View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3581_low_10 (Length: 290)

Name: NF3581_low_10
Description: NF3581
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3581_low_10
NF3581_low_10
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (19-234)||(45158211-45158426)
chr2 (52-243)||(17932569-17932756)
chr2 (52-243)||(17943472-17943659)
chr2 (52-244)||(30261830-30262020)
chr2 (52-290)||(12781232-12781468)
chr2 (52-290)||(27517650-27517886)
chr2 (52-231)||(30478929-30479104)
chr2 (52-290)||(39679980-39680215)
chr2 (65-290)||(39686933-39687153)
chr2 (51-231)||(20054837-20055013)
chr2 (64-231)||(38190946-38191107)
chr2 (65-290)||(2736155-2736375)
chr2 (52-231)||(22712588-22712763)
chr2 (65-290)||(17462386-17462606)
chr2 (65-243)||(45567359-45567532)
chr2 (65-290)||(2740891-2741111)
chr2 (64-231)||(20050094-20050255)
chr2 (52-251)||(37170802-37170999)
chr2 (83-231)||(22717297-22717440)
chr2 (52-244)||(33603929-33604121)
chr2 (80-183)||(20589727-20589829)
chr2 (52-152)||(33674551-33674652)
chr2 (92-226)||(28458902-28459035)
chr2 (116-251)||(15693975-15694111)
chr2 (116-290)||(10942521-10942695)
chr2 (116-290)||(10948390-10948564)
chr2 (133-194)||(41303138-41303199)
chr2 (133-185)||(27248015-27248067)
chr2 (116-201)||(17921770-17921855)
chr2 (116-197)||(26345677-26345758)
chr2 (63-185)||(30720726-30720853)
chr2 (52-117)||(35894442-35894508)
chr2 (116-290)||(40699446-40699620)
chr2 (139-185)||(13828458-13828503)
chr2 (64-185)||(34575224-34575349)
chr2 (133-217)||(35028664-35028747)
chr2 (169-290)||(45679774-45679893)
chr2 (169-290)||(33670978-33671098)
chr2 (66-96)||(43139404-43139434)
chr2 (116-177)||(11578231-11578291)
chr2 (191-290)||(20146618-20146718)
chr2 (133-177)||(45332302-45332345)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (52-290)||(46783078-46783317)
chr1 (52-290)||(4144694-4144930)
chr1 (52-231)||(3091176-3091354)
chr1 (51-231)||(2401293-2401469)
chr1 (52-268)||(21353381-21353593)
chr1 (52-290)||(9526401-9526637)
chr1 (52-266)||(25134006-25134218)
chr1 (51-251)||(2393332-2393530)
chr1 (65-231)||(2232547-2232707)
chr1 (63-231)||(14996987-14997152)
chr1 (82-251)||(9521681-9521847)
chr1 (52-185)||(14352993-14353132)
chr1 (136-251)||(13125508-13125623)
chr1 (135-244)||(155822-155930)
chr1 (148-250)||(20566713-20566813)
chr1 (66-289)||(27916548-27916765)
chr1 (86-254)||(43104228-43104395)
chr1 (137-256)||(28279383-28279502)
chr1 (116-177)||(15669518-15669578)
chr1 (116-177)||(20291554-20291614)
chr1 (116-177)||(26332613-26332673)
chr1 (133-177)||(8347397-8347440)
chr1 (133-177)||(42922344-42922387)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (64-290)||(27703179-27703404)
chr3 (51-285)||(46966664-46966896)
chr3 (52-281)||(13893396-13893626)
chr3 (52-243)||(29914013-29914200)
chr3 (52-250)||(27762037-27762233)
chr3 (52-290)||(38002804-38003040)
chr3 (52-290)||(47878182-47878418)
chr3 (52-289)||(11079452-11079687)
chr3 (52-290)||(10896940-10897176)
chr3 (52-250)||(16996810-16997008)
chr3 (65-290)||(10094086-10094306)
chr3 (52-290)||(10612789-10613025)
chr3 (65-243)||(27544223-27544396)
chr3 (52-231)||(5858481-5858654)
chr3 (64-231)||(22626056-22626217)
chr3 (64-231)||(47882954-47883115)
chr3 (65-290)||(10100103-10100323)
chr3 (65-290)||(10200966-10201186)
chr3 (52-290)||(54193160-54193397)
chr3 (64-231)||(4535563-4535724)
chr3 (54-231)||(20031390-20031563)
chr3 (51-231)||(54188442-54188619)
chr3 (65-243)||(10208059-10208232)
chr3 (54-244)||(26762975-26763169)
chr3 (52-251)||(10595084-10595281)
chr3 (115-290)||(36871309-36871483)
chr3 (65-268)||(6303260-6303458)
chr3 (83-231)||(16462170-16462313)
chr3 (52-268)||(10949293-10949506)
chr3 (52-231)||(3329827-3330003)
chr3 (170-289)||(15823659-15823778)
chr3 (52-125)||(15823783-15823857)
chr3 (134-286)||(1620473-1620624)
chr3 (116-177)||(25635458-25635518)
chr3 (64-185)||(11066611-11066737)
chr3 (64-177)||(13420306-13420410)
chr3 (116-238)||(23633531-23633651)
chr3 (139-197)||(23941862-23941920)
chr3 (116-177)||(561897-561957)
chr3 (160-268)||(48390335-48390441)
chr3 (147-286)||(53973691-53973831)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (52-290)||(25351288-25351522)
chr7 (52-290)||(25356982-25357216)
chr7 (52-287)||(6067212-6067448)
chr7 (52-290)||(21369576-21369813)
chr7 (52-290)||(25410065-25410301)
chr7 (52-268)||(30246905-30247119)
chr7 (52-290)||(3320062-3320297)
chr7 (52-290)||(3324810-3325045)
chr7 (65-290)||(25405343-25405563)
chr7 (52-289)||(2120833-2121069)
chr7 (52-290)||(8378515-8378751)
chr7 (65-243)||(7069730-7069903)
chr7 (65-243)||(7074737-7074910)
chr7 (64-231)||(42006612-42006773)
chr7 (52-251)||(44143916-44144113)
chr7 (52-290)||(7464530-7464765)
chr7 (52-289)||(44016673-44016909)
chr7 (65-231)||(15541067-15541227)
chr7 (52-231)||(44512597-44512772)
chr7 (52-290)||(44010761-44010998)
chr7 (115-290)||(16297032-16297208)
chr7 (52-154)||(34547007-34547110)
chr7 (160-289)||(6046643-6046772)
chr7 (52-145)||(1099587-1099681)
chr7 (72-195)||(12310119-12310236)
chr7 (52-290)||(6332268-6332500)
chr7 (116-238)||(13290536-13290657)
chr7 (63-290)||(11081567-11081789)
chr7 (133-197)||(26210664-26210728)
chr7 (207-290)||(34546891-34546976)
chr7 (63-96)||(11084436-11084469)
chr7 (116-177)||(21990257-21990317)
chr7 (78-106)||(1099726-1099754)
chr7 (137-197)||(8260605-8260665)
chr7 (133-177)||(24817476-24817519)
chr7 (208-244)||(45366677-45366713)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (52-290)||(26557673-26557908)
chr4 (52-251)||(16638761-16638961)
chr4 (64-290)||(3982186-3982412)
chr4 (52-290)||(5336791-5337031)
chr4 (52-268)||(4570029-4570243)
chr4 (79-290)||(16185845-16186055)
chr4 (64-290)||(36769427-36769650)
chr4 (52-231)||(16489284-16489459)
chr4 (52-290)||(8529202-8529438)
chr4 (52-289)||(7050269-7050504)
chr4 (64-231)||(36771344-36771506)
chr4 (52-231)||(47566427-47566603)
chr4 (65-290)||(11853499-11853719)
chr4 (67-290)||(15831093-15831312)
chr4 (52-249)||(31300359-31300554)
chr4 (52-290)||(15312251-15312487)
chr4 (52-157)||(25614061-25614168)
chr4 (52-225)||(4556137-4556306)
chr4 (52-290)||(18586901-18587137)
chr4 (65-243)||(55822215-55822388)
chr4 (52-197)||(25699684-25699828)
chr4 (63-238)||(4874540-4874714)
chr4 (52-250)||(4558245-4558442)
chr4 (52-251)||(13072031-13072228)
chr4 (52-231)||(15316893-15317068)
chr4 (116-223)||(54906738-54906845)
chr4 (52-290)||(4884809-4885045)
chr4 (64-251)||(16688990-16689173)
chr4 (116-289)||(47150904-47151077)
chr4 (66-290)||(10112975-10113193)
chr4 (53-111)||(32274089-32274148)
chr4 (63-244)||(9022407-9022583)
chr4 (133-290)||(9863874-9864035)
chr4 (165-276)||(16631228-16631340)
chr4 (207-290)||(25613967-25614052)
chr4 (63-193)||(38208789-38208913)
chr4 (208-251)||(3578720-3578763)
chr4 (134-185)||(5516359-5516410)
chr4 (165-289)||(10114518-10114639)
chr4 (116-177)||(19322844-19322904)
chr4 (133-249)||(31983578-31983694)
chr4 (133-177)||(3760116-3760160)
chr4 (144-251)||(54928697-54928804)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (63-289)||(15949481-15949708)
chr8 (52-290)||(30423146-30423386)
chr8 (52-251)||(33032589-33032786)
chr8 (52-231)||(2267093-2267271)
chr8 (64-231)||(29554857-29555018)
chr8 (65-290)||(28327858-28328078)
chr8 (52-231)||(28895437-28895612)
chr8 (52-231)||(9021179-9021354)
chr8 (78-251)||(17799474-17799644)
chr8 (52-290)||(23179572-23179808)
chr8 (65-243)||(16752581-16752754)
chr8 (52-231)||(590729-590904)
chr8 (65-290)||(16757279-16757499)
chr8 (51-185)||(17847612-17847746)
chr8 (65-290)||(25684593-25684813)
chr8 (65-251)||(28332581-28332762)
chr8 (65-243)||(4812546-4812719)
chr8 (52-231)||(26268304-26268477)
chr8 (64-250)||(21033819-21034000)
chr8 (51-185)||(28228448-28228582)
chr8 (133-290)||(31035287-31035445)
chr8 (93-244)||(6376118-6376268)
chr8 (64-217)||(31573809-31573954)
chr8 (84-231)||(3276312-3276454)
chr8 (116-250)||(31578327-31578461)
chr8 (115-185)||(13985193-13985263)
chr8 (133-236)||(3895990-3896094)
chr8 (64-185)||(33839037-33839161)
chr8 (52-111)||(15944808-15944868)
chr8 (169-290)||(28890816-28890936)
chr8 (116-177)||(30480625-30480685)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (52-227)||(24542746-24542921)
chr6 (53-231)||(19701934-19702109)
chr6 (81-290)||(5165824-5166032)
chr6 (52-251)||(17694902-17695098)
chr6 (52-231)||(12166218-12166394)
chr6 (65-290)||(13878677-13878897)
chr6 (65-290)||(16785869-16786089)
chr6 (52-250)||(22351903-22352099)
chr6 (65-231)||(22342873-22343033)
chr6 (65-243)||(26887283-26887456)
chr6 (65-243)||(31248773-31248946)
chr6 (65-290)||(13883425-13883645)
chr6 (52-251)||(33215762-33215959)
chr6 (52-268)||(25465932-25466146)
chr6 (65-290)||(35201338-35201558)
chr6 (52-154)||(3577658-3577761)
chr6 (52-154)||(17035990-17036093)
chr6 (52-154)||(13467607-13467710)
chr6 (208-290)||(11262681-11262763)
chr6 (66-251)||(20526894-20527071)
chr6 (135-276)||(17904374-17904514)
chr6 (52-231)||(26643111-26643286)
chr6 (52-231)||(26749077-26749252)
chr6 (52-286)||(7293871-7294095)
chr6 (135-250)||(30445673-30445789)
chr6 (64-154)||(25941593-25941682)
chr6 (169-251)||(3577539-3577620)
chr6 (208-251)||(22870150-22870193)
chr6 (116-238)||(26945275-26945397)
chr6 (133-223)||(7542459-7542549)
chr6 (116-249)||(12186122-12186255)
chr6 (169-290)||(25941720-25941840)
chr6 (170-244)||(3833460-3833536)
chr6 (64-290)||(22857963-22858182)
chr6 (63-173)||(30443382-30443484)
chr6 (116-177)||(3027976-3028036)
chr6 (63-96)||(7542590-7542623)
chr6 (133-177)||(12195636-12195679)
chr6 (169-249)||(12937244-12937324)
chr6 (207-268)||(17038320-17038383)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (64-271)||(31782485-31782691)
chr5 (52-290)||(26406477-26406720)
chr5 (53-276)||(10627298-10627523)
chr5 (52-290)||(35385463-35385699)
chr5 (52-251)||(40222698-40222895)
chr5 (52-290)||(17841260-17841497)
chr5 (52-290)||(22672769-22673005)
chr5 (65-290)||(1170761-1170981)
chr5 (52-149)||(25838042-25838140)
chr5 (64-251)||(1240377-1240560)
chr5 (64-231)||(11962505-11962666)
chr5 (78-250)||(28786366-28786535)
chr5 (65-231)||(2298073-2298233)
chr5 (52-231)||(25452430-25452605)
chr5 (64-231)||(16093363-16093524)
chr5 (52-290)||(25445427-25445667)
chr5 (83-238)||(4897792-4897947)
chr5 (79-244)||(15445322-15445493)
chr5 (116-249)||(2144613-2144747)
chr5 (66-290)||(17413176-17413393)
chr5 (133-244)||(35430292-35430404)
chr5 (119-289)||(15143565-15143735)
chr5 (133-290)||(29748461-29748619)
chr5 (64-157)||(25562432-25562525)
chr5 (63-185)||(34033683-34033799)
chr5 (169-290)||(42238311-42238431)
chr5 (115-177)||(18596741-18596802)
chr5 (65-185)||(15224883-15224997)
chr5 (145-197)||(32520563-32520615)
chr5 (66-243)||(4754207-4754377)
chr5 (64-94)||(35314749-35314779)
chr5 (133-238)||(36208689-36208794)
chr5 (52-111)||(42238238-42238298)
chr5 (116-177)||(34530788-34530848)
chr5 (20-52)||(3515261-3515293)
chr5 (133-177)||(42770880-42770923)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (52-290)||(16260-16496)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (52-290)||(16997-17233)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (52-225)||(188320-188489)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (65-243)||(224769-224942)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (65-145)||(31091-31170)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (135-290)||(57438-57594)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (133-177)||(15944-15987)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 45158211 - 45158426
Alignment:
Q  19 atgtcatcaattttgaagtatttgtgcttcacaggtttatagagattctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45158211 atgtcatcaattttgaagtatttgtgcttcacaggtttatagagactctcttggaaacaaacattagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaa 45158310  T
Q  119 cactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45158311 cactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttg 45158410  T
Q  219 taaagaaactcatcat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  45158411 taaagaaactcatcat 45158426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 17932569 - 17932756
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  17932569 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 17932667  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattgga 243  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17932668 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 17943472 - 17943659
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  17943472 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacggg 17943570  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattgga 243  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17943571 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtgga 17943659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30262020 - 30261830
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| || ||  ||| ||||||||| | ||||||    
T  30262020 ggtttatagagttttctcttggcaataaacactagggttgagattgttttgattcacctgaaacaaaacattgctaagatagagtctcttgattacggga 30261921  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || | | ||||||| |||||| | ||||   ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30261920 agaaattcaggactttgggtagaattaggtttcaagactaattcttgtaactctttgatat---tttgtaaagaaactcatcattgtagtggaa 30261830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12781468 - 12781232
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  12781468 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttaaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 12781370  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  12781369 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 12781275  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  12781274 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 12781232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27517886 - 27517650
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  27517886 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 27517788  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  27517787 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 27517693  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  27517692 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 27517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 30478929 - 30479104
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  30478929 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacggg 30479027  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  30479028 aagagact-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 30479104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 39679980 - 39680215
Alignment:
Q  52 ggtttatagagattctctt--ggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |    
T  39679980 ggtttatagagaatctcttttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgag 39680078  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatgga 248  Q
    |||||  | | ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  39680079 aagaggctga-gac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacgga 39680173  T
Q  249 gagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  39680174 gagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 39680215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 39686933 - 39687153
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  39686933 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 39687029  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | ||| ||    
T  39687030 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctccc 39687126  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  39687127 ccagactaggtcatcattagaccgaac 39687153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20055013 - 20054837
Alignment:
Q  51 aggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  20055013 aggtttatagagaatttctctttgcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 20054915  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20054914 gaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 20054837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 38190946 - 38191107
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  38190946 ttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac 38191043  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  38191044 -ttgagtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaaaaaactcat 38191107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 2736155 - 2736375
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  2736155 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcacattgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggact 2736252  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  2736253 ttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 2736348  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  2736349 ccagactaggtcatcattagaccgaac 2736375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22712763 - 22712588
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  22712763 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 22712665  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22712664 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 22712588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 17462386 - 17462606
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  17462386 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 17462482  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  17462483 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc-ct--tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 17462579  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  17462580 ccagactaggtcatcattagaccgaac 17462606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 45567359 - 45567532
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  45567359 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 45567455  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45567456 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 45567532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 2740891 - 2741111
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  2740891 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcacattgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggtt-gggac- 2740987  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  2740988 ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 2741084  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  2741085 ccagactaggtcatcattagaccgaac 2741111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20050255 - 20050094
