View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3436-Insertion-13 (Length: 446)

Name: NF3436-Insertion-13
Description: NF3436
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3436-Insertion-13
NF3436-Insertion-13
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-357)||(3409462-3409818)
chr6 (1-357)||(2377929-2378284)
chr6 (136-357)||(29518857-29519078)
chr6 (11-359)||(10073989-10074336)
chr6 (191-357)||(29518495-29518661)
chr6 (191-357)||(32741171-32741337)
chr6 (167-382)||(2578419-2578634)
chr6 (191-381)||(35210196-35210384)
chr6 (191-347)||(3409251-3409407)
chr6 (166-368)||(10074352-10074553)
chr6 (191-382)||(3058218-3058410)
chr6 (166-370)||(16454872-16455078)
chr6 (190-368)||(3415449-3415629)
chr6 (191-357)||(14748342-14748504)
chr6 (201-357)||(2377756-2377912)
chr6 (199-370)||(2579860-2580030)
chr6 (192-357)||(1846741-1846906)
chr6 (170-371)||(2579478-2579678)
chr6 (174-370)||(2578822-2579016)
chr6 (191-347)||(26544041-26544197)
chr6 (191-382)||(1127352-1127543)
chr6 (201-357)||(16454577-16454733)
chr6 (201-348)||(16107680-16107827)
chr6 (205-357)||(2843560-2843713)
chr6 (167-381)||(2579087-2579297)
chr6 (166-369)||(10073604-10073804)
chr6 (201-379)||(5832007-5832182)
chr6 (136-356)||(16107998-16108208)
chr6 (202-354)||(6999799-6999951)
chr6 (199-370)||(593694-593867)
chr6 (202-342)||(1950200-1950340)
chr6 (204-307)||(32460630-32460733)
chr6 (199-353)||(10911565-10911720)
chr6 (205-324)||(9062383-9062501)
chr6 (199-370)||(12071678-12071849)
chr6 (166-318)||(8481893-8482045)
chr6 (199-370)||(12085021-12085191)
chr6 (199-369)||(12092470-12092640)
chr6 (194-351)||(5958613-5958766)
chr6 (166-331)||(6071098-6071264)
chr6 (199-380)||(31714671-31714849)
chr6 (1-106)||(29518678-29518784)
chr6 (166-272)||(35210456-35210551)
chr6 (203-368)||(17135058-17135223)
chr6 (3-87)||(2579387-2579473)
chr6 (167-315)||(2975521-2975668)
chr6 (136-258)||(33605913-33606034)
chr6 (1-87)||(16107855-16107943)
chr6 (1-98)||(26544224-26544321)
chr6 (3-87)||(2578730-2578816)
chr6 (206-369)||(30618606-30618766)
chr6 (267-311)||(22605301-22605345)
chr6 (1-52)||(2579805-2579856)
chr6 (303-350)||(3409405-3409452)
chr6 (267-318)||(11637760-11637811)
chr6 (236-282)||(14789279-14789325)
chr6 (267-311)||(21130103-21130147)
chr6 (1-52)||(2579042-2579093)
chr6 (1-48)||(16454750-16454797)
chr6 (291-349)||(10902438-10902496)
chr6 (1-65)||(35210378-35210442)
chr6 (275-317)||(11638053-11638095)
chr6 (324-381)||(2975296-2975352)
chr6 (1-57)||(10073918-10073974)
chr6 (333-381)||(35210554-35210601)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (1-376)||(22304370-22304747)
chr3 (59-340)||(4823515-4823796)
chr3 (4-357)||(41359765-41360116)
chr3 (112-382)||(37990614-37990884)
chr3 (107-351)||(15773099-15773346)
chr3 (167-381)||(54017793-54018008)
chr3 (96-356)||(11661846-11662108)
chr3 (201-367)||(37990967-37991133)
chr3 (201-355)||(43346793-43346947)
chr3 (201-357)||(35946524-35946680)
chr3 (199-381)||(15772854-15773035)
chr3 (199-369)||(29644890-29645060)
chr3 (199-381)||(42342364-42342546)
chr3 (150-382)||(29644557-29644791)
chr3 (166-355)||(42342092-42342283)
chr3 (199-369)||(12114550-12114720)
chr3 (199-357)||(32589704-32589861)
chr3 (199-357)||(33803252-33803410)
chr3 (190-349)||(39934963-39935124)
chr3 (167-357)||(21832345-21832532)
chr3 (199-357)||(54018198-54018356)
chr3 (191-348)||(39389062-39389219)
chr3 (166-349)||(22303963-22304141)
chr3 (199-357)||(25739425-25739583)
chr3 (201-354)||(32462903-32463057)
chr3 (201-357)||(52634678-52634833)
chr3 (166-357)||(32462558-32462752)
chr3 (191-357)||(50612447-50612618)
chr3 (199-384)||(1634288-1634473)
chr3 (199-358)||(31190017-31190168)
chr3 (199-357)||(53577364-53577522)
chr3 (201-357)||(25755396-25755552)
chr3 (137-331)||(3135099-3135293)
chr3 (199-354)||(45395656-45395811)
chr3 (201-357)||(3135454-3135617)
chr3 (167-350)||(9240118-9240300)
chr3 (201-358)||(45901715-45901873)
chr3 (200-357)||(53117975-53118131)
chr3 (199-359)||(39914252-39914412)
chr3 (199-358)||(8327904-8328067)
chr3 (4-178)||(22303759-22303934)
chr3 (166-254)||(22304213-22304301)
chr3 (191-357)||(37726496-37726654)
chr3 (201-349)||(49336694-49336843)
chr3 (257-384)||(22303631-22303759)
chr3 (191-358)||(51886553-51886714)
chr3 (201-381)||(33175635-33175820)
chr3 (199-357)||(44160547-44160702)
chr3 (180-331)||(47964544-47964694)
chr3 (209-381)||(42584800-42584970)
chr3 (273-381)||(41359467-41359575)
chr3 (188-306)||(3384317-3384435)
chr3 (225-323)||(33362327-33362425)
chr3 (199-369)||(39336219-39336387)
chr3 (269-357)||(54017548-54017636)
chr3 (199-357)||(47964915-47965073)
chr3 (202-291)||(7767380-7767469)
chr3 (201-317)||(11661537-11661638)
chr3 (308-381)||(22304302-22304376)
chr3 (202-307)||(46546375-46546480)
chr3 (199-255)||(43346650-43346706)
chr3 (241-327)||(39336000-39336086)
chr3 (241-346)||(12749211-12749316)
chr3 (249-309)||(52634990-52635050)
chr3 (303-356)||(8328374-8328427)
chr3 (202-331)||(25317161-25317290)
chr3 (201-317)||(25991405-25991521)
chr3 (1-76)||(53577540-53577616)
chr3 (279-383)||(43978839-43978947)
chr3 (266-317)||(53596027-53596078)
chr3 (266-317)||(53596342-53596393)
chr3 (254-311)||(17731950-17732007)
chr3 (254-311)||(19033181-19033238)
chr3 (266-317)||(53596542-53596593)
chr3 (281-357)||(7766783-7766857)
chr3 (1-88)||(15773029-15773117)
chr3 (266-313)||(48127859-48127906)
chr3 (4-87)||(54018093-54018178)
chr3 (1-58)||(53577659-53577716)
chr3 (326-370)||(9239940-9239984)
chr3 (199-231)||(12747878-12747910)
chr3 (267-311)||(16871005-16871049)
chr3 (267-311)||(17735037-17735081)
chr3 (267-311)||(19036306-19036350)
chr3 (2-52)||(33803184-33803234)
chr3 (161-223)||(2299937-2300000)
chr3 (266-311)||(16143505-16143550)
chr3 (270-311)||(16869843-16869884)
chr3 (204-265)||(36986040-36986101)
chr3 (204-265)||(37011479-37011540)
chr3 (262-298)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (1-369)||(3669862-3670229)
chr8 (3-349)||(1013879-1014225)
chr8 (1-357)||(9309156-9309512)
chr8 (190-357)||(3669678-3669845)
chr8 (189-369)||(30441071-30441255)
chr8 (201-355)||(3038292-3038446)
chr8 (177-367)||(34835185-34835377)
chr8 (166-367)||(34835439-34835643)
chr8 (166-367)||(34835705-34835909)
chr8 (166-355)||(40518550-40518738)
chr8 (201-349)||(34834878-34835026)
chr8 (191-382)||(20870549-20870741)
chr8 (133-350)||(45121663-45121881)
chr8 (167-357)||(8918764-8918956)
chr8 (199-347)||(45122067-45122215)
chr8 (191-349)||(1014253-1014411)
chr8 (150-353)||(30359558-30359763)
chr8 (199-369)||(45121898-45122068)
chr8 (172-357)||(45122604-45122782)
chr8 (201-381)||(30359273-30359454)
chr8 (167-359)||(6731872-6732055)
chr8 (177-353)||(9482608-9482784)
chr8 (201-360)||(25561812-25561972)
chr8 (199-357)||(6876862-6877021)
chr8 (199-358)||(9608745-9608904)
chr8 (201-356)||(33113368-33113523)
chr8 (201-357)||(40518071-40518229)
chr8 (167-357)||(45122972-45123164)
chr8 (201-357)||(37544490-37544646)
chr8 (202-357)||(147454-147609)
chr8 (224-370)||(9483174-9483320)
chr8 (201-357)||(1513915-1514071)
chr8 (206-354)||(70277-70425)
chr8 (150-353)||(18371665-18371863)
chr8 (193-351)||(40579512-40579670)
chr8 (199-357)||(5915872-5916025)
chr8 (199-355)||(5420651-5420807)
chr8 (199-354)||(41972158-41972316)
chr8 (209-381)||(18371970-18372142)
chr8 (150-271)||(18372342-18372463)
chr8 (166-347)||(147794-147968)
chr8 (170-357)||(6651476-6651652)
chr8 (199-357)||(9308977-9309139)
chr8 (150-271)||(18372785-18372905)
chr8 (202-347)||(32640542-32640682)
chr8 (150-303)||(18372988-18373139)
chr8 (203-356)||(18380020-18380171)
chr8 (193-357)||(32305478-32305635)
chr8 (199-347)||(4154678-4154824)
chr8 (199-350)||(9507777-9507933)
chr8 (222-336)||(9609108-9609222)
chr8 (154-243)||(18372485-18372574)
chr8 (191-277)||(41416251-41416335)
chr8 (202-312)||(43274824-43274934)
chr8 (166-368)||(4154270-4154472)
chr8 (277-370)||(41129066-41129159)
chr8 (201-317)||(8794113-8794229)
chr8 (199-369)||(9620666-9620834)
chr8 (274-357)||(40579269-40579352)
chr8 (199-348)||(12283873-12284021)
chr8 (281-357)||(8919144-8919220)
chr8 (201-307)||(18372656-18372758)
chr8 (381-446)||(45324454-45324519)
chr8 (202-289)||(3037776-3037865)
chr8 (203-348)||(43398077-43398225)
chr8 (209-272)||(25561729-25561792)
chr8 (204-304)||(20130454-20130553)
chr8 (199-331)||(5274775-5274907)
chr8 (276-369)||(20995404-20995497)
chr8 (202-366)||(40991756-40991920)
chr8 (293-357)||(43274635-43274699)
chr8 (1-88)||(147626-147715)
chr8 (280-337)||(16524446-16524503)
chr8 (310-381)||(3037944-3038016)
chr8 (235-291)||(18373236-18373292)
chr8 (150-225)||(43274699-43274776)
chr8 (1-57)||(34835050-34835105)
chr8 (253-340)||(40417733-40417820)
chr8 (299-353)||(18372288-18372342)
chr8 (270-307)||(12156708-12156745)
chr8 (199-256)||(20995502-20995559)
chr8 (199-276)||(33831978-33832055)
chr8 (5-88)||(9608932-9609017)
chr8 (257-298)||(11442911-11442952)
chr8 (1-57)||(30359448-30359501)
chr8 (199-231)||(18645713-18645745)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (1-382)||(44290434-44290806)
chr1 (2-379)||(48588465-48588843)
chr1 (1-357)||(26661522-26661881)
chr1 (189-381)||(44290800-44290993)
chr1 (7-278)||(3537226-3537496)
chr1 (136-368)||(41157311-41157545)
chr1 (161-348)||(37556071-37556260)
chr1 (191-357)||(41759475-41759641)
chr1 (191-368)||(3537589-3537765)
chr1 (199-357)||(41142372-41142531)
chr1 (167-358)||(34364891-34365084)
chr1 (1-231)||(50051777-50052007)
chr1 (199-382)||(41156991-41157176)
chr1 (168-368)||(22077484-22077683)
chr1 (191-353)||(3550712-3550871)
chr1 (172-357)||(11977251-11977438)
chr1 (201-354)||(17294579-17294733)
chr1 (199-381)||(31767138-31767319)
chr1 (190-381)||(45493951-45494146)
chr1 (199-357)||(29798199-29798357)
chr1 (199-381)||(34364507-34364688)
chr1 (201-357)||(34649440-34649596)
chr1 (199-357)||(5319965-5320123)
chr1 (207-357)||(14318875-14319025)
chr1 (200-382)||(40082408-40082589)
chr1 (191-357)||(50052024-50052189)
chr1 (191-382)||(32168673-32168853)
chr1 (203-369)||(9955911-9956079)
chr1 (193-325)||(32594748-32594880)
chr1 (199-381)||(45084382-45084557)
chr1 (199-355)||(3875333-3875489)
chr1 (199-370)||(37850588-37850758)
chr1 (196-342)||(38804370-38804516)
chr1 (201-334)||(26661921-26662054)
chr1 (202-348)||(37555733-37555878)
chr1 (199-350)||(24600321-24600472)
chr1 (199-353)||(66476-66630)
chr1 (199-357)||(39066201-39066358)
chr1 (167-366)||(22077101-22077311)
chr1 (167-346)||(66100-66278)
chr1 (205-381)||(5575110-5575284)
chr1 (166-347)||(30630648-30630828)
chr1 (199-381)||(24131965-24132143)
chr1 (199-381)||(41184383-41184583)
chr1 (190-319)||(44043810-44043944)
chr1 (200-351)||(22793279-22793431)
chr1 (199-368)||(22077818-22077986)
chr1 (209-349)||(5528762-5528902)
chr1 (199-379)||(19283434-19283613)
chr1 (201-383)||(45839629-45839815)
chr1 (2-130)||(48588340-48588468)
chr1 (270-357)||(11977015-11977102)
chr1 (199-381)||(21378036-21378199)
chr1 (199-347)||(44685456-44685605)
chr1 (199-370)||(1188574-1188746)
chr1 (269-383)||(50051664-50051776)
chr1 (199-384)||(1187336-1187522)
chr1 (270-382)||(47380142-47380254)
chr1 (214-356)||(44091909-44092051)
chr1 (181-258)||(50469180-50469256)
chr1 (241-317)||(10351202-10351278)
chr1 (226-346)||(4956218-4956340)
chr1 (150-251)||(47379891-47379990)
chr1 (1-91)||(34364682-34364774)
chr1 (199-246)||(35154150-35154197)
chr1 (199-265)||(4878803-4878869)
chr1 (166-348)||(24448245-24448426)
chr1 (7-103)||(11977128-11977224)
chr1 (248-293)||(41184152-41184197)
chr1 (1-57)||(66399-66455)
chr1 (298-357)||(4266798-4266855)
chr1 (199-359)||(5996870-5997029)
chr1 (254-314)||(35154046-35154106)
chr1 (1-52)||(31767094-31767144)
chr1 (1-88)||(34649614-34649702)
chr1 (191-264)||(4266875-4266948)
chr1 (1-46)||(9956084-9956129)
chr1 (1-87)||(37555903-37555990)
chr1 (240-356)||(9499020-9499136)
chr1 (281-317)||(12466365-12466401)
chr1 (1-57)||(22077422-22077478)
chr1 (208-267)||(30630912-30630972)
chr1 (272-318)||(9956212-9956258)
chr1 (1-35)||(30630586-30630620)
chr1 (292-369)||(30697310-30697387)
chr1 (339-381)||(45084576-45084617)
chr1 (93-184)||(3537495-3537587)
chr1 (1-37)||(22077776-22077812)
chr1 (281-317)||(31973375-31973411)
chr1 (136-184)||(41184198-41184246)
chr1 (199-335)||(50556451-50556587)
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (1-379)||(6500626-6501002)
chr5 (191-381)||(6500443-6500632)
chr5 (107-370)||(3295002-3295266)
chr5 (199-382)||(40296291-40296473)
chr5 (191-383)||(27502011-27502202)
chr5 (136-353)||(624134-624350)
chr5 (191-353)||(18603124-18603286)
chr5 (191-357)||(32487386-32487551)
chr5 (192-357)||(41170627-41170792)
chr5 (196-356)||(36492218-36492378)
chr5 (167-385)||(13415734-13415951)
chr5 (172-381)||(26074122-26074330)
chr5 (166-379)||(26074577-26074792)
chr5 (202-381)||(25327938-25328117)
chr5 (199-357)||(15370099-15370257)
chr5 (202-357)||(3295345-3295498)
chr5 (201-385)||(42405570-42405752)
chr5 (199-379)||(41632782-41632961)
chr5 (190-357)||(9498655-9498821)
chr5 (201-381)||(1028493-1028673)
chr5 (201-369)||(6224198-6224366)
chr5 (199-382)||(36568544-36568725)
chr5 (206-357)||(11416977-11417128)
chr5 (200-357)||(299490-299647)
chr5 (209-353)||(34753029-34753173)
chr5 (199-357)||(12662652-12662810)
chr5 (166-383)||(24489181-24489394)
chr5 (201-350)||(26075168-26075318)
chr5 (199-358)||(35150007-35150165)
chr5 (166-331)||(26074807-26074975)
chr5 (191-357)||(623810-623976)
chr5 (225-370)||(15370428-15370573)
chr5 (211-353)||(33747783-33747925)
chr5 (196-334)||(29549278-29549416)
chr5 (191-337)||(5723811-5723957)
chr5 (167-349)||(38427525-38427697)
chr5 (199-349)||(26590918-26591068)
chr5 (201-355)||(300961-301107)
chr5 (166-331)||(36521922-36522086)
chr5 (201-357)||(35167838-35167994)
chr5 (202-368)||(2411010-2411176)
chr5 (10-145)||(9498496-9498629)
chr5 (202-383)||(35914852-35915031)
chr5 (166-317)||(36522277-36522427)
chr5 (191-274)||(7768842-7768925)
chr5 (166-317)||(31509589-31509742)
chr5 (285-367)||(26900007-26900089)
chr5 (201-294)||(42508614-42508707)
chr5 (201-279)||(26074320-26074398)
chr5 (202-336)||(41635212-41635346)
chr5 (9-94)||(32487576-32487661)
chr5 (201-356)||(13786002-13786157)
chr5 (213-324)||(31509745-31509857)
chr5 (266-317)||(13042606-13042657)
chr5 (286-357)||(38427306-38427377)
chr5 (201-280)||(39309686-39309764)
chr5 (257-358)||(13785631-13785732)
chr5 (283-335)||(795254-795306)
chr5 (270-337)||(9498343-9498410)
chr5 (256-335)||(36527117-36527196)
chr5 (201-294)||(42524719-42524811)
chr5 (257-317)||(32445943-32446003)
chr5 (266-313)||(13112604-13112651)
chr5 (171-234)||(13785732-13785794)
chr5 (202-259)||(6225047-6225104)
chr5 (191-239)||(5660290-5660338)
chr5 (236-324)||(19275566-19275653)
chr5 (2-83)||(26075058-26075140)
chr5 (279-317)||(13042784-13042822)
chr5 (279-317)||(13112782-13112820)
chr5 (199-241)||(35150747-35150789)
chr5 (199-241)||(35151038-35151080)
chr5 (257-355)||(42435486-42435583)
chr5 (85-138)||(795196-795249)
chr5 (301-353)||(24489583-24489635)
chr5 (167-211)||(15370380-15370426)
chr5 (266-317)||(36389016-36389067)
chr5 (2-37)||(38427396-38427431)
chr5 (281-311)||(5963765-5963795)
chr5 (253-331)||(9510546-9510624)
chr5 (1-88)||(13416036-13416124)
chr5 (191-248)||(22298956-22299014)
chr5 (1-88)||(26074403-26074492)
chr5 (297-333)||(795152-795189)
chr5 (289-353)||(5660340-5660405)
chr5 (270-311)||(34103625-34103666)
chr5 (304-357)||(35150810-35150863)
chr5 (1-57)||(299666-299721)
chr5 (1-57)||(25328111-25328167)
chr5 (267-311)||(41341523-41341567)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (2-357)||(5542625-5542980)
chr2 (1-350)||(14745300-14745649)
chr2 (167-355)||(37106156-37106344)
chr2 (1-356)||(29676703-29677065)
chr2 (190-357)||(36178605-36178772)
chr2 (191-381)||(41283451-41283641)
chr2 (191-357)||(14745667-14745833)
chr2 (195-357)||(37105920-37106082)
chr2 (189-353)||(5543002-5543166)
chr2 (171-351)||(15880233-15880415)
chr2 (127-306)||(36178320-36178498)
chr2 (201-357)||(6421387-6421543)
chr2 (199-354)||(962598-962753)
chr2 (167-354)||(40679632-40679818)
chr2 (199-357)||(42514649-42514807)
chr2 (166-357)||(6422084-6422268)
chr2 (167-367)||(7598577-7598769)
chr2 (206-357)||(15511495-15511646)
chr2 (199-357)||(35580724-35580881)
chr2 (166-355)||(28531316-28531504)
chr2 (217-382)||(36178147-36178311)
chr2 (201-357)||(6712978-6713135)
chr2 (201-350)||(36005887-36006035)
chr2 (204-383)||(33731653-33731833)
chr2 (199-356)||(38796619-38796778)
chr2 (166-357)||(40733482-40733675)
chr2 (199-384)||(37632572-37632755)
chr2 (166-357)||(40733848-40734040)
chr2 (191-347)||(1769884-1770040)
chr2 (203-338)||(28254258-28254391)
chr2 (212-382)||(23346250-23346418)
chr2 (210-367)||(40163362-40163520)
chr2 (119-382)||(3673003-3673250)
chr2 (199-358)||(7598228-7598387)
chr2 (201-343)||(5367457-5367599)
chr2 (179-307)||(31468800-31468926)
chr2 (167-277)||(38796298-38796410)
chr2 (261-380)||(6421793-6421911)
chr2 (199-306)||(16542449-16542556)
chr2 (207-357)||(29676543-29676687)
chr2 (199-382)||(16590888-16591066)
chr2 (199-347)||(12529038-12529186)
chr2 (169-357)||(30313147-30313335)
chr2 (136-256)||(36785664-36785786)
chr2 (166-316)||(30323430-30323581)
chr2 (202-287)||(31899496-31899581)
chr2 (166-317)||(33561491-33561641)
chr2 (166-369)||(29873525-29873729)
chr2 (271-380)||(3672773-3672882)
chr2 (201-357)||(29874023-29874179)
chr2 (207-311)||(37895107-37895211)
chr2 (202-315)||(31259658-31259774)
chr2 (167-317)||(37894732-37894881)
