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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3468_low_7 (Length: 361)

Name: NF3468_low_7
Description: NF3468
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3468_low_7
NF3468_low_7
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-354)||(28678245-28678598)
chr5 (1-354)||(28704237-28704592)
chr5 (15-354)||(759524-759866)
chr5 (1-354)||(5506065-5506414)
chr5 (1-250)||(34016320-34016563)
chr5 (154-354)||(30490226-30490427)
chr5 (183-345)||(26506600-26506760)
chr5 (193-347)||(17343783-17343936)
chr5 (1-108)||(30490083-30490190)
chr5 (193-322)||(20884320-20884449)
chr5 (1-173)||(38740219-38740394)
chr5 (1-154)||(20883208-20883361)
chr5 (4-173)||(35049027-35049188)
chr5 (1-139)||(32911065-32911194)
chr5 (186-254)||(14216905-14216973)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-354)||(55527275-55527631)
chr4 (1-353)||(24973509-24973864)
chr4 (1-230)||(45244971-45245203)
chr4 (127-354)||(34234459-34234688)
chr4 (171-322)||(50007333-50007485)
chr4 (171-318)||(50335099-50335247)
chr4 (5-173)||(41420271-41420442)
chr4 (3-173)||(1939003-1939176)
chr4 (1-152)||(50334314-50334464)
chr4 (1-173)||(18486722-18486896)
chr4 (1-173)||(156345-156509)
chr4 (183-254)||(41784344-41784415)
chr4 (35-99)||(41785102-41785166)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-354)||(38386534-38386890)
chr7 (1-354)||(19363551-19363907)
chr7 (3-354)||(38048005-38048349)
chr7 (1-354)||(4543-4890)
chr7 (171-322)||(44225336-44225488)
chr7 (1-173)||(44226109-44226283)
chr7 (193-312)||(2368802-2368921)
chr7 (1-139)||(10525986-10526124)
chr7 (3-173)||(23943354-23943529)
chr7 (1-170)||(12168509-12168681)
chr7 (183-344)||(24503381-24503537)
chr7 (188-354)||(12868903-12869067)
chr7 (243-346)||(26151807-26151903)
chr7 (42-98)||(29248665-29248721)
chr7 (35-91)||(29256227-29256283)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-354)||(8273595-8273951)
chr2 (171-354)||(26225153-26225341)
chr2 (171-347)||(35003716-35003891)
chr2 (1-139)||(22728104-22728242)
chr2 (193-322)||(22728878-22729007)
chr2 (1-154)||(19379880-19380032)
chr2 (1-173)||(9826918-9827091)
chr2 (193-320)||(9827724-9827851)
chr2 (183-347)||(14330021-14330179)
chr2 (1-173)||(35004479-35004654)
chr2 (94-173)||(26224465-26224547)
chr2 (178-219)||(28758457-28758498)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (1-347)||(39646120-39646469)
chr3 (1-354)||(35068659-35069015)
chr3 (1-354)||(34084442-34084793)
chr3 (1-255)||(19871620-19871859)
chr3 (1-146)||(15041041-15041186)
chr3 (1-139)||(20513723-20513860)
chr3 (171-322)||(30930404-30930556)
chr3 (171-322)||(14439627-14439778)
chr3 (3-173)||(54336403-54336575)
chr3 (1-147)||(7666041-7666177)
chr3 (193-322)||(20514680-20514809)
chr3 (193-346)||(27933682-27933829)
chr3 (183-354)||(30530697-30530862)
chr3 (1-139)||(53771965-53772101)
chr3 (272-353)||(19871550-19871631)
chr3 (193-322)||(54336116-54336245)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-354)||(34278955-34279311)
chr8 (53-354)||(5966646-5966950)
chr8 (171-321)||(5016468-5016619)
chr8 (1-170)||(22675543-22675720)
chr8 (1-173)||(5015674-5015849)
chr8 (3-173)||(5075903-5076075)
chr8 (1-139)||(32076777-32076914)
chr8 (218-322)||(32075857-32075961)
chr8 (1-139)||(33228647-33228783)
chr8 (183-340)||(15893493-15893644)
chr8 (3-173)||(41601259-41601434)
chr8 (183-254)||(30944364-30944435)
chr8 (35-121)||(24618654-24618740)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (1-353)||(12704177-12704532)
chr6 (1-354)||(32274819-32275176)
chr6 (1-354)||(4319443-4319800)
chr6 (1-354)||(31483997-31484354)
chr6 (171-322)||(1030593-1030745)
chr6 (1-173)||(1031372-1031545)
chr6 (3-141)||(23236171-23236308)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-353)||(33618174-33618529)
chr1 (1-353)||(28475103-28475458)
chr1 (1-354)||(33401756-33402103)
chr1 (1-354)||(48026492-48026848)
chr1 (1-281)||(35563842-35564108)
chr1 (171-322)||(12066929-12067081)
chr1 (186-303)||(30704112-30704229)
chr1 (199-347)||(7318861-7319007)
chr1 (5-154)||(23943317-23943466)
chr1 (1-153)||(36183088-36183234)
chr1 (1-173)||(12067650-12067815)
chr1 (1-173)||(1181148-1181313)
chr1 (4-75)||(25818876-25818947)
chr1 (171-236)||(23942632-23942698)
chr1 (3-89)||(30703304-30703389)
[»] scaffold0700 (2 HSPs)
scaffold0700 (193-354)||(4349-4509)
scaffold0700 (3-154)||(4638-4788)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (1-123)||(33305-33426)
scaffold0015 (193-322)||(32490-32619)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 28678245 - 28678598
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28678245 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactcaaaaacatcgttttt-tcacaatcatgtaatcacacataaacgatccaaac 28678343  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacacttgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28678344 ggtccaaatttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacacttgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataat 28678443  T
Q  201 attagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtc-ggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgacc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28678444 attagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcgggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgacc 28678543  T
Q  300 gacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28678544 gacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 28678598  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 28704237 - 28704592
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  28704237 agtttaacaagattatcggataatacgacataatctattcaaagtactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcatacataaacgatccagac 28704336  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28704337 ggtccaaatttcacaaattcgtcagtaatgacccttaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 28704436  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28704437 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaa-atgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccga 28704535  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28704536 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 28704592  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 759524 - 759866
Alignment:
Q  15 atcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacggtccaaagttcac 114  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  759524 atcggataatacgacataatcaatccaaataactcaaaaacatcattttactcacaatcacgtaatcacacgtaaacgatccaaacgatccaaatttcac 759623  T
Q  115 aaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattatattagttacat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  759624 aaattcgccggtaatgacccgtaataatttacacacacttaatgacacgcaaatgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacat 759723  T
Q  212 attggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  759724 attggccataaatatcaaaattacacaaccgaccaccaaaaaatatgttggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgactgacccaaaagtg 759823  T
Q  312 tcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  759824 tcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 759866  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5506414 - 5506065
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttc-tcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506414 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcatttttcctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 5506315  T
Q  100 cggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttata 196  Q
              |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5506314 t---------ttcacaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacaattcaaaataattcatttcatatatttata 5506224  T
Q  197 ttatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatt-tgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgcc 295  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5506223 taatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacagccggccaccaaaaaaatatgtcggggtctaataccaccaaaaaatatgacgaacacc 5506124  T
