View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3579_low_1 (Length: 700)

Name: NF3579_low_1
Description: NF3579
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3579_low_1
NF3579_low_1
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (16-682)||(29453134-29453800)
chr1 (17-679)||(29443154-29443825)
chr1 (154-682)||(29423049-29423577)
chr1 (34-682)||(29467610-29468273)
chr1 (17-110)||(29422941-29423034)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (17-682)||(9315647-9316337)
chr2 (23-539)||(9284163-9284703)
chr2 (206-681)||(10335692-10336149)
chr2 (203-682)||(9328432-9328905)
chr2 (203-609)||(10352942-10353351)
chr2 (203-682)||(9320815-9321285)
chr2 (203-617)||(11987373-11987796)
chr2 (209-617)||(9364467-9364878)
chr2 (203-537)||(12012521-12012858)
chr2 (325-682)||(10347740-10348100)
chr2 (206-537)||(12018857-12019194)
chr2 (203-682)||(12005939-12006427)
chr2 (324-680)||(9274475-9274822)
chr2 (251-521)||(7115633-7115906)
chr2 (17-682)||(9065413-9066135)
chr2 (370-609)||(10371858-10372100)
chr2 (324-538)||(9061115-9061329)
chr2 (324-538)||(8573479-8573693)
chr2 (326-529)||(9291899-9292096)
chr2 (17-140)||(11987865-11987989)
chr2 (17-140)||(12012927-12013051)
chr2 (203-313)||(9061358-9061468)
chr2 (203-313)||(9291755-9291865)
chr2 (53-195)||(10371503-10371644)
chr2 (17-313)||(10347401-10347707)
chr2 (390-523)||(16269109-16269242)
chr2 (206-322)||(8579695-8579811)
chr2 (203-313)||(8573725-8573835)
chr2 (32-183)||(9294990-9295144)
chr2 (17-153)||(9320599-9320736)
chr2 (17-184)||(9364245-9364409)
chr2 (212-313)||(10371679-10371780)
chr2 (17-122)||(12019285-12019388)
chr2 (17-105)||(9291566-9291655)
chr2 (203-305)||(9274333-9274435)
chr2 (27-153)||(9061545-9061675)
chr2 (17-153)||(9328228-9328355)
chr2 (203-311)||(10341182-10341293)
chr2 (17-69)||(12006543-12006595)
chr2 (405-488)||(7611974-7612057)
chr2 (563-667)||(7115475-7115579)
chr2 (27-102)||(9274200-9274276)
chr2 (254-314)||(16268952-16269012)
chr2 (25-112)||(8573934-8574024)
chr2 (405-488)||(17566107-17566190)
chr2 (38-151)||(9272296-9272410)
chr2 (407-467)||(8579532-8579592)
chr2 (17-73)||(10352738-10352794)
chr2 (563-617)||(12012432-12012486)
chr2 (475-529)||(8576392-8576446)
chr2 (571-669)||(12018716-12018814)
chr2 (564-682)||(16269277-16269395)
chr2 (559-617)||(17565966-17566024)
chr2 (649-682)||(9284011-9284044)
chr2 (564-617)||(9284076-9284129)
chr2 (117-194)||(10335589-10335665)
chr2 (571-615)||(7612157-7612201)
chr2 (28-72)||(10341038-10341082)
chr2 (17-72)||(19393258-19393318)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (203-535)||(41966682-41967017)
chr8 (17-187)||(41967066-41967236)
chr8 (571-682)||(41966544-41966655)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (212-591)||(26574700-26575085)
chr4 (18-73)||(26574525-26574580)
chr4 (206-308)||(561019-561121)
chr4 (421-467)||(561273-561319)
chr4 (559-617)||(561423-561481)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (327-520)||(45243656-45243849)
chr7 (405-511)||(45230467-45230576)
chr7 (327-470)||(45237907-45238050)
chr7 (218-313)||(45230256-45230351)
chr7 (231-313)||(45243531-45243613)
chr7 (204-313)||(45237760-45237869)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (324-539)||(37462443-37462661)
chr3 (17-153)||(37462098-37462236)
chr3 (407-467)||(39427680-39427740)
chr3 (218-312)||(37462313-37462410)
chr3 (558-609)||(39427819-39427870)
[»] scaffold0667 (3 HSPs)
scaffold0667 (331-682)||(4432-4792)
scaffold0667 (17-151)||(4073-4208)
scaffold0667 (206-314)||(4289-4394)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (406-472)||(36224454-36224520)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 643; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 29453800 - 29453134
Alignment:
Q  16 taggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttgcttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453800 taggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttacttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 29453701  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcctggggaaggaaggtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29453700 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtataattctctttcctggggaaggaaggtg 29453601  T
Q  216 gcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453600 gcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctc 29453501  T
Q  316 acaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29453500 acaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattccgccaaagtaaaa 29453401  T
Q  416 agtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaa 515  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453400 agttcacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaa 29453301  T
Q  516 ccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaat 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453300 ccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcacctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaat 29453201  T
Q  616 tacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453200 tacacgagattgcaactgaccaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 29453134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 29443825 - 29443154
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattca-------atttg--cttttaacataaagtttaactgcatatatcatat 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||       |||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  29443825 aggtagagacttcaaaataattagagaatccttgtcctatgataagaattcagaattcaatttgaccttttaacatggagtttaactagatatatcatat 29443726  T
Q  108 gatggatctattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcctggggaa 207  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29443725 gatgggtccattgaattgatattaacttatacaaagaaaaaactcaggtaatcaataagaagtaccttctcttgcttgtttgattctccttcctggggaa 29443626  T
Q  208 ggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaac 307  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| |   ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29443625 agaaggttgtacaagacttccaacacaaatgatggcatgatccaccctaggaattccttcaacataactaacacattcactcttgagatcataccaaaac 29443526  T
Q  308 agcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagcca 407  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29443525 agcttctcacgatctacttgcaacagaaccatacttctatcgctcgaataacctaaaatcctcaaagctctcaaaggtaaactgaaacacgattcagcca 29443426  T
Q  408 aagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacaccc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29443425 aagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttagcagtttgataattcacaatcatacaaagacaccc 29443326  T
Q  508 ttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaac 607  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29443325 ttccagaaccgaaataccaatttgaaaactctcactattaacatcttcacctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgagtgttaggttaaac 29443226  T
Q  608 gcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaa 679  Q
    || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29443225 gcgacaattgcacgaggttgcaacagatcaagtttccgagtcattacccagtgaagggaattctcaacaaaa 29443154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 682
Target Start/End: Original strand, 29423049 - 29423577
Alignment:
Q  154 gataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcctggggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaa 253  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29423049 gataatcaataagaagtaccttctcttgcttgtgcgattctccttcctagggaaggaaggtgatacaagacttccaacacaaatcatggcttgatcgaaa 29423148  T
Q  254 ttaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcg 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29423149 ttaggaattccttgaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctcaggatctacttgcaacagaaccatacctccatcgctcg 29423248  T
Q  354 aataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcat 453  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29423249 aataagctaaaagcctcaaagctttcaaaggtaaggtgaaacacgattctgccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcat 29423348  T
Q  454 cacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttct 553  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29423349 cagccaaacatcaattttaacagtttgataattcacagtcatacaaaggcacccttccagaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttct 29423448  T
