View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3576_low_38 (Length: 290)

Name: NF3576_low_38
Description: NF3576
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3576_low_38
NF3576_low_38
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (19-280)||(2357033-2357295)
chr3 (24-161)||(49434089-49434226)
chr3 (29-153)||(33247988-33248113)
chr3 (21-173)||(1232520-1232677)
chr3 (21-153)||(3588400-3588533)
chr3 (21-153)||(27030712-27030845)
chr3 (21-153)||(45527647-45527780)
chr3 (23-153)||(20837094-20837225)
chr3 (21-153)||(7653251-7653384)
chr3 (21-153)||(8615503-8615636)
chr3 (21-153)||(10386099-10386232)
chr3 (21-153)||(22097667-22097800)
chr3 (29-153)||(37471723-37471848)
chr3 (21-171)||(23193905-23194055)
chr3 (23-153)||(27850581-27850711)
chr3 (21-153)||(9989396-9989529)
chr3 (29-153)||(36469472-36469596)
chr3 (70-149)||(26335121-26335201)
chr3 (21-153)||(23385396-23385529)
chr3 (21-153)||(48168222-48168355)
chr3 (21-153)||(52308114-52308247)
chr3 (21-127)||(4743029-4743135)
chr3 (68-153)||(20963729-20963815)
chr3 (59-153)||(17405127-17405222)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (21-162)||(1454787-1454928)
chr6 (21-162)||(1466479-1466620)
chr6 (29-171)||(14270654-14270796)
chr6 (24-153)||(5989035-5989164)
chr6 (24-153)||(24878865-24878995)
chr6 (21-153)||(26604339-26604472)
chr6 (21-153)||(34006502-34006635)
chr6 (21-170)||(9518473-9518622)
chr6 (29-153)||(14479560-14479685)
chr6 (29-134)||(15642436-15642541)
chr6 (21-154)||(25976949-25977081)
chr6 (21-153)||(3539047-3539180)
chr6 (21-153)||(26515457-26515590)
chr6 (69-172)||(34913432-34913533)
chr6 (35-162)||(13173859-13173986)
chr6 (35-162)||(13182392-13182519)
chr6 (31-153)||(32806801-32806924)
chr6 (21-153)||(24161284-24161417)
chr6 (20-153)||(21596555-21596693)
chr6 (21-153)||(9932834-9932967)
chr6 (72-153)||(26510392-26510474)
chr6 (21-162)||(21631171-21631315)
chr6 (21-143)||(32821812-32821934)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (19-189)||(29032811-29032981)
chr7 (21-154)||(22909117-22909250)
chr7 (29-153)||(2477658-2477783)
chr7 (20-153)||(12090488-12090622)
chr7 (21-153)||(2797592-2797725)
chr7 (21-153)||(12183866-12183999)
chr7 (31-153)||(12190843-12190966)
chr7 (21-153)||(8107917-8108050)
chr7 (21-153)||(10346334-10346467)
chr7 (21-153)||(31878601-31878733)
chr7 (21-153)||(2631396-2631529)
chr7 (21-153)||(3544909-3545042)
chr7 (21-153)||(31158305-31158438)
chr7 (21-172)||(1274571-1274720)
chr7 (21-153)||(19472292-19472425)
chr7 (21-153)||(24482744-24482877)
chr7 (21-153)||(31664523-31664656)
chr7 (23-153)||(22818412-22818543)
chr7 (21-153)||(22321829-22321962)
chr7 (29-153)||(23795094-23795219)
chr7 (30-154)||(19063513-19063637)
chr7 (29-153)||(1953957-1954082)
chr7 (93-153)||(33160182-33160243)
chr7 (94-153)||(6172527-6172587)
chr7 (94-153)||(45500812-45500872)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (21-168)||(39656067-39656214)
chr5 (21-153)||(27167126-27167259)
chr5 (21-154)||(37251934-37252066)
chr5 (21-153)||(7314965-7315098)
chr5 (21-153)||(9404424-9404557)
chr5 (21-153)||(11723305-11723438)
chr5 (21-153)||(11766755-11766888)
chr5 (21-153)||(34456297-34456430)
chr5 (22-153)||(33434603-33434735)
chr5 (24-153)||(31845980-31846110)
chr5 (21-153)||(14344469-14344602)
chr5 (21-153)||(16904638-16904771)
chr5 (21-153)||(30607105-30607238)
chr5 (21-153)||(34869775-34869908)
chr5 (72-154)||(32226832-32226914)
chr5 (21-153)||(24835735-24835868)
chr5 (29-153)||(6269890-6270015)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (21-155)||(22233880-22234014)
chr8 (21-153)||(16958550-16958683)
chr8 (21-155)||(22222694-22222830)
chr8 (21-155)||(22229036-22229172)
chr8 (21-172)||(22243273-22243423)
chr8 (21-154)||(13509963-13510096)
chr8 (21-154)||(13599493-13599626)
chr8 (21-155)||(1607283-1607418)
chr8 (21-171)||(17992876-17993027)
chr8 (21-171)||(4861979-4862130)
chr8 (21-153)||(8743312-8743445)
chr8 (21-153)||(9068196-9068329)
chr8 (21-153)||(16580085-16580218)
chr8 (21-153)||(22180601-22180734)
chr8 (21-153)||(28926172-28926305)
chr8 (21-153)||(41577360-41577493)
chr8 (21-160)||(11309016-11309156)
chr8 (24-153)||(28370093-28370223)
chr8 (21-153)||(27348026-27348159)
chr8 (21-153)||(3298802-3298935)
chr8 (70-153)||(34006838-34006922)
chr8 (21-153)||(12538157-12538290)
chr8 (29-153)||(24040716-24040841)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (30-152)||(35321-35443)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (21-154)||(14184-14317)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (21-153)||(30218420-30218553)
chr4 (30-172)||(33110741-33110884)
chr4 (21-153)||(21677696-21677829)
chr4 (21-153)||(19247856-19247989)
chr4 (21-153)||(20948745-20948878)
chr4 (21-127)||(53895406-53895512)
chr4 (21-153)||(1187965-1188098)
chr4 (21-153)||(4839165-4839298)
chr4 (21-153)||(42532916-42533049)
chr4 (21-153)||(323438-323571)
chr4 (21-153)||(6639977-6640110)
chr4 (21-153)||(22047681-22047814)
chr4 (24-153)||(26069725-26069855)
chr4 (30-151)||(46692074-46692196)
chr4 (29-153)||(40995586-40995711)
chr4 (21-153)||(44432082-44432215)
chr4 (21-153)||(55326774-55326909)
chr4 (70-153)||(52618514-52618598)
chr4 (93-153)||(5273652-5273713)
chr4 (53-162)||(8894922-8895032)
chr4 (67-153)||(35416758-35416845)
chr4 (29-153)||(26373666-26373791)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (21-153)||(24663160-24663293)
chr2 (21-153)||(36040291-36040424)
chr2 (21-153)||(28457906-28458039)
chr2 (21-153)||(36557551-36557684)
chr2 (21-153)||(42702235-42702368)
chr2 (21-160)||(13230370-13230510)
chr2 (21-149)||(14700645-14700774)
chr2 (21-153)||(27257385-27257518)
chr2 (21-153)||(29223715-29223848)
chr2 (21-153)||(29337014-29337147)
chr2 (21-172)||(21159942-21160098)
chr2 (21-153)||(5784553-5784686)
chr2 (21-153)||(23925060-23925193)
chr2 (90-168)||(492724-492802)
chr2 (21-153)||(36667898-36668031)
chr2 (31-162)||(9787145-9787281)
chr2 (93-160)||(8687774-8687842)
chr2 (21-151)||(43991533-43991658)
chr2 (29-153)||(32522929-32523054)
chr2 (92-153)||(11651816-11651878)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (21-154)||(8996291-8996424)
chr1 (21-153)||(13218074-13218207)
chr1 (21-153)||(33492227-33492360)
chr1 (20-153)||(44505298-44505432)
chr1 (21-153)||(11738826-11738959)
chr1 (21-153)||(38121961-38122094)
chr1 (21-153)||(39001210-39001343)
chr1 (21-169)||(15161087-15161235)
chr1 (23-153)||(432371-432502)
chr1 (21-172)||(9268617-9268768)
chr1 (24-153)||(9667727-9667857)
chr1 (21-153)||(12168245-12168378)
chr1 (21-153)||(49249072-49249205)
chr1 (24-153)||(13830288-13830417)
chr1 (90-168)||(36080205-36080283)
chr1 (29-153)||(16832819-16832944)
chr1 (29-153)||(16129659-16129784)
chr1 (30-153)||(41000141-41000265)
chr1 (21-81)||(36083831-36083891)
chr1 (21-134)||(39454123-39454236)
chr1 (29-133)||(16130234-16130338)
chr1 (47-153)||(6244201-6244308)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (21-165)||(1013-1157)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (34-154)||(12244-12364)
scaffold0298 (34-154)||(16014-16134)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (34-154)||(12194-12314)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (21-153)||(116596-116729)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (31-153)||(16512-16635)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (21-153)||(28928-29061)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (23-153)||(6732-6863)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (21-153)||(1564-1697)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (21-153)||(25679-25812)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (23-153)||(1-132)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (21-153)||(8742-8875)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (21-153)||(76480-76613)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (21-134)||(9482-9595)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2357295 - 2357033
Alignment:
Q  19 gttagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357295 gttagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 2357196  T
Q  119 gaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctctgggaaatcaaatctccaccaaaagtgtgatgtgtggtgcccttttt 218  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2357195 gaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctctaggaaatcaaatctccaccaaaagtgtgatgtgcggtgcccttttt 2357096  T
Q  219 cccttttcc-aaaacgtgaaatccccttcttttcaaaagtgtgatacctcctccattcctttg 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357095 cccttttccaaaaacgtgaaatccccttcttttcaaaagtgtgatacctcctccattcctttg 2357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 49434226 - 49434089
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  49434226 atgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatc 49434127  T
Q  124 tactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaat 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  49434126 tactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaat 49434089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33248113 - 33247988
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248113 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 33248014  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  33248013 ctaactaccttgctttgtgtttctct 33247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 1232520 - 1232677
