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Alignment Overview

Query: NF3605_high_22 (Length: 399)

Name: NF3605_high_22
Description: NF3605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3605_high_22
NF3605_high_22
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (68-310)||(9244058-9244300)
chr8 (73-310)||(26364739-26364973)
chr8 (76-310)||(521983-522214)
chr8 (78-310)||(30644591-30644819)
chr8 (78-291)||(30640801-30641013)
chr8 (75-291)||(20308923-20309139)
chr8 (75-291)||(21095556-21095772)
chr8 (75-291)||(9245333-9245550)
chr8 (75-291)||(41636831-41637047)
chr8 (77-285)||(34642667-34642874)
chr8 (75-291)||(43584408-43584624)
chr8 (73-288)||(20309956-20310172)
chr8 (73-288)||(21096589-21096805)
chr8 (74-276)||(41638070-41638271)
chr8 (74-291)||(26366096-26366313)
chr8 (65-310)||(34643848-34644087)
chr8 (78-289)||(43585849-43586059)
chr8 (73-177)||(31202964-31203068)
chr8 (75-163)||(3714550-3714638)
chr8 (75-163)||(43134079-43134167)
chr8 (73-163)||(3713061-3713149)
chr8 (212-291)||(22012274-22012353)
chr8 (231-286)||(31203071-31203126)
chr8 (212-291)||(22013161-22013240)
chr8 (75-143)||(22012157-22012225)
chr8 (218-289)||(3714443-3714514)
chr8 (75-143)||(22013289-22013357)
chr8 (218-289)||(3713185-3713256)
chr8 (247-285)||(43133976-43134014)
chr8 (210-279)||(20066208-20066277)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (75-310)||(29186664-29186899)
chr7 (75-291)||(43113674-43113890)
chr7 (70-291)||(19217622-19217843)
chr7 (65-321)||(9391509-9391765)
chr7 (75-310)||(18788443-18788678)
chr7 (68-291)||(44417450-44417673)
chr7 (78-292)||(3537429-3537642)
chr7 (73-285)||(27072562-27072774)
chr7 (73-285)||(27205539-27205751)
chr7 (69-293)||(48792437-48792661)
chr7 (75-291)||(29187932-29188148)
chr7 (75-291)||(48793418-48793634)
chr7 (74-291)||(13750538-13750755)
chr7 (70-291)||(18787143-18787364)
chr7 (75-320)||(43962442-43962687)
chr7 (75-285)||(7011633-7011844)
chr7 (75-285)||(7026991-7027202)
chr7 (75-291)||(13597144-13597359)
chr7 (75-291)||(44420425-44420640)
chr7 (72-291)||(45399912-45400131)
chr7 (75-291)||(9392717-9392933)
chr7 (75-284)||(32519658-32519867)
chr7 (74-289)||(37237132-37237344)
chr7 (153-340)||(13749081-13749266)
chr7 (80-279)||(32518426-32518616)
chr7 (69-310)||(43960939-43961165)
chr7 (71-280)||(44746722-44746931)
chr7 (70-288)||(3538478-3538686)
chr7 (75-273)||(44230427-44230625)
chr7 (153-289)||(26005429-26005565)
chr7 (153-291)||(44748465-44748603)
chr7 (96-310)||(12630584-12630799)
chr7 (156-310)||(43114970-43115124)
chr7 (74-168)||(45688866-45688960)
chr7 (75-203)||(37235813-37235941)
chr7 (158-291)||(13599159-13599293)
chr7 (75-163)||(26006773-26006861)
chr7 (69-165)||(19008925-19009021)
chr7 (70-185)||(12630498-12630613)
chr7 (75-165)||(19016725-19016815)
chr7 (73-143)||(44231892-44231962)
chr7 (75-152)||(42611435-42611512)
chr7 (76-163)||(7057359-7057446)
chr7 (75-163)||(27071020-27071108)
chr7 (75-163)||(27207205-27207293)
chr7 (250-310)||(9357679-9357739)
chr7 (209-289)||(45398657-45398737)
chr7 (197-280)||(19218897-19218980)
chr7 (76-125)||(26005412-26005461)
chr7 (247-289)||(44231765-44231807)
chr7 (71-131)||(45398538-45398598)
chr7 (230-285)||(37235939-37235994)
chr7 (252-289)||(45689023-45689060)
chr7 (71-131)||(24653733-24653793)
chr7 (71-127)||(44748569-44748625)
chr7 (70-123)||(13599268-13599321)
chr7 (153-185)||(7057397-7057429)
chr7 (76-108)||(9357862-9357894)
chr7 (75-123)||(13749063-13749111)
chr7 (153-185)||(44231910-44231942)
chr7 (153-185)||(45688885-45688917)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (68-291)||(51693140-51693363)
chr1 (70-292)||(52086622-52086842)
chr1 (70-310)||(51468334-51468574)
chr1 (66-280)||(5488780-5488994)
chr1 (73-310)||(17244173-17244410)
chr1 (75-291)||(7110226-7110442)
chr1 (66-291)||(7111377-7111601)
chr1 (75-291)||(51468803-51469019)
chr1 (78-288)||(45229508-45229718)
chr1 (81-276)||(50484913-50485108)
chr1 (75-310)||(52759363-52759598)
chr1 (83-310)||(45228283-45228510)
chr1 (76-276)||(5488502-5488702)
chr1 (75-273)||(40187603-40187800)
chr1 (92-288)||(52087679-52087875)
chr1 (91-310)||(38235033-38235251)
chr1 (75-273)||(18819262-18819460)
chr1 (85-280)||(1821918-1822114)
chr1 (77-289)||(47533758-47533970)
chr1 (75-274)||(1823215-1823410)
chr1 (65-291)||(50483501-50483726)
chr1 (156-287)||(52761502-52761633)
chr1 (79-269)||(47532961-47533150)
chr1 (75-237)||(17245621-17245782)
chr1 (70-170)||(25181496-25181596)
chr1 (188-310)||(21203124-21203246)
chr1 (75-143)||(18820806-18820874)
chr1 (75-127)||(52761602-52761654)
chr1 (187-242)||(49784941-49784996)
chr1 (197-279)||(51088653-51088735)
chr1 (212-289)||(18820679-18820756)
chr1 (75-124)||(21202963-21203012)
chr1 (153-185)||(18820824-18820856)
chr1 (153-185)||(25181519-25181551)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (74-291)||(10802888-10803105)
chr4 (75-291)||(7261445-7261661)
chr4 (75-310)||(17356361-17356596)
chr4 (73-291)||(38032322-38032540)
chr4 (75-310)||(22621867-22622099)
chr4 (75-291)||(34095561-34095777)
chr4 (70-291)||(38031163-38031384)
chr4 (75-291)||(8815259-8815475)
chr4 (75-289)||(10804099-10804313)
chr4 (74-340)||(56233723-56233973)
chr4 (76-291)||(23757872-23758088)
chr4 (70-281)||(8814130-8814340)
chr4 (75-310)||(18091580-18091815)
chr4 (110-310)||(22623029-22623226)
chr4 (79-291)||(48501226-48501437)
chr4 (75-280)||(35191817-35192019)
chr4 (78-285)||(48499367-48499573)
chr4 (65-278)||(17357778-17357991)
chr4 (75-291)||(56234923-56235138)
chr4 (98-310)||(5433293-5433502)
chr4 (77-243)||(35193146-35193312)
chr4 (95-310)||(36074677-36074892)
chr4 (75-168)||(34122827-34122920)
chr4 (188-320)||(35925804-35925936)
chr4 (187-291)||(35927018-35927122)
chr4 (78-185)||(48081598-48081705)
chr4 (75-163)||(48463014-48463102)
chr4 (75-177)||(48080270-48080372)
chr4 (93-171)||(48081552-48081630)
chr4 (75-163)||(34121299-34121387)
chr4 (212-292)||(48081281-48081361)
chr4 (224-291)||(48081469-48081536)
chr4 (218-289)||(34122725-34122796)
chr4 (77-128)||(48081392-48081443)
chr4 (205-289)||(48462907-48462991)
chr4 (209-280)||(17522475-17522546)
chr4 (75-114)||(22624389-22624428)
chr4 (196-289)||(21570330-21570423)
chr4 (71-131)||(5574196-5574256)
chr4 (153-185)||(34122870-34122902)
chr4 (153-185)||(48463052-48463084)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (70-291)||(28777589-28777810)
chr3 (75-291)||(31937035-31937251)
chr3 (70-291)||(46903526-46903747)
chr3 (73-321)||(2233177-2233425)
chr3 (78-291)||(46902334-46902547)
chr3 (75-291)||(17116202-17116417)
chr3 (73-285)||(31938216-31938427)
chr3 (75-291)||(23073276-23073492)
chr3 (77-291)||(43393955-43394170)
chr3 (88-289)||(21729092-21729293)
chr3 (78-291)||(47431089-47431302)
chr3 (76-310)||(35759114-35759348)
chr3 (78-291)||(55209785-55209997)
chr3 (76-291)||(37609322-37609537)
chr3 (75-292)||(21727910-21728127)
chr3 (75-291)||(28776448-28776664)
chr3 (78-310)||(52521930-52522161)
chr3 (75-291)||(5689725-5689935)
chr3 (75-288)||(10979080-10979293)
chr3 (71-292)||(52525261-52525481)
chr3 (76-279)||(53180718-53180920)
chr3 (69-274)||(17742211-17742417)
chr3 (69-274)||(19043531-19043737)
chr3 (75-288)||(2232602-2232815)
chr3 (75-276)||(54354308-54354509)
chr3 (78-274)||(5691014-5691209)
chr3 (69-289)||(50881020-50881233)
chr3 (75-273)||(54353023-54353221)
chr3 (76-289)||(11346813-11347026)
chr3 (75-291)||(11348374-11348589)
chr3 (136-291)||(17740891-17741046)
chr3 (136-291)||(19042211-19042366)
chr3 (76-291)||(47429628-47429838)
chr3 (76-283)||(53765876-53766083)
chr3 (158-308)||(37610648-37610798)
chr3 (97-291)||(47917515-47917708)
chr3 (75-243)||(46986043-46986208)
chr3 (78-289)||(15290394-15290604)
chr3 (153-291)||(35758082-35758220)
chr3 (70-206)||(23091186-23091322)
chr3 (156-291)||(55210810-55210945)
chr3 (78-216)||(53764432-53764569)
chr3 (163-292)||(10978093-10978221)
chr3 (70-185)||(43392621-43392736)
chr3 (72-207)||(53178698-53178833)
chr3 (75-207)||(17117387-17117517)
chr3 (170-310)||(50879782-50879922)
chr3 (71-185)||(23072056-23072169)
chr3 (75-163)||(34014508-34014596)
chr3 (200-291)||(33111747-33111837)
chr3 (77-205)||(33113306-33113426)
chr3 (94-175)||(50879513-50879594)
chr3 (75-163)||(24376458-24376546)
chr3 (65-132)||(34015829-34015896)
chr3 (75-163)||(27750461-27750549)
chr3 (75-139)||(53101827-53101891)
chr3 (235-310)||(43392766-43392841)
chr3 (76-168)||(27749107-27749199)
chr3 (75-127)||(35758064-35758116)
chr3 (78-122)||(37610797-37610841)
chr3 (221-285)||(53764896-53764959)
chr3 (250-288)||(53101697-53101735)
chr3 (88-132)||(21729382-21729426)
chr3 (235-310)||(23072199-23072274)
chr3 (96-128)||(23072140-23072172)
chr3 (153-185)||(34014526-34014558)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (75-291)||(32348939-32349155)
chr6 (65-310)||(32712345-32712587)
chr6 (75-288)||(11801247-11801460)
chr6 (75-291)||(32713785-32714001)
chr6 (77-310)||(34996647-34996877)
chr6 (74-291)||(3000695-3000912)
chr6 (74-310)||(34995351-34995586)
chr6 (75-291)||(18572885-18573100)
chr6 (75-291)||(32347808-32348024)
chr6 (75-241)||(29479146-29479312)
chr6 (78-291)||(19383057-19383262)
chr6 (71-185)||(18574301-18574415)
chr6 (187-285)||(21094517-21094615)
chr6 (187-281)||(27719848-27719941)
chr6 (224-291)||(21095281-21095348)
chr6 (73-143)||(29477757-29477827)
chr6 (76-155)||(19788248-19788327)
chr6 (235-335)||(18574165-18574271)
chr6 (75-155)||(19761942-19762022)
chr6 (187-276)||(7628436-7628526)
chr6 (247-289)||(29477912-29477954)
chr6 (92-149)||(25138811-25138868)
chr6 (63-139)||(7628312-7628388)
chr6 (196-280)||(18230452-18230536)
chr6 (153-185)||(29477777-29477809)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (77-291)||(19228840-19229054)
chr5 (75-291)||(19229975-19230191)
chr5 (66-310)||(12372304-12372549)
chr5 (75-291)||(39349480-39349696)
chr5 (75-285)||(39350553-39350763)
chr5 (70-273)||(9083216-9083419)
chr5 (78-291)||(13278133-13278346)
chr5 (75-278)||(18654296-18654500)
chr5 (72-310)||(6803508-6803745)
chr5 (69-290)||(13276813-13277026)
chr5 (75-277)||(9081979-9082181)
chr5 (75-279)||(18655566-18655770)
chr5 (75-310)||(12373603-12373839)
chr5 (70-310)||(39164056-39164288)
chr5 (75-183)||(8447077-8447185)
chr5 (157-291)||(4031903-4032039)
chr5 (158-291)||(4032927-4033060)
chr5 (78-176)||(6801977-6802075)
chr5 (70-165)||(35952464-35952559)
chr5 (179-289)||(42962122-42962232)
chr5 (70-127)||(4031876-4031933)
chr5 (76-163)||(25001643-25001730)
chr5 (157-245)||(3944662-3944750)
chr5 (211-310)||(14356562-14356662)
chr5 (197-280)||(30674746-30674829)
chr5 (77-127)||(4033031-4033081)
chr5 (153-185)||(8447095-8447127)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (74-291)||(16602724-16602941)
chr2 (75-291)||(38243857-38244073)
chr2 (75-310)||(27892219-27892454)
chr2 (74-273)||(23832967-23833165)
chr2 (75-291)||(27891106-27891322)
chr2 (77-252)||(26388220-26388395)
chr2 (135-293)||(38242943-38243098)
chr2 (75-185)||(16604197-16604307)
chr2 (73-183)||(43814519-43814629)
chr2 (75-165)||(23833898-23833988)
chr2 (73-163)||(5033476-5033566)
chr2 (75-163)||(5034846-5034934)
chr2 (76-160)||(19577359-19577443)
chr2 (198-289)||(370885-370976)
chr2 (113-163)||(15496083-15496133)
chr2 (78-132)||(43814642-43814696)
chr2 (187-276)||(44800984-44801073)
chr2 (247-289)||(5033631-5033673)
chr2 (247-310)||(16604092-16604155)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (69-276)||(35202-35409)
scaffold0141 (75-276)||(31033-31234)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (69-276)||(79403-79610)
scaffold0049 (75-276)||(83578-83779)
[»] scaffold0878 (3 HSPs)
scaffold0878 (75-285)||(2934-3145)
scaffold0878 (153-310)||(1847-2003)
scaffold0878 (93-127)||(1847-1881)
[»] scaffold1425 (2 HSPs)
scaffold1425 (75-291)||(1503-1719)
scaffold1425 (75-285)||(134-343)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (74-285)||(25252-25464)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (75-177)||(104301-104403)
scaffold0026 (229-310)||(104405-104486)
scaffold0026 (153-185)||(104319-104351)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (187-281)||(9270-9363)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (197-310)||(22351-22465)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (197-280)||(42923-43003)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 310
Target Start/End: Original strand, 9244058 - 9244300
Alignment:
Q  68 tatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatt 167  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9244058 tattttaggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatt 9244157  T
Q  168 tcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaac 267  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9244158 tattttattcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaac 9244257  T
Q  268 acctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  9244258 acctaatttatttattttcttctttttcttccctcatcttcat 9244300  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 310
Target Start/End: Original strand, 26364739 - 26364973
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26364739 ttggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcctttaacttatttcttt 26364838  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26364839 tattcaatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttataatgtatcaccaacaccta 26364938  T
Q  273 atttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  26364939 atttatttagtttcttctt---cttccctcatcttcat 26364973  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 522214 - 521983
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  522214 gcttaattaatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttattttat 522115  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  522114 tcaatttgatctaattttgataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacccctaatt 522015  T
Q  276 tatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  522014 tatttactttcttctt---cttccctcatcttcat 521983  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30644819 - 30644591
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30644819 ttaattgatctgtcggttccttaatttatttcttttatttaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttcttttattc 30644720  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30644719 aatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaa-gagaccgttggattacggaggtctatcaaattttataatggatcaccaacacctaattta 30644621  T
Q  278 tttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||| ||| |||||   ||| ||||||||||||    
T  30644620 tttagttttttctt---cttccctcatcttcat 30644591  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 30640801 - 30641013
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30640801 ttaattgatatgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccttatcaaacacgtca-ttaacttatttcttttattc 30640899  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30640900 aatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 30640999  T
Q  278 tttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||    
T  30641000 tttactttcttctt 30641013  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 20308923 - 20309139
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  20308923 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgttttta 20309022  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309023 ttcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaat 20309122  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  20309123 ttatttactttcttctt 20309139  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 21095556 - 21095772
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  21095556 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgttttta 21095655  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21095656 ttcaatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaat 21095755  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  21095756 ttatttactttcttctt 21095772  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9245550 - 9245333
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtccctt-aacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9245550 ggcttaaatgatctgccggtccttttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttatttt 9245451  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9245450 attcaatttagtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgctgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9245351  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9245350 tttatttactttcttctt 9245333  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 41636831 - 41637047
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41636831 ggcttaattgatttgccggtccttttacttatttctttcattcaatttggtcccataagtcttaactttctaaaacacgtcccttaatttatttctttta 41636930  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41636931 ttcaatttggtccaacttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaagtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaat 41637030  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  41637031 ttatttactttcttctt 41637047  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 285
Target Start/End: Original strand, 34642667 - 34642874
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34642667 cttaattgatctgccggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 34642766  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34642767 caatttggtttaattttgataattttaatcccctaaaaaa-aaaaccgttggattgcggaggtctatcagattttatagtatatcaccaacatctaattt 34642865  T
Q  277 atttacttt 285  Q
    |||||||||    
T  34642866 atttacttt 34642874  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 43584408 - 43584624
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43584408 ggcttaattgatctgtcggtccattaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 43584507  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| | |||||||| |||||||||||   |||||    
T  43584508 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcttttaaaaaaagagaccgttggattacaaaagtctatcagattttataatgtatcaccaatgtctaat 43584607  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  43584608 ttatttactttcttctt 43584624  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20310172 - 20309956
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20310172 ttggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 20310073  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctcta-aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacct 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20310072 tattcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacct 20309973  T
Q  272 aatttatttactttctt 288  Q
    || ||||||||||||||    
T  20309972 aacttatttactttctt 20309956  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21096805 - 21096589
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21096805 ttggcttaattaatctgctcgtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 21096706  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctcta-aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacct 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21096705 tattcgatttggttcaattttgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacct 21096606  T
Q  272 aatttatttactttctt 288  Q
    || ||||||||||||||    
T  21096605 aacttatttactttctt 21096589  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41638271 - 41638070
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41638271 tggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttattctcataagtcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttctttt 41638172  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41638171 attcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaa-gagacaattggattacagaggtctatcatgttttatagtgtatcaccaacacctaa 41638073  T
Q  274 ttt 276  Q
    |||    
T  41638072 ttt 41638070  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26366313 - 26366096
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||||| || || |||||||||||||||    
T  26366313 tggcttaattgatctgccgatcctttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaaccttatcaaacatgttccataacttatttctttt 26366214  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26366213 attcaatttggtccatttttaataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttagattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacataa 26366114  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26366113 tttatttactttcttctt 26366096  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34644087 - 34643848
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  34644087 atttaattttagcttaattgatccgtcggtcccttgacttatttcttttattcaatttg-tcccataaatcttaactttctcaaacacctctattaattt 34643989  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacc 264  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  34643988 atttcttttatttaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaa--agaccgttggatt---gaggtctatcagattttatggcgtatcacc 34643894  T
Q  265 aacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||   ||| ||||||||||||    
T  34643893 aacacctaatttatttggattcttcttcttcttccctcatcttcat 34643848  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43586059 - 43585849
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  43586059 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatctcataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 43585960  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43585959 aatttgatccaattttaataattttaatcctttaaaaaa-aagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaattta 43585861  T
Q  278 tttactttcttc 289  Q
    |||| |||||||    
T  43585860 tttattttcttc 43585849  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Original strand, 31202964 - 31203068
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31202964 ttggcttaattaatctgtcgtttccttaacttatttcttttattcattttggtcccataaatcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 31203063  T
Q  173 tattc 177  Q
    |||||    
T  31203064 tattc 31203068  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3714638 - 3714550
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3714638 ggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 3714550  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43134167 - 43134079
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43134167 ggcttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttcttaaacacatcccttaact 43134079  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 3713061 - 3713149
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3713061 ttggcttaattgatctgtcggtctcttaa-ttatttcttttatttaatttggttc-ataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 3713149  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 22012274 - 22012353
Alignment:
Q  212 aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||| |||| |||||||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22012274 aaaaaggagatcgttggataagtgaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctgatttatttactttcttctt 22012353  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Original strand, 31203071 - 31203126
Alignment:
Q  231 tacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttc 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31203071 tacggaggtctatcaaattttataatgtatcaccaacacctaacttatttactttc 31203126  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22013240 - 22013161
Alignment:
Q  212 aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||| |||| |||||||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22013240 aaaaaggagatcgttggataagtgaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctgatttatttactttcatctt 22013161  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 143
Target Start/End: Original strand, 22012157 - 22012225
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaacttt 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  22012157 ggcttaattgaactgtcggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtctcataactcttaacttt 22012225  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3714514 - 3714443
Alignment:
Q  218 gagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3714514 gagatcgttggataagggagatctatcagatcttatagtgtatcaccaacacttgatttatttactttcttc 3714443  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22013357 - 22013289
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaacttt 143  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  22013357 ggcttaattgaactgctggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtcccataactcttaacttt 22013289  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Original strand, 3713185 - 3713256
Alignment:
Q  218 gagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  3713185 gagatcgttggataagggagatctattagatcttatagtgtatcacaaacacttgatttatttactttcttc 3713256  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43134014 - 43133976
Alignment:
Q  247 attttatagtgtatcaccaacacctaatttatttacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43134014 attttatagtgtatcaccaacacttgatttatttacttt 43133976  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 279
Target Start/End: Original strand, 20066208 - 20066277
Alignment:
Q  210 taaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 279  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20066208 taaaaaaagagaccgttggataaaagagatccatcagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttatt 20066277  T