Q  296 gaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5506123 gaccgacccaaaaatgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 5506065  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 34016320 - 34016563
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34016320 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgttcttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaat 34016419  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
             |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34016420 ---------ttcacaaattcgccggtaatgaccggtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataaatcatttcatatatttatat 34016510  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaa 250  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34016511 aatattagttacatattgacaataaatatcaaaattacacaaccagccaccaa 34016563  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 354
Target Start/End: Original strand, 30490226 - 30490427
Alignment:
Q  154 tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccacc-aaaa 252  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30490226 tgacacgtaaacaatccaaaacaattcatttcatatatttatataatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaa 30490325  T
Q  253 aatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattctt 352  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30490326 aatatttcggggtgtaataccaacaaaaaaaatgacgaacaccgaccgacccagaagtgtcataacatatctaactagactagtgatagtgcatattctt 30490425  T
Q  353 cg 354  Q
    ||    
T  30490426 cg 30490427  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 183 - 345
Target Start/End: Original strand, 26506600 - 26506760
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||    
T  26506600 ttcatatatttatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcgg--tataataccaccaaaaaa 26506697  T
Q  283 taggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgca 345  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26506698 taggacgaacaccgacgaaccaaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 26506760  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17343936 - 17343783
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17343936 tatataatattagttatatattggccataaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaatacca-caaaaaataggacgaac 17343838  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcata 347  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  17343837 accgaccgatcaaaaagtgtcataacctagctaactaggctagtgatagtgcata 17343783  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 30490083 - 30490190
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30490083 agtttaacaagagtatcggataatacgacataatcaatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 30490182  T
Q  101 ggtccaaa 108  Q
    ||||||||    
T  30490183 ggtccaaa 30490190  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Original strand, 20884320 - 20884449
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884320 tatataatattagttacatattggccacaaatatcaaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcgggatgtaataccaccaaaaaataggacgaac 20884419  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20884420 accgaccgacctataagtgtcctaacctat 20884449  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38740394 - 38740219
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  38740394 agtttaacaacattatcatataatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatagtttttcactcaatcacataatcaccaataaacgatccaaac 38740295  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
     ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  38740294 agtccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 38740219  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 20883208 - 20883361
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatc-gtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  20883208 agtttaacaagattattggataatacgacacaattgatcaaaattacacaaaaacatcattttttttcacaatcacataatcacac-ttaacgatccaaa 20883306  T
Q  100 cggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt 154  Q
    ||||||||  | | |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20883307 cggtccaatttacgcaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacactt 20883361  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 35049027 - 35049188
Alignment:
Q  4 ttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacggt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||          |||| |    
T  35049027 ttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttt-tcacaatcacataatcacacat----------aacgat 35049115  T
Q  104 ccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  35049116 ccaaattacacaaattcgccggtaatgacccataatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 35049188  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32911194 - 32911065
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||        ||||||||||| |||| || ||||    
T  32911194 agtttaacaagattatcggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgtttttctca--------taatcacacat-aacgatctaaac 32911104  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
     || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32911103 agtacaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaat 32911065  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Original strand, 14216905 - 14216973
Alignment:
Q  186 atatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaa 254  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  14216905 atatatatatataatgttagttatatattggccataaatatcggcgttacataactggccaccaaaaaa 14216973  T

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Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 55527631 - 55527275
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55527631 agtttaacaagattaccggataacacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 55527532  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55527531 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacgcttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 55527432  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55527431 aatattagttacatgttggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccga 55527332  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55527331 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 55527275  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24973864 - 24973509
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  24973864 agtttaacaagattatcggataatacggcgtaatcgatccaaattactcaaaaacctcatttttctcacaatcacgtaatcaagcataaacgatccaaac 24973765  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973764 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacctgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 24973665  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  24973664 aatattagttacattttggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaatatgacgaacaccga 24973565  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24973564 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcctattcttc 24973509  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 45244971 - 45245203
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45244971 agtttaagaagattatcggataatacaacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 45245070  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45245071 gttccaaatttcacaaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 45245170  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaa 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45245171 aatattagttacatattggccataaatatcaaa 45245203  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 127 - 354
Target Start/End: Original strand, 34234459 - 34234688
Alignment:
Q  127 aatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattatattagttacatattggccataaa 223  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  34234459 aatgatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaatgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattgaccgtaaa 34234558  T
