View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3533_low_1 (Length: 305)

Name: NF3533_low_1
Description: NF3533
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3533_low_1
NF3533_low_1
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (17-295)||(3712-3990)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (17-295)||(33342091-33342370)
chr6 (17-295)||(34164761-34165040)
chr6 (17-295)||(6027151-6027429)
chr6 (17-295)||(34166983-34167262)
chr6 (17-295)||(25421208-25421488)
chr6 (22-302)||(16653008-16653289)
chr6 (22-295)||(16554772-16555046)
chr6 (22-295)||(16631328-16631602)
chr6 (22-295)||(16578509-16578783)
chr6 (22-295)||(16616597-16616871)
chr6 (24-284)||(27647777-27648035)
chr6 (17-227)||(13153886-13154097)
chr6 (22-284)||(412016-412279)
chr6 (19-284)||(3072747-3073014)
chr6 (22-284)||(6097442-6097695)
chr6 (19-284)||(2171520-2171792)
chr6 (27-281)||(31404671-31404932)
chr6 (27-277)||(16452325-16452583)
chr6 (34-281)||(30834539-30834794)
chr6 (27-281)||(5406196-5406456)
chr6 (27-281)||(5410521-5410781)
chr6 (38-200)||(5413401-5413561)
chr6 (34-200)||(21588931-21589095)
chr6 (34-200)||(21593664-21593828)
chr6 (38-109)||(5409076-5409146)
chr6 (27-200)||(33160348-33160521)
chr6 (24-109)||(3808701-3808785)
chr6 (34-200)||(17762990-17763155)
chr6 (27-281)||(16568953-16569193)
chr6 (34-197)||(17758026-17758188)
chr6 (34-200)||(2972943-2973107)
chr6 (42-200)||(28137420-28137576)
chr6 (27-200)||(9183028-9183199)
chr6 (34-109)||(26830127-26830200)
chr6 (27-109)||(33211182-33211262)
chr6 (38-109)||(26800679-26800748)
chr6 (34-109)||(5043718-5043792)
chr6 (34-200)||(22424829-22424995)
chr6 (27-109)||(26954283-26954363)
chr6 (24-99)||(603082-603156)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (17-295)||(5138193-5138472)
chr4 (17-295)||(5135967-5136247)
chr4 (17-295)||(8395508-8395785)
chr4 (17-295)||(8393299-8393576)
chr4 (17-295)||(7124804-7125084)
chr4 (17-295)||(7122585-7122865)
chr4 (19-268)||(31495304-31495556)
chr4 (27-281)||(13992289-13992544)
chr4 (34-281)||(29999809-30000063)
chr4 (27-268)||(56178633-56178882)
chr4 (27-200)||(48143042-48143215)
chr4 (29-200)||(52095361-52095530)
chr4 (18-196)||(2209717-2209895)
chr4 (27-186)||(5370079-5370237)
chr4 (34-200)||(41964415-41964580)
chr4 (27-200)||(47038408-47038577)
chr4 (39-200)||(9927467-9927626)
chr4 (18-180)||(12119559-12119720)
chr4 (27-200)||(12739547-12739718)
chr4 (34-200)||(46703500-46703666)
chr4 (34-109)||(50673851-50673924)
chr4 (18-200)||(26364236-26364416)
chr4 (34-200)||(41639426-41639590)
chr4 (27-181)||(12743922-12744073)
chr4 (27-181)||(12745311-12745462)
chr4 (36-193)||(5207848-5208003)
chr4 (34-109)||(6656047-6656120)
chr4 (34-109)||(8648230-8648303)
chr4 (36-200)||(40632445-40632607)
chr4 (18-109)||(50262688-50262778)
chr4 (51-109)||(8665499-8665556)
chr4 (27-109)||(26175633-26175713)
chr4 (40-200)||(37229731-37229890)
chr4 (27-109)||(48893635-48893715)
chr4 (38-99)||(379480-379541)
chr4 (34-200)||(12073392-12073557)
chr4 (18-200)||(54883020-54883200)
chr4 (36-174)||(26699447-26699585)
chr4 (27-200)||(34570411-34570582)
chr4 (27-200)||(36463386-36463557)
chr4 (27-200)||(45687179-45687351)
chr4 (36-99)||(6542185-6542247)
chr4 (36-200)||(36994524-36994686)
chr4 (27-109)||(5429770-5429850)
chr4 (27-109)||(5871911-5871991)
chr4 (39-109)||(35662532-35662600)
chr4 (27-198)||(46147388-46147557)
chr4 (27-100)||(52467351-52467423)
chr4 (39-99)||(27416974-27417033)
chr4 (39-200)||(37740625-37740784)
chr4 (36-146)||(4588014-4588121)
chr4 (27-74)||(52082660-52082707)
chr4 (128-200)||(12747851-12747924)
chr4 (128-200)||(54200001-54200074)
chr4 (36-109)||(31474242-31474313)
chr4 (27-99)||(29254594-29254665)
chr4 (57-113)||(33089966-33090021)
chr4 (55-146)||(33989899-33989989)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (17-295)||(6594544-6594822)
chr7 (17-295)||(6592326-6592604)
chr7 (17-295)||(18388746-18389024)
chr7 (17-295)||(18392182-18392460)
chr7 (17-295)||(32060308-32060590)
chr7 (22-284)||(20343811-20344073)
chr7 (19-284)||(24789755-24790021)
chr7 (130-295)||(1562103-1562268)
chr7 (27-284)||(39731283-39731541)
chr7 (19-284)||(43504142-43504409)
chr7 (19-281)||(35853825-35854094)
chr7 (19-284)||(25766948-25767215)
chr7 (19-123)||(1560654-1560757)
chr7 (27-281)||(29990965-29991225)
chr7 (19-284)||(48408709-48408984)
chr7 (27-200)||(34310712-34310884)
chr7 (27-200)||(23555039-23555212)
chr7 (27-268)||(25615785-25616025)
chr7 (34-200)||(22269973-22270137)
chr7 (27-281)||(4178685-4178945)
chr7 (27-200)||(14069830-14070001)
chr7 (27-200)||(14379858-14380029)
chr7 (27-146)||(19502233-19502350)
chr7 (27-200)||(41317431-41317602)
chr7 (34-109)||(32358058-32358131)
chr7 (34-109)||(8359319-8359393)
chr7 (18-96)||(2390385-2390462)
chr7 (34-99)||(3259095-3259159)
chr7 (34-200)||(29608737-29608901)
chr7 (38-200)||(30024740-30024900)
chr7 (51-200)||(48491579-48491727)
chr7 (35-99)||(6432071-6432134)
chr7 (27-200)||(27347817-27347988)
chr7 (27-181)||(41649008-41649158)
chr7 (40-200)||(4253538-4253697)
chr7 (34-200)||(48599338-48599502)
chr7 (36-200)||(43864244-43864406)
chr7 (27-96)||(48489534-48489602)
chr7 (27-99)||(8153442-8153513)
chr7 (34-109)||(4508710-4508783)
chr7 (36-99)||(18396418-18396481)
chr7 (36-99)||(30814536-30814598)
chr7 (27-109)||(31732966-31733046)
chr7 (128-200)||(23343975-23344048)
chr7 (36-109)||(24525508-24525579)
chr7 (129-200)||(24525992-24526065)
chr7 (38-109)||(31518993-31519063)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (17-295)||(16546534-16546813)
chr5 (17-295)||(16544312-16544591)
chr5 (17-295)||(40379995-40380273)
chr5 (17-295)||(40382206-40382484)
chr5 (17-295)||(25078023-25078303)
chr5 (17-295)||(25135992-25136272)
chr5 (19-295)||(10593161-10593438)
chr5 (24-288)||(22536283-22536545)
chr5 (19-284)||(29751148-29751414)
chr5 (19-284)||(29720278-29720544)
chr5 (19-284)||(29722438-29722704)
chr5 (22-284)||(9789215-9789478)
chr5 (22-284)||(16409389-16409652)
chr5 (22-284)||(18441639-18441902)
chr5 (22-284)||(26177797-26178059)
chr5 (22-284)||(26170688-26170939)
chr5 (27-281)||(25412672-25412932)
chr5 (27-281)||(13342971-13343232)
chr5 (27-281)||(30182499-30182760)
chr5 (27-281)||(36074039-36074302)
chr5 (27-181)||(37439161-37439313)
chr5 (29-268)||(13239674-13239921)
chr5 (34-200)||(213465-213630)
chr5 (34-200)||(40147261-40147425)
chr5 (29-200)||(28278316-28278485)
chr5 (27-200)||(32636824-32636995)
chr5 (34-109)||(5058136-5058209)
chr5 (54-200)||(13695713-13695859)
chr5 (27-200)||(42428427-42428598)
chr5 (36-200)||(13488203-13488365)
chr5 (38-281)||(30682930-30683178)
chr5 (27-99)||(19806463-19806534)
chr5 (34-109)||(27637616-27637689)
chr5 (52-99)||(16640961-16641008)
chr5 (36-109)||(16452171-16452242)
chr5 (36-109)||(28750661-28750732)
chr5 (36-96)||(4160702-4160762)
chr5 (36-281)||(31182883-31183133)
chr5 (34-109)||(27015614-27015687)
chr5 (27-109)||(533860-533940)
chr5 (27-109)||(8565943-8566023)
chr5 (18-146)||(316817-316943)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (17-295)||(4598509-4598788)
chr3 (17-295)||(10056122-10056401)
chr3 (17-295)||(10058344-10058623)
chr3 (17-295)||(10060566-10060845)
chr3 (17-295)||(10062788-10063067)
chr3 (17-295)||(10065010-10065289)
chr3 (17-295)||(10211298-10211577)
chr3 (17-295)||(4600730-4601009)
chr3 (17-295)||(10209078-10209357)
chr3 (17-295)||(3617352-3617632)
chr3 (22-295)||(25637331-25637604)
chr3 (22-284)||(6716414-6716676)
chr3 (22-284)||(54635039-54635301)
chr3 (24-284)||(45282897-45283161)
chr3 (97-295)||(10067232-10067431)
chr3 (19-284)||(801005-801272)
chr3 (19-235)||(7779992-7780208)
chr3 (166-284)||(6718598-6718718)
chr3 (27-284)||(23200134-23200398)
chr3 (27-284)||(23197935-23198199)
chr3 (27-281)||(45095075-45095335)
chr3 (19-281)||(9636114-9636385)
chr3 (27-281)||(5258140-5258402)
chr3 (27-281)||(5260319-5260581)
chr3 (27-197)||(19683885-19684054)
chr3 (27-200)||(7762265-7762437)
chr3 (27-200)||(37408458-37408630)
chr3 (27-281)||(9581193-9581454)
chr3 (27-189)||(7764476-7764636)
chr3 (27-200)||(34491212-34491383)
chr3 (17-70)||(10067435-10067488)
chr3 (36-200)||(4569952-4570115)
chr3 (18-200)||(49199456-49199638)
chr3 (18-200)||(43401788-43401970)
chr3 (24-109)||(43403737-43403821)
chr3 (27-200)||(29196383-29196555)
chr3 (27-197)||(39153358-39153526)
chr3 (34-109)||(6095603-6095676)
chr3 (18-196)||(30236129-30236305)
chr3 (27-200)||(40734498-40734669)
chr3 (34-200)||(41819526-41819691)
chr3 (27-200)||(44331545-44331716)
chr3 (18-97)||(40913395-40913473)
chr3 (34-109)||(54593795-54593868)
chr3 (27-109)||(16499120-16499200)
chr3 (38-197)||(22835010-22835167)
chr3 (27-109)||(40735474-40735554)
chr3 (39-98)||(27305719-27305777)
chr3 (39-198)||(31314447-31314604)
chr3 (51-197)||(760850-760995)
chr3 (36-109)||(47304342-47304413)
chr3 (38-146)||(53921511-53921616)
chr3 (34-99)||(55301975-55302040)
chr3 (27-281)||(29682269-29682530)
chr3 (27-181)||(29813083-29813234)
chr3 (40-99)||(46173457-46173515)
chr3 (128-200)||(5236551-5236624)
chr3 (51-109)||(29810959-29811016)
chr3 (42-99)||(46860574-46860631)
chr3 (128-200)||(5433971-5434046)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (17-295)||(12647372-12647650)
chr2 (19-284)||(6266605-6266871)
chr2 (22-221)||(13656023-13656221)
chr2 (22-284)||(32289479-32289741)
chr2 (27-284)||(4484326-4484592)
chr2 (27-281)||(45099665-45099926)
chr2 (27-284)||(30833252-30833518)
chr2 (27-281)||(4503129-4503390)
chr2 (27-281)||(36205661-36205921)
chr2 (27-281)||(5723252-5723512)
chr2 (27-200)||(2334414-2334586)
chr2 (27-109)||(36988072-36988153)
chr2 (27-181)||(6595002-6595154)
chr2 (36-195)||(33648176-33648335)
chr2 (34-200)||(45726929-45727093)
chr2 (27-268)||(34139767-34140017)
chr2 (36-200)||(29867869-29868031)
chr2 (34-109)||(35446888-35446961)
chr2 (27-182)||(723741-723893)
chr2 (39-146)||(14633834-14633939)
chr2 (29-200)||(24398055-24398228)
chr2 (34-109)||(1631736-1631809)
chr2 (27-109)||(17057366-17057446)
chr2 (27-109)||(17085349-17085429)
chr2 (27-271)||(38312159-38312411)
chr2 (27-99)||(39284936-39285007)
chr2 (51-281)||(42362262-42362500)
chr2 (27-97)||(11151588-11151657)
chr2 (27-109)||(36318006-36318086)
chr2 (27-109)||(36773653-36773733)
chr2 (36-109)||(17490154-17490225)
chr2 (27-99)||(17450678-17450748)
chr2 (127-200)||(13121769-13121843)
chr2 (42-94)||(28672036-28672088)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (17-295)||(44203536-44203814)
chr1 (19-295)||(9036320-9036596)
chr1 (19-284)||(21053872-21054138)
chr1 (19-284)||(40282291-40282557)
chr1 (19-284)||(9987116-9987381)
chr1 (19-284)||(20622225-20622492)
chr1 (27-201)||(13316348-13316521)
chr1 (27-284)||(51765302-51765569)
chr1 (27-197)||(8550783-8550952)
chr1 (27-281)||(20762582-20762844)
chr1 (27-200)||(3189330-3189502)
chr1 (27-200)||(3198147-3198319)
chr1 (27-200)||(3206986-3207158)
chr1 (34-200)||(37168297-37168462)
chr1 (34-200)||(29136247-29136412)
chr1 (18-109)||(42297962-42298052)
chr1 (34-200)||(13547093-13547257)
chr1 (34-109)||(13549004-13549077)
chr1 (36-200)||(44455160-44455322)
chr1 (34-200)||(47255343-47255508)
chr1 (27-200)||(28220223-28220394)
chr1 (34-200)||(7482234-7482399)
chr1 (34-109)||(11348789-11348862)
chr1 (27-197)||(834164-834332)
chr1 (27-200)||(3156865-3157036)
chr1 (27-146)||(4552634-4552750)
chr1 (34-109)||(28242396-28242469)
chr1 (27-181)||(28265551-28265702)
chr1 (34-109)||(31925711-31925784)
chr1 (18-109)||(37033059-37033149)
chr1 (34-200)||(47115171-47115337)
chr1 (27-109)||(13659333-13659413)
chr1 (34-99)||(193711-193775)
chr1 (27-200)||(49918350-49918521)
chr1 (27-109)||(28223418-28223498)
chr1 (35-109)||(34603668-34603740)
chr1 (27-109)||(45644351-45644431)
chr1 (27-109)||(46065009-46065089)
chr1 (55-146)||(22079371-22079461)
chr1 (27-99)||(31659338-31659409)
chr1 (59-146)||(5459961-5460046)
chr1 (51-109)||(23555286-23555342)
chr1 (36-109)||(19754586-19754657)
chr1 (34-99)||(37876770-37876834)
chr1 (129-181)||(6378603-6378655)
chr1 (27-99)||(50167172-50167243)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (17-295)||(15290427-15290706)
chr8 (17-295)||(15470796-15471075)
chr8 (17-295)||(42575310-42575589)
chr8 (22-288)||(25689865-25690131)
chr8 (22-284)||(3439418-3439680)
chr8 (19-284)||(2627649-2627916)
chr8 (27-281)||(17982563-17982825)
chr8 (27-281)||(34254327-34254586)
chr8 (27-281)||(31218167-31218429)
chr8 (27-281)||(34256503-34256762)
chr8 (27-281)||(44303764-44304027)
chr8 (27-200)||(42498193-42498366)
chr8 (28-181)||(1746216-1746366)
chr8 (27-200)||(19945355-19945529)
chr8 (34-200)||(42434995-42435159)
chr8 (27-200)||(15212786-15212957)
chr8 (27-198)||(40321082-40321251)
chr8 (34-200)||(4283524-4283688)
chr8 (27-200)||(33352150-33352321)
chr8 (27-200)||(43036423-43036594)
chr8 (34-109)||(18655491-18655564)
chr8 (27-109)||(4743211-4743291)
chr8 (18-99)||(10930187-10930267)
chr8 (27-200)||(27811278-27811449)
chr8 (51-110)||(1345391-1345449)
chr8 (36-99)||(40221845-40221907)
chr8 (27-109)||(3303667-3303747)
chr8 (27-109)||(5689362-5689442)
chr8 (27-182)||(12702631-12702783)
chr8 (27-146)||(6599027-6599143)
chr8 (27-146)||(6674480-6674596)
chr8 (57-109)||(40328871-40328922)
chr8 (36-99)||(4733806-4733868)
chr8 (161-200)||(8965820-8965859)
chr8 (37-146)||(41366622-41366727)
chr8 (34-99)||(11384085-11384149)
chr8 (37-109)||(18141911-18141981)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (17-295)||(2590-2868)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (18-295)||(6177-6454)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (29-281)||(434443-434703)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (27-284)||(11157-11423)
scaffold0491 (27-202)||(8731-8907)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (27-281)||(827-1087)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (19-200)||(11557-11737)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (27-200)||(114602-114774)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (17-63)||(1-47)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (34-181)||(18007-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (36-99)||(10589-10651)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (27-109)||(149094-149174)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (34-109)||(7418-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (36-109)||(20421-20492)


Alignment Details
Target: scaffold0674 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 3712 - 3990
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3712 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 3811  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3812 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 3911  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3912 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 33342091 - 33342370
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342091 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 33342190  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342191 ggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 33342290  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342291 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34165040 - 34164761
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165040 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 34164941  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164940 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 34164841  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164840 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6027429 - 6027151
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027429 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 6027330  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027329 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 6027230  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027229 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34167262 - 34166983
