagg 41877940  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  41877939 accgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaactaaataattagatgaccaaaaaggtaactaagcct 41877859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39448767 - 39448502
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39448767 tttatttattagcatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactcttatggttcatatgtatgtgt 39448668  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39448667 gaaacaagatgtcagatacccacataacacaaactctaacgcttatttaaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagg 39448568  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39448567 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaa 39448502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19508709 - 19508413
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||    
T  19508709 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattagtaactgt 19508613  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccc-taacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtag 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19508612 tatggttcacatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaacccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 19508513  T
Q  331 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  19508512 tcacagtgagaaacttagagggccgacataaatcaattgttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaa-gtaattaagc 19508414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21763477 - 21763180
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21763477 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttgtttttatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 21763381  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaat-aaaattaacagaaatgactaaatgtag 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21763380 tatggttcatatctatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaacaaacagaaatgactaaatgtag 21763281  T
Q  331 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  21763280 taacggtgaaaaacctggaggaccgaaataaatcaatttttagttggaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataattaagc 21763181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37206723 - 37206447
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | |    
T  37206723 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatattattggtaacttt 37206627  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37206626 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 37206527  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37206526 aacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaactagaggattaatctgatatcaactgaatagttagagg 37206447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36122710 - 36122435
Alignment:
Q  154 tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtga 253  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  36122710 tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatattattggtagctgatatggttcatatgtatgtgtga 36122611  T
Q  254 aataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggac 353  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  36122610 aacaggagatcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacagtgaaaaacttagatgac 36122511  T
Q  354 cgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  36122510 aaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaattaag 36122435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 52557366 - 52557089
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  52557366 tttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtaactgatattattggtaattgttataattcatatgtatgtct 52557267  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||  | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  52557266 gaaacagacggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtaagaaacttatagg 52557167  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52557166 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 52557089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 152 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 53259417 - 53259184
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  53259417 tttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaacaatgagtgatattattggtaattattatggttcatatgtatgtgt 53259318  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53259317 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 53259218  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53259217 accgaaattaattaatttttagttagaggaccaa 53259184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23755697 - 23755438
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23755697 tttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgt 23755598  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| || |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  23755597 gaaacaggaggtcaggtagccacgtaacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgataagaaacttagaga 23755498  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23755497 accgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagagg 23755438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 197 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8398264 - 8398031
Alignment:
Q  197 atgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgttta 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8398264 atgactaaatagtgactgatattattgataactattatggtttatatgtatgtgtggaacaggaggtcag-tacccacataacacaaaccctaacattta 8398166  T
Q  297 tttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaa 396  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8398165 tttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacaatgagaaagttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaa 8398066  T
Q  397 ctaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8398065 ctaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 8398031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41752112 - 41751817
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  41752112 tatgtgggtcctctaattt---tatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 41752016  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  41752015 tatgattcatatgtatttgtgaaacaggatgtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagtaaagactaaatgtagt 41751916  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  41751915 aacagtgagaaactta-aagaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta-aaggacaaaaaggtaattaagcc 41751818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50508753 - 50508512
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  50508753 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgt 50508657  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50508656 tatggttcatatgtatgtgcgaaacaggaggtcaggtacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagt 50508557  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50508556 aacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagtta 50508512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 16038082 - 16038245
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038082 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 16038181  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16038182 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 16038245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6712125 - 6711962
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712125 acccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6712026  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6712025 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagagggccaaaaatataatttagcct 6711962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8592131 - 8591968
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8592131 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 8592032  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  8592031 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaaggtaatttagcct 8591968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 53751190 - 53751352
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53751190 acccacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 53751289  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  53751290 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 53751352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14985493 - 14985330
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985493 acccacataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 14985394  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  14985393 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 14985330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 19088629 - 19088792
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088629 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19088728  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19088729 tttagttagaggattaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 19088792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 25182100 - 25182263
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25182100 acccacataacacaaactcaaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 25182199  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||    
T  25182200 tttagttagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaagaccaaaaagataatttagcct 25182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 39448776 - 39448938
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39448776 acccagataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 39448875  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  39448876 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 39448938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 623973 - 624130
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623973 ataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 624072  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  624073 tagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 624130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 33091741 - 33091898
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33091741 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagatgactgaaataaatcaatt 33091840  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33091841 tttagttagaggaccaatctaatactaattaaatagttagaggactaaaaatgtaatt 33091898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 53259432 - 53259576
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53259432 ataacacaaactctaacgtgtatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 53259531  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  53259532 tagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 53259576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 1433559 - 1433722
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1433559 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaaattagaggaccaaaataaatcaatt 1433658  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1433659 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 1433722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 21763469 - 21763632
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763469 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 21763568  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21763569 tttagttagaggactaatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 21763632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24898345 - 24898194
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24898345 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaat 24898246  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24898245 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 24898194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38339654 - 38339492
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38339654 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggacctaaataaatcaatt 38339555  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  38339554 tttagttagaggaccaatctgataccagttaaatagttagaggaccaaaaaggtaattcagcc 38339492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 30683816 - 30683973
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683816 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgcgaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 30683915  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  30683916 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatatttagaggaccaaaaatataatt 30683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 276 - 431
Target Start/End: Original strand, 15477940 - 15478095
Alignment:
Q  276 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15477940 taacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaattaatcaatttttagtt 15478039  T
Q  376 agaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  15478040 agaggaccaatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaaggtaatttagcc 15478095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 43734574 - 43734724
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43734574 acccacataacacaaatcttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatt 43734673  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43734674 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 43734724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 46849957 - 46850107
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46849957 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 46850056  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  46850057 tttagttagaggactaatctgataccaatttaatagttagatgaccaaaaa 46850107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44957545 - 44957388
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957545 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 44957446  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44957445 tagaggaccaatccgataccaataaaatagttagaggaccaaaaatataatttagcct 44957388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 288 - 432
Target Start/End: Original strand, 25269307 - 25269451
Alignment:
Q  288 taacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 387  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25269307 taacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatc 25269406  T
Q  388 tgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25269407 cgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcct 25269451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 23756094 - 23756245
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23756094 ataacgcaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttagt 23756193  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23756194 taaaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 23756245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 273 - 432
Target Start/End: Original strand, 36122725 - 36122883
Alignment:
Q  273 atataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36122725 atataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaattttta 36122823  T
Q  373 gttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36122824 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaatttagcct 36122883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 42855627 - 42855790
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855627 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 42855726  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| | | | ||||| |||||| |||||    
T  42855727 tttagttggaggaccaatccgatactaattaaatagttaaatgactaaaaaggtaatttagcct 42855790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 418
Target Start/End: Original strand, 41752104 - 41752253
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41752104 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactacatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatgaatt 41752203  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaa 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41752204 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 41752253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 50768977 - 50768820
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768977 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagtactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 50768878  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  50768877 tagatgaccaattcgataccaattaaatagttaaaggatcaaaaaggtaattaagcct 50768820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 52557381 - 52557525
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52557381 ataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 52557480  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  52557481 tagaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 52557525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12817968 - 12817805
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12817968 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagggctaaatgtagtaacagtgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 12817869  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  12817868 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaatttagcct 12817805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20888299 - 20888164
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20888299 ataacacaaaccctaacattcatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 20888200  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagag 410  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20888199 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagag 20888164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 285 - 432
Target Start/End: Original strand, 44125774 - 44125921
Alignment:
Q  285 ccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44125774 ccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagacca 44125873  T
