View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3594_high_22 (Length: 288)

Name: NF3594_high_22
Description: NF3594
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3594_high_22
NF3594_high_22
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (48-270)||(43057406-43057628)
chr7 (52-270)||(151995-152213)
chr7 (48-270)||(35089831-35090053)
chr7 (48-270)||(30110940-30111162)
chr7 (48-270)||(27418367-27418589)
chr7 (68-270)||(40097231-40097434)
chr7 (144-270)||(47914878-47915004)
chr7 (69-270)||(39301002-39301192)
chr7 (48-147)||(47914054-47914153)
chr7 (143-251)||(46037170-46037278)
chr7 (50-78)||(33474820-33474848)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (49-270)||(24150558-24150779)
chr3 (50-270)||(35731069-35731289)
chr3 (51-270)||(38629528-38629747)
chr3 (49-270)||(50900173-50900394)
chr3 (48-270)||(30588976-30589199)
chr3 (48-270)||(36054732-36054954)
chr3 (48-236)||(26005580-26005768)
chr3 (49-270)||(26293293-26293514)
chr3 (68-270)||(46251948-46252150)
chr3 (68-270)||(13662685-13662887)
chr3 (110-270)||(26005770-26005930)
chr3 (50-269)||(19551885-19552094)
chr3 (69-270)||(27593289-27593490)
chr3 (97-270)||(39338073-39338244)
chr3 (81-270)||(26555951-26556123)
chr3 (68-270)||(36786108-36786309)
chr3 (111-270)||(52023987-52024146)
chr3 (107-270)||(38682563-38682728)
chr3 (222-270)||(53183972-53184020)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (48-270)||(41386595-41386817)
chr8 (48-269)||(7148178-7148399)
chr8 (48-269)||(29260001-29260222)
chr8 (48-270)||(2112928-2113150)
chr8 (52-270)||(40265010-40265228)
chr8 (51-270)||(4655184-4655403)
chr8 (49-270)||(41965526-41965745)
chr8 (49-270)||(43605090-43605311)
chr8 (50-270)||(42275109-42275330)
chr8 (95-270)||(10802543-10802718)
chr8 (68-266)||(28619985-28620183)
chr8 (102-270)||(9457680-9457848)
chr8 (69-270)||(37567118-37567319)
chr8 (69-264)||(30382420-30382615)
chr8 (96-270)||(8502769-8502943)
chr8 (68-270)||(4302551-4302755)
chr8 (118-270)||(9209173-9209325)
chr8 (96-270)||(35142179-35142353)
chr8 (49-129)||(41965324-41965404)
chr8 (212-270)||(1605902-1605960)
chr8 (95-148)||(40013271-40013324)
chr8 (214-270)||(40013363-40013419)
chr8 (48-79)||(9457841-9457872)
chr8 (198-266)||(23185838-23185906)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (48-270)||(29941082-29941304)
chr2 (48-270)||(45547068-45547290)
chr2 (54-266)||(6289232-6289444)
chr2 (69-270)||(11534972-11535173)
chr2 (69-270)||(24193232-24193433)
chr2 (68-259)||(34028677-34028868)
chr2 (68-270)||(20157502-20157704)
chr2 (74-270)||(11998169-11998364)
chr2 (95-270)||(24193686-24193868)
chr2 (127-266)||(45485502-45485631)
chr2 (177-251)||(18176323-18176397)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (48-269)||(8583730-8583951)
chr4 (48-270)||(42218171-42218393)
chr4 (49-270)||(3435689-3435904)
chr4 (50-264)||(44930018-44930232)
chr4 (95-270)||(8880581-8880756)
chr4 (69-270)||(52109543-52109744)
chr4 (95-270)||(25935924-25936098)
chr4 (68-270)||(26336205-26336407)
chr4 (74-270)||(47685281-47685477)
chr4 (72-270)||(45332803-45333001)
chr4 (72-270)||(45340493-45340691)
chr4 (72-270)||(42720856-42721055)
chr4 (69-270)||(54509851-54510050)
chr4 (107-270)||(33449963-33450126)
chr4 (49-230)||(7820239-7820405)
chr4 (69-268)||(40143915-40144098)
chr4 (143-251)||(38230928-38231036)
chr4 (177-260)||(53272056-53272139)
chr4 (50-78)||(56397742-56397770)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (48-270)||(81507-81729)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (49-266)||(45318601-45318818)
chr1 (50-270)||(26882553-26882773)
chr1 (48-270)||(52705530-52705752)
chr1 (69-270)||(36402384-36402585)
chr1 (68-270)||(1928149-1928351)
chr1 (72-270)||(29208892-29209090)
chr1 (69-270)||(33243060-33243257)
chr1 (69-270)||(33263233-33263430)
chr1 (69-270)||(10896937-10897138)
chr1 (102-200)||(45534991-45535089)
chr1 (106-191)||(9831782-9831867)
chr1 (198-270)||(9831427-9831499)
chr1 (220-270)||(45534943-45534993)
chr1 (143-251)||(19007400-19007508)
chr1 (143-251)||(48194746-48194854)
chr1 (143-251)||(48203504-48203612)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (48-270)||(6476438-6476660)
chr6 (102-270)||(29834064-29834232)
chr6 (102-270)||(29865498-29865666)
chr6 (76-270)||(3110038-3110232)
chr6 (69-270)||(10643758-10643961)
chr6 (68-270)||(30877989-30878191)
chr6 (152-251)||(7858203-7858302)
chr6 (143-251)||(709070-709178)
chr6 (143-251)||(7100320-7100428)
chr6 (143-251)||(8794202-8794310)
chr6 (49-79)||(29834041-29834071)
chr6 (49-79)||(29865475-29865505)
chr6 (182-251)||(5957285-5957354)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (49-270)||(40410727-40410948)
chr5 (69-270)||(6828537-6828739)
chr5 (95-269)||(17518566-17518741)
chr5 (95-269)||(10571249-10571423)
chr5 (143-251)||(2276025-2276133)
chr5 (177-269)||(6902525-6902617)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (48-270)||(34539-34761)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (102-270)||(21192-21360)
scaffold0237 (50-79)||(21170-21199)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (68-270)||(16303-16489)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (143-227)||(1705-1789)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 43057406 - 43057628
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057406 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 43057505  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057506 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 43057605  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43057606 accactggatttcattggactca 43057628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 152213 - 151995
Alignment:
Q  52 tttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152213 tttggtagagtattacaaaatctaaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 152114  T
Q  152 tctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152113 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 152014  T
Q  252 ctggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||    
T  152013 ctggatttcattggactca 151995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 35089831 - 35090053
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35089831 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttataccaa 35089930  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089931 acaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 35090030  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  35090031 accacttgatttcattggactca 35090053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30111162 - 30110940
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30111162 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaa 30111063  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111062 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataatagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 30110963  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30110962 accactggatttcattggactca 30110940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 27418367 - 27418589
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27418367 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctttgtgtgggagaccaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaa 27418466  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418467 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgattactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 27418566  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27418567 accactggatttcattggactca 27418589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40097434 - 40097231
