View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3471_low_74 (Length: 223)

Name: NF3471_low_74
Description: NF3471
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3471_low_74
NF3471_low_74
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-221)||(6563-6783)
scaffold0621 (1-221)||(8494-8718)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-221)||(19292-19513)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (1-221)||(18005674-18005895)
chr7 (1-221)||(67773-67993)
chr7 (1-216)||(44014206-44014418)
chr7 (1-221)||(16219589-16219810)
chr7 (5-221)||(16056360-16056576)
chr7 (1-221)||(47831835-47832056)
chr7 (1-212)||(811012-811224)
chr7 (4-221)||(22072944-22073164)
chr7 (1-217)||(15754765-15754980)
chr7 (1-208)||(12901351-12901560)
chr7 (1-221)||(34200814-34201032)
chr7 (1-140)||(16495430-16495567)
chr7 (1-221)||(11995902-11996120)
chr7 (1-221)||(28505173-28505391)
chr7 (1-150)||(2280061-2280212)
chr7 (1-209)||(20220073-20220281)
chr7 (80-221)||(9389569-9389710)
chr7 (1-96)||(12255789-12255886)
chr7 (1-163)||(1867924-1868088)
chr7 (1-133)||(13647353-13647487)
chr7 (142-221)||(16324175-16324254)
chr7 (1-159)||(14044774-14044935)
chr7 (1-159)||(14354804-14354965)
chr7 (1-99)||(38227509-38227606)
chr7 (1-150)||(19486686-19486837)
chr7 (1-99)||(10063813-10063911)
chr7 (1-99)||(18456408-18456505)
chr7 (1-150)||(15008441-15008592)
chr7 (1-133)||(18430737-18430870)
chr7 (1-95)||(3564363-3564457)
chr7 (1-133)||(456346-456479)
chr7 (1-133)||(11393291-11393424)
chr7 (1-133)||(11972521-11972654)
chr7 (1-133)||(14949126-14949259)
chr7 (1-133)||(15376717-15376850)
chr7 (1-133)||(16232545-16232678)
chr7 (1-133)||(18640297-18640430)
chr7 (1-133)||(20385127-20385260)
chr7 (1-133)||(21189599-21189732)
chr7 (1-133)||(24702263-24702396)
chr7 (1-133)||(27216885-27217018)
chr7 (1-133)||(32125516-32125649)
chr7 (1-133)||(41522942-41523075)
chr7 (1-133)||(41525404-41525537)
chr7 (1-133)||(17061919-17062052)
chr7 (1-99)||(26212024-26212122)
chr7 (5-95)||(48273421-48273511)
chr7 (1-99)||(12698859-12698958)
chr7 (58-221)||(15113028-15113192)
chr7 (1-133)||(16410084-16410217)
chr7 (1-133)||(24704713-24704843)
chr7 (1-99)||(9509217-9509315)
chr7 (1-95)||(24275196-24275289)
chr7 (1-92)||(10589067-10589158)
chr7 (1-133)||(44116534-44116667)
chr7 (1-95)||(15144037-15144130)
chr7 (58-162)||(1858762-1858867)
chr7 (1-50)||(16386292-16386341)
chr7 (1-88)||(16213709-16213795)
chr7 (58-94)||(16324135-16324171)
chr7 (3-43)||(27847881-27847921)
chr7 (1-37)||(40443419-40443455)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-221)||(22921741-22921962)
chr1 (1-221)||(33681035-33681256)
chr1 (1-221)||(22237655-22237877)
chr1 (1-221)||(52927854-52928063)
chr1 (1-221)||(21861441-21861663)
chr1 (1-127)||(21754073-21754198)
chr1 (1-221)||(20248307-20248524)
chr1 (1-221)||(21896130-21896349)
chr1 (1-140)||(14295507-14295644)
chr1 (1-140)||(20918632-20918769)
chr1 (80-221)||(35981560-35981701)
chr1 (1-209)||(50613999-50614210)
chr1 (1-209)||(50621827-50622038)
chr1 (54-209)||(50686694-50686850)
chr1 (80-221)||(49261447-49261588)
chr1 (1-209)||(16368170-16368379)
chr1 (1-196)||(41049933-41050129)
chr1 (81-221)||(20636957-20637097)
chr1 (1-86)||(35261086-35261171)
chr1 (1-151)||(21161744-21161892)
chr1 (1-162)||(16758677-16758841)
chr1 (1-133)||(45574846-45574980)
chr1 (25-140)||(22130863-22130976)
chr1 (1-95)||(50210212-50210306)
chr1 (41-140)||(51130632-51130729)
chr1 (1-151)||(16093825-16093978)
chr1 (1-133)||(13988891-13989024)
chr1 (1-133)||(21475091-21475224)
chr1 (1-133)||(21923295-21923428)
chr1 (1-92)||(34509808-34509899)
chr1 (1-95)||(21840792-21840885)
chr1 (1-133)||(23593739-23593872)
chr1 (1-133)||(26064966-26065100)
chr1 (1-133)||(29298162-29298294)
chr1 (1-49)||(38801433-38801481)
chr1 (1-133)||(433037-433168)
chr1 (1-99)||(21026708-21026806)
chr1 (1-99)||(22532297-22532395)
chr1 (1-99)||(27250724-27250822)
chr1 (1-44)||(20847205-20847247)
chr1 (1-38)||(20454610-20454646)
chr1 (58-162)||(22124370-22124475)
chr1 (170-221)||(12271744-12271796)
chr1 (62-161)||(48603541-48603641)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-221)||(5671-5891)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (3-221)||(25175880-25176099)
chr2 (1-221)||(28406004-28406226)
chr2 (3-221)||(7604-7824)
chr2 (1-221)||(18786774-18786996)
chr2 (1-134)||(7679613-7679746)
chr2 (1-127)||(22134175-22134299)
chr2 (1-209)||(23207305-23207515)
chr2 (54-213)||(23791356-23791516)
chr2 (1-140)||(23071905-23072042)
chr2 (1-133)||(19671858-19671991)
chr2 (54-209)||(25108970-25109126)
chr2 (1-150)||(23708561-23708712)
chr2 (1-133)||(22105437-22105571)
chr2 (1-133)||(20520152-20520286)
chr2 (1-99)||(298809-298908)
chr2 (1-99)||(23060541-23060639)
chr2 (54-162)||(24697536-24697645)
chr2 (1-133)||(18808968-18809101)
chr2 (1-150)||(22413078-22413231)
chr2 (1-133)||(23130887-23131020)
chr2 (1-133)||(23133354-23133487)
chr2 (1-133)||(23709536-23709669)
chr2 (1-133)||(23712017-23712150)
chr2 (1-133)||(24367799-24367932)
chr2 (1-133)||(34402526-34402659)
chr2 (1-133)||(39682338-39682471)
chr2 (1-99)||(23076470-23076568)
chr2 (1-71)||(38138-38207)
chr2 (1-127)||(23004776-23004905)
chr2 (1-99)||(23660051-23660148)
chr2 (58-219)||(22459435-22459598)
chr2 (1-130)||(23135615-23135745)
chr2 (1-133)||(571422-571555)
chr2 (1-133)||(6726020-6726153)
chr2 (1-133)||(21155064-21155197)
chr2 (1-133)||(28577124-28577257)
chr2 (1-99)||(23654381-23654479)
chr2 (2-133)||(32039502-32039634)
chr2 (1-50)||(23285893-23285941)
chr2 (1-133)||(24898199-24898333)
chr2 (1-133)||(24900682-24900816)
chr2 (1-133)||(24903159-24903293)
chr2 (1-133)||(24905636-24905770)
chr2 (1-133)||(24908111-24908245)
chr2 (1-45)||(20309136-20309180)
chr2 (1-133)||(32214925-32215058)
chr2 (1-99)||(22731229-22731327)
chr2 (1-95)||(23103396-23103488)
chr2 (185-221)||(22134089-22134126)
chr2 (1-37)||(23040247-23040282)
chr2 (58-133)||(31345201-31345277)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-221)||(40046-40267)
scaffold0023 (1-220)||(100402-100622)
scaffold0023 (1-133)||(94436-94569)
scaffold0023 (1-133)||(44479-44613)
scaffold0023 (1-46)||(119903-119948)
scaffold0023 (1-133)||(17444-17577)
scaffold0023 (181-221)||(101602-101642)
scaffold0023 (3-50)||(101529-101576)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-221)||(2517-2738)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-221)||(14569-14790)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (1-218)||(21673732-21673949)
chr8 (1-221)||(23760713-23760937)
chr8 (1-211)||(38855134-38855344)
chr8 (1-221)||(6520396-6520616)
chr8 (1-221)||(21285625-21285846)
chr8 (1-221)||(26355572-26355791)
chr8 (1-221)||(5866149-5866367)
chr8 (1-221)||(21491023-21491241)
chr8 (1-209)||(37116375-37116586)
chr8 (1-221)||(983274-983499)
chr8 (1-221)||(17140944-17141162)
chr8 (1-209)||(17266876-17267087)
chr8 (1-221)||(20498590-20498812)
chr8 (1-221)||(21249412-21249630)
chr8 (1-221)||(21255250-21255468)
chr8 (1-168)||(13508009-13508178)
chr8 (1-187)||(24353048-24353235)
chr8 (1-162)||(17439436-17439600)
chr8 (54-207)||(22364744-22364897)
chr8 (1-168)||(13597541-13597710)
chr8 (1-133)||(17612069-17612203)
chr8 (1-99)||(22626764-22626861)
chr8 (1-99)||(16092337-16092435)
chr8 (1-99)||(22875093-22875190)
chr8 (1-99)||(21918995-21919093)
chr8 (1-71)||(16199668-16199737)
chr8 (1-133)||(1484427-1484560)
chr8 (1-133)||(5853296-5853429)
chr8 (1-133)||(14409448-14409581)
chr8 (1-133)||(20046199-20046332)
chr8 (1-133)||(20403252-20403385)
chr8 (1-133)||(22001778-22001911)
chr8 (1-92)||(28649046-28649137)
chr8 (1-99)||(7372806-7372904)
chr8 (1-92)||(31971285-31971375)
chr8 (54-101)||(40492844-40492891)
chr8 (1-99)||(26219742-26219838)
chr8 (1-162)||(19154816-19154980)
chr8 (2-132)||(19801387-19801517)
chr8 (1-133)||(15203235-15203368)
chr8 (1-133)||(16413320-16413453)
chr8 (1-99)||(18818404-18818502)
chr8 (1-99)||(20536236-20536334)
chr8 (1-99)||(21923923-21924021)
chr8 (1-86)||(6759286-6759371)
chr8 (1-86)||(23406407-23406492)
chr8 (1-99)||(26225288-26225384)
chr8 (1-50)||(18879276-18879324)
chr8 (1-133)||(4483306-4483438)
chr8 (1-45)||(21396029-21396073)
chr8 (1-45)||(21790522-21790566)
chr8 (1-44)||(45131047-45131089)
chr8 (53-162)||(37515785-37515895)
chr8 (1-38)||(21389506-21389543)
chr8 (1-38)||(21778832-21778869)
chr8 (55-133)||(25484279-25484359)
chr8 (1-133)||(14823798-14823931)
chr8 (49-140)||(21383887-21383978)
chr8 (58-161)||(25363134-25363238)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (31-221)||(2090-2281)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-221)||(2676-2899)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-221)||(62226-62444)
scaffold0028 (1-221)||(132686-132900)
scaffold0028 (1-133)||(134236-134369)
scaffold0028 (1-133)||(136705-136838)
scaffold0028 (1-133)||(139174-139307)
scaffold0028 (1-133)||(144112-144245)
scaffold0028 (1-133)||(141643-141776)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (1-221)||(15470952-15471172)
chr3 (1-223)||(16103808-16104030)
chr3 (1-221)||(16097356-16097577)
chr3 (3-221)||(14234517-14234738)
chr3 (1-192)||(12174164-12174352)
chr3 (1-127)||(32307705-32307830)
chr3 (1-217)||(13210205-13210420)
chr3 (1-126)||(49668044-49668169)
chr3 (3-209)||(37251051-37251259)
chr3 (1-124)||(9512948-9513067)
chr3 (1-124)||(9520923-9521042)
chr3 (1-150)||(52523669-52523822)
chr3 (10-221)||(1644556-1644757)
chr3 (1-99)||(27165275-27165373)
chr3 (1-209)||(22110235-22110445)
chr3 (82-221)||(49389502-49389642)
chr3 (1-150)||(24340665-24340816)
chr3 (80-221)||(1465283-1465424)
chr3 (1-99)||(23274715-23274813)
chr3 (1-133)||(43925986-43926121)
chr3 (1-99)||(53301545-53301644)
chr3 (1-99)||(12399237-12399335)
chr3 (1-150)||(37642207-37642358)
chr3 (1-99)||(42386438-42386536)
chr3 (1-99)||(14972882-14972980)
chr3 (1-99)||(14572617-14572714)
chr3 (1-99)||(21618474-21618570)
chr3 (1-99)||(36166623-36166719)
chr3 (1-86)||(11424768-11424852)
chr3 (35-150)||(2051141-2051260)
chr3 (1-133)||(7781351-7781484)
chr3 (1-133)||(17672651-17672784)
chr3 (1-92)||(18438562-18438653)
chr3 (1-133)||(43550482-43550616)
chr3 (1-99)||(24153204-24153301)
chr3 (1-95)||(606324-606419)
chr3 (3-150)||(22147467-22147616)
chr3 (1-133)||(8899119-8899252)
chr3 (1-133)||(16282815-16282948)
chr3 (1-133)||(17446659-17446792)
chr3 (1-133)||(17463203-17463336)
chr3 (1-133)||(29172587-29172720)
chr3 (1-133)||(34159351-34159484)
chr3 (1-133)||(38961895-38962028)
chr3 (1-133)||(45606911-45607044)
chr3 (1-133)||(53070657-53070790)
chr3 (1-133)||(55476516-55476649)
chr3 (1-99)||(17487884-17487982)
chr3 (1-99)||(17499366-17499464)
chr3 (1-99)||(43840960-43841058)
chr3 (1-99)||(14576828-14576925)
chr3 (1-42)||(28194718-28194759)
chr3 (1-130)||(28848618-28848748)
chr3 (1-133)||(9707611-9707744)
chr3 (1-133)||(12567585-12567718)
chr3 (1-133)||(13544050-13544183)
chr3 (1-133)||(16454285-16454418)
chr3 (1-95)||(6469178-6469271)
chr3 (1-89)||(12377949-12378039)
chr3 (1-99)||(13442302-13442400)
chr3 (1-99)||(23083356-23083454)
chr3 (1-99)||(26686915-26687013)
chr3 (1-95)||(40213720-40213813)
chr3 (143-209)||(43927304-43927370)
chr3 (1-90)||(55500967-55501055)
chr3 (1-133)||(13151794-13151928)
chr3 (1-133)||(13154259-13154393)
chr3 (1-50)||(20698480-20698528)
chr3 (1-133)||(10247727-10247860)
chr3 (1-95)||(25476384-25476478)
chr3 (58-162)||(5223388-5223493)
chr3 (185-221)||(12934184-12934221)
chr3 (185-221)||(32307879-32307916)
chr3 (185-221)||(49667957-49667994)
chr3 (58-161)||(12339790-12339894)
chr3 (58-161)||(12469985-12470089)
chr3 (58-161)||(14179455-14179559)
chr3 (58-161)||(16796570-16796674)
chr3 (58-161)||(43889558-43889662)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-221)||(10555-10776)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-207)||(21502041-21502249)
chr5 (1-221)||(21329369-21329590)
chr5 (1-221)||(26011907-26012128)
chr5 (1-221)||(21565570-21565791)
chr5 (1-221)||(20026812-20027034)
chr5 (1-221)||(22959407-22959625)
chr5 (1-221)||(19668926-19669146)
chr5 (1-221)||(19660710-19660928)
chr5 (1-209)||(22178103-22178314)
chr5 (1-133)||(22144077-22144211)
chr5 (80-140)||(21741486-21741546)
chr5 (1-74)||(36314605-36314678)
chr5 (25-127)||(29448054-29448159)
chr5 (1-99)||(21729059-21729157)
chr5 (1-99)||(21808384-21808482)
chr5 (1-150)||(40725881-40726032)
chr5 (1-99)||(1096495-1096593)
chr5 (1-99)||(23390491-23390589)
chr5 (1-99)||(22412212-22412309)
chr5 (1-99)||(24493597-24493694)
chr5 (1-133)||(264772-264905)
chr5 (4-95)||(9077983-9078074)
chr5 (1-133)||(10732944-10733077)
chr5 (1-133)||(11581203-11581336)
chr5 (1-133)||(29329959-29330092)
chr5 (1-133)||(39363409-39363542)
chr5 (1-99)||(22075047-22075145)
chr5 (1-99)||(13025339-13025436)
chr5 (1-99)||(13095523-13095620)
chr5 (1-133)||(20902012-20902146)
chr5 (1-97)||(25431422-25431518)
chr5 (1-98)||(8286838-8286936)
chr5 (1-133)||(20909037-20909170)
chr5 (1-92)||(24529248-24529339)
chr5 (1-133)||(42245369-42245502)
chr5 (1-79)||(21997549-21997627)
chr5 (1-99)||(25421560-25421658)
chr5 (39-99)||(20766115-20766175)
chr5 (1-133)||(29346005-29346138)
chr5 (1-45)||(37723931-37723975)
chr5 (1-43)||(26740697-26740738)
chr5 (1-133)||(18319037-18319171)
chr5 (3-44)||(21293020-21293060)
chr5 (1-130)||(39245161-39245291)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-221)||(12794-13015)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (1-221)||(39706161-39706381)
chr4 (1-221)||(12288081-12288303)
chr4 (1-221)||(12774035-12774246)
chr4 (1-221)||(13722-13944)
chr4 (1-221)||(15551845-15552062)
chr4 (80-221)||(15099456-15099597)
chr4 (1-209)||(53082035-53082245)
chr4 (8-219)||(8846391-8846619)
chr4 (80-213)||(15190423-15190556)
chr4 (1-217)||(43198428-43198648)
chr4 (1-209)||(46640339-46640549)
chr4 (1-96)||(52243192-52243289)
chr4 (11-221)||(16596686-16596894)
chr4 (1-95)||(16377522-16377614)
chr4 (1-133)||(44615313-44615446)
chr4 (1-99)||(23374354-23374452)
chr4 (1-99)||(8574864-8574960)
chr4 (1-99)||(16270231-16270328)
chr4 (1-133)||(12311-12444)
chr4 (1-133)||(15118356-15118489)
chr4 (1-133)||(18215278-18215411)
chr4 (1-133)||(19618176-19618309)
chr4 (1-133)||(44773091-44773224)
chr4 (1-133)||(51463872-51464005)
chr4 (1-133)||(52312535-52312668)
chr4 (1-99)||(7798802-7798900)
chr4 (1-99)||(14280341-14280438)
chr4 (1-99)||(54798749-54798847)
chr4 (1-99)||(6899919-6900016)
chr4 (1-99)||(16239965-16240062)
chr4 (1-98)||(52873363-52873460)
chr4 (55-96)||(15464929-15464970)
chr4 (1-92)||(7088905-7088996)
chr4 (1-133)||(44928883-44929017)
chr4 (1-99)||(12902785-12902883)
chr4 (1-95)||(14038676-14038770)
chr4 (1-99)||(22636463-22636561)
chr4 (1-50)||(3096321-3096369)
chr4 (3-99)||(7893733-7893829)
chr4 (1-38)||(17046515-17046552)
chr4 (1-130)||(18239426-18239556)
chr4 (1-133)||(1837513-1837646)
chr4 (1-133)||(19242724-19242857)
chr4 (1-44)||(17333305-17333347)
chr4 (1-99)||(44052857-44052955)
chr4 (1-71)||(14053325-14053394)
chr4 (1-133)||(15355328-15355462)
chr4 (1-133)||(3515032-3515165)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (5-221)||(10413-10630)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (5-221)||(23019438-23019655)
chr6 (1-221)||(19652223-19652442)
chr6 (32-221)||(22080611-22080800)
chr6 (1-221)||(19668399-19668621)
chr6 (1-217)||(1561331-1561546)
chr6 (1-221)||(28496346-28496564)
chr6 (1-221)||(29808757-29808975)
chr6 (1-221)||(9098397-9098607)
chr6 (1-74)||(27333238-27333311)
chr6 (1-74)||(27393978-27394051)
chr6 (1-221)||(20109166-20109390)
chr6 (1-88)||(4185827-4185914)
chr6 (1-88)||(4186395-4186482)
chr6 (1-96)||(25644348-25644444)
chr6 (1-146)||(31155346-31155490)
chr6 (1-150)||(8227453-8227604)
chr6 (1-99)||(16496272-16496370)
chr6 (1-95)||(29060568-29060662)
chr6 (1-86)||(20076728-20076812)
chr6 (1-133)||(1595574-1595707)
chr6 (28-88)||(4668217-4668277)
chr6 (28-88)||(4675064-4675124)
chr6 (1-133)||(22782252-22782385)
chr6 (1-95)||(19303540-19303633)
chr6 (1-133)||(2291184-2291317)
chr6 (1-133)||(12742342-12742475)
chr6 (1-133)||(18334596-18334729)
chr6 (1-133)||(19005071-19005204)
chr6 (1-133)||(19858923-19859056)
chr6 (1-133)||(24422572-24422705)
chr6 (104-196)||(28103796-28103887)
chr6 (1-133)||(30676714-30676847)
chr6 (1-133)||(33861819-33861952)
chr6 (1-133)||(33864303-33864436)
chr6 (1-95)||(18409826-18409920)
chr6 (54-160)||(18696569-18696675)
chr6 (140-221)||(27333157-27333238)
chr6 (140-221)||(27393897-27393978)
chr6 (54-162)||(18706387-18706495)
chr6 (1-209)||(23076758-23076969)
chr6 (1-99)||(17287791-17287889)
chr6 (1-99)||(20360955-20361053)
chr6 (1-95)||(25629354-25629448)
chr6 (1-95)||(25688527-25688620)
chr6 (1-133)||(20556898-20557029)
chr6 (1-130)||(1540918-1541048)
chr6 (1-38)||(22831531-22831568)
chr6 (1-209)||(35008176-35008387)
chr6 (1-45)||(16920679-16920723)
chr6 (1-133)||(34963398-34963531)
chr6 (58-152)||(18896256-18896350)
chr6 (1-79)||(25656654-25656731)
chr6 (1-162)||(33443075-33443235)
chr6 (54-190)||(18177575-18177712)
chr6 (54-190)||(18199319-18199456)
chr6 (54-190)||(18204159-18204296)
chr6 (1-133)||(16448530-16448664)
chr6 (3-95)||(20593803-20593895)
chr6 (1-50)||(20638328-20638376)
chr6 (58-162)||(23414969-23415074)
chr6 (1-45)||(35245614-35245658)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (3-221)||(159-377)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-221)||(5995-6216)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-221)||(32564-32784)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-221)||(129933-130154)
scaffold0010 (1-96)||(60713-60809)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-221)||(6840-7058)
scaffold0556 (55-221)||(8097-8264)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-211)||(6639-6850)
scaffold0333 (1-211)||(14019-14230)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-221)||(22546-22763)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-221)||(160712-160932)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-211)||(12967-13178)
scaffold0138 (54-209)||(18121-18277)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-221)||(907-1127)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-221)||(1110-1331)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-221)||(45664-45885)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-221)||(7948-8167)
scaffold0218 (20-221)||(29152-29354)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-221)||(136239-136462)
scaffold0021 (1-221)||(144947-145170)
scaffold0021 (1-95)||(174794-174886)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-209)||(6166-6377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-209)||(128853-129063)
scaffold0022 (1-206)||(78350-78556)
scaffold0022 (1-99)||(116455-116551)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-221)||(15689-15907)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (1-223)||(11320-11540)
scaffold0046 (1-140)||(2025-2162)
scaffold0046 (1-92)||(28442-28533)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-209)||(38344-38555)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (3-221)||(53420-53640)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-221)||(12596-12817)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-140)||(1025-1162)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (5-221)||(103510-103720)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-209)||(97033-97244)
scaffold0006 (1-209)||(106311-106522)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-221)||(32126-32340)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (1-99)||(1060-1158)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-79)||(23898-23976)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-99)||(38697-38795)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (54-209)||(87-243)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-221)||(34151-34369)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-79)||(15792-15870)
scaffold0020 (161-221)||(15704-15765)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-133)||(25134-25268)
scaffold0123 (54-162)||(619-727)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (4-221)||(7930-8151)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-150)||(11492-11643)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (1-92)||(13156-13247)
scaffold0357 (1-96)||(16098-16193)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-150)||(38198-38349)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-99)||(3146-3243)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-209)||(19768-19978)
scaffold0080 (1-99)||(39941-40038)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-150)||(17969-18120)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-96)||(27747-27842)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-99)||(39505-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-99)||(75210-75307)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-209)||(578-787)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (54-209)||(1681-1836)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-209)||(267688-267898)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-95)||(3185-3279)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-99)||(44702-44800)
scaffold0122 (1-95)||(26064-26158)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (31-221)||(2317-2505)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-99)||(25924-26021)
scaffold0026 (1-99)||(39886-39983)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (28-88)||(9133-9193)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-92)||(4877-4968)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (3-99)||(38791-38886)
scaffold0145 (1-99)||(32970-33067)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-95)||(17214-17310)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-133)||(20383-20515)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-99)||(1879-1977)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-99)||(32952-33049)
scaffold0120 (1-99)||(45956-46053)
scaffold0120 (1-95)||(16141-16235)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-133)||(20772-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-133)||(37846-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-133)||(158454-158587)
scaffold0003 (1-95)||(339949-340040)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-95)||(10798-10891)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-99)||(13239-13337)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-130)||(13417-13547)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-99)||(24297-24396)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (31-150)||(225465-225585)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-133)||(4719-4852)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-133)||(13972-14105)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-92)||(1317-1406)
scaffold0106 (1-45)||(7294-7338)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-45)||(51610-51654)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-99)||(1980-2078)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-95)||(9267-9360)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-92)||(15466-15556)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-99)||(51941-52039)
scaffold0011 (1-99)||(167973-168071)
scaffold0011 (58-161)||(126040-126144)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-59)||(13525-13582)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (1-57)||(28806-28863)
