View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3608_high_6 (Length: 375)

Name: NF3608_high_6
Description: NF3608
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3608_high_6
NF3608_high_6
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (13-358)||(2630908-2631253)
chr4 (13-345)||(23873761-23874094)
chr4 (13-358)||(8487266-8487612)
chr4 (13-345)||(55298145-55298475)
chr4 (19-358)||(20673218-20673560)
chr4 (119-358)||(12776599-12776839)
chr4 (143-358)||(33312908-33313124)
chr4 (13-352)||(7663523-7663863)
chr4 (25-352)||(23279122-23279450)
chr4 (25-288)||(47540505-47540768)
chr4 (70-254)||(8655415-8655599)
chr4 (167-289)||(25875129-25875250)
chr4 (65-288)||(3130316-3130539)
chr4 (97-280)||(1121013-1121196)
chr4 (260-358)||(42072807-42072905)
chr4 (201-288)||(5817654-5817741)
chr4 (88-125)||(13159132-13159169)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (13-358)||(16421295-16421639)
chr8 (13-358)||(2871701-2872045)
chr8 (13-272)||(412651-412909)
chr8 (13-358)||(7451862-7452207)
chr8 (148-358)||(35405253-35405464)
chr8 (13-113)||(35405460-35405560)
chr8 (25-288)||(19385007-19385270)
chr8 (191-289)||(28542582-28542680)
chr8 (197-285)||(12218486-12218574)
chr8 (80-150)||(30501686-30501756)
chr8 (22-110)||(39482996-39483084)
chr8 (106-144)||(43613442-43613480)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (13-358)||(29308917-29309263)
chr3 (13-358)||(23601282-23601628)
chr3 (13-358)||(6176763-6177109)
chr3 (13-358)||(2813785-2814131)
chr3 (13-352)||(7146557-7146896)
chr3 (27-341)||(25873411-25873726)
chr3 (13-288)||(30167630-30167905)
chr3 (25-330)||(9378633-9378940)
chr3 (13-288)||(49732218-49732493)
chr3 (247-358)||(6517892-6518004)
chr3 (64-272)||(28675265-28675473)
chr3 (65-149)||(13448197-13448281)
chr3 (201-288)||(32004560-32004647)
chr3 (197-272)||(24227411-24227486)
chr3 (201-286)||(14868258-14868343)
chr3 (106-158)||(9319513-9319565)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (13-358)||(13754975-13755320)
chr6 (13-358)||(15673334-15673680)
chr6 (22-358)||(8873120-8873457)
chr6 (13-358)||(23347751-23348097)
chr6 (22-345)||(25317385-25317700)
chr6 (22-345)||(26204879-26205194)
chr6 (40-358)||(19348783-19349093)
chr6 (35-144)||(4406736-4406845)
chr6 (58-149)||(1682765-1682856)
chr6 (65-272)||(33629694-33629900)
chr6 (64-144)||(33745819-33745899)
chr6 (229-289)||(4596465-4596525)
chr6 (19-285)||(19256628-19256894)
chr6 (88-128)||(14528113-14528153)
chr6 (88-128)||(14532839-14532879)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (13-356)||(3692140-3692482)
chr1 (13-358)||(32353582-32353928)
chr1 (13-358)||(38231196-38231542)
chr1 (27-345)||(48073731-48074050)
chr1 (22-340)||(37530091-37530412)
chr1 (13-320)||(14119311-14119620)
chr1 (13-358)||(36928677-36929022)
chr1 (13-358)||(36305294-36305639)
chr1 (13-288)||(21527741-21528016)
chr1 (25-358)||(4644524-4644856)
chr1 (65-288)||(14365962-14366184)
chr1 (44-288)||(47115868-47116112)
chr1 (13-278)||(48266003-48266268)
chr1 (173-288)||(25639908-25640023)
chr1 (24-291)||(30970904-30971171)
chr1 (201-288)||(52336242-52336329)
chr1 (303-358)||(8982383-8982438)
chr1 (201-288)||(9528226-9528313)
chr1 (82-132)||(26510710-26510760)
chr1 (47-137)||(34853959-34854049)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (13-352)||(43627013-43627354)
chr2 (13-345)||(33547394-33547727)
chr2 (13-358)||(13549633-13549979)
chr2 (13-341)||(9949549-9949878)
chr2 (13-352)||(22052142-22052482)
chr2 (79-358)||(26681390-26681670)
chr2 (86-341)||(31594080-31594336)
chr2 (13-358)||(31085922-31086267)
chr2 (90-352)||(35694148-35694411)
chr2 (22-358)||(45421027-45421364)
chr2 (24-290)||(31774262-31774528)
chr2 (45-212)||(26180242-26180409)
chr2 (220-358)||(32145412-32145550)
chr2 (304-345)||(16103660-16103701)
chr2 (247-286)||(558655-558694)
chr2 (206-286)||(26490731-26490811)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (13-345)||(13439575-13439908)
chr7 (35-358)||(28326865-28327189)
chr7 (13-358)||(30385709-30386054)
chr7 (13-356)||(45235461-45235805)
chr7 (108-358)||(3632312-3632561)
chr7 (13-185)||(45942534-45942706)
chr7 (25-301)||(12379022-12379299)
chr7 (27-352)||(3104418-3104744)
chr7 (25-288)||(46623284-46623547)
chr7 (25-358)||(15654002-15654336)
chr7 (13-289)||(43104890-43105166)
chr7 (197-285)||(21277520-21277608)
chr7 (201-288)||(9546317-9546404)
chr7 (197-344)||(38730027-38730175)
chr7 (169-286)||(19728069-19728186)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (22-358)||(6264492-6264831)
chr5 (13-358)||(32917826-32918172)
chr5 (23-341)||(34480482-34480801)
chr5 (93-345)||(34858058-34858311)
chr5 (13-352)||(15499931-15500271)
chr5 (44-288)||(10487222-10487466)
chr5 (22-122)||(31862339-31862439)
chr5 (34-144)||(6020462-6020572)
chr5 (115-286)||(4399459-4399630)
chr5 (106-144)||(5596774-5596812)
chr5 (206-286)||(3199605-3199685)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (108-358)||(13524-13773)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (13-352)||(7190-7530)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (67-288)||(134975-135196)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (67-288)||(312802-313023)
scaffold0002 (67-288)||(328256-328477)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (191-264)||(22676-22749)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2631253 - 2630908
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2631253 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgcatgggttg 2631154  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631153 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 2631054  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631053 taaaaaagctacctttgtttttaggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 2630954  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2630953 cgttgtaactcttggtttatgaggtagtctcttcggcacatcttgt 2630908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 23873761 - 23874094
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23873761 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgataggtggaggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 23873860  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23873861 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgtgacccccatcccctgtttacttgataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 23873960  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  23873961 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggtttttctgttgtgttttgtatgtaa 23874060  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23874061 ccgttgtaactcttggtttctgaggtagtctcta 23874094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 8487266 - 8487612
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8487266 aatatttcagatcatttcttacagttcacttatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttttatgtgcctgggttg 8487365  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8487366 tttggactgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 8487465  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8487466 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattgactaatgtttttctggtgtgttttgtttgtaa 8487565  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
      ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  8487566 ttgttataactcttggtttctgaggtagtctcttaggcacatcttgt 8487612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 55298475 - 55298145
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55298475 aatatttcagctcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgc---acgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 55298379  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55298378 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccctatcccctgtttacttgataagattaagttgttgtctctaggttggttgaaagc 55298279  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  55298278 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggtttttctgttgtgttttgtatgtaa 55298179  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55298178 tcgttgtaactcttggtttctgaggtagtctcta 55298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20673560 - 20673218
Alignment:
Q  19 tcagatcattttttc-cagttcactcattt-gacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtg 116  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20673560 tcagatcatttttttacagttcactcattttgacagttggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgcctaggttgtttg 20673461  T
Q  117 gaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaa 216  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20673460 gaatgaacataataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggtataaagctaaa 20673361  T
Q  217 aaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgt 315  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20673360 aaagcttcctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagctctcttgtttgtttgggtatttgctaatgtttttatgttgtgttttgtttgtaatcgt 20673261  T
Q  316 tgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||    
T  20673260 tgtaactcttggttcctgaggtagtctcttaggcacaccttgt 20673218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 12776599 - 12776839
Alignment:
Q  119 atgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaa 218  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12776599 atgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccc-atcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaag 12776697  T
Q  219 agctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtg-ttttgtttgtaaccgtt 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  12776698 agctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctgttgtgtttttttttgtaatcgtt 12776797  T
Q  317 gtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||    
T  12776798 gtaactcttggttcctgaggtagtctcttaggcacaccttgt 12776839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33313124 - 33312908
Alignment:
Q  143 atcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactca 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  33313124 atcatgttgttactcccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctttaggttggttgaaagttaaaaaagttacttttgtttttgggactca 33313025  T
Q  243 gcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  33313024 gcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggcattggctaatgattttctgttgtgttttgtttgtaatcgttataactcttgattcctgaggtagtc 33312925  T
Q  342 tctacggcacatcttgt 358  Q
    |||| |||||| |||||    
T  33312924 tctaaggcacaccttgt 33312908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 7663523 - 7663863
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||| | || || ||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7663523 aatatttccgatcattttattcattttacttatttgacaggtggttttgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgggttg 7663622  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  7663623 tgtggaatgaacgcaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttagacaaggttaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 7663722  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttc-tgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    || ||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||   ||||||     
T  7663723 tagaaaagctacttttgtttttggtacccatcagtggtggtcatgctctcttgtttgtttgggtattggctaatgtagtcttgttgggttggttttgtat 7663822  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