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||  | |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||    
T  1232520 tagatgtagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataaga 1232619  T
Q  121 atctactcctaacac-----tttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctctg 173  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1232620 atctactcctaacaccttattttgctttgtgtttctctctagaaatgtcatctctctg 1232677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3588533 - 3588400
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3588533 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 3588434  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3588433 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 27030712 - 27030845
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27030712 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 27030811  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27030812 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27030845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45527780 - 45527647
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45527780 tagatgtagctagatatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 45527681  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45527680 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 45527647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20837225 - 20837094
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20837225 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 20837126  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  20837125 ctactcctaactaccttgccttgtatttctct 20837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 7653251 - 7653384
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7653251 tagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 7653350  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7653351 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 7653384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8615636 - 8615503
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8615636 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 8615537  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8615536 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8615503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 10386099 - 10386232
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10386099 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcga 10386198  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10386199 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 10386232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22097800 - 22097667
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22097800 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 22097701  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22097700 atctactcctaactaccttactttgtgtttctct 22097667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 37471723 - 37471848
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37471723 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactc 37471822  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37471823 ctaactactttgctttgtgtttctct 37471848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23194055 - 23193905
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23194055 tagatgtagctacatatgtctctgatagtttg-caaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 23193957  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctc 171  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23193956 atctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctaaaaatgccatctctc 23193905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Original strand, 27850581 - 27850711
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27850581 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 27850680  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  27850681 ctactcctaactaccttgc-ttgtgtttctct 27850711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9989529 - 9989396
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  || | |||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9989529 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 9989430  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9989429 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9989396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 36469472 - 36469596
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36469472 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 36469571  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||    
T  36469572 ctaactaccttgc-ttgtgtttctct 36469596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26335201 - 26335121
Alignment:
Q  70 gatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgttt 149  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  26335201 gatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 26335121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23385529 - 23385396
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | || | |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23385529 tagatgtagctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 23385430  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  23385429 atctactcctaactaccttgctttttgtttctct 23385396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 48168222 - 48168355
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||   |||||| | ||||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48168222 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttga 48168321  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  48168322 atctactcctaactaccttgcttcgtgtttctct 48168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 52308114 - 52308247
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  |||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  52308114 tagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctaga 52308213  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52308214 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 52308247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 4743029 - 4743135
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| |||| | |||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4743029 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttga 4743128  T
Q  121 atctact 127  Q
    |||||||    
T  4743129 atctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 20963729 - 20963815
Alignment:
Q  68 aagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||| |||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20963729 aagatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 20963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 153
Target Start/End: Original strand, 17405127 - 17405222
Alignment:
Q  59 gatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17405127 gatggaagaaagatgaatattacatgtcaagactcatgatatctctacaaatcttgaaaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctct 17405222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1454928 - 1454787
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1454928 tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 1454829  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1454828 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctctatagaaatg 1454787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1466620 - 1466479
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1466620 tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 1466521  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1466520 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctctatagaaatg 1466479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14270796 - 14270654
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14270796 gctacatatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 14270697  T
Q  129 ctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14270696 ctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgtcatctctc 14270654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 5989035 - 5989164
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5989035 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaa-aaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 5989133  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5989134 tactcctaactaccttgctttgtgtttctct 5989164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24878995 - 24878865
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24878995 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatc 24878896  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  24878895 tactcctaactaccttgttttgtgtttctct 24878865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26604472 - 26604339
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26604472 tagatgtagctacatatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaaga 26604373  T
Q  121 atctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  26604372 atctacttctaacacccttgctttgtgtttctct 26604339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34006635 - 34006502
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34006635 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttga 34006536  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34006535 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 9518473 - 9518622