chr2 (261-353)||(6421688-6421780)
chr2 (252-344)||(36784273-36784365)
chr2 (180-307)||(33953821-33953947)
chr2 (166-306)||(41678419-41678559)
chr2 (202-357)||(9231252-9231407)
chr2 (200-330)||(31385738-31385868)
chr2 (215-304)||(28254165-28254254)
chr2 (167-261)||(42514981-42515078)
chr2 (289-384)||(31899077-31899170)
chr2 (202-355)||(3594180-3594333)
chr2 (263-353)||(35580443-35580534)
chr2 (202-306)||(12910231-12910335)
chr2 (1-76)||(36178513-36178589)
chr2 (1-49)||(37106099-37106147)
chr2 (201-247)||(6421306-6421352)
chr2 (199-340)||(33954279-33954419)
chr2 (241-317)||(30312831-30312907)
chr2 (253-312)||(25390313-25390372)
chr2 (266-317)||(28226404-28226455)
chr2 (241-298)||(2336666-2336723)
chr2 (1-88)||(7598403-7598491)
chr2 (269-317)||(8904498-8904546)
chr2 (270-317)||(28226726-28226772)
chr2 (303-381)||(2109988-2110066)
chr2 (5-88)||(40734063-40734147)
chr2 (166-221)||(40734243-40734300)
chr2 (266-315)||(13792536-13792585)
chr2 (199-235)||(3672719-3672755)
chr2 (9-37)||(35580671-35580699)
chr2 (1-37)||(36785893-36785928)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (1-357)||(37533011-37533347)
chr7 (12-354)||(14681323-14681663)
chr7 (1-318)||(22566702-22567021)
chr7 (199-381)||(1085593-1085774)
chr7 (112-328)||(7553937-7554154)
chr7 (199-381)||(7517580-7517762)
chr7 (167-357)||(30244236-30244428)
chr7 (193-381)||(29157559-29157747)
chr7 (199-357)||(23377-23535)
chr7 (191-357)||(37533364-37533530)
chr7 (167-357)||(30245043-30245231)
chr7 (206-357)||(11845198-11845349)
chr7 (201-357)||(6054562-6054718)
chr7 (201-369)||(45433243-45433411)
chr7 (199-357)||(40094774-40094932)
chr7 (199-379)||(22567017-22567196)
chr7 (199-349)||(36939741-36939891)
chr7 (112-357)||(45434548-45434794)
chr7 (201-346)||(45754718-45754862)
chr7 (207-347)||(19122740-19122879)
chr7 (199-357)||(24177435-24177593)
chr7 (205-355)||(34218036-34218186)
chr7 (199-382)||(118276-118459)
chr7 (201-370)||(47129097-47129265)
chr7 (199-381)||(8128417-8128599)
chr7 (199-380)||(36622960-36623140)
chr7 (204-357)||(30032572-30032725)
chr7 (202-355)||(9901648-9901799)
chr7 (199-319)||(16569196-16569316)
chr7 (199-319)||(16596346-16596466)
chr7 (199-353)||(40230295-40230449)
chr7 (172-325)||(1085280-1085436)
chr7 (202-334)||(24838724-24838857)
chr7 (202-354)||(20599317-20599471)
chr7 (199-348)||(36534795-36534942)
chr7 (199-357)||(41854635-41854792)
chr7 (220-355)||(37167808-37167937)
chr7 (241-357)||(30253534-30253646)
chr7 (245-382)||(28300228-28300366)
chr7 (167-269)||(30244667-30244771)
chr7 (170-272)||(30255308-30255412)
chr7 (202-351)||(41910592-41910749)
chr7 (199-320)||(43241495-43241616)
chr7 (280-381)||(47129450-47129549)
chr7 (170-272)||(30245463-30245567)
chr7 (199-287)||(28301613-28301701)
chr7 (282-356)||(28300569-28300644)
chr7 (1-97)||(37532897-37532994)
chr7 (199-267)||(36109007-36109075)
chr7 (287-355)||(37532753-37532821)
chr7 (300-382)||(30244453-30244534)
chr7 (300-382)||(30253671-30253752)
chr7 (204-304)||(44361517-44361616)
chr7 (121-196)||(37532822-37532896)
chr7 (150-317)||(37345868-37346036)
chr7 (167-249)||(40094502-40094583)
chr7 (266-317)||(21416181-21416232)
chr7 (309-382)||(7517767-7517840)
chr7 (309-382)||(7518033-7518106)
chr7 (300-381)||(30245256-30245336)
chr7 (268-316)||(23569043-23569091)
chr7 (199-317)||(4124128-4124246)
chr7 (193-236)||(14681281-14681324)
chr7 (267-346)||(40094424-40094503)
chr7 (282-344)||(45755010-45755072)
chr7 (266-311)||(21619091-21619136)
chr7 (59-107)||(45697753-45697801)
chr7 (254-357)||(37393114-37393216)
chr7 (201-251)||(36967335-36967385)
chr7 (4-86)||(40094664-40094747)
chr7 (1-57)||(1085543-1085599)
chr7 (241-357)||(15902342-15902457)
chr7 (267-311)||(27391815-27391859)
chr7 (2-88)||(28300473-28300559)
chr7 (11-91)||(45433424-45433505)
chr7 (294-348)||(4719305-4719359)
chr7 (335-381)||(7517982-7518028)
chr7 (1-37)||(8128387-8128423)
chr7 (266-306)||(27598052-27598092)
chr7 (26-87)||(48243356-48243419)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-319)||(5158-5477)
scaffold0078 (199-350)||(4982-5133)
[»] chr4 (115 HSPs)
chr4 (12-357)||(18932747-18933102)
chr4 (166-380)||(36629205-36629418)
chr4 (189-379)||(50630731-50630921)
chr4 (199-381)||(25483336-25483517)
chr4 (191-357)||(41370349-41370515)
chr4 (191-366)||(55933113-55933288)
chr4 (136-370)||(44620595-44620830)
chr4 (199-381)||(10245920-10246101)
chr4 (199-382)||(54017568-54017751)
chr4 (136-356)||(39404334-39404555)
chr4 (171-347)||(54108888-54109060)
chr4 (168-381)||(22027936-22028150)
chr4 (199-381)||(3340807-3340988)
chr4 (199-356)||(1731646-1731803)
chr4 (201-370)||(39792845-39793014)
chr4 (196-357)||(50002423-50002584)
chr4 (199-369)||(36608647-36608817)
chr4 (199-347)||(52884695-52884844)
chr4 (169-347)||(52884856-52885038)
chr4 (201-381)||(39404020-39404200)
chr4 (201-356)||(34646648-34646803)
chr4 (199-381)||(22028342-22028527)
chr4 (191-337)||(49880152-49880297)
chr4 (202-356)||(50459724-50459878)
chr4 (209-357)||(54343006-54343147)
chr4 (208-357)||(44620362-44620511)
chr4 (201-357)||(36572021-36572177)
chr4 (199-366)||(22183253-22183420)
chr4 (199-340)||(4955332-4955473)
chr4 (167-352)||(20826186-20826370)
chr4 (208-357)||(44621011-44621160)
chr4 (199-358)||(49076828-49076986)
chr4 (218-357)||(54936215-54936353)
chr4 (167-383)||(3244424-3244638)
chr4 (205-381)||(20825842-20826018)
chr4 (112-308)||(2740984-2741180)
chr4 (200-367)||(16888804-16888971)
chr4 (199-350)||(32941128-32941279)
chr4 (162-357)||(49076449-49076643)
chr4 (202-358)||(49302907-49303065)
chr4 (156-382)||(3341083-3341310)
chr4 (198-357)||(54108537-54108694)
chr4 (199-370)||(2740700-2740869)
chr4 (200-356)||(16889535-16889691)
chr4 (214-328)||(45496820-45496934)
chr4 (199-354)||(4390102-4390257)
chr4 (175-370)||(43174480-43174677)
chr4 (167-356)||(45489331-45489522)
chr4 (253-357)||(23817679-23817783)
chr4 (1-131)||(41370532-41370662)
chr4 (201-317)||(41707503-41707618)
chr4 (191-322)||(6975489-6975620)
chr4 (199-354)||(34004586-34004739)
chr4 (199-381)||(54741154-54741334)
chr4 (201-345)||(19504707-19504842)
chr4 (199-354)||(51768061-51768216)
chr4 (199-354)||(3700365-3700512)
chr4 (245-355)||(18879852-18879962)
chr4 (239-357)||(43827480-43827597)
chr4 (250-351)||(31691203-31691306)
chr4 (136-265)||(44621361-44621492)
chr4 (212-307)||(54017750-54017845)
chr4 (201-336)||(40067045-40067181)
chr4 (199-357)||(28034229-28034387)
chr4 (79-288)||(10246240-10246436)
chr4 (220-357)||(48111696-48111833)
chr4 (221-357)||(3271806-3271947)
chr4 (204-368)||(760194-760356)
chr4 (241-340)||(15841383-15841482)
chr4 (1-142)||(10246095-10246237)
chr4 (191-251)||(50788087-50788147)
chr4 (207-265)||(44620304-44620362)
chr4 (199-331)||(23556890-23557022)
chr4 (205-357)||(45489712-45489864)
chr4 (291-357)||(43174233-43174299)
chr4 (1-101)||(3340982-3341083)
chr4 (1-77)||(45496726-45496803)
chr4 (266-317)||(11197293-11197344)
chr4 (202-317)||(34544107-34544225)
chr4 (224-355)||(39698944-39699077)
chr4 (183-265)||(44620926-44621011)
chr4 (3-87)||(2740868-2740953)
chr4 (262-381)||(11783528-11783646)
chr4 (170-236)||(41370673-41370738)
chr4 (279-353)||(41370738-41370812)
chr4 (2-88)||(20826013-20826101)
chr4 (312-381)||(23817431-23817498)
chr4 (199-287)||(11348396-11348484)
chr4 (205-317)||(15841023-15841134)
chr4 (136-195)||(16889315-16889375)
chr4 (266-317)||(10396198-10396249)
chr4 (266-317)||(10396483-10396534)
chr4 (266-318)||(922485-922537)
chr4 (2-91)||(44621175-44621266)
chr4 (267-306)||(1868119-1868158)
chr4 (309-348)||(19895406-19895445)
chr4 (257-315)||(11706584-11706641)
chr4 (265-311)||(51681604-51681650)
chr4 (313-370)||(11702284-11702341)
chr4 (253-313)||(2891864-2891924)
chr4 (2-91)||(23817569-23817659)
chr4 (199-247)||(45050601-45050649)
chr4 (277-353)||(50787996-50788072)
chr4 (266-317)||(11197003-11197054)
chr4 (191-222)||(18933103-18933134)
chr4 (254-297)||(45484774-45484817)
chr4 (243-317)||(31249896-31249970)
chr4 (275-317)||(41707279-41707321)
chr4 (327-381)||(45496678-45496732)
chr4 (199-240)||(11706636-11706677)
chr4 (310-347)||(19895533-19895570)
chr4 (262-295)||(29802604-29802637)
chr4 (327-367)||(1731581-1731621)
chr4 (1-37)||(19895470-19895506)
chr4 (281-317)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (1-357)||(147-497)
scaffold0702 (201-357)||(514-670)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (8-381)||(1083-1465)
scaffold0391 (246-317)||(1731-1802)
scaffold0391 (166-250)||(3092-3178)
scaffold0391 (1-71)||(1595-1666)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (112-348)||(5689-5931)
scaffold0734 (199-348)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (167-315)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (199-357)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (201-276)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (201-331)||(39459-39588)
scaffold0113 (166-324)||(39805-39963)
scaffold0113 (1-37)||(39629-39665)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (193-277)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (237-277)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 3409462 - 3409818
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3409462 cccaatagtggtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggtcgttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggct 3409561  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 200  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409562 ccttgtgcagggatggcaatacaggcaaagtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 3409661  T
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  3409662 caagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaa 3409761  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409762 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 2377929 - 2378284
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2377929 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggct 2378028  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2378029 ccttgtgcaggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggttt 2378126  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2378127 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggta 2378226  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378227 agaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 357
Target Start/End: Original strand, 29518857 - 29519078
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 235  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518857 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 29518956  T
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29518957 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 29519056  T
Q  336 agcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29519057 agcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10074336 - 10073989
Alignment:
Q  11 gtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgtgca 10074237  T
Q  110 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 208  Q
      |||||||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  10074236 acaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtg 10074140  T
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10074139 agttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtgg 10074040  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 359  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074039 tgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2578634 - 2578419
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578634 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 2578536  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  2578535 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagccc 2578436  T
Q  365 ccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2578435 ccctca-tgacccaacaa 2578419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 381
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210384
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaaca 35210384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 166 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10074553 - 10074352
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074553 tgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10074455  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10074454 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcc 10074355  T
Q  366 cct 368  Q
    |||    
T  10074354 cct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058410
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || |||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaacaa 3058410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 166 - 370
Target Start/End: Original strand, 16454872 - 16455078
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16454872 tgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaat 16454971  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16454972 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagct 16455071  T
Q  364 cccctca 370  Q
    |||||||    
T  16455072 cccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 368
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  290 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579860
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca 2579860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  192 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 291  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  292 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2579678 - 2579478
Alignment:
Q  170 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  2579678 ggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcc 2579580  T
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  2579579 cataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctc 2579480  T
Q  370 ac 371  Q
    ||    
T  2579479 ac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578822
Alignment:
Q  174 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  274 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127543
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||  ||||| |||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctcgatgaccaaacaa 1127543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454733
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 205 - 357
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  304 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2579297 - 2579087
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |    
T  2579297 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----a 2579202  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 364  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  2579201 ggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctc 2579103  T
Q  365 ccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||| ||||||||||    
T  2579102 ccctca-tgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10073804 - 10073604
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073804 tgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10073708  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 365  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  10073707 gatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcc 10073608  T
Q  366 cctc 369  Q
    ||||    
T  10073607 cctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 201 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 356
Target Start/End: Original strand, 16107998 - 16108208
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16107998 agcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaa 16108097  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 333  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16108098 agagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgtt 16108185  T
Q  334 ctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  16108186 ataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 202 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  299 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 342  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  304 tgtg 307  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 353
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgt 324  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071678
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca 12071678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 318
Target Start/End: Original strand, 8481893 - 8482045
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||    
T  8481893 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 318  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  194 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Original strand, 6071098 - 6071264
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  6071098 tgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 6071196  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071197 atgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 380
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 380  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 29518678 - 29518784
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29518678 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggc 29518777  T