      ||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||    
T  7663823 ttgttgtaactcttggttcctgtagtagtctctaaggcaca 7663863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23279450 - 23279122
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |    
T  23279450 cattttttacagtttacttatttgacaggtagtgctcactctagatgctcttttatgcaacttatatggcttctttgtgtgtgggttgtgtggaacgaac 23279351  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||| || |  || |||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  23279350 gaaataatcgtctgtttaataatgttgttactcccatcccccgtttattagacaaggttaagatgtttcctttagggtggctaaaaggtaaaaaagctac 23279251  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt-ttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactc 323  Q
     || ||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||| ||||| | ||||||||  |||||||||     
T  23279250 ttttgttttcggtacccaacagtggtggtcttgccctcttgtttgtttgggtataggttaatgttgctctgctgtgtgtggtttgtaattgttgtaactt 23279151  T
Q  324 ttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||    
T  23279150 ttggtttctgtggcagtctctaaggcaca 23279122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47540768 - 47540505
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  47540768 cattttcttcagtttacttatttgacaggtggtgctaagtctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgggttgtgtggaatgaac 47540669  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || ||| |||||||| ||||  | || | |||  |  ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47540668 gaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcatttcccgtttgttagacaaggtcaagatgttgtccttaacttggttgaaagctaaaaaagctac 47540569  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  47540568 ttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcatgccctcttgtgtgtttgggtataggctgatgt 47540505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 254
Target Start/End: Original strand, 8655415 - 8655599
Alignment:
Q  70 cgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| ||||  | || ||||| ||  |||    
T  8655415 cgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgggttgtgtggaatgagcgaaataatcgcctgtttaataatgtaataactcccattccccgtt 8655514  T
Q  170 tactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtc 254  Q
    |  |||||||| | ||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  8655515 tgttagataaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaggctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtc 8655599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 289
Target Start/End: Original strand, 25875129 - 25875250
Alignment:
Q  167 gtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgt 266  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||    
T  25875129 gtttattagacaaggttaagatgttgtctttaggttggttgaaagctaaaaaaactacctttgtttttggcacgcatcagtggtggtcaaacccttttgt 25875228  T
Q  267 ttgtttaggtattggctaatgtt 289  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  25875229 ttgttt-ggaattggctaatgtt 25875250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 288
Target Start/End: Original strand, 3130316 - 3130539
Alignment:
Q  65 ctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||    
T  3130316 ctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgaacaaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattcc 3130415  T
Q  165 ttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctctt 264  Q
      | ||  |||| ||| | ||  || ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  3130416 ccgcttgttagacaaggtcaaattgttgtccttagcttggttgaaagctaaaaaaactacttttgtgtttgatactcaacagtggtggtcttgccctctt 3130515  T
Q  265 gtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    || ||||| ||||| |||| ||||    
T  3130516 gtgtgtttgggtataggctgatgt 3130539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 1121013 - 1121196
Alignment:
Q  97 ctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctc 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| |||||||| ||||  | || | ||||||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||      
T  1121013 ctttgtgcctggattgtgtggaatgaacgaaataatcgtctgtttaataatgtaataactcacatcccccgtttgttagacaaggtaaagatgttgtcct 1121112  T
Q  197 taggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattg 280  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1121113 taggttgattgaaaattaaaaaagctatctttgtttttggtacccaacagtggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattg 1121196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 358
Target Start/End: Original strand, 42072807 - 42072905
Alignment:
Q  260 ctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  42072807 ctcttgtttgtttgggtattggctaatgtctttctgttatggcttggttgtaacc-ttgtaactcttggttttggaggtagtcactagggcacaccttgt 42072905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Original strand, 5817654 - 5817741
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||    
T  5817654 ttggttgaaagctaaaaaaactacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctcttatgtgtttgggtataggctgatgt 5817741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Original strand, 13159132 - 13159169
Alignment:
Q  88 atatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcg 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13159132 atatggcttctttttgcctgggttgtgtagaatgagcg 13159169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 16421295 - 16421639
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  16421295 aatatatcagatcatttt-tccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgtttgggttg 16421393  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16421394 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatattgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctatctctaggttggttgaaagc 16421493  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16421494 taaaaaagctacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatattttctgttgtgttttgtttgtaac 16421593  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16421594 cgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcacatcttgt 16421639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2872045 - 2871701
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2872045 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgttgctggacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcctgggttg 2871946  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| || |   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2871945 tttggaatgaacgtaataatcagatgtttaatcatgttgttacccc-ataccttgtttactagataagattaagctgctatctctaggttggttgaaagc 2871847  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||    
T  2871846 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctattgt-tttggtttgtaa 2871748  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2871747 ccgttgtaactcttgatttttgtggtagtctctaaggcacatcttgt 2871701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 412651 - 412909
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  412651 aatatttccgatcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgttgtcaaacggtcttttatgcaactaatattgcttctttgtgtctgggttg 412750  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  412751 tttggaatgaacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccc-atcccttgtttactagataagattaagttgctgtctttaggttggctgaaagc 412849  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgttt 272  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  412850 taaaaaaactacctttgtttttggaattcaacagtggtggtcaagccctcttgtttgttt 412909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7452207 - 7451862
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  7452207 aatatttcagatcattttcttcagtttacttatttgacaggtggtgctgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggctactttgtgactgggttg 7452108  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| |  || || ||| |||||||| ||||| | || ||||||||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  7452107 tgtggaatgaacaaaataatcgtctgtttaataatgttataactcccatcccccgtttgttagacaaggtaaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 7452008  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  || | |  | || ||||||||     
T  7452007 taaaaaagctatctttgtttttggtacccaacagtggtggtcaagccctcttgtttatttgggtattggctaacgtagtccggttgggttggtttgtaat 7451908  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
     ||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| |||||    
T  7451907 tgttgtaactcttggttcctatggtagtctctaaggcacagcttgt 7451862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35405464 - 35405253
Alignment:
Q  148 gttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagt 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  35405464 gttgttgcccccatcccttgtttattagaaaagattaagacattgtctttaggttggctaaaagctaaaaaagctacctttgtttttggaattcagcagt 35405365  T
Q  248 ggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat-gttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctac 346  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  35405364 ggtgatcaaaccctcttgtttgtttgagtattggctgatatttttctgctgtgtcttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttctgatgtagtctctaa 35405265  T
Q  347 ggcacatcttgt 358  Q
    || ||| |||||    
T  35405264 ggtacaccttgt 35405253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35405560 - 35405460
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  35405560 aatatttccgatcatttttttcagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaacttatatggtttctatgtgtctgggttg 35405461  T
Q  113 t 113  Q
    |    
T  35405460 t 35405460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Original strand, 19385007 - 19385270
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |    | |||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  19385007 cattttcttcagtttacttatttgacaggtggtgctaagtccagacgttcttttatgcaacttatttagcttatctgtgcctgtgttgtgtggaatgaac 19385106  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  19385107 gaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttcttagacaaggtcaagatgttgtccttatcttggttaaaagctaaaaaagctac 19385206  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     || || || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  19385207 ttttgtgttcggtactcagcagtggtggtcatgccctcttgtgtgtttgggtataggctgatgt 19385270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28542680 - 28542582
Alignment:
Q  191 tgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt 289  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28542680 tgtctttaggatggttgaaagctaaaaaagcttgttttgtttttggctttcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtt 28542582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 285
Target Start/End: Original strand, 12218486 - 12218574
Alignment:
Q  197 taggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaa 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  12218486 taggttggttgaaagctagaaaagctatctttatttttggtactcagcagtggtggtcatgcccttttctttgtctgggtattggctaa 12218574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30501756 - 30501686
Alignment:
Q  80 tgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgtt 150  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  30501756 tgcaattaatctggcttctttgtgcttgggttttgtggaatgaacgtaataaccgtctgtttaataatgtt 30501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 110
Target Start/End: Original strand, 39482996 - 39483084