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34167262 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaa 34167163  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167162 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 34167063  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167062 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25421488 - 25421208
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421488 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 25421389  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421388 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 25421289  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421288 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16653289 - 16653008
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16653289 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 16653191  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16653190 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 16653091  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttgcttctcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16653090 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttgattctcc 16653008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16555046 - 16554772
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16555046 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 16554948  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16554947 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 16554848  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16554847 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16631602 - 16631328
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16631602 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 16631504  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16631503 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 16631404  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16631403 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 16578509 - 16578783
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16578509 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 16578607  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16578608 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 16578707  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16578708 tacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16616871 - 16616597
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16616871 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 16616773  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16616772 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 16616673  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16616672 tacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27648035 - 27647777
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27648035 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 27647938  T
Q  124 aagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctaca 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647937 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctaca 27647838  T
Q  224 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647837 tggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13154097 - 13153886
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154097 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 13153998  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgac-atgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153997 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 13153898  T
Q  216 tctctacaaggt 227  Q
    ||||||||||||    
T  13153897 tctctacaaggt 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 412279 - 412016
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  412279 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 412182  T
Q  122 acaaga--ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttct 216  Q
    |||| |   |||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  412181 acaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 412083  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412082 ctcttcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 3072747 - 3073014
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  3072747 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaga 3072844  T
Q  119 aatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--t 213  Q
     |||||| |   |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3072845 gatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 3072943  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072944 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 6097442 - 6097695
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        
T  6097442 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag---- 6097535  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctct 218  Q
           |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  6097536 ------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcact 6097628  T
Q  219 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097629 caccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 2171520 - 2171792
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  2171520 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaaga 2171616  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaa 209  Q
     ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||    
T  2171617 gatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 2171715  T
Q  210 tga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171716 tgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 31404671 - 31404932
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  31404671 agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 31404767  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  31404768 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttc 31404866  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404867 actcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Original strand, 16452325 - 16452583
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  ||  |||    
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatatgaaag 16452423  T
Q  127 aggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 214  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  16452424 -ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 16452521  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 277  Q
    | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452522 cactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 30834539 - 30834794
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| | |||||    
T  30834539 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaagggtta 30834635  T
Q  133 caagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctct 220  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||     
T  30834636 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 30834734  T
Q  221 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834735 ccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 5406196 - 5406456
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  5406196 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5406292  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5406293 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5406391  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406392 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 5410521 - 5410781
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  5410521 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5410617  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5410618 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5410716  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410717 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413561
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5413497  T
Q  137 aaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||| |||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5413498 aaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21589095 - 21588931
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  21589095 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21589000  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588999 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21593828 - 21593664
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  21593828 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21593733  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593732 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409146
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5409146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 33160348 - 33160521
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  33160348 agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 33160444  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160445 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3808785
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 3808785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17763155 - 17762990
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||  | ||||    
T  17763155 tcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaaag--atacaaatgagtta 17763059  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568953
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaa------------ 16569109  T
Q  127 aggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---a 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||        
T  16569108 aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttacc 16569012  T
Q  222 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569011 caaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17758188 - 17758026
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  17758188 tcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 2972943 - 2973107
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  2972943 tcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 2973038  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973039 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137576
Alignment:
Q  42 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaat 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaat 28137515  T
Q  141 tagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137516 tagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183199
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 9183123  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183124 tgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 26830127 - 26830200
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26830127 tcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26830200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211262
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctt 33211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800679
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 26800679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5043792 - 5043718
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5043792 tcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctt 5043718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 22424829 - 22424995
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga---ggt 130  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||| |   |||    
T  22424829 tcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  131 tacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954363
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26954363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603156
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaa 603156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5138472 - 5138193
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138472 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 5138373  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138372 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 5138273  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138272 tctctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5136247 - 5135967
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136247 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 5136148  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgac-atgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136147 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 5136048  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136047 tctctacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8395785 - 8395508
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8395785 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaa 8395687  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395686 gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 8395587  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395586 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8393576 - 8393299
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8393576 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaa 8393478  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393477 gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 8393378  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8393377 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7125084 - 7124804
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125084 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 7124985  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124984 ggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 7124885  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124884 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7122865 - 7122585
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122865 aaacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 7122766  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122765 ggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 7122666  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122665 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 31495304 - 31495556
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||     
T  31495304 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatgagttc-ttacaaaaga 31495401  T
Q  119 aatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--t 213  Q
     |||||| |   |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31495402 gatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 31495500  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31495501 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 13992289 - 13992544
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||     
T  13992289 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaagag--atacaaa 13992384  T
Q  127 ag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctct 220  Q
    || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  13992385 agagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactca 13992483  T
Q  221 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Original strand, 29999809 - 30000063
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| || ||||    
T  29999809 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaaagatacaaaagagtta 29999906  T
Q  133 caagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||| ||  ||| |||  |    
T  29999907 caagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacc 30000005  T
Q  223 aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000006 aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 56178633 - 56178882
