View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3493_high_3 (Length: 576)

Name: NF3493_high_3
Description: NF3493
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3493_high_3
NF3493_high_3
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (79-489)||(1365830-1366240)
chr7 (97-489)||(26282391-26282785)
chr7 (82-488)||(40001547-40001937)
chr7 (79-380)||(26633293-26633594)
chr7 (79-372)||(36438184-36438477)
chr7 (79-285)||(25610091-25610297)
chr7 (169-380)||(32956704-32956916)
chr7 (79-380)||(41852134-41852432)
chr7 (82-359)||(773719-773997)
chr7 (317-439)||(25609962-25610084)
chr7 (201-380)||(33909993-33910174)
chr7 (82-377)||(42311943-42312238)
chr7 (171-437)||(18015504-18015786)
chr7 (79-372)||(40737834-40738117)
chr7 (170-380)||(44893952-44894164)
chr7 (210-380)||(18895361-18895531)
chr7 (207-419)||(7366571-7366790)
chr7 (235-380)||(9479057-9479202)
chr7 (79-380)||(30739052-30739356)
chr7 (169-380)||(36796293-36796507)
chr7 (169-308)||(7636247-7636388)
chr7 (93-437)||(46221550-46221908)
chr7 (169-302)||(12251210-12251344)
chr7 (81-380)||(41908106-41908407)
chr7 (79-380)||(40841075-40841380)
chr7 (176-380)||(6380013-6380220)
chr7 (243-438)||(8358291-8358500)
chr7 (201-437)||(11672442-11672696)
chr7 (79-380)||(28589978-28590274)
chr7 (169-380)||(33419039-33419253)
chr7 (169-380)||(42161044-42161257)
chr7 (176-308)||(4099970-4100104)
chr7 (175-373)||(44876087-44876276)
chr7 (79-386)||(3799596-3799898)
chr7 (387-438)||(12251542-12251594)
chr7 (380-489)||(25061709-25061821)
chr7 (79-135)||(28105789-28105845)
chr7 (387-437)||(33419273-33419322)
chr7 (347-380)||(12251489-12251522)
chr7 (387-416)||(42161277-42161306)
chr7 (79-128)||(44002766-44002815)
chr7 (264-380)||(25061834-25061949)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (79-507)||(43511420-43511849)
chr5 (79-489)||(3349562-3349970)
chr5 (79-489)||(20975805-20976216)
chr5 (86-489)||(42291719-42292123)
chr5 (93-489)||(4734428-4734824)
chr5 (79-489)||(29156010-29156421)
chr5 (82-489)||(10591109-10591513)
chr5 (82-438)||(17513772-17514139)
chr5 (79-489)||(5829214-5829612)
chr5 (169-378)||(40956245-40956454)
chr5 (208-379)||(138075-138246)
chr5 (79-377)||(27351282-27351580)
chr5 (79-303)||(7390234-7390457)
chr5 (169-380)||(13474559-13474772)
chr5 (90-377)||(17325777-17326065)
chr5 (169-478)||(13656024-13656352)
chr5 (201-385)||(931300-931484)
chr5 (90-303)||(33281681-33281894)
chr5 (169-368)||(19099236-19099436)
chr5 (169-380)||(26377695-26377910)
chr5 (202-368)||(13423806-13423973)
chr5 (90-308)||(18873459-18873680)
chr5 (91-367)||(10033489-10033770)
chr5 (169-308)||(12661311-12661451)
chr5 (202-375)||(40779127-40779298)
chr5 (85-257)||(8379282-8379453)
chr5 (234-380)||(16515454-16515600)
chr5 (82-135)||(4177375-4177428)
chr5 (79-135)||(13288618-13288674)
chr5 (216-368)||(36718535-36718689)
chr5 (264-386)||(23069144-23069266)
chr5 (264-380)||(8379539-8379655)
chr5 (387-438)||(12661161-12661213)
chr5 (93-128)||(13424046-13424081)
chr5 (79-133)||(16515682-16515736)
chr5 (387-416)||(26377930-26377959)
chr5 (265-310)||(37029051-37029096)
chr5 (387-415)||(36718723-36718751)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (79-489)||(1092874-1093283)
chr6 (82-489)||(29308303-29308710)
chr6 (235-489)||(1690622-1690877)
chr6 (82-485)||(31860826-31861214)
chr6 (82-368)||(30915197-30915488)
chr6 (171-380)||(2618285-2618495)
chr6 (169-436)||(6360620-6360901)
chr6 (79-341)||(3748401-3748663)
chr6 (171-376)||(6754140-6754346)
chr6 (201-380)||(12614670-12614850)
chr6 (79-285)||(6294279-6294487)
chr6 (169-308)||(628018-628157)
chr6 (170-368)||(29149345-29149544)
chr6 (181-379)||(19231544-19231741)
chr6 (169-380)||(57617-57830)
chr6 (97-308)||(21946109-21946317)
chr6 (174-308)||(29401142-29401277)
chr6 (169-302)||(22503751-22503885)
chr6 (201-380)||(3514804-3514985)
chr6 (201-292)||(11088564-11088655)
chr6 (169-380)||(7525089-7525301)
chr6 (200-341)||(350383-350524)
chr6 (241-308)||(14893412-14893479)
chr6 (79-136)||(1690550-1690607)
chr6 (265-310)||(31234911-31234956)
chr6 (79-135)||(11088746-11088802)
chr6 (387-437)||(2618214-2618265)
chr6 (93-128)||(3514698-3514733)
chr6 (387-437)||(24455078-24455129)
chr6 (389-438)||(29400998-29401047)
chr6 (387-438)||(57545-57597)
chr6 (421-489)||(5877017-5877084)
chr6 (387-415)||(6754088-6754116)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (79-486)||(55134032-55134440)
chr4 (102-489)||(45172502-45172887)
chr4 (82-489)||(34982045-34982452)
chr4 (82-380)||(35653816-35654114)
chr4 (169-378)||(5545261-5545470)
chr4 (188-380)||(21791490-21791681)
chr4 (169-380)||(19661309-19661521)
chr4 (175-376)||(32130718-32130920)
chr4 (169-380)||(53011642-53011854)
chr4 (212-379)||(43154754-43154921)
chr4 (201-377)||(23426120-23426298)
chr4 (169-324)||(41038236-41038392)
chr4 (216-380)||(22423614-22423780)
chr4 (173-380)||(23256524-23256731)
chr4 (169-504)||(28463510-28463864)
chr4 (169-380)||(27632327-27632540)
chr4 (204-303)||(10575481-10575580)
chr4 (236-380)||(24449054-24449200)
chr4 (169-308)||(44478041-44478182)
chr4 (169-367)||(29579823-29580022)
chr4 (169-380)||(11681664-11681878)
chr4 (169-380)||(11689943-11690157)
chr4 (171-378)||(29221545-29221754)
chr4 (81-186)||(24449222-24449328)
chr4 (169-380)||(16072523-16072740)
chr4 (175-380)||(26328961-26329164)
chr4 (169-271)||(51066347-51066449)
chr4 (387-437)||(39372816-39372867)
chr4 (79-112)||(9925295-9925328)
chr4 (387-437)||(32130944-32130995)
chr4 (279-380)||(21168986-21169088)
chr4 (387-416)||(19661260-19661289)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (79-489)||(34523787-34524194)
chr8 (84-437)||(39697776-39698129)
chr8 (79-464)||(12531407-12531790)
chr8 (85-438)||(23567117-23567465)
chr8 (81-489)||(32098012-32098437)
chr8 (175-380)||(5869253-5869454)
chr8 (97-380)||(3628598-3628881)
chr8 (169-380)||(7858014-7858227)
chr8 (176-380)||(43967999-43968205)
chr8 (201-380)||(13585228-13585409)
chr8 (169-380)||(18420531-18420744)
chr8 (236-380)||(35874854-35875000)
chr8 (170-308)||(43926246-43926385)
chr8 (201-365)||(3471545-3471710)
chr8 (169-365)||(18112061-18112259)
chr8 (201-381)||(44665000-44665183)
chr8 (172-368)||(30915214-30915410)
chr8 (200-375)||(33452728-33452901)
chr8 (81-186)||(35875022-35875128)
chr8 (201-308)||(1004060-1004170)
chr8 (204-380)||(29372294-29372463)
chr8 (82-309)||(42076109-42076337)
chr8 (209-380)||(42951727-42951908)
chr8 (90-292)||(36514999-36515202)
chr8 (201-338)||(27074546-27074684)
chr8 (145-292)||(42777763-42777911)
chr8 (387-434)||(3445544-3445591)
chr8 (383-438)||(41666088-41666142)
chr8 (223-281)||(3575117-3575175)
chr8 (228-295)||(5971742-5971805)
chr8 (387-416)||(1003969-1003998)
chr8 (387-415)||(7857966-7857994)
chr8 (79-135)||(33452934-33452990)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (83-503)||(18172779-18173197)
chr2 (79-505)||(17117478-17117897)
chr2 (79-504)||(15457306-15457732)
chr2 (82-446)||(38985545-38985908)
chr2 (82-487)||(18915889-18916295)
chr2 (82-398)||(21747067-21747382)
chr2 (79-370)||(36059738-36060029)
chr2 (82-380)||(39081328-39081624)
chr2 (90-380)||(1418840-1419129)
chr2 (169-380)||(19367341-19367554)
chr2 (169-380)||(18676232-18676446)
chr2 (169-372)||(38599340-38599541)
chr2 (79-380)||(13997244-13997544)
chr2 (170-380)||(25222252-25222464)
chr2 (169-380)||(13020351-13020565)
chr2 (169-377)||(26151669-26151880)
chr2 (169-380)||(41096459-41096673)
chr2 (93-380)||(42411406-42411692)
chr2 (169-377)||(45618909-45619118)
chr2 (169-377)||(2063738-2063947)
chr2 (169-380)||(7993562-7993775)
chr2 (209-379)||(27302491-27302661)
chr2 (93-377)||(29480484-29480768)
chr2 (93-415)||(1226114-1226445)
chr2 (216-368)||(6530601-6530754)
chr2 (204-380)||(34061813-34061990)
chr2 (169-374)||(31273089-31273293)
chr2 (176-308)||(4855995-4856128)
chr2 (169-292)||(42759678-42759802)
chr2 (169-437)||(12269285-12269566)
chr2 (176-368)||(45042331-45042525)
chr2 (173-276)||(36481428-36481532)
chr2 (387-437)||(6530518-6530568)
chr2 (175-292)||(13001655-13001772)
chr2 (380-438)||(9029471-9029531)
chr2 (387-437)||(18676466-18676517)
chr2 (387-437)||(36481264-36481315)
chr2 (169-232)||(38599593-38599655)
chr2 (386-424)||(31273318-31273356)
chr2 (387-424)||(26151903-26151940)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (79-489)||(12971226-12971637)
chr1 (82-488)||(27703370-27703787)
chr1 (79-364)||(50371080-50371365)
chr1 (172-380)||(5560413-5560622)
chr1 (87-365)||(44836566-44836840)
chr1 (169-380)||(25930532-25930745)
chr1 (207-380)||(37873723-37873897)
chr1 (207-372)||(42740048-42740213)
chr1 (169-381)||(10109647-10109862)
chr1 (90-301)||(13120710-13120921)
chr1 (82-380)||(15441220-15441516)
chr1 (169-380)||(30899584-30899800)
chr1 (169-380)||(48722292-48722507)
chr1 (209-380)||(12884100-12884272)
chr1 (169-380)||(17674278-17674487)
chr1 (169-308)||(18127859-18127999)
chr1 (79-380)||(26486208-26486499)
chr1 (169-380)||(51110023-51110236)
chr1 (216-380)||(24556736-24556900)
chr1 (169-377)||(6150653-6150864)
chr1 (90-372)||(22386680-22386963)
chr1 (169-311)||(30004830-30004972)
chr1 (171-380)||(29208022-29208233)
chr1 (169-380)||(14084622-14084835)
chr1 (176-308)||(33124559-33124692)
chr1 (169-380)||(50552424-50552637)
chr1 (169-308)||(9-149)
chr1 (169-308)||(28885593-28885733)
chr1 (169-380)||(6333441-6333650)
chr1 (201-380)||(17487237-17487418)
chr1 (171-385)||(1269484-1269689)
chr1 (171-380)||(20905210-20905423)
chr1 (79-302)||(9777421-9777646)
chr1 (209-302)||(52055560-52055654)
chr1 (200-260)||(31369358-31369418)
chr1 (250-370)||(38263804-38263924)
chr1 (82-132)||(37873592-37873642)
chr1 (387-424)||(30899527-30899564)
chr1 (236-380)||(3907402-3907545)
chr1 (387-437)||(12884292-12884343)
chr1 (387-437)||(14084855-14084906)
chr1 (387-437)||(17487440-17487491)
chr1 (317-380)||(28189327-28189390)
chr1 (387-437)||(48722527-48722578)
chr1 (289-375)||(31369432-31369518)
chr1 (79-128)||(39080454-39080503)
chr1 (87-135)||(1269727-1269775)
chr1 (79-123)||(24556989-24557033)
chr1 (265-301)||(32810370-32810406)
chr1 (93-129)||(33124489-33124525)
chr1 (169-260)||(52240458-52240550)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (86-486)||(48626869-48627269)
chr3 (82-504)||(43905689-43906085)
chr3 (207-379)||(42009223-42009395)
chr3 (175-486)||(51939483-51939812)
chr3 (79-368)||(7767005-7767297)
chr3 (82-379)||(27303118-27303413)
chr3 (171-380)||(18408121-18408331)
chr3 (207-380)||(36538147-36538320)
chr3 (83-343)||(46904709-46904969)
chr3 (207-381)||(21596264-21596438)
chr3 (169-380)||(21784705-21784918)
chr3 (169-379)||(52655045-52655257)
chr3 (169-368)||(25599009-25599208)
chr3 (207-369)||(50677275-50677437)
chr3 (169-380)||(28132658-28132870)
chr3 (172-368)||(13401401-13401599)
chr3 (171-380)||(23164496-23164706)
chr3 (181-380)||(54430482-54430682)
chr3 (169-380)||(46791619-46791832)
chr3 (213-380)||(1649798-1649965)
chr3 (172-303)||(15987207-15987338)
chr3 (234-380)||(41707043-41707190)
chr3 (169-437)||(8364030-8364315)
chr3 (209-380)||(29387716-29387889)
chr3 (178-341)||(19965812-19965975)
chr3 (169-308)||(24252622-24252762)
chr3 (200-380)||(40152084-40152264)
chr3 (169-380)||(23067646-23067861)
chr3 (169-380)||(27729691-27729904)
chr3 (201-308)||(1255007-1255112)
chr3 (209-292)||(6715457-6715540)
chr3 (82-386)||(51146861-51147165)
chr3 (234-310)||(4207346-4207418)
chr3 (169-232)||(27110794-27110857)
chr3 (202-303)||(20762056-20762158)
chr3 (79-128)||(21596516-21596565)
chr3 (387-437)||(21784938-21784989)
chr3 (387-437)||(27110962-27111013)
chr3 (387-437)||(29387909-29387960)
chr3 (387-437)||(46791852-46791903)
chr3 (82-135)||(40151966-40152019)
chr3 (387-416)||(41707210-41707239)
chr3 (387-415)||(27729924-27729952)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (171-380)||(17056-17268)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (169-380)||(16639-16852)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (169-285)||(1086-1203)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (185-308)||(8332-8457)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (171-301)||(46099-46228)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (169-285)||(22727-22844)
scaffold0035 (387-437)||(22919-22970)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (90-134)||(99092-99136)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1366240 - 1365830
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1366240 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttgtaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttacaaacggtgt 1366141  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1366140 catttgaatatgtcaattatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttc 1366041  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1366040 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaagaaactcaaacgtg 1365941  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttt-tatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1365940 taaagaagtaacatatatatttttatatttaagt-ggggtgggtattagagttaattttttcggaggcccatagattttggaggcccggcttgattgagc 1365842  T
Q  478 atcttgcactcc 489  Q
    | ||||||||||    
T  1365841 accttgcactcc 1365830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 97 - 489
Target Start/End: Original strand, 26282391 - 26282785
Alignment:
Q  97 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtcactt 196  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  26282391 aatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttgtatttttcactt 26282490  T
Q  197 attcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 294  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26282491 atatgttgtgggaaaggagaaaatgaatgatttatatgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 26282590  T
Q  295 tcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatat 394  Q
    | ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26282591 tgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtgcagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatat 26282690  T
Q  395 atattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  26282691 atattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttctgaggcctatagcttttggaggcccggcttgattgagtaccttgcactcc 26282785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 488
Target Start/End: Original strand, 40001547 - 40001937
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  40001547 taagctttattagaaaaatagaattagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtggaatttactaacggcgtcgt 40001646  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||               |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40001647 ttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggttt---------------gattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 40001731  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40001732 ttgactgattaagtgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccagatttatgttcagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaa 40001831  T
Q  382 agaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatct 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  40001832 agaagtaacatatatattttttatttaagtaggggtgggtattagagttaatttttt-ttaggcccatagcttttggaggcccggcttaattgagcacct 40001930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26633594 - 26633293
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||    
T  26633594 agctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacgtctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtg 26633495  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||| | | |||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26633494 tcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 26633396  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||| | |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26633395 caaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggttttatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgt 26633296  T
Q  378 gta 380  Q
    |||    
T  26633295 gta 26633293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 372
Target Start/End: Original strand, 36438184 - 36438477
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | ||||| ||||||||    
T  36438184 agctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtg 36438283  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    ||||||| | | ||||||  | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  36438284 tcatttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaagggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaattattgttgtgattctttcaatgaaatggttttt 36438382  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||    
T  36438383 caaattgactgattaagtgattatacaaattgatagtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagcctagaaaaaactca 36438477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25610297 - 25610091
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||       |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  25610297 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttccaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacggtgt 25610198  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  25610197 cgtttggatttgtcacctatccattgtgggaaaggggaaaactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgacttttc 25610098  T
Q  279 aaattga 285  Q
    |||||||    
T  25610097 aaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32956916 - 32956704
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  32956916 ctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatcattgttgtgattctttcaatgaa 32956817  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtct-agaaaaa 367  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||  ||||||  ||| |||||||| | || ||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||    
T  32956816 ataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggggtggtttgatagcatcagatttatgtccagaaaggagaactagagtctaaaaaaaa 32956717  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  32956716 actcaaacgtgta 32956704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Original strand, 41852134 - 41852432
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtg 177  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||        |||||||| ||||| ||  | |||| |||||||||    
T  41852134 agctaagtttcattaagaaatcagaatcagaagaacttttaaacgtcaaacgaaata--aaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatctaacggtg 41852231  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| || ||    
T  41852232 tcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaattatttatgcaaaaaagaaatgagtgttgcgattctttcaatgaaataactctt 41852331  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||| ||| |||| |||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41852332 taaattgactgagtaagtgattata-aaattgg-agtggttttatagcaccatatttacatcctgaaaggagaactaaagtctagaaaaaacccaaacgt 41852429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 359
Target Start/End: Original strand, 773719 - 773997
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||| |||     
T  773719 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata-aaaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcg 773817  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgta--aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    ||||||||||| |||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  773818 tttgaatttgtgactcctccgttgttggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttc 773916  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtc 359  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | || |||||| |||||| | || ||||||||||    
T  773917 aaattgactgataaagtaattatacaaattaggggtgatttgatagcatcagatttatttccagaaatgataactaaagtc 773997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25610084 - 25609962
Alignment:
Q  317 tttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  25610084 tttgatagtaccagatttatgttcagataggagaactaaagtctagaaaaaacccaaatgtgtaaagaagtaacatacatattttttatttaaatggagg 25609985  T
Q  417 tggatattggagttaattttttc 439  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    
T  25609984 tgggtattagagttaattttttc 25609962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33910174 - 33909993
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33910174 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagcgatt 33910075  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| | || |||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33910074 atacaaattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 33909993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42312238 - 42311943
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtc 179  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||    
T  42312238 taagcttcattaaaaaattagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtc 42312139  T
Q  180 atttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 279  Q
     |||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42312138 gtttagatttgtcgctcatccgttgtgg-aaaggggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttca 42312040  T
Q  280 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||| |   ||  |||| ||  | || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42312039 aattgactaatcaagtgattatacaaatcgagggtagtttg-taacatcagatttatgtccagaaaagagaattagagtctagaaaaaactcaaacgt 42311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 437
Target Start/End: Original strand, 18015504 - 18015786
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg---taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||| |||     ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  18015504 aacggtgtcgtttgaatttgtcacttttctgttgtgtaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatga 18015603  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | || ||||| ||||||||||||    
T  18015604 aatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaa 18015703  T
Q  368 actcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||| ||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  18015704 actcaaacatgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaattttt 18015786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 372
Target Start/End: Original strand, 40737834 - 40738117
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||        | |||||| ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  40737834 agctaagcttcattaaaaagtcagaatcaaaagaacttttaaa-atgaaacaaaataaaataaaataaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtg 40737932  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    ||||||||| | ||||||  | ||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||         ||||||||||| | || |||||||||||    
T  40737933 tcatttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaag---------ttgtgattctttcaataaaatagctttt 40738022  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  40738023 taaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcaaaaaagtagaactagagtttagaaaaaactca 40738117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 380
Target Start/End: Original strand, 44893952 - 44894164
Alignment:
Q  170 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  || | ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || ||    
T  44893952 taacggtgtcgtttgaatttgtaactcctttgctgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaa 44894051  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaa 367  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||| | |  |||||||| || | |  ||||||| ||||||| |||||    
T  44894052 atagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttaataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactatagtctagaaaaaa 44894151  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  44894152 actcaaacgtgta 44894164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 380
Target Start/End: Original strand, 18895361 - 18895531
Alignment:
Q  210 aaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||     
T  18895361 aaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaatta 18895460  T
Q  310 gtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataag-agaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     ||||| |||||||  | |||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18895461 atagtggtttgataacatcaaatttatgtcta-ataagtagaactcgagtctagaaaaaactcatacgtgta 18895531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7366790 - 7366571
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||    
T  7366790 ggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaa 7366691  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------aaagaagtaacatatatatt 399  Q
