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Alignment Overview

Query: NF3536_low_15 (Length: 374)

Name: NF3536_low_15
Description: NF3536
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3536_low_15
NF3536_low_15
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (210-356)||(46923081-46923227)
chr3 (12-187)||(44265930-44266105)
chr3 (12-186)||(44908690-44908864)
chr3 (12-185)||(16913795-16913968)
chr3 (12-201)||(14404552-14404741)
chr3 (12-185)||(5742302-5742476)
chr3 (12-185)||(5779261-5779435)
chr3 (17-201)||(43493514-43493698)
chr3 (17-188)||(17339829-17340000)
chr3 (17-188)||(43492198-43492369)
chr3 (33-187)||(49679541-49679695)
chr3 (12-201)||(19191314-19191503)
chr3 (12-201)||(49680277-49680466)
chr3 (25-189)||(19192199-19192363)
chr3 (38-188)||(17343659-17343809)
chr3 (12-201)||(54515542-54515731)
chr3 (12-189)||(24199241-24199421)
chr3 (22-179)||(14403601-14403758)
chr3 (14-185)||(44909235-44909404)
chr3 (12-147)||(5738883-5739017)
chr3 (12-147)||(5775995-5776129)
chr3 (12-187)||(44266842-44267017)
chr3 (12-103)||(24199972-24200063)
chr3 (12-147)||(17195762-17195897)
chr3 (95-188)||(54515060-54515153)
chr3 (113-201)||(37066580-37066668)
chr3 (14-101)||(8320164-8320251)
chr3 (42-139)||(4524726-4524823)
chr3 (143-201)||(37065956-37066015)
chr3 (142-196)||(35835412-35835466)
chr3 (142-196)||(35892129-35892183)
chr3 (143-201)||(52362630-52362688)
chr3 (82-135)||(16913126-16913179)
chr3 (115-186)||(16913059-16913130)
chr3 (12-63)||(32982407-32982458)
chr3 (100-185)||(4524824-4524909)
chr3 (17-94)||(8321847-8321924)
chr3 (130-195)||(8322266-8322331)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (12-193)||(39137949-39138130)
chr8 (12-201)||(18607595-18607784)
chr8 (50-195)||(39137317-39137463)
chr8 (12-192)||(23898907-23899087)
chr8 (17-187)||(18195237-18195407)
chr8 (22-187)||(14396551-14396716)
chr8 (17-189)||(3206470-3206642)
chr8 (12-186)||(41826648-41826822)
chr8 (12-188)||(14655824-14656000)
chr8 (12-200)||(35352295-35352483)
chr8 (17-186)||(3207188-3207357)
chr8 (12-186)||(10296028-10296202)
chr8 (12-188)||(9011951-9012127)
chr8 (12-188)||(37731963-37732139)
chr8 (12-195)||(10296818-10297001)
chr8 (34-188)||(14395135-14395289)
chr8 (82-193)||(5562780-5562891)
chr8 (96-187)||(18606861-18606952)
chr8 (34-195)||(35351564-35351725)
chr8 (60-127)||(39482372-39482439)
chr8 (132-186)||(32319819-32319873)
chr8 (165-201)||(42269357-42269393)
chr8 (142-193)||(19970550-19970601)
chr8 (142-201)||(19971285-19971344)
chr8 (142-201)||(21021465-21021524)
chr8 (142-193)||(21022208-21022259)
chr8 (12-106)||(39482229-39482329)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (12-192)||(33707476-33707656)
chr6 (50-196)||(33706808-33706954)
chr6 (12-201)||(7190820-7191009)
chr6 (17-188)||(16008232-16008403)
chr6 (17-188)||(3646557-3646728)
chr6 (18-188)||(3645540-3645710)
chr6 (18-188)||(28564443-28564613)
chr6 (12-185)||(6022282-6022455)
chr6 (17-201)||(13701694-13701878)
chr6 (17-201)||(25133271-25133455)
chr6 (12-187)||(13220687-13220862)
chr6 (12-186)||(6023350-6023524)
chr6 (38-188)||(7191547-7191697)
chr6 (12-187)||(7823874-7824049)
chr6 (82-188)||(25136528-25136634)
chr6 (82-188)||(13703243-13703349)
chr6 (130-201)||(13220030-13220101)
chr6 (17-127)||(16009404-16009514)
chr6 (121-188)||(16011961-16012028)
chr6 (113-191)||(2479979-2480057)
chr6 (142-192)||(8615433-8615483)
chr6 (113-191)||(26666914-26666992)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (16-186)||(50277901-50278071)
chr1 (16-186)||(50289569-50289739)
chr1 (12-183)||(50266185-50266356)
chr1 (17-188)||(35575875-35576046)
chr1 (17-187)||(2483195-2483365)
chr1 (12-201)||(16518476-16518665)
chr1 (38-196)||(48481540-48481698)
chr1 (12-201)||(5496324-5496513)
chr1 (18-186)||(35574877-35575045)
chr1 (50-193)||(50266799-50266942)
chr1 (17-187)||(8850458-8850628)
chr1 (12-186)||(10844576-10844750)
chr1 (33-187)||(16519272-16519426)
chr1 (81-201)||(42023197-42023316)
chr1 (17-186)||(8851591-8851760)
chr1 (17-188)||(10846621-10846793)
chr1 (17-188)||(22373275-22373446)
chr1 (33-155)||(10845357-10845479)
chr1 (52-189)||(2481785-2481922)
chr1 (25-201)||(20567952-20568129)
chr1 (52-201)||(42024073-42024221)
chr1 (27-155)||(5495431-5495559)
chr1 (17-127)||(22374443-22374553)
chr1 (17-124)||(10845523-10845630)
chr1 (41-201)||(39773297-39773467)
chr1 (130-202)||(19172630-19172702)
chr1 (130-186)||(22374851-22374907)
chr1 (113-191)||(47966995-47967072)
chr1 (131-188)||(8473198-8473255)
chr1 (144-201)||(17237695-17237752)
chr1 (133-185)||(4968924-4968976)
chr1 (143-201)||(17238479-17238538)
chr1 (111-201)||(39871808-39871898)
chr1 (130-188)||(50006589-50006647)
chr1 (143-195)||(6631312-6631364)
chr1 (109-201)||(50191201-50191293)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-193)||(8113340-8113519)
chr4 (17-188)||(1949920-1950091)
chr4 (33-187)||(6944737-6944891)
chr4 (50-192)||(8112720-8112862)
chr4 (12-201)||(38941081-38941270)
chr4 (12-188)||(5045764-5045940)
chr4 (17-188)||(56162243-56162414)
chr4 (17-188)||(26044932-26045103)
chr4 (12-185)||(22341459-22341632)
chr4 (25-201)||(5044821-5044997)
chr4 (17-201)||(26043710-26043894)
chr4 (17-200)||(8683558-8683741)
chr4 (18-188)||(56164046-56164216)
chr4 (20-201)||(1953396-1953577)
chr4 (38-187)||(6946440-6946589)
chr4 (12-193)||(22339886-22340067)
chr4 (12-201)||(31690156-31690345)
chr4 (52-201)||(13265498-13265647)
chr4 (12-147)||(6945502-6945637)
chr4 (12-185)||(38941886-38942059)
chr4 (12-201)||(55903172-55903361)
chr4 (12-201)||(37002929-37003122)
chr4 (111-195)||(47370979-47371063)
chr4 (12-105)||(14014384-14014477)
chr4 (113-191)||(27109766-27109844)
chr4 (165-201)||(11311488-11311524)
chr4 (144-188)||(14014298-14014342)
chr4 (123-201)||(5064461-5064539)
chr4 (12-105)||(14014877-14014970)
chr4 (17-90)||(23941644-23941717)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (17-186)||(25109801-25109970)
chr5 (17-186)||(25168893-25169062)
chr5 (12-188)||(20339668-20339844)
chr5 (25-201)||(3389245-3389421)
chr5 (17-188)||(19080180-19080351)
chr5 (12-188)||(19080810-19080986)
chr5 (33-201)||(3636820-3636988)
chr5 (17-188)||(25838445-25838616)
chr5 (17-201)||(25839537-25839722)
chr5 (125-201)||(41608999-41609075)
chr5 (18-128)||(3390993-3391103)
chr5 (12-105)||(8469332-8469426)
chr5 (165-201)||(8469835-8469871)
chr5 (165-201)||(27100405-27100441)
chr5 (163-201)||(23237031-23237069)
chr5 (143-201)||(41608401-41608458)
chr5 (45-105)||(7209566-7209627)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (17-188)||(2283940-2284111)
chr2 (14-201)||(20634077-20634263)
chr2 (17-185)||(36912598-36912766)
chr2 (17-185)||(9261118-9261286)
chr2 (18-201)||(2284938-2285121)
chr2 (12-201)||(3574310-3574499)
chr2 (38-188)||(13105372-13105523)
chr2 (17-188)||(20650886-20651057)
chr2 (12-188)||(20632988-20633164)
chr2 (17-188)||(36150156-36150327)
chr2 (18-201)||(36911578-36911761)
chr2 (12-190)||(23288787-23288965)
chr2 (12-201)||(6583095-6583284)
chr2 (69-183)||(16177645-16177760)
chr2 (82-188)||(6582484-6582590)
chr2 (17-186)||(9259981-9260150)
chr2 (17-188)||(32705567-32705738)
chr2 (27-155)||(13105623-13105751)
chr2 (12-186)||(3573493-3573674)
chr2 (12-127)||(20651359-20651474)
chr2 (17-188)||(44531183-44531354)
chr2 (27-170)||(13105107-13105255)
chr2 (18-186)||(7697474-7697644)
chr2 (14-101)||(16156074-16156161)
chr2 (142-201)||(15555044-15555103)
chr2 (130-201)||(34238807-34238878)
chr2 (12-105)||(34239442-34239536)
chr2 (143-201)||(41319999-41320057)
chr2 (132-188)||(44532004-44532060)
chr2 (133-186)||(13105545-13105598)
chr2 (12-48)||(16178122-16178158)
chr2 (163-201)||(13544588-13544626)
chr2 (165-201)||(29156142-29156178)
chr2 (130-202)||(41527747-41527819)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (12-202)||(27168488-27168678)
chr7 (17-188)||(39832124-39832295)
chr7 (33-201)||(32019333-32019501)
chr7 (17-201)||(39830938-39831122)
chr7 (12-201)||(11511032-11511221)
chr7 (18-186)||(2396118-2396286)
chr7 (17-186)||(32021032-32021201)
chr7 (25-189)||(11511948-11512112)
chr7 (17-201)||(2397105-2397289)
chr7 (12-158)||(36670220-36670366)
chr7 (58-186)||(32020155-32020283)
chr7 (12-188)||(36670951-36671127)
chr7 (234-324)||(47467144-47467233)
chr7 (12-185)||(27169342-27169513)
chr7 (101-188)||(19386776-19386863)
chr7 (14-101)||(3689944-3690031)
chr7 (21-104)||(20343231-20343314)
chr7 (234-324)||(47227393-47227479)
chr7 (12-67)||(32020078-32020133)
chr7 (163-201)||(20008230-20008268)
chr7 (165-201)||(27596941-27596977)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (12-187)||(63560-63735)
scaffold0039 (12-188)||(62587-62763)
scaffold0039 (113-187)||(68945-69019)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-201)||(256828-257015)
scaffold0008 (12-201)||(257481-257657)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (25-189)||(476-640)
scaffold0169 (12-128)||(1399-1515)
[»] scaffold0548 (1 HSPs)
scaffold0548 (165-201)||(6878-6914)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (113-191)||(3801-3879)
scaffold0119 (113-191)||(15856-15934)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Original strand, 46923081 - 46923227
Alignment:
Q  210 gtctgattaaatttggaaaccaaaaaactagtttgagtctcaaacactgaggtacaaaattggcatcgagctatgcttttgttgggagtattagaaaact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46923081 gtctgattaaatttggaaaccaaaaaactagtttgagtctcaaacactgaggtacaaaattggcatcgagctatgcttttgttgggagtattagaaaact 46923180  T
Q  310 tccatgaacattgaaaaaattatggctgttttaagatacgatcggaa 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46923181 tccatgaacattgaaaaaattatggctgttttaagatacgatcggaa 46923227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44266105 - 44265930
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  44266105 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttatggtgataagtgttgactacaatagagaatgaaattaaaatctaccatatcaattaatctga 44266006  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
     ||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44266005 tccattaatcaacattagaattaaatgtcaagatttagagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcc 44265930  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44908864 - 44908690
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||| |||||| |  |||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  44908864 tcaatgaattaaaagacattaattgctttgttattttgtagtcatgaatgttgattccaatagagaatgaaattaaaatctatcctatcaattaatctaa 44908765  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  44908764 gtcattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaacacacttactctttgagtcaaaatatc 44908690  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 16913795 - 16913968
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16913795 tcaaacaattaaaagacattaattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactataatagaaaatagaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 16913894  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    | |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16913895 gtcattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaatatat 16913968  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 14404552 - 14404741
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  14404552 tcaatcaattaagagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatataaaatgaaattaaagcttattatatcaattaatttaa 14404651  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  14404652 gtcattaatcaaaattagaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttgaagtcaaaatatcccctcttatatatat 14404741  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 5742302 - 5742476
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaa-tatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaattta 110  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| || | || ||||||||||  || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5742302 tcaatcatttaaaatacatttattgttttgttattttgtgattataagtgttgactaaaaatagagaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatcta 5742401  T
Q  111 agccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  5742402 agccattaatcaatattcaaattaaaggtcaagatttggagtaagttattgcacttactcttggagtcaaaatat 5742476  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 5779261 - 5779435
