View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3482_high_49 (Length: 288)

Name: NF3482_high_49
Description: NF3482
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3482_high_49
NF3482_high_49
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-276)||(18059736-18060014)
chr1 (1-276)||(17004638-17004916)
chr1 (1-276)||(38055069-38055347)
chr1 (1-271)||(46523394-46523667)
chr1 (1-196)||(17148647-17148845)
chr1 (1-139)||(19962477-19962617)
chr1 (1-140)||(22227947-22228086)
chr1 (1-140)||(22232644-22232783)
chr1 (1-157)||(7640912-7641069)
chr1 (1-157)||(22035568-22035725)
chr1 (1-50)||(5072362-5072411)
chr1 (1-50)||(18601092-18601141)
chr1 (234-276)||(22035448-22035490)
chr1 (4-140)||(2116393-2116529)
chr1 (235-276)||(20254312-20254353)
chr1 (1-140)||(45051561-45051700)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-276)||(16376351-16376629)
chr6 (1-276)||(16383675-16383953)
chr6 (1-276)||(10488699-10488977)
chr6 (1-276)||(16556117-16556395)
chr6 (1-276)||(16632673-16632951)
chr6 (1-276)||(22225716-22225994)
chr6 (1-276)||(1556005-1556283)
chr6 (1-276)||(19610018-19610296)
chr6 (1-196)||(16231972-16232170)
chr6 (1-196)||(18086801-18086999)
chr6 (1-196)||(13620772-13620970)
chr6 (1-196)||(23977849-23978047)
chr6 (1-139)||(19299375-19299515)
chr6 (1-105)||(22251544-22251648)
chr6 (1-207)||(29665942-29666151)
chr6 (189-276)||(33314387-33314474)
chr6 (1-157)||(29869754-29869911)
chr6 (1-50)||(16825726-16825775)
chr6 (96-211)||(27740903-27741021)
chr6 (1-50)||(25175792-25175841)
chr6 (21-140)||(14626124-14626243)
chr6 (1-50)||(1650079-1650128)
chr6 (1-50)||(27653957-27654006)
chr6 (21-53)||(19629556-19629588)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-276)||(1467717-1467995)
chr3 (1-276)||(49232436-49232714)
chr3 (1-276)||(25058739-25059017)
chr3 (1-276)||(12902068-12902346)
chr3 (1-272)||(5228317-5228590)
chr3 (1-225)||(22275260-22275487)
chr3 (1-276)||(12264770-12265049)
chr3 (1-225)||(15468318-15468545)
chr3 (1-196)||(18911073-18911271)
chr3 (1-179)||(12811938-12812119)
chr3 (1-276)||(44228985-44229263)
chr3 (1-204)||(54651529-54651735)
chr3 (160-276)||(18897139-18897255)
chr3 (1-106)||(18897022-18897127)
chr3 (21-207)||(11986172-11986361)
chr3 (1-138)||(16821280-16821417)
chr3 (1-50)||(41270304-41270353)
chr3 (1-50)||(55316448-55316497)
chr3 (1-42)||(15936613-15936654)
chr3 (1-80)||(15615032-15615111)
chr3 (1-42)||(15938455-15938496)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-276)||(11231316-11231594)
chr2 (1-276)||(22513163-22513441)
chr2 (1-276)||(28775785-28776063)
chr2 (1-276)||(24685759-24686037)
chr2 (1-276)||(12728392-12728670)
chr2 (1-276)||(34824475-34824753)
chr2 (1-276)||(16935593-16935871)
chr2 (1-276)||(17006253-17006531)
chr2 (1-276)||(23778023-23778301)
chr2 (1-196)||(8943926-8944124)
chr2 (1-196)||(12635846-12636044)
chr2 (1-196)||(42177947-42178145)
chr2 (1-196)||(3798581-3798779)
chr2 (1-196)||(12641620-12641818)
chr2 (1-276)||(21141895-21142173)
chr2 (1-157)||(23774257-23774414)
chr2 (1-157)||(5888608-5888765)
chr2 (15-140)||(7507844-7507969)
chr2 (1-50)||(19886635-19886684)
chr2 (234-276)||(5888843-5888885)
chr2 (234-276)||(23774137-23774179)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-276)||(31309-31587)
scaffold0107 (1-276)||(39646-39924)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-276)||(39103-39381)
scaffold0076 (1-139)||(43137-43275)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (1-276)||(271338-271616)
chr8 (1-276)||(644304-644582)
chr8 (1-276)||(830039-830317)
chr8 (1-276)||(22088772-22089050)
chr8 (1-276)||(15319137-15319415)
chr8 (1-276)||(15499506-15499784)
chr8 (1-276)||(22006236-22006514)
chr8 (1-276)||(13662243-13662521)
chr8 (1-196)||(13720906-13721104)
chr8 (1-276)||(16195230-16195509)
chr8 (1-196)||(16873029-16873227)
chr8 (1-139)||(21844546-21844684)
chr8 (1-139)||(21851939-21852077)
chr8 (1-140)||(6774232-6774371)
chr8 (1-140)||(24549120-24549259)
chr8 (1-50)||(30120951-30121000)
chr8 (1-50)||(16674366-16674415)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (1-276)||(7822728-7823006)
chr7 (1-276)||(7830039-7830317)
chr7 (1-276)||(27101615-27101893)
chr7 (1-276)||(27108963-27109241)
chr7 (1-276)||(27176433-27176711)
chr7 (1-276)||(38783707-38783985)
chr7 (1-276)||(15950769-15951047)
chr7 (1-276)||(15760092-15760370)
chr7 (1-196)||(18979999-18980197)
chr7 (1-196)||(14250876-14251074)
chr7 (1-196)||(15927648-15927846)
chr7 (1-196)||(13758450-13758648)
chr7 (3-144)||(48622646-48622788)
chr7 (4-157)||(10000351-10000505)
chr7 (1-157)||(16418618-16418775)
chr7 (21-158)||(13321134-13321273)
chr7 (1-139)||(13572816-13572954)
chr7 (1-140)||(16478936-16479075)
chr7 (1-50)||(10989638-10989687)
chr7 (1-42)||(18253821-18253862)
chr7 (1-158)||(13910998-13911156)
chr7 (234-276)||(10000583-10000625)
chr7 (234-276)||(16418498-16418540)
chr7 (1-50)||(2437686-2437735)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-276)||(35582036-35582314)
chr5 (1-276)||(21932359-21932637)
chr5 (1-276)||(21938529-21938807)
chr5 (1-276)||(22883062-22883340)
chr5 (1-276)||(36989748-36990026)
chr5 (1-276)||(1219498-1219776)
chr5 (1-276)||(7425324-7425602)
chr5 (1-225)||(17471566-17471793)
chr5 (1-196)||(10777948-10778146)
chr5 (1-276)||(35791076-35791355)
chr5 (1-196)||(23514641-23514839)
chr5 (1-276)||(11212043-11212321)
chr5 (1-157)||(23328678-23328835)
chr5 (1-157)||(24616282-24616439)
chr5 (1-157)||(24712658-24712815)
chr5 (1-157)||(24745676-24745833)
chr5 (21-207)||(32950762-32950952)
chr5 (1-139)||(27009981-27010119)
chr5 (1-50)||(18777966-18778015)
chr5 (1-50)||(12603-12652)
chr5 (1-50)||(25426857-25426906)
chr5 (1-50)||(43443369-43443418)
chr5 (234-276)||(23328558-23328600)
chr5 (1-50)||(19500128-19500177)
chr5 (1-50)||(21073569-21073618)
chr5 (1-50)||(22366455-22366504)
chr5 (234-274)||(24616165-24616205)
chr5 (234-274)||(24712541-24712581)
chr5 (234-274)||(24745559-24745599)
chr5 (1-140)||(29188258-29188397)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-276)||(29162-29440)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-276)||(153985-154263)
scaffold0023 (1-50)||(169886-169935)
scaffold0023 (1-45)||(36327-36371)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-276)||(18168970-18169248)
chr4 (1-276)||(19020486-19020764)
chr4 (1-276)||(15287223-15287501)
chr4 (1-276)||(15294332-15294610)
chr4 (1-196)||(7132043-7132241)
chr4 (1-276)||(17145635-17145913)
chr4 (1-276)||(18248218-18248496)
chr4 (1-196)||(20000803-20001001)
chr4 (1-156)||(22738390-22738547)
chr4 (63-276)||(8374508-8374724)
chr4 (1-157)||(26339140-26339297)
chr4 (1-65)||(8378365-8378429)
chr4 (1-142)||(22352042-22352184)
chr4 (1-138)||(10644360-10644497)
chr4 (46-207)||(40885585-40885748)
chr4 (1-50)||(47357883-47357932)
chr4 (235-276)||(22738269-22738310)
chr4 (234-276)||(22352260-22352302)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-276)||(10317-10595)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-276)||(1553-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-276)||(2392-2670)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (30-276)||(3-252)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (5-276)||(34140-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-196)||(1492-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-276)||(7434-7712)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-276)||(54416-54694)
scaffold0066 (1-207)||(45099-45308)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-144)||(54008-54152)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-140)||(5190-5329)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (1-144)||(3547-3691)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (1-157)||(6718-6875)
scaffold0183 (234-276)||(6598-6640)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-106)||(3895-4000)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (21-207)||(56105-56294)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-157)||(7330-7487)
scaffold0003 (234-276)||(7210-7252)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-137)||(177-313)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-140)||(3101-3240)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-157)||(23727-23884)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-50)||(10726-10775)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-45)||(12105-12149)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-140)||(9323-9462)
scaffold0215 (1-140)||(16221-16360)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-50)||(1278-1327)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-50)||(21090-21139)
scaffold0139 (1-50)||(14036-14084)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-50)||(64497-64546)
scaffold0026 (1-42)||(107983-108024)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-140)||(13299-13438)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-45)||(31649-31693)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 18059736 - 18060014
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18059736 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 18059835  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059836 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 18059935  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059936 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17004916 - 17004638
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17004916 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 17004817  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17004816 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 17004717  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004716 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 38055069 - 38055347
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38055069 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 38055168  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38055169 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 38055268  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055269 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46523667 - 46523394
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  46523667 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtga 46523568  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46523567 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 46523468  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattga 271  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46523467 ccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17148845 - 17148647