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggt 110  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39482996 gatcatttattgcagtttactcatatgacaagtggtggcaaagctagagggtctttcatgcaactaatatggcttctttgtgcatgggt 39483084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 144
Target Start/End: Original strand, 43613442 - 43613480
Alignment:
Q  106 tgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaat 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43613442 tgggttgtgtggaatgaacgtaacaaccgtctgtttaat 43613480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29309263 - 29308917
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  29309263 aatatatcagatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatgacttctatgtgtctgggttg 29309164  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttaccccc-atcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309163 tgtggaatgagcgtaacaaccgtatgtttaatcatgttgttaccccccatctcttgtttactagctaagattaagctgctgtctctaggttggttgaaag 29309064  T
Q  212 ctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309063 ctaaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattgggtaatgttttctgttgtgttttgtttgtaa 29308964  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29308963 ccgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcacatcttgt 29308917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23601628 - 23601282
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23601628 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 23601529  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601528 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 23601429  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23601428 taaaaaagctatctttgtttttgggactcaacagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttatgttgtgttttgtttgtaa 23601329  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  23601328 ccgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcacaccttgt 23601282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 6176763 - 6177109
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6176763 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttttatgtgcctgggttg 6176862  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6176863 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttaccctcatctcttgtttactagataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 6176962  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6176963 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattgactaatgtttttctggtgtgttttgtttgtaa 6177062  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6177063 ttgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcacatcttgt 6177109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 2813785 - 2814131
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  2813785 aatatttcaaatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcgtttatgcaactaatatgacttctatgtgcctgggtag 2813884  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2813885 tctggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagttgttgtctctaggttggttgaaagc 2813984  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2813985 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcaatggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctagtgtgttttgtttgtaa 2814084  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  2814085 ccgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaagacacaccttgt 2814131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7146896 - 7146557
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7146896 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttttgcaacttatatggcttctttgtgcctgggttg 7146797  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7146796 tttggaatgaacgtaataaccggatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgatgtctctaggttggttgaaagc 7146697  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  7146696 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaaacccccttgtttgtttgggtatttgctaatgtttttctgctgt-ttttgtttgtaa 7146598  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7146597 ccattgtaactcttggtttctgtggtagtctctaaggcaca 7146557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 341
Target Start/End: Original strand, 25873411 - 25873726
Alignment:
Q  27 ttttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgt 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  25873411 ttttttacagttcactcatttggcaggtggtggtgctgctaggcgttcttttatgcaactcatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatgaacgt 25873510  T
Q  127 aacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctacct 226  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25873511 aataatcgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccgtgtttacttgataaggttaagttgatgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagctatct 25873610  T
Q  227 tcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactctt 325  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25873611 ttgtttttggaactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttatgctgtgtcttgtttgtaaccgttgtaactctt 25873710  T
Q  326 ggtttttgaggtagtc 341  Q
    ||||| ||||||||||    
T  25873711 ggtttctgaggtagtc 25873726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 30167630 - 30167905
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30167630 aatatttccgatcattttcttcagtttacttatttgacgggtggtgctgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgggttg 30167729  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  30167730 tgtggaatgaacgcaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttagacaaagttaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 30167829  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    || ||||||||| || |||| ||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30167830 tagaaaagctacttttgtttatggtacccggcagtggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattggctaatgt 30167905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9378940 - 9378633
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  9378940 catttgttacagtttactcatatgacaagtggtggtaatgatagtcgttcttttatgcaactcatatgacttctgtgtgcctgggttgtttggaatgaat 9378841  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  9378840 gaaactatcgtctgtttaataatgttgttactcccatcccccgtttattagacaaggttaagatgttgtctttaggttggctaaaagttaaaaaagctac 9378741  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtca-agccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt-ttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaact 322  Q
    ||| ||| |||| || || || ||||||| | ||||||||  ||||||| || || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  9378740 ctttgttattggtacacaacaatggtggttatagccctctcttttgtttgggaataggctaacgttgttctgctgtgttatgtttgtaactgttgaaact 9378641  T
Q  323 cttggttt 330  Q
    ||||||||    
T  9378640 cttggttt 9378633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 49732218 - 49732493
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  49732218 aatatatccgaccattttcttcagtttacttatttgacaggtggtgctaagtctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcccgggttg 49732317  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||| ||||||||||||    
T  49732318 tgtggaacgagcgaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttagacaaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaagc 49732417  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  49732418 taaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcatgccctcttgtgtgtttgggtataggctgatgt 49732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 358
Target Start/End: Original strand, 6517892 - 6518004
Alignment:
Q  247 tggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttct-gttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6517892 tggtggtcaagccctcttgtttgtttggatattggctaatgttttcttgttgtattttgtgtgtaaccgttgtaattcttgatttttgaggtagtctcta 6517991  T
Q  346 cggcacatcttgt 358  Q
     |||||| |||||    
T  6517992 aggcacaccttgt 6518004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 28675265 - 28675473
Alignment:
Q  64 gctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||| | || || || ||  | |||||| |||||||||| ||||| |    
T  28675265 gctagacgttcttttatgcaactcatttgacttctgtgtgtctgtgttgtgtggaattaacgaaataatcgcctatttaataatgttgttactcccattc 28675364  T
Q  164 cttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctct 263  Q
    || | ||  |||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||| || ||| |    
T  28675365 ctcgattgttagacaaggttaagatgttgtctttaggctggttgaaagttaaaaaagctacttttgttttcggtacgcagtagtggtggtcgagtccttt 28675464  T
Q  264 tgtttgttt 272  Q
     ||||||||    
T  28675465 agtttgttt 28675473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13448281 - 13448197
Alignment:
Q  65 ctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||| |||||||| ||||    
T  13448281 ctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgagttgtgtggaatgaacgaaataatcgtctgtttaataatgt 13448197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32004647 - 32004560
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  32004647 ttggttgaaagctaaaagaactacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcatgccctcttgtatgtttgggtataggctgatgt 32004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24227486 - 24227411
Alignment:
Q  197 taggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||    
T  24227486 taggttggttgaaagctaaaaaaattacttttgtttttagtactcagcaatggtggtcgtgcccttttgtctgttt 24227411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 286
Target Start/End: Original strand, 14868258 - 14868343
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat 286  Q
    |||| ||||||||||||| || || || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||| ||  |||||||||    
T  14868258 ttggctgaaagctaaaaatgccacttttgtttttggaactcagatgtggtggtcaagtcctatggtttgtttgggctttggctaat 14868343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Original strand, 9319513 - 9319565
Alignment:
Q  106 tgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccc 158  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  9319513 tgggttgtgtggagtgaacgtaacaaccgtttgttcaataatattgtaacccc 9319565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13755320 - 13754975
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  13755320 aatatatcagatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatgacttctatgtgtctgggttg 13755221  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13755220 tgtggaatgagcgtaacaaccgtatgtttaatcaggttgttacccccatccattgtttactagataagattaaactgctgtctctaggttggttgaaagc 13755121  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13755120 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 13755021  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  13755020 cgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcatatcttgt 13754975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15673680 - 15673334
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15673680 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatttggcttctatgtgcctgggttg 15673581  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15673580 tttggaatgaacgtaataaccgtttgtttaatcattttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 15673481  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt-ttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15673480 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgttgttctggtgtgttttgtttgtaa 15673381  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15673380 acgttgtaactcttgatttctgaggtagtctctaacgcacaccttgt 15673334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 8873120 - 8873457