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaa-tatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaattta 110  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| || | || ||||||||||  || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5779261 tcaatcatttaaaatacatttattgttttgttattttgtgattataagtgttgactaaaaatagagaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatcta 5779360  T
Q  111 agccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  5779361 agccattaatcaatattcaaattaaaggtcaagatttggagtaagttattgcacttactcttggagtcaaaatat 5779435  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 43493514 - 43493698
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43493514 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 43493613  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  43493614 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 43493698  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17340000 - 17339829
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17340000 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 17339901  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17339900 taaccaatattaaaattaaaggtcaagatttggtgtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 17339829  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43492369 - 43492198
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43492369 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 43492270  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43492269 taacaaatattagaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 43492198  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49679695 - 49679541
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  49679695 attgttttcttattttatggtgataattgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaatcaaaattgcaat 49679596  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49679595 taaagatcaagatttggagtaagttattacacttactcttgaagtcaaaatatcc 49679541  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19191503 - 19191314
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19191503 tcaattaattaaaagtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctaccatatcaattaatctaa 19191404  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||| ||| |||  |||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19191403 gtcattaaccaaaattttaattaaaggtcaagatttgtagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 19191314  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 49680277 - 49680466
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  49680277 tcaatcaattaaatgacaattattgtttttttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatataattaaagcctaccatatcaattaatctaa 49680376  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | ||| |||||| |||| ||||||| || | |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  49680377 gtcatcaatcaaaattgcaattaaaagttaagatttggaataagttattacacttactcttggagtcaaaatatcttccctcatatatat 49680466  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 19192199 - 19192363
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||   ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||     
T  19192199 agacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttaactacgatagaaaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatctaatccattaaccaaa 19192298  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19192299 attgtaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccct 19192363  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 17343659 - 17343809
Alignment:
Q  38 tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaag 137  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  17343659 tttattgttttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccattaactaatattaaaattaaag 17343758  T
Q  138 gtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17343759 gtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 17343809  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 54515542 - 54515731
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| || |||| ||||| |||    
T  54515542 tcaaacaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcaaatcatttaatctaa 54515641  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  54515642 gcaattaaccaatattagaattaaaggttaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 54515731  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24199421 - 24199241
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttga---ctttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatt 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||   ||  |||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  24199421 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtgatgataagtgttgatgactacaatagaaaatggaattaaagtctaacatatcaattaatc 24199322  T
Q  109 taagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24199321 taagtcattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggagttaaaatatccct 24199241  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14403758 - 14403601
Alignment:
Q  22 aaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatc 121  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  14403758 aaaagatatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatataaaatagaattaaaatctattatatcaattaatctaagtcattaatc 14403659  T
Q  122 aatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtca 179  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||    
T  14403658 aaaattgaaattaaatgtcaagatttggagtaagttattaccattactcttggagtca 14403601  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 44909235 - 44909404
Alignment:
Q  14 aatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||    | |||| |||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||      
T  44909235 aatcaattaaaagacattaattgctttgtt----tgtggtaatgagtatcgacttcaatagagaatgaaattaaagactatcatatcaattaatctaaat 44909330  T
Q  114 cattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagt--taaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  44909331 cattaatcaatattaaaattgaaggtcataatttggagtaagttataacacacttacttttagagttaaaatat 44909404  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5739017 - 5738883
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5739017 tcaatcaattaaaagacatttaatgttttgttattttatagtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagtctaccatatcagttaatctaa 5738918  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgattt 147  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  5738917 gtcattaat-aatattggaattaaaagtcaagattt 5738883  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5776129 - 5775995
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5776129 tcaatcaattaaaagacatttaatgttttgttattttatagtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagtctaccatatcagttaatctaa 5776030  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgattt 147  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  5776029 gtcattaat-aatattggaattaaaagtcaagattt 5775995  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 44266842 - 44267017
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||| | |  |||| | ||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||    
T  44266842 tcaatgaattaaaagatatttattgctttgttattttatggtgataaatgtttattacaatagaaaatgaaattaaagcctactatgttaattaatctaa 44266941  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44266942 gctattaatcaaaattaaaattaaagatcaagatttggagtaagttattacatttactcttggagtcaaaatatcc 44267017  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 24199972 - 24200063
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaat 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  24199972 tcaaacaattaaaagacattaattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactataatagaaaatagaattaaagcctaccatatcaat 24200063  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 17195762 - 17195897
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  17195762 tcaaacaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataaatgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaa 17195861  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgattt 147  Q
      |||||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  17195862 atcattaaccaatattataattaaaggtcaagattt 17195897  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 54515153 - 54515060
Alignment:
Q  95 catatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54515153 catatcaattaatccaagccattaaccaatattggaattaaaggtcaagatttaaagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 54515060  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 201
Target Start/End: Original strand, 37066580 - 37066668
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37066580 ccattaattgatattgagattaaggatcaagatttggagtaagtttagagacttactcttgaagtcaaaatatctctcctcatatatat 37066668  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 8320251 - 8320164
Alignment:
Q  14 aatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatca 101  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  8320251 aatcaagtaaaagtaattaattgttttactattttgaggggatgagtgttaactctaatacataagaaaattaaagtctaccatatca 8320164  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4524823 - 4524726
Alignment:
Q  42 ttattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggt 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||  |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  4524823 ttattttgtggtgataagtgttaactacaatagaaaatagaattaaagtctacaatatcaattaatctaagccattatctaaaattggaattaaaggt 4524726  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37066015 - 37065956
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc-atatatat 201  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37066015 gatttggagtaagtttagagacttactcttggagtcaaaatatccctcctctatatatat 37065956  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35835466 - 35835412
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcata 196  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35835466 tgatttggagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccctcctcata 35835412  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35892183 - 35892129
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcata 196  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35892183 tgatttggagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccctcctcata 35892129  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52362688 - 52362630
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52362688 gatttggagtaggtctataaacttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 52362630  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16913179 - 16913126
Alignment:
Q  82 aattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaa 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  16913179 aattaaagtctaacatatcaattaatctaagtcattaatcaaaattggaattaa 16913126  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16913130 - 16913059
Alignment:
Q  115 attaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913130 attaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacatttactcttggagtcaaaatatc 16913059  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 32982458 - 32982407
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgtt 63  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  32982458 tcaatcaattaaaagttattaattgttttgttattttgtgatgatgagtgtt 32982407  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 4524824 - 4524909
Alignment:
Q  100 caattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    |||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||    ||||||| |||||||||||||||    
T  4524824 caattaatctaagtcatcaaccaaaattggaattaaaggtcaagattttgagtaagatattgtacttactcttggagtcaaaatat 4524909  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 8321847 - 8321924
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctac 94  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||   |||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  8321847 caattaaaactcattaattgttttaccattttgaagtgatgagtgttaactccaatagagaaaaaaattaaagtctac 8321924  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Original strand, 8322266 - 8322331
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8322266 aattaaaggcaaagatttagagtaagtaaccaaacttactcttggagtcaaaatatccctcctcat 8322331  T

