View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3608_high_11 (Length: 301)

Name: NF3608_high_11
Description: NF3608
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3608_high_11
NF3608_high_11
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (13-286)||(41765070-41765345)
chr7 (13-191)||(48928289-48928466)
chr7 (13-212)||(48928556-48928754)
chr7 (1-182)||(29173540-29173721)
chr7 (13-208)||(21991610-21991805)
chr7 (14-207)||(5657474-5657667)
chr7 (1-180)||(26980325-26980504)
chr7 (13-191)||(22687230-22687408)
chr7 (13-212)||(18797299-18797496)
chr7 (13-207)||(8861260-8861454)
chr7 (1-191)||(31520704-31520893)
chr7 (13-209)||(30055499-30055696)
chr7 (2-159)||(32593170-32593326)
chr7 (13-181)||(12165753-12165921)
chr7 (5-209)||(12390614-12390818)
chr7 (13-207)||(4582894-4583088)
chr7 (13-209)||(32821045-32821241)
chr7 (14-206)||(24211717-24211909)
chr7 (13-208)||(43686015-43686209)
chr7 (13-207)||(6546494-6546688)
chr7 (13-191)||(7334785-7334963)
chr7 (13-207)||(15612751-15612944)
chr7 (13-191)||(38258536-38258714)
chr7 (13-209)||(9355818-9356014)
chr7 (12-191)||(33688253-33688431)
chr7 (13-207)||(27283719-27283913)
chr7 (13-208)||(31579056-31579256)
chr7 (14-205)||(27421373-27421563)
chr7 (16-125)||(11071263-11071372)
chr7 (13-207)||(10359206-10359400)
chr7 (13-191)||(25691536-25691715)
chr7 (16-191)||(37347013-37347188)
chr7 (13-207)||(37109847-37110043)
chr7 (14-210)||(17842577-17842775)
chr7 (13-208)||(32432431-32432621)
chr7 (53-170)||(35353120-35353238)
chr7 (58-211)||(26524364-26524517)
chr7 (13-127)||(10481660-10481774)
chr7 (38-191)||(23111181-23111334)
chr7 (13-205)||(44413371-44413564)
chr7 (13-98)||(37704241-37704326)
chr7 (13-111)||(44598737-44598835)
chr7 (12-89)||(15672753-15672830)
chr7 (77-207)||(34362205-34362334)
chr7 (1-128)||(38053540-38053659)
chr7 (13-107)||(43925177-43925270)
chr7 (13-63)||(26588076-26588126)
chr7 (14-74)||(37703491-37703551)
chr7 (143-205)||(8299192-8299254)
chr7 (68-110)||(34362149-34362191)
chr7 (14-74)||(46481122-46481182)
chr7 (162-213)||(40381934-40381985)
chr7 (162-191)||(3953747-3953776)
chr7 (162-191)||(23402374-23402403)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (13-212)||(22450954-22451153)
chr3 (1-191)||(11357343-11357534)
chr3 (13-209)||(33378776-33378969)
chr3 (12-210)||(21193594-21193792)
chr3 (16-208)||(11466814-11467006)
chr3 (16-191)||(52040916-52041092)
chr3 (13-207)||(4015451-4015645)
chr3 (13-191)||(27480370-27480548)
chr3 (17-207)||(37203058-37203248)
chr3 (1-196)||(40935993-40936187)
chr3 (14-209)||(48354930-48355125)
chr3 (13-207)||(51212972-51213166)
chr3 (13-209)||(35844315-35844512)
chr3 (13-191)||(43975879-43976054)
chr3 (13-207)||(37157699-37157892)
chr3 (13-209)||(34132924-34133120)
chr3 (13-205)||(46297753-46297945)
chr3 (13-184)||(44186492-44186663)
chr3 (13-210)||(39282641-39282837)
chr3 (15-191)||(53229145-53229322)
chr3 (16-208)||(26941254-26941446)
chr3 (13-209)||(4761640-4761838)
chr3 (13-191)||(29099362-29099540)
chr3 (14-208)||(40552251-40552445)
chr3 (13-159)||(42506066-42506212)
chr3 (13-208)||(3655193-3655388)
chr3 (17-159)||(2007972-2008114)
chr3 (14-191)||(32373479-32373654)
chr3 (26-191)||(20373300-20373465)
chr3 (12-185)||(45174516-45174692)
chr3 (12-191)||(44891514-44891683)
chr3 (12-191)||(22446054-22446234)
chr3 (13-208)||(7327473-7327669)
chr3 (14-129)||(43348327-43348441)
chr3 (13-175)||(3362276-3362440)
chr3 (13-104)||(29163912-29164003)
chr3 (13-191)||(24488953-24489131)
chr3 (13-191)||(25579746-25579924)
chr3 (13-149)||(24708106-24708242)
chr3 (15-107)||(46994654-46994746)
chr3 (13-148)||(14586661-14586796)
chr3 (12-125)||(53176127-53176240)
chr3 (38-209)||(47481511-47481682)
chr3 (13-86)||(33698265-33698338)
chr3 (12-160)||(21009792-21009940)
chr3 (16-110)||(38591786-38591880)
chr3 (14-107)||(54828693-54828786)
chr3 (13-84)||(22622709-22622780)
chr3 (14-96)||(11835619-11835702)
chr3 (12-183)||(54505823-54505993)
chr3 (14-91)||(36012244-36012322)
chr3 (56-121)||(53811696-53811767)
chr3 (14-80)||(1089811-1089877)
chr3 (162-209)||(40640637-40640684)
chr3 (143-209)||(55343405-55343471)
chr3 (113-206)||(11835702-11835790)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (13-214)||(7235025-7235225)
chr6 (31-191)||(33618850-33619010)
chr6 (13-191)||(15491631-15491809)
chr6 (14-206)||(20768087-20768275)
chr6 (22-208)||(8513232-8513419)
chr6 (13-209)||(4318812-4319009)
chr6 (13-208)||(3879929-3880124)
chr6 (22-205)||(6088910-6089094)
chr6 (13-213)||(29182157-29182357)
chr6 (14-205)||(30353349-30353540)
chr6 (13-191)||(21017102-21017280)
chr6 (13-210)||(1945830-1946028)
chr6 (13-207)||(33892993-33893186)
chr6 (21-209)||(5627389-5627577)
chr6 (13-208)||(7055205-7055400)
chr6 (76-209)||(18498431-18498565)
chr6 (13-146)||(6091173-6091306)
chr6 (162-209)||(19631747-19631794)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (13-207)||(28003003-28003197)
chr4 (14-209)||(38011852-38012047)
chr4 (13-191)||(33816550-33816728)
chr4 (14-209)||(25701075-25701270)
chr4 (16-191)||(5047985-5048160)
chr4 (13-191)||(34948114-34948292)
chr4 (13-207)||(55241122-55241315)
chr4 (14-210)||(27396613-27396809)
chr4 (13-209)||(35021052-35021248)
chr4 (28-207)||(19089485-19089664)
chr4 (13-190)||(23761089-23761265)
chr4 (13-209)||(29584217-29584411)
chr4 (13-210)||(55477908-55478109)
chr4 (12-191)||(7703533-7703704)
chr4 (16-185)||(32579466-32579637)
chr4 (13-208)||(35025613-35025800)
chr4 (13-197)||(32592103-32592287)
chr4 (13-208)||(37663758-37663951)
chr4 (20-191)||(49375982-49376154)
chr4 (13-191)||(19440665-19440843)
chr4 (13-213)||(9139241-9139439)
chr4 (16-205)||(36493708-36493897)
chr4 (13-208)||(25184112-25184307)
chr4 (13-205)||(33341397-33341592)
chr4 (13-191)||(4598009-4598185)
chr4 (13-191)||(37775685-37775861)
chr4 (13-191)||(46888174-46888352)
chr4 (13-181)||(17167739-17167907)
chr4 (13-181)||(17173316-17173484)
chr4 (32-191)||(50764748-50764905)
chr4 (13-205)||(47253751-47253934)
chr4 (13-182)||(54499254-54499425)
chr4 (13-191)||(879565-879743)
chr4 (20-153)||(4934226-4934360)
chr4 (13-209)||(30002649-30002837)
chr4 (13-189)||(6864053-6864229)
chr4 (13-209)||(32912597-32912793)
chr4 (13-209)||(34361509-34361704)
chr4 (15-208)||(37287732-37287919)
chr4 (13-207)||(39397918-39398103)
chr4 (21-213)||(42199723-42199915)
chr4 (13-99)||(1815409-1815495)
chr4 (13-129)||(50697320-50697435)
chr4 (13-107)||(17272068-17272158)
chr4 (162-211)||(38812263-38812312)
chr4 (13-85)||(3042741-3042813)
chr4 (113-209)||(4205114-4205210)
chr4 (141-210)||(17272008-17272077)
chr4 (162-205)||(20097494-20097537)
chr4 (162-211)||(2704508-2704557)
chr4 (132-209)||(7152242-7152319)
chr4 (162-207)||(38811813-38811858)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (13-191)||(14758053-14758231)
chr1 (13-209)||(15168083-15168286)
chr1 (19-191)||(31621545-31621717)
chr1 (13-205)||(33725586-33725778)
chr1 (16-209)||(16415639-16415833)
chr1 (14-191)||(47279201-47279378)
chr1 (1-209)||(11742325-11742532)
chr1 (13-205)||(15752027-15752219)
chr1 (14-175)||(40884841-40885002)
chr1 (13-191)||(4330291-4330471)
chr1 (14-208)||(2959743-2959937)
chr1 (13-207)||(38823210-38823404)
chr1 (13-208)||(10181994-10182189)
chr1 (13-191)||(27532967-27533144)
chr1 (13-209)||(48620631-48620827)
chr1 (13-207)||(3309144-3309338)
chr1 (13-129)||(27227471-27227587)
chr1 (13-209)||(34012363-34012559)
chr1 (13-191)||(27267186-27267361)
chr1 (16-207)||(42721035-42721226)
chr1 (13-209)||(15382927-15383123)
chr1 (13-191)||(7079049-7079238)
chr1 (13-188)||(9903040-9903215)
chr1 (13-208)||(18422646-18422841)
chr1 (13-170)||(32216088-32216245)
chr1 (12-209)||(32267028-32267225)
chr1 (12-205)||(41926161-41926354)
chr1 (13-209)||(3534926-3535122)
chr1 (14-209)||(39393377-39393573)
chr1 (13-209)||(1547281-1547469)
chr1 (13-188)||(10922742-10922917)
chr1 (13-205)||(238499-238690)
chr1 (13-191)||(47682480-47682657)
chr1 (13-207)||(30326938-30327132)
chr1 (13-125)||(25160710-25160822)
chr1 (13-208)||(19899755-19899950)
chr1 (21-208)||(30254419-30254605)
chr1 (21-191)||(28564775-28564945)
chr1 (21-209)||(37618886-37619078)
chr1 (59-207)||(21289661-21289816)
chr1 (13-211)||(8222123-8222318)
chr1 (13-191)||(37451298-37451475)
chr1 (13-178)||(51128884-51129049)
chr1 (13-205)||(28769651-28769842)
chr1 (20-139)||(27563898-27564017)
chr1 (21-191)||(23999359-23999529)
chr1 (26-168)||(46931446-46931588)
chr1 (13-107)||(27763297-27763391)
chr1 (13-107)||(22170807-22170901)
chr1 (13-122)||(38759610-38759723)
chr1 (161-209)||(4150489-4150537)
chr1 (162-207)||(43579242-43579287)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (13-191)||(33908249-33908427)
chr5 (15-207)||(14409310-14409501)
chr5 (1-208)||(1429114-1429321)
chr5 (13-207)||(31786627-31786821)
chr5 (13-191)||(22980809-22980987)
chr5 (13-191)||(26268090-26268268)
chr5 (13-209)||(19119857-19120053)
chr5 (12-191)||(699166-699345)
chr5 (13-191)||(30969305-30969483)
chr5 (13-209)||(8741867-8742064)
chr5 (1-209)||(24886100-24886310)
chr5 (13-207)||(7693230-7693424)
chr5 (13-214)||(27330299-27330498)
chr5 (14-208)||(39572818-39573012)
chr5 (16-188)||(5837574-5837746)
chr5 (1-213)||(8466739-8466950)
chr5 (13-205)||(25500907-25501099)
chr5 (13-209)||(38528218-38528413)
chr5 (14-208)||(9200232-9200426)
chr5 (13-207)||(36866762-36866956)
chr5 (13-207)||(40133385-40133579)
chr5 (13-209)||(12910348-12910549)
chr5 (14-206)||(32563150-32563342)
chr5 (13-207)||(23116203-23116397)
chr5 (16-209)||(5112297-5112490)
chr5 (13-183)||(22019656-22019826)
chr5 (13-191)||(27318468-27318646)
chr5 (13-210)||(36860420-36860618)
chr5 (13-191)||(35511458-35511636)
chr5 (13-139)||(23954770-23954897)
chr5 (13-209)||(22974063-22974259)
chr5 (14-206)||(31705594-31705785)
chr5 (13-149)||(6824460-6824598)
chr5 (14-153)||(21088748-21088887)
chr5 (13-191)||(22255197-22255376)
chr5 (13-207)||(15724490-15724682)
chr5 (12-209)||(35826464-35826660)
chr5 (13-208)||(35933901-35934090)
chr5 (13-128)||(15992521-15992636)
chr5 (13-168)||(28416508-28416663)
chr5 (13-209)||(14919509-14919706)
chr5 (13-126)||(43308633-43308746)
chr5 (13-129)||(7208845-7208960)
chr5 (20-208)||(8436965-8437152)
chr5 (58-149)||(25668707-25668798)
chr5 (13-129)||(35504443-35504559)
chr5 (70-191)||(11898018-11898139)
chr5 (13-168)||(17158012-17158166)
chr5 (16-87)||(42342851-42342921)
chr5 (13-85)||(13956343-13956415)
chr5 (113-214)||(13956426-13956527)
chr5 (13-146)||(5829962-5830086)
chr5 (12-54)||(25669739-25669781)
chr5 (132-207)||(16004476-16004552)
chr5 (162-209)||(22616492-22616539)
chr5 (162-206)||(10237415-10237459)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (13-208)||(27082835-27083030)
chr8 (13-207)||(5299943-5300137)
chr8 (12-209)||(38643975-38644172)
chr8 (13-209)||(34894964-34895160)
chr8 (13-213)||(36694963-36695163)
chr8 (13-207)||(6098515-6098709)
chr8 (13-191)||(37970516-37970694)
chr8 (13-208)||(16446872-16447067)
chr8 (14-207)||(33906223-33906404)
chr8 (13-191)||(465857-466035)
chr8 (13-191)||(1204942-1205120)
chr8 (21-191)||(10555207-10555377)
chr8 (13-207)||(13307622-13307816)
chr8 (13-218)||(1150102-1150306)
chr8 (13-209)||(9864145-9864341)
chr8 (12-208)||(34952027-34952223)
chr8 (13-191)||(11727039-11727217)
chr8 (13-207)||(12876108-12876302)
chr8 (13-209)||(16222860-16223056)
chr8 (13-209)||(43643592-43643788)
chr8 (13-191)||(23854428-23854606)
chr8 (14-207)||(41362517-41362707)
chr8 (12-209)||(40862416-40862613)
chr8 (21-212)||(31933891-31934082)
chr8 (13-126)||(1149629-1149742)
chr8 (13-208)||(30654580-30654775)
chr8 (14-129)||(39099117-39099232)
chr8 (13-180)||(41910985-41911153)
chr8 (14-129)||(1953987-1954103)
chr8 (14-124)||(35459709-35459819)
chr8 (13-125)||(7890954-7891066)
chr8 (1-99)||(7998401-7998500)
chr8 (18-127)||(44869576-44869686)
chr8 (13-155)||(43025753-43025895)
chr8 (13-180)||(8803814-8803974)
chr8 (13-81)||(4132683-4132750)
chr8 (83-207)||(4133077-4133199)
chr8 (58-108)||(33197947-33197997)
chr8 (139-210)||(24823395-24823466)
chr8 (167-208)||(7998361-7998402)
chr8 (161-205)||(6446708-6446752)
chr8 (143-207)||(15009241-15009305)
chr8 (169-209)||(39099262-39099302)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (13-213)||(36641980-36642182)
chr2 (13-210)||(4166919-4167116)
chr2 (13-213)||(33550995-33551195)
chr2 (13-208)||(19424637-19424832)
chr2 (13-207)||(19313852-19314045)
chr2 (13-205)||(33660377-33660569)
chr2 (13-211)||(29242147-29242345)
chr2 (13-208)||(4264086-4264281)
chr2 (13-207)||(4478368-4478564)
chr2 (13-126)||(45327801-45327914)
chr2 (13-205)||(43770848-43771039)
chr2 (13-175)||(27349948-27350109)
chr2 (13-207)||(41465509-41465695)
chr2 (38-206)||(13711465-13711633)
chr2 (13-209)||(31570743-31570939)
chr2 (17-191)||(4763644-4763821)
chr2 (14-191)||(26357593-26357770)
chr2 (13-181)||(3176965-3177133)
chr2 (13-205)||(41463859-41464051)
chr2 (13-208)||(17071746-17071941)
chr2 (14-209)||(39167373-39167568)
chr2 (13-175)||(37905740-37905902)
chr2 (13-191)||(44285965-44286143)
chr2 (13-170)||(43648254-43648411)
chr2 (13-175)||(33709241-33709403)
chr2 (13-107)||(41960940-41961034)
chr2 (1-126)||(7006918-7007043)
chr2 (13-208)||(17054105-17054300)
chr2 (16-209)||(18494292-18494473)
chr2 (13-209)||(2325387-2325575)
chr2 (16-208)||(5881533-5881729)
chr2 (21-183)||(33902092-33902252)
chr2 (14-181)||(19289333-19289500)
chr2 (13-207)||(44913662-44913857)
chr2 (38-208)||(11366415-11366585)
chr2 (13-106)||(31861953-31862046)
chr2 (62-180)||(41051263-41051382)
chr2 (13-191)||(35958925-35959090)
chr2 (24-104)||(19501760-19501839)
chr2 (162-191)||(6177791-6177820)
chr2 (13-66)||(18258296-18258349)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (13-208)||(133-328)
scaffold0002 (13-186)||(94374-94547)
scaffold0002 (13-106)||(408420-408512)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (13-205)||(7889-8081)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (13-205)||(11908-12103)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (21-205)||(43959-44143)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-205)||(154644-154828)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-159)||(267331-267477)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-191)||(146015-146185)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (116-208)||(42347-42439)
scaffold0009 (11-63)||(100894-100948)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 41765070 - 41765345
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41765070 gtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccacc 41765169  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41765170 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttccttaat 41765269  T
Q  213 tattaacattgcaatattg---atgttacacaaacgcttttttaaaatgttgtgacctacactgtggtatacaattt 286  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41765270 ta-taacattgcaatattgcacatgttacacaaaagcttttttaaaatgttgtgacctacattgtggtatacaattt 41765345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 48928289 - 48928466
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48928289 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcacc 48928387  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928388 gtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 48928556 - 48928754
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48928556 gtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcacc 48928654  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  48928655 gtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttctttaat 48928754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29173721 - 29173540
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173721 tgatagtcttaagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaact 29173622  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 182  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29173621 tttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21991805 - 21991610
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  21991805 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacact 21991706  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21991705 gtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcct 21991610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 5657474 - 5657667
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5657474 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactg 5657573  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5657574 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26980504 - 26980325
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26980504 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaact 26980405  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 180  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  26980404 tttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22687408 - 22687230
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22687408 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccact 22687309  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22687308 gcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgactt 22687230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18797496 - 18797299