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17148845 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 17148746  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148745 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 19962477 - 19962617
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19962477 atgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgg 19962576  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962577 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22228086 - 22227947
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    ||||    
T  22228086 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtga 22227987  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227986 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22232783 - 22232644
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    ||||    
T  22232783 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtga 22232684  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232683 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 7640912 - 7641069
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  7640912 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 7641010  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641011 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22035725 - 22035568
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  22035725 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 22035627  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035626 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 5072362 - 5072411
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5072362 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 5072411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 18601092 - 18601141
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  18601092 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtg 18601141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22035490 - 22035448
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22035490 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22035448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2116529 - 2116393
Alignment:
Q  4 aaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||||| || ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||    
T  2116529 aaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaat 2116430  T
Q  104 tacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    ||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  2116429 tacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 2116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20254353 - 20254312
Alignment:
Q  235 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20254353 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 20254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45051700 - 45051561
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||| ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  45051700 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 45051601  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  45051600 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 16376351 - 16376629
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16376351 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 16376450  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16376451 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 16376550  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376551 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 16383675 - 16383953
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16383675 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 16383774  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16383775 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 16383874  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383875 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10488977 - 10488699
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488977 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 10488878  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10488877 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 10488778  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488777 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 16556117 - 16556395
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16556117 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 16556216  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16556217 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 16556316  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556317 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 16632673 - 16632951
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16632673 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 16632772  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16632773 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 16632872  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632873 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22225716 - 22225994
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22225716 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 22225815  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225816 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 22225915  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225916 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1556283 - 1556005
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1556283 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 1556184  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1556183 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatatt 1556084  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556083 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19610296 - 19610018
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  19610296 atgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtga 19610197  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19610196 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatatt 19610097  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610096 ccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16232170 - 16231972
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16232170 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 16232071  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232070 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 18086801 - 18086999
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18086801 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 18086900  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086901 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 13620772 - 13620970
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13620772 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 13620871  T
Q  101 aatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620872 aattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23978047 - 23977849
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23978047 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 23977948  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977947 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19299515 - 19299375
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19299515 atgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgg 19299416  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299415 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22251544 - 22251648
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22251544 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 22251643  T
Q  101 aatta 105  Q
    |||||    
T  22251644 aatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29666151 - 29665942
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  29666151 atgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtga 29666052  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||  ||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||    
T  29666051 aattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgtt 29665952  T
Q  198 ccattgatgt 207  Q
    | ||||||||    
T  29665951 caattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  189 attcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 29869754 - 29869911
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  29869754 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 29869852  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869853 aattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 16825726 - 16825775
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16825726 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 16825775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740903
Alignment:
Q  96 ggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattc 192  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| || ||  |  ||||| |||||| ||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  193 atattccattgatgtggtt 211  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  27740921 atgttcaattgatgtggtt 27740903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25175841 - 25175792
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25175841 atgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 25175792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatg 119  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| ||||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatg 14626222  T
Q  120 tataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  14626223 taaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 1650079 - 1650128
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||    
T  1650079 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtg 1650128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 27653957 - 27654006
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  27653957 atgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 27654006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19629588 - 19629556
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtg 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19629588 aattgttgttaaattcgtgctcttgttgtggtg 19629556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 1467717 - 1467995
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1467717 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 1467816  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1467817 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 1467916  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467917 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49232714 - 49232436
