View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3605_low_7 (Length: 584)

Name: NF3605_low_7
Description: NF3605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3605_low_7
NF3605_low_7
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (12-329)||(51191871-51192188)
chr3 (12-331)||(8457718-8458037)
chr3 (14-331)||(51951757-51952074)
chr3 (13-331)||(21689560-21689876)
chr3 (14-331)||(55218647-55218964)
chr3 (12-331)||(43018354-43018673)
chr3 (12-317)||(13443953-13444259)
chr3 (33-290)||(39133522-39133777)
chr3 (12-182)||(39383422-39383592)
chr3 (12-304)||(26400024-26400316)
chr3 (202-331)||(39371318-39371447)
chr3 (28-131)||(7622657-7622759)
chr3 (120-316)||(23487893-23488089)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (12-331)||(48446467-48446786)
chr4 (12-329)||(33846131-33846448)
chr4 (12-331)||(26006084-26006403)
chr4 (12-311)||(26429191-26429490)
chr4 (12-317)||(2536978-2537283)
chr4 (12-315)||(52759126-52759429)
chr4 (12-331)||(17423821-17424140)
chr4 (12-331)||(35852980-35853299)
chr4 (9-331)||(9034719-9035028)
chr4 (17-331)||(54552427-54552740)
chr4 (12-331)||(8169324-8169642)
chr4 (12-331)||(12274001-12274320)
chr4 (12-268)||(25058303-25058559)
chr4 (12-331)||(22359240-22359558)
chr4 (106-331)||(791766-791991)
chr4 (12-258)||(19396165-19396411)
chr4 (334-442)||(26939720-26939828)
chr4 (495-563)||(26939881-26939949)
chr4 (27-142)||(23860006-23860121)
chr4 (12-84)||(791992-792063)
chr4 (231-311)||(11307069-11307149)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (12-331)||(9360563-9360882)
chr7 (12-331)||(42851786-42852108)
chr7 (17-311)||(25611367-25611661)
chr7 (12-331)||(4595029-4595348)
chr7 (12-311)||(23362130-23362429)
chr7 (12-311)||(3962293-3962592)
chr7 (12-329)||(40187181-40187499)
chr7 (14-331)||(30466489-30466808)
chr7 (12-256)||(14160360-14160604)
chr7 (12-331)||(5866053-5866357)
chr7 (62-331)||(24267771-24268040)
chr7 (12-197)||(8150854-8151039)
chr7 (12-205)||(9026511-9026701)
chr7 (44-209)||(28423910-28424075)
chr7 (48-292)||(35827427-35827671)
chr7 (12-127)||(6596171-6596286)
chr7 (12-188)||(21946923-21947086)
chr7 (89-201)||(33336093-33336205)
chr7 (12-178)||(2405146-2405311)
chr7 (28-155)||(49079074-49079201)
chr7 (260-331)||(33336221-33336292)
chr7 (124-174)||(34899048-34899098)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (12-331)||(26937-27256)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (12-331)||(23769774-23770093)
chr2 (12-331)||(24477475-24477794)
chr2 (12-331)||(38451692-38452010)
chr2 (12-331)||(45085984-45086303)
chr2 (28-331)||(10213639-10213942)
chr2 (12-317)||(23407748-23408052)
chr2 (12-235)||(22605835-22606058)
chr2 (48-331)||(40074065-40074345)
chr2 (12-131)||(31411364-31411483)
chr2 (12-301)||(27177575-27177864)
chr2 (12-287)||(1604721-1604995)
chr2 (12-122)||(11616661-11616771)
chr2 (37-136)||(32025536-32025635)
chr2 (39-105)||(28317799-28317865)
chr2 (12-73)||(20214282-20214343)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (12-311)||(32957279-32957578)
chr6 (12-331)||(7597381-7597700)
chr6 (12-279)||(7435615-7435882)
chr6 (12-331)||(12523432-12523730)
chr6 (12-157)||(7608473-7608618)
chr6 (191-329)||(7607711-7607849)
chr6 (14-156)||(6192539-6192681)
chr6 (15-126)||(34183123-34183234)
chr6 (12-304)||(13405966-13406258)
chr6 (28-280)||(31797991-31798243)
chr6 (17-83)||(29025240-29025306)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-311)||(186967-187266)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (12-311)||(9609501-9609800)
chr5 (12-331)||(29242107-29242426)
chr5 (12-311)||(30796797-30797096)
chr5 (15-331)||(1721792-1722108)
chr5 (129-331)||(27452586-27452787)
chr5 (12-154)||(39860924-39861066)
chr5 (12-129)||(36978727-36978847)
chr5 (106-184)||(4052831-4052909)
chr5 (242-331)||(39860774-39860863)
chr5 (12-66)||(16007131-16007185)
chr5 (28-84)||(4052910-4052966)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (12-330)||(5839587-5839905)
chr8 (12-312)||(25663345-25663645)
chr8 (12-311)||(32577878-32578191)
chr8 (28-331)||(36530957-36531260)
chr8 (12-174)||(11503068-11503230)
chr8 (12-162)||(32282842-32282992)
chr8 (12-209)||(14219795-14219992)
chr8 (12-149)||(40395242-40395377)
chr8 (21-163)||(10342351-10342497)
chr8 (211-256)||(32283002-32283047)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (38-331)||(216283-216576)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (28-331)||(2214-2517)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (12-301)||(6564-6853)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (12-331)||(58220-58540)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (12-287)||(5156-5431)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (12-154)||(48522162-48522304)
chr1 (106-331)||(25070898-25071123)
chr1 (168-331)||(48518882-48519045)
chr1 (12-331)||(19956354-19956673)
chr1 (12-145)||(26347349-26347482)
chr1 (28-290)||(11079803-11080065)
chr1 (28-84)||(25070841-25070897)
chr1 (28-78)||(15393518-15393568)
chr1 (123-208)||(25698534-25698619)
chr1 (122-166)||(15327479-15327523)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (17-100)||(5316-5399)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (12-91)||(20691-20770)
scaffold0201 (123-316)||(20493-20686)
[»] scaffold0548 (1 HSPs)
scaffold0548 (231-311)||(3847-3927)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (162-269)||(9069-9176)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 51191871 - 51192188
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  51191871 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtacagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcaatctagca 51191970  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  51191971 aagctatgaacgacttcgttggcttgtctctgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagacgtctacagtcattgattactacac 51192070  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51192071 taaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaaccca 51192170  T
Q  312 atacatgactgataataa 329  Q
     |||||||||||||||||    
T  51192171 gtacatgactgataataa 51192188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8458037 - 8457718
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||    
T  8458037 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccattatagca 8457938  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| |||||||    
T  8457937 aagctataagcgacttcattggcttgtcttcgaataaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggtgtctacaatcattgataactgcgc 8457838  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    | |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8457837 tgaaattagagacgtcacttttactgccataaaggctatctaccataattttggaatcaagcacaaagtccacaattcctagctgcagatcgcgaaccca 8457738  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  8457737 gtacatggctgataataaac 8457718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51952074 - 51951757
Alignment:
Q  14 aagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaa 113  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  51952074 aagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgtaaagccactctagcaaa 51951975  T
Q  114 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgcta 213  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51951974 actatgagcgaattcattggcttgtcttcgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactgcgcaa 51951875  T
Q  214 aaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaat 313  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51951874 aaattagagaccccacttttcctgtcataaagactatccaccacacttttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctacagatcacgaacctaat 51951775  T
Q  314 acatgactgataataaac 331  Q
    |||||  |||||||||||    
T  51951774 acatggttgataataaac 51951757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21689876 - 21689560
Alignment:
Q  13 gaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaa 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21689876 gaagtaacttattgtatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccactctagcaa 21689777  T
Q  113 agctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgct 212  Q
    ||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  21689776 agct--gagtgacttcgttgacttgtctctgaataaacctaacatcagaggttactagattagaagctaacaagcgtctacattcattgattactgcgct 21689679  T
Q  213 aaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaa 312  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21689678 aaaattagagacgtcacttttactaccataaaaactatctaccacagttttgaaatcaagctcaaagttcacaatacccagctgcagatcgcgaacccaa 21689579  T
Q  313 tacatgactgataataaac 331  Q
    | ||| | |||||||||||    
T  21689578 tgcattattgataataaac 21689560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Original strand, 55218647 - 55218964
Alignment:
Q  14 aagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaa 113  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55218647 aagaaacttattgcatttcatttatgataatagtagaggtacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaa 55218746  T
Q  114 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgcta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||    
T  55218747 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaatgcgcta 55218846  T
Q  214 aaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaat 313  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  55218847 aaattagatacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagttcacaatacctagttgcagatcacagacccagt 55218946  T
Q  314 acatgactgataataaac 331  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  55218947 acattgctgataataaac 55218964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 43018354 - 43018673
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  43018354 agaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactatagca 43018453  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  43018454 aaactatgagcaactttgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctatagtctttgattactgcgc 43018553  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||| |||    
