View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3447_low_19 (Length: 363)

Name: NF3447_low_19
Description: NF3447
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3447_low_19
NF3447_low_19
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (26-298)||(19868636-19868919)
chr3 (26-292)||(4250045-4250322)
chr3 (26-154)||(9157797-9157925)
chr3 (26-154)||(42354593-42354721)
chr3 (131-298)||(25491857-25492014)
chr3 (25-159)||(30158212-30158346)
chr3 (26-154)||(9154624-9154752)
chr3 (26-154)||(10963216-10963344)
chr3 (26-154)||(10966725-10966853)
chr3 (26-154)||(18883022-18883150)
chr3 (26-154)||(44508617-44508745)
chr3 (26-159)||(2783925-2784058)
chr3 (26-154)||(27054679-27054807)
chr3 (26-149)||(10959714-10959837)
chr3 (26-149)||(29233768-29233890)
chr3 (26-154)||(28327252-28327380)
chr3 (26-154)||(28330577-28330705)
chr3 (26-149)||(5887164-5887286)
chr3 (26-149)||(2279800-2279923)
chr3 (26-149)||(5897148-5897270)
chr3 (26-149)||(16314770-16314892)
chr3 (26-149)||(16414936-16415058)
chr3 (26-149)||(18495764-18495886)
chr3 (26-149)||(18515910-18516032)
chr3 (26-149)||(23374910-23375032)
chr3 (26-154)||(3305658-3305786)
chr3 (26-154)||(6173533-6173661)
chr3 (26-120)||(54736312-54736406)
chr3 (26-118)||(4226033-4226125)
chr3 (26-154)||(20536759-20536886)
chr3 (26-154)||(18551477-18551605)
chr3 (26-68)||(25888650-25888692)
chr3 (163-260)||(3305540-3305635)
chr3 (163-260)||(28327134-28327229)
chr3 (163-260)||(28330459-28330554)
chr3 (152-186)||(20536898-20536932)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (26-298)||(1810590-1810873)
chr5 (26-263)||(33920829-33921078)
chr5 (26-154)||(17944459-17944587)
chr5 (26-159)||(4732013-4732146)
chr5 (26-154)||(19685978-19686106)
chr5 (26-154)||(34652937-34653065)
chr5 (26-154)||(2500190-2500318)
chr5 (26-154)||(19689361-19689489)
chr5 (26-149)||(26337796-26337919)
chr5 (26-159)||(26547897-26548030)
chr5 (26-159)||(26551456-26551589)
chr5 (26-159)||(28562541-28562674)
chr5 (26-159)||(28566109-28566242)
chr5 (26-154)||(33321106-33321234)
chr5 (27-260)||(9690453-9690698)
chr5 (30-159)||(40800102-40800231)
chr5 (26-149)||(26726760-26726882)
chr5 (54-154)||(3194967-3195067)
chr5 (26-149)||(25185200-25185323)
chr5 (109-153)||(2453142-2453186)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (26-292)||(13251-13528)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (23-159)||(27863733-27863869)
chr8 (26-159)||(14187805-14187938)
chr8 (26-159)||(5964060-5964193)
chr8 (26-154)||(9466936-9467064)
chr8 (26-149)||(20262369-20262492)
chr8 (26-149)||(21048999-21049122)
chr8 (26-159)||(22654066-22654199)
chr8 (26-154)||(30645282-30645410)
chr8 (26-149)||(31981162-31981285)
chr8 (32-154)||(39660145-39660267)
chr8 (26-260)||(5827717-5827963)
chr8 (26-149)||(13331902-13332025)
chr8 (26-153)||(31984799-31984926)
chr8 (26-149)||(17013214-17013337)
chr8 (26-149)||(17543864-17543987)
chr8 (26-149)||(24434846-24434968)
chr8 (26-149)||(24903666-24903789)
chr8 (26-149)||(24444892-24445014)
chr8 (166-254)||(14627143-14627229)
chr8 (90-149)||(18696171-18696231)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (26-154)||(11702769-11702897)
chr4 (26-292)||(56089496-56089773)
chr4 (26-154)||(10247629-10247757)
chr4 (26-159)||(18859582-18859715)
chr4 (26-154)||(13978942-13979070)
chr4 (26-154)||(15850981-15851109)
chr4 (26-149)||(3719678-3719801)
chr4 (26-146)||(3734131-3734250)
chr4 (26-149)||(14701719-14701842)
chr4 (26-149)||(49639998-49640120)
chr4 (26-154)||(26703673-26703801)
chr4 (26-146)||(49636705-49636824)
chr4 (26-153)||(10385760-10385881)
chr4 (64-292)||(19928563-19928802)
chr4 (51-154)||(33400539-33400642)
chr4 (72-159)||(17670221-17670308)
chr4 (23-154)||(23653089-23653223)
chr4 (163-260)||(13978824-13978919)
chr4 (26-184)||(11560578-11560750)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (26-153)||(1503615-1503742)
chr2 (26-153)||(1506819-1506946)
chr2 (26-158)||(18011755-18011887)
chr2 (26-159)||(13518108-13518241)
chr2 (26-154)||(30719583-30719711)
chr2 (26-154)||(38326453-38326581)
chr2 (26-159)||(11059603-11059736)
chr2 (26-154)||(4577661-4577788)
chr2 (26-154)||(38316229-38316357)
chr2 (26-154)||(40677954-40678082)
chr2 (26-149)||(15704152-15704275)
chr2 (26-149)||(18938709-18938831)
chr2 (26-149)||(22592328-22592451)
chr2 (26-149)||(29435564-29435687)
chr2 (58-154)||(38326178-38326274)
chr2 (90-149)||(15719470-15719529)
chr2 (163-260)||(40678105-40678200)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (27-292)||(3918-4194)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (29-154)||(19864-19989)
scaffold0214 (26-154)||(13415-13543)
scaffold0214 (26-154)||(27431-27559)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (26-159)||(20100447-20100580)
chr7 (26-159)||(22257061-22257194)
chr7 (26-154)||(22083625-22083752)
chr7 (26-292)||(3541350-3541625)
chr7 (26-159)||(22232809-22232942)
chr7 (26-159)||(22253797-22253930)
chr7 (26-157)||(748223-748354)
chr7 (26-149)||(26152964-26153087)
chr7 (26-159)||(8397648-8397781)
chr7 (26-159)||(5826890-5827023)
chr7 (26-154)||(6964095-6964223)
chr7 (26-154)||(38431201-38431329)
chr7 (26-154)||(44017974-44018102)
chr7 (26-149)||(23598945-23599067)
chr7 (26-149)||(26460280-26460402)
chr7 (26-149)||(710199-710322)
chr7 (26-149)||(2251685-2251807)
chr7 (26-149)||(12803447-12803569)
chr7 (26-149)||(26182116-26182238)
chr7 (26-154)||(43549001-43549129)
chr7 (26-149)||(11825537-11825660)
chr7 (71-159)||(2349276-2349364)
chr7 (62-152)||(23467349-23467440)
chr7 (163-260)||(44018125-44018220)
chr7 (210-260)||(17601382-17601432)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (26-159)||(14969471-14969604)
chr6 (26-260)||(12746496-12746742)
chr6 (23-154)||(34502151-34502282)
chr6 (26-292)||(35027315-35027592)
chr6 (26-154)||(31262579-31262707)
chr6 (26-149)||(13095880-13096003)
chr6 (26-154)||(9313967-9314095)
chr6 (26-154)||(5618491-5618618)
chr6 (26-150)||(28117652-28117776)
chr6 (26-154)||(28894663-28894791)
chr6 (26-154)||(2330438-2330566)
chr6 (26-149)||(11410578-11410701)
chr6 (26-149)||(17231669-17231792)
chr6 (26-149)||(22920343-22920465)
chr6 (30-154)||(33679375-33679498)
chr6 (26-154)||(2331090-2331218)
chr6 (26-154)||(17696397-17696526)
chr6 (26-118)||(15579097-15579189)
chr6 (26-87)||(5618396-5618457)
chr6 (97-159)||(3827069-3827131)
chr6 (27-79)||(11296321-11296373)
chr6 (51-154)||(31123238-31123341)
chr6 (59-93)||(3827018-3827052)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (26-154)||(7046-7174)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (26-159)||(37641671-37641804)
chr1 (26-149)||(28918188-28918311)
chr1 (26-154)||(3087907-3088035)
chr1 (26-149)||(17902969-17903092)
chr1 (26-149)||(24200426-24200548)
chr1 (26-154)||(18392201-18392329)
chr1 (26-154)||(33898134-33898262)
chr1 (26-154)||(34552866-34552994)
chr1 (26-149)||(16839115-16839237)
chr1 (26-149)||(16849045-16849167)
chr1 (26-149)||(20981173-20981296)
chr1 (26-154)||(23441466-23441594)
chr1 (26-149)||(49719667-49719791)
chr1 (30-149)||(20964270-20964389)
chr1 (26-149)||(49716184-49716309)
chr1 (26-154)||(6195626-6195754)
chr1 (26-114)||(50197142-50197230)
chr1 (163-260)||(23441617-23441712)
chr1 (163-260)||(33898016-33898111)
[»] scaffold0911 (2 HSPs)
scaffold0911 (26-154)||(4371-4499)
scaffold0911 (163-260)||(4255-4350)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (26-292)||(52778-53055)
scaffold0083 (26-292)||(28981-29258)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (26-149)||(27061-27184)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (26-149)||(27176-27298)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (26-149)||(53064-53187)
scaffold0062 (90-149)||(68027-68086)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (26-153)||(227157-227284)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (26-149)||(1216-1338)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (26-149)||(28842-28965)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (26-113)||(2298-2385)
scaffold0360 (26-125)||(6123-6222)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (33-131)||(2022-2120)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (163-292)||(20018-20144)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19868919 - 19868636
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19868919 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 19868820  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat---------------gaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaaga 210  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  19868819 gaagaagctagggttaatagtcatgcaaagcaatcatatgaaaagcaacaaacacaaataattctgaataaagactaggattccattgaatt---aagga 19868723  T
Q  211 gagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19868722 gagtttaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttagctactcatgttcat 19868636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4250322 - 4250045
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4250322 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4250223  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  4250222 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 4250125  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  4250124 agtacttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatctaagagtttagctactcat 4250045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9157925 - 9157797
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9157925 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9157826  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9157825 caagaagttagggttactagtcatgcaaa 9157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 42354593 - 42354721