Q  224 tatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatc 323  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34234559 tatcaaaattacacaaccagcaaccaaaaaatatgtcgaggcgtaatacca-caaaaaatagaacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctata 34234657  T
Q  324 taactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34234658 taactagactagtgatagtgcatattcttcg 34234688  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Original strand, 50007333 - 50007485
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50007333 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccaaaaatatccaaattacttaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaa 50007432  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50007433 taccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcataacctat 50007485  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 50335099 - 50335247
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50335099 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattagccacaaatatccaaattacataatcggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaa 50335198  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  50335199 taccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaac 50335247  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41420442 - 41420271
Alignment:
Q  5 taacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtcc-aaacggt 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  41420442 taacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaaacggt 41420344  T
Q  104 ccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41420343 ccaaattacacaaattcgccggtaatgactcgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 41420271  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1939176 - 1939003
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgt-ttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  1939176 tttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaacg 1939078  T
Q  102 gtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |   |||||| |||||||||||||    
T  1939077 gtccaagttacacaaattcgccggtaatgacctgtaatcacttaaacacatttaatgacacgtaaacgatccaaa 1939003  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 50334314 - 50334464
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||     
T  50334314 agtttaacaagattgttggataatacgacacaatcgatgaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcacgcat-aacgatccaaat 50334412  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacac 152  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  50334413 ggtccaaattacacaaattcgctggtaatgacccgtaatcacttaaacacac 50334464  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18486896 - 18486722
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||    
T  18486896 agtttaacaagattatcgaataatatgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcatttttctcacaatcacataatcatacat-aacgattcaaac 18486798  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
      |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18486797 aatccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 18486722  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 156345 - 156509
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |           |||| |||||||    
T  156345 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatagtttttttcacaatcacat-----------aacgatccaaac 156433  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  156434 ggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttgatgacacgtaaacgatccaaa 156509  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41784415 - 41784344
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaa 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  41784415 ttcatatatttatataatattagttacatattgatcacaaatatccaaattacataattggccaccaaaaaa 41784344  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41785166 - 41785102
Alignment:
Q  35 cgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41785166 cgatccaaattacccaaattcatcgtttttctcaaaatcacataatcacacataaacgatccaaa 41785102  T

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Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 38386534 - 38386890
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38386534 agtttaacaagattatcggataatacgacataattgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 38386633  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38386634 ggtccaaatttcacaaatttaccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 38386733  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38386734 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccga 38386833  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38386834 ccgatccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 38386890  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19363907 - 19363551
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19363907 agtttaagaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 19363808  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19363807 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaatgacctgtaataatttaaacacacttaatgacaggtaaacgatccaaaataattcatttcatatatatatat 19363708  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||    
T  19363707 aatattagttacatattagccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccactaaaatatatgacgaacatcga 19363608  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19363607 tcgatccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 19363551  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 354
Target Start/End: Original strand, 38048005 - 38048349
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacgg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  38048005 tttaacaagattat-ggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatagtttttctcacaatcacataatcacacataaacggtccaaat-- 38048101  T
Q  103 tccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatatta 199  Q
           ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||  |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38048102 -------ttcacaaattccctgataattacccgtaataatttaaactcacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataa 38048194  T
Q  200 tattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgacc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38048195 tattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgacc 38048294  T
Q  300 gacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38048295 gacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 38048349  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4890 - 4543
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||     
T  4890 agtttaacaagattatcagataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacattcacgtaatcacacataaacgattcaaat 4791  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
             |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  4790 ---------ttcacagattcgccgttaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcattttatttatttattt 4700  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4699 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccga 4600  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4599 ccgatctaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 4543  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44225488 - 44225336
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44225488 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaa 44225389  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  44225388 taccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 44225336  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44226283 - 44226109
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  44226283 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaac 44226185  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  44226184 ggtccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 44226109  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 312
Target Start/End: Original strand, 2368802 - 2368921
