View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3457_low_8 (Length: 307)

Name: NF3457_low_8
Description: NF3457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3457_low_8
NF3457_low_8
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-297)||(34967042-34967338)
chr6 (1-297)||(17013412-17013711)
chr6 (1-297)||(22461873-22462169)
chr6 (1-293)||(23222926-23223219)
chr6 (29-295)||(29158163-29158428)
chr6 (1-256)||(19854330-19854586)
chr6 (1-297)||(23222091-23222388)
chr6 (7-297)||(19175332-19175622)
chr6 (1-297)||(21931379-21931675)
chr6 (8-297)||(31467379-31467662)
chr6 (1-241)||(16136438-16136678)
chr6 (1-297)||(22585330-22585626)
chr6 (1-297)||(22590161-22590457)
chr6 (142-296)||(15889491-15889644)
chr6 (1-210)||(32352222-32352431)
chr6 (38-297)||(15004692-15004950)
chr6 (1-297)||(22848190-22848483)
chr6 (1-297)||(18629386-18629680)
chr6 (29-171)||(14856630-14856772)
chr6 (1-297)||(17556808-17557089)
chr6 (1-230)||(17374772-17374999)
chr6 (1-297)||(33538147-33538441)
chr6 (139-297)||(17856234-17856391)
chr6 (1-230)||(17083043-17083269)
chr6 (1-167)||(29605625-29605790)
chr6 (139-255)||(18733218-18733334)
chr6 (8-67)||(19672468-19672527)
chr6 (1-179)||(22361662-22361837)
chr6 (244-297)||(32352426-32352479)
chr6 (1-229)||(21623343-21623571)
chr6 (2-140)||(16887726-16887863)
chr6 (1-50)||(25651412-25651461)
chr6 (7-179)||(35135908-35136079)
chr6 (1-81)||(18381675-18381755)
chr6 (52-297)||(25654350-25654593)
chr6 (7-78)||(33324873-33324944)
chr6 (8-72)||(18399120-18399184)
chr6 (8-58)||(28195108-28195158)
chr6 (260-297)||(14856516-14856553)
chr6 (236-297)||(29605800-29605860)
chr6 (1-33)||(29160343-29160375)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (1-294)||(7454-7747)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (1-297)||(18041308-18041604)
chr8 (1-296)||(33172403-33172695)
chr8 (1-297)||(24552346-24552642)
chr8 (1-297)||(22496984-22497281)
chr8 (1-297)||(45558714-45559009)
chr8 (1-297)||(45464904-45465198)
chr8 (1-297)||(16002173-16002469)
chr8 (10-297)||(22887945-22888233)
chr8 (1-297)||(18261250-18261543)
chr8 (1-297)||(27232869-27233162)
chr8 (10-247)||(19331143-19331380)
chr8 (1-297)||(38635426-38635720)
chr8 (87-297)||(24239875-24240086)
chr8 (11-297)||(17502346-17502632)
chr8 (10-258)||(22314255-22314504)
chr8 (1-297)||(5854789-5855083)
chr8 (10-258)||(20175587-20175837)
chr8 (10-258)||(20220314-20220564)
chr8 (1-297)||(15933473-15933768)
chr8 (134-297)||(31590310-31590473)
chr8 (1-297)||(18118064-18118361)
chr8 (1-179)||(22742939-22743116)
chr8 (1-297)||(26011669-26011960)
chr8 (90-297)||(23218141-23218349)
chr8 (1-297)||(33528600-33528895)
chr8 (42-241)||(22723393-22723594)
chr8 (142-297)||(4234397-4234551)
chr8 (2-297)||(29306593-29306890)
chr8 (1-179)||(33610949-33611125)
chr8 (1-142)||(21198084-21198224)
chr8 (1-179)||(17285379-17285557)
chr8 (202-297)||(22745110-22745204)
chr8 (1-126)||(23149954-23150078)
chr8 (1-117)||(23151790-23151905)
chr8 (8-179)||(23837380-23837550)
chr8 (63-171)||(22366232-22366342)
chr8 (1-79)||(23158336-23158414)
chr8 (149-247)||(37652242-37652340)
chr8 (1-79)||(37653610-37653688)
chr8 (1-78)||(25296333-25296410)
chr8 (1-78)||(25758353-25758430)
chr8 (2-78)||(23226071-23226147)
chr8 (8-75)||(22981455-22981522)
chr8 (1-179)||(15969996-15970171)
chr8 (87-148)||(31017704-31017767)
chr8 (8-127)||(38533831-38533949)
chr8 (260-297)||(19331104-19331141)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-297)||(8267504-8267800)
chr7 (1-297)||(46474177-46474474)
chr7 (1-297)||(33559822-33560118)
chr7 (1-297)||(9319340-9319635)
chr7 (1-297)||(45149759-45150056)
chr7 (17-297)||(9250630-9250909)
chr7 (1-297)||(9723581-9723879)
chr7 (1-297)||(13448603-13448899)
chr7 (1-297)||(28390487-28390771)
chr7 (1-297)||(4446387-4446684)
chr7 (1-297)||(38424394-38424688)
chr7 (1-297)||(4438958-4439255)
chr7 (1-297)||(8563122-8563419)
chr7 (1-297)||(9611483-9611778)
chr7 (1-297)||(9839054-9839349)
chr7 (1-297)||(31501348-31501641)
chr7 (1-250)||(28722285-28722533)
chr7 (139-297)||(18079273-18079430)
chr7 (1-250)||(14935535-14935785)
chr7 (1-250)||(15363128-15363378)
chr7 (10-258)||(44304826-44305076)
chr7 (145-297)||(13352272-13352424)
chr7 (1-297)||(48356819-48357113)
chr7 (1-297)||(20583333-20583626)
chr7 (1-226)||(15358972-15359195)
chr7 (1-297)||(4484902-4485188)
chr7 (1-297)||(34240984-34241279)
chr7 (1-297)||(16914705-16915000)
chr7 (142-297)||(39285953-39286108)
chr7 (88-297)||(16383945-16384155)
chr7 (93-297)||(14942269-14942472)
chr7 (93-297)||(15369862-15370065)
chr7 (1-250)||(15977670-15977921)
chr7 (5-84)||(17947581-17947660)
chr7 (108-258)||(21537611-21537761)
chr7 (142-225)||(21675389-21675472)
chr7 (62-253)||(19070098-19070291)
chr7 (1-168)||(14271806-14271971)
chr7 (1-179)||(17223832-17224010)
chr7 (10-82)||(14940936-14941008)
chr7 (10-82)||(15368529-15368601)
chr7 (1-72)||(13377704-13377775)
chr7 (1-123)||(39291467-39291589)
chr7 (12-45)||(17947546-17947579)
chr7 (10-79)||(17984750-17984819)
chr7 (1-58)||(49047689-49047746)
chr7 (8-179)||(13274959-13275127)
chr7 (207-296)||(17984616-17984706)
chr7 (89-179)||(25124391-25124480)
chr7 (42-127)||(16569952-16570036)
chr7 (42-127)||(16595626-16595710)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (1-297)||(21109925-21110221)
chr5 (1-297)||(19873936-19874233)
chr5 (4-297)||(23234258-23234554)
chr5 (1-297)||(16835074-16835371)
chr5 (1-297)||(26559592-26559887)
chr5 (1-297)||(23417417-23417713)
chr5 (23-297)||(5621571-5621844)
chr5 (1-293)||(11763283-11763576)
chr5 (1-297)||(29918140-29918435)
chr5 (10-250)||(6456805-6457044)
chr5 (1-297)||(37983539-37983834)
chr5 (5-295)||(24084256-24084534)
chr5 (1-253)||(21617191-21617442)
chr5 (1-218)||(22885817-22886022)
chr5 (1-297)||(21222387-21222680)
chr5 (28-297)||(24225124-24225391)
chr5 (1-179)||(19862384-19862561)
chr5 (1-179)||(21310605-21310781)
chr5 (1-179)||(21297071-21297247)
chr5 (2-75)||(23981514-23981587)
chr5 (1-117)||(432638-432753)
chr5 (8-126)||(3674044-3674161)
chr5 (1-58)||(5450858-5450915)
chr5 (1-126)||(28902366-28902490)
chr5 (1-126)||(28938761-28938885)
chr5 (1-117)||(32966106-32966221)
chr5 (10-179)||(16595691-16595858)
chr5 (1-36)||(7728595-7728630)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (1-297)||(54398558-54398853)
chr4 (1-297)||(47468125-47468420)
chr4 (1-297)||(50219720-50220012)
chr4 (1-297)||(13589848-13590146)
chr4 (1-297)||(13442453-13442748)
chr4 (1-297)||(40904708-40905006)
chr4 (1-297)||(41916520-41916798)
chr4 (1-155)||(18238075-18238229)
chr4 (139-293)||(10237048-10237202)
chr4 (11-297)||(12133384-12133671)
chr4 (1-297)||(15013062-15013354)
chr4 (1-297)||(38764884-38765177)
chr4 (20-297)||(54363068-54363348)
chr4 (151-297)||(18235976-18236122)
chr4 (1-297)||(41256147-41256441)
chr4 (1-297)||(7964490-7964784)
chr4 (142-297)||(19559676-19559831)
chr4 (105-295)||(28428029-28428219)
chr4 (20-297)||(15213398-15213678)
chr4 (142-297)||(49072000-49072155)
chr4 (1-297)||(18276609-18276903)
chr4 (1-222)||(7185697-7185916)
chr4 (20-224)||(17375155-17375358)
chr4 (1-73)||(47535065-47535137)
chr4 (87-224)||(17372921-17373057)
chr4 (221-297)||(24238012-24238088)
chr4 (3-179)||(13809407-13809580)
chr4 (1-182)||(21417482-21417664)
chr4 (8-179)||(52265405-52265573)
chr4 (1-126)||(15045003-15045127)
chr4 (1-179)||(14901407-14901582)
chr4 (1-58)||(15109364-15109421)
chr4 (115-253)||(47534901-47535040)
chr4 (1-79)||(37957019-37957097)
chr4 (260-293)||(10374964-10374997)
chr4 (90-171)||(34177552-34177631)
chr4 (1-58)||(41165961-41166018)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-297)||(5767946-5768241)
chr1 (1-297)||(40436044-40436341)
chr1 (1-297)||(25094034-25094328)
chr1 (1-297)||(20194200-20194498)
chr1 (1-297)||(33397527-33397817)
chr1 (33-297)||(76194-76458)
chr1 (1-297)||(52400806-52401100)
chr1 (1-297)||(49997059-49997353)
chr1 (1-297)||(21195189-21195483)
chr1 (139-297)||(20822937-20823095)
chr1 (139-295)||(20836741-20836897)
chr1 (62-297)||(18852493-18852729)
chr1 (1-247)||(8537737-8537982)
chr1 (1-247)||(8602976-8603221)
chr1 (1-297)||(17609103-17609398)
chr1 (5-297)||(37233638-37233928)
chr1 (1-282)||(20177350-20177632)
chr1 (9-179)||(13376754-13376923)
chr1 (2-297)||(22143139-22143432)
chr1 (1-127)||(19603272-19603397)
chr1 (1-126)||(16656813-16656937)
chr1 (57-182)||(21978003-21978130)
chr1 (1-72)||(38033675-38033746)
chr1 (1-58)||(20955454-20955511)
chr1 (1-177)||(22829324-22829497)
chr1 (1-72)||(27674971-27675042)
chr1 (1-72)||(36356294-36356365)
chr1 (5-126)||(16646091-16646211)
chr1 (1-58)||(51627679-51627736)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (1-297)||(43427291-43427588)
chr3 (1-297)||(10913061-10913356)
chr3 (9-297)||(38375472-38375760)
chr3 (1-297)||(8605000-8605295)
chr3 (1-297)||(41661740-41662035)
chr3 (23-297)||(21166858-21167131)
chr3 (20-297)||(17758384-17758662)
chr3 (20-297)||(19059704-19059982)
chr3 (112-297)||(31411415-31411599)
chr3 (1-297)||(14814542-14814837)
chr3 (1-297)||(4161983-4162277)
chr3 (1-171)||(50313362-50313532)
chr3 (81-297)||(11638553-11638769)
chr3 (38-297)||(25103767-25104028)
chr3 (1-119)||(31412287-31412405)
chr3 (1-297)||(33368706-33368999)
chr3 (87-297)||(40038706-40038917)
chr3 (7-191)||(11515373-11515556)
chr3 (1-294)||(12538849-12539141)
chr3 (1-218)||(13301326-13301541)
chr3 (1-218)||(13311982-13312197)
chr3 (176-297)||(50313564-50313686)
chr3 (1-179)||(11402765-11402943)
chr3 (1-179)||(11882115-11882290)
chr3 (10-297)||(37915069-37915356)
chr3 (14-199)||(17393622-17393808)
chr3 (132-297)||(6224863-6225027)
chr3 (1-117)||(15517806-15517921)
chr3 (1-179)||(12953139-12953317)
chr3 (1-126)||(9590702-9590826)
chr3 (1-73)||(6228625-6228697)
chr3 (1-297)||(3576215-3576510)
chr3 (1-255)||(17191716-17191970)
chr3 (1-294)||(18970096-18970390)
chr3 (1-253)||(17204856-17205108)
chr3 (1-101)||(4145787-4145885)
chr3 (1-81)||(47784758-47784838)
chr3 (1-58)||(34560074-34560131)
chr3 (206-293)||(17586711-17586797)
chr3 (1-179)||(48421752-48421928)
chr3 (1-126)||(39656701-39656825)
chr3 (1-72)||(30207391-30207462)
chr3 (92-179)||(34560133-34560219)
chr3 (1-72)||(17139683-17139754)
chr3 (2-78)||(14080685-14080761)
chr3 (89-179)||(51961033-51961122)
chr3 (1-75)||(15876243-15876317)
chr3 (11-72)||(14059214-14059275)
chr3 (8-72)||(16880305-16880369)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-296)||(9636920-9637214)
chr2 (28-297)||(6094888-6095156)
chr2 (1-297)||(24277936-24278231)
chr2 (1-297)||(16292577-16292873)
chr2 (1-297)||(25595195-25595491)
chr2 (13-297)||(18536943-18537227)
chr2 (79-296)||(9637227-9637443)
chr2 (79-296)||(9637456-9637672)
chr2 (79-296)||(9637685-9637901)
chr2 (1-258)||(20279586-20279845)
chr2 (108-297)||(29114651-29114841)
chr2 (1-229)||(19660055-19660281)
chr2 (2-188)||(19666704-19666887)
chr2 (7-179)||(23821536-23821705)
chr2 (7-179)||(23830615-23830784)
chr2 (1-126)||(24087335-24087459)
chr2 (1-82)||(24884861-24884942)
chr2 (132-297)||(24884944-24885108)
chr2 (42-181)||(45573312-45573452)
chr2 (42-181)||(45576979-45577119)
chr2 (42-181)||(45580646-45580786)
chr2 (42-181)||(45584313-45584453)
chr2 (42-181)||(45587980-45588120)
chr2 (42-181)||(45591647-45591787)
chr2 (42-181)||(45595314-45595454)
chr2 (42-181)||(45598981-45599121)
chr2 (42-181)||(45602648-45602788)
chr2 (42-181)||(45606315-45606455)
chr2 (42-181)||(45609982-45610122)
chr2 (42-181)||(45613649-45613789)
chr2 (42-181)||(45617316-45617456)
chr2 (222-297)||(11010095-11010170)
chr2 (1-126)||(722566-722690)
chr2 (1-81)||(43646068-43646148)
chr2 (1-72)||(68167-68238)
chr2 (1-72)||(22775206-22775277)
chr2 (1-72)||(22780584-22780655)
chr2 (1-171)||(19669013-19669181)
chr2 (1-72)||(3248-3319)
chr2 (8-58)||(31146196-31146246)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-297)||(67674-67969)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (1-297)||(8665-8960)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (1-297)||(655-952)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-295)||(86532-86825)
scaffold0004 (1-297)||(27672-27967)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-297)||(37733-38028)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-297)||(25521-25820)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (5-297)||(131994-132284)
scaffold0022 (9-297)||(67732-68021)
scaffold0022 (1-126)||(102870-102994)
scaffold0022 (8-57)||(109772-109821)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (7-297)||(2547-2838)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (1-297)||(22174-22469)
scaffold0165 (1-294)||(30139-30433)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (1-297)||(14211-14506)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-297)||(33189-33473)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (1-297)||(740-1034)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-297)||(108184-108479)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-247)||(3426-3672)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (10-297)||(19710-19998)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (13-297)||(12953-13239)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (12-297)||(26769-27051)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (9-297)||(5595-5880)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (20-297)||(2561-2840)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-253)||(12551-12805)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (10-297)||(6854-7141)
scaffold0013 (1-297)||(35653-35950)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-297)||(4780-5073)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-297)||(197031-197325)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (10-258)||(55160-55409)
scaffold0084 (10-258)||(2867-3116)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-297)||(43898-44194)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-297)||(6719-7013)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (75-228)||(113963-114116)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (90-273)||(3645-3828)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-247)||(23500-23744)
scaffold0080 (1-253)||(43619-43870)
scaffold0080 (260-297)||(23461-23498)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-297)||(31195-31490)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-258)||(12416-12675)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (10-258)||(34273-34521)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (1-297)||(69632-69928)
scaffold0009 (139-258)||(244578-244697)
scaffold0009 (139-212)||(244709-244782)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-297)||(2700-2995)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (150-297)||(11303-11449)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (89-297)||(2287-2494)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-179)||(53521-53697)
scaffold0025 (1-126)||(85708-85831)
scaffold0025 (149-297)||(85836-85980)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (158-297)||(6200-6340)
scaffold0057 (1-102)||(6058-6159)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (4-297)||(96976-97267)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (61-258)||(115989-116187)
scaffold0032 (2-218)||(104480-104694)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-227)||(76693-76919)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (150-253)||(13471-13574)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (201-297)||(180657-180753)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-253)||(6845-7097)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (2-253)||(22243-22493)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (2-179)||(8186-8361)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (1-179)||(1244-1420)
scaffold0409 (1-179)||(9499-9675)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (2-127)||(1493-1617)
scaffold0456 (2-127)||(8638-8762)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-179)||(10860-11039)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (1-58)||(7577-7634)
scaffold0253 (1-58)||(17002-17059)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-81)||(6836-6916)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (216-297)||(12399-12480)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-71)||(28711-28781)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-72)||(2317-2388)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-58)||(11269-11326)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (1-58)||(1360-1416)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (2-78)||(22424-22500)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-183)||(1402-1581)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-142)||(79714-79854)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (20-162)||(1-145)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (1-100)||(1529-1628)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (9-72)||(10845-10908)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (8-179)||(3501-3669)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (7-57)||(89880-89930)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-126)||(116506-116619)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (1-58)||(469-526)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 34967042 - 34967338
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
34967042 tttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagaaaaataatcactt 34967141  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
34967142 attcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcttagca 34967241  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34967242 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 34967338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17013711 - 17013412
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17013711 tttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 17013612  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaatt-agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctag 198  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||    
17013611 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaactcccttacctcaattagcaactaatcctag 17013512  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
17013511 ccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 17013412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22462169 - 22461873
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
22462169 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagaacgaatttcaacaactaagtgaaaaataataactt 22462070  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
22462069 attcaaataagcacttatgcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattattattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagca 22461970  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
22461969 aaagcttcaattttgctcctagaatctctatcacctcttgatccttcaagc-tttatcccttttaaccctttttctccttctcttgaactttctctct 22461873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 23222926 - 23223219
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23222926 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataaaaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 23223025  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
23223026 attcaaataagcacttatgcatatgattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacacccttacctcaataagcaataatcctagc 23223125  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttct 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
23223126 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttctttaggc-tttctcccttctaacccttttgctcattctctagaactttct 23223219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29158428 - 29158163
Alignment:
29 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
29158428 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatatcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaatt 29158329  T
129 agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctc 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
29158328 agggaaaaattagaactaaatgattatgattgaaatctaaccctcttacttcaataaacaataaccatagcaaaaacttcaatttatctcctagaatctc 29158229  T
229 tatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 295  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
29158228 taccacctcttggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctct 29158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 19854330 - 19854586
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
19854330 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacagctaagagcaaaataatcactt 19854429  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||    
19854430 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattgtgattgaactctaacccccttaccttaattagcaaataatcctagc 19854529  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttc 256  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19854530 caaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttc 19854586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 23222091 - 23222388
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
23222091 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagattacgaatttcaactattaagtgtaaaataatcactt 23222190  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
23222191 attcaattaatcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatttaacacccttacctcaataaacaataatcctagc 23222290  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
23222291 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-ttcctctcttttaacccttttgctccttctctagaactttctctct 23222388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 19175332 - 19175622
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||    
19175332 caacaacaattcaattatcatcaattttatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaactgcaaaataatcactttttcaa 19175431  T
107 ttaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagc 205  Q
     ||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19175432 ataagcacatatgcatagaattagggaagaaacta-aactgagagattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagc 19175530  T
206 ttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||    
19175531 ttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttctctcttctaaccctttttctcctcctcttgaactttctctct 19175622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 21931379 - 21931675
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
21931379 tttcatcaacaacaattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatatcatcttaacaagagtacaaatttcaacttctaagtgcaaaataatcactt 21931478  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
21931479 attcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaacta-aactaggagattatgattgaaatctaacccccttacctcagtaagcaataatcctagc 21931577  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
21931578 aaaagcttcaatttagctcctagaatatctatcacctcttggttcttcacgc-tttctcccttctaatccttttgctccttctcttgaactttctctct 21931675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31467662 - 31467379
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
31467662 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataataagagcatgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaat 31467563  T
108 taagcacttaagcatacaattagg-gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||           
31467562 taagcacttaagcatacaattaggaaaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagc------- 31467470  T
207 tca-atttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| | ||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
31467469 tcagacttagctcctagaatcaccaccacctcttagttcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgtactttctctct 31467379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16136438 - 16136678
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16136438 tttcatcaaaaactattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatattatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 16136537  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattaggga-aaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
16136538 attcaaataagcacttatgcatagaattagggatgaaacta-aactaagagattatcattgaaatctaactcccttacctcaataagcaataatcctagc 16136636  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 241  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
16136637 aaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttgg 16136678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22585626 - 22585330
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||    
22585626 tttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcactt 22585527  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
22585526 attcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagc 22585427  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
22585426 aaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-ttttctcccttctaacccttttcatcttctcttgaactttctctct 22585330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22590457 - 22590161
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||    
22590457 tttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcactt 22590358  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
22590357 attcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagc 22590258  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
22590257 aaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-ttttctcccttctaacccttttcatcttctcttgaactttctctct 22590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15889644 - 15889491
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15889644 aactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataattcttgcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacatcttgg 15889545  T
242 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctc 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
15889544 gtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttttctcttctcttgaactttctctc 15889491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 32352222 - 32352431
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32352222 tttcaccataaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaatataccatcatagaaagagcatgaatttcaacaactatgagcaaaataatcactt 32352321  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||  ||||     
32352322 attcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacctcctcgcctcaattagcaataatcatagcc 32352421  T
201 aaagcttcaa 210  Q
    ||||||||||    
32352422 aaagcttcaa 32352431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15004950 - 15004692
Alignment:
38 tactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaa 137  Q
    |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  || ||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||     
15004950 tactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaag 15004851  T
138 ttac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacct 236  Q
      || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
15004850 aaactaactaagtgattatgcttgaaatttaaccc-cttacctcaattagcaattatcctagcaaaaacttcaatttagctcctaaaatctctatcacct 15004752  T
237 cttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15004751 cttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 15004692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 22848190 - 22848483
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||    
22848190 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaactatga--acaataatcaatt 22848287  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||| ||  ||||  ||| ||||      
22848288 attcaactaagcacttaaacatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaattcccttaccttaaatagcacaaatcctagtc 22848387  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||    
22848388 caagcttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaacccttttccccttctcttgcaccttctctct 22848483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18629680 - 18629386
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
18629680 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 18629582  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||  |   ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||||    
18629581 attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcctagc 18629483  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||| ||| ||| |||| || ||| |||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18629482 ccaagcttcactttacctcctaggatctataccacttcttgaatcttcaaacttct-tcccctcaaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 18629386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14856772 - 14856630
Alignment:
29 aatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaatt 128  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||    
14856772 aatttcttgtattcaaacatatcgtcgtaacaagagcacaaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaaacactcaaacatgcaatt 14856673  T
129 agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 171  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
14856672 aaggaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaaccc 14856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17557089 - 17556808
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||    
17557089 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgca-tcaaacatatcatcataattagagcacgaattt-aacaactatgaac-aaataatcaatt 17556993  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||   ||| |||||     
17556992 attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattac-actagatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagctcaaatcctagcc 17556894  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||| ||| |||| |||  | ||| |||| |||||           || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17556893 taagcttcactttatctcctagattcttcaccacttcttaggtct-----------tctcttctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 17556808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17374999 - 17374772
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |||||    
17374999 tttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcataata--cactt 17374902  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    || | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
17374901 atctcaattaagcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaaccc-cttacctcaataaacaataatcctag 17374804  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctcta 230  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||    
17374803 ccaaagcttcaattaagctcatagaatctcta 17374772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33538441 - 33538147
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
33538441 tttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 33538344  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||  |||| |||||    
33538343 actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttcgcacaaattcctagc 33538245  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
33538244 ccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatctttaagcttcttctcc--tctaaccctttttcatcttctcttgcactttctctct 33538147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17856391 - 17856234
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
17856391 tacaactaagagattatgattgaaatctaaccccct-acctcaataaacaataatcctaacaaaaacttcaattaagctcctagaatctctatcacctct 17856293  T
239 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| || |||||| |||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
17856292 tggttcatcaagc-tttccctcttataaccatttttctccttctcttgaactttctctct 17856234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17083269 - 17083043
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| || | || |||||||||    
17083269 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatgaac-aattaatcactt 17083172  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||  | |||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||| |||||    
17083171 attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgatta-aaatgaattctaacccccttaccttagttagcaattaatcctagc 17083074  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctcta 230  Q
      |||||||| |||||||| ||| |||||||    
17083073 cgaagcttcactttagctcctaggatctcta 17083043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 29605625 - 29605790
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
29605625 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatt-catgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaactatgaac-aaataatcactt 29605722  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaac-taagtgattatgattgaaatcta 167  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || |||  || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
29605723 attcaattaagcacttaatcatgcatttaatgagaaattacaacttaattgattatggttgaattcta 29605790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 18733218 - 18733334
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||    
18733218 tacaagtaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataaggaataatcctagcaaaggcttcaattaagctcctagaatctctagctcctct 18733317  T
239 tgggtcttcaagctttt 255  Q
    ||| |||||||| ||||    
18733318 tggttcttcaagttttt 18733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 19672468 - 19672527
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcac 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
19672468 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataataagagcac 19672527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22361837 - 22361662
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||| || | || |||||| ||    
22361837 tttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaac-aattaatcattt 22361739  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
      | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
22361738 gctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattacta--aaatgattatgattgaattctaacccccttacct 22361662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 32352426 - 32352479
Alignment:
244 cttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32352426 cttcaagcttttctcccttctaaccattttcctattctcttgaactttctctct 32352479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21623343 - 21623571
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||  || || | || |||||| ||    
21623343 tttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaac-aattaatcaatt 21623441  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||  |||||||  |  || ||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
21623442 actcaattaagcacttattcatacaacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagc 21623541  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctct 229  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||    
21623542 ccaagcttcactttagctcctaggatctct 21623571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16887863 - 16887726
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||    
16887863 ttcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattta 16887765  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaatta 140  Q
    || |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||    
16887764 ttcaattaatcacttattcatacaataattgaaaaatta 16887726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 25651412 - 25651461
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatat 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
25651412 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat 25651461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35136079 - 35135908
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||| |||    
35136079 caacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcaattatctaa 35135981  T
107 ttaagcacttaagcatacaatta-gggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||| ||||||  |||||||| |  | ||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
35135980 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 35135908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18381755 - 18381675
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 81  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
18381755 tttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaact 18381675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654593
Alignment:
52 atcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtga 151  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||  ||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||    
25654350 atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaat-taatcacctactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattaca-ctaaatga 25654447  T
152 ttatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattc-tagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    |||  |   || |||||||| ||||||| ||| ||||   |||| ||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||    
25654448 ttagcaca-aattctaacccccttaccttaattagcacagattcctagcgcaagtttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 25654546  T
251 ctt-ttctcccttctaaccatttt-cctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
25654547 cttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 25654593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 33324873 - 33324944
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||    
33324873 caacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaaca 33324944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 18399120 - 18399184
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
18399120 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28195158 - 28195108
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||    
28195158 aacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa 28195108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14856553 - 14856516
Alignment:
260 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
14856553 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 14856516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Original strand, 29605800 - 29605860
Alignment:
236 tcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
29605800 tcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaactcttttcctcttctcttgcactttctctct 29605860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 29160375 - 29160343
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 33  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
29160375 tttcactaacaacaattcaattatcaccaattt 29160343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7747 - 7454
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
7747 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaagaacaaaataatcactt 7648  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||    
7647 attcaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaacccctttcctcaataagcaataatcctagca 7548  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctc 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
7547 aaagcttcaatttagctcttagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcctgaactttctc 7454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18041604 - 18041308
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
18041604 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtactcaaacatatcgtcataacaagagcacgaatttcagcaactaagagcaaaataatcactt 18041505  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
18041504 attcaattaagcacttaagcatacaattagggaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaaccccttacctcaataagcaataatcctagca 18041405  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
18041404 aaagcttcaatttaactcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttcttttgaactttctctct 18041308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 33172403 - 33172695
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
33172403 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaatttcaacaacta-gagcaaaataatcactt 33172501  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
33172502 attcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-ttacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagca 33172600  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctc 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
33172601 aaagcttcaatttagcttttagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctc 33172695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24552642 - 24552346
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
24552642 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaaaagcaaaataatcactt 24552543  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| || |||    
24552542 attcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaacaaagtgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattaacaataatccttgca 24552443  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
24552442 aaaacttcaatttagctcctagaatctttatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttttctcttctcttgaactttctctct 24552346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22497281 - 22496984
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22497281 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 22497182  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
22497181 attcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctgacccccttacctcaataagcaataatcctagc 22497082  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
22497081 aaaagtttcaatttagctcatagaatctctatcacatcttggttcttcaagc-tctctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 22496984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45559009 - 45558714
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
45559009 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcatgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 45558910  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||     
45558909 attcaaataatcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcaataatcatagcc 45558810  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
45558809 aaagcttcaatttttctcctagaatctttatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 45558714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45465198 - 45464904
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
45465198 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaatttcaacaacta--agcaaaataatcactt 45465101  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
45465100 actcaattaagcatttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagc 45465001  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
45465000 caaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 45464904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 16002173 - 16002469
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16002173 tttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcatgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 16002272  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
16002273 attcaaataagcacttatgcatagaatttgggaagaaatta-agctaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagc 16002371  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
16002372 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttagttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 16002469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 22887945 - 22888233
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatta 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
22887945 caacaattcaaatatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaata 22888044  T
110 agcacttaagcatacaattagggaaa--aattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22888045 agcacttatgcataaaattaggggaagaaatta-aactaaaggattatgaataaaatctaacccccttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 22888143  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
22888144 caatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactctctctct 22888233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18261543 - 18261250
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
18261543 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaac-aaagaatcactt 18261445  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
18261444 attcaattaaacacttaatcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaaatctaaccc-cttaccttagttagcaaaaatcctagct 18261347  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttcta-accattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||    
18261346 caagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctacccctttttcctcttctcttgcactttctctct 18261250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27233162 - 27232869
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
27233162 tttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaac-taataatcactt 27233064  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
27233063 attcaattaagcacttaaccatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccc-cttaccttagttagcaaaaatcctagcc 27232965  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
27232964 caaacttcaatttatctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttccaaccattttcctcttttcttgcactttctctct 27232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19331380 - 19331143
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||    
19331380 caacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatagtcataacaagagcacgaatttcaacaaccaagagaaaaataatcacttattcaaata 19331281  T
110 agcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | || || ||| |||||  ||||||||    
19331280 agcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacattagttagaaaaaatcctagctcaagcttca 19331181  T
210 atttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
    ||||| ||| ||||||| | | |||||| | |||||||    
19331180 atttacctcctagaatcaccaccacctcctaggtcttc 19331143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38635720 - 38635426
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||    
38635720 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaac-aaagattcactt 38635622  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||| || ||| |||||    
38635621 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaaatcctagc 38635522  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
38635521 caaagcttcactttaactcatagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaaccctttt-ctcttctcttgcactttctctct 38635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 297
Target Start/End: Original strand, 24239875 - 24240086
Alignment:
87 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
24239875 caaaataatcacttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaacccccttacctcaata 24239973  T
185 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctct 283  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
24239974 agcaataatcccagcaaaagcttcaatttagctccttgaatctctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctct 24240072  T
284 tgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||    
24240073 tgaactttctctct 24240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 297
Target Start/End: Original strand, 17502346 - 17502632
Alignment:
11 aacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaa 110  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||  | |  |  || |||||||||||||| || |||    
17502346 aacaattcaatcatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataa 17502445  T
111 gcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttca 209  Q
    ||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
17502446 gcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttatctcaattagcaataatcctagcaaaagcttca 17502545  T
210 atttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
17502546 atttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaatccttttcctcatctcttgaactttctctct 17502632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 22314255 - 22314504
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
22314255 caacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 22314354  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
22314355 aagcacttatgcatagaattagggaaaaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacgcccttacctcaataagcaataatcctagccaaagctt 22314453  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
22314454 caatttagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctc 22314504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 5854789 - 5855083
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
5854789 tttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 5854887  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||  | | |||||     
5854888 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaattagcacaattcctagcc 5854986  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
5854987 caagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 5855083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20175837 - 20175587
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
20175837 caacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 20175738  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
20175737 aagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagcaataatcctagcaaaagctt 20175638  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
20175637 caagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 20175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20220564 - 20220314
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
20220564 caacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 20220465  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
20220464 aagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagcaataatcctagcaaaagctt 20220365  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
20220364 caagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 20220314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 15933473 - 15933768
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||    
15933473 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 15933571  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||  | || |||||    
15933572 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaattagcacaatttcctagc 15933670  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      | |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
15933671 ccaggcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 15933768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 31590310 - 31590473
Alignment:
134 aaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
31590310 aaaattacaactaattgattatgattgaactctaacccccttatctcaattagcaaataatccttgccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatc 31590409  T
233 acctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
31590410 acctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 31590473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18118361 - 18118064
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||    
18118361 tttcatcaacaacaattcaattatcatcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagttcacaataatcactt 18118262  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    |||| || |||||| ||   |||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||    
18118261 atttcaaataagcatttttacataaaattagggaagagatta-aactaagagattatgaatgaaaactagcccccttacctcaactagaaataatcctag 18118163  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||  | |||||||||||||||||||||    
18118162 caaaagcttcaattaagctcatagaatctctatcacctcttgattcttcaagc-tttctcccttttaacacttttgttccttctcttgaactttctctct 18118064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 22742939 - 22743116
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
22742939 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaacaactatgaac-aaataatcaatt 22743037  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
22743038 attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacct 22743116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 26011669 - 26011960
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
26011669 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 26011767  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||  | | |||||     
26011768 actcaattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaattagcacaattcctagcc 26011863  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||| |||||  ||||||||||| | || | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
26011864 caagcttcactttacctcctatgatctctaccacttcttgaatcttcaagcttctttctc-tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 26011960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 297
Target Start/End: Original strand, 23218141 - 23218349
Alignment:
90 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccc-tcttacctcaataagc 187  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||    
23218141 aataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaaccccttttacctcaattagc 23218240  T
188 aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
23218241 aataatcctagcaaaagcttcaatttagcgcctagaatctctaacatctattgggtcttcacgc-tttatcccttctaaccatttttctcttctcttgaa 23218339  T
288 ctttctctct 297  Q
    ||||||||||    
23218340 ctttctctct 23218349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 33528600 - 33528895
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||| | || |||||||||    
33528600 tttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaac-aattaatcactt 33528698  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||||    
33528699 attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcctagc 33528797  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      || ||||| |||||||| ||| |||||||  || |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||    
33528798 tcaaacttcactttagctcctaggatctctactacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttcttttgcactttctctct 33528895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 22723393 - 22723594
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-t 139  Q
    |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||| | ||  |    
22723393 caaacattacatcaaaacataagcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatataattagggtagaagat 22723492  T
140 acaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctctt 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
22723493 acaactaaatgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagcttctagaatctctatcacctctt 22723592  T
240 gg 241  Q
    ||    
22723593 gg 22723594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 4234397 - 4234551
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||| ||||     
4234397 aactaagtgattatgcttgaaatctaacgcccttacctcaattagcaataaccctagcaaaagcttcaatttagttcctaaaacctttatcaccgcttga 4234496  T
242 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
4234497 gtattcaaac-tttctcccttctaacccttttcctgttctcttgaactttctctct 4234551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 29306593 - 29306890
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||||||||| | |||| ||| || | ||  |||||||||    