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42354593 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 42354692  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42354693 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 42354721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25492014 - 25491857
Alignment:
Q  131 agttagggttaatagtcatgcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatg 230  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  25492014 agttagggttaatagtcat------caatgaacacaaataattttgaataaagactaggattccgttgaattaaata---gagttcaaacaaattacatg 25491924  T
Q  231 gttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25491923 gttcatagatcacaatagattcatctcatggctc-gattaatctaagagcttagctactcatgttcat 25491857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Original strand, 30158212 - 30158346
Alignment:
Q  25 atatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  30158212 atatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatgtaatt 30158311  T
Q  125 gcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30158312 gcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 30158346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9154752 - 9154624
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9154752 tatctctaggttcctatgttgaattaaatataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9154653  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9154652 caagaagttaggattactagtcatgcaaa 9154624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10963344 - 10963216
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10963344 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10963245  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10963244 cacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10963216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10966853 - 10966725
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10966853 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10966754  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10966753 cacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10966725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18883150 - 18883022
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18883150 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaatccctaagatcaatttatgtgattg 18883051  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18883050 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 18883022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44508745 - 44508617
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44508745 tatctctaggttcctgtgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctcgggttagtagtcattcaattcttaagatcaatttatgtgattg 44508646  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44508645 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 44508617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2784058 - 2783925
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  2784058 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 2783959  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2783958 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 2783925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27054807 - 27054679
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27054807 tatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 27054708  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27054707 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 27054679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10959837 - 10959714
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10959837 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcagaattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 10959738  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    || |||| ||||||| ||||||||    
T  10959737 cacgaagctagggttgatagtcat 10959714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 29233768 - 29233890
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  29233768 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 29233866  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29233867 caagaagctagggttaatagtcat 29233890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28327380 - 28327252
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28327380 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28327281  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28327280 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28327252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28330705 - 28330577
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28330705 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28330606  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28330605 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28330577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 5887164 - 5887286
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  5887164 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 5887262  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  5887263 caagaagctagggttaatagtcat 5887286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 2279800 - 2279923
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  2279800 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 2279899  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  2279900 caagaagctaaggttaatagtcat 2279923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 5897148 - 5897270
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  5897148 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 5897246  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  5897247 taagaagctagggttaatagtcat 5897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16314770 - 16314892
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16314770 tatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16314868  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16314869 caagaagctagggttaatagtcat 16314892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16414936 - 16415058
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  16414936 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt- 16415034  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16415035 caagaagctagggttaatagtcat 16415058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 18495764 - 18495886
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  18495764 tatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 18495862  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18495863 caagaagctagggttaatagtcat 18495886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 18515910 - 18516032
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||     
T  18515910 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaattcataatatcaattcatataatt- 18516008  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18516009 caagaagctagggttaatagtcat 18516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 23374910 - 23375032
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  23374910 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagatagggttaaaagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 23375008  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  23375009 caagaagctagggttaatagtcat 23375032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3305786 - 3305658
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  3305786 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcattattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctattatcaatttatgtgattg 3305687  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3305686 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 3305658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 6173533 - 6173661
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  6173533 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactaattcaggattaaaatctagggttagtggtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 6173632  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6173633 caagaagctagggttaatagtcatacaaa 6173661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Original strand, 54736312 - 54736406
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  54736312 tatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaggattagtagcgattcaattcttaagatcaatttatgt 54736406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 4226033 - 4226125
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||    
T  4226033 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagcaatcattcaatttctaagatcaatttat 4226125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 20536759 - 20536886
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  20536759 tatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcaattaattcctaagatcaattaatatgattg 20536858  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20536859 -aagaagttagggttaatagtcatacaaa 20536886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18551605 - 18551477
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | | || |||||||||||||| ||  |||||    
T  18551605 tatctctagtttcatatgtaaagtcaaacagaatcactatttcaggtttaatagctagggttagtagtcaattaactcctaagatcaattaatacaattg 18551506  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  18551505 aaagaagctagggttagtagccatacaaa 18551477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 68
Target Start/End: Original strand, 25888650 - 25888692
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttc 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25888650 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttc 25888692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3305635 - 3305540
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3305635 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 3305540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28327229 - 28327134