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  20050255 ttctctttgcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggct-aggac 20050158  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    || || || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20050157 ttgga-tataattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 20050094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37170999 - 37170802
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||| |||    
T  37170999 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-caccagggttgggattgttttgaatcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcatggg 37170901  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  37170900 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 37170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22717440 - 22717297
Alignment:
Q  83 tagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgttt 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  22717440 tagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggttt 22717343  T
Q  183 gaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22717342 gaagactaattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 22717297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 33603929 - 33604121
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||| ||||||| ||||    
T  33603929 ggtttatagagatttcttttggcaacaaacattagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatggga 33604028  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    || |||| | ||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||  |||  | | |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33604029 agtgattga-gactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaa 33604121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Original strand, 20589727 - 20589829
Alignment:
Q  80 cactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatg 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  20589727 cactatggttgtgattgttttggttcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 20589825  T
Q  180 tttg 183  Q
    ||||    
T  20589826 tttg 20589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33674652 - 33674551
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  33674652 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 33674554  T
Q  150 aag 152  Q
    |||    
T  33674553 aag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28459035 - 28458902
Alignment:
Q  92 gattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattga 191  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  28459035 gattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatatt-gggactttgggtagaattaggtttgaagactga 28458937  T
Q  192 ttcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaa 226  Q
    |||||| ||| |||   || |||||||||||||||    
T  28458936 ttcttgtaaccctcggctacctctttgtaaagaaa 28458902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 251
Target Start/End: Original strand, 15693975 - 15694111
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc- 214  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | | |||||||     
T  15693975 aaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctct 15694074  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagag 251  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  15694075 tttgtaaagttactcatcattttagtggaacggagag 15694111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10942695 - 10942521
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |   ||| ||    
T  10942695 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-ct 10942597  T
Q  216 ttgtaaagaaactcatc-attatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||| || | ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10942596 ttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaac 10942521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10948564 - 10948390
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |   ||| ||    
T  10948564 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-ct 10948466  T
Q  216 ttgtaaagaaactcatc-attatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||| || | ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10948465 ttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaac 10948390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41303199 - 41303138
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  41303199 agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattc 41303138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27248067 - 27248015
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27248067 agtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattaggtttgaa 27248015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 17921770 - 17921855
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaac 201  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  17921770 aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaac 17921855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 26345677 - 26345758
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26345677 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttg 26345758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30720853 - 30720726
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattg------ttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagat 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||      | ||||||||||||| |  ||||||| |||| ||  |||||||| | |||| ||||||||    
T  30720853 attctcttggcaccaaacactagggttgagattgaatcactattgattcatcttgga-gaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagat 30720755  T
Q  157 tcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    ||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  30720754 tcgtgactttgggtagaattaggtttgaa 30720726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35894508 - 35894442
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaa 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  35894508 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaa 35894442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Original strand, 40699446 - 40699620
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc- 214  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||  || | |||||||     
T  40699446 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaatcctttgatatctct 40699544  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||| | | | ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  40699545 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaac 40699620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828458
Alignment:
Q  139 ttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattca-gactttgggtagaattatgtttgaa 13828458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34575349 - 34575224
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttt------tgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagatt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |      ||||||| |||| | ||| |||| |||| ||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  34575349 ttctcttggcaacaaacattagggttgagattgaataatcattgattcaccttggagaaa-cactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agatt 34575252  T
Q  158 caggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  34575251 cgggactttgggtagaattaggtttgaa 34575224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 35028664 - 35028747
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt 217  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | ||||||||||||    
T  35028664 agtctcttgatcacgagaagagattgac-actttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttt 35028747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 45679774 - 45679893
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttccccag 267  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||||||    
T  45679774 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccag 45679870  T
Q  268 agtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | || ||||  ||| ||||||||    
T  45679871 actaggtcatcattagaccgaac 45679893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33671098 - 33670978
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttcccca 266  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| || | ||| |||||    
T  33671098 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 33671002  T
Q  267 gagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    || || ||||  ||| ||||||||    
T  33671001 gactaggtcatcattagaccgaac 33670978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 96
Target Start/End: Original strand, 43139404 - 43139434
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43139404 ctcttggcaacaaacactagggttgagattg 43139434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11578291 - 11578231
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  11578291 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 11578231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20146718 - 20146618
Alignment:
Q  191 attcttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||| | || | ||| || |||| || |||| ||||||||||||    
T  20146718 attcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaa 20146619  T
Q  290 c 290  Q
    |    
T  20146618 c 20146618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45332345 - 45332302
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45332345 agtctcttggttacgggaagagatt-aggactttgggtagaatta 45332302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 46783078 - 46783317
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||  ||    
T  46783078 ggtttatagagaattatctttgcaacaaacactagggttgagatcgttttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatga 46783177  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggaga 250  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  46783178 agagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagaga 46783277  T
Q  251 gatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  46783278 gctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaac 46783317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4144930 - 4144694
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4144930 ggtttatagagaatttctcttggcaa-aaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 4144832  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  4144831 aagagact-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactc---aatatatctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 4144737  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  4144736 agagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaac 4144694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3091354 - 3091176
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||| || ||    
T  3091354 ggtttatagagaatttctcttggtaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacaccgctaggattgagtctcttggtaacagg 3091255  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3091254 aagagattga-gac-ttgagtagaattaagtttgaagactaattcttgtaacactc-aatatctctttgtaaagaaactcat 3091176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2401469 - 2401293
Alignment:
Q  51 aggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  2401469 aggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgg 2401371  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2401370 gaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 2401293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21353593 - 21353381
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  21353593 ggtttatagagaatttctcttggtaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacggg 21353495  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  21353494 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggag 21353400  T
Q  250 agatgttatcttccccaga 268  Q
    || || | ||| |||||||    
T  21353399 agctgctctctcccccaga 21353381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 9526401 - 9526637
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  9526401 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 9526499  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaact--catcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  9526500 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---aatatctctttgtaaagaaacttatatcattatagtggaacgg 9526594  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  9526595 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 9526637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Original strand, 25134006 - 25134218
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25134006 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactatggttgtgattgttttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacggg 25134104  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||    
T  25134105 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatataattatagtggaacgg 25134199  T
Q  248 agagatgttatcttcccca 266  Q
    |||| |||| ||| |||||    
T  25134200 agagctgttctctccccca 25134218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2393530 - 2393332
Alignment:
Q  51 aggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  2393530 aggtttatagagaatttctcttggcaataa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgg 2393432  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatg 246  Q
    ||| ||  || ||   ||| |||||||||  |||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  2393431 gaatag--tctgggacttgggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacg 2393337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 2232547 - 2232707
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  2232547 tctcttggcaacaa-ctttagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 2232643  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  2232644 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcat 2232707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 14996987 - 14997152
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  14996987 attctcttggtaataaacactagggttgggattgtttttattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattga-ga 14997085  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    | ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| || ||   |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14997086 c-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-tcctaaatatctctttgcaaataaactcat 14997152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 9521681 - 9521847
Alignment:
Q  82 ctagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||| |||    
T  9521681 ctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtt 9521778  T
Q  182 tgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaact--catcattatattggaatggagag 251  Q
    |||| | ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  9521779 tgaagactgattcttgaaactc---aatatctctttgtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagag 9521847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 185
Target Start/End: Original strand, 14352993 - 14353132
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttt------tgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtc 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |      ||||||| |||| | ||| |||| |||| || |||||||||||||    
T  14352993 ggtttgtagagatttctcttggcaacaaacactaggtttgagattgaatcaccattgattcaccttggagaaa-cactattaggatttagtctcttggtc 14353091  T
Q  145 acgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  14353092 acggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaa 14353132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13125623 - 13125508
Alignment:
Q  136 ctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcat 234  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  13125623 ctcttggtcaagggaagagattg-ggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13125525  T
Q  235 tatattggaatggagag 251  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  13125524 tatagtggaacggagag 13125508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Original strand, 155822 - 155930
Alignment:
Q  135 tctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | |  |||||||||||||||  |||||||||    
T  155822 tctcttggtcacgggaagagattg-ggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaaccttttgttatctctttgtaaagttactcatcat 155920  T
Q  235 tatattggaa 244  Q
    |||| |||||    
T  155921 tatagtggaa 155930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20566813 - 20566713
Alignment:
Q  148 ggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatgg 247  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || | |  || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20566813 ggaagagattcaagactttaggtagaattatgtt--aagactagttattgtaaccctctaatatctctttctaaagaaattcttcattatagtggaatgg 20566716  T
Q  248 aga 250  Q
    |||    
T  20566715 aga 20566713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 289
Target Start/End: Original strand, 27916548 - 27916765
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||| |||| |  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||  |||||||||  | ||||    
T  27916548 ctcttggcaacaaacactagggttggaattg-----attcaccttgga--aaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtg-actt 27916639  T
Q  166 tgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaac--tctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    || || |||||| ||||||| | | ||||||  |||  ||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| | || | ||| ||    
T  27916640 tgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctccc 27916739  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27916740 ccagactaggtcagtattggaccgaa 27916765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 43104228 - 43104395
Alignment:
Q  86 ggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||| |||| ||  ||||| |||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||| |||||||    
T  43104228 ggttgagattgttttggttcaccttgga--aaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaa-actttgggtagaattaggtttgaa 43104324  T
Q  186 tattgatt-cttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatg 254  Q
     |||  || |||| ||| || | |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43104325 gatttttttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatg 43104395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 28279383 - 28279502
Alignment:
Q  137 tcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcatcatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||  |   ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28279383 tcttggtcacgggaagagatt-gggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcatt 28279481  T
Q  236 atattggaatggagagatgtt 256  Q
    ||| |||||| ||||| ||||    
T  28279482 atagtggaattgagagttgtt 28279502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15669578 - 15669518
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  15669578 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 15669518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 20291554 - 20291614
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20291554 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagact-aggactttgggtagaatta 20291614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26332673 - 26332613
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  26332673 aaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattga-gactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8347440 - 8347397
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8347440 agtctcttgatcacgggaagagattga-gactttgagtagaatta 8347397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 42922344 - 42922387
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  42922344 agtctcttggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 42922387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27703404 - 27703179
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27703404 ttctcttggcatcaaacactaggatttggattgttttgattcaccttgaacaaaacattgttaggatataatatcttggtcacggggagagattcaggac 27703305  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||| ||    
T  27703304 tttgaatagaattaggtttgaa-attgatttttgtaactctttgatatctctttgtaaagaaactcataattatagtggaaaagagacatgctctctccc 27703206  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||| |||| |||| | |||||||||||    
T  27703205 ccatagtaggtcagttttggaccgaac 27703179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46966896 - 46966664
Alignment:
Q  51 aggtttatagagattc-tcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||   | ||||||||| ||||||     
T  46966896 aggtttatagagattcctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttcgattcatcttaaacaaaacaatgttag--gagagtctcttgctcacgga 46966799  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| ||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  46966798 aaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagag 46966699  T
Q  250 agatgttatcttccccagagtatgtcaatattggac 285  Q
    || ||   || ||||||||||| |||||||||||||    
T  46966698 agctgccctc-tccccagagtaggtcaatattggac 46966664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 281
Target Start/End: Original strand, 13893396 - 13893626
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattg-ttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13893396 ggtttatagagaattctcttggcaacaaacactagggttgggattgtttttgattcaccttgaacaaaataccgttagaattgagtctcttggtcacggg 13893495  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  13893496 aagagattga-gac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctc-aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 13893592  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatatt 281  Q
    |||| |  | ||| |||||||||| |||| ||||    
T  13893593 agagcttctctctcccccagagtaggtcattatt 13893626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29914200 - 29914013
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  29914200 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 29914102  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattgga 243  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29914101 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtgga 29914013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27762233 - 27762037
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  27762233 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttaaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 27762135  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  27762134 aagaggtt-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 27762040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 38002804 - 38003040
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||    
T  38002804 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacggg 38002902  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  38002903 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 38002997  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||||||| ||| || |||| || ||||  ||| ||||||||    
T  38002998 agagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaac 38003040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47878418 - 47878182
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  47878418 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 47878320  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  47878319 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 47878225  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| | ||||| || |||| |||| ||||||||    
T  47878224 agagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaac 47878182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Original strand, 11079452 - 11079687
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||  |||||||||||||||||    
T  11079452 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcatcttgaacaaaacactatcaggattgagtctcttggtcacggg 11079550  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    || ||  |  |||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  11079551 aaaaggct-gggacttag-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 11079645  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  11079646 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaa 11079687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 10896940 - 10897176
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  10896940 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacggg 10897038  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  10897039 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 10897133  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  10897134 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 10897176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Original strand, 16996810 - 16997008
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||| || | | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  16996810 ggtttatagagaattctcttggtaataaacactagggttggaaatgttttgattcacctagaataaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaa 16996909  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgt-aaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    ||| |||  ||  |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  16996910 agaaatt--gggatttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctctttgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggag 16997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10094306 - 10094086
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  10094306 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 10094210  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  10094209 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 10094113  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  10094112 ccagactaggtcatcattagaccgaac 10094086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10613025 - 10612789
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  ||  ||| |||||||||||||    
T  10613025 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacggg 10612927  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  10612926 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 10612832  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  10612831 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 10612789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 27544223 - 27544396
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||      
T  27544223 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgt--ggaac 27544319  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27544320 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 27544396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 5858481 - 5858654
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||  |||||||||||||    
T  5858481 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacggg 5858577  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5858578 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 5858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22626217 - 22626056
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  22626217 ttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac 22626120  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  22626119 -ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcat 22626056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47883115 - 47882954
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  47883115 ttctcttggcaacaa-cactatggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac 47883018  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  47883017 -ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aaaatctctttgtaaagaaactcat 47882954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10100323 - 10100103
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  10100323 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 10100227  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  10100226 ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 10100130  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  10100129 ccagactaggtcatcattagaccgaac 10100103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10201186 - 10200966
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  10201186 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 10201090  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  10201089 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 10200993  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  10200992 ccagactaggtcatcattagaccgaac 10200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 54193160 - 54193397
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttt-gattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  54193160 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgtttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgg 54193258  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatg 246  Q
    ||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||  |    
T  54193259 gaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaacccatatcattatagtggatcg 54193353  T
Q  247 gagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  54193354 gagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 54193397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 4535563 - 4535724
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||      
T  4535563 ttctcttggcaacaa-cactagggttgggtttgttttgattcactttgaacaaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggtt--ggga 4535659  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4535660 attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 4535724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20031563 - 20031390
Alignment:
Q  54 tttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaa 151  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20031563 tttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 20031465  T
Q  152 gagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||  |  |||| ||| ||| ||||| ||||||| |  |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20031464 gaggct-gggac-ttgggtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 20031390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 54188442 - 54188619
Alignment:
Q  51 aggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttt-gattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacg 147  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  54188442 aggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactaggtttgggattgtttttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacg 54188540  T
Q  148 ggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  54188541 ggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 54188619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10208232 - 10208059
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  10208232 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 10208136  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10208135 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 10208059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Original strand, 26762975 - 26763169
Alignment:
Q  54 tttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaag 152  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  26762975 tttatagagatttctcctgggaacaaacactagggttgtgattgatttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaag 26763074  T
Q  153 agattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaac---tctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    | ||||  ||||| | ||||||||| |||||||  || ||| ||| |||   | | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  26763075 aaattcgagacttcgggtagaattaggtttgaagtttaattattgtaacccttttttgatatctctttgtaaagttactcatcattataatggaa 26763169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10595281 - 10595084
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  10595281 ggtttatagagaatttatcttggcaacaa-cactagggtttggattgttttgattcaccatgaacaaagcactattaggattaagtctcttggtcacggg 10595183  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca--tcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  | | ||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  10595182 aagaggctga-gac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactc---aatatctctttgtaaagaaactcatgtcattatagtggaacgg 10595088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36871483 - 36871309
Alignment:
Q  115 aaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc 214  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||| || |  ||||||    
T  36871483 aaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattg-ggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc 36871385  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | || | ||| ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  36871384 tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaac 36871309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Original strand, 6303260 - 6303458
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  6303260 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 6303356  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||| | ||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  6303357 ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 6303453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Original strand, 16462170 - 16462313
Alignment:
Q  83 tagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgttt 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  16462170 tagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggttt 16462267  T
Q  183 gaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16462268 gaagactaattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 16462313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10949506 - 10949293
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  10949506 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttc-gattgttttgattcaccttgaacaaagtactattaggattgagtctcttggtcacggg 10949409  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||   | |||  ||| || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  10949408 aagag--gctggaacttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaacgg 10949314  T
Q  248 agagatgttatcttccccaga 268  Q
    |||| || | ||| |||||||    
T  10949313 agagctgctctctcccccaga 10949293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 3329827 - 3330003
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||   |||||||||||    
T  3329827 ggtttatagagaatttctcttggcaataaacactagggttgggaatgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattcagttagttggtcacggg 3329926  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3329927 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattc---aatatctctttgtaaagaaactcat 3330003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15823778 - 15823659
Alignment:
Q  170 tagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagag 269  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| || | |||  || ||||    
T  15823778 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagag 15823679  T
Q  270 tatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    || |||||||||||||||||    
T  15823678 taagtcaatattggaccgaa 15823659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15823857 - 15823783
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgtt 125  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  15823857 ggtttatagagttttctctttgaaacaaacactagggctgagattgttttgattcaccttgaacaaaacattgtt 15823783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1620624 - 1620473
Alignment:
Q  134 gtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatca 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||   |  |||||| ||| || | |||||||||||||||   ||||||||    
T  1620624 gtcttttggtcacgggaagagattg-ggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctctttgtaaacttactcatca 1620526  T
Q  234 ttatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggacc 286  Q
    ||||| ||||| |||| | || | ||| ||| ||| || |||| |||||||||    
T  1620525 ttatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggacc 1620473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 25635458 - 25635518
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  25635458 aaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 25635518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 11066611 - 11066737
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtt------ttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagatt 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||| |||| | ||| |||| |||| ||  | ||| ||| |||||||||||||||    
T  11066611 ttctcttggcaataaacactagggttgagattgaaccaccattgattcaccttggagaaa-cactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagatt 11066709  T