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||     ||    
T  9518473 tagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaaaattcatgatgtctcaacaaatcttcataaga 9518572  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctct 170  Q
    ||||||| ||||||  |   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9518573 atctacttctaacatctcattttgtgtttctctctagaaatgtcatctct 9518622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14479685 - 14479560
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14479685 gctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 14479586  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  14479585 ctaactaccttgctttgtgtttctct 14479560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15642541 - 15642436
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15642541 gctacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactc 15642442  T
Q  129 ctaaca 134  Q
    ||||||    
T  15642441 ctaaca 15642436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25977081 - 25976949
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25977081 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-atgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 25976983  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25976982 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 25976949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3539180 - 3539047
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3539180 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 3539081  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3539080 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 26515457 - 26515590
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26515457 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 26515556  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26515557 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26515590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 34913533 - 34913432
Alignment:
Q  69 agatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatct 168  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34913533 agatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctc--tagaaatgtcatct 34913436  T
Q  169 ctct 172  Q
    ||||    
T  34913435 ctct 34913432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 13173859 - 13173986
Alignment:
Q  35 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaga--tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaa 132  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13173859 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13173956  T
Q  133 cactttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  13173957 caccttactttgtgtttttctatagaaatg 13173986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 13182392 - 13182519
Alignment:
Q  35 tatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaga--tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaa 132  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13182392 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13182489  T
Q  133 cactttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  13182490 caccttactttgtgtttttctatagaaatg 13182519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Original strand, 32806801 - 32806924
Alignment:
Q  31 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 130  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32806801 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 32806900  T
Q  131 aac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  32806901 aactaccttgctttgtgtttctct 32806924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 24161284 - 24161417
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24161284 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttga 24161383  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24161384 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 24161417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 21596555 - 21596693
Alignment:
Q  20 ttagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcct----agactcatgatgtctcaacaaatcttgg 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    |||   ||||||||||||||||||||||    
T  21596555 ttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttgg 21596654  T
Q  116 gttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21596655 cttgaatctactcctaactaccatgctttgtgtttctct 21596693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 9932834 - 9932967
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9932834 tagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttga 9932933  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  9932934 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 9932967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510474
Alignment:
Q  72 tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26510474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21631315 - 21631171
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaga--tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||  |||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  21631315 tagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgtt 21631216  T
Q  119 gaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
     ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21631215 aaatctactcttaactaccttgctttatgtttctctctaaaaatg 21631171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32821934 - 32821812
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||   |||||||| |  | ||||||| |||| |||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  32821934 tagatgtagctacatttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttga 32821835  T
Q  121 atctactcctaacactttgcttt 143  Q
    ||||| |||||| || |||||||    
T  32821834 atctattcctaataccttgcttt 32821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 29032811 - 29032981
Alignment:
Q  19 gttagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  29032811 gttagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaata 29032910  T
Q  119 gaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctctgggaaatcaaatctcca 189  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||    
T  29032911 gaatctactcctaacaccttactttgtgtttctctatagaaatgccatctctctaaataatcaaatctcca 29032981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22909250 - 22909117
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22909250 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattga 22909151  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22909150 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 22909117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2477783 - 2477658
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477783 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 2477684  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  2477683 ctaactaccttgctttgtgtttctct 2477658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 12090488 - 12090622
Alignment:
Q  20 ttagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12090488 ttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttg 12090587  T
Q  120 aatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12090588 aatttactcctaactaccttgctttgtgtttctct 12090622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 2797592 - 2797725
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2797592 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 2797691  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  2797692 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 2797725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12183999 - 12183866
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12183999 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttga 12183900  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12183899 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 12183866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12190966 - 12190843
Alignment:
Q  31 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 130  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12190966 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 12190867  T
Q  131 aac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  12190866 aactaccttgctttgtgtttctct 12190843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 8107917 - 8108050
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8107917 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 8108016  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8108017 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 10346334 - 10346467
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10346334 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 10346433  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10346434 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 10346467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31878733 - 31878601
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31878733 tagatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaaggatgaaa-aaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 31878635  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31878634 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31878601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2631529 - 2631396