T  43018554 taaaattagagacgtcacttttaataccataaagactatctaccacggttttgaaatcaaactcaaagtccacaatatctagttgcagatcgtgaatcca 43018653  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  43018654 atacatggctgataataaac 43018673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13444259 - 13443953
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtag-agatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagc 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||  | ||     
T  13444259 agaagaaacttattgtatttcattcataatgatagtaggagataaaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacgtgaagccaaccgagg 13444160  T
Q  111 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13444159 aaagctatgagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagtggttgctaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattaattactgcg 13444060  T
Q  211 ctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccc 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  13444059 ctaaaattagagacgccacttttactaccataaggactatccaccacaattttggaattaagctcaaagtccacaatacccagttgtagatcacgaaccc 13443960  T
Q  311 aatacat 317  Q
    |||||||    
T  13443959 aatacat 13443953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39133777 - 39133522
Alignment:
Q  33 attcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39133777 attcaaaataatagtagagatacaagattgaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgacttcgttg 39133678  T
Q  133 gcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattt 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||| || |||    
T  39133677 gcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaaacgtctacaatcattaattac--cgctaaaattagagacgtcacttt 39133580  T
Q  233 tactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacc 290  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  39133579 tactaccataaagattatctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacc 39133522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39383592 - 39383422
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39383592 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaaaatggaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaaaccactcgagca 39383493  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  39383492 aagctatgaacgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagaggttattaaattagaagctaa 39383422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26400316 - 26400024
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    ||||||    
T  26400316 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaatatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaaactttcctagca 26400217  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||  ||||||  ||| ||| ||  || ||| ||||||||| | ||| |    
T  26400216 aaactatgagcgactttgttggcttgtctatgaataaacctaacatcagaggtttctaaatctaaaggtaagaggtgtctaccgtcattgatcaatgcac 26400117  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcac 304  Q
    || ||||| ||| | || ||||||| ||||||||| |||| || | |  ||||||||||| |||||| || | |||||| | ||||| |||||    
T  26400116 tataattagagatgtcacttttactaccataaagattatcaactacatgtttggaatcaagctcaaaatccataatacccaactgcaaatcac 26400024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39371447 - 39371318
Alignment:
Q  202 attactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagat 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  39371447 attactgcgctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatttatcacaattttggaatcaatctcaaagtccacaatacctgactccagat 39371348  T
Q  302 cacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    | |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  39371347 cgcgaacccagtacatggttgataataaac 39371318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7622759 - 7622657
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||  ||||||| |||| ||||| ||    
T  7622759 atttcatttataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcat-acgcgaagccaccttagcaaatctataagcgattt 7622661  T
Q  128 cgtt 131  Q
    ||||    
T  7622660 cgtt 7622657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23488089 - 23487893
Alignment:
Q  120 agcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaatta 219  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |  | ||  ||||||| |||||||||  ||| |||| ||| | || ||||| ||| |||||    
T  23488089 agcgacttcgtaggcttgtctctgattaaacctaacatcatcaattgctaaatcacaagctaacatgcgtctacaatcaattataactgcactataatta 23487990  T
Q  220 aagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaataca 316  Q
       |||  | |||| || ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||   |||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23487989 gtaacgttactttttctaccatagagactatccaccacatttttggaatcaaggccaaaatccacaatacctagctatagatcacgcacccaataca 23487893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48446786 - 48446467
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  48446786 agaagaaatttattgtatttcattcataataatagtagagatataagatggaaccataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagca 48446687  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48446686 aagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatctgaagctaacagacgtctaccgtcattgattactgcgc 48446587  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48446586 taaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttgaaatcaagttcaaagtccacaatacctagttgcaggtcgcgaaccca 48446487  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  48446486 atacatggctgataataaac 48446467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33846448 - 33846131
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33846448 agaagaaacttattgcatttcattcagaataatagtagaaatacaagatggaatcctaatgtgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 33846349  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33846348 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacaccagaggttaccaaatcagaagctaacaaacgtctatagtcattgattactgcgc 33846249  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33846248 taaaattagatatgccacttttactgccataaagactatctaccaaaattttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgtagatcacgaaccca 33846149  T
Q  312 atacatgactgataataa 329  Q
     |||||| ||||||||||    
T  33846148 gtacatggctgataataa 33846131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 26006084 - 26006403
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26006084 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcaagca 26006183  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |     
T  26006184 aaactatgagcgacttcgttggcttgtctctgaataaacctaacatcagaagttactacatcagaagctaacaggggtctacagtcattgattactgtga 26006283  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26006284 taaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacatttttgaaatcaagctcaaattccacaatacctagctggacatcacgaaccca 26006383  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     |||||  ||||||||||||    
T  26006384 gtacatagctgataataaac 26006403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 26429191 - 26429490
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26429191 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 26429290  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  26429291 aagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 26429390  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26429391 taaaattaaagacgccactagtactaccataaagactgtttaccataattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttggagatcacgaaccca 26429490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 317
Target Start/End: Original strand, 2536978 - 2537283
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  2536978 agaagaaacttattgcattttattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaacatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagca 2537077  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |    
T  2537078 aagttataagagacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgattactgcac 2537177  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  2537178 taaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctatatgtagatcgcgaaccca 2537277  T
Q  312 atacat 317  Q
     |||||    
T  2537278 gtacat 2537283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Original strand, 52759126 - 52759429
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  52759126 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtatagatacacgatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactctaaca 52759225  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  52759226 aaactatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacatgcgtctacaatcattgattactgcgc 52759325  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52759326 taaaattagagacgccagttttaataccataaagactatctatcacggttttggaatcaaactcaaagttcacaatacctagttgcagatcgcgaaccca 52759425  T
Q  312 atac 315  Q
    ||||    
T  52759426 atac 52759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 17423821 - 17424140
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  17423821 agaagaaacttattgaatttcattcatgataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgactcgaagccactctagca 17423920  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17423921 aagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcataggttgccaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgatcactgcgc 17424020  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17424021 taaaattagagacgccacaattactaccatagagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgtagatcgcaaaccca 17424120  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||  | ||||||||||    
T  17424121 atacattgcagataataaac 17424140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35853299 - 35852980
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35853299 agaagaaacttattgcatttaattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 35853200  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | || |||||||    
T  35853199 aaactatgagcgacttcgttgacttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaacagaagtctacaatcactaataactgcgc 35853100  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35853099 taaaattagagatgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaacaca 35853000  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     | |||  ||||||||||||    