Q  100 tccttgt 106  Q
    |||||||    
T  29518778 tccttgt 29518784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 272
Target Start/End: Original strand, 35210456 - 35210551
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35210456 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagag 35210544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2579473 - 2579387
Alignment:
Q  3 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2579473 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Original strand, 2975521 - 2975668
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2975521 gatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 315  Q
     |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975618 tgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Original strand, 33605913 - 33606034
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 235  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33605913 agcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaa 33606011  T
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataa 258  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606012 agtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16107855 - 16107943
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16107855 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa 16107943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 26544224 - 26544321
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtgg 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  26544224 cccaacactggtattagagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccggtatttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2578816 - 2578730
Alignment:
Q  3 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2578816 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618606
Alignment:
Q  206 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 305  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  306 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc 30618606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 2579856 - 2579805
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2579856 cccaacagtggtatcagagccccggttccacgaagggtacgaccgaggcagc 2579805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 350
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 318  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 2579093 - 2579042
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 52  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2579093 cccaacagtgatatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 2579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 16454750 - 16454797
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgagg 48  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16454750 cccaacagtggtatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccgagg 16454797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 35210378 - 35210442
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgca 65  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||||||    
T  35210378 cccaacagtggtatcaaagcctcggttcgacgaagggtacgaccgaagtagccggtcgttgcgca 35210442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  275 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975352
Alignment:
Q  324 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaaca 2975352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10073974 - 10073918
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  10073974 cccaacaatggtatcagatccccggttcaacgaaaggtacgaccgaggcagccggtc 10073918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 381
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210601
Alignment:
Q  333 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 35210601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 22304370 - 22304747
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  22304370 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggc 22304469  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304470 tccttgttcaggaacgacgatacaagcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtt 22304568  T
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22304569 tgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggt 22304668  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304669 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 59 - 340
Target Start/End: Original strand, 4823515 - 4823796
Alignment:
Q  59 ttgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagca 157  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4823515 ttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaatggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggagca 4823613  T
Q  158 cgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4823614 cgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttata 4823713  T
Q  258 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823714 agtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41360116 - 41359765
Alignment:
Q  4 aacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag--caagtggctc 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||  ||||||||||    
T  41360116 aacagtggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccg--gcagccggtcgttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctc 41360019  T
Q  102 cttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||||||||||  ||     
T  41360018 cttgtgcaagaacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtg 41359920  T
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37990884 - 37990614
Alignment:
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtga 209  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  37990884 aacggcgatacatgcaaagt-aaaagcttccgct-tgaggggggcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtga 37990787  T
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990786 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 37990687  T
Q  310 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||    
T  37990686 gtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaacaa 37990614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 351
Target Start/End: Original strand, 15773099 - 15773346
Alignment:
Q  107 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 204  Q
    |||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15773099 gcagcaacagcgatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaag 15773197  T
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15773198 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagt 15773297  T
Q  305 gtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773298 gtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54018008 - 54017793
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018008 gatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54017909  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 364  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  54017908 ggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctc 54017809  T
Q  365 ccctcactgacccaaca 381  Q
    ||| || ||||||||||    
T  54017808 ccc-cagtgacccaaca 54017793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 356
Target Start/End: Original strand, 11661846 - 11662108
Alignment:
Q  96 tggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11661846 tggctccttgtgcagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttg 11661945  T
Q  196 --gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-tt 292  Q
      || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11661946 ttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggttt 11662045  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662046 ttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990967
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccc 37990967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 201 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773035
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaaca 15773035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342364
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaaca 42342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29644791 - 29644557
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 246  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29644791 ggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttg 29644692  T
Q  247 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  29644691 aacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgt 29644592  T
Q  347 ggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||| ||||||| |  ||||||||  |||||||||||    
T  29644591 ggatggtcccccaaactcccctc-gtgacccaacaa 29644557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42342283 - 42342092
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  42342283 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaag 42342184  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342183 aggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 287  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  288 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21832532 - 21832345
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832532 gatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 21832434  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832433 actcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22304141 - 22303963
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  22304141 tgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaag 22304049  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304048 cggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 201 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634833
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccc 52634833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32462752 - 32462558
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32462752 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaa 32462653  T
Q  263 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462652 gatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  286 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634288
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaaa 384  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaacaaaa 1634288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  137 gcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 235  Q
    |||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 9240118 - 9240300
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9240118 gatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagg 9240216  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240217 acccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 358
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 359  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22303934 - 22303759
Alignment:
Q  4 aacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  22303934 aacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttc 22303835  T
Q  103 ttgtgcaggaacggcgatacaggc-aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 178  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22303834 ttgtgcagcaacggcgattcaggcaaaagtaaaaagcttccgct-ttaggggaacacgttgaattgatggactcaca 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Original strand, 22304213 - 22304301
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304213 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  301 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303631
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  356 cctaggctcccctcactgacccaacaaaa 384  Q
    |||||  || |||||||||| ||||||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaacaaaa 22303631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 358
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  298 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  180 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 279  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  280 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  273 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 372  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  373 gacccaaca 381  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  188 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 287  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  288 aggttttgggtaagagtgt 306  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  225 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 369  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017548
Alignment:
Q  269 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcccc 54017548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  301 gagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304376
Alignment:
Q  308 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaaca 22304376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  302 agtgtg 307  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 255
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 327  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  341 cgatgt 346  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 309
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  249 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  301 gagtgtggtgtctctct 317  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 53577540 - 53577616
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  53577540 cccaacagtggtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978839
Alignment:
Q  279 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactga 374  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||| | | |||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccctttagtga 43978848  T
Q  375 cccaacaaa 383  Q
    |||||||||    
T  43978847 cccaacaaa 43978839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 15773029 - 15773117
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15773029 cccaacagtggtatcagagccctgattcgacgaagggtacgatcgaggccgccggtcagttatgcagaaagcagcaacagcgatacaag 15773117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 54018178 - 54018093
Alignment:
Q  4 aacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  54018178 aacagtggcatcagagctccggttcaacgaagggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaatggcggtacaa 54018093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 53577659 - 53577716
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca 58  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||    
T  53577659 cccaacagtggtatcagagtcccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtca 53577716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 370
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239984
Alignment:
Q  326 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 9239984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 33803234 - 33803184
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 52  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33803234 ccaacagtggtatcagagcctcgattcgacgaagggtacgactgaggcagc 33803184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 2299937 - 2300000
Alignment:
Q  161 taaagtgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299937 taaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 311
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  262 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 3669862 - 3670229
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  3669862 cccaacggtggtatcagagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggct 3669961  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3669962 ccttgtgcaggaacggcgatacatgcaaagt-aagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggttt 3670060  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3670061 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggta 3670160  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670161 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1014225 - 1013879
Alignment:
Q  3 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1014225 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctcc 1014126  T
Q  103 ttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgc 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014125 ttgtgcaggaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgc 1014027  T
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  1014026 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaag 1013927  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013926 agtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 9309156 - 9309512
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  9309156 cccaaaagtggtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggc 9309255  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gt 197  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||    |||| |||| |||| | |    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  9309256 tccttgtgcagcaacagtgatacaaagcaagtaaaaaacttctgttgg--ggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgt 9309353  T
Q  198 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||    
