View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3568_low_10 (Length: 237)

Name: NF3568_low_10
Description: NF3568
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3568_low_10
NF3568_low_10
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-229)||(42997324-42997552)
chr4 (1-229)||(14708508-14708736)
chr4 (3-229)||(28569320-28569546)
chr4 (5-229)||(3412802-3413023)
chr4 (58-227)||(15224800-15224969)
chr4 (55-229)||(18236895-18237068)
chr4 (3-229)||(16243277-16243502)
chr4 (3-229)||(19757478-19757703)
chr4 (3-229)||(19782103-19782328)
chr4 (43-229)||(26243581-26243767)
chr4 (3-229)||(2014782-2015007)
chr4 (43-229)||(23139275-23139460)
chr4 (14-209)||(18222265-18222460)
chr4 (5-207)||(9530460-9530660)
chr4 (13-229)||(17152373-17152589)
chr4 (43-229)||(1951677-1951864)
chr4 (43-229)||(18602662-18602833)
chr4 (103-229)||(45938152-45938276)
chr4 (14-229)||(18228740-18228956)
chr4 (143-229)||(43256428-43256514)
chr4 (143-229)||(18609319-18609405)
chr4 (104-229)||(22634398-22634525)
chr4 (43-78)||(18609256-18609291)
chr4 (3-39)||(4561210-4561246)
chr4 (3-39)||(5756814-5756850)
chr4 (3-39)||(9556724-9556760)
chr4 (161-225)||(20157502-20157566)
chr4 (3-39)||(33742571-33742607)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (1-229)||(1903-2131)
scaffold0546 (14-229)||(6144-6359)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (1-229)||(11176-11404)
scaffold0109 (1-229)||(38693-38921)
scaffold0109 (14-229)||(6948-7163)
scaffold0109 (3-39)||(35819-35855)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-229)||(32605214-32605442)
chr8 (1-229)||(32598682-32598910)
chr8 (1-229)||(17055263-17055481)
chr8 (3-229)||(23846892-23847117)
chr8 (14-229)||(30308641-30308855)
chr8 (3-229)||(16231352-16231578)
chr8 (104-229)||(15531893-15532018)
chr8 (3-96)||(22113604-22113697)
chr8 (3-96)||(22135107-22135200)
chr8 (3-229)||(23834175-23834402)
chr8 (14-229)||(15538452-15538667)
chr8 (20-229)||(17828476-17828684)
chr8 (3-96)||(22166257-22166350)
chr8 (14-209)||(22044908-22045103)
chr8 (138-229)||(24445517-24445608)
chr8 (143-229)||(21387077-21387163)
chr8 (143-229)||(21383657-21383743)
chr8 (143-229)||(14398124-14398210)
chr8 (14-134)||(22028656-22028776)
chr8 (14-134)||(18619577-18619697)
chr8 (3-39)||(19278159-19278195)
chr8 (3-39)||(21972461-21972497)
chr8 (3-39)||(21976546-21976582)
chr8 (3-39)||(22112045-22112081)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-229)||(1880-2108)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-229)||(41666953-41667181)
chr2 (1-229)||(26125212-26125435)
chr2 (14-229)||(60820-61034)
chr2 (43-229)||(27263276-27263463)
chr2 (5-229)||(23187079-23187302)
chr2 (5-229)||(23598342-23598565)
chr2 (3-229)||(19928379-19928604)
chr2 (20-229)||(18855354-18855561)
chr2 (43-209)||(22461105-22461270)
chr2 (143-229)||(31344881-31344967)
chr2 (3-209)||(41530886-41531087)
chr2 (3-39)||(12901388-12901424)
chr2 (3-39)||(15477797-15477833)
chr2 (165-209)||(22811958-22812002)
chr2 (3-39)||(24628355-24628391)
chr2 (3-39)||(27379309-27379345)
chr2 (3-39)||(27383355-27383391)
chr2 (3-39)||(27601990-27602026)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (3-229)||(77047-77273)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-229)||(9338-9566)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-229)||(25135546-25135774)
chr6 (1-229)||(21702291-21702519)
chr6 (43-229)||(1587647-1587833)
chr6 (43-229)||(20803469-20803656)
chr6 (58-227)||(31478162-31478331)
chr6 (58-227)||(1644293-1644462)
chr6 (55-229)||(5616744-5616917)
chr6 (3-229)||(22592681-22592905)
chr6 (3-229)||(9482170-9482395)
chr6 (3-229)||(12496312-12496537)
chr6 (3-229)||(12706692-12706918)
chr6 (3-208)||(16741231-16741435)
chr6 (43-209)||(19662794-19662959)
chr6 (43-229)||(2685235-2685421)
chr6 (143-229)||(23414649-23414735)
chr6 (143-229)||(27556407-27556493)
chr6 (161-227)||(16624137-16624203)
chr6 (171-229)||(27416231-27416289)
chr6 (104-209)||(22430006-22430113)
chr6 (3-39)||(11567056-11567092)
chr6 (3-39)||(12618721-12618757)
chr6 (3-39)||(23395262-23395298)
chr6 (3-39)||(23990114-23990150)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (3-229)||(21885065-21885291)
chr5 (3-229)||(26172468-26172694)
chr5 (14-229)||(4036223-4036439)
chr5 (43-229)||(25229322-25229508)
chr5 (43-229)||(25293478-25293664)
chr5 (58-227)||(10752949-10753118)
chr5 (3-229)||(33409232-33409457)
chr5 (3-229)||(16674156-16674381)
chr5 (43-229)||(18774206-18774394)
chr5 (20-229)||(42805423-42805633)
chr5 (20-229)||(21340660-21340869)
chr5 (14-229)||(18784049-18784266)
chr5 (3-227)||(17718316-17718538)
chr5 (20-229)||(26742639-26742849)
chr5 (43-229)||(26666047-26666233)
chr5 (43-229)||(26937644-26937830)
chr5 (143-229)||(18355961-18356047)
chr5 (143-229)||(20911186-20911272)
chr5 (43-229)||(24532964-24533150)
chr5 (43-207)||(20232577-20232740)
chr5 (161-229)||(23535622-23535690)
chr5 (3-39)||(19472596-19472632)
chr5 (3-39)||(20296041-20296077)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-229)||(62264-62492)
scaffold0044 (161-229)||(12907-12975)
scaffold0044 (161-229)||(19191-19259)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (5-229)||(8503-8727)
scaffold0111 (51-229)||(15647-15825)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-226)||(16537-16762)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-229)||(35151609-35151837)
chr7 (1-229)||(16275495-16275723)
chr7 (14-229)||(14216918-14217133)
chr7 (43-229)||(15728328-15728514)
chr7 (5-229)||(16724510-16724732)
chr7 (5-229)||(17701524-17701746)
chr7 (43-229)||(18556976-18557162)
chr7 (3-229)||(13149158-13149383)
chr7 (14-229)||(8917430-8917645)
chr7 (14-229)||(13461764-13461980)
chr7 (14-229)||(18945-19161)
chr7 (43-209)||(11987235-11987401)
chr7 (43-229)||(9593348-9593535)
chr7 (78-209)||(16457309-16457439)
chr7 (143-229)||(13918795-13918881)
chr7 (143-229)||(25927518-25927604)
chr7 (160-229)||(1859118-1859187)
chr7 (66-208)||(6801237-6801378)
chr7 (122-227)||(2530385-2530491)
chr7 (104-229)||(13635445-13635572)
chr7 (161-229)||(15580694-15580762)
chr7 (143-227)||(18425443-18425527)
chr7 (143-209)||(7519373-7519439)
chr7 (104-229)||(16583259-16583386)
chr7 (161-229)||(12318130-12318198)
chr7 (3-39)||(12704535-12704571)
chr7 (3-39)||(12715058-12715094)
chr7 (3-39)||(12718862-12718898)
chr7 (3-39)||(12723773-12723809)
chr7 (3-39)||(16114435-16114471)
chr7 (3-39)||(16117588-16117624)
chr7 (3-39)||(16907077-16907113)
chr7 (3-39)||(18279597-18279633)
chr7 (3-39)||(18283560-18283596)
chr7 (3-39)||(26292589-26292625)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (3-229)||(15341-15567)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (3-229)||(16696789-16697022)
chr3 (58-227)||(4589125-4589294)
chr3 (58-227)||(19775353-19775522)
chr3 (3-229)||(3833678-3833903)
chr3 (3-229)||(38814388-38814613)
chr3 (21-229)||(16797948-16798156)
chr3 (55-229)||(15941833-15942006)
chr3 (21-229)||(16808775-16808983)
chr3 (43-209)||(17241997-17242162)
chr3 (116-229)||(1598469-1598581)
chr3 (143-229)||(8489487-8489573)
chr3 (143-229)||(15464869-15464955)
chr3 (143-229)||(5223068-5223154)
chr3 (143-229)||(12339470-12339556)
chr3 (106-227)||(15850063-15850183)
chr3 (143-228)||(11854422-11854507)
chr3 (105-227)||(31097532-31097656)
chr3 (3-94)||(16865010-16865101)
chr3 (143-227)||(16750605-16750689)
chr3 (104-229)||(15482666-15482793)
chr3 (143-229)||(11300781-11300868)
chr3 (3-209)||(15617400-15617607)
chr3 (161-209)||(2897858-2897906)
chr3 (3-39)||(7109895-7109931)
chr3 (3-39)||(7113830-7113866)
chr3 (161-209)||(14668583-14668631)
chr3 (161-209)||(19725953-19726001)
chr3 (3-39)||(22321861-22321897)
chr3 (3-39)||(22336916-22336952)
chr3 (3-39)||(27409520-27409556)
chr3 (3-39)||(28949921-28949957)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (47-229)||(5920-6102)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (58-227)||(80300-80469)
scaffold0029 (3-209)||(65404-65611)
scaffold0029 (104-209)||(80738-80842)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (58-227)||(20229161-20229330)
chr1 (3-229)||(19211870-19212096)
chr1 (3-229)||(46975471-46975696)
chr1 (54-229)||(18882371-18882545)
chr1 (3-229)||(20138086-20138312)
chr1 (43-209)||(12646895-12647060)
chr1 (143-229)||(33797286-33797372)
chr1 (14-209)||(23819186-23819381)
chr1 (143-227)||(41388258-41388342)
chr1 (161-227)||(39244176-39244242)
chr1 (161-227)||(39247731-39247797)
chr1 (162-229)||(36819345-36819412)
chr1 (1-35)||(21615635-21615669)
chr1 (3-39)||(16375334-16375370)
chr1 (3-39)||(20228685-20228721)
chr1 (3-39)||(21407549-21407585)
chr1 (3-39)||(52639735-52639771)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (58-227)||(80706-80876)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (3-229)||(9907-10132)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (3-229)||(63858-64082)
scaffold0042 (14-229)||(75742-75956)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (21-229)||(372-565)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (3-229)||(18358-18583)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (3-229)||(9424-9649)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-229)||(36310-36518)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (14-209)||(18247-18442)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (3-229)||(3407-3633)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (14-185)||(23264-23435)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (20-229)||(139715-139923)
scaffold0003 (171-229)||(71072-71130)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (3-229)||(19894-20119)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (3-229)||(24845-25072)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (104-229)||(173295-173420)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (104-229)||(228350-228475)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (143-229)||(20480-20566)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (104-229)||(2649-2775)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (143-229)||(6684-6770)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (20-229)||(18525-18735)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (143-227)||(30890-30974)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (161-229)||(207883-207951)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (43-156)||(6-119)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (161-209)||(185-233)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (3-39)||(58595-58631)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 42997324 - 42997552
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42997324 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 42997423  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  42997424 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactga 42997523  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42997524 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 42997552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 14708508 - 14708736
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14708508 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaactgtgaagctttatgagttgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 14708607  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  14708608 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 14708707  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14708708 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 14708736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 28569320 - 28569546
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28569320 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattata 28569419  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  28569420 ctcacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 28569519  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28569520 tgcatgattatgaataagttgatgatg 28569546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3413023 - 3412802
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatact 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3413023 ttaggtact-aatgagacctattaaagatattgatgag-aactgtgaagctttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 3412926  T
Q  105 tacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttg 204  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  3412925 ta-ttgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagttg 3412827  T
Q  205 catgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  3412826 catgagtatgaataagttgatgatg 3412802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15224969 - 15224800
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15224969 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatgaattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 15224870  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15224869 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 15224800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18237068 - 18236895
Alignment:
Q  55 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttttta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| |||    
T  18237068 tttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgtta 18236970  T
Q  155 tttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18236969 ttaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 18236895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 16243277 - 16243502
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||||| ||      
T  16243277 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattga-ttgc 16243374  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16243375 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16243474  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  16243475 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 16243502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19757478 - 19757703
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  19757478 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 19757575  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19757576 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19757675  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19757676 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19757703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19782328 - 19782103
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  19782328 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 19782231  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19782230 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19782131  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19782130 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19782103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 26243581 - 26243767
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26243581 gaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatga-ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttga 26243679  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  26243680 gaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 26243767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2015007 - 2014782
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||      
T  2015007 ctttaggtact-aaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 2014910  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2014909 ctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 2014810  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  2014809 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 2014782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23139460 - 23139275
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||    
T  23139460 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccatacttgaattattgttaattgatcaagaat-tgttga 23139363  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23139362 gaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23139275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 18222265 - 18222460
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  18222265 taatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 18222363  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || || || |||||||||| || | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18222364 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 18222460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9530660 - 9530460
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatac 103  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||| ||        
T  9530660 ttaggtact-aatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtga-ttgcct 9530563  T
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  9530562 ttactcgaattattgttaattgatcaagaat-tgttgagaatgatttattattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaactaagtt 9530464  T
Q  204 gcat 207  Q
    ||||    
T  9530463 gcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 17152373 - 17152589
Alignment:
Q  13 ttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttga 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  17152373 ttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttga 17152471  T
Q  112 attgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatt 211  Q
    ||| || || |||||||||| || | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17152472 attattattgaatgatcaaggaattgttga-aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 17152570  T
Q  212 atgta-taagttgatgatg 229  Q
     || | |||||||||||||    
T  17152571 ctgaattaagttgatgatg 17152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 1951677 - 1951864
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||| || |||||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||    
T  1951677 gaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattga-ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttga 1951775  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
     ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  1951776 aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 1951864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 18602662 - 18602833
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||               ||||| ||||||  |||||  ||||||    
T  18602662 gaactgtgaagctttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaatta---------------ttgttgaatgattgagaaatgattgag 18602746  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18602747 aatgatttgttgtttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataagttgacgatg 18602833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45938276 - 45938152
Alignment:
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  45938276 cttacttga-ttattgttaattgatcaagaat-tgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaaga 45938179  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45938178 tgcatgtctatgtataagctgatgatg 45938152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18228740 - 18228956
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||    
T  18228740 taatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgtctttacttgaa 18228838  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || || || |||||||||| || | |||  ||||| || ||||  | |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |     
T  18228839 ttattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagcttgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaactaagttgcatgagtc 18228938  T
Q  213 tgta-taagttgatgatg 229  Q
    || | |||||||||||||    
T  18228939 tgaattaagttgatgatg 18228956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 43256428 - 43256514
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43256428 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 43256514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 18609319 - 18609405
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18609319 aatgatttgttgtttaacctcatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataagttgacgatg 18609405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 22634398 - 22634525
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||| ||||| ||  |||| | |  |||||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||    
T  22634398 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 22634497  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  | || ||||||||||||||    
T  22634498 ttgcatgcgtctgaataagttgatgatg 22634525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 78
Target Start/End: Original strand, 18609256 - 18609291
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatg 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18609256 gaactgtgaagctttatgaattgttaagtgattatg 18609291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 4561210 - 4561246
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4561210 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 4561246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 5756814 - 5756850
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5756814 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 5756850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 9556760 - 9556724
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9556760 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 9556724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 20157502 - 20157566
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgat 225  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  20157502 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgat 20157566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 33742607 - 33742571
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33742607 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 33742571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2131 - 1903
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131 agctttaggtatttaatgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtggagctttatgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 2032  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2031 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactga 1932  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1931 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6359
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  6144 taatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 6242  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| ||||||||||||  |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||  |    
T  6243 ttattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagca 6342  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  6343 tgaataagttgatgatg 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11176 - 11404
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11176 agctttaggtatttaatgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtggagctttatgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 11275  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11276 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactga 11375  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11376 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 11404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 38693 - 38921
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38693 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcatgaaccgtggagctttatgaattgataaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 38792  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38793 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagagtgatttgttatttaacttgatgtcatttgataatgctgcaaatgttatttaactga 38892  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38893 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 38921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7163 - 6948
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  7163 taatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 7065  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| ||||||||||||  |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||  |    
T  7064 ttattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagca 6965  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  6964 tgaataagttgatgatg 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 35819 - 35855
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35819 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 35855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32605442 - 32605214
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32605442 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 32605343  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  32605342 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaa 32605243  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32605242 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 32605214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32598910 - 32598682
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32598910 agctttaggtacttagtgtgacctattacagattatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 32598811  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  32598810 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttgacttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaa 32598711  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32598710 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 32598682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17055263 - 17055481
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17055263 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 17055362  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  17055363 tacttacttgaattgttgtt----------gaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 17055452  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17055453 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 17055481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 23846892 - 23847117