    ||| | ||| ||| |||  | |||||||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||       ||| ||||||||||||   |    
T  7366690 ttgatggtggtttaatatcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtatagaaaaaactcatacgtgtgctgaaaaaaaaagtaacatataatat 7366591  T
Q  400 ttttatttaagtgggggtgg 419  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  7366590 tttaatttaagtgggggtgg 7366571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9479202 - 9479057
Alignment:
Q  235 aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaattt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||    
T  9479202 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaattt 9479103  T
Q  335 atgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  9479102 atgtccagaaagtagaactagagtttagaaaaaaatcatacgtgta 9479057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30739356 - 30739052
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaa-gtgacagagaggtagagtttactaa-cggt 176  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||        | || |||| ||||||||  | ||||| || ||||    
T  30739356 agctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttctatacatgaaatgaaataaaataaaataaaagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacggt 30739257  T
Q  177 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttt 276  Q
    |||||||| ||||||||||    |||||||  |||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||    
T  30739256 gtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaaggggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaatgatcgttgtgattcttttaatgaaataacttt 30739157  T
Q  277 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaac 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||    || |||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |  | ||||| |||||||||||||    
T  30739156 tcaaattgactgattaagtgattataaaaattgaagatggtttgatagcatccgatttatgtccagaaaggagaattggaatctagaaaaaaactcaaac 30739057  T
Q  376 gtgta 380  Q
    |||||    
T  30739056 gtgta 30739052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 36796293 - 36796507
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  36796293 ctaacggtgtcgttttgatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 36796392  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaacta-aagtctagaaa 365  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||  |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||    
T  36796393 aaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaattaagggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaa 36796492  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  36796493 aaactcaaacgtgta 36796507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 7636247 - 7636388
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  7636247 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcttctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggcttatgggaagaaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatg 7636346  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7636347 aaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 7636388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 437
Target Start/End: Original strand, 46221550 - 46221908
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtcatttgaatttgt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||        |||||||| ||||  ||| | |||| |||||| | ||||||| ||||||    
T  46221550 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgt 46221647  T
Q  192 cacttattc-gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactga 289  Q
    || || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46221648 ca-ttcttctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactga 46221746  T
Q  290 ttaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa-ctcaaacgtgta-------a 381  Q
    |||||| ||| ||| |||| |  ||  |||||||| |    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||       |    
T  46221747 ttaagtgattctacaaattaggggtagtttgataggattcgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtatactaaagaa 46221846  T
Q  382 agaag------taacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  46221847 agaaaatgatataacatatatattttttatttaagtaggggtgggtattagatttaattttt 46221908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 302
Target Start/End: Original strand, 12251210 - 12251344
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  12251210 ctaacggtgacgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 12251309  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12251310 aatagctttccaaattgactgattaaatgattata 12251344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 41908407 - 41908106
Alignment:
Q  81 ctaagctttattaaaaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgt 178  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||        |||||||| | ||||||  | |||| |||||| | |    
T  41908407 ctaagcttcattaaaaaaatcagaatcagaaaaacttctaaacatgaaacaaaata-aaaaaaattaagtgaaaaagaggtgaaatttatctaacgatat 41908309  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| || |||||||  | ||| |||  ||||| ||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  41908308 cgtttggatctgtcactcctccgtagtgaaaaaggagaatacgagtg-tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttc 41908210  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataa-gagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacg 376  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||||| || | || ||||||||||| | || |||||| | |||| || |||||||||||||     
T  41908209 taattgactgattaagtgattgtacaaattggaggtggtttgaaagcatcagatttatgtccaaaaaatgagaaccagagtcaagaaaaaaactcaaaca 41908110  T
Q  377 tgta 380  Q
    ||||    
T  41908109 tgta 41908106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Original strand, 40841075 - 40841380
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggt-agagtttactaacgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||         ||| ||| ||| |||| | | ||| |||| ||    
T  40841075 agctaagctttattaaaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaataattgaaagataggtgaaattttcctaatgg 40841174  T
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 275  Q
    | || |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||   ||  |||| |||    
T  40841175 tctcgtttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattcttttaatagaataactt 40841274  T
Q  276 ttcaaattgactgattaagtcattataccaatt-ggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaa 374  Q
    |  ||||||| |  |||||| ||||||| |||| ||  ||| |||||||  | || ||||||||||| | |  | || || |||||||||||||||||||    
T  40841275 tataaattgattagttaagtaattatacaaattaggaggtggtttgataacatcatatttatgtccaaaaagaataattagagtctagaaaaaactcaaa 40841374  T
Q  375 cgtgta 380  Q
    | ||||    
T  40841375 catgta 40841380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Original strand, 6380013 - 6380220
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||| | |||||||||      
T  6380013 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagac 6380112  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag--aaaaaactca 372  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | || ||| |||| || | |  ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6380113 ttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagattcatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactca 6380212  T
Q  373 aacgtgta 380  Q
    ||||||||    
T  6380213 aacgtgta 6380220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 438
Target Start/End: Original strand, 8358291 - 8358500
Alignment:
Q  243 atgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccag 342  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| ||     
T  8358291 atgattgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattatataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaa 8358390  T
Q  343 ataagagaactaaagtctaga-aaaaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggag 428  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8358391 aaaggagaactaaagtctagagaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtgagggtggatattagat 8358490  T
Q  429 ttaatttttt 438  Q
    ||||||||||    
T  8358491 ttaatttttt 8358500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11672696 - 11672442
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  11672696 gttgtggaaaagagtaaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgatt 11672597  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatt--tatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa-------- 385  Q
    |||| |||| | |||| |||||||| | |  |||  ||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||   |||||||            
T  11672596 atacaaattaggagtggtttgataggatccgatttatatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaatg 11672497  T
Q  386 --gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  11672496 atataacatatatattttttatttaagtggggggtggatattagatttaattttt 11672442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Original strand, 28589978 - 28590274
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||        |||||||  ||||||||  | ||||| ||||  ||    
T  28589978 agctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaatttctaaacatgaaatgaaata--gaaaaattaagtggaagagaggtgaattttacctaacaatg 28590075  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  ||     
T  28590076 tcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggggaaaacgaatgg-ttacgcgaaaaagaaataattgttgtgattcttttaatgaaatag--tta 28590172  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
     ||| | ||| ||||||| ||||||  ||||||  ||| |||| ||| | |  |||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28590173 aaaagtaactaattaagtaattatataaattgggggtggtttggtagcatcgtatttttgtccagaaaggataactaaa-tctagaaaaaactcaaacat 28590271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 33419039 - 33419253
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  33419039 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatga 33419138  T
Q  268 aatagcttttcaaattgac-tgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |  ||  |||||||| | |  |||||||| || | |  ||||||| ||||||| |||    
T  33419139 aataacttttcaaattgacttaattaagtgattatacaaattaggggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaacaagaactagagtctagaaaa 33419238  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  33419239 aaactcaaacgtgta 33419253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 42161044 - 42161257
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || || || ||| |||||||||| | |||||    
T  42161044 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaattg-ttgctgtgattctttcaatgaa 42161142  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttg--atagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||| |  ||| ||||  |||| | | ||||||||| || | | ||||| || ||||||| |||    
T  42161143 atagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaattaggggtggtttgatataggatccaatttatgtacaaaaatgagaattagagtctagaaaa 42161242  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  42161243 aaactcaaacgtgta 42161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4100104 - 4099970
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaa-cgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagc 273  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||  || ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  4100104 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagc 4100005  T
Q  274 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4100004 ttttcaaattgattgattaagtgattatacaaatt 4099970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 373
Target Start/End: Original strand, 44876087 - 44876276
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  44876087 gtgtcgtttggatttgtcactccttcattgtggaaa--gggaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagct 44876183  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaa 373  Q
    ||  ||||||||||||||| | ||| ||  ||||||| | | |||||||||| | ||||||||| |||    |||||||| |||||| |||||||||||    
T  44876184 ttctaaattgactgattaaatgattttaaaaattggt-gcggtttgatagtatc-aatttatgtacag----gagaactagagtctaaaaaaaactcaa 44876276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 386
Target Start/End: Original strand, 3799596 - 3799898
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  3799596 agctaaacttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata--aaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtg 3799693  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||| ||||| | ||  | | |||||||||     |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||      
T  3799694 tcgtttggatttg-cgctcctccattgtgggaatttctaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttcc 3799791  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
     |||||| || ||||| | ||||||| | ||||  ||| ||||| || | ||||||||  |||||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||     
T  3799792 aaaattggcttattaaatgattatacaatttggaggtggtttga-agcatcaaattta-atccagaaaggagaactaaaatctaaaagaaacccaaacgc 3799889  T
Q  378 gtaaagaag 386  Q
    |||| ||||    
T  3799890 gtaatgaag 3799898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Original strand, 12251542 - 12251594
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  12251542 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttt 12251594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25061821 - 25061709
Alignment:
Q  380 aaagaagtaacatatatatttttt-atttaagt-gggggtggatattggagttaa-ttttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgag 476  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||   ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  25061821 aaagaagtaacatatttttttttttatttaagtagggggtggatattagacttaattttttttttaggcccataatatttggaggtccggcttggttgag 25061722  T
Q  477 catcttgcactcc 489  Q
    || ||||||||||    
T  25061721 caccttgcactcc 25061709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28105845 - 28105789
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  28105845 agctaagcttcattaagaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacgaaata 28105789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 33419273 - 33419322
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  33419273 taacatatatattttttatttaagt-ggggtggttattagatttaattttt 33419322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 380
Target Start/End: Original strand, 12251489 - 12251522
Alignment:
Q  347 gagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12251489 gagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 12251522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 416
Target Start/End: Original strand, 42161277 - 42161306
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42161277 taacatatatattttttatttaagtggggg 42161306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Original strand, 44002766 - 44002815
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 128  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  44002766 agctaagcttcattaaaaaattataatcagaagaacttctaaacatgaaa 44002815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25061949 - 25061834
Alignment:
Q  264 atgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctaga 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||  | |  |||||||| | || ||||||||||| | |  ||||||| |||||| |    
T  25061949 atgaaatagcttttcaaattaactgataaagtgattgtacaaattgagaatagtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaagaactagagtcta-a 25061851  T
Q  364 aaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||| | |||||||||    
T  25061850 aaaaattaaaacgtgta 25061834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 79 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43511849 - 43511420
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43511849 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgt 43511750  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43511749 cgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttc 43511650  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43511649 aaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 43511550  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  43511549 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtggaggtgggtattagatttaattttttctgaggcccatagcttttggaggtccggcttgattgagca 43511450  T
Q  479 tcttgcact-ccttaaagccgggcctgtct 507  Q
     |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  43511449 ccttgcactccctcaaggccgggcctgtct 43511420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Original strand, 3349562 - 3349970
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||       || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  3349562 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaactaaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgt 3349661  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3349662 gatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttc 3349761  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349762 aaattgactgattaagtcattattccaattggtagtggtttgat-gtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 3349860  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  3349861 taaagaagtaacatatgtattttttatttaagt-gaggtgggtattacaattaattttatcggaggcccatagattttggaggcctgacttgattgagca 3349959  T
Q  479 tcttgcactcc 489  Q
    |||||||||||    
T  3349960 tcttgcactcc 3349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20976216 - 20975805
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20976216 agctatgctttattaaaaaatcataatcagaagagcttttaaacattgaaccaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgt 20976117  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20976116 catttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagacgaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttc 20976017  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa--aaaactcaaacg 376  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20976016 aaattgactgattaaatgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgtcaagataagagaactaaagtctagaaaaaaaactcaaacg 20975917  T
Q  377 tgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgag 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20975916 tgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtggaggtgggtattagagttaa-tttttctgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgag 20975818  T
Q  477 catcttgcactcc 489  Q
    || ||||||||||    
T  20975817 caccttgcactcc 20975805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 489
Target Start/End: Original strand, 42291719 - 42292123
Alignment:
Q  86 ctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn--ttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcattt 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  42291719 ctttataaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgatgacattt 42291818  T
Q  184 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaatt 283  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42291819 ggatttgtcacttatccgcggtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaatt 42291918  T
Q  284 gactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaag 383  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42291919 gactgattaagtgattatacaaattggtggtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtttagaaaaaagtcaaacgtgtaaag 42292018  T
Q  384 aagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  42292019 aagtaacatatatattttttatttaagtgggcgtgagtattagagttaattttttctgaggcctatagcttttggaggcccggc-taattgagcaccttg 42292117  T
Q  484 cactcc 489  Q
    ||||||    
T  42292118 cactcc 42292123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 93 - 489
Target Start/End: Original strand, 4734428 - 4734824
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgt 191  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4734428 aaaaaattaaaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgt 4734527  T
Q  192 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 291  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  4734528 cacttatccgctgtgggaaatgggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatc 4734627  T
Q  292 aagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaaca 391  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4734628 aagggattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatgtaaagaagtaaca 4734727  T
Q  392 tatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4734728 tatatattttttatttaagt-ggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcattttgcactcc 4734824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 29156421 - 29156010
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  29156421 agctaaactttattaaaaaatcaaaatcagtagagcttctaaacatgaaacaaaatacaaaaaaattaattgaaagagaggtagaatttactaacggtat 29156322  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||     
T  29156321 cgtttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttt 29156222  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29156221 aaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagataggataactatagtctagaaaaaactcaaacgtg 29156122  T
Q  379 taaagaagtaacatatatatt-ttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagc 477  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||| || ||||||||||| |||| | |||  ||||||||| || | ||||||||||    
T  29156121 taaagaagtaacatatatatttttttatttaaatagaggtgggtattagatttaattttttctgaggtccataacttttggaggtccggtttgattgagc 29156022  T
Q  478 atcttgcactcc 489  Q
    ||||||||||||    
T  29156021 atcttgcactcc 29156010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Original strand, 10591109 - 10591513
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  10591109 taagctttattaaaaaatcagaatcagaatagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgccgt 10591208  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| |||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10591209 ttggattgattacttatccgttgtgggaaaggggataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaa 10591308  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591309 ttaactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccatatttatgttcagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 10591408  T
Q  382 agaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatct 481  Q
    | ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||  | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10591409 aaaaagaac--atatattttttatttaaatgggggtgggtattagagttga-tttttctaaagcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacct 10591505  T
Q  482 tgcactcc 489  Q
    ||||||||    
T  10591506 tgcactcc 10591513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 438
Target Start/End: Original strand, 17513772 - 17514139
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||| ||||   || |    
T  17513772 taagctttattaaaaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgacctcgt 17513871  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  17513872 ttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaa 17513971  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17513972 ttgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgttagtaccagatttatatccagataggagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaa 17514071  T
Q  382 agaagtaac-----------atatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  17514072 agaagtaacattttttttttatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaatttttt 17514139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5829612 - 5829214
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5829612 agctaaactttattaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacat--aatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagagtttactaacagtgt 5829515  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||      
T  5829514 cgtttggatttgtcacctatccgttgtaggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt-- 5829417  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||    || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  5829416 aaattgactgattaagtgattatacaaattgaggttggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctataaaaaactcaaacgt- 5829318  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
           |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||| |   ||| ||||||||    
T  5829317 -------gtaacatacatattttttatttaaatgggggtgggtattaaggttaattttttctgagacccataatttttagaggtctgacttaattgagca 5829225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40956454 - 40956245
