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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF3529_high_8 (Length: 380)
Name: NF3529_high_8
Description: NF3529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3529_high_8 |
 | |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1655 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: scaffold0060 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 3918 - 4274
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
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|
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| T |
3918 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
4017 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
4018 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
4117 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
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| T |
4118 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
4217 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
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| T |
4218 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
4274 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41496137 - 41495781
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
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|
| T |
41496137 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
41496038 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41496037 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
41495938 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
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| T |
41495937 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
41495838 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41495837 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
41495781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13088063 - 13087746
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13088063 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtctatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
13087964 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13087963 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaatc |
13087864 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13087863 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
13087764 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttca |
324 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13087763 |
agctaaatgcctggttca |
13087746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39926414 - 39926058
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39926414 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
39926315 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39926314 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
39926215 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39926214 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
39926115 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39926114 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
39926058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 40233563 - 40233918
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40233563 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattccatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
40233662 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40233663 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
40233762 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40233763 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaa-attatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
40233861 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40233862 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctatcgaagcatgtcctacgttttata |
40233918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 34108289 - 34108644
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34108289 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatgactatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
34108388 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34108389 |
agaattgatattgccattcataaagcctctaataaaaa-tattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
34108487 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattatgaa-----ataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34108488 |
attttcacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
34108587 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34108588 |
aactaaatgcctggttcatgttcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
34108644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43622073 - 43621728
Alignment:
| Q |
24 |
tttttaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctatagaattggtatt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
43622073 |
tttttaaagggatcattctatttgtatgactatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctataaaattgatatt |
43621974 |
T |
|
| Q |
124 |
gccattcataaagcctctaataa-aaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaataatttttaccta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43621973 |
gccattcataaagcctctaataaaaaaatattatcatgactacaaaacaacaaatcaacaaagcagtttagaaaagagtgaagacaataatttttactta |
43621874 |
T |
|
| Q |
223 |
aagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgtc |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
43621873 |
aagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatatgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcaactaaatgcc |
43621774 |
T |
|
| Q |
318 |
tggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43621773 |
tggttcatattcatacactctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
43621728 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 11154899 - 11155096
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11154899 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatgactatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
11154998 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaa |
209 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11154999 |
agaattaatattgacattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaaaagtgaagacaa |
11155096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 363
Target Start/End: Original strand, 11155096 - 11155224
Alignment:
| Q |
235 |
aaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgtctggttcatattcatacc |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11155096 |
aaataaatctaaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcaactaaatgcctagttcatattcatacc |
11155195 |
T |
|
| Q |
335 |
ctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11155196 |
ctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
11155224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 54319085 - 54319441
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54319085 |
aatatcaagaatttttcaaatggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
54319184 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
54319185 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
54319284 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54319285 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaataaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
54319384 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54319385 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
54319441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35186663 - 35186307
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35186663 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcgtgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
35186564 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35186563 |
agaattggtattgccattcataaaacctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
35186464 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35186463 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaataaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
35186364 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35186363 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
35186307 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 49806222 - 49806578
Alignment:
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13 |
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111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
49806222 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcgttctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgctcatgaagaccagctctacggaaaagtgttatctat |
49806321 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49806322 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
49806421 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
49806422 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
49806521 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49806522 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
49806578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 42645997 - 42646352
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42645997 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
42646096 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42646097 |
agaattggtattgtcattcataaagcctctaataaaaaatattattacgactacaaaacaacaaatcagcaaaacagtttagaaaagagtgaagacaata |
42646196 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42646197 |
a-ttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
42646295 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42646296 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctttgtcgaagcatgtcctacgttttata |
42646352 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 964912 - 965263
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
964912 |
aatatcaagaattttgcatagggatcattttatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
965011 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
965012 |
agaattggtattgtcattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaaacagtttagaaaagagtgaagacaata |
965111 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
965112 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgt |
965211 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgtt |
358 |
Q |
| |
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|
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| T |
965212 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgtt |
965263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 13452454 - 13452809
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13452454 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacgggtaagtgttatctat |
13452553 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13452554 |
agaattggtattgtcattcatatt-cctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
13452652 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattatgaa-----ataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
13452653 |
atttttacctacaaaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
13452752 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13452753 |
atctaaatgcctggttcatattcataccatctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
13452809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 53577879 - 53577523
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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53577780 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
53577779 |
agaattggtattgtcattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaattagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
53577680 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53577679 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatac |
53577580 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53577579 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacattttata |
53577523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 10257171 - 10257259
Alignment:
| Q |
13 |
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100 |
Q |
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|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
10257171 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataa |
10257259 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 283 - 363
Target Start/End: Original strand, 15553104 - 15553184