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  23846892 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 23846989  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23846990 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 23847089  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23847090 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 30308641 - 30308855
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  30308641 taatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgta-ttacttgaa 30308738  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||| |||||||| ||    
T  30308739 ttattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaatctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaatttgcatgagta 30308838  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  30308839 tgaataagttgatgatg 30308855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 16231352 - 16231578
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||      
T  16231352 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgc 16231449  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||  | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  16231450 atttacttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16231549  T
Q  202 ttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || | |||||||||||||    
T  16231550 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 16231578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15532018 - 15531893
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15532018 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagtt 15531919  T
Q  204 gcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||    
T  15531918 gcatgtctatgtataagctgatgatg 15531893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 22113604 - 22113697
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattga 96  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22113604 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22113697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 22135107 - 22135200
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattga 96  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22135107 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22135200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23834402 - 23834175
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaatta 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||     
T  23834402 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactga-ttg 23834305  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||     
T  23834304 tatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaactat 23834205  T
Q  201 gttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||||    
T  23834204 gttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 23834175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15538667 - 15538452
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||| ||| ||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| ||    ||||||||     
T  15538667 taatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattga-ttgcctttacttgag 15538569  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  15538568 ttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtcta 15538469  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||    
T  15538468 tgtataagctgatgatg 15538452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 17828476 - 17828684
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||| |||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||  ||| |  |||||||| || |||    
T  17828476 gacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattgtctttacttga-ttattg 17828574  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtata 218  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  17828575 ttaattgatcaagaat-tgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagttgcatgtctatgtata 17828673  T
Q  219 agttgatgatg 229  Q
    || ||||||||    
T  17828674 agctgatgatg 17828684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 22166257 - 22166350
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattga 96  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22166257 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaagtgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 22166350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22045103 - 22044908
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||  | |||||||||    
T  22045103 taatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgcatttacttgaa 22045005  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || || |  ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  22045004 ttattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagttgcatga 22044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 24445517 - 24445608
Alignment:
Q  138 ttgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24445517 ttgagaatgatttgttatgaaacctgatgtgatttgattatgctgtaaatgttatttaactaagttgcatgtctatgtataagctgatgatg 24445608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21387163 - 21387077
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21387163 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21383743 - 21383657
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21383743 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 21383657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 14398124 - 14398210
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14398124 aatgaattgttattaagctttatgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 14398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22028776 - 22028656
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||    
T  22028776 taatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattg-attgcatttacttgaa 22028678  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaa 134  Q
    || || || |||||||||||||    
T  22028677 ttattattgaatgatcaagaaa 22028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18619697 - 18619577
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||  |||||||||| || |  |||||||||    
T  18619697 taatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattga-ttgtctttacttgaa 18619599  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaa 134  Q
    || || || |||||||||||||    
T  18619598 ttattattgaatgatcaagaaa 18619577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 19278159 - 19278195
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19278159 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 19278195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 21972461 - 21972497
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21972461 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 21972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 21976546 - 21976582
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21976546 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 21976582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22112081 - 22112045
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22112081 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 22112045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2108 - 1880
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2108 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattctggattgaatta 2009  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  2008 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaa 1909  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1908 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41667181 - 41666953
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41667181 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaaactttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatgaattgaatta 41667082  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  41667081 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 41666982  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41666981 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 41666953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26125435 - 26125212
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26125435 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcaagaactgtgaagctttatggattgttaaatgattatgaagtgaattatggatttaatta 26125336  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||      |||||||||||||    
T  26125335 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagtttatgtgatttgattatgct-----tgttatttaactaa 26125241  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26125240 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 26125212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 61034 - 60820
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaat 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  61034 taatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaat 60935  T
Q  114 tgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattat 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||    
T  60934 tattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtga-ttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatat 60836  T
Q  214 gtataagttgatgatg 229  Q
    | |||||||| |||||    
T  60835 gaataagttgttgatg 60820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27263463 - 27263276
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattg-ttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27263463 gaactgtgaagctttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattga 27263364  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27263363 gaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 27263276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23187302 - 23187079
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatac 103  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| ||     
T  23187302 ttaggtact-aatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggatt-aattgtat 23187205  T
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  23187204 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23187105  T
Q  204 gcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||    
T  23187104 ccatgagtatgaataagttgatgatg 23187079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23598565 - 23598342
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatac 103  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| ||     
T  23598565 ttaggtact-aatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggatt-aattgtat 23598468  T
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  23598467 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23598368  T
Q  204 gcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||    
T  23598367 ccatgagtatgaataagttgatgatg 23598342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19928379 - 19928604
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| || |    
T  19928379 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattga-ttgt 19928476  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19928477 ctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19928576  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  19928577 ttgcatgtttatgaataatctgatgatg 19928604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 18855354 - 18855561
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||| |||| | ||| ||    ||||||||||| |||    
T  18855354 gacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtga-ttgcctttacttgaattattg 18855452  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtata 218  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18855453 ttaattgatcaagaat-tgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaactaagttgcatg-ttatgaata 18855550  T
Q  219 agttgatgatg 229  Q
    |  ||||||||    
T  18855551 aactgatgatg 18855561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 22461105 - 22461270
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  22461105 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 22461202  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  22461203 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 22461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31344967 - 31344881
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31344967 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 31344881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 41530886 - 41531087
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttta-tgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||| || ||| || |||| | ||||  ||| ||||| |||      
T  41530886 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattg-attgc 41530984  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||   | |||| ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||    
T  41530985 a-ttacttgaattattattgaatgatcaaga---tgttga-aatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaag 41531079  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  41531080 ttgcatga 41531087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 12901388 - 12901424