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  40956454 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaa 40956355  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg-tagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||  | || |||||| | | || ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  40956354 atagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattggagaatg-tttgattgcatcagatttatgtccacaaaggagaactagagtctagaaaaa 40956256  T
Q  368 actcaaacgtg 378  Q
    |||||||||||    
T  40956255 actcaaacgtg 40956245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 138246 - 138075
Alignment:
Q  208 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  138246 gaaaggggaaaacgaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaat 138147  T
Q  308 tggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataag-agaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    || | ||| |||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  138146 tgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcc-gaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgt 138075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27351580 - 27351282
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||        |||||||| ||||||||  | ||||| |||  |||    
T  27351580 agctaaacttcattaaaaaattcgaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaaata-aaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatagtg 27351482  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||  ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| | |||||||| ||||     
T  27351481 tcgtttagatttgtcactcctccgttgtgggaaagaagaaaatgactggtttatgcaaaaaagaaatgatttaggttattctttcaatgaaataactttc 27351382  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27351381 caaattgactgattaagtggttatacaaattggaggtggtttgatagcaccaaatttatgttcagaaaggagaactagagtctagaaaaatctcaaacgt 27351282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 303
Target Start/End: Original strand, 7390234 - 7390457
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||| |||||||||    
T  7390234 agctaagcttcattaaaaaatcggaatcagaagaacttttaaacataaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtg 7390333  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||||||  ||||||| |  || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  7390334 tcgtttgaat--gtcacttctatgtcgcaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataactttt 7390431  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattatac 303  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  7390432 taaattgactgattaagtgattatac 7390457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13474772 - 13474559
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  13474772 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 13474673  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| ||| ||| ||||    
T  13474672 aacaacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtttagaaaaa 13474573  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  13474572 aactcaaacgtgta 13474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17326065 - 17325777
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        | |||||| ||| ||||  | ||||| |||||||||| |||| | |    
T  17326065 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaataaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat 17325966  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag-cttttcaaattgact 287  Q
     ||||||  | ||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  17325965 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaagcgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgact 17325867  T
Q  288 gattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||||||| ||||| | ||| | | ||  ||| |||| | |||||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  17325866 gattaagtgattattcaaatcgatggtagtttaatagcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtctaaaaaaaactcatacgt 17325777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13656352 - 13656024
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  13656352 ctaacggtgtcgtttgaatttgacactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 13656253  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt---ggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa 364  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | | ||  |||  ||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||    
T  13656252 aataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggatggtttttttttaggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa 13656153  T
Q  365 aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt--tcggaggccaat 449  Q
    ||||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||  |  ||||||       
T  13656152 aaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggaggtggttattagatttaatttttcgttagaggcccga 13656053  T
Q  450 agtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13656052 agtatttggaggcccagcctgattgagca 13656024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 931484 - 931300
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |     |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  931484 gttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactgattaagtgatta 931390  T
Q  301 taccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-----aaaaaactcaaacgtgtaaagaa 385  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| | ||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||| |||||||||    
T  931389 tacaaattgggtgtgatttaatagcatcaaatttatatatagaaaagagaactatagtctagaagaaaaaaaactcaaacatgtaaagaa 931300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33281894 - 33281681
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatt 188  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        | |||||| ||||||||  | |||||| |||| |||| ||||||||    
T  33281894 attaaaagatcataatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaatataaaaaaat-aagtgaaagagaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatt 33281796  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 288  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||     
T  33281795 tgtcactcatccgttgtgggaaaaggaaaagcaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgacta 33281696  T
Q  289 attaagtcattatac 303  Q
    ||||||| |||||||    
T  33281695 attaagtgattatac 33281681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 368
Target Start/End: Original strand, 19099236 - 19099436
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||| ||  |  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19099236 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacttctcggttgtggaaagtgataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19099335  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |   || |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||||| |||||    
T  19099336 aatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaattagggatggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactatagtctaaaaaaa 19099435  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  19099436 a 19099436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 26377695 - 26377910
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  26377695 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcagttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 26377794  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag--aa 364  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||  ||    
T  26377795 aaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 26377894  T
Q  365 aaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||||    
T  26377895 aaaactcaaacgtgta 26377910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13423973 - 13423806
Alignment:
Q  202 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 300  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  13423973 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgattaagtgatta 13423874  T
Q  301 taccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    ||| |||| | | || |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||    
T  13423873 tacaaattaggaatggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctaaaaaaaa 13423806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18873680 - 18873459
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 188  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | ||||| ||||||| || |||| | |    
T  18873680 attaaaaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaagttaagtgaaagaaaggtgaaatttacctaacggtttcgtttggaat 18873581  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaat---ggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattga 285  Q
     ||||||  | ||| || ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  18873580 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaataatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgg 18873482  T
Q  286 ctgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||  |||||| ||||    
T  18873481 ctgattaagtggttatacaaatt 18873459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10033770 - 10033489
Alignment:
Q  91 ttaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaa-----tacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||        |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||| || ||||    
T  10033770 ttaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtttcgtttg 10033671  T
Q  185 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 284  Q
     | | ||||||  | ||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  10033670 gaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattg 10033573  T
Q  285 ac-tgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    || | | | ||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  10033572 actttaatcagtgattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtacagaaagtagaactagagtctagaaaaa 10033489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12661451 - 12661311
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||  ||||||||||||||| | ||||    
T  12661451 ctaacagtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatga 12661352  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  12661351 aatagctttccaaattgactggttaagtgattatacaaatt 12661311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40779298 - 40779127
Alignment:
Q  202 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||    
T  40779298 ttgtgggaaagg--aaaacgaatggtttatacgaaaaaagaaatgattgttgtgattcctca-atggaatagtttttcaaattgacttattaaacgatta 40779202  T
Q  301 taccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 375  Q
    ||| ||||||   |  |||||||  | ||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40779201 tacaaattggggatagtttgataacatcaaatttatgttcagaaaggagaactagactctagaaaaaactcaaac 40779127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Original strand, 8379282 - 8379453
Alignment:
Q  85 gctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcattt 183  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |        |||||||| ||||||||  | |||||  ||||||||| |||    
T  8379282 gcttcattaaaaaataagtatcagaagatcttctaaacatgaaacgaaaaa-aaaaatattaagtgaaagagaggtgaaatttacgcaacggtgtcgttt 8379380  T
Q  184 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgatt 257  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  8379381 ggatttgtcactcatccgttgtgggaa-ggggaaaacgaatggattatgcgaaaaagaaattattgttgtgatt 8379453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16515600 - 16515454
Alignment:
Q  234 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||   ||||| | ||| ||| |||| | ||||||    
T  16515600 aaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattattaaaattgatggtgttttaatagcatcaaatt 16515501  T
Q  334 tatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  16515500 tatgtctagaaagtagaactaaagtttaaaaaaagctcatacgtgta 16515454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4177428 - 4177375
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4177428 taagcttcattaaaaaatcataatcagaagaacttctaaacatgaaacaaaata 4177375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13288674 - 13288618
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13288674 agctaagtttcattaaaaaatcataatcagaagaacatttaaacatgaaacaaaata 13288618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 36718535 - 36718689
Alignment:
Q  216 aaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtag 313  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| |||| || |||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| |  |    
T  36718535 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaattagggg 36718634  T
Q  314 tgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    || |||||||| | |  ||| |||| || | | |||||||| |||||||||||||    
T  36718635 tggtttgataggatccgattcatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 36718689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23069266 - 23069144
Alignment:
Q  264 atgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctaga 363  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||| ||| | || |||||||| |||| | ||||| || ||| || |    
T  23069266 atgaaatagctttccaaatcgaatgattaagggattatacaaattgggggtggtttgctagcatcatatttatgttcagaaaggagaattagagtataaa 23069167  T
Q  364 aaaaactcaaacgtgtaaagaag 386  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  23069166 aaaaacacaaacgtgtaacgaag 23069144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 380
Target Start/End: Original strand, 8379539 - 8379655
Alignment:
Q  264 atgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctaga 363  Q
    |||||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||  | || ||||||||||| | | |||||  | ||||||||    
T  8379539 atgaaataactttcgaaattaattgattaagtaattatacaaattaggggtgatttgataacatcatatttatgtccataaatgagaatgagagtctaga 8379638  T
Q  364 aaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8379639 aaaaactcaaatgtgta 8379655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12661213 - 12661161
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  12661213 taacatatatattttttatttaagtggagggtagatattagatttaatttttt 12661161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13424081 - 13424046
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13424081 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaa 13424046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16515736 - 16515682
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaa 133  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16515736 agctaagcttcatgaaaaagtcagaatgagaagaactttaaaacatgaaacaaaa 16515682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 416
Target Start/End: Original strand, 26377930 - 26377959
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377930 taacatatatattttttatttaagtggggg 26377959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Original strand, 37029051 - 37029096
Alignment:
Q  265 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 310  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  37029051 tgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 37029096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 415
Target Start/End: Original strand, 36718723 - 36718751
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36718723 taacatatatattttttatttaagtgggg 36718751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Original strand, 1092874 - 1093283
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1092874 agctaagctttattaaaaaattagaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgt 1092973  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  1092974 catttggatttgtcacttatccgttttgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttc-atgaaatagcttttt 1093072  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1093073 aaattgactgatttagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatg 1093172  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  1093173 caaagaagtaacatatatagtttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttcggaggcccataaattttgaaggcccgacttaattgagca 1093272  T
Q  479 tcttgcactcc 489  Q
     ||||||||||    
T  1093273 ccttgcactcc 1093283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Original strand, 29308303 - 29308710
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308303 taagctttattaaaaaatcagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcat 29308402  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  29308403 ttagatttatcacttatccattgtgggaaaggggaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaa 29308502  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29308503 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagatagaaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacgtgtaa 29308602  T
Q  382 agaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatct 481  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||  |||||||||||| ||    
T  29308603 agaagtaccatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttcggaagcctataacttctggaggcccgacttgattgagcacct 29308702  T
Q  482 tgcactcc 489  Q
    ||||||||    
T  29308703 tgcactcc 29308710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 235 - 489
Target Start/End: Original strand, 1690622 - 1690877
Alignment:
Q  235 aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaattt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  1690622 aaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattt 1690721  T
Q  335 atgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaa-t 433  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |    
T  1690722 atgtccaaataggagaactaaaatttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatattttatttaagtggaggtgggtattagagttaatt 1690821  T
Q  434 tttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1690822 tttttctgaggcccatagcttttggaggctcggcttgattgagcatcttgcactcc 1690877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31861214 - 31860826
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatc-agaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtca 180  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||       |||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||      
T  31861214 taagctttattaaaaaaaatagaattagaagagcttctaaacataaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagagatagaatttactaacgacgttg 31861116  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||               |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31861115 tttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggttt---------------gattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 31861031  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31861030 attgactgattaagtaattatacaaattggg-gtggtttgata-taccagatttatgtccagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgta 31860933  T
Q  381 aagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcgg--aggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||     ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||    
T  31860932 aagaagtaacatatatattttttatttaggtgggggtgggtattagagttaatttttttttttaggcccatagcttttcgaggtccggcttgattgagca 31860833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 368
Target Start/End: Original strand, 30915197 - 30915488
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||     
T  30915197 taagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttataaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagagataaaatttacataacggtgtcg 30915296  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaa-----gaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 275  Q
    |||||| | ||||||| | ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||  |||||     ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  30915297 tttgaaat-gtcacttctacgtcgtaagaaaggggataatgaatggtttatgcgaaaaattaaagaaatgattgttgtgattctttcaattaaatagctt 30915395  T
Q  276 ttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  30915396 ttcaaattgactgattaagtaattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaa 30915488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2618495 - 2618285
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2618495 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaa 2618396  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2618395 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactaaagtctagaaaaaac 2618296  T
Q  370 tcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||    
T  2618295 tcaaacgtgta 2618285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6360901 - 6360620
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat-gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  6360901 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg- 6360803  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  6360802 aataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtggtttgataggatccgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctagaaaaa 6360703  T
Q  368 actcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaatttt 436  Q
    |||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6360702 actcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggtggatattagatttaatttt 6360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 341
Target Start/End: Original strand, 3748401 - 3748663
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |        |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  3748401 agctaagcttcattaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaatatgaaataaaacaaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggtg 3748500  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    ||||||| | | ||||||  | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3748501 tcatttggaat-gtcactcctacgtcgcatgaaaggggaaaacgaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttt 3748599  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | | |||||||| | ||||||||||||||    
T  3748600 caaattgattgattaagtgattatacaaattgatggcggtttgatagcatcaaatttatgtcca 3748663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6754346 - 6754140
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6754346 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 6754247  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |   || |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||    
T  6754246 tagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaattagggatggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagaatctagaaaaaac 6754147  T
Q  370 tcaaacg 376  Q
    |||||||    
T  6754146 tcaaacg 6754140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Original strand, 12614670 - 12614850
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12614670 gttgtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 12614769  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12614770 atacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 12614850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6294487 - 6294279
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacgg 175  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        ||| |||| ||||||||  | ||||| ||||||    
T  6294487 agctaagcttcattaaaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattatgtgaaagagaggtgaaatttacctaacgg 6294388  T
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctt 275  Q
    |||| |||| | | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6294387 tgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgctt 6294289  T
Q  276 ttcaaattga 285  Q
    ||||||||||    
T  6294288 ttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 628018 - 628157
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  628018 ctaacgatgtcgtttggatttatcacttctctgttgtggaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 628116  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  628117 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 628157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29149544 - 29149345
Alignment:
Q  170 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  29149544 taacggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 29149445  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
     || |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||||    
T  29149444 ctaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggtgtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 29149345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19231741 - 19231544
Alignment:
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||| |||| |||||| | | ||||||||||   ||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||    