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctat 166  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  40097434 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacattaaaaagtctcacaaaatccat 40097335  T
Q  167 tactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgga 266  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40097334 tagtcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattgga 40097235  T
Q  267 ctca 270  Q
    ||||    
T  40097234 ctca 40097231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 47914878 - 47915004
Alignment:
Q  144 ctaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47914878 ctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccataaaaatctgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatt 47914977  T
Q  244 gaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47914978 gaataccactggatttcattggactca 47915004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 39301002 - 39301192
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            ||| |||    
T  39301002 aaatctcaaggctatatgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaa------------atccatt 39301089  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39301090 actcacaacaatctattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggaatttattggac 39301189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 147
Target Start/End: Original strand, 47914054 - 47914153
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47914054 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 47914153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 46037170 - 46037278
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  46037170 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaat 46037269  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  46037270 tgaatacca 46037278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33474848 - 33474820
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaag 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33474848 aatttggaagagtattacaaaatctcaag 33474820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 24150558 - 24150779
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150558 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 24150657  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150658 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtggacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 24150757  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24150758 ccactggatttcattggactca 24150779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35731289 - 35731069
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35731289 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgttagcaggtgcattttacactaaac 35731190  T
Q  150 aatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35731189 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 35731090  T
Q  250 cactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  35731089 cactggatttgattggactca 35731069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 38629528 - 38629747
Alignment:
Q  51 atttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629528 atttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaaatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaca 38629627  T
Q  151 atctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629628 atctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtatagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 38629727  T
Q  251 actggatttcattggactca 270  Q
     ||| ||||||||| |||||    
T  38629728 gctgaatttcattgaactca 38629747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 50900173 - 50900394
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50900173 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggaaatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatgtacattttacattaaa 50900272  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50900273 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctctagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaatcgaata 50900372  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50900373 ccactggatttcattggactca 50900394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30589199 - 30588976
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30589199 tgaatttggaagagtattacaaaatctgaaggctatgtgtgggtgataaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacacta 30589100  T
Q  147 aacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaa 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30589099 aacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaa 30589000  T
Q  247 taccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  30588999 taccactgaatttcattggactca 30588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 36054732 - 36054954
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36054732 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttaatagatacattttacactaa 36054831  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054832 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaaaactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 36054931  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36054932 accactggatttcattggactca 36054954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 26005580 - 26005768
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005580 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 26005679  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaat 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26005680 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaatagacaatttttaagttatgcaaaat 26005768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 26293293 - 26293514
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26293293 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgaggttgttagtaggtacattttacactaaa 26293392  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26293393 caatcacacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtaaacaatttttaagttatgcaaaatctcaattaaata 26293492  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  26293493 tcactagatttcattggactca 26293514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Original strand, 46251948 - 46252150
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    |||||||| ||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46251948 aaaatctcgagcttatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 46252047  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46252048 actcacaacaatccattaaaatccgtaaagttttgaataccagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 46252147  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  46252148 tca 46252150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13662887 - 13662685
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13662887 aaaatctcaaggttatgtgtgggaggcagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccatt 13662788  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662787 actcacaacaatccattaaaacccgtagtgttttgaatacgagtagacaatttttaagttgtgcgaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 13662688  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  13662687 tca 13662685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 270
Target Start/End: Original strand, 26005770 - 26005930
Alignment:
Q  110 ctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26005770 ctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaatacca 26005869  T
Q  210 gtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005870 gtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 26005930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 19551885 - 19552094