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  56178633 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 56178729  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 214  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  56178730 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 56178828  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 268  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178829 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48143215 - 48143042
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  ||||||     
T  48143215 agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttatgaagag--atacaaa 48143119  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143118 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095530
Alignment:
Q  29 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aaga 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  |||| ||      
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttc-ttac-aaagagatacaaatg 52095456  T
Q  128 ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095457 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2209895 - 2209717
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2209895 aacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 2209799  T
Q  118 gaatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 196  Q
      |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209798 agatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370237
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5370175  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc--ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 186  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370176 agggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |  ||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaaatgggtt 41964485  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||| ||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964484 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038577
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||  | ||||||     
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgag-tccttacaaacag-atacaaa 47038503  T
Q  127 aggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
     | |||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038504 tgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Original strand, 9927467 - 9927626
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  ||||||||||    
T  9927467 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 9927562  T
Q  138 aattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927563 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12119720 - 12119559
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12119720 aacaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttac-aaag 12119624  T
Q  118 gaatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctac 180  Q
      |||||| | |||||||||||||||||||  | | |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119623 agatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739718
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||| ||    
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-atacaaatag-atacaaa 12739642  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 200  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739643 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46703666 - 46703500
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  46703666 tcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 50673851 - 50673924
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50673851 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 50673924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26364416 - 26364236
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  26364416 aacaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-taatgagttc-ttac-aaag 26364321  T
Q  118 gaatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      ||||||  | ||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364320 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41639590 - 41639426
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | |||| ||  |||||    
T  41639590 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttc-ttacaaatag-atacaaatgggtta 41639495  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  | | |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639494 caagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 12744017  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744018 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 12745406  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745407 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 5207848 - 5208003
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagga-atacaagaggttaca 134  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||| |||| ||    
T  5207848 acccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaatagatatacaag-ggttgca 5207943  T
Q  135 agaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 193  Q
    | |||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207944 ataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6656120 - 6656047
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6656120 tcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 6656047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8648303 - 8648230
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8648303 tcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctt 8648230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632445
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||||    
T  40632607 acccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttaca 40632512  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632511 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 50262688 - 50262778
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  50262688 aacaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttctt 50262778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665499
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8665499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175713
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26175713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Original strand, 37229731 - 37229890
Alignment:
Q  40 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaagaggttacaagaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| ||  |||||||| ||    
T  37229731 agttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttacaaagagatataaaaagggttacaacaa 37229827  T
Q  139 attagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||| || || ||| | |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229828 atttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893715
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 48893715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379480
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 379480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12073557 - 12073392
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  12073557 tcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||| ||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 54883200 - 54883020
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54883200 aacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 54883105  T
Q  118 gaatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||| ||  |||||||||||||||||||  ||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883104 agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 174
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 134  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   |||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttac-aaagagatacaaaagagttaca 26699544  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaat 174  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| | ||||||||||||||    
T  26699545 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 34570411 - 34570582
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaa- 125  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  34570411 agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaat 34570506  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570507 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||  |||| ||    
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 36463481  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463482 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||     
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatag-atacaaa 45687274  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     | |||| ||||||||||| |||||| | |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45687275 tgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 6542185 - 6542247
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  6542185 acccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 6542247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36994686 - 36994524
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||    
T  36994686 acccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 36994591  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994590 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429770
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5429770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871911
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttctt 5871911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662532
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 35662532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||     
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 46147483  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 198  Q
     | ||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147484 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467423
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa 52467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417033
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27417033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740625
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  ||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 37740689  T
Q  138 aattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  37740688 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4588121 - 4588014
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttaca 134  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||||    
T  4588121 acccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttaca 4588026  T
Q  135 agaaattagctt 146  Q
    ||||||||||||    
T  4588025 agaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082707
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagag 74  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagag 52082707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 12747851 - 12747924
Alignment:
Q  128 ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747851 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 54200001 - 54200074
Alignment:
Q  128 ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54200001 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31474313 - 31474242
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31474313 acccagttcggtcc-aacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatc-aatgagttctt 31474242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254594
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  29254665 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaa 29254594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089966
Alignment:
Q  57 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttaca 113  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttaca 33089966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  55 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttacaagaaattagctt 146  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttac-aaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 6594544 - 6594822
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594544 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 6594643  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594644 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 6594743  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594744 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 6592326 - 6592604
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592326 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 6592425  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592426 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 6592525  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592526 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 18388746 - 18389024
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388746 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 18388845  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388846 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 18388945  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388946 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 18392182 - 18392460
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392182 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 18392281  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392282 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 18392381  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392382 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 32060308 - 32060590
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060308 aaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 32060407  T
Q  117 --ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 214  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060408 aggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 32060507  T
Q  215 ctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32060508 ctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccctttg 32060590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20344073 - 20343811
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20344073 caaagagattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 20343976  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20343975 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 20343876  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343875 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24790021 - 24789755
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24790021 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtt-tttacaaaagg 24789924  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  24789923 gatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttc 24789824  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789823 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  130 ttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtgt 1562202  T
Q  230 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562203 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39731541 - 39731283
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  39731541 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaa 39731444  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagct-tgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 222  Q
    || ||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  39731443 agagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 39731345  T
Q  223 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731344 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 43504142 - 43504409
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  43504142 acaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaga 43504239  T