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  49232714 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 49232615  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232614 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 49232515  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232514 ccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25059017 - 25058739
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25059017 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 25058918  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25058917 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 25058818  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058817 ccattgatgttgttattgttaacttatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 12902068 - 12902346
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12902068 atgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 12902167  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902168 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 12902267  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12902268 ccattgatgttgttattattaactgatactattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5228590 - 5228317
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5228590 atgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 5228492  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5228491 aattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatatt 5228392  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgat 272  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228391 ccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22275487 - 22275260
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22275487 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 22275388  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275387 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 22275288  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatg 225  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22275287 ccattgatgttgttattgttaactgatg 22275260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 12264770 - 12265049
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12264770 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 12264869  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  12264870 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgt 12264969  T
Q  197 tccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12264970 tccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 15468318 - 15468545
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15468318 atgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 15468417  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15468418 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 15468517  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatg 225  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15468518 ccattgatgttgttattgttaactgatg 15468545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18911271 - 18911073
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18911271 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 18911172  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911171 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12812119 - 12811938
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12812119 atgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgg 12812020  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 179  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12812019 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44229263 - 44228985
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  44229263 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 44229164  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||    
T  44229163 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgtt 44229064  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44229063 ccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54651735 - 54651529
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  | ||||    
T  54651735 atgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtga 54651636  T
Q  101 aatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||    
T  54651635 aattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgtt 54651536  T
Q  198 ccattga 204  Q
    |||||||    
T  54651535 ccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897255
Alignment:
Q  160 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatactta 18897238  T
Q  260 attgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897239 attgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 18897022 - 18897127
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  18897022 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgg 18897121  T
Q  101 aattac 106  Q
    ||||||    
T  18897122 aattac 18897127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986361
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| ||  || |||||||||  |||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  119 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 11986361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16821417 - 16821280
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||  | ||| | |||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  16821417 atgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtga 16821318  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 138  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821317 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 41270353 - 41270304
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  41270353 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 41270304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 55316497 - 55316448
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  55316497 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 55316448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 15936613 - 15936654
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15936613 atgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 15936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15615111 - 15615032
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||| |||||||| |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||    
T  15615111 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgat 15615032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 15938455 - 15938496
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  15938455 atgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctc 15938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 11231316 - 11231594
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11231316 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 11231415  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11231416 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 11231515  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231516 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22513163 - 22513441
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22513163 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 22513262  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22513263 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 22513362  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513363 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 28775785 - 28776063
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28775785 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 28775884  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28775885 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 28775984  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775985 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 24685759 - 24686037
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24685759 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 24685858  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24685859 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 24685958  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24685959 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12728670 - 12728392
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12728670 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 12728571  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12728570 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatatt 12728471  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728470 ccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34824753 - 34824475
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34824753 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 34824654  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34824653 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatatt 34824554  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824553 ccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16935871 - 16935593
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  16935871 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtga 16935772  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935771 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 16935672  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935671 ccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17006531 - 17006253
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  17006531 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtga 17006432  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006431 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 17006332  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006331 ccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 23778023 - 23778301
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23778023 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 23778122  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23778123 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatatt 23778222  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778223 ccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8944124 - 8943926
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  8944124 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtga 8944025  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8944024 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12635846 - 12636044