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Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 29186664 - 29186899
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29186664 ggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttta 29186763  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186764 ttcaatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 29186863  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  29186864 ttatttattttcttctttttcttccctcatcttcat 29186899  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 43113674 - 43113890
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43113674 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 43113773  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43113774 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccagcacctaat 43113873  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43113874 ttatttgctttcttctt 43113890  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Original strand, 19217622 - 19217843
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19217622 ttttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccattaacttatttc 19217721  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19217722 ttttattcaatttggtacaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacac 19217821  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19217822 ctaatttatttactttcttctt 19217843  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 321
Target Start/End: Original strand, 9391509 - 9391765
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9391509 atttatctttggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttcactt 9391608  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacc 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |    
T  9391609 atttcttttattcaatttggtacaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcatc 9391708  T
Q  265 aacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcatgcaaccttcaa 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| || |||||||    
T  9391709 aacaccaaatttatttactttcttcttcttcttccatcatcttcattcatccttcaa 9391765  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18788678 - 18788443
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18788678 ggcttaattgatatgccggtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcctataaatcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 18788579  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18788578 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaatagaccgttggattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaat 18788479  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  18788478 ttatttactttcttcttctctttccctcatcttcat 18788443  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 291
Target Start/End: Original strand, 44417450 - 44417673
Alignment:
Q  68 tatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatt 167  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44417450 tattttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaacattctcaaacacgtcccttaacttatt 44417549  T
Q  168 tcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaac 267  Q
    | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  44417550 tattttcttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagattgttggattacggaggtctatcagattttatagtctatcaccaac 44417649  T
Q  268 acctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44417650 acctaatttatttactttcttctt 44417673  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 292
Target Start/End: Original strand, 3537429 - 3537642
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537429 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 3537528  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     |||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  3537529 aatttagtctaattttaataattttaatcccctaaaaaaagaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtatatcaccatcacctaattt- 3537627  T
Q  278 tttactttcttcttt 292  Q
    |||||||||||||||    
T  3537628 tttactttcttcttt 3537642  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27072774 - 27072562
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27072774 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttt 27072675  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27072674 tattcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtttatcaccaacaccta 27072575  T
Q  273 atttatttacttt 285  Q
    |||||||||||||    
T  27072574 atttatttacttt 27072562  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 285
Target Start/End: Original strand, 27205539 - 27205751
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27205539 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttt 27205638  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27205639 tattcaatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtctatcaccaacaccta 27205738  T
Q  273 atttatttacttt 285  Q
    |||||||||||||    
T  27205739 atttatttacttt 27205751  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 293
Target Start/End: Original strand, 48792437 - 48792661
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48792437 attttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttttcaaacatgtcccttaacttattt 48792536  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48792537 cttttattcaatttgatctaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaagggtgtataagattttatagtgtatcaccaaca 48792636  T
Q  269 cctaatttatttactttcttctttc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  48792637 ccaaatttatttactttcttctttc 48792661  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29188148 - 29187932
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29188148 ggcttaaatgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttatttta 29188049  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29188048 ttcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgcagaggtctatcagattttatagtgcatcaccaacacctaat 29187949  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  29187948 ttatttactttcttctt 29187932  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48793634 - 48793418
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48793634 ggcttaattgatttgccggtcccttaacttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttta 48793535  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  48793534 ttcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtgtataagattttatagtgtatcaccaacaccaaat 48793435  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  48793434 ttatttactttcttctt 48793418  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13750755 - 13750538
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13750755 tggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 13750656  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || || ||||    
T  13750655 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcatcaactaa 13750556  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  13750555 tttatatactttcgtctt 13750538  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Original strand, 18787143 - 18787364
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  18787143 tttttagcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttgtttaatttggtcccataaatcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttc 18787242  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  18787243 ttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccgttggattacggaggtttatcagattttatggtgtatcaccaacac 18787342  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctt 291  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  18787343 ttaatttatttactttcttctt 18787364  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43962687 - 43962442
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43962687 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttagctttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 43962588  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43962587 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcatctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtatatcactaacacctaat 43962488  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcatgcaaccttca 320  Q
    |||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||| || ||||||    
T  43962487 ttatttcctttcttcttcttcttccctcatctacattcatccttca 43962442  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Original strand, 7011633 - 7011844
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7011633 ggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttta 7011732  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcc-tctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7011733 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 7011832  T
Q  274 tttatttacttt 285  Q
    ||||||||||||    
T  7011833 tttatttacttt 7011844  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Original strand, 7026991 - 7027202
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7026991 ggcttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttctttta 7027090  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcc-tctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7027091 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 7027190  T
Q  274 tttatttacttt 285  Q
    ||||||||||||    
T  7027191 tttatttacttt 7027202  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 13597144 - 13597359
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13597144 ggcttaattgaactgccgatcctttaacgtatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccctgaacttatttctttta 13597243  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597244 ttaaatttgat-caattttgataattttaatcctctaaaaaaagatatcgttggattagggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaat 13597342  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  13597343 ttatttactttcttctt 13597359  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44420640 - 44420425
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44420640 ggcttaattgatatgccgatcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 44420541  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  44420540 ttcaatttagtccaattttgataattttaatgccctaaaaaaagataccgttggattacgaaggtctatcaga-tttatagtgtatcaccaacatctaat 44420442  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  44420441 ttatttactttcttctt 44420425  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45400131 - 45399912
Alignment:
Q  72 tttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 171  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||  |||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45400131 tttggtttaattgatctgccggtcccttaacttatttgtttattttgatttggtctcataactcttaacttttgcaaacacgtcccttaacttatttctt 45400032  T
Q  172 ttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacct 271  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  45400031 ttatttactttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacct 45399932  T
Q  272 aatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45399931 aatttatttactttcttctt 45399912  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9392933 - 9392717
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9392933 ggcttaattgatcttccgttcctttaacttatttcttttatttaatttattcctataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 9392834  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9392833 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccggcacctaat 9392734  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  9392733 ttatttactttcttctt 9392717  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32519867 - 32519658
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32519867 ggctaaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaaattatttctttta 32519768  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32519767 ttcaatttggttcaattttaataattttaatcccttaaaaaaagagaccgttgaattacgaaggtctaccagattgtatagtgtgtcaccaacacctaat 32519668  T
Q  275 ttatttactt 284  Q
    || |||||||    
T  32519667 ttttttactt 32519658  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37237344 - 37237132
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  37237344 tggcttaattgatctgcccgtcccttaatttatttcttttatttaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacacatcccttaacttattt--ttt 37237247  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37237246 attaaatttggtccaattttgataattt-aatcctctaaaaaaagagatcgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatgaccaacacctaa 37237148  T
Q  274 tttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  37237147 tttatttactttcttc 37237132  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 13749081 - 13749266
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  13749081 gtcccataacttatttcttatatttaatttgatttaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttgaattacgtaggtctataaaa-tttc 13749179  T
Q  253 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcatgcaaccttcaacaattttcttcatccacat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13749180 tagtgtatcaccaacacctaatttatttaatttcttctttctctttcct-atcttcatacaacgttcaacaattttcttcatccacat 13749266  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Original strand, 32518426 - 32518616
Alignment:
Q  80 aattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcca 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32518426 aattgatctatcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaaattatttcttttattcaa 32518525  T
Q  180 tttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 279  Q
    ||||||||         ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518526 tttggttc---------aattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 32518616  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 43960939 - 43961165
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |            ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43960939 attttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcgt------------tctcaaacacgtcccttaatttattt 43961026  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43961027 cttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcctctacaaaaacagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcactaaca 43961126  T
Q  269 cctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43961127 cctaatttatttactttcttctt---cttccctcatcttcat 43961165  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 280
Target Start/End: Original strand, 44746722 - 44746931
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44746722 ttttggtttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatcttataagtcttaattttctcaaacatgttcgttaacttatttct 44746821  T
Q  171 tttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacc 270  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  44746822 tttattcaatttggtcaaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcatattttatagtgtattatcaacacc 44746921  T
Q  271 taatttattt 280  Q
    ||||||||||    
T  44746922 taatttattt 44746931  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3538686 - 3538478
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  3538686 tttttggcttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcttttcacttatttc 3538587  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||          ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  3538586 tttta----------ttcaattttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttacggtgtatcaccaacat 3538497  T
Q  270 ctaatttatttactttctt 288  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3538496 ctaatttatttactttctt 3538478  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 44230427 - 44230625
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  44230427 ggcttaattgatctgccgatcccttagattatttcttttattcaatttagttccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttta 44230526  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44230527 ttcaatttggtccaattttaataatttcaatcccctacgaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacacctaa 44230625  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Original strand, 26005429 - 26005565
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26005429 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggttcaattttgataattttactccactaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctataagatttta 26005528  T
Q  253 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26005529 tagtgtatcaccaacacgtaatttatgtactttcttc 26005565  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44748603 - 44748465
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  44748603 gtcccttaatttatttcttttattcaatatggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaggagactgttggattacgaaggtctatcagatttta 44748504  T
Q  253 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748503 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 44748465  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Original strand, 12630584 - 12630799
Alignment:
Q  96 ccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaac-ttatttcttttattccatttggttcaattttg 194  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  12630584 ccttaacttatgtcttttcttcaatttggtctcaaaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacctttttttttttattcaatttggtctaattttg 12630683  T
Q  195 ataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttcc 294  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  12630684 ataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacagaggtatatcagattttattatggatcactaacacctaatttatttactttcttcttctt 12630783  T
Q  295 ctttcctcatcttcat 310  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12630784 cttccctcatcttcat 12630799  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43115124 - 43114970
Alignment:
Q  156 ccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatag 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  43115124 ccttaacttatttcttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcccttaaaaaagaagaccgttggattactgaagtctatcagattttatag 43115025  T
Q  256 tgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43115024 tgcatcatcataacctaatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 43114970  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 45688866 - 45688960
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45688866 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacatcccttaactcattt 45688960  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 203
Target Start/End: Original strand, 37235813 - 37235941
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37235813 ggcttaattggcctgccggtcccttaacttatttcttttatttaatttggttccataaatcccaactttctcaaacgcgtcccttaacttatttctttga 37235912  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataatttta 203  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  37235913 ttcaatttggtccaattttgagaatttta 37235941  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13599293 - 13599159
Alignment:
Q  158 ttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatc-ctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagt 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||  ||||||  | |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13599293 ttaacttatttcttttattcaatttgctccaattttgataattttaatatcttaaaaaaaaaaaattgttggattacggaggtctatcagattttatagt 13599194  T
Q  257 gtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13599193 gtatcagtaacacctaatttatttactttcttctt 13599159  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26006861 - 26006773
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  26006861 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttgttcaatttggtcccataagttttaactatcacaaacacatcccttaact 26006773  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 19008925 - 19009021
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  19008925 attttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaatcgcgtcccttaactta 19009021  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Original strand, 12630498 - 12630613
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  12630498 tttttggtataattgatatgtcggtcctttaacttatgtcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgttccttaacttatgtc 12630597  T
Q  170 ttttattccatttggt 185  Q
    |||| ||| |||||||    
T  12630598 ttttcttcaatttggt 12630613  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19016815 - 19016725
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  19016815 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaaccacgtcccttaactta 19016725  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44231962 - 44231892
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaacttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44231962 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaacttt 44231892  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 152
Target Start/End: Original strand, 42611435 - 42611512
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacac 152  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42611435 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacac 42611512  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7057446 - 7057359
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| ||||    
T  7057446 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccgtcacaaacacatccctcaact 7057359  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 27071020 - 27071108
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  27071020 ggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 27071108  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27207293 - 27207205
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  27207293 ggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 27207205  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9357739 - 9357679
Alignment:
Q  250 ttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  9357739 ttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttcatcttctttcctcatcttcat 9357679  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 289
Target Start/End: Original strand, 45398657 - 45398737
Alignment:
Q  209 ctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||||||| |||| | |||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45398657 ctaaaaaaggagatcattggataagggaggtttatcaaatcttatagtgtatcaccaacatctaatttatttactttcttc 45398737  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19218980 - 19218897
Alignment:
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19218980 aattttaatcctctgaaaaaggagaccgttggataaaagaggtccatgagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttattt 19218897  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 125
Target Start/End: Original strand, 26005412 - 26005461
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggt 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26005412 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 26005461  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44231807 - 44231765
Alignment:
Q  247 attttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44231807 attttatagtgtatcaccaacacctgatttatttactttcttc 44231765  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Original strand, 45398538 - 45398598
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccata 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||    
T  45398538 ttttggtttaattgatctgtcggtcccttaacttacttctttatttcgatttggtcccata 45398598  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 285
Target Start/End: Original strand, 37235939 - 37235994
Alignment:
Q  230 ttacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttacttt 285  Q
    ||||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235939 ttacggaggtcaatcagattttacaatgtatcaccaacacctaatttatttacttt 37235994  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 289
Target Start/End: Original strand, 45689023 - 45689060
Alignment:
Q  252 atagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45689023 atagtgtatcaccaacacttaatttatttactttcttc 45689060  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24653793 - 24653733
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccata 131  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  24653793 ttttggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtcccata 24653733  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44748625 - 44748569
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  44748625 ttttggcttaatcgatctgccagtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcc 44748569  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13599321 - 13599268
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttg 123  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13599321 tttttggcataattgatctgccaatcctttaacttatttcttttattcaatttg 13599268  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7057429 - 7057397
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7057429 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 7057397  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9357894 - 9357862
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttattt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9357894 gcttaattgatctgtcgatcccttaacttattt 9357862  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 123
Target Start/End: Original strand, 13749063 - 13749111
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  13749063 ggcttaattgatctggcggtcccataacttatttcttatatttaatttg 13749111  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44231942 - 44231910
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44231942 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 44231910  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 45688885 - 45688917
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45688885 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 45688917  T