T  9309354 gtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcggg 9309453  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309454 taagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  290 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441255
Alignment:
Q  189 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  285 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 201 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 34835185 - 34835377
Alignment:
Q  177 cacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 274  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835185 cacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 34835284  T
Q  275 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835285 actcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Original strand, 34835439 - 34835643
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835439 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835538  T
Q  263 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835539 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835638  T
Q  363 tcccc 367  Q
    |||||    
T  34835639 tcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Original strand, 34835705 - 34835909
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835705 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835804  T
Q  263 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835805 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835904  T
Q  363 tcccc 367  Q
    |||||    
T  34835905 tcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Original strand, 40518550 - 40518738
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518550 tgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag 40518648  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518649 gacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 201 - 349
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870549
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  289 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaacaa 20870549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45121881 - 45121663
Alignment:
Q  133 aaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggat 230  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45121881 aaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggat 45121783  T
Q  231 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 330  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  45121782 aaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggtt 45121683  T
Q  331 gttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45121682 gttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8918956 - 8918764
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918956 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 8918857  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918856 ggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 353
Target Start/End: Original strand, 30359558 - 30359763
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 247  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30359558 ggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttga 30359657  T
Q  248 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30359658 acaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtg 30359757  T
Q  348 gacggt 353  Q
    ||||||    
T  30359758 gacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 357
Target Start/End: Original strand, 45122604 - 45122782
Alignment:
Q  172 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122604 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 45122696  T
Q  272 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122697 taaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359454
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaaca 30359454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 359
Target Start/End: Original strand, 6731872 - 6732055
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||     
T  6731872 gatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagaga 6731962  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 359  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731963 acccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9482784 - 9482608
Alignment:
Q  177 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 276  Q
    ||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482784 cacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 9482685  T
Q  277 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482684 ccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 360  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Original strand, 45122972 - 45123164
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  45122972 gatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaaga 45123069  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123070 tgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 357
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 224 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  224 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  324 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  206 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  306 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18371863 - 18371665
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 249  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371863 ggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18371764  T
Q  250 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18371763 a----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 292  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 355
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18372463 - 18372342
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372463 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372364  T
Q  250 accttataagtaagaggaccca 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18372363 accttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 347
Target Start/End: Original strand, 147794 - 147968
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         
T  147794 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa----- 147888  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147889 ----cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 357
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  170 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 269  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  297 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18372905 - 18372785
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372905 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372807  T
Q  250 accttataagtaagaggaccca 271  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18372806 accttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18373139 - 18372988
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373139 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaa 18373040  T
Q  249 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373039 caccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 357
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 336
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  222 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 321  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  322 tgtgtggttgttcta 336  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18372574 - 18372485
Alignment:
Q  154 agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372574 agcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 277  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  302 agtgtggtgtc 312  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4154472 - 4154270
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4154472 tgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 363  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || ||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagact 4154275  T
Q  364 cccct 368  Q
    |||||    
T  4154274 cccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  277 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  301 gagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  274 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  301 gagtgtg 307  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 446
Target Start/End: Original strand, 45324454 - 45324519
Alignment:
Q  381 aaaatgtatttctctcttgaaaattccaccatgattcagtcatttatttcataatctttggttcgt 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45324454 aaaatgtatttctcccttgaaaattccaccatgattcagtcatttatttcataatctttggttcgt 45324519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 289  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 331
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  276 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 366
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 366  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 147626 - 147715
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  147626 cccaacagtgatatcagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaag 147715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 337
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  280 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037944
Alignment:
Q  310 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaaca 3037944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  235 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43274776 - 43274699
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274776 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 34835050 - 34835105
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34835050 cccaacagtggtatcagagccc-ggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 34835105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  253 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 9608932 - 9609017
Alignment:
Q  5 acagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||   ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9608932 acagtggtatcagtgccccggttcgacaaagggtacgaccgaggaaaccggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggtacaag 9609017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30359448 - 30359501
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30359448 cccaacagtggtatcagag--cctgttcgacgaaggga-cgaccgaggcagccggtc 30359501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44290806 - 44290434
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||        |||||    
T  44290806 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacggtggtacaa--------tggct 44290715  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290714 ccttgtgcaggaacgacgatacaggcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggttt 44290616  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290615 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 44290516  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  44290515 agagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacaa 44290434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48588843 - 48588465
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 101  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  48588843 ccaacaatgatatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtcattgtgcagaaagctgcaacgacggtacaagcagcaagtggctc 48588744  T
Q  102 cttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588743 cttgtgcaggaacgacgatacatgcaaaat-aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 48588645  T
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48588644 caagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaa 48588545  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  48588544 gagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaa 48588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26661881 - 26661522
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    ||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||    
T  26661881 cccaaaagtggtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggc 26661782  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt 198  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  26661781 tccttgtgcagcaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttg 26661683  T
Q  199 tg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 296  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26661682 tgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgg 26661583  T
Q  297 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661582 gtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 189 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290800
Alignment:
Q  189 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  289 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaaca 44290800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3537496 - 3537226
Alignment:
Q  7 agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtg--gctcct 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||     |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  3537496 agtggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggcagttagtc-----gcagaaagcaagcaacggcggtacaagcagcaagtgtggctcct 3537402  T
Q  104 tgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca 202  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537401 tgtgcaggaacgacgatacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca 3537302  T
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537301 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 368
Target Start/End: Original strand, 41157311 - 41157545
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157311 agcttccgctctg-ggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 41157409  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 333  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157410 agagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgtt 41157509  T
Q  334 ctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157510 ctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 37556071 - 37556260
Alignment:
Q  161 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37556071 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata 37556170  T
Q  258 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556171 agtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  299 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 358
Target Start/End: Original strand, 34364891 - 34365084
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364891 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaga 34364990  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34364991 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50052007 - 50051777
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  50052007 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtggttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggct 50051908  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||  || |||||||| | | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50051907 ccttgtgcaggaacggcgatactggcaaagt-aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggttt 50051809  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051808 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157176
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaacaa 41157176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22077683 - 22077484
Alignment:
Q  168 atggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077683 atggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 22077585  T
Q  268 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22077584 cccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccc 22077485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 353
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 357
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  172 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 201 - 354
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493951
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  285 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaaca 45493951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364688
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaaca 34364688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 207 - 357
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  207 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  307 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 382
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082589
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |   ||||||| || |||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctccccccagtgacccaacaa 40082589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052024
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccc 50052024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168673
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaacaa 32168673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 203 - 369