Q  385 atctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  44125874 atccgacaccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcct 44125921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 44991566 - 44991729
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991566 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacaaaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44991665  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  44991666 ttcagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 44991729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 53995222 - 53995386
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaat--gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaa 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53995222 acccacataacacaaaccctaacgtt-atttgaataaaactaacataaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaa 53995320  T
Q  367 tttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  53995321 tttttagttagaggactaatgcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 53995386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 19508701 - 19508824
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19508701 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagggtgagaaacttggaggaccgaaataaatcaatt 19508800  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19508801 tttagttagaggaccaatctgata 19508824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 37206715 - 37206877
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37206715 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacgatgaaaaacttagagaaccgaaataaatcaatt 37206814  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||| |||||| ||||    
T  37206815 tttagttagaggactaatctgatatcaattaaatagttagagaacaaaaaaggtaatttagcc 37206877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 55022427 - 55022283
Alignment:
Q  287 ctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaat 386  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55022427 ctaacgtttattttaataaaactaacagaaagga-taaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaat 55022329  T
Q  387 ctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  55022328 ctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 55022283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 409
Target Start/End: Original strand, 49135928 - 49136065
Alignment:
Q  276 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaaca----gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49135928 taacacaaatcctaacgtttatttgaataaaattgacataaagaaataactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttt 49136027  T
Q  372 agttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  49136028 agttagaggatcaatctgataccaattaaatagttaga 49136065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 50508745 - 50508885
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50508745 acccacataacataaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaacggtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 50508844  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50508845 tttagttagatgaccaatctgataccaattaaataattaga 50508885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 41878147 - 41878309
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41878147 acccacataacataaaccctaacatttatttgaataaaactagcagaaaggactaa-tgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgcaataaatcaatt 41878245  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  41878246 tttagttagaggactaatctgattccaattatatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcct 41878309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 43566666 - 43566792
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  43566666 acccacataacacaaatcctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaagactgaaataaatcaatt 43566765  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgatacca 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43566766 tttagttagaggaccaatccgatacca 43566792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 292 - 431
Target Start/End: Original strand, 44957668 - 44957807
Alignment:
Q  292 gtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 391  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44957668 gtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaaatgtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatttgat 44957767  T
Q  392 accaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44957768 atcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44957807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 319 - 432
Target Start/End: Original strand, 4513254 - 4513367
Alignment:
Q  319 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4513254 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaa 4513353  T
Q  419 atgtaattaagcct 432  Q
    | |||||| |||||    
T  4513354 aggtaatttagcct 4513367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44125755 - 44125624
Alignment:
Q  298 ttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaac 397  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  44125755 ttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaaaaaatcaatttttagttagagaaccaatttaataccaat 44125656  T
Q  398 taaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  44125655 taaatagttaaaggaccaaaaagataattaag 44125624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47603088 - 47602942
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47603088 cctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttaattagaggaccaa 47602989  T
Q  386 tctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  47602988 tccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 47602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Original strand, 52692740 - 52692889
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52692740 acaaaccctaacgttt-ttaaattaaatttaacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagag 52692838  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||    
T  52692839 gaccaatc-gatagcaattaaatagctaaaggaccaaaaaggtaatttagcc 52692889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Original strand, 47603710 - 47603812
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  47603710 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttag 47603809  T
Q  430 cct 432  Q
    |||    
T  47603810 cct 47603812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 333 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52692122 - 52692044
Alignment:
Q  333 acggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52692122 acggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagagg 52692044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 44957560 - 44957661
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44957560 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 44957659  T
Q  252 ga 253  Q
    ||    
T  44957660 ga 44957661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23756079 - 23755985
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgta 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23756079 tttatttattagtatcattttggtcatatgttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgta 23755985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31214250 - 31214161
Alignment:
Q  343 acttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  31214250 actttgaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgatcaaaaatgtaatttagcct 31214161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Original strand, 55022424 - 55022490
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55022424 ttagaggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagagg 55022490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 131
Target Start/End: Original strand, 37210896 - 37210953
Alignment:
Q  74 aatgtttagtaacatttttcaattttattaaccatcggagcgggtcctaagcataggc 131  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  37210896 aatgtttagccacatttttcaattgtattaaccatcagagccgatcctgagcataggc 37210953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Original strand, 44432929 - 44433005
Alignment:
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||| | |||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  44432929 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagtgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 44433005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48210023 - 48209947
Alignment:
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  48210023 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 48209947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21856834 - 21856554
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21856834 tttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgt 21856735  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856734 gaaataggaggtcaggtacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 21856635  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21856634 accaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 21856554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35167788 - 35167490
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattat--gattaaatagtgacggatattattgataatt 229  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||| |    
T  35167788 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttagtcctaatccttgttaaggtattatatgattaaatagtgactgatattaatggtaact 35167692  T
Q  230 gttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgta 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35167691 gttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgta 35167592  T
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35167591 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 35167492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5938109 - 5937816
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  5938109 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 5938013  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5938012 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 5937913  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5937912 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagaatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 5937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25176936 - 25176665
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25176936 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 25176837  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||      | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176836 gaa------ggtcaggtatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 25176743  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25176742 accataataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 25176665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 155 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6236197 - 6235920
Alignment:
Q  155 atttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaa 254  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6236197 atttattagtatcatcttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 6236098  T
Q  255 ataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 354  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6236097 acaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggacc 6235998  T
Q  355 gaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6235997 gaaataaatcaatttttaattataggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 6235920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 9046240 - 9046537
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  9046240 tatgtgggtcctctaa---atttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 9046336  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  9046337 tatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaggactaaatgtagt 9046436  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9046437 agcggtgagaaacttagcggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 9046536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Original strand, 5310980 - 5311274
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  5310980 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 5311076  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  5311077 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagt 5311176  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5311177 aacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaactaag 5311274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3423466 - 3423150
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  3423466 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 3423370  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  3423369 tatggttcatatgtatgtgttaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagt 3423270  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  3423269 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaatggtaattaagcc 3423170  T
Q  432 tgttaaattatatagaaaaag 452  Q
    | |||||||||| | ||||||    
T  3423169 t-ttaaattatacacaaaaag 3423150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 18053110 - 18053404
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18053110 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgt 18053206  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||   |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  18053207 tatggtt---atgtatgtgtgaaacaggatgtcagatacccatataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagt 18053303  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  18053304 aacggtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaactaagcc 18053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 2517173 - 2517452
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2517173 tttatttataagaatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattagtggtaattgttatggttcatatgtatgtgt 2517272  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||| |||||||| || |||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517273 gaaacaagaggtcagatactcacataacacagatcataacgtttatttaaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 2517372  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2517373 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 2517452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 34890798 - 34891094
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  34890798 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgt 34890894  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34890895 tatgattcatatgtgtgtgtgaaacagaaggtcaggtacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagt 34890994  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34890995 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa-gtaattaagcc 34891093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 7270783 - 7271080
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  7270783 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 7270879  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  7270880 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcatgtactcacataacacaaaccccaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatatagt 7270979  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7270980 aacgatgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggcaattaagcc 7271079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 31237900 - 31238196
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  31237900 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtattattttgatcatgttccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattgttaactgt 31237996  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31237997 tatggttcatatgtatgtgagaaacaggaagtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 31238096  T
Q  332 aacggtgagaaactt-agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31238097 aacggtgaaaaacttaagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga-gaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 31238195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 155 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34994656 - 34994383
Alignment:
Q  155 atttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaa 254  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34994656 atttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 34994557  T
Q  255 ataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 354  Q
    | | ||| |||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34994556 acacgaggtcaagtacccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggacc 34994457  T
Q  355 gaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  34994456 gaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaattaa 34994383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 173 - 429
Target Start/End: Original strand, 32753365 - 32753621
Alignment:
Q  173 ggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagataccc 272  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  32753365 ggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgttatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtaccc 32753464  T
Q  273 atataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 372  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753465 acataacacaaactctgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 32753564  T
Q  373 gttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32753565 gttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 32753621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 26957133 - 26957411
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26957133 tttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgttatgattcatatgtatgtgt 26957232  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26957233 gaaacaggaggtcaggtagccacata-cacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaagg 26957331  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  26957332 accgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctaataccaattaaatagttagatgaccaaaaagataattaagcc 26957411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 31247287 - 31247566