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12901388 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12901424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15477833 - 15477797
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15477833 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 15477797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 22811958 - 22812002
Alignment:
Q  165 tgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22811958 tgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 24628355 - 24628391
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24628355 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 24628391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 27379309 - 27379345
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27379309 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 27379345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 27383355 - 27383391
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27383355 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 27383391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 27602026 - 27601990
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27602026 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 27601990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 77047 - 77273
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  77047 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattata 77146  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  77147 cttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 77246  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  77247 tgcatgattatgaataagttgatgatg 77273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9566 - 9338
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  9566 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgcgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatcc 9467  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  9466 tacttacttgagttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 9367  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9366 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 25135546 - 25135774
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25135546 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtggagctttatgaattgataaatgattatgaagtgaactatgaattgaatta 25135645  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  25135646 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaacctattgagagtgattcgttacttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaattga 25135745  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25135746 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 25135774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21702519 - 21702291
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21702519 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 21702420  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||    
T  21702419 tactttcttgaatttttgttgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaa 21702320  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21702319 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 21702291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 1587647 - 1587833
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1587647 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgag 1587746  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1587747 aatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 1587833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 20803469 - 20803656
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20803469 gaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattga 20803568  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20803569 gaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagctgcatgaatatgaataagttgatgatg 20803656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 31478162 - 31478331
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  31478162 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 31478261  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  31478262 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 31478331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1644462 - 1644293
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1644462 atgaattgttaaatgattaagaaatgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 1644363  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  1644362 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 1644293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 5616744 - 5616917
Alignment:
Q  55 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttttta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  5616744 tttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgtta 5616842  T
Q  155 tttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5616843 ttaaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 5616917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22592681 - 22592905
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||       
T  22592681 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaagttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgcc 22592778  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  22592779 tttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaactaagt 22592878  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  22592879 tgcatgtctatgaataagctgatgatg 22592905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9482170 - 9482395
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||      
T  9482170 ctttaggtact-aatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattga-ttgc 9482267  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  9482268 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaactaag 9482367  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  9482368 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9482395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12496537 - 12496312
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  12496537 ctttaggtagtta-tgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattga-ttgc 12496440  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12496439 ctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttgtgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaag 12496340  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  12496339 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 12496312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12706918 - 12706692
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||| |||||||||| ||      
T  12706918 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattga-ttgc 12706821  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||| |  ||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12706820 atttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 12706721  T
Q  202 ttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || | |||||||||||||    
T  12706720 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 12706692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16741435 - 16741231
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||      
T  16741435 ctttaggtact-agtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgc 16741338  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||    
T  16741337 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaag 16741238  T
Q  202 ttgcatg 208  Q
    |||||||    
T  16741237 ttgcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19662959 - 19662794
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  19662959 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 19662862  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  19662861 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 19662794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 2685235 - 2685421
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||  | ||||||||||  | ||||    
T  2685235 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaat-tgttga 2685332  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  2685333 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 2685421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23414735 - 23414649
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23414735 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 23414649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27556493 - 27556407
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27556493 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 27556407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16624203 - 16624137
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  16624203 ttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 16624137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 27416231 - 27416289
Alignment:
Q  171 ttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27416231 ttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaatatgttgatgatg 27416289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 22430006 - 22430113
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||| ||  |||| | |  |||||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||    
T  22430006 ttacttgaattattattaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaag 22430105  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  22430106 ttgcatga 22430113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11567092 - 11567056
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11567092 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 11567056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 12618721 - 12618757
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12618721 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12618757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23395298 - 23395262
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23395298 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 23395262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23990150 - 23990114
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23990150 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 23990114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 21885065 - 21885291
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21885065 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataattattatgaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattata 21885164  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  21885165 cttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 21885264  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21885265 tgcatgattatgaataagttgatgatg 21885291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26172694 - 26172468
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26172694 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattaca 26172595  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  26172594 cttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 26172495  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    || |||||||||  |||||||||||||    
T  26172494 tgaatgattatgattaagttgatgatg 26172468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4036439 - 4036223
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaat 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4036439 taatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagctttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaat 4036340  T
Q  114 tgttgttaaatgatcaag-aaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  4036339 tattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaata 4036240  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  4036239 tgaataagttgatgatg 4036223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 25229322 - 25229508
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25229322 gaactgagaagttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgag 25229421  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25229422 aatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25229508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 25293478 - 25293664
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25293478 gaactgagaagttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgag 25293577  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25293578 aatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25293664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10753118 - 10752949
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  10753118 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 10753019  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  10753018 aacttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 10752949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33409457 - 33409232