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956079
Alignment:
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc 9956079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  196 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 348
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22077311 - 22077101
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacacctt 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||    
T  22077311 gatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaatacctt 22077213  T
Q  255 ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077212 ataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 22077113  T
Q  355 ccctaggctccc 366  Q
    ||| ||||||||    
T  22077112 ccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 66278 - 66100
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66278 gatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaaga 66180  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 346  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66179 ggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 381
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30630828 - 30630648
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30630828 tgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagag 30630730  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630729 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  290 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 380  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  381 a 381  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  284 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
     |||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 383
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839815
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccctcactgacccaacaaa 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgt-gatagtccctcttggctcccctcaataacccaacaaa 45839815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 48588468 - 48588340
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 101  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  48588468 ccaaaagtggtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctc 48588369  T
Q  102 cttgtgcaggaacggcgatacaggcaaag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588368 cttgtgcaggaacggcgatacaggcaaag 48588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 357
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378036
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaaca 21378036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 370  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051664
Alignment:
Q  269 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtccccctagctcccct 50051678  T
Q  369 cactgacccaacaaa 383  Q
    |  ||||||||||||    
T  50051677 c-gtgacccaacaaa 50051664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187336
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacaaaa 384  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca-ttacccaacaaaa 1187336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380142
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  370 actgacccaacaa 382  Q
    | |||||||||||    
T  47380154 attgacccaacaa 47380142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 356
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  214 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 313  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  314 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469180
Alignment:
Q  181 tgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 258  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  226 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 323  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  324 tgtggttgttctagcctcgatgt 346  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47379990 - 47379891
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 249  Q
    |||||||||| | || || |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  47379990 ggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttgat--gcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaac 47379893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 34364682 - 34364774
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34364682 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 34364774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Original strand, 24448245 - 24448426
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  24448245 tgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagag 24448343  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    | | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  24448344 ggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 11977128 - 11977224
Alignment:
Q  7 agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcct 103  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11977128 agtggcatcagagccc-ggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  248 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 293  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 66455 - 66399
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  66455 cccaacagtgatatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 66399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 359  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 31767144 - 31767094
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 52  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  31767144 cccaacagtggtatcagagcccc-gttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 31767094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 34649614 - 34649702
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  34649614 cccaacagtggtatcagagcccc-gttcgatgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaag 34649702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 9956084 - 9956129
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccga 46  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  9956084 cccaacagtggtatcagagcctcggttcgacgaagggtacgaccga 9956129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 37555903 - 37555990
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   || ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  37555903 cccaacagtggtatcagagcccc-attcggcgaagggtatgatcgaggcagctggtccgattgcgcaaaaagcagcaacggcggtacaa 37555990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 356
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  240 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 339  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  340 tcgatgtggacggtccc 356  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22077478 - 22077422
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  22077478 cccaacagtggcatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccaaggcagccggtc 22077422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  208 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 267  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  272 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 318  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 30630620 - 30630586
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaag 35  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30630620 cccaacagtggtatcagagtcccggttcgacgaag 30630586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 369
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  292 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 381
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  339 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3537587 - 3537495
Alignment:
Q  93 aagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| || || ||||||||||  || |||||||| | | |  |||||||||||||||||||    
T  3537587 aagtggctccttgtgcaagaacgacgacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 22077812 - 22077776
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22077812 cccaacagtggcatcagagcccaggttcgacgaaggg 22077776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41184246 - 41184198
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 184  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41184246 agcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 335  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6500626 - 6501002
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6500626 cccaacagtggtatcagagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggct 6500725  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    |||| || ||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6500726 ccttatgtaggaacgccgatacag-caaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggttt 6500823  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6500824 gcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggata 6500922  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6500923 agagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaa 6501002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 191 - 381
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500632
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaaca 6500632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3295266 - 3295002
Alignment:
Q  107 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgca 202  Q
    |||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  3295266 gcagcaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgca 3295169  T
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3295168 agtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatga 3295070  T
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295069 gtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296291
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaacaa 40296291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 191 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502011
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaa 383  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaacaaa 27502011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 136 - 353
Target Start/End: Original strand, 624134 - 624350
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 235  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  624134 agcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaat 624232  T
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  624233 agtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttct 624332  T
Q  336 agcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  624333 agcctcgatgtggacggt 624350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  192 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 291  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  292 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 196 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  196 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13415951 - 13415734
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415951 gatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 13415853  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||    
T  13415852 ggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctc 13415754  T
Q  365 ccctcactgacccaacaaaat 385  Q
    ||||   ||||||||||||||    
T  13415753 ccct-ggtgacccaacaaaat 13415734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074122
Alignment:
Q  172 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  272 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctc 26074132  T
Q  372 tgacccaaca 381  Q
    ||||||||||    
T  26074131 tgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 379
Target Start/End: Original strand, 26074577 - 26074792
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | |||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagct 26074776  T
Q  364 cccctcactgacccaa 379  Q
    |||||| |||||||||    
T  26074777 cccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 381
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328117
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaaca 25328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405570
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaaat 385  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaacaaaat 42405570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  290 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028493
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaaca 1028493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568544
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaacaa 36568544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  206 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  306 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 357
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 209 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24489394 - 24489181
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  24489394 tgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga- 24489297  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 365  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||    
T  24489296 -acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcc 24489198  T
Q  366 cctcactgacccaacaaa 383  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  24489197 cctc-gtgacccaacaaa 24489181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 201 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 299  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26074975 - 26074807
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26074975 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtagg 26074876  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074875 aggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  225 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 324  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  325 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 353
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  211 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  311 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  196 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 334  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 337  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 349
Target Start/End: Original strand, 38427525 - 38427697
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38427525 gatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagg 38427614  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427615 acccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 355
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36522086 - 36521922
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||||    
T  36522086 tgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagag 36521988  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521987 gacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 368
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9498629 - 9498496
Alignment:
Q  10 ggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9498629 ggtatcagagccccg-ttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgtgca 9498531  T
Q  110 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgct 145  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9498530 ggaacggtgatacatgcaaagt-aagagcttccgct 9498496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 383
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915031
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaa 383  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtccccca-gctccgctca-tgacccaacaaa 35915031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36522427 - 36522277
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  36522427 tgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagag 36522329  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522328 gaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Original strand, 31509589 - 31509742
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31509589 tgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgag 31509687  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509688 aggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  285 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 294
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 294  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 279
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 336  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 94
Target Start/End: Original strand, 32487576 - 32487661
Alignment:
Q  9 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaa 94  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32487576 tggtatcagagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagccgatcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 324
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  213 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  312 ctctcttgcttgt 324  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 357
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  286 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 280