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Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 68 - 291
Target Start/End: Original strand, 51693140 - 51693363
Alignment:
Q  68 tatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatt 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51693140 tattttaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatt 51693239  T
Q  168 tcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaac 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  51693240 tcttttattcaatttggttcaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaac 51693339  T
Q  268 acctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  51693340 acctaatttatttactttcttctt 51693363  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 292
Target Start/End: Original strand, 52086622 - 52086842
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52086622 ttttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 52086721  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52086722 ttttattcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaa--aaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatcaccatcac 52086819  T
Q  270 ctaatttatttactttcttcttt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  52086820 ctaatttttttactttcttcttt 52086842  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 310
Target Start/End: Original strand, 51468334 - 51468574
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51468334 tttttggcttaattgatctgccggtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 51468433  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51468434 ttttattcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaagattgatggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 51468533  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    | |||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||    
T  51468534 ccaatttatttacttttttcttcttcttccctcatcttcat 51468574  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5488994 - 5488780
Alignment:
Q  66 tttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5488994 tttatatttggcttaattgatccgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgttcattaactta 5488895  T
Q  166 tttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacca 265  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5488894 tttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcacca 5488795  T
Q  266 acacctaatttattt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  5488794 acacctaatttattt 5488780  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 310
Target Start/End: Original strand, 17244173 - 17244410
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17244173 ttggcttaattaacctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctcaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 17244272  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||    
T  17244273 gattcaatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccgataccta 17244372  T
Q  273 atttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  17244373 atttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 17244410  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 7110226 - 7110442
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7110226 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 7110325  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7110326 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattgcggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacgcctaat 7110425  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  7110426 ttatttactttcttctt 7110442  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7111601 - 7111377
Alignment:
Q  66 tttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7111601 tttatatttgacttaatt-atctcccggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccattaactga 7111503  T
Q  166 tttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacca 265  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  7111502 tttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatca 7111403  T
Q  266 acacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7111402 acacctaatttatttactttcttctt 7111377  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 51469019 - 51468803
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51469019 ggcttaattgatctgtcagtcccttaacttattttttttattcaatttggtcccataaatcttaactttttcaaacacgtccctaaacttatttcttcta 51468920  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | | | ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51468919 ttcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaaaagcattggattacggagatctattagattttacagtgtatcaccaacacctaat 51468820  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  51468819 ttatttactttcttctt 51468803  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45229718 - 45229508
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45229718 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 45229619  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45229618 aatttgatccaattttgataattttaatcctataaaaaaaaagattgttggattacggaggtctatcagattttataatggatcaccaacacctaattta 45229519  T
Q  278 tttactttctt 288  Q
    |||| ||||||    
T  45229518 tttagtttctt 45229508  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50485108 - 50484913
Alignment:
Q  81 attgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccat 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50485108 attgatctgccggtcccttaacttatttcatttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaat 50485009  T
Q  181 ttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50485008 ttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccattggattacataggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 50484913  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 52759363 - 52759598
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  52759363 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttta 52759462  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52759463 ttcaatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 52759562  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  52759563 ttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 52759598  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 310
Target Start/End: Original strand, 45228283 - 45228510
Alignment:
Q  83 tgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccattt 182  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  45228283 tgatctgccggttctttaacttatttcttttatttaattttgtcccataaattttaaccttatcaaacacgttctttaacttatttcttttattcaattt 45228382  T
Q  183 ggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttac 282  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  45228383 ggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttatagtgtatcacaaacgcttaatttatttac 45228482  T
Q  283 tttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  45228483 tttcttcttcttcttccctcatcttcat 45228510  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Original strand, 5488502 - 5488702
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5488502 gcttaattgatctgttggtcccttaatttatttcttttattcaatttgattccataagacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttat 5488601  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5488602 tcaatttgatccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacgtaatt 5488701  T
Q  276 t 276  Q
    |    
T  5488702 t 5488702  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 40187603 - 40187800
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40187603 ggcttaattgatctgacggtcctttcacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgtcc-ttaacttatttctttta 40187701  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
     || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40187702 ctcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaa 40187800  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52087875 - 52087679
Alignment:
Q  92 ggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaatt 191  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  52087875 ggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtctcatatgtcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttcttttattcaatttgattcaatt 52087776  T
Q  192 ttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttctt 288  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  52087775 ttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaatttatttaatttctt 52087679  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38235251 - 38235033
Alignment:
Q  91 cggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaat 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  38235251 cggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttggtccaat 38235152  T
Q  191 tttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttct 290  Q
    ||| |||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38235151 tttaataagtttaatcc-caaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttct 38235053  T
Q  291 ttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |   ||| ||||||||||||    
T  38235052 tcttcttccctcatcttcat 38235033  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 18819262 - 18819460
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18819262 ggcttaattgatctgccggttccttaaattattttttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaatcacgtcccttaatttatttctttta 18819361  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18819362 ttcaatttggcccaattttaataattttaatcccctatgaaaagaaaccgttggattacggaggtatatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 18819460  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Original strand, 1821918 - 1822114
Alignment:
Q  85 atctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta-tttcttttattccatttg 183  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||     
T  1821918 atctgtcggttccttaatttattttttttattcaattttgtcctataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttttatttaattta 1822017  T
Q  184 gttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1822018 gtctaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttgggttacgaaggtctatctgattttatagtgtatcattaacacctaatttattt 1822114  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47533970 - 47533758
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| || |||    
T  47533970 cttaattgatctgctggtctcttaaattatttcttttatttaatttagtcccataagttttaactttttcaaatacgtctcttaaattatttcattcatt 47533871  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||  ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47533870 caatttgattcaattttgataattataatcctccaaaaaaatagaccgttaaattagagagatctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 47533771  T
Q  277 atttactttcttc 289  Q
    |||||||||||||    
T  47533770 atttactttcttc 47533758  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1823410 - 1823215
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||   ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  1823410 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaa---tctcaaacatgtcgcttaacttattt-tttta 1823315  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1823314 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcttctaaaaagataaaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 1823215  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 291
Target Start/End: Original strand, 50483501 - 50483726
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||| |||||  |||| ||    
T  50483501 atttatcttaggcttaattgatctgtcggtct-ttaacttatttcttgtattcaatttggtctcataagtcttaattttcttaaaaacgtcatttaattt 50483599  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctct-aaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcac 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| ||    
T  50483600 atttcttttattcaatttggtccaatttttataattttactcccctaaaaaaaagagactgttggattacggaagtcta-cagattttatcgtgtataac 50483698  T
Q  264 caacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50483699 caacacctaatttatttactttcttctt 50483726  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52761633 - 52761502
Alignment:
Q  156 ccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatag 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  52761633 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctgaaaaaagagaccgttggattgcggaggtctatcagattttatag 52761534  T
Q  256 tgtatcaccaacacctaatttatttactttct 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52761533 tgtatcaccaacacctaatttatttactttct 52761502  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 269
Target Start/End: Original strand, 47532961 - 47533150
Alignment:
Q  79 taattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcc 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  47532961 taattgatctgccggtcccttaagttattttttttattcaatttggtctcataaatcttaactttatcaaacacgttccttaaattatttcatttattca 47533060  T
Q  179 atttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  47533061 atttgattcaattttgataattttaatcttctaaaaaa-cagactgttgaattatggaagtctatcagattttataatgtatcaccaacac 47533150  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17245782 - 17245621
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17245782 ggcttaattgatccgccggttccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacaagtcccttaacttattt-tttta 17245684  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggag 237  Q
    ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17245683 ttaaatttggtccaattttgatcattttaatcctctaaaaaaaaagaccgttggattacggag 17245621  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 25181496 - 25181596
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181496 ttttttgcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 25181595  T
Q  170 t 170  Q
    |    
T  25181596 t 25181596  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Original strand, 21203124 - 21203246
Alignment:
Q  188 aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttct 287  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21203124 aattttcataattctaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaatttatttactttct 21203223  T
Q  288 tctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    | ||   |||| |||||||||||    
T  21203224 tattcttcttttctcatcttcat 21203246  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18820874 - 18820806
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaacttt 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  18820874 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 18820806  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 52761654 - 52761602
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52761654 ggcttaattgatatgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 52761602  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49784996 - 49784941
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtcta 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  49784996 caattttaataattttaatcccctaaaaaaagagactgttggattacggaagtcta 49784941  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 51088653 - 51088735
Alignment:
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatt 279  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| | | || | ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  51088653 aattttaatctcctaaaaaaggagaccgttggataaaggaggtctgtgatatctaatcatgtatcaccaacacttaatttatt 51088735  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18820756 - 18820679
Alignment:
Q  212 aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||| |||| |||||||| |  ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18820756 aaaaaagagatcgttggataagtgaggtctactagatttgatagtgtatcactaacacctgattcatttactttcttc 18820679  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 124
Target Start/End: Original strand, 21202963 - 21203012
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttgg 124  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21202963 ggcttaattgaactcccggtcccttaacttaattattttcttcaatttgg 21203012  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18820856 - 18820824
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18820856 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 18820824  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 25181519 - 25181551
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25181519 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 25181551  T