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12635846 atgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 12635945  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635946 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 42177947 - 42178145
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42177947 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtga 42178046  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178047 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 3798581 - 3798779
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3798581 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 3798680  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798681 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12641620 - 12641818
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  12641620 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctga 12641719  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641720 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21142173 - 21141895
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  21142173 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatga 21142074  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||    
T  21142073 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgtt 21141974  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21141973 ccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23774414 - 23774257
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23774414 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 23774316  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774315 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5888608 - 5888765
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  5888608 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 5888706  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888707 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Original strand, 7507844 - 7507969
Alignment:
Q  15 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaa 113  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||    
T  7507844 atgaataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 7507943  T
Q  114 agtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  7507944 a-tatgtaaaaataataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 19886635 - 19886684
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19886635 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 19886684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Original strand, 5888843 - 5888885
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5888843 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 5888885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23774179 - 23774137
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23774179 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 23774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31587 - 31309
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31587 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 31488  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31487 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 31388  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31387 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39924 - 39646
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  39924 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtga 39825  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  39824 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatgttattcatatt 39725  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39724 tcattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39381 - 39103
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39381 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 39282  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39281 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 39182  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39181 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43275 - 43137
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  43275 atgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 43176  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43175 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 271338 - 271616
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  271338 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 271437  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  271438 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 271537  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271538 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 644582 - 644304
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  644582 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 644483  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  644482 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 644383  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644382 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 830317 - 830039
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  830317 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 830218  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  830217 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 830118  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830117 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22088772 - 22089050
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22088772 atgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtga 22088871  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22088872 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 22088971  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088972 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15319137 - 15319415
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15319137 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 15319236  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15319237 aattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgtt 15319336  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319337 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15499506 - 15499784
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15499506 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 15499605  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15499606 aattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgtt 15499705  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499706 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22006236 - 22006514
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22006236 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 22006335  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006336 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 22006435  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22006436 ccattgatgtggttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggactgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 13662243 - 13662521
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  13662243 atgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtga 13662342  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662343 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 13662442  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13662443 ccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 13720906 - 13721104
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13720906 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 13721005  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721006 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16195509 - 16195230
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16195509 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 16195410  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  16195409 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgt 16195310  T
Q  197 tccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| |||  | | |||||||| | | |   ||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195309 tccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 16873029 - 16873227
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16873029 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 16873128  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873129 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 21844546 - 21844684
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  21844546 atgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtga 21844645  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    |||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844646 aattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 21851939 - 21852077
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  21851939 atgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtga 21852038  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    |||||  | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21852039 aattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6774232 - 6774371
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  6774232 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 6774331  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  6774332 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 6774371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24549259 - 24549120
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  24549259 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 24549160  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  24549159 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 24549120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 30121000 - 30120951
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  30121000 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 30120951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 16674366 - 16674415
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  16674366 atgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtg 16674415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7823006 - 7822728
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7823006 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 7822907  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7822906 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 7822807  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822806 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7830317 - 7830039