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  33409457 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 33409360  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33409359 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 33409260  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  33409259 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 33409232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16674381 - 16674156
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||| ||||| ||||||  || |||||| |||| ||| |||||| ||      
T  16674381 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattga-ttgc 16674284  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16674283 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16674184  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16674183 ttgcatgtttaagaataagctgatgatg 16674156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18774394 - 18774206
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattg 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||    
T  18774394 gaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttg 18774296  T
Q  141 agaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| | || | |||||||||||||    
T  18774295 aaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18774206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42805633 - 42805423
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||     
T  42805633 gacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattt-tatttacttgaattatta 42805535  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta-t 217  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || | |    
T  42805534 ttaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagtctgaatt 42805435  T
Q  218 aagttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  42805434 aagttgatgatg 42805423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 21340660 - 21340869
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||    ||||| ||||| |||    
T  21340660 gacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtga-ttgcctttactcgaattattg 21340758  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tat 217  Q
    |||| ||||||||||  | || |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  21340759 ttaattgatcaagaat-tgtttagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaaat 21340857  T
Q  218 aagttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  21340858 aagttgatgatg 21340869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18784266 - 18784049
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaattatacttacttga 111  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||    ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||    
T  18784266 taatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattga-ttgtatttacttga 18784168  T
Q  112 attgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatt 211  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |    
T  18784167 attattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 18784068  T
Q  212 atgta-taagttgatgatg 229  Q
     || | |||||||||||||    
T  18784067 ctgaattaagttgatgatg 18784049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 17718316 - 17718538
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  17718316 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgatttcc 17718414  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17718415 t-ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaacatgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaactaag 17718513  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  17718514 ttgcatg-ttatgaataagctgatga 17718538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 26742639 - 26742849
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || || ||||| ||||| ||     
T  26742639 gacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttga-ttgtatttactcgaattatta 26742737  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta-t 217  Q
    || |||||||||| || | |||||||||| || ||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |    
T  26742738 ttgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagcctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaact 26742837  T
Q  218 aagttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  26742838 aagttgatgatg 26742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 26666047 - 26666233
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  26666047 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 26666144  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  26666145 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26666233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 26937644 - 26937830
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  26937644 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 26937741  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  26937742 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18356047 - 18355961
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18356047 aatgaattgttattaaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 18355961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 20911186 - 20911272
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20911186 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 20911272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 24532964 - 24533150
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  24532964 gaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 24533061  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  24533062 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 24533150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20232740 - 20232577
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||  | ||||    
T  20232740 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcctttacttgaattattgttgattgatcaataat-tgttga 20232643  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  20232642 gaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 23535622 - 23535690
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23535622 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 23535690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 19472596 - 19472632
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19472596 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 19472632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20296077 - 20296041
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20296077 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 20296041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 62492 - 62264
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  62492 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 62393  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  62392 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 62293  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  62292 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 62264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12975 - 12907
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  12975 ttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19259 - 19191
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  19259 ttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 19191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8727 - 8503
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatact 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8727 ttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactataaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatact 8628  T
Q  105 tacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttg 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8627 tactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttg 8528  T
Q  205 catgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  8527 catgattatgaataagttgatgatg 8503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15825 - 15647
Alignment:
Q  51 aagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825 aagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattt 15726  T
Q  151 tttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15725 gttatttaacttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 15647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16537 - 16762
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16537 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataatgatcatgaactgtgaagcattatgaattgttaaataattaagaagtgaattatggattgaatta 16636  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  16637 tacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaagttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 16736  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatg 226  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  16737 gtcgcatgattatgaataagttgatg 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35151837 - 35151609
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35151837 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatta 35151738  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  35151737 tacttgcttgaattattgttgaatgatgaagaagctattgagtatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 35151638  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35151637 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 35151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16275723 - 16275495
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaatta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16275723 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactaatcatgaattgtgaaactttatgagttgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 16275624  T
Q  101 tacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  16275623 tacttgcttgaactgttgttgaatgatcaagaaactattgagtatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 16275524  T
Q  201 gttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16275523 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 16275495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14217133 - 14216918
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaat 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14217133 taatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattgaaatatacttgcttgaat 14217034  T
Q  114 tgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattat 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||    
T  14217033 tattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaactaagttgcatgaatat 14216934  T
Q  214 gtataagttgatgatg 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  14216933 gaataagttgatgatg 14216918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15728514 - 15728328
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15728514 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgag 15728415  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15728414 aatgatttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 15728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 16724510 - 16724732
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatact 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16724510 ttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 16724608  T
Q  105 tacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttg 204  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  16724609 tatttgaattattgttgaatgatcaag-aactattgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttg 16724707  T
Q  205 catgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16724708 catgagtatgaataagttgatgatg 16724732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 17701524 - 17701746
Alignment:
Q  5 ttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatact 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17701524 ttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 17701622  T
Q  105 tacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttg 204  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  17701623 tatttgaattattgttgaatgatcaag-aactattgagaatgacttgttatttaacctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttg 17701721  T
Q  205 catgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  17701722 catgagtatgaataagttgatgatg 17701746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18557162 - 18556976
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgag 142  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||  |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18557162 gaactgtgaagccttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatttacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgag 18557063  T
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18557062 aatgatttgctattgaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgactatgtataagttgatgatg 18556976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13149383 - 13149158