Q  119 aatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--t 213  Q
     |||||| |   |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  43504240 gatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattt 43504338  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504339 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35854094 - 35853825
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  35854094 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaaga 35853998  T
Q  119 aatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactca 208  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||    
T  35853997 gatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 35853899  T
Q  209 atga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    ||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853898 atgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 25766948 - 25767215
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||     
T  25766948 acaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttcaaaagaga 25767046  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc----accaagacactcaatga 212  Q
     | | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    | |||||||||||||||    
T  25767047 tacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatga 25767145  T
Q  213 --ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
      ||| |||  |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767146 ttttcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Original strand, 1560654 - 1560757
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1560654 acaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagg 1560752  T
Q  119 aatac 123  Q
     ||||    
T  1560753 gatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990965
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||  ||||||     
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatt--agaaagagatacaaa 29991129  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  29991128 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 29991030  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991029 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48408984 - 48408709
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||     
T  48408984 acaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt-caaaaga 48408887  T
Q  119 aatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactc 207  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||    
T  48408886 gatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 48408788  T
Q  208 aatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408787 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||     
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaaga-tacaaa 34310808  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     | ||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310809 tgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23555039
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagagg--tacaa 23555117  T
Q  126 gag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 200  Q
     || ||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555116 aagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25616025 - 25615785
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  25616025 agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaatg-atacaaa 25615929  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--- 220  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||       
T  25615928 tgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatgattttctctcac 25615833  T
Q  221 acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 268  Q
     |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615832 ccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22270137 - 22269973
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  22270137 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 22270042  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270041 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4178945 - 4178685
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    ||||  ||||||     
T  4178945 agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 4178850  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 214  Q
    | ||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  4178849 agggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 4178751  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178750 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070001
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 14069925  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069926 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380029
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 14379953  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379954 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19502350 - 19502233
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  19502350 agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 19502254  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt 146  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19502253 agagttacaagaaattagctt 19502233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 41317526  T
Q  127 agg-ttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 200  Q
     || ||||||||||||||| |||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317527 tggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 32358058 - 32358131
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32358058 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 32358131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 8359319 - 8359393
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8359319 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8359393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2390462 - 2390385
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 96  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2390462 aacaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 2390385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3259159 - 3259095
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3259159 tcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 3259095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29608901 - 29608737
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  29608901 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 29608806  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608805 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024900
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaag 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaag 30024835  T
Q  137 aaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024836 aaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||  |||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttt--caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 48491631  T
Q  149 catgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491630 caagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6432071
Alignment:
Q  35 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaa 6432071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27347988 - 27347817
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  27347988 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 27347893  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347892 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649158
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 41649103  T
Q  126 gaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
      ||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649104 tgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Original strand, 4253538 - 4253697
Alignment:
Q  40 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagga-atacaagaggttacaagaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||  || ||| ||| ||||||| |||    
T  4253538 agttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttctttccaaagagatataaaag-ggttacatgaa 4253634  T
Q  139 attagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||| | || | |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253635 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 48599338 - 48599502
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||  ||||||  | ||||    
T  48599338 tcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt--ccaaagagatacaaatgagtta 48599433  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599434 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43864406 - 43864244
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  43864406 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttaca 43864311  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     |||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864310 ggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489534
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 96  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 48489534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153442
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8153442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 4508710 - 4508783
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  4508710 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttctt 4508783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396418
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30814598 - 30814536
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  30814598 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733046
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttctt 31733046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  128 ggttacaagaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525579
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 24525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  129 gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518993
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttctt 31518993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16546813 - 16546534
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546813 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 16546714  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546713 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattc 16546614  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546613 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16544591 - 16544312
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544591 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 16544492  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544491 gggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 16544392  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544391 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40380273 - 40379995
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380273 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 40380174  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380173 gggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 40380074  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380073 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40382484 - 40382206
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382484 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 40382385  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382384 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 40382285  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382284 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25078303 - 25078023
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078303 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 25078204  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078203 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 25078104  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078103 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25136272 - 25135992
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136272 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 25136173  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136172 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 25136073  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136072 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10593438 - 10593161
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10593438 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagg 10593340  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 218  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593339 gatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 10593240  T
Q  219 c--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10593239 ctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Original strand, 22536283 - 22536545
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22536283 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 22536380  T
Q  124 aagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctaca 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22536381 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctgca 22536480  T
Q  224 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536481 gggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 29751148 - 29751414
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29751148 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 29751245  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29751246 gatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 29751345  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751346 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29720544 - 29720278
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29720544 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 29720447  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29720446 gatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 29720347  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720346 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29722704 - 29722438
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29722704 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 29722607  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29722606 gatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 29722507  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722506 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 9789215 - 9789478
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  9789215 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 9789312  T
Q  122 acaagag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  9789313 acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcac 9789411  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789412 tcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16409652 - 16409389
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  16409652 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 16409555  T
Q  122 acaagag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16409554 acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcac 16409456  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409455 tcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 18441639 - 18441902
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  18441639 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 18441736  T
Q  122 acaagag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  18441737 acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcac 18441835  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441836 tcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26178059 - 26177797