Q  158 caggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11066710 cgggactttgggtagaattaggtttgaa 11066737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13420410 - 13420306
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13420410 ttctctaggcaacaaacactagggttgag------ttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gac 13420320  T
Q  164 tttgagtagaatta 177  Q
    |||| |||||||||    
T  13420319 tttgggtagaatta 13420306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Original strand, 23633531 - 23633651
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||| | | ||||||| ||| |  | ||||||||    
T  23633531 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta-ggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctct 23633628  T
Q  216 ttgtaaagaaactcatcattata 238  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  23633629 ttgtaaagttactcatcattata 23633651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 23941862 - 23941920
Alignment:
Q  139 ttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23941862 ttggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattaggtttgaatacttattcttg 23941920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 561957 - 561897
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  561957 aaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattga-gactttgggtagaatta 561897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48390441 - 48390335
Alignment:
Q  160 ggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgtta 257  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||| || |     
T  48390441 ggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttctaaagagactcatatcattatagtggaacggagagctgctc 48390346  T
Q  258 tcttccccaga 268  Q
    ||| |||||||    
T  48390345 tctcccccaga 48390335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53973831 - 53973691
Alignment:
Q  147 gggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattggaat 245  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| || |  |||||||| | |  | |||||||| ||| ||||||  |||||||| | || |||||     
T  53973831 gggaagagattcgagactttaggtagaattatgtttaaagaccgattcttgtatccatttaatatcttttttgtaaagttactcatcaatgtagtggaac 53973732  T
Q  246 ggagag-atgttatcttccccagagtatgtcaatattggacc 286  Q
    |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53973731 ggagagcatgt-atctcccctagagtatgtcaatattggacc 53973691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 25351288 - 25351522
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25351288 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 25351386  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  25351387 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggag 25351481  T
Q  250 agatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    || |||| ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25351482 agctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 25351522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 25356982 - 25357216
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25356982 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 25357080  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  25357081 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaag 25357175  T
Q  250 agatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25357176 agatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 25357216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6067448 - 6067212
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttt-gattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  6067448 ggtttatagagaattctcttggtaacaaacactagggttgggattgtttttgattcaccttgaacaaaacattgataggatttagtctcttggtcacggg 6067349  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgt-aaagaaactcatcattatattggaatgga 248  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| || || |||    
T  6067348 aagagattga-gactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtcattatagtgaaacgga 6067251  T
Q  249 gagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccg 287  Q
    ||| || | ||| ||||| | || |||| ||||||||||    
T  6067250 gagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccg 6067212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 21369576 - 21369813
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||     
T  21369576 ggtttatagagaaattctcttggcaacaaacattagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacgga 21369675  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    ||||||||  |||| ||| ||| ||||| ||||||| | |||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  21369676 aagagatt-gggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 21369770  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| | ||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  21369771 agagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaac 21369813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 25410065 - 25410301
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25410065 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 25410163  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  25410164 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 25410258  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25410259 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 25410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 30246905 - 30247119
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  30246905 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactacggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 30247003  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  30247004 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 30247098  T
Q  248 agagatgttatcttccccaga 268  Q
    |||| || ||||| |||||||    
T  30247099 agagctgctatctcccccaga 30247119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3320297 - 3320062
Alignment:
Q  52 ggtttatagagattctct--tggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  3320297 ggtttatagagaatctctattggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 3320199  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatgga 248  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  3320198 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgga 3320104  T
Q  249 gagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  3320103 gagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 3320062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3325045 - 3324810
Alignment:
Q  52 ggtttatagagattctct--tggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  3325045 ggtttatagagaatctctattggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 3324947  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatgga 248  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  3324946 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgga 3324852  T
Q  249 gagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  3324851 gagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 3324810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 25405343 - 25405563
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  25405343 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 25405439  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  25405440 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 25405536  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25405537 ccagactaggtcatcattagaccgaac 25405563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Original strand, 2120833 - 2121069
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgtt-ttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  2120833 ggtttatagagattttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttgttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 2120931  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatg 246  Q
    ||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |    
T  2120932 gaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcg 2121026  T
Q  247 gagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    ||||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  2121027 gagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaa 2121069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8378751 - 8378515
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||    
T  8378751 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacggg 8378653  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  8378652 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 8378558  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  8378557 agagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 8378515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 7069730 - 7069903
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  7069730 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 7069826  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7069827 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 7069903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 7074737 - 7074910
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  7074737 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 7074833  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7074834 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 7074910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 42006612 - 42006773
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  42006612 ttctcttggcaagaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac 42006709  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  42006710 -ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 42006773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44144113 - 44143916
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  44144113 ggtttatagagaatttttcttggcaacaa-cactagggttatgattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 44144015  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  44144014 aagaggct-gggactttg-gcagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaaaaaactcatatcattatagtggaacgg 44143920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7464765 - 7464530
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||| ||||||||    
T  7464765 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggtttggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctttgtcacggg 7464667  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
     ||||  |  |||| ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  7464666 gagaggct-gggac-ttgggta-aattaggtttgaagagtgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 7464573  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||||||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  7464572 agagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaac 7464530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44016909 - 44016673
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||| |||| | |    
T  44016909 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttagtcatgag 44016810  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaact--catcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  ||| |||| | ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  44016809 aagaggct-gggaatttg-gcagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcacatcattataatggaacgg 44016715  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
     ||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  44016714 cgagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaa 44016673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15541227 - 15541067
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  15541227 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 15541131  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  15541130 ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcat 15541067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44512772 - 44512597
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactaggg-ttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  44512772 ggtttatagagaattttctttgcaacaa-cactaggggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 44512674  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  44512673 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 44512597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44010998 - 44010761
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||| |||| | |    
T  44010998 ggtttatagagaatttttcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgatccaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttagtcatgag 44010899  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||| ||||| ||||| | | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  44010898 aagaggct-gggac-ttgtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 44010804  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  44010803 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 44010761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16297208 - 16297032
Alignment:
Q  115 aaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactc-tctaatatct 213  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||    
T  16297208 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaacccttttaatatct 16297110  T
Q  214 c-tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | |||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| || | ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16297109 cttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaac 16297032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34547110 - 34547007
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  34547110 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacagagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 34547012  T
Q  150 aagag 154  Q
    |||||    
T  34547011 aagag 34547007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 289
Target Start/End: Original strand, 6046643 - 6046772
Alignment:
Q  160 ggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatc 259  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| || | ||    
T  6046643 ggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctc 6046742  T
Q  260 ttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    | ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  6046743 tcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1099681 - 1099587
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtca 145  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  1099681 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgaaattgttttgattcacgttgaacaaaacactattaggattgactctcttggtca 1099587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310119
Alignment:
Q  72 gcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagta 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     ||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgggattg-----attcaccttgaacaaa-cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttcgaactttgggta 12310143  T
Q  172 gaattatgtttgaatattgattct 195  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  12310142 taattatgtttgaagactgattct 12310119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 6332268 - 6332500
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||  ||| |  ||||||| |||  ||  ||||||||||||||  ||    
T  6332268 ggtttatagagtttactcttggcaacaaacactaggattgagattg-----attcagtttgga--aaacactattaagattgagtctcttggtcacaaga 6332360  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| | ||||| | | ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||     
T  6332361 agagattgag-actttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga- 6332458  T
Q  250 aga-tgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||| |||| ||| ||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  6332459 agactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaac 6332500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13290657 - 13290536
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| ||| || ||| || ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | | ||||||||    
T  13290657 aaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatatt-agaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctct 13290559  T
Q  216 ttgtaaagaaactcatcattata 238  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  13290558 ttgtaaagttactcatcattata 13290536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 11081567 - 11081789
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  |||    ||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11081567 attctcttggcaacaaacactagggttgaga-----ttgattcactttg--ggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagatt-agga 11081658  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaa--ctctctaatatctctt-tgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatc 259  Q
     |||| ||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||  || | | ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||| |||  | || | ||    
T  11081659 ttttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctc 11081758  T
Q  260 ttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11081759 tcccccagactaggtcaatattggaccgaac 11081789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 197
Target Start/End: Original strand, 26210664 - 26210728
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26210664 agtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttgaagactgattcttg 26210728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34546976 - 34546891
Alignment:
Q  207 aatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  34546976 aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 34546891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 96
Target Start/End: Original strand, 11084436 - 11084469
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11084436 attctcttggcaacaaacaatagggttgagattg 11084469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 21990257 - 21990317
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21990257 aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagg-ctttgagtagaatta 21990317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1099754 - 1099726
Alignment:
Q  78 aacactagggttgagattgttttgattca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099754 aacactagggttgagattgttttgattca 1099726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 8260605 - 8260665
Alignment:
Q  137 tcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  8260605 tcttggtcacgggaagagattttggattttgtatagaattgggtttgaagattgattcttg 8260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24817519 - 24817476
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24817519 agtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 24817476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Original strand, 45366677 - 45366713
Alignment:
Q  208 atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45366677 atatctctttgtaaagaaactcatcatcacattggaa 45366713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 26557673 - 26557908
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  26557673 ggtttatagagatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttaaacaaaacactattaggatatagtctcatggtcacggga 26557772  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggaga 250  Q
    | ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| | | ||||||    |  | | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26557773 aaagattcaagactttgggtggaattaggtttgaaaactaattctt----ccttttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggaga 26557868  T
Q  251 gatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | || | ||| ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  26557869 gctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaac 26557908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 16638761 - 16638961
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  16638761 ggtttatagagaatttctctttgcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttaaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacagg 16638860  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  16638861 aagagattga-gac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccctc-aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 16638957  T
Q  248 agag 251  Q
    ||||    
T  16638958 agag 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3982412 - 3982186
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  3982412 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaa-cactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggac 3982314  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttc 262  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| | || | ||| |    
T  3982313 tttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 3982214  T
Q  263 cccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | || | || |||| |||||||||||||    
T  3982213 ctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5337031 - 5336791
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactag--ggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgg 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5337031 ggtttatagagaattctattggcaacaaacactatatggttgagattgttttgactcaccttgaataaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgg 5336932  T
Q  149 gaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgt-aaagaaactcatcattatattggaatgg 247  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5336931 gaagagatt-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacgg 5336834  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  5336833 agagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaac 5336791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 4570029 - 4570243
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4570029 ggtttatagagaatttctcttggcaacat-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacggg 4570127  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    ||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  4570128 aagaggtt-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 4570222  T
Q  248 agagatgttatcttccccaga 268  Q
    |||| || | ||| |||||||    
T  4570223 agagctgctctctcccccaga 4570243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16186055 - 16185845
Alignment:
Q  79 acactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattat 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||     
T  16186055 acactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-ggaactttgggtagaattag 16185957  T
Q  179 gtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaat 278  Q
    ||||||| | | ||||||||||| || | |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| | || | ||| ||||||| || |||| |    
T  16185956 gtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagt 16185857  T
Q  279 attggaccgaac 290  Q
     |||||||||||    
T  16185856 tttggaccgaac 16185845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Original strand, 36769427 - 36769650
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||  | | |||    
T  36769427 ttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctga-gac 36769525  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatctt 261  Q
     ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | |||     
T  36769526 -ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctc 36769621  T
Q  262 ccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  36769622 ccccagactaggtcatcattagaccgaac 36769650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 16489284 - 16489459
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  16489284 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactaaggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 16489382  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16489383 aagagact-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 16489459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 8529202 - 8529438
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  8529202 ggtttatagagaatttctcttggcaacac-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 8529300  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  8529301 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 8529395  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  8529396 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 8529438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7050504 - 7050269
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  7050504 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactaaggttgtgattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 7050406  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  7050405 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 7050311  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  7050310 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaa 7050269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 36771344 - 36771506
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||| ||||||||  |   |||    
T  36771344 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggct-gtgac 36771442  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  36771443 -ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 36771506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 47566427 - 47566603
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  47566427 ggtttatagagaatttatcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcacattgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacagg 47566526  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||  | ||| |||| ||||||||| ||||||| |  |||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  47566527 aagaga--ctggaatttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttttaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 47566603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 11853499 - 11853719
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  11853499 tctcttggcaacaa-ctctagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 11853595  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  11853596 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 11853692  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  11853693 ccagactaggtcatcattagaccgaac 11853719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 290
Target Start/End: Original strand, 15831093 - 15831312
Alignment:
Q  67 tcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggacttt 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  15831093 tcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac-tt 15831189  T
Q  167 gagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttccc 264  Q
    | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||    
T  15831190 gcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 15831286  T
Q  265 cagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || ||||  ||| ||||||||    
T  15831287 cagactaggtcatcattagaccgaac 15831312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 31300359 - 31300554
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  31300359 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 31300457  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  31300458 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 31300552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 15312251 - 15312487
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  15312251 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacggg 15312349  T
Q  150 aagagattcag-gactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatg 246  Q
    |  |||| | | ||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  15312350 a--agatgctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacg 15312443  T
Q  247 gagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  15312444 gagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 15312487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25614168 - 25614061
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  25614168 ggtttatagagaatttctcttggtaacaaacactagggttgagattgttttgattcacattgaacaaaacactgttagaattgagtctcttggtcacgag 25614069  T
Q  150 aagagatt 157  Q
    ||||||||    
T  25614068 aagagatt 25614061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4556306 - 4556137
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4556306 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgtttcgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 4556208  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaa 225  Q
    |||||  |  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  4556207 aagaggct-gggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaa 4556137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 18586901 - 18587137
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  18586901 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 18586999  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  18587000 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 18587094  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  18587095 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 18587137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 55822215 - 55822388
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  | | |||     
T  55822215 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctga-gac- 55822311  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  55822312 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 55822388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 197
Target Start/End: Original strand, 25699684 - 25699828
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25699684 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 25699782  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  25699783 aagagact-gggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttg 25699828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4874714 - 4874540
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  4874714 attctctagacaacaaacactagagttgggtttgttttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagattcgtaa 4874615  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattata 238  Q
    ||||| || ||||||| |||||| | | ||||||| ||| ||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4874614 ctttgggt-gaattatatttgaagactaattcttgtaacccttctatatcactttgtaaagaaactcatcgttata 4874540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Original strand, 4558245 - 4558442
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||| | |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4558245 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaacactagggctgggttgtttttgatttaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 4558344  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  4558345 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 4558439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13072228 - 13072031
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  ||  |||||||||||||| ||    
T  13072228 ggtttatagagaatttctcttggcaacat-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactgg 13072130  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||   | |   |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  13072129 aagag--gctgtgatttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtagaatgg 13072035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 15316893 - 15317068
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  15316893 ggtttatagagaatttctcttggcagcaa-cactagggttcggattgttttgatttaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 15316991  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15316992 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 15317068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Original strand, 54906738 - 54906845
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  54906738 aaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctct 54906837  T
Q  216 ttgtaaag 223  Q
    ||||||||    
T  54906838 ttgtaaag 54906845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 4884809 - 4885045
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4884809 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactgggggtgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 4884907  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  | | ||| ||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  4884908 aagaggctga-gac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaaaaaactcatatcattatagtggaacgg 4885002  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  4885003 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 4885045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16689173 - 16688990
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||  |  ||||    
T  16689173 ttctctttgcaacaa-ctctaggtttggaattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctg-ggac 16689076  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagag 251  Q
    || | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  16689075 ttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagag 16688990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47151077 - 47150904
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctct 215  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | ||||||||    
T  47151077 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaa-tttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctct 47150979  T
Q  216 ttg-taaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    ||  |||||   |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  47150978 tttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaa 47150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Original strand, 10112975 - 10113193
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg-aagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||  |  ||||||| |||  ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10112975 ctcttggcaacaaacactagggttgagattg-----attcacctt--aggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagatt-aggact 10113066  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaac-tctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| |||||||||  |||||| | | ||||||| ||| | | | |||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||    
T  10113067 ttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccc 10113166  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | ||| || || | |||||||||||||    
T  10113167 caagactaggttagtattggaccgaac 10113193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32274148 - 32274089
Alignment:
Q  53 gtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32274148 gtttatagagatttctattggcaacaaacactagagttgagattgttttgattcaccttg 32274089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 244
Target Start/End: Original strand, 9022407 - 9022583
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||     ||||| |||| | ||| || | |||| ||| | | ||||||||||||||||||||| || |    
T  9022407 attctcttggcaacaaacactatggttgggattg-----attcaccttggagaaa-cagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgag-a 9022499  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctcta---atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | ||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  9022500 ctttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctctattgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaa 9022583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 9863874 - 9864035
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatc 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | | ||||||||||||||||  |||||||    
T  9863874 agtcttttggtcacgggaagagattgag-actttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatc 9863972  T
Q  233 at---tatattggaatggagagatgttatcttcccc--agagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||   |||| ||||| |||||| || | ||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  9863973 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaac 9864035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Original strand, 16631228 - 16631340
Alignment:
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttc 262  Q
    ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |  | ||| |    
T  16631228 ttgagtagaatgaggtttgaaggctgattcttgtaaccctc-aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctactctctcc 16631326  T
Q  263 cccagagtatgtca 276  Q
    ||||||||| ||||    
T  16631327 cccagagtaggtca 16631340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25614052 - 25613967
Alignment:
Q  207 aatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  25614052 aatatctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaaaggagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaac 25613967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38208913 - 38208789
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |  ||||||| |||  ||  ||||| ||||||||  ||||||||||  ||    