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Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 10802888 - 10803105
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802888 tggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 10802987  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10802988 attcaatttggtccaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtttatcagattttatattgtatcaccaacaccgaa 10803087  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10803088 tttatttactttcttctt 10803105  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7261661 - 7261445
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7261661 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 7261562  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7261561 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccattggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaat 7261462  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  7261461 ttatttactttcttctt 7261445  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 17356361 - 17356596
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17356361 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatgccagaaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 17356460  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17356461 ttcaatttgttccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctagt 17356560  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    | |||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  17356561 tcatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 17356596  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38032540 - 38032322
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38032540 ttggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttt 38032441  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  38032440 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacaccta 38032341  T
Q  273 atttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38032340 atttatttactttcttctt 38032322  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 22621867 - 22622099
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22621867 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctttacttatttctttta 22621966  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22621967 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccgacaccgaat 22622066  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22622067 ttatttactttcttctt---cttccctcatcttcat 22622099  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34095777 - 34095561
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34095777 ggcttaattgatctattagtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttg 34095678  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34095677 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcacccacacctaat 34095578  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  34095577 ttatttactttcttctt 34095561  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Original strand, 38031163 - 38031384
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38031163 ttttaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttc 38031262  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  38031263 ttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccataaaaaaaaagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacac 38031362  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38031363 ctaatttatttactttcttctt 38031384  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8815475 - 8815259
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8815475 ggcttaattgatttgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttcta 8815376  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8815375 ttcaaattggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaaaaaaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccaaat 8815276  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  8815275 ttatttactttcttctt 8815259  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10804313 - 10804099
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  10804313 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttcttaaataagttccttaacttatttctttta 10804214  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  10804213 ttcaatttggttcaattttgataattttaatccactaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacgcctaat 10804114  T
Q  275 ttatttactttcttc 289  Q
    |||||||||||||||    
T  10804113 ttatttactttcttc 10804099  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 340
Target Start/End: Original strand, 56233723 - 56233973
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56233723 tggcttaatagatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcgcataagtctcaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttt 56233822  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||                ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56233823 attcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccg----------------tataagattttatagtgtatcgccaacacctaa 56233906  T
Q  274 tttatttactttcttctttccctttcctcatcttcatgcaaccttcaacaattttcttcatccacat 340  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  56233907 tttatttactttcttcttcctctttcctcatcttcatgcaacattcaacaattttcatcatccacat 56233973  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23758088 - 23757872
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23758088 gcttaattgatctgccggttctttaatttatttcttttattcaatttagtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 23757989  T
Q  176 tccatttggttc-aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    |  |||| | || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23757988 taaattttgatccaattttgataattttaatcctccaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacctaat 23757889  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  23757888 ttatttactttcttctt 23757872  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 8814130 - 8814340
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8814130 ttttcggcttaattgatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataaatcttatctttctcaaacatgtcccttaacttatttc 8814229  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  8814230 ttttattcaatttggtcgaattttgataattttaataccctaaaaaat-agactgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtaacaccaacac 8814328  T
Q  270 ctaatttattta 281  Q
    ||||||||||||    
T  8814329 ctaatttattta 8814340  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 18091580 - 18091815
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  18091580 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctatttta 18091679  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091680 ttcaatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 18091779  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  18091780 ttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 18091815  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22623226 - 22623029
Alignment:
Q  110 ttttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22623226 ttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaagcacgtccctttacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccc 22623127  T
Q  210 taaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttca 309  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||    
T  22623126 tacaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccaacatctaatttatttactctcttctt---cttccctcatcttca 22623030  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48501437 - 48501226
Alignment:
Q  79 taattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcc 178  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  48501437 taattgatctgtcggttctttaacttatttcttttattcaattaggtttcataattcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttcttttattca 48501338  T
Q  179 atttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 278  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48501337 atttggtctaattttaat-attttaatcccctaaaaaaagagaccgttagattacggaggtctgtcagattttattgtgtatcatcaacacctaatttat 48501239  T
Q  279 ttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||    
T  48501238 ttactttcttctt 48501226  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 280
Target Start/End: Original strand, 35191817 - 35192019
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35191817 ggcttaattgattcgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttctttta 35191916  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  35191917 ttcaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacggaagtctatcaaattttatagtgt---accaccacctaat 35192013  T
Q  275 ttattt 280  Q
    ||||||    
T  35192014 ttattt 35192019  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 285
Target Start/End: Original strand, 48499367 - 48499573
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48499367 ttaattgatctgccgccaccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataattcttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttattttattc 48499466  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  48499467 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattacagaggtctatcagattttacggtgtatcaccaacatctaattt- 48499565  T
Q  278 tttacttt 285  Q
    ||||||||    
T  48499566 tttacttt 48499573  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17357991 - 17357778
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17357991 atttatttaaggtttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactt 17357892  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacc 264  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |    
T  17357891 atttcttttattcaatatgatccaattttgataattttaatctcctgaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctaccagattttataatgtatcagc 17357792  T
Q  265 aacacctaatttat 278  Q
    || || ||||||||    
T  17357791 aatacttaatttat 17357778  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 56235138 - 56234923
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  56235138 ggcttaattgatctgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacacaccccttaacttatttctttta 56235039  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  56235038 ttcaattcggtctaattttgatacttttaatcctctaaaaaa-cagaccaatgaattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaat 56234940  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  56234939 ttatttactttcttctt 56234923  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5433502 - 5433293
Alignment:
Q  98 ttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgata 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||    
T  5433502 ttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttctcaaacatgtgccttaacttatttattttattcaatttactccaattttgata 5433403  T
Q  198 attttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctt 297  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  5433402 attttaataccctaaaaattgagactgttgtattacggaggtctatcagattttataatgtatcacaaacacctaatttatttaatttcttctt---ctt 5433306  T
Q  298 tcctcatcttcat 310  Q
     ||||||||||||    
T  5433305 ccctcatcttcat 5433293  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35193312 - 35193146
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35193312 cttaattgacctgccagtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaaacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 35193213  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctat 243  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35193212 caatttggtccatttttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacggaggtctat 35193146  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36074892 - 36074677
Alignment:
Q  95 cccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaact-ttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaatttt 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  36074892 cccttatcttatttattttattcaatttagtcccataaattttaactcttctcaagcacgttccttaacttattttttttattcaatttggtctaatttt 36074793  T
Q  194 g-ataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttcttt 292  Q
      ||| ||||||||   |||||||  ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  36074792 ttatatttttaatctcataaaaaa--agatcgttggattacgaaggtctatcatattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttaatttcctcttc 36074695  T
Q  293 ccctttcctcatcttcat 310  Q
      ||| ||||||||||||    
T  36074694 ttcttccctcatcttcat 36074677  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34122920 - 34122827
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34122920 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaactcattt 34122827  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 35925804 - 35925936
Alignment:
Q  188 aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttct 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35925804 aattttgataattttaatcttctaaaaaaaaagactgttggattacggagatctatcagattttatagtgtatcgtcaacacctaatttatttactttct 35925903  T
Q  288 tctttccctttcctcatcttcatgcaaccttca 320  Q
    ||||   ||  |||||||||||| || ||||||    
T  35925904 tcttcttctcccctcatcttcattcatccttca 35925936  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35927122 - 35927018
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttc 286  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927122 caattttgataattttaatctcctaaaaaaaaagatcgttggattacgaaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttc 35927023  T
Q  287 ttctt 291  Q
    |||||    
T  35927022 ttctt 35927018  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48081705 - 48081598
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48081705 ttaattgatgtgtcggtcccttaacttattccttttattcaatttggttccataagtcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttattc 48081606  T
Q  178 catttggt 185  Q
     |||||||    
T  48081605 aatttggt 48081598  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48463102 - 48463014
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48463102 ggcttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 48463014  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 48080270 - 48080372
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  48080270 ggcttaattgatctgtcggtcacttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacttgtcctttaacttatttctttta 48080369  T
Q  175 ttc 177  Q
    |||    
T  48080370 ttc 48080372  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 48081630 - 48081552
Alignment:
Q  93 gtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48081630 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagttatttctt 48081552  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 34121299 - 34121387
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  34121299 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcacttaact 34121387  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48081361 - 48081281
Alignment:
Q  212 aaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttcttt 292  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||  ||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48081361 aaaaaagagaccgttggattccagatatctatgagagtttatactgtatcaccaacacctaatttatttactttcttcttt 48081281  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48081536 - 48081469
Alignment:
Q  224 gttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||| ||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48081536 gttggattgcggaggtctttcagagtttataatgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 48081469  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34122796 - 34122725
Alignment:
Q  218 gagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34122796 gagaacgttggataagggagatctatcagatcttatagtgtatcaccaacacttgatttatttactttcttc 34122725  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 48081443 - 48081392
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtccc 128  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  48081443 cttaattgatttgccggtcccttaacttattccttttattcaatttggtccc 48081392  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48462991 - 48462907
Alignment:
Q  205 tcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||| |||| ||||| | || ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  48462991 tcctctcaaaatagagatcgttggattagggagatctatcagatcttatactgtatcatcaacacatgatttatttactttcttc 48462907  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17522546 - 17522475
Alignment:
Q  209 ctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17522546 ctaaaacaggagaccgttggaaaaaggaggtctataagatctaagagtgtatcaccgacacctaatttattt 17522475  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22624428 - 22624389
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttatttta 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22624428 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttctttta 22624389  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21570423 - 21570330
Alignment:
Q  196 taattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| | || | || ||||||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  21570423 taattttaaacctctcaaaaagaagaccgttggataaaggaggtctatcagatctaatcgtgtatcaccagcgcctaattatattactttcttc 21570330  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Original strand, 5574196 - 5574256
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccata 131  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||    
T  5574196 ttttggcttaattgatcctccggtcccttaacttaattcttttatttaaattggtaccata 5574256  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34122902 - 34122870
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34122902 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 34122870  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48463084 - 48463052
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48463084 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 48463052  T