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Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 39137949 - 39138130
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39137949 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttgtggtgatgagtgttgactccaatataaaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 39138048  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39138049 gtcattaatcaatatttaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacactaactcttggagtcagaatatccctcctc 39138130  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 18607595 - 18607784
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607595 tcaatcaattaaatgacaattattgttttcttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatagaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 18607694  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18607695 gtcatcaatcaaaattgcaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactctttgagtcaaaatatctcccctcatatatat 18607784  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39137463 - 39137317
Alignment:
Q  50 tggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttgg 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  39137463 tggtgatgagtgttgactctaataaagaatgaaattaaatcctaccatatcaattaatctaagccattaatcaatattagaattaaaagtcatgatttgg 39137364  T
Q  150 agtaagttaaaacacttact-tttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39137363 agtaagttaaaacacttactctttggagtcaaaatattcctcctcat 39137317  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23899087 - 23898907
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || | || | ||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23899087 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgtgattttgtgattataattgttgactacaatagagaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 23898988  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcct 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23898987 gccattaatcaatattggaattaaaggtcataatttagagtaagttattgcacttactcttggagtcaaaatatctctcct 23898907  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18195407 - 18195237
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18195407 caattaaaagatatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttaactacaatagaaaatgaaattaaagtctatcatatcaattaatttaagccat 18195308  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18195307 taaccaatattataattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatcc 18195237  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 14396551 - 14396716
Alignment:
Q  22 aaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatc 121  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14396551 aaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaatc 14396650  T
Q  122 aatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14396651 aaaattgaaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatcc 14396716  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3206642 - 3206470
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3206642 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtggtaagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 3206543  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3206542 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccct 3206470  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41826822 - 41826648
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  41826822 tcaattaattaaaagtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaaacctaccatatcaattaatctaa 41826723  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41826722 gtcattaaccaaaattgaaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 41826648  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14656000 - 14655824
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||  | || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14656000 tcaatcaattaaaatacatatattgttttgttattttgtggtgttaagtgtcgactacagtagaaaatgaaattaaagtctaacatatcaattaatctaa 14655901  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14655900 gtcattaatcaatattaaaattaaaggtcaaaatttggaataagttattacacttactcttggagtcaaaatatccc 14655824  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 35352295 - 35352483
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35352295 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgatgagtgttgactacagtagaaaataaaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 35352394  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatata 200  Q
     ||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||| | |||| ||  ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35352395 accattaaccaaaattggaatcaaagatcaggatttgaaataagatattacacttattcttggagtcaaaatatctccactcatatata 35352483  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 3207188 - 3207357
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  3207188 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatgaaattaaagtctatcatatcaattaatccaagccat 3207287  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3207288 taaccaatattaaaattaaaggtcaaaatttggagtaagatattacacttactcttggaatcaaaatatc 3207357  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10296202 - 10296028
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| |  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  10296202 tcaatcaattaaatgacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgctgattacaatagaaaataaaattaaactctaccatatcaattattctaa 10296103  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10296102 accattaatcaaaattgcaattaaaggtcaaaatttgaagtaaattattacacttactcttggagtcaaaatatc 10296028  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9012127 - 9011951
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| | | ||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9012127 tcaatcgattaaaagacatttattgttttgttattttgtgatgataaatattgactacaatagaaaattgaattaaagcctaccatatcaattaatataa 9012028  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  9012027 gccattaatcaaaattggaattaaaggttaagatttgaagtaagttattacatttactcttggagtcaaaatttccc 9011951  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37732139 - 37731963
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||| | |||  |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  37732139 tcaatgaattaaatgacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttgactataatagaaaatggaattaaagcctaccatagcaattaatctaa 37732040  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37732039 accattaatcaaaattgtaattaaaggtcaagatttaaagtacgttattatacttactcttggagtcaaaatatccc 37731963  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 10296818 - 10297001
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  ||| || ||||||||||  | || | |||  |||||||| |||||||||||||||||   |    
T  10296818 tcaatcaattgaatgacatttattgttttgttattttgcggtaataagtgttgactacagtagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatccta 10296917  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10296918 gctattaatcaaaattgtaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatctcccctcat 10297001  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14395289 - 14395135
Alignment:
Q  34 ttgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaatt 133  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||    
T  14395289 ttgttttgttattttgtggtgataagtgttgattagaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagtcattaaccaaaattggaatt 14395190  T
Q  134 aaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14395189 aaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 14395135  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5562891 - 5562780
Alignment:
Q  82 aattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaa 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||    
T  5562891 aattaaagtctaccatatcaattaatctaagccattaaccaaacttgtaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttgctcttggagtcaaa 5562792  T
Q  182 atatccctcctc 193  Q
    ||||||||||||    
T  5562791 atatccctcctc 5562780  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18606952 - 18606861
Alignment:
Q  96 atatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18606952 atatcaattaatctaagccattaatcaaaattgtaattaaaggtcgagatttggagtaagttattacatttatttttggagtcaaaatatcc 18606861  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35351725 - 35351564
Alignment:
Q  34 ttgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaatt 133  Q
    ||||||| ||||||| || || | |||||||| |  |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||| ||||    
T  35351725 ttgttttgttattttgtgttgttaagtgttgattacaataaaaaatgaaattaaagcctaccatatcaattcatctaagtcattaaccaaaattggaatt 35351626  T
Q  134 aaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||   |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  35351625 aaaagtcaagatttggagtaagatattgcactaactcttggagtcaaaatatcattcctcat 35351564  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 127
Target Start/End: Original strand, 39482372 - 39482439
Alignment:
Q  60 tgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatatt 127  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39482372 tgttgactacaatagagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatctaagccgttaatcaatatt 39482439  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Original strand, 32319819 - 32319873
Alignment:
Q  132 ttaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  32319819 ttaaaggtcaaaatttggagtaagttaatagacttactcttggagtcaaaatatc 32319873  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42269393 - 42269357
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269393 ttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 42269357  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19970601 - 19970550
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19970601 tgatttggagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccctcctc 19970550  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 201
Target Start/End: Original strand, 19971285 - 19971344
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||| |||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19971285 tgatttagagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccttcctcatatatat 19971344  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21021524 - 21021465
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||| |||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21021524 tgatttagagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccttcctcatatatat 21021465  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 21022208 - 21022259
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21022208 tgatttggagtaactcaaaagagttactcttggagtcaaaatatccctcctc 21022259  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 39482229 - 39482329
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttga-------ctttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatt 104  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||       || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39482229 tcaatcaattaaaa-acctttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgattgttgactataatagataatgaaattaaagtctaccatatcaatt 39482327  T
Q  105 aa 106  Q
    ||    
T  39482328 aa 39482329  T