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  31247287 tttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgt 31247386  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt-agag 350  Q
    |||| ||||  |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31247387 gaaacaggaagtcaggtacccacataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgact-aatgtagtaacggtgaaaaacttaagag 31247485  T
Q  351 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31247486 gactgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 31247566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6137674 - 6137378
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  6137674 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgagtgatattatttgtaattgt 6137578  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6137577 tatgtttcatttgtctgtgtgaaataggaggtcagacatccacataacacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagt 6137478  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6137477 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatc-atttttaattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 6137379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 7270107 - 7270404
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  7270107 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattgttgataactgt 7270203  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7270204 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataccacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagt 7270303  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  7270304 aacgatgagaaatttagagaaccaaaaaaaattaatttttagttagaggatcaattcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataattaagcc 7270403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32993311 - 32993017
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  32993311 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatattattggtaactgt 32993215  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  32993214 tatggttcatatgtatgtgtgaaacatgaggacaggtacctacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatgtagt 32993115  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  32993114 aacaatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttacttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaagaaggtaattaag 32993017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 26600511 - 26600777
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26600511 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 26600607  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||          ||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26600608 tat----------tatgtgtgaaacagggggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 26600697  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26600698 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatccaataccaactaaatagttagagg 26600777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Original strand, 15932830 - 15933004
Alignment:
Q  255 ataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 354  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932830 ataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 15932929  T
Q  355 gaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15932930 aaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 15933004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 24744482 - 24744770
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  24744482 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 24744578  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |      ||| ||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  24744579 t------cat-tgtatgtgtgaaacagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtaat 24744671  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24744672 aacagtgagaaacttaaagaatggaaataaatcaatttttagttagaggaccaat-taataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 24744770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 978578 - 978414
Alignment:
Q  268 tacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978578 tacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 978479  T
Q  368 ttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  978478 ttttagttagaggatcaatacgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 978414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 21856843 - 21857006
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21856843 acccatataacaaaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 21856942  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21856943 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatacttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 21857006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32753339 - 32753177
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753339 acccacataacacaaaccttaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 32753240  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32753239 tttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 32753177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18053118 - 18052955
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053118 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 18053019  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||| |||||    
T  18053018 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggatcaaaaaagtaatttagcct 18052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 32993303 - 32993466
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32993303 acccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatt 32993402  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  32993403 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttagcct 32993466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9046248 - 9046086
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046248 acccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgacaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 9046149  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  9046148 tttacttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 9046086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2517164 - 2517007
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517164 acccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 2517065  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2517064 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 2517007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26600519 - 26600356
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26600519 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaattaatt 26600420  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  26600419 tttagttagaggactaatccgataccaatttaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 26600356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6532354 - 6532192
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6532354 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatcactaaatgtagtaacggtgagaaatttagagaaccgaaataaatcaatt 6532255  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6532254 tttagttagaggatcaatccgatacaaattaaatagttagaggacaaaaaaggtaattaagcc 6532192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Original strand, 10412796 - 10412949
Alignment:
Q  276 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10412796 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaatagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 10412895  T
Q  376 agaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||    
T  10412896 agagaactaatccgataccaactaaatagttaaaagaccaaaaagataattaag 10412949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5639452 - 5639297
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5639452 tttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgt 5639353  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaa 307  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5639352 gaaataggaggtcgggtacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaa 5639297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 21540265 - 21540415
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21540265 acccacataacgcaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 21540364  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  21540365 tttaattagaggactaatctgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaa 21540415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24744490 - 24744348
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24744490 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacggtgtgaaagttagaggaccgaaataaatcaatt 24744391  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24744390 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagagg 24744348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 5938101 - 5938258
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938101 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 5938200  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  5938201 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagatgaccaaaaaggtaatt 5938258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31237908 - 31237751
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31237908 acccacataaaacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 31237809  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31237808 tttagttagagaactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 31237751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 429
Target Start/End: Original strand, 6137666 - 6137825
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137666 acccacataacacaaaatctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6137764  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6137765 tttagttaaaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 6137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34890806 - 34890643
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34890806 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaactttgaggaccaaaataaatcaatt 34890707  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  34890706 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaacaaaaaggtaatttagcct 34890643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 34994674 - 34994830
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34994674 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagt 34994773  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| ||||    
T  34994774 tagaggaccaatctaataccaattaaatagttagatgactaaaaaggtaatttagcc 34994830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5310988 - 5310838
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5310988 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatt 5310889  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  5310888 tttagttataggactactctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaa 5310838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 429
Target Start/End: Original strand, 6236215 - 6236369
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236215 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatttagtaactgttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 6236314  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  6236315 tagaggaccaatcaaatatcaattaaatagttaggggaccaaaaaagtaattaag 6236369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7270115 - 7269950
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaat--taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaa 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7270115 acccacataacacaaaccctaacatttatttaaataaaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaa 7270016  T
Q  367 tttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| |||||    
T  7270015 tttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggattaaaaaagtaatttagcct 7269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 5639461 - 5639618
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5639461 acccacataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaataaatt 5639560  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  5639561 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaagatcaaaaatgtaatt 5639618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31247272 - 31247121
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31247272 ataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaacaccgaaataaatcaatttttagt 31247173  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31247172 tagagaactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 31247121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17244815 - 17244664
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17244815 acaaaccctaacgtttcttctattaaaactaacagaaatgacgaaatataataacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagag 17244716  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17244715 gaccaaaccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 17244664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Original strand, 34517991 - 34518142
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  34517991 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttagtttgag 34518090  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34518091 gaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 34518142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 320 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7438915 - 7438803
Alignment:
Q  320 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7438915 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 7438816  T
Q  420 tgtaattaagcct 432  Q
      ||||| |||||    
T  7438815 gataatttagcct 7438803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14276534 - 14276402
Alignment:
Q  296 atttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatacca 395  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14276534 atttgaataaaactaatacaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaagtaaatcaatttttagttagaggatcaatccgatacca 14276435  T
Q  396 actaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  14276434 attaaataggtagaggaccaaaaaggtaattaa 14276402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 385
Target Start/End: Original strand, 3423458 - 3423574
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3423458 acccacatatcacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaaattagaggaccgaaataaaccaatt 3423557  T
Q  369 tttagttagaggaccaa 385  Q
    |||| |||| |||||||    
T  3423558 tttaattagcggaccaa 3423574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 287 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3036025 - 3035926
Alignment:
Q  287 ctaacgtttatttgaataaaattaacagaaa-tgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3036025 ctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaatgactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaa 3035926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 29261255 - 29261402
Alignment:
Q  286 cctaacgtttatttgaataaaatt-aacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 384  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29261255 cctaacgttttttttaattaaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgacataaatcaatttttagttagaggacca 29261354  T
Q  385 atctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  29261355 atctaataccaattaaatagttagaggactaaaaatataatttagcct 29261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26957118 - 26957015
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957118 ataacataaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 26957019  T
Q  375 taga 378  Q
    ||||    
T  26957018 taga 26957015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7270791 - 7270673
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||    
T  7270791 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatatagtaacggtaagaaacttaaaagatcaaaataaatcaatt 7270692  T
Q  369 tttagttagaggaccaatc 387  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  7270691 tttaattagaggaccaatc 7270673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 270 - 356
Target Start/End: Original strand, 25176946 - 25177032
Alignment:
Q  270 cccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176946 cccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 25177032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15932830 - 15932729
Alignment:
Q  331 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  15932830 taacgatgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagc 15932731  T
Q  431 ct 432  Q
    ||    
T  15932730 ct 15932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6228880 - 6228730
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6228880 acaaaccctaacatttcttctattaaaacaaacagaaatgacgaaatatagtaacggtgataaacttag-ggaccaaaataaatcaatttttagttagag 6228782  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6228781 gaccaaaccgataccaattaaataattagaggactaaaaaggtaattaagcc 6228730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15286492 - 15286350
Alignment:
Q  283 aaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 382  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15286492 aaccctaacgttt-tttaattaaatttaacggaaatgactaaatgcagtaacggtgagaaacttaagggattgaaataaatcaatttttagtcagaggac 15286394  T
Q  383 caatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15286393 caatccgacaccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatt 15286350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 303 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29260658 - 29260536
Alignment:
Q  303 taaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaat 402  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29260658 taaatttaacggaaatgactaaatgtagtaatg-tgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagtttgaggaccaatctgataccaattaaat 29260560  T
Q  403 agttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  29260559 agttagaggaccagaaaggtaatt 29260536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34517373 - 34517271
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  34517373 gtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgacaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttag 34517274  T
Q  430 cct 432  Q
    |||    
T  34517273 cct 34517271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 25180219 - 25180299
Alignment:
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  25180219 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccagaaaggtaatttagcct 25180299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Original strand, 35167833 - 35167906
Alignment:
Q  359 taaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35167833 taaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 35167906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21540273 - 21540184
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattga 224  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21540273 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattga 21540184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 431
Target Start/End: Original strand, 27829292 - 27829414
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  27829292 ttaatagaaatgacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaactgttaccaattaaatagttg 27829391  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| || |||| |||||||||||    
T  27829392 gaggacc-aaaaggtaattaagcc 27829414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 432
Target Start/End: Original strand, 17245561 - 17245711
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 381  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17245561 aaaccctaacttttttattaataaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttagggga 17245660  T
Q  382 ccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| | ||||| || |||||| |||  || ||||||||| |||| |||||    
T  17245661 ccaaaccgatactaattaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 17245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34251656 - 34251553
Alignment:
Q  327 gtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||    
T  34251656 gtagtaacgatgagaaacttagaggatcgaaataaattaatttttagt--caggactaatccgataccaactaaataattagaggattaaaaaggtaatt 34251559  T
Q  427 aagcct 432  Q
     |||||    
T  34251558 tagcct 34251553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 407
Target Start/End: Original strand, 6229643 - 6229748
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || |||    
T  6229643 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttag-ggaccaaaccgatactaattaa 6229741  T
Q  401 atagtta 407  Q
    |||||||    
T  6229742 atagtta 6229748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Original strand, 35167780 - 35167837
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaat 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  35167780 acccacataacacaaaccctaacgtttacttgaataaaactaacagaaaggattaaat 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1158669 - 1158588
Alignment:
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||   ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1158669 ggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgtaattaagcc 1158588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Original strand, 19862 - 20155
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19862 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggttttatgattaaatagtgacggatattattgataactgt 19958  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19959 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 20058  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20059 aacggtgagaaacttagaggacaaaaaataatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 20155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19870 - 19713
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870 acccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19771  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19770 tttagttagaggactaatccaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 19713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7496258 - 7495979
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7496258 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgagtaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 7496160  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7496159 gaaataggaggtcagatacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagagg 7496060  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7496059 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 7495979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8174181 - 8173888
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8174181 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttgtttttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgt 8174085  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8174084 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgttcatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagt 8173985  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8173984 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 8173888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 15744611 - 15744897
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15744611 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgt 15744707  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          ||| |||||||||||||    
T  15744708 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttaaata----------aaacgactaaatgtagt 15744797  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15744798 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 15744897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15406035 - 15405755
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15406035 tttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 15405936  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15405935 gaaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaag 15405836  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15405835 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 15405755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12860663 - 12860381
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||              
T  12860663 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacgggtattat---------- 12860577  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12860576 ---ggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 12860480  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12860479 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 12860381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 13193159 - 13193439
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13193159 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 13193258  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193259 gaaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 13193358  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13193359 accgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataattaagcct 13193439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24372263 - 24371966
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  24372263 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctattcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgt 24372167  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    | |||||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  24372166 tttggttcatatgtatgtgtgaaacagaaggtcgggtacccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagt 24372067  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24372066 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 24371967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19815983 - 19815707
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19815983 tttatttattagtatcattttgctcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 19815884  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||| |||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815883 gaaacaagaggtcagatagtcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 19815784  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19815783 accgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 19815707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34735639 - 34735342
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  34735639 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatataattgataactgt 34735543  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  34735542 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggctaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagt 34735443  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  34735442 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaattcgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagattattaagcc 34735343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2148182 - 2147888
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  2148182 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 2148086  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2148085 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 2147986  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatca-atttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2147985 aacggtgagaaacttagaggcccgaaataaatcatttttttagttagaggaccaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 2147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 29472413 - 29472693
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29472413 tttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatagttcatatgtatgtgt 29472512  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29472513 gaaacaggaggtcaggtactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagagg 29472612  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  29472613 accaaaataaatcaattttttgttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtatttaagcct 29472693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26181996 - 26181701
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  26181996 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgt 26181900  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  26181899 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagatcagatacacacataacacaaaccttaaggtttatttgaataaaactaacagaaaggaatatatgtagt 26181800  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26181799 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagtggaccaatccaattccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 26181701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 41474253 - 41474532
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41474253 tttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattataattaaatagtgactgatagtattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 41474352  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41474353 gaaacaggaggtcagatactcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaactcagagg 41474452  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  41474453 accgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataattaagcc 41474532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 385
Target Start/End: Original strand, 10992005 - 10992255
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |    
T  10992005 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctatgtcttgctaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactct 10992101  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10992102 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 10992201  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10992202 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggaccaa 10992255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 16305179 - 16305455
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  16305179 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgt 16305275  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  16305276 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagt 16305375  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16305376 aacggtgagaaacttagaggattgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagg 16305455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 132 - 426
Target Start/End: Original strand, 17052212 - 17052499
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||      |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||    
T  17052212 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttaac----gttaaggtattatgattaaataatgactgatattatagataactgt 17052304  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17052305 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcgggtacccacataacacaaacactaacgtttatttgaatgaaactaacagaaatgactaaatgtagt 17052404  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17052405 aanggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaacatgtaatt 17052499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 428
Target Start/End: Original strand, 7469320 - 7469605
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  ||    
T  7469320 tatgtgggtcctctaactt---tatttactagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagttagtgatattattgttaaccgt 7469416  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  7469417 tatggttcatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatacttacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgacta-------- 7469508  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  7469509 aacgatgagaaacttagacgactgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagagaaccaaaaaggtaattaa 7469605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 419
Target Start/End: Original strand, 36713742 - 36714023
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  36713742 tatgtgggtcctctaactt---tatttattag--tcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaa-tagtgactgatattattggtaactgt 36713835  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  36713836 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaatgactaagtgtggt 36713935  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  36713936 aacggtgagaaacctagatgacgaaaataaatcaatttttagtttgaggaccaattcaataccaattaaatagttagagaaccaaaaa 36714023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 217 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24138282 - 24138067
Alignment:
Q  217 attattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaa 316  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24138282 attattggtaactgttatggctcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcatgtacacacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaa 24138183  T
Q  317 atgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaa 416  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24138182 aggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaa 24138083  T
Q  417 aaatgtaattaagcct 432  Q
    ||| |||||| |||||    
T  24138082 aaaggtaatttagcct 24138067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 261 - 428
Target Start/End: Original strand, 30898581 - 30898748
Alignment:
Q  261 gatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaata 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30898581 gatcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaacaaaata 30898680  T
Q  361 aatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30898681 aatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 30898748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 7496267 - 7496430
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7496267 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 7496366  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7496367 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaatgtaattaagcct 7496430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7469328 - 7469171
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469328 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 7469229  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7469228 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagagggccaaaaaggtaatt 7469171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 33470211 - 33470374
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33470211 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 33470310  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33470311 tttagtcagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 33470374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 19847606 - 19847769
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19847606 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaattaatt 19847705  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19847706 tttagttagaggaccaatccaataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagcct 19847769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 24372255 - 24372418
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24372255 acccacataacacaaatcctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 24372354  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24372355 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 24372418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13193144 - 13192987
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193144 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 13193045  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  13193044 tagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcct 13192987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15744619 - 15744462