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28327229 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28327134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28330554 - 28330459
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28330554 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28330459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 186
Target Start/End: Original strand, 20536898 - 20536932
Alignment:
Q  152 aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagact 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536898 aaagcaatgaacacaaataattttgaataaagact 20536932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Original strand, 1810590 - 1810873
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1810590 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattacaatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaatttctaagatcaatttatgtaattg 1810689  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc---------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaaga 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||               ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  1810690 taagaagttagggttaatagtcatgcaaaacaatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctcaataaagactaggaatccattgaatt---aaaga 1810786  T
Q  211 gagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 298  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1810787 gacttcaaacaaatttcatgattcatagatcataatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttaactactcatattcat 1810873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33921078 - 33920829
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33921078 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 33920979  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  33920978 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 33920881  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgact 263  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33920880 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact 33920829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17944587 - 17944459
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17944587 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 17944488  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17944487 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 17944459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 4732013 - 4732146
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4732013 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcatccaattcctaatatcaattcatgtaattg 4732112  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4732113 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 4732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19686106 - 19685978
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19686106 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttattagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 19686007  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19686006 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19685978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 34652937 - 34653065
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34652937 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattattatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 34653036  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34653037 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 34653065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 2500190 - 2500318
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2500190 tatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 2500289  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2500290 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 2500318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19689489 - 19689361
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19689489 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 19689390  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689389 taagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19689361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26337919 - 26337796
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26337919 tatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 26337820  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     |||||  ||||||||||||||||    
T  26337819 aaagaaactagggttaatagtcat 26337796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26548030 - 26547897
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26548030 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 26547931  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26547930 cacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26547897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26551589 - 26551456
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26551589 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 26551490  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26551489 cacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26551456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 28562541 - 28562674
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  28562541 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 28562640  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28562641 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28562674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 28566109 - 28566242
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  28566109 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttg 28566208  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28566209 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28566242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 33321106 - 33321234
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33321106 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggctagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 33321205  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33321206 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 33321234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9690698 - 9690453
Alignment:
Q  27 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9690698 atctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaaactagggttagtagtcgttcaattcctaagatcaatttatgtgattga 9690599  T
Q  127 aagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagaga 212  Q
    || ||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||    
T  9690598 aataagctagggttaatagtcatgcaaacaatcgtacgaaaagcaatgaacacaaataattatgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagaga 9690501  T
Q  213 gttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  9690500 gttcgtaacaaattatatggttcacaaatcacaa-agattcatctcatg 9690453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Original strand, 40800102 - 40800231
Alignment:
Q  30 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  40800102 tctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaaggtagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacg 40800201  T
Q  130 aagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  40800202 aagctagggttaatagtcatacaaaacaat 40800231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26726882 - 26726760
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  26726882 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 26726784  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  26726783 caagaagctatggttaatagtcat 26726760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3195067 - 3194967
Alignment:
Q  54 cagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195067 cagaattattatttcaggattaaaagctaaggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 3194968  T
Q  154 a 154  Q
    |    
T  3194967 a 3194967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25185323 - 25185200
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25185323 tatctctaggttcctatgatgaattaaacagagctagtattttaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattg 25185224  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  25185223 caagaagctagggttattagtcat 25185200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2453186 - 2453142
Alignment:
Q  109 atcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453186 atcaatttatgtggttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 2453142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13528 - 13251
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13528 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 13429  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  13428 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaattatacaaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 13331  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  13330 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 27863733 - 27863869
Alignment:
Q  23 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27863733 tcatatccctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaagatcaattcatgtaa 27863832  T
Q  123 ttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27863833 ttgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 27863869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14187938 - 14187805
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14187938 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactacttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 14187839  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14187838 caagaagttagggtttatagtcatacaaagcaat 14187805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5964193 - 5964060