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Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 33707476 - 33707656
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33707476 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttgtggtgatgagtgttgactccaatatagaataaaattaaagtctaccatattaattaatctaa 33707575  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcct 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33707576 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcttgatttggagcaagttaaaacacttactcttagagtcaaaatatccctcct 33707656  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33706954 - 33706808
Alignment:
Q  50 tggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttgg 149  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33706954 tggtgatgagggttgactctaatagagaatgaaattaaaatctactatatcaattaatctaagccattaaccaatattggaattaaaggtcatgatttag 33706855  T
Q  150 agtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcata 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33706854 agtaagttaaaacacttattcttggagtcaaaatatccctcctcata 33706808  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7191009 - 7190820
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  7191009 tcaatcaattaaaagacatttattgttttcttattttgtgatgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcataccatatcatttaatttaa 7190910  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7190909 gccattaatcaaaattgaaattaaaggttaagatttgaagtaagctattacacttgctcttggagtcaaaatatcctccctcatatatat 7190820  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16008403 - 16008232
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16008403 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 16008304  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16008303 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 16008232  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 3646557 - 3646728
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||  | || | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  3646557 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtaataagtgttgactacagtaaaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagtcat 3646656  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3646657 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 3646728  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3645710 - 3645540
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3645710 aattaaaagacatttattattttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 3645611  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3645610 aaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 3645540  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28564613 - 28564443
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28564613 aattaaaagacatttattgttttattattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 28564514  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    || |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  28564513 aaccaatattagaattaaaagtcaagatttggagtaagatattactcttactcttggagtcaaaatatccc 28564443  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6022455 - 6022282
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  | || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  6022455 tcaatcaattataagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacagtagaaaatgaaattaaagcctaccatattaattaatctaa 6022356  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    || ||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  6022355 gctattaaccaaaattggaatcaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatat 6022282  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13701878 - 13701694
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | ||| |||||||||  || ||||||||||||| |||| |||    
T  13701878 caattaaaagacatttattgtttttttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatgaaattaaagcatatcatatcaattaatctaagtcat 13701779  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13701778 taaccaatattaaaattaaaggtcaaaatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 13701694  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25133455 - 25133271
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  || | | ||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  25133455 caattaaaagacatttattgtttttttattttgtagtgataagtgttaactacaaaagaaaatgaaattaaagcatatcatatcaattaatctaagccat 25133356  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25133355 taaccaatattagaattaaatgtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 25133271  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 13220687 - 13220862
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  13220687 tcaatcaattaaaagacatttattgttttcttattttgtgatgataagtgttgactacaatagaaaattgaattaaagcataccatatcatttaatctaa 13220786  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
     |||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13220787 accattaattaaaattgaaattaaaagttaagatttggagtaagttattacatttattcttggagtcaaaatatcc 13220862  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 6023350 - 6023524
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  | |||||||||| || || | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6023350 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggttgtaagtgttgactatagtagaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatttaa 6023449  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
      |||||| ||  |||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6023450 atcattaaccataattggaatcaaaggttaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 6023524  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 7191547 - 7191697
Alignment:
Q  38 tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaag 137  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||     
T  7191547 tttattattttgtggtaataagtgttgactataatacaaaattgaattaaagtctaccatatcaattaatctaagtcattaattaaaattggaattaaat 7191646  T
Q  138 gtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||| |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7191647 gtcaagatttgaagtaagttattaaacttactcttggagtcaaaatatccc 7191697  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7824049 - 7823874
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  7824049 tcaagcaattaaaagacatttattattttcttattttgcggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaa 7823950  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    | |||||| |||||||  |||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7823949 gtcattaaccaatattagaattaaagttcaaaatttggaataagatattacacttactcttgaagtcaaaatatcc 7823874  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Original strand, 25136528 - 25136634
Alignment:
Q  82 aattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaa 181  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  25136528 aattaaagcctatcatatcaattaatctaaaccattaaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaa 25136627  T
Q  182 atatccc 188  Q
    |||||||    
T  25136628 atatccc 25136634  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Original strand, 13703243 - 13703349
Alignment:
Q  82 aattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaa 181  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  13703243 aattaaagcctatcatatcaattaacctaaaccattaaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatgttacacttactcttggagtcaaa 13703342  T
Q  182 atatccc 188  Q
    |||||||    
T  13703343 atatccc 13703349  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13220101 - 13220030
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13220101 aattaaaggtcaaaatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcccccctcatatatat 13220030  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 16009404 - 16009514
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16009404 caattaaaacacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaaacctatcatatcaattaatctaagccat 16009503  T
Q  117 taatcaatatt 127  Q
    ||| |||||||    
T  16009504 taaccaatatt 16009514  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 188
Target Start/End: Original strand, 16011961 - 16012028
Alignment:
Q  121 caatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16011961 caatattagaattaaaggtcaagatttggagtaaaatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 16012028  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 2479979 - 2480057
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2479979 ccattgattaatattgaaattaagggctaagatttggagtaactttaagcacttactcttggagtcaatatatccctcc 2480057  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8615483 - 8615433
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcct 192  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8615483 tgatttggagtaactcaaaagagttactattggagtcaaaatatccctcct 8615433  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26666992 - 26666914
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||| || ||| ||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26666992 ccattaattgatattagaattaaaggccaagatgtggagtaacataacaaacttactcttggagtcaaaatatccctcc 26666914  T