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2631529 tagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 2631430  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2631429 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 2631396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 3544909 - 3545042
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |  | ||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544909 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttga 3545008  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  3545009 atctactcctaactacctttctttttgtttctct 3545042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 31158305 - 31158438
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31158305 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 31158404  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31158405 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31158438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1274720 - 1274571
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||| || |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1274720 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaa 1274621  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctct 172  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  1274620 atctactcataacaccttactttgtgtttctc--tagaaatgccatctctct 1274571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 19472292 - 19472425
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |  || |||||| |||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19472292 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 19472391  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19472392 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 19472425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24482877 - 24482744
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  24482877 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttg 24482778  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  24482777 atctactcataactcccttgctttgtgtttctct 24482744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 31664523 - 31664656
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||  ||||| | ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31664523 tagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 31664622  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31664623 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31664656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22818543 - 22818412
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22818543 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 22818444  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  22818443 ctactcctaactaccttgccttgtatttctct 22818412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 22321829 - 22321962
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||| |||| |||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22321829 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 22321928  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  22321929 atctactcctaactaacttgctttgtatttctct 22321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23795219 - 23795094
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23795219 gctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 23795120  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||    
T  23795119 ctaactaccttgctttgagtttctct 23795094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19063637 - 19063513
Alignment:
Q  30 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 129  Q
    |||||||||||||||  |||||  || || |||||  | ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19063637 ctacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcc 19063538  T
Q  130 taacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
T  19063537 taacaccttactttgtgtttctcta 19063513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1954082 - 1953957
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  | |  |||| |||| ||| | |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1954082 gctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactc 1953983  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  1953982 ctaactacattgctttgtgtttctct 1953957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33160243 - 33160182
Alignment:
Q  93 catgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33160243 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33160182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6172587 - 6172527
Alignment:
Q  94 atgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6172587 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 6172527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Original strand, 45500812 - 45500872
Alignment:
Q  94 atgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  45500812 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcataactaccttgctttgtgtttctct 45500872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 39656067 - 39656214
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  39656067 tagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtaga 39656166  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatct 168  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39656167 atctactcctaacaccttacgttgtgtttctctctagaaatgtcatct 39656214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 27167126 - 27167259
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27167126 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttga 27167225  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27167226 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27167259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 37251934 - 37252066
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37251934 tagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttgggttga 37252032  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  37252033 atctacacctaacaccttgttttgtgtctctcta 37252066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7315098 - 7314965
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7315098 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 7314999  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7314998 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 7314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9404557 - 9404424
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9404557 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 9404458  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9404457 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9404424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 11723305 - 11723438
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11723305 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 11723404  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11723405 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11723438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11766888 - 11766755
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11766888 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 11766789  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11766788 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11766755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34456430 - 34456297
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34456430 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 34456331  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34456330 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34456297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33434735 - 33434603
Alignment:
Q  22 agatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaa 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33434735 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 33434636  T
Q  122 tctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33434635 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33434603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31846110 - 31845980
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31846110 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 31846011  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31846010 tactcctaactaccttgctttgtgtttctct 31845980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14344602 - 14344469
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14344602 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 14344503  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14344502 atctactcctaactaccttgctttgagtttctct 14344469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 16904638 - 16904771
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16904638 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 16904737  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16904738 atctacccctaactaccttgctttgtgtttctct 16904771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 30607105 - 30607238
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30607105 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttga 30607204  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30607205 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 30607238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 34869775 - 34869908