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7830317 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 7830218  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7830217 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 7830118  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830117 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 27101615 - 27101893
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101615 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 27101714  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27101715 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 27101814  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101815 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 27108963 - 27109241
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27108963 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 27109062  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27109063 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 27109162  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109163 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27176711 - 27176433
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27176711 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 27176612  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27176611 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 27176512  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176511 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 38783707 - 38783985
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38783707 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 38783806  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38783807 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 38783906  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783907 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15950769 - 15951047
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15950769 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 15950868  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950869 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 15950968  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950969 ccattgatgtgattattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15760092 - 15760370
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  15760092 atgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtga 15760191  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15760192 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatatt 15760291  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760292 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 18979999 - 18980197
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18979999 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 18980098  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980099 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14250876 - 14251074
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14250876 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtga 14250975  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14250976 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15927846 - 15927648
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  15927846 atgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtga 15927747  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927746 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13758648 - 13758450
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13758648 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 13758549  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758548 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 48622646 - 48622788
Alignment:
Q  3 gaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48622646 gaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaa 48622745  T
Q  103 ttacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 144  Q
    |||| | ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  48622746 ttacatgttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 10000351 - 10000505
Alignment:
Q  4 aaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  10000351 aaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaat 10000449  T
Q  104 tacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000450 tacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16418775 - 16418618
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  16418775 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 16418677  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418676 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13321273 - 13321134
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||    
T  13321273 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtat 13321174  T
Q  119 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321173 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13572954 - 13572816
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || || || ||   |||||    
T  13572954 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtga 13572855  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    |||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572854 aattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16478936 - 16479075
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  16478936 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 16479035  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16479036 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16479075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10989687 - 10989638
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  10989687 atgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 10989638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 18253821 - 18253862
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18253821 atgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 18253862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 13910998 - 13911156
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| | || ||||| ||   |||||    
T  13910998 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtga 13911097  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 158  Q
    |||||| | |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13911098 aattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Original strand, 10000583 - 10000625
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10000583 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 10000625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16418540 - 16418498
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16418540 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 16418498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 2437735 - 2437686
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2437735 atgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtg 2437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35582314 - 35582036
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35582314 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 35582215  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35582214 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 35582115  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582114 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 21932359 - 21932637
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21932359 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 21932458  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21932459 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 21932558  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932559 ccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 21938529 - 21938807
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21938529 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 21938628  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21938629 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 21938728  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938729 ccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22883062 - 22883340
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22883062 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatga 22883161  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22883162 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatatt 22883261  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883262 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 36989748 - 36990026
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36989748 atgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 36989847  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36989848 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatatt 36989947  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989948 ccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 1219498 - 1219776
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1219498 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 1219597  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219598 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 1219697  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219698 tcattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7425602 - 7425324
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  7425602 atgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtga 7425503  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7425502 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 7425403  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7425402 ccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17471566 - 17471793
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17471566 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 17471665  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17471666 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatatt 17471765  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatg 225  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17471766 ccattgatgttgttattgttaactgatg 17471793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10777948 - 10778146
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10777948 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 10778047  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778048 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 35791076 - 35791355
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  35791076 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtga 35791175  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  35791176 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgt 35791275  T