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  13149383 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 13149286  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13149285 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 13149186  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  13149185 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 13149158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8917645 - 8917430
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||    
T  8917645 taatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcatttacttgaa 8917547  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  8917546 ttattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagta 8917447  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||||||||||||    
T  8917446 tgaataagttgatgatg 8917430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13461980 - 13461764
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaattatacttacttga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |  ||||||||    
T  13461980 taatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattga-ttgtttttacttga 13461882  T
Q  112 attgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatt 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||| |    
T  13461881 attattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaactaatttgcatgagt 13461782  T
Q  212 atgtataagttgatgatg 229  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13461781 atgaataagttgatgatg 13461764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18945 - 19161
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  18945 taatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 19043  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || || || |||||||||| || | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  19044 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtc 19143  T
Q  213 tgta-taagttgatgatg 229  Q
    || | |||||||||||||    
T  19144 tgaattaagttgatgatg 19161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11987401 - 11987235
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||| |||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||    
T  11987401 gaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattga-ttgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttga 11987303  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11987302 aaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 11987235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9593535 - 9593348
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||| || |||||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||    
T  9593535 gaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattga-ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttga 9593437  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
     ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  9593436 aaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 9593348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 16457309 - 16457439
Alignment:
Q  78 gaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataa 177  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    
T  16457309 gaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgatta 16457407  T
Q  178 tgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  16457408 tgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 16457439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 13918795 - 13918881
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13918795 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 13918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 25927518 - 25927604
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25927518 aatgaatttttattaagtttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 25927604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 1859118 - 1859187
Alignment:
Q  160 cttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1859118 cttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 1859187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6801378 - 6801237
Alignment:
Q  66 ttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttga 164  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||    
T  6801378 ttaagtgattatgaagtgaaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttaattgatcaagaat-tgttgagaatgatttgttattaagcttga 6801281  T
Q  165 tgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatg 208  Q
      ||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  6801280 catgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Original strand, 2530385 - 2530491
Alignment:
Q  122 aatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatg-tgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||| || ||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2530385 aatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 2530484  T
Q  221 ttgatga 227  Q
    |||||||    
T  2530485 ttgatga 2530491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 13635445 - 13635572
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||| ||||| ||  |||| | |  |||||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||    
T  13635445 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 13635544  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  13635545 ttgcatgagtctgaataagttgatgatg 13635572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15580762 - 15580694
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  15580762 ttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgatgatg 15580694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18425527 - 18425443
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  18425527 aatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 18425443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 7519373 - 7519439
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7519373 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttggatga 7519439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16583386 - 16583259
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| ||||| ||  |||| | |  |||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||||||| |    
T  16583386 ttacttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacg 16583287  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  16583286 ttgcatgagtctgaataagttgatgatg 16583259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12318198 - 12318130
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  12318198 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagatgatgatg 12318130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 12704535 - 12704571
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12704535 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12704571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12715094 - 12715058
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12715094 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12715058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12718898 - 12718862
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12718898 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12718862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12723809 - 12723773
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12723809 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 12723773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16114471 - 16114435
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16114471 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 16114435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16117624 - 16117588
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16117624 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 16117588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 16907077 - 16907113
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16907077 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 16907113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18279633 - 18279597
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18279633 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 18279597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18283596 - 18283560
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18283596 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 18283560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 26292625 - 26292589
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26292625 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 26292589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15567 - 15341
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattata 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15567 ctttaggtacttagtgtgacctattaaagatactgatcatgaattgtgaagctttctgagttgctaaatgattatgaagtgaattatggattgaattata 15468  T
Q  103 cttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15467 cttacttgaattgttgttggatgatcaagaaactaatgagaatgatttgttatttaacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 15368  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15367 tgcataattatgaataagttgatgatg 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16697022 - 16696789
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat------cag-gaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattg 95  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||      | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16697022 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaactgtgaactgtgaagctttatgaattgttaaatgatcatgaagtgaattatggattg 16696923  T
Q  96 aattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttattta 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  16696922 aattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgttttgttctttaacttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttattta 16696823  T
Q  196 actaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16696822 actaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 16696789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 4589125 - 4589294
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  4589125 atgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 4589224  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  4589225 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 4589294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19775522 - 19775353
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  19775522 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 19775423  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19775422 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 19775353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3833903 - 3833678
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  3833903 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 3833806  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3833805 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 3833706  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  3833705 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 3833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38814613 - 38814388
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||      
T  38814613 ctttaggtact-aatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatga-ttgc 38814516  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38814515 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 38814416  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||  ||||| ||||||||    
T  38814415 ttgcatgtctatcaataagctgatgatg 38814388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 16797948 - 16798156
Alignment:
Q  21 acctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgt 119  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  16797948 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 16798046  T
Q  120 taaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataa 219  Q
    | ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16798047 tgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttgcatgagtatgaataa 16798146  T
Q  220 gttgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  16798147 gttgatgatg 16798156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 15941833 - 15942006
Alignment:
Q  55 tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttttta 154  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||    |||||||| || ||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||    
T  15941833 tttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggatttgattgcctttacttgatttattgctaattgatcaagaat-tgttgaaaatgatttgtta 15941931  T
Q  155 tttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  15941932 ttaaatttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtctaagtataagctgatgatg 15942006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 16808775 - 16808983
Alignment:
Q  21 acctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgt 119  Q