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  18797496 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 18797397  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||   ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18797396 gtacaaacagtggggtgttactcattacattttt--tatgttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 18797299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8861454 - 8861260
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  8861454 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccact 8861355  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  8861354 gtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31520704 - 31520893
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31520704 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaact 31520802  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31520803 tttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgactt 31520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30055696 - 30055499
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30055696 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30055597  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  30055596 gtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 30055499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 32593170 - 32593326
Alignment:
Q  2 gatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32593170 gatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaactt 32593268  T
Q  102 ttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 159  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  32593269 ttgataccaccatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12165921 - 12165753
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||     
T  12165921 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccact 12165822  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12165821 gtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 12390614 - 12390818
Alignment:
Q  5 agtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  12390614 agtcttaagtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttg 12390713  T
Q  105 atgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattt 204  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || || ||||||    
T  12390714 atgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattt 12390813  T
Q  205 tcctt 209  Q
    |||||    
T  12390814 tcctt 12390818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4583088 - 4582894
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  4583088 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 4582989  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  4582988 gtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 32821045 - 32821241
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  32821045 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccatt 32821144  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  32821145 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24211909 - 24211717
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  24211909 tgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattc 24211810  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
    || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  24211809 tataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43686209 - 43686015
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  43686209 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccatt 43686110  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  43686109 gtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6546688 - 6546494
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||  ||     
T  6546688 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttact 6546589  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  6546588 gtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7334963 - 7334785
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      
T  7334963 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcatt 7334864  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7334863 gtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgactt 7334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 15612751 - 15612944
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  15612751 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccact 15612850  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
     |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||    
T  15612851 ctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38258714 - 38258536
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  38258714 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 38258615  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  38258614 gtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgactt 38258536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 9355818 - 9356014
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||     
T  9355818 gtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcact 9355917  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  9355918 gtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 33688253 - 33688431
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33688253 agtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccac 33688352  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     | ||||||||| || ||  |||||  |||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33688353 tggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataactt 33688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27283913 - 27283719
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27283913 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcatt 27283814  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||| || || |||||||||    
T  27283813 gtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 31579056 - 31579256
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  31579056 gtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcatt 31579155  T
Q  113 gta-----caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||      |||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  31579156 gtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcc 31579255  T
Q  208 t 208  Q
    |    
T  31579256 t 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421563
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattg 27421471  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || || |||||||    
T  27421472 tacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11071372 - 11071263
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  11071372 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgta 11071273  T
Q  116 caaacagtgg 125  Q
    ||||||||||    
T  11071272 caaacagtgg 11071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 10359206 - 10359400
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatt-aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  10359206 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcac 10359304  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
     ||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||   |  | || ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  10359305 tgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 25691536 - 25691715
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  25691536 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccact 25691635  T
Q  113 gtacaaacagtggggt-gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||| |||    |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25691636 gtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgactt 25691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37347188 - 37347013
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37347188 ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgta 37347089  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||| |||||||  ||||| || | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  37347088 caaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgactt 37347013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37110043 - 37109847
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggta--gggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  37110043 gtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtca 37109944  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
      |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37109943 ttgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 17842577 - 17842775
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggta--gggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||     
T  17842577 tgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcat 17842676  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
     |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||    
T  17842677 tgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcctta 17842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32432621 - 32432431
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||      
T  32432621 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcatt 32432522  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  32432521 gtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgata-----gtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35353238 - 35353120
Alignment:
Q  53 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35353238 tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgc 35353139  T
Q  152 tatagtgtcgacttcacca 170  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  35353138 tatagtgttgacttcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524517
Alignment:
Q  58 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagt 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||  ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  158 gtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 211  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 26524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10481774 - 10481660
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||      
T  10481774 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcatt 10481675  T
Q  113 gtacaaacagtgggg 127  Q
    |||||||||||||||    
T  10481674 gtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23111334 - 23111181
Alignment:
Q  38 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||    
T  23111334 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcac 23111235  T
Q  138 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     | | |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23111234 aatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 23111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413564
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||      
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagt 44413470  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||   | |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  44413471 gtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704241
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 44598835 - 44598737
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44598835 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccac 44598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 15672753 - 15672830
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672753 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  77 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  177 tcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||| | || || || |||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38053659 - 38053540
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||| |||||||| ||||||||    
T  38053659 tgatagtcttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaact 38053568  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggt 128  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  38053567 tttgatgtcattgtacaaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43925270 - 43925177
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43925270 gtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatg 43925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588126
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 37703491 - 37703551
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 74  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37703491 tgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299192
Alignment:
Q  143 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 110
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362191
Alignment:
Q  68 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgcca 34362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 46481122 - 46481182
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  46481122 tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40381985 - 40381934
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  40381985 acttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttaatt 40381934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3953776 - 3953747
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953776 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 3953747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 191
Target Start/End: Original strand, 23402374 - 23402403
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402374 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22451153 - 22450954
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22451153 gtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccacc 22451054  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22451053 atacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 22450954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 11357343 - 11357534
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11357343 tgatagtcttaagtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaact 11357442  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357443 tttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 11357534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 33378776 - 33378969
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33378776 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcacc 33378875  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||    
T  33378876 gtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactttgccatagaattttcctt 33378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21193792 - 21193594
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  21193792 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcac 21193693  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
      ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21193692 tctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcctta 21193594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11467006 - 11466814
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  11467006 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgta 11466907  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  11466906 caaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 52040916 - 52041092
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  52040916 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactata 52041015  T
Q  116 caaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52041016 caaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 52041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4015645 - 4015451
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4015645 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 4015546  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
     |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  4015545 ctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480548
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcacc 27480469  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  27480470 gtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgactt 27480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37203248 - 37203058
Alignment:
Q  17 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 116  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37203248 tacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtac 37203149  T
Q  117 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37203148 aaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40936187 - 40935993