T  35852999 gtgcattgctgataataaac 35852980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9035028 - 9034719
Alignment:
Q  9 acgagaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactcta 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||       
T  9035028 acgagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact--- 9034932  T
Q  109 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactg 208  Q
              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||    
T  9034931 ----------gaccgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactg 9034842  T
Q  209 cgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaac 308  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  9034841 cgctaaaattagaaacgccaatattactaccataaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagattgcgaac 9034742  T
Q  309 ccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  9034741 ccaatacatggctgataataaac 9034719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54552740 - 54552427
Alignment:
Q  17 aaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagct 116  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54552740 aaacttattgcatttcattcataataatagcaaagatacaagaaggaatcctgatatgaatatgaaatctagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 54552641  T
Q  117 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaa 216  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  54552640 atgaccgacttcgttagcttgtatccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaataggcgtatacaatcatttattactacgctaaaa 54552541  T
Q  217 ttaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaataca 316  Q
     || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  54552540 -tagagatgccatttttactaccataaagactatctacgacaattttgaaatcaagctcaaagtccataatacccagctgcagatcacgaacccagtaca 54552442  T
Q  317 tgactgataataaac 331  Q
    |  ||||||||||||    
T  54552441 tagctgataataaac 54552427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 8169324 - 8169642
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||  ||||||    
T  8169324 agaagaaacttattgcatt-cattcataataatagtagagatataaggtggaattctaatatgaataatgaaactagcatgacgcgaagccatcctagca 8169422  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||| |||| |||||    
T  8169423 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacaatcattaattaatgcgc 8169522  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8169523 taaaataaaagacaccacttttactaccataaagattatccgccacagttttgaaatcaaactcaaagtccataatatccagctgcagatcacgaaccca 8169622  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||| || || ||||||||||    
T  8169623 ataaattacagataataaac 8169642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12274320 - 12274001
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  12274320 agaaaaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatagaaactaacatgacacaaagttactctagca 12274221  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  12274220 aagctaagagcgacttcgttggcttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcatctacagtcattgattactgcgc 12274121  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    | |||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||  || | ||| || |||||    
T  12274120 tgaaattagaggtgccacttttactaccataaagactatcagccacagttttggaatcaagctcaaagttcacaatacctaattgtatatcgcggaccca 12274021  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     ||||| ||| |||||||||    
T  12274020 gtacatcactaataataaac 12274001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 25058303 - 25058559
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  25058303 agaagaaacttactatattttattcataataatagtagagatacaagattgaatcttaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaagccagtctaaca 25058402  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  25058403 aaactatgagcgacttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcagatgttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaattactgcgc 25058502  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaat 268  Q
    |||||||| | | |  | ||||||| ||||||||| |||  |||| | |||||||||    
T  25058503 taaaattagatatgttacttttactaccataaagattattcaccacacttttggaat 25058559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 22359240 - 22359558
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||    
T  22359240 agaacaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactaaagca 22359339  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| | |  ||| | ||||||||||| ||    
T  22359340 aaactatgagtgacttcgttggcttgtattcgaataaa-caaacatcagagattactaaatcagaagctaacaggcatcgacaataattgattactgtgc 22359438  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |||    
T  22359439 taaaattagagacgtcacttttactgttataaagactatataccacagttttgaaatcaaactcaaagtccacaatacctagttacaaatcacgaatcca 22359538  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  22359539 gtacatggctgataataaac 22359558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 791991 - 791766
Alignment:
Q  106 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgatta 205  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  791991 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacagacgtctacaatcattgatca 791892  T
Q  206 ctgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacg 305  Q
    |||||||||||||| |||| |||   ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||  || |||||||| ||    
T  791891 ctgcgctaaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccagaatactcagttgcagatcgcg 791792  T
Q  306 aacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  791791 aacccaatacattgctgataataaac 791766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 19396165 - 19396411
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||  |||||    
T  19396165 agaaaaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatacaatcttaatatgaatgtgaaaactagtatgacgcaaagccaccatagca 19396264  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| ||| |    
T  19396265 aaactataagcgactttattggcttgtctccgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagctaacaaacatttacaattatttattattgcac 19396364  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccata 258  Q
    || ||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19396365 tataattagagacgacacttttacaaccataaagactatccaccata 19396411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 334 - 442
Target Start/End: Original strand, 26939720 - 26939828
Alignment:
Q  334 tggactttgtttatcctgtaaatnnnnnnnnttcgtaccagcgttttagcaccacattgtatggtattcatttttccaatcacatttcaattcatcgaac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26939720 tggactttgtttatcctgtaaataaaaaaaattcgtaccagcgttttagcaccacattgtatggtattcatttttccaatcacatttcaattcatcgaac 26939819  T
Q  434 aattgtagc 442  Q
    |||||||||    
T  26939820 aattgtagc 26939828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 495 - 563
Target Start/End: Original strand, 26939881 - 26939949
Alignment:
Q  495 ctatatcatattattgtaaatagatattgtgtacttttgatctttattacatacattatacaaccttac 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26939881 ctatatcatattattgtaaatagatattgtgtacttttgatctttattacatacattatacaaccttac 26939949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Original strand, 23860006 - 23860121
Alignment:
Q  27 tatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgact 126  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  23860006 tattgcattcattatagtagtagagatacgagatgaaatcgtaatatgaatatgaaaattattatgatgcaaaatcactctagtaaagctatgagcgatt 23860105  T
Q  127 tcgttggcttgtctcc 142  Q
    |||||| ||| |||||    
T  23860106 tcgttgacttatctcc 23860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 792063 - 791992
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaa 84  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  792063 agaagaaatttattgcatttcattcataataat-gtagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaa 791992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 11307069 - 11307149
Alignment:
Q  231 tttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  11307069 tttacttccatatagactatccaccacagttttggaatcaatctcaaagtccacaatatccaactgaagatcacgaaccca 11307149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9360882 - 9360563
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  9360882 agaagaaacttattgtatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaactactctagca 9360783  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9360782 aaactatgatcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaaacagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactgcgc 9360683  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  9360682 taaaattagaaacgccacttttactgccataaagactatctatcacatttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctaactggagatcgcgaaccca 9360583  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  9360582 atacatggctgataataaac 9360563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42852108 - 42851786
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagta---gagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactcta 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  42852108 agaagaaacttattccatttcattcataataataataatagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccacgtta 42852009  T
Q  109 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactg 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  42852008 gcaaaactatgagcgacttcgttggattgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacacgcgtctacagtcattgattactg 42851909  T
Q  209 cgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaac 308  Q
    | ||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  42851908 cactaaaattagatacgccacttttaataccataaagactatctaccacggttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaac 42851809  T
Q  309 ccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42851808 ccaatacatgactgataataaac 42851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 25611367 - 25611661
Alignment:
Q  17 aaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagct 116  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611367 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 25611466  T