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2368802 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacatgaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 2368901  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgt 312  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  2368902 accgaccgaccaaaaagtgt 2368921  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 10525986 - 10526124
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  || |||     
T  10525986 agtttaacaacattatcagataatacgacattatcaatcaaaattacacaaaaacatagtttttcgcacaatcacgtaatcaccaataaacaatcaaaat 10526085  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10526086 ggtccaaattacacaaattcgccggtaataacccgtaat 10526124  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23943529 - 23943354
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaa-catcgtttttct--cacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||    
T  23943529 tttaacaagattattggataatacgacaaaatcgatcaaaattacacaaaaaacatcgtttttttttcacaatcacataatcagacataa-caatccaaa 23943431  T
Q  100 cggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    | || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  23943430 cagttcaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 23943354  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 12168509 - 12168681
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || |||||| | | |||||    
T  12168509 agtttaacaacattatcagataatacgacataatcgatccaaattacacaaaatcatcgtttatcatacaatcacataataacgcataaaagattcaaac 12168608  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatcc 170  Q
    | |||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||| | |||| ||||||   |||||| ||||||||||    
T  12168609 gatccaaattacacaaattcgtcgttaatgacgcgtaatcacttaattacacttaatgacacgtaaacgatcc 12168681  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24503537 - 24503381
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||||   |||||  ||  || |   |||||||    
T  24503537 ttcatatatttatacaatattagttaaatattggccacaaatatccaaattacatatccggccaccaaaaaacacgtcggtatgatat-cgtgcaaaaaa 24503439  T
Q  283 taggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgc 344  Q
    |||||| |||    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  24503438 taggacaaac----accgaccaaaaagtctcataacctatctaagtagtctagtgatagtgc 24503381  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12869067 - 12868903
Alignment:
Q  188 atatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaatagga 287  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||| |||| |  ||||||||||||    
T  12869067 atatatatataatgttagttacatattggccacaagtatcagcgttacataaccggccaccaaaaaatatgtc--ggtgcaatatcgacaaaaaatagga 12868970  T
Q  288 cgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||| || ||  |   |||| ||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||    
T  12868969 cgaacaccaacaaaaaaaaaaatgtcatagcctatctaactagcttagtgatagagcataatcttcg 12868903  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26151903 - 26151807
Alignment:
Q  243 gccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagt 342  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26151903 gccaccaaaaaatatgtcgg--tgtaatatcaacaaaaaataggacaaac----accaacaaaaaagtgtcataacctatctaactag-ctagtgatagt 26151811  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Original strand, 29248665 - 29248721
Alignment:
Q  42 aattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaa 98  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29248665 aattacccaaattcatcgtttttctcaaaatcacataatcacacataaacgatccaa 29248721  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 29256227 - 29256283
Alignment:
Q  35 cgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaac 91  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  29256227 cgatccaaattacacaaaatcatcgtttttttcgcaatcacaaaatcacacataaac 29256283  T

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Target: chr2 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 8273595 - 8273951
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8273595 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 8273694  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
      |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8273695 attccaaatttcacaaattcaccggtaatgactcgtaataatttaaaaacacttaatgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 8273794  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  8273795 aatattagttacatattgaccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaataggacgaacatcga 8273894  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8273895 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactaaactagtgatagtgcatattcttcg 8273951  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 354
Target Start/End: Original strand, 26225153 - 26225341
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatttatattatat------tagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcgggg 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||      |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26225153 aaaataattcattt-atatatttatataatatataatatagttacatattgatcataaatatccaaattacacaatcggccaccaaaaaatatgtcgggg 26225251  T
Q  265 tgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26225252 tgtaataccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacgtatctacctagactagtgatagtgcataatcttcg 26225341  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35003891 - 35003716
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaat 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | | | ||||||||||||   ||||||||||||    
T  35003891 aaaatatttcatttcatatatttatataatattagttacatattgaccacaaatatccaaattacatatccgaccaccaaaaaatacatcggggtgtaat 35003792  T
Q  271 accaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcata 347  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35003791 accaccagaaaataggacgaacaccga-cgacctaaaagtgacataacctatctaactaggctattgatagtgcata 35003716  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 22728104 - 22728242
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  22728104 agtttaacaacattatcagataatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatcatttttctcacaatcacataatcacccataaacgaaccaaac 22728203  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  22728204 ggtccaaattacacaaattcgctggtaatgacccgtaat 22728242  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Original strand, 22728878 - 22729007
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22728878 tatataatattagttacatattggccacagatatccaaattaaataactggccacccaaaaatacgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 22728977  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22728978 accgatcgacctaaaagtgtcataacctat 22729007  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19380032 - 19379880
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19380032 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgaacaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaac 19379934  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt 154  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  19379933 ggtccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacactt 19379880  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 9826918 - 9827091
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  9826918 agtttaacaagattgtcagataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgtttttctcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaac 9827016  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt--gacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||   |||| |||||||||||||    
T  9827017 ggtccgaattacacaaattcatcagtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatacacgtaaacgatccaaa 9827091  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 9827724 - 9827851
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9827724 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaataccacaaaaaaataagacgaac 9827823  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacct 320  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  9827824 accgaccgacctataagtgtcctaacct 9827851  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 347