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40936187 tgatagtcttaagtgttacacttaaaaaaagtt-ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaact 40936089  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaa 196  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| || ||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40936088 tttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacaa 40935993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48355125 - 48354930
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  48355125 tgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattg 48355026  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  48355025 tacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213166
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccatt 51213071  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  51213072 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35844512 - 35844315
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35844512 gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcac 35844413  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35844412 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35844315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 43975879 - 43976054
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |    
T  43975879 gtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatc 43975978  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||    
T  43975979 gtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt---caaaaaagtcattctcatgactt 43976054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37157892 - 37157699
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37157892 gtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccact 37157793  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  37157792 gtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34133120 - 34132924
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  34133120 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcatt 34133021  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  34133020 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 34132924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 46297753 - 46297945
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||      
T  46297753 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccatt 46297852  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  46297853 gtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Original strand, 44186492 - 44186663
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  44186492 gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 44186591  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 184  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  44186592 gtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 44186663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39282837 - 39282641
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  39282837 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccact 39282738  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  39282737 gtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctta 39282641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 53229145 - 53229322
Alignment:
Q  15 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  53229145 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgt 53229244  T
Q  115 acaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53229245 acaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgactt 53229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 26941254 - 26941446
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  26941254 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattata 26941353  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  26941354 caaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 4761640 - 4761838
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  4761640 gtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 4761739  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||  | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  4761740 gtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcctt 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29099540 - 29099362
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||     
T  29099540 gtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcact 29099441  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29099440 gtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 29099362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Original strand, 40552251 - 40552445
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||| |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  40552251 tgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattg 40552350  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40552351 tacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 42506066 - 42506212
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  42506066 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 42506165  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 159  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  42506166 gtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 3655193 - 3655388
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  3655193 gtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 3655292  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||| | || |||||||||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  3655293 gtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2008114 - 2007972
Alignment:
Q  17 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2008114 tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtac 2008015  T
Q  117 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 159  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||    
T  2008014 aaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgt 2007972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32373654 - 32373479
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||| |    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactg 32373555  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32373554 tacaaacagtggagt--tactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgactt 32373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373465
Alignment:
Q  26 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  126 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||  ||||  |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 20373465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45174692 - 45174516
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  45174692 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcta 45174593  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccact--cactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 185  Q
    | ||||||||||||  |||  |||  ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  45174592 ctgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44891683 - 44891514
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||      
T  44891683 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc-- 44891586  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
           |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44891585 -------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgactt 44891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 22446054 - 22446234
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22446054 agtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgcca 22446153  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    | ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22446154 ctgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgactt 22446234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 7327473 - 7327669
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  7327473 gtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 7327572  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg-tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||| | ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  7327573 gtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43348441 - 43348327
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||      
T  43348441 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccacta 43348343  T
Q  114 tacaaacagtggggtg 129  Q
     |||||||||||||||    
T  43348342 aacaaacagtggggtg 43348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3362440 - 3362276
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa--gtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3362440 gtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgcca 3362341  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 175  Q
    | ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  3362340 ctgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29164003 - 29163912
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29164003 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 24488953 - 24489131
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  24488953 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcatt 24489052  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    || ||||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||||||| |  ||||||| | |||| ||||| || ||||||    
T  24489053 gtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgactt 24489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25579924 - 25579746
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  25579924 gtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcact 25579825  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||| ||| ||| |  ||  | |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25579824 gtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Original strand, 24708106 - 24708242
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa--gtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24708106 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtca 24708205  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 149  Q
    | ||||  |||||| ||||  ||||||| || |||||||    
T  24708206 ctgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgat 24708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 46994654 - 46994746
Alignment:
Q  15 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994654 gttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 14586661 - 14586796
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||     
T  14586661 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcact 14586760  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttga 148  Q
    ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  14586761 gtataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53176240 - 53176127
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  53176240 agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttat 53176141  T
Q  112 cgtacaaacagtgg 125  Q
     |||||||||||||    
T  53176140 tgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47481682 - 47481511
Alignment:
Q  38 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 137  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||     
T  47481682 taaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcat 47481583  T
Q  138 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||||  ||||||| || ||  ||||||||||    
T  47481582 tacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcctt 47481511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33698338 - 33698265
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698338 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 21009792 - 21009940
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||  |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  21009792 agtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcat 21009891  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 160  Q
      |||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21009892 tctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtc 21009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 38591880 - 38591786
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  38591880 ttacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgcca 38591786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 54828693 - 54828786
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  54828693 tgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatg 54828786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 22622709 - 22622780
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 84  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622709 gtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835702
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54505993 - 54505823
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  54505993 agtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcat 54505895  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 183  Q
      || ||| | |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  54505894 tctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattct 54505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36012322 - 36012244
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012322 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 121
Target Start/End: Original strand, 53811696 - 53811767
Alignment:
Q  56 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg------actgaacttttgatgccaccgtacaaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53811696 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1089877 - 1089811
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089877 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Original strand, 40640637 - 40640684
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  40640637 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 40640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343471
Alignment:
Q  143 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 55343471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Original strand, 11835702 - 11835790
Alignment:
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||     ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11835702 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgata-----gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 7235025 - 7235225
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7235025 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcacc 7235123  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||    
T  7235124 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataat 7235223  T
Q  213 ta 214  Q
    ||    
T  7235224 ta 7235225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618850
Alignment:
Q  31 ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgc 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  131 cactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgactt 33618850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491631
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccact 15491710  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491709 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20768275 - 20768087
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20768275 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccacta 20768178  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
     ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20768177 -acaaacaatgga-tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8513419 - 8513232
Alignment:
Q  22 ttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8513419 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8513320  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8513319 agtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 4318812 - 4319009
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  4318812 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcac 4318911  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4318912 tgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 4319009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 3879929 - 3880124
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||      
T  3879929 gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcatt 3880028  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3880029 gtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6089094 - 6088910
Alignment:
Q  22 ttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6089094 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaac 6088995  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  6088994 agtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29182357 - 29182157
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||     
T  29182357 gtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacact 29182258  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||    