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5964193 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 5964094  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5964093 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 5964060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9467064 - 9466936
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9467064 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9466965  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9466964 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 9466936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20262492 - 20262369
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  20262492 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 20262393  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20262392 caagaagttagggttaatagtcat 20262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21049122 - 21048999
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  21049122 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 21049023  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21049022 caagaagttagggttaatagtcat 21048999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22654199 - 22654066
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22654199 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaagattactatttcaggattaaaagttggggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 22654100  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22654099 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22654066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30645410 - 30645282
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30645410 tatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaaaattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 30645311  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30645310 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30645282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31981285 - 31981162
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31981285 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatttatgtgattg 31981186  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     |||||| || |||||||||||||    
T  31981185 taagaagctatggttaatagtcat 31981162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 39660145 - 39660267
Alignment:
Q  32 taggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39660145 taggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 39660244  T
Q  132 gttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  39660245 gttagggttagtagtcatacaaa 39660267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5827963 - 5827717
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5827963 tatctcgaggttcctatgttgaattaaacagaattactctttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagattaatttatgtgattg 5827864  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||  |  |||||||    
T  5827863 aaagaagctagggttaatagtcaagcaaacaatcataagaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttctttga--tgtaaaagag 5827766  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5827765 aattcttaacaaactacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 5827717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13332025 - 13331902
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13332025 tatctctaggttcctatgatgaattaaacagaattactatttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13331926  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  13331925 aaagaagctagggttagtagtcat 13331902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31984926 - 31984799
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31984926 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31984827  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  31984826 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 31984799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 17013214 - 17013337
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| |     
T  17013214 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaatt 17013313  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17013314 caataagctagggttaatagtcat 17013337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17543987 - 17543864
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| |     
T  17543987 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcataatatcaattcatataaatt 17543888  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17543887 caataagctagggttaatagtcat 17543864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24434968 - 24434846
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24434968 tatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24434870  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24434869 caagaagctagggttaatagtcat 24434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 24903666 - 24903789
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  24903666 tatctctagcttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 24903765  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24903766 caagaagctagggttaatagtcat 24903789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24445014 - 24444892
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24445014 tatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctaggattaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24444916  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24444915 caagaagctagggttaatagtcat 24444892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14627229 - 14627143
Alignment:
Q  166 aaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcat 254  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14627229 aaataattatgaataatgactaggtttccaatga--tatcaaagggagttcaaacaaattacatggttcacagattacaatagattcat 14627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 149
Target Start/End: Original strand, 18696171 - 18696231
Alignment:
Q  90 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaa-gaagttagggttaatagtcat 149  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18696171 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaaggaagttagggttaatagtcat 18696231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 11702769 - 11702897
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11702769 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 11702868  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11702869 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 11702897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 56089496 - 56089773
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56089496 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 56089595  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  56089596 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 56089693  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  56089694 agttcttaacaaattacatgattcacagatcacaa-agattcatttcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 56089773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10247757 - 10247629
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10247757 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 10247658  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247657 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 10247629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18859715 - 18859582
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18859715 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 18859616  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18859615 cacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 18859582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13979070 - 13978942
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13979070 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13978971  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  13978970 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 13978942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15851109 - 15850981
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15851109 tatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattg 15851010  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15851009 aaagaagttagggttattagtcatacaaa 15850981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 3719678 - 3719801
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  3719678 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 3719777  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  3719778 caagaagctagggttaatagtcat 3719801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3734250 - 3734131
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  3734250 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 3734152  T
Q  126 caagaagttagggttaatagt 146  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  3734151 caagaagctagggttaatagt 3734131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14701842 - 14701719
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  14701842 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 14701743  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  14701742 caagaagctagggttaatagtcat 14701719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 49639998 - 49640120
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  49639998 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 49640096  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  49640097 caagaagctagggttaatagtcat 49640120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 26703673 - 26703801