Alignment:
| Q |
283 |
gttatagttaacattcacacatgcagctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15553104 |
gttacagttaacattcacacatgcagctaaatgcctgattcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacattttata |
15553184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39873141 - 39872784
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39873141 |
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T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |
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|
| T |
39873041 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagcgtagacaata |
39872942 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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atttttacttaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaatattatgttatagttaacattcacacatgc |
39872842 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttatat |
364 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39872841 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttatat |
39872784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24349899 - 24349543
Alignment:
| Q |
13 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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agaattgatattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
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T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttttacttaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattacctgaatataaaacaataaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
24349600 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24349599 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctctttcgaagcatgtcctacgttttata |
24349543 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 24327445 - 24327802
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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aatatcaagaatttttcaaagggattattctatttgtatggctatgatgagaactcaggtgtgtccatgaagagcagctctacggataagtgttatctat |
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T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaat-cagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaat |
210 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
24327545 |
agaattgatattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatacagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaat |
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T |
|
| Q |
211 |
aatttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatg |
305 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aatttttacttaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattacctgaatataaaacaataaaagattatgttatagttaacattcacacatg |
24327744 |
T |
|
| Q |
306 |
cagctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
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|
|
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24327745 |
cagctaaatgcctggttcatattcataccctctttcgaagcatgtcctacgttttata |
24327802 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34763077 - 34762721
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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34762978 |
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|
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112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ggaattggtattgccattcataaagcctttaataaaaaatattattatgattacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttataaaagagtgaagacaata |
34762878 |
T |
|
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212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34762877 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatatgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
34762778 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34762777 |
agctaaatgactggttcatattcataccctctgtggaagcatgtcctacgttttata |
34762721 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Original strand, 2394994 - 2395330
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| |
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2394994 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtcgatgaagatcagctctacggataagtgttatctat |
2395093 |
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agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
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| |
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|
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2395094 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaa-acaata |
2395192 |
T |
|
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212 |
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306 |
Q |
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| T |
2395193 |
atttttacctaaagaggattatgaagagaaataaatctcaaaa-----atctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
2395287 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatg |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2395288 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatg |
2395330 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23778205 - 23777838
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23778205 |
aatatcaagaatttttcaaagggaacattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgttcatgaagaccagctctacggataagtgttatccat |
23778106 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23778105 |
agaattggtattgtcattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
23778006 |
T |
|
| Q |
212 |
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294 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23778005 |
atttttacctaaagaggattatcaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataatagttaacattcacacatgcaa-attatgttatagttaat |
23777907 |
T |
|
| Q |
295 |
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363 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
23777906 |
attcacacatgcagttaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
23777838 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23865158 - 23864791
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23865158 |
aatatcaagaatttttcaaagggaacattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgttcatgaagaccagctctacggataagtgttatccat |
23865059 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23865058 |
agaattggtattgtcattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
23864959 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataa-----aaca-------atgaaagattatgttatagttaac |
294 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23864958 |
atttttacctaaagaggattatcaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataatagttaacattcacacatgcaa-attatgttatagttaat |
23864860 |
T |
|
| Q |
295 |
attcacacatgcagctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23864859 |
attcacacatgcagttaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
23864791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7480330 - 7480109
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7480330 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacagataagtattatatat |
7480231 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7480230 |
ggaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
7480131 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7480130 |
atttttacctaaagaggattat |
7480109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7480086 - 7480018
Alignment:
| Q |
295 |
attcacacatgcagctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7480086 |
attcacacatgcagctaaatgcctagttcatattcataccctctgtcgaaacatgtcctacgttttata |
7480018 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 45058783 - 45059138
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45058783 |
aatatcaagaatttttcaaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
45058882 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
45058883 |
agaattcgtattgtcattcataaagcctctgataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaaggcaata |
45058982 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgc |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45058983 |
atttttacctaaa-aggattatgaagagaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatac |
45059081 |
T |
|
| Q |
307 |
agctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45059082 |
agctaaatgcctggttcatattcataccctatgtcgaagcatgtcctacgttttata |
45059138 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 363
Target Start/End: Original strand, 15034000 - 15034331
Alignment:
| Q |
29 |
aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctatagaattggtattgccat |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15034000 |
aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatctgtgtctatgaagaccagctctacggataagtgttttctatagaattggtattgccat |
15034099 |
T |
|
| Q |
129 |
tcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaataatttttacctaaagagg |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15034100 |
tcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaatcaacaaa--------gcagtttagaaaagagtgaagacaataatttttacctaaagagg |
15034191 |
T |
|
| Q |
229 |
attatgaa-----ataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgtctggttc |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15034192 |
attatgaagagaaataaatctaaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgcctggttc |
15034291 |
T |
|
| Q |
324 |
atattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15034292 |
atattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
15034331 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 30407756 - 30407978
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30407756 |
aatatcaagaatttttcaaaggggtcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagagcaactctacggataagtgttatctat |
30407855 |
T |
|
| Q |
112 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaata |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30407856 |
agaattggtattgccattcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagagtgaagacaata |
30407955 |
T |
|
| Q |
212 |
atttttacctaaagaggattatg |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30407956 |
atttttacctaaagaggattatg |
30407978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 277 - 363
Target Start/End: Original strand, 30407972 - 30408058
Alignment:
| Q |
277 |
gattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgtctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30407972 |
gattatgttatagttaacattcacacatgcagctaaatgcctggttcatattcataccctctgtcgaagcatgtcctacgttttata |
30408058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1655 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:
Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Original strand, 307 - 576
Alignment:
| Q |
29 |
aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctatagaattggtattgccat |
128 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
307 |
aaagggaacattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctctacggataagtgttatctatggaattgatattgccat |
406 |
T |
|
| Q |
129 |
tcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaagcagtttagaaaagcgtgaagacaataatttttacctaaagagg |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
407 |
tcataaagcctctaataaaaaatattattatgactacaaaacaacaaatcagcaaaacagtttagaaaagagtgaaaacaataatttttacctaaagagg |
506 |
T |
|
| Q |
229 |
attat-----gaaataaatctcaaaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaa |
293 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
507 |
attatgaagagaaataaatctcaaaaatattatccgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaa |
576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1099198 - 1099118
Alignment:
| Q |
13 |
aatatcaagaattttt-aaagggatcattctatttgtatggctatgatgagaactcatgtgtgtccatgaagaccagctct |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1099198 |
aatatcaagaattttttaaagagaccgttctatttttatgactattatgagaactcatgtgtgtgtatcaagaccagctct |
1099118 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1099116 - 1099055
Alignment:
| Q |
247 |
aaaatattatctgaatataaaacaatgaaagattatgttatagttaacattcacacatgcag |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1099116 |
aaaaaattagctgaatatagaacaatgaaaaattaagttatagtcaacattcacacttgcag |
1099055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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