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Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 50277901 - 50278071
Alignment:
Q  16 tcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagcca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50277901 tcaattaaaagacattaattgttttattattttggggtgatgagtgttgactccaatatataataaaattaaagtctaccatatcaattaatctaagtca 50278000  T
Q  116 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50278001 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttactcttggagtcaaaatatc 50278071  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 50289569 - 50289739
Alignment:
Q  16 tcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagcca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50289569 tcaattaaaagacattaattgttttattattttggggtgatgagtgttgactccaatatataataaaattaaagtctaccatatcaattaatctaagtca 50289668  T
Q  116 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50289669 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttactcttggagtcaaaatatc 50289739  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50266356 - 50266185
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||     |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50266356 tcaatcaattaaaagatattaattgttttattattttatgatgatgattgcgtcatccaatataaaataaaattaaagtctatcatatcaattaatctaa 50266257  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaat 183  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50266256 gtcattaatcaatattgaaattaaatgttataatttgaagtaagtcaaaacacttgcttttggagtcaaaat 50266185  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 35575875 - 35576046
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35575875 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 35575974  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35575975 taaccaatattagaattaaagatcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 35576046  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 2483195 - 2483365
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2483195 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaattgaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 2483294  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2483295 taatcaatattggaattaaaggtcaagatttagagtaaaatattacacttactcttgaagtcaaaatatcc 2483365  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16518665 - 16518476
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16518665 tcaatcaatttaatgacaattattgttttcttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatagaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 16518566  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | ||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16518565 gtcatcaatcaaaattgtaattaaatgtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatatcccctcatatatat 16518476  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Original strand, 48481540 - 48481698
Alignment:
Q  38 tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaag 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||     
T  48481540 tttattattttgtggtaatgagtgttgactataatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagtcattaatcaaaattgaaattaaat 48481639  T
Q  138 gtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcata 196  Q
     ||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  48481640 atcaagatttgaagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcccccctcata 48481698  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 5496324 - 5496513
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5496324 tcaattaattaaatgtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaaacctaccatatcaattaatctaa 5496423  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  5496424 gtcattaaccaaaattgaaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatctctacccatatatat 5496513  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35575045 - 35574877
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35575045 aattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 35574946  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35574945 aaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 35574877  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Original strand, 50266799 - 50266942
Alignment:
Q  50 tggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttgg 149  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  50266799 tggttatgagtgttgactctaatagataaagaaattaaaacctaccatatcaattaatctaagatattaatcaatattggaattaaatgtcatgatttag 50266898  T
Q  150 agtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50266899 agtaagttaaaacacttactctttgagtcaaaatatccctcctc 50266942  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8850628 - 8850458
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8850628 caattaaaacacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttgactacaatagaaaatcgaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 8850529  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8850528 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatcc 8850458  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10844750 - 10844576
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  10844750 tcaatcaattaaatgacaattattgttttcttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatataattaaagcctatcatatcaattaatctaa 10844651  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    | ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||    
T  10844650 gtcatcaatcaaaattgcaattaaaggtcaagatttggagtaagttattataattactcttggagtcaaaatatc 10844576  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Original strand, 16519272 - 16519426
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||    
T  16519272 attgttttcttattttatggtgataattgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaattaaaattgcaat 16519371  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16519372 taaaggttaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcc 16519426  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42023316 - 42023197
Alignment:
Q  81 aaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaa 180  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  42023316 aaattaaaacctaccatataaattaatctaagccattaatcaatattacaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaa 42023217  T
Q  181 aatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  42023216 aatatccc-cctcatatatat 42023197  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 8851591 - 8851760
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | ||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  8851591 caattaaaagacatttattgtttttttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatgaaattaaagcatatcatatcaattaatctaagccat 8851690  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8851691 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttgaagtaagatattatacttactcttggagtcaaaatatc 8851760  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 10846621 - 10846793
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgt-tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagcca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  10846621 caattaaaagacatttattgtgtttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaaacca 10846720  T
Q  116 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10846721 ttaaccaatattagaattaaaggtcaagatttgaagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 10846793  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22373446 - 22373275
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  |||| | |||  ||||||||  || ||||||||||||| |||| |||    
T  22373446 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcttatcatatcaattaatctaagtcat 22373347  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  22373346 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactctttgagtcaaaatatccc 22373275  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 10845357 - 10845479
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  10845357 attgttttcttattttatggtgataattgttgactacaatagaaaatggaattaaagccaaccatatcaattaatctaagccattaatcaaaattgcaat 10845456  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaag 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  10845457 taaaggtcaagatttggagtaag 10845479  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2481922 - 2481785
Alignment:
Q  52 gtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggag 151  Q
    ||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  2481922 gtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctattatatcaattaatctaagccattaaccaatattaaaattaaatgtcaagatttgaag 2481823  T
Q  152 taagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2481822 taagatattacacttactcttggagtcaaaatatccct 2481785  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 20567952 - 20568129
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||   ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20567952 agacatttattgtttcgttattttgtggtgataagtgttaactacgatagaaaatgaaattaaagcataccatatcaattaatctaagccattaaccaaa 20568051  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct-cctcatatatat 201  Q
    |||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20568052 attcgaattaaatgtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatattcctaccttatatatat 20568129  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 42024073 - 42024221
Alignment:
Q  52 gtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggag 151  Q
    ||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||    
T  42024073 gtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctaccatagcaattaatctaaaccattaatcaaaattgtaattaaaggtcaagatttagag 42024172  T
Q  152 taagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    || ||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42024173 tacgttattatacttactcttggagtcaaaatatctctcct-atatatat 42024221  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5495559 - 5495431
Alignment:
Q  27 acattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatat 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  5495559 acatttattgttttgttattttgtggtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatataacccattaatcaaaat 5495460  T
Q  127 tgaaattaaaggtcatgatttggagtaag 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5495459 tgaaattaaaggtcaagatttggagtaag 5495431  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 22374443 - 22374553
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22374443 caattaaaagacatttattgctttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatataattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 22374542  T
Q  117 taatcaatatt 127  Q
    ||| |||||||    
T  22374543 taaccaatatt 22374553  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10845630 - 10845523
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10845630 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 10845531  T
Q  117 taatcaat 124  Q
    ||| ||||    
T  10845530 taaccaat 10845523  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Original strand, 39773297 - 39773467
Alignment:
Q  41 attattttatggtgatgagtgttga-ctttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta----------atttaagccattaatcaatattga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||          || |||  ||||||| ||||||      
T  39773297 attattttatggtgatgagtgtttaactacaatagagaataaaattaaagtccatcacatcaattattatgaatcaatctaaatcattaattaatattag 39773396  T
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39773397 agttaaaggtcaagatttggagtaagttaatagacttactcttggagtcaaaatatcccacct-atatatat 39773467  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19172702 - 19172630
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatatg 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19172702 aattaaaggtcaagattgagagtaagtaaaagaacttactcttggagtcaaaatatccctccttatatatatg 19172630  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 22374851 - 22374907
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22374851 aattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 22374907  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47967072 - 47966995
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||| || |||||||||||||| | | | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47967072 ccattgattaatattgaaattaaggctaa-gatttggagtaactttaaacacttactcttggagtcaatatatccctcc 47966995  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8473255 - 8473198
Alignment:
Q  131 attaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8473255 attaaatgtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 8473198  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17237752 - 17237695
Alignment:
Q  144 atttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||||||||  | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17237752 atttggagtaagtctataaacttactcttgcagtcaaaatatccctcctcatatatat 17237695  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 4968924 - 4968976
Alignment:
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  4968924 taaaggtcaagatttggagtaagtttatagacttactcttggagtcaaaatat 4968976  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Original strand, 17238479 - 17238538
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc-atatatat 201  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17238479 gatttggagtaagtctataaacttactcttggagtcaaaatatccctcctctatatatat 17238538  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 201
Target Start/End: Original strand, 39871808 - 39871898
Alignment:
Q  111 agccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||  |||||  ||| ||||| || ||| ||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39871808 agccattaattcatattagaatcaaaggccaagatgtggagtaacataacaaacttactcttggagtcagaatatccctccccatatatat 39871898  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50006647 - 50006589
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  50006647 aattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggaatcaaaatatccc 50006589  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6631364 - 6631312
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6631364 gatttggagtaagtctataaacttacccttggagtcaaaatatccctcctcat 6631312  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 50191201 - 50191293
Alignment:
Q  109 taagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||| ||| |||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  50191201 taagccattaattaacaatacaattaaaagtcaagatatggagtaagtaaacaaacttactcttggagccaaaatatcatccctcatatatat 50191293  T