Q  117 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  25611467 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaa 25611566  T
Q  217 ttaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    ||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25611567 ttagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 25611661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 4595029 - 4595348
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||    
T  4595029 agaataaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacagaaaaccactctagca 4595128  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4595129 aaactatgagcgacttcgttggtttgtctccgaacaaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattgattattgcgc 4595228  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    | |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4595229 ttaaattagagacgccacattttctgccataaagactatataccacaattttggaatcaagcttaaagtccaaaatacctagttgcagatcgcgaactca 4595328  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     ||||||  |||||||||||    
T  4595329 gtacatggttgataataaac 4595348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23362429 - 23362130
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23362429 agaagaaatttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 23362330  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  23362329 aagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaatgaaccttacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 23362230  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23362229 taaaattagagacaccacttttcctaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 23362130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 3962293 - 3962592
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3962293 agaagaagcttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatacgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 3962392  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||    
T  3962393 aagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactgcgc 3962492  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3962493 taaaattagagacgccactattactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcgagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 3962592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40187499 - 40187181
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  40187499 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcaagacgcaaaaccactctaaca 40187400  T
Q  112 aag-ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcg 210  Q
    ||  ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40187399 aaaactatgagtgttttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagttaacaagcgtctacagtcattgattactgcg 40187300  T
Q  211 ctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccc 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40187299 ctaaaattagagacgccacttttattgccataaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagtccacactacctagctgcagatcgcgaaccc 40187200  T
Q  311 aatacatgactgataataa 329  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  40187199 attaaatggctgataataa 40187181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30466808 - 30466489
Alignment:
Q  14 aagaaacttattatatttcattcataa--taatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  30466808 aagaaacttattgcatttcattcaaaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgcaaagccactctagca 30466709  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  30466708 aaactatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacttcagaggttactatatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 30466609  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30466608 taaaattagagacgccacttttactatcataaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaaccca 30466509  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     | |||  ||||||||||||    
T  30466508 gtgcattgctgataataaac 30466489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14160604 - 14160360
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14160604 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagaaggaatcctaatatgaatacgcaaactagcatgacgcaaagccactctagca 14160505  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||    
T  14160504 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattgcgc 14160405  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctacca 256  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||    
T  14160404 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctacca 14160360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5866357 - 5866053
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  5866357 agaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaattaacatgacacgaagccactctagga 5866258  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||  ||| || |||||||||| | |||      
T  5866257 aagctatgagcaattttgtttgcttgtctccgaataaacctaac---------------atcagaagctaacatgcgtctatagtcattgatcattgcag 5866173  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5866172 taaaattagagacgccacatttactaccataaagattatctaccacaattttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaaccta 5866073  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  5866072 atacactactgataataaac 5866053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 331
Target Start/End: Original strand, 24267771 - 24268040
Alignment:
Q  62 aaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattaga 161  Q
    ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24267771 aaatcctaacataaatatggaaactaacatgacgcaaagtcatcctagcaaaactatgagcgacttcattgacttgtctctgaataaacctaacattaga 24267870  T
Q  162 agttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataatt 261  Q
     |||| |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  24267871 ggttactaaatcagaaactaacaagcgtctacaatcattaattactgcgctaaaattagagacgccacttttaccaccataaagactatccaccacaatt 24267970  T
Q  262 ttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  24267971 ttggaatcaagcacaaagtccacaatacctagttgcagatcatgaacccaatacattgctgatagtaaac 24268040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 8150854 - 8151039
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  8150854 agaagaaacttattacatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatttggaaactagtatgacgcaaagtcacgctagca 8150953  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtc 197  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  8150954 aaactatgagcgacttcgtttgcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacagtc 8151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9026701 - 9026511
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9026701 agaagaaacttatttcatttcattcataataatag---agatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacgcaaatccactctagca 9026605  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgatta 205  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  9026604 aaactatgagcgacttcgttgacttgtctctgaataaacctaacatcataagttactaaatcagaagctaaccggcgtctacaatcattgatta 9026511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 28423910 - 28424075
Alignment:
Q  44 tagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 143  Q
    |||| |||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28423910 tagttgagatacaagatggaattctgatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactctagcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 28424009  T
Q  144 aataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgc 209  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||    
T  28424010 aatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagaagtctacaatcattaataactgc 28424075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35827671 - 35827427
Alignment:
Q  48 agagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaata 147  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||    
T  35827671 agagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacatgaatccattctagcaaagctatgagcaactttgtaggcttgtctcagaata 35827572  T
Q  148 aacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagac 247  Q
    |||||||||| |||  || ||| |||| || ||||||  ||| || | |||||||| ||||| ||| ||||| | || ||| |||| || | ||| ||||    
T  35827571 aacctaacataagagattgttagatcataaactaacatgcgtttataatcattgatcactgcactataattagaaacaccacttttgctactatagagac 35827472  T
Q  248 tatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaataccta 292  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  35827471 tatccaccacaattttggaatcaagctcaaaatccacaataccta 35827427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6596286 - 6596171
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  6596286 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagatatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactctaaca 6596187  T
Q  112 aagctatgagcgactt 127  Q
    || ||||||| |||||    
T  6596186 aaactatgagtgactt 6596171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 21946923 - 21947086
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |       | |||||||| |||||| ||  ||||||    
T  21946923 agaagaaacttattccatttcatttataataatagtagatatacaagatgagatcttaatatgga-------actaacatgatgcaaagtcatcctagca 21947015  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacg 188  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21947016 aaactatgagcgactttgttggcttgtctccgaataaac------ttagaggttactaaatcagaagctaacagacg 21947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Original strand, 33336093 - 33336205
Alignment:
Q  89 catgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacg 188  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||| | |    
T  33336093 catgacgcgaagccaccctagcaaacttatgagcaacttcgttggcttgtctctgaataaacctaatactagaggttgctaaatcagaagctaacaaagg 33336192  T
Q  189 tatacagtcattg 201  Q
    | |||||||||||    
T  33336193 tttacagtcattg 33336205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2405311 - 2405146
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| || |||||| || |||||||| |||     