T  19231741 tttggatttatcacttctccattgtgggaaaattgaaaaagaatagtttatacgaaaaagaaatgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaa 19231642  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    ||||| ||||||||| || |||| |||||   ||  |||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19231641 attgattgattaagtgat-atacaaattgaaggtagtttgatagcaccagatttatgtccagaaagtagaactaaactctagaaaaaactcaaacgtgt 19231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 57830 - 57617
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  57830 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatga 57731  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtct-agaaaa 366  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| ||| | | ||||    
T  57730 aatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtttaaaaaaa 57631  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  57630 aactcaaacgtgta 57617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21946317 - 21946109
Alignment:
Q  97 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgtcact 195  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |        |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  21946317 aatcagaatcagaataacttttaaatatgaaacaaaaca-aaataaattaagtgaaagagaggtggaatttacctaacggtgtcgtttgaat--gtcact 21946221  T
Q  196 tattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 295  Q
      | ||| || |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21946220 cttacgt-gtaggaaagaggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagt 21946122  T
Q  296 cattataccaatt 308  Q
     ||||||| ||||    
T  21946121 gattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29401277 - 29401142
Alignment:
Q  174 ggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |  || |||| |||||| || ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  29401277 ggtgtcatttggatttgtcactcctctgtcgtggaaaagggtaagacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataa 29401178  T
Q  273 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29401177 cttttcaaattgactgattaagtgattatactaatt 29401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22503885 - 22503751
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat-gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||   || ||| ||||||||||| | |||||| | | ||    
T  22503885 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacga 22503786  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22503785 aatagtttttcaaattgactgattaagtgattata 22503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Original strand, 3514804 - 3514985
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||| || |||    
T  3514804 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgatt 3514903  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3514904 atacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtttagaaaaaaactcaaacgtgta 3514985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11088655 - 11088564
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgatta 292  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11088655 gttgtggtaaaggggaaa-caaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta 11088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 7525089 - 7525301
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  7525089 ctaacggtgtc-tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataa 7525187  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||||||| | |  |||||||| || |   |||||||| ||||||| ||||    
T  7525188 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaatggagaactagagtctagaaaaa 7525287  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  7525288 aactcaaacgtgta 7525301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 350524 - 350383
Alignment:
Q  200 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctat-gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 298  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  350524 cgttatgggaaaagggaaa-caaattgtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgat 350426  T
Q  299 tataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 341  Q
    ||||  ||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||    
T  350425 tatataaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtcca 350383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 308
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893479
Alignment:
Q  241 aaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 14893479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 1690550 - 1690607
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatac 136  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1690550 agctaaactttataaaaaaatcagaatcagaaaagcttctaaacatgaaacgaaatac 1690607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31234956 - 31234911
Alignment:
Q  265 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31234956 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 31234911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11088802 - 11088746
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11088802 agctaaacttcattaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaata 11088746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2618265 - 2618214
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  2618265 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 2618214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 128
Target Start/End: Original strand, 3514698 - 3514733
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3514698 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaa 3514733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24455129 - 24455078
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  24455129 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 24455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29401047 - 29400998
Alignment:
Q  389 acatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  29401047 acatatatattttttatttaagtggaggtgggtattatatttaatttttt 29400998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 57597 - 57545
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggg-gtggatattggagttaatttttt 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  57597 taacatatatatcttttatttaagtggggagtgggtattagacttaatttttt 57545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 489
Target Start/End: Original strand, 5877017 - 5877084
Alignment:
Q  421 tattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  5877017 tattagagttaattttt-ctgaggcccatagctcttggaggcccgacttgattgagcaccttgcactcc 5877084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6754116 - 6754088
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754116 taacatatatattttttatttaagtgggg 6754088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 55134440 - 55134032
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55134440 agctaagctttattaaaaaatcaggatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgt 55134341  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaa-gaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55134340 catttggatttattacttatccgttgcgggaaaagggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagctttt 55134241  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55134240 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctacaaaaaactcaaacgt 55134141  T
Q  378 gtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagc 477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |  |||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  55134140 gtaaagaagtaatatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagtaaattttttcgaagacacatagcttttgaaggcccggcttgtttgagc 55134041  T
Q  478 atcttgcac 486  Q
    | |||||||    
T  55134040 accttgcac 55134032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 102 - 489
Target Start/End: Original strand, 45172502 - 45172887
Alignment:
Q  102 gaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||       | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45172502 gaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaat-aagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccg 45172600  T
Q  202 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45172601 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 45172700  T
Q  302 accaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatttt 401  Q
    || |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45172701 acaaattag-ggtggtttgatagtaccagatttatgtccagattggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatttt 45172799  T
Q  402 ttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||  ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  45172800 ttatttaagtgggggtggatattagatttaattttttttgaggcacataacttttgtaggtccggcttgattgagcaccttgcactcc 45172887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 34982452 - 34982045
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||       |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  34982452 taagctttattaaaaa-tcagaatcagaagaaattctaaacataaaacgaaatacaaaaaaattaagtaaaagagaggtagaatttactaacggggtcgt 34982354  T
Q  182 ttga-atttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |    
T  34982353 ttgagatttgtcatttatctgttgtgggaaaggggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttcca 34982254  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||   || |||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34982253 attgactgattaagtgattatacaaattggggatggtttgttagtaccagatttatgtccagatagaaaaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 34982154  T
Q  381 aagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  34982153 aagaagtaacatatatattttttatttaagtaggggtgggtattagatttaattttttctgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaca 34982054  T
Q  481 ttgcactcc 489  Q
    |||||||||    
T  34982053 ttgcactcc 34982045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 380
Target Start/End: Original strand, 35653816 - 35654114
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtca 180  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  35653816 taagcttcattaaaaagtccgaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtca 35653915  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||||| | ||||||  | ||| || |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35653916 tttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 35654014  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35654015 attgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 35654114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 169 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5545470 - 5545261
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   |||||    
T  5545470 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtgagaagggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaa 5545371  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||    
T  5545370 atagctttccaaattgaccgattaagtgattatacaaattggtggtggtttgatggcatcaaatttatgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaa 5545271  T
Q  369 ctcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||    
T  5545270 ctcaaacgtg 5545261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 380
Target Start/End: Original strand, 21791490 - 21791681
Alignment:
Q  188 ttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 287  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21791490 ttgtcactcattcgtcgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgact 21791588  T
Q  288 gattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||| |||||||  ||||   ||| |||||| | | ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21791589 gattaagtgattatacacattgaaggtggtttgatggcatcaaatttatgttcagaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacatgta 21791681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19661521 - 19661309
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  19661521 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatga 19661422  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||||||    
T  19661421 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaa 19661322  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  19661321 actcaaacgtgta 19661309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 376
Target Start/End: Original strand, 32130718 - 32130920
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagc 273  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  32130718 gtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagt 32130817  T
Q  274 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |  |||||||  |||||||||||||||||    
T  32130818 ttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagtgtctagaaaaaactcaa 32130917  T
Q  374 acg 376  Q
    |||    
T  32130918 acg 32130920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 53011854 - 53011642
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  53011854 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatga 53011755  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | ||||| || ||| ||||||||    
T  53011754 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaattagagtttagaaaaa 53011655  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  53011654 actcaaacgtgta 53011642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 379
Target Start/End: Original strand, 43154754 - 43154921
Alignment:
Q  212 ggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggt 311  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  43154754 ggggaaaacgaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgat 43154853  T
Q  312 agtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  43154854 ggtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaagtagaactagaatctagaaaaaactcatacgtgt 43154921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 377
Target Start/End: Original strand, 23426120 - 23426298
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23426120 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgatt 23426219  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23426220 atacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgt 23426298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41038392 - 41038236
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  41038392 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 41038293  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatag 324  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  41038292 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgatag 41038236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22423780 - 22423614
Alignment:
Q  216 aaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtag 313  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| | |    
T  22423780 aaaacgaatgatttatgtggaaaaaataaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatgg 22423681  T
Q  314 tgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22423680 tggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 22423614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23256731 - 23256524
Alignment:
Q  173 cggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23256731 cggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatag 23256632  T
Q  273 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||  |||||| ||||||||||    
T  23256631 ctttctaaattgactgattaagtggttatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactggagtctaaaaaaaactca 23256532  T
Q  373 aacgtgta 380  Q
    || |||||    
T  23256531 aatgtgta 23256524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 504
Target Start/End: Original strand, 28463510 - 28463864
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  28463510 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctattgtggaaaagggcaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatga 28463609  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||  | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||||||    
T  28463610 aatagcttttcaacttgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 28463709  T
Q  368 a-ctcaaacgtgta-------aagaag------taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt--tcggaggccaata 450  Q
    | ||||||||| ||       |||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||  |  ||||||  ||    
T  28463710 aactcaaacgtttactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgta 28463809  T
Q  451 gtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgcactcctt-aaagccgggcctg 504  Q
    |  |||||||| || || ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  28463810 gcatttggaggtccggcctgattgaacaccttgcacaccttcaaagccgggcctg 28463864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27632540 - 27632327
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| | ||||    
T  27632540 ctaacggtgttgtttggatttgtcactactctgttgtggaaaagggtaaagcgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatga 27632441  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aa 366  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| || | | |||||||| | ||||||| ||    
T  27632440 agtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagaactagaatctagaaaaa 27632341  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  27632340 aactcaaacgtgta 27632327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 303
Target Start/End: Original strand, 10575481 - 10575580
Alignment:
Q  204 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  10575481 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattgactgattaagtgattatac 10575580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24449200 - 24449054
Alignment:
Q  236 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg--gtagtgatttgatagtaccaaatt 333  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||| |||||||| | ||||||    
T  24449200 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 24449101  T
Q  334 tatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24449100 tatatccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 24449054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44478182 - 44478041
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  44478182 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 44478083  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  44478082 aaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaatt 44478041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29580022 - 29579823
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  |||    
T  29580022 ctaacggtatcatttggatttgtcactactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattga 29579923  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    ||| |||||||| | || |||||||| || | || ||||||| ||||||||||||    
T  29579922 aatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaatagaactagagtctagaaaaa 29579823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 11681664 - 11681878
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  11681664 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11681763  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataa-gagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |||||||| | |  ||||||||  | | || |||||||| ||||||| |||    
T  11681764 aataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaa 11681863  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  11681864 aaactcaaacgtgta 11681878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 11689943 - 11690157
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  11689943 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11690042  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataa-gagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |||||||| | |  ||||||||  | | || |||||||| ||||||| |||    
T  11690043 aataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaa 11690142  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  11690143 aaactcaaacgtgta 11690157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 378
Target Start/End: Original strand, 29221545 - 29221754
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  29221545 aacggtgtcgtttaaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaa 29221644  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaa 368  Q
    |||  || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| | || |||||||| || | | ||||| || ||||||| ||||||    
T  29221645 tagacttccaaattgaccgtttaagtgattatacaaattaagagtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaacgagaattagagtctagaaaaaaa 29221744  T
Q  369 ctcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||    
T  29221745 ctcaaacgtg 29221754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24449328 - 24449222
Alignment:
Q  81 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24449328 ctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtc 24449229  T
Q  180 atttgaa 186  Q
    |||||||    
T  24449228 atttgaa 24449222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16072740 - 16072523
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctat-- 265  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |  ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| || |      
T  16072740 ctaacgatgtcatttgggtttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttctttca 16072641  T
Q  266 --gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag- 362  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |   || |||||||| | ||||||||||| || | | |||| ||| ||  |||     
T  16072640 ttgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattagggatggtttgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagatctagagcttaga 16072541  T
Q  363 aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16072540 aaaaaactcaaacgtgta 16072523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 380
Target Start/End: Original strand, 26328961 - 26329164
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagc 273  Q
    ||||| ||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  |||    
T  26328961 gtgtcgtttgaatttatcattcctccgttgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatccaaaaaataaatgatcgttgtgattctttttattgaagcagc 26329059  T
Q  274 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaa 373  Q
    |||  ||||||||||||| | | ||||||  ||||||  ||| |||| ||| | || ||||||||||  | | ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  26329060 tttctaaattgactgattgaatgattatataaattggaggtggtttggtagcatcagatttatgtcc--aaaggagaattacagtctagaaaaaattcaa 26329157  T
Q  374 acgtgta 380  Q
    |||||||    
T  26329158 acgtgta 26329164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 271
Target Start/End: Original strand, 51066347 - 51066449
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  51066347 ctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 51066444  T
Q  267 aaata 271  Q
    |||||    
T  51066445 aaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 39372816 - 39372867
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  39372816 taacatatatattttttatttaagtggcgggtggatattagatttaattttt 39372867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9925328 - 9925295
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9925328 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 9925295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 32130944 - 32130995
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  32130944 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 32130995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21169088 - 21168986
Alignment:
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgt 377  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| |||| |  |||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21169088 aaattgactcattaattgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgt 21168989  T
Q  378 gta 380  Q
    |||    
T  21168988 gta 21168986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19661289 - 19661260
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661289 taacatatatattttttatttaagtggggg 19661260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Original strand, 34523787 - 34524194
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||  | ||||||||| |||| |||||||||    
T  34523787 agctaagctttattaaaa-atcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtg--aaagaggtagaatttaataacggtgt 34523883  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34523884 cgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttc 34523983  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34523984 aaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 34524083  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  34524084 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaattttttctgaggcccgtagcttttggaggtccggcttgattgagca 34524183  T