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19551885 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagaaagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttattaggtacattttacactaaac 19551984  T
Q  150 aatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 249  Q
    ||| |||||||||          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19551985 aatttcacaaaat----------caacaatcaattaaaatctgtagagttttgaataccactagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattaaatac 19552074  T
Q  250 cactggatttcattggactc 269  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19552075 cactggatttcattgaactc 19552094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27593490 - 27593289
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  27593490 aaatctcaaagctatgtgttggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 27593391  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27593390 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagatgtgcaaaacctcaattgaataccactgaattttattggact 27593291  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  27593290 ca 27593289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Original strand, 39338073 - 39338244
Alignment:
Q  97 aaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtaga 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39338073 aaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctca--aaatccattactcacaacaatccattaaaatccttaca 39338170  T
Q  197 gttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39338171 attttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactca 39338244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26556123 - 26555951
Alignment:
Q  81 tatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatc 180  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  26556123 tatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatc----------------- 26556041  T
Q  181 cattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26556040 cattaaaatccgtagagttttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 26555951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36786309 - 36786108
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||    
T  36786309 aaaatctcaaggctatgtgtgagagacaaaaaagtctcaaggc-aggtgtgtgattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccatt 36786211  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36786210 actcacaacaattcattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaagtttaaagttttgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 36786111  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  36786110 tca 36786108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 111 - 270
Target Start/End: Original strand, 52023987 - 52024146
Alignment:
Q  111 taggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  52023987 taggtgtgagattgttactaggtacattttatactaaaaagtctcttaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagaattttgattactaa 52024086  T
Q  211 tagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52024087 tagacaatttttaaattgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactca 52024146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38682728 - 38682563
Alignment:
Q  107 aggctaggtgtgagattgttagtaggtac---attttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38682728 aggctaggtgtgagattgttagtaggtactacattttatactaaaaaatctctcaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagaattttga 38682629  T
Q  204 ataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  38682628 ataccaata-acaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatatcactgaagtttattggactca 38682563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 270
Target Start/End: Original strand, 53183972 - 53184020
Alignment:
Q  222 taagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  53183972 taagttatgcaaaatctcaattgaataccaccagattttattggactca 53184020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 41386595 - 41386817
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386595 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 41386694  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386695 acaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 41386794  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41386795 accactggatttcattggactca 41386817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 48 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7148399 - 7148178
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148399 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 7148300  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7148299 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatgccagtagacaatttctaagttatgcaaaatctcaattgaat 7148200  T
Q  248 accactggatttcattggactc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7148199 accactggatttcattggactc 7148178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 269
Target Start/End: Original strand, 29260001 - 29260222
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29260001 tgaatttggaatagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtacgtacattttacactaa 29260100  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29260101 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 29260200  T
Q  248 accactggatttcattggactc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29260201 accactggatttcattggactc 29260222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2113150 - 2112928
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2113150 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagacagaaaagtctcaatgctaggtgtgagattgtcagtaggtacattttacactaa 2113051  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2113050 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaat 2112951  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2112950 accactggatttcattggactca 2112928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Original strand, 40265010 - 40265228
Alignment:
Q  52 tttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40265010 tttggtagagtattacaaaatctaaaggctacgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaa 40265109  T
Q  152 tctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40265110 tctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagagttttgaataccattagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 40265209  T
Q  252 ctggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40265210 ctggatttcattggactca 40265228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4655403 - 4655184
Alignment:
Q  51 atttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaca 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4655403 atttggaagagtatcacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatgtacattttacactaaaca 4655304  T
Q  151 atctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655303 atctcacaaaatccattactcataacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccggtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacc 4655204  T
Q  251 actggatttcattggactca 270  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  4655203 actgaatttcattggactca 4655184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 41965526 - 41965745
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965526 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttagtaggtacattttacactaaa 41965625  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965626 taatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatatgtagagttttgaataccagtagacaa--tttaagttatgcaaaatctcaattgaata 41965723  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41965724 ccactggatttcattggactca 41965745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 43605090 - 43605311