scaffold0211 (185-221)||(28683-28720)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-99)||(8528-8622)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-92)||(10427-10516)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-45)||(16310-16354)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-133)||(29957-30090)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-133)||(40425-40558)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-133)||(11313-11446)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-99)||(1043-1141)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-99)||(3498-3596)
scaffold0292 (1-99)||(371-468)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-99)||(4536-4633)
scaffold0228 (1-99)||(12118-12215)
scaffold0228 (1-99)||(22070-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-95)||(16599-16693)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-44)||(32095-32137)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (85-127)||(2261-2303)
scaffold1137 (195-223)||(2173-2201)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (58-178)||(675-796)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-38)||(5184-5221)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-50)||(4740-4788)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (58-162)||(39337-39442)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-79)||(2703-2783)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-133)||(161093-161227)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (55-99)||(27912-27956)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-92)||(20946-21030)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6563 - 6783
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 6662  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6663 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaac 6762  T
Q  201 ttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  6763 ttagtttttaacctctaagat 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8494 - 8718
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||     
T  8494 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatatt 8593  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaat--tatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 196  Q
    || | ||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  8594 catatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacat-cagtcttactggaacaacatcagcaagataa 8692  T
Q  197 -caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  8693 acaacttagtttcttacctctaagat 8718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19292 - 19513
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19292 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 19391  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19392 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagataaacaa 19491  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19492 cttagtttctaacctctaagat 19513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18005674 - 18005895
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005674 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 18005773  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18005774 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 18005873  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18005874 cttagtttctaacctctaagat 18005895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 67773 - 67993
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67773 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa-tatc 67871  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  67872 aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagataaacaa 67971  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  67972 cttagtttctaacctctaagat 67993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 44014206 - 44014418
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  44014206 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac---atctcaaatatc 44014302  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44014303 aacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaac 44014402  T
Q  201 ttagtttctaacctct 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  44014403 ttagtttttaacctct 44014418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16219810 - 16219589
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||    
T  16219810 actcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatc 16219711  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16219710 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 16219612  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16219611 acttagtttctaacctccaagat 16219589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 16056360 - 16056576
Alignment:
Q  5 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-c 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16056360 atgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaac 16056458  T
Q  104 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  16056459 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataaacaactt 16056557  T
Q  203 agtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  16056558 agtttcttacctctaagat 16056576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 47831835 - 47832056
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  47831835 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatc 47831934  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  47831935 aaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaata 47832033  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  47832034 acttagtttctaacctccaagat 47832056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 811224 - 811012
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||    
T  811224 actcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatc 811125  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  811124 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaactacaacagcaagataaata 811026  T
Q  199 acttagtttctaac 212  Q
    ||||||||||||||    
T  811025 acttagtttctaac 811012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 22072944 - 22073164
Alignment:
Q  4 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  22072944 catgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 22073043  T
Q  103 -cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taacaa 199  Q
     |||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  22073044 acataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaa 22073142  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| || |||| ||||||    
T  22073143 cttagttccttacctgtaagat 22073164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15754980 - 15754765
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15754980 actcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatc 15754884  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  15754883 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaac 15754785  T
Q  198 aacttagtttctaacctcta 217  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15754784 aacttagtttctaacctcta 15754765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 12901351 - 12901560
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||  |    
T  12901351 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagcaacatcacaac-a 12901449  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  12901450 tcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataaa 12901548  T
Q  197 caacttagtttc 208  Q
    ||||||||||||    
T  12901549 caacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34200814 - 34201032
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  34200814 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 34200910  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||||| | ||||    
T  34200911 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaaca 34201009  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34201010 acttagtttctaacctctaagat 34201032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16495430 - 16495567
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  16495430 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 16495526  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
    | || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495527 agacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11996120 - 11995902
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  11996120 actcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatc 11996024  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||||| | ||||    
T  11996023 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaaca 11995925  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  11995924 aattagtttctaacctctaagat 11995902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28505391 - 28505173
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||   ||||| ||||    
T  28505391 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaa---ctcaattatc 28505295  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |   ||| |||| | ||||    
T  28505294 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattgacaacaaggtaaaca 28505196  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28505195 acttagtttctaacctctaagat 28505173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2280212 - 2280061
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2280212 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatt 2280113  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280112 catatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20220281 - 20220073
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |    
T  20220281 actcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc---aacatctcaaaca 20220185  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||     
T  20220184 tcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagataag 20220086  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  20220085 caacttagtttct 20220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9389710 - 9389569
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||| ||    
T  9389710 atcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatata-caatccaggcttactggaa 9389612  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||| |||||    
T  9389611 tgacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacctccaagat 9389569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12255886 - 12255789
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  12255886 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1868088 - 1867924
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  1868088 actcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaacaacatctcaaaca 1867990  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaa 163  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  1867989 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaa 1867924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 13647353 - 13647487
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13647353 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13647451  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647452 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324254
Alignment:
Q  142 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagat 16324254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 14044774 - 14044935
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaat 97  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||     
T  14044774 actcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14044872  T
Q  98 atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 159  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044873 atcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 14354804 - 14354965
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaat 97  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||     
T  14354804 actcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14354902  T
Q  98 atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 159  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354903 atcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 38227509 - 38227606
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38227509 actcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19486837 - 19486686
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  19486837 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 19486738  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  19486737 cacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10063911 - 10063813
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  10063911 actcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18456505 - 18456408
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18456505 actcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15008592 - 15008441
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  15008592 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctcaaaca 15008494  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    ||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008493 tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 18430737 - 18430870
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18430737 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 18430834  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430835 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3564457 - 3564363
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3564457 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 456346 - 456479
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  456346 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 456443  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456444 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11393424 - 11393291
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  11393424 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 11393327  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393326 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 11972521 - 11972654
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  11972521 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 11972618  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972619 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14949259 - 14949126
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  14949259 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 14949162  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949161 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15376850 - 15376717
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  15376850 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 15376753  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376752 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16232545 - 16232678
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  16232545 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 16232642  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232643 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 18640297 - 18640430
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18640297 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 18640394  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640395 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20385260 - 20385127
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20385260 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 20385163  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385162 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21189732 - 21189599
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  21189732 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 21189635  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189634 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24702263 - 24702396
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24702263 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24702360  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702361 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 27216885 - 27217018
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  27216885 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 27216982  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216983 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 32125516 - 32125649
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  32125516 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 32125613  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125614 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 41522942 - 41523075
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  41522942 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 41523039  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523040 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 41525404 - 41525537
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  41525404 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 41525501  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525502 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17062052 - 17061919
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17062052 actcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaattatt 17061954  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061953 aacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 26212024 - 26212122
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  26212024 actcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Original strand, 48273421 - 48273511
Alignment:
Q  5 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48273421 atgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12698859 - 12698958
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  12698859 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 12698957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 221
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113192
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  |  ||||| |  ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  157 atattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15113128 atataaat-cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagat 15113192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16410084 - 16410217
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  16410084 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 16410181  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410182 tcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24704713 - 24704843
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24704713 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24704808  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704809 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 9509217 - 9509315
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9509217 actcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24275196 - 24275289
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24275196 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 10589067 - 10589158
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  10589067 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 44116534 - 44116667
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  44116534 actcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 44116631  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116632 tcacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15144130 - 15144037
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15144130 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1858867 - 1858762
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | ||||| || |||    
T  1858867 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc 1858768  T
Q  157 atatta 162  Q
    ||||||    
T  1858767 atatta 1858762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16386341 - 16386292
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||    
T  16386341 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaa 16386292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16213709 - 16213795
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  16213709 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctca 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 27847921 - 27847881
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 43  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847921 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 40443419 - 40443455
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacata 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443419 actcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 40443455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22921962 - 22921741
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921962 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 22921863  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22921862 aacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 22921763  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22921762 cttagtttctaacctctaagat 22921741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33681035 - 33681256
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  33681035 actcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatc 33681134  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||    
T  33681135 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaaca 33681233  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33681234 acttagtttctaacctctaagat 33681256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22237655 - 22237877
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22237655 actcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatc 22237754  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa-cagcaagat-aac 197  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||  ||| || ||||| ||||||||| |||    
T  22237755 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcgctggaacaacaatcagcaagataaac 22237853  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22237854 aacttagtttctaacctctaagat 22237877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52928063 - 52927854
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||    
T  52928063 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------catctcaaatatc 52927976  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  52927975 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaatagcaagataaaca 52927877  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52927876 acttagtttctaacctctaagat 52927854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21861663 - 21861441
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  21861663 actcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacatt 21861564  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21861563 catatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagcaagataaac 21861465  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  21861464 aacttagtttcttacctctaagat 21861441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21754073 - 21754198
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21754073 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgc-aatcaacaacatctcaattatc 21754171  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaa 127  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21754172 aacataatccatttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20248307 - 20248524
