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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3552_low_22 (Length: 228)

Name: NF3552_low_22
Description: NF3552
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3552_low_22
NF3552_low_22
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (17-228)||(20274910-20275121)
chr1 (13-190)||(13497088-13497264)
chr1 (13-194)||(24775992-24776172)
chr1 (13-190)||(42436217-42436393)
chr1 (13-228)||(2840859-2841073)
chr1 (13-228)||(49005386-49005600)
chr1 (13-194)||(45537413-45537593)
chr1 (14-194)||(2023590-2023769)
chr1 (13-189)||(32050311-32050486)
chr1 (13-193)||(38983978-38984157)
chr1 (14-193)||(42807268-42807446)
chr1 (13-194)||(43642605-43642785)
chr1 (13-194)||(18410768-18410948)
chr1 (13-194)||(28645212-28645392)
chr1 (13-194)||(32523404-32523584)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (13-228)||(29088571-29088789)
chr8 (13-190)||(22514379-22514555)
chr8 (13-194)||(39621535-39621715)
chr8 (13-190)||(40557962-40558138)
chr8 (13-194)||(12501106-12501285)
chr8 (13-194)||(6417126-6417305)
chr8 (13-190)||(13279164-13279340)
chr8 (13-190)||(16428713-16428889)
chr8 (13-190)||(33441885-33442061)
chr8 (13-194)||(18385033-18385213)
chr8 (13-190)||(36895975-36896151)
chr8 (13-114)||(16885908-16886009)
chr8 (110-194)||(16888127-16888211)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (13-194)||(3554417-3554600)
chr2 (13-228)||(4650870-4651084)
chr2 (13-193)||(6904979-6905158)
chr2 (88-194)||(42224596-42224702)
chr2 (13-190)||(9616908-9617083)
chr2 (13-194)||(40263964-40264141)
chr2 (13-193)||(4720144-4720322)
chr2 (13-190)||(39121916-39122092)
chr2 (13-190)||(42842434-42842610)
chr2 (17-190)||(12256076-12256248)
chr2 (13-97)||(42224723-42224807)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (13-148)||(22386370-22386505)
chr5 (13-194)||(5811962-5812142)
chr5 (13-190)||(1212092-1212268)
chr5 (14-194)||(1598087-1598266)
chr5 (13-190)||(16476138-16476314)
chr5 (13-190)||(23106945-23107121)
chr5 (13-190)||(25336617-25336793)
chr5 (13-190)||(36789099-36789276)
chr5 (14-194)||(40831012-40831191)
chr5 (13-194)||(16478721-16478901)
chr5 (17-190)||(22720722-22720894)
chr5 (13-190)||(28968962-28969138)
chr5 (13-194)||(39564642-39564821)
chr5 (13-133)||(22496401-22496520)
chr5 (142-194)||(22496511-22496563)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (13-228)||(4066134-4066348)
chr3 (13-194)||(28417786-28417966)
chr3 (13-194)||(37965329-37965509)
chr3 (13-228)||(33955314-33955528)
chr3 (13-194)||(47333834-47334014)
chr3 (13-194)||(22398354-22398534)
chr3 (13-190)||(35350224-35350400)
chr3 (88-194)||(23303410-23303516)
chr3 (19-194)||(3344441-3344615)
chr3 (89-228)||(23302720-23302858)
chr3 (13-190)||(10122100-10122276)
chr3 (13-190)||(26705536-26705712)
chr3 (13-228)||(33956618-33956832)
chr3 (13-190)||(1002432-1002608)
chr3 (13-190)||(43845355-43845531)
chr3 (13-190)||(54610711-54610887)
chr3 (13-190)||(30107214-30107390)
chr3 (90-189)||(38189954-38190053)
chr3 (13-97)||(23303541-23303625)
chr3 (14-193)||(45579507-45579705)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (13-189)||(47400165-47400361)
chr7 (13-194)||(6613195-6613375)
chr7 (13-194)||(21953598-21953778)
chr7 (13-187)||(9178762-9178935)
chr7 (13-190)||(35505393-35505569)
chr7 (13-194)||(46805305-46805485)
chr7 (13-190)||(18784028-18784204)
chr7 (13-190)||(42047151-42047327)
chr7 (13-194)||(42049850-42050030)
chr7 (13-194)||(34643238-34643417)
chr7 (17-190)||(44044972-44045144)
chr7 (13-190)||(37315502-37315678)
chr7 (13-190)||(35113906-35114082)
chr7 (96-190)||(19296006-19296097)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (13-193)||(48945809-48945988)
chr4 (13-194)||(27023947-27024127)
chr4 (13-194)||(36352631-36352811)
chr4 (88-228)||(25887918-25888057)
chr4 (13-190)||(7510015-7510191)
chr4 (13-190)||(27071583-27071759)
chr4 (13-194)||(34802589-34802769)
chr4 (13-190)||(9768006-9768182)
chr4 (13-190)||(27151675-27151851)
chr4 (13-190)||(4943738-4943914)
chr4 (13-194)||(5944408-5944589)
chr4 (13-97)||(25888080-25888164)
[»] scaffold0088 (3 HSPs)
scaffold0088 (13-194)||(761-941)
scaffold0088 (13-194)||(11336-11516)
scaffold0088 (13-193)||(24645-24824)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (13-194)||(22510805-22510985)
chr6 (13-190)||(19421140-19421316)
chr6 (13-190)||(4271032-4271208)
chr6 (13-190)||(14180507-14180683)
chr6 (13-194)||(18902553-18902733)
chr6 (17-190)||(14175971-14176143)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (13-190)||(832-1008)
[»] scaffold1289 (1 HSPs)
scaffold1289 (13-193)||(730-909)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (13-194)||(198330-198509)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (13-190)||(11638-11814)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20275121 - 20274910
Alignment:
Q  17 attttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccgt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20275121 attttgtgattgttgtgtactcatatccaaaagtgctactatttatatagaaaatagtactataacgatcaatatatatattaattgttaatttgactgt 20275022  T
Q  117 tttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcataagat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  20275021 tttaaaattaatattttcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaaaaattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaacttcataagat 20274922  T
Q  217 ttgaagtttaat 228  Q
    ||||| ||||||    
T  20274921 ttgaaatttaat 20274910  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13497264 - 13497088
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  13497264 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 13497167  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13497166 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 13497088  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24776172 - 24775992
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  24776172 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatattaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 24776075  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24776074 accattttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgtttagattatatttcatgtaacctac 24775992  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42436393 - 42436217
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  42436393 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 42436296  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42436295 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 42436217  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2841073 - 2840859
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||  ||||||||    
T  2841073 ctatattttgtgattgttgtgtacttgtaccaaaaagtgctactatttatgtagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taatcattaatttg 2840976  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||    
T  2840975 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaaattaacttcat 2840876  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  2840875 aacatttgaaatttaat 2840859  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49005600 - 49005386
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  || || ||||||||    
T  49005600 ctatattttgtaattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttttatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--tacttattaatttg 49005503  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  49005502 accgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgcgcattaaacgattatattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaacttcat 49005403  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  49005402 aacatttgaaatttaat 49005386  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45537593 - 45537413
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  45537593 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 45537496  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45537495 gccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgcaacctac 45537413  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2023769 - 2023590
Alignment:
Q  14 tatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  2023769 tatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttga 2023672  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  2023671 ccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctac 2023590  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32050486 - 32050311
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  32050486 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 32050389  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32050388 accgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaa 32050311  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 38983978 - 38984157
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||  ||||||||    
T  38983978 ctatattttgtgattgttgtgtacttctacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taatcattaatttg 38984075  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38984076 atcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaaccta 38984157  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42807446 - 42807268
Alignment:
Q  14 tatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatag-aaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||  |||   |||  |||| |||||||| |||||||||    
T  42807446 tatatattgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttataaagaaaaatagtaccgtaaaagtta--atatctattaattattaatttga 42807349  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42807348 ccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 42807268  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 43642605 - 43642785
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  43642605 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccataagcgctactatttatatagaaaaatattatcataacggttaatatctat--taattattaatttg 43642702  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  43642703 accgttttaaaattaatataatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgtttagattttatttcatgtaacctac 43642785  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18410948 - 18410768
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  18410948 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 18410851  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18410850 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 18410768  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 28645212 - 28645392
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  28645212 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 28645309  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28645310 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 28645392  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 32523404 - 32523584
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  32523404 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 32523501  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32523502 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 32523584  T