Q  554 tcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcatta 653  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||   |||||||    
T  29423449 tcaccaatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcatgtgttaggttaaacgcaacaattacacgaggtttcaacggatcaagtttctccgtcatta 29423548  T
Q  654 tccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29423549 tccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 29423577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 34 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 29468273 - 29467610
Alignment:
Q  34 taattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg--cttttaacataaagtttaactgcat-----atatcatatgatggatctattgaac--t 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||     |||||||||||| | || ||| |||  |    
T  29468273 taattagagaatcattgtcctataataagaattcaatttgaccttttaac--agagtttaactgcatatatcatatcatatgataggtccatt-aactgt 29468177  T
Q  125 gaaattaacttatacagagc---------aaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcctggggaaggaaggtg 215  Q
    || ||||||||||||| | |         ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29468176 gatattaacttatacataacaaaaactcaaaaaactcagacaatcaataagaagtaccttctcttgcttgtgcgattctcgttcctagggaaggaaggtg 29468077  T
Q  216 gcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctc 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29468076 gtacaagacttccaacacaaatcatagcttcattcaaattaggaattccttcaacataattaacatgttcactcttgagatcataccaaaacaacttctc 29467977  T
Q  316 acaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaa 415  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||| |||  | |||||||||||    
T  29467976 atggtctacttcaaacagaaccatacttccatcgctcgaataacctaaaggcctcaaagattccaactgtaaagtgaaacacgatctaaccaaagtaaaa 29467877  T
Q  416 agtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaa 515  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  29467876 agtttacgccaactatctctacatccatattctttcatcaaccaaacatcaattttactagtttgataattcacaatcaactaaagacaccctcccaaaa 29467777  T
Q  516 ccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaat 615  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| | |||    
T  29467776 ccgcaacatcaattttaaaactctcaacattaacttcataacctatttcaggaagaggaacctcattgaaaatctcaagctttaggttaaacgcgataat 29467677  T
Q  616 tacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    || || |||||| |||  ||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29467676 taaacaagattgtaacccatcaagtttcttcttcattatccaatgaagagaattctcaacaaaaacc 29467610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 29422941 - 29423034
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg--cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgat 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  29422941 aggtagagacttcaaaataattagagaatcattgtcatataataagaattcaatttgaccttttaac--agagtttaactagatatatcatatgat 29423034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 9315647 - 9316337
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  9315647 aggtagagaatttaaagtaattagggaatccttgtcctataataagaattcaatttgacctttagcatagagtttaactacttatatcatatgatgggtc 9315746  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttg------cttgtatgattctctttcctg------- 202  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||      |||||||||||||| ||| |            
T  9315747 cattgaactgacattaacttatacatagcaaaaactcaaataatatataag---taccttctcttgttcttgcttgtatgattctccttcttcctacaat 9315843  T
Q  203 --------gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgag 294  Q
            |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | |     
T  9315844 aatcaacagggaaggaaggtggtacaagactttcaacacaaatcatagcttcatccaaattagaaattccttcaacataaataacttgttcactcatcaa 9315943  T
Q  295 atcataccaaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaa 394  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| || || |||||| ||||||||  ||||   ||||||| |||| |||||    
T  9315944 gtcacaccaaaacagcttcttacaatctatttccaatagaaccttacttccgtcactagaataacctaaaggcttcaaaaaattcaaagataaagtgaaa 9316043  T
Q  395 catgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatca 494  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  9316044 catgaattaaccaaagtaaaaagtttacacca------actagatccatagtctttcatcacccaaacatcagttttagtagtttgataattcaaaatca 9316137  T
Q  495 tacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaact------ctcactattcacttcttccc---ctattt---caggaaaaggaacctcatt 582  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||      ||||||||| || |||   |   ||||||   |||||| ||||||| ||||    
T  9316138 tacaaagacaccctcccaaaacagcaacagcaatttgaaaactctcacactcactattaacctctatactttctatttcagcaggaagaggaaccacatt 9316237  T
Q  583 gaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||| | || ||  ||  |||  |||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9316238 gaaaatctcaagtgttaggttaaacgcgacaatgaaacaagggtgtgactcttcactttgctgagtcattacccagtgaagagaattctgaacaaaaacc 9316337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9284703 - 9284163
Alignment:
Q  23 agacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatctattga 121  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||| |    
T  9284703 agacatcaaagtaattggagactccttgtccgataataagaattcaatttgacctttaatataaagtttaactacataaattatatgatgggtccattaa 9284604  T
Q  122 actgaaattaacttatacagagcaaaaa-ctcagataataaataagga-gtaccttc------tcttgcttgtatgattctctttcctg----------- 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||      ||||||||  | ||||||| ||| |                
T  9284603 actaaaattaacttatacaaagcaaaaaactcagataatcaataaagaagtaccttctcttgctcttgcttaaacgattctccttcttactagaattatc 9284504  T
Q  203 ----gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatca 298  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||    
T  9284503 aacagggaaggaaggtggcacaagactttcaacacaaatcatagcttcatccaaattaggaattccttcaacataaataacttgctcactcttcaaatca 9284404  T
Q  299 taccaaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatg 398  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  9284403 taccaaaccagcttcttacaatctatttctaatagaaccttactaccatcactagaataacctaaaggcctcaaagatttcaaacgtaaagtgaaccgtg 9284304  T
Q  399 attcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcataca 498  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  9284303 atttaaccaaagtaaaaattttacaccaactatctctagaaccatattctttcatcacccaaacgtcaattttagtagtttgataattcacaatcatact 9284204  T
Q  499 aagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactct 539  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||  |||  ||||||||||    
T  9284203 aagacaacctcctaaaacagcaacctcaaggtcaaaactct 9284163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 206 - 681
Target Start/End: Original strand, 10335692 - 10336149
Alignment:
Q  206 aaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaa 305  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10335692 aaggaaggtgaaacaagacttccaacacaaatcatagtgtcatccaaattaggaattccttcaacataactaatttgttcactcttcaaatcataccaaa 10335791  T
Q  306 acagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagc 405  Q
    ||| ||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||            |||   ||||| |||| | |    
T  10335792 acaacttcttacaatcgatttccaatagaaccttacttccatcactacaataacctaaaggcctcaaa------------aaatctaaacacgatttaac 10335879  T
Q  406 caaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacac 505  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  10335880 caaagtaaaatgtttacaccaactatctctacagccatattctttcatcacccaaacatcaattttagtagtttgataattcacaggcaaacaaagacac 10335979  T
Q  506 ccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaa 605  Q
    ||| ||||||| |||| |  ||||| |||||||||| || | | |  |||       ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||    
T  10335980 cctcccaaaacagcaatagaaattttaaaactctcattactaattatttc------atcaggaagaggaacctcattgaaaatctcaagtgatagattaa 10336073  T
Q  606 acgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaac 681  Q
    ||||| |||||| || || ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10336074 acgcagcaattaaacaaggttgtaacccatcaagtttcggagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaac 10336149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 203 - 682