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  26178059 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 26177962  T
Q  122 acaagag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  26177961 acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcac 26177864  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177863 tcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26170939 - 26170688
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        
T  26170939 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag---- 26170846  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctct 218  Q
           |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  26170845 ------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcact 26170754  T
Q  219 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||    
T  26170753 caccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagag 26170688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25412932 - 25412672
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  25412932 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 25412836  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  25412835 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 25412737  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412736 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  ||||||     
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 13343137  T
Q  127 agg-ttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  13343136 aggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 13343038  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343037 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30182760 - 30182499
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||| ||     
T  30182760 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatagaaa 30182664  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 214  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  30182663 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 30182565  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182564 cactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 36074039 - 36074302
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  ||||||     
T  36074039 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 36074134  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga- 212  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       |||||||||||||||     
T  36074135 agagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 36074233  T
Q  213 -ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074234 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 37439217  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  37439216 agagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13239921 - 13239674
Alignment:
Q  29 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||    
T  13239921 attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaag 13239825  T
Q  129 -gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttct 216  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||     
T  13239824 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 13239726  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 268  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239725 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 213630 - 213465
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  213630 tcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  133 caagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||| || ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40147425 - 40147261
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  40147425 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 40147330  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147329 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  29 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aaga 127  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||| ||      
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatg 28278390  T
Q  128 ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278389 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32636995 - 32636824
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||    
T  32636995 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 32636900  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636899 tgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5058209 - 5058136
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5058209 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5058136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  54 ttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-cat 151  Q
    |||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||||||||| || |||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaagaga-tacaaaagggttacaagaaattagctttaacaa 13695810  T
Q  152 gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    | |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695811 gctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 42428522  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428523 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 13488270  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488269 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 281
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagt-tctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaa 30683026  T
Q  136 gaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaa 224  Q
    |||||||||||  ||| ||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 30683122  T
Q  225 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683123 ggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 27637616 - 27637689
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27637616 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 27637689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641008
Alignment:
Q  52 acttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 16641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16452242 - 16452171
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16452242 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctt 16452171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750732
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 28750732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 96  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31183133 - 31182883
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  31183133 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctt-acaaaggga-tacaaatggttacaa 31183038  T
Q  136 gaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ac--aa 224  Q
    ||||||| |||  |||   |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || || ||  ||    
T  31183037 gaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaa 31182939  T
Q  225 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182938 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27015687 - 27015614
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  27015687 tcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttctt 27015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533860
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttctt 533860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566023
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8566023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 316943 - 316817
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  | |||| ||||| |||||| |||||||||||||||      
T  316943 aacacaaaga-attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaa-tgagttctttacaaaga 316846  T
Q  118 gaatacaagagg-ttacaagaaattagctt 146  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  316845 ga-tacaaaaggattacaagaaattagctt 316817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 4598509 - 4598788
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598509 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 4598608  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598609 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 4598708  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598709 tctctacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10056401 - 10056122
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056401 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10056302  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056301 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10056202  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056201 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10058623 - 10058344
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058623 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10058524  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058523 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10058424  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058423 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10060845 - 10060566
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060845 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10060746  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060745 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10060646  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060645 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10063067 - 10062788
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063067 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10062968  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062967 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10062868  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062867 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10065289 - 10065010
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065289 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10065190  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065189 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10065090  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065089 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10211577 - 10211298
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211577 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10211478  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211477 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10211378  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10211377 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 4600730 - 4601009
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600730 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 4600829  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600830 ggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 4600929  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600930 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10209357 - 10209078
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209357 aaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 10209258  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209257 ggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 10209158  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209157 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3617632 - 3617352
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617632 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 3617533  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617532 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 3617433  T
Q  217 ctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617432 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25637604 - 25637331
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25637604 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggat 25637505  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637504 acaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 25637405  T
Q  222 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637404 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6716676 - 6716414
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6716676 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 6716579  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6716578 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 6716479  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716478 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54635301 - 54635039
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  54635301 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 54635204  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  54635203 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 54635104  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635103 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45283161 - 45282897
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttt--acaaaaggaat 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||    
T  45283161 aagagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggat 45283062  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45283061 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 45282962  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282961 tgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  97 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  196 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10067232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 801272 - 801005
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  801272 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaga 801175  T
Q  119 aatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--t 213  Q
     |||||| |   |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  801174 gatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 801076  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801075 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 7779992 - 7780208
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  7779992 acaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaga 7780089  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttc 215  Q
     |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  7780090 gatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttc 7780188  T
Q  216 tctctacaaggtgtttccca 235  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  7780189 tctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  166 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  264 aaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 23200134 - 23200398
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||     
T  23200134 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaa 23200230  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  |||    
T  23200231 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 23200329  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200330 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 23197935 - 23198199
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||     
T  23197935 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaa 23198031  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  |||    
T  23198032 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 23198130  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198131 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095075
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 45095239  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  45095238 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 45095140  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095139 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 281