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Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 29088571 - 29088789
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatat--atatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  29088571 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgctactatttatatagaaaatagtactataacgattaatatatatatattaattgctaattt 29088670  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnntt-aacttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       || ||||||    
T  29088671 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacgtacaaaaaaattaaacttc 29088770  T
Q  210 ataagatttgaagtttaat 228  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  29088771 ataagatttgaaatttaat 29088789  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22514555 - 22514379
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  22514555 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 22514458  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22514457 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 22514379  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 39621535 - 39621715
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  39621535 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctat--taattattaatttg 39621632  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39621633 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatattttatgtaacctac 39621715  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40558138 - 40557962
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  40558138 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 40558041  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40558040 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 40557962  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 12501106 - 12501285
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||| ||||    
T  12501106 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtaccaaaaac-gctactattgatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattattttg 12501202  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12501203 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 12501285  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6417305 - 6417126
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| ||||||||    
T  6417305 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaatttg 6417208  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6417207 accgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 6417126  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 13279164 - 13279340
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  13279164 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 13279261  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13279262 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 13279340  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16428889 - 16428713
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  16428889 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 16428792  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16428791 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 16428713  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33442061 - 33441885
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  33442061 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctgctatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 33441964  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33441963 accgttttaaaattaatattattaacaactttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 33441885  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 18385033 - 18385213
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  18385033 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 18385130  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18385131 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 18385213  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 36895975 - 36896151
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |  |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  36895975 ctatattttgtgattgttgtgtactcatatccaaaatctccactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaattta 36896072  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36896073 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 36896151  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 16885908 - 16886009
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885908 ctatattttatgattgttgtgtactcatacctaaaagtgctactatttatatagaaaatagtactataacgattaatatatatattaattgttaatttga 16886007  T
Q  113 cc 114  Q
    ||    
T  16886008 cc 16886009  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 16888127 - 16888211
Alignment:
Q  110 tgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888127 tgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 16888211  T