Target Start/End: Original strand, 9328432 - 9328905
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  9328432 gggaaggaaggtggtacaagacttccaacagaaaacataacatcatggaaatcaggaattccttcaacataactaacttgtgcactcctaaaatcataca 9328531  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattc 402  Q
    |||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| |  ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||     
T  9328532 aaaacagcttctcaaaatccaccctcaacaaaaccttttttccatcactcaaataacctaaaggcctcaaagatttcaaaggtaaatggaaacacgattt 9328631  T
Q  403 agccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaaga 502  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  9328632 aaccatagtaaaaagtttacaccaactatctctatatccatattgtttcatcacccaaacatcaatttcagtagtttcataattcaaagtcatgcaaaga 9328731  T
Q  503 cacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggt 602  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||  |  || |    | |  ||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  9328732 caccctcccaaaacatcaacatcaatttcaaaactcttatta--ctattat----caacatcaggaagaggaaccacattgaaaatttcaagtgttaggt 9328825  T
Q  603 taaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    ||||||||||||||| |  ||  || ||   | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9328826 taaacgcaacaattaaagaaggatgtaatccaccaagtttcttagtcattatccagtgaagagaattctcaaccaaaacc 9328905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 203 - 609
Target Start/End: Original strand, 10352942 - 10353351
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  10352942 gggaagtaaggtggtacaagacttccaacacaaatcatagtgtcatccaaattaagaatttcttgaacataactaacttgtttactctccaaatcatacc 10353041  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattc 402  Q
    |||| || ||||||  ||||||   ||||| |||| |  ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||| | ||||     
T  10353042 aaaatagattctcaacatctaccctcaacaaaaccttttttctatcactcgaataacctaaaagcctcaaagattgcaaaggtaaatcgaaagaagattt 10353141  T
Q  403 agccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaaga 502  Q
    | ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || ||||| ||||||||||||||||    
T  10353142 aaccacagtaaaaagtttacaccaactctctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttagtatctttataatccacaatcatacaaaga 10353241  T
Q  503 cacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatt---tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgtta 599  Q
    |||||| | ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  10353242 caccctcctaaagcagcaacacgaattttaaaactcttactattaacttcttcctctatttcatcaggaagaggaacctcattgaaagtctcaagtgtta 10353341  T
Q  600 ggttaaacgc 609  Q
    ||||||||||    
T  10353342 ggttaaacgc 10353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 203 - 682
Target Start/End: Original strand, 9320815 - 9321285
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9320815 gggaaggaaggtgggacaagacttccaacacaaaacataactccatggaaatcaggaattccttcaacataactaacttgtgcactcttcaaatcatacc 9320914  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattc 402  Q
    ||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||| ||||     
T  9320915 aaaacagcttctcagcatctaccctcaacaaaaccttttttccatcactcgaataacctaaaggcctcaaagatttcaaaggtaaatcgtaacacgattt 9321014  T
Q  403 agccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaaga 502  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||  ||||    | |||| ||||||    
T  9321015 aaccatagtaaaaagtttacaccaactatctctagaaccatattctttcatcacccaaacatcaacttttgtagtttcgtaat---aagtcatgcaaaga 9321111  T
Q  503 cacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggt 602  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |  || |      |  ||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  9321112 caccctcccaaaacatcaacatcaatttcaaaactctcatta--ctattat----gaacatcaggaagaggaaccacattgaaaatttcaagtgttaggt 9321205  T
Q  603 taaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||| |||||||||| |  ||  || ||   | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321206 taaatgcaacaattaaagaaggatgtaatccaccaagtttctttgtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 9321285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 203 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 11987796 - 11987373
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  11987796 gggaaggagggtggtacaagacttccaacacaaatcatagcttcatcgaatttaggaattccgtcaacataactaaattgttcactcttcaaatcatacc 11987697  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattc 402  Q
    ||| ||||||||    ||  |  ||||||| |||| |  | ||||| ||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  11987696 aaaccagcttcttgtgattaagatccaacaaaacctttttaccatcactcgaataacccaaagggctcaaagatttcaaaggtaaaacgaaacacgattc 11987597  T
Q  403 agccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaaga 502  Q
       ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  11987596 catcaatgtgaaaagtttacaccaactatctctacatccatattctttcatcacccaaatatcaatctt---agtatgatgattcacagtcaaacaaaga 11987500  T
Q  503 cacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactatt------cactt---cttcccctatttc---aggaaaaggaacctcattgaaaatct 590  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||      | |||   || | ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11987499 caccctcccaaaacagcaacatcaatttcaaaacttgcactattagtaacctcttcacctcctcctatttcatgaggaaaaggaacctcattgaaaacct 11987400  T
Q  591 cgtgtgttaggttaaacgcaacaatta 617  Q
    || ||||||||||||| || |||||||    
T  11987399 cgagtgttaggttaaatgcgacaatta 11987373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 209 - 617
Target Start/End: Original strand, 9364467 - 9364878
Alignment:
Q  209 gaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaaca 308  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9364467 gaaggtggtacaagactaccaacacaaatcatagcttcattcatattaggaattcctggaacactagtaacgttttcactcttgagatcgtaccaaaaca 9364566  T
Q  309 gcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcag-cca 407  Q
    |||||| || ||||| |||||| | |||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||     |||| | || ||   |||    
T  9364567 gcttcttacgatctatttccaataaaaccttctttccatcactcgaataacctaaaggcctcaacgatttcaaaggtgtcg-gaaaaaagagtcccacca 9364665  T
Q  408 aagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacaccc 507  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9364666 aagtaaacaatttacaccaactatcttttaatccatattctttcatcacccaaacatcaatttgagtagtttgataattcacaatcatactaagacaccc 9364765  T
Q  508 ttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcact---attcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggtta 604  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||   |||     |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9364766 tcccaaaaccgcaacatcgatttcaaaactctcactctcattattaacttcacctatttcaggaagtggaacttcattgaaaatctctagtgttaagtta 9364865  T
Q  605 aacgcaacaatta 617  Q
    |||||||| ||||    
T  9364866 aacgcaactatta 9364878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 203 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12012858 - 12012521
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||||||    
T  12012858 gggaaggagggtggtacaagacttccaacacaaatcatagcttcatcgaaattaggaattccttcaacataactaacttg---actcttcaaatcatacc 12012762  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaa------ccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaaca 396  Q
    ||| |||||||| |  || ||| ||||||| ||      ||||  | |||||  |||||||| | ||||| | ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  12012761 aaaccagcttcttatgatttacctccaacaaaaacaaaaccattttaccatcattcgaataacccaaaggtctcaaaaatatcaaaggtaaaacgaaaca 12012662  T
Q  397 tgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcata 496  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  12012661 cgattccaccaaagtaaaaagtttacaccaactatctttacaaccatattctttcatcaccaatacatcaatcttagtagtttgatgattcacaatcata 12012562  T
Q  497 caaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaact 537  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  12012561 caaagacaccctcccaaatcagcaacagaaatttcaaaact 12012521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 325 - 682
Target Start/End: Original strand, 10347740 - 10348100