Target Start/End: Original strand, 9636114 - 9636385
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  9636114 acaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag 9636211  T
Q  119 aatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctc-------accaagacactc 207  Q
     |||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||       ||||||||||||    
T  9636212 -atacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactc 9636309  T
Q  208 aatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    |||||  ||| |||  |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636310 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 5258140 - 5258402
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||     
T  5258140 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 5258236  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  5258237 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 5258335  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258336 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 5260319 - 5260581
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||     
T  5260319 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 5260415  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||  |    
T  5260416 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattt 5260514  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260515 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 19683885 - 19684054
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  19683885 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 19683981  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683982 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 7762341  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762340 agagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37408630 - 37408458
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  37408630 agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 37408534  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408533 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581193
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 9581358  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 217  Q
      ||||| |||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||    
T  9581357 tgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttc 9581259  T
Q  218 tct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581258 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7764636 - 7764476
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  7764636 agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 7764540  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 189  Q
    || |||||||||||||||||| | || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7764539 agagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 34491288  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     | ||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491287 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 10067488 - 10067435
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067488 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4570115 - 4569952
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  4570115 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 4570019  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||  | | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570018 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 49199456 - 49199638
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  49199456 aacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 49199552  T
Q  118 gaatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199553 agatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 43401788 - 43401970
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-a 116  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  43401788 aacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaga 43401885  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |  | | ||   ||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401886 gataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43403821
Alignment:
Q  24 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttctt 43403821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 29196478  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||| |||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196479 tgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||     
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctt--ataaagggatacaaa 39153453  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
     | ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153454 tgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 6095603 - 6095676
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095603 tcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 6095676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30236305 - 30236129
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    ||||| |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30236305 aacaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 30236210  T
Q  118 gaatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 196  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236209 agatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 40734574  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     | ||||||||||||||| ||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734573 tgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 41819526 - 41819691
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  41819526 tcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||     
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaa 44331621  T
Q  127 agg-ttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     || |||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331620 tggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 40913473 - 40913395
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 97  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  40913473 aacaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 40913395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 54593868 - 54593795
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54593868 tcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 54593795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16499120
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 16499120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaag 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaag 22835105  T
Q  137 aaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
    ||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835106 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735474
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 40735474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatca 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31314604 - 31314447
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||  ||||||||||    
T  31314604 cagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaaag-atacaaatgggttacaaga 31314509  T
Q  138 aattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 198  Q
    |||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314508 aattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 760995 - 760850
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  760995 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 760899  T
Q  149 catgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
    || | |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  760898 caagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 47304413 - 47304342
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47304413 acccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 47304342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921616
Alignment:
Q  38 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaag 136  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | ||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaatga-tacaaatgagttacaag 53921606  T
Q  137 aaattagctt 146  Q
    ||||||||||    
T  53921607 aaattagctt 53921616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 55301975 - 55302040
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55301975 tcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 55302040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682269
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 29682435  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 216  Q
      ||| |||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  29682434 tgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgatttt 29682336  T
Q  217 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682335 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813083
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||    ||     
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttacaaagagatgcaaat 29813138  T
Q  127 aggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
     |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173457
Alignment:
Q  40 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 46173457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 5236551 - 5236624
Alignment:
Q  128 ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236551 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810959
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 29810959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860574
Alignment:
Q  42 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaa 46860574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  128 ggttacaagaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 12647372 - 12647650
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647372 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 12647471  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647472 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 12647571  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647572 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6266871 - 6266605
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6266871 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 6266774  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6266773 gatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 6266674  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266673 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 13656023 - 13656221
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13656023 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggat 13656121  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656122 acaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 13656221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32289741 - 32289479
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  32289741 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttc-ttacaaaagagat 32289644  T
Q  122 acaagag-gttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctc 217  Q
    |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  32289643 acaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcac 32289546  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289545 tcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 4484326 - 4484592
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  4484326 agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaa 4484423  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 214  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||      
T  4484424 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgattta 4484522  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484523 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45099926 - 45099665
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  ||||||     
T  45099926 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 45099831  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  45099830 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 45099732  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099731 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30833518 - 30833252
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  30833518 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaa 30833421  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 214  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |||||||||||||||||      
T  30833420 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattta 30833322  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    | |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30833321 cactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagag 30833252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 4503129 - 4503390
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  ||||||     
T  4503129 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 4503224  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 213  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||       | |||||||||||||||  |    
T  4503225 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattt 4503323  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503324 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 36205661 - 36205921
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || || |||||||||||    ||||  ||||||     
T  36205661 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt---caaagagatacaaa 36205756  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 214  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  36205757 agagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 36205855  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205856 cactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723512
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 5723348  T
Q  126 gaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5723349 aaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5723447  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723448 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334586
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 2334510  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 200  Q
    || ||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2334511 agagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa-cccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 36988072 - 36988153
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36988072 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 36988153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 6595002 - 6595154
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  || |  ||     
T  6595002 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaagagattcaaaa 6595099  T
Q  127 aggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
     |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595100 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttaca 134  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttac-aaagaaatacaaaagggttaca 33648238  T
Q  135 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 195  Q
     |||||||||||  ||| | |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648237 ggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45727093 - 45726929
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  45727093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 45726998  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726997 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34140017