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Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 3554417 - 3554600
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatat--atatattaattgttaattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3554417 ctatattttgtgattgttgtgtattcatacctaaaagtgctactatttatataaaaaatagtactataacgattaatatatatatattaattgttaattt 3554516  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3554517 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 3554600  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 4650870 - 4651084
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||  ||||||||    
T  4650870 ctatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taatcattaatttg 4650967  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||    
T  4650968 atcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaaaattataaaatatgcattaaacgattagattatatttgatgtaacctacaaaaaaattaacttcat 4651067  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  4651068 aacatttgaaatttaat 4651084  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6905158 - 6904979
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||  ||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  6905158 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttataaagaaaaatagtaccgtaacggttaatatctat--taattattaatttg 6905061  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6905060 accgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 6904979  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42224702 - 42224596
Alignment:
Q  88 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42224702 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgt 42224603  T
Q  188 aacctac 194  Q
    |||||||    
T  42224602 aacctac 42224596  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9617083 - 9616908
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  9617083 ctatattttatgattgttgtgtactcgtatccaaaagcg-tactatttatacagaaaaatagtactataacggttaatatctat--taattgttaatttg 9616987  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9616986 accgttttaaagttaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaac 9616908  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40264141 - 40263964
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||   |||||||| | ||||||| |||  ||||| ||| |||||    
T  40264141 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactattgatataaaaaaa--tactataacggttaatatctat--taattattattttga 40264046  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40264045 ccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 40263964  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 4720144 - 4720322
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  4720144 ctatattttgtgattgttgtgtactcgttttcaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 4720241  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4720242 accgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattat-aaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 4720322  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 39121916 - 39122092
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  39121916 ctatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 39122013  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39122014 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 39122092  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 42842434 - 42842610
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  42842434 ctatattttgtaattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 42842531  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  42842532 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 42842610  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 12256076 - 12256248
Alignment:
Q  17 attttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  12256076 attttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttgaccg 12256173  T
Q  116 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  12256174 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaac 12256248  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42224807 - 42224723
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42224807 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaacttgctactatttatatagaaaataatactataacgattaatatatatat 42224723  T