T  38208913 attctcttggcaacaaacactagggttgaga-----ttgattcatcttgga-gaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgaga 38208820  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgatt 193  Q
    ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  38208819 ctttaggtagatttaagtttgaagattgatt 38208789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3578763 - 3578720
Alignment:
Q  208 atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagag 251  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3578763 atatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagag 3578720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5516410 - 5516359
Alignment:
Q  134 gtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  5516410 gtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaattaagtttgaa 5516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 289
Target Start/End: Original strand, 10114518 - 10114639
Alignment:
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccc 264  Q
    |||||||||||||||||| || | | |||| || |||   || |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||| || | ||| |||    
T  10114518 ttgagtagaattatgtttaaagactaattcatgtaac---cttatatctctttgtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccc 10114614  T
Q  265 cagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    |||| || |||| ||||||||||||    
T  10114615 cagactaggtcagtattggaccgaa 10114639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 19322844 - 19322904
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  19322844 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 19322904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31983694 - 31983578
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatc-tctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||| || | ||||| | ||||||||   ||||||    
T  31983694 agtctcttggtcatgggaagagattga-gactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaaccctttgatatcttttttgtaaaattactcat 31983596  T
Q  232 cattatattggaatggag 249  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  31983595 cattatagtggaacggag 31983578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 3760116 - 3760160
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  3760116 agtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaatta 3760160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54928804 - 54928697
Alignment:
Q  144 cacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcatcattatattgg 242  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||    
T  54928804 cacgggaagagatttaggatttag-gtaaaattaagtttgaagactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtgg 54928706  T
Q  243 aatggagag 251  Q
    || ||||||    
T  54928705 aacggagag 54928697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 289
Target Start/End: Original strand, 15949481 - 15949708
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15949481 attctctttacaacaaacactaggtttgtgattgtttggattcaccttgaacaaaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcggga 15949580  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgt-aaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatctt 261  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||| | | ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| |  |||||     
T  15949581 c-ttgggtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaattctctgatatctctttgtaaaagaaacccatcgttatattggaacagagagctactatctc 15949679  T
Q  262 cccc-agagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  15949680 cccctagagtaggttaatattggcccgaa 15949708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 30423146 - 30423386
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||    
T  30423146 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaacactagggctgagattgttttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcggg 30423245  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||| ||||||| | | ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  30423246 aagagatt-ggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaattctc-aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 30423343  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| | |||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  30423344 agagctgctctctcctccagagtaggtcatcattagaccgaac 30423386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 33032589 - 33032786
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  33032589 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 33032687  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  33032688 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaatgg 33032782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2267271 - 2267093
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |    
T  2267271 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaacactacggttgagattgttttgattcacgttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatg 2267172  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2267171 aagagatt-aggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctc-aacatctctttgtaaagaaactcat 2267093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29555018 - 29554857
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  29555018 ttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac 29554921  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29554920 -ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 29554857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 28327858 - 28328078
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  28327858 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 28327954  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | ||| ||    
T  28327955 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctccc 28328051  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  28328052 ccagactaggtcatcattagaccgaac 28328078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 28895437 - 28895612
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  28895437 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 28895535  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28895536 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 28895612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9021354 - 9021179
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  9021354 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttcggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 9021256  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9021255 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 9021179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17799644 - 17799474
Alignment:
Q  78 aacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||| |||||    
T  17799644 aacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctga-gac-ttgagtataatta 17799547  T
Q  178 tgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagag 251  Q
     ||||||| | ||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  17799546 ggtttgaagactgattcttataactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagag 17799474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23179808 - 23179572
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  23179808 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccgg 23179710  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |   ||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  23179709 aagaggct-gtgactttg-gtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 23179615  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | || || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  23179614 atagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 23179572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16752754 - 16752581
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  16752754 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 16752658  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16752657 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 16752581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 590729 - 590904
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  590729 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cacttgggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 590827  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  590828 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcat 590904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16757499 - 16757279
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  16757499 tctcttgacaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 16757403  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  16757402 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 16757306  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  16757305 ccagactaggtcatcattagaccgaac 16757279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 17847612 - 17847746
Alignment:
Q  51 aggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  | ||||||| |||||||    
T  17847612 aggtttatagagatttctctaggcaacaaacactatggttgggattgttttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacggg 17847711  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  17847712 aagagattga-gactttgggtagaattaggtttgaa 17847746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 25684593 - 25684813
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||  ||||       
T  25684593 tctcttagcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagaga--cagggac 25684689  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  25684690 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 25684786  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25684787 ccagactaggtcatcattagaccgaac 25684813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Original strand, 28332581 - 28332762
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |  ||||     
T  28332581 tctcttggtaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggct-gggac- 28332677  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagag 251  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  28332678 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagag 28332762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4812719 - 4812546
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||  |  ||||     
T  4812719 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggct-gggac- 4812623  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  4812622 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaaatcattcattatagtgga 4812546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26268477 - 26268304
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  | || | |||||||||||||     
T  26268477 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagagttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactatta--agattgactcttggtcacgga 26268381  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26268380 aagaggat-gggac-ttgggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 26268304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 250
Target Start/End: Original strand, 21033819 - 21034000
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| | |   ||||    
T  21033819 ttctcttggcaacaa-cactaggcttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagggct--gggac 21033915  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggaga 250  Q
     ||| |||||| || ||||||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  21033916 -ttgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggaga 21034000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 28228448 - 28228582
Alignment:
Q  51 aggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||   | |||| | ||||| |||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||| |    
T  28228448 aggtttatagagaattcttttggcaacaaacactatggttagaactgttgttattcaccttgaacaaaacactattaggatagagactcttggtcacgag 28228547  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  28228548 aagagattctggactttg-gtagaattaagtttgaa 28228582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 31035287 - 31035445
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||    
T  31035287 agtctcttggtcacaggaagagattgag-actttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttgtaaagttactcatc 31035385  T
Q  233 attatattggaatggagagatgttatcttccccagagtat--gtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||| ||||| |||| | || | ||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  31035386 attatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaac 31035445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 244
Target Start/End: Original strand, 6376118 - 6376268
Alignment:
Q  93 attgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgat 192  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||| | | ||    
T  6376118 attgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattga-gactttatgtagaattaggtttgaagactaat 6376216  T
Q  193 tcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    |||||  ||  | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6376217 tcttgttaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaa 6376268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31573954 - 31573809
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||     ||||| ||||    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31573954 ttctcttggcaacaaacactatggttgggattg-----attcaccttggg--aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gac 31573863  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt 217  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| || ||| | ||||||||||    
T  31573862 tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttt 31573809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 3276312 - 3276454
Alignment:
Q  84 agggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttg 183  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||| ||||||||| |||||    
T  3276312 agggttgggattgttttgatttaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttg 3276409  T
Q  184 aatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    || | ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  3276410 aagactgattcttgtaactc---aatgtctctttgtaaagaaactcat 3276454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31578461 - 31578327
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc- 214  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | | |||||||     
T  31578461 aaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctct 31578363  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggaga 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31578362 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaga 31578327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13985263 - 13985193
Alignment:
Q  115 aaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13985263 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaa 13985193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Original strand, 3895990 - 3896094
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactc-tctaatatctc-tttgtaaagaaactca 230  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||  |||||    
T  3895990 agtctcttcgtcacgggaagaaattg-ggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactca 3896088  T
Q  231 tcatta 236  Q
    ||||||    
T  3896089 tcatta 3896094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33839161 - 33839037
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttt------tgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagatt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |      ||||||| |||| | ||| |||| |||| ||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  33839161 ttctcttggcaacaaacactagggttgaaattgaatcaccattgattcaccttgaagaaa-cactattaggattgagtctcttggtca--ggaagagatt 33839065  T
Q  158 caggactttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  33839064 caagactttgggtagaattaggtttgaa 33839037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Original strand, 15944808 - 15944868
Alignment:
Q  52 ggtttatagagat-tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  15944808 ggtttatagagaaatctcttggcaacaaacactagggttctgattgctttgattcaccttg 15944868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 28890816 - 28890936
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttcccca 266  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| || | ||| |||||    
T  28890816 gtagaattaggtttgaagactgattcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 28890912  T
Q  267 gagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    || || ||||  ||| ||||||||    
T  28890913 gactaggtcatcattagaccgaac 28890936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30480685 - 30480625
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  30480685 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagg-ctttgggtagaatta 30480625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24542921 - 24542746
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| |||||| |||| ||| ||    
T  24542921 ggtttatagagatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaataaaacacttttaggatagagtctcatggttacgaga 24542822  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaac 227  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  24542821 agagattcatgactttggatagaattaggttt-aaaattgattcttgtaaccctttgatatctctttgtaaagaaac 24542746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19702109 - 19701934
Alignment:
Q  53 gtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  19702109 gtttatagagaatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggga 19702010  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||  | | ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  19702009 agaggctga-gac-ttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactc---aatatccctttgtaaataaactcat 19701934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5166032 - 5165824
Alignment:
Q  81 actagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgtt-agtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatg 179  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |    
T  5166032 actagggttgggat-gttttgattcactttgaacaaaacactgtttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg-ggacttgg-gtagaattagg 5165936  T
Q  180 tttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat--cattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaa 277  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||     