29306593 ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctatgaac-aatcaatcactta 29306691  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    || |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  |||| |||||    
29306692 ttcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccctcttaccttaattagcacaaattcctagc 29306791  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctccct-tctaacc--attttcctcttctcttgaactttctctc 296  Q
      |||||||| |||||||| ||  |||||||  || |||||  |||||||||  |||||| | |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
29306792 ccaagcttcagtttagctcctaagatctctacgacttcttgaatcttcaagc--ttctccttctctaacccatttttcctcttctcttgcactttctctc 29306889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33611125 - 33610949
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||    
33611125 tttcaccaacaacaatctaatgatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcatagttagagcacaaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 33611027  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
33611026 attcaattaatcacttaaacatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 33610949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21198224 - 21198084
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || | || |||||| ||    
21198224 tttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaac-aattaatcaatt 21198126  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattaca 142  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
21198125 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattaca 21198084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 17285379 - 17285557
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || || ||| ||    
17285379 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattattcaatt 17285477  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||| |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
17285478 attcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 17285557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Original strand, 22745110 - 22745204
Alignment:
202 aagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
22745110 aagcttcaatttagctcttagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 22745204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23149954 - 23150078
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
23149954 tttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaattatgaac-aattaatcattt 23150052  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
23150053 actcaattaagcacttactcatacaa 23150078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23151905 - 23151790
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
23151905 tttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac-aattaatcattt 23151807  T
101 atttaattaagcactta 117  Q
    | | |||||||||||||    
23151806 actgaattaagcactta 23151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 23837380 - 23837550
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||| || | || |||||| ||| | |||    
23837380 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaac-aattaatcatttactcaat 23837478  T
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||||||||||  |||||||  |  |||||  || |   || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
23837479 taagcacttattcatacaacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 23837550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Original strand, 22366232 - 22366342
Alignment:
63 agcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattg 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
22366232 agcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatataattagggtagaagctacaactaagtgattatgattg 22366331  T
161 aaatctaaccc 171  Q
    |||||||||||    
22366332 aaatctaaccc 22366342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 23158336 - 23158414
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||    
23158336 tttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaa 23158414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37652340 - 37652242
Alignment:
149 tgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||    
37652340 tgattatgattgaattctaacccccttaccttaattaacacaaattctagcacaagcttcactttagatcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 37652242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 37653688 - 37653610
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 79  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||    
37653688 tttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaaagcacgaatttcaacaa 37653610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 25296333 - 25296410
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
25296333 tttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaaca 25296410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 25758353 - 25758430
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
25758353 tttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaaca 25758430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23226147 - 23226071
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||    
23226147 ttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaaca 23226071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Original strand, 22981455 - 22981522
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
22981455 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttca 22981522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 15969996 - 15970171
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
15969996 tttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttctttcgtacaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaac-aattaatcattt 15970094  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | ||||||||| |||  |||||||| |  |||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||    
15970095 actcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattgc-actaaatgattatga-tgaattccaacccccttacct 15970171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31017767 - 31017704
Alignment:
87 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattaggg-aaaaattacaactaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||    
31017767 caaaataatcacttattttaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagttacaactaag 31017704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 38533831 - 38533949
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   ||| |||||||  ||||| || || | || || ||| ||| |||||    
38533831 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattatgaac-aattagtcaattacttaat 38533929  T
108 taagcacttaagcatacaat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||    
38533930 taagcacttattcatacaat 38533949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19331141 - 19331104
Alignment:
260 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
19331141 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 19331104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8267800 - 8267504
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
8267800 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 8267701  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
8267700 attcaaataagcacttatgcatacaattagggaaaaattacaactaagtggttatgattgaaatctaacctctttacctcaataagcaataatcctagca 8267601  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
8267600 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 8267504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 46474177 - 46474474
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
46474177 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagtaaaataatcactt 46474276  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    | | |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
46474277 actcaattaaacacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccattatctcaataagcaataatcctagc 46474376  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
46474377 aaaagctacaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttttctcttctcttgaactttctctct 46474474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 33559822 - 33560118
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
33559822 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattttaacatatcatcatagcaagaggacgaatttcaacagctatgaacaaaataatcactt 33559921  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||     
33559922 attcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataaccctagcc 33560021  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
33560022 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 33560118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9319635 - 9319340
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
9319635 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagcgcaaaatgatcactt 9319536  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||    
9319535 attcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacctccttacctcaattaacaataatcgtagca 9319436  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
9319435 aaatcttcaatttagcttctagaatctctatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttctctcttctcttgaactttctctct 9319340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 45149759 - 45150056
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
45149759 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaacaatcactt 45149858  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
45149859 attcaaataagcacttgtgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgaatgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagc 45149958  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
45149959 aaaaacttcaatttagctcgtagaatctctatcacttcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 45150056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 9250630 - 9250909
Alignment:
17 tcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcactt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
9250630 tcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagcgcaaaatgatcacttattcaattaagcactt 9250729  T
117 aagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||    
9250730 aagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacctccttacctcaattaacaataatcgtagcaaaatcttcaatttagc 9250829  T
217 tcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
9250830 ttctagaatctctatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttctctcttctcttgaactttctctct 9250909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9723879 - 9723581
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
9723879 tttcatcaacatcaattgaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaattaagtgcaaaataatcactt 9723780  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
9723779 attcaaataagcacttatgcatataattagggaaaatattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccccttacctcaataagcaataatcctag 9723680  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
9723679 caaaagcttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccatttgctccttctcttgaactttctctct 9723581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13448899 - 13448603
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13448899 tttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatgataacaagagcatgaatttcaacaactaagagtaaaataatcactt 13448800  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag-caataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||    
13448799 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaacttattgattatggttgaactctaacccccttacctcaattagtaaataatcctagc 13448700  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
13448699 caaagcttcaatttaactcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 13448603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 28390487 - 28390771
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28390487 tttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttgaacaactaagagcaaaataatcactt 28390586  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||             ||||||||||| ||| |||||| ||| |    
28390587 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgatt------------ccttacctcaattagcaaataatcctacc 28390674  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
28390675 gaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcatctcttgagtcttcaaacttttctcccttctaaccatttt-ctcttctcttgaactttctctct 28390771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 4446387 - 4446684
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt-caacaactaagagcaaaataatcact 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |    
4446387 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcacgtattttcaacaattaagagcaacataatcagt 4446486  T
100 tatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    |||  |||||||||||||| |||   ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||    
4446487 tatccaattaagcacttaatcatgatattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttacctccattagcaacaatcctagc 4446586  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
4446587 caaagctttaatttagctcatagaatctctaccacctcttgtgtcttcaagcttttctcttctctaacccttttcctcctctcttgaactttctctct 4446684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 38424394 - 38424688
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
38424394 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataaccagagcacgaatttcaacaactatgaacaaag-aatcactt 38424492  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||| ||| |||||     
38424493 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgtttatggttgaaatctaacctccttaccttagttagcaaaaatcctagcc 38424592  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
38424593 caaacttcaatttagctcctagaatctccatcacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacctttttcctcttctcttgcactttctctct 38424688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 4438958 - 4439255
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt-caacaactaagagcaaaataatcact 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
4438958 tttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatattatcataactatagcacgaattttcagcagttaagagcaacataatcact 4439057  T
100 tatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    |||  ||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||||    
4439058 tatccaattaagcactcaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaactcccttgcctcaattagcaacaatcctagc 4439157  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
4439158 caaagcttcaatttagctcctagaatctctagcacctcttgtgtcttcaagcttttctcttcactaacctttttcctcttctcttgaactttctctct 4439255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8563419 - 8563122
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
8563419 tttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactgagttcacaataatcactt 8563320  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    || | || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
8563319 atatcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaaata-aactaagagattatgaatgaaatataacccccttacctcaataagcaataatcctag 8563221  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||||    
8563220 caaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacgtcttggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgctccttcttttgagttttctctct 8563122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 9611483 - 9611778
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || ||||||| |    
9611483 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacgt 9611581  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||    
9611582 actcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaattagcaaaaattcctcgc 9611680  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
9611681 cgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 9611778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 9839054 - 9839349
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || ||||||| |    
9839054 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacgt 9839152  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||    
9839153 actcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaattagcaaaaattcctcgc 9839251  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
9839252 cgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 9839349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 31501348 - 31501641
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||    
31501348 tttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaa-taatcactt 31501446  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
31501447 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaa-ttacaactaattgattattgttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcc 31501545  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
31501546 caagcttcaatttagctcttagaatgtccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaactcttttcctcttctcttgcactttctctct 31501641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28722285 - 28722533
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||    
28722285 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaac-aaagattcactt 28722383  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | | ||||||| | |||     
28722384 attcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttaacaataatccaagcc 28722483  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
     || ||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||    
28722484 caaacttcactttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag 28722533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18079430 - 18079273
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
18079430 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaaccttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 18079331  T
239 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
18079330 tggttcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgaccttctcttgaactttctctct 18079273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14935535 - 14935785
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || | ||| | ||||||    
14935535 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaacaactgtga-ccaaagattcactt 14935633  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac--cctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||| ||||| ||| ||||    
14935634 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacggccccttaccttaattagcaaaaatcctag 14935733  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
14935734 cccaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag 14935785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 15363128 - 15363378
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || | ||| | ||||||    
15363128 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaacaactgtga-ccaaagattcactt 15363226  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaac--cctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||| ||||| ||| ||||    
15363227 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacggccccttaccttaattagcaaaaatcctag 15363326  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
15363327 cccaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag 15363378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44305076 - 44304826
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
44305076 caacaattcaattatcatcaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagtacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 44304977  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
44304976 aagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaaatgattatgattgaaatctaacccctttacttcaataagcaataatcctagcaaaagctt 44304877  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||| | ||||| || |||||||| | | |||||| |||||||| |||||||    
44304876 caagtaagctcctaaaatctctagctcatcttggttcttcaagtttttctc 44304826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Original strand, 13352272 - 13352424
Alignment:
145 taagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtc 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13352272 taagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagaaaaagctacaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtc 13352371  T
245 ttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
13352372 ttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 13352424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 48356819 - 48357113
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||    
48356819 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 48356917  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    | | ||||||||| |||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  | | |||||     
48356918 actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaattcctagcc 48357016  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
48357017 caagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttattctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 48357113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20583626 - 20583333
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||| || |||| |||||||||    
20583626 tttcatcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaatttcaacaactatgaacaaa-taatcactt 20583528  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| ||| |     
20583527 attcaattaggcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctaccc 20583428  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||| || |||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
20583427 caagctacactttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaaccctttt-atcttctcttgcactttctctct 20583333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15358972 - 15359195
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||    
15358972 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatga--acaataatcagtt 15359069  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||     
15359070 attcaactaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaatcctagcc 15359169  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatc 226  Q
     |||||||||||||| || |||||||    
15359170 caagcttcaatttagatcctagaatc 15359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 4484902 - 4485188
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
4484902 tttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatattagga-cacgaatttcaacaactatgaac-aaataatcactt 4484999  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||   ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||| | | ||||| ||| |||||     
4485000 attcaattaagcacttaatcatgatattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccctttaccttagttagcaaaaatcctagcc 4485098  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |      |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
4485099 ca------aatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttcaaacccttttccttttctcttgtactttctctct 4485188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34241279 - 34240984
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | | ||||||||| | |||||| || | || |||||||||    
34241279 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaactatgaac-aattaatcactt 34241181  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattc-tagc 199  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  ||||| || |    
34241180 actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcttaac 34241082  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
34241081 ccaagcttcactttagctcataggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 34240984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16915000 - 16914705
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
16915000 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 16914902  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||| || |  |||| |||||    
16914901 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaagttac-actaaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaattaggacaaattcctagc 16914803  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
16914802 ccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttcaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctgttctcttgcactttctctct 16914705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39286108 - 39285953
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||    
39286108 aactaagtgattatgcttgaaatcttacccccttacctcaaaaagcaataattctagccaaagcttcaattaagctcctagaatctgtagctcctcttgg 39286009  T
242 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
39286008 ttcttcaag-ttttctcccttctaacccttttactcattctcttgaactttctctct 39285953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Original strand, 16383945 - 16384155
Alignment:
88 aaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   | |    
16383945 aaaataatcacttatttcaattaagcacttacgcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattatgattgaaatctaacccccttaccttggtta 16384044  T
186 gcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttg 285  Q
    |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
16384045 gcaaaaatcctagcccaagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcttcttctcttg 16384143  T
286 aactttctctct 297  Q
     |||||||||||    
16384144 cactttctctct 16384155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 297
Target Start/End: Original strand, 14942269 - 14942472
Alignment:
93 aatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataa 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
14942269 aatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaattagcaaaaa 14942368  T
193 ttctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttc 292  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
14942369 tcctagcccaagctacaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaacccttttcctcttctcttgcactttc 14942467  T
293 tctct 297  Q
    |||||    
14942468 tctct 14942472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 297
Target Start/End: Original strand, 15369862 - 15370065
Alignment:
93 aatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataa 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
15369862 aatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaattagcaaaaa 15369961  T
193 ttctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttc 292  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||||||| | | ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
15369962 tcctagcccaagctacaatttagctcctagaatcaccaccacttcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaacccttttcctcttctcttgcactttc 15370060  T
293 tctct 297  Q
    |||||    
15370061 tctct 15370065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15977921 - 15977670
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||  | | ||  || |||||||||||    
15977921 tttcatcatcaataattcaattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcactt 15977822  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    || | ||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||    
15977821 atctcaattaagcacttatgtatagaattagagaagaagctacaactaaaatattatgattgaaatctatctcccttacttcaataagcaataatcctag 15977722  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
15977721 ccaaagcttcaattaagctcctagaatctctaactcctcttggttcttcaag 15977670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17947660 - 17947581
Alignment:
5 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaag 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
17947660 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcatcataacaagagcacgtatttcaacaactaag 17947581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21537761 - 21537611
Alignment:
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 206  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
21537761 taagcacttatgcatagaattggggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatttaacccccttacctcaataagcaataaccctagccaaagct 21537663  T
207 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
21537662 tcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctc 21537611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21675472 - 21675389
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
21675472 aactaagtgattatgattgaattctaacccccttacatcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaat 21675389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 253
Target Start/End: Original strand, 19070098 - 19070291
Alignment:
62 gagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgatt 159  Q
    |||||||||||||| ||| |||   || ||| |||| |||||| || |||||||||  ||||| |||||| |||   |||||||||||   ||||||| |    
19070098 gagcacgaatttcaccaattaaattcacaatgatcatttatttcaaataagcacttttgcatataattagagaatggattacaactaataaattatgaat 19070197  T
160 gaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
19070198 gaaatctaacccccttacctcaattggtaataatcctagcaaaaacttcaatttaactcctagaatttctatcacctcttgattcttcaagctt 19070291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14271971 - 14271806
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||| || | || |||||| ||    
14271971 tttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt-gacaactatgaac-aattaatcattt 14271874  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa 168  Q
    | | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||    
14271873 actcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaa 14271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17224010 - 17223832
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  || | || |||| | ||    
17224010 tttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaac-aattaattattt 17223912  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
17223911 actcaattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattac-actaaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 17223832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 14940936 - 14941008
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaacta 82  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
14940936 caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta 14941008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 15368529 - 15368601
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaacta 82  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
15368529 caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta 15368601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 13377704 - 13377775
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
13377704 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39291589 - 39291467
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||    
39291589 tttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcactt 39291490  T
101 atttaattaagcacttaagcata 123  Q
    ||| || |||| ||||| |||||    
39291489 attcaaataagtacttatgcata 39291467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 17947579 - 17947546
Alignment:
12 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17947579 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa 17947546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17984819 - 17984750
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 79  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
17984819 caacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaatttcaacaa 17984750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 49047746 - 49047689
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||| ||||    
49047746 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataa 49047689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 13274959 - 13275127
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||| | |||    
13274959 aacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaat 13275057  T
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||||||||||  |||||||  |  |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
13275058 taagcacttattcatacaacaattgaaaaatggcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 13275127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17984706 - 17984616
Alignment:
207 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctc-ttgaactttctctc 296  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||    
17984706 tcaattaagctcctagaatctctatcacctcttgtttcttcaag-tcttctctcttctaaccctttttttcattctctttgaactttctctc 17984616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Original strand, 25124391 - 25124480
Alignment:
89 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
25124391 aaataatcacttatttcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaagactaacccccttacct 25124480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16570036 - 16569952
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
16570036 caaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagc-aaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaat 16569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 16595626 - 16595710
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||    
16595626 caaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagc-aaataatcaattatccaattaagcacttattcatacaat 16595710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 21109925 - 21110221
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
21109925 tttcaccaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataataattt 21110024  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||     
21110025 gtttaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacctccttacctcaattagcaataatcctagcc 21110124  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
21110125 aaagcttcaatttagctcctagaatctctgtcacctcttgggtcttcaagcttttcccccttctaaccattttcctcttctcttgaattttctctct 21110221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 19873936 - 19874233
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19873936 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 19874035  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
19874036 attcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgatggaaatctaacccccttacctcaataaacaataatcctagc 19874135  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
19874136 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctctcttttaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 19874233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23234554 - 23234258
Alignment:
4 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23234554 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtacttaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatt 23234455  T
104 taattaagcacttaagcatacaattag----ggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
     || |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
23234454 caaataagcacttaagcatacaattagaaaaaaaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatcaaatccccttacctcaataagcaataatcctagc 23234355  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
23234354 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcgtgcttttct-tcttctaacccttttcctcttctcttggactctctctct 23234258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16835371 - 16835074
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
16835371 tttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 16835272  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |    
16835271 attcaaataagcacttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcagtaagaaataatcctaac 16835172  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
16835171 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctctcggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 16835074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26559887 - 26559592
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||    
26559887 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgattaaaataatcattt 26559788  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
26559787 attcaattaagcacttaaacatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattataattgaaatctaaccc-cttacctcaattagcaataatcctagct 26559689  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
26559688 aaaacatcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttttatcttctcttgaactttctctct 26559592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 23417417 - 23417713
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
23417417 tttcatcaacaacaattcaatcatcaccaaattcatgtactcaaacaaatcatcataacaagagcacgaatttcaacaattaagtgcaaaataatcactt 23417516  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
23417517 attcaaataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatataacccccttacctcaataagaaataatcctagc 23417615  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
23417616 aaaaacttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 23417713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5621844 - 5621571
Alignment:
23 atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5621844 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagcaaaaacacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcat 5621745  T
123 acaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatag 222  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||    
5621744 gcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaactttaacccccttacctcaattagcaataatcatagccaaagcttcaattcatctcttag 5621645  T
223 aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
5621644 aatctctatcacatcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 5621571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11763576 - 11763283
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
11763576 tttcatcaacatcaactcaattatcatcaaattcatctactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 11763477  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagg-gaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
11763476 attcaaataagcacttatgcatataattaggagaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaacccccttacctcaataagcaacaatcctag 11763378  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttct 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
11763377 caaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaaccctttttctccttctcttgaactttct 11763283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 29918140 - 29918435
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
29918140 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttcaacaactatgaacaaaa-aatcactt 29918238  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||  |  || |||||     
29918239 attcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaagttacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagttagtgaacatcctagcc 29918338  T
201 aaagcttcaatttagctcatag-aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||||||| | | |||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
29918339 caaacttcaatttagctcttggaaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaacccttttcctcttctcttgcattttctctct 29918435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 6456805 - 6457044
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatta 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
6456805 caacaattcaattatcgccaatttcatgtattcaaacgtatcttcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaaa-taatcacttattcaatta 6456903  T
110 agcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttca 209  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || | | ||||| ||| ||| |  ||||||||    
6456904 agcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttatcttagttagcaaaaatcctaacccaagcttca 6457003  T
210 atttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
6457004 atttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag 6457044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 37983539 - 37983834
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||    
37983539 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 37983637  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca-ataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||| | | |||||||    
37983638 actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaatttctagc 37983736  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||  || || |||||||||||||||| |||||||||||    
37983737 ccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttct-cctcttaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 37983834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 24084256 - 24084534
Alignment:
5 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaa-gagcaaaataatcacttatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||| ||| ||| ||| || |||| ||||||||||||    
24084256 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagggcacgaatgtcaccaattaatgaacaaa-taatcacttatt 24084354  T
104 taattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaa 203  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||| | | || || ||| |||||        
24084355 caattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaatccccttaccttagttagaaaaaatcctagc---- 24084450  T
204 gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 295  Q
             |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
24084451 -------cctagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tcttctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctct 24084534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 21617191 - 21617442
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaa-gagcaaaataatcact 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || | || ||||| ||    
21617191 tttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaac-aattaatccct 21617289  T
100 tatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  | | |||||    
21617290 tactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaattcctagc 21617388  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
      || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||    
21617389 ccaaccttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagctt 21617442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22885817 - 22886022
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || | |||| |||| ||    
22885817 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaaccatgaac-aaattatcaatt 22885915  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||           | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||     
22885916 attcaattaagcactta-----------atgaaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttacctcaattagcacaaatcctagcc 22886004  T
201 aaagcttcaatttagctc 218  Q
     |||||||||||||||||    
22886005 taagcttcaatttagctc 22886022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21222680 - 21222387
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || | || ||||||  |    
21222680 tttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaac-aattaatca-at 21222583  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||  |||| |||||    
21222582 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaataattatgattgaactctaacccccataccttaattatcaccaattcctagc 21222484  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||    
21222483 ccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttc--tctaacccttttcctcttctcttacactttttctct 21222387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24225391 - 24225124
Alignment:
28 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||| |||||||     
24225391 caatttcatatatacaaacatatcaccataattaaggcacgaaattcaacatctaagaacaat-taatcacttaatcaattaagcacttaaccatacaac 24225293  T
128 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatct 227  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| | | ||||  | | |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||    
24225292 tagtgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatct 24225194  T
228 ctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaacca-ttttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
24225193 ctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccatttttcctcttctcttgcactttctctct 24225124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19862384 - 19862561
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||||||    
19862384 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcactt 19862482  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
19862483 actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 19862561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21310781 - 21310605
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||  || || | || |||||||||    
21310781 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatgaac-aattaatcactt 21310683  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || ||||||||| |||| | |||||| |||||||    
21310682 actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattttaacccccttacct 21310605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21297247 - 21297071
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||  || || | || |||||||||    
21297247 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatgaac-aattaatcactt 21297149  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||   || | ||||||| |||| |||||||| |||||||    
21297148 actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatga-tgaattctaacccccttacct 21297071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23981587 - 23981514
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
23981587 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttca 23981514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 432638 - 432753
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
432638 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatc-aattaatcattt 432736  T
101 atttaattaagcactta 117  Q
    | | |||||||||||||    
432737 actcaattaagcactta 432753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 3674044 - 3674161
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||| | |||    
3674044 aacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaat 3674142  T
108 taagcacttaagcatacaa 126  Q
    ||||||||||  |||||||    
3674143 taagcacttattcatacaa 3674161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5450915 - 5450858
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
5450915 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 5450858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 28902366 - 28902490
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
28902366 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 28902464  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
28902465 actcaattaagcacttattcatacaa 28902490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 28938761 - 28938885
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
28938761 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 28938859  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
28938860 actcaattaagcacttattcatacaa 28938885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32966221 - 32966106
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
32966221 tttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcttacattccaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaac-aattaatcattt 32966123  T
101 atttaattaagcactta 117  Q
    | | |||||||||||||    
32966122 actcaattaagcactta 32966106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 16595691 - 16595858
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatta 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || || ||| ||| | |||||    
16595691 caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattagtcaattactcaatta 16595789  T
110 agcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||||||||  |||||||| |  ||||| |||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
16595790 agcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 16595858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 7728595 - 7728630
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 36  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7728595 tttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcat 7728630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 54398558 - 54398853
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
54398558 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatttcaaaaactaagagcaaaataatccctt 54398657  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
54398658 attcaattaagcacttaagcatacaattagagaaaaattacaactaagtgattatgattgagatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagca 54398757  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
54398758 aaaacttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttgtctct 54398853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47468420 - 47468125
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
47468420 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattacaacagctaagagcaaaataatcactt 47468321  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
47468320 attcaattaagcacttaagcatgcaattaggggaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaaccatcttacctcaataagcaataatcctagca 47468221  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
47468220 aaagtttcaatttagctcctacaatctctattacctcttgggtcttcaagc-tttatcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 47468125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50220012 - 50219720
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||    
50220012 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaactaa---caaaataatcactt 50219916  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||    
50219915 attcaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattgattatgatcgaaatctaacccccttacctcaattaacaataatcctagca 50219816  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
50219815 aaaacttcaatttaactcctagaatctatatcacctcttaggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcatcttctcttgaactttctctct 50219720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13590146 - 13589848
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
13590146 tttcatcaacatcaattgaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaattaagtgcaaaataatcactt 13590047  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
13590046 attcaaataagcacttatgcatataattagggaaaatattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccccccttacctcaataagcaataatcctag 13589947  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
13589946 caaaagcttcaatttagctcctcgaatctttatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccatttgctccttctcttgaactttctctct 13589848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13442748 - 13442453
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13442748 tttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 13442649  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataag-caataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||    
13442648 actcaattaagcacttaagcatgcaatta-ataaaaattacaactaattgattatgattgaactctaacccccttacctcaattagtaaataatcctagc 13442550  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
13442549 caaagcttcaatttagctcctagaatctttatcatctcttgagttttcaagtttttctcccttctaatcctttt-ctcttctcttgaactttctctct 13442453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40905006 - 40904708
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||    
40905006 tttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagtaatcattt 40904907  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||| ||||     
40904906 attcaattaagcacttaaccatgcaattattgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttacctgaagtagcaaataatcctagt 40904807  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
40904806 caaagcttcaatttagctcctagattctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccctttttcctattctcttgcactttctctct 40904708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41916798 - 41916520
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
41916798 tttcaccaacaacaattatattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagagcaaaataa------ 41916705  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||    
41916704 ----------gcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaaccc-cttacctcaattagcaataatcctaaca 41916616  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
41916615 aaaatttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaaacttttctcccttctattcctttt-ctcttctcttgaactttctctct 41916520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18238229 - 18238075
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
18238229 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacct 18238130  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattat 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
18238129 attcaattaagcacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattat 18238075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10237202 - 10237048
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
10237202 tacaactaagttattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaaaatcctagcaaaagcttcaatttaggtcctagaatctctatcacctct 10237103  T
239 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10237102 tgagtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 10237048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12133671 - 12133384
Alignment:
11 aacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatta 109  Q
    ||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || ||    
12133671 aacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcaccaatttcaacaattaagt-cacaataatcacttatctcaaata 12133573  T
110 agcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttc 208  Q
    |||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
12133572 agcacttatgcattgaaatagggaagaagctacaacttagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttc 12133473  T
209 aatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||    
12133472 aatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttatcccttctaacccttttgctccttatcttgaactttctctct 12133384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15013354 - 15013062
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
15013354 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaac-aattaatcactt 15013257  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  ||| |||||     
15013256 attcaattaagcacttaaacatacaacaaatg-aaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaatcctagct 15013158  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
15013157 caagcttcactttagctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 15013062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 38764884 - 38765177
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||    
38764884 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatga--aaaataatcaatt 38764981  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||||     
38764982 attcaactaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaattagcacaaatcatagcc 38765081  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
38765082 caaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaacctttttgctcttctcttgcactttctctct 38765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 54363348 - 54363068
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt--aattaagcactta 117  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