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  357 ct 358  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  283 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 337  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  256 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 335  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 294
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 294  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 313
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13785794 - 13785732
Alignment:
Q  171 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785794 gactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 259  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  236 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26075140 - 26075058
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggt 83  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26075140 ccaacagtggtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  279 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  279 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 795249 - 795196
Alignment:
Q  85 caagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagc 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  795249 caagcagcaagtggctccttgtgcagcaacggtgatacagacaaagtaaaaagc 795196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 353
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Original strand, 38427396 - 38427431
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427396 ccaacagtggtattagagccccggttcgacgaaggg 38427431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 311
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  253 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13416124 - 13416036
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13416124 cccaacagtggtatcagagtccc-gttcgtcgaagggtacgaccgaggcaaccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaag 13416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 248  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 26074403 - 26074492
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26074403 cccaacaatggcatcagagccccggtttgacaaagggtacgaccgagacagctagtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaag 26074492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  297 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  289 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 353  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 311
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 357
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  304 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 299666 - 299721
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  299666 cccaacagtggtatcagagcctc-gttcgacgaagggtgcgatcaaggcagccggtc 299721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 25328111 - 25328167
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  25328111 cccaacagtggtaccagagccccccttcgacgaagggcacgaacgaggcagccggtc 25328167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5542980 - 5542625
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |   || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  5542980 ccaacagtggtatcagagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctc 5542881  T
Q  102 cttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggga-gcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542880 cttgtgcaggaacagcgatacaggcaaagttaga-gcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 5542782  T
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5542781 caagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaa 5542682  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542681 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14745649 - 14745300
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  14745649 cccaacagtggtatcagagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatcgttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggct 14745550  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14745549 ccttgtgcaggaacggcgatacagacaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggttt 14745452  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745451 gcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 14745352  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745351 agagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 167 - 355
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 29676703 - 29677065
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| || | ||| |||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  29676703 cccaacagtggtatcagagccccggttcaacgaagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggc 29676802  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gt 197  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  29676803 tccttgtgcagcaacggaaatacaagcaa-gtaaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgt 29676901  T
Q  198 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggtt 292  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  29676902 gtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggct 29677001  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677002 ttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  190 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  290 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 191 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283451
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaaca 41283451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 357
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  195 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  295 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  189 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  289 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 351
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  171 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 268  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  269 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36178498 - 36178320
Alignment:
Q  127 aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 226  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36178498 aaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacattaaagtgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttc 36178400  T
Q  227 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178399 ggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421543
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccc 6421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40679818 - 40679632
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40679818 gatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagaga 40679720  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679719 acccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514807
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42514807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 6422084 - 6422268
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6422084 tgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagag 6422176  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422177 gacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 367
Target Start/End: Original strand, 7598577 - 7598769
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598577 gatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 7598676  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 366  Q
    ||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7598677 acccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctccc 7598768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  206 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 305  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  306 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28531504 - 28531316
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28531504 tgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagag 28531406  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531405 gtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178147
Alignment:
Q  217 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  317 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccctc-gtgacccaacaa 36178147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713135
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6713135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 383
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731833
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  304 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaacaaa 383  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaacaaa 33731833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  299 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 40733482 - 40733675
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733482 tgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaag 40733581  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733582 aggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632572
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaaa 384  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaacaaaa 37632572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 40733848 - 40734040
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733848 tgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaag 40733947  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733948 agggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  203 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 338  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346418
Alignment:
Q  212 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  312 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaacaa 23346418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 382
Target Start/End: Original strand, 3673003 - 3673250
Alignment:
Q  119 atacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaag-gggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttata 215  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3673003 atacatgcaaagt-aaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttata 3673101  T
Q  216 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 315  Q
    |||||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  3673102 tgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctct 3673184  T
Q  316 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  3673185 cttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacaa 3673250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  179 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 276  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  277 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38796410 - 38796298
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796410 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T
Q  265 ggacccataaacc 277  Q
    ||||| |||||||    
T  38796310 ggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 380
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  261 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  361 gctcccctcactgacccaac 380  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  299 aagagtgt 306  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 357
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  207 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  307 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591066
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaacaa 16591066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 357
Target Start/End: Original strand, 30313147 - 30313335
Alignment:
Q  169 tggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313147 tggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagg 30313244  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||    
T  30313245 acccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccc 30313335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36785786 - 36785664
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785786 agcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 36785687  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36785686 atagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 316
Target Start/End: Original strand, 30323430 - 30323581
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||    
T  30323430 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgag 30323528  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 316  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323529 aggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33561641 - 33561491
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33561641 tgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagag 33561543  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561542 gacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29873729 - 29873525
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |    
T  29873729 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 363  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggct 29873531  T
Q  364 cccctc 369  Q
    ||||||    
T  29873530 cccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 271 - 380
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672882
Alignment:
Q  271 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  371 ctgacccaac 380  Q
     |||||||||    
T  3672873 gtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  207 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  307 ggtgt 311  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  299 aagagtgtggtgtctct 315  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37894881 - 37894732
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  37894881 gatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaag 37894783  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894782 actcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  261 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  252 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  180 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 279  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  33953947 ttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctg 33953849  T
Q  280 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953848 ttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41678559 - 41678419
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41678559 tgatggactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgag 41678461  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678460 aggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 357
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 330  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  215 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 261
Target Start/End: Original strand, 42514981 - 42515078
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514981 gatggactcacatttgagggggagtgttg-tgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899077
Alignment:
Q  289 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaaaa 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca-tgatccaacaaaa 31899077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  263 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  302 agtgt 306  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 36178589 - 36178513
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  36178589 cccaatagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 36178513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 37106099 - 37106147
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37106099 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggc 37106147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  253 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 312  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 7598403 - 7598491
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt-cattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  7598403 cccaacactggtatcaaagcccaggttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 7598491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  269 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 317
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  270 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 381
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  303 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 40734063 - 40734147
Alignment:
Q  5 acagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40734063 acagtggtatcagagccccg-ttcgtcaaagggtacgaccgaggcagccggttcgtttgcgcagaaagcagcaacaacggtacaag 40734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 40734243 - 40734300
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734243 tgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 315  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 235
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 35580699 - 35580671