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Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 8113340 - 8113519
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8113340 tcaatcaattaaaagacattcattgttttattattttgtggtgatgagtgttgactccaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatctaa 8113439  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||    
T  8113440 gccattaatcaatattgaaattcaaggtcatgatttggagtaagttaaaacactt--tcttgaagtcaaaatatcactcctc 8113519  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1950091 - 1949920
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1950091 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactgcaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 1949992  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1949991 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttacttttggagtcaaaatatccc 1949920  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6944891 - 6944737
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  6944891 attgttttcttattttatggtgataattgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaatcaaaattgcaat 6944792  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6944791 taaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcc 6944737  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8112862 - 8112720
Alignment:
Q  50 tggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttgg 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  8112862 tggtgatgagtgttgactctaatagagaatgaaattaaaacctaccgtaccaattaatctaagccattaatcaatattggaattaaatgtcataatttga 8112763  T
Q  150 agtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcct 192  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8112762 agtaagttaaaacacttactctttgagtcaaaatatccctcct 8112720  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38941270 - 38941081
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38941270 tcaatcaattaaatgacatttattgttatgttattttgtagtgataagtgttgactacaatagaaaataaaattaaagcctaccatatcaattattttaa 38941171  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
     ||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  38941170 accattaatcaaaattgcaattaaaagtcaatattttgagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcaccccttatatatat 38941081  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 5045764 - 5045940
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5045764 tcaattaattaaatgtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactataatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 5045863  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
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T  5045864 gtcattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 5045940  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 56162414 - 56162243
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  56162414 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaattaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 56162315  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56162314 taaccaatattagaattaaagatcaagattttgagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 56162243  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 26044932 - 26045103
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26044932 caattaaaagacatttattggtttgttattttgaggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 26045031  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26045032 taatcaatattagaattaaaggtcaagatttgtagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 26045103  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 22341459 - 22341632
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| ||  | ||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||| |  |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  22341459 tcaatcaattgaataatatttattgttttgttattttgtgatgataagtgttgattacaatagaaaataaaattaaaatctaccatataaattaatctaa 22341558  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  22341559 gtcattaatcaatattgcaattaaaggtcaaaatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatat 22341632  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5044997 - 5044821
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  5044997 agacatttattgttttgttattttgtggtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaatcaaa 5044898  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5044897 attgaaattaaagatcaagatttggagtaagatattacaattactctttgagtcaaaatatccctacccatatatat 5044821  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26043894 - 26043710
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || || |||||| |||  |||| | |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  26043894 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtcataagtgttcactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatttaagtcat 26043795  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  26043794 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 26043710  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8683741 - 8683558
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8683741 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaataaaaaatggaattaaaatctatcatatcaattaattttagccat 8683642  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatata 200  Q
    |||  ||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8683641 taactaatattggaattaaatgtcaagatctagagtaagatattatacttactcttggagtcaaaatatccccactcatatata 8683558  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 56164046 - 56164216
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  56164046 aattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 56164145  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    || |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  56164146 aaccaatattagaattaaaggtcaaaatttggagtaagatattacacttactcttggagtaaaaatatccc 56164216  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 1953396 - 1953577
Alignment:
Q  20 ttaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1953396 ttaaaagacatttattgtttagttattttgtagtgataagtgttaactacaataaaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccattaa 1953495  T
Q  120 tcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
     |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  1953496 ccaatattagaattaaaggttaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 1953577  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 6946440 - 6946589
Alignment:
Q  38 tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaag 137  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  6946440 tttattattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccattaaccaatattagaattaaag 6946539  T
Q  138 gtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6946540 gtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatcc 6946589  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22340067 - 22339886
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| || | ||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22340067 tcaatgaattaaatgacatttattgttttgttatcttgtagtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctaccataacaattaatctaa 22339968  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctc 193  Q
      |||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22339967 atcattaatccaaattgtaattaaagatcaagatttggagtgagttattacacttactcttggagtcaaaatatcccccctc 22339886  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 31690156 - 31690345
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31690156 tcaattaattaaatgtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 31690255  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||  | |||||||||    
T  31690256 gtcatcaaccaaaattgaaattaaaggtcaagatttggagtaaaatattacacttactcttgaattcaaaatatccccacccatatatat 31690345  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13265647 - 13265498
Alignment:
Q  52 gtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggag 151  Q
    ||||| |||||| |||  |||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13265647 gtgataagtgttaactacaatagaaaattaaattaaattctatcatatcaattaatccaagccattaaccaatattaaaattaaaggtcaagatttggag 13265548  T
Q  152 taagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13265547 taagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 13265498  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 6945502 - 6945637
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6945502 tcaatcaattaaatgacaattattgttttcttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatagaattaaagtctaccatatcaattaatctaa 6945601  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgattt 147  Q
    | ||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  6945602 gtcatcaatcaaaattgcaattaaatgtcaagattt 6945637  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 38941886 - 38942059
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||   ||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  38941886 tcaatcaattgaatgacatttattattttgttattttgcagtgattagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctaccatatcagttaatccta 38941985  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  38941986 gcttttaatcaaaattgcaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaatatat 38942059  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 55903172 - 55903361
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||   ||| ||||||||||||| |||    
T  55903172 tcaatcaattaaaagatatttattgttttgttattttgtgatgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaagacctatcatatcaattaatctaa 55903271  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||  | ||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  55903272 gccattaaccaaaattaaaattaaaggttaagatttagagtaagatattatacttactcttggagttaacatatccctcttcacatatat 55903361  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37003122 - 37002929
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatt--- 108  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |  |||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||       
T  37003122 tcaattaattagaagtcatttattgttttattattttgtggtgataagtgttaattacaatagaaaatagaattaaaacctaccatatcaattaattaat 37003023  T
Q  109 -taagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
     |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  37003022 ctaagtcattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattatacttactcttggtgtcaaaatatccccacccatatatat 37002929  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 47370979 - 47371063
Alignment:
Q  111 agccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcat 195  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47370979 agccattaattgatattagaattaaaggtcaagatgtgaagtaacttaacaaacttactcttggagtcaaaatatccctcctcat 47371063  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14014477 - 14014384
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||  | ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  14014477 tcaattaattaaaagtcattaattattttgttgtttagtagtgatgagtgttgacttcaatagagaaggaaattaaagtttaccgtatcaatta 14014384  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27109844 - 27109766
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27109844 ccattgattaatattgaaattaagggctaagatttggagtaactttaagcacttactcttggagtcaatatatccctcc 27109766  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 11311488 - 11311524
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11311488 ttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 11311524  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14014342 - 14014298
Alignment:
Q  144 atttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14014342 atttggagtaggttaacacacttactcttggagtcaaaatatccc 14014298  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 5064461 - 5064539
Alignment:
Q  123 atattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  5064461 atattaaaattaagggacaagatttggaggaagtttaaagacttacgcttggagtcaaaatatccatccatatatatat 5064539  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Original strand, 14014877 - 14014970
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||| | |||||| | |||||||  |||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  14014877 tcaattaattaaaagatattaattattttgttgttttgtagtgatgcgggttgactccaatagagaaggaaactaaagactaccatatcaatta 14014970  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Original strand, 23941644 - 23941717
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagt 90  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  23941644 caattaaaagtcattaattgttttgccattttgggatgatgagtgttaactctaatagagaagaaaattaaagt 23941717  T

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Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 25109801 - 25109970
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  25109801 caattaaaagacattaaatattttgttgttttttggtgatgagtgttgacttcaatagagaacgaaattaaagtctagcgtatcaattaatctaagtcat 25109900  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25109901 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaacacacttactcttggagtcaaaatatc 25109970  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 25168893 - 25169062
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  25168893 caattaaaagacattaaatattttgttgttttttggtgatgagtgttgacttcaatagagaacgaaattaaagtctagcgtatcaattaatctaagtcat 25168992  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25168993 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaacacacttactcttggagtcaaaatatc 25169062  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 20339668 - 20339844
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20339668 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttctggtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 20339767  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20339768 gccattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 20339844  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3389421 - 3389245
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3389421 agacatttattgttttgttattttgtggtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatataagccattaatcaaa 3389322  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3389321 attgaaattaaaggtcaagatttggagtaagatatcacacttactcttggagtcaaaatatccctacccatatatat 3389245  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19080351 - 19080180
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19080351 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtgatgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagtctatcatatcaattaatctaagtcat 19080252  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19080251 taaccaatattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 19080180  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 19080810 - 19080986
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19080810 tcaagcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaattgaattaaagtctatcatatcaattaatctaa 19080909  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19080910 gtcattaaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttgaagtcaaaatatccc 19080986  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 3636820 - 3636988
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  3636820 attgttttcttattttatggtgataattgttgagtacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaagccattaatcaaaattgcaat 3636919  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3636920 taaagatcaagatttggagtaagttattacccttactcttggagtcaaaatattctccctcatatatat 3636988  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25838616 - 25838445
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25838616 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaattgaattaaagcctatcatatcaattaatctaaaccat 25838517  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25838516 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 25838445  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 25839537 - 25839722
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttatt-attttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagcca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||  |||| | ||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  25839537 caattaaaagacatttattgttttttttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatgaaattaaagcatatcatatcaattaatctaagcca 25839636  T
Q  116 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||||    
T  25839637 ttaactaatattagaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactctttgagtcaaaatatcccaacccatatatat 25839722  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Original strand, 41608999 - 41609075
Alignment:
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41608999 attgaaattaaagatcaagatttggagtaagtttagagacttactcttgaagtcaaaatatccctcctcatatatat 41609075  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 3390993 - 3391103
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3390993 aattaaatgtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaataaaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaacctaagccatt 3391092  T
Q  118 aatcaatattg 128  Q
    || ||| ||||    
T  3391093 aaccaaaattg 3391103  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8469426 - 8469332
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtg-ttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||   ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8469426 tcaatcaattaaaagttattaattgttttgttattttgtgatgatgagtgtttaactagcatagaaaagaaaattaaagtctaccatatcaatta 8469332  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 8469835 - 8469871
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469835 ttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 8469871  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 27100405 - 27100441
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27100405 ttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 27100441  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23237069 - 23237031
Alignment:
Q  163 acttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23237069 acttactcttggagtcaatatatccctcctcatatatat 23237031  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41608458 - 41608401
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41608458 gatttgaagtaagtttagagacttacttttagagtcaaaatatccctcct-atatatat 41608401  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Original strand, 7209566 - 7209627
Alignment:
Q  45 ttttatggtgatgagtgttga-ctttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta 105  Q
    |||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7209566 ttttatggtgatgaatgtttaactacaatagagaataaaattaaagtctatcatatcaatta 7209627  T