54363348 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaataatcacttatttttaattaagcactta 54363249  T
118 agcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctc-ttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttag 215  Q
     ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
54363248 tgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaaccccccttacctcaacaaacaataatcctagcaaaagcttcaatttag 54363150  T
216 ctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
54363149 ctcctaaaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttcccccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 54363068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18236122 - 18235976
Alignment:
151 attatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
18236122 attatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaaaatcctagcaaaagcttcaatttagcttctagaatctctatcacgtcttgggtctgcaag 18236023  T
251 cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
18236022 cttttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 18235976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41256441 - 41256147
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
41256441 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaa-catttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaat-taatcactt 41256344  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | | ||  ||| |||||     
41256343 attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttaacacaaatcctagcc 41256244  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||| |||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
41256243 caagctttaatttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttcaag-tctcctatcttctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 41256147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7964784 - 7964490
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| || | || || ||||||    
7964784 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaac-aattactcactt 7964686  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||| || ||    
7964685 actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattccttgc 7964587  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
7964586 ccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 7964490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 19559676 - 19559831
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaa-gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttg 240  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
19559676 aactaattgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagaaaaaagcttcaatttacctcttagaatctctatcatctcttg 19559775  T
241 ggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19559776 agtcttcaagcttt-ctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 19559831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Original strand, 28428029 - 28428219
Alignment:
105 aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagcaaaa 203  Q
    ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||    
28428029 aattaagcacttaaatatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaactctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagctaaa 28428128  T
204 gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 295  Q
     |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
28428129 acttcaatttaactcctagaatctccatcacctcttgggtcttcaagtttttctcccttctaacccttct-atcttctcttgaactctctct 28428219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15213678 - 15213398
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||| | ||| |||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||     
15213678 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaattttatcaattaaattcaaactaatcacttatttcaattaagcacttat 15213579  T
119 gcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 217  Q
    ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
15213578 gcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattgtgattgaa-tctaacccccttacctcaataagcaataatcctag-aaaagcttcaatttagct 15213481  T
218 catagaatctctatcacctc---ttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    | ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
15213480 cctagaatctctatcacctctaattggtttttcaagc-tttctcctttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 15213398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 49072000 - 49072155
Alignment:
142 aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgg 241  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
49072000 aactaagagattatgcttgaaatctaacccccctacctcaataagcaataatcgtagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctaacacctcttgg 49072099  T
242 gtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
49072100 ttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactctctctct 49072155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 18276609 - 18276903
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || | || ||||||| |    
18276609 tttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacat 18276707  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| || |  | | |||||     
18276708 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgc-actaaatgattatgattgaattctaaccccgttaccttaattagtacaattcctagct 18276806  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||| |||| || ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
18276807 caagcttcactttagctcctaggatctgtaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 18276903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7185916 - 7185697
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||    
7185916 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 7185818  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||| ||||  |||| |||||    
7185817 attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacctccttaccttaattagcacaaattcctagc 7185720  T
200 aaaagcttcaatttagctcatag 222  Q
      || ||||| ||||||||||||    
7185719 ccaaacttcactttagctcatag 7185697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17375358 - 17375155
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||||||  | |||     
17375358 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaataatcacttatttcaattaatta-ttat 17375260  T
119 gcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 217  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
17375259 gcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataagcaacaattctagcaaaagc-tcaatttagtt 17375162  T
218 catagaa 224  Q
    | |||||    
17375161 cctagaa 17375155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 47535137 - 47535065
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
47535137 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 47535065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17373057 - 17372921
Alignment:
87 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
17373057 caaaataatcacttatttcaattaatta-ttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaaaggattatgaatgaaatctaaccctcttacctcaata 17372960  T
185 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaa 224  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||    
17372959 aacaacaatcctagcaaaagc-tcaatttagttcctagaa 17372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 24238012 - 24238088
Alignment:
221 agaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
24238012 agaatctctatcacctcttggttgttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctctttctcttgaactttctctct 24238088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13809580 - 13809407
Alignment:
3 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| |||     
13809580 tcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattac 13809482  T
103 ttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
13809481 tcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaatggcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 13809407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 21417482 - 21417664
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||   | |||||||| |  ||||||||||| ||||  || |||||||||||    
21417482 tttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctctaaaacaagagtagaaatttcaacaattaagctcacaataatcactt 21417581  T
101 at-ttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaa 182  Q
    ||   || |||||||||| ||| | |||||| |||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
21417582 atcccaaataagcacttatgcaaagaattagagaagggattacaactaagagattatgaatgaaatctaaccc-cttacctcaa 21417664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52265573 - 52265405
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||| || | || |||||| |||   |||    
52265573 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaac-aattaatcaattacccaat 52265475  T
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| ||||||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
52265474 taaacacttattcatacaataattgaaaaattgcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 52265405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15045003 - 15045127
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
15045003 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 15045101  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
15045102 actcaattaagcacttattcatacaa 15045127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 14901407 - 14901582
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
14901407 tttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaac-aattaatcattt 14901504  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| |||  || ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
14901505 actcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaaatgattatga-tgaaatttaacccccttacct 14901582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15109421 - 15109364
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
15109421 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 15109364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47535040 - 47534901
Alignment:
115 ttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagcaaaagcttcaattt 213  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| || ||  |||||||| |||    
47535040 ttaatcatacaataatggaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcacttt 47534941  T
214 agctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
47534940 agctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 47534901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 37957097 - 37957019
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaa 79  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |  |  |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
37957097 tttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattccaacaa 37957019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 293
Target Start/End: Original strand, 10374964 - 10374997
Alignment:
260 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
10374964 cttctaacccttttcctcttctcttgaactttct 10374997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 34177631 - 34177552
Alignment:
90 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
34177631 aataatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaaccc 34177552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 41166018 - 41165961
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||| |||||||    
41166018 tttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataa 41165961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5768241 - 5767946
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5768241 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 5768142  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||    
5768141 attcaattaagcacttaagcatgcaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaatatcctagca 5768042  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
5768041 aaaactttaatttagctcctagaatctctatcacttcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40436341 - 40436044
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
40436341 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 40436242  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
40436241 attcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataattaagtgattgtgattgaaatctaacccccttacctcaataaacaataatcctagc 40436142  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
40436141 aaaagtttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 40436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 25094034 - 25094328
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
25094034 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacagttaagtgcaaaataatcactt 25094133  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
25094134 attcaaataagcacttatgcataga--tagggaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagca 25094231  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
25094232 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacttcttggttcttcaagc-tttctccattctaaaccttttgctcattctcttgaactttctctct 25094328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 20194200 - 20194498
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaa-catatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcact 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
20194200 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatactcaaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcatt 20194299  T
100 tatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
20194300 tattcaaataagcacttatgcatagaattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaagtctaacttccttacctcaataagcaataatcctag 20194399  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||    
20194400 caaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcatggttcttcaagc-tttctcccttctgactcttttgctccttctcttgaactttctctct 20194498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 33397527 - 33397817
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
33397527 tttcatcaacaacaactcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaat-------gcaaaataatcactt 33397619  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
33397620 attcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagc 33397719  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||    
33397720 aaaaggttcgatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttggacttcctctct 33397817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 76458 - 76194
Alignment:
33 tcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattaggg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||| || || ||||||||    
76458 tcatgtactcaaacatatcatcataacaaaagcacgaatttcaacaacttagtgcaaaataatcacttattcaaataagcaattatgcttagaattaggg 76359  T
133 aa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctat 231  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
76358 aagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcatagcaaaagcttcaatttaactcctagaatctctat 76260  T
232 cacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
76259 cacctcttggttcttcaagc-ttactcccttctgacccttttgctcattctcttgaactttctctct 76194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 52400806 - 52401100
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||    
52400806 tttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaacaactatgaacaaa-taatcactt 52400904  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||     
52400905 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagttagcaaaaatcctagcc 52401004  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
52401005 caagcttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctgacccttttcctcttcttttgcactttctctct 52401100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 49997353 - 49997059
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  | || |||| |||||||||    
49997353 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatcatgaacaaa-taatcactt 49997255  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
49997254 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagct 49997155  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
49997154 caaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tatcttctcttctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 49997059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 21195189 - 21195483
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||||    
21195189 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaat-taatcactt 21195287  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| | | ||||  ||| |||||     
21195288 attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttagttagcacaaatcctagcc 21195387  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
21195388 caagcttcactttagctcctagaatcaccatcacctcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 21195483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 297
Target Start/End: Original strand, 20822937 - 20823095
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20822937 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatccttgcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 20823036  T
239 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
20823037 tggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 20823095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 20836741 - 20836897
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20836741 tacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 20836840  T
239 tgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctct 295  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
20836841 tcgttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctct 20836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18852729 - 18852493
Alignment:
62 gagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattg 160  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |||||||| ||  |||||||||  |||||||||||    
18852729 gagcacgaatttcaacgattaagtacacgataatcacttattcaaataagcacttatgcatatatttagggaagaagctacaactaaa-gattatgattg 18852631  T
161 aaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctccc 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
18852630 aaatctaacccccttacctcaataaacaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaaac-tttctccc 18852532  T
261 ttctaac-cattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
18852531 ttctaactctttttgctccttctcttgaactttctctct 18852493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8537982 - 8537737
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |  |||||||| ||    
8537982 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaac-gaataatcaatt 8537884  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| | | ||||  ||| |||||     
8537883 attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaaatcctagcc 8537784  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
8537783 caagcttcactttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 8537737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8603221 - 8602976
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |  |||||||| ||    
8603221 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaac-gaataatcaatt 8603123  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| | | ||||  ||| |||||     
8603122 attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaaatcctagcc 8603023  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
8603022 caagcttcactttaactcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 8602976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 17609103 - 17609398
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || | || |||||||||    
17609103 tttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatc-aactaatcactt 17609201  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||| ||| |    
17609202 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcctaac 17609300  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| | || | ||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||    
17609301 ccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttct-tcgcctctaaccctttttccccttctcttgcacttgctctct 17609398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37233928 - 37233638
Alignment:
5 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||  | | || || ||||||| |     
37233928 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaac-aattactcacttactc 37233830  T
105 aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaag 204  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  | | |||||  |||    
37233829 aattaagcacttaataatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaattcctagcccaag 37233731  T
205 cttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
37233730 cttcactttacctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttc--tctaaccctttttcctcttctcttacactttctctct 37233638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20177350 - 20177632
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | | ||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
20177350 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 20177448  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| | ||  |||| |||||    
20177449 actcaattaagcacttaaacatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagc 20177548  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctc 282  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||  |||||  |||||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||    
20177549 ccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccctttttcctcttctc 20177632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13376923 - 13376754
Alignment:
9 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatt 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| || ||| || |||  |||||| ||| | ||||    
13376923 acaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaacaat-taatcaattactaaatt 13376825  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
13376824 aagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 13376754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22143432 - 22143139
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||    
22143432 ttcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattta 22143334  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagca 200  Q
    |  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||| |||||     
22143333 tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaaccc-cttaccttagttagcaattaatcctagcc 22143236  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattt--tcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||| |||   | | | |||||  ||||||||||| |||||   ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
22143235 caagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaagcttcttctc---tctaacccttttctcctcttctcttgcactttctctct 22143139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 19603272 - 19603397
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
19603272 tttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaac-aattaatcaatt 19603370  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    | | |||||||||||||  ||||||||    
19603371 actcaattaagcacttattcatacaat 19603397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16656813 - 16656937
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
16656813 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 16656911  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
16656912 actcaattaagcacttattcatacaa 16656937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Original strand, 21978003 - 21978130
Alignment:
57 aacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttat-ttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgatta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |||||| ||| ||||  |||||| ||| | || ||||||||   ||||    
21978003 aacaagagcacgaatttcaacaattaagctcacaataatcacttatctcaaataagcatttatgcattgaattagagaagagatcacaactaaaatatta 21978102  T
155 tgattgaaatctaaccctcttacctcaa 182  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
21978103 tgaatgaaatctaacccccttacttcaa 21978130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38033746 - 38033675
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||||    
38033746 tttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt 38033675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20955511 - 20955454
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
20955511 tttcaccaacaacagatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataa 20955454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22829497 - 22829324
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || ||   || |||||| ||    
22829497 tttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga-ataattaatcaatt 22829399  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttac 177  Q
    | | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||    
22829398 actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgc-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttac 22829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 27674971 - 27675042
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
27674971 tttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 27675042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36356365 - 36356294
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||||    
36356365 tttcaccaacaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt 36356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 16646091 - 16646211
Alignment:
5 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt 104  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||| |     
16646091 accaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactc 16646189  T
105 aattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    |||||||||||||  |||||||    
16646190 aattaagcacttattcatacaa 16646211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 51627736 - 51627679
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||    
51627736 tttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataa 51627679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43427588 - 43427291
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactca---aacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatca 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43427588 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatca 43427489  T
98 cttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattcta 197  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
43427488 cttattcaattaagcacttatgcatacaattagg-aaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatccta 43427390  T
198 gcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
43427389 gcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttatcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttttctct 43427291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 10913061 - 10913356
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
10913061 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgaaaaataatcactt 10913160  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| |  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
10913161 attcacataagcacttatgcatagatttagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccttatctcaataagcaataatcctagc 10913259  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
10913260 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcctttctaacccttttgcccttctcttgaactttctctct 10913356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38375760 - 38375472
Alignment:
9 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || |    
38375760 acaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaattaagtgcaaaataatcactcattcaaat 38375661  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
38375660 aagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagatattatgattgaaatctaactctcttacctcaataagcaataatcctagcaaaagctt 38375562  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
38375561 caatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 38375472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 8605000 - 8605295
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8605000 tttcatcaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatgactt 8605099  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagc 199  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| |||| |||||    
8605100 gttcaaataagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactatgtgattatgattgaactctaactct-ttaccttaattagcaattaatcctagc 8605198  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
8605199 caaagcttcaatttagctcctagattctctaacacctcttgagtcttcaagc-ttcctctattctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 8605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 41661740 - 41662035
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
41661740 tttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattttaacaacta-gagcaaaataatcactt 41661838  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctagc 199  Q
    | | || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
41661839 aatcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaattaattgattatgattaaactttaacccccttacctcaattagcaaataatcctagc 41661938  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
41661939 caaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccatttt-ctcttctcttgaactttctctct 41662035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21167131 - 21166858
Alignment:
23 atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21167131 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagcaaaaacacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcat 21167032  T
123 acaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatag 222  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||    
21167031 gcaattaatgaaaaattacaactaattaattatgattgaactttaacccccttacctcaattagcaataatcatagccaaagcttcaattcatctcttag 21166932  T
223 aatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
21166931 aatctctatcacatcttgagtcttcaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 21166858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17758662 - 17758384
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||     
17758662 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcacaagcacgaatttcatcaattaacttcaaaataatcacttatttcaattaagcacttat 17758563  T
119 gcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 217  Q
    ||||| |||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
17758562 gcatagaattagggtagaagctacaactaagatattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttggct 17758463  T
218 catagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17758462 cctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 17758384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19059982 - 19059704
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||     
19059982 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcacaagcacgaatttcatcaattaacttcaaaataatcacttatttcaattaagcacttat 19059883  T
119 gcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 217  Q
    ||||| |||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
19059882 gcatagaattagggtagaagctacaactaagatattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttggct 19059783  T
218 catagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
19059782 cctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 19059704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31411599 - 31411415
Alignment:
112 cacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
31411599 cacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaat 31411500  T
212 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
31411499 ttaactcttagaatctctatcacctcttggttcttcaagcttttct-ccttctaacccttttcctcttctcttgaactttctctct 31411415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14814837 - 14814542
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
14814837 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaa-taatcactt 14814739  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
14814738 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcc 14814639  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
14814638 gaagcttaaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaagtctcctctttc-tctaaccattttcctcttctcttgccctttctctct 14814542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4162277 - 4161983
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
4162277 tttcaccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaa-taatcactt 4162179  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||     
4162178 attcaattaagcacttaatcatgcctttaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcc 4162079  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
4162078 caaacttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctctcctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 4161983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 50313362 - 50313532
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
50313362 tttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcactt 50313461  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 171  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
50313462 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattacgattgaactctaaccc 50313532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 297
Target Start/End: Original strand, 11638553 - 11638769
Alignment:
81 taagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctc 180  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
11638553 taagagcaaaataatcaattactcaattaagcacttaagcatgcagttaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacccccttacctc 11638652  T
181 aataagc-aataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctctt 279  Q
    ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
11638653 aattagcaaataatcctagccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagttttcaagcttttctccattctaaccctttt-atctt 11638751  T
280 ctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||    
11638752 ctcttgaactttctctct 11638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25104028 - 25103767
Alignment:
38 tactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt-atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa 136  Q
    |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||||  | |    
25104028 tactcaaacattacatcaaaacataagcacgaatttcatcaattaatttcataataatcactttatacaaataagcacttatgcatagaattaggataga 25103929  T
137 at-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacc 235  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25103928 agctacaactaaatgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagtaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacc 25103829  T
236 tcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
25103828 tcttggttcttcaag-ttttctcccttttaacctttttgctccttctcttgaactttctctct 25103767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31412405 - 31412287
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31412405 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 31412306  T
101 atttaattaagcacttaag 119  Q
    ||| |||||||||||||||    
31412305 attcaattaagcacttaag 31412287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33368999 - 33368706
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||| || | ||||||| | ||    
33368999 tttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaacaactatgaac-aaataattaatt 33368901  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||   | ||||  ||| |||||     
33368900 attcaaataagcacttaatcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctttgttagcacaaatcctagcc 33368802  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
33368801 aaaacttcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag--tctctcctcttctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 33368706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40038917 - 40038706
Alignment:
87 caaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaata 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
40038917 caaaataatcatttatttcaattaagcacttatgcatagaattagggtagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaaccccct-acctcaata 40038819  T
185 agcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctct 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
40038818 agcaataatcctagcaaaaacttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttagttcttcaagc-tttctcccttgtaacccttttgctcattctct 40038720  T
284 tgaactttctctct 297  Q
    ||||| ||||||||    
40038719 tgaaccttctctct 40038706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11515556 - 11515373
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
11515556 caacaacaattcaattatcatcaaatccatatactcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagtg-aaaataatcacttattcaa 11515458  T
107 ttaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaata 191  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
11515457 ataagcacttatgcatagaattagggaagaaaata-aactaagaaattatgaatgaaatctaaccccctgacctcaataagcaata 11515373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12539141 - 12538849
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||    
12539141 tttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaatttcaacaataaagctcacaataatcactt 12539042  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    || | || | |||||||| ||| | ||||||  || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||    
12539041 atctcaaatgagcacttatgcaaagaattagataagagattacaactaagagattatgaatgaaatctaacccccttactgcaataaacaataatcctag 12538942  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctc 294  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||||||   ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
12538941 caaaagcttcaatttagttcctaaaatatctatca---cttggttattcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctc 12538849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13301541 - 13301326
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||    
13301541 tttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatctaagaac-caataatcactt 13301443  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||    
13301442 attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagc 13301345  T
200 aaaagcttcaatttagctc 218  Q
      |||||||| ||||||||    
13301344 ccaagcttcactttagctc 13301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13312197 - 13311982
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||    
13312197 tttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatctaagaac-caataatcactt 13312099  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||    
13312098 attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagc 13312001  T
200 aaaagcttcaatttagctc 218  Q
      |||||||| ||||||||    
13312000 ccaagcttcactttagctc 13311982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 297
Target Start/End: Original strand, 50313564 - 50313686
Alignment:
176 acctcaataagcaa-taattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttc 274  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
50313564 acctcaattagcaaataatcctagccaaaacttcaatttagctcctggaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccattttc 50313663  T
275 ctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
50313664 ctcttctcttgcactttctctct 50313686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 11402765 - 11402943
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
11402765 tttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcactt 11402864  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| || |||||||||  ||||| || ||| ||| || |  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
11402865 attcaaataagcacttgtgcatagaactagagaagaaatgaaactaagagattatgaatgaaatctaacccacttacct 11402943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11882290 - 11882115
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
11882290 tttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattcaacatctaagaac-aaataatcactt 11882192  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |   |||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
11882191 attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 11882115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915069
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    |||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |  ||| |||||| | || |    
37915356 caacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagt-cacagcaataacttatctcaaat 37915258  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    || ||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
37915257 aaacacctatgcatagaaatagggaagaaggtacaacttagagattatgattgacatctaacccccttacctcaataaacaataatcatagcaaaaactt 37915158  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
37915157 caatttagctcctagaataactatcacctctt-gttcttcaagc-cttctcccttctaaccctttttctcattctcttgaactttttctct 37915069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 17393622 - 17393808
Alignment:
14 aattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagc 112  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | ||||||||    
17393622 aattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcataataatcacttatctcaattaagc 17393721  T
113 acttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    | ||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
17393722 aattatgcatagaattagggaagaagctacaacta-gagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagc 17393808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6225027 - 6224863
Alignment:
132 gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctat 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |     
6225027 gaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagttagcaaaaatcctaacacaagcttcaatttagctcctagaatctccac 6224928  T
232 cacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
6224927 cacctcttaggtcttcaag-actcctttcttctaacccttttcctcttctctcgcactttctctct 6224863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 15517806 - 15517921
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  || || | || |||||||||    
15517806 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaac-aattaatcactt 15517904  T
101 atttaattaagcactta 117  Q
    | | |||||||||||||    
15517905 actcaattaagcactta 15517921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 12953139 - 12953317
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaa-gagcaaaataatcact 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||| || | || ||||||||    
12953139 tttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaacaactaatgaac-aattaatcact 12953237  T
100 tatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    || | |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||   || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
12953238 tactcaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaaattacactaaattgattatgattgaattctaatccccttacct 12953317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9590826 - 9590702
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| || | || ||| |||||    
9590826 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaac-aattaaccactt 9590728  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||    
9590727 attcaattaagcacttaatcatacaa 9590702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 6228697 - 6228625
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
6228697 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3576510 - 3576215
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||  || | || |||||| ||    
3576510 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaac-aattaatcattt 3576412  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||  | |||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
3576411 actcaattaagcacttattcgtacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagc 3576312  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||| ||| ||| ||||||  ||  |||||  | |||||||| |||| |  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
3576311 ccaagcttcactttacctcctaggatctcttccaattcttgaatattcaagctcttcttc--tctaaccctttttcctcttctcttacactttctctct 3576215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17191716 - 17191970
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||| || | || |||||| ||    
17191716 tttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaac-aattaatcattt 17191814  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | ||||||||| ||   |||||||  |  |||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
17191815 actcaattaagcaattgttcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagc 17191914  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctttt 255  Q
      || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||||    
17191915 ccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctttt 17191970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18970096 - 18970390
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| || |  |||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  || |||||||||||    
18970096 tttcatcatcaacaattcaattaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcactt 18970195  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || ||| |||||| ||||| ||  || |||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||  ||| |||||    
18970196 attcaaataatcacttatgcatagaaaaagagaaaagaaactaactaagtggttatgattgaaatctaacccccttaccttagttagcacaaatcctagc 18970295  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctc 294  Q
      || | |||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
18970296 ccaaacatcaatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaaccctttttcctcttctcttgcactttctc 18970390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17204856 - 17205108
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||| || | || |||||| ||    
17204856 tttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaac-aattaatcattt 17204954  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | ||||||||||||   | ||| |  |  |||||||||||   || |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
17204955 actcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatggaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagc 17205054  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
      |||||||| |||||||| ||| || |||| ||  |||||  |||||||||||    
17205055 ccaagcttcactttagctcctaggatttctaccaattcttgaatcttcaagctt 17205108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4145885 - 4145787
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
4145885 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaac-aaataatcactt 4145788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 47784838 - 47784758
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
47784838 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaact 47784758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 34560074 - 34560131
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
34560074 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattataa 34560131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17586797 - 17586711
Alignment:
206 ttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttct 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17586797 ttcaatttagctcctagaatctccaccacctcttagatcttcaag-tctcctctcttctaaccattttcatcttctcttgaactttct 17586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 48421752 - 48421928
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||  | |  |  || |||||||||||    
48421752 tttcatcaccaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcactt 48421851  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||    
48421852 attcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaactctcttacct 48421928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 39656701 - 39656825
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||| || || | || |||||| ||    
39656701 tttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaac-aattaatcattt 39656799  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
39656800 actcaattaagcacttattcatacaa 39656825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 30207391 - 30207462
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
30207391 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 179
Target Start/End: Original strand, 34560133 - 34560219
Alignment:
92 taatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
34560133 taatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgatcatgattgaattctaacccccttacct 34560219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 17139683 - 17139754
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||    
17139683 tttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 17139754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 14080685 - 14080761
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    |||||||||||| ||||    
14080685 ttcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaaca 14080761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51961122 - 51961033
Alignment:
89 aaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
51961122 aaataatcacttatttcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaagactaacccccttacct 51961033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 15876243 - 15876317
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 75  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
15876243 tttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttca 15876317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14059275 - 14059214
Alignment:
11 aacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
14059275 aacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 16880305 - 16880369
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||| |||   |||||||||||    
16880305 aacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaatt 16880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 9636920 - 9637214
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9636920 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 9637019  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
9637020 attcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacctcaattagcaataatcctagca 9637119  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctc 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
9637120 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccctttt-atcttctcttgaactttctctc 9637214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 6094888 - 6095156
Alignment:
28 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
6094888 caatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaat 6094987  T
128 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
6094988 tagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaaatttcaatttagctcgtagaatct 6095087  T
228 ctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
6095088 ctatcacctcttggttcctcaagc-tttctcccttctaacccttttcctcttctcttaaactttctctct 6095156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 24277936 - 24278231
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
24277936 tttcaccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca-caactaagagaaaaataatcactt 24278034  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||     
24278035 attcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattagaaataatcctagcc 24278134  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
24278135 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttctcttaaactttctctct 24278231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16292873 - 16292577
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16292873 tttcaccaacaacagttcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaatagcacaaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 16292774  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
16292773 acttaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagc 16292674  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
16292673 caaaacttcaatttagctcctagaatctctaacacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 16292577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 25595195 - 25595491
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
25595195 tttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcccaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 25595294  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    | | |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
25595295 agtcacataagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaaccccccttacctcaataagcaataatcctag 25595393  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
25595394 caaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaag-ttttctcccttctaacctttttgcccttctcttgaactttctctct 25595491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 18536943 - 18537227
Alignment:
13 caattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagc 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || |||||    
18536943 caatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcgacaattaagtgaaaaataatcactcattcaaataagc 18537042  T
113 acttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 211  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
18537043 acttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaaacttcaat 18537141  T
212 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
18537142 ttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaaac-tttctcccttctaaccctttagctccttctcttgaactttctctct 18537227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Original strand, 9637227 - 9637443
Alignment:
79 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
9637227 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637326  T
179 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 278  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||    
9637327 tcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccctttt-atct 9637425  T
279 tctcttgaactttctctc 296  Q
    ||||||||||||||||||    
9637426 tctcttgaactttctctc 9637443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Original strand, 9637456 - 9637672
Alignment:
79 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
9637456 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637555  T
179 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 278  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||    
9637556 tcaattagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttctaaccctttt-atct 9637654  T
279 tctcttgaactttctctc 296  Q
    ||||||||||||||||||    
9637655 tctcttgaactttctctc 9637672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Original strand, 9637685 - 9637901
Alignment:
79 actaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
9637685 actaagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaattaggaaaaaattacaactaattgattatgattgaaatcttatccccttacc 9637784  T
179 tcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctct 278  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||    