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15744619 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15744520  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15744519 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 15744462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 8174173 - 8174336
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8174173 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagaaacggtgagaaatttaaaggaccgaaataaattaatt 8174272  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  8174273 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 8174336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10992013 - 10991850
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10992013 acccacataacacaaactgtaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaatttagaggaccgaaataaatcaatt 10991914  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  10991913 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 10991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29472398 - 29472242
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29472398 ataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatctatttttagt 29472299  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29472298 tagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattgagcc 29472242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 273 - 429
Target Start/End: Original strand, 38332972 - 38333128
Alignment:
Q  273 atataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332972 atataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 38333071  T
Q  373 gttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  38333072 gttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaag 38333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 34735631 - 34735793
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34735631 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 34735730  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34735731 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 34735793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 26181988 - 26182150
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26181988 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagggccgaaataaatcaatt 26182087  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26182088 tttagttagaggaccaatccgatatcaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaatttagcc 26182150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38332866 - 38332704
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332866 acccacataaaacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38332767  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  38332766 tttagttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaatgtaatttagcc 38332704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16305187 - 16305024
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305187 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 16305088  T
Q  369 tttagttagaggacc-aatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  16305087 tttagttagaggaccaaatccgataccaattaaatagttaga-ggacaaaaatgtaatttagcct 16305024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 411
Target Start/End: Original strand, 15406050 - 15406186
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406050 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 15406149  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15406150 tagaggaccaatccaataccaattaaatagttagagg 15406186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 428
Target Start/End: Original strand, 2148174 - 2148333
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2148174 acccacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatt 2148273  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | | | ||||||||| ||||    
T  2148274 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttaaatgacaaaaaatgtatttaa 2148333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 19815992 - 19816155
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815992 acccacataacacagactctaacgtttatttgaataaaactagcagaaaggactaaatgtagtaatggtctgaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19816091  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  19816092 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagtttgaggaccaaaaaggtaatttagcct 19816155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42834578 - 42834452
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42834578 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaatagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagt 42834479  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaa 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42834478 tagaggaccaatccgataccaattaaa 42834452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 385
Target Start/End: Original strand, 12860655 - 12860771
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860655 acccacataacacaaaccgtaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 12860754  T
Q  369 tttagttagaggaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||    
T  12860755 tttagttagaggaccaa 12860771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 24138794 - 24138957
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaat-gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24138794 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaat 24138893  T
Q  368 ttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||| ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  24138894 ttttaattaaagtactaatttgataccaattaaatagttagaataccaaaaaggtaattaagcc 24138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36713750 - 36713588
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  36713750 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacactgagaaatttagaggacataaataaatcaatt 36713651  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  36713650 tttagttagaagatcaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 36713588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41474244 - 41474087
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41474244 acccacataacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaacataaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatt 41474145  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41474144 tttaattacaggaccgatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaatgtaatt 41474087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 302 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8444951 - 8444825
Alignment:
Q  302 ataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaa 401  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  8444951 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagataaccaatccgatatcaactaaa 8444852  T
Q  402 tagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  8444851 tagttagaagaccaaaaaggtaattaa 8444825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19847614 - 19847490
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  19847614 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 19847519  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaatagga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847518 tatggttcatatgtatgtgtgaaatagga 19847490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8962510 - 8962372
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8962510 acaaaccctaacgttt-tttaattaaatttaatggaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttgagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 8962412  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  8962411 gaccaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaa 8962372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 321 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17032703 - 17032592
Alignment:
Q  321 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  17032703 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17032604  T
Q  421 gtaattaagcct 432  Q
     ||||| |||||    
T  17032603 ataatttagcct 17032592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 321 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17051039 - 17050928
Alignment:
Q  321 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  17051039 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17050940  T
Q  421 gtaattaagcct 432  Q
     ||||| |||||    
T  17050939 ataatttagcct 17050928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24138802 - 24138710
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataa 227  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24138802 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgataa 24138710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 426
Target Start/End: Original strand, 8445123 - 8445234
Alignment:
Q  315 aaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggcc 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  8445123 aaatgactaaatgtagtaactgtgataaacttagaggaccgaagtaaatcaatttttaattagagtgctaatccgataccaattaaatagttagaggaca 8445222  T
Q  415 aaaaatgtaatt 426  Q
    ||||| ||||||    
T  8445223 aaaaaggtaatt 8445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 431
Target Start/End: Original strand, 8963166 - 8963267
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  8963166 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaatttag 8963265  T
Q  430 cc 431  Q
    ||    
T  8963266 cc 8963267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 223
Target Start/End: Original strand, 38332858 - 38332946
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattg 223  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38332858 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattg 38332946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 23992162 - 23992267
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  |||||||   |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || |||    
T  23992162 aataaaattaacggaaatgtctaaaattagtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 23992261  T
Q  401 atagtt 406  Q
    ||||||    
T  23992262 atagtt 23992267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Original strand, 13810489 - 13810528
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgac 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13810489 aaaccctaacgtttttttgaataaaattaacagaaatgac 13810528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17052220 - 17052164
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacg-tttatttgaataaaattaacagaaatgactaa 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  17052220 acccacataacacaaaccctaacgttttatttgaataaaactaacagcaaagactaa 17052164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19847361 - 19847297
Alignment:
Q  342 aacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagag 410  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19847361 aacttagagg-ccaaaataaatcaatttttagt-agagg-ccaatccg-taccaactaaatagttagag 19847297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 72916 - 73212
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  72916 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccaatattattggtaactgt 73011  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  73012 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggccaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 73111  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  73112 aacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 73211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 72924 - 72761
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72924 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 72825  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  72824 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 72761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 27186027 - 27186324
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  27186027 tatgtgggtcctctaattt---tattaattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgaatggtattattggtaattgt 27186123  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27186124 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 27186223  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27186224 aacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 27186323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36440479 - 36440199
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36440479 tttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 36440380  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36440379 gaaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagagg 36440280  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  36440279 accgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaaggtaattaagcct 36440199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37424541 - 37424262
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37424541 tttatttattaatatcattttggtcctattttttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatctgt 37424442  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37424441 gaaacaggaggtcaggtacccaaataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaag 37424342  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  37424341 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaaataaatagttagaggatcaaaaagataattaagcc 37424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 38959003 - 38958724
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  38959003 tttatttataagtatcattttggtcttatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttacgtttcatttgtatgtgt 38958904  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38958903 gaaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 38958804  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38958803 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38958724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 152 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16860582 - 16860315
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |    
T  16860582 tttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgcatgttt 16860483  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16860482 gaaacaggaggtcagatacacacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagg 16860383  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  16860382 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccgattaaatagttagaggaccaaaaa 16860315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35570059 - 35569777
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtat---- 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||        
T  35570059 tttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatatgt 35569960  T
Q  248 --gtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaact 345  Q
      |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35569959 atgtgtgaaacaggaggtcaga-actcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtgagaaact 35569861  T
Q  346 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  35569860 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaagaccaaaaaggtaattaag 35569777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 9989477 - 9989753
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  9989477 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatattattggtaattgt 9989573  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9989574 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagacacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 9989673  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9989674 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagatcaatccgataccaattaaataggtagagg 9989753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24040366 - 24040087
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcat--tttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgt 249  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  24040366 tttatttattagtatcatattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattattgttcatatgtatgt 24040267  T
Q  250 gtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaga 349  Q
    || ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24040266 gtaaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagt 24040167  T
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  24040166 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataattaag 24040087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 132 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32288373 - 32288079
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  32288373 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgt 32288277  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32288276 tatggttcatatgtatgtgtgaagcaagaggtcatgtatccacataacacaaacc-taacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagt 32288178  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32288177 aacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 32288079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 419
Target Start/End: Original strand, 2183097 - 2183381
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  2183097 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatatcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgt 2183193  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2183194 tatggtttatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagacacccacataagacaaaccttaatgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagt 2183293  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  2183294 aacggtgagaaacttacagaaccgaaataaatcaatttttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttagagcgcaaaaaa 2183381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29199230 - 29198972
Alignment:
Q  153 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtg 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29199230 ttatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatgttattgataactgttatgattcatatgtatgtgtg 29199131  T
Q  253 aaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 352  Q
    ||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  29199130 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 29199031  T
Q  353 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  29199030 tcgaaataaatcaatttttaattagaggactaatttaatatcaattaaatagttagagg 29198972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 403
Target Start/End: Original strand, 11316129 - 11316376
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||   || | |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11316129 tttatttattagtatcattttggtcctatgtctt---aaca-attatgattaaatattgacttatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 11316224  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
     ||| | ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11316225 aaaacatgaggtcaaatatccacataacacaaaccctaacgtttattcgaataaaattaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagg 11316324  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaata 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11316325 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaata 11316376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 237 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39325606 - 39325414
Alignment:
Q  237 ttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacgg 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |    
T  39325606 ttcatatgtatgtgtgaaacaggagatcagatgcccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacag 39325507  T
Q  337 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  39325506 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaattaag 39325414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 238 - 428
Target Start/End: Original strand, 25182910 - 25183100
Alignment:
Q  238 tcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggt 337  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  |    
T  25182910 tcatatgtatgtgtgaaacagaagatcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagcaacatt 25183009  T
Q  338 gagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25183010 gagaagcttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 25183100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 269 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9989485 - 9989317
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989485 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 9989386  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcctgttaa 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  9989385 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaagtaatttagcctattaa 9989317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34264644 - 34264406
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  34264644 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaatatcattttggttctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 34264548  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||    
T  34264547 tatggttcatatgtatgtgtgaaacatgaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttattt--------------gaaaggactaaatgtagt 34264462  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34264461 aacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagagggccaatc 34264406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 38959018 - 38959173
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38959018 ataacacaaaatctaac-tttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 38959116  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38959117 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38959173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 24040375 - 24040537
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24040375 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaggaacggtgagaaacttaaaggactgaaataagtcaatt 24040474  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24040475 tttagttagaggatcaatccgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 24040537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 39325649 - 39325805
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39325649 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagtactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 39325748  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  39325749 tagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggactaaaaatgtaatttagcc 39325805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2183105 - 2182942
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  2183105 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaagctaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagacgacataaataaatcaatt 2183006  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  2183005 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaattaatttagcct 2182942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 36440488 - 36440651
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440488 acccatataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagttatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 36440587  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  36440588 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 36440651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 37424553 - 37424709
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37424553 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 37424652  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37424653 tttagttagaggactaatccaata-caattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 37424709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27186035 - 27185874
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27186035 acccacataaaacaaaccctaacatttatttgaataaaacta-caggaaggactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 27185937  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27185936 tttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 27185874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11316114 - 11315982
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11316114 ataacacaaaccctaacgtttattggaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaatagtaagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagt 11316015  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11316014 tagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 11315982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 1140077 - 1140215
Alignment:
Q  285 ccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140077 ccctaacgtttatttgaataaaactaaca--------taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacca 1140168  T
Q  385 atctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  1140169 atccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggcaattaagcc 1140215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Original strand, 32288365 - 32288521
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288365 acccacataacacaaactctaacatt-atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtattaacagtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 32288463  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  32288464 tttagttagaggaccaatctaatatcaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatt 32288521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 411
Target Start/End: Original strand, 35570074 - 35570210
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35570074 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagactaaaataaatcaatttttagt 35570173  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  35570174 tagaggagtaatcaaataccaattaaatagttagagg 35570210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 25567282 - 25567439
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  25567282 ataacaaaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggatcaaaataaatcaatttttagt 25567381  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || || ||||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||    
T  25567382 taaagaaccaatccgataccaattaaatagttaaaggactaaaaaagtaatttagcct 25567439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 34264636 - 34264802
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaa----taaatc 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  34264636 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataattaaatc 34264735  T
Q  365 aatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  34264736 aatttttagttagaggaccaattcaataccaattaaatagttggaggaccaaaaatataatttagcc 34264802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19184748 - 19184598
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19184748 acaaaccctaacggttcttctattaaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagag 19184649  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19184648 gaccaaaccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 19184598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16860699 - 16860587
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16860699 tttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 16860600  T
Q  252 gaaataggagatc 264  Q
    |||| | ||||||    
T  16860599 gaaacaagagatc 16860587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 428
Target Start/End: Original strand, 31756629 - 31756749
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  31756629 ttaacagaaatgacaaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggactaaaccgttaccaattaaatagtta 31756728  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    |  | ||||||| ||||||||    
T  31756729 ggagaccaaaaaggtaattaa 31756749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 431
Target Start/End: Original strand, 19128434 - 19128503
Alignment:
Q  362 atcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19128434 atcaatttttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 19128503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Original strand, 19185504 - 19185635
Alignment:
Q  301 aataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaa 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||| || |||    
T  19185504 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaa 19185603  T
Q  401 atagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||  || ||||||| |||||| |||||    
T  19185604 atagttaagggaccaaaaaggtaatttagcct 19185635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Original strand, 33817659 - 33817713
Alignment:
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33817659 aaataaataaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagag 33817713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25567267 - 25567196
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattg 223  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25567267 tttatttattagtattattttagtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattg 25567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 82154 - 81857
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  82154 tatgtgggtcctctaactt---tatttattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 82058  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  82057 tatggttcatatgtatctgtgaaacaggaggtcaggtacccaaattacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagt 81958  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  81957 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaaataaatagttagaggatcaaaaagataattaagcc 81858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 426
Target Start/End: Original strand, 90782 - 90883
Alignment:
Q  325 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaa 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  90782 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaactaaatagttagaggacgaaaaatataa 90881  T
Q  425 tt 426  Q
    ||    
T  90882 tt 90883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 82146 - 82231
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 354  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82146 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacc 82231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 349227 - 349523
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  349227 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgt 349323  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  349324 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagt 349423  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  349424 aaaagtgag-aacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaggggaccaaaaaggtaactaagcc 349522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 113537 - 113816
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  113537 tttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgctaattgttatagtgcatttgtatgtgt 113636  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  113637 gaaacaagaggtcagatacccacataacactaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagatg 113736  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  113737 accgaaagaaatcaatttttagttacaggaccaatctgatagcacttaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 113816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 349235 - 349093
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  349235 acccacataacgcaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaaaaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 349136  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  349135 tttagttagaggactaatctaatactaattaaatagttagagg 349093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 302 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 113522 - 113392
Alignment:
Q  302 ataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaa 401  Q
    |||||| |||| |||| || ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  113522 ataaaactaacggaaaggaataaatttactaacgatgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcggataccaattaaa 113423  T
Q  402 tagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
     ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  113422 cagttagaggaccaaaaatgttatttagcct 113392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14414 - 14134
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  14414 tttatttattagcatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactcttatggttcatatgtatgtgt 14315  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14314 gaaacaagaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagg 14215  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14214 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaacaggtaattaagcct 14134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 14423 - 14586
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14423 acccagataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacatagaggaccgaaataaatcaatt 14522  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  14523 tttagttagaggatcaatccgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 14586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50772 - 50478
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  50772 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 50676  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50675 tatggttcttatgtatgtgtgaaagaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagt 50576  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  50575 aacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcagataccaattaaataggtagaggaccaaaaagataattaag 50478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 50764 - 50927
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50764 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 50863  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaact-aaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50864 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 50927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 8582 - 8874
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  8582 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 8678  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8679 tatggttcatgtgtatgtgtgaaacaggaggtcagatacccgcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagt 8778  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatta 427  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8779 aacggtgagaaacttagagaacataaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatta 8874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8590 - 8428
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8590 acccacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacagaaaatactaaatattgtaacagtgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatt 8491  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  8490 tttagtta-aagatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 8428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Original strand, 15048553 - 15048847
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  15048553 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatattattggtaactgt 15048649  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15048650 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 15048749  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15048750 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 15048847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27473350 - 27473072
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27473350 tttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 27473251  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||  | ||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27473250 gaagcaagaggtcagatacccacataacacaaatcataatgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaac-gtgagaaacttagagg 27473152  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27473151 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatatcaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 27473072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 152 - 431