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43605090 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaagtacattttacattaaa 43605189  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43605190 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcgaaatctcaattgaata 43605289  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43605290 ccactggatttcattggactca 43605311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42275330 - 42275109
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattg-ttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42275330 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattggttagtaggtacattttacactaaa 42275231  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275230 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccataaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 42275131  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  42275130 ccgctggatttcatttgactca 42275109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 95 - 270
Target Start/End: Original strand, 10802543 - 10802718
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802543 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgta 10802642  T
Q  195 gagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802643 gagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 10802718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28620183 - 28619985
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||    
T  28620183 aaaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattgtacattaaacaatctcacaaagttcatt 28620084  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28620083 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactgaatttcattgga 28619985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9457848 - 9457680
Alignment:
Q  102 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457848 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 9457749  T
Q  202 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457748 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 9457680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 37567118 - 37567319
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  37567118 aaatcttaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaaagcctcacaaaatccatta 37567217  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37567218 ctcacaacaattcattaaaatccgtacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatactactggattttattggact 37567317  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  37567318 ca 37567319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 264
Target Start/End: Original strand, 30382420 - 30382615
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  30382420 aaatctcaaagttatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaattgatta 30382519  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30382520 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattg 30382615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8502943 - 8502769
Alignment:
Q  96 gaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtag 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502943 gaaaagtcttaaggctatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtag 8502844  T
Q  196 agttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8502843 aattttaaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactca 8502769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Original strand, 4302551 - 4302755
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa--gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatcta 165  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |    
T  4302551 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatgtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgctaaatcca 4302650  T
Q  166 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  4302651 ttactcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaatactaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccattgaattttattgg 4302750  T
Q  266 actca 270  Q
    |||||    
T  4302751 actca 4302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9209325 - 9209173
Alignment:
Q  118 gagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9209325 gagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaataaattacccacaacaaactattaaaatccttagagttttgaataccaatagacaa 9209226  T
Q  218 tttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9209225 tttttaagttgtccaaaatttcaattgaataccactggattttattgaactca 9209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35142353 - 35142179
Alignment:
Q  96 gaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtag 195  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||     
T  35142353 gaaaagtcttgaggctagttgtgagagtgttagtaggtagattttacactaaaaagtctcataaaatccattactcacaacaatctaataaaatccgtaa 35142254  T
Q  196 agttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  35142253 tattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaatacgaccggattttattggactca 35142179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Original strand, 41965324 - 41965404
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41965324 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgcgagattgttagt 41965404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 1605902 - 1605960
Alignment:
Q  212 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1605902 agacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactactggatttcattagactca 1605960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 40013271 - 40013324
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40013271 agaaaagtctcaaggccaagtgtgagattgttagtaggtatattttatactaaa 40013324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Original strand, 40013363 - 40013419
Alignment:
Q  214 acaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  40013363 acaatttttaagttgtgcaaaatctaaattgaataccactgaattttattgaactca 40013419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9457872 - 9457841
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457872 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 9457841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23185906 - 23185838
Alignment:
Q  198 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgga 266  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23185906 tttttaataccaggagacaatttttaagttgtgaaaaattttgattgaataccaccagattttattgga 23185838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29941304 - 29941082
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941304 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatatgtgggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 29941205  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941204 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 29941105  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  29941104 accactggatttcattagactca 29941082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45547290 - 45547068
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45547290 tgaatttggaagtgtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatataaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 45547191  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45547190 acaatctcacaaaatccattacttacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgctaaatctcaattgaat 45547091  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  45547090 accactgaatttcattggactca 45547068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Original strand, 6289232 - 6289444
Alignment:
Q  54 tggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289232 tggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatc 6289331  T