Alignment:
Q  9 tggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580699 tggtatcagagccccggttcgacgaaggg 35580671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 36785928 - 36785893
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36785928 cccaacagtggtatcagagcccc-gttcgacgaaggg 36785893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37533347 - 37533011
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||         
T  37533347 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa----- 37533253  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
                  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37533252 --------------cggcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggttt 37533168  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37533167 gcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggta 37533068  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533067 a-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 354
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681663
Alignment:
Q  12 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 111  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctccttatgcagg 14681422  T
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg--agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 209  Q
    || ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||  |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14681423 aa-ggcgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaa 14681520  T
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14681521 gttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggt 14681620  T
Q  310 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681621 gtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22567021 - 22566702
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagcccc-ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtgg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||  | ||| | ||| ||||||| | ||||   ||||||||| |||||||||    
T  22567021 cccaatagtggtatcagagcccccggtccgacgaagggtacgaccaaggccaccggttagttgtgcagaaaacagcaaagacggtacaagaagcaagtgg 22566922  T
Q  99 ctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--g 196  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  22566921 ctccttgtgcagcaacgacaatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttg 22566823  T
Q  197 tttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 296  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566822 tatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 22566723  T
Q  297 gtaagagtgtggtgtctctctt 318  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  22566722 gtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 112 - 328
Target Start/End: Original strand, 7553937 - 7554154
Alignment:
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 209  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7553937 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 7554035  T
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554036 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggt 7554135  T
Q  310 gtctctcttgcttgtgtgg 328  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7554136 gtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Original strand, 30244236 - 30244428
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244236 gatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaaga 30244335  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244336 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 381
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157747
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  293 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaaca 29157747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533364
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Original strand, 30245043 - 30245231
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245043 gatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245142  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30245143 cgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845349
Alignment:
Q  206 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  306 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 11845349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567017
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaa 22567017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 349  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 357
Target Start/End: Original strand, 45434548 - 45434794
Alignment:
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 210  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||    
T  45434548 aacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaag 45434647  T
Q  211 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45434648 ttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 45434747  T
Q  311 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434748 tctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 346
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  207 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  307 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 205 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118276
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  299 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaacaa 118276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 370
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129265
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca 47129265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128417
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaaca 8128417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 380
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 380  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  304 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 319
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1085436 - 1085280
Alignment:
Q  172 actcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  1085436 actcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaac 1085337  T
Q  269 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085336 ccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 334  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 354
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 355
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  220 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  320 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 357
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  341 cgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300228
Alignment:
Q  245 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  344 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | |||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaacaa 28300228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Original strand, 30244667 - 30244771
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30244667 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T
Q  265 ggacc 269  Q
    |||||    
T  30244767 ggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  170 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  268 cccat 272  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 351  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 320
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgc 320  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 381
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  280 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Original strand, 30245463 - 30245567
Alignment:
Q  170 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30245463 ggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30245562  T
Q  268 cccat 272  Q
    |||||    
T  30245563 cccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  282 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37532994 - 37532897
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||    
T  37532994 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 267  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  287 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 382
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244534
Alignment:
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaacaa 30244534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 382
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253752
Alignment:
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaacaa 30253752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37532896 - 37532822
Alignment:
Q  121 acaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgg 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532896 acaggcaaagtaaaaagcttccgctata-ggggaacacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 37345868 - 37346036
Alignment:
Q  150 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 247  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| |    
T  37345868 ggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaa 37345966  T
Q  248 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345967 acattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40094583 - 40094502
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 249  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094583 gatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 382
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517840
Alignment:
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaacaa 7517840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 382
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518106
Alignment:
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaacaa 7518106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 381
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  268 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctct 317  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 236
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 346  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 344
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  282 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 344  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 107
Target Start/End: Original strand, 45697753 - 45697801
Alignment:
Q  59 ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 107  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45697753 ttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgtg 45697801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  354 cccc 357  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40094747 - 40094664
Alignment:
Q  4 aacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtaca 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40094747 aacagtggtatcagagccctg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacggcggtaca 40094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1085599 - 1085543
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  1085599 cccaacagtggtatcatagccccggttcgatgaagggtatgaccgaggcagccggtc 1085543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 357
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  341 cgatgtggacggtcccc 357  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28300559 - 28300473
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc-attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  28300559 ccaacactggtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 28300473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 45433424 - 45433505
Alignment:
Q  11 gtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 91  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45433424 gtatcagagccc-ggttcgacaaagggtacgaccgaggcagctggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggttcaagtag 45433505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 381
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  335 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 8128423 - 8128387
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8128423 cccaacagtggtatcaaagccctggttcgacgaaggg 8128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 306
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  26 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 5158 - 5477
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5158 cccaacagtggcatcacagccccg-ttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggtcgttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggct 5256  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||    
T  5257 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgt 5355  T
Q  198 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  5356 gtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgga 5455  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5456 taagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 115)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18932747
Alignment:
Q  12 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggtggttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 18933003  T
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 210  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||  |||||| |||| | | ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18933002 aacggcgatacaggtaaaat-aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgag 18932905  T
Q  211 ttatatgtcccacatcgg-----------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932904 ttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggta 18932805  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932804 agagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 380
Target Start/End: Original strand, 36629205 - 36629418
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36629205 tgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagag 36629303  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  36629304 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcc 36629403  T
Q  366 cctcactgacccaac 380  Q
    ||||| |||||||||    
T  36629404 cctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630731
Alignment:
Q  189 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  289 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483517
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaaca 25483517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 370
Target Start/End: Original strand, 44620595 - 44620830
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620595 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaa 44620694  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 333  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620695 atagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T
Q  334 ctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620794 atatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246101
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaaca 10246101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017568
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccta-gctccccctcctgacccaacaa 54017568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 356
Target Start/End: Original strand, 39404334 - 39404555
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    ||||||||||  | || ||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404334 agcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 39404432  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 333  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404433 agagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 39404532  T
Q  334 ctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39404533 ctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Original strand, 54108888 - 54109060
Alignment:
Q  171 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108888 gactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 54108984  T
Q  271 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54108985 ataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027936
Alignment:
Q  168 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 365  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcc 22027951  T
Q  366 cctcactgacccaaca 381  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22027950 cctca-tgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340988
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaaca 3340988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  196 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  296 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 369  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 169 - 347
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  169 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404200
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaaca 39404200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028342