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaataca-a 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagggatacata 34139863  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 216  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  34139864 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatttt 34139962  T
Q  217 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 268  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139963 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867869
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttaca 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||  || |||||    
T  29868031 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaagaga-tacaaatgggttaca 29867936  T
Q  135 agaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867935 agaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 35446888 - 35446961
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35446888 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 35446961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Original strand, 723741 - 723893
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 723836  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 182  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723837 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Original strand, 14633834 - 14633939
Alignment:
Q  39 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  14633834 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttc-ttacaaaagggatacaaatgggttacaaga 14633930  T
Q  138 aattagctt 146  Q
    |||||||||    
T  14633931 aattagctt 14633939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  29 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga- 127  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| |     
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaag 24398131  T
Q  128 ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398130 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 1631736 - 1631809
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1631736 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttctt 1631809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057446
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085429
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17085429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312159
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||  |||| ||    
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatc-ttac-aaagagatacaaa 38312316  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 216  Q
      |||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  38312315 tgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 38312217  T
Q  217 ctct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 271  Q
    | ||   ||||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38312216 cactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaacc 38312159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagctt-ga 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||  |    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 42362404  T
Q  149 catgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatg 237  Q
    || | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||    
T  42362403 caagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatg 42362305  T
Q  238 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362304 tttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151657
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 97  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatc 11151657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318086
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 36318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773653
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 36773653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 17490154 - 17490225
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17490154 acccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttctt 17490225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13121843 - 13121769
Alignment:
Q  127 aggttacaagaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||| | || | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121843 aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  42 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccact 94  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44203814 - 44203536
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203814 aaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 44203715  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203714 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 44203615  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203614 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9036596 - 9036320
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9036596 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 9036499  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 218  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036498 gatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 9036399  T
Q  219 c--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9036398 ctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21054138 - 21053872
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21054138 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagg 21054041  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttc 215  Q
     |||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  21054040 gatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttt 21053941  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053940 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40282557 - 40282291
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40282557 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagg 40282460  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40282459 gatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 40282360  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282359 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9987381 - 9987116
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  9987381 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttg-caaaagg 9987284  T
Q  119 aatacaagaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--c 215  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9987283 gatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 9987185  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987184 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 20622225 - 20622492
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-tacaaaag 117  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  20622225 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaag 20622323  T
Q  118 gaatacaagaggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--tt 214  Q
    | |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  20622324 ggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgatttt 20622422  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622423 ccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||     
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 13316444  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 201  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316445 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51765569 - 51765302
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac--a 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||  |    
T  51765569 agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaa 51765472  T
Q  125 agaggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt- 214  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||     
T  51765471 aggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgattt 51765372  T
Q  215 -ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
     | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765371 acactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 8550783 - 8550952
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||     
T  8550783 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaggga-tacaaa 8550879  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 197  Q
     | ||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550880 tgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20762844 - 20762582
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  ||||||     
T  20762844 agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacgaagag--atacaaa 20762748  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||       ||||| |||||||||  |    
T  20762747 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattt 20762649  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762648 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3189502 - 3189330
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||     
T  3189502 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaa 3189406  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||| |||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189405 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3198319 - 3198147
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||     
T  3198319 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaa 3198223  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||| |||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198222 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3207158 - 3206986
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||     
T  3207158 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaa 3207062  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||| |||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207061 agagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37168462 - 37168297
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  37168462 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 37168367  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168366 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29136412 - 29136247
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||     
T  29136412 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 42297962 - 42298052
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42297962 aacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctt 42298052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 13547093 - 13547257
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  13547093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 13547188  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||| ||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547189 caagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 13549004 - 13549077
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13549004 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13549077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455160
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | ||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaaga-tacaaatgagttaca 44455227  T
Q  135 agaaattagcttga-catgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||| || | || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44455226 agaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 47255343 - 47255508
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  47255343 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220394
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 28220318  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220319 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 7482234 - 7482399
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  7482234 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 7482329  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482330 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11348862 - 11348789
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11348862 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 11348789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834332
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 834259  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 197  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834260 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3157036 - 3156865
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  3157036 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 3156941  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  3156940 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552750
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaa 4552729  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt 146  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  4552730 ggggttacaagaaattagctt 4552750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28242469 - 28242396
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28242469 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 28242396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265702
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||    
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaa 28265646  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265647 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 31925711 - 31925784
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31925711 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 31925784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 37033059 - 37033149
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37033059 aacacgaatagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttctt 37033149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47115337 - 47115171
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  |||||| |  ||||    
T  47115337 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtt-tttac-aaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  132 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659413
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13659413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 193775 - 193711
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  193775 tcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaa 193711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918350
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 49918426  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918425 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223498
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 28223498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603668
Alignment:
Q  35 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttctt 34603668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644431
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 45644431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46065009
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctt 46065009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079371
Alignment:
Q  55 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaagaaattagctt 146  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaattagctt 22079371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659338
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaa 31659338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  59 ctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagctt 146  Q
    ||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctttacaaa-gaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555342
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 23555342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19754657 - 19754586