Q  154 tcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccact 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289332 tcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccact 6289431  T
Q  254 ggatttcattgga 266  Q
    |||||||||||||    
T  6289432 ggatttcattgga 6289444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11535173 - 11534972
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  11535173 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttatgtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 11535074  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11535073 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaattccactggattttattggact 11534974  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  11534973 ca 11534972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 24193232 - 24193433
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  24193232 aaatttcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 24193331  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24193332 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggact 24193431  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  24193432 ca 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 259
Target Start/End: Original strand, 34028677 - 34028868
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  34028677 aaaatctcaagactatgtgtggcagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 34028776  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggattt 259  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34028777 actcgtaacaatccattaaaatccttataattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattt 34028868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Original strand, 20157502 - 20157704
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  20157502 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaagctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 20157601  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20157602 actcataacaatctattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatatttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactgaattttattggac 20157701  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  20157702 tca 20157704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 270
Target Start/End: Original strand, 11998169 - 11998364
Alignment:
Q  74 tcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcac 173  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  11998169 tcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaatctcaaggct-ggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcac 11998267  T
Q  174 aacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11998268 aacaaaccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 11998364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24193868 - 24193686
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccatt-------aaa 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||       |||    
T  24193868 agaaaagtcttgaggctaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacagcaatccattaaaaattaaa 24193769  T
Q  188 atccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    || |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  24193768 attcgtagaattttgaataccaataaacagtttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccgaattttattggactca 24193686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45485631 - 45485502
Alignment:
Q  127 agtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagt 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||          |    
T  45485631 agtaggtacattttacgctaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccatagaattttgaatattagtagac----------t 45485542  T
Q  227 tatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45485541 tatgcaaaatctcaattgaataccactgaattttattgga 45485502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Original strand, 18176323 - 18176397
Alignment:
Q  177 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 251  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  18176323 aatccattaaaatctcaagaattttgaataccaatagacattttataagatttataaaatctcaattgaatacca 18176397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 48 - 269
Target Start/End: Original strand, 8583730 - 8583951
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583730 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 8583829  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8583830 acaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatcttaattgaat 8583929  T
Q  248 accactggatttcattggactc 269  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  8583930 accactgaatttcattggactc 8583951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 42218171 - 42218393
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218171 tgaatttggaagaatattacaaaatctcaaggctatgtgtaggagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 42218270  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218271 acaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 42218370  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42218371 accactggatttcattggactca 42218393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 3435689 - 3435904
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435689 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatg------agatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 3435782  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435783 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagcacacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 3435882  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  3435883 ccactgaatttcattggactca 3435904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44930232 - 44930018
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930232 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaaatctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaac 44930133  T
Q  150 aatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930132 aatctcacaaaatcctttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacccgtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 44930033  T
Q  250 cactggatttcattg 264  Q
    ||||| |||||||||    
T  44930032 cactgaatttcattg 44930018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 95 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8880756 - 8880581
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880756 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaattcattactcacaacaatccattaaaatccgta 8880657  T
Q  195 gagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880656 gagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 8880581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52109744 - 52109543
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52109744 aaatctcaaggttatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgggattgttagtaggtacattttacattaaacaatctcacaaaatccatta 52109645  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52109644 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcggtatacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccattggatttcattggact 52109545  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  52109544 ca 52109543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25936098 - 25935924
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgta 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  25936098 agaaaagtctcaaggctag-tgtgagattgttaataggttcattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaattcgat 25936000  T