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26703673 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatatgattg 26703772  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  26703773 aaagaagctagagttagtagtcatacaaa 26703801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Original strand, 49636705 - 49636824
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  49636705 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 49636803  T
Q  126 caagaagttagggttaatagt 146  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  49636804 caagaagctagggttaatagt 49636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10385881 - 10385760
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10385881 tatctctaggttcctatgttgaattaaa------tactatatcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 10385788  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10385787 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 10385760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19928802 - 19928563
Alignment:
Q  64 atttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat-------------- 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||                  
T  19928802 atttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcagaa 19928703  T
Q  150 gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatag 248  Q
    | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19928702 gaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-ag 19928606  T
Q  249 attcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  19928605 attcatctcattact-taatcaatctaagagtttagctactcat 19928563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Original strand, 33400539 - 33400642
Alignment:
Q  51 aaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 150  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33400539 aaacaaaattactatttcagaattaaaagttagggttagtagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcaag 33400638  T
Q  151 caaa 154  Q
    ||||    
T  33400639 caaa 33400642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17670308 - 17670221
Alignment:
Q  72 attaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17670308 attaaaaggtagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 17670221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23653223 - 23653089
Alignment:
Q  23 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagt-aatt--caattcctaagatcaatttatg 119  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||| ||||||||| |      
T  23653223 tcatatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaattaataatacctgagatcaattaaca 23653124  T
Q  120 taattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23653123 tgattgaaagaagttaggtttaatagtcatgcaaa 23653089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13978919 - 13978824
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13978919 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 13978824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11560750 - 11560578
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  | | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||||| |||||| |  | | |     
T  11560750 tatctctagtttcatatgtaaagttaaacataattactattttaggattaaaagatagggttactagtcaattaatacctaaggtcaattaacatgacta 11560651  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaaga 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11560650 aaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaatcataataaaagcaatgaacacaaataattttgaataaaga 11560578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Original strand, 1503615 - 1503742
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1503615 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 1503714  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1503715 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 1503742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Original strand, 1506819 - 1506946
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1506819 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 1506918  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1506919 caagaagctagggttaatagtcatgcaa 1506946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18011887 - 18011755
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18011887 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 18011788  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaa 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18011787 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaa 18011755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13518241 - 13518108
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13518241 tatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 13518142  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  13518141 cacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 13518108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30719711 - 30719583
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30719711 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactattttaggattaaaagttagagttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 30719612  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719611 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30719583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 38326453 - 38326581
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38326453 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 38326552  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326553 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11059736 - 11059603
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11059736 tatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagtgttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 11059637  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11059636 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 11059603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4577788 - 4577661
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4577788 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagg-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4577690  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4577689 taagaagatagggttaatagtcatgcaaa 4577661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 38316229 - 38316357
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38316229 tatctctaagttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 38316328  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  38316329 aaagaagctacggttagtagtcatacaaa 38316357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 40677954 - 40678082
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  40677954 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 40678053  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  40678054 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 40678082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 15704152 - 15704275
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  15704152 tatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 15704251  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15704252 caggaagttagggttaatagtcat 15704275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18938831 - 18938709
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  18938831 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 18938733  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18938732 caagaagctagggttaatagtcat 18938709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22592451 - 22592328
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| |     
T  22592451 tatctctaagttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatctcaattcatataaatt 22592352  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22592351 caagaagctagggttaatagtcat 22592328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29435687 - 29435564
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  29435687 tatctctaggttcctatgttgaaacaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaattt 29435588  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29435587 caagaagctagggttaatagtcat 29435564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38326274 - 38326178
Alignment:
Q  58 attactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326274 attattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 149
Target Start/End: Original strand, 15719470 - 15719529
Alignment:
Q  90 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15719470 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 15719529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Original strand, 40678105 - 40678200
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40678105 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 40678200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4194 - 3918
Alignment:
Q  27 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4194 atctctaggttcctatgttgaatgaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattga 4095  T
Q  127 aagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagaga 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||    
T  4094 aagaagctagggttaatagtcatgcaaccaatcatacgaaaaccaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagaga 3997  T
Q  213 gttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    ||||  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3996 gttcttaacaaattacatggtttacatatcacaa-agattcttctcatggct-taattaatctaagagtttagctactcat 3918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19989 - 19864
Alignment:
Q  29 ctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19989 ctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaa 19890  T
Q  129 gaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19889 gaagttagggttaatagtcatgcaaa 19864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13543 - 13415