Alignment:
Q  325 ttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacac 424  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||  |||| |||   |||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10347740 ttccaacagaaccttacttccatcactagaataacatatgggcctcaacaatttcaaaggtaaatcgaaacacgactcagccatagtaaaaagtttacac 10347839  T
Q  425 cagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacac 524  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  || |||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  10347840 caactatctctacatccatattctttcatgacccaaacatcaattttagtatctttataatcgacagtgatacaaagacaccctcccaaaacagcaacat 10347939  T
Q  525 caatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatt---tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacg 621  Q
     || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| |      
T  10347940 gaacttcaaaactctcaccattaacttcttcacctatttcatcaggaagaggaacctcattgaaaatttcaagtgtgaggttaaacgcgacaattaaaga 10348039  T
Q  622 agattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    ||  || |||  ||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10348040 aggatgtaacccatcaagtttcttcgtcataatccagtgaatagaattctcaacaaaaacc 10348100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 206 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12019194 - 12018857
Alignment:
Q  206 aaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaa 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  12019194 aaggaaggtggtacaagacttccaacacaaatcatggcttcatcgaaattaggaattccttcaacataactaacttgctgactcttcaaatcataccaaa 12019095  T
Q  306 acagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagc 405  Q
     |||| | | |  || ||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||  | | |||||||||| |||||| |||||       
T  12019094 ccagcatattatgatttacatccaacaaaaccttttttccatcactcgaataacctaaagggctcaaaaatctaaaaggtaaaacgaaacacgattccat 12018995  T
Q  406 caaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagttt------gataattcacaatcatacaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  | |||      ||||||||| ||||| ||||    
T  12018994 caaagtaaaaagtttacaccaactatctctacatccatattctttcatcacccaaacacctatcttagtaatttgatttcgataattcataatcaaacaa 12018895  T
Q  500 agacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaact 537  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  12018894 agacaccctcccaaatcagcaacagcaatttgaaaact 12018857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 203 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12006427 - 12005939
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||   || |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  12006427 gggaaggaaggcagtacaagacttccaacacaaatcatcgcttcatcgaaatttggaattccctcaatgtaattaacttcttcactcttcaaatcatacc 12006328  T
Q  303 aaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattc 402  Q
    ||| |||||||| |  || ||| || |||| ||   |  ||||||| || |||||| |||||||   ||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |    
T  12006327 aaaccagcttcttatgatttacctcaaacaaaagtttttttccatcacttgaataacctaaagggatcaaagatatcacaggtaaaacgaaacacgatcc 12006228  T
Q  403 agccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaaga 502  Q
       ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12006227 catcaaagtaaaaagtttacaccaactatctttacaaccatattctttcatcacccatacatcaatcttagtagtttgataattcacaatcaaacaaaga 12006128  T
Q  503 cacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactc---tcactattcacttcttcccctatt------tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgt 593  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||   | || | | || ||||| ||| ||      ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  12006127 caccctcccaaatcagcaacattaatttcaaaactccgattacaaataacctcttcacctcttatttcatcaggaaaaggaacctcgttgaaaacctcaa 12006028  T
Q  594 gtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||    || |||  |||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006027 gtgttaggttaaacgcgaaaattaaacgctgatgtaacccatcaggtttcttgaccatcatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 12005939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 324 - 680
Target Start/End: Original strand, 9274475 - 9274822
Alignment:
Q  324 cttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttaca 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||  || || |||||| | |||   ||||||||||||||||||    
T  9274475 cttccaacagaaccttacttccatcactagaataacataaaggcctaaaaatttccaaatctacaaggaaacaaggttccatcaaagtaaaaagtttaca 9274574  T
Q  424 ccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaaca 523  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| || |  | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9274575 ccaactatctgtagaaccatattctttcatcacccaaacttcaaattcagtatttcgataattcaaagtcatacaaagacacccttccaaaacaacaaca 9274674  T
Q  524 ccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgag 623  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9274675 ttaatttcaaaactctcactattgacttc---------ttcaggaagaggaaccacattgaaaatatcaagtgttaggttaaacgcaacaattaaacaag 9274765  T
Q  624 attgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaa 680  Q
      ||  ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9274766 ggtgtgactcatcaatttccctagtcattacccagtgaagagaattctcaacaaaaa 9274822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 251 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7115906 - 7115633
Alignment:
Q  251 aaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| | |||||||| |    
T  7115906 aaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcgctcttcaaatcataccaaaccagcttcctacaatctatttccaatagaaccttgcttccatcac 7115807  T
Q  351 tcgaataagctaaaggcc---acaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattc 447  Q
    | |||||| |||||||||   || | ||  |||||| ||||  |||||| || | | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  7115806 tagaataacctaaaggcctgaaccatgtaatcaaagataaatcgaaacacgaattaaccaatgtaaaaagtttacaccagctgtctctagatccatattg 7115707  T
Q  448 tttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7115706 tttcatcacccaaacatctgttttagtagttctataattcacaatcatacaaagacaccctcccaaaacagcaa 7115633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9066135 - 9065413
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||| | || | ||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  9066135 aggtagaaacttcaaagtaattagagaatctttatcctatgataagacttcaatttgaccttgagca--aagtttagctacatatatcatatgatgggtc 9066038  T
Q  116 t--------attgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactca-------gataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcc 200  Q
             |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||       || |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  9066037 attgggtccattgaactgatattaacttgtacaaagcaagaactcaaaacttagaaaataaataagaagtaccttctcttggttgttcgattctccttcc 9065938  T
Q  201 tg------------gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcact 288  Q
    |             |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  | ||   ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  9065937 tacaattatcaacagggaaggaagttggtacaagactttcaacacaaatcacagtgtcattccaattaggaactccttcaacataaataacttgttcact 9065838  T
Q  289 cttgagatcataccaaaacagcttctcacaatctac---------------------ttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggc 367  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||| |  ||||||                     ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||| ||||    
T  9065837 cttcaaatcataccaaaagagcttctgatgatctacctccaacaaaacctcaattgcttccaacagaaccttacttccatcaccggaataacctagaggc 9065738  T
Q  368 cacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaa 467  Q
    | | ||| | ||||| || ||  |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9065737 ctcgaagctgtcaaatgtgaatggaaacaagatttgaccaaagtaaaaagtttacaccaactatctctagatccatattctttcatcacccaaccatcaa 9065638  T
Q  468 ttttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctc---actattcacttcttcccc---tat 561  Q
    | |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||||||||   |||||| || ||||| ||   |||    
T  9065637 tattagtagtttcataattcaaaatcatacaaagacaccctcccaaaacagcaacagtcatttgaaaactctcattactattaacctcttcacctcttat 9065538  T