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19754657 acccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 19754586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 37876770 - 37876834
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  37876770 tcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaa 37876834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6378655 - 6378603
Alignment:
Q  129 gttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6378655 gttacaaaaaattagcttacaatgttcaacatgaacaaaccctaatttctacc 6378603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167243
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 50167243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15290706 - 15290427
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290706 aaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 15290607  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290606 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 15290507  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290506 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15471075 - 15470796
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471075 aaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 15470976  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470975 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 15470876  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15470875 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 42575310 - 42575589
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575310 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 42575409  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgac-atgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575410 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 42575509  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575510 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25690131 - 25689865
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25690131 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 25690034  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc-- 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25690033 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 25689934  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689933 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3439680 - 3439418
Alignment:
Q  22 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 121  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  3439680 caaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 3439583  T
Q  122 acaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctc 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  3439582 acaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctt 3439483  T
Q  220 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439482 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2627916 - 2627649
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||     
T  2627916 acaccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctt-acacaaga 2627819  T
Q  119 aatacaagagg--ttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--t 213  Q
     |||||| | |  || ||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2627818 gatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 2627720  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627719 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17982825 - 17982563
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||     
T  17982825 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 17982729  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  17982728 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 17982630  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982629 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 34254327 - 34254586
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||     
T  34254327 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaa 34254423  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34254424 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34254522  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254523 actcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31218429 - 31218167
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||     
T  31218429 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaa 31218333  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  31218332 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 31218234  T
Q  214 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218233 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Original strand, 34256503 - 34256762
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  34256503 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 34256599  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34256600 agggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34256698  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     | |  |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256699 acacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44304027 - 44303764
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||     
T  44304027 agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--aaaaagagatacaaa 44303931  T
Q  127 agg-ttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga-- 212  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||||||||||      
T  44303930 aggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 44303832  T
Q  213 ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303831 ttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42498366 - 42498193
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||     
T  42498366 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaa 42498270  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498269 agggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746366
Alignment:
Q  28 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 1746311  T
Q  128 -ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746312 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 19945355 - 19945529
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  | | |||    
T  19945355 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatacaaaag 19945453  T
Q  127 aggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19945454 tggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 42434995 - 42435159
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  42434995 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 42435090  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212786
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 15212862  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212861 tgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||    
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtt-tttac-aaagagatactaa 40321156  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 198  Q
      ||||||||||||||| |||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321155 tgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4283688 - 4283524
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  4283688 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 4283593  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 33352226  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352225 tgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036423
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||     
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaa 43036499  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
     |  |||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43036498 tgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18655564 - 18655491
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18655564 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 18655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743291
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 4743291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 10930187 - 10930267
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10930187 aacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 10930267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||||  |||| ||    
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttc-ttac-aaagagatacaaa 27811354  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811353 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Original strand, 1345391 - 1345449
Alignment:
Q  51 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1345391 aacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221845
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 40221845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303747
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctt 3303747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689362
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5689362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702783
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  | | ||    
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttc-ttacaaagagacacaaaa 12702727  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 182  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702728 g-ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6599027
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaa 6599048  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt 146  Q
      |||||||||||||||||||    
T  6599047 tgggttacaagaaattagctt 6599027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674480
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aa 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaa 6674501  T
Q  126 gaggttacaagaaattagctt 146  Q
      |||||||||||||||||||    
T  6674500 tgggttacaagaaattagctt 6674480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328871
Alignment:
Q  57 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 40328871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4733868 - 4733806
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  4733868 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaa 4733806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Original strand, 8965820 - 8965859
Alignment:
Q  161 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965820 gaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366727
Alignment:
Q  37 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaa 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| || |||||| ||    
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagggatacaaataggttaaaa 41366716  T
Q  136 gaaattagctt 146  Q
    |||||||||||    
T  41366717 gaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11384149 - 11384085
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |   ||||||||||| ||||||    
T  11384149 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaa 11384085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141911
Alignment:
Q  37 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 18141911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Original strand, 2590 - 2868
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 116  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2590 aaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa 2689  T
Q  117 ggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2690 gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 2789  T
Q  217 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2790 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6454 - 6177
Alignment:
Q  18 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6454 aacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 6355  T
Q  118 gaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 217  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6354 ggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 6255  T
Q  218 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6254 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 434703 - 434443
Alignment:
Q  29 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga- 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |     
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaag 434607  T
Q  128 ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  434606 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 434508  T
Q  216 tctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
     |||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434507 actcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 284
Target Start/End: Original strand, 11157 - 11423
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||     
T  11157 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaaagagatacaaa 11254  T
Q  127 a-ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 214  Q
    | ||||||||||||||||  || ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |||||||||||||||||      
T  11255 agggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattta 11353  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 284  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11354 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Original strand, 8731 - 8907
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||     
T  8731 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaaagagatacaaa 8828  T
Q  127 a-ggttacaagaaattag-cttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 202  Q
    | ||||||||||||||||  || | | |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8829 agggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||  ||||||     
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt---caaagagatacaaa 992  T
Q  127 a-ggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac------caagacactcaatga--tt 214  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  ||    
T  991 agggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttt 893  T
Q  215 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 281  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  892 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11557
Alignment:
Q  19 acacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  11737 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaaga 11641  T
Q  119 aatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 200  Q
     ||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11640 gatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||     
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaa 114678  T
Q  127 ag-gttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114677 agcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 47 - 1
Alignment:
Q  17 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47 aaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18151
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 132  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||  | ||||    
T  18007 tcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagt--tttac-aaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  133 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 181  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10589
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  10651 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149174
Alignment:
Q  27 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 149174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7418
Alignment:
Q  34 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  7491 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttctt 7418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 20421 - 20492
Alignment:
Q  36 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20421 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttctt 20492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University