Target Start/End: Original strand, 34470715 - 34470994
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34470715 tttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgttatgattcttatgtatgtgt 34470814  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34470815 gaaacaggaactcaggtacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgaaaaacttagagg 34470914  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34470915 accaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 34470994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37569594 - 37569313
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaa-tagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtg 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37569594 tttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaaatagtgactgatatgattggtaactgttatggttcatatgtatgtg 37569495  T
Q  251 tgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 350  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37569494 tgaaacaggaggtcaggtacccacataacaaaaaccataacgtttattcgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 37569395  T
Q  351 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  37569394 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatcaagcct 37569313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45276892 - 45276597
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  45276892 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 45276796  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45276795 tatggttcatatgtatgtgtggaacaggaggtcag-tacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatataaatgactaaatgtagt 45276697  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  45276696 aacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 45276597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 429
Target Start/End: Original strand, 38588741 - 38589035
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  38588741 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 38588837  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  38588838 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcaggtacccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacataaaggactaaatctagt 38588937  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  38588938 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaaaataattaag 38589035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15871917 - 15871621
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15871917 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 15871821  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15871820 tatggttcatgtgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagt 15871721  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  15871720 aacagtgagaaatttagaggaccaaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaattaagcc 15871621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5435179 - 5434902
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5435179 tttatttattagtatcattttggtcatatgcctagttaaggtattataattaaataatgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 5435080  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5435079 gaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaa 5434980  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5434979 accgaaataaatcaaattttaggtagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 5434902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Original strand, 1870104 - 1870386
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattat--gattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgt 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  1870104 tttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatattattagtaaccgttatggttcatatgtatgt 1870203  T
Q  250 gtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaga 349  Q
    |||||| ||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1870204 gtgaaacaggaggtctggtgcccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactttgagaaacttaga 1870303  T
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1870304 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatctatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 1870386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5152813 - 5152536
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |    
T  5152813 tttatttactagtatcattttggtcatatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatatat 5152714  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5152713 gaaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagagg 5152614  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  5152613 acc-aaataaatcaatttttagtcagaggaccaatctgataccaattaaacagttagaggatcaaaaaggtaattaagc 5152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11708029 - 11707749
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11708029 tttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 11707930  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| || ||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11707929 gaaacagaaggacaaatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtattaacagtgagaaacttagagg 11707830  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  11707829 atcgaaacaaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaagataattaagcct 11707749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Original strand, 40048226 - 40048501
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  40048226 tttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataaccgttatggttcat-tgtatgtgt 40048324  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048325 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 40048424  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||    
T  40048425 atcaaaataaaacaatttttagttagaggatcaatacgataccaactaaataactagaggatcaaaaaggtaattaa 40048501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1646803 - 1646500
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  1646803 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattatgggtaattgt 1646707  T
Q  232 tatggttcatatgtat------gtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaa 325  Q
     ||| ||||| |||||      |||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1646706 aatgtttcatttgtatttgtatgtgtgaaataggaggtcaggcacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaa 1646607  T
Q  326 tgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaat 425  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1646606 tatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaat 1646507  T
Q  426 taagcct 432  Q
    |||||||    
T  1646506 taagcct 1646500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1740244 - 1739952
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1740244 tatgtgggtcctctaactt---tatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattct 1740148  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1740147 tatgtttcatttgtatgtgtgaaataggaggtcaggcacccacatagcacaaatcttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaat 1740048  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatta 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1740047 aacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatta 1739952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 27669570 - 27669850
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattg- 230  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||     
T  27669570 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaaatagtgactgatgttattggtaactgt 27669666  T
Q  231 ----ttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaat 326  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27669667 taatttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgattatttgaataaaactaacagaaatgactaaat 27669766  T
Q  327 gtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27669767 gtagtaacagtgtgaaactta-aagatcgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagagg 27669850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44594880 - 44594604
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44594880 tttatttattagtattattttggttctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgt 44594781  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||| |||    
T  44594780 gaaataggaggtcaagtacccacatagcacaaactctaatgtttatatgaataaaactaacagaaataactaaatgtagtaacgaatataaatttaaagg 44594681  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44594680 accgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctaatagcaattaaataattagaggaccaaaaatgtaattaa 44594604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 241 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33819975 - 33819784
Alignment:
Q  241 tatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgag 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33819975 tatgtatgtgtgaaacaggaggtcatatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgag 33819876  T
Q  341 aaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  33819875 aaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaatttagcct 33819784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1432293 - 1432136
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1432293 acccaaataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1432194  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1432193 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 1432136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7535112 - 7534845
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7535112 tttatttattagtatcattttggtcttattcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatattatttgtaactgttatggttcatatgtatgtgt 7535013  T
Q  252 gaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 351  Q
    |||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||         ||||||||||||||||| | |    
T  7535012 gaaacaggaggccagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggac---------taacggtgagaaacttaaatg 7534922  T
Q  352 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  7534921 accgaaataaatcaatttttaattaaaggactaatccgatatcaactaaataattagaagaccaaaaaggtaattaa 7534845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45077499 - 45077221
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataa-ttg 230  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  45077499 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaacttt 45077403  T
Q  231 ttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtag 330  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||         
T  45077402 ttatggtccacatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatacccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaa----- 45077308  T
Q  331 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45077307 --------------ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 45077222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 27473365 - 27473522
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473365 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 27473464  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  27473465 tagaggactaatctgataccaattaaattgttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 27473522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 33295978 - 33296135
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33295978 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagt 33296077  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  33296078 tagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 33296135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40660183 - 40659983
Alignment:
Q  231 ttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtag 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  40660183 ttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactattagaaaagactaaatgtag 40660084  T
Q  331 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagc 430  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  40660083 taacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagatgactaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagc 40659984  T
Q  431 c 431  Q
    |    
T  40659983 c 40659983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38588749 - 38588607
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588749 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38588650  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38588649 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagagg 38588607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15048561 - 15048399
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048561 acccacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15048462  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15048461 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 15048399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 428
Target Start/End: Original strand, 1651860 - 1652018
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651860 acccacataacacaaaacctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1651958  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1651959 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 1652018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 428
Target Start/End: Original strand, 1740236 - 1740394
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740236 acccacataacacaaaacctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1740334  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1740335 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 1740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 45077491 - 45077654
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45077491 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 45077590  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  45077591 tttagttagaggaccaatctgatactaatcaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 45077654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 45276884 - 45277047
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45276884 acccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatt 45276983  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  45276984 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 45277047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7949574 - 7949424
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949574 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 7949475  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7949474 tttaattaaaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 7949424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 15871909 - 15872071
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871909 acccacataacacaagctctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15872008  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15872009 tttatttagaggaccaatctgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 15872071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 428
Target Start/End: Original strand, 40660180 - 40660333
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660180 ataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 40660279  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40660280 tagaggaccaattcgataacaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 40660333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 279 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1870085 - 1869953
Alignment:
Q  279 cacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1870085 cacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaattaatttttagttaga 1869986  T
Q  379 ggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1869985 ggatcaatctgataccaattaaatagttagagg 1869953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 282 - 426
Target Start/End: Original strand, 11173935 - 11174079
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 381  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11173935 aaactctaacatttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 11174034  T
Q  382 ccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11174035 ccaatcagataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 11174079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Original strand, 5152822 - 5152964
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5152822 acccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaaaactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 5152921  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  5152922 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaacagtcagagg 5152964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 269 - 419
Target Start/End: Original strand, 5435188 - 5435338
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5435188 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 5435287  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaa 419  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  5435288 tttagttagagcaccaatccgataccaattatatagttagaggaccaaaaa 5435338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 7535127 - 7535284
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7535127 ataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 7535226  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  7535227 tagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 7535284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 22763232 - 22763384
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22763232 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 22763331  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  22763332 gaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 22763384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 411