Q  195 gagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25935999 gagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatactactagatttcattggactca 25935924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26336407 - 26336205
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  26336407 aaaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 26336308  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26336307 actcacaataatccattaaaatccttagaattttgaataccaataaacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggac 26336208  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  26336207 tca 26336205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 47685477 - 47685281
Alignment:
Q  74 tcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcac 173  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  47685477 tcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaagtttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcgcaaaatctattactcac 47685378  T
Q  174 aacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47685377 aacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgagcaaaatctcaattgaataccactgaattttattggactca 47685281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45333001 - 45332803
Alignment:
Q  72 tctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactc 171  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||    
T  45333001 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactc 45332902  T
Q  172 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45332901 acaacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 45332803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45340691 - 45340493
Alignment:
Q  72 tctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactc 171  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||    
T  45340691 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtttcataaaatccattactc 45340592  T
Q  172 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45340591 acaacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 45340493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42721055 - 42720856
Alignment:
Q  72 tctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattact 170  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  42721055 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattact 42720956  T
Q  171 cacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42720955 cacaacaacccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 42720856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 54510050 - 54509851
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  54510050 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaaagcctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 54509951  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
       || |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54509950 ---cataacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 54509854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 33449963 - 33450126
Alignment:
Q  107 aggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaata 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33449963 aggctatgtgtgagattgttagtagatacattttacactaaaatgtctcacaaaatccattactcacaataatccattaaaatccgtagaattttgaata 33450062  T
Q  207 ccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  33450063 ccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccaccgaattttattggactca 33450126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7820405 - 7820239
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaagg-ctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7820405 gaatttggaagagtaatacaaaatcccaagggctatgtgtgggagacagaaaagtctccaggctaggtgtgagattgttagtaggtgcattttacactaa 7820306  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatg 230  Q
    ||||||||| |||                ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7820305 acaatctcataaa----------------aattcattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatg 7820239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40144098 - 40143915
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||             
T  40144098 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttaagtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaa--------- 40144008  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
           |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  40144007 -------caatccattaaaattcttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatacctctgaattttattggact 40143915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38231036 - 38230928
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  38231036 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaat 38230937  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  38230936 tgaatacca 38230928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53272139 - 53272056
Alignment:
Q  177 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttc 260  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  53272139 aatccattaaaatatgtatacttttgaataccaatagacattttataagtcagccaaagtctcatttgaataccaccggatttc 53272056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 56397770 - 56397742
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaag 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56397770 aatttggaagagtattacaaaatctcaag 56397742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 81507 - 81729
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  81507 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaa 81606  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81607 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccaggagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 81706  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  81707 accactggatttcattggactca 81729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45318818 - 45318601
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318818 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgataaaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 45318719  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318718 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 45318619  T
Q  249 ccactggatttcattgga 266  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45318618 ccactggatttcattgga 45318601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 270
Target Start/End: Original strand, 26882553 - 26882773
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26882553 aatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggtgatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtatatacattttacactaaac 26882652  T
Q  150 aatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26882653 aatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatctgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatac 26882752  T
Q  250 cactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26882753 cactggatttcattggactca 26882773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52705752 - 52705530
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52705752 tgaatttggaagagtattacaatatctcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtcttaaggctaggcgtgagattgttagtaagtacattttacaccaa 52705653  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52705652 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 52705553  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52705552 accactggatttcattggactca 52705530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36402585 - 36402384