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||  | ||||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34869775 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 34869874  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  34869875 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 34869908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32226914 - 32226832
Alignment:
Q  72 tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32226914 tgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 32226832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24835868 - 24835735
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24835868 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttga 24835769  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  24835768 atctactcctaactaccttgatttgtgtttctct 24835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6270015 - 6269890
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||| || | |||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6270015 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaatctactc 6269916  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
     |||| || || ||||||||||||||    
T  6269915 ataactacatttctttgtgtttctct 6269890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 22233880 - 22234014
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22233880 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 22233979  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctat 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22233980 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctctat 22234014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16958683 - 16958550
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16958683 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 16958584  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  16958583 atctactcttaactaccttgctttgtgtttctct 16958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 22222694 - 22222830
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaga--tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22222694 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggta 22222793  T
Q  119 gaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22222794 gaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctat 22222830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 22229036 - 22229172
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaga--tgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtt 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22229036 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggta 22229135  T
Q  119 gaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22229136 gaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctat 22229172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 22243273 - 22243423
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243273 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttga 22243372  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctct 172  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22243373 atctacttctaactaccttgttttgtgtttctc--tagaaatgtcatctctct 22243423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13510096 - 13509963
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13510096 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttga 13509997  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13509996 atctacttctaacatcttgctttgtgtttctcta 13509963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13599626 - 13599493
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13599626 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttga 13599527  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13599526 atctacttctaacatcttgctttgtgtttctcta 13599493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1607418 - 1607283
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  1607418 tagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaaga 1607319  T
Q  121 atctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctctat 155  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1607318 atatactcttaacacccttgctttgtgtttctctat 1607283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17993027 - 17992876
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  17993027 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattga 17992928  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctc 171  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17992927 atctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctagaaatgccatctctc 17992876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 171
Target Start/End: Original strand, 4861979 - 4862130
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4861979 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 4862078  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctc 171  Q
    |||||||| |||| || || | |||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4862079 atctactcttaactaccttaccttgtgtttctctctaaaaatgccatctctc 4862130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 8743312 - 8743445
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8743312 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 8743411  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8743412 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 9068196 - 9068329
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9068196 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 9068295  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9068296 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 9068329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16580218 - 16580085
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16580218 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 16580119  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16580118 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 16580085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22180734 - 22180601
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22180734 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 22180635  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22180634 atctactcctaactaccttgctttttgtttctct 22180601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 28926172 - 28926305
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28926172 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 28926271  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28926272 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28926305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 41577360 - 41577493
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41577360 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 41577459  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41577460 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 41577493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 11309016 - 11309156
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | || | |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11309016 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 11309115  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaa 160  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11309116 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctagaaa 11309156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28370223 - 28370093
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28370223 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 28370124  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28370123 tactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28370093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27348159 - 27348026
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27348159 tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 27348060  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27348059 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 27348026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3298935 - 3298802
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  || | |||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3298935 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 3298836  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3298835 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 3298802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 34006838 - 34006922
Alignment:
Q  70 gatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34006838 gatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34006922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12538290 - 12538157
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  12538290 tagatgtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttga 12538191  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  12538190 atctaatcctaactaccttgatttgtgtttctct 12538157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24040841 - 24040716
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   | | ||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24040841 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactt 24040742  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||    