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  8873120 gatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgctgttagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatg 8873219  T
Q  122 agcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagc 221  Q
    | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8873220 aacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttacttgataaggttaagttgatgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagc 8873319  T
Q  222 taccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaa 320  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8873320 tacctttgtttttggaactcaacagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttcagttgtgtcttgtttgtaaccgttgtaa 8873419  T
Q  321 ctcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  8873420 ctcttagtttctgaggtagtctctaaggcacaccttgt 8873457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 23347751 - 23348097
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23347751 aatatttcagatcattttttacagttcactcatttgacaggcggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttttatgtgcctgggttg 23347850  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23347851 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttaccagataagattaagttgttgtctctaggttggttgaaagc 23347950  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||||||    
T  23347951 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattgactaatgtttttctagtgtattttgattgtaa 23348050  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
      ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  23348051 ttgttgtaactctcgttttctgaggtagtctctaaggcacaccttgt 23348097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25317700 - 25317385
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25317700 gatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatttggcttctttgtgcatgagttgtgtggaatg 25317601  T
Q  122 agcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagc 221  Q
    |  | || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||| ||||||| |    
T  25317600 aaagaaataaccgtctctttaatcaggttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagatgttgtctttaggttggcttaaagttaaaaaaac 25317501  T
Q  222 taccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaa 320  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||         |||||||    
T  25317500 tacctttgtttttggaactcagcagtggtcgtcaagccctcttgtttgtttggatattggctaatgtctttttgttgtggattg---------gttgtaa 25317410  T
Q  321 ctcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  25317409 ctcttggttttggaggtagtctcta 25317385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26205194 - 26204879
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26205194 gatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatttggcttctttgtgcatgagttgtgtggaatg 26205095  T
Q  122 agcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagc 221  Q
    |  | || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||| ||||||| |    
T  26205094 aaagaaataaccgtctctttaatcaggttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagatgttgtctttaggttggcttaaagttaaaaaaac 26204995  T
Q  222 taccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaa 320  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||         |||||||    
T  26204994 tacctttgtttttggaactcagcagtggtcgtcaagccctcttgtttgtttggatattggctaatgtctttttgttgtggattg---------gttgtaa 26204904  T
Q  321 ctcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  26204903 ctcttggttttggaggtagtctcta 26204879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19349093 - 19348783
Alignment:
Q  40 actcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgt 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  19349093 actcatttgacaggtggtggtgttgctagacggtcttttatgcaactaatatggcttctctgtgcctgggttgtttggaatgaacgaaataaccgtatgt 19348994  T
Q  140 ttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggac 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |          ||||||||||| |||||||| ||    
T  19348993 ttaatcatggtgttacccccatcccttgtttactagataagattaagatgttgtctttaggttggct---------taaagctacctttgtttttggaac 19348903  T
Q  240 tcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggta 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  19348902 tcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtatgggtattggctaatgtctttatgttgtggcttggttgtaacctttgtaactcttggtttcggaggta 19348803  T
Q  339 gtctctacggcacatcttgt 358  Q
     |||||| |||||| |||||    
T  19348802 atctctagggcacaccttgt 19348783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4406845 - 4406736
Alignment:
Q  35 agttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccg 134  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  4406845 agtttactcatatgataggtggtggtaaagctagacgttcgtttctgcagctaatatgacttctttgtgcctgggttgtgtggaatgaacgaaacaatcg 4406746  T
Q  135 tttgtttaat 144  Q
    | ||||||||    
T  4406745 tctgtttaat 4406736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1682856 - 1682765
Alignment:
Q  58 ggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgt 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||| ||||    
T  1682856 ggtggtgctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgggttgtgtggaatgaacgaaataatcgtctgtttaataatgt 1682765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33629900 - 33629694
Alignment:
Q  65 ctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | || || || ||  |||||||| || |  | || ||||| ||    
T  33629900 ctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgggttgtgtggaattaacgaaataatcgcctgtttaataatataataactcccattcc 33629801  T
Q  165 ttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctctt 264  Q
      ||||  |||| ||| | ||  || ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33629800 ccgtttgttagacaaggtcaaattgttgtccttagcttggttgaaagctaaaaaa-ctacttttgtgtttggtactcaacagtggtggtcatgccctctt 33629702  T
Q  265 gtttgttt 272  Q
    || |||||    
T  33629701 gtgtgttt 33629694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33745899 - 33745819
Alignment:
Q  64 gctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaat 144  Q
    ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||    
T  33745899 gctagacgttcatttcttcagctcatatggcttctttgtgcttgggttgtgtggaatgagcgaaataatcgtctgtttaat 33745819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4596525 - 4596465
Alignment:
Q  229 gtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt 289  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4596525 gtttttggctctcaacagcggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtt 4596465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19256894 - 19256628
Alignment:
Q  19 tcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtgga 118  Q
    |||||||||||||| || |  |||| | ||||||| | ||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| || |||||| ||||    
T  19256894 tcagatcattttttgcaatgtactcttctgacaggggctggtaaagctagacgctcttttatgcaactcatttggcttctgtgtgtctaggttgtttgga 19256795  T
Q  119 atgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaa 218  Q
    |||| || || ||  |  | |||||| ||||||||||  | || ||  ||||| |||| ||| ||||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  19256794 atgaacgaaataattgcctctttaataatgttgttacgtctattccccgtttattagacaaggttaatatgttgtctttaggatggttgaaagctataaa 19256695  T
Q  219 agctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaa 285  Q
    | |||  || || | ||| ||||| | ||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||    
T  19256694 acctatttttgtgtatggtactcaaccgtggtggtcgaaccatattgtttgtttcgatatcggctaa 19256628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14528153 - 14528113
Alignment:
Q  88 atatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14528153 atatggcttctttgtgccttggttgtgtggaatgaacgtaa 14528113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14532879 - 14532839
Alignment:
Q  88 atatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaa 128  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14532879 atatgacttctttgtgccttggttgtgtggaatgaacgtaa 14532839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3692482 - 3692140
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3692482 aatatatcatatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgcctgggttg 3692383  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692382 tgtggaatgagcgtagcaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 3692283  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3692282 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgagtattggctaatgttttatgttgtgttttgtttgtaac 3692183  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatctt 356  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  3692182 cgttgtaa-tcttaatttctgagatagtctctaaggcacatctt 3692140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 32353582 - 32353928
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32353582 aatatttcagatcattttttatagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 32353681  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32353682 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaattatgttgttacccccatcccttgtttacttgataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 32353781  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32353782 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctgttgtgttttgtttgtaa 32353881  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32353882 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctaaggcacaccttgt 32353928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38231542 - 38231196
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  38231542 aatatttcatatcattttttacatttcacttttttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaactaatatgacttctatgtgcctgagttg 38231443  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38231442 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 38231343  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtttt-ctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38231342 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcatcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattggctaatgttttcctggtgtgttttgtttgtaa 38231243  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||    
T  38231242 ccgttgtaactcttggtttctgatgttgtctctaaggcacaccttgt 38231196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Original strand, 48073731 - 48074050
Alignment:
Q  27 ttttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgt 126  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  48073731 ttttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgttagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttgtttggaatgaacgt 48073830  T
Q  127 aacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctacct 226  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48073831 aataaccgtatgtttaatcacgttgttacccccatcccctgtttacttgataaggttaagctgttgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctacct 48073930  T
Q  227 tcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactctt 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48073931 ttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggtttttctgttgtgttttgtatgtaatcgttgtaactctt 48074030  T
Q  326 ggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  48074031 ggtttctgaggtagtctcta 48074050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37530412 - 37530091