Q  479 tcttgcactcc 489  Q
     ||||||||||    
T  34524184 ccttgcactcc 34524194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 437
Target Start/End: Original strand, 39697776 - 39698129
Alignment:
Q  84 agctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcattt 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||        ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39697776 agctatattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcattt 39697875  T
Q  184 gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaatt 283  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39697876 ggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggcgaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaatt 39697975  T
Q  284 gactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaag 383  Q
    |||| ||||| | || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39697976 gactaattaaatgatcatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgccaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaag 39698075  T
Q  384 aagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  39698076 aagtaacatatatattttttatttaagtggaggtgggtattaaagttaattttt 39698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 12531790 - 12531407
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  12531790 agctaagctttattaaaaaatcagaataagaagagcttctaaacatgaaacgaaatataaaaaaattaagtgaaagagaggtataatttactaacggcgt 12531691  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  12531690 cgtttgaatttgtcatttatccgttgtgggaaaggggaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttt 12531591  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12531590 aaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtagtttgatagtacaagatttatgttcggataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 12531491  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggccc 464  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||| |||| | |||| ||||||||||||    
T  12531490 taaagaagtaacatatctattttttatttaagt-ggggtgggtattagagttga-tttttctgaggtccatagcttttggaggccc 12531407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Original strand, 23567117 - 23567465
Alignment:
Q  85 gctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttg 184  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23567117 gctttattaaaaaaatagaat---aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagtggtagaatttactaacggcgtcgtttg 23567212  T
Q  185 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 284  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||    
T  23567213 gatttgtcatttatccgttgtgggaaaaggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattg 23567312  T
Q  285 actgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaaga 384  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23567313 actgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtagcagatttatgttcagataagagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaaaa 23567412  T
Q  385 agtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||    
T  23567413 agtaccatatatattttttatttaagt-ggagtgggtatcagagttaatttttt 23567465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 489
Target Start/End: Original strand, 32098012 - 32098437
Alignment:
Q  81 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtc 179  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  32098012 ctaagcatcattaaaaaatcgaaatcagatgaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacgtaacggtgtc 32098111  T
Q  180 atttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 279  Q
     |||| ||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  32098112 gtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttcca 32098211  T
Q  280 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||   |||| |||||||| | |||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32098212 aattgactgattaagtgatcatacaaattaagagtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaaggataactagagtctagaaaaaactcaaacgtgt 32098311  T
Q  380 -------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaa--ttttttcggaggccaatagtttttggaggcc 463  Q
                 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||  ||||| | |||||||||||| |    
T  32098312 actgaagaaagaaaaagaagtaacatatatattttttaattaagtggggggtgggtattagacttaattttttttctcaggcctagagtttttggaggac 32098411  T
Q  464 cagcttgattgagcatcttgcactcc 489  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  32098412 cggcttggttgagcaccttgcactcc 32098437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 380
Target Start/End: Original strand, 5869253 - 5869454
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5869253 gtgtcgtttgaatttgtcactccttcattgtgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 5869350  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| || ||| |||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||     
T  5869351 tttcaaattgactgattaagtgattttaaaaatt-gtggtggtttgatagtatc-aatttatgtacagaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaat 5869448  T
Q  375 cgtgta 380  Q
    ||||||    
T  5869449 cgtgta 5869454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 380
Target Start/End: Original strand, 3628598 - 3628881
Alignment:
Q  97 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgtcact 195  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||| |||| | | ||||||    
T  3628598 aatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaagaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaactgtgtcgtttggaat-gtcact 3628696  T
Q  196 tattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 295  Q
      | ||| || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3628697 cctacgtcgtaggaaacggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatgt 3628796  T
Q  296 cattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     ||||||| ||||  | ||| |||||||| | |||||||||| |||||    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3628797 gattatacaaattaatggtggtttgatagcatcaaatttatgaccagaatgtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 3628881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7858227 - 7858014
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  7858227 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttaaatga 7858128  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aa 366  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||    
T  7858127 attaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgttcaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 7858028  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  7858027 aactcaaacgtgta 7858014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Original strand, 43967999 - 43968205
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  43967999 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataact 43968098  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaa 373  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43968099 tttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaa 43968198  T
Q  374 acgtgta 380  Q
    |||||||    
T  43968199 acgtgta 43968205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13585409 - 13585228
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  13585409 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaattgatt 13585310  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13585309 atacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 13585228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 18420531 - 18420744
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  18420531 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 18420630  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||| | ||||    
T  18420631 aacagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagtgtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctggaaaaa 18420730  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  18420731 aactcaaacgtgta 18420744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35875000 - 35874854
Alignment:
Q  236 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg--gtagtgatttgatagtaccaaatt 333  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||| |||||||| | ||||||    
T  35875000 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 35874901  T
Q  334 tatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35874900 tatatccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 35874854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Original strand, 43926246 - 43926385
Alignment:
Q  170 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| ||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  43926246 taacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 43926345  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43926346 atagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 43926385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3471710 - 3471545
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3471710 gttgtggaaaagggtaaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 3471611  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaa 365  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| | ||||||||    
T  3471610 atacaaattaggggtggtttgatagaatcacatttatgtacaaaaatgagaactagattctagaaa 3471545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18112259 - 18112061
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||     
T  18112259 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaata 18112160  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaa 365  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||  | |  |||||||| || | |||||||||| | ||||||||    
T  18112159 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgatatgatccgatttatgtacataaaagagaactagattctagaaa 18112061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 381
Target Start/End: Original strand, 44665000 - 44665183
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||     
T  44665000 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatg 44665099  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtc--tagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  44665100 atacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctataaaaaaaactcaaacgtgtaa 44665183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 368
Target Start/End: Original strand, 30915214 - 30915410
Alignment:
Q  172 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaat 270  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || |  |||||||||| ||||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  30915214 acggtgttatttggatttatcatttctctgttgtgggaatggggaaa-caaattatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaat 30915312  T
Q  271 agcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  | | |||| ||| | || || |||||||||| | ||||| || |||||| ||||||    
T  30915313 agcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattggaggaggtttggtagcatcagatctatgtccagaaaggagaattagagtctaaaaaaaa 30915410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33452901 - 33452728
Alignment:
Q  200 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 298  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  33452901 cgttgtgggaaaggggaaa-caaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgat 33452803  T
Q  299 tataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 375  Q
    ||||  ||||||  ||| |||||||  |  | ||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33452802 tatataaattggaggtggtttgataccataagatttatgtcc--aaaagagaattagagtctagaaaaaactcaaac 33452728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35875128 - 35875022
Alignment:
Q  81 ctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  35875128 ctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtc 35875029  T
Q  180 atttgaa 186  Q
    |||||||    
T  35875028 atttgaa 35875022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1004170 - 1004060
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaa--aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt-caaattgactgattaagtca 297  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |    
T  1004170 gttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgattaagtga 1004071  T
Q  298 ttataccaatt 308  Q
    |||||| ||||    
T  1004070 ttatacaaatt 1004060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29372463 - 29372294
Alignment:
Q  204 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 303  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| | ||  |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  29372463 gtggcaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatac 29372364  T
Q  304 caattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     |||||   ||  |||||||| |       |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29372363 aaattgtgggtagtttgatagca-------tatgtccagaaaggaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacatgta 29372294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42076337 - 42076109
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtca 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||    
T  42076337 taagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtca 42076238  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttat--gtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    |||| |  |||||||  | | | || | |||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||| ||| || |||||||| | |||  ||||||||||    
T  42076237 tttgga-atgtcactcctac-tcgtagaaaaggggaaaacgaatagtttatgcggaaaaaaataattattattatgattctttcaatgttatagcttttc 42076140  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattg 309  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  42076139 aaattgattgattaagttattatacaaattg 42076109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 380
Target Start/End: Original strand, 42951727 - 42951908
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtg----attcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||    |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42951727 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatac 42951826  T
Q  304 caattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-----aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     |||| | |||| |||||||| |    |||||||| || | | |||||||| |||||||     ||||||||||||||||||    
T  42951827 aaattaggagtggtttgataggattcgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaagaaaaaaaactcaaacgtgta 42951908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Original strand, 36514999 - 36515202
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtgtcatttgaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        |||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| |||| |      
T  36514999 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagagctgaaatttatctaacggtgtcgtttgga-a 36515097  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 287  Q
    |||||||  | ||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||    
T  36515098 tgtcactcctacgtcgtaggaaatgggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaact 36515197  T
Q  288 gatta 292  Q
    |||||    
T  36515198 gatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27074684 - 27074546
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  27074684 gttgtggaaaaaggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgattaagtgatt 27074585  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgt 338  Q
    |||| |||| |  ||| |||||||| | || ||||||||    
T  27074584 atacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgt 27074546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42777911 - 42777763
Alignment:
Q  145 taagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa 243  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||  ||||  |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||   |||| |||    
T  42777911 taagtgaaagagaggtgaaatttactgaacggtgtggtttggttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaacgaatggtatatgcggaaaaaaaa 42777812  T
Q  244 tgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 292  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  42777811 tgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattgactaatta 42777763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3445591 - 3445544
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaatt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  3445591 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaatt 3445544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 438
Target Start/End: Original strand, 41666088 - 41666142
Alignment:
Q  383 gaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaatttttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41666088 gaagtaacatatatattttttatttaagtggggttgg-tattagacttaatttttt 41666142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Original strand, 3575117 - 3575175
Alignment:
Q  223 atggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3575117 atggtttatgcaaaaatgaaatgatttaggtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 3575175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 295
Target Start/End: Original strand, 5971742 - 5971805
Alignment:
Q  228 ttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 295  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5971742 ttatgcaaaagagaactgattgttgtgattctt----taaaatagctttttaaattgactgattaagt 5971805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1003998 - 1003969
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1003998 taacatatatattttttatttaagtggggg 1003969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7857994 - 7857966
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7857994 taacatatatattttttatttaagtgggg 7857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33452990 - 33452934
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  33452990 agctaaacttcattaaaaaatcataattagaagaacttctaaacatgaaacgaaata 33452934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 83 - 503
Target Start/End: Original strand, 18172779 - 18173197
Alignment:
Q  83 aagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||       ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||    
T  18172779 aagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaatt--gtgaaagagaggtagaatttaccaacggcgtcgtt 18172876  T
Q  183 tgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaat 282  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18172877 tggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaat 18172976  T
Q  283 tgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaa 382  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172977 tgagtgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagtaccagatttatgtccatataggagaa-taaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaa 18173075  T
Q  383 gaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatctt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18173076 gaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttctgaggtccatagctcttggaggcccggcttgattgagcacctt 18173175  T
Q  483 gcact-ccttaaagccgggcct 503  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  18173176 gcactccctcaaagccgggcct 18173197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 79 - 505
Target Start/End: Original strand, 17117478 - 17117897
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17117478 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgt 17117577  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17117578 cgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttc 17117677  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||        ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17117678 aaattgactg--------attatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagagctaaaatctagaaaaaattcaaacgtg 17117769  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17117770 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgagtattagatttaattttttgtggggcccatagtttttggaggtccggcttgattgagca 17117869  T
Q  479 tcttgcac-tccttaaagccgggcctgt 505  Q
     ||| ||| |||| || |||||||||||    
T  17117870 ccttacacttcctcaaggccgggcctgt 17117897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 79 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15457732 - 15457306
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||       |||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||    
T  15457732 agctaagctttattaaaaaatcaaaataagaagagcttctgaacatgaaacgaaaaacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacagcgt 15457633  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  15457632 cgtttggatttgtcacttgtccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaattattgttgtgattctttcaataaaatagctttt 15457533  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457532 caaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtagtttgatagtaccagatttatgtccggataagtgaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 15457433  T
Q  378 gtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15457432 gtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaat-ttttctgaggcccataacttttggaggcccggcttgattgagc 15457334  T
Q  478 atcttgcactc-cttaaagccgggcctg 504  Q
    | ||||||||| || || ||||||||||    
T  15457333 accttgcactctctcaaggccgggcctg 15457306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 82 - 446
Target Start/End: Original strand, 38985545 - 38985908
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||       |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |    
T  38985545 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaaaatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaattcactaacggcgtctt 38985644  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38985645 ttggatttgtcacttatccgttgtggaaaaggggaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 38985744  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38985745 ttgattgattaaatgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaa-taaagtttagaaaaaactcaaacgtgtaa 38985843  T
Q  382 agaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggcc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  38985844 agaagtaacatatatattttttatttaagtggggtggggtattagagttaattttttctgaggcc 38985908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 487
Target Start/End: Original strand, 18915889 - 18916295
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  18915889 taagctttattaaaaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgt 18915988  T
Q  182 tt-gaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18915989 ttcgattttatcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaa 18916088  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18916089 attgattgattaagtgattatacaaattggggatggtttgatagtaccagatttatgtccagattgaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgta 18916188  T
Q  381 aagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatc 480  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| |    
T  18916189 aaaaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatttttttttaggcccatagctattggaggcccgacttgattgagcacc 18916288  T
Q  481 ttgcact 487  Q
    |||||||    
T  18916289 ttgcact 18916295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 398
Target Start/End: Original strand, 21747067 - 21747382
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  21747067 taagctttattaaaaaaatagaatcaaaagagcttttaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttcagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgt 21747165  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||  ||| |||    
T  21747166 ttgaatttctcacttatctgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaa 21747265  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21747266 ttgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaa 21747365  T
Q  382 agaagtaacatatatat 398  Q
    | |||||| ||||||||    
T  21747366 aaaagtaatatatatat 21747382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 370
Target Start/End: Original strand, 36059738 - 36060029
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |    
T  36059738 agctaaacttcattaaaaaatcagattcacaagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtaaaatttacgtaacggcg 36059837  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    || |||| | | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  36059838 tcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaaagggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttt 36059936  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaact 370  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||| |||| | | |  ||||||| |||||||||||||||    