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  20248307 actcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatc 20248403  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    ||||||  | |||| |||||||  | ||||||| |||||| || |    
T  20248404 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgca-tcagtcttactg-gacaacaacatcaagataaata 20248501  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20248502 acttagtttctaacctctaagat 20248524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21896349 - 21896130
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  21896349 actcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacatt 21896250  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||    
T  21896249 catatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactga---aacaacaacaagataaac 21896154  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  21896153 aacttagtttcttacatctaagat 21896130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14295644 - 14295507
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  14295644 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 14295548  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
    | || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295547 agacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 20918632 - 20918769
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  20918632 actcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 20918728  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918729 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35981701 - 35981560
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| ||    
T  35981701 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagat 35981560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50614210 - 50613999
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  50614210 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 50614111  T
Q  99 tcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taa 196  Q
    ||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||    
T  50614110 tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaa 50614012  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  50614011 caacttagtttct 50613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50622038 - 50621827
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  50622038 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 50621939  T
Q  99 tcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taa 196  Q
    ||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||    
T  50621938 tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaa 50621840  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  50621839 caacttagtttct 50621827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 50686694 - 50686850
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||      
T  50686694 tcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcg 50686793  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50686794 gatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 50686850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 49261447 - 49261588
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||    
T  49261447 atcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caattccggcttactggaa 49261545  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
      |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagat 49261588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16368379 - 16368170
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16368379 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc-aaca 16368282  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    ||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16368281 tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaa 16368183  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    ||||||| |||||    
T  16368182 caacttaatttct 16368170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41050129 - 41049933
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  41050129 actcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aaca 41050031  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 196  Q
    ||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41050030 tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637097
Alignment:
Q  81 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 180  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  181 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagat 20637097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35261171 - 35261086
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 86  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35261171 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 21161744 - 21161892
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || ||    
T  21161744 actcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatcat 21161840  T
Q  100 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  21161841 caacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcatt 21161892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 16758677 - 16758841
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||       
T  16758677 actcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcacaacat 16758776  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 162  Q
    ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758777 tcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45574980 - 45574846
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  45574980 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 45574882  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
     |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574881 taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130863
Alignment:
Q  25 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatat 123  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  124 acaattatataccatta 140  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 50210306 - 50210212
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50210306 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  41 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16093978 - 16093825
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaat 97  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  16093978 actcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaacatctcaaac 16093880  T
Q  98 atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093879 atcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 13988891 - 13989024
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13988891 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13988988  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988989 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21475224 - 21475091
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  21475224 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 21475127  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475126 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21923428 - 21923295
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  21923428 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 21923331  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923330 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 34509808 - 34509899
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34509808 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21840792 - 21840885
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  21840792 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23593872 - 23593739
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23593872 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23593775  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593774 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 26064966 - 26065100
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  26064966 actcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaatacc-aatgcaaatcaacaacatctcaaaga 26065064  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||| | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065065 tcatatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 29298162 - 29298294
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  29298162 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 29298258  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 38801481 - 38801433
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801481 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 433037 - 433168
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  433037 actcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 433132  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433133 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 21026708 - 21026806
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21026708 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22532297 - 22532395
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22532297 actcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27250822 - 27250724
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  27250822 actcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20847247 - 20847205
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 44  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847247 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20454646 - 20454610
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20454646 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 22124370 - 22124475
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||    
T  22124370 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacatcaaatc 22124469  T
Q  157 atatta 162  Q
    ||||||    
T  22124470 atatta 22124475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271796
Alignment:
Q  170 cttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagat 12271796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 161
Target Start/End: Original strand, 48603541 - 48603641
Alignment:
Q  62 taacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatat 160  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||||||    
T  48603541 taacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgtatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatat 48603640  T
Q  161 t 161  Q
    |    
T  48603641 t 48603641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 5671 - 5891
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5671 actcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 5770  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  5771 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaaac 5870  T
Q  201 ttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5871 ttagtttttaacctctaagat 5891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 25175880 - 25176099
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175880 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 25175979  T
Q  103 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 201  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25175980 cataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 25176079  T
Q  202 tagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25176080 tagtttctaacctctaagat 25176099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 28406004 - 28406226
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406004 actcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T
Q  100 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  28406104 caacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagataaaca 28406203  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28406204 acttagtttctaacctctaagat 28406226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7604
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  102 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaa 7626  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||  ||||| |||||    
T  7625 cttagtttcctacctccaagat 7604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18786996 - 18786774
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| || |||  |    
T  18786996 actcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacgtcacaac-a 18786898  T
Q  99 tcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  18786897 tcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcata-taatttaggcttactgaaacaacaacagcatgataaa 18786799  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||    
T  18786798 caacttagtttcctacctccaagat 18786774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 7679613 - 7679746
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||| |||    
T  7679613 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaacatcataaacatc 7679711  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatata 134  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679712 aaacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22134299 - 22134175
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  22134299 actcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatgc-aatcaataacatctcatttatc 22134202  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaa 127  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22134201 aacataatccatttaatgtatatacaa 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23207305 - 23207515
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       
T  23207305 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaacat 23207404  T
Q  99 tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 197  Q
    |  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |    
T  23207405 tataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagtaagataagc 23207503  T
Q  198 aacttagtttct 209  Q
    ||||||||||||    
T  23207504 aacttagtttct 23207515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 23791356 - 23791516
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  23791356 tcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacc 213  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  23791456 aatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttccaacc 23791516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23072042 - 23071905
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||   ||||| ||||    
T  23072042 actcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaa---ctcaattatc 23071946  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071945 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 19671858 - 19671991
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||   ||    
T  19671858 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaatattc 19671957  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671958 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 25108970 - 25109126
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| |    
T  25108970 tcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaatatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatca 25109069  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 209  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25109070 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 25109126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23708712 - 23708561
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||     
T  23708712 actcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacatt 23708613  T
Q  100 -caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
      || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708612 caaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22105437 - 22105571
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  22105437 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaattat 22105535  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105536 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20520286 - 20520152
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  20520286 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaaca 20520188  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520187 tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 298908 - 298809
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  298908 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23060541 - 23060639
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23060541 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697536
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  153 gatcatatta 162  Q
     |||||||||    
T  24697545 aatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 18808968 - 18809101
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18808968 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 18809065  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809066 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22413231 - 22413078
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||    
T  22413231 actcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aa 22413133  T
Q  97 tatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
     |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413132 catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 23130887 - 23131020
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23130887 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23130984  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130985 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 23133354 - 23133487
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23133354 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23133451  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133452 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23709669 - 23709536
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23709669 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23709572  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709571 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23712150 - 23712017
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23712150 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23712053  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712052 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24367799 - 24367932
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24367799 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24367896  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367897 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34402659 - 34402526
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  34402659 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 34402562  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402561 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 39682338 - 39682471
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  39682338 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 39682435  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682436 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23076470 - 23076568
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076470 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 38207 - 38138
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38207 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 23004776 - 23004905
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23004776 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 23004875  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaa 127  Q
    ||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004876 tcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23660051 - 23660148
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23660051 actcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459435
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagat 155  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||  | |||  ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |  |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  156 catattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaag 219  Q
    | |||  || ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22459498 cgtatacat-cagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaag 22459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 23135615 - 23135745
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23135615 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 23135712  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135713 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 571422 - 571555
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |    
T  571422 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattgt 571519  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571520 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 6726020 - 6726153
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||    
T  6726020 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattat 6726117  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726118 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21155197 - 21155064
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| |||    
T  21155197 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacgtctcaattat 21155100  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155099 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 28577124 - 28577257
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||    
T  28577124 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaacgtctcaattat 28577221  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577222 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23654479 - 23654381
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23654479 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32039634 - 32039502
Alignment:
Q  2 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  32039634 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 32039537  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039536 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 23285893 - 23285941
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23285893 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 23285941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24898333 - 24898199
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24898333 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 24898236  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898235 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24900816 - 24900682
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24900816 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 24900719  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900718 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24903293 - 24903159
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24903293 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 24903196  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903195 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24905770 - 24905636
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24905770 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 24905673  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905672 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24908245 - 24908111