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Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 22386370 - 22386505
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22386370 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtaccataacgattaatatatatattaattgttaatttta 22386469  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22386470 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatat 22386505  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 5811962 - 5812142
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  5811962 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctat--taattattaatttg 5812059  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5812060 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctac 5812142  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 1212092 - 1212268
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  1212092 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 1212189  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1212190 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaatgattaaattatatttcatgtaac 1212268  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 1598087 - 1598266
Alignment:
Q  14 tatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  1598087 tatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttga 1598184  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  1598185 ccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctac 1598266  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16476314 - 16476138
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  16476314 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatatctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 16476217  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16476216 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 16476138  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 23106945 - 23107121
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  23106945 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 23107042  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23107043 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 23107121  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25336793 - 25336617
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||  ||||| | |||||     
T  25336793 ctatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatatat--taattatcaattta 25336696  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  25336695 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 25336617  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 36789099 - 36789276
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| | ||||||| | ||||||    
T  36789099 ctatattttgtgattattgtatactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaa-attaattatcaatttg 36789197  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  36789198 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatattttatgtaac 36789276  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40831191 - 40831012
Alignment:
Q  14 tatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||     
T  40831191 tatattttgtgattgttgtgtactcgaacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttgg 40831094  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  40831093 ccgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattatattatatttcatgtaacctac 40831012  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16478901 - 16478721
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  16478901 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 16478804  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16478803 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 16478721  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 22720722 - 22720894
Alignment:
Q  17 attttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  22720722 attttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttgaccg 22720819  T
Q  116 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22720820 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaac 22720894  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 28968962 - 28969138
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  28968962 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 28969059  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28969060 atcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 28969138  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 39564642 - 39564821
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| ||||||||    
T  39564642 ctatattttgtgattgttgtgtactcg-acccaaaaacgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctaa--taattattaatttg 39564738  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39564739 accgttttaaaattaacattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctac 39564821  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 22496401 - 22496520
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatag-aaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||  |||| |||||||| ||||||||    
T  22496401 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggtta--atatctattaattattaatttg 22496498  T
Q  112 accgttttaaaattaatattat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22496499 accgttttaaaattaatattat 22496520  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 22496511 - 22496563
Alignment:
Q  142 ttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22496511 ttaatattataaaatgtgtattaaatgattatattatatttcatgtaacctac 22496563  T

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Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 4066134 - 4066348
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  4066134 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 4066231  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  4066232 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaacttcat 4066331  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  4066332 aacatttgaaatttaat 4066348  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 28417786 - 28417966
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  28417786 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 28417883  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28417884 accgttttaaaattaatattataaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 28417966  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37965509 - 37965329
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  37965509 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 37965412  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37965411 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 37965329  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 33955314 - 33955528
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  33955314 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttgtatagaaaaatagtactataacggttaatatctat--taattattaatttg 33955411  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  33955412 accgttttaaaattaatattatcaacttatttaatattataaaatgtgcatttaactattagattatatttcatgtaacctacaaaaaaattaacttcat 33955511  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  33955512 aacatttgaaatttaat 33955528  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 47333834 - 47334014
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  47333834 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 47333931  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47333932 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattttaaaatatgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 47334014  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22398534 - 22398354
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  22398534 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 22398437  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22398436 gccgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgcgcattaaaagattatattatatttcatgtaacctac 22398354  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 35350224 - 35350400
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  35350224 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 35350321  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35350322 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 35350400  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23303516 - 23303410
Alignment:
Q  88 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23303516 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgt 23303417  T
Q  188 aacctac 194  Q
    |||||||    
T  23303416 aacctac 23303410  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 3344441 - 3344615
Alignment:
Q  19 tttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccgtt 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  3344441 tttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatatatatagaaaaataataccataacggttaatatctat--taattattaagttgaccgtt 3344538  T
Q  118 ttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3344539 ttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 3344615  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23302858 - 23302720
Alignment:
Q  89 tatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23302858 tatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacatctttaatattattaaatgtacattaaacgattagattatatttcatgta 23302759  T
Q  189 acctacnnnnnnnttaacttcataagatttgaagtttaat 228  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23302758 acctac-aaaaaattaacttcataagatttgaaatttaat 23302720  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 10122100 - 10122276
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  10122100 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaattta 10122197  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10122198 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 10122276  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 26705536 - 26705712
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  26705536 ctatattttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 26705633  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26705634 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 26705712  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 33956618 - 33956832
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  33956618 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtactcaagagctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 33956715  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctacnnnnnnnttaacttcat 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||       ||||||||||    
T  33956716 accgtgttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcatttaacgattaaattatatttcatgtaacatacaaaaaaattaacttcat 33956815  T
Q  212 aagatttgaagtttaat 228  Q
    || ||||||| ||||||    
T  33956816 aacatttgaaatttaat 33956832  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 1002432 - 1002608
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  1002432 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 1002529  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1002530 actgttttaaaattaatatcatcaacgtctttaatattataaaacatgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 1002608  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43845531 - 43845355
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  43845531 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 43845434  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  43845433 atcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 43845355  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54610887 - 54610711
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  54610887 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 54610790  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  54610789 atcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 54610711  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30107390 - 30107214
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  30107390 ctatattttgtgattgttgtatactcatacccaaaagctcaactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 30107293  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30107292 accgttttaaaattaatattataaacaactttaatattataaaaagtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 30107214  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 189
Target Start/End: Original strand, 38189954 - 38190053
Alignment:
Q  90 atatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaa 189  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38189954 atataaattaattatcaatttgaccgttttaaaattaatattaactacgtctttaatattataaaatgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaa 38190053  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23303625 - 23303541
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23303625 ctatattttgtgattgttgtgtactcagacccaaaagtgctactatttatatagaaaatggtactataacgattaatatatatat 23303541  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 45579507 - 45579705
Alignment:
Q  14 tatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttga 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||| |||   |||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  45579507 tatattttgtgagtgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatggaaaggtagtaccatagcaattaatatctat--taattattaatttga 45579604  T
Q  113 ccgttttaaaattaatattat--------------------caacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacct 192  Q
    |||| ||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45579605 ccgtgttaaaattaatattatatggaaaggtagtaccatagcaacgtctttaatattataaaatgtgcattaaatggatagattatatttcatgtaacct 45579704  T