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Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28777810 - 28777589
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28777810 ttttaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttc 28777711  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  28777710 ttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacac 28777611  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28777610 ctaatttatttactttcttctt 28777589  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 31937035 - 31937251
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31937035 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttcacttatttatttta 31937134  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31937135 ttcattttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 31937234  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    || ||||||||||||||    
T  31937235 ttttttactttcttctt 31937251  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 46903747 - 46903526
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46903747 tttttggcttaattgatctttcagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaagtttttcaaacacgtcctttaacttatttc 46903648  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  46903647 ttttattcaatttggtacaattttgatgattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacac 46903548  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46903547 ctaatttatttactttcttctt 46903526  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2233425 - 2233177
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2233425 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaattcggtctcataagtcttaactttgtcaaacatgtcccttaacttatttcttt 2233326  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2233325 tattcaatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattatggagatctataagattttatagcgtatcaccaacaccta 2233226  T
Q  273 atttatttactttcttctttccctttcctcatcttcatgcaaccttcaa 321  Q
    ||||| |||||||||||||   ||| | |||||||||| || |||||||    
T  2233225 atttaattactttcttcttcttcttccatcatcttcattcatccttcaa 2233177  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 46902334 - 46902547
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46902334 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 46902433  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46902434 aatttggtgcaattttgataattttaatcccctaaaagaagagattgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcactaacaccaaattta 46902533  T
Q  278 tttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||    
T  46902534 tttactttcttctt 46902547  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 17116202 - 17116417
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17116202 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtgttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 17116301  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17116302 ttcaatttggttcaattttgataattttaatcc-ctaaaaaatgacaccgttggattacggaggtccatcagagtttatagtgtatcaccaacacctaat 17116400  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17116401 ttattcactttcttctt 17116417  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31938427 - 31938216
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938427 ttggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 31938328  T
Q  173 tattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31938327 tattcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacaccta 31938228  T
Q  273 atttatttacttt 285  Q
    |||| ||||||||    
T  31938227 attt-tttacttt 31938216  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23073492 - 23073276
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23073492 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaagatgtcccttaacttatttctttta 23073393  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23073392 ttcaaactggttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtgtatcaaattttacggtgtatcaccaacacctaat 23073293  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  23073292 ttatttactttcttctt 23073276  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43394170 - 43393955
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt-cttttat 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43394170 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaagacgtcccttaacttattttcttttat 43394071  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43394070 tcaaattggtccaattttgataattttaaccccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaatt 43393971  T
Q  276 tatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||    
T  43393970 tatttactttcttctt 43393955  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21729293 - 21729092
Alignment:
Q  88 tgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttc 187  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21729293 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagttctaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttgattc 21729194  T
Q  188 aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729193 aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaacacctaatttatttactttct 21729094  T
Q  288 tc 289  Q
    ||    
T  21729093 tc 21729092  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47431302 - 47431089
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47431302 ttaattgatttgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttttcaaacacgttccttaacttatttcttttgttc 47431203  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47431202 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatggaggtctattagattttatagtgtatcacccacacctaattta 47431103  T
Q  278 tttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||    
T  47431102 tttactttcttctt 47431089  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35759348 - 35759114
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35759348 gcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttat 35759249  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35759248 tcaatttggtccaattttgataattttaatctaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaatt 35759149  T
Q  276 tatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  35759148 tatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 35759114  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 55209785 - 55209997
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  55209785 ttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttattt 55209884  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55209885 aatttggtccaattttgataattttaatccacgaaaaaa-gagaccattggattacggaggtctatcagaatttatagtgtattaccaacacctaattta 55209983  T
Q  278 tttactttcttctt 291  Q
    |||||||| |||||    
T  55209984 tttactttattctt 55209997  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 291
Target Start/End: Original strand, 37609322 - 37609537
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37609322 gcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttat 37609421  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  37609422 tcaatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattagggaggtctataagatttaatagtgtctcatcaacacctaatt 37609521  T
Q  276 tatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||    
T  37609522 tatttactttcttctt 37609537  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 292
Target Start/End: Original strand, 21727910 - 21728127
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21727910 ggcttaattgatctgccggtcccataacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttctttta 21728009  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21728010 ttcaatttgattcaattttgataattttaatctcctaaaaaagtagactgttagattacgaaggtctatctcattttataatgtatcaccaacacctaat 21728109  T
Q  275 ttatttactttcttcttt 292  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21728110 ttatttaccttcttcttt 21728127  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 28776448 - 28776664
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28776448 ggcttaattgatctatcagtcctttaatttattttttttattcaatttgatcctataaatcttaattttctcaaacaagtcccttaactgatttctttta 28776547  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28776548 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaacagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcatcaacacctaat 28776647  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  28776648 ttatttactttcttctt 28776664  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Original strand, 52521930 - 52522161
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  52521930 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttctttaattcaatttggtctcatagatcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttattttattc 52522029  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522030 aatttggtccaattttgataactttaatcccctaaaaaa-aagacagttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 52522128  T
Q  278 tttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  52522129 tttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 52522161  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 5689725 - 5689935
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||      | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689725 ggcttaattgatctgtcgctcccttagcttatttcttttattaaatttggtcccataagattt------cccaaacacgtcccttaacttatttctttta 5689818  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5689819 ttaaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaacaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacttaat 5689918  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  5689919 ttatttactttcttctt 5689935  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10979293 - 10979080
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10979293 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaaatttctcaaacacgtcatttcacttatttctttta 10979194  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10979193 ttcaatttgattcaattttgataattttagtccctttaaaaaagagaccattggattacggaggtttatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaat 10979094  T
Q  275 ttatttactttctt 288  Q
    ||||||||||||||    
T  10979093 ttatttactttctt 10979080  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52525481 - 52525261
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52525481 ttttgacttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcccttaacttatttct 52525382  T
Q  171 tttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacc 270  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  52525381 tttattcaatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatgaaggttaataagattttataatgtgtcaccaacatc 52525282  T
Q  271 taatttatttactttcttcttt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  52525281 taattt-tttactttcttcttt 52525261  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53180920 - 53180718
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  53180920 gcttaattgatttgccggtcccttaacttattt-ttttattcaatttgatctcataagtcgtaactttctcaaacacgttctttaacttattttttttat 53180822  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53180821 tcaatttagtccaattttaataattttaatcctctaaaaaaggagaccgttggattacggaggtctatcagattgtatagtgtatcaccaacacctaatt 53180722  T
Q  276 tatt 279  Q
    ||||    
T  53180721 tatt 53180718  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17742417 - 17742211
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742417 attttaggcttaatacatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 17742318  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattt-tatagtgtatcaccaac 267  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||||    
T  17742317 cttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaac 17742218  T
Q  268 acctaat 274  Q
    |||||||    
T  17742217 acctaat 17742211  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19043737 - 19043531
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19043737 attttaggcttaatacatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 19043638  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattt-tatagtgtatcaccaac 267  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||||    
T  19043637 cttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaac 19043538  T
Q  268 acctaat 274  Q
    |||||||    
T  19043537 acctaat 19043531  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 288
Target Start/End: Original strand, 2232602 - 2232815
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2232602 ggcttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaatttatttctttta 2232701  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  2232702 ttcaatttaatccaattttaataattttaatcccctagaaaaaaagaccattggattacggaggtctatgagattttacggtgtatcagcaacacctaat 2232801  T
Q  275 ttatttactttctt 288  Q
    ||||||||||||||    
T  2232802 ttatttactttctt 2232815  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54354509 - 54354308
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54354509 ggcttaattgatctgccggtcccttaacctatttcttttatttaatttggtcccttaagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttga 54354410  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54354409 ttcaatttggtccaattttgataattttaattccctataaaaagagaccattggattatagaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 54354310  T
Q  275 tt 276  Q
    ||    
T  54354309 tt 54354308  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5691209 - 5691014
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5691209 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatta 5691110  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
     | || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5691109 aactt-gtccaattttgataatttaaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 5691014  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50881233 - 50881020
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50881233 atttttggcttaattgatgtgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgaccacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttattt 50881134  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| | |||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  50881133 cttttattcaatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaa-------attggattatgaaggtctaccatattttatagtgtaccaccaaca 50881041  T
Q  269 cctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  50881040 cctaatttatttattttcttc 50881020  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 54353023 - 54353221
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54353023 ggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttatcaaacatgtcccttaacttatttctttta 54353122  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
     || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54353123 ctcaatttggtccaatttttataattttaatccccgaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatcgtgtatcactaacacctaa 54353221  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 289
Target Start/End: Original strand, 11346813 - 11347026
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11346813 gcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcatataaatcttaactttatcaaacacgtgccttaatttatttcttttat 11346912  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11346913 tcaatttgttccaattttgataattttaatcccctgaaaagagagaccattggattatgaaggtctaccatattgtatagtgtatcaccaacacctaatt 11347012  T
Q  276 tatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||||    
T  11347013 tatttactttcttc 11347026  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11348589 - 11348374
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  11348589 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtattaactttatcatacatgttccttaactaatttctttta 11348490  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11348489 tttaatttgatccaattttgataattttaattccttagaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtatatcacc-acacctaat 11348391  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    | |||||||||||||||    
T  11348390 taatttactttcttctt 11348374  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Original strand, 17740891 - 17741046
Alignment:
Q  136 ttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacgg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  17740891 ttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattacgg 17740990  T
Q  236 aggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740991 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 17741046  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Original strand, 19042211 - 19042366
Alignment:
Q  136 ttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacgg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  19042211 ttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattacgg 19042310  T
Q  236 aggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19042311 aggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 19042366  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 291
Target Start/End: Original strand, 47429628 - 47429838
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||       |||||| |    
T  47429628 gcttaattgatctgcatgtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccttta-------tcttttgt 47429720  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatga--gaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  47429721 tcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaaaagactgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacatctaa 47429820  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47429821 tttatttactttcttctt 47429838  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53766083 - 53765876
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53766083 gcttaattgatctgcgggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccgtaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 53765984  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||  ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| || || |||    
T  53765983 tcaatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaagagaaactattggattacggaggtctacgagattttacagtgtatcaccaccatctgatt 53765884  T
Q  276 tatttact 283  Q
    ||||||||    
T  53765883 tatttact 53765876  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37610798 - 37610648
Alignment:
Q  158 ttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtg 257  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37610798 ttaacttattttttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtg 37610699  T
Q  258 tatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  37610698 tatcaccaacacctaatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttc 37610648  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47917708 - 47917515
Alignment:
Q  97 cttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgat 196  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||    
T  47917708 cttaacttatttcttttatttaatttggtctcataaatcttagttttctcaaacacgtccct-aacttatttcttttattcaatttgatctaattttaat 47917610  T
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47917609 aattttaatcccctaaaaataaagattgttggattacggaggtttatcagattttatagtgtattaccaacaccgaatttatttactttcctctt 47917515  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46986208 - 46986043
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  46986208 ggcttaattgatttgccggccccttaatttatttcttttattcaatttggtccaataagtcttaactctctcaaacacgtcccttaacttattt-tctta 46986110  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctat 243  Q
    ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46986109 ttaaatttggtcaaattttgataattttaatcctttaaaaaa--agaccgttggattacggaggtctat 46986043  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15290604 - 15290394
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  15290604 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatcacataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 15290505  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| ||| |||| | |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15290504 aatttgatccaattttaataattttaatcatttaaaaaa-aagaccattgaattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaattta 15290406  T
Q  278 tttactttcttc 289  Q
    |||| |||||||    
T  15290405 tttattttcttc 15290394  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Original strand, 35758082 - 35758220
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  35758082 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctatcagatttta 35758181  T
Q  253 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35758182 cagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 35758220  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 206
Target Start/End: Original strand, 23091186 - 23091322
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23091186 ttttaggcttaattgatctgccggtcttttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttaattc 23091285  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatc 206  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23091286 ttttattcaatttggtccaactttgataattttaatc 23091322  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55210945 - 55210810
Alignment:
Q  156 ccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatag 255  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| | ||||||||     
T  55210945 ccttaacttatttcttttattaaatttggatcaattttgataattttaatccactaaaaaaagatactgttgaattacggagatctatcagattttataa 55210846  T
Q  256 tgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55210845 tgtatcaccaacacataatttatttactttcttctt 55210810  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Original strand, 53764432 - 53764569
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53764432 ttaattgatctaccggtcctttaacttattt-ttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttattc 53764530  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaa 216  Q
     |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53764531 aatttagtcaaattttgataattttaatcccctaaaaaa 53764569  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Original strand, 10978093 - 10978221
Alignment:
Q  163 ttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatca 262  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10978093 ttatttcttttattcaacttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatca 10978192  T
Q  263 ccaacacctaatttatttactttcttcttt 292  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10978193 ccatcacctaattt-tttactttcttcttt 10978221  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Original strand, 43392621 - 43392736
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43392621 ttttttgcgtaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttc 43392720  T
Q  170 ttttattccatttggt 185  Q
    |||||||| |||||||    
T  43392721 ttttattcaatttggt 43392736  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Original strand, 53178698 - 53178833
Alignment:
Q  72 tttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 171  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53178698 tttggcttaattgatctgccgatcccttaacttattttttttattcaatttgatttcataagccttaactttctcaaacacgttccttaacttatttctt 53178797  T
Q  172 ttattccatttggttcaattttgataattttaatcc 207  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  53178798 ttattcaatttgatccaattttgatcattttaatcc 53178833  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17117517 - 17117387
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||    
T  17117517 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaa--tttttttttta 17117420  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcc 207  Q
    ||| ||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  17117419 ttcaatttgggcaaattttgatgattttaatcc 17117387  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 50879782 - 50879922
Alignment:
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||  | | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50879782 ttttattcaattttgtccaattttgataattttaatcccatagaaaaaaaaatcgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 50879881  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  50879882 ctaatttgtttcctttcttcttcttctttcctcatcttcat 50879922  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 23072056 - 23072169
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 170  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23072056 ttttggtttaattgatctgctggtcccttaattcatttcatttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaagacgt-ccttaacttatttct 23072154  T
Q  171 tttattccatttggt 185  Q
    ||||||| |||||||    
T  23072155 tttattcaatttggt 23072169  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 34014508 - 34014596
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  34014508 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactgtcgcaaacacatcccttaact 34014596  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33111837 - 33111747
Alignment:
Q  200 tttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33111837 tttaatcc-ctaaaaaaagatatcgttgtattacggaggtctataaaattttatagtgtatctcccacacctaatttatttactttcttctt 33111747  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33113426 - 33113306
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc-ttttat 175  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33113426 cttaattgatctaccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggt---------tttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttttat 33113336  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaat 205  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33113335 tcaatttggtccaattttgataattttaat 33113306  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 175
Target Start/End: Original strand, 50879513 - 50879594
Alignment:
Q  94 tcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50879513 tcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttcttaaacacgtcccttaaattattttttttat 50879594  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24376546 - 24376458
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  24376546 ggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 24376458  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34015896 - 34015829
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataa 132  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34015896 atttagtttaggcttaattgatttgtcggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcccataa 34015829  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27750549 - 27750461
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  27750549 ggctcaattgatctgccagtcctttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaattttttcaaacacatcccttaact 27750461  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53101891 - 53101827
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaa 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53101891 ggcttaattgatctgccggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcctataattcttaa 53101827  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 43392766 - 43392841
Alignment:
Q  235 gaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43392766 gaggtctatcagattttatagtgtaccaccaacaccaaatttatttattttcttcttcttcttccctcatcttcat 43392841  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 27749107 - 27749199
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||   |||||||||| ||||    
T  27749107 gcttaattgatctaccggttccttaacttatgtcttttattcaatttagtcacataagtcttaactttcttaaacgtatcccttaactcattt 27749199  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 35758064 - 35758116
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35758064 ggcttaatcaatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 35758116  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37610841 - 37610797
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaattt 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37610841 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattt 37610797  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 53764896 - 53764959
Alignment:
Q  221 accgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttacttt 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  53764896 accgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacttaattt-tttacttt 53764959  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 288
Target Start/End: Original strand, 53101697 - 53101735
Alignment:
Q  250 ttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53101697 ttatagtgtatcaccaacacttaatttatttactttctt 53101735  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21729426 - 21729382
Alignment:
Q  88 tgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataa 132  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21729426 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataa 21729382  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 23072199 - 23072274
Alignment:
Q  235 gaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  23072199 gagatctatcagattttatagtgtaccgccaacaccagatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 23072274  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Original strand, 23072140 - 23072172
Alignment:
Q  96 ccttaacttatttattttattcaatttggtccc 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23072140 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccc 23072172  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 34014526 - 34014558
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34014526 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 34014558  T