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13543 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattcctatttgaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13444  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13443 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27559 - 27431
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataatttttattttatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 27460  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27459 taagaagttagggttaatagtcatgcaaa 27431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20100580 - 20100447
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20100580 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattg 20100481  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20100480 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 20100447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22257194 - 22257061
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22257194 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 22257095  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22257094 caagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22257061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 22083625 - 22083752
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22083625 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaga-ttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 22083723  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083724 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 22083752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 3541350 - 3541625
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3541350 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 3541449  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||              | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  3541450 aaagaagctagggttaatagtcattcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaatgaagactaggttttcattga--tgttaaagag 3541547  T
Q  212 agttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||   |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  3541548 agttc-ttcaaattacatggtcaacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatctaagagtttagctactcat 3541625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 22232809 - 22232942
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22232809 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattg 22232908  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22232909 caagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22253930 - 22253797
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22253930 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggttaatagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattg 22253831  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22253830 caagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22253797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Original strand, 748223 - 748354
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  748223 tatctctaggtatctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 748322  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagca 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  748323 caagaagctagggttaaaagtcatacaaagca 748354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26153087 - 26152964
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26153087 tatctctaagttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 26152988  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  26152987 aaagaagttagggttagtagtcat 26152964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8397781 - 8397648
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8397781 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 8397682  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8397681 cacgaagctagggttaataatcatacaaaacaat 8397648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 5826890 - 5827023
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5826890 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaacagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattg 5826989  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5826990 cacgaagctatggttaatagtcatacaaagcaat 5827023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6964223 - 6964095
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6964223 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 6964124  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6964123 aaagaaggtagggttagtagtcatacaaa 6964095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38431329 - 38431201
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38431329 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 38431230  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  38431229 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 38431201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 44017974 - 44018102
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44017974 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 44018073  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  44018074 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 44018102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 23598945 - 23599067
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  23598945 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 23599043  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  23599044 caagaagctatggttaatagtcat 23599067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26460402 - 26460280
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  26460402 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 26460304  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  26460303 caagaagctagggttaatagtcat 26460280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 710199 - 710322
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  710199 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 710298  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  710299 caagaagctagggttaatagtcat 710322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2251807 - 2251685
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  2251807 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattagtaattcaggattaaaaactagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 2251709  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  2251708 caagaagctagggttaatagtcat 2251685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 12803447 - 12803569
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12803447 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctaggg-tagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 12803545  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  12803546 aaagaagctagggttagtagtcat 12803569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26182238 - 26182116
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||     
T  26182238 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcttaatatcaattcatataatt- 26182140  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  26182139 caagaagctagggttaatagtcat 26182116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43549129 - 43549001
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43549129 tatctttagattcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaagttcaatttatgtgattg 43549030  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  43549029 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 43549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 11825537 - 11825660
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |   |||||||||    
T  11825537 tatctctaggtttctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctgatatcgagacatgtaattg 11825636  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  11825637 cacgaagctagggttaatagtcat 11825660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2349364 - 2349276
Alignment:
Q  71 gattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2349364 gattaaaagctagggttaatagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 2349276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 152
Target Start/End: Original strand, 23467349 - 23467440
Alignment:
Q  62 ctatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt-cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgca 152  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23467349 ctatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattaaatttcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgca 23467440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Original strand, 44018125 - 44018220
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44018125 cacaaataattctgaataaagattaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 44018220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17601432 - 17601382
Alignment:
Q  210 agagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  17601432 agagttcaaacaagttacattgttcacatattacaatagattcatctcatg 17601382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14969604 - 14969471
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14969604 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 14969505  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14969504 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 14969471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12746742 - 12746496
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12746742 tatctctaggttcatatgttgaattaaacagaattactatttcacgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 12746643  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  12746642 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 12746545  T