T  29182257 gtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttttcttaat 29182158  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  29182157 t 29182157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 30353349 - 30353540
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |    
T  30353349 tgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactg 30353448  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||||| | |   |||| | |||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  30353449 tacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 21017102 - 21017280
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  21017102 gtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccatt 21017201  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| |||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21017202 gtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 21017280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1946028 - 1945830
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  1946028 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 1945929  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||    
T  1945928 ctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcctta 1945830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 33892993 - 33893186
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||      
T  33892993 gtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcatt 33893091  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| | |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  33893092 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5627577 - 5627389
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||     
T  5627577 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaat 5627478  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||  ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||    
T  5627477 agtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055400
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 7055304  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     |||||| |||| ||||  ||| | || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  7055305 ctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498431
Alignment:
Q  76 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  175 agtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttcctt 18498431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 6091173 - 6091306
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||      
T  6091173 gtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcatt 6091272  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 146  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  6091273 gtacaaacaatggtgtgttactcactacattttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19631794 - 19631747
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  19631794 acttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 19631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 28003003 - 28003197
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  28003003 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcact 28003102  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28003103 gtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38012047 - 38011852
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38012047 tgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccg 38011948  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38011947 tacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38011852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816728
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccacc 33816649  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33816650 gtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 25701075 - 25701270
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25701075 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactg 25701174  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  25701175 tacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcctt 25701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 5047985 - 5048160
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||    
T  5047985 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgta 5048084  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5048085 caaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataactt 5048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 34948114 - 34948292
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  34948114 gtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccact 34948213  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948214 ttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgactt 34948292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 55241122 - 55241315
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55241122 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccact 55241220  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  55241221 gtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27396809 - 27396613
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |    
T  27396809 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattg 27396710  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    |||||||||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  27396709 tacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 27396613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 35021052 - 35021248
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||      
T  35021052 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaat 35021151  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35021152 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 35021248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 19089485 - 19089664
Alignment:
Q  28 caaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  19089485 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgggg 19089584  T
Q  128 tgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| || |||||| ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19089585 tgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23761265 - 23761089
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  23761265 gtgttacacttaaaacaaggtaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 23761167  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 190  Q
     ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761166 atacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 29584217 - 29584411
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  29584217 gtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccatt 29584316  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  29584317 gtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 29584411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 55477908 - 55478109
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  55477908 gtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 55478007  T
Q  113 gt----acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||    ||||||||||| |||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  55478008 gtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcct 55478107  T
Q  209 ta 210  Q
    ||    
T  55478108 ta 55478109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7703704 - 7703533
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7703704 agtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcac 7703613  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703612 cgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 7703533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32579637 - 32579466
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt- 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  32579637 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgta 32579539  T
Q  115 --acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 185  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32579538 caacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 35025613 - 35025800
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  35025613 gtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgat--------gatactacgaggactgaacttttgatgtcaac 35025704  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  35025705 gtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32592287 - 32592103
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  32592287 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcact 32592188  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 197  Q
     |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32592187 atacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaat 32592103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 37663758 - 37663951
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37663758 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 37663857  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||    ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  37663858 gtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49376154 - 49375982
Alignment:
Q  20 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 119  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  49376154 acttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaag 49376055  T
Q  120 cagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag-aaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376054 cagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgactt 49375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 19440665 - 19440843
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  19440665 gtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccatt 19440764  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| |||| |||  | ||| |||| |||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440765 gtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9139439 - 9139241
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||     
T  9139439 gtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcact 9139340  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||  | |||| || |||||  ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9139339 gtacaaacggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttccttaat 9139242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Original strand, 36493708 - 36493897
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  36493708 ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgta 36493807  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||| |||||||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  36493808 caaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25184307 - 25184112
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||      
T  25184307 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcatt 25184208  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  25184207 gtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33341592 - 33341397
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  33341592 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccact 33341494  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcacta----cacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||||||||   ||| | |    || |||||||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  33341493 gtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4598185 - 4598009
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||     
T  4598185 gtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccact 4598087  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598086 gtacaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 4598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37775861 - 37775685
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||     
T  37775861 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccact 37775764  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  37775763 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgactt 37775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 46888174 - 46888352
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |     
T  46888174 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgct 46888273  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  |||||| |  |||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  46888274 gtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgactt 46888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17167907 - 17167739
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||      
T  17167907 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcatt 17167808  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17167807 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17173484 - 17173316
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||      
T  17173484 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcatt 17173385  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17173384 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764748
Alignment:
Q  32 gtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgcc 131  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtt 50764806  T
Q  132 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  50764805 actcacaacacttttgat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt 50764748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47253934 - 47253751
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47253934 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtcact 47253843  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  47253842 gtataaacaatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Original strand, 54499254 - 54499425
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||     
T  54499254 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcat 54499353  T
Q  112 c-gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 182  Q
      |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54499354 tagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 879565 - 879743
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||      
T  879565 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcatt 879664  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||| || ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  879665 gtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgactt 879743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 4934226 - 4934360
Alignment:
Q  20 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  4934226 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaa 4934325  T
Q  120 cagt-ggggtgccactcactacacttttgatacta 153  Q
    || | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  4934326 caatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 30002649 - 30002837
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||        ||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  30002649 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat--------gatactaagaagactgaacttttgatgtcact 30002740  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| || || || ||||||||    
T  30002741 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccatagagttttcctt 30002837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6864229 - 6864053
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  6864229 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctatt 6864130  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 189  Q
    ||||||| ||| || ||  | ||| || | |||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6864129 gtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 32912597 - 32912793
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||      
T  32912597 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcatt 32912696  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  32912697 ctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 34361509 - 34361704
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||      
T  34361509 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcatt 34361607  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  34361608 ctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 34361704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37287919 - 37287732
Alignment:
Q  15 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||        || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  37287919 gttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatga--------tattatgaggattgaacttttgatgccactg 37287828  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  37287827 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39397918
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||         ||||||||||  || |||||||||||||||| |||     