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtg--ctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  37530412 gatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgttctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaa 37530313  T
Q  120 tgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaa 219  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37530312 tgaacttaataatcgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttacttgataaggttaagttgatgtctttaggttggctgaaagctaaaaaa 37530213  T
Q  220 gctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgt 318  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  37530212 gctacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttggatattggctaatgtttttctgttgtatcttatttgtaaccgttgt 37530113  T
Q  319 aactcttggtttttgaggtagt 340  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  37530112 aactcttagtttctgaggtagt 37530091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14119620 - 14119311
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  14119620 aatatttccgatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacggtcttttatgcaactaatatggcttttatgtgtctgggttg 14119521  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtc-tctaggttggttgaaag 211  Q
    | |||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| ||||||    
T  14119520 tttggaatgaacgaaataatcgtctgtttaatcatgttgttacccccgtcccttgtttactagataagattaagatgttgtcttttaggttggctgaaag 14119421  T
Q  212 ctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgta 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14119420 ctaaaaaagttacctttgttttcgaaactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgaatattgggtaatgtttttctgttgtgtcttgtttgta 14119321  T
Q  311 accgttgtaa 320  Q
    ||| ||||||    
T  14119320 acccttgtaa 14119311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36929022 - 36928677
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  36929022 aatatttcagatcattttcttcaatttacttatttgacaggtggtgctgtttctagacgttcttttatgcaacttatttggctactttgtgcttgggttg 36928923  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  36928922 tgtggaatgaacgaaataatcgtctgtttaataatgttataactcccatccctcgtttgttagacaaggtaaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 36928823  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || | |  | || ||||||||     
T  36928822 taaaaaagctatctttgtttttggtacccaacagtggtggttaagccctcttgtttgtttgggtattggctaacgtagtccgattgggttggtttgtaat 36928723  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
     ||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| |||||    
T  36928722 tgttgtaactcttggttcctatggtagtctctaaggcacaccttgt 36928677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36305639 - 36305294
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36305639 aatatttcagatcattttcttcaatttacttatttgacaggtggtgctgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggctactttgtgtctgggttg 36305540  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||  | || ||||| |   ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  36305539 tgtggaatgaacgaaataatcgtctgtttaataatgtaataactcccattctccgtttgttagacaaggtaaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 36305440  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||| |  | ||||||||    
T  36305439 taaaaaagctatctttgttttcagtacccaacagtggtggtcatgccctcttgtttgtttggctattggctaatgtagtcctgttg-ggatggtttgtaa 36305341  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
      ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||    
T  36305340 ttgttgtaactcttggttcctgtggtagtctctaaggcacaccttgt 36305294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21528016 - 21527741
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21528016 aatatatctgaccattttcttcagtttattcatttgacaggtggtgctaagtctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcctgggttg 21527917  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||| || || ||  |||||||| ||||  | || ||||| ||  ||||  |||||||| | ||| || | ||  ||| ||||||||| ||    
T  21527916 tgtggaatgagcgaaataatcgactgtttaataatgtaataactcccattccccgtttgttagataaggtcaagatgttatccttagcttggttgaaggc 21527817  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||    
T  21527816 taaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctcttatgtgtttgggtataggctgatgt 21527741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4644856 - 4644524
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4644856 cattttctacagtttacttatttgacagatggtgctaattctagacgttcttttatgcaacttgtttggcttctctgtgcctgggttgtgtggaatgaac 4644757  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || | | |||||||| ||||  | ||  |||| ||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4644756 gaaataatcatctgtttaataatgtaataacttccattcccagtttgttagacaaggtcaagatgttgtccttaggttggttgaaagcaaaaaaagctac 4644657  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgtt--ttgtttgtaaccgttgtaac 321  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||   ||||||| |||  |||||| |    ||||||||    
T  4644656 ttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcgtgccctcttgtgtgtttgggtataggctgatgtagctctgttgggttggttgttttt----gttgtaac 4644561  T
Q  322 tcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||    
T  4644560 tcttggttcttgttgtagtctctatggcacaccttgt 4644524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 288
Target Start/End: Original strand, 14365962 - 14366184
Alignment:
Q  65 ctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||    
T  14365962 ctagacgttcttttatgcaacttatttagcttctctgtgcttgggttgtgtggaatgagcgaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattcc 14366061  T
Q  165 ttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctctt 264  Q
      ||||  |||| ||| | ||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14366062 ccgtttgttagacaaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaagctaaaaaagcta-ttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcatgccctctt 14366160  T
Q  265 gtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    || ||||| ||||| |||| ||||    
T  14366161 gtgtgtttgggtataggctgatgt 14366184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47116112 - 47115868
Alignment:
Q  44 atttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaa 143  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |  || || ||| |||||||    
T  47116112 atttgacaggtggtgttaattctagacgttcttttatgcaatttatatgacttttttgtgcctgagttgtgtggaatgaacaaaataatcgtctgtttaa 47116013  T
Q  144 tcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcag 243  Q
    | ||||  | || | ||| || |||||   ||| ||| | ||| || ||||  |||  ||||||||||||||||||||||  || | |||||| || |||    
T  47116012 taatgtaataactctcattccctgtttgtcagacaaggtaaagatgttgtccttagaatggttgaaagctaaaaaagctatttttgcttttggtacccag 47115913  T
Q  244 cagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  47115912 cagtggtggtcatgccctcttgtgtgtttgggtataggctaatgt 47115868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 48266003 - 48266268
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  48266003 aatatatctgaccattttcttcagtttacttatttgacaggtgatgctaagtctagatgttattttatgcaacttatttggcttctctgtgtctgggttg 48266102  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||  ||| | ||| || ||||  ||| ||||||||||||    
T  48266103 tgtggaatgagcgaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttaggcaaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaagc 48266202  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtat 278  Q
    ||||||| |||| || || ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  48266203 taaaaaaactacttttgtgtttgatacttagcagtggtggtcataccctcttgtgtgtttgggtat 48266268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Original strand, 25639908 - 25640023
Alignment:
Q  173 tagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgttt 272  Q
    |||||||| ||||| || ||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25639908 tagataaggttaagatgttgtccttaagttagttgaaagctagaaaagctacttttgtttttggtacccagcagtggtggtcataccctcttgtttgttt 25640007  T
Q  273 aggtattggctaatgt 288  Q
     ||||||| |||||||    
T  25640008 gggtattgactaatgt 25640023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Original strand, 30970904 - 30971171
Alignment:
Q  24 tcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgag 123  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||   |||| | ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  30970904 tcatttgtttcagttcactcatatggcaggtggcggtaaagctaaatgttctttcatgcaactcatctggctcctttgtgcttgggttgtgtggcatgag 30971003  T
Q  124 cgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagcta 223  Q
    || || |  || ||||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||  ||||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||| |  |    
T  30971004 cgcaatagtcgattgtttaacaatgtttttactcccattccctgtctgctttataagattaagttattgtctttaggttggctgcaagctaaaaatgtca 30971103  T
Q  224 ccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtttt 291  Q
      ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| ||||||||||||    
T  30971104 tttttacttttggaactcagcagtggtggtctagccctttaacttgcttgggtataggctaatgtttt 30971171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52336329 - 52336242
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  52336329 ttggttgaaagataaaaaagctatttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcatgccctcttgtgtgtttgggtataggctgatgt 52336242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8982438 - 8982383
Alignment:
Q  303 tgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8982438 tgtttgtaccccttgtaattcttggttttggaggtagtctctaaggcacatcttgt 8982383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Original strand, 9528226 - 9528313
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||| |||| ||||    
T  9528226 ttggttgaaagttaaaaaatctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgtcctcttatgtgtttgggtataggctgatgt 9528313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 26510710 - 26510760
Alignment:
Q  82 caactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaac 132  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26510710 caacttatatggttactttgtgcctggtttgtgtggaatgaacgtaacaac 26510760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Original strand, 34853959 - 34854049
Alignment:
Q  47 tgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgttt 137  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| || ||||| ||||| || ||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34853959 tgacaggtgttggtaaagctaaacgttcgttcatgcagctaatttgactattttgttcttgggttgtgtggaatgaacgtaacaaccgttt 34854049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43627354 - 43627013
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43627354 aatatttcatatcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcctgggttg 43627255  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43627254 tttggaatgaacgtaataaccggatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 43627155  T
Q  213 taa-aaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgta 310  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43627154 taaaaaaagctacatttgtttttgggactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctgttgttttttgtttgta 43627055  T
Q  311 accgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43627054 accgttgtaactcttggtttttgtggtagtctctaaggcaca 43627013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33547727 - 33547394