T  24040741 ctaactacattgatttatgtttctct 24040716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Original strand, 35321 - 35443
Alignment:
Q  30 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35321 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcc 35420  T
Q  130 taacactttgctttgtgtttctc 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  35421 taacaccttgctttgtgtttctc 35443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14317 - 14184
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14317 tagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttga 14218  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14217 atctactcctaacaccttgctttgtgtctctcta 14184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 30218420 - 30218553
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30218420 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttga 30218519  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  30218520 atctactcttaactaccttgctttgtgtttctct 30218553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 33110741 - 33110884
Alignment:
Q  30 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 129  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33110741 ctacatatgtctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactct 33110840  T
Q  130 taac-actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctct 172  Q
    |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33110841 taactaccttgccttgtgtttctctctagaaatgtcatctctct 33110884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 21677696 - 21677829
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21677696 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 21677795  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21677796 atctattcctaactactttgctttgtgtttctct 21677829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 19247856 - 19247989
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19247856 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttga 19247955  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  19247956 atctactcccaactaccttgctttgtgtttctct 19247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20948878 - 20948745
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20948878 tagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttga 20948779  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  20948778 atctacttttaactaccttgctttgtgtttctct 20948745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 53895512 - 53895406
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895512 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 53895413  T
Q  121 atctact 127  Q
    |||||||    
T  53895412 atctact 53895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1188098 - 1187965
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1188098 tagatgtagctacatatgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttga 1187999  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1187998 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 1187965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 4839165 - 4839298
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4839165 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 4839264  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4839265 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 4839298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 42532916 - 42533049
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  42532916 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttga 42533015  T
Q  121 atctactcctaa-cactttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42533016 atctactcctaaccaccttgctttgtgtttctct 42533049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 323571 - 323438
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  323571 tagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 323472  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  323471 atctactcctaactatcttgctttgtgtttctct 323438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6640110 - 6639977
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  6640110 tagatgtagctacatatgtctatgaaagctttggaaaagatagaagaaagatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaaga 6640011  T
Q  121 atctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6640010 atctactcctaacacccttgctttgtgtttctct 6639977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22047814 - 22047681
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22047814 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttga 22047715  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22047714 atcttctcctaactaccttgctttgtgtttctct 22047681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26069855 - 26069725
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | || |||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26069855 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 26069756  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  26069755 tacttctaactaccttgctttgtgtttctct 26069725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 46692074 - 46692196
Alignment:
Q  30 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 129  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||   | | ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46692074 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 46692173  T
Q  130 taac-actttgctttgtgtttct 151  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  46692174 taactaccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 40995586 - 40995711
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| |||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40995586 gctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 40995685  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||    
T  40995686 ctaactaccttgatttgtgtttctct 40995711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 44432082 - 44432215
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44432082 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatgatgtctcaagaaatcttggcttga 44432181  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  44432182 atctactcctaactaccttgctttgagtttctct 44432215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 55326909 - 55326774
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | || |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  55326909 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 55326810  T
Q  121 --atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
      ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  55326809 atatctactcctaactatcttgctatgtgtttctct 55326774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52618598 - 52618514
Alignment:
Q  70 gatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52618598 gatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 52618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Original strand, 5273652 - 5273713
Alignment:
Q  93 catgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5273652 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 5273713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8895032 - 8894922
Alignment:
Q  53 gcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttct 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||    
T  8895032 gcaaaagatggaagaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgcattgtgtttct 8894933  T
Q  152 ctatagaaatg 162  Q
    || ||||||||    
T  8894932 ctctagaaatg 8894922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Original strand, 35416758 - 35416845
Alignment:
Q  67 aaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  35416758 aaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatctttctttgtgtttctct 35416845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 26373666 - 26373791
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaa-agatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctact 127  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||| |||   |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26373666 gctatatatgtctatgatagctttgcaaaggat-aaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctact 26373764  T
Q  128 cctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  26373765 cctaactaccttgctttgtgtttctct 26373791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 24663160 - 24663293
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24663160 tagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatga 24663259  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24663260 aactactcctaacaaccttgctttgtgtttctct 24663293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 36040291 - 36040424
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36040291 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 36040390  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36040391 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 36040424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 28457906 - 28458039
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28457906 tagatgtagctacatatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttga 28458005  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28458006 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 28458039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 36557551 - 36557684