9637785 tcaattagcaattatcctagcaaaagtttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagttttcctcccttataacc-tttttctct 9637883  T
279 tctcttgaactttctctc 296  Q
    ||||||||||||||||||    
9637884 tctcttgaactttctctc 9637901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 20279586 - 20279845
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||||||    
20279586 tttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagttcaccataatcactt 20279685  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
20279686 atttcaattaagcacttttacatacaattagggaagaagctacaactaaaagattatgaatgaaatctaatccccttacctcaataagcaataatcctag 20279785  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
20279786 caaaagcttcaattaagctccgagaatctctatctccccttggttcttcaagcttctctc 20279845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 29114651 - 29114841
Alignment:
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29114651 taagcacttatgcatataattagagaaaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagct 29114750  T
207 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
29114751 tcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttcttccttctaacccttttgctcattctcttaaactttctctct 29114841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19660055 - 19660281
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
19660055 tttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatctaagaac-aaataatcactt 19660153  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
19660154 attccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatga-tgaattctaaccc-cttaccttaattatcaccaattcctagc 19660251  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctct 229  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||    
19660252 ccaagcttcactttagctcctaggatctct 19660281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 19666704 - 19666887
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||   |||||| |||||| |||||||| || | || ||||||||||    
19666704 ttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaac-aattaatcactta 19666802  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 188  Q
    || ||||||||| |||  |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
19666803 ttcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttaattagca 19666887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23821705 - 23821536
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||| | ||    
23821705 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacttactcaa 23821607  T
107 ttaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
23821606 ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattac-actaaatgattat-aatgaaatctaacccccttacct 23821536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23830784 - 23830615
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||| | ||    
23830784 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcacttactcaa 23830686  T
107 ttaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
23830685 ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattac-actaaatgattat-aatgaaatctaacccccttacct 23830615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24087459 - 24087335
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  || ||   || |||||||||    
24087459 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgctcaaacatatcatcataattagagcccgaattttaacatttatga-ataattaatcactt 24087361  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||| |||||||    
24087360 actcaattaagcacttaatcatacaa 24087335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 24884861 - 24884942
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaacta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||    
24884861 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacaacta 24884942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 297
Target Start/End: Original strand, 24884944 - 24885108
Alignment:
132 gaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaa-aagcttcaatttagctcatagaatctcta 230  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||||  | | |||||   || |||||||||||||| ||| |||||||    
24884944 gaaaaattaca-ctaaatgattatgattgaattataacccccttaccttagtaagcacaattcctagccccaaacttcaatttagctcctaggatctcta 24885042  T
231 tcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||  |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24885043 ccagttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 24885108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45573452 - 45573312
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45573452 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45573353  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45573352 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45573312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45577119 - 45576979
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45577119 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45577020  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45577019 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45576979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45580786 - 45580646
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45580786 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45580687  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45580686 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45580646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45584453 - 45584313
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45584453 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45584354  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45584353 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45584313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45588120 - 45587980
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45588120 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45588021  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45588020 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45587980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45591787 - 45591647
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45591787 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45591688  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45591687 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45591647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45595454 - 45595314
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45595454 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45595355  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45595354 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45595314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45599121 - 45598981
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45599121 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45599022  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45599021 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45598981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45602788 - 45602648
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45602788 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45602689  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45602688 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45602648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45606455 - 45606315
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45606455 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45606356  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45606355 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45606315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45610122 - 45609982
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45610122 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45610023  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45610022 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45609982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45613789 - 45613649
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45613789 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45613690  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45613689 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45613649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45617456 - 45617316
Alignment:
42 caaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaa-aaatta 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||  ||| | ||||    
45617456 caaacataacatcaaaataagagcacgaatttcaacaattaaactcacaataatcacttatctaaataaacacttatgcaaagaattaaagaagagatta 45617357  T
141 caactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctca 181  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
45617356 caactaagagattatgaatgaaatctatcccccttacctca 45617316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 11010095 - 11010170
Alignment:
222 gaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
11010095 gaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaaatttctctct 11010170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 722566 - 722690
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||    
722566 tttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaattttaacaattatgaac-aattaatcattt 722664  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
722665 actcaattaagcacttattcatacaa 722690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 43646068 - 43646148
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||    
43646068 tttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaact 43646148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 68167 - 68238
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
68167 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22775277 - 22775206
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
22775277 tttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22780655 - 22780584
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
22780655 tttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19669181 - 19669013
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||   |||||| | |||| |||| ||| || | || |||||| ||    
19669181 tttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaac-aattaatcattt 19669083  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccc 171  Q
    ||  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| ||||||||    
19669082 atccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatga-tgaattctaaccc 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3319 - 3248
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |  |||||||| |||||||| | |||||||||||    
3319 tttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaatt 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 31146246 - 31146196
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
31146246 aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataa 31146196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 67969 - 67674
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
67969 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaagtaatcactt 67870  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
67869 attcaattaatcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaattggttatgtttgaaatctaacccccttacctcaattagcaaaaatcctagca 67770  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
67769 aaagcttcaatttagcacctagaatatctatcacctcttgcgtcttcaagcttttctcccttctaacccttat-ctctactcttgaactttctctct 67674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8960
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
8665 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcacaacaagagcacgaatttcaataactaagaacaaaataatcactt 8764  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
8765 attcaattaagcacttaagcatacaattaaggaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaataatcctagca 8864  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
8865 aaagcttcaattgagctcctataatctctatcacttcttaagtcttcaagcttctctcccttctaaccctttt-atcttctcttgaactttctctct 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 952 - 655
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
952 tttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcactt 853  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagc 199  Q
    ||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
852 attcaaataagcacttatgtatagaattggggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagc 753  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
752 aaaagcttcaatttagctcctagaatctctatctcctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 86532 - 86825
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
86532 tttcaccaacaaaaattcaattatcacaaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacggatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 86631  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
86632 attcaattaagcacttaagcatgcaattaggg-aaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattagcaataatcctaaca 86730  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctct 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
86731 aaagtttcaatttagctcctagattctctatcacatcttggatcttcaaacttttctcccttttaaccatttttctcttctcttgaactttctct 86825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27672 - 27967
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
27672 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactatgagcaaaataatcattt 27771  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||     
27772 attcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattagcaataatcctagcc 27871  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
27872 aaagctgcaatttagatcctagaatctctatcacctcttgggtctttaagtttttctcccttctaaccctttt-ctcttcccttgaactttctctct 27967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 37733 - 38028
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
37733 tttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaact-agagcaaaataatcactt 37831  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||    
37832 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaactctaacctccttacctcaattagcaaataatcctagc 37931  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
37932 taaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagttttcaagcttttctcccttctaaccatttt-ctcttctcttgaactttctctct 38028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 25521 - 25820
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25521 tttcaccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 25620  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaatt-agggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattctag 198  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||    
25621 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaaattacaactaattgattatggttgaactctaactcccttacctcaattagcaactaatcctag 25720  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
25721 ccaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 25820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 131994 - 132284
Alignment:
5 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |     
131994 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaact-agag-aaaataatcacttactc 132091  T
105 aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagcaaaa 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| ||     
132092 aattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaataatcatagccaac 132191  T
204 gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
132192 gcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaacc-tttttctcttctcttgaactttctctct 132284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 68021 - 67732
Alignment:
9 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |    
68021 acaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataacaagaacacgaatttcaacaattaattgcaaaataatcactcattcaaat 67922  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaa-ccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagct 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
67921 aagcacttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaaccccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagct 67823  T
207 tcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||    
67822 tcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaaactttttgctccttcttttgaactttctctct 67732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 102994 - 102870
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||    
102994 tttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaatt 102896  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    | | |||||||||||||  |||||||    
102895 actcaattaagcacttattcatacaa 102870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 109772 - 109821
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcata 57  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||    
109772 aacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata 109821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2838 - 2547
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaa 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
2838 caacaacgattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagtacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaa 2739  T
107 ttaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagc 205  Q
     |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
2738 ataagcagttatgcatataattagggaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatataacccccgtacctcaacaagcaataatcctagcaaaagc 2639  T
206 ttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
2638 ttcaatttagctcctataatctctatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctcattctcttgaactttctctct 2547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 22174 - 22469
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
22174 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgagaaaaataatcactt 22273  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
22274 attcaattaagcacttaagcatgcaattaatg-aaaattacaactaattgactatgattgaaatctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagc 22372  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
22373 caaagcttcaatttatcttctaggatctctatcacctcttgagtcttcaagcttttctcccttctaaccctttt-ctcttctcttgaactttctctct 22469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 30139 - 30433
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
30139 tttcacctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattttaactact-agagcaaaataatcactt 30237  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaatta--gggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaa-taattcta 197  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
30238 actcaattaagcacttaagcatgcaattaataaaaaaaattacaacaaattgattatgattgaactctaacccccttacctcaattagcaactaatccta 30337  T
198 gcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctc 294  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
30338 gtcaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgagtcttcaagcttctctcccttctaaccctttt-ctcttgtcttgaactttctc 30433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 14211 - 14506
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
14211 tttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattttaacaact-agagcaaaataatcactt 14309  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagc-aataattctagc 199  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
14310 actcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaagaattataactaattgattatgattgaactctaacccccttacctcaattagcaaataatcctagc 14409  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
14410 caaagcttcaatttagctcctagaatctctatcaactcttgagccttcaagcttttctcccttctaactctttt-ctcttctcatgaactttctctct 14506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33473 - 33189
Alignment:
13 caattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagc 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| || |||||    
33473 caatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaaaattaagtacaaaataatcactcattcaaataagc 33374  T
113 acttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 211  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
33373 acttatgcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagaaataatcctagcaaaagcttcaat 33275  T
212 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||    
33274 ttagttcctagaatctatatcacctcttggttcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgttcattctcttgaactttctctct 33189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 740
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
1034 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaactatgaacaaa-taatcactt 936  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || || ||| |||||     
935 atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttaccttagttagaaaaaatcctagcc 836  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
835 caagcttcaatttagctcatagaatctccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctattctcttgcactttctctct 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 108184 - 108479
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
108184 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacatgtaagagcaaaataatcactt 108283  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||  ||||     
108284 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcgtagcc 108383  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| || || ||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
108384 caagcgtcaatttatctcctagaatcactaccacctcttaggtcttccagtctcttct--cttttaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 108479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 3426 - 3672
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
3426 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcactt 3525  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||   ||| |||||     
3526 attcaattaagcacttaagcatgaaattagggaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaacccccttgccttaattagctcaaatcctagcc 3625  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||| | | || ||||| |||||||    
3626 caagcttcactttaactcctagaatcaccaccaactcttaggtcttc 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19998 - 19710
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
19998 caacaattcaattatcatcaatttcacatacccaaacataacactaaaacatgagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 19899  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    || |||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
19898 aaacacttatgcatagaattagggaagaaattaga-ctaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaaaaatcctagcaaaaactt 19800  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
19799 caatttagctcctagaatctctattacctcttggtttttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 19710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 12953 - 13239
Alignment:
13 caattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat-taag 111  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||| |||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||  |||     
12953 caattcaagtatgaacaatttcatatcctcaatcatgtcactaaaactagagcacgaatttcaacaaataagctcacaataatcacttatccaaaataat 13052  T
112 cacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaa 210  Q
    |||||| ||||  |||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
13053 cacttatgcatgaaattagggtagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcac 13152  T
211 tttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
13153 ttaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagcttttctcccttctaacccttttcctcttctcttgaactctctctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27051 - 26769
Alignment:
12 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||  | || |||| |||||||||||| |||||||    
27051 acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaa-taatcacttattcaattaag 26953  T
112 cacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaat 211  Q
    ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||| ||||||||||    
26952 cacttaa-catggaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcacaagcttcaat 26854  T
212 ttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
26853 ttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 26769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5880
Alignment:
9 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaatt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||  | || | ||||||||||||||| ||||    
5595 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaac-aaataatcacttattcaatt 5693  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttc 208  Q
    |||||||||| |||  |||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||  |||||||    
5694 aagcacttaa-catggaattaataaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcctagcccaagcttc 5792  T
209 aatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
5793 aatttagctcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 5880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2840 - 2561
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||     
2840 attatcaacaaattcatatacacaaacatcacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaattcaaaataatcacttatttcaattaagcacttat 2741  T
119 gcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagct 217  Q
    ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
2740 gcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattatgattgaaatctaacccacttacctcaataagcaataattctagcaaaaactttaatttagct 2641  T
218 catagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccatttt-cctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    | ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||    
2640 cctagaatctctatcccgtcttggttcttcaaactttt-tcccttctaacccttttgcaacttgtcttgaactttctctct 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12805 - 12551
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
12805 tttcatcatcaacaattcaattatgaataatttcatatcctcaaacatatcactaaaactagagcacgaatttcaacaaataagctcacaataatcactt 12706  T
101 atttaa-ttaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    ||  || ||||| ||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
12705 atccaaattaaggacttatgcaaagaattagagaaaagattacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctaa 12606  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
12605 caaaagcttccatttagcccttagaatctctagctcctcttggttcttcaagctt 12551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6854
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |  ||| ||| ||||| |  | ||| |||| ||||||||||||||  |||  || | ||||||||||| | || |    
7141 caacaattcaattatcaacaagttaacatacccaatcatataactaaaactagagaacgaatttcaacaagcaagttcata-taatcacttatctcaaat 7043  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7042 aagcacttaagcatagaattagggaagaaatta-aactaagagattatgattgaaatataacccctttacctcaataagcaataatcctagcaaaagctt 6944  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctc-ttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
6943 caatttagctcctaggatctctatcaccttttggttcttcaagc-tttatcccttctaacccttttgctctttctcttgaactttctctct 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 35653 - 35950
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||| |   |||||||||||  || ||||  || | || |||||  ||    
35653 tttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaac-aattaatctttt 35751  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||| ||  |||||||  |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