T  36059937 taaattaactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttttgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaact 36060029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39081624 - 39081328
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | |||||  |  |||||||    
T  39081624 taagcttcattataaaatcagaatcataagaacttttaaatatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgtgtcat 39081525  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| | | ||||||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39081524 ttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaactaatggtttatatgaaaa-gaaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaa 39081427  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39081426 ttgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtaaaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 39081328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1419129 - 1418840
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| | |    
T  1419129 attaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcatttggaat 1419030  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 288  Q
     |||||| || |||  | |||||||  |||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  1419029 -gtcactcatacgtcataggaaaggaaaaaatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactg 1418931  T
Q  289 attaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||| ||||||| | | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1418930 attaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaa-ttatgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 1418840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 19367341 - 19367554
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||     ||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19367341 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccactgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19367440  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| ||||    
T  19367441 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagaatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 19367540  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  19367541 aactcaaacgtgta 19367554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 18676232 - 18676446
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  18676232 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctcttttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 18676331  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||  |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| |||    
T  18676332 aaatagctttccaaattgactgattaagttattatacaaattaggggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 18676431  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  18676432 aaactcaaacgtgta 18676446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38599541 - 38599340
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| | |||||    
T  38599541 ctaacggtgtcgtttgaaat-gccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-aaaaaataaataattgttttgattctttcaatgaa 38599444  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||| | || ||||||  |||  ||||||||    
T  38599443 atagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgataatgatttgatagcatcaaatttatatccataaaatagaacttgagttaagaaaaaa 38599344  T
Q  369 ctca 372  Q
    ||||    
T  38599343 ctca 38599340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13997544 - 13997244
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||  |||    
T  13997544 agctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacaaaacaaaataaaacaagattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaaatgtg 13997445  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    |  |||| | | |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  13997444 ttgtttggaat-gtcactcatacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttt 13997347  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagag-aactaaagtctagaaaaaactcaaacg 376  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | |||||   ||| ||  |||| | |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  13997346 caaattgactcattaagtgattattcaaattgacggtggttcaatagcatcaaatttatgtccaga-aagtgaaactagagtctaggaaaaactcatacg 13997248  T
Q  377 tgta 380  Q
    ||||    
T  13997247 tgta 13997244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25222464 - 25222252
Alignment:
Q  170 taacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  25222464 taacggtgttgtttgaatttgtcactcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 25222365  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aaa 367  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||||||||||||| |||    
T  25222364 ataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaattaggaatgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaaaa 25222265  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  25222264 actcaaacgtgta 25222252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13020565 - 13020351
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||  ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||   ||||    
T  13020565 ctaacggtgtcatttgaatttttcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttaaatga 13020466  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa--a 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| |||||||||  |    
T  13020465 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaa 13020366  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||    
T  13020365 aaactcaaacgtgta 13020351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 377
Target Start/End: Original strand, 26151669 - 26151880
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  26151669 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 26151768  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaacta-aagtctag-aaa 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||| |||    
T  26151769 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaa 26151868  T
Q  366 aaactcaaacgt 377  Q
    ||||||||||||    
T  26151869 aaactcaaacgt 26151880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 41096459 - 41096673
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  41096459 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 41096558  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| |||    
T  41096559 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 41096658  T
Q  366 aaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||| |||||    
T  41096659 aaactcaaatgtgta 41096673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 380
Target Start/End: Original strand, 42411406 - 42411692
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttgaatttgtc 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||        |||||||| |||| | || | ||  ||||||||||| |||| |||| ||    
T  42411406 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaagaaatta-aaaataattaagtgaaagag-gttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttttc 42411503  T
Q  193 acttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaa-aagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 291  Q
    |||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42411504 actcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaatt 42411603  T
Q  292 aagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42411604 aagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 42411692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45619118 - 45618909
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  45619118 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 45619019  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaacta-aagtctagaaaa 366  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||||||    
T  45619018 aatagc-ttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaa 45618920  T
Q  367 aactcaaacgt 377  Q
    |||||||||||    
T  45618919 aactcaaacgt 45618909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2063947 - 2063738
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaa-aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2063947 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttttgcgggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 2063848  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| |  | |||||||| || | | || ||||| |||||| |||||    
T  2063847 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggattatatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctaaaaaaa 2063748  T
Q  368 actcaaacgt 377  Q
    ||||||||||    
T  2063747 actcaaacgt 2063738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7993775 - 7993562
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||    
T  7993775 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatg 7993676  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaa 366  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |   ||||||| || | | |||||||| |||||||||||    
T  7993675 aaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccggtttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 7993576  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||| |||||    
T  7993575 aactcaaatgtgta 7993562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 379
Target Start/End: Original strand, 27302491 - 27302661
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27302491 aaaggtgaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaatt 27302590  T
Q  309 ggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    |   |||||||| ||| | | ||||| |||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  27302591 gagggtgatttggtagcatcgaatttttgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaactcaaatgtgt 27302661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 377
Target Start/End: Original strand, 29480484 - 29480768
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgt 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  29480484 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaatacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaactttacctaacggtgtcgtttggaat-gt 29480582  T
Q  192 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 291  Q
    ||||  |  || ||  |||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29480583 cactcctatgtcgtaagaaaggggaagacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaat 29480682  T
Q  292 aagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    ||||  |||| | ||||| | ||| ||| |||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29480683 aagtgtttattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgtccagaaagttgaactaaagtctaaaaaaaaatcatacgt 29480768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 415
Target Start/End: Original strand, 1226114 - 1226445
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatttgt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| |||||| |  | ||||| ||||| |||| |||| |||| |    
T  1226114 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaacgatgtcgtttggatttat 1226213  T
Q  192 cacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgat 290  Q
     | |  |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  1226214 gattccttcgttgtggggtagg--aaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgat 1226311  T
Q  291 taagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt---------aa 381  Q
    | ||| ||||||  |||||   ||| |||| ||| | || ||||||||||  | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||         ||    
T  1226312 tgagtgattatataaattgagggtggtttggtagcatcagatttatgtcc--aaaggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaaa 1226409  T
Q  382 agaagtaacatatata--ttttttatttaagtgggg 415  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1226410 agaagtaacatatatattttttttatttaagtgggg 1226445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6530754 - 6530601
Alignment:
Q  216 aaaacgaatggtttatgtaaaaaaga-aatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagt 314  Q
    |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||    
T  6530754 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 6530655  T
Q  315 gatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    | |||||||||| |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||||    
T  6530654 ggtttgatagtatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaa 6530601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 380
Target Start/End: Original strand, 34061813 - 34061990
Alignment:
Q  204 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 302  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  34061813 gtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtaatcata 34061912  T
Q  303 ccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    | ||||    ||| |||||||| |||| |||||||| || | |  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  34061913 caaattatgggtggtttgataggaccagatttatgtacaaaaagaagaactatagtctaaaaaaaactcatacgtgta 34061990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 374
Target Start/End: Original strand, 31273089 - 31273293
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||   |||||    
T  31273089 ctaactgtgtcgtttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgaatgttatgattcttttaatgaa 31273188  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    ||||  || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| |||||||  | |||||||| ||||||| | |||| ||  ||| || ||||||    
T  31273189 atagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaattgg-ggtggtttgataacatcaaatttaagtccagaaaggagagctggagtatacaaaaaa 31273287  T
Q  369 ctcaaa 374  Q
    ||||||    
T  31273288 ctcaaa 31273293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4856128 - 4855995
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4856128 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggttaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 4856029  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  4856028 ttccaaattcactgattaagtgattatacaaatt 4855995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 292
Target Start/End: Original strand, 42759678 - 42759802
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  42759678 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcacccctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 42759777  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgatta 292  Q
    |||| |||| |||||||||||||||    
T  42759778 aataactttccaaattgactgatta 42759802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12269566 - 12269285
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  |  | ||||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||   ||||    
T  12269566 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcattcctctgctgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatga 12269467  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaa 367  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| |||||| |||||    
T  12269466 aatagctttccaaatc-actgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctaaaaaaa 12269368  T
Q  368 actcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    | ||||| |||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  12269367 attcaaatgtgtactaaagaaaaaaaatgatataacatatatattttttatttaagctggggtggatattagatttaattttt 12269285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45042525 - 45042331
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    |||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||  |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||      
T  45042525 tgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa--cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagac 45042428  T
Q  275 tttca---aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataag-agaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  45042427 tttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcaaatttatgtac-gaaaagaagaactagagtctagaaaaaa 45042331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36481532 - 36481428
Alignment:
Q  173 cggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaata 271  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36481532 cggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaata 36481433  T
Q  272 gcttt 276  Q
    |||||    
T  36481432 gcttt 36481428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6530568 - 6530518
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6530568 taacgtatatattttttatttaagtgggggtggatattagatttaattttt 6530518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13001772 - 13001655
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| || |||    |||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  13001772 gtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtgggaaaggagaaaacgaattgtatatactgaaaaaaaatgattattgtgattcttttaatgaaatagct 13001673  T
Q  275 tttcaaattgactgatta 292  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  13001672 ttataaattgactaatta 13001655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9029531 - 9029471
Alignment:
Q  380 aaagaagtaacatatatatt-ttttatttaagtgggg-gtggatattggagttaatttttt 438  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  9029531 aaagaaataacatatatatttttttatttaagtggggtgtggatattagacttaatttttt 9029471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 18676466 - 18676517
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  18676466 taacatatatattttttatttaagtgaggggtgggtattagatttaattttt 18676517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36481315 - 36481264
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  36481315 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 36481264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38599655 - 38599593
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 232  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38599655 ctaacggtgtcgtttgaaat-gccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 38599593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 424
Target Start/End: Original strand, 31273318 - 31273356
Alignment:
Q  386 gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatatt 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31273318 gtaacatatatattttttatttgagtgggggtgggtatt 31273356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 424
Target Start/End: Original strand, 26151903 - 26151940
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggggtggatatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26151903 taacatatatattttttatttaaatgggggtgggtatt 26151940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 79 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12971637 - 12971226
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||        ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  12971637 agctaaactttattaaaaaatcagaatcagtttagcttcttaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagataggtagaatttactaacggagt 12971538  T
Q  179 catttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttc 278  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12971537 cgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttc 12971438  T
Q  279 aaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12971437 aaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgataatatcagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 12971338  T
Q  379 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtg-ggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| ||||||||||||    
T  12971337 taaagaagtaacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagagttaattttttctgaggcccattgctcttggaggcccggcttgattgagc 12971238  T
Q  478 atcttgcactcc 489  Q
    | ||||||||||    
T  12971237 accttgcactcc 12971226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 488
Target Start/End: Original strand, 27703370 - 27703787
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||        ||||||||  |||||||  | ||||| |||| |||||     
T  27703370 taagctttgttaaaaaatcagaatcataataacttctaaacatgaaacgaaata-----aaattaagtgaaggagaggtgaaatttacctaacagtgtcg 27703464  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||| ||| ||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  27703465 tttggatt-gtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttccaa 27703563  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt- 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27703564 attgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgttcaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 27703663  T
Q  380 ------------aaagaagtaacatatatatttttt---atttaagt-gggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcc 463  Q
                ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  | || |  |||||||||||||||    
T  27703664 ctaaagaaagaaaaagaagtaacatatatattttttttaatttaagtggggggtgggtattagacttaatttttt-tgtggtccgtagtttttggaggcc 27703762  T
Q  464 cagcttgattgagcatcttgcactc 488  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27703763 cagcttggttgagcaccttgcactc 27703787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50371365 - 50371080
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||        |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||    
T  50371365 agctaagcttcattaaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaacgaaata-aaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacgatg 50371267  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    |  |||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||    
T  50371266 ttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaagggaaaaactaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagttttt 50371167  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa 364  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||    
T  50371166 caaattgactgattaagtgattatacaaattgagggtgatttgatagcatcaactttatatccagaaaggagaactagagtctagaa 50371080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5560622 - 5560413
Alignment:
Q  172 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatgaaat 270  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||| | ||||| |||| |||||||   |||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5560622 acggtgttatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaagagaaaatgaatagtttatgcggaaaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaat 5560523  T
Q  271 agcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaact 370  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||    
T  5560522 aactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttggtagcaccagatttatgtccagaaatgagaactatagtctaaaaaaatct 5560423  T
Q  371 caaacgtgta 380  Q
    ||||||||||    
T  5560422 caaacgtgta 5560413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Original strand, 44836566 - 44836840
Alignment:
Q  87 tttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttga 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||||||     
T  44836566 tttattaaaaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctagcggtgtcatttgg 44836665  T
Q  186 atttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattga 285  Q
    | | ||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  44836666 aat-gtcactcctacgtcgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgat----gtgattctttcagtgaaatagtttttcaaattga 44836760  T
Q  286 ctgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaa 365  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||    
T  44836761 ctgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgttcagaaagtagaactagaatctagaaa 44836840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25930745 - 25930532
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  25930745 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaa 25930646  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag--aaaa 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |  ||  |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||||||  ||||    
T  25930645 atagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaattaggggtagtttgataggatcagatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagacaaaa 25930546  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  25930545 aactcaaacgtgta 25930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 380
Target Start/End: Original strand, 37873723 - 37873897
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  37873723 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaa 37873822  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||| | ||| |||||||| | |||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  37873823 ttgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtctagaaagtagaactagagtctagaaaaaaactcatacgtgta 37873897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42740213 - 42740048