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 296  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  297 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaaca 22028342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  302 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 209 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  209 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  208 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  308 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 366  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Original strand, 20826186 - 20826370
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20826186 gatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagaga 20826284  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 352  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826285 acccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  208 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  308 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 218 - 357
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936353
Alignment:
Q  218 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  318 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 54936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3244638 - 3244424
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 266  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3244638 gatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagg 3244540  T
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 366  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | || ||    
T  3244539 acccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtccccttgacttcc 3244440  T
Q  367 ctcactgacccaacaaa 383  Q
    |||  ||||||||||||    
T  3244439 ctc-gtgacccaacaaa 3244424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 205 - 381
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| ||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Original strand, 2740984 - 2741180
Alignment:
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggag--cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 209  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||  || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  2740984 aacggcgatacgagcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtga 2741081  T
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741082 gttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 350  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 49076643 - 49076449
Alignment:
Q  162 aaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076643 aaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataag 49076544  T
Q  260 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076543 taagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 358
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 358  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 382
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341310
Alignment:
Q  156 cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  354 cccctaggctcccctcactgacccaacaa 382  Q
    |||| |  |||||||| | ||||||||||    
T  3341283 cccccaaactcccctc-cagacccaacaa 3341310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 357
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  198 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 296  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  297 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  214 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  314 ctcttgcttgtgtgg 328  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 370
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174677
Alignment:
Q  175 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  272 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45489522 - 45489331
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45489522 gatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaag 45489423  T
Q  264 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 356  Q
    || || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489422 agaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  253 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 352  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  353 tcccc 357  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41370532 - 41370662
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  41370532 cccaacagtgatatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtcgttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagct 41370631  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41370632 ccttgtgcaggaacggcgatacaggtaaagt 41370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  301 gagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 290  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741154
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaaca 54741154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 345
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 345  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 354  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 355
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  245 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  345 gtggacggtcc 355  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 239 - 357
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  239 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 338  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  339 ctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  250 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  348 gacg 351  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Original strand, 44621361 - 44621492
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 233  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44621361 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaa 44621460  T
Q  234 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621461 acagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  212 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 336  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 288
Target Start/End: Original strand, 10246240 - 10246436
Alignment:
Q  79 gcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 178  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||              |||||||     
T  10246240 gcggtacaagcaacaagtggcttcttgtgcagcaatggctatacatgcaaagtaaaaagcttccactcta-ggggagc--------------gactcacg 10246324  T
Q  179 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 276  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10246325 cttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaac 10246424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  220 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 319  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  320 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 357
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  221 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 316  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  317 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 368
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  204 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  304 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 368  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  241 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 340  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 10246095 - 10246237
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||    
T  10246095 cccaacagtggtatcagaaccccggttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggc 10246194  T
Q  100 tccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttcc 142  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  10246195 ttcttgtgcagcaacggctatacatgcaaagtaaaaagcttcc 10246237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  207 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 357
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  291 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 3340982 - 3341083
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||||||||    
T  3340982 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggc 3341081  T
Q  100 tc 101  Q
    ||    
T  3341082 tc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 45496726 - 45496803
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaac 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  45496726 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaac 45496803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  202 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 298  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  224 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 321  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  322 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 355  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  183 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Original strand, 2740868 - 2740953
Alignment:
Q  3 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2740868 caacagtggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaa 2740953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783528
Alignment:
Q  262 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 361  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  362 ctcccctcactgacccaaca 381  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 236
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  170 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 353
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  279 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 20826013 - 20826101
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 88  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20826013 ccaacagtggcatcagagccccaattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaag 20826101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817431
Alignment:
Q  312 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 23817431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 287  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  205 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  305 gtggtgtctctct 317  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16889375 - 16889315
Alignment:
Q  136 agcttccgctctaaggggagcacg-ttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 195  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889375 agcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 318
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Original strand, 44621175 - 44621266
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| ||||   || |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44621175 ccaacagtggtatcagagccctggtttgacgaagggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 44621266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 306
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  267 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 348
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  309 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  257 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 315  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  265 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 311  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  313 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  253 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23817659 - 23817569
Alignment:
Q  2 ccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  23817659 ccaacagtggtatcatagcccca-ttcgacgaagggtacgatcgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagtag 23817569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  277 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 353  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  191 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 297
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  254 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 297  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  243 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  275 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496732
Alignment:
Q  327 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaaca 45496732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 240  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 347
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  310 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 295
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  262 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  327 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 367  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 19895470 - 19895506
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19895470 cccaacagtggtatcagagcttcggttcgacgaaggg 19895506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  281 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 147
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  497 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggct 398  T
Q  101 ccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 199  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  397 ccttgtgcaggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggttt 300  T
Q  200 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||    
T  299 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggta 205  T
Q  300 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204 agaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  301 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1083
Alignment:
Q  8 gtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || | ||| |     
T  1465 gtggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaagtagt--gtcggtccgtt 1368  T
Q  106 tgc---------aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 195  Q
    |||         || |||| ||||||| |||| || || ||||||||||| |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1367 tgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gt-aagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttg 1270  T
Q  196 gtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 293  Q
     | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1269 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 1170  T
Q  294 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 381  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||    
T  1169 tgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  246 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 3092
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3178 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1666 - 1595
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagc 71  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  1666 cccaacagtggtatcagagcctc-gttcgacaaagggtacaaccgaggcagctggtccgtttgcgcagaaagc 1595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 348
Target Start/End: Original strand, 5689 - 5931
Alignment:
Q  112 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 209  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5689 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 5787  T
Q  210 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagt 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||    
T  5788 gttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagt 5887  T
Q  305 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5888 gtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  298 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17648 - 17496
Alignment:
Q  167 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17648 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaaga 17549  T
Q  265 ggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17548 ggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  199 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 298  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  299 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 357  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 331
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  201 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  301 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 331  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Original strand, 39805 - 39963
Alignment:
Q  166 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| |||     
T  39805 tgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagat 39904  T
Q  266 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 324  Q
    ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39905 gagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 39629 - 39665
Alignment:
Q  1 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 37  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39629 cccaacagtggtatcagagccgaggttcgacgaaggg 39665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  193 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 277  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  237 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University