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24908245 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 24908148  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908147 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 20309136 - 20309180
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  20309136 actcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat 20309180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32215058 - 32214925
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  32215058 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 32214961  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214960 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22731327 - 22731229
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||| | ||||||    
T  22731327 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23103488 - 23103396
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  23103488 actcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22134126 - 22134089
Alignment:
Q  185 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22134126 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 22134089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 23040282 - 23040247
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacata 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040282 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 133
Target Start/End: Original strand, 31345201 - 31345277
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  31345201 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat 31345277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40267 - 40046
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40267 actcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 40168  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  40167 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaacaa 40068  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40067 cttagtttctaacctctaagat 40046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 100402 - 100622
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  100402 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  100502 aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 100601  T
Q  200 cttagtttctaacctctaaga 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  100602 cttagtttctaacctctaaga 100622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 94436 - 94569
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  94436 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 94533  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94534 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 44479 - 44613
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat--catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  44479 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 44576  T
Q  99 tcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44577 ttcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 119903 - 119948
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119903 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17577 - 17444
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  17577 actcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 17480  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17479 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 101602 - 101642
Alignment:
Q  181 aacaacagcaagataacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  101602 aacaacaacaagagaacaacttagtttctaacctctaagat 101642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Original strand, 101529 - 101576
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101529 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2738 - 2517
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738 actcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 2639  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2638 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagataaacaa 2539  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  2538 cttaatttctaacctctaagat 2517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14790 - 14569
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790 actcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 14691  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14690 aacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagatatacaa 14591  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14590 cttagtttctaacctctaagat 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21673732 - 21673949
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673732 actcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 21673831  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaac 200  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21673832 aatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataacaac 21673931  T
Q  201 ttagtttctaacctctaa 218  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21673932 ttagtttttaacctctaa 21673949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23760937 - 23760713
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23760937 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatatc 23760838  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat----aa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |     ||    
T  23760837 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaacaacaacaaggtaaa 23760738  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  23760737 caacttagtttttaacctctaagat 23760713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38855344 - 38855134
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855344 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 38855245  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38855244 aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 38855146  T
Q  200 cttagtttctaa 211  Q
    ||||||| ||||    
T  38855145 cttagttcctaa 38855134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6520396 - 6520616
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  6520396 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatc 6520495  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  6520496 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataa 6520594  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6520595 cttagtttctaacctccaagat 6520616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21285625 - 21285846
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21285625 actcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 21285724  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||      
T  21285725 aaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaagc 21285823  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  21285824 acttagtttcttacctctaagat 21285846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26355791 - 26355572
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  26355791 actcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcagccatc 26355693  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || || ||||  ||||| |||||    
T  26355692 aacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaataacaaaaagataaacaa 26355594  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26355593 cttagtttctaacctctaagat 26355572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5866367 - 5866149
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  5866367 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 5866271  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  5866270 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 5866172  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5866171 acttagtttctaacctctaagat 5866149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21491023 - 21491241
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  21491023 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 21491119  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  21491120 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 21491218  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21491219 acttagtttctaacctctaagat 21491241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 37116375 - 37116586
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  37116375 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 37116474  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  37116475 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 37116573  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  37116574 caacttagtttct 37116586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 983499 - 983274
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | || |    
T  983499 actcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacatcac-aaca 983401  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat--- 194  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||       
T  983400 tcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaacaacaacaacatgat 983302  T
Q  195 -aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  983301 aaacaacttagtttcctacctccaagat 983274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17140944 - 17141162
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||   ||||| ||||    
T  17140944 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatc 17141040  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  17141041 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 17141139  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17141140 acttagtttctaacctctaagat 17141162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17267087 - 17266876
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17267087 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 17266988  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  17266987 tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacagtaagataag 17266889  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  17266888 caacttagtttct 17266876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20498590 - 20498812
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  20498590 actcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacatt 20498689  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||| | ||||| |||||| |||    
T  20498690 catatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagataaac 20498788  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  20498789 aacttagtttcttacctccaagat 20498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21249412 - 21249630
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||    
T  21249412 actcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattat 21249508  T
Q  100 c-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataaca 198  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||| ||| | |  ||||||| | |||||    
T  21249509 caaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttagtgagacattaacagcagggtaaca 21249607  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  21249608 acttagttcctaacctctaagat 21249630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21255250 - 21255468
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||    
T  21255250 actcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattat 21255346  T
Q  100 c-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataaca 198  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||| ||| | |  ||||||| | |||||    
T  21255347 caaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttagtgagacattaacagcagggtaaca 21255445  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  21255446 acttagttcctaacctctaagat 21255468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13508178 - 13508009
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||     
T  13508178 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatatt 13508079  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 168  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13508078 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24353048 - 24353235
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24353048 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaaca 24353146  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 187  Q
    ||  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24353147 tcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17439600 - 17439436
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17439600 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 17439501  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 162  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439500 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagttt 207  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13597710 - 13597541
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||     
T  13597710 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatatt 13597611  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 168  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13597610 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17612203 - 17612069
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  17612203 actcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 17612104  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612103 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22626764 - 22626861
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22626764 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16092435 - 16092337
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092435 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22875093 - 22875190
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875093 actcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21919093 - 21918995
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21919093 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16199737 - 16199668
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  16199737 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 1484427 - 1484560
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  1484427 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 1484524  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484525 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5853429 - 5853296
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  5853429 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 5853332  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853331 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14409581 - 14409448
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  14409581 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 14409484  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409483 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20046332 - 20046199
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20046332 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 20046235  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046234 ttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 20403252 - 20403385
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20403252 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 20403349  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403350 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22001778 - 22001911
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  22001778 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 22001875  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001876 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28649137 - 28649046
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28649137 actcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 7372806 - 7372904
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372806 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 31971285 - 31971375
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||| ||| ||||||||    
T  31971285 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 26219742 - 26219838
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26219742 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19154980 - 19154816
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| |  |||  ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| || ||| |    
T  19154980 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaacaacttaaaca 19154881  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 162  Q
    ||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  19154880 tcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatatta 19154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19801517 - 19801387
Alignment:
Q  2 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| |||||| |||      
T  19801517 ctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19801420  T
Q  102 ac--ataattcatataatgtatatacaattata 132  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801419 acatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15203368 - 15203235
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||    
T  15203368 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattat 15203271  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203270 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16413453 - 16413320
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  16413453 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 16413356  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413355 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18818502 - 18818404
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||| ||||| ||||||    
T  18818502 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 20536236 - 20536334
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20536236 actcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21924021 - 21923923
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21924021 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 6759286 - 6759371
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  6759286 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 23406407 - 23406492
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  23406407 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26225384 - 26225288
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26225384 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18879324 - 18879276
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879324 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 4483306 - 4483438
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  4483306 actcatgcagcttagtt-aataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 4483402  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483403 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 21396073 - 21396029
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  21396073 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 21396029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 21790566 - 21790522
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  21790566 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 21790522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 45131089 - 45131047
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 44  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131089 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 37515785 - 37515895
Alignment:
Q  53 atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || || ||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  37515785 atcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacatt 37515884  T
Q  152 agatcatatta 162  Q
    | |||| ||||    
T  37515885 aaatcacatta 37515895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21389543 - 21389506
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21389543 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatag 21389506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21778869 - 21778832
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21778869 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatag 21778832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25484359 - 25484279
Alignment:
Q  55 catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  25484359 catgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 25484279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 14823798 - 14823931
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  14823798 actcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 14823895  T
Q  100 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14823896 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14823931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  49 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25363238 - 25363134
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  25363238 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 25363139  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  25363138 atatt 25363134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2090
Alignment:
Q  31 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  131 tataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagat 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2899 - 2676
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2899 actcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 2800  T
Q  101 aacataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-a 195  Q
    | | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2799 agcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 2702  T
Q  196 acaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2701 acaacttagtttctaacctctaagat 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 62226 - 62444
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  62226 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacatctcaaatatc 62322  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  62323 aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 62422  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  62423 cttagtttctaacctctaagat 62444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 132686 - 132900
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||    
T  132686 actcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatg-taatcatcaacgtctcaattat 132784  T
Q  100 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  132785 caacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaaca 132877  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  132878 acttagtttctaacctctaagat 132900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 134236 - 134369
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  134236 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 134333  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134334 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 136705 - 136838
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  136705 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 136802  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136803 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 139174 - 139307
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  139174 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 139271  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139272 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 144112 - 144245