Target Start/End: Original strand, 44594895 - 44595031
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44594895 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaatgactaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 44594994  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  44594995 tagaggactaatccaatatcaattaaatagttagagg 44595031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 1646795 - 1646957
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646795 acccacataacataaaacctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1646893  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1646894 tttagttagatgaccaatccgataccaattaaatagttagaggacgaaaaaggtaattaagcct 1646957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27669578 - 27669440
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27669578 acccacataacataaaccctaacgtttatttcaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacagtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatt 27669479  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27669478 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 27669440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 309 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33295858 - 33295739
Alignment:
Q  309 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttag 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295858 taacagaaatgactaaatgtaataacggtgacaaacttagaataccgaaataaatcaatttttaattagaagaccaatctgataccaactaaatagttag 33295759  T
Q  409 agggccaaaaatgtaattaa 428  Q
    ||| ||||||| || |||||    
T  33295758 aggaccaaaaaggtcattaa 33295739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 7949566 - 7949721
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  7949566 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactg- 7949661  T
Q  232 tatggttcatatgtat-gtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaa 290  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7949662 tattgttcatatgtatggtctgaaataggaggtcagatacccacataacacaaacactaa 7949721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33295963 - 33295860
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33295963 tttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatgattcatatgtatgtgt 33295864  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  33295863 gaaa 33295860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1651868 - 1651719
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1651868 tatgtgggtcctctaactt---tatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattct 1651772  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaa 284  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  1651771 tatgtttcatttgtatgtgtgaaataggaggtcaggcacccacatagcacaaa 1651719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 363
Target Start/End: Original strand, 18298523 - 18298611
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaat 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18298523 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccaaaataaat 18298611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 432
Target Start/End: Original strand, 24666005 - 24666129
Alignment:
Q  308 ttaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  24666005 ttaacagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttaaaggaccaaaccgttaccaattaaatagtta 24666104  T
Q  408 gagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  24666105 gaggaccaaaaaggtaattaagcct 24666129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Original strand, 1432302 - 1432421
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1432302 tttatttattaatatcattttgatcatatgccttgttaatgtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtacgtgt 1432401  T
Q  252 gaaataggagatcagatacc 271  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  1432402 gaaacaggaggtcagatacc 1432421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 432
Target Start/End: Original strand, 11920136 - 11920223
Alignment:
Q  345 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||    
T  11920136 ttagaggacccaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatttagcct 11920223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24659475 - 24659366
Alignment:
Q  152 tttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgt 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  24659475 tttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatattattactaactgttatagttaatatgtatgtgt 24659376  T
Q  252 gaaataggag 261  Q
    |||| |||||    
T  24659375 gaaacaggag 24659366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24652905 - 24652822
Alignment:
Q  349 aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24652905 aggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 24652822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 409
Target Start/End: Original strand, 37569616 - 37569743
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 381  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  37569616 aaactctaacgtttatttgaataaaactaactgaaaagactaaatatagtaacaacgagaaatttagaggaccaaaataaataaatttttaattagatga 37569715  T
Q  382 ccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
     ||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  37569716 tcaatccgatatcaattaaatacttaga 37569743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 330 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22762614 - 22762513
Alignment:
Q  330 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaag 429  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  22762614 gtaacggtgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatataatttag 22762515  T
Q  430 cc 431  Q
    ||    
T  22762514 cc 22762513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 40048215 - 40048089
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        | |||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  40048215 ataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac--------agttagagaatcaaaataaattaatttttagt 40048124  T
Q  375 tagaggaccaatctgataccaactaaatagttaga 409  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  40048123 tagaggactaatccaatatcaattaaatagttaga 40048089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15740760 - 15740613
Alignment:
Q  282 aaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 381  Q
    ||||||||||||||  || | |||| ||||| |||| ||||||| || |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  15740760 aaaccctaacgttt--ttaattaaatttaacggaaaggactaaaagtggtaacggaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttagggga 15740663  T
Q  382 ccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  15740662 ccaaaccgatactaattaaatagttaatggaccaaaaaggcaattaagcc 15740613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18298478 - 18298410
Alignment:
Q  193 tattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggag 261  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18298478 tattatgattaaatagtgacaaatattattagtaactgttatgattcatatgtatgtgtgaaataggag 18298410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11920135 - 11920075
Alignment:
Q  372 agttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11920135 agttagaggaccaatccaaaaccaaataaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 11920075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 411
Target Start/End: Original strand, 33819975 - 33820043
Alignment:
Q  343 acttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33819975 acttagaagactgaaataaattaatttttagttagatgatcaatccgataccaattaaatagttagagg 33820043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Original strand, 12643891 - 12643966
Alignment:
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12643891 aaataaatcaatatttagttagaggaccaaatcgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 12643966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Original strand, 15741607 - 15741682
Alignment:
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  15741607 aaataaatcaaaatttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattaagcc 15741682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11173930 - 11173858
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaata 207  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  11173930 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcatttgggttctatgctttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30650265 - 30650189
Alignment:
Q  356 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  30650265 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagcct 30650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Original strand, 39912224 - 39912300
Alignment:
Q  350 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  39912224 ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatt 39912300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 18427 - 18723
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  18427 tatgtgggtcctctaattt---tatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 18523  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18524 tatggttcatatgtatgtgtgaaacaggcggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagt 18623  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18624 aacagtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaattaagcc 18723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 269 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18435 - 18278
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18435 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagaagacctaaataaatcaatt 18336  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18335 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataatt 18278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Original strand, 15602 - 15898
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15602 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcatttttgtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 15698  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagt 331  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  15699 tatggttcgtatgtatatgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagggattaaatgtagt 15798  T
Q  332 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcc 431  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15799 catggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatccgataccagttaaatagttagaggatcaaaaaagtaattaagcc 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15610 - 15473
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  15610 acccacataacacaaactcaaacatttatttgaat-----taacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaatgaccaaaataaatcaatt 15516  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  15515 tttaattagaggatcaatccgataccaattgaatagttagagg 15473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 407
Target Start/End: Original strand, 6179 - 6420
Alignment:
Q  165 atcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatc 264  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| | ||  ||    
T  6179 atcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattattatgtttcttatggatgtgtgaaacaagatgtc 6278  T
Q  265 agatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 364  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6279 agatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaat-aatc 6377  T
Q  365 aatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  6378 aatttttagttagaggaccaatacgataccaattaattagtta 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 6044
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6154 ataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacaatgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagt 6055  T
Q  375 tagaggaccaa 385  Q
    |||||||||||    
T  6054 tagaggaccaa 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 240 - 411
Target Start/End: Original strand, 56395 - 56566
Alignment:
Q  240 atatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 339  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56395 atatgtatgtgtgaaacaggaggttaggtacccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 56494  T
Q  340 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  56495 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagagg 56566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 240 - 411
Target Start/End: Original strand, 63520 - 63691
Alignment:
Q  240 atatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 339  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63520 atatgtatgtgtgaaacaggaggttaggtacccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 63619  T
Q  340 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  63620 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagagg 63691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45918 - 45755
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45918 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 45819  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||    
T  45818 tttagttagaggactaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaatagtaatttagcct 45755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Original strand, 45910 - 46020
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  45910 tatgtgggtcctctaactt---tacttattagtttcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 46006  T
Q  232 tatggttcatatgt 245  Q
    |||| || ||||||    
T  46007 tatgatttatatgt 46020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20913 - 20750
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 20814  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20813 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagcct 20750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 317
Target Start/End: Original strand, 20905 - 21086
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20905 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgt 21000  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21001 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaatagaaa 21086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21673 - 21511
Alignment:
Q  269 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673 acccacataacacaaaacctaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 21575  T
Q  369 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21574 tttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 21511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 279 - 432
Target Start/End: Original strand, 22451 - 22604
Alignment:
Q  279 cacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 378  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22451 cacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 22550  T
Q  379 ggaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22551 ggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 22604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 284
Target Start/End: Original strand, 21665 - 21814
Alignment:
Q  132 tatgtgggtcctctaatttatttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgataattgt 231  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21665 tatgtgggtcctctaactt---tatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgt 21761  T
Q  232 tatggttcatatgtatgtgtgaaataggagatcagatacccatataacacaaa 284  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21762 tatgtttcatttgtatgtgtgaaataggaggtcagacacccacataacacaaa 21814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14347 - 14231
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagcaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 14248  T
Q  375 tagaggaccaatctgata 392  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  14247 taga-gaccaatccgata 14231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 386
Target Start/End: Original strand, 147134 - 147245
Alignment:
Q  275 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 374  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  147134 ataacataaatcctaacgtttattcgaataaaattaacggaaatgactaaatatagtaacgatgagaaacttaacggaccgaaataaatcaatttttagt 147233  T
Q  375 tagaggaccaat 386  Q
    | ||||||||||    
T  147234 tcgaggaccaat 147245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 284 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 144166 - 144040
Alignment:
Q  284 accctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacc 383  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  144166 accctaacgttttttt-aataaaaccaatggaaaagactaaaagtagtaacggtgagaaatttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagagaacc 144068  T
Q  384 aatctgataccaactaaatagttagagg 411  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  144067 aatatgataccaattaaatagttagagg 144040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9932 - 9781
Alignment:
Q  280 acaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 379  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9932 acaaaccctaacgttttttt-aataaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagag 9834  T
Q  380 gaccaatctgataccaactaaatagttagagggccaaaaatgtaattaagcct 432  Q
    || ||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||| | ||||||||||    
T  9833 gagcaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattaagcct 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 407
Target Start/End: Original strand, 10860 - 10982
Alignment:
Q  284 accctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacc 383  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10860 accctaacgttttttt-aataaaattaacggaaagaactaaaagtggtaacagaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggacc 10958  T
Q  384 aatctgataccaactaaatagtta 407  Q
    || | ||||| || ||||||||||    
T  10959 aaaccgatactaattaaatagtta 10982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University