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  36402585 aaatctcaaagttatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 36402486  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36402485 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggact 36402386  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  36402385 ca 36402384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Original strand, 1928149 - 1928351
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  1928149 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtcacaaggctaggtgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 1928248  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1928249 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctgaattgaataccactggattttattggac 1928348  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  1928349 tca 1928351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29209090 - 29208892
Alignment:
Q  72 tctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactc 171  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29209090 tctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttggtagatatatgttacactaaaaagtctcacaaaatccattactc 29208991  T
Q  172 acaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29208990 acaacaatccattaaaatccttagaactttgaataccaatagacaatttttaagttgtgtaaaatctcaattgaatacctctggattttattggactca 29208892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 33243060 - 33243257
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||| ||||    
T  33243060 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccatta 33243155  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  33243156 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtact 33243255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 33263233 - 33263430
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||| ||||    
T  33263233 aaatctcaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtctct----taggtgtgagattgttagtaggtacaatttacattaaaaagtttcacaaaatccatta 33263328  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  33263329 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatctcaattgaataccactggattttattgtact 33263428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10897138 - 10896937
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    ||||||||| |||||||||   ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||    
T  10897138 aaatctcaaagctatgtgtgagagacaaaaaagtgtcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacattaaaatgtttcacaaaatccatta 10897039  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggact 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10897038 ctcataacaatccattaaaatcctaccaattttgaataccaatagacaatttttaagttgggcaaaatctcaattgaataccactggattttattagact 10896939  T
Q  269 ca 270  Q
    ||    
T  10896938 ca 10896937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45535089 - 45534991
Alignment:
Q  102 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45535089 tctcaaggctacgtgtgagattgttagtaggtacattttacactcaacaatctcaaaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcagtagagttt 45534991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9831867 - 9831782
Alignment:
Q  106 aaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatcc 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9831867 aaggttaggtgtgagattgttagtaagtatattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatcc 9831782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9831499 - 9831427
Alignment:
Q  198 ttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9831499 ttttgaataccaatagacaatttgtaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggactca 9831427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45534993 - 45534943
Alignment:
Q  220 tttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45534993 tttaagttatgcaaaatctcaattgaataccgctgaatttcattggactca 45534943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 19007400 - 19007508
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  19007400 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagactttttaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatctcaat 19007499  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  19007500 tgaatacca 19007508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48194854 - 48194746
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  48194854 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaat 48194755  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  48194754 tgaatacca 48194746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48203612 - 48203504
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||  | |||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  48203612 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaatacctatggacaattcataagtcatgagaaatctcaat 48203513  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  48203512 tgaatacca 48203504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 6476438 - 6476660
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6476438 tgaatttgaaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgggagacagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtagttacattttacactaa 6476537  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6476538 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatactagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 6476637  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  6476638 accactggattttattggactca 6476660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Original strand, 29834064 - 29834232
Alignment:
Q  102 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834064 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29834163  T
Q  202 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834164 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 29834232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Original strand, 29865498 - 29865666
Alignment:
Q  102 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865498 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 29865597  T
Q  202 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865598 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 29865666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Original strand, 3110038 - 3110232
Alignment:
Q  76 aaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaa 175  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3110038 aaggctatgtgtgggagatagaaaagtcttaatactaggtgcgagattgtcagtatgtacattttacactaaacaatctcacaaaatccattactcacaa 3110137  T
Q  176 caatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3110138 caatccattaaaatccgtagagttttgaataactgcacacaattttcaagttaggcaaaatctcaattgaatatcactggatttcattggactca 3110232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 10643758 - 10643961
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatta 168  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  10643758 aaatcttaaggctatgtgtgggagacaaaaaagtcttaagattaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatta 10643857  T
Q  169 ctcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatg--caaaatctcaattgaataccactggatttcattgga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10643858 ctcacaacaatccattaaaatccttacaattttgattaccaatagacaatttttaagttgtgatcaaaatctcaattgaataccactggattttattgga 10643957  T
Q  267 ctca 270  Q
    ||||    
T  10643958 ctca 10643961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30878191 - 30877989
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  30878191 aaaatctcaagactatgtgtgggagacaaaaaagtctcaaggctagatgtgagattgttagtagatgcattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 30878092  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30878091 actcataacaatccattaaaatccttagaattttgaataccaatagacaatttttaagctgtacaaaatctgaattgaataccactagattttattggac 30877992  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  30877991 tca 30877989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 7858203 - 7858302