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33547727 aatatttcagctcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 33547628  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33547627 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccctgtttacttgataaggttaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 33547528  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  33547527 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggtttttctgttgtgttttgtatgtaa 33547428  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33547427 tcgttgtaactcttggtttctgaggtagtctcta 33547394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13549979 - 13549633
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13549979 aatatttccgatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctttgtgcctgggttg 13549880  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||  | ||||     
T  13549879 tgtggaatgaacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagatgttgtctttaggttgacttaaagt 13549780  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  13549779 taaaaaagctacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtctttctgttgtggcttggttgtaa 13549680  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
       ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  13549679 ttcttgtaactcttggttttggaggtagtcgctagggcacaccttgt 13549633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 9949549 - 9949878
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  9949549 aatatttccgatcattttttacagttcactcttttggctggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctatgtgtctgggttg 9949648  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||    
T  9949649 tttggaatgaacgtaataatcgtctgtttaatcatgtggttacccccatcccttgtttacttgataaggttaagttgatgtctttaggttggctaaaagc 9949748  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  9949749 taaaaaagctacctttgtttttgacactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtctttttgctgtgtcttgtttgtaa 9949848  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtc 341  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9949849 ccgttgtaactcttggcttctgaggtagtc 9949878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22052482 - 22052142
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||     
T  22052482 aatatttccgatcattttcttcagtttactcatttgtcaggtggtggtgttgctagacggtcttttttgcaactcatttggcttctatgtgtctgggtta 22052383  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||    
T  22052382 tctggaatgaacgaaataaccgtcagtttaatcatgttgttacccccatccattgtttattagataagattaagttgttgtctttaggttggcttaaagc 22052283  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||    
T  22052282 taaaaaagctacttttgtttttggaactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtctttctgttatggcttggttgtaa 22052183  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22052182 cacttgtaactgttggtttttgaggtagtctctagggcaca 22052142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26681670 - 26681390
Alignment:
Q  79 atgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagata 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26681670 atgcaactaatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatgaacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttacttgata 26681571  T
Q  179 agattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtat 278  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26681570 aggttaagttgttgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagctacctttgtttttggaactcaacagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtat 26681471  T
Q  279 tggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||    
T  26681470 tggctaatgtttttcagttgtgtcttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttctgaggtaatctctaagacacaccttgt 26681390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31594336 - 31594080
Alignment:
Q  86 taatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaa 185  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31594336 taatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatgaacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttacttgataaggttaa 31594237  T
Q  186 gctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaa 285  Q
      || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31594236 attgatgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagctacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaa 31594137  T
Q  286 tg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtc 341  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31594136 tgtttttctgttgtgtcttgttagtaaccgttgtaactcttggtttctgaggtagtc 31594080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 31085922 - 31086267
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  31085922 aatatttctgatcattttttacagtttactcatttgtcaggtggtggtaatgctagacgttcttttatgcaactcatatgccttttgtgtgcctgggttg 31086021  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||| | || || |||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  | ||||| |||||| |||||||||    
T  31086022 tttggaattaacgaaataaccgcatgtttaataatgttgttactcccatcccgtgtttattagacaagattaagacgttgtctttaggttagttgaaagc 31086121  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgttgtgttttgtttgtaac 312  Q
    |||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||   |||||||||     
T  31086122 taaaaaagctacatttgtttttggtatacaacagtggtggtcaagccctcttgtttgtttggatataggctaatgtattctgctgtgacatgtttgtaat 31086221  T
Q  313 cgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||    
T  31086222 cgttgtaactcttggtttctgaagtagtctctaaggtacaccttgt 31086267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 90 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35694411 - 35694148
Alignment:
Q  90 atggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctg 189  Q
    |||||||||  |||| || ||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35694411 atggcttctacgtgcttgagttgtttggaatgaacgaaataaccgtgtgtttaatcatgttgttatccccatcccttgtttactagataagattaagacg 35694312  T
Q  190 ctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-t 288  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  35694311 ctgtctttaggttagctgaaagctaaaaaaactacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttggatattggctaatgtt 35694212  T
Q  289 tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35694211 tttctgctatgtcttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttctgaggtagtctctaaggcaca 35694148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45421364 - 45421027
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    ||||||||| | || || ||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45421364 gatcattttattcaatttacttatttgacaggtggtaatgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgggttgtgtggaatg 45421265  T
Q  122 agcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagc 221  Q
    | || || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||  ||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  45421264 aacgcaataatcgtctgtttaataatgtaataactcacattccacgtttgttagacaaagttaagatgttgtccttaggttggttgaaagctagaaaagc 45421165  T
Q  222 taccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttc-tgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaa 320  Q
    ||| || |||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||   ||||||   |||||||    
T  45421164 tacttttgtttatggtacccagcagtggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtagtcttgttgggttggttttgtatttgttgtaa 45421065  T
Q  321 ctcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||  ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  45421064 ctcttggttcctgtagtagtctctaaggcacaccttgt 45421027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31774528 - 31774262
Alignment:
Q  24 tcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgag 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||   |||| | ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31774528 tcattttttgcagttcactcatatgacaggtggcggtaaagctaaatgttctttcatgcaactcatctgacttctttgtgcttgagttgtgtggaatgag 31774429  T
Q  124 cgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagcta 223  Q
     | || |  || ||||||||  ||||| |||| ||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||||| || |    
T  31774428 ggcaatagtcgcttgtttaaaaatgttattactcccattccctgtttgcttgataaggttaagatgttgtctttaggattgctgaaagctaaaaatgcca 31774329  T
Q  224 ccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttt 290  Q
      ||   || ||| ||||||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| |||||||||||    
T  31774328 tttttacttatggaactcagcagtggtggtctagccctttaacttgcttgggtataggctaatgttt 31774262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 212
Target Start/End: Original strand, 26180242 - 26180409
Alignment:
Q  45 tttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaat 144  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | || || || ||  | | ||||    
T  26180242 tttggcaggtggtggtaatgctaggcgttcttttctgcaactcatatggcttctgtgtgcctgagttgtatgaaataaacgaaataatcgcctttataat 26180341  T
Q  145 catgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
     |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||| | |||||||    
T  26180342 aatgttgttactcccatcccccgtttattagacaaggttaagatgatgtctttaggttagctgaaagc 26180409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32145550 - 32145412
Alignment:
Q  220 gctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt-ttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgt 318  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| | | ||| |||  |||||    
T  32145550 gctacctttgtttttggtacacagcagtg-tggtctagccctcttgtttgtttgggtataggctaatgttgttctgctgtgctctatttctaattgttgt 32145452  T
Q  319 aactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||| |||||    
T  32145451 aactcttgatttctgcagtagtttctaaggcacaccttgt 32145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16103701 - 16103660
Alignment:
Q  304 gtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16103701 gtttgtaaccgttgtaactcttagtttctgaggtagtctcta 16103660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 286
Target Start/End: Original strand, 558655 - 558694
Alignment:
Q  247 tggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  558655 tggtggtcatgccctcttgtttgtttaggtattggttaat 558694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 286
Target Start/End: Original strand, 26490731 - 26490811
Alignment:
Q  206 tgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat 286  Q
    |||||||||||||||  |  || || ||||| |||||| |||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  26490731 tgaaagctaaaaaagtcatgtttgtatttggtactcagaagtggtagtcaagccctttggcttgtttgggtattggctaat 26490811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13439908 - 13439575
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13439908 aatatttcagctcattttttacagttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatctggcttctttgtgcctgggttg 13439809  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13439808 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcacgttgttacccccatcccctgtttacttgataaggttaagctgttgtctctaggttggttgaaagc 13439709  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  13439708 taaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtgttggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggtttttctgttgtgttttgtatgtaa 13439609  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13439608 tcgttgtaactcttggtttctgaggtagtctcta 13439575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28327189 - 28326865