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcact 39398013  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  39398012 gtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 39397918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42199915 - 42199723
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||     
T  42199915 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaat 42199816  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 213  Q
    | ||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||| || || || || ||||||| ||||    
T  42199815 aatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcctaaatt 42199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1815495 - 1815409
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815495 gtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50697435 - 50697320
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||      
T  50697435 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcatt 50697337  T
Q  113 gtacaaacagtggggtg 129  Q
    |||||||| || |||||    
T  50697336 gtacaaacggtagggtg 50697320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17272158 - 17272068
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17272158 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Original strand, 38812263 - 38812312
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  38812263 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 38812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3042813 - 3042741
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 85  Q
    ||||||| |||| || |||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042813 gtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4205210 - 4205114
Alignment:
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  4205210 gtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 4205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272008
Alignment:
Q  141 acttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctta 17272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Original strand, 20097494 - 20097537
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  20097494 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2704557 - 2704508
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  2704557 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttccttaa 2704508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 7152242 - 7152319
Alignment:
Q  132 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||    
T  7152242 actcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38811858 - 38811813
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38811858 acttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38811813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14758231 - 14758053
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14758231 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccacc 14758132  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758131 gtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 14758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15168286 - 15168083
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15168286 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccacc 15168187  T
Q  113 gt-------acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||    
T  15168186 gtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaatttt 15168087  T
Q  206 cctt 209  Q
    ||||    
T  15168086 cctt 15168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 31621545 - 31621717
Alignment:
Q  19 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31621545 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaa 31621644  T
Q  119 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    | || ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31621645 atagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgactt 31621717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 33725586 - 33725778
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725586 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 33725685  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
      | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  33725686 aaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16415833 - 16415639
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16415833 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgta 16415734  T
Q  116 caaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||  | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16415733 caaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47279378 - 47279201
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactg 47279279  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47279278 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 47279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11742325 - 11742532
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11742325 tgatagtcttaattgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaact 11742423  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgga 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |    
T  11742424 tttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaa 11742523  T
Q  201 attttcctt 209  Q
    |||||||||    
T  11742524 attttcctt 11742532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15752219 - 15752027
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15752219 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 15752120  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15752119 gtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40885002 - 40884841
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885002 tgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccg 40884903  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  40884902 tacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4330471 - 4330291
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  4330471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccact 4330372  T
Q  113 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga-cttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4330371 gtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataactt 4330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2959937 - 2959743
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2959937 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactg 2959838  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  2959837 tacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38823404 - 38823210
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  38823404 gtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacact 38823305  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38823304 gtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 10181994 - 10182189
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10181994 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccact 10182093  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||| | |||| ||  || ||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  10182094 gtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 27532967 - 27533144
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  27532967 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccact 27533065  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533066 gtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48620827 - 48620631
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  48620827 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcact 48620728  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||    
T  48620727 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcctt 48620631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3309338 - 3309144
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  3309338 gtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccac 3309239  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
     ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  3309238 tgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 27227471 - 27227587
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27227471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccact 27227570  T
Q  113 gtacaaacagtggggtg 129  Q
    |||||||||||| ||||    
T  27227571 gtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 34012363 - 34012559
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34012363 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccact 34012462  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34012463 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34012559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 27267186 - 27267361
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||     
T  27267186 gtgttacactcaaaacaaggtagattaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccact 27267284  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27267285 gtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 27267361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42721226 - 42721035
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||    
T  42721226 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgta 42721127  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  ||||| |   ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  42721126 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15383123 - 15382927
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||      
T  15383123 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacatt 15383024  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||| | || |||| || || |||||||||||    
T  15383023 gtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 7079049 - 7079238
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  7079049 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcatt 7079148  T
Q  113 gtacaaac-----------agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||           |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7079149 gtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 9903040 - 9903215
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||     
T  9903040 gtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcact 9903139  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 188  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9903140 gtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18422841 - 18422646
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  18422841 gtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcatt 18422742  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  18422741 gtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32216245 - 32216088
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||      
T  32216245 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccatt 32216146  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 170  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  32216145 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32267225 - 32267028
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  32267225 agtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcat 32267126  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||    
T  32267125 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcctt 32267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41926354 - 41926161
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  41926354 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccac 41926255  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
     |||||||||||||| |   |||||||| | |||||||  |||||| |  |||||| || |||| ||||| |||| |||| || || |||||||    
T  41926254 tgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3535122 - 3534926
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||     
T  3535122 gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcact 3535023  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    | |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  3535022 gcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttcctt 3534926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39393573 - 39393377
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  39393573 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccact 39393474  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||| ||  ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  39393473 gtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcctt 39393377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1547469 - 1547281
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1547469 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgccact 1547378  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  1547377 gcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 1547281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10922917 - 10922742
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  10922917 gtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 10922818  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10922817 gtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 238499 - 238690
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  238499 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 238598  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| || |||||| || || |||||||    
T  238599 gtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 47682480 - 47682657
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  47682480 gtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccact 47682579  T
Q  113 gtacaaacagtggg-gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||| ||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682580 gtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgactt 47682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 30326938 - 30327132
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  30326938 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctatt 30327037  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||| || ||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||| | |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  30327038 gtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25160822 - 25160710
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25160822 gtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 25160723  T
Q  113 gtacaaacagtgg 125  Q
    |||||||| ||||    
T  25160722 gtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 19899755 - 19899950
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  19899755 gtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccatt 19899854  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     ||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  19899855 ctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30254605 - 30254419
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  30254605 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 30254506  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||| | ||   ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || ||||||||||    
T  30254505 agt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 28564775 - 28564945
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28564775 cttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 28564874  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||  ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| |||| ||||    
T  28564875 agtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataactt 28564945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 37618886 - 37619078
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg--atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 118  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||    
T  37618886 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaa 37618985  T
Q  119 acagtggggtg--ccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||    ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |||| || || |||||||||||    
T  37618986 acagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcctt 37619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  59 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt-------ttgatac 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       || ||      
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  152 tatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8222318 - 8222123
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  8222318 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccatt 8222219  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 211  Q
    ||   ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||| | ||| |||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  8222218 gt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttccttaa 8222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37451475 - 37451298