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Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2284111 - 2283940
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2284111 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 2284012  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2284011 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 2283940  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 20634077 - 20634263
Alignment:
Q  14 aatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  | || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20634077 aatcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacagtagaaaatgaaattaaagcctaccatatcaattaatctaagc 20634176  T
Q  114 cattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20634177 cattaaccaaaattggaatcaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatcccacc-catatatat 20634263  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 36912598 - 36912766
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36912598 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 36912697  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  36912698 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatat 36912766  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 9261118 - 9261286
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  9261118 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactataatataaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagtcat 9261217  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9261218 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacaattactcttggagtcgaaatat 9261286  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 2284938 - 2285121
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2284938 aattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 2285037  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  2285038 aaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 2285121  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 3574310 - 3574499
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3574310 tcaatcaaagaaatgacatttattgttttgttattttgtagtgataggtgttgactataatagaaaattgaattaaagtctaccacatcaattaatctaa 3574409  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3574410 gtcattaatcaaaattgcaatcaaaggtcaatatttggagtaagttattatacttacttttggagtcaaaatatcttccctcatatatat 3574499  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 13105372 - 13105523
Alignment:
Q  38 tttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaat-taaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaa 136  Q
    |||||| |||| |||| || | ||||||||  ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13105372 tttattgttttgtggtaataaatgttgactacaatatagaataaaaaataaatactaccatatcaattaatctaagtcattaatcaatattgaaattaaa 13105471  T
Q  137 ggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13105472 ggtcatgatttggagtaaattaacacacttactctcagagtcaaaatatccc 13105523  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20651057 - 20650886
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  20651057 caattaaaagacatttattgttttattattttgtggtgataggtgttggctacaatagaaaatttaattaaagcctatcatatcaattaatctaagtcat 20650958  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  20650957 taaccaatattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttgctcttggagtcaaaatatccc 20650886  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20633164 - 20632988
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||   | |  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20633164 tcaatcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgaccacagtggaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatttaa 20633065  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20633064 accattaaccaagattggaatcaaaggtcaaaatttgaagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 20632988  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 36150156 - 36150327
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||| | | ||||||  |||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36150156 caattaaaagacacttattgttttgttattttgtagtgataattattgactacaatagaaaatagaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 36150255  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36150256 taaccaatattggaattaaaggtcaagatttagagtaagatattacacttactcttggaatcaaaatatccc 36150327  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36911761 - 36911578
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36911761 aattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 36911662  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||| || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  36911661 aaccaatattagaattaaaggtcaagatttagaataagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 36911578  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 23288787 - 23288965
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||   |    
T  23288787 tcaatcaattgaatgacatttattattttgttattttgcggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatccta 23288886  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctc 190  Q
    |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23288887 gttattaatcaaaattgcaattaaaggtcaagatttggagtaagttattacacttactcttagagtcaaaatatccctc 23288965  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 6583095 - 6583284
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  6583095 tcaagcaattaaaagacatttattattttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcttatcatatcaattaatctaa 6583194  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  6583195 gccattaaccgatattagaattaaaggtcaagattttgagtaagatattatacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 6583284  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16177760 - 16177645
Alignment:
Q  69 taatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaatt-aaaggtcatgatttggagtaagttaaaacactta 167  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16177760 taatagagaattaaattaaaggctaccatatcaaataatataagccattaatcaatattggaattaaaaggtcatgatttggagtaagttaacacacttg 16177661  T
Q  168 cttttggagtcaaaat 183  Q
    || ||| |||||||||    
T  16177660 ctcttgaagtcaaaat 16177645  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6582590 - 6582484
Alignment:
Q  82 aattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaa 181  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  6582590 aattaaagcctatcatatcaattaatctaagccattaaccaatattgaaattaaaggtcaagatttagagtaagatactacacttactcttggagtcaaa 6582491  T
Q  182 atatccc 188  Q
    |||||||    
T  6582490 atatccc 6582484  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9260150 - 9259981
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9260150 caattaaaagataattattgttttgttattttgtagtgataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 9260051  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  9260050 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtccaaatatc 9259981  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 32705567 - 32705738
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||  |||| | |||  ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||    
T  32705567 caattaaaagacatctattgttttgttattttgtggtaataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcttaacatattaattaatctaagccat 32705666  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32705667 taaccaatattagaattaaaggtcaaaatttggagtaagatattacatttactcttggagtcaaaatatccc 32705738  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 13105623 - 13105751
Alignment:
Q  27 acattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatat 126  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||||||||  |||| ||||| ||| |||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13105623 acatttattgttttattatttcgttatgataagtgttgactacaatagagaatgaaactaaagcatatcatatcaattaatctaagtcattaatcaatat 13105722  T
Q  127 tgaaattaaaggtcatgatttggagtaag 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13105723 tgaaattaaatgtcatgatttggagtaag 13105751  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3573674 - 3573493
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  3573674 tcaatcaattgaatgacatttattgttttgttattttatggtgataagttttgactacaatagaaaatgaaattaaagcctacaatatcaattaatctca 3573575  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaa-------ttaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    | |||||||||| |||| ||       |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  3573574 gtcattaatcaaaattgcaattaaagtttaaaggtcaagatttggagtaaattattacacttactcttagagtcaaaatatc 3573493  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 20651359 - 20651474
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20651359 tcaagcaattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatttaa 20651458  T
Q  112 gccattaatcaatatt 127  Q
    | |||||| |||||||    
T  20651459 gtcattaaccaatatt 20651474  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44531354 - 44531183
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||| | | ||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  44531354 caattaaaagacatttattgttttgttattttgcagtgataattattgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagtcat 44531255  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44531254 taaccaatatttgaattaaaggtcaagatttaaagtaagatattacacttactcttggagtgaaaatatccc 44531183  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 170
Target Start/End: Original strand, 13105107 - 13105255
Alignment:
Q  27 acattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat-- 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  |||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||      
T  13105107 acatttattgttttgttattttgtggtgataattgttgactacaatagagaaggaaattaaagtatacca-atcaattaatataaaccattaatcaatat 13105205  T
Q  125 ----attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttactt 170  Q
        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  13105206 tgaaattgaaattgaaggtcatgattttgagtaagttaacacactaactt 13105255  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7697644 - 7697474
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtga--tgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagcca 115  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||   | |||| |||||  |||  | ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  7697644 aattaaaagacatttattattttgttattttgtggtgtgttaagtgctgactacaatgaaaaatgaaattaaagcataccatattaattaatctaagtca 7697545  T
Q  116 ttaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||    
T  7697544 ttaattaatattggaattaaaaatcaagatttggagtaagttatcatacttactcttagagtcaaaatatc 7697474  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16156161 - 16156074
Alignment:
Q  14 aatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatca 101  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||  |||||  || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16156161 aatcaagtaaaagtaattaattgttttaccattttgaggggatgagtgttaactctaatatagaagaaaattaaagtctaccatatca 16156074  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 201
Target Start/End: Original strand, 15555044 - 15555103
Alignment:
Q  142 tgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15555044 tgatttggagtaacttaaaagagttactcttggagttaaaatatccctcctcatatatat 15555103  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34238878 - 34238807
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34238878 aattaaaggctaagatttggagtaagtctatagacttacttttggagtcaaaatatctctcctcatatatat 34238807  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Original strand, 34239442 - 34239536
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtg-ttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatta 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||   ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34239442 tcaatcaattaaaagttattaattgttttgttattttgtgatgatgagtgtttaactaccatagaaaagaaaattaaagtctaccatatcaatta 34239536  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41320057 - 41319999
Alignment:
Q  143 gatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41320057 gatttggagtaagtctataaacttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 41319999  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Original strand, 44532004 - 44532060
Alignment:
Q  132 ttaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44532004 ttaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 44532060  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13105598 - 13105545
Alignment:
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  13105598 taaatgtcatgatttggagtaagttaacacacttatttttgtggtcaaaatatc 13105545  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 16178158 - 16178122
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattatttt 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16178158 tcaatcaattaaaagacattaattgttttgttatttt 16178122  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13544626 - 13544588
Alignment:
Q  163 acttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544626 acttactcttgaagtcaaaatatccctcctcatatatat 13544588  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29156178 - 29156142
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29156178 ttactcttggagtcaaaatatccctccccatatatat 29156142  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 202
Target Start/End: Original strand, 41527747 - 41527819
Alignment:
Q  130 aattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatatg 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  | | | ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41527747 aattaaaggttaagatttggagtaagtatatagatttactcttagagttaaaatatctctcctcatatatatg 41527819  T