T  2405311 agaaaaaacttattgtatttcatttataataatatgagagatataagatggaatcttaatataaatacgaaaactagcatgacacagagccactcgagcg 2405212  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaag 178  Q
    || | || |  |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| | | |||| |||||||||||    
T  2405211 aaacaataaatgacttcgttgacatgtctcctaataaccctaacatca-aggttactaaatcagaag 2405146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49079201 - 49079074
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| | |||| |||  |||||||||| || ||| |||||||||  | ||||| ||| || || |||| ||||||||    
T  49079201 atttcatctataataagaatagagatacatgatggaattttaatatgaatgtgaaaactaacatgacaaagagccattcttgctaatctataagcgactt 49079102  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49079101 tgttggtttgtctccaaataaacctaac 49079074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Original strand, 33336221 - 33336292
Alignment:
Q  260 ttttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||    
T  33336221 ttttggaatcaagctcaaaatccacaatacccaactgcagatcatgcacccaatacattgttgataataaac 33336292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34899098 - 34899048
Alignment:
Q  124 acttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatca 174  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34899098 acttcattgacttgtctcctaataaacctaacatcagaagttgttaaatca 34899048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 26937 - 27256
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26937 agaaaaaacttattgcatttcattcataataatagcagagatacaagatgaaattctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccactctagca 27036  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |    
T  27037 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaaaatcagaggttacgaaatcagaagataacaggcgtctacaatcattgattactgcac 27136  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27137 taaaattagagacaccatttatactgccataaagactatctaccatagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaaccca 27236  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  27237 atacatggctgataataaac 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 23769774 - 23770093
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||| || ||||   |||||| |||||||||    
T  23769774 agaacaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatagaattctaatatgaatatggaaactagcatgtaacaaagctactctagca 23769873  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23769874 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaattctgaagctaacagacgtctacaatcattgattactgcgc 23769973  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23769974 taaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaaccca 23770073  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  23770074 gtacatggctgataataaac 23770093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 24477475 - 24477794
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  24477475 agaagaaacttattgcatttcattcatcataatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcataacgcaaagccactctagca 24477574  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||    
T  24477575 aaactatgagcgacttcgttggtttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacagtcattcattactgcgc 24477674  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  24477675 taaaattagagacgccacttttactaccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctaattgcagatcgcgaaccca 24477774  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  24477775 atacatggctgataataaac 24477794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 38451692 - 38452010
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  38451692 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagta-agatacaagatgaaattctaatatgaatatggaaactagcatggtgcaaagccactctagca 38451790  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  38451791 aagctatgagcgatttcgttggcttgtctccgaaaaaacctaacattagaggttaataaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattattgcgc 38451890  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  38451891 taaaattagagacgccacttttactaccataaaggctatccatcacggttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagccgaagatcgcgaaccca 38451990  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  38451991 gtacatggctgataataaac 38452010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 45085984 - 45086303
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  45085984 agaagaaacttatttcatttcattcataataatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactctagcc 45086083  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||    
T  45086084 aagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagtcgtttacaatcattgatcacggcgc 45086183  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  45086184 taaaattagagacgccacatttgctaccataaagactatctaccacattcttggaatcaagctcaaagttcacaatacccaactgcagatcgcgaaccca 45086283  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  45086284 atacattgctgataataaac 45086303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10213942 - 10213639
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10213942 atttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccaccctagcaaaactatgagcgactt 10213843  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgcc 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||    
T  10213842 cgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcgtctacaatcattagttactgcgctaaaattagatacgcc 10213743  T
Q  228 aattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataat 327  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  10213742 acttttactaccataaagactatccaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacccagctgcagatcacggacccaatacagtgctgataat 10213643  T
Q  328 aaac 331  Q
    ||||    
T  10213642 aaac 10213639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 317
Target Start/End: Original strand, 23407748 - 23408052
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||  ||| ||    
T  23407748 agaagaaatttattgcatttcgttcataataatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgatgcgaagacatcctaaca 23407847  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||   |    
T  23407848 aaactatgagcgactttgtttgcttgtctccgaataaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacaatcattaattactaaac 23407947  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  23407948 taaaattagagacgtcacttttactatcataaagactatccaccacagttttagaatcaagctcaaagtccacaatacccagctgca-atcacgaactca 23408046  T
Q  312 atacat 317  Q
    ||||||    
T  23408047 atacat 23408052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22606058 - 22605835
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  22606058 agaagaaactgattgcatttcattcataataattgtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaaaccactctcgca 22605959  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||| |||    
T  22605958 aagctatgagcgactccgttggcttgtctctgattgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgactacaatcattaataactacgc 22605859  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttac 235  Q
     ||||||| |||||||| ||||||    
T  22605858 aaaaattagagacgccacttttac 22605835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 331
Target Start/End: Original strand, 40074065 - 40074345
Alignment:
Q  48 agagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaata 147  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  40074065 agagatacaagatggaatcttaatatgaatatgaaaactagcatgacgcgaagccatt-tagcaaaactatgagcgactttgttggcttgtctct-aata 40074162  T
Q  148 aacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagac 247  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  40074163 aacctaacattagaggttgctaaatcagaagcaaacagacgtttacagccattgat-actgcactataattagaaacgccgcttttactaccataaagac 40074261  T
Q  248 tatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||| |||| | ||||||||  || |||||| || |||||||| |  || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  40074262 tatccaccacagttttggaacaaaactcaaaatccacaatacccaattgtagatcacgcacccaatacattgctgataataaac 40074345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 31411364 - 31411483
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  31411364 agaagaaacttattgtatttcattcataataataatagatatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacacaaagtcactctagca 31411463  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgtt 131  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  31411464 aagctatgaacgacttcgtt 31411483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27177864 - 27177575
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |  | | |||| |||||||||||||||||  |  ||||| |||||||   ||||      
T  27177864 agaagaaacttattgtatttcaattaaaataatagtagagatacacaacggaatcttaatatgaatatggaaacaagaatgacacaaagccgtcctagtg 27177765  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||| |||||||  |||||| |||||| |||| ||||  || ||||| |    
T  27177764 aaactatgagctacttcgttggcttgtctcataataaacctgacatcaaaggttactaaatcaagagctaatagacgtctacaatcatcaatcactgcac 27177665  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagat 301  Q
    || ||||||| || ||| ||||||  ||||| |||||||| |||| | |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||||||||    
T  27177664 tataattaaaaacaccatttttaccaccatagagactatcgaccacagttttggaatcaaactgaaaatctacaatccccaactgcagat 27177575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1604995 - 1604721
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||||||||     
T  1604995 agaagaaacttattgcgtttcatttataataataagagatataaaagatggaatc-taatatgaatacgaaaactaacatgacactaatccactctagcg 1604897  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| || || |  ||| |||||||| | ||| |    
T  1604896 aaactatgaacgactttgttgatttgtctcctaataaacctaatatcagatgttactaaatcagaagctagcacacatcaacaatcattgatcaatgcac 1604797  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaat 287  Q
    |  ||||| ||||  || | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||    
T  1604796 tttaattagagacatcactcttaccaccataaatactatctaccatagttttgtaatcaaactcaaaatccacaat 1604721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11616771 - 11616661
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  11616771 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgtaaagtcactctagca 11616672  T