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Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32349155 - 32348939
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32349155 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcttataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 32349056  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32349055 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaat 32348956  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  32348955 ttatttactttcttctt 32348939  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 310
Target Start/End: Original strand, 32712345 - 32712587
Alignment:
Q  65 atttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  32712345 atttattttaggtttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcagtttggtcctataaatcttacatttctcaaatacgtctcttaactt 32712444  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacc 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32712445 atttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtaccacc 32712544  T
Q  265 aacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  32712545 aacacctaacttatttactttcttctt---cttccctcatcttcat 32712587  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11801460 - 11801247
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11801460 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 11801361  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11801360 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcattaacacctaat 11801261  T
Q  275 ttatttactttctt 288  Q
    ||||||||||||||    
T  11801260 ttatttactttctt 11801247  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32714001 - 32713785
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32714001 ggcttaattgatctgctggtcctgtaacttatttcttttattcagtttggttccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 32713902  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32713901 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgttggattacggaggtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaat 32713802  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  32713801 ttatttactttcttctt 32713785  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34996877 - 34996647
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34996877 cttaattgatttgtcggtccctgaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaacttatttcttttatt 34996778  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34996777 caatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 34996678  T
Q  277 atttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  34996677 atttactttcttctt---cttccctcatcttcat 34996647  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3000912 - 3000695
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3000912 tggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacctcccttaacttatttctttt 3000813  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3000812 attcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaacacagatcgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaa 3000713  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3000712 tttatttactttcttctt 3000695  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 34995351 - 34995586
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34995351 tggcttaattgatctgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtct-ttaacttatttctttt 34995449  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34995450 attcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaa 34995549  T
Q  274 tttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  34995550 tttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 34995586  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 18572885 - 18573100
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18572885 ggcttaattgatctgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttcttaaaaacgtcccttaacttatttctttta 18572984  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18572985 ttcaaattgggccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-gacactgttggattacggaggtctatcaaattttacagtgtatcaccaacacataat 18573083  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  18573084 ttatttactttcttctt 18573100  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 32347808 - 32348024
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32347808 ggcttaattgatctgctggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagtgatttctttta 32347907  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32347908 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacgggggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaat 32348007  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  32348008 ttatttactttcttctt 32348024  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29479312 - 29479146
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29479312 ggcttaattgatctgccgatcccttaaattatttcttttattcaatctggtcccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctttta 29479213  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtct 241  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  29479212 ttcaatttggtccaattttaataatttcaatcccctacgaaaagagacagttggattacagaggtct 29479146  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19383262 - 19383057
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta--tttcttttat 175  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||       |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19383262 ttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatt-------ataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattttttttttat 19383170  T
Q  176 tccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatt 275  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19383169 tcaatttgatctaattttgataattttaatgccctaaaaa--gagaccgttggattacgatggtctatcagattttatagtgtatca-caacatctaatt 19383073  T
Q  276 tatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||    
T  19383072 tatttactttcttctt 19383057  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18574415 - 18574301
Alignment:
Q  71 ttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18574415 ttttggcttaattgatctgccggtcccttgacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttct 18574316  T
Q  171 tttattccatttggt 185  Q
    ||||||| |||||||    
T  18574315 tttattcaatttggt 18574301  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Original strand, 21094517 - 21094615
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttacttt 285  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21094517 caattttgataactttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctactagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttacttt 21094615  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Original strand, 27719848 - 27719941
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 281  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719848 caattttgatgattttaatcccctaaaaaa-gagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 27719941  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21095348 - 21095281
Alignment:
Q  224 gttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21095348 gttggattacggaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttattctt 21095281  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Original strand, 29477757 - 29477827
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaacttt 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  29477757 ttggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 29477827  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 155
Target Start/End: Original strand, 19788248 - 19788327
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtc 155  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  19788248 gcttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatctcataagttttaactttcataaacacgtc 19788327  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18574271 - 18574165
Alignment:
Q  235 gaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttct-----ttccct-ttcctcatcttcatgcaaccttcaacaatttt 328  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  18574271 gaggtctatcagattttatagtgtaccaccaacaccggatttatttactttcttcttcttcttccctcatcctcatcttcattcaaccttcatcaatctt 18574172  T
Q  329 cttcatc 335  Q
    | |||||    
T  18574171 catcatc 18574165  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 19761942 - 19762022
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtc 155  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  19761942 ggcttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatcttataagttttaattttcataaacacgtc 19762022  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 276
Target Start/End: Original strand, 7628436 - 7628526
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatga-gaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||| ||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7628436 caattttgataatttcaatcccctaaaaaaaaaagaccgttagattatggagatctaccagatttcacagtgtatcaccaacacctaattt 7628526  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Original strand, 29477912 - 29477954
Alignment:
Q  247 attttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29477912 attttatggtgtatcaccaacacctgatttatttactttcttc 29477954  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 25138811 - 25138868
Alignment:
Q  92 ggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  25138811 ggtcccttaacttattttttcgattcaatttggtcccctaattttaaactgtctcaaa 25138868  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 7628312 - 7628388
Alignment:
Q  63 tgatttatttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaa 139  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| || ||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  7628312 tgattaatatttggcttaattgaactcccggtcccttaatttaattctttttgtcaaattggtcccataacttttaa 7628388  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 280
Target Start/End: Original strand, 18230452 - 18230536
Alignment:
Q  196 taattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| |||||| | ||||||  |||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18230452 taattttaatccgcttgaaaaagagaccattggataaaggaggttcatatgatttaacagtgtatcaccaacacctaattaattt 18230536  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 29477777 - 29477809
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29477777 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 29477809  T