Q  562 tt---caggaaaaggaacctc-attgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatcca 657  Q
    ||   ||||||  |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||| |  ||  || ||| |||| ||||||   ||||||||| |    
T  9065537 ttcagcaggaaggggaacctcaattgaaaatttcaagtgtgaggttaaatgcaacaattaaagaaggatgtaaccgatctagtttcttcgtcattatcaa 9065438  T
Q  658 gtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  9065437 gtgaatagaattctcaacaaaaacc 9065413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 370 - 609
Target Start/End: Original strand, 10371858 - 10372100
Alignment:
Q  370 caaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaatt 469  Q
    ||||| || ||||||||||   |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||      
T  10371858 caaagattccaaaggtaaacccaaacttgatttaaccaaagtaaaaagtttacaccaactatctctagaaccatattctttcatcacccaaatatcaacg 10371957  T
Q  470 ttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatt---tcag 566  Q
    |||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |   ||||    
T  10371958 ttagtagttttataatccacagtcatacaaagacaccctcctaaaacagcaacacgaatttcaaaactattactattaacttcttcacctagttcatcag 10372057  T
Q  567 gaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgc 609  Q
    | | |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  10372058 ggagaggaacctcattgaaagtctcaagtgataggttaaacgc 10372100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9061329 - 9061115
Alignment:
Q  324 cttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttaca 423  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||  ||| |||| ||||   | ||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  9061329 cttccaacagaaccttacctccatcactagaataacataacggcctcaaaaagtccaaaggtgaattgaaacacgatttaaccaaagtaaaaagtttaca 9061230  T
Q  424 ccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaaca 523  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  9061229 ccaactatctctagatccatagtctttcatcacccaaacatcaattttagtagcttcataattcacagacatgcaaagacacccacccaaaacagcaaca 9061130  T
Q  524 ccaatttcaaaactc 538  Q
    | ||||| |||||||    
T  9061129 cgaattttaaaactc 9061115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 324 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8573693 - 8573479
Alignment:
Q  324 cttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttaca 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| | ||| ||| ||| ||  | ||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  8573693 cttccaacagaaccttacttccatcactagaataacctaaaggcctcgaagatttaaaatgtggagtgaaacacgatttaacgaaagtaaaaagtttaca 8573594  T
Q  424 ccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaaca 523  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  8573593 ccaactatctctagaaccatattctttcatcacccaaacatcaatttcagtggtttcataattcacagacatacaaagacacccacccaaaacagcaaga 8573494  T
Q  524 ccaatttcaaaactc 538  Q
    | || || |||||||    
T  8573493 cgaaatttaaaactc 8573479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 326 - 529
Target Start/End: Original strand, 9291899 - 9292096
Alignment:
Q  326 tccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacacc 425  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| ||||||||      |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  9291899 tccaacagaaccttacttccatccctagaataacataaaggcctcaaagatttcaaag------tgaaccgcgatttaaccaaagtaaaaagtttacacc 9291992  T
Q  426 agctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacacc 525  Q
    | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| |    
T  9291993 aactatctctagaaccatattgtttcatcacccaaacatcaattttagtagtttcataattcacagtcatacaaagacactctcctaaaacagcaacagc 9292092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11987989 - 11987865
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11987989 aggtagagacttcaaagtaattagaaaatccttgtcctataataggaattcaatttgacctttaacataaagtttaactacatatatcacatgatgggtc 11987890  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttataca 140  Q
     |||||| ||| |||||||||||||    
T  11987889 cattgaattgatattaacttataca 11987865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12013051 - 12012927
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12013051 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgtcctataataagaattcaatttgacctttaacatggagtctaactacatatatcatatgatgggtc 12012952  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttataca 140  Q
     |||||| ||| |||||||||||||    
T  12012951 cattgaattgatattaacttataca 12012927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9061468 - 9061358
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9061468 gggaagaaaggtgatacgagacttccaacataaaacatagcttcatcaaaattaggaattccttcaacataactaacttgttcactcttgagatcatacc 9061369  T
Q  303 aaaacagcttc 313  Q
    |||||||||||    
T  9061368 aaaacagcttc 9061358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Original strand, 9291755 - 9291865
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  9291755 gggaaggaaggtggtagaagactttcaacacaaatcatagcttcatccaaattaggaattccttcaacataactaatttgttcactcttcaaatcatacc 9291854  T
Q  303 aaaacagcttc 313  Q
    |||||||||||    
T  9291855 aaaacagcttc 9291865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Original strand, 10371503 - 10371644
Alignment:
Q  53 ctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatctattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaact 151  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  10371503 ctatgataagaattcaatttgacctttaacacagagtttaactgcatatataatatgatggatccattgaactgatattaacttatacacaacaaaaact 10371602  T
Q  152 cagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctc 195  Q
    ||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10371603 cagtta--aaacaataagtaccttctcttgcttgtatgattctc 10371644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 10347401 - 10347707
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatcct-tgttctataataagaattcaatttgcttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || | | |||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  10347401 aggtaaagacttcaaagtaattagaaaatactctatcctatgataagaattcaatttg--------atagagtttaactgcatatatgatatgataagtc 10347492  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattctctttcctg------------- 202  Q
     |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |                  
T  10347493 cattgaactgatat-aacttatacacaacaaaaactcagttaaacaataagaagtaccttctcttgcttggatgattctccttcttcctacgattatcaa 10347591  T
Q  203 --gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaatt---aggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatc 297  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  10347592 cagggaaggaaggtgggacaagacttccaacacaaaacatagtttcattcatattaggaggaattccttcaacataactaatttgttcactcttcaaatc 10347691  T
Q  298 ataccaaaacagcttc 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  10347692 ataccaaaacagcttc 10347707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 390 - 523
Target Start/End: Original strand, 16269109 - 16269242
Alignment:
Q  390 tgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcac 489  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16269109 tgaaacacgatttaaccaaggtaaaaagtttgcaccaactatctctatatccatactctttcatcacccaaacatcaattttagtagtttcataattcac 16269208  T
Q  490 aatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaaca 523  Q
    | | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16269209 agttatacaaagacatcctcccaaaacagcaaca 16269242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8579811 - 8579695
Alignment:
Q  206 aaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaa 305  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8579811 aaggaaggtggtagaagggttccaacataaatcatagtttcattgaaattaggaattccttgaacacaagtaacttcttcacttttgagatcataccaaa 8579712  T
Q  306 acagcttctcacaatct 322  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8579711 acagcttcttacaatct 8579695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8573835 - 8573725
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  8573835 gggaagaaaggtggtacaagacttccaacacaaaacatagctgcattccaattaggaattccttcaacataactgacttgttcactcttcaaatcatacc 8573736  T
Q  303 aaaacagcttc 313  Q
    |||||||||||    
T  8573735 aaaacagcttc 8573725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9295144 - 9294990
Alignment:
Q  32 agtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatctattgaactgaaatt 130  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| || ||||||||| || ||| |||| |||||    
T  9295144 agtaattagagaacccctgtcctataataagaattcaatttgacctttagcatagagtttaaccacataaattatatgatgggtccattaaactaaaatt 9295045  T
Q  131 aacttatacagagc-aaaaactcagataataaat-aaggagtaccttctcttgct 183  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  9295044 aacttatacaaagcaaaaaactcagataatcaataaagaagtaccttctcttgct 9294990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 9320599 - 9320736
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  9320599 aggtagagacttcaaagtaattagagtatccttgtccgataataaaaattcaatttgacctatagcatagagtttaacttaatatatcatatgatgggtc 9320698  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactca 153  Q
     |||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  9320699 cattgaattgacatcaactaatacatagcaaaaactca 9320736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 9364245 - 9364409
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |     
T  9364245 aggtatagacttcaaagtaattagagactccttgtcctataataagaattccatttgacctttaatatagagtttaagtacatatatcatatgatgggtt 9364344  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgctt 184  Q
     ||||||| || || | |||||||| |||||| ||||||||||  || |||   |||||||||||||||    
T  9364345 cattgaacggatat-agcttatacacagcaaagactcagataaacaacaag---taccttctcttgctt 9364409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 10371679 - 10371780
Alignment:
Q  212 ggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagct 311  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10371679 ggtggtacaagactaccaacacaaaccatagcatcatccaaattagaatttccttcaacataactaacttgttcactcttcaaatcataccaaaacagct 10371778  T
Q  312 tc 313  Q
    ||    
T  10371779 tc 10371780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12019388 - 12019285
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttgcttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  12019388 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgtcctataataagaattccaat--acattaacatagagtttaactacatatatcatatgatgggtcc 12019291  T
Q  117 attgaa 122  Q
    ||||||    
T  12019290 attgaa 12019285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 9291566 - 9291655
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9291566 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgtcctataataagaattcaatttaacctttagcatagagtttaactacatgtatcat 9291655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 305
Target Start/End: Original strand, 9274333 - 9274435
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |  || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9274333 gggaaggagggtggtacaaaacttccaacccaaataatagttccattgaagttaggaattcctttaacaaaactaacttgttcactcttcaaatcatacc 9274432  T
Q  303 aaa 305  Q
    |||    
T  9274433 aaa 9274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9061675 - 9061545
Alignment:
Q  27 ttcaaagtaattagagaatc-----cttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatctattg 120  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||| |||||| |||||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||    
T  9061675 ttcaaagtaattagagaatcaaatccttgtcctataacaagaattcaatttaacctttagcatagagtttaactacatatattatatgatgg--ccattg 9061578  T
Q  121 aactgaaattaacttatacagagcaaaaactca 153  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  9061577 aactgacatcaacttatacatagcaaaaactca 9061545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 9328228 - 9328355
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  9328228 aggtagagacttcaaagtaattagagaa--------ctat--taagaattcaatttgacctttagcatagagtttaacttcatatatcatatgacgggtc 9328317  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactca 153  Q
     |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  9328318 cattgaattgacatcaacttatacatagcaaaaactca 9328355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Original strand, 10341182 - 10341293
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaac---acaactaacttgttcactcttgagatcat 299  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  | |||||    
T  10341182 gggaagaaaggtggtactatacttccaacacacatcatagcatcatccaaatcaggaattccttcaacataataactaacttgttcactctccaaatcat 10341281  T
Q  300 accaaaacagct 311  Q
    ||||||||||||    
T  10341282 accaaaacagct 10341293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12006595 - 12006543
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12006595 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgtcctaaaataagaattcaa 12006543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 488
Target Start/End: Original strand, 7611974 - 7612057
Alignment:
Q  405 ccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattca 488  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  7611974 ccaaagtaaacaatttacaccaactatcttttaatccatattctttcatcacccaaacatcaaacttaatagtttcataattca 7612057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 563 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7115579 - 7115475
Alignment:
Q  563 tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaa 662  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| || ||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7115579 tcaggaagaggaacctcaatgaaacgctcaagtgttaggttaaacgcgacaattaaacaagggtgtgactcatcaagtttccgagacattatccagtgaa 7115480  T
Q  663 gagaa 667  Q
     ||||    
T  7115479 cagaa 7115475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 9274200 - 9274276
Alignment:
Q  27 ttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatat 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  9274200 ttcaaagtaattagtgaatccttgtcctataataagaattcaacatgacctttagcataaagtttaactacatatat 9274276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Original strand, 16268952 - 16269012
Alignment:
Q  254 ttaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttct 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16268952 ttaggaattccttcaacataactaactcgttcactcttcaaatcataccaaaacaacttct 16269012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8574024 - 8573934
Alignment:
Q  25 acttcaaagtaattagagaatccttgttcta--taataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8574024 acttcaaagtaattagagaatccttgtcctatgtgataagaatttaatttgacctttagcatagagtttaaccacatatatcatatgatgg 8573934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17566190 - 17566107
Alignment:
Q  405 ccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattca 488  Q
    |||| ||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  17566190 ccaaggtaaacaatttacaccaattatctctaaatccatattctttaatcacccaaacatcaacattagtagtttgataattca 17566107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 9272296 - 9272410
Alignment:
Q  38 tagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatctattgaactgaaattaactta 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||   |||||| |||| | |||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||    
T  9272296 tagagaatcctatttctataataagaattcaattagacctttagcattgggtttaattgcaaagatcatatgatgggttcattaaactgacattaactta 9272395  T
Q  137 tacagagcaaaaact 151  Q
    |||| ||||||||||    
T  9272396 tacatagcaaaaact 9272410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8579592 - 8579532
Alignment:
Q  407 aaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaa 467  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8579592 aaagtaaacaatttacaccaactatctctaaatccatattttttcatcacccaaacctcaa 8579532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 10352738 - 10352794
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg 73  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  10352738 aggtaaagacgtcaaagtaattagagaatccttatcctatgataagaattcaatttg 10352794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 12012486 - 12012432
Alignment:
Q  563 tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaatta 617  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  12012486 tcaggaaatggaacctcattgaaaagctcaagtgttaggttaaacgcgacaatta 12012432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 8576446 - 8576392
Alignment:
Q  475 agtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaatt 529  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  8576446 agtttcataattcacactcatacaaagacaccctccaaaaacagcaacatcaatt 8576392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12018814 - 12018716