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36557551 tagatgtacctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttga 36557650  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  36557651 atctactcctaactaccttgctatgtgtttctct 36557684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 42702235 - 42702368
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42702235 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggaggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 42702334  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42702335 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 42702368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 13230370 - 13230510
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13230370 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttga 13230469  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaa 160  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  13230470 atctactcataactaccttgctttgtgtttctctctagaaa 13230510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14700774 - 14700645
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14700774 tagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttga 14700675  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgttt 149  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  14700674 atctactcttaactaccttgctttgtgttt 14700645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27257518 - 27257385
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  27257518 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaa 27257419  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  27257418 atctcctccaaactaccttgttttgtgtttctct 27257385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29223848 - 29223715
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29223848 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 29223749  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29223748 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29223715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29337147 - 29337014
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29337147 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 29337048  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29337047 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29337014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21160098 - 21159942
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||    
T  21160098 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataaga 21159999  T
Q  121 atctactcctaac-----actttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctct 172  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21159998 atctactcctaacaccttactttgctttgtgtgtctctcttgaaatgtcatctctct 21159942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 5784553 - 5784686
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5784553 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 5784652  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  5784653 atctactcctaacttccttgctttgtgtttctct 5784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 23925060 - 23925193
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23925060 tagatgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttga 23925159  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23925160 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 23925193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 492802 - 492724
Alignment:
Q  90 actcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  492802 actcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctctctagaaatgccatct 492724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 36667898 - 36668031
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  36667898 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaa 36667997  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36667998 gtctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 36668031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 162
Target Start/End: Original strand, 9787145 - 9787281
Alignment:
Q  31 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 130  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||    
T  9787145 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatcttgataagaatctactcct 9787244  T
Q  131 aaca-----ctttgctttgtgtttctctatagaaatg 162  Q
    ||||     ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9787245 aacatcttgctttgctttgtgtctctctctagaaatg 9787281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Original strand, 8687774 - 8687842
Alignment:
Q  93 catgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-actttgctttgtgtttctctatagaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8687774 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctagaaa 8687842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43991658 - 43991533
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||      |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43991658 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagat------tccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 43991565  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttct 151  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43991564 atctactcctaactaccttgccttgtgtttct 43991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32523054 - 32522929
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||  | | ||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32523054 gctacatatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactc 32522955  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  32522954 ctaactaccttgctttgtgtttctct 32522929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11651878 - 11651816
Alignment:
Q  92 tcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaaca-ctttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  11651878 tcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctactcataacacccttgctttgtgtttctct 11651816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 8996291 - 8996424
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8996291 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttga 8996390  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctcta 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8996391 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctcta 8996424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 13218074 - 13218207
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13218074 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 13218173  T
Q  121 atctactcctaa-cactttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13218174 atctactcctaaccaccttgctttgtgtttctct 13218207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 33492227 - 33492360
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33492227 tagatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 33492326  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33492327 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 44505298 - 44505432
Alignment:
Q  20 ttagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||||||| |||| |||    
T  44505298 ttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttg 44505397  T
Q  120 aatctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44505398 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 44505432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 11738826 - 11738959
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11738826 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttga 11738925  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11738926 atttactcctaactaccttgctttgtgtttctct 11738959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 38121961 - 38122094
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38121961 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 38122060  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38122061 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 38122094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 39001210 - 39001343
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39001210 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 39001309  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39001310 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 39001343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15161235 - 15161087
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15161235 tagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagaggatgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaaga 15161136  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctc 169  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15161135 atctactcctaatatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 15161087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Original strand, 432371 - 432502
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  432371 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagt 432470  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  432471 ctactcctaactaccttgccttgtatttctct 432502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9268768 - 9268617
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || ||  ||    