Alignment:
Q  35 agttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccg 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28327189 agttcactcatttgataggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctttgtgcttgggttgtttggaatgaacgtaataaccg 28327090  T
Q  135 tttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgttttt 234  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  28327089 aatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctatatttgttttt 28326990  T
Q  235 gggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28326989 gggactcagcagtggcggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctgttgttttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttctg 28326890  T
Q  334 aggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
     ||||||||||| |||||| |||||    
T  28326889 tggtagtctctaaggcacaccttgt 28326865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30386054 - 30385709
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  30386054 aatatttcagatcatgttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgttgctagacattcttt-atgcaacttatatggcttctatgtgtctgggttg 30385956  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30385955 tttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagacaagattaagttgttgtctctaggttggttgaaagc 30385856  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30385855 taaaaatgctacatttgtttttgggattcagcaggggcggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttctggtgtgtcttgtttgtaa 30385756  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  30385755 ccgttgtaactcttggtttctgatgtagtctctaaggcacaccttgt 30385709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45235805 - 45235461
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  45235805 aatatttctgataatttttgacagtttactcatttgacaggtggtggaattgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttccatgtgtctgggttg 45235706  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||    
T  45235705 tttggaatgaatgaaataaccgtttgtttaatcatgttgttatccccatcccttgtttattagaaaagattaagacgatgtctttaggttggctgaatgc 45235606  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45235605 taaaaaagctacctttgtttttggaactcagtcgtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctattgtttttctgctgtgtcttgtttgtaa 45235506  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatctt 356  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  45235505 ccgttgtaactcttaatttctgaggtagtctctaagacacatctt 45235461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3632561 - 3632312
Alignment:
Q  108 ggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttg 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  3632561 ggttgtttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccc-attctttgtt-attagataagattaagctgttgtctttaggttagttg 3632464  T
Q  208 aaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat-gttttctgttgtgttttgtt 306  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  3632463 aaagctaaaaaagttatctttgtttttgggactcagcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattgactaatatttttctggtgtgttttgtt 3632364  T
Q  307 tgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3632363 tgtaattgttgtaactcttagtttttgaggtagtctctaaggcacaccttgt 3632312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45942706 - 45942534
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45942706 aatatttccgatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctacacattcttttatgcaactaatttggcttctttgtgtctgggttg 45942607  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaa 185  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45942606 tgtggaatgaacgaaataaccatttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttattagataagattaa 45942534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 12379022 - 12379299
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  12379022 cattttttacagtttacttattttacaggtggtggtaaagctagacgttcttttatgcaactcgtatggcttctgtgtgcctgcgttgtgtggaatgaac 12379121  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || ||  |  |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  12379122 gaaataaatgcctgtttaataatgtagttactcccatcccctgtttattagacaatgttaagttgttgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagctaa 12379221  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt-ttctgttgtgtt 301  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  12379222 ctttgtttttggaacacagcaatggtggtcaaacccgcttgtttgtttgggcataggctaatgttgttctgttgtgtt 12379299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3104744 - 3104418
Alignment:
Q  27 ttttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgt 126  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| ||     
T  3104744 ttttttacagtttattcatttgacaagtggtgctaatgctagacgttcttttatgcaactattatgtcttatgtgtgcctgtgttgtttggaatgaacga 3104645  T
Q  127 aacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctacct 226  Q
    ||||| ||  | |||||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3104644 aacaatcgcctatttaatgatgttataactcccattccatgtttgctagacaaggttaagatgttgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagctacct 3104545  T
Q  227 tcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactctt 325  Q
    | |||  ||| || || || |||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3104544 ttgttcatggtacacaacaatggtggtctaaccctcttgtttgtttggatataggctactgtttttctgttgtgctctgtttgcaatcgttgtaactctt 3104445  T
Q  326 ggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    ||||| ||   ||||||||| ||||||    
T  3104444 ggtttctgcaatagtctctaaggcaca 3104418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46623547 - 46623284
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  46623547 cattttcttcagtttacttatttgacaggtggtgttgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgggtcgtgtgaaatgaac 46623448  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46623447 gaaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttagacaaggttaagatgttgtccttaggatggttgaaagctaaaaaagctac 46623348  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     || |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46623347 ttttgtttttggtacccagtagtggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattggttaatgt 46623284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Original strand, 15654002 - 15654336
Alignment:
Q  25 cattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagc 124  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  15654002 cattttcttcagtttacttatttgataggtggtgctgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgagttgtgtggaatgaac 15654101  T
Q  125 gtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctac 224  Q
    | || || ||| |||||||| ||||  | || ||||| ||  ||||  |||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15654102 gaaataatcgtctgtttaataatgtaataactcccattccccgtttgttagacaaggtaaagatgttgtctttaggatggttgaaagctaataaaactac 15654201  T
Q  225 cttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttc-tgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactc 323  Q
     || |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||| |||   |||||||  ||||||||||    
T  15654202 ttttgtttttggtacccagcagtgatggtcatgccctcttgtttgcttgggtattggctaatgtagtcatgttgggttggttttgtaattgttgtaactc 15654301  T
Q  324 ttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    ||||||  ||  |||||||||| | |||| |||||    
T  15654302 ttggttcctgtagtagtctctaagacacaccttgt 15654336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43105166 - 43104890
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||| || |||||| | || || ||| |||    
T  43105166 aatatatctgaccattttctgcagtttactcatttgacaggtggtggtagagctcgacgggcttttatgtaactcatttggcttttgtgcgcttggcttg 43105067  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| |  ||||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||| ||  ||||| |||| ||| ||||| || | ||| |||| |||||||||||    
T  43105066 tttggaatgaacaaaacaatcgcctgtttaataatgtggttactcccattccccgtttattagacaaggttaagatgttttctttaggatggttgaaagc 43104967  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgtt 289  Q
    ||||||||||   || ||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43104966 taaaaaagcttgttttgtttttggctctgagcagtggtagtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggttaatgtt 43104890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 285
Target Start/End: Original strand, 21277520 - 21277608
Alignment:
Q  197 taggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21277520 taggttggttgaaagctaaaaaagctatctttgtttttggtacccagcagtggtggtcatgccctcttgtttgtttgggtattggctaa 21277608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9546404 - 9546317
Alignment:
Q  201 ttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||    
T  9546404 ttggttgaaagctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctcttatgtgtttgggtataggctgatgt 9546317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38730175 - 38730027
Alignment:
Q  197 taggttggttgaaagct-aaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttctgt 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||  | |||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||    
T  38730175 taggttggttgaaagctgaaaaaaactacttttatttttggtacacaatagtggtggtttaaccctcttgtttgcttggttatcggctaatgtttt-tgt 38730077  T
Q  296 tgtgttttgttt-gtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctct 344  Q
    |||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  38730076 tgtgctctgttttgtatctgttgtaactcttggattttgcagtagtctct 38730027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19728186 - 19728069
Alignment:
Q  169 ttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgttt 268  Q
    ||||| ||||| |||||| || | ||| |||  ||| ||||||||||||| || || || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | ||||    
T  19728186 ttacttgataaaattaagttgttatctttagcgtggctgaaagctaaaaatgccacttttgtttttggaactcagatgtggtggtcaagtcctatggttt 19728087  T
Q  269 gtttaggtattggctaat 286  Q
    |||| ||  |||||||||    
T  19728086 gtttgggctttggctaat 19728069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 6264492 - 6264831
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  6264492 gatcattttttacagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctaaacgttcttttatgcaactaatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatg 6264591  T
Q  122 agcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagc 221  Q
    | || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6264592 aacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactttataaggttaagttgttgtctttaggttggttgaaagctaaaaaagc 6264691  T
Q  222 taccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-ttttctgttgtgttttgtt--tgtaaccgttgt 318  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  6264692 tacttttgtttttggaactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttgtttgggtattggctaatgtttttcagttgtgtcttgtttgtgtaatcgttgt 6264791  T
Q  319 aactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  6264792 aactcttggtttctgaggtagtctctaaggcacaccttgt 6264831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32918172 - 32917826
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32918172 aatatttctgatcattttttacagtttactcatttgacaggtggtggtgttgctagacggtcttttatgcaactaatttggcttctatgtgcctgggttg 32918073  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||     