Target Start/End: Original strand, 14330021 - 14330179
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaa 282  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||  ||||||| |  |||||||    
T  14330021 ttcatatatttgtataatattagttttatattggccacaaatattcaaattacataaccgaccaccaaaaaatgcgtcgg--tgtaatatcgacaaaaaa 14330118  T
Q  283 taggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcata 347  Q
    ||||||||||    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14330119 taggacgaac----accgaccaaaaactgtcataatctatctaactagactagtgatagtgcata 14330179  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35004654 - 35004479
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  || ||||||| ||||||||  | || ||  ||||||| |||||||    
T  35004654 agtttaacaacattatcatataatacgacataatcgatccaaattacacaaaattattgtttttcgcacaatcaaattattaccaataaacgatccaaac 35004555  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||| |||| | |||||||||| |  |||||||||||||| | | ||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  35004554 ggttcaaattacacaaattcgtcgataatgacccgtaatcactaaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 35004479  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 173
Target Start/End: Original strand, 26224465 - 26224547
Alignment:
Q  94 tccaaacggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26224465 tccaaacggtcaaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 26224547  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28758498 - 28758457
Alignment:
Q  178 ttcatttcatatatttatattatattagttacatattggcca 219  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28758498 ttcacttcatatatttatataatactagttacatattggcca 28758457  T

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Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 39646120 - 39646469
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39646120 agtttaagaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatagtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacaatccaaac 39646219  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646220 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 39646319  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39646320 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaacctgccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaatgggacgaacaccga 39646419  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcata 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39646420 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcata 39646469  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35069015 - 35068659
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35069015 agtttaacaagattatcagataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaactatccaaac 35068916  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35068915 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacaattaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 35068816  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  35068815 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattatacaaccggccaccaaaaaatatgtcagggtgtaataccacaaaaaaatatgacgaacaccga 35068716  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35068715 ccgactcaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 35068659  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 34084442 - 34084793
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34084442 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 34084541  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34084542 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaatagttcatttcatatatttatat 34084641  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |    
T  34084642 aatattagttacgtattggccataaatatcaaaattacacaaccgaccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaa-----a 34084736  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34084737 ccgacccaaaaatgtcataacctatctaactaaactagtgatagtgcatattcttcg 34084793  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19871859 - 19871620
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19871859 agtttaacaagattatcggataatatgacataatcgatctaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaa- 19871761  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
                     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19871760 -----------------ttcgccggtaattacccgtaataatttaaacacactttatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 19871678  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaat 255  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19871677 aatattagttacatattgaccataaatatcaaaattacacaaccggccacaaaaaaat 19871620  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 15041041 - 15041186
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15041041 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaatcatgtaatcacacataaacgatccaaac 15041140  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaa 146  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  15041141 ggtccaaatttcacaaattcgtcggtaattatccgtaataatttaa 15041186  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 20513723 - 20513860
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  20513723 agtttaacaagattatcggatcatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatcgtttttctcataatcacataatcacacgt-aacgatccaaac 20513821  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  20513822 ggtccaaattacacaaattcaccggtaatgacccgtaat 20513860  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Original strand, 30930404 - 30930556
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  30930404 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatatttgccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgaaa 30930503  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30930504 taccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 30930556  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Original strand, 14439627 - 14439778
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||   | |||||||||    
T  14439627 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacattggggtgtaa 14439726  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14439727 taccaccaaaaaataggac-aacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 14439778  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 54336575 - 54336403
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacgg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  54336575 tttaacaaaattatcggataatatgacataatcgttcaaaattacacaaaaacgtcgtttttctcacaatcacataatcacacat-aacgatcaaaacgg 54336477  T
Q  103 tccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  54336476 tccaaatttcacaaatttgccggtaatgacctgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 54336403  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 7666041 - 7666177
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||      
T  7666041 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaatt-ctcaaaaacattgtttttctcacaatcacttaatcacacataaa-----caa-- 7666132  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaa 147  Q
      |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7666133 --tccaaatttcagaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaa 7666177  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Original strand, 20514680 - 20514809
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20514680 tatataatattagttacatattggccacaaatctccaaattacataaccggccacccaaaaaaatgttggggtgtaatatcaccaaaaaataggacgaac 20514779  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20514780 atcgaccgacctaaaagtgtcataatctat 20514809  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27933829 - 27933682
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27933829 tatataatgttagttacatattggccacaaatattcaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtc--ggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 27933732  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcat 346  Q
        ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  27933731 ----accgaccaaaaagtgtcataatcaatctaattagactagtgatagtgcat 27933682  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30530862 - 30530697
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||| |   ||||||    
T  30530862 ttcatatatttatataatattagttacataatgagcacaaatatccaaattacataactgaccaccaaaaaatacgtccg--tgtaatatcgaaaaaaaa 30530765  T
Q  283 taggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30530764 taggacggac----accgaccaaaaagtgtcataacctatctaactagactaatgatagtgcataatcttcg 30530697  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53772101 - 53771965
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||    
T  53772101 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttt-tcacaatcacataatcacacgt-aatgatccaaac 53772004  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  53772003 ggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaat 53771965  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19871631 - 19871550
Alignment:
Q  272 ccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttc 353  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19871631 ccacaaaaaaataggatgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttc 19871550  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54336245 - 54336116
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54336245 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccgaccaccagaaaatacgtcgggatgtaataccaccagaaaataggacaaac 54336146  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
       |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  54336145 attgaccgaccaaaaagagtcataacctat 54336116  T

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Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34279311 - 34278955
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34279311 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaacacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 34279212  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279211 ggtccaaatttcacaaattcgtcggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 34279112  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34279111 aatattagttacatattggccataaatataaaaattacacaaccgaccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataagacgaacaccga 34279012  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  34279011 tcgatccaaaagtgtcataacctatctaactaaaatagtgatagtgcatattcttcg 34278955  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5966950 - 5966646
Alignment:
Q  53 aacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacac 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5966950 aacatagtttttctcacaatcacataatcacacataaacgatccaaacggtccacatttcacacattcgtcggtaatgacccgtaataatttaaacacac 5966851  T
Q  153 tt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccacca 249  Q
    ||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5966850 ttagtgacacgtaaacgatccaaactaattcatttcatatatttatataatattagttacatattggtcataaatatcaaaattacacaaccggtcacca 5966751  T
Q  250 aaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatatt 349  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5966750 aaaaatatgtcgaggtgtaataccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatatt 5966651  T
Q  350 cttcg 354  Q
    |||||    
T  5966650 cttcg 5966646  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 321
Target Start/End: Original strand, 5016468 - 5016619
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  5016468 aaaataatttatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcgaggtgtaa 5016567  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataaccta 321  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  5016568 taccacaaaaaaataagacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaaccta 5016619  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22675720 - 22675543
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacata-----aacggtc 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||| |     
T  22675720 agtttaacaagattatcggatagtacgacataatcgatcaaaattatacaaaaacatcgtttttctcacaatcacataatcacacataagtataacgatt 22675621  T
Q  96 caaacggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatcc 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||| |||| | ||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  22675620 caaacggtccaaatttcacaaattcgctggtgatggcccataatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatcc 22675543  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5015674 - 5015849
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatc-gtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  5015674 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacgcaaaaacatcattttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaag 5015772  T
Q  100 cggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5015773 cggtccaaattacacaaattcgctagtaatgacccataatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 5015849  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5076075 - 5075903
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacgg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||    
T  5076075 tttaacaagattattggataatgcgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcgcatgatcacacat-aacgatccaaacgg 5075977  T
Q  103 tccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5075976 tccaaattacacaaattcgccggtaatgacctgtaatgacttaaaaacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 5075903  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32076914 - 32076777
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||    
T  32076914 agtttaacaacattataagataatacgacataatcgatcaaaattacacaaaatcatcgtttttctcacgatcacataatcacacat-aacaatcaaaac 32076816  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  32076815 ggtccaaattacagaaattcgccggtaatgacccgtaat 32076777  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32075961 - 32075857
Alignment:
Q  218 cataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataa 317  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  32075961 cataaatatccaaattacataaccggtcacccaaaaatacgtcggggtgtaataccactaaaaaataagacgaacaccgaccgaccaaaaagtgtcatag 32075862  T
Q  318 cctat 322  Q
    |||||    
T  32075861 cctat 32075857  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33228783 - 33228647
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||    
T  33228783 agtttaacaacattatcagataatacgacattatcgatccaaattacacaaa--catagtttttcgcacaaccacgtaatcaccaataaacgatcaaaac 33228686  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaat 139  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  33228685 ggtccaaattacacaaattcgccggtaatcacccataat 33228647  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Original strand, 15893493 - 15893644
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||  ||||  ||||||||| |  |||||||    
T  15893493 ttcatatatttatataatattaattacatattggccacaaatatccaaattacataaccgaccaccaaaaaaaatgtc--ggtgtaatatcgacaaaaaa 15893590  T
Q  283 taggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgata 340  Q
    ||||| |||     || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  15893591 taggaggaa----tactgaccaaaaagtgtcttcacctatctaactagactagtgata 15893644  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41601434 - 41601259
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgt---ttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaa 99  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  |||    
T  41601434 tttaataagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatttaaa 41601336  T
Q  100 cggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
     |||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41601335 tggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgactcgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 41601259  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30944435 - 30944364
Alignment:
Q  183 ttcatatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaa 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30944435 ttcatatatttatataatattagttagatattggccacaaatatccaaattacataactggccaccaaaaaa 30944364  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Original strand, 24618654 - 24618740
Alignment:
Q  35 cgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacggtccaaagttcacaaattcg 121  Q
    |||| |||||||| ||||   ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| | || |||||||    
T  24618654 cgatccaaattacacaaatttatcgtttatcacacaatcacataatcacacataaacgatcaaaacgatccaaattacagaaattcg 24618740  T

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Target: chr6 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 12704177 - 12704532
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12704177 agtttaagaagattatcggataatacgacataatcgatcctaattactcaaaaacatcgtttttttgacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 12704276  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704277 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgatacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 12704376  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12704377 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacactga 12704476  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttc 353  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  12704477 ccgacccaaaaatgtcatatcctatctaactagactagtgatattgcataatcttc 12704532  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 32274819 - 32275176
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32274819 agtttaagaagattatcgaataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 32274918  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32274919 ggtccaaatttcacaaattcgccgataatgacccgtaataatttaaacacactcaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 32275018  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccacc-aaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccg 296  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  32275019 aatattaggtacatattggccataaatatcaaaattacacaaccagccaccaaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatataacgaacaccg 32275118  T
Q  297 accgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32275119 accaacccaaaagtgtcataacctatctaacaagactagtgatagtgcatattcttcg 32275176  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 4319443 - 4319800
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacaca--taaacggtccaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||    
T  4319443 agtttaagaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaa-catcgtttttctcacaattacgtaatcacacacataaacgatctaa 4319541  T
Q  99 acggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttat 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4319542 acggtccaaatttcacaaattcgccggtgatgacccgtaataatttatacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttat 4319641  T
Q  196 attatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgcc 295  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4319642 ataataatagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcagggtgtaataccaccaaaaaattggacgaacacc 4319741  T
Q  296 gaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4319742 gaccgacccaaaagtgtcacaacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 4319800  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 31483997 - 31484354
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  31483997 agtttaacaagattatcggataatacaacataatagatcaaaattacttaaaaacatcgtttttctcacaattacgtaatcacacataaatgatccaaac 31484096  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| || | |||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484097 ggtccaaatttaaaaaattcaccggtaatgtcccgtaacaatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 31484196  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccacc-aaaaaataggacgaacgccg 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  31484197 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccatcaaaaaatatttcggggtgtaataccaccaaaaaaataggacgaacaccg 31484296  T
Q  297 accgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31484297 accgacccaaaagggtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 31484354  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1030745 - 1030593
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1030745 aaaataattcatctcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaataagtcggggtgtaa 1030646  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1030645 taccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 1030593  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1031545 - 1031372
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  1031545 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgttttt-tcacaatcacataatcacacataa-cgatccaaac 1031448  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  1031447 ggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 1031372  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23236308 - 23236171
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  23236308 tttaacaagattatcggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttctcacaataacataatcacacat-aacgatccaaacgg 23236210  T
Q  103 tccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataa 141  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  23236209 tccaaattacacatattcgcccgtagtgacccgttataa 23236171  T

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Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 33618174 - 33618529
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33618174 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaa- 33618272  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33618273 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaattatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 33618372  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaata-ggacgaacgccg 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| | |    
T  33618373 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaaaattgacgaacactg 33618472  T
Q  297 accgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33618473 accgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgataatgcatattcttc 33618529  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 28475103 - 28475458
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28475103 agtttaagaagattatcggataatgcgacttaatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 28475202  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28475203 ggtccaaatttcacaaattcgctggcaatgacctgtaataatttaaacacacttaatgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 28475302  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28475303 aatattagttacatattggctgtaaatatcaaaattacacaaccgaccaccaaaaaatatgatggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccga 28475402  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28475403 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagcgatagtgcatattcttc 28475458  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 33401756 - 33402103
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33401756 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaat 33401855  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
             |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33401856 ---------ttcacaaattcgccggtaattatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 33401946  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  33401947 aatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaaattgacgaacaccga 33402046  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33402047 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgcatattcttcg 33402103  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48026848 - 48026492
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48026848 agtttaacaagattattggataacacaacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 48026749  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt---gacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatat 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48026748 ggtccaaatttcaaaaattcgtcggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacatgtaaacgatccaaaataattcattacatatatttatat 48026649  T