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  42740213 ggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaa 42740114  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
    ||| | ||  |||||||| | |||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  42740113 ttgatggttgtttgatagcatcaaacttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactca 42740048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10109862 - 10109647
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  10109862 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 10109763  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa--a 365  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| | | ||||||||| || | | |||||||| |||||||||  |    
T  10109762 aattgctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 10109663  T
Q  366 aaactcaaacgtgtaa 381  Q
    ||||||||||||||||    
T  10109662 aaactcaaacgtgtaa 10109647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 301
Target Start/End: Original strand, 13120710 - 13120921
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcatttgaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||| |||| | |    
T  13120710 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgatagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat 13120809  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactg 288  Q
     ||||||  | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13120810 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactg 13120908  T
Q  289 attaagtcattat 301  Q
    ||||||| |||||    
T  13120909 attaagtgattat 13120921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15441516 - 15441220
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||         ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||     
T  15441516 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaacggaataaaaaaaa--taagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggcgtcg 15441419  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttca 279  Q
    |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||  |    
T  15441418 tttggatttgtcactcttctgttgtggaaaaggg-aaaatgaatgatttatgcaaaaaagaatt-attgttgtgattctttttaatgaaatagctttata 15441321  T
Q  280 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||   ||| |||||||| |  | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15441320 aattgagtgattaagtgattatacaaattgtaggtggtttgatagcattatatttatgtctagaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgt 15441221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30899800 - 30899584
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg---taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctat 265  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  30899800 ctaacggtgtcgtttggatttgtcattcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat 30899701  T
Q  266 gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag--a 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||  |    
T  30899700 gaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaa 30899601  T
Q  364 aaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||||||    
T  30899600 aaaaactcaaacgtgta 30899584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 48722292 - 48722507
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  48722292 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattatttcaatga 48722391  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag---aa 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | ||||| || |||||||   ||    
T  48722392 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaaatagagtctagaaaaa 48722491  T
Q  365 aaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||||    
T  48722492 aaaactcaaacgtgta 48722507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 380
Target Start/End: Original strand, 12884100 - 12884272
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12884100 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 12884199  T
Q  309 ggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12884200 aggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 12884272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 17674278 - 17674487
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  17674278 ctaacggtgtcatttggaat-gtcactcttacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaa 17674376  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagag-aactaaagtctagaaaaa 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||| |||| | ||||||||| || ||| ||| | ||||| ||||||| ||||    
T  17674377 atagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatatctaga-aagtgaaactagagtctag-aaaa 17674474  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    ||||| |||||||    
T  17674475 actcatacgtgta 17674487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 18127859 - 18127999
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  18127859 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattcttgcaatga 18127958  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18127959 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18127999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Original strand, 26486208 - 26486499
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagttta-ctaacggtg 177  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||| ||  | ||||||  | |||| | |||||||    
T  26486208 agctaagcttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaattg--aaagaggtgaaatttaccaaacggtg 26486305  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagctttt 277  Q
    ||||||| |  |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  26486306 tcatttgga-atgtcacttctacgtcgtaggaaagaggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagctttt 26486404  T
Q  278 caaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 377  Q
    ||        |||||||| ||||||| ||||| |  || |||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26486405 ca--------gattaagtgattatacaaattgatgatggtttgatagcatcaaatttatttccagaaagtagaactagagtttagaaaaaactcatacgt 26486496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 51110023 - 51110236
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||  ||||| |||||||||||  || || ||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  51110023 ctaacggtgtcatttgaatttgtcactcctttgttgtggaaaaggataaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatga 51110122  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | || ||||| ||||||| ||||    
T  51110123 aatagctttctaaattgactgattaagtgattatagaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggataactatagtctagaaaaa 51110222  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  51110223 aactcaaacgtgta 51110236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24556900 - 24556736
Alignment:
Q  216 aaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtg 315  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| | |||    
T  24556900 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattgatggtg 24556801  T
Q  316 atttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
     ||| |||| |||||||||||||  ||| |   ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  24556800 gtttaatagcaccaaatttatgttgagaaagtggaattagagtctagaaaaaactcatacgtgta 24556736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6150864 - 6150653
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaat-gattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||  || |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| | |||    
T  6150864 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatg 6150765  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| |||    
T  6150764 aaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatataaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 6150665  T
Q  366 aaactcaaacgt 377  Q
    ||||||||||||    
T  6150664 aaactcaaacgt 6150653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 372
Target Start/End: Original strand, 22386680 - 22386963
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttact-aacggtgtcatttgaatt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||| ||  | |||| | |||| |||| |||| | |    
T  22386680 attaaaaaatcagaatcataagattttttaaacacgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatttaacgatgtcgtttggaat 22386779  T
Q  189 tgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatga-ttgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgact 287  Q
     ||||||  | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22386780 -gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgact 22386878  T
Q  288 gattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
    |||||||| ||| | | ||||| | ||| ||  |||| | |||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||    
T  22386879 gattaagtgattgttcaaattgatggtggttaaatagcatcaaatttatgtccagacagtggaactagagtctagaaaaaactca 22386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 311
Target Start/End: Original strand, 30004830 - 30004972
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||| | |||||    
T  30004830 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaa 30004929  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggt 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  30004930 atagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaattggt 30004972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Original strand, 29208022 - 29208233
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29208022 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 29208121  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaa 368  Q
    |||  || || ||||||||||||| | ||||||| |||| |  ||| |||||||  |  | |||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  29208122 tagacttccagattgactgattaaatgattatacaaattaggggtggtttgatatgattagatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaa 29208221  T
Q  369 ctcaaacgtgta 380  Q
     |||||||||||    
T  29208222 ttcaaacgtgta 29208233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 14084622 - 14084835
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa--tgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||  || || |||  ||||| ||||||||||| | |||    
T  14084622 ctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggagaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatg 14084721  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaa 366  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   || |  |||||||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||||||||||    
T  14084722 aaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacattttaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 14084821  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    || |||||| ||||    
T  14084822 aattcaaacctgta 14084835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Original strand, 33124559 - 33124692
Alignment:
Q  176 tgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    |||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33124559 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 33124658  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  33124659 tttcaaattgacttattaagtgattatacaaatt 33124692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 50552637 - 50552424
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||| |||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  50552637 ctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaaggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50552538  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtcta-gaaaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||  ||||    
T  50552537 aataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaa 50552438  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  50552437 aactcaaacgtgta 50552424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 9
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  149 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49 aatcactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 28885593 - 28885733
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| ||| |  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  28885593 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatga 28885692  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28885693 aatagctttcaaaattgattgattaagtgattatacaaatt 28885733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 6333441 - 6333650
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||   || ||    
T  6333441 ctaacagtgtcgtttggattcttcactcattcgttgtgggaa--gggaaagcgaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaa 6333538  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctaga-aaaa 367  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| | | || |||||||||| || |||||||| |||  | |||||||| |||||| | ||||    
T  6333539 ataactttccaatttgactgattaagtgattttacagattagga-tggtttgatagtatcagatttatgtacaggaatgagaactagagtctaaagaaaa 6333637  T
Q  368 actcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||||    
T  6333638 actcaaacgtgta 6333650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Original strand, 17487237 - 17487418
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 299  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||    
T  17487237 gttgtggaaaaggataaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttattaagtgatt 17487336  T
Q  300 ataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||  |||| |  ||| |||||||| | |  ||||||||  | | | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  17487337 atataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgta 17487418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1269689 - 1269484
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcg-ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| | ||||   |||| ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  1269689 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctccgcttgtgggaaaggagaaaacgaatg-tatatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaa 1269592  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    |||||||||||||||||        | ||| ||| ||||||  ||| ||| |||| | || ||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  1269591 tagcttttcaaattgac--------taattttacaaattgggggtggtttcatagcatcagatttatgtctagaaaggagaattagagtctagaaaaaac 1269500  T
Q  370 tcaaacgtgtaaagaa 385  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1269499 tcaaacgtgtacagaa 1269484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Original strand, 20905210 - 20905423
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  20905210 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaa 20905309  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa--aa 366  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |   || |||||||| |  | |||||||| || | | |||||||| |||||||||  ||    
T  20905310 atagacttccaaattgactgaataagtgattatacaaattagggctggtttgataggattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaataa 20905409  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  20905410 aactcaaacgtgta 20905423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9777646 - 9777421
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnn-ttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggt 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||         |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||    
T  9777646 agctaaacttcattaaaaaatcagaattagaataacttctaaacatgaaactaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggt 9777547  T
Q  177 gtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagctt 275  Q
    ||| |||| |||| ||| | || | || |||||||||||||| | |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||  || |||||||| |     
T  9777546 gtcgtttggatttatcattcatccattatgggaaaggggaaa-caaatggtttatgagaaaaggtaatgattgttgtgattctttttattgaaatagtta 9777448  T
Q  276 ttcaaattgactgattaagtcattata 302  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9777447 ttcaaattgactgattgagtgattata 9777421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 52055654 - 52055560
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  52055654 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaactgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattata 52055560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 260
Target Start/End: Original strand, 31369358 - 31369418
Alignment:
Q  200 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattctt 260  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31369358 cgttgtgggataaggaaaaatgaatggtttatgcaaaaaagaaatgatttttgtgattctt 31369418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263804
Alignment:
Q  250 ttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagag 349  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||| | ||||| ||| |||| | |||||||||||||| | |   |    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtaataattcaaatcgatagtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtgg 38263825  T
Q  350 aactaaagtctagaaaaaact 370  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38263824 aactagagtctagaaaaaact 38263804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 37873592 - 37873642
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaa 132  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37873592 taagcttcattaaaaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaa 37873642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30899564 - 30899527
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggggtggatatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30899564 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtatt 30899527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3907545 - 3907402
Alignment:
Q  236 aaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaattta 335  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  | |  |||||    
T  3907545 aaaagaaattatttttatgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattgg-agtggtttgataccatcgtattta 3907447  T
Q  336 tgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||| || | |  | || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3907446 tgttcataaagaaaaaataaagtctaaaaaaaacttaaacgtgta 3907402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 12884292 - 12884343
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  12884292 taacatatatattttttatttaagtaggggttggatattagatttaattttt 12884343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 14084855 - 14084906
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  14084855 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 14084906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 17487440 - 17487491
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  17487440 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 17487491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28189390 - 28189327
Alignment:
Q  317 tttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||| | || |||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28189390 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 28189327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 48722527 - 48722578
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  48722527 taacatatatattttttatttaagtggggggtggatattaaatttaattttt 48722578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Original strand, 31369432 - 31369518
Alignment:
Q  289 attaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 375  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||  | || ||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  31369432 attaagtgattatacaaattgaaagtggtttgataacatcagatttatgtccagaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaac 31369518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Original strand, 39080454 - 39080503
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 128  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  39080454 agctaagcttcattgaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaa 39080503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1269775 - 1269727
Alignment:
Q  87 tttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  1269775 tttattaaaaaatcagaatcaatagaacttctaaacatgaaacgaaata 1269727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24557033 - 24556989
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaaca 123  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24557033 agctaagcttcattgaaaaattagaatcagaagaacttttaaaca 24556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 301
Target Start/End: Original strand, 32810370 - 32810406
Alignment:
Q  265 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32810370 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattat 32810406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 129
Target Start/End: Original strand, 33124489 - 33124525
Alignment:
Q  93 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 129  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33124489 aaaaattcagaatcagaagaacttttaaacatgaaac 33124525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Original strand, 52240458 - 52240550
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattctt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  |  ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  52240458 ctaacagtgtcgtttgaatttgtcgctcctctgttgtggaaaagggcaaaatgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctt 52240550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 86 - 486
Target Start/End: Original strand, 48626869 - 48627269
Alignment:
Q  86 ctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnt-taagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcatttg 184  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||         ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48626869 ctttataaaaaaattagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttg 48626968  T
Q  185 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattg 284  Q
     ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  48626969 gatttgtcacttatccgctgtgggaatggg-aaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattg 48627067  T
Q  285 actgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaaga 384  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48627068 actgatcaagtgattatacaaattggcggtggtctgatagtatcagatttatgtccagatatgagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaaga 48627167  T
Q  385 agtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatcttgc 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48627168 agtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgc 48627267  T
Q  485 ac 486  Q
    ||    
T  48627268 ac 48627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 504
Target Start/End: Original strand, 43905689 - 43906085
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttactaacggtgtcat 181  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43905689 taagctttactaaaaaaatagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcat 43905788  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||||||| |||||||||    
T  43905789 ttggatttgtcacttatccgctgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtg----------tgaaataacttttcaaa 43905878  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||       
T  43905879 ttgactgattgagtgattatacaaattgagggtagtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctaaaaaaacctcaaacgtg--- 43905975  T
Q  382 agaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtggatattggagttaattttttcggaggccaatagtttttggaggcccagcttgattgagcatct 481  Q
              |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||   | ||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  43905976 ----------tatatattttttatttaagt-ggggtggataatagagttaatttttt--taagctcatagcttttggaggtccgacttgattgagcacct 43906062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 379
Target Start/End: Original strand, 42009223 - 42009395
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42009223 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 42009322  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    ||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42009323 ttgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactaaagtctaaaaaaaactcatacgtgt 42009395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 486
Target Start/End: Original strand, 51939483 - 51939812