Q  197 tccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| |||  | | |||||||| | | |   ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35791276 tccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23514839 - 23514641
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23514839 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 23514740  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514739 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 11212043 - 11212321
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11212043 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 11212142  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  11212143 aattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgtt 11212242  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11212243 ccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23328835 - 23328678
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23328835 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 23328737  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328736 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24616439 - 24616282
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |||    
T  24616439 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatga 24616341  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616340 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24712815 - 24712658
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |||    
T  24712815 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatga 24712717  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712716 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24745833 - 24745676
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |||    
T  24745833 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatga 24745735  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745734 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950762
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| ||  || |||||||||  ||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  119 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 207  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgt 32950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27010119 - 27009981
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||||  |   |||||    
T  27010119 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtga 27010020  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 139  Q
    |||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010019 aattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 18777966 - 18778015
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18777966 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtg 18778015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12652 - 12603
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12652 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 12603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25426906 - 25426857
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25426906 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 25426857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 43443369 - 43443418
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43443369 atgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtg 43443418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23328600 - 23328558
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328600 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19500177 - 19500128
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  19500177 atgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 19500128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21073569 - 21073618
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21073569 atgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 21073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 22366455 - 22366504
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22366455 atgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 22366504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24616205 - 24616165
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 274  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616205 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24712581 - 24712541
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 274  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712581 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24745599 - 24745559
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 274  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745599 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 29188258 - 29188397
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  29188258 atgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 29188357  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  29188358 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 29188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29440 - 29162
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  29440 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtga 29341  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29340 aattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 29241  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29240 ccattgatgtggttattgttaatttatgttattgttagtgaattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 153985 - 154263
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  153985 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 154084  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  154085 agttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatatt 154184  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154185 ccattgatgtggttattgttaacttatgctattgtgggtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 169886 - 169935
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  169886 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 36371 - 36327
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 45  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  36371 atgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 36327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18169248 - 18168970
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18169248 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 18169149  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169148 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 18169049  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18169048 ccattgatgtggttattgttaaataatgctattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19020764 - 19020486
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19020764 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 19020665  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19020664 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 19020565  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020564 ccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15287223 - 15287501
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  15287223 atgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtga 15287322  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15287323 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 15287422  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287423 ccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15294332 - 15294610
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  15294332 atgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtga 15294431  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15294432 aattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 15294531  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294532 ccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 7132043 - 7132241
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7132043 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 7132142  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132143 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 17145635 - 17145913
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17145635 atgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 17145734  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  17145735 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgtt 17145834  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17145835 ccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18248496 - 18248218
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  18248496 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatga 18248397  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  18248396 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgtt 18248297  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18248296 ccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20001001 - 20000803
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20001001 atgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtga 20000902  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000901 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22738547 - 22738390
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22738547 atgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 22738448  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 156  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738447 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  63 tgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  160 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 259  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||  |||||||||| ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  260 attgtggattgatgatg 276  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26339297 - 26339140
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  26339297 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 26339199  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339198 aattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8378429 - 8378365
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8378429 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 22352042 - 22352184
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  22352042 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 22352140  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 142  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352141 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10644497 - 10644360