T  5165935 tttgaagaatgattcttgtaaccctg-aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcat 5165837  T
Q  278 tattggaccgaac 290  Q
     ||| ||||||||    
T  5165836 cattagaccgaac 5165824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17695098 - 17694902
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  17695098 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaa-actagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 17695000  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaact-catcattatattggaatgga 248  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||    
T  17694999 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactatatcattatagtggaacgga 17694905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12166394 - 12166218
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||| ||  |||||||||||||||||    
T  12166394 ggtttatagagaatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcacgttgaacaaagcaccattaggattgagtctcttggtcacggg 12166295  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  12166294 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattc---aatatctctttgtaaagaaactcat 12166218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 13878677 - 13878897
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  13878677 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 13878773  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  13878774 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 13878870  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  13878871 ccagactaggtcatcattagaccgaac 13878897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 16785869 - 16786089
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  16785869 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 16785965  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  16785966 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 16786062  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  16786063 ccagactaggtcatcattagaccgaac 16786089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22352099 - 22351903
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  22352099 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgaatcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 22352001  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  | ||   |||| ||||||||| ||||||| | |||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  22352000 aagaggctgag--atttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 22351906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22343033 - 22342873
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||||||||   | ||  |    
T  22343033 tctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaacttgaacaaagcactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagag--gctgggat 22342937  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| |||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22342936 ttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 22342873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26887456 - 26887283
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  26887456 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 26887360  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26887359 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 26887283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31248946 - 31248773
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  31248946 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 31248850  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31248849 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 31248773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 13883425 - 13883645
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  13883425 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 13883521  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  13883522 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 13883618  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  13883619 ccagactaggtcatcattagaccgaac 13883645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 33215762 - 33215959
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||     
T  33215762 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttgtgattgttttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggc 33215860  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  33215861 aagaggct-gggacttgga-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 33215955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25466146 - 25465932
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||     
T  25466146 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactaaggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcattattaggattgagtctcttaatcacgga 25466048  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  25466047 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 25465953  T
Q  248 agagatgttatcttccccaga 268  Q
    |||| || | ||| |||||||    
T  25465952 agagctgctctctcccccaga 25465932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35201558 - 35201338
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  35201558 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 35201462  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  35201461 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 35201365  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    | ||| || |||| |||| ||||||||    
T  35201364 caagactaggtcattattagaccgaac 35201338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3577761 - 3577658
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  3577761 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 3577663  T
Q  150 aagag 154  Q
    |||||    
T  3577662 aagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Original strand, 17035990 - 17036093
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  17035990 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 17036088  T
Q  150 aagag 154  Q
    |||||    
T  17036089 aagag 17036093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13467710 - 13467607
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  13467710 ggtttatagagaatttatctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 13467612  T
Q  150 aagag 154  Q
    |||||    
T  13467611 aagag 13467607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Original strand, 11262681 - 11262763
Alignment:
Q  208 atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || | ||| ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  11262681 atatctctttgtaaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaac 11262763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 251
Target Start/End: Original strand, 20526894 - 20527071
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactt 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||| |||| |  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  20526894 ctcttgacaacaaacactagggttgagattg-----attcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag-actt 20526985  T
Q  166 tgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagag 251  Q
    |  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||  | | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20526986 ttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagag 20527071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17904514 - 17904374
Alignment:
Q  135 tctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcat 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||| || | ||||||||| ||| || |   |||| |||||||||  |||||  ||    
T  17904514 tctcttggtcatgggaagagatttaggattttggctagaattaggtttaaacactgattcttgtaaccctttggaatct-tttgtaaagttactcaaaat 17904416  T
Q  235 tatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtca 276  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  17904415 tatagtggaatggagagttgttatcttccccatagtaggtca 17904374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 26643111 - 26643286
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  26643111 ggtttatagagaatttctcttgcccacaa-cactagggttgggattgttttgattcacctcgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacagg 26643209  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |  |||| | ||   ||| ||||||||| ||| ||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26643210 a--agatgctgggacttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 26643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 26749077 - 26749252
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  26749077 ggtttatagagaatttctcttgcccacaa-cactagggttgggattgttttgattcacctcgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacagg 26749175  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |  |||| | ||   ||| ||||||||| ||| ||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26749176 a--agatgctgggacttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 26749252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 286
Target Start/End: Original strand, 7293871 - 7294095
Alignment:
Q  52 ggtttatagagatt-ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||   ||| |||| ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  |    
T  7293871 ggttcatagagatttctcttggtaagaaacactagggttggtattgttttcgctcaccttgaacaaa-cactattaagatagagtctcttggtcacgtaa 7293969  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggaga 250  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||  |||||| | | ||||||| |||          ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  7293970 agagattcaagacttagggtggaattaattttgaagactaattcttgtaac----------ctctttgtatagaaactcatcattatagtggaacagaga 7294059  T
Q  251 gatgttatcttccccagagtatgtcaatattggacc 286  Q
    | || | ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7294060 gttgctctctcccccagagtaggtcagtattggacc 7294095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Original strand, 30445673 - 30445789
Alignment:
Q  135 tctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcatca 233  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  30445673 tctcttggtcatgtgaagagatccaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatca 30445772  T
Q  234 ttatattggaatggaga 250  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  30445773 ttatagtggaacggaga 30445789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 154
Target Start/End: Original strand, 25941593 - 25941682
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagag 154  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || | |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  25941593 ttctcttggtaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcattattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25941682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3577620 - 3577539
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagag 251  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  3577620 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagag 3577539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22870193 - 22870150
Alignment:
Q  208 atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22870193 atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagag 22870150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Original strand, 26945275 - 26945397
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc- 214  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| | | | ||| ||| |||||  | |||||||     
T  26945275 aaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatctct 26945373  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattata 238  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  26945374 tttgtaaagttactcatcattata 26945397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7542549 - 7542459
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| ||||||| | | ||| ||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  7542549 agtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctctttgtaaag 7542459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12186255 - 12186122
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc- 214  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| | | | ||||||| |||||  | |||||||     
T  12186255 aaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattga-gactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctct 12186157  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  12186156 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 12186122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 25941720 - 25941840
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttcccca 266  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||    
T  25941720 gtagaattaggtttgaagactgattcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 25941816  T
Q  267 gagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    || || ||||  ||| ||||||||    
T  25941817 gactaggtcatcattagaccgaac 25941840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Original strand, 3833460 - 3833536
Alignment:
Q  170 tagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaag-aaactcatcattatattggaa 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3833460 tagaattatgtttgaaaattgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaa 3833536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22858182 - 22857963
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||| ||||    ||||||| |||  ||  ||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  22858182 ttctcttggtaacaaacactagggttgagattg-----attcaccttggg--aaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgag-ac 22858091  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctcta-atatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttc 262  Q
    |||  ||||| ||| ||||||| | | ||||||| ||| || |  |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||  | || | ||| |    
T  22858090 tttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 22857991  T
Q  263 cccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||    
T  22857990 cccagactaggtcagtattggaccgaac 22857963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 30443382 - 30443484
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| |||| | ||| |||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30443382 attctgttggcaacaaacactagggttgatattg-----attcaccttgaagaaa-cactattaggata--gtcttctggtcacgggaagagattcagga 30443473  T
Q  163 ctttgagtaga 173  Q
    ||||| |||||    
T  30443474 ctttgggtaga 30443484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3028036 - 3027976
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3028036 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattga-gactttgagtagaatta 3027976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7542623 - 7542590
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7542623 attctcttggcaacaaacactagggttgggattg 7542590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12195679 - 12195636
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12195679 agtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 12195636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12937324 - 12937244
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    ||||||||| |||||||   | ||||||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  12937324 gtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 12937244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Original strand, 17038320 - 17038383
Alignment:
Q  207 aatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttccccaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||    
T  17038320 aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccaga 17038383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31782691 - 31782485
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||      
T  31782691 ttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt--ggga 31782594  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatctt 261  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| || | |||     
T  31782593 attgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctc-aatatttctttgtaaagaaactcatattattatagtagaatggagagttgctctctc 31782495  T
Q  262 ccccagagta 271  Q
    ||||||||||    
T  31782494 ccccagagta 31782485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26406720 - 26406477
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggga 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||    
T  26406720 ggtttatagagaattctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacagga 26406621  T
Q  151 agagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctc-----taatatctctttgt-aaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||  |||      ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  26406620 agagattga-gac-ttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcaatatcaatatctctttgtaaaagaaattcatcattatagtggaa 26406523  T
Q  245 tggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
     | |||| || | ||| | |||||||| || || ||| ||||||||    
T  26406522 cgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaac 26406477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 276
Target Start/End: Original strand, 10627298 - 10627523
Alignment:
Q  53 gtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttt-gattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10627298 gtttatagagaatttctcttagcaacaaacactagggttaggattgtttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggg 10627397  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||||| | ||| | | ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  10627398 aagagattga-gac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccct-gaatatctctttgtaaataaactcatatcattatagtggaacgg 10627494  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtca 276  Q
    |||| || | ||| ||| |||||| ||||    
T  10627495 agagctgctctctcccctagagtaggtca 10627523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35385699 - 35385463
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  35385699 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 35385601  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  35385600 aagaggct-gggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 35385506  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  35385505 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 35385463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 40222698 - 40222895