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Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 47400165 - 47400361
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatat--------------------a 92  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||                    |    
T  47400165 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaataatactataacgattaatatatatatatatatatatatata 47400264  T
Q  93 tatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47400265 tatattaattgttaatttgatcgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaa 47400361  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6613375 - 6613195
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| |||  |||    
T  6613375 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtatccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattacattg 6613278  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6613277 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 6613195  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 21953598 - 21953778
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||  ||||| ||||||||    
T  21953598 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaataactat--taattattaatttg 21953695  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21953696 atcgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtacactaaacgattagattatatttcatttaacctac 21953778  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 9178762 - 9178935
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  9178762 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtaccgaaaagtgctactatttatataaaaaaatagttccataatggttaatatctat--taattattaatttg 9178859  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9178860 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgcattaaaagattagattatatttcatgt 9178935  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35505569 - 35505393
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  35505569 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 35505472  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35505471 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 35505393  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46805485 - 46805305
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  46805485 ctatattttgtgattattgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctat--taattattaatttg 46805388  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46805387 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttagtattataaaatgtgtattaaataattagattatatttcatgtaacctac 46805305  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 18784028 - 18784204
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  18784028 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 18784125  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18784126 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 18784204  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42047327 - 42047151
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  42047327 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 42047230  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42047229 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 42047151  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42050030 - 42049850
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| |||||||    
T  42050030 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 42049933  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42049932 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 42049850  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 34643238 - 34643417
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| ||||||||    
T  34643238 ctatattttgtgattgttgtgtacttgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaatttg 34643335  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34643336 accgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 34643417  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 44044972 - 44045144
Alignment:
Q  17 attttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccg 115  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  44044972 attttgtgattgttgtttactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttgaccg 44045069  T
Q  116 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  44045070 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacggttaaattatatttcatgtaac 44045144  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 37315502 - 37315678
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  37315502 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 37315599  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  37315600 atcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 37315678  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35114082 - 35113906
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  35114082 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttagatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 35113985  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  35113984 atcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 35113906  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 19296006 - 19296097
Alignment:
Q  96 attaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19296006 attaattattaatttaaccgttttaaaatcaatatta---acgtctttaattttataaaatgtgcattaaatgattgtattatatttcatgtaac 19296097  T

