View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3434_high_18 (Length: 317)

Name: NF3434_high_18
Description: NF3434
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3434_high_18
NF3434_high_18
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (2-307)||(41286949-41287253)
chr5 (4-307)||(41332756-41333059)
chr5 (2-307)||(41316782-41317087)
chr5 (2-307)||(41328823-41329128)
chr5 (2-303)||(41366939-41367240)
chr5 (2-307)||(41324846-41325151)
chr5 (2-307)||(31177749-31178054)
chr5 (2-302)||(41337568-41337868)
chr5 (2-307)||(31187812-31188117)
chr5 (4-307)||(41310983-41311290)
chr5 (2-307)||(31225661-31225966)
chr5 (2-158)||(41305243-41305399)
chr5 (192-299)||(41432005-41432112)
chr5 (247-299)||(14235910-14235962)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (2-307)||(17248629-17248934)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41287253 - 41286949
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41287253 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgcccaagcattgacaagaaccct 41287154  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41287153 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatagcaggatgcaacctcattgtttctttg 41287054  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| |    
T  41287053 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgtctcaaccacatacccctttctatcaaacactcttcttacctcagcttgtgctt-ttccatca 41286955  T
Q  302 cctttg 307  Q
    ||||||    
T  41286954 cctttg 41286949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41333059 - 41332756
Alignment:
Q  4 tcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccctag 103  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |  ||||| |    
T  41333059 tcaattgtgctattaacaaacctctcaggtttaaaactctcagcttcaacccaataccttgaatctcttccaatagcccaagcattaaccattacccttg 41332960  T
Q  104 tcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttgat 203  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||| |||||||||||||||||||     
T  41332959 tcttagctgggatttcatacccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaattaacaatggtgcaacgggatgtaacctcaatgtttctttgac 41332860  T
Q  204 aacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccattacc 303  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| ||||    
T  41332859 gacagactttaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacactcttcttacttcaatctgtgcttcttccaatacc 41332760  T
Q  304 tttg 307  Q
    ||||    
T  41332759 tttg 41332756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41317087 - 41316782
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  41317087 aatcaattgggctattaacaaacctctcaggtttaaaactctcagcttcaacccaataccttggatctcttccaatagcccaagcattgacagcaaccct 41316988  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||  || | |||||||||||||||  ||||||||     || ||| |||||||||||||||||||    
T  41316987 tgtcttggctggaatctcataaccattgatttggcatctctccctactttctcttggaactaacaatggagcaacaggatacaacctcaatgtttctttg 41316888  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41316887 atgacagactttaagtatatcaattggtacaactctgtctcatccacatatccctttttatcaaacactcttcttacttcagcttgtgcttgttccatta 41316788  T
Q  302 cctttg 307  Q
    | ||||    
T  41316787 catttg 41316782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41329128 - 41328823
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||    
T  41329128 aatcaattggactattaacaaacctctcaggtttaaaactctcagcttcaacccaataccttgaatctcttccaatagcccaagcattaaccattaccct 41329029  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||||    |  |||||||||||||||||||||||    
T  41329028 tgtcttagctgggatttcatacccattgatttggcatctctccctactttctcttggaactaacaatggtgcaacgggatgcaacctcaatgtttctttg 41328929  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41328928 atgacggactttaagtatatcaattggtgcaactctgtctcatccacatactcctttttatcaaacactctacttacttcatcttgtgcttcttccatta 41328829  T
Q  302 cctttg 307  Q
    ||||||    
T  41328828 cctttg 41328823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41367240 - 41366939
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||||| || || ||| |||  || || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||    
T  41367240 aatcaattcggctattaagaaatctctcaggcttaaaactcttggcatcaacccaatacctcggatctcttccaatagcccaagcattaacaatgaccct 41367141  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  41367140 tgtcttagctgggatatcatatctatttatttggcatggcttcgtactttctcttggaatcaataatggtatagaaggatgcaacctcattgtttctttg 41367041  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  41367040 atgacggattttaagtatatcaattggtgcaactctgtctcattcacatatccctttttatcaaacactcttcttacctcaacttgtgctgcttccatta 41366941  T
Q  302 cc 303  Q
    ||    
T  41366940 cc 41366939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41325151 - 41324846
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||    
T  41325151 aatcaattggactattaacaaacctctcaggtttaaaactttcagcatcaacccaataccttggatctcttccaatagcccaagcattaaccatgaccct 41325052  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||  || | |||||||||||||||  ||||| |||| ||   |||| | ||||| |||||| |||    
T  41325051 tgtcttagctgggatttcatacccattgatttggcatctctccctactttctcttggaagtaacaacggtacggttggatgtagcctcattgtttccttg 41324952  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  41324951 atcacagattttaagtatatcaattggtgcaactctgtctcatccacaaaccccttcctatcaaaaactcttcttacctcagcttgtgcttcttccatca 41324852  T
Q  302 cctttg 307  Q
    ||||||    
T  41324851 cctttg 41324846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 31177749 - 31178054
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||| |  ||| ||    
T  31177749 aatcaattgtgctattaacaaacctctcgggtttaaaactctcagcttctgcccaatacctttcatctcttccaattgcccaaacattgatagcaactct 31177848  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
T  31177849 tgttttagctgggatttcatacccattgatttggcatctctctctactttctcttggaatcaacaaaggtaaagaaggatgcaaccttaatgtttctttg 31177948  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  31177949 attatagactttaagtatatcaaatggtgcaactctgtttcatcgacatgcccctttttatcaaacacttttcttacttcagcttgtgcttccttcatta 31178048  T