Q  212 agtt-caaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  12746544 agttattaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatccatctcatg 12746496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34502282 - 34502151
Alignment:
Q  23 tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34502282 tcatatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactacttcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtga 34502183  T
Q  123 ttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34502182 ttgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 34502151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Original strand, 35027315 - 35027592
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35027315 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 35027414  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| |||||||| |||||||              | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  35027415 aaagaagctagggttagtagtcatataaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 35027512  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||    
T  35027513 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagcttagctactcat 35027592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31262707 - 31262579
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31262707 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaactactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31262608  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31262607 caagaagttagagttaataatcatgcaaa 31262579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 13095880 - 13096003
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13095880 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 13095979  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13095980 caagaagttagggttaatagtcat 13096003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 9313967 - 9314095
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9313967 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaagagctatggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9314066  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9314067 caataagctagggttaatagtcatgcaaa 9314095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 5618491 - 5618618
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5618491 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagaagtcattcaattcttaa-atcaatttatgtgattg 5618589  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5618590 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 5618618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28117776 - 28117652
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28117776 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattg 28117677  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatg 150  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28117676 caagaagctagggttaataatcatg 28117652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 28894663 - 28894791
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28894663 tatctctaggtttctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 28894762  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28894763 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 28894791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2330566 - 2330438
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2330566 tatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgttattg 2330467  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2330466 aaagaatctagagttaatagtcatgcaaa 2330438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11410701 - 11410578
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  11410701 tatctctaggatcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaattt 11410602  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11410601 caagaagctagggttaatagtcat 11410578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17231792 - 17231669
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  17231792 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattacaatttcagaattaaaagatagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 17231693  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  17231692 caagaagatagggttaatagtcat 17231669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22920465 - 22920343
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  22920465 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggataaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 22920367  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22920366 caagaagctagggttaatagtcat 22920343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 33679375 - 33679498
Alignment:
Q  30 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 129  Q
    |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  33679375 tctaggttcctaggttgaattaa-cataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattgaaag 33679473  T
Q  130 aagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33679474 aagttagggttaatagtcatgcaaa 33679498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2331218 - 2331090
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2331218 tatctctaggttcctacgttgaattaaacagaattgatatttcatgattaaaagctggtgttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgttattg 2331119  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2331118 aaagaagctaggatcaatagtcatgcaaa 2331090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17696526 - 17696397
Alignment:
Q  26 tatctctaggttccta-tgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 124  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17696526 tatctctaggttcctagtgttgagttaaacagaattacaatttcaggattaagagccagggctagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgatt 17696427  T
Q  125 gcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17696426 gcaagaagttagggttaatagtcatacaaa 17696397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 15579097 - 15579189
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15579097 tatctctaggttcatatgttgaattaaatagatttactatttcatgattaaaatatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttat 15579189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Original strand, 5618396 - 5618457
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5618396 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtt 5618457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Original strand, 3827069 - 3827131
Alignment:
Q  97 tcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3827069 tcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatacaaagcaat 3827131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 11296321 - 11296373
Alignment:
Q  27 atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11296321 atctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaag 11296373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31123341 - 31123238
Alignment:
Q  51 aaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 150  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| | | ||| ||||||||||||| |  | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31123341 aaacacaattactatttcaggattaaaagctagggaaagtagtcaattaatacctaagatcaattaacatgattgaaagaagctagggttaatagtcatg 31123242  T
Q  151 caaa 154  Q
    ||||    
T  31123241 caaa 31123238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 93
Target Start/End: Original strand, 3827018 - 3827052
Alignment:
Q  59 ttactatttcatgattaaaagctagggttaatagt 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3827018 ttactatttcaggattaaaagctagggttaatagt 3827052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7174 - 7046
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7174 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 7075  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7074 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 7046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37641804 - 37641671
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37641804 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 37641705  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 159  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37641704 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 37641671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28918311 - 28918188
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  28918311 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaatttatttaattt 28918212  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    || || | ||||||||||||||||    
T  28918211 catgatgctagggttaatagtcat 28918188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 3087907 - 3088035
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  3087907 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagttattcaattcctaagatcaatttatatggttg 3088006  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3088007 aaagaagttagggttattagtcatacaaa 3088035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 17902969 - 17903092
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  17902969 tatctctagattcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 17903068  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  17903069 caagaagctagggttaatagtcat 17903092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 24200426 - 24200548
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  24200426 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 24200524  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24200525 caagaagctagggttaatagtcat 24200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18392329 - 18392201