Alignment:
Q  175 gtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatag 272  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51939483 gtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatag 51939582  T
Q  273 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51939583 cttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactca 51939682  T
Q  373 aacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt--tcggaggccaatagttttt 456  Q
    ||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||  |  |||||| ||||  |||    
T  51939683 aacgtggactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttttgttagaggcccatagaattt 51939782  T
Q  457 ggaggcccagcttgattgagcatcttgcac 486  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||    
T  51939783 ggaggccccgcctggttgagcaccttgcac 51939812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7767297 - 7767005
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtg 177  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||| ||  | ||||| |||| |||    
T  7767297 agctaagcttcattaaaaagtcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaactgtg 7767198  T
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa---aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagct 274  Q
    ||||||| | | ||||||  | |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7767197 tcatttggaat-gtcactcctacgtcttaggaaatgggaaaacgaatagtttatgtgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagct 7767099  T
Q  275 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||  |||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||    
T  7767098 tttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggttgtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactggagtctagaaaaaa 7767005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27303413 - 27303118
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||     
T  27303413 taagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatggtgtcg 27303314  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaa 280  Q
    |||||||  ||||||  | ||| || |||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27303313 tttgaat--gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacaaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 27303217  T
Q  281 attgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| || | | |||||||||||||| | |  |||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  27303216 attgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttcatggcatcaaatttatgtccataaagtagaagtagagtctagaaaaaacacatacgtgt 27303118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18408331 - 18408121
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt-aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |     
T  18408331 aacggtgtcgtttggatttgtcactgctctgttgtggaaaagggtaaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggat 18408232  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  18408231 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactaaagtctagaaaaaac 18408132  T
Q  370 tcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||    
T  18408131 tcaaacgtgta 18408121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 380
Target Start/End: Original strand, 36538147 - 36538320
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36538147 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 36538246  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||| | ||| |||||||| | ||| |||||||||| | |  | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  36538247 ttgatggtggtttgatagcatcaagtttatgtccataaagtataactagagtttagaaaaaactcatacgtgta 36538320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46904969 - 46904709
Alignment:
Q  83 aagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtcat 181  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  46904969 aagcttcattaaaaaatcagaataagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgt 46904870  T
Q  182 ttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaa 281  Q
    ||| | | ||||||  | ||| || |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  46904869 ttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaataaaaggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaa 46904771  T
Q  282 ttgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccaga 343  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  46904770 ttgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatctatgtccaga 46904709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21596438 - 21596264
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  21596438 ggaaagggaaaaacaaatggtttgagcaaaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaa 21596339  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 381  Q
    |||| |||| |||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21596338 ttgggagtggtttgatagcatctgatttatgtccagaaaggagaattagagtctagaaaaaacgcaaacgtgtaa 21596264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 21784705 - 21784918
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  21784705 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 21784804  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaa 366  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||    
T  21784805 aaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 21784904  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  21784905 aactcaaacgtgta 21784918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 379
Target Start/End: Original strand, 52655045 - 52655257
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  52655045 ctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 52655144  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctaga-aaa 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| | |  |||||| | || | | |||||||| |||||||| |||    
T  52655145 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttgataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctagagaaa 52655244  T
Q  367 aactcaaacgtgt 379  Q
    |||||||||||||    
T  52655245 aactcaaacgtgt 52655257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 368
Target Start/End: Original strand, 25599009 - 25599208
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||| | |||||    
T  25599009 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaa 25599108  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||| |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||||    
T  25599109 atagtttttcaaattgactgattaagtgattatataaattagaggtggtttgatagaatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaa 25599208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Original strand, 50677275 - 50677437
Alignment:
Q  207 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50677275 ggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 50677374  T
Q  307 ttggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    ||| | ||| |||||||  | ||||||| |||||||| |  | ||||||||||||| ||||||    
T  50677375 ttgatggtggtttgataacaacaaatttttgtccagaaagtataactaaagtctaggaaaaac 50677437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 28132658 - 28132870
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaa 268  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  28132658 ctaacggcgtcgtttgaacttgtcactcctctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 28132757  T
Q  269 atagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||||||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| |||||||||||||    
T  28132758 atagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 28132857  T
Q  369 -ctcaaacgtgta 380  Q
     |||||| |||||    
T  28132858 tctcaaatgtgta 28132870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13401599 - 13401401
Alignment:
Q  172 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgta--aaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13401599 acggtgtcgtttgaatttggcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaa 13401500  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| | | ||| ||||| || | | |||||||| ||| |||||||||    
T  13401499 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagagtggtttgataggatcgaatgtatgtacaaaaaggagaactagagtttagaaaaaa 13401401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Original strand, 23164496 - 23164706
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  23164496 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 23164595  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    |||  || |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||    
T  23164596 tagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaac 23164695  T
Q  370 tcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||    
T  23164696 tcaaacgtgta 23164706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 54430682 - 54430482
Alignment:
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 279  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||   |||||||| |||||||    
T  54430682 tttggatttgtcactcgtttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttca 54430583  T
Q  280 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||  | || |||||||| || | | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  54430582 aattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataacatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagcctagaaaaaactcaaacgtgt 54430483  T
Q  380 a 380  Q
    |    
T  54430482 a 54430482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 46791619 - 46791832
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  46791619 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatga 46791718  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaa 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||| ||||    
T  46791719 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 46791818  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  46791819 aactcaaacgtgta 46791832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 380
Target Start/End: Original strand, 1649798 - 1649965
Alignment:
Q  213 gggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggta 312  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||      
T  1649798 gggaaaacaaatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggg 1649897  T
Q  313 gtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| | | |||| |||||| ||| |||||    
T  1649898 gtgatttgatagcaccagatttatgtctagaaaagagaactagattttagacaaaacttaaatgtgta 1649965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15987338 - 15987207
Alignment:
Q  172 acggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaata 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||    
T  15987338 acggtgtcatttgaatttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaata 15987239  T
Q  272 gcttttcaaattgactgattaagtcattatac 303  Q
     ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  15987238 actttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 380
Target Start/End: Original strand, 41707043 - 41707190
Alignment:
Q  234 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |  ||| |||||||| | |  |||    
T  41707043 aaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatgcaaattaggggtggtttgataggatccgatt 41707142  T
Q  334 tatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||| || | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41707143 tatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 41707190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 8364315 - 8364030
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa--aaagaaatgattgttgtgattcttcctatg 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  8364315 ctaacggtgtcgtttggatttgtctctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttgtgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 8364216  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-a 365  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||| | ||||||||| |    
T  8364215 aaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaacaagagtctagaaaa 8364116  T
Q  366 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    |||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  8364115 aaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtggatattagatttaattttt 8364030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 380
Target Start/End: Original strand, 29387716 - 29387889
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  29387716 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaat 29387815  T
Q  308 tggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtct-agaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    | |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  29387816 taggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgta 29387889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 341
Target Start/End: Original strand, 19965812 - 19965975
Alignment:
Q  178 tcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgtt-gtgattcttcctatgaaatagcttt 276  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  19965812 tcatttgaatttctcattcatccgttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgggaaa-aaatgattgtttgtgattcttttaatgaaatagcttt 19965910  T
Q  277 tcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtcca 341  Q
    |||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| | || |||||||||||    
T  19965911 tcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcagtggtttgatagcatcagatttatgtcca 19965975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24252762 - 24252622
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  |||    
T  24252762 ctaacggggtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactga 24252663  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24252662 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 24252622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 380
Target Start/End: Original strand, 40152084 - 40152264
Alignment:
Q  200 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttccta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 298  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  40152084 cgttgtgggaaaggggaaa-caaatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgat 40152182  T
Q  299 tataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||| ||||||   ||||||| ||| | || || |||||| | | |  |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  40152183 tatacaaattggggatgatttggtagcatcagatctatgtctaaaaagaagaattagagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 40152264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 23067646 - 23067861
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaa-aagaaatgattgt-tgtgattcttcctatg 266  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||   |||    
T  23067646 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtgattctttaaatg 23067745  T
Q  267 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag--aa 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | ||||||||||||||||  ||    
T  23067746 aaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaa 23067845  T
Q  365 aaaactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||||    
T  23067846 aaaactcaaacgtgta 23067861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Original strand, 27729691 - 27729904
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaaga-aatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||| | || |    
T  27729691 ctaacagtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatca 27729790  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtcta-gaaaa 366  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||| |  ||| |||||||  | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||  ||||    
T  27729791 aattgctttccaaattgattgattatgtgattatacaaattaggggtggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaa 27729890  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  27729891 aactcaaacgtgta 27729904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Original strand, 1255007 - 1255112
Alignment:
Q  201 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1255007 gttgcgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaattattgt--tgattctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcatta 1255104  T
Q  301 taccaatt 308  Q
    ||| ||||    
T  1255105 tacaaatt 1255112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6715540 - 6715457
Alignment:
Q  209 aaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6715540 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgatta 6715457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 51147165 - 51146861
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaatacnnnnnnnttaagtgacagagaggtagagtttac-taacggtgtca 180  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |        | |||||| |||||| || | ||||| ||||||||||     
T  51147165 taagcttcattaaaaaatcataatcagaagaactcttaaacacgaaacaaaacaaaataaaatgaagtgaaagagagataaaatttacctaacggtgtcg 51147066  T
Q  181 tttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaa-aagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttca 279  Q
    |||| | | ||||||| |  || || | |||||| |||||||||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| |    
T  51147065 tttggaat-gtcacttctatgtcgtagaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttta 51146968  T
Q  280 aattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg 378  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||| | ||| ||| |||| | |||||||||||||| | |   |||||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  51146967 aattgactgattaagtga-tattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtggaactagaatctagaaaaaaactcatacgtg 51146869  T
Q  379 taaagaag 386  Q
    ||| ||||    
T  51146868 taacgaag 51146861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Original strand, 4207346 - 4207418
Alignment:
Q  234 aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  4207346 aaaaaagaaaggattgttgtgattctt----tgaaatatctttccaaattgaatgattaagtgattatacaaattgg 4207418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Original strand, 27110794 - 27110857
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27110794 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatg 27110857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20762158 - 20762056
Alignment:
Q  202 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 300  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||  || |||||| |||||| |||| ||||    
T  20762158 ttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtgatta 20762059  T
Q  301 tac 303  Q
    |||    
T  20762058 tac 20762056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21596565 - 21596516
Alignment:
Q  79 agctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21596565 agctaagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaa 21596516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 21784938 - 21784989
Alignment:
Q  387 taacatatatatttt-ttatttaagtgggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  21784938 taacatatatatttttttatttaagtgggggtgaatattagatttaattttt 21784989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 27110962 - 27111013
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  27110962 taacatatatattttttatttaagtagggggtgggtattagatttaattttt 27111013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 29387909 - 29387960
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  29387909 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 29387960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 46791852 - 46791903
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagt-gggggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  46791852 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttt 46791903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 40151966 - 40152019
Alignment:
Q  82 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaata 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||    
T  40151966 taagcttcattaaaaaatcagaatcataaaaacttttaaatatgaaacgaaata 40152019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 416
Target Start/End: Original strand, 41707210 - 41707239
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtggggg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41707210 taacatatatattttttatttaagtggggg 41707239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 415
Target Start/End: Original strand, 27729924 - 27729952
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgggg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729924 taacatatatattttttatttaagtgggg 27729952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 380
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17268
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaa-tgattgttgtgattcttcctatgaaa 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| | | ||||    
T  17056 aacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaa 17155  T
Q  270 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaaaaaac 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| | |  |||||| | || | | |||||||| ||||||||||||||    
T  17156 tagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatatacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaac 17255  T
Q  370 --tcaaacgtgta 380  Q
      |||||||||||    
T  17256 attcaaacgtgta 17268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16852 - 16639
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaa-atgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || || || ||||| |||||||||||| | ||||    
T  16852 ctaacggtgtcgtttggatttgttactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatga 16753  T
Q  268 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctagaa-aa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| | |  |||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||    
T  16752 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 16653  T
Q  367 aactcaaacgtgta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  16652 aactcaaacgtgta 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 1086
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaa-aaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  1203 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 1104  T
Q  268 aatagcttttcaaattga 285  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  1103 aatagctttccaaattga 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Original strand, 8332 - 8457
Alignment:
Q  185 aatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgt--aaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaatagcttttcaaat 282  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||  ||||    
T  8332 aatttgtcactcctccgttgcgggaagggggaaaacgaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaat 8431  T
Q  283 tgactgattaagtcattataccaatt 308  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  8432 tgactgattaattgattatacaaatt 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 301
Target Start/End: Original strand, 46099 - 46228
Alignment:
Q  171 aacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatgaaat 270  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  | | |||||  |||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  46099 aacggtgtcgtttggatttgtcactcct-ctttgtgaaaaagagtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaat 46197  T
Q  271 agcttttcaaattgactgattaagtcattat 301  Q
    ||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  46198 agacttccaaattgactgattaagtgattat 46228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 285
Target Start/End: Original strand, 22727 - 22844
Alignment:
Q  169 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttattcgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-taaaaaagaaatgattgttgtgattcttcctatga 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  22727 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaatga 22826  T
Q  268 aatagcttttcaaattga 285  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  22827 aatagtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 437
Target Start/End: Original strand, 22919 - 22970
Alignment:
Q  387 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtggatattggagttaattttt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22919 taacatatatattttttatttaagtggagggtggatattagatttaattttt 22970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 99136 - 99092
Alignment:
Q  90 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  99136 attaaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaat 99092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University