    |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  16808775 acctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaattattgt 16808873  T
Q  120 taaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataa 219  Q
    | |||| |||||||| | |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||   |||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  16808874 tgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatattgcatgagtatgaataa 16808973  T
Q  220 gttgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  16808974 gttgatgatg 16808983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17242162 - 17241997
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  17242162 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 17242065  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  17242064 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 17241997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 1598469 - 1598581
Alignment:
Q  116 ttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaa-cttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg 214  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  1598469 ttgttaattgatcaagaat-tgttgaaaatgatttgttatttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaat-gttatttaactaagttgcatgtctatg 1598566  T
Q  215 tataagttgatgatg 229  Q
    |||||| ||||||||    
T  1598567 tataagctgatgatg 1598581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 8489487 - 8489573
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8489487 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 8489573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15464955 - 15464869
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15464955 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 15464869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5223154 - 5223068
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  5223154 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatgagtatgaataagttgatgatg 5223068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12339556 - 12339470
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12339556 aatgaattgttattaaacttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 12339470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Original strand, 15850063 - 15850183
Alignment:
Q  106 acttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgc 205  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| | | || ||||| || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15850063 acttgaattattgttgaatgatcaagaaattgt-gaaaatgaattgttattaaacttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgc 15850161  T
Q  206 atgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||   || ||||||||||||    
T  15850162 atgagactgaataagttgatga 15850183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11854507 - 11854422
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgat 228  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  11854507 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgttgat 11854422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Original strand, 31097532 - 31097656
Alignment:
Q  105 tacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaact--tgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||    
T  31097532 tacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgt 31097631  T
Q  203 tgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  31097632 tgcatgagtctgaataagttgatga 31097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 16865010 - 16865101
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaag-ctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggatt 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||    
T  16865010 ctttaggtact-aatgtgacctatcaaagataatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaagagattatgaaatgatttatggatt 16865101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 16750605 - 16750689
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  16750605 aatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 16750689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15482793 - 15482666
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||| | |||| ||||| ||  |||| | |  |||||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||    
T  15482793 ttacttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 15482694  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  15482693 ttgcatgagtctgaataagttgatgatg 15482666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 11300781 - 11300868
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatg-tataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  11300781 aatgaattgttattaaacgttatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 11300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15617607 - 15617400
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttta-tgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||| || ||| || |||| | ||||  ||| ||||| ||||     
T  15617607 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattg-attac 15617509  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaacta 199  Q
    | ||||||||||| || || |||||||| |||  | |||| ||||| ||  |||| | |  ||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  15617508 a-ttacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 15617410  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  15617409 agttgcatga 15617400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 2897858 - 2897906
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2897858 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2897906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7109931 - 7109895
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7109931 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 7109895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7113866 - 7113830
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7113866 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 7113830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14668631 - 14668583
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  14668631 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14668583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 19725953 - 19726001
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19725953 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22321897 - 22321861
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22321897 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 22321861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22336952 - 22336916
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22336952 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 22336916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 27409520 - 27409556
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27409520 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 27409556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 28949957 - 28949921
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28949957 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 28949921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 229
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6102
Alignment:
Q  47 tgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5920 tgtgaagctttatgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattgaaatatacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatg 6019  T
Q  147 attttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6020 atttgttatttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 6102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 80469 - 80300
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  80469 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttattt 80370  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  80369 aacttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 65404 - 65611
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttta-tgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||| || ||| || |||| | ||||  ||| ||||| |||      
T  65404 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattg-attgc 65502  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaacta 199  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |  ||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  65503 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 65601  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  65602 agttgcatga 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 80842 - 80738
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||  | |||| ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  80842 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagatgttga-aatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagtt 80744  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  80743 gcatga 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 20229161 - 20229330
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttattt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20229161 atgaattgttaaatgattaagaagtgaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttattt 20229260  T
Q  158 aacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  20229261 aacttaatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 20229330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19212096 - 19211870
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |    
T  19212096 ctttaggtact-aatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgt 19211999  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  19211998 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 19211899  T
Q  202 ttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || | |||||||||||||    
T  19211898 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 19211870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46975696 - 46975471
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| || |    
T  46975696 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgt 46975599  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46975598 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 46975499  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |  |||| ||||| ||||||||    
T  46975498 ttgcacgtctatgaataagctgatgatg 46975471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18882545 - 18882371
Alignment:
Q  54 ctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttttt 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||| |||||| | ||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  18882545 ctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaat-aattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgtt 18882447  T
Q  154 atttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  18882446 attaagcttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgcatttttatgaataagctgatgatg 18882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20138312 - 20138086
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||  ||      
T  20138312 ctttaggtact-aatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattgg-ttgc 20138215  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      || |||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  20138214 ctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 20138115  T
Q  202 ttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || | |||||||||||||    
T  20138114 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 20138086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12647060 - 12646895
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagc-tttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||    
T  12647060 gaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaat-tgttga 12646963  T
Q  142 gaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  12646962 gaatgatttgttattaagcttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 12646895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33797372 - 33797286
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33797372 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 33797286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 23819186 - 23819381
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||||  |||||||||| || |  |||||||||    
T  23819186 taatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattga-ttgtctttacttgaa 23819284  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || || || ||||||||||||| |  ||| ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  23819285 ttattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagcttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatga 23819381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 41388258 - 41388342
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| |||||||| | ||||||  || ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  41388258 aatgaatttttattaagcttgatacgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 41388342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 39244176 - 39244242