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Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48945988 - 48945809
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  48945988 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaagctctactatttatatagaaaagtagtaccataacgattaatatctat--taattattaatttg 48945891  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48945890 accgttttaatattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 48945809  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 27023947 - 27024127
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  27023947 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagtgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 27024044  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27024045 accattttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatataacctac 27024127  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 36352631 - 36352811
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  36352631 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 36352728  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36352729 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacaattagattatatttcatgtaacctac 36352811  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25888057 - 25887918
Alignment:
Q  88 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25888057 atatatatattaattgttaatttgaccgttttaaaattaatattatcaacttctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgt 25887958  T
Q  188 aacctacnnnnnnnttaacttcataagatttgaagtttaat 228  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25887957 aacctac-aaaaaattaacttcataagatttgaaatttaat 25887918  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7510191 - 7510015
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  7510191 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 7510094  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7510093 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 7510015  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27071759 - 27071583
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  27071759 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 27071662  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27071661 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 27071583  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34802769 - 34802589
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||  ||||||||    
T  34802769 ctatattttatgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatacagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taataattaatttg 34802672  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34802671 aacgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 34802589  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 9768006 - 9768182
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||  ||  ||||| | ||||||    
T  9768006 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatcaat--taattatcaatttg 9768103  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  9768104 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaagttatatttcatgtaac 9768182  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27151851 - 27151675
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || |||||| | ||||||    
T  27151851 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatata-at-ttaattatcaatttg 27151754  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27151753 acagttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtgatttaaacgattaaattatatttcatgtaac 27151675  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4943914 - 4943738
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||  ||||| | ||||||    
T  4943914 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 4943817  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4943816 atcgttctaaaattaatattatcaacatctttaatattataaaacgtgcattaaacaattaaattatatttcatgtaac 4943738  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5944589 - 5944408
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa---tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatt 109  Q
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T  5944589 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaatt 5944492  T
Q  110 tgaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
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T  5944491 taaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 5944408  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25888164 - 25888080
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataatgattaatatatatat 97  Q
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T  25888164 ctatattttgtgattgttgtgtacttatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaatagtactataacgattaatatatatat 25888080  T

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Target: scaffold0088 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 761 - 941
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatag-aaaatagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  761 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacccaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacagtta--atatctgttaattattaatttg 858  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
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T  859 accgttttaaaattaatattatcaacgtttttaatattataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaacctac 941  T

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Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11516 - 11336
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  11516 ctatattttgtgatttttgtgtactcgtacccaaaagcgcgactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 11419  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
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T  11418 accgttttaaaattaatattatcaacatatttaatattataaaatgtgcattaaacacttagattatatttcatgtaacctac 11336  T

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Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 24645 - 24824
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  24645 ctatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 24742  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24743 gcagttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 24824  T

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Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22510985 - 22510805
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||  ||||| |||||||     
T  22510985 ctatattttgtgattgttgtgtactcatgaccaaaaatgctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatatctat--taattattaattta 22510888  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22510887 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatgtgtattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 22510805  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19421316 - 19421140
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  19421316 ctatattttatgattgttgtgtacttgtacccaaatgcgctactatttatatagaaaaatagtacgataacggttaatatctat--taattattaatttg 19421219  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19421218 accgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatattataaaatatgtattaaatgattagattatatttcatgtaac 19421140  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 4271032 - 4271208
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  4271032 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 4271129  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
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T  4271130 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 4271208  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14180683 - 14180507
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  14180683 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 14180586  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
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T  14180585 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 14180507  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 18902553 - 18902733
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa--tagtactataatgattaatatatatattaattgttaattt 110  Q
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T  18902553 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaattt 18902650  T
Q  111 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
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T  18902651 gaccgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 18902733  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14176143 - 14175971
Alignment:
Q  17 attttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttgaccg 115  Q
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T  14176143 attttgtgattgttatgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatttat--taattatcaattttaccg 14176046  T
Q  116 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
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T  14176045 ttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 14175971  T

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Target: scaffold1788 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 832 - 1008
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  832 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaaactctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatataaat--taattatcaatttg 929  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
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T  930 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 1008  T

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Target: scaffold1289 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 909 - 730
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
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T  909 ctatattttgtgattgttgtgtactcgttctcaaaagcgctactatttatatagaaaaatagtaccataacggttaatatctat--taattattaatttg 812  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaaccta 193  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  811 tctgttttaaaattaatattatcaacgtatttaatatgataaaatgtgcattaaacgattagattatatttcatgtaaccta 730  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 198330 - 198509
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||   ||||| ||||||||    
T  198330 ctatattttgtgattgttgtgtactcgtacctaaaagcgctactatttatataaaaaaatagtaccataacggttaatatctac--taattattaatttg 198427  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaacctac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  198428 accgttttaaaattaatattatcaacgtaattaatattataaaatgtgcatt-aatgattagattatatttcatctaacctac 198509  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11814 - 11638
Alignment:
Q  13 ctatattttgtgattgttgtgtgctcatacccaaaagtgcttctatttatatagaaaa-tagtactataatgattaatatatatattaattgttaatttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||  ||||| | |||||     
T  11814 ctatattttgtgattgttgtgtactcatacccaaaatctctactatttatatagaaaaatagtatcataacggttaatataaat--taattatcaattta 11717  T
Q  112 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaatgtacattaaatgattagattatatttcatgtaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11716 accgttttaaaattaatattatcaacgtctttaatattataaaacgtgcattaaacgattaaattatatttcatgtaac 11638  T

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