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  37451475 gtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcatt 37451377  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| || |||||  ||| | |||| |||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  37451376 gtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51129049 - 51128884
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||      
T  51129049 gtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcatt 51128950  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 178  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  51128949 gtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28769842 - 28769651
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  28769842 gtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccatt 28769743  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||  ||||||| | |||||| ||| | ||||||| || || |||||||    
T  28769742 gtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 27563898 - 27564017
Alignment:
Q  20 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  27563898 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaa 27563997  T
Q  120 cagtggggtgccactcacta 139  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  27563998 cagtggagtgttactcacta 27564017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23999529 - 23999359
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||     
T  23999529 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaat 23999430  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||  ||||  || | |||| ||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23999429 agtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 23999359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46931588 - 46931446
Alignment:
Q  26 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 125  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||    
T  46931588 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtgg 46931489  T
Q  126 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 168  Q
    |||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  46931488 ggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 27763297 - 27763391
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27763297 gtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatg 27763391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22170901 - 22170807
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22170901 gtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38759723 - 38759610
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga----ctgaacttttgatgc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||     
T  38759723 gtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgt 38759624  T
Q  109 caccgtacaaacag 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  38759623 cactgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 4150489 - 4150537
Alignment:
Q  161 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  4150489 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 4150537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43579287 - 43579242
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43579287 acttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33908427 - 33908249
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908427 gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 33908328  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33908327 gtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgactt 33908249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409501
Alignment:
Q  15 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgt 14409408  T
Q  115 acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |  || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  14409409 attaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 1429114 - 1429321
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1429114 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatt 1429213  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgga 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||| || || ||    
T  1429214 tttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttcaccataga 1429313  T
Q  201 attttcct 208  Q
     |||||||    
T  1429314 tttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 31786627 - 31786821
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31786627 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccact 31786726  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||     ||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||    
T  31786727 gtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22980987 - 22980809
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  22980987 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 22980888  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |  |||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980887 gctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 22980809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26268268 - 26268090
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26268268 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcacc 26268169  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26268168 gtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 26268090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19120053 - 19119857
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||     
T  19120053 gtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcact 19119954  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19119953 gtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 19119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 699345 - 699166
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  699345 agtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcac 699246  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     |||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  699245 tgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataactt 699166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 30969305 - 30969483
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30969305 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30969404  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30969405 gtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgactt 30969483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 8741867 - 8742064
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||      
T  8741867 gtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccatt 8741966  T
Q  113 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8741967 gtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 8742064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24886310 - 24886100
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24886310 tgatagtcttaagtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaact 24886211  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatgacttgacaatg 198  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||     
T  24886210 tttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccata 24886111  T
Q  199 gaattttcctt 209  Q
     ||||||||||    
T  24886110 aaattttcctt 24886100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7693424 - 7693230
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  7693424 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccact 7693325  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  7693324 gtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27330498 - 27330299
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  27330498 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccatt 27330399  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||    
T  27330398 gtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttccttaat 27330301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39573012 - 39572818
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  39573012 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactg 39572913  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39572912 cacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5837746 - 5837574
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||    
T  5837746 ttacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgta 5837647  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 188  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837646 caaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8466950 - 8466739
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8466950 tgatagtcttaagtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaact 8466851  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatgga 200  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||    
T  8466850 tttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcataga 8466752  T
Q  201 attttccttaatt 213  Q
    |||||||||||||    
T  8466751 attttccttaatt 8466739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 25500907 - 25501099
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||      
T  25500907 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagt 25501006  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25501007 gtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 38528218 - 38528413
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  38528218 gtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcact 38528316  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  38528317 gtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9200426 - 9200232
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  9200426 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactg 9200327  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  9200326 tacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36866956 - 36866762
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  36866956 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccatt 36866857  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||||    
T  36866856 gtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40133579 - 40133385
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||      
T  40133579 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccatt 40133480  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  40133479 gtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12910549 - 12910348
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc--- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  12910549 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 12910450  T
Q  110 --accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
      || |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  12910449 gtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 12910350  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  12910349 tt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32563342 - 32563150
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |    
T  32563342 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactg 32563243  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  32563242 tacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 23116203 - 23116397
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  23116203 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccact 23116302  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||  | |||||||||| ||||||| | || || |||||||||    
T  23116303 gtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112490
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgta 5112396  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  5112397 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 5112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22019826 - 22019656
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  22019826 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcact 22019727  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 183  Q
     |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22019726 atacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 27318468 - 27318646
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||      
T  27318468 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcatt 27318567  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27318568 gtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 27318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36860618 - 36860420
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaa-ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  36860618 gtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcat 36860519  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
     |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  36860518 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 36860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 35511458 - 35511636
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  35511458 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcact 35511557  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  |||| |||  |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35511558 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgactt 35511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 23954770 - 23954897
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac- 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||     
T  23954770 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccact 23954869  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcacta 139  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23954870 agtaaaaacagtggggtgttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22974063 - 22974259
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  |      
T  22974063 gtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttatt 22974162  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  22974163 gtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcctt 22974259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 31705594 - 31705785
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |    
T  31705594 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattg 31705692  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
    ||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  31705693 tacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Original strand, 6824460 - 6824598
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga--acttttgatgcca 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  6824460 gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtca 6824559  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 149  Q
    | ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  6824560 ctgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 21088748 - 21088887
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  21088748 tgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 21088847  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088848 tacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatacta 21088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22255376 - 22255197
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  22255376 gtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccatt 22255277  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22255276 gtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgactt 22255197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15724682 - 15724490
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||      
T  15724682 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcatt 15724585  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  15724584 gtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 35826464 - 35826660
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35826464 agtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcac 35826562  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     ||||||||| ||  |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35826563 tgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35934090 - 35933901
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaat-tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35934090 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccac 35933991  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
      ||     |||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  35933990 --ta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcct 35933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 15992521 - 15992636
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  15992521 gtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcact 15992620  T