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Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 19228840 - 19229054
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19228840 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgttccttaactgatttcttttatt 19228939  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19228940 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 19229039  T
Q  277 atttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||    
T  19229040 atttactttcttctt 19229054  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19230191 - 19229975
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19230191 ggcttaattgatctgccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttctttta 19230092  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19230091 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcatcaacacttaat 19229992  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  19229991 ttatttactttcttctt 19229975  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Original strand, 12372304 - 12372549
Alignment:
Q  66 tttattttt-ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactt 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12372304 tttatttttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttgttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaactt 12372403  T
Q  165 atttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcacc 264  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12372404 atttgttttattcaatttgatccaattttgataattttaataccctaaaaaaacataccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcacc 12372503  T
Q  265 aacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  12372504 aacacctaatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 12372549  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 39349480 - 39349696
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39349480 ggcttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataactcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctttta 39349579  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39349580 ctcaatttggttcaatttttataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgtttgattacggaggtctattagattttatcgtggatcaccaacacctaat 39349679  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  39349680 ttatttactttcttctt 39349696  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39350763 - 39350553
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39350763 ggcttaattgatatgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 39350664  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
     |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39350663 cttaatttggtccaatttttataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 39350564  T
Q  275 ttatttacttt 285  Q
    || ||| ||||    
T  39350563 ttttttgcttt 39350553  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9083419 - 9083216
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9083419 tttttggcttaattgatctgccggtttcttaattcatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactttttta 9083320  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9083319 ttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacac 9083220  T
Q  270 ctaa 273  Q
    ||||    
T  9083219 ctaa 9083216  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13278346 - 13278133
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  13278346 ttaattgatctgtcggtcccttaatttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttacttc 13278247  T
Q  178 catttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 277  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13278246 aatttgatccaattttgataattttaatcccatagaaaaagagaccgttggattagggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 13278147  T
Q  278 tttactttcttctt 291  Q
    |||||||| |||||    
T  13278146 tttactttattctt 13278133  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Original strand, 18654296 - 18654500
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654296 ggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 18654395  T
Q  175 tt-ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||   ||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18654396 ttaaaatttggtccaattttgatcattttaatcccattaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 18654495  T
Q  274 tttat 278  Q
    |||||    
T  18654496 tttat 18654500  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6803745 - 6803508
Alignment:
Q  72 tttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  6803745 tttggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcacataagtcttaattttctcaaacatgtttcttaacttatttctt 6803646  T
Q  172 ttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacct 271  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  6803645 ttattcaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaaaaacagaccgttagattac-aaagtctatcagattttatagtgtatcaccaacatct 6803547  T
Q  272 aatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  6803546 aatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 6803508  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Original strand, 13276813 - 13277026
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276813 attttaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttattt 13276912  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||        ||||||||    
T  13276913 cttttattcaatttggtcaaattttgataattttaatcccttaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtgtatcacatttta--------caccaaca 13277004  T
Q  269 cctaatttatttactttcttct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13277005 cctaatttatttactttcttct 13277026  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 277
Target Start/End: Original strand, 9081979 - 9082181
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9081979 ggcttaattgatctaccggttccttaactcatttcttttattcaatttgattccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 9082078  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  9082079 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaatgagaccgttggatcacggatgtctatcagattttatagtatatcgctaacacctaat 9082178  T
Q  275 tta 277  Q
    |||    
T  9082179 tta 9082181  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18655770 - 18655566
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18655770 ggcttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttta 18655671  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||| | ||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  18655670 ttcaatttggtccaactttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacgaaagtctatcagattttacggtgtatcaccaacaattaat 18655571  T
Q  275 ttatt 279  Q
    |||||    
T  18655570 ttatt 18655566  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12373839 - 12373603
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12373839 ggcttaattgatccgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttatttta 12373740  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatc----ctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacc 270  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||| | |||||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  12373739 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacactgtatcaccaacacc 12373640  T
Q  271 taatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  12373639 taatttatttactttcttctt---cttccctcatcttcat 12373603  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 310
Target Start/End: Original strand, 39164056 - 39164288
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc 169  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||     ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39164056 ttttaggcttaattgatctgctggtccattaactt-----ttttattcaatttagtctcataagtcttaactttatcaaacacgtcccttaacttatttc 39164150  T
Q  170 ttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacac 269  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||  |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39164151 ttttattcaatttggtccaattttgat-attttaatcc-cttaaaaaaaagactgttgaattacggaggcctatcaaattttatagtgtatcaccaacac 39164248  T
Q  270 ctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  39164249 ctaatttatttacttttttc-ttctttttcctcatcttcat 39164288  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 8447077 - 8447185
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8447077 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 8447176  T
Q  175 ttccatttg 183  Q
    ||| |||||    
T  8447177 ttcaatttg 8447185  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 291
Target Start/End: Original strand, 4031903 - 4032039
Alignment:
Q  157 cttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||    
T  4031903 cttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatccactaaaaaaagagaccgttgaattacggaagtctaccagattttatagt 4032002  T
Q  257 gtatcaccaacacctaatt--tatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4032003 gtatcaccaacacctaatttatatttactttcttctt 4032039  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4033060 - 4032927
Alignment:
Q  158 ttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtg 257  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  4033060 ttaacttattttttttatttaacttggtccaattttaataattttaatccactaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatg 4032961  T
Q  258 tatcaccaacacctaatttatttactttcttctt 291  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4032960 tatcattaacacctagtttatttactttcttctt 4032927  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 6801977 - 6802075
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801977 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttttttaatttggtctcataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 6802075  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35952559 - 35952464
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35952559 ttttaggcttaactgatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaactttgtcaaacgcgtcccttaactta 35952464  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Original strand, 42962122 - 42962232
Alignment:
Q  179 atttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 278  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||       
T  42962122 atttggtcctattttattaattttaaacctctcaaaaagaagaccgttggataaaggaggtctataagatctaatggtgtatcaccaacacctaattata 42962221  T
Q  279 ttactttcttc 289  Q
    |||||||||||    
T  42962222 ttactttcttc 42962232  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 127
Target Start/End: Original strand, 4031876 - 4031933
Alignment:
Q  70 tttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4031876 tttttggcttaattgatctgccggtcacttaacttatttcttttattcaatttagtcc 4031933  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Original strand, 25001643 - 25001730
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  25001643 gcttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatttcataagtcttaactttcgcaaactggtccctcaact 25001730  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3944750 - 3944662
Alignment:
Q  157 cttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataa 245  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  3944750 cttaacttattatttttatttaatttgatccaattttaataattttaataccataaaaaaagtgaccattggattacggaagtctataa 3944662  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 310
Target Start/End: Original strand, 14356562 - 14356662
Alignment:
Q  211 aaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta-tttactttcttctttccctttcctcatcttca 309  Q
    |||||| |||||| |||||| |  ||||||||| | || | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  14356562 aaaaaaagagaccattggatgaatgaggtctatcacatctaattgtgtatcaccaacacctgatttattttactttcttcatcttctttcctcatcttca 14356661  T
Q  310 t 310  Q
    |    
T  14356662 t 14356662  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30674829 - 30674746
Alignment:
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| || | |   |||||||||||||||||||||||||    
T  30674829 aattttaatctcctaaaaaaggagaccgttgaataaaggaggtctgtaagatctaaccatgtatcaccaacacctaatttattt 30674746  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4033081 - 4033031
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4033081 cttaattgatctgtcgatcctttaacttattttttttatttaacttggtcc 4033031  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 8447095 - 8447127
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8447095 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 8447127  T

