View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3594_low_4 (Length: 603)

Name: NF3594_low_4
Description: NF3594
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3594_low_4
NF3594_low_4
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (19-592)||(38581189-38581765)
chr5 (160-592)||(38574167-38574598)
chr5 (19-162)||(38573627-38573770)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (184-592)||(18523578-18523986)
chr7 (184-592)||(18643929-18644337)
chr7 (184-592)||(18631221-18631629)
chr7 (184-592)||(18600996-18601404)
chr7 (184-465)||(18646642-18646923)
chr7 (19-162)||(18523015-18523158)
chr7 (19-162)||(18632020-18632163)
chr7 (19-162)||(18652022-18652165)
chr7 (19-162)||(18600461-18600604)
chr7 (19-162)||(18644728-18644871)
chr7 (19-162)||(18647314-18647457)
chr7 (184-254)||(18651560-18651630)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 592
Target Start/End: Original strand, 38581189 - 38581765
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38581189 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgtcattactcaatgctttcatttggtactcaaac 38581288  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataatacgtgttatattttagtcgttaatttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38581289 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataatatgtgttatcttttagtcgttaatttaaaaatatatttgtattcatggcgtcaaaat 38581388  T
Q  219 taatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatc---tttgaagatttcaaatagatggaatggattcaaaaacatcttgtttccatac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38581389 taatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatcatctttgaagatttcaaatagatggaatggattcaaaaacatcttgtttccatac 38581488  T
Q  316 ggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgtaaaaatggacttcaccataataacaagaacag 415  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38581489 ggtattgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgtgaaaatggacttcaccattataacaagaacag 38581588  T
Q  416 gtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgttacagattctcagaatattggggacacaagat 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38581589 gtagaaaagcatgggcaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgttacagattctcagaatattggggacacaagat 38581688  T
Q  516 gggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtcatagcttctt 592  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38581689 gggagatttcgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtgatagcttctt 38581765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 160 - 592
Target Start/End: Original strand, 38574167 - 38574598
Alignment:
Q  160 atacgtgttatattttagtcgttaatttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggac 259  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38574167 atacttgttacattttagttgtta-tttaaaaatatatttattttcatggcgtcaaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggac 38574265  T
Q  260 catctttgaagatttcaaatagatggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgc 359  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38574266 catctttgaagttttcaaaaacatggactggattcaaaaacatattgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctaattggatatgc 38574365  T
Q  360 atttttcctgtttctatgttgtgtaaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattcca 459  Q
    ||||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38574366 atttttcctatttctaactactgtgaaaatggacttcacaatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttttgattcca 38574465  T
Q  460 acgtttgttggtctcgtagtatgttacagattctcagaatattggggacacaagatgggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggac 559  Q
    | | || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38574466 atggtttttggtctcctagtgtgttacagattcccagaatattggatacacgagatgggaaattttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggac 38574565  T
Q  560 aaagtggctgttattttgttgtcatagcttctt 592  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  38574566 aaagtggttgttactttgctgtcatagcttctt 38574598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 38573627 - 38573770
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38573627 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttggtacttaaac 38573726  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38573727 gtctcagggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 38573770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 184 - 592
Target Start/End: Original strand, 18523578 - 18523986
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagatttcaaatagat 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18523578 atttaaaaatatatttgttttcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagttttcaaaaacat 18523677  T
Q  284 ggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgt 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||    
T  18523678 ggactggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctaattggatatgcatttttcctgtttctaactactgt 18523777  T
Q  384 aaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgt 483  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||    
T  18523778 aaaaatggacttcaccatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttttgattccaatgttttttggtctcctagtgtgt 18523877  T
Q  484 tacagattctcagaatattggggacacaagatgggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtca 583  Q
    |||||||||  ||||| ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  18523878 tacagattccaagaattttggaaactcgagatgggaaattttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggtcaaagtggttgttactttgctgtca 18523977  T
Q  584 tagcttctt 592  Q
    |||||||||    
T  18523978 tagcttctt 18523986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 184 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18644337 - 18643929
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagatttcaaatagat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18644337 atttaaaaatatatttgttttcatggcgtcaaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagttttcaaaaacat 18644238  T
Q  284 ggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgt 383  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||    
T  18644237 ggactggattcaaaaatatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctaattggatatgcatttttcctgtttctaactactgt 18644138  T
Q  384 aaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgt 483  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  18644137 gaaaatggacttcaccatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttgtgattccaatgttttttggtctcgtagtgtgt 18644038  T