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | | |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  40222698 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagtattattaggattgagtctcttgatcacggg 40222796  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||   | |||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  40222797 aagag--gctggaacttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgg 40222891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17841497 - 17841260
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| |||||||||    
T  17841497 ggtttatagagaatttctcttggcaaacaatactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacggg 17841398  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||   | |||  ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  17841397 aagag--gctggaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 17841303  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  17841302 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 17841260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 22672769 - 22673005
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||| |    
T  22672769 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgag 22672867  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  | | ||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  22672868 aagaggctga-gac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 22672962  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  22672963 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 22673005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Original strand, 1170761 - 1170981
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  1170761 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 1170857  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattggaatggagagatgttatcttcc 263  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || | ||| ||    
T  1170858 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccc 1170954  T
Q  264 ccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  1170955 ccagactaggtcatcattagaccgaac 1170981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Original strand, 25838042 - 25838140
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga-ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  25838042 ggtttatagagaattctcttggtaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggagagagtctcttggtcacggg 25838140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 1240377 - 1240560
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||||||   | ||      
T  1240377 ttctctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagag--gctggga 1240473  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagag 251  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  1240474 tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagag 1240560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11962666 - 11962505
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||||||||  | | |||    
T  11962666 ttctcttggcaacaa-cactagggttgagattgttttgattcaccatgaacaaagcactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctga-gac 11962569  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
     ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11962568 -ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 11962505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 250
Target Start/End: Original strand, 28786366 - 28786535
Alignment:
Q  78 aacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||| | |||||||    
T  28786366 aacactagggttggaattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac-ttgggcagaatta 28786463  T
Q  178 tgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggaga 250  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  28786464 ggtttgaagattgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaacggaga 28786535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2298233 - 2298073
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  | | |||     
T  2298233 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctga-gac- 2298137  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||    
T  2298136 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttataaagaaactcat 2298073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 25452430 - 25452605
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  25452430 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagcgttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 25452528  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25452529 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 25452605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16093524 - 16093363
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| | |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || |   ||||    
T  16093524 ttctcttggcaacaaacactagggttgggatctttttgattcaccttg-aaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaag-tctgggac 16093427  T
Q  164 tttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    || | |||||||||  |||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16093426 ttag-gtagaattagatttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcat 16093363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 25445427 - 25445667
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaaca----ctgttagtatatagtctcttggtca 145  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    || |||| ||  |||||||||||||    
T  25445427 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactatctattaggattgagtctcttggtca 25445525  T
Q  146 cgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattgga 243  Q
    |||||||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25445526 cgggaagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtgga 25445620  T
Q  244 atggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
      |||||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  25445621 tcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 25445667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Original strand, 4897792 - 4897947
Alignment:
Q  83 tagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgttt 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| | ||    
T  4897792 tagggttgagattgttttcattcaccttgaacaaatcactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagatt-gtgactttgggtagaattaggctt 4897890  T
Q  183 gaatattgattcttgcaactctctaatatctct-ttgtaaagaaactcatcattata 238  Q
    ||| | ||||||||| |||  | | |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4897891 gaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagttactcatcattata 4897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15445493 - 15445322
Alignment:
Q  79 acactagggttgagattgttttgat---tcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggt---cacgggaagagattcaggactttgagtag 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    |||  ||||||||| || |||||||||||    
T  15445493 acactagggttgagattgttttgatatttcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgag-actttgagtag 15445395  T
Q  173 aattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcatcattatattggaa 244  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15445394 aattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 15445322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2144747 - 2144613
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaa-ctctctaatatctc 214  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | ||||||| || || | | |||||||    
T  2144747 aaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc 2144648  T
Q  215 tttgtaaagaaactcatcattatattggaatggag 249  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 2144613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17413393 - 17413176
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||    ||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  17413393 ctcttggcaacaaacactagggttgggattg-----attcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag-actt 17413302  T
Q  166 tgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccc 264  Q
    |  ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||| | ||| |||    
T  17413301 taggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccc 17413202  T
Q  265 cagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    ||||||  |||| | |||||||||||    
T  17413201 cagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 35430292 - 35430404
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactc-tctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| || || | | ||||||||||||||||  ||||||    
T  35430292 agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttgatatctctttgtaaagttactcat 35430391  T
Q  232 cattatattggaa 244  Q
    ||||||| |||||    
T  35430392 cattatagtggaa 35430404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 289
Target Start/End: Original strand, 15143565 - 15143735
Alignment:
Q  119 cactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-ttt 217  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| || | ||||||| |||    
T  15143565 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-tggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 15143663  T
Q  218 gtaaagaaactcatcattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaa 289  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| || | ||| ||| ||| || |||| |||| |||||||    
T  15143664 gtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaa 15143735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 29748461 - 29748619
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactc-tctaatatctctttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||  |||||| | | ||||||| ||||| | | |||| ||||||||||| || ||||    
T  29748461 agtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaactaaatttgaagactaattcttgtaactcttttgatatatctttgtaaaggaattcat 29748560  T
Q  232 cattatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
     |||||  ||||| | |||| || | ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  29748561 tattatggtggaacgaagagctgctctctcccccaaagtaggtcagtattggaccgaac 29748619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25562525 - 25562432
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagatt 157  Q
    |||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  25562525 ttcttttgggaacaaatattaggattgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactcttaggatttagtttctgggtcacgagaagagatt 25562432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34033799 - 34033683
Alignment:
Q  63 attctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcagga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     | |||| | ||| |||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34033799 attctcttggcaacaaacactagcgttgggattgattt-----accttggagaaa-cactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcagga 34033706  T
Q  163 ctttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
     |||| ||||||||| |||||||    
T  34033705 ttttgggtagaattaagtttgaa 34033683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 42238311 - 42238431
Alignment:
Q  169 gtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatggagagatgttatcttcccca 266  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||    
T  42238311 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 42238407  T
Q  267 gagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    || || ||||  ||| ||||||||    
T  42238408 gactaggtcatcattagaccgaac 42238431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 18596741 - 18596802
Alignment:
Q  115 aaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18596741 aaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 18596802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224883
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||| | ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggttatgattg-----attcaccttgaagaaa-cactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagact 15224904  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaa 185  Q
    ||| ||| ||||| |||||||    
T  15224903 ttgggtaaaattaggtttgaa 15224883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Original strand, 32520563 - 32520615
Alignment:
Q  145 acgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttg 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  32520563 acgggaagagattcatgactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttg 32520615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 4754207 - 4754377
Alignment:
Q  66 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||   |||||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  4754207 ctcttggcaacaaacactagggttgaga-----ttgattcaccttg--aaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagatt-gtgactt 4754298  T
Q  166 tgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaa-ctctctaatatctctttgtaaagaaactcatcattatattgga 243  Q
    ||  |||||||| |||||||   | ||||||| || || | | ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  4754299 tggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccttttttatatctctttgtaaagttactcatcaatatagtgga 4754377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 94
Target Start/End: Original strand, 35314749 - 35314779
Alignment:
Q  64 ttctcttggcaacaaacactagggttgagat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35314749 ttctcttggcaacaaacactagggttgagat 35314779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Original strand, 36208689 - 36208794
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctc-tttgtaaagaaactcat 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | | ||||||| ||| |  | ||||||| |||||||||  ||||||    
T  36208689 agtctcttggtaacgggaagagattga-gactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 36208787  T
Q  232 cattata 238  Q
    |||||||    
T  36208788 cattata 36208794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Original strand, 42238238 - 42238298
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttg 111  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42238238 ggtttatagagaatttctctttgcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttg 42238298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34530848 - 34530788
Alignment:
Q  116 aaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34530848 aaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagatt-aggactttgagtagaatta 34530788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 3515293 - 3515261
Alignment:
Q  20 tgtcatcaattttgaagtatttgtgcttcacag 52  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515293 tgtcatcaattttgaagtatttatgcttcacag 3515261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 42770880 - 42770923
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  42770880 agtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 42770923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Original strand, 16260 - 16496
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  16260 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 16358  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |    
T  16359 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactc---aatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacag 16453  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  16454 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 16496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17233 - 16997
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  17233 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgtttcatcttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacggg 17135  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactc--atcattatattggaatgg 247  Q
    |||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||    
T  17134 aaga-agctaggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaact---tattatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcgg 17040  T
Q  248 agagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
    |||| || | ||| ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  17039 agagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 16997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 188489 - 188320
Alignment:
Q  52 ggtttatagaga--ttctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacggg 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  188489 ggtttatagagaatttctcttggcaacaa-cactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 188391  T
Q  150 aagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaa 225  Q
    |||||  |  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  188390 aagaggct-gggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactc---aatatctctttgtaaagaa 188320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 224769 - 224942
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggact 164  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  224769 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gggac- 224865  T
Q  165 ttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatctctttgtaaagaaactca-tcattatattgga 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  224866 ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactc---attatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgga 224942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 31091 - 31170
Alignment:
Q  65 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcatcttgcacaaaacactgttagtatatagtctcttggtca 145  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  31091 tctcttggcaacaa-ctctagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtca 31170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 57594 - 57438
Alignment:
Q  135 tctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaattatgtttgaatattgattcttgcaactctctaatatct-ctttgtaaagaaactcatca 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||  ||||||| ||| || | ||||||  |||||||||  |||||| |    
T  57594 tctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatta 57495  T
Q  234 ttatattggaatggagagatgttatcttccccagagtatgtcaatattggaccgaac 290  Q
     |||| |||||  ||||| || | ||| ||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  57494 atataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaac 57438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15987 - 15944
Alignment:
Q  133 agtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  15987 agtctcttggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 15944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University