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Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27168678 - 27168488
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |  |||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  27168678 tcaatcaattgaataacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgattacaatagaaaatgaaattaaaatctaccatataaattaatctaa 27168579  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatatg 202  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27168578 gtctttaatcaatattgcaattaaaggtcaagattaggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatcccccctcatatatatg 27168488  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 39832124 - 39832295
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39832124 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 39832223  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39832224 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 39832295  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32019501 - 32019333
Alignment:
Q  33 attgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||  |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||    
T  32019501 attgttttcttattttatggtgataattgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccatatcaattattctaagtcattaatcaaaattgcaat 32019402  T
Q  133 taaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32019401 taaaagtcaagatttggagtaagttattacacttactctaggagtcaaaatatcccccctcatatatat 32019333  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39831122 - 39830938
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39831122 caattaaaagacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccat 39831023  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  39831022 taaccaatattagaattaaaggtcaaaatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 39830938  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11511221 - 11511032
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  11511221 tcaattaattaaatgtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctaccataccaattaatctaa 11511122  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    | |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  11511121 gtcattaaccaaaattggaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 11511032  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2396286 - 2396118
Alignment:
Q  18 aattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccatt 117  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2396286 aattaaaagatatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagtctatcatatcaattaatctaagccatt 2396187  T
Q  118 aatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    || |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2396186 aaccaatattagaattaaaagtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 2396118  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 32021032 - 32021201
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | |||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  32021032 caattaaaagacatttattattttgttattttgtagtgataagtgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctatcatatcaattaatctaagtcat 32021131  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32021132 taaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatc 32021201  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 11511948 - 11512112
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| | |||| |||  |||| | |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  11511948 agacatttattgttttgttattttgtggggataaatgttaactacaatagaaaatggaattaaagcctaccgtatcaattaatctaagccattaatcaaa 11512047  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11512048 attgaaattaaagatcaagatttggagtaaaatattacacttactcttggagtcaaaatatccct 11512112  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 2397105 - 2397289
Alignment:
Q  17 caattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccat 116  Q
    ||||||||| | ||| || ||||| |||||||  || ||  || |||||||  |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2397105 caattaaaanaaatttatngttttgttattttgggggganaagngttgactacaatanaaaatgaaattaaagcctatcatatcaattaatctaagccat 2397204  T
Q  117 taatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  2397205 taaccaatattanaattaaaggtcaagatttggagtaanatattacacttactcttggagtcaaaatatccccacccatatatat 2397289  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36670366 - 36670220
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36670366 tcaatcaattaaatgacatttattgttttgttattttgtagtgataagtgttcactacaatagaaaataaaattaaagtctaccatatcaattactttaa 36670267  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagtta 158  Q
     |||| |||||| ||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  36670266 accatcaatcaaaattgctattaaatgtcaagatttagagtaagtta 36670220  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Original strand, 32020155 - 32020283
Alignment:
Q  58 agtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagtt 157  Q
    ||||||||||  |||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32020155 agtgttgactacaatagaaaatagaattaaaagctaccatatcaattaatctaagtcatcaatcaaaattgcaattaaaggtcaggatttggagtaagtt 32020254  T
Q  158 aaaacacttacttttggagtcaaaatatc 186  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020255 attacacttactcttggagtcaaaatatc 32020283  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 36670951 - 36671127
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||| | |||  ||||||||  ||||||||||||||||   |    
T  36670951 tcaatcaattgaatgatatctattgttttgttattttgcggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcataccatatcaattaatccta 36671050  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    || ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36671051 gctattaatcaaaattgcaattaaatgtcaagatttggagtaagttattacacttactcttggagtcaaaatatccc 36671127  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 47467144 - 47467233
Alignment:
Q  234 aaactagtttgagtctcaaacactgaggtacaaaattggcatcgagctatgcttttgttgggagtattagaaaacttccatgaacattgaa 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47467144 aaactagtttgagtctcaaacactgaggtacaaaactggcatcaagctatgattttgtt-ggagtattagcaaacttccaagaacattgaa 47467233  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 27169342 - 27169513
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||  |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27169342 tcaatgaattaaatgacatt--ttgttttgttattttgtagtgataagtgtagactacaatagaaaatggaattaaagtctaccatagcaattaatctaa 27169439  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatat 185  Q
     ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||| ||| |||||||||||    
T  27169440 accattaatcaaaattgtaattaatggtcaagatttggagtaatttattatacttactcttgaagtcaaaatat 27169513  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 188
Target Start/End: Original strand, 19386776 - 19386863
Alignment:
Q  101 aattaatttaagccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19386776 aattaatctaagccattaaccaatattagaattaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccc 19386863  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 3689944 - 3690031
Alignment:
Q  14 aatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatca 101  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||  |||||  || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3689944 aatcaagtaaaagtaattaattgttttaccattttgaggggatgagtgttaactctaatatagaagaaaattaaagtctaccatatca 3690031  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20343314 - 20343231
Alignment:
Q  21 taaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaatt 104  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20343314 taaaagtcattaattgttttgttattttgtggtgatgaatgttgactccaacagagaagaaaattaaagcctaccatatcaatt 20343231  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47227479 - 47227393
Alignment:
Q  234 aaactagtttgagtctcaaacactgaggtacaaaattggcatcgagctatgcttttgttgggagtattagaaaacttccatgaacattgaa 324  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47227479 aaactagtttgaatctcaaaca--gaggtacaaact-ggcatcaaggtatgcttttgttga-agtattagcaaacttccatgaacaatgaa 47227393  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 32020078 - 32020133
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgact 67  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32020078 tcaatcaattaaatgacaattattgttttcttattttgtggtgataagtgttgact 32020133  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20008268 - 20008230
Alignment:
Q  163 acttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20008268 acttactcttggagtcaatatatccctcctcatatatat 20008230  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 27596941 - 27596977
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27596941 ttactttttgagtcaatatatccctcctcatatatat 27596977  T

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Target: scaffold0039 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 63560 - 63735
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |    
T  63560 tcaatcaattaaaagacatttattcttttgttattttgtggtgataagtgttgattacaatagagaataaaattaaaacctaccatatcaattaatctga 63659  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
     ||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  63660 tccattaatcaacattggaactaaatgtcaagatttggagtaagttattgcacttacttttggagtcaaaatatcc 63735  T

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Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 62763 - 62587
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  62763 tcaatcaattaaaagacatttattgctttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagcctactatatcaattaatctaa 62664  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccc 188  Q
    | |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  62663 gtcattaatcaaaattggaattaaaagtcaagatttggagtaagttattacacttactcttagagtcaaaatatccc 62587  T

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Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Original strand, 68945 - 69019
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatcc 187  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  68945 ccattaatcaacattggaactaaatgtcaagatttggagtaagttattgcacttacttttggagtcaaaatatcc 69019  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 257015 - 256828
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||   ||| | |||  |||||||| |||||||  ||| |||| |||    
T  257015 tcaatcaattaaaagatattcattgttttgttattttgtgatgataagtgttgactacgatagaaaatggaattaaagcctaccat--caactaatctaa 256918  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256917 gccattaaccaaacttgtaattaaaggttaagatttagagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 256828  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 257481 - 257657
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  257481 tcaatcaattaaaagacatttattattttgttatttcatggtgataagtgttgattataataaaaaatggaattaaagcctaccatatcaattaatctaa 257580  T
Q  112 gccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
                 |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  257581 -------------attggaattaaatgtcaagatttggagtaacatattacacttactcttggagtcaaaatatcccaccctatatatat 257657  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 640 - 476
Alignment:
Q  25 agacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaagccattaatcaat 124  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  |||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||     
T  640 agacatttactgttttgttattttgtggtgataagtgttcactacaatagaaaatggaattaaagtataccatatcaattaatctaagctattaactaaa 541  T
Q  125 attgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccct 189  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  540 attggatttaaaggtcaagatttggagtaagatattacacttactcttggagtcaaaatatccct 476  T

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Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 1399 - 1515
Alignment:
Q  12 tcaatcaattaaaagacattaattgttttattattttatggtgatgagtgttgactttaatatagaataaaattaaagtctaccatatcaattaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1399 tcaattaattaaaagtcatttattgttttgttattttgtggtgataagtgttgactacaatagaaaatggaattaaagtctaccatatcaattaatctaa 1498  T
Q  112 gccattaatcaatattg 128  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  1499 gtcattaaccaaaattg 1515  T

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Target: scaffold0548 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6914 - 6878
Alignment:
Q  165 ttacttttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6914 ttactcttggagtcaaaatatccctcctcatatatat 6878  T

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Target: scaffold0119 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 3801 - 3879
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||| || ||| ||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3801 ccattaattgatattagaattaaaggccaagatgtggagtaacataacaaacttactcttggagtcaaaatatccctcc 3879  T

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Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 15856 - 15934
Alignment:
Q  113 ccattaatcaatattgaaattaaaggtcatgatttggagtaagttaaaacacttacttttggagtcaaaatatccctcc 191  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||| || ||| ||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15856 ccattaattgatattagaattaaaggccaagatgtggagtaacataacaaacttactcttggagtcaaaatatccctcc 15934  T

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