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18392329 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 18392230  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18392229 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 18392201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33898262 - 33898134
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33898262 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaacatcaatttatgtgattg 33898163  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  33898162 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 33898134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 34552866 - 34552994
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34552866 tatctctaggttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattg 34552965  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  34552966 aaagaaactagggttagtagtcatacaaa 34552994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16839115 - 16839237
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16839115 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16839213  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16839214 caagaagctagggttaatagtcat 16839237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16849045 - 16849167
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16849045 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 16849143  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16849144 caagaagctagggttaatagtcat 16849167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20981296 - 20981173
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  20981296 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattattaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcttaatatcaattcatgtaattt 20981197  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20981196 caagaagttagggttaatagtcat 20981173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 23441466 - 23441594
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23441466 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggataaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 23441565  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23441566 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 23441594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49719791 - 49719667
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactattt-catgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49719791 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagtattacttttttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatt 49719692  T
Q  125 gcaagaagttagggttaatagtcat 149  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  49719691 tcaagaagctagggttaatagtcat 49719667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20964389 - 20964270
Alignment:
Q  30 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  20964389 tctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatacatgtaatttcaag 20964290  T
Q  130 aagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  20964289 aagctatggttaatagtcat 20964270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49716309 - 49716184
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctat--gttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaat 123  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49716309 tatctctaggtttctatatgttgaatcaaacagtattactatttcaagattaaaagctagggttagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaat 49716210  T
Q  124 tgcaagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  49716209 ttcaagaagctagggttaatagtcat 49716184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6195754 - 6195626
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6195754 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaagattaaaagttatggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 6195655  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  6195654 aaagaagccagggttagtagtcatacaaa 6195626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 50197142 - 50197230
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50197142 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaataactatttcaagattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaagatcaat 50197230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Original strand, 23441617 - 23441712
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23441617 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgaagtcaaaaagag--ttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatatcatg 23441712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33898111 - 33898016
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33898111 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 33898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4499 - 4371
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4499 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4400  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 154  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  4399 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4350 - 4255
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4350 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 4255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53055 - 52778
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53055 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaagattaaaagatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 52956  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| |||| |||||||||||||              |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  52955 aaagaagctaggattaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagctttgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 52858  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  52857 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatacatctcatgtct-taatcaatctaagagtttagctactcat 52778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29258 - 28981
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29258 tatctctaggttcccaggttgaattaaacagaattactatttcaggaataaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 29159  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 211  Q
     |||||| |||| |||||||||||||              ||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  29158 aaagaagctaggtttaatagtcatgcaatcaatcatatgaaaatctttgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 29061  T
Q  212 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  29060 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 28981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 27061 - 27184
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |     
T  27061 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataaatt 27160  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27161 caagaagttagggttaatagtcat 27184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27298 - 27176
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  27298 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 27200  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  27199 caagaagctagggttaatagtcat 27176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 53064 - 53187
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  53064 tatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 53163  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  53164 caggaagttagggttaatagtcat 53187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 149
Target Start/End: Original strand, 68027 - 68086
Alignment:
Q  90 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68027 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 68086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 227284 - 227157
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  227284 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 227185  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 153  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  227184 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 227157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1216
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  1338 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatataatt- 1240  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1239 caaaaagctagggttaatagtcat 1216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 28842 - 28965
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  28842 tatctttaggttcctatgttgaatcaaacaggattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataattt 28941  T
Q  126 caagaagttagggttaatagtcat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  28942 caagaagctagggttaatagtcat 28965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2385 - 2298
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  2385 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaa 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6222 - 6123
Alignment:
Q  26 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6222 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattcctatttcagaattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2120 - 2022
Alignment:
Q  33 aggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 131  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2120 aggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcagttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Original strand, 20018 - 20144
Alignment:
Q  163 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatga 261  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  20018 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgg 20114  T
Q  262 ctctgattaatctaagagcttaactactcat 292  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  20115 ct-taatcaatctaagagtttagctactcat 20144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University