T  32918072 tttggaatgaacgaaataaccgtctgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttattagataagattaagatgttgtctttaggttggcttaaagt 32917973  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  32917972 taaaaaagctacctttgtttttggaactcagcagtggtggtcaagtcctcttgtttgtttgggtattggctaatgtctttctgttgtggcttggttgtaa 32917873  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  32917872 cccttgtaactcttgattttggaggtagtctctagggcacaccttgt 32917826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34480801 - 34480482
Alignment:
Q  23 atcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatga 122  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  34480801 atcattttttacagttcactcttttggcaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctatgtgtctgggttgtttggaatga 34480702  T
Q  123 gcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagct 222  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34480701 acgtaataatcgtctgtttaatcatgtggttacccccatcccttgtttacttgataaggttaagttgatgtctttaggttggctgaaagctaaaaaagct 34480602  T
Q  223 accttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaac 321  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||     
T  34480601 acctttgtttttggcactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaatatctttttgctgtgtcttgtttgtaaccgttgtaat 34480502  T
Q  322 tcttggtttttgaggtagtc 341  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  34480501 tcttggcttctgaggtagtc 34480482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 93 - 345
Target Start/End: Original strand, 34858058 - 34858311
Alignment:
Q  93 gcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34858058 gcttctttgtgcctgggttgtttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaaccatgttgttacccctatcccctgtttacttgataagattaagctgttg 34858157  T
Q  193 tctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatg-tttt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  34858158 tctctaggttggttgaaagctaaaaaagctacctttgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttgggtattggctaaggttttt 34858257  T
Q  292 ctgttgtgttttgtttgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctcta 345  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34858258 ctgttgtgttttgtatgtaatcgttgtaactcttggtttctgaggtagtctcta 34858311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 15499931 - 15500271
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||     
T  15499931 aatatttccgatcattttcttcagtttactcatttgtcaggtggtggtgttgctagacggtcttttttgcaactcatttggcttctatgtgtctgggtta 15500030  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    | |||||||| || || |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||||    
T  15500031 tctggaatgaacgaaataaccatctgtttaatcatgttgttacccccatcaattgtttattagataagattaagttattgtctttaggttggcttaaagc 15500130  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt-tttctgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||    
T  15500131 taaaaaagctacttttgtttttggaactcagcagtggtggtcaaaccctcttgtttatttgagtattggctaatgtctttctgttttggcttggttgtaa 15500230  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
    |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15500231 cacttgtaactgttggttttggaggtagtctctagggcaca 15500271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Original strand, 10487222 - 10487466
Alignment:
Q  44 atttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaa 143  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  10487222 atttgacaggtggtgctaagtctagacgttcttttatgcaacttatttggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgaaataatcgtctgtttaa 10487321  T
Q  144 tcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcag 243  Q
    | ||||  | ||  |||| |   ||||  |||||||| | ||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||     
T  10487322 taatgtaataacttccattctccgtttgttagataaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaagctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcaa 10487421  T
Q  244 cagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||    
T  10487422 cagtggtggtcttgccctcttatgtgtttgggtataggctgatgt 10487466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31862439 - 31862339
Alignment:
Q  22 gatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatg 121  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31862439 gatcatttattgcagtttactcatatgacaggtggtggcaaagctagacggtctttcatgcaactaatatggcttctttgtgtctgggttttgtggaatg 31862340  T
Q  122 a 122  Q
    |    
T  31862339 a 31862339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6020572 - 6020462
Alignment:
Q  34 cagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaacc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||   |||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |    
T  6020572 cagttcactcatatgacaggtggaggtaaagctagatgttcttttcagcaacttatatggctcctttatgtctgggttgtgtggaatgagcgtaataatc 6020473  T
Q  134 gtttgtttaat 144  Q
    | |||||||||    
T  6020472 gcttgtttaat 6020462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4399630 - 4399459
Alignment:
Q  115 tggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagcta 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||    | ||| | ||||| ||||| |||||| || | ||| |||   || |||||||||    
T  4399630 tggaatgagcgtaacaatcgtttgtttaaaaatgtgattaccgaggttcctagattacttgataaaattaagttgttatctttagcgcggctgaaagcta 4399531  T
Q  215 aaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat 286  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||    
T  4399530 aaaaagccacttttgtttttggaactcagatgtggtggtcaagtcctatggtttgtttgggcattagctaat 4399459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 144
Target Start/End: Original strand, 5596774 - 5596812
Alignment:
Q  106 tgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaat 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5596774 tgggttgtgtgaaatgaacgtaacaaccgtttgtttaat 5596812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 286
Target Start/End: Original strand, 3199605 - 3199685
Alignment:
Q  206 tgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat 286  Q
    ||||||||||||| || || || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||| || |||| |||||    
T  3199605 tgaaagctaaaaatgccacttttgtttttggaactcagatgtggtggtcaagtcctatggtttgtttgggcattgcctaat 3199685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 358
Target Start/End: Original strand, 13524 - 13773
Alignment:
Q  108 ggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttg 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  13524 ggttgtttggaatgaacgtaataaccgtatgtttaatcatgttgttacccc-attctttgtt-attagataagattaagctgttgtctttaggttagttg 13621  T
Q  208 aaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaat-gttttctgttgtgttttgtt 306  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13622 aaagctaaaaaagttatctttgtttttgggactcagcagtggtggtcacgccctcttgtttgtttgggtattgactaatatttttctggtgtgttttgtt 13721  T
Q  307 tgtaaccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcacatcttgt 358  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13722 tgtaattgttgtaactcttagtttttgaggtagtctctaaggcacaccttgt 13773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7530 - 7190
Alignment:
Q  13 aatatatcagatcattttttccagttcactcatttgacaggtggtggtgctgctagacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttg 112  Q
    ||||| || ||||||||| | || || ||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7530 aatatttccgatcattttattcattttacttatttgacaggtggttttgtttctagacgttcttttatgcaacttatatggcttctttgtgcatgggttg 7431  T
Q  113 tgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatcccttgtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagc 212  Q
    |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||  | || | ||| ||  ||||  |||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  7430 tgtggaatgaacgcaataatcgtctgtttaataatgtaataactctcattccccgtttgttagacaaggttaagatgttgtccttaggttggttgaaagc 7331  T
Q  213 taaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgtttgtttaggtattggctaatgttttc-tgttgtgttttgtttgtaa 311  Q
    || ||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||   ||||||     
T  7330 tagaaaagctacttttgtttttggtacccatcagtggtggtcatgctctcttgtttgtttgggtattggctaatgtagtcttgttgggttggttttgtat 7231  T
Q  312 ccgttgtaactcttggtttttgaggtagtctctacggcaca 352  Q
      ||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||    
T  7230 ttgttgtaactcttggttcctgtagtagtctctaaggcaca 7190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 288
Target Start/End: Original strand, 134975 - 135196
Alignment:
Q  67 agacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccctt 166  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||  |||||||| ||||  | || ||||| ||      
T  134975 agacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcttgggttgtgtcgaatgagcgaaataatcgcctgtttaataatgtaataactcccattcccc 135074  T
Q  167 gtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgt 266  Q
    ||||  |||||||| | ||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||  |    
T  135075 gtttgttagataaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaggctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctctcat 135174  T
Q  267 ttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     ||||| ||||| |||| ||||    
T  135175 gtgtttgggtataggctgatgt 135196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 288
Target Start/End: Original strand, 312802 - 313023
Alignment:
Q  67 agacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccctt 166  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||  |||||||| ||||  | || ||||| ||      
T  312802 agacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcttgggttgtgtcgaatgagcgaaataatcgcctgtttaataatgtaataactcccattcccc 312901  T
Q  167 gtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgt 266  Q
    ||||  |||||||| | ||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||  |    
T  312902 gtttgttagataaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaggctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctctcat 313001  T
Q  267 ttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     ||||| ||||| |||| ||||    
T  313002 gtgtttgggtataggctgatgt 313023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 288
Target Start/End: Original strand, 328256 - 328477
Alignment:
Q  67 agacgttcttttatgcaactaatatggcttctttgtgcctgggttgtgtggaatgagcgtaacaaccgtttgtttaatcatgttgttacccccatccctt 166  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||  |||||||| ||||  | || ||||| ||      
T  328256 agacgttcttttatgcaacttatttggcttctctgtgcttgggttgtgtcgaatgagcgaaataatcgcctgtttaataatgtaataactcccattcccc 328355  T
Q  167 gtttactagataagattaagctgctgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctcttgt 266  Q
    ||||  |||||||| | ||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||  |    
T  328356 gtttgttagataaggtcaagatgttgtccttagcttggttgaaggctaaaaaagctacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctctcat 328455  T
Q  267 ttgtttaggtattggctaatgt 288  Q
     ||||| ||||| |||| ||||    
T  328456 gtgtttgggtataggctgatgt 328477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 22676 - 22749
Alignment:
Q  191 tgtctctaggttggttgaaagctaaaaaagctaccttcgtttttgggactcagcagtggtggtcaagccctctt 264  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||| | || || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22676 tgtctttagcttgattgaaagctaaaaaaaccacttttgtgtttggtactcagcagtggtggtcttgccctctt 22749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University