Q  198 tatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccga 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48026648 aatattagttacatattgaccataaatatcaaaattacacaaccggccatcaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccga 48026549  T
Q  298 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  48026548 cctatccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtcatagtgcgtattcttcg 48026492  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 35563842 - 35564108
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35563842 agtttaaccagattatcagataatacgacataatcgatcc-------tcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaac 35563934  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacacttgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatattat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |    |||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||    
T  35563935 ggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacctgtaataatttaaacaa---tgacacgtaaacaatccaaaataatt----tcatatatttatataat 35564027  T
Q  201 attagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35564028 attagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaatggcctccaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 35564108  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12067081 - 12066929
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12067081 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaa 12066982  T
Q  270 taccaccaaaaaataggacgaacgccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||| ||||||||    
T  12066981 taccaccaaaaaataggacgaacaccaaccgacctataaatgtcctaacctat 12066929  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 303
Target Start/End: Original strand, 30704112 - 30704229
Alignment:
Q  186 atatatttatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaatag 285  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30704112 atatatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccatcaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaatatag 30704211  T
Q  286 gacgaacgccgaccgacc 303  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30704212 gacgaacaccgaccgacc 30704229  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Original strand, 7318861 - 7319007
Alignment:
Q  199 atattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacgccgac 298  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| |||||   |||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  7318861 atattagtcacatattggccacaaatatccaaattacataaccggacacaaaaaaatatgtcga--tgtaatactacaaaaaaatatgacgaacaccgac 7318958  T
Q  299 cgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcata 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7318959 cgaccaaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgataatgcata 7319007  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23943466 - 23943317
Alignment:
Q  5 taacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtcc-aaacggt 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  23943466 taacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacacat-aacgatccaaaacggt 23943368  T
Q  104 ccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt 154  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  23943367 ccaaattacacaaattcgccggtaatgacacgtaatcacttaaacacactt 23943317  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 36183088 - 36183234
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||| |||||||    
T  36183088 agtttaacaagattatcggataatatgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttctcacaatcacataatcac------acgatccaaac 36183181  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact 153  Q
    || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  36183182 ggaccaaattacaaaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacact 36183234  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12067815 - 12067650
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||          |||    
T  12067815 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcactcat----------aac 12067726  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  12067725 gatccaaacttaacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatccaaa 12067650  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1181313 - 1181148
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||          |||    
T  1181313 agtttaataagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacgtcgtttttttcacaatcacataatcacacat----------aac 1181224  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaa 173  Q
    | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  1181223 gatccaaattccacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatccaaa 1181148  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25818947 - 25818876
Alignment:
Q  4 ttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcac 75  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25818947 ttaacaatattataagataatacaacataatcgatccaaattacacaaaatcatcgtttttctcacaatcac 25818876  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23942698 - 23942632
Alignment:
Q  171 aaaataattcatttcatatatt-tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattaca 236  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23942698 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatacaaattaca 23942632  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 30703304 - 30703389
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  30703304 tttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacac-aaaacatcatttttttcacaactacataatcacacataa 30703389  T

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Target: scaffold0700 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4509 - 4349
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4509 tatataatattaattatatattggccataaatatccaaattacacaatcggccaccaaaaaatacgtcggggtgtaatacaaccaaaaaataggacgaac 4410  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactattgatagtgcatattcttcg 354  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4409 accgaccgaccc-aaagtttcataacctatctaactagactagtgatagtgcataatcttcg 4349  T

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Target: scaffold0700; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4638
Alignment:
Q  3 tttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaacgg 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  4788 tttaaaaagattatcggataatacgacataatcgaacaaaattacataagaacatcgtttttctcacaatcacttaatcacacat-aacgatccaaacgg 4690  T
Q  103 tccaaagttcacaaattcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacactt 154  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  4689 tccaaatttcacaaatttgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacactt 4638  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33426 - 33305
Alignment:
Q  1 agtttaacaagattatcggataatacgacatagtcgattcaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacggtccaaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||     
T  33426 agtttaacaagattatcggatagtacgacataattgatcaaaattacacaaaaatattgcttttctcacaatcacataattacacat-aacgatccaaaa 33328  T
Q  101 ggtccaaagttcacaaattcgcc 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  33327 ggtccaaattacacaaattcgcc 33305  T

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Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32619 - 32490
Alignment:
Q  193 tatattatattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatttgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaac 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| | |  | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32619 tatataatattagttacatattgtccacaaatattcaaattacatatccagtcacccaaaaatacgtcggggtgtaataccaccaaaaactaggacgaac 32520  T
Q  293 gccgaccgacccaaaagtgtcataacctat 322  Q
     | ||||  || ||||||||||||||||||    
T  32519 actgacctgccaaaaagtgtcataacctat 32490  T

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