Alignment:
Q  571 aggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaatt 669  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||||    || ||| || | ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12018814 aggaacctcattgaaaatatcgagtgtgaggttaaatgcgacaattaacaaaggttgaaagttatcaaatttccttgtcattatccaatgaagagaatt 12018716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 682
Target Start/End: Original strand, 16269277 - 16269395
Alignment:
Q  564 caggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaag 663  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |  ||  || |||   |||||||||   | |||||| ||| |||     
T  16269277 caggaagaggaacctcgttgaaaatctcaagtgttaggttaaacgcgacgattaaagaaggatgtaacccgtcaagtttcttcgccattatacagcgaat 16269376  T
Q  664 agaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16269377 agaattctcaacaaaaacc 16269395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 559 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 17566024 - 17565966
Alignment:
Q  559 tatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaatta 617  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  17566024 tatttcaggaagaggaacctcgatgaaaatctcttgtttgaggttaaacgcgacaatta 17565966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9284044 - 9284011
Alignment:
Q  649 cattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9284044 cattatccagtgaatagaattctcaacaaaaacc 9284011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 9284129 - 9284076
Alignment:
Q  564 caggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaatta 617  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  9284129 caggaagaggaacctctttgaaaacctctagtgttaggttaaacgcgacaatta 9284076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 10335589 - 10335665
Alignment:
Q  117 attgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgtatgattct 194  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10335589 attgaactgatat-aacttatacacaacaaaaactcagtcaaacaataagaagtaccttcccttgcttgtacgattct 10335665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 615
Target Start/End: Original strand, 7612157 - 7612201
Alignment:
Q  571 aggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaat 615  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  7612157 aggaacctcattgaaaatctcttgtgtaaggttaaaagcgacaat 7612201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 10341038 - 10341082
Alignment:
Q  28 tcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaattt 72  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  10341038 tcaaggtaattagagaatccttatcctatgataagaattcaattt 10341082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19393318 - 19393258
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatc-----cttgttctataataagaattcaattt 72  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||     ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19393318 aggttgagacttcaaagtaattagagaatctaatccttttcctataataagaattcaattt 19393258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 203 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41967017 - 41966682
Alignment:
Q  203 gggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  41967017 gggaaggaaggtggtacaagacttccaacacaaaacatggcttcatcaaaattaggaattccttcaacataagtaatttgttcactcttcaaatcatacc 41966918  T
Q  303 aaaacagcttc---tcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatga 399  Q
    ||||||| |||   |||  |  | ||| |||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||  || ||| | |||||||| | || ||||||| ||    
T  41966917 aaaacagtttcaaatcattaattccttgcaacagaaccttccttccatcgctagaacaacctaaaacccccaaggatttcaaagatgaagtgaaacaaga 41966818  T
Q  400 ttcagccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaa 499  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  41966817 tttaaccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctagatcgatattctttcatcacccaaacatcaacatcgctagtttgataatccacaaccatacaa 41966718  T
Q  500 agacacccttccaaaaccgcaacaccaatttcaaaa 535  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||    
T  41966717 agacaccctcccaaaacagaaacagaaatttcaaaa 41966682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41967236 - 41967066
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | ||| |||  |||||||| ||    
T  41967236 aggtaaagccttcgaagtaattagagaatagttatcctataataagaattcaatttaacctttaacatagagtttaagtacatgtattgtatgatgggtc 41967137  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactcagataataaataaggagtaccttctcttgcttgta 187  Q
     |||| ||| ||  |||| |||||| ||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  41967136 cattgcact-aatctaacatatacaaagcaaaagctaagataatgaacaagaagtaccttctcttgcttgta 41967066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 41966655 - 41966544
Alignment:
Q  571 aggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacgagattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattc 670  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||  || ||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||     
T  41966655 aggaacctggttgaaaatctcaagtgttaggttaaacgcgacaattaaacaagggtgtaatccatcaagttccttggtcattatccagtgaagagaattg 41966556  T
Q  671 tcaacaaaaacc 682  Q
    | ||||||||||    
T  41966555 tgaacaaaaacc 41966544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 591
Target Start/End: Original strand, 26574700 - 26575085
Alignment:
Q  212 ggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||  | ||| || |  ||||||||| | |||||  | ||||||||||||||| |    
T  26574700 ggtggtacaagacttccaacacaaatcatagcgtcatccaaatcaagatcttcttgaaaatgactaacttgattactctccaaatcataccaaaacagat 26574799  T
Q  312 tctcacaatctacttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaa--at-gaaacatgattcagccaa 408  Q
    || ||  ||||||   ||||| |||| |  |||||||  | |||||| ||||| ||| ||||| || || |||||||  || |||||| |||| | |||     
T  26574800 tcacaacatctaccctcaacaaaaccttttttccatcaatggaataacctaaaagcctcaaagattccacaggtaaatcatcgaaacacgatttaaccac 26574899  T
Q  409 agtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacaccct 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26574900 agtaaaaagtttacaccaactatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttagtatctttataatccacagtcatacaaagacaccct 26574999  T
Q  509 tccaaaaccgcaacaccaatttcaaaactctcactattcacttcttcccctatt---tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctc 591  Q
     | ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26575000 cctaaatcagcaacacgaattttaaaactcttactattaacttgttcccctatttcatcaggaagaggaacctcgttgaaagtctc 26575085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Original strand, 26574525 - 26574580
Alignment:
Q  18 ggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg 73  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  26574525 ggtaaagacgtcaaagtaattagagaatccttatcctatgataagaattcaatttg 26574580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 308
Target Start/End: Original strand, 561019 - 561121
Alignment:
Q  206 aaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaa 305  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||  ||||||  || ||  || ||| ||||||||||||||||    
T  561019 aaggaaggtggtagaaggcttccaacataaatcataactttattgatattaggaattcctggaacacaggtagctcttttacttttgagatcataccaaa 561118  T
Q  306 aca 308  Q
    |||    
T  561119 aca 561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 467
Target Start/End: Original strand, 561273 - 561319
Alignment:
Q  421 acaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaa 467  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  561273 acaccaactatctctaaatccatattctttcattacccaaacatcaa 561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 617
Target Start/End: Original strand, 561423 - 561481
Alignment:
Q  559 tatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaatta 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  561423 tatttcaggaagaggaacctcattgaaaatctcttgggcaaggttaaacgcgacaatta 561481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 327 - 520
Target Start/End: Original strand, 45243656 - 45243849
Alignment:
Q  327 ccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacacca 426  Q