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Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 16602724 - 16602941
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16602724 tggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 16602823  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16602824 atttaaattggtccaattttgataattttaatccctaaaaaaaaaagaccgttggattacggatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaa 16602923  T
Q  274 tttatttactttcttctt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16602924 tttatttactttcttctt 16602941  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38244073 - 38243857
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38244073 ggcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttta 38243974  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  38243973 ttcaatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagatactgttggattacaaaggtgtataagattttacagtgtattaccaacaccaaat 38243874  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  38243873 ttatttactttcttctt 38243857  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27892454 - 27892219
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27892454 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttctttta 27892355  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27892354 ttcaatttgatccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 27892255  T
Q  275 ttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  27892254 ttatttactttttttttcttcttccctcatcttcat 27892219  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Original strand, 23832967 - 23833165
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23832967 tggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttattttattccatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcc-ttaacttttttatttt 23833065  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23833066 attcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaagaagaccgttggattacggaggtctagaagattttatagtgtatcatcaacacctaa 23833165  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Original strand, 27891106 - 27891322
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27891106 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataggtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 27891205  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||     ||||||  |||||||| ||||||| | |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27891206 ttcattttggttcaattttgataattttaataaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaatgtctatcagattttccagtgtatcaccaacacctaat 27891305  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  27891306 ttatttactttcttctt 27891322  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 252
Target Start/End: Original strand, 26388220 - 26388395
Alignment:
Q  77 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26388220 cttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 26388319  T
Q  177 ccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26388320 taatttgattcaattttgataattttaatcccatataaaaaaagaccgtttgattacggaggtctatcagatttta 26388395  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 293
Target Start/End: Original strand, 38242943 - 38243098
Alignment:
Q  135 tttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacg 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  38242943 tttaactttttcaaacatgtctcttaacttatttcttttatttaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattaca 38243042  T
Q  235 gaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttc 293  Q
     ||   ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38243043 aag---tataagattttataatgtatcaccaacaccaaatttatttactttcttctttc 38243098  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16604307 - 16604197
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16604307 ggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaagtttctcaagcacgtccctgaacttatttctttta 16604208  T
Q  175 ttccatttggt 185  Q
    ||| |||||||    
T  16604207 ttcaatttggt 16604197  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Original strand, 43814519 - 43814629
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttt 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43814519 ttggcttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttcgtctcataagtcttaactttctcaaatacgtcctttaacttatttcttt 43814618  T
Q  173 tattccatttg 183  Q
    ||||| |||||    
T  43814619 tattcaatttg 43814629  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23833988 - 23833898
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaactta 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23833988 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 23833898  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 5033476 - 5033566
Alignment:
Q  73 ttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5033476 ttggcttaatagatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttctcaaatacatcccttaact 5033566  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5034934 - 5034846
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5034934 ggcttaattgatttgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggttctataacttttaactttctcaaacacatcccttaact 5034846  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19577443 - 19577359
Alignment:
Q  76 gcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtccctta 160  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||| || |||||||    
T  19577443 gcttaattgatctcccggtcccttaacttatttcttttagtcaatttggtcccataactcttaactttaacaaagacatccctta 19577359  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 289
Target Start/End: Original strand, 370885 - 370976
Alignment:
Q  198 attttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  370885 attttaaacctctaaaaaataagaccgttggataaatgaggtctatcaaatctaatggtgtatcaccaacacctaattatattactttcttc 370976  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Original strand, 15496083 - 15496133
Alignment:
Q  113 tattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaact 163  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15496083 tattcaatttggtcccataagtcttaactttcacaaacacgtcccttaact 15496133  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43814696 - 43814642
Alignment:
Q  78 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataa 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43814696 ttaattgatctgtcggtcccctaacatatttcttttattcaatttggtctcataa 43814642  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 276
Target Start/End: Original strand, 44800984 - 44801073
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  44800984 caattttgataatttcaatcccctaaaaaacaagaccgttggattatagaggtttaccagatttcacagtgtatcaccaacacctgattt 44801073  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Original strand, 5033631 - 5033673
Alignment:
Q  247 attttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5033631 attttatagtgtatcaccaacatttaatttatttactttcttc 5033673  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16604155 - 16604092
Alignment:
Q  247 attttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  16604155 attttatagtgtaccaccaacactggatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 16604092  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35409 - 35202
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35409 atttttggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttattt 35310  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  35309 cttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaaca 35210  T
Q  269 cctaattt 276  Q
    ||||||||    
T  35209 cctaattt 35202  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 31033 - 31234
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31033 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 31132  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
     || ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31133 ctcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 31232  T
Q  275 tt 276  Q
    ||    
T  31233 tt 31234  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 79403 - 79610
Alignment:
Q  69 atttttggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  79403 atttttggcttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttattt 79502  T
Q  169 cttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaaca 268  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  79503 cttttactcaatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaaca 79602  T
Q  269 cctaattt 276  Q
    ||||||||    
T  79603 cctaattt 79610  T

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Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 83779 - 83578
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  83779 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttctttta 83680  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
     || ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  83679 ctcaatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaat 83580  T
Q  275 tt 276  Q
    ||    
T  83579 tt 83578  T

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Target: scaffold0878 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3145 - 2934
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3145 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttctttta 3046  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcc-tctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaa 273  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3045 ttcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 2946  T
Q  274 tttatttacttt 285  Q
    ||||||||||||    
T  2945 tttatttacttt 2934  T

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Target: scaffold0878; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 1847 - 2003
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaatttta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||   |||||||| ||||||| | |||||| | |||||     
T  1847 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaatttt-ataattttaatccaaaaaaaatatagaccgttagattacgaatgtctattagattttc 1945  T
Q  253 tagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  1946 cagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 2003  T

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Target: scaffold0878; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 127
Target Start/End: Original strand, 1847 - 1881
Alignment:
Q  93 gtcccttaacttatttattttattcaatttggtcc 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1847 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 1881  T

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Target: scaffold1425 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1425
Description:

Target: scaffold1425; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1719 - 1503
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  1719 ggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttccttta 1620  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  1619 ttcaatttggtccaattttgataattttaatcccttaaaaaaacagaccgttggattatagaggtctatcagattttacggtgtataaccaacacctaat 1520  T
Q  275 ttatttactttcttctt 291  Q
    || ||||||||||||||    
T  1519 ttttttactttcttctt 1503  T

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Target: scaffold1425; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Original strand, 134 - 343
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  134 ggcttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttccttta 233  T
Q  175 ttccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaat 274  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  234 ttcaatttggtcaaattttgataattttaattccttaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagcgtatcaccaacacctaat 333  T
Q  275 ttatttacttt 285  Q
    || ||||||||    
T  334 tt-tttacttt 343  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25464 - 25252
Alignment:
Q  74 tggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 173  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25464 tggcttaattgatctgccgctcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttctttt 25365  T
Q  174 attccatttggttcaattttgataattttaatcctctaaaaaatga-gaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacaccta 272  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  25364 attaaatttggtccaattttgataattttaatcatttaaaacaagaggacagttggattacggaggtttatcacattttatagtgtattatcaacaccta 25265  T
Q  273 atttatttacttt 285  Q
    |||||||||||||    
T  25264 atttatttacttt 25252  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 104301 - 104403
Alignment:
Q  75 ggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttattttattcaatttggtcccataatttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104301 ggcttaattgatttgacggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttctttta 104400  T
Q  175 ttc 177  Q
    |||    
T  104401 ttc 104403  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 104405 - 104486
Alignment:
Q  229 attacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttcttctttccctttcctcatcttcat 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  104405 attacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaatttatttactttcttcttcttcttccctcatcttcat 104486  T

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Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 185
Target Start/End: Original strand, 104319 - 104351
Alignment:
Q  153 gtcccttaacttatttcttttattccatttggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  104319 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggt 104351  T

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Target: scaffold0349 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Original strand, 9270 - 9363
Alignment:
Q  187 caattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 281  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9270 caattttgatgattttaatcccctaaaaaa-gagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttattta 9363  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22465 - 22351
Alignment:
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttatttactttct-tctttccc 295  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| |||| | | ||||||| || || | |  |||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||      
T  22465 aattttaatcctataaaaaagaagaccgtcggataaagaaggtctacaagatctaacggtgtatcatcaacacataatttttttactttttctctttctt 22366  T
Q  296 tttcctcatcttcat 310  Q
    |||||||||||||||    
T  22365 tttcctcatcttcat 22351  T

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Target: scaffold0081 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43003 - 42923
Alignment:
Q  197 aattttaatcctctaaaaaatgagaccgttggattacggaggtctataaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttattt 280  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |   ||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43003 aattttaatcctccgaaaatggagaccgttggataa---aggtccatgagatttaacagtgtatcaccaacacctaatttattt 42923  T

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