Q  484 tacagattctcagaatattggggacacaagatgggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtca 583  Q
    |||||||||  ||||| ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  18644037 tacagattccaagaattttggaaactcgagatgggaaattttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttatagggcaaagtggttgttactttgctgtca 18643938  T
Q  584 tagcttctt 592  Q
    |||||||||    
T  18643937 tagcttctt 18643929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 184 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18631629 - 18631221
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagatttcaaatagat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18631629 atttaaaaatatatttgttttcatggcgtcaaaattactgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagttttcaaaaacat 18631530  T
Q  284 ggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgt 383  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||    
T  18631529 ggactggattcaaaaatatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctaattggatatgcatttttcctgtttctaactactgt 18631430  T
Q  384 aaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgt 483  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||    
T  18631429 gaaaatggacttcaccatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttttgattccaatgttttttggtctcctagtgtgt 18631330  T
Q  484 tacagattctcagaatattggggacacaagatgggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtca 583  Q
    |||||||||  ||||| ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  18631329 tacagattccaagaattttggaaactcgagatgggaaattttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttatagggcaaagtggttgttactttgctgtca 18631230  T
Q  584 tagcttctt 592  Q
    |||||||||    
T  18631229 tagcttctt 18631221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 184 - 592
Target Start/End: Original strand, 18600996 - 18601404
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagatttcaaatagat 283  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18600996 atttaaaaatatatttgtttccatggcgtcaaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagttttcaaaaacat 18601095  T
Q  284 ggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgt 383  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |  |||    
T  18601096 ggattggattcaaaaatatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctacttggatatgcatttttcctgtttctaactactgt 18601195  T
Q  384 aaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgtttgttggtctcgtagtatgt 483  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||    
T  18601196 gaaaatggacttcaccatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttttgattccaatgttttttggtctcctagtgtgt 18601295  T
Q  484 tacagattctcagaatattggggacacaagatgggattttttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttataggacaaagtggctgttattttgttgtca 583  Q
    |||||||||  ||||| ||||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  18601296 tacagattccaagaattttggaaactcgagatgggaaattttgaagcaaaaaaccttcctgttatagttatagggcaaagtggttgttactttgctgtca 18601395  T
Q  584 tagcttctt 592  Q
    |||||||||    
T  18601396 tagcttctt 18601404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 184 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18646923 - 18646642
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagatttcaaatagat 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18646923 atttaaaaatatatttgttttcatggcgtcaaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttctaggaccatctttgaagttttcaaaaacat 18646824  T
Q  284 ggaatggattcaaaaacatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccttaattggctatgcatttttcctgtttctatgttgtgt 383  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||    
T  18646823 ggactggattcaaaaatatcttgtttccatacggtactgaagatgtaataagtgtaatatccctaattggatatgcatttttcctgtttctaactactgt 18646724  T
Q  384 aaaaatggacttcaccataataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttatgattccaacgttt 465  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18646723 gaaaatggacttcaccatgataacaagaacaggtagaaaagcatggacaatagctttttgttcctttttgattccaatgttt 18646642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 18523015 - 18523158
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18523015 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttggtacttaagc 18523114  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18523115 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18523158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18632163 - 18632020
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18632163 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttggtacttaagc 18632064  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18632063 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18632020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18652165 - 18652022
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18652165 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttggtacttaagc 18652066  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18652065 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18652022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 18600461 - 18600604
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  18600461 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattacacaatgctttcatttggtacttaagc 18600560  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18600561 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18644871 - 18644728
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  18644871 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttgatacttaagc 18644772  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18644771 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18647457 - 18647314
Alignment:
Q  19 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatttttgccattactcaatgctttcatttggtactcaaac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  18647457 gatcaagctgcaatgcctatgcaatccactttgccattgttagagcttcaaattctcacaatctttgccattactcaatgctttcatttgatacttaagc 18647358  T
Q  119 gcattggagtcccttatttcgtttcacaaatcttggtaataata 162  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18647357 gtcttggggtcccttatttcgtttcacaaatcatggtaataata 18647314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18651630 - 18651560
Alignment:
Q  184 atttaaaaatatatttgtattcatggcgtcgaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttct 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18651630 atttaaaaatatatttgttttcatggcgtcaaaattaatgatacataaattttgcaggctggtttagttct 18651560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University