Alignment:
Q  152 tctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7858203 tctcacaaaatctattactcacaacaatgcattaaaatccgtagaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaatacca 7858302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 709178 - 709070
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||| |||||    
T  709178 actaaaaagtctcacaaaatccattacatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatttcaat 709079  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  709078 tgaatacca 709070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7100428 - 7100320
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  7100428 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaat 7100329  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  7100328 tgaatacca 7100320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 8794202 - 8794310
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  8794202 actaaaaagtctcacaaaatccattccatccaagaatccatcaaaatctatagacttttgaataccaatggacaattcataagtcatgagaaatctcaat 8794301  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  8794302 tgaatacca 8794310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 79
Target Start/End: Original strand, 29834041 - 29834071
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834041 gaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 29834071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 79
Target Start/End: Original strand, 29865475 - 29865505
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865475 gaatttggaagagtattacaaaatctcaagg 29865505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5957354 - 5957285
Alignment:
Q  182 attaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca 251  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  5957354 attaaaatctatagacttttgaataccaatagacaattcataagtcatgagaaatcttaattgaatacca 5957285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40410948 - 40410727
Alignment:
Q  49 gaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410948 gaatttggaaaagtattacaaaatttcaaggctatgtgtgggagatagaaaagtctcaagtctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaa 40410849  T
Q  149 caatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40410848 caatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatacgagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaata 40410749  T
Q  249 ccactggatttcattggactca 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  40410748 ccactagatttcattggactca 40410727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 6828537 - 6828739
Alignment:
Q  69 aaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaa-gtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctatt 167  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  6828537 aaatctcaaagctatgtgtgggagacaaaaaaagtctcaaggttagatgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccatt 6828636  T
Q  168 actcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggac 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6828637 actcataacaatccattaaaatccttacaattttgaatatcaatagacaatttttaagttgtgcaaaatctcaattgaataccactggattttattggac 6828736  T
Q  268 tca 270  Q
    |||    
T  6828737 tca 6828739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17518741 - 17518566
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgta 194  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17518741 agaaaagtcttgaggctgggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaaaagtctcacaaaatccattactcgcaacattccattaaaatccgta 17518642  T
Q  195 gagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaatacca-ctggatttcattggactc 269  Q
    || |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  17518641 gaattttgaatcccaataaacaatttttaagttgtgcaaaatcttaattgaataccaccgggattttattggactc 17518566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10571423 - 10571249
Alignment:
Q  95 agaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgta 194  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||||| ||| || ||||||||| |||||| | | ||    
T  10571423 agaaaagtcttaaggttaggtgtgagattgttagtatgtacattttatactaaaaagtttcacaaaatccattcctgacaacaatctattaaatttcata 10571324  T
Q  195 gagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactc 269  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10571323 gaattttgaataccaatagacaatttttaagttgtacaaaatcttaattgaataccaccggattttattggactc 10571249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 2276025 - 2276133
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaat 242  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||  ||||| |||  |||| | |||    
T  2276025 actaaaaaatctcacaaaatccattatacaaaagaatccattaaaatctatagacttttgaatatcaatagacaattcataagtcatgagaaattttaat 2276124  T
Q  243 tgaatacca 251  Q
    |||||||||    
T  2276125 tgaatacca 2276133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Original strand, 6902525 - 6902617
Alignment:
Q  177 aatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactc 269  Q
    |||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  6902525 aatccattgaaatcaatacatttttgaataccaagagacaatttttaagttgtaaaaaatcttgattgaataccaccagattttgttggactc 6902617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 34539 - 34761
Alignment:
Q  48 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34539 tgaatttggaagagtattacaaaatctcaaggctatgtgtgagagatagaaaagtctcaaggttaggtgtgagattgttagtagatacattttacactaa 34638  T
Q  148 acaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34639 acaatctcacaaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaatatcagcagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaat 34738  T
Q  248 accactggatttcattggactca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  34739 accactgtatttcattggactca 34761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Original strand, 21192 - 21360
Alignment:
Q  102 tctcaaggctaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21192 tctcaaggttaggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcataaaatccattactcacaacaatccattaaaatccgtagagtttt 21291  T
Q  202 gaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 270  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292 gaataccgatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattggactca 21360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Original strand, 21170 - 21199
Alignment:
Q  50 aatttggaagagtattacaaaatctcaagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21170 aatttggaagagtattacaaaatctcaagg 21199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Original strand, 16303 - 16489
Alignment:
Q  68 aaaatctcaaggctatgtgttgaagatagaaaagtctcaaggcta--ggtgtgagattgttagtaggtacattttacactaaacaatctcacaaaatcta 165  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16303 aaaatttcaaggctatgtgtgagagacataaaagtctcaaggttataggtgtgagattgttagtaggtacactttacactaaacaatctcacaaaatcca 16402  T
Q  166 ttactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggatttcattgg 265  Q
    |||||||||                  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16403 ttactcaca------------------tagaattttgaatactaatagacaatttttaagttatgcaaaatctcaattgaataccactggattttattgg 16484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 1705 - 1789
Alignment:
Q  143 actaaacaatctcacaaaatctattactcacaacaatccattaaaatccgtagagttttgaataccagtagacaatttttaagtt 227  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  1705 actaaaaagtctcacaaaatccattctacaaaagaatccattaaaatctgcagatttttgaataccaatagacattttataagtt 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University