Q  302 cctttg 307  Q
     |||||    
T  31178049 tctttg 31178054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41337868 - 41337568
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  41337868 aatcaattgagctattaacaaacctctcaggtttaaaactctcagcttcaacccaatactttggatctcttccaattgcccaaacattgacagcaaccct 41337769  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||  ||   ||||||||||||||| |||||| ||||  | | |||| | ||| ||||||||||||    
T  41337768 tgtcttagctgggatctcatacccattgatttcacatctctctctactttctcttggaaccaacaaaggtacagtaggatgtagcctaaatgtttctttg 41337669  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || ||| |||| |||||| |||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  41337668 atgacacactttaagtatgtcaactgttgcaactctgtctcgtctacatacccctttttatcaaacactcttcttacctcaacttgtgcttcttccatta 41337569  T
Q  302 c 302  Q
    |    
T  41337568 c 41337568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 31187812 - 31188117
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||| |  ||| ||    
T  31187812 aatcaattgtgctattgagaaacctctcaggtttaaaactctcagcttctgcccaatacctttcatctcttccaattgcccaaacattgatagcaactct 31187911  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| || |  | | |||| | ||||||||||||| ||    
T  31187912 tgttttagctgggatttcatacccattgatttggcatctctctctactttctcttggaaccaacaaaggcacagaaggatgtagcctcaatgtttctctg 31188011  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31188012 attatagactttaagtatatcaattggtgcaactctgtttcatcgacatacccctttttatcaaacacttttcttacttcagcttgtgctttctccatta 31188111  T
Q  302 cctttg 307  Q
     |||||    
T  31188112 tctttg 31188117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41311290 - 41310983
Alignment:
Q  4 tcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccctag 103  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||  || || |    
T  41311290 tcaattgtgctattaacaaacctctcaggtttaaatctctcagcttcaacccaataccttggatctcttccaatagcccaagcaataataacgactcttg 41311191  T
Q  104 tcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttgat 203  Q
    ||||    ||||| ||||  | |||||||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||||    |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  41311190 tcttaattgggatctcatgcctattaatttggcatctctccctactttctcttggaactaacaatggtgcaactggatgcaacctcagtgtttctttgat 41311091  T
Q  204 aacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacata----cccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccat 299  Q
     ||| |||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41311090 gacaaactttaagtatatcaacaggtgcaactccatctcatccacatatatacccctttttatcaaacactcttcttacttcaacttgtgcttcttccat 41310991  T
Q  300 tacctttg 307  Q
    ||||||||    
T  41310990 tacctttg 41310983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31225966 - 31225661
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||| |  ||| ||    
T  31225966 aatcaattgtgctattgagaaacctctcaggtttaaaactctcagcttctgcccaatacctttcatctcttccaattgcccaaacattgatagcaactct 31225867  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| |||   |   |||| || |||||||||||| |     
T  31225866 tgttttagctgggatttcatacccattgatttggcatctctctctactttctcttggaaccaacaaaggtgcagatggatgtaatctcaatgtttctcta 31225767  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31225766 attatagactttaagtatattaattggtgcaactctgtttcatcgacatgtccctttttatcaaacatgtttcttacttcagcttgtgcttcctccatta 31225667  T
Q  302 cctttg 307  Q
     |||||    
T  31225666 tctttg 31225661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41305399 - 41305243
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  41305399 aatcaattgagctattaacaaacctctcgggtttaaaactctcagcttcaacccaatactttggatctcttccaatcgcccaagcattgacaataaccct 41305300  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttgg 158  Q
    |||||| || || ||||||||  |||| ||||||||   || | |||||||||||||    
T  41305299 agtcttagctggaatatcatactcattgatttggcaactctccctactttctcttgg 41305243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41432112 - 41432005
Alignment:
Q  192 tgtttctttgataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgct 291  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  41432112 tgtttctttgatgatagacttcaagtatatcaattagtgcaactcagtctcatccacataccctttcatatcaaacactcttcttacctcagcttgtgct 41432013  T
Q  292 tcttccat 299  Q
    ||||||||    
T  41432012 tcttccat 41432005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14235962 - 14235910
Alignment:
Q  247 acatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccat 299  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14235962 acatacccctttctatcaaactcccttcttacctcagcttgtgcttcttccat 14235910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 17248629 - 17248934
Alignment:
Q  2 aatcaattggactattaacaaacctctcgggtttgaaattctcagcttcgacccaatatcttggatctcttccaattgccaaagcattgacaagaaccct 101  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||    
T  17248629 aatcaattgggctattaaaaaacctttcaggtttgaaactctcagcttcaacccaatacctttgatctcttccaattgcccaaacattaacagcaaccct 17248728  T
Q  102 agtcttggccgggatatcatatccattaatttggcatggcttcatactttctcttggaatcaacaatggtatggcatgatgcaacctcaatgtttctttg 201  Q
     ||||| || || |||||||| || || ||| | |||   | | |||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||| ||||| ||||||||||    
T  17248729 tgtcttagctggaatatcatacccgttgattcgacatttttccctactttgtctaggaatcaacaatggtacaataggatgcagcctcagtgtttctttg 17248828  T
Q  202 ataacagacttcaagtatatcaattggtgcaactctgactcatccacatacccctttttatcaaacattcttcttgcttcagcttgtgcttcttccatta 301  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  17248829 atgacagaatttaagtatattaattgatccaactccgtttcatctacatacccctttctatcaaaaacacttcttacctcagcttgtgctgcttccatca 17248928  T
Q  302 cctttg 307  Q
    ||||||    
T  17248929 cctttg 17248934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University