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  144112 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 144209  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144210 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 141643 - 141776
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  141643 actcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 141740  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141741 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15470952 - 15471172
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  15470952 actcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatc 15471051  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15471052 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaca 15471149  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  15471150 acttagtttctaacctccaagat 15471172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16103808 - 16104030
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16103808 actcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaatatc 16103906  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16103907 aaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggatt-agtcttactggaacaacaacagcaagataaaca 16104005  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagatta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16104006 acttagtttctaacctctaagatta 16104030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16097356 - 16097577
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16097356 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatc 16097455  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16097456 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaaca 16097554  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  16097555 acttagtttctaatctctaagat 16097577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 14234517 - 14234738
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-a 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  14234517 tcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 14234616  T
Q  102 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactga--aataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| || |    
T  14234617 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataaata 14234715  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  14234716 acttagtttctaacctccaagat 14234738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12174352 - 12174164
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  12174352 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---aacaacaactcaaatatc 12174256  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 192  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||  | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12174255 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 32307705 - 32307830
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32307705 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaattatc 32307803  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaa 127  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32307804 aacataatccatttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13210420 - 13210205
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  13210420 actcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatc 13210324  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| |||   |||| |||||| |||    
T  13210323 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgca-tcagccttactggaatgttaacaacaagataaac 13210225  T
Q  198 aacttagtttctaacctcta 217  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13210224 aacttagtttctaacctcta 13210205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49668169 - 49668044
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac-aacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||    
T  49668169 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaaacatctcatttat 49668071  T
Q  100 caacataattcatataatgtatataca 126  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  49668070 caacataatccatttaaagtatataca 49668044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37251259 - 37251051
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  37251259 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatc 37251161  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  37251160 ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcagacttactggaacaacaacagtaagataaaca 37251062  T
Q  199 acttagtttct 209  Q
    |||||||||||    
T  37251061 acttagtttct 37251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 9512948 - 9513067
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||  ||||    
T  9512948 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca----atcaacatctcatttatc 9513043  T
Q  101 aacataattcatataatgtatata 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  9513044 aacataatccatttaatgtatata 9513067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 9520923 - 9521042
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||  ||||    
T  9520923 actcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca----atcaacatctcatttatc 9521018  T
Q  101 aacataattcatataatgtatata 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  9521019 aacataatccatttaatgtatata 9521042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 52523822 - 52523669
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52523822 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 52523723  T
Q  99 -tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
     ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523722 ttcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1644757 - 1644556
Alignment:
Q  10 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataatt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  1644757 gcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatac-aatcaacaatatctcaattatcaacataatc 1644660  T
Q  110 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 208  Q
    ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1644659 catttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaagataaacaacttagtttc 1644569  T
Q  209 taacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||    
T  1644568 taacctctaagat 1644556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 27165275 - 27165373
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165275 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22110445 - 22110235
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  22110445 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagcatctcaac-a 22110347  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  22110346 tcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 22110248  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  22110247 caacttagtttct 22110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389502
Alignment:
Q  82 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 180  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||     
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  181 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 49389502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24340816 - 24340665
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||     
T  24340816 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatatt 24340717  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  24340716 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1465424 - 1465283
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||  | |  ||| ||||||||||| ||    
T  1465424 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaata-aacaatccaggcttactggaa 1465326  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | ||| || |||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  1465325 tgacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagat 1465283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23274715 - 23274813
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23274715 actcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 43925986 - 43926121
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  43925986 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 43926085  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926086 tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53301644 - 53301545
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca-acaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301644 actcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12399237 - 12399335
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12399237 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37642358 - 37642207
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  37642358 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 37642259  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  37642258 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 42386438 - 42386536
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386438 actcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 14972882 - 14972980
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14972882 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 14572617 - 14572714
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  | |||||||||||| ||||||    
T  14572617 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 21618474 - 21618570
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21618474 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 36166623 - 36166719
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166623 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11424852 - 11424768
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  11424852 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatcaatagcaaatcaaca 11424768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  35 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  131 tataccattaacaacaacat 150  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7781484 - 7781351
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  7781484 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattat 7781387  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781386 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 17672651 - 17672784
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  17672651 actcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattat 17672748  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672749 tcacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 18438562 - 18438653
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18438562 actcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43550616 - 43550482
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  43550616 actcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 43550518  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550517 tcacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24153301 - 24153204
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24153301 actcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 606419 - 606324
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  606419 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-atca 101  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  102 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 8899119 - 8899252
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  8899119 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 8899216  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899217 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16282948 - 16282815
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||    
T  16282948 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 16282851  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282850 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17446792 - 17446659
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  17446792 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 17446695  T
Q  100 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446694 tcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 17463203 - 17463336
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  17463203 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 17463300  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463301 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29172720 - 29172587
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  29172720 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 29172623  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172622 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34159351 - 34159484
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  34159351 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 34159448  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159449 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38962028 - 38961895
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  38962028 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 38961931  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961930 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45607044 - 45606911
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  45607044 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 45606947  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606946 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53070790 - 53070657
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  53070790 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 53070693  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070692 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 55476516 - 55476649
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  55476516 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 55476613  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476614 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 17487884 - 17487982
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17487884 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 17499366 - 17499464
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17499366 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 43840960 - 43841058
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  43840960 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14576925 - 14576828
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14576925 actcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 28194718 - 28194759
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194718 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28848748 - 28848618
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  28848748 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 28848651  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848650 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9707744 - 9707611
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  9707744 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaattat 9707647  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707646 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 12567585 - 12567718
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  12567585 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 12567682  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567683 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 13544050 - 13544183
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13544050 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13544147  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544148 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16454418 - 16454285
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  16454418 actcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 16454321  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454320 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6469271 - 6469178
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6469271 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 12377949 - 12378039
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 89  Q
    |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377949 actcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 13442302 - 13442400
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13442302 actcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23083454 - 23083356
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23083454 actcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 26686915 - 26687013
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686915 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40213813 - 40213720
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40213813 actcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927370
Alignment:
Q  143 aacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 209  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 43927370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 55500967 - 55501055
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  55500967 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13151928 - 13151794
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13151928 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 13151831  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151830 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13154393 - 13154259
Alignment:
Q  1 actcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13154393 actcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 13154296  T
Q  99 tcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154295 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20698528 - 20698480
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20698528 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 20698480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10247860 - 10247727
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  10247860 actcatacagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 10247763  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247762 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25476478 - 25476384
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25476478 actcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 5223388 - 5223493
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | ||||| || |||    
T  5223388 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc 5223487  T
Q  157 atatta 162  Q
    ||||||    
T  5223488 atatta 5223493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12934221 - 12934184
Alignment:
Q  185 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12934221 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 12934184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Original strand, 32307879 - 32307916
Alignment:
Q  185 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32307879 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 32307916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49667994 - 49667957
Alignment:
Q  185 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49667994 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 49667957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 12339790 - 12339894
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  12339790 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 12339889  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  12339890 atatt 12339894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 12469985 - 12470089
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  12469985 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcacatc 12470084  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  12470085 atatt 12470089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 14179455 - 14179559
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  14179455 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 14179554  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  14179555 atatt 14179559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 16796570 - 16796674
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  16796570 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 16796669  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  16796670 atatt 16796674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43889662 - 43889558
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  43889662 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 43889563  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  43889562 atatt 43889558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10555 - 10776
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  10555 actcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatc 10654  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10655 gaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 10753  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  10754 acttagtttcttacctctaagat 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21502249 - 21502041
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||    
T  21502249 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatc 21502150  T
Q  101 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21502149 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 21502050  T
Q  199 acttagttt 207  Q
    |||||||||    
T  21502049 acttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21329590 - 21329369
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| |||    
T  21329590 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaacatc 21329491  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  21329490 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaca 21329392  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  21329391 acttagtttcttacctctaagat 21329369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26012128 - 26011907
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  26012128 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatc 26012029  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||    
T  26012028 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataaaca 26011930  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  26011929 acttagtttctaacctccaagat 26011907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21565570 - 21565791
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21565570 actcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatatc 21565669  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||    
T  21565670 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaaca 21565768  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21565769 acttagtttctaacctctaagat 21565791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20027034 - 20026812
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | || |    
T  20027034 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcac-aaca 20026936  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  20026935 tcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacata-taattcaggcttactgaaacaactacaacaagataaa 20026837  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  20026836 caacttagtttcttacctctaagat 20026812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22959625 - 22959407
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22959625 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatc 22959529  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||   ||||||  | |||| ||||||| || || |||| |||||| ||||    