Q  113 gtacaaacagtggggt 128  Q
    ||||||||||||||||    
T  15992621 gtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 28416508 - 28416663
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| ||||     
T  28416508 gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccact 28416607  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 168  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  28416608 gtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 14919509 - 14919706
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14919509 gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 14919608  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     || |||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| | | |||| | ||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  14919609 atataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcctt 14919706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 43308633 - 43308746
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43308633 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 43308732  T
Q  113 gtacaaacagtggg 126  Q
    |||| |||||||||    
T  43308733 gtacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 7208845 - 7208960
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  7208845 gtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaat 7208943  T
Q  113 gtacaaacagtggggtg 129  Q
    |||||||| || |||||    
T  7208944 gtacaaacggtagggtg 7208960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8437152 - 8436965
Alignment:
Q  20 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 119  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8437152 acttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaa 8437054  T
Q  120 cagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    || |||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  8437053 caatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacattagaattgtcct 8436965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25668798 - 25668707
Alignment:
Q  58 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25668798 tcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35504559 - 35504443
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| || | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |    
T  35504559 gtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatc 35504460  T
Q  113 gtacaaacagtggggtg 129  Q
     ||||||| ||| ||||    
T  35504459 atacaaacggtgaggtg 35504443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898018
Alignment:
Q  70 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||| | |  |||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  170 agaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgactt 11898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 17158012 - 17158166
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| || |||||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||      
T  17158012 gtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcatt 17158110  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 168  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  17158111 gtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 42342921 - 42342851
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 87  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342921 ttacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 13956343 - 13956415
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 85  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956343 gtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 13956426 - 13956527
Alignment:
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13956426 gtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttccttaat 13956525  T
Q  213 ta 214  Q
    ||    
T  13956526 ta 13956527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5830086 - 5829962
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  5830086 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcatt 5829996  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 146  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| ||||    
T  5829995 gtacaaacggtagggtgttactcattacattttt 5829962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25669781 - 25669739
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 54  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669781 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 16004476 - 16004552
Alignment:
Q  132 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc-attctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  16004476 actcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22616539 - 22616492
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  22616539 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 22616492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10237459 - 10237415
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  10237459 acttcactagaaaagtcattttcatgacttcacaatagaattttc 10237415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 27082835 - 27083030
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27082835 gtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccact 27082934  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  27082935 gcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 5299943 - 5300137
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5299943 gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccact 5300042  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5300043 gtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38644172 - 38643975
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38644172 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccac 38644073  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
       |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38644072 tagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34895160 - 34894964
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34895160 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccact 34895061  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34895060 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34894964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 36694963 - 36695163
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  36694963 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 36695062  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||    
T  36695063 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttccttaat 36695162  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  36695163 t 36695163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 6098515 - 6098709
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  6098515 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcact 6098614  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||||    
T  6098615 gtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 6098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 37970516 - 37970694
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  37970516 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcatt 37970615  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37970616 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 37970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 16446872 - 16447067
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||      
T  16446872 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccatt 16446971  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  16446972 atacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33906404 - 33906223
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                
T  33906404 tgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------ 33906317  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||    
T  33906316 tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 466035 - 465857
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  466035 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccact 465936  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  465935 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgactt 465857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1205120 - 1204942
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  1205120 gtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 1205021  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205020 gtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 1204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 10555207 - 10555377
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  10555207 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 10555306  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10555307 agtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 10555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13307816 - 13307622
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  13307816 gtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcact 13307717  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  13307716 gtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150306
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |       
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgtt 1150201  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  1150202 gtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc-taat 1150300  T
Q  213 tattaa 218  Q
    ||||||    
T  1150301 tattaa 1150306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9864341 - 9864145
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  9864341 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcatt 9864242  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  9864241 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 9864145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 34952027 - 34952223
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  34952027 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcac 34952126  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  34952127 tgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcct 34952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11727217 - 11727039
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11727217 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccact 11727118  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     |||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11727117 atacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 11727039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12876302 - 12876108
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  12876302 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 12876203  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  12876202 gtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16223056 - 16222860
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16223056 gtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 16222957  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||| | |||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  16222956 gtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 43643592 - 43643788
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||      
T  43643592 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcatt 43643691  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  43643692 gtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 23854428 - 23854606
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23854428 gtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 23854527  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    | ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854528 gcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 23854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40862613 - 40862416
Alignment:
Q  12 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  40862613 agtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccat 40862515  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||| || || |||||||||||    
T  40862514 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 31933891 - 31934082
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| |||     
T  31933891 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaag 31933990  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||    
T  31933991 agtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcacgttagaattttctttaat 31934082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 1149629 - 1149742
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  1149629 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcatt 1149728  T
Q  113 gtacaaacagtggg 126  Q
    ||||||||||||||    
T  1149729 gtacaaacagtggg 1149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 30654580 - 30654775
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||      
T  30654580 gtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcatt 30654679  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
      |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  30654680 caacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 39099117 - 39099232
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtg 39099216  T
Q  114 tacaaacagtggggtg 129  Q
    |||||| |||||||||    
T  39099217 tacaaagagtggggtg 39099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911153
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctact 41911084  T
Q  113 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 180  Q
    ||   || ||| ||||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  41911085 gttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 1953987 - 1954103
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1953987 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccact 1954086  T
Q  113 gtacaaacagtggggtg 129  Q
    || |||| ||| |||||    
T  1954087 gtccaaatagtagggtg 1954103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 35459709 - 35459819
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  35459709 tgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattg 35459808  T
Q  114 tacaaacagtg 124  Q
    ||||| |||||    
T  35459809 tacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 7890954 - 7891066
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||      
T  7890954 gtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccatt 7891053  T
Q  113 gtacaaacagtgg 125  Q
    |||||||| ||||    
T  7891054 gtacaaacggtgg 7891066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7998500 - 7998401
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998500 tgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44869686 - 44869576
Alignment:
Q  18 acacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |    
T  44869686 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgc 44869587  T
Q  117 aaacagtgggg 127  Q
    |||||||||||    
T  44869586 aaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43025895 - 43025753
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || |||      
T  43025895 gtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccatt 43025796  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactata 155  Q
    ||||||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  43025795 gtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgatactata 43025753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 8803814 - 8803974
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||       | |||||||||||||| ||      
T  8803814 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcatt 8803906  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 180  Q
     |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8803907 ctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 4132683 - 4132750
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4132683 gtgttacacttaaa-caaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 207
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133199
Alignment:
Q  83 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||   |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  183 tcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33197997 - 33197947
Alignment:
Q  58 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33197997 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823466
Alignment:
Q  139 acacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctta 24823466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7998402 - 7998361
Alignment:
Q  167 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7998402 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 7998361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 6446708 - 6446752
Alignment:
Q  161 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  6446708 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttt 6446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15009305 - 15009241
Alignment:
Q  143 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  15009305 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 15009241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 39099262 - 39099302
Alignment:
Q  169 cagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  39099262 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 39099302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36642182 - 36641980
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa--ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36642182 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 36642083  T
Q  111 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    | |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  36642082 ctgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 36641983  T
Q  211 att 213  Q
    |||    
T  36641982 att 36641980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4167116 - 4166919
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  4167116 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccatt 4167017  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  4167016 gtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 4166919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 33550995 - 33551195
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      
T  33550995 gtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcatt 33551094  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||    
T  33551095 gtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataat 33551194  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  33551195 t 33551195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 19424637 - 19424832
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19424637 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccact 19424736  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
     || ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  19424737 atataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19314045 - 19313852
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  19314045 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcact 19313947  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19313946 gtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 33660377 - 33660569
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33660377 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccact 33660476  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||| | ||||||| || || |||||||    
T  33660477 gtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 29242147 - 29242345
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  29242147 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccact 29242246  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 211  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| ||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  29242247 gtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaa 29242345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 4264086 - 4264281
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||     
T  4264086 gtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcact 4264185  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  4264186 gtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4478564 - 4478368
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4478564 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccac 4478465  T
Q  112 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc-atgacttgacaatggaattttcc 207  Q
     ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||| || ||||||| || || |||||||||    
T  4478464 tgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45327914 - 45327801
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45327914 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcacc 45327815  T
Q  113 gtacaaacagtggg 126  Q
    ||| ||||| ||||    
T  45327814 gtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 43770848 - 43771039
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  43770848 gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccact 43770947  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||    
T  43770948 gtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 27349948 - 27350109
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  27349948 gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcact 27350046  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 175  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  27350047 gtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41465695 - 41465509
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |    
T  41465695 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagc 41465596  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
    ||        | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  41465595 gt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13711633 - 13711465
Alignment:
Q  38 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 137  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  13711633 taaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcac 13711534  T
Q  138 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 206  Q
     ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  13711533 aacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 31570743 - 31570939
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  31570743 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcact 31570842  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
     || ||| |||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||    
T  31570843 ataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4763821 - 4763644
Alignment:
Q  17 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 116  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4763821 tacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtac 4763722  T
Q  117 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg---acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4763721 aaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 4763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26357770 - 26357593
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| ||| |    
T  26357770 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactg 26357671  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26357670 tacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 26357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3177133 - 3176965
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  3177133 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 3177034  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 181  Q
    ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  3177033 gtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 41463859 - 41464051
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41463859 gtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccact 41463958  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||||||    
T  41463959 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 17071746 - 17071941
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||      
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||| | || | ||  ||| |||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 39167373 - 39167568
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  39167373 tgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattg 39167472  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| || |||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||||    
T  39167473 tacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcctt 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37905902 - 37905740
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37905902 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 37905803  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 175  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  37905802 gtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44286143 - 44285965
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  44286143 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccact 44286044  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
     ||||||||||| | |    ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  44286043 atacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgactt 44285965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 43648254 - 43648411
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  43648254 gtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcatt 43648353  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 170  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  43648354 atacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 33709241 - 33709403
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  33709241 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 33709340  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 175  Q
    |||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  33709341 gtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 41961034 - 41960940
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41961034 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 7006918 - 7007043
Alignment:
Q  1 tgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  7006918 tgatattcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaact 7007017  T
Q  101 tttgatgccaccgtacaaacagtggg 126  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  7007018 tttgatgctactgtacaaacagtggg 7007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 17054105 - 17054300
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||      
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||| || | ||  ||| |||||| |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 18494292 - 18494473
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  18494292 ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------ 18494385  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
          ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  18494386 ------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcctt 18494473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 2325387 - 2325575
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2325387 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagt 2325478  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 209  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||    
T  2325479 gtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttcctt 2325575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5881729 - 5881533
Alignment:
Q  16 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  5881729 ttacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgta 5881631  T
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacac-----ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||     |||||||  |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||    
T  5881630 caaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902092
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 183  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 19289333 - 19289500
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  |    
T  19289333 tgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattg 19289432  T
Q  114 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 181  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  19289433 tacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44913857 - 44913662
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgccac 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||     
T  44913857 gtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcat 44913758  T
Q  112 cgtacaaac-agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 207  Q
      ||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  44913757 tttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 11366415 - 11366585
Alignment:
Q  38 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 137  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| | ||  |||||     
T  11366415 taaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcat 11366514  T
Q  138 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||    
T  11366515 tacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31862046 - 31861953
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 106  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862046 gtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  62 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |     
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  161 gacttcaccagaaaagtcat 180  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35959090 - 35958925
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| ||| ||      
T  35959090 gtgttacgcttataacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcatt 35959004  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35959003 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 104
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  24 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 104  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6177820 - 6177791
Alignment:
Q  162 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177820 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 6177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258349
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 66  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 133
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  328 gtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 229  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  228 gtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 94374 - 94547
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  94374 gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccact 94473  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 186  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  94474 gtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 408420 - 408512
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408420 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8081 - 7889
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8081 gtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 7982  T
Q  113 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  7981 gtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 11908
Alignment:
Q  13 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  12103 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccact 12004  T
Q  113 g-tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca-ttctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||  ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  12003 gatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44143 - 43959
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44143 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaac 44044  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  44043 aacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 154644 - 154828
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  154644 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaac 154743  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 205  Q
    |  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  154744 aacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 267477 - 267331
Alignment:
Q  14 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| |    
T  267477 tgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactg 267378  T
Q  114 tac-aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 159  Q
    ||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  267377 tacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 146015 - 146185
Alignment:
Q  21 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||     
T  146015 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaat 146114  T
Q  121 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 191  Q
    | |||||||  ||||| |||| |||| ||  |||| |||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  146115 aatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgactt 146185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42347
Alignment:
Q  116 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 208  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 100948 - 100894
Alignment:
Q  11 aagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 63  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  100948 aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University