Q  112 aagctatgagc 122  Q
    |||||||||||    
T  11616671 aagctatgagc 11616661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32025635 - 32025536
Alignment:
Q  37 ataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggctt 136  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32025635 ataataattgtagagatataacatgaaattctaatataaatatggaaactagcatgacatgaagtcactctagcaaagctatgagcaacttcattggctt 32025536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28317865 - 28317799
Alignment:
Q  39 aataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccact 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  28317865 aataatagtagagatataagatgaaatcttaatataaatatgaaaattatcatgacacaaaaccact 28317799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20214343 - 20214282
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatat 73  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20214343 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaaaatgaaatcctaatat 20214282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32957578 - 32957279
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32957578 agaagaaacttatcgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 32957479  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  32957478 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtctacaatcattaataactgcgc 32957379  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32957378 taaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggaatcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcatgaaccca 32957279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7597700 - 7597381
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  7597700 agaagaaatttattgcttttcattcataataagagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatcacgcaaagccactctagca 7597601  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7597600 aagctatgagcgactttggtggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaataaaaaactaacatacgtctacagtcattgattactgcgc 7597501  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7597500 taaatctagagacgccacttttactgccataaagactctctaccacaattttgaaatcaaactcaaagtccacaatacctagctgcagatcacaaaccca 7597401  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
     ||||||  |||||||||||    
T  7597400 gtacatggttgataataaac 7597381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 7435615 - 7435882
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7435615 agaagaaatttattgcatttcgttcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 7435714  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  7435715 aagctattagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacaggcgtctacagtcattgattactacgc 7435814  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaag 279  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  7435815 taaaattagagacgctaattttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaag 7435882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12523730 - 12523432
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                     ||||||    
T  12523730 agaagaaatttattgcatttcattcataataatggtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaa---------------------ctagca 12523652  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  12523651 aaactatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagattttgttaaattagaagctaacaggcgtctatagtcattgatcactgcgc 12523552  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||| |||   ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12523551 taaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccataatactcagctgcagatcgcgaaccca 12523452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7608618 - 7608473
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  7608618 agaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaattataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactatagca 7608519  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacat 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7608518 aagctatgagtgacttcgttggcttgtcttcgaataaacctaacat 7608473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7607849 - 7607711
Alignment:
Q  191 tacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacc 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  7607849 tacagtcattgattactacgctaaaattagagacgccacttttactacaataaagactatctaccacaattttgaaatcaagctcaaagtccacaatacc 7607750  T
Q  291 tagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataa 329  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||    
T  7607749 tagctgcagaccacgaacccagcccatggctgataataa 7607711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6192681 - 6192539
Alignment:
Q  14 aagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaa 113  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||    
T  6192681 aagaaacttattgcatttcattcatgataatagtagaaatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgtagagccactctagcaaa 6192582  T
Q  114 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaaca 156  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6192581 gatatgagtgatttcgttggcttgtctccgaatgaacctaaca 6192539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Original strand, 34183123 - 34183234
Alignment:
Q  15 agaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaag 114  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183123 agaaacttattgcatttaattcataatagtagtagagatacaagatgaaatcccaatataaatatgaaaactaacatgacgcaaagccactctagcaaag 34183222  T
Q  115 ctatgagcgact 126  Q
    ||||||||||||    
T  34183223 ctatgagcgact 34183234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13406258 - 13405966
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| | |||  |||| |||||||| |||||||| || |||||| | ||| ||  ||||||    
T  13406258 agaagaagcttattgtatttcatttaaaataagagtagagatacacgatcgaatcttaatatgattatggaaactagcatgactcgaagtcatcctagca 13406159  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||  | ||  |    
T  13406158 aaactatgagtgacttaattggcttgtctccgaataaacataacatcagaggttgctaaatcagaagctaacatacgtttactatcattgagcattgtac 13406059  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcac 304  Q
    || ||||| | | | || ||||||  |||||||||||||| |||| | ||||| | |||| || ||| |||||| |||| |  ||||||||||    
T  13406058 tataattagaaatggcacttttaccaccataaagactatcaaccacagttttgaagtcaagctgaaaatctacattacccaaatgcagatcac 13405966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 31797991 - 31798243
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||  |||| |  |||||    |||||||  ||||||  ||||    
T  31797991 attttattcataataatagcagagatacaagatgaaatcctaatatagatatgaaaactagaatgatgtgaagccgtcatagcaaatttatgagtaactt 31798090  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgcc 227  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||| | || ||||||| |  || ||||| ||||||||| ||| | |    
T  31798091 cgttagcttgtcttcaaataaacctaacatcagaggttactagatcaaaagctaacatatgtctacagtcttgaatcactgcactaaaattagagatgtc 31798190  T
Q  228 aattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagt 280  Q
    |  |||||  |||||||||||||| || | | ||||  |||||| ||||||||    
T  31798191 acatttaccaccataaagactatccactacagtttttaaatcaaactcaaagt 31798243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 29025240 - 29025306
Alignment:
Q  17 aaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaa 83  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29025240 aaacttattgcatttcattcataataatagtagtgatacaagatgaaatcttaatacgaatatggaa 29025306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 187266 - 186967
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  187266 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactatagca 187167  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||    
T  187166 aagctatgagcgaattcgttggcttgtctccgaatgaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattgcgc 187067  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  187066 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 186967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 9609501 - 9609800
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||     
T  9609501 agaagaaacttattgcatttcatacaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactctagcg 9609600  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  9609601 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 9609700  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9609701 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 9609800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 29242107 - 29242426
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29242107 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaatatggaatcctaatataaatatggaaactagcatgatgtaaagccactctagca 29242206  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||    
T  29242207 aagctatgagcgacttcattggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacagacgtctacaatcattaatatctgcgc 29242306  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29242307 taaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccatagttttggagtcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaaccca 29242406  T
Q  312 atacatgactgataataaac 331  Q
    || |||  ||||||| ||||    
T  29242407 atgcattgctgataacaaac 29242426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 30796797 - 30797096
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  30796797 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatgcaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcaagacgcaaagccactctagca 30796896  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  30796897 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaatagacgtctacaatcattaataactgcgc 30796996  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30796997 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcaaatcacgaaccca 30797096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1722108 - 1721792
Alignment:
Q  15 agaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaag 114  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||     