T  9268768 tagatgtagctacatatgtctttgcaagtttggcaaaggataaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaaga 9268669  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctct 172  Q
    |||||||| |||||   |  ||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  9268668 atctactcttaacaaccttatttatgtttgtctctaaaaatgtcatctctct 9268617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 9667727 - 9667857
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9667727 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 9667826  T
Q  124 tactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  9667827 tactcctaactaccttgccttgtatttctct 9667857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 12168245 - 12168378
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12168245 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 12168344  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  12168345 atctacacctaactaccttgctttgtgtttctct 12168378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 49249205 - 49249072
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49249205 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 49249106  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  49249105 atctactcctaactaccttactttgtgtttctct 49249072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13830417 - 13830288
Alignment:
Q  24 atgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 123  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  13830417 atgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatc 13830318  T
Q  124 tactcctaacactttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  13830317 tactcctaacacccttccttgtgtttctct 13830288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36080283 - 36080205
Alignment:
Q  90 actcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatct 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36080283 actcatgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 36080205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 16832819 - 16832944
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16832819 gctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 16832918  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  16832919 ctaactaccttactttgtgtttctct 16832944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16129784 - 16129659
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  | | ||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16129784 gctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 16129685  T
Q  129 ctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||    
T  16129684 ctaactatcttgctttgtgtttctct 16129659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Original strand, 41000141 - 41000265
Alignment:
Q  30 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 129  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||   | | ||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41000141 ctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 41000240  T
Q  130 taac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  41000241 taactaccttgctttgtgtttctct 41000265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 36083891 - 36083831
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattcc 81  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  36083891 tagatgtaactacatatgtctatgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagataaagattcc 36083831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39454236 - 39454123
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||| | ||  ||    
T  39454236 tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaaga 39454137  T
Q  121 atctactcctaaca 134  Q
    ||||||| ||||||    
T  39454136 atctacttctaaca 39454123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16130338 - 16130234
Alignment:
Q  29 gctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactc 128  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||  | | ||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16130338 gctacatatgtctatgataactttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactc 16130239  T
Q  129 ctaac 133  Q
    |||||    
T  16130238 ctaac 16130234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6244308 - 6244201
Alignment:
Q  47 agcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaaca-ctttgctttgt 145  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  6244308 agctttgcaaaagatggaagaaggatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaacacccttgctttgt 6244209  T
Q  146 gtttctct 153  Q
    ||||||||    
T  6244208 gtttctct 6244201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1157
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1013 tagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggataga 1112  T
Q  121 atctactcctaacactttgctttgtgtttctctatagaaatgtca 165  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1113 atctactcctaacaccttactttgtgtttctctctagaaatgtca 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 12244 - 12364
Alignment:
Q  34 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 133  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12244 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12343  T
Q  134 actttgctttgtgtttctcta 154  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12344 accttgctttgtgtttctcta 12364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16134
Alignment:
Q  34 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 133  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16014 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 16113  T
Q  134 actttgctttgtgtttctcta 154  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16114 accttgctttgtgtttctcta 16134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12314 - 12194
Alignment:
Q  34 atatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 133  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12314 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12215  T
Q  134 actttgctttgtgtttctcta 154  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12214 accttgctttgtgtttctcta 12194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 116596 - 116729
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  116596 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 116695  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  116696 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 116729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Original strand, 16512 - 16635
Alignment:
Q  31 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 130  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16512 tacatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactctt 16611  T
Q  131 aac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  16612 aactaccttactttgtgtttctct 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 28928 - 29061
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28928 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 29027  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29028 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 29061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6863 - 6732
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6863 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 6764  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  6763 ctactcctaactaccttgccttgtatttctct 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1697 - 1564
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1697 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 1598  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1597 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 1564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 25679 - 25812
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25679 tagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 25778  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25779 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 25812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Original strand, 1 - 132
Alignment:
Q  23 gatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  | ||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaat 100  T
Q  123 ctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  101 ctactcccaactaccttgctttgtctttctct 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8875 - 8742
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8875 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 8776  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  8775 atctactcctaactaccttgccttgtgtttctct 8742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 76480 - 76613
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |  | |||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  76480 tagatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 76579  T
Q  121 atctactcctaac-actttgctttgtgtttctct 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  76580 atctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 76613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 9482 - 9595
Alignment:
Q  21 tagatgtggctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||| | ||  ||    
T  9482 tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaaga 9581  T
Q  121 atctactcctaaca 134  Q
    ||||||| ||||||    
T  9582 atctacttctaaca 9595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University