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||    ||||    
T  10644497 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtga 10644398  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 138  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644397 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885748
Alignment:
Q  46 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 144  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||| || | ||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattat 40885684  T
Q  145 gcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 207  Q
    ||| ||||| ||||  ||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  40885685 gctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 40885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 47357932 - 47357883
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  47357932 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 47357883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  235 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Original strand, 22352260 - 22352302
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22352260 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22352302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10595
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10317 atgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 10416  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10417 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatatt 10516  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517 ccattgatgttgttgttgttaactgatgctattgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 1553 - 1831
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1553 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 1652  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  1653 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatata 1752  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
      |||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1753 aaattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2670 - 2392
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  2670 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtga 2571  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2570 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatatt 2471  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2470 ccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Original strand, 3 - 252
Alignment:
Q  30 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatg 127  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  128 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  227 tatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 34140 - 34414
Alignment:
Q  5 aaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaatt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34140 aaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatt 34239  T
Q  105 ac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccat 201  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34240 acatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccat 34339  T
Q  202 tgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    | |||| |||  | | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34340 taatgttgttgctattaactgatgctattgtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1690
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1492 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtga 1591  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1592 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 7434 - 7712
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  7434 atgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatga 7533  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||    
T  7534 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgtt 7633  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    ||||| | ||  || || | |||||||| | | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7634 ccattaaggttattgttattaactgatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54694 - 54416
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  54694 atgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtga 54595  T
Q  101 aatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  54594 aattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgtt 54495  T
Q  198 ccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  54494 ccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45308 - 45099
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  45308 atgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtga 45209  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatt 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  45208 aattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgtt 45109  T
Q  198 ccattgatgt 207  Q
    ||||||||||    
T  45108 ccattgatgt 45099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54152 - 54008
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  54152 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtga 54053  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 144  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54052 aattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5329
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  5190 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 5289  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5290 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3691 - 3547
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  3691 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtga 3592  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 144  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3591 aattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6875 - 6718
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  6875 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 6777  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6776 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6640 - 6598
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6640 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4000 - 3895
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  4000 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 3901  T
Q  101 aattac 106  Q
    ||||||    
T  3900 aattac 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56294
Alignment:
Q  21 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| ||  || |||||||||  |||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  119 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 56294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7487 - 7330
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  7487 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatga 7389  T
Q  101 aattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7388 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7252 - 7210
Alignment:
Q  234 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7252 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 313 - 177
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  313 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtga 214  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 137  Q
    |||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||    
T  213 aattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3240 - 3101
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | | | |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  3240 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 3141  T
Q  101 aattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |  || |||||| |||||| ||||| |||||    
T  3140 aattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaa 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23727 - 23884
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| | | || || | ||| ||| | | || |||||||||||||||||||||  || |||    
T  23727 atgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatga 23825  T
Q  101 aattacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 157  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23826 aattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 10726 - 10775
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10726 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtg 10775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 12105 - 12149
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12105 atgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 9323 - 9462
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  9323 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 9422  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9423 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 16221 - 16360
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  16221 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 16320  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16321 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 1278 - 1327
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1278 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21090 - 21139
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21090 atgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtg 21139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14084
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14036 atgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgctgtg 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 64497 - 64546
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  64497 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 64546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 108024 - 107983
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  108024 atgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 107983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 13299 - 13438
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||  |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   |||||    
T  13299 atgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 13398  T
Q  101 aattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 140  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13399 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 31649 - 31693
Alignment:
Q  1 atgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 45  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31649 atgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 31693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University