T  1722108 agaaacttattgcatttctttcataataataatagagatacaagatgaaattttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactctagccaaa 1722009  T
Q  115 ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  1722008 ctatgagcgacttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagttaacaggcgtttacaatcattgatcactgcgctaa 1721909  T
Q  215 aattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaata 314  Q
    ||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||  |||  |||||    
T  1721908 aattaaagacgccacatttcttaccataaagactatctaccacagtcttggaatcaagctcaaaatccacaatacacagctgcagatcgtgaattcaata 1721809  T
Q  315 catgactgataataaac 331  Q
    |||  ||||||||||||    
T  1721808 cattgctgataataaac 1721792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 331
Target Start/End: Original strand, 27452586 - 27452787
Alignment:
Q  129 gttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgcca 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27452586 gttggcttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagt-gtctacaatcattgattattgcgctaaaattagagacgcca 27452684  T
Q  229 attttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataata 328  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||  ||||||||    
T  27452685 cttctactgccataaagactatccaccacaggtttggaatcaagctcaatgtccacaatacctagctgaagatcgcgaatccggtacatggatgataata 27452784  T
Q  329 aac 331  Q
    |||    
T  27452785 aac 27452787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39861066 - 39860924
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  39861066 agaaaaaacttattgcatttctttcataataatagtagagatacaagattgaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccaccctagca 39860967  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaa 154  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39860966 aaattatgagcgacttccttggcttgtctccgaataaacctaa 39860924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 36978847 - 36978727
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccact---cta 108  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||| || |||||||| || |||||    ||    
T  36978847 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatgaaaactagcatgacgcgaaaccacttaatta 36978748  T
Q  109 gcaaagctatgagcgacttcg 129  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  36978747 acaaagctatgagcgacttcg 36978727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4052909 - 4052831
Alignment:
Q  106 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaaca 184  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||    
T  4052909 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaaca 4052831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39860863 - 39860774
Alignment:
Q  242 aaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  39860863 aaagactatctaccacagtattggaatcaagctcaaaatccataatacccagctgcagatcacgcacccaatacattgctgataataaac 39860774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 16007131 - 16007185
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatc 66  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16007131 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatc 16007185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4052966 - 4052910
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaa 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  4052966 atttcattcataataatggtagagatataagatggaatcctaaaatgaatatggaaa 4052910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5839905 - 5839587
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5839905 agaagaaacttattgcatttcattcatgataatagtagagatacaagatgaaattctaatattaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 5839806  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  5839805 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccaaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 5839706  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5839705 taaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagttaagctcaatgtccacaatacctagttgcagatcgcggaccca 5839606  T
Q  312 atacatgactgataataaa 330  Q
     |||||  |||||||||||    
T  5839605 gtacattgctgataataaa 5839587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25663645 - 25663345
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  25663645 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataataggagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaaatagcatgacgcaaatccactctagca 25663546  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  25663545 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgc 25663446  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  25663445 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttagagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgctgataacaaaccca 25663346  T
Q  312 a 312  Q
    |    
T  25663345 a 25663345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32578191 - 32577878
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagcca-------- 103  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||            
T  32578191 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccattctagca 32578092  T
Q  104 ------ctctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtc 197  Q
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  32578091 aagccactctagcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacattc 32577992  T
Q  198 attgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgc 297  Q
    ||| || ||||| ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  32577991 attaataactgcactaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgc 32577892  T
Q  298 agatcacgaaccca 311  Q
    ||||||||||||||    
T  32577891 agatcacgaaccca 32577878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36531260 - 36530957
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||| |||| ||||||||    
T  36531260 atttcattcataataatagtagagaaacaagatggaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacacaaaactattctagcaaaactataagcgactt 36531161  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaag-ctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgc 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||  |||| | || | | |||||||||||||||| |||||||||| |||  |    
T  36531160 cgtttgcttgtctccgaataaacctaacatcagaggtttctaaataaaaaaactaa-atacatctgcagtcattgattactgtgctaaaattagagatac 36531062  T
Q  227 caattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataa 326  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  36531061 cacttttactaccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttccagatcatgaacccaatacatgactgatag 36530962  T
Q  327 taaac 331  Q
    |||||    
T  36530961 taaac 36530957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Original strand, 11503068 - 11503230
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  11503068 agaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcg 11503167  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  11503168 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatca 11503230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 32282842 - 32282992
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  32282842 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagtcactctagca 32282941  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32282942 aagctatgagcgacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaa 32282992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 14219795 - 14219992
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||| ||     
T  14219795 agaagaaatttattgtatttcatttaaaataatagtagaaatgtaagctgaaatcttaatatgaatatggaaactaacatgacacggagtcactctggcg 14219894  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgc 209  Q
    ||  ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14219895 aaattatgaccgactttgttggtttgtctcctaataaacctaacatcagatattactaaatcaaaagctaacagacgtctacaatcattgatcactgc 14219992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40395377 - 40395242
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  40395377 agaagaaatttattgtatttcattca--ataatagtagagatacaagataaaattctaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaatccactctagca 40395280  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaa 149  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40395279 aagctatgagtgacttagttgacttgtctccgaataaa 40395242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10342497 - 10342351
Alignment:
Q  21 ttattatatttcattcat-aataatagtagagatataagatgaaatc---ataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagct 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  10342497 ttattgtatttcattcattaataatagtagagatataagatggaatcctaataatatgaatatgaaaactagcatgacacaaagccattttagcaaagct 10342398  T
Q  117 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaag 163  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10342397 atgagcgatttcgttggtttgtctccaaataaacctaacatcagaag 10342351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Original strand, 32283002 - 32283047
Alignment:
Q  211 ctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctacca 256  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32283002 ctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctacca 32283047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 216576 - 216283
Alignment:
Q  38 taataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  216576 taataatagtagagatattagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatggcgcaaagccactctagcaaaggaatgagcgacttcgttggcttg 216477  T
Q  138 tctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactg 237  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  216476 tctccgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaatctaacatgcgtctacagtcattgattattgcgctaaaattaaagatgccatttttactg 216377  T
Q  238 ccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  216376 ccataaagactatctaccacaattttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgtagatcgcgaacccagtacatggcagataataaac 216283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Original strand, 2214 - 2517