T  22959528 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgca-tcagtcttactggaacaaaaacaacaagataaaca 22959430  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  22959429 acttggtttttaacctctaagat 22959407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19668926 - 19669146
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  19668926 actcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatc 19669022  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta--gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
     ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||||  | |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||    
T  19669023 aaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacaacaagataaa 19669121  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  19669122 cgacttagtttctaacctctaagat 19669146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19660928 - 19660710
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||   ||||| ||||    
T  19660928 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaa---ctcaattatc 19660832  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  19660831 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 19660733  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19660732 acttagtttctaacctctaagat 19660710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22178314 - 22178103
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22178314 actcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 22178215  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||     
T  22178214 tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacagtaagataag 22178116  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  22178115 caacttagtttct 22178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22144077 - 22144211
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |    
T  22144077 actcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacatt 22144176  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144177 catatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21741546 - 21741486
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741546 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 36314605 - 36314678
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314605 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448159
Alignment:
Q  25 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 121  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  122 atacaa 127  Q
    ||||||    
T  29448154 atacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21729157 - 21729059
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21729157 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21808482 - 21808384
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21808482 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 40725881 - 40726032
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  40725881 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 40725980  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40725981 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1096495 - 1096593
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||  || ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1096495 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23390589 - 23390491
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23390589 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22412212 - 22412309
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412212 actcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24493597 - 24493694
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24493597 actcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 264905 - 264772
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  264905 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 264808  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264807 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 9077983 - 9078074
Alignment:
Q  4 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9077983 catgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10733077 - 10732944
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  10733077 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 10732980  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10732979 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11581336 - 11581203
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  11581336 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaattat 11581239  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581238 tcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 29329959 - 29330092
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  29329959 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 29330056  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330057 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 39363409 - 39363542
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  39363409 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 39363506  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363507 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22075047 - 22075145
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22075047 actcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 13025339 - 13025436
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13025339 actcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 13095523 - 13095620
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13095523 actcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20902146 - 20902012
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa--at 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||  ||    
T  20902146 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattat 20902049  T
Q  98 atca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
     ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902048 ttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25431422 - 25431518
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  25431422 actcatgcatcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8286936 - 8286838
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  8286936 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 20909037 - 20909170
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20909037 actcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 20909134  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909135 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 24529248 - 24529339
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24529248 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42245502 - 42245369
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  42245502 actcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 42245405  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245404 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21997627 - 21997549
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21997627 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 25421560 - 25421658
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421560 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  39 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 29346005 - 29346138
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  29346005 actcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 29346102  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346103 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 37723931 - 37723975
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723931 actcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 26740738 - 26740697
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 43  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26740738 actcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18319171 - 18319037
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||    
T  18319171 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 18319074  T
Q  99 tcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319073 ttcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 21293060 - 21293020
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 44  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293060 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 39245161 - 39245291
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| |||    
T  39245161 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtcccaattat 39245258  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39245259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12794 - 13015
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  12794 actcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatc 12893  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  12894 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggcttactggaacaacaacagcaagataaacc 12992  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12993 acttagtttctaacctctaagat 13015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39706381 - 39706161
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||    
T  39706381 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaacatc 39706282  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  39706281 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 39706183  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||| || |||| ||| |||||    
T  39706182 cttaattcctaatctccaagat 39706161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12288303 - 12288081
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |    
T  12288303 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcac-aaca 12288205  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12288204 tcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 12288106  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||    
T  12288105 caacttagtttcctacctccaagat 12288081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12774035 - 12774246
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  12774035 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatac-aatcaacaacatctcaattatc 12774133  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12774134 aacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 12774224  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12774225 cttagtttctaacctctaagat 12774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13944 - 13722
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  13944 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatatt 13845  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||  ||||| |||    
T  13844 catatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaac 13746  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  13745 aacttagtttcttacctctaagat 13722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15551845 - 15552062
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||    
T  15551845 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaa---ctcaattatc 15551941  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaa 199  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||   |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||| | ||||||    
T  15551942 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcagggtaacaa 15552040  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15552041 cttagtttctaacctctaagat 15552062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 15099456 - 15099597
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| ||    
T  15099456 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    | |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagat 15099597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53082245 - 53082035
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  53082245 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaaca 53082147  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  53082146 tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 53082048  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  53082047 caacttagtttct 53082035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 8846391 - 8846619
Alignment:
Q  8 cagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaa----------------tcaacaacatc 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||                ||| |||||||    
T  8846391 cagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatgctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 8846490  T
Q  92 tcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 190  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||||  ||    
T  8846491 tcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaactaca 8846589  T
Q  191 agat-aacaacttagtttctaacctctaag 219  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8846590 agataaacaacttagtttctaatctctaag 8846619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 15190423 - 15190556
Alignment:
Q  80 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| ||    
T  15190423 atcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  180 taacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacc 213  Q
    | |||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacc 15190556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43198648 - 43198428
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  43198648 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaata 43198549  T
Q  99 -tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-a 195  Q
     ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || | ||||| |||||| |    
T  43198548 ttcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcatt-agtcttactggaacatcaacaacaagataa 43198450  T
Q  196 acaacttagtttctaacctcta 217  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  43198449 acaacttagttttttacctcta 43198428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46640549 - 46640339
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |    
T  46640549 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctc-aaca 46640451  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||     
T  46640450 tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacagtaagataag 46640352  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  46640351 caacttagtttct 46640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 52243289 - 52243192
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  52243289 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596894
Alignment:
Q  11 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  110 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  | |||   | |||| ||||||  || |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagca-tcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 16596881  T
Q  209 taacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||    
T  16596882 taacctctaagat 16596894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16377614 - 16377522
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16377614 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 44615313 - 44615446
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  44615313 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 44615410  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615411 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23374452 - 23374354
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23374452 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8574960 - 8574864
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  8574960 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16270328 - 16270231
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16270328 actcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12444 - 12311
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  12444 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 12347  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12346 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15118489 - 15118356
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  15118489 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 15118392  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118391 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18215411 - 18215278
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18215411 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 18215314  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215313 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19618309 - 19618176
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  19618309 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 19618212  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618211 tcacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44773224 - 44773091
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  44773224 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 44773127  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773126 tcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51464005 - 51463872
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  51464005 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattat 51463908  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  51463907 tcacatataattcaaataatgcatatataattatat 51463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 52312535 - 52312668
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  52312535 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 52312632  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312633 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 7798802 - 7798900
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798802 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 14280341 - 14280438
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14280341 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacgg-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 54798847 - 54798749
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798847 actcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 6899919 - 6900016
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6899919 actcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16240062 - 16239965
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16240062 actcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 52873460 - 52873363
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| |||||    
T  52873460 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  55 catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 7088905 - 7088996
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  7088905 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44929017 - 44928883
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||| |||||||||| |||    
T  44929017 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaattat 44928919  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928918 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12902785 - 12902883
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || ||| |||||||| ||||||    
T  12902785 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 14038676 - 14038770
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14038676 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22636463 - 22636561
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22636463 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 3096321 - 3096369
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096321 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 7893733 - 7893829
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893733 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 17046515 - 17046552
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046515 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18239556 - 18239426
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18239556 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 18239459  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239458 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1837646 - 1837513
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  1837646 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 1837549  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837548 tcacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 19242724 - 19242857
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  19242724 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 19242821  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242822 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 17333305 - 17333347
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 44  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333305 actcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 44052857 - 44052955
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  44052857 actcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14053394 - 14053325
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 71  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  14053394 actcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15355462 - 15355328
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||    
T  15355462 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 15355365  T
Q  99 tcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355364 ttcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 3515032 - 3515165
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  3515032 actcatgcagcttagttaaa-aaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 3515129  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  3515130 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 3515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10413
Alignment:
Q  5 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  10630 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaac 10531  T
Q  104 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  10530 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacaactt 10432  T
Q  203 agtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10431 agtttctaacctctaagat 10413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 23019438 - 23019655
Alignment:
Q  5 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aac 103  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  23019438 atgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 23019537  T
Q  104 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23019538 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactt 23019636  T
Q  203 agtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23019637 agtttctaacctccaagat 23019655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19652223 - 19652442
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19652223 actcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc-aatcaacaacatctcaaacatc 19652321  T
Q  101 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19652322 aacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacagcaagataaacaa 19652420  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19652421 cttagtttctaacctctaagat 19652442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080611
Alignment:
Q  32 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattat 131  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  132 ataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagat 22080611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19668399 - 19668621
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |    
T  19668399 actcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcac-aaca 19668497  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19668498 tcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcata-tacatcagacttactgaaacaacaacagcaagataaa 19668596  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  19668597 caacttagtttcttacctccaagat 19668621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 1561331 - 1561546
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1561331 actcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatc 1561427  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  1561428 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaac 1561526  T
Q  198 aacttagtttctaacctcta 217  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1561527 aacttagtttctaacctcta 1561546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28496564 - 28496346
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  28496564 actcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatc 28496468  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  28496467 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 28496369  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  28496368 acttagtttctaaactctaagat 28496346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29808975 - 29808757
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  29808975 actcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatc 29808879  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  29808878 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaaca 29808780  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  29808779 acttagtttctaaactctaagat 29808757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9098607 - 9098397
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || | || |    
T  9098607 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaacaacttcac-aaca 9098509  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  9098508 tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat------------aacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaataactgcaagataaa 9098422  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  9098421 caaattagtttcttacctctaagat 9098397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27333311 - 27333238
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333311 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27394051 - 27393978
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394051 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20109166 - 20109390
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-t 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  20109166 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatatt 20109265  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-a 195  Q
    || | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  | ||| ||  |||| ||||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  20109266 catatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgata-tacatcagtcttactagaaagacatcagcaagataa 20109364  T
Q  196 acaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  20109365 acaacttagtttcttacctctaagat 20109390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4185914 - 4185827
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4185914 actcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 4186395 - 4186482
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4186395 actcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 25644348 - 25644444
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  25644348 actcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31155490 - 31155346
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-a 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||| || |    
T  31155490 actcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatca 31155394  T
Q  99 tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 146  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155393 tcaacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8227604 - 8227453
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  8227604 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 8227505  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  8227504 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 16496272 - 16496370
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  16496272 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 29060568 - 29060662
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29060568 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 20076728 - 20076812
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20076728 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 1595574 - 1595707
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  1595574 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaattat 1595671  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595672 tcacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  28 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  28 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22782252 - 22782385
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||     
T  22782252 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 22782349  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782350 tcacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19303633 - 19303540
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19303633 actcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2291317 - 2291184
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  2291317 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 2291220  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291219 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 12742342 - 12742475
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  12742342 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 12742439  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742440 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18334729 - 18334596
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18334729 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 18334632  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334631 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 19005071 - 19005204
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  19005071 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 19005168  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005169 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19859056 - 19858923
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  19859056 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 19858959  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858958 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24422572 - 24422705
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24422572 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24422669  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422670 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  104 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 196  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30676847 - 30676714
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  30676847 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 30676750  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676749 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 33861819 - 33861952
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  33861819 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 33861916  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861917 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 33864303 - 33864436
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  33864303 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 33864400  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864401 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18409920 - 18409826
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18409920 actcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  153 gatcatat 160  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333157
Alignment:
Q  140 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagat 27333157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393897
Alignment:
Q  140 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagat 27393897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  153 gatcatatta 162  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23076758 - 23076969
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  ||||||||||| || ||| |    
T  23076758 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaaca 23076857  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  23076858 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaacaacagtaagataag 23076956  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    ||| |||||||||    
T  23076957 caaattagtttct 23076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17287889 - 17287791
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287889 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20361053 - 20360955
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20361053 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25629448 - 25629354
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25629448 actcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 25688527 - 25688620
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  25688527 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20557029 - 20556898
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  20557029 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc-aattt 20556933  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556932 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1541048 - 1540918
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  1541048 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 1540951  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540950 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 22831531 - 22831568
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831531 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 35008176 - 35008387
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  |||||| |||| || ||| |    
T  35008176 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaacaacttaaaca 35008275  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  35008276 tcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaataacagtaagataag 35008374  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  35008375 caacttagtttct 35008387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 16920723 - 16920679
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16920723 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34963398 - 34963531
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  34963398 actcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 34963495  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963496 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18896350 - 18896256
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896350 gatataacaatatc-aatgacaatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 25656654 - 25656731
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  25656654 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 33443075 - 33443235
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| |||||||||||||| |||   ||| | ||||| || ||| |    
T  33443075 actcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatcaaat---aataatcaacaacttaaaca 33443170  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 162  Q
    ||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  33443171 tcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatatta 33443235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18177712 - 18177575
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18177712 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18177613  T
Q  152 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 190  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18177612 aaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaacagca 18177575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18199456 - 18199319
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18199456 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18199357  T
Q  152 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 190  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18199356 aaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaacagca 18199319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 18204159 - 18204296
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18204159 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18204258  T
Q  152 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 190  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18204259 aaatcat-ttacatcagacttactgaaacaacaacagca 18204296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16448664 - 16448530
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||    
T  16448664 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 16448567  T
Q  99 tcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448566 ttcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 20593803 - 20593895
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20593803 tcatgcagctcagttaaataaa-aacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20638376 - 20638328
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20638376 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 20638328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 23414969 - 23415074
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | ||||| || |||    
T  23414969 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc 23415068  T
Q  157 atatta 162  Q
    ||||||    
T  23415069 atatta 23415074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 35245614 - 35245658
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  35245614 actcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 159 - 377
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-a 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  159 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 258  T
Q  102 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || |||  || |||||||||||||||||||||    
T  259 acataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcactagaacaacaacagcaagataacaact 357  T
Q  202 tagtttctaacctctaagat 221  Q
     |||||||||||||||||||    
T  358 cagtttctaacctctaagat 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6216 - 5995
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||    
T  6216 actcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatc 6117  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  6116 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaataacagcaagataaata 6018  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  6017 acttagtttttaacctccaagat 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32564 - 32784
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32564 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgc-aatcaacaacatctcaaacatc 32662  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  32663 aaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaaca 32761  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  32762 acttagtttcttacctctaagat 32784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 129933 - 130154
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  129933 actcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatc 130032  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  130033 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaaca 130131  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  130132 acttagtttctaacctctaagat 130154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 60809 - 60713
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60809 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6840 - 7058
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6840 actcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatc 6936  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6937 aaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaaca 7035  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7036 acttagtttctaacctctaagat 7058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8264
Alignment:
Q  55 catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  154 atcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagat 8264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6850
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| |||    
T  6639 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatc 6738  T
Q  101 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6739 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaaca 6837  T
Q  199 acttagtttctaa 211  Q
    |||||| ||||||    
T  6838 acttagattctaa 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 14019 - 14230
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| |||    
T  14019 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatc 14118  T
Q  101 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14119 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaaca 14217  T
Q  199 acttagtttctaa 211  Q
    |||||| ||||||    
T  14218 acttagattctaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22763 - 22546
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22763 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatc 22664  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||  | |||| ||||||| || | ||||| |||||  ||||    
T  22663 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----atatgca-tcagtcttactggaacagcaacatcaagacaaaca 22569  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22568 acttagtttctaacctctaagat 22546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 160712 - 160932
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  160712 actcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgc-aatcaacaacatgtcaaatatc 160810  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  160811 aaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaaca 160909  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  160910 acttagtttctaacctctaagat 160932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 12967 - 13178
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  12967 actcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatc 13066  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  13067 aaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaata 13165  T
Q  199 acttagtttctaa 211  Q
    |||||||||||||    
T  13166 acttagtttctaa 13178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18121
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttct 209  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18177 aaacata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttct 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1127 - 907
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| |||    
T  1127 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatc 1028  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  1027 aaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaata 930  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  929 acttagtttctaacttccaagat 907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1331
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||| |||    
T  1110 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaacatc 1209  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||| || ||||||| |||||| || |    
T  1210 aaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaaaa 1308  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  1309 acttagtttcttacctctaagat 1331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45885 - 45664
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  45885 actcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaattatc 45786  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||  ||||||| || ||||    
T  45785 aaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaattacagcaatataaaca 45687  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45686 acttagtttctaacctctaagat 45664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 7948
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  |    
T  8167 actcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaac-a 8069  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  8068 tcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcata-taattcaggcttactga---aacaacagcaagataaa 7973  T
Q  197 caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  7972 caacttagtttcttacctctaagat 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29152
Alignment:
Q  20 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  119 tatatacaattatatacc---attaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacct 214  Q
    |||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacct 29159  T
Q  215 ctaagat 221  Q
    |||||||    
T  29158 ctaagat 29152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 136462 - 136239
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |    
T  136462 actcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-a 136364  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-a 195  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  136363 tcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 136265  T
Q  196 acaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||    
T  136264 acaacttagtttcctacctccaagat 136239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 145170 - 144947
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |    
T  145170 actcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-a 145072  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-a 195  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  145071 tcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 144973  T
Q  196 acaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||    
T  144972 acaacttagtttcctacctccaagat 144947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 174794 - 174886
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  174794 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6377 - 6166
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6377 actcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 6278  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  6277 tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataag 6179  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  6178 caacttagtttct 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 129063 - 128853
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  129063 actcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 128965  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  128964 tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 128866  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  128865 caacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 78350 - 78556