    ||||||||||  |||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45243656 ccaacagaactttacttcgatcactcgaataacataaaggcctcaaagattccaaatgaaaattgaaacacgatttaaccaaagtaaaaagtttacacca 45243755  T
Q  427 gctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgca 520  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45243756 aatatctctagaaccatattctttcatcacccaaacatcaatttcattagtttgataattcacaatcatacaaagacactctcccaaaaccgca 45243849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 511
Target Start/End: Original strand, 45230467 - 45230576
Alignment:
Q  405 ccaaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaa---catcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaag 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45230467 ccaaagtaaaaagtttacaccaactatctctagaaccatattctttcatcacccaaacatcatcaattttattagtttgataattcacaatcatacaaag 45230566  T
Q  502 acacccttcc 511  Q
    |||| |||||    
T  45230567 acactcttcc 45230576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 470
Target Start/End: Original strand, 45237907 - 45238050
Alignment:
Q  327 ccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacacca 426  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||||| |||   ||||| | | ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45237907 ccaacagaactttacttcgatcgcttgaataacataaaggcctcaacaatttcagatgaaaattgaaacacgattcaactaaagtaaaaagtttacacca 45238006  T
Q  427 gctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattt 470  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45238007 actatctctagatccatattctttcatcacccaaacatcaattt 45238050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 45230256 - 45230351
Alignment:
Q  218 acaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttc 313  Q
    ||||| ||| || ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45230256 acaaggctttcagcacaaatcattacttcattgaaagtaggaattccttgaacatgagtaacttgttcactcttgaaatcataccaaaacagcttc 45230351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 45243531 - 45243613
Alignment:
Q  231 cacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagcttc 313  Q
    ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45243531 cacaaatcattacttcattgaaagtaggaattccttgaacataagtaagttgttcactgttgagatcataccaaaacagcttc 45243613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Original strand, 45237760 - 45237869
Alignment:
Q  204 ggaaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcatacca 303  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||  ||| ||  ||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45237760 ggaaggaaggtggtacaaggctttcagcacaaatcattacttcattcaaagtaggaattcctcgaacataaataacttgttcattcttgaggtcatacca 45237859  T
Q  304 aaacagcttc 313  Q
    ||||| ||||    
T  45237860 aaacaacttc 45237869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 324 - 539
Target Start/End: Original strand, 37462443 - 37462661
Alignment:
Q  324 cttccaacagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttaca 423  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||    
T  37462443 cttccaacaaaaccttacttccatcactagaataacataaaggcctcaaagatttcaaaggtgaagtgaaacacgatttatccacagtacaaagtttaca 37462542  T
Q  424 ccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacag---tttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgca 520  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  37462543 ccaactatctctagatccatattctttcatcacccaaacatcaaatttagtagtttttttataattcacagtcatacaaagacagcctcccaaaacagca 37462642  T
Q  521 acaccaatttcaaaactct 539  Q
    ||| ||| | |||||||||    
T  37462643 acatcaagtccaaaactct 37462661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 37462098 - 37462236
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg--cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  37462098 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgtcctataacaagaattcaatttgaccttttagcatagaacttaactacatatatcatatgatgggt 37462197  T
Q  115 ctattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaactca 153  Q
    | | |||||| | |  |||||||||| | ||||||||||    
T  37462198 ccaatgaactaacagaaacttatacataacaaaaactca 37462236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 467
Target Start/End: Original strand, 39427680 - 39427740
Alignment:
Q  407 aaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaa 467  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39427680 aaagtaaacaatttacaccaactatatctatatccatattctttcatcacccaaacatcaa 39427740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 37462313 - 37462410
Alignment:
Q  218 acaagacttccaacacaaatcatagc---ttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaaacagctt 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |  ||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37462313 acaagactttcaacacaaatcatagcagctccattcaaattaggaactccttcaatataactaacttgttcactcttccaatcataccaaaacagctt 37462410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 558 - 609
Target Start/End: Original strand, 39427819 - 39427870
Alignment:
Q  558 ctatttcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgc 609  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  39427819 ctatttcaggaagaggaacctcattgaaaatctcttgagttatgttaaacgc 39427870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0667 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0667
Description:

Target: scaffold0667; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 331 - 682
Target Start/End: Original strand, 4432 - 4792
Alignment:
Q  331 cagaaccatacttccatcgctcgaataagctaaaggccacaaagttttcaaaggtaaaatgaaacatgattcagccaaagtaaaaagtttacaccagcta 430  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||  |||||| | | ||| ||||||| || || ||| ||| ||||    || |||||||||||||||||| |||    
T  4432 cagaaccttacttccatcactagaataacataaaggactcgaagatttcaaatgtgaagtgacacacgatttcatcatagtaaaaagtttacaccaacta 4531  T
Q  431 tctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaattttaacagtttgataattcacaatcatacaaagacacccttccaaaaccgcaacaccaattt 530  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||    
T  4532 tcttttaatccatattgtttcatcacccaaacatcaattttagtagtttcataattcacagtcatacaaagacatcctcccaaagcagcaacatcaattt 4631  T
Q  531 caaaactctcact---att---cacttcttcccctatt---tcaggaaaaggaacctcattgaaaatctcgtgtgttaggttaaacgcaacaattacacg 621  Q
    ||| ||| ||| |   |||   | ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||| |      
T  4632 caacactgtcatttgaattaacctcttcttcacctatttcgtcaggaagaggaacctcattgaaaatttcaagtgttaggttaaaagcgacaattagaga 4731  T
Q  622 agattgcaactgatcaagtttccgagtcattatccagtgaagagaattctcaacaaaaacc 682  Q
    ||  || |||  ||||||||||   | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4732 aggatgtaacccatcaagtttctttgccattatccagtgaatagaatcctcaaccaaaacc 4792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0667; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 151
Target Start/End: Original strand, 4073 - 4208
Alignment:
Q  17 aggtagagacttcaaagtaattagagaatccttgttctataataagaattcaatttg-cttttaacataaagtttaactgcatatatcatatgatggatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  4073 aggtagagaattcaaagtaattatagaatccttttcctataataagaattcaatttgagttttagcacagagtttaactaaataaatcatatgatgggtc 4172  T
Q  116 tattgaactgaaattaacttatacagagcaaaaact 151  Q
     ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  4173 cattgaacagatattaacttatacacagcaaaaact 4208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0667; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Original strand, 4289 - 4394
Alignment:
Q  206 aaggaaggtggcacaagacttccaacacaaatcatagcttgatcgaaattaggaattccttcaacacaactaacttgttcactcttgagatcataccaaa 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||| |||   || |||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  4289 aaggaaggtggtacaagacttccaacacaaatcttagctccattgaaatcaggaatttctt---cataactaacttgttcagtcttcaaatcataccaaa 4385  T
Q  306 acagcttct 314  Q
    |||||||||    
T  4386 acagcttct 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 472
Target Start/End: Original strand, 36224454 - 36224520
Alignment:
Q  406 caaagtaaaaagtttacaccagctatctctacatccatattctttcatcacccaaacatcaatttta 472  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36224454 caaagtaaacaatttacaccaactatctctaaatccatattctttcatcacccaaacatcaaattta 36224520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University