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2214 atttcattcataataatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgactt 2313  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgcc 227  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || | |||||||||| |||||||    
T  2314 cgttggcttgtctgcgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaccgtgctaaaattagagacgcc 2413  T
Q  228 aattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataat 327  Q
    | ||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||    
T  2414 atttttactaccataaagattgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaaccgagtacattgctgataat 2513  T
Q  328 aaac 331  Q
    ||||    
T  2514 aaac 2517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6853 - 6564
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6853 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccgctctagca 6754  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  6753 aagctatgagcgacttcgttgtcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtttacaatcattaataactgcgc 6654  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagat 301  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6653 taaaattagagacgccatttttactaccataaaggctgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacctagttgcagat 6564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 58540 - 58220
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||    
T  58540 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaaccctaatatgaatatggaaactagcatgacataaagccactcgagca 58441  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||    
T  58440 aagctatgagagacttcgttggcttgtcttccaataaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaataggcgtctacagtcatttattactacgc 58341  T
Q  212 taaaattaaagacgcca-attttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccc 310  Q
    |||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||| || ||| |||||||    
T  58340 taaaattagagacacgattttttactgccataaagactatctaccacaattttggaatcaatatcaaagtccaacgtacctagctacaaatcgcgaaccc 58241  T
Q  311 aatacatgactgataataaac 331  Q
    | |||||| | ||||||||||    
T  58240 agtacatggcagataataaac 58220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5431 - 5156
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  5431 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaattttaatatgaatatggaaattagcatgatgcaaagtcactatagca 5332  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||     
T  5331 aagttatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggcgtctacaatcattaataactgcgt 5232  T
Q  212 taaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaat 287  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  5231 taaaattagagacgctacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaat 5156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48522304 - 48522162
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48522304 agaagaaacttattgcatttcatttataataatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 48522205  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48522204 aagctatgagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaa 48522162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 25070898 - 25071123
Alignment:
Q  106 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgatta 205  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  25070898 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacatgcgtctacagtcattgatca 25070997  T
Q  206 ctgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacg 305  Q
    |||||||||||||| |||| |||   | ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||  |    
T  25070998 ctgcgctaaaattagagacaccacaataactaccatatagaccatctaccacaattttggaatcaaactcaaagtccacaatactcagctgcagatcgtg 25071097  T
Q  306 aacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25071098 aacgcaatacattgctgataataaac 25071123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48519045 - 48518882
Alignment:
Q  168 taaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||    
T  48519045 taaatcagaagctaacagacgtctatagtcattgattattgcgctaaaatcagagacgtcacttttactgccgcaaagaatatctaccacgattttggaa 48518946  T
Q  268 tcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaatacatgactgataataaac 331  Q
    ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48518945 tcaagttcaaagtccacaatacctaactgcagatcgcgaacccagtacatgactgataataaac 48518882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19956673 - 19956354
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||   || || | ||  | || || ||||||    
T  19956673 agaagaaacttattccatttcattcataataatattatagatacaagatggaatcctaatatgcatatgga---tagcaaggcgggaggcaaccctagca 19956577  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgc 211  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||| |||  ||||| |||| |||||| || | || | |||||||| ||||| |    
T  19956576 aaactataagcgacttcgttggtttgtctccaaataaacttaaaataagaggttgctaaattagaaactaacaaacatctaaaatcattgatcactgcac 19956477  T
Q  212 taaaattaaag---acgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaac 308  Q
    || ||||| |    || ||  |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |    ||||||||| ||    
T  19956476 tataattagacgacacaccgcttttgctaccataaagactatccaccacaattttggaatcaagctcaaaatccacaatacccaaaatcagatcacgcac 19956377  T
Q  309 ccaatacatgactgataataaac 331  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  19956376 ccaatacattgctgataataaac 19956354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26347482 - 26347349
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagca 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||||||||||||  |    
T  26347482 agaagaaatttattttattttattcataataatagtagagatacaagatggaatcataatataaatatagaaattagtatgatgtaaagccactctaata 26347383  T
Q  112 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaa 145  Q
    | | ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  26347382 aggttatgagcgacttcattgatttgtctccgaa 26347349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11080065 - 11079803
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactt 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||||||||  |||| || | |||| |  || | | || || || |||| || |||||    
T  11080065 atttcatttataataatcgtagagatacaagatggaatcctgatatgaatacagaaactagcctgacacggagtcgcccttgctaaactataagagactt 11079966  T
Q  128 cgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgcc 227  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||   || |||| || || || ||| | ||| ||||| | || ||    
T  11079965 cgttggtttgtctcctaatgaacctaacataagatgttattaaatttgaagctaacatgtgtctacaatcgttaatcacttcactataattagaaacacc 11079866  T
Q  228 aattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacc 290  Q
    |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11079865 acatttactaccatatagactatccaccacaattttagaattaatatcaaagtccacaatacc 11079803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 25070841 - 25070897
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaa 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  25070841 atttcattcataataatggtagagatataagatggaatcctaaaatgaatatggaaa 25070897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 15393518 - 15393568
Alignment:
Q  28 atttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaata 78  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15393518 atttcatttataataacagtagagatacaagatgaaatcttaatatgaata 15393568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25698619 - 25698534
Alignment:
Q  123 gacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactg 208  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | | |||  ||||||||||| ||||| | || |||| |||||||| ||||    
T  25698619 gacttcgttgacttgtctccaaataaacgtaacatcaaaggttgctaaatcagaagttaacatatgtctacaatcattgatcactg 25698534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15327523 - 15327479
Alignment:
Q  122 cgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagtta 166  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15327523 cgacttcattggcttgtctcctaatgaacctaacatcagaagtta 15327479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5399
Alignment:
Q  17 aaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaag 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  5316 aaacttattgcatttcattcatgataatagtagagatacaagatggaatcttaatatgaatataaaaactaacatgacgcaaag 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20770 - 20691
Alignment:
Q  12 agaagaaacttattatatttcattcataataatagtagagatataagatgaaatcataatatgaatatggaaattaacat 91  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20770 agaagaaacttattgcatttcatttataataatagtagagatacaagatgtaatcttaatatgaatatagaaactaacat 20691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20686 - 20493
Alignment:
Q  123 gacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacattagaagttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  | ||  ||||||| |||||||||  ||| |||| ||| | || | ||| ||| |||||       
T  20686 gacttcgttggcttgtctctgattaaacctaacatcatcaattgctaaatcacaagctaacatgcgtctacaatcaattataattgcactataattagta 20587  T
Q  223 acgccaattttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaacccaataca 316  Q
    ||   | |||| || ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20586 acattactttttctaccatagagactatccaccacagttttggaatcaaggtcaaaatccacaatacctagctatagatcacgcacccaataca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0548 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 3847 - 3927
Alignment:
Q  231 tttactgccataaagactatctaccataattttggaatcaatctcaaagtctacaatacctagctgcagatcacgaaccca 311  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  3847 tttacttccatatagactatccaccacagttttggaatcaatctcaaagtccacaatatccaactgaagatcacgaaccca 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 269
Target Start/End: Original strand, 9069 - 9176
Alignment:
Q  162 agttattaaatcagaagctaacagacgtatacagtcattgattactgcgctaaaattaaagacgccaattttactgccataaagactatctaccataatt 261  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||| |||||| |  || ||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  9069 agttattaaattagaagttaagaggcgtttacaatcattaattactacattataattagaaacgtcatttttactaccataaagactatccaccacagtt 9168  T
Q  262 ttggaatc 269  Q
    ||||||||    
T  9169 ttggaatc 9176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University