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  78350 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc-aaca 78447  T
Q  99 tc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  78448 tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 78546  T
Q  197 caacttagtt 206  Q
    ||||||||||    
T  78547 caacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 116455 - 116551
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  116455 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15689 - 15907
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  15689 actcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 15785  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||  || |||| ||||||| |  |  ||||||||| | ||||    
T  15786 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaa-tcagtcttactggatcattaacagcaaggtaaaca 15884  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15885 acttagtttctaacctctaagat 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11320 - 11540
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  11320 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 11416  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
     ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||  || |  |||| |||| | ||||    
T  11417 aaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttacttgaacattaacaccaaggtaaaca 11515  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagatta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11516 acttagtttctaacctctaagatta 11540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2025 - 2162
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  2025 actcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 2121  T
Q  101 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2122 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 28442 - 28533
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28442 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 38344 - 38555
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  38344 actcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaaca 38443  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  38444 tcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 38542  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  38543 caacttagtttct 38555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53420
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tca 101  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  102 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 199  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||  ||||| |||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaa 53442  T
Q  200 cttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  53441 cttagtttcttacctctaagat 53420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12596 - 12817
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-- 98  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      
T  12596 actcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatact 12695  T
Q  99 tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 197  Q
    |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||   ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12696 tatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacatt-agacttactgaaacaacaacagcaagataaac 12793  T
Q  198 aacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  12794 aacttagtttattacctctaagat 12817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 1025
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  1162 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 1066  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 140  Q
    | || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1065 agacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 103720 - 103510
Alignment:
Q  5 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 102  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      ||  |    
T  103720 atgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaacaacatc------at--a 103629  T
Q  103 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  103628 cataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaggaagataaagaact 103530  T
Q  202 tagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  103529 tagtttcctacctccaagat 103510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 97033 - 97244
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  97033 actcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 97132  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  97133 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaag 97231  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  97232 caacttagtttct 97244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 106311 - 106522
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  106311 actcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca 106410  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  106411 tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaag 106509  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  106510 caacttagtttct 106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32126 - 32340
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||    
T  32126 actcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg-taatcatcaacgtctcaattat 32224  T
Q  100 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  32225 caacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaaca 32317  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32318 acttagtttctaacctctaagat 32340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1060 - 1158
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  1060 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23976 - 23898
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 79  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976 actcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38795 - 38697
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38795 actcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 87 - 243
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttct 209  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  187 aatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttct 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34151 - 34369
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||| ||||    
T  34151 actcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatc 34247  T
Q  101 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    || | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||    
T  34248 aaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaaaattaacagcaaggtaaaca 34346  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34347 acttagtttctaacctctaagat 34369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15870 - 15792
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15870 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15765 - 15704
Alignment:
Q  161 taattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15765 taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagat 15704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 25134 - 25268
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25134 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaaca 25232  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25233 tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  153 gatcatatta 162  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 7930
Alignment:
Q  4 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||| | ||    
T  8151 catgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattc 8052  T
Q  101 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 198  Q
    | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| || |||| || |||| ||||||||| ||||    
T  8051 atatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtctcactggaacaacatcagcaagataaaca 7953  T
Q  199 acttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  7952 acttagtttcatacctctaagat 7930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11643
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  11492 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 11591  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11592 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 13156 - 13247
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13156 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16193 - 16098
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16193 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38349 - 38198
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaat-at 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  38349 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 38250  T
Q  100 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38249 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3243 - 3146
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3243 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19978 - 19768
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |    
T  19978 actcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc-agca 19880  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||     
T  19879 tcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacagtaagataag 19781  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  19780 caacttagtttct 19768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 39941 - 40038
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  39941 actcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18120 - 17969
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||     
T  18120 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatatt 18021  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 150  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  18020 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27842 - 27747
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27842 actcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 39505 - 39602
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39505 actcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 75307 - 75210
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  75307 actcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 578 - 787
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |    
T  578 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatc-ccaaca 675  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  676 tcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagttagataaa 774  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  775 caacttagtttct 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1681
Alignment:
Q  54 tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | |    
T  1836 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  153 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttct 209  Q
     |||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  1737 aatcata-taattcaggcttactggaacaacaatagtaagataggcaacttagtttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 267688 - 267898
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  267688 actcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctc-aaca 267786  T
Q  99 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 196  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||| ||| ||| |||     
T  267787 tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcagtaagctaag 267885  T
Q  197 caacttagtttct 209  Q
    |||||||||||||    
T  267886 caacttagtttct 267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3279 - 3185
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3279 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44800 - 44702
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44800 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26158 - 26064
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  26158 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2317
Alignment:
Q  31 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 129  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  130 atataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    ||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  2408 atataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagat 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 25924 - 26021
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25924 actcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 39886 - 39983
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39886 actcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  28 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 88  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 4877 - 4968
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4877 actcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 38791 - 38886
Alignment:
Q  3 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38791 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 32970 - 33067
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  32970 actcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17310 - 17214
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat---catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17310 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20515 - 20383
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20515 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20418  T
Q  101 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20417 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1879 - 1977
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  1879 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33049 - 32952
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  33049 actcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46053
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  45956 actcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16141 - 16235
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  16141 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 20772 - 20905
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  20772 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 20869  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20870 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 37846 - 37979
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  37846 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 37943  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37944 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 158587 - 158454
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  158587 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 158490  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158489 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 340040 - 339949
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  340040 actcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 10798 - 10891
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  10798 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 13239 - 13337
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13239 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 13417 - 13547
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13417 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13514  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaatta 130  Q
      ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13515 tcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24396 - 24297
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  24396 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 24298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  31 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 128  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgc-aatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  129 tatataccattaacaacaacat 150  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 4719 - 4852
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  4719 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 4816  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4817 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 13972 - 14105
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13972 actcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 14069  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14070 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 1317 - 1406
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  1317 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 7294 - 7338
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  7294 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 51610 - 51654
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51610 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1980 - 2078
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1980 actcatgcagcttagttaattaa-caacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 9267 - 9360
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  9267 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15556 - 15466
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||| ||| ||||||||    
T  15556 actcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 51941 - 52039
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  51941 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 168071 - 167973
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  168071 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 126040 - 126144
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||    
T  126040 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatc 126139  T
Q  157 atatt 161  Q
    |||||    
T  126140 atatt 126144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 13525 - 13582
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatga 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  13525 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatga 13582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28863 - 28806
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataacca-acagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 57  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28863 actcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28720 - 28683
Alignment:
Q  185 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagat 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28720 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagat 28683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8622 - 8528
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  8622 actcatgcagcttagttaaataac----agcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 10516 - 10427
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | ||| ||||||||||||    
T  10516 actcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16310 - 16354
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 45  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16310 actcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtat 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 29957 - 30090
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||    
T  29957 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaattat 30054  T
Q  100 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30055 tcacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 40425 - 40558
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  40425 actcgtgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 40522  T
Q  100 caacat--aattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40523 tcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 11313 - 11446
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  11313 actcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 11410  T
Q  100 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 133  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11411 tcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1043
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  1141 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 3498 - 3596
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  3498 actcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 371 - 468
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  371 actcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4633
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4536 actcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12118 - 12215
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12118 actcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 22070 - 22167
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22070 actcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16693 - 16599
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  16693 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 32095 - 32137
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 44  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32095 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  85 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2201 - 2173
Alignment:
Q  195 aacaacttagtttctaacctctaagatta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2201 aacaacttagtttctaacctctaagatta 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 675
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||| |||||    
T  796 gatataacaatatcaaaagataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactatcaacatcagatc 697  T
Q  157 atattaattcaggcttactgaa 178  Q
    | ||||  ||||||||||||||    
T  696 acattatatcaggcttactgaa 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 5221 - 5184
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5221 actcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatag 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 4740 - 4788
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4740 actcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 39337 - 39442
Alignment:
Q  58 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 156  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | ||||| || |||    
T  39337 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc 39436  T
Q  157 atatta 162  Q
    ||||||    
T  39437 atatta 39442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 2703 - 2783
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 79  Q
    |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  2703 actcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 161227 - 161093
Alignment:
Q  1 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa-caacatctcaaata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  161227 actcatgcagcttagttaaat-atcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaatta 161130  T
Q  99 tcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 133  Q
    |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161129 ttcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 99
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  55 catgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 99  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Original strand, 20946 - 21030
Alignment:
Q  9 agcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatct 92  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20946 agcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University