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  39244176 ttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 39244242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 39247731 - 39247797
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  39247731 ttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 39247797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 36819345 - 36819412
Alignment:
Q  162 tgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  36819345 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 36819412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21615669 - 21615635
Alignment:
Q  1 agctttaggtacttaatgtgacctattaaagataa 35  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21615669 agctttaggtacttagtgtgacctattaaagataa 21615635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 16375334 - 16375370
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16375334 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 16375370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 20228685 - 20228721
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20228685 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 20228721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 21407585 - 21407549
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21407585 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 21407549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 52639771 - 52639735
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52639771 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 52639735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 80706 - 80876
Alignment:
Q  58 atgaattgttaaatgattatgaagtgaact-atggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  80706 atgaattgttaaatgattatgaagtgaaattatggattgaattatacctacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatt 80805  T
Q  157 taacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  80806 taacttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10132 - 9907
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  10132 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 10035  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10034 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 9935  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  9934 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 64082 - 63858
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||      
T  64082 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga-ttgc 63985  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  63984 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 63885  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  63884 ttgcatg-ttatgaataagctgatgatg 63858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 75956 - 75742
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| || ||    |||||||||    
T  75956 taatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggataga-ttgcctttacttgaa 75858  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgatta 212  Q
    || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  75857 ttattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacctgttgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgcatg-tta 75759  T
Q  213 tgtataagttgatgatg 229  Q
    || ||||| ||||||||    
T  75758 tgaataagctgatgatg 75742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 565 - 372
Alignment:
Q  21 acctattaaagataatgatcaggaactgtgaagctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgtt 120  Q
    |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||               ||||    
T  565 acctattaaagatattgactgagaactgtgaagctttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattat---------------tgtt 481  T
Q  121 aaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataag 220  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  480 gaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaacctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataag 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18583 - 18358
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||| || |||| |||||| ||| ||      
T  18583 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactga-ttgc 18486  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  18485 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaactaag 18386  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  18385 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9649 - 9424
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  9649 ctttaggtact-aatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattga-ttgc 9552  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
      ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  9551 ctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaactaag 9452  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9451 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36518 - 36310
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |   | ||||   ||||||||    
T  36518 gacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattgattgcca-ttacccaaattgttg 36420  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtata 218  Q
    |||| ||||||||||  | || |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  36419 ttaattgatcaagaat-tgttaagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaattaagttgcatgtttatgaata 36321  T
Q  219 agttgatgatg 229  Q
    |  ||||||||    
T  36320 aactgatgatg 36310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 18247 - 18442
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||  || ||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  18247 taatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 18345  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || || || |||||||||| || | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18346 ttattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 18442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 3407 - 3633
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||  |||||| |||||||||| ||      
T  3407 ctttaggtact-aatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattga-ttgc 3504  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  3505 atttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaag 3604  T
Q  202 ttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || | |||||||||||||    
T  3605 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23435 - 23264
Alignment:
Q  14 taatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  23435 taatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga-ttgtatttacttgaa 23337  T
Q  113 ttgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaa 185  Q
    || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  23336 ttattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagcttgatgtgatttgattaagctgcaa 23264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 139923 - 139715
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaag-ctttatgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||    ||||| ||||| |||    
T  139923 gacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtga-ttgcctttactcgaattattg 139825  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtata 218  Q
     | | ||||||||||  | ||||||||||||| || || | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  139824 attattgatcaagaat-tgttgagaatgatttgttgttaagcttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtttatgaata 139726  T
Q  219 agttgatgatg 229  Q
    |  ||||||||    
T  139725 aactgatgatg 139715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 71130 - 71072
Alignment:
Q  171 ttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  71130 ttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaatatgttgatgatg 71072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19894 - 20119
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| | ||||  ||| |||||| ||      
T  19894 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgc 19991  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||||||    
T  19992 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaag 20091  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  20092 ttgcatgaatctgaataagttgatgatg 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24845 - 25072
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||      
T  24845 ctttaggtact-aatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga-ttgc 24942  T
Q  102 acttacttgaattgttgttaaatgatcaa-gaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaa 200  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||| | || |||||| ||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |    
T  24943 atttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactga 25042  T
Q  201 gttgcatgattatgta-taagttgatgatg 229  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||||    
T  25043 gttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 25072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 173420 - 173295
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||| | |||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  173420 ttacttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 173321  T
Q  204 gcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||| | || ||||||||||||||    
T  173320 gcatgagtctgaataagttgatgatg 173295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 228350 - 228475
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||   |||| ||||| || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  228350 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagcttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 228449  T
Q  204 gcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||| | || ||||||||||||||    
T  228450 gcatgagtctgaataagttgatgatg 228475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Original strand, 20480 - 20566
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20480 aatgaattgttattaagcttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 20566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 2649 - 2775
Alignment:
Q  104 ttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaact--tgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaag 201  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  2649 ttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttga-aatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaag 2747  T
Q  202 ttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  2748 ttgcatgagtctgaataagttgatgatg 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6770 - 6684
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| || ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  6770 aatgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttcatgatg 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 18525 - 18735
Alignment:
Q  20 gacctattaaagataatgatcaggaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttg 118  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| | ||||  ||| |||||| ||  | ||||||||||| ||     
T  18525 gacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattt 18622  T
Q  119 ttaaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaact--tgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgta 216  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | || |    
T  18623 ttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtctgaa 18722  T
Q  217 taagttgatgatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  18723 taagttgatgatg 18735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30974 - 30890
Alignment:
Q  143 aatgattttttatttaacttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatga 227  Q
    ||||| || ||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30974 aatgaattgttattaagcttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatga 30890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 207883 - 207951
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatgattatgtataagttgatgatg 229  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  207883 ttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 6
Alignment:
Q  43 gaactgtgaagcttt-atgaattgttaaatgattatgaagtgaactatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||    
T  119 gaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga-ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttga 21  T
Q  142 gaatgattttttatt 156  Q
    |||||| || |||||    
T  20 gaatgaattgttatt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 185
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatttgataatgctgcaaacgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  233 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 58595 - 58631
Alignment:
Q  3 ctttaggtacttaatgtgacctattaaagataatgat 39  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  58595 ctttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgat 58631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University