35752 actcaattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagc 35851  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||  |||||  |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||    
35852 ccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccctttttcctcttctccttcactttctctct 35950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 4780 - 5073
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||| || |||  |||||| ||    
4780 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa--taatcagtt 4877  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||     
4878 attcaactaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaatcctagcc 4977  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||||||||| || ||||||| | | |||||| | ||||||||||  |  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
4978 caagcttcaatttagatcctagaatcaccaccacctcataggtcttcaag--tcgctcctcttctaacgcttttcctcttctcttgcactttcactct 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 197325 - 197031
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||| | || |||||||||    
197325 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaac-aattaatcactt 197227  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  | | |||||     
197226 atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaattcctagcc 197128  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
197127 caagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgcactttctctct 197031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 55160 - 55409
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||  |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || |    
55160 caacaattcagttatcatgaatttcacataccgaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcaaaataatcacttatctcaaat 55259  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
55260 aagcacttatgcataaaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagaaaaatctt 55358  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
55359 caattaagctcctagaatctccagctcctcttggttcttcaagcttttctc 55409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 2867 - 3116
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||  |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
2867 caacaattcagttatcatcagattcacataccgaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 2966  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||| |   ||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
2967 aagcacttatgcatagaattagcgaagacgctacaactaaat-attacgtttgaaatctaacccccttacctcaataaacaataatcctagcataagctt 3065  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||||| ||||| || |||||| | | |||||| | ||||||||||||||||    
3066 caattaagctcctaaaatctccagctcctcttcgttcttcaagcttttctc 3116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44194 - 43898
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | || |  || |||||||||||    
44194 tttcatcatcaacaattcaattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcactt 44095  T
101 atttaattaagcacttaagcatac--aattagggaa-aaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattcta 197  Q
    ||| || ||| |||||| |||||   ||  || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||    
44094 attcaaataatcacttatgcatagcaaaagagagaagaaatta--actaagtgattatgattgaaatctaaccccgttacctcaattagcaataatccta 43997  T
198 gcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
43996 gcaaaaacctcaatttaactcctaaaatctctatcacctcttgagtcttcaagctttt-tcccttctgacccttttccttttctcttgaactttctctct 43898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 6719 - 7013
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||    
6719 tttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaatttcatcaactatgaacaaa-taatcactt 6817  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || || |||||||| ||||||| | | ||||| |||  ||||     
6818 attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacacctaattggttatggttaaattctaacccccttaccttagttagcaaaaatcatagcc 6917  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaag-cttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
6918 caagcttcaatttagctcctagaatcatcaccaccgcttaggtcttcaagtctcttct--cttctaacccttgtcctcttctcttgcactttctctct 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 228
Target Start/End: Original strand, 113963 - 114116
Alignment:
75 aacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaa-attacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctc 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
113963 aacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatataattaaggaaaagattataactaagtgattatgattgaaatctaacccg- 114061  T
174 ttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctc 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
114062 ttacctcaataagcaatatttctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctc 114116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3828 - 3645
Alignment:
90 aataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattac-aactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 188  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||  || || ||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
3828 aataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagagagaagaaactaactaagtgattatgcttgaaatctaacccctttacctcaattagca 3729  T
189 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccatttt 273  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
3728 ataatcctaacaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttctcccttctaaccctttt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23744 - 23500
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
23744 tttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaac-aaataatcaatt 23646  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||| ||| |||||     
23645 attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaa-tcattatgattgaattctaacccccttatcttaattagcaaaaatcctagcc 23547  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttc 247  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||    
23546 caagcttcactttagctcctagaatcttcaccacctcttaggtcttc 23500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43870 - 43619
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||||| || | || |||||||||    
43870 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 43772  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||    
43771 actcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagc 43673  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||    
43672 ccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttaaatcttcaagctt 43619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23498 - 23461
Alignment:
260 cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
23498 cttctaacccttttcctcttctcttgcactttctctct 23461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 31195 - 31490
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || | || |||||||||    
31195 tttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaac-aattaatcactt 31293  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||    
31294 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagc 31392  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccatt-ttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      |||||||| |||||||| ||| || ||||  |  |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
31393 ccaagcttcactttagctcctagtatttctacaaattcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacccttgttcctcttcccttgcactttctctct 31490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12675 - 12416
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||| || |  ||| ||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||||||  |||  || |||||||||||    
12675 tttcatcatcaataattcaattatcaacaagttaacatacccaatcatatcactaaaactagagcacaaatttcaacaagcaagttcataataatcactt 12576  T
101 attt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctag 198  Q
    || | || || ||||||| ||||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
12575 atctcaaatatgcacttatgcatagaattaggaaagaagctacaactaagagattatgattgaaatctaaccccattacctcaataagcaataatcctag 12476  T
199 caaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
12475 caaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttctccaagcttttctc 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34521 - 34273
Alignment:
10 caacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aatt 108  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | || |    
34521 caacagttcagttatcatcaatttcacatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttatctcaaat 34422  T
109 aagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagctt 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
34421 aagcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgattgaaatctaacccccttacctcaataagcaataatcctagcaaaagctc 34323  T
208 caatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    ||||  ||||| || || || || |  ||||||| ||||||||||||||||    
34322 caataaagctccta-aaactttagcttctcttggttcttcaagcttttctc 34273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 69632 - 69928
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
69632 tttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 69730  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
      | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||  |||| |||||    
69731 tctcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaattagcacaaattcctagc 69829  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaacc--attttcctcttctcttgaactttctctc 296  Q
      |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||    
69830 ccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaacccttttttcctctactcttgcactttctctc 69927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 244697 - 244578
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctct 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
244697 tacaactaagagattatgattgaaatctagttcccttacctaaataagcaataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctct 244598  T
239 tgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    | | ||||||||||| ||||    
244597 tagttcttcaagcttctctc 244578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 244782 - 244709
Alignment:
139 tacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatt 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
244782 tacaactaatagattatgattgaaatctagtccccttaccacaataagcaattatcctagcaaaagtttcaatt 244709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 2700 - 2995
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||    
2700 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac-aattaatcactt 2798  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||| ||  ||| | |||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||| |||| |||||    
2799 actgaattaatcatctaatcttacaacaaatgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccgcttaccttagttagcaaaaattcctagc 2897  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaa-ccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
      || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||    
2898 tcaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttctcc--tctaaccctttttcctcttctcttgctctttctctct 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 297
Target Start/End: Original strand, 11303 - 11449
Alignment:
150 gattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaa 249  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
11303 gattatgaatgaaaactagccc-cttacctcaataagcaataatcttagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttggttcctcaa 11401  T
250 gcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
11402 gc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 11449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 297
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2494
Alignment:
89 aaataatcacttatttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca 188  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||    
2287 aaataatcatttattcaatgaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagttagca 2386  T
189 ataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaac 288  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||    
2387 aaaatcctagcccaagcttcaatttagttcctagaatcaccaccacctcttaggtcttcaag-tctcctctcttctaaccctttttctcttctcttgcac 2485  T
289 tttctctct 297  Q
    |||||||||    
2486 tttctctct 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 53521 - 53697
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||| || | || |||||||||    
53521 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaac-aattaatcactt 53619  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
53620 actcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 53697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 85708 - 85831
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
85708 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgca-ttaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaac-aattaatcactt 85805  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaa 126  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||    
85806 attcaattaagcatttaaacatacaa 85831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 297
Target Start/End: Original strand, 85836 - 85980
Alignment:
149 tgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttca 248  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||  |||| || |   |||||||| ||||||||    
85836 tgattatgattgaattcaaacccccttaccttaattagcacaaattctaacccaagcttcactttagcttctagactcac---cacctcttaggtcttca 85932  T
249 agcttttctcc-cttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    ||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
85933 ag--tctctcatcttctaaccattttcctcttctcttgcactttctctct 85980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6340
Alignment:
158 ttgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttct 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |     
6200 ttgaaatctaaccctgttacctcaataagcaataatcctagcaaaagcttcaattaagctcctagaatctctagctcctcttggttcttcaagttttccc 6299  T
258 cccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    || |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
6300 cctttctaacccttttgctccttctcttgaactctctctct 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 6058 - 6159
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||  |||  || |||||||||||    
6058 tttcatcatcaacaattcaattatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaacaagcaagttcataataatcactt 6157  T
101 at 102  Q
    ||    
6158 at 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 97267 - 96976
Alignment:
4 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| || | || |||||||| | |    
97267 caccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaac-aattaatcactcact 97169  T
104 taattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaa 203  Q
     |||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||  | | |||||  ||    
97168 caattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcattagcacaattcctagcccaa 97070  T
204 gcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt-ttctcccttctaaccattttcctcttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||| |||| ||| ||  ||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| ||| | | || |||||||||||||||| |||| ||||||    
97069 gcttcactttacctcctacgatctctaccatttcttgaatcttcaagcttcttct-cctccaaccctttttcctcttctcttgcacttcctctct 96976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 116187 - 115989
Alignment:
61 agagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaagcatacaattagggaaaaat-tacaactaagtgattatgat 158  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  || ||||||||||||| | || ||| |||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||    
116187 agagcacgaatttcaactagcaagttcataataatcacttatctcaaataatcacttatgcatagaattagggaagaagctacaactaaa-gattatgat 116089  T
159 tgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctc 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||    
116088 tgaaatctaacccctttacctcaataagcaataaccctagcaaaagcttcaattatgctcctagaatctctagctcctcttgattcctcaagcttttctc 115989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 104694 - 104480
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||   |||||| |||||| |||| ||| || | || ||||||||||    
104694 ttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaac-aattaatcactta 104596  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattc-tagca 200  Q
     | ||||||||| |||  |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||     
104595 ctcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaaattac-actaaatgattatga-tgaattctaacccacttaccttaattagcacaaattcttagcc 104498  T
201 aaagcttcaatttagctc 218  Q
     |||||||| ||||||||    
104497 caagcttcactttagctc 104480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 76919 - 76693
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||| || | || || ||| ||    
76919 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaac-aattactcaatt 76821  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
76820 actcaattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagc 76721  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatct 227  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||    
76720 ccaagcttcactttagctcctaggatct 76693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 253
Target Start/End: Original strand, 13471 - 13574
Alignment:
150 gattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataattctagcaaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaa 249  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
13471 gattatgaatgaaatctataccgcttacctcaattagcgataatcctagcaaaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgattcttcaa 13570  T
250 gctt 253  Q
    ||||    
13571 gctt 13574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 180753 - 180657
Alignment:
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
180753 aaagcttcaatttagctcctagaatctctatcacctcttgggtcttcaagc-tttcttctttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 180657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7097 - 6845
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| || || ||| | ||||| ||    
7097 tttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaaca-aatcattt 6999  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagcaataatt-ctagc 199  Q
    | | |||||||||||||  |||||||  |  |||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||  |||| |||||    
6998 actcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagc 6899  T
200 aaaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
      |||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
6898 ccaagcttcactttaactcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22493 - 22243
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||    
22493 ttcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaac-aattattcactta 22395  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaataagca-ataattctagca 200  Q
    ||  |||||||| |||   ||||||  |  || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||||     
22394 ttctattaagcatttattaatacaacaaatgagaaattac-actaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcagttaatcctagcc 22296  T
201 aaagcttcaatttagctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagctt 253  Q
     || ||||| |||||||| ||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||    
22295 caaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctt 22243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8361
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||    
8186 ttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattta 8284  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    |  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||   || ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
8285 tccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 8361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1420 - 1244
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| ||    
1420 tttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattt 1322  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaa-gtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
1321 atccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac-actaatatgattatga-tgaattctaacccccttacct 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9675 - 9499
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| ||    
9675 tttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattt 9577  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaa-gtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||  |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
9576 atccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac-actaatatgattatga-tgaattctaacccccttacct 9499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1617 - 1493
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||    
1617 ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattta 1519  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||    
1518 tccaattaagcacttattcatacaat 1493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8762 - 8638
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| || | || |||||| |||    
8762 ttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaac-aattaatcattta 8664  T
102 tttaattaagcacttaagcatacaat 127  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||    
8663 tccaattaagcacttattcatacaat 8638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11039 - 10860
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || |||||| ||||| | || ||| ||||  |||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||| ||| ||| | || ||||| |||||    
11039 tttcatcatcaacaactcaatcaacatcaaattcacatactcaaacattacatcaaagcataagcacgaatttcatcaattaaaatcataataaccactt 10940  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaa-ttacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
        || |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
10939 tgcaaaataagcacttatgcatagaattagagaaaaggttacaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacct 10860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 7577 - 7634
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
7577 tttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataa 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 17002 - 17059
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
17002 tttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataa 17059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 6836 - 6916
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||    
6836 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataacaact 6916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12480 - 12399
Alignment:
216 ctcatagaatctctatcacctcttgggtcttcaagcttttctcccttctaaccattttcct-cttctcttgaactttctctct 297  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
12480 ctcatagaatctttatcacttcttgattcttcaagc-tttctcccttctaacccttttgctccttctcttgaactttctctct 12399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 28711 - 28781
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 71  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
28711 tttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 28781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2388 - 2317
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
2388 tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 11269 - 11326
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||    
11269 tttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataa 11326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 1360 - 1416
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
1360 tttccccaacaacaactcaattatcactaatttcatgta-tcaaacatatcatcataa 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22500 - 22424
Alignment:
2 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaaca 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||| ||   ||||||||||||| ||||    
22500 ttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaaca 22424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1581 - 1402
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |  |  || |||||||| ||    
1581 tttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcattt 1482  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacctcaat 183  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||  |  | |||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
1481 attcaattaagcacttattcatacaacaaatg-aaaactac-actaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctcaat 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 79714 - 79854
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   || |||||||||| | || ||| || | || |||||| ||    
79714 tttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaac-aattaatcattt 79812  T
101 atttaattaagcacttaagcatacaattagggaaaaattaca 142  Q
    ||  |||||| ||||||  |||||||| |  |||||||||||    
79813 atccaattaatcacttattcatacaataattgaaaaattaca 79854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 1
Alignment:
20 attatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattt-aattaagcacttaa 118  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||  ||||||||||| | ||| |||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||     
145 attatcaacaaattcatatacccaaacatcacatcaaagcataagcacgaattttatcaattaaattcaaactaatcacttatttcaattaagcacttat 46  T
119 gcatacaattaggg-aaaaattacaactaagtgattatgattgaa 162  Q
    ||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||    
45 gcaaagaattagggtagaaactacaactaagagattgtgattgaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1628
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcactt 100  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
1529 tttcatcaacaacaacttaattatcatcaaattcatgtatccaaatatggcatcaaaacataagcacgaatttcaacaattaaaatcacaataatcactt 1628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 10845 - 10908
Alignment:
9 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 72  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||    
10845 acaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 3501 - 3669
Alignment:
8 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaat 107  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || || | || |||||| ||| | |||    
3501 aacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaat 3599  T
108 taagcacttaagcatacaattagggaaaaattacaactaagtgattatgattgaaatctaaccctcttacct 179  Q
    ||||||||||  |||||||| |  | |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
3600 taagcacttattcatacaataattgtaaaattgcaa-taaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 3669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 89930 - 89880
Alignment:
7 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcata 57  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
89930 caacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcata 89880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 116619 - 116506
Alignment:
12 acaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttatttaattaag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| || |||| || |||| | ||| | |||||||    
116619 acaattcaattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagc-aattaataatttactcaattaag 116521  T
112 cacttaagcatacaa 126  Q
    ||||||  |||||||    
116520 cacttattcatacaa 116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 469 - 526
Alignment:
1 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 58  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
469 tttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University