View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3622_low_3 (Length: 571)

Name: NF3622_low_3
Description: NF3622
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3622_low_3
NF3622_low_3
[»] scaffold0208 (3 HSPs)
scaffold0208 (108-553)||(6352-6798)
scaffold0208 (205-553)||(12225-12573)
scaffold0208 (33-64)||(6842-6873)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (167-553)||(10244277-10244664)
chr3 (206-553)||(11839708-11840055)
chr3 (172-553)||(42197110-42197492)
chr3 (172-553)||(49151442-49151823)
chr3 (172-553)||(38455500-38455880)
chr3 (206-553)||(10238195-10238542)
chr3 (206-553)||(17055775-17056122)
chr3 (205-553)||(42191202-42191550)
chr3 (206-553)||(10760633-10760980)
chr3 (206-553)||(49157509-49157855)
chr3 (206-553)||(38449048-38449393)
chr3 (206-553)||(8331617-8331963)
chr3 (206-553)||(30051085-30051431)
chr3 (209-552)||(55003398-55003737)
chr3 (192-499)||(11846032-11846340)
chr3 (172-380)||(10766819-10767028)
chr3 (212-553)||(53069043-53069378)
chr3 (206-552)||(13444888-13445227)
chr3 (206-553)||(48128030-48128369)
chr3 (385-553)||(10769131-10769299)
chr3 (192-422)||(17593250-17593481)
chr3 (205-553)||(28964710-28965043)
chr3 (445-553)||(26429639-26429747)
chr3 (270-522)||(34300350-34300609)
chr3 (424-522)||(13837534-13837632)
chr3 (216-518)||(46656538-46656850)
chr3 (272-497)||(12108716-12108945)
chr3 (204-485)||(24643532-24643815)
chr3 (456-522)||(2982458-2982524)
chr3 (172-206)||(13366835-13366869)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (167-553)||(25387447-25387834)
chr1 (206-553)||(25381518-25381865)
chr1 (210-550)||(34739819-34740158)
chr1 (206-553)||(50306027-50306365)
chr1 (172-553)||(31051374-31051760)
chr1 (205-553)||(31057874-31058221)
chr1 (205-553)||(1078074-1078401)
chr1 (239-553)||(8092862-8093175)
chr1 (206-552)||(44409831-44410186)
chr1 (205-522)||(24926737-24927060)
chr1 (192-522)||(24963671-24964008)
chr1 (206-552)||(27954994-27955336)
chr1 (172-553)||(38151923-38152293)
chr1 (206-383)||(12183562-12183743)
chr1 (450-501)||(12183816-12183867)
chr1 (468-526)||(23254006-23254063)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (172-553)||(12692229-12692610)
chr5 (206-553)||(12686162-12686508)
chr5 (172-553)||(28531430-28531811)
chr5 (206-553)||(28525369-28525715)
chr5 (206-553)||(7389531-7389877)
chr5 (206-553)||(41297109-41297453)
chr5 (205-554)||(30384358-30384715)
chr5 (203-522)||(30772142-30772463)
chr5 (192-550)||(19066076-19066438)
chr5 (366-553)||(32097165-32097352)
chr5 (192-381)||(24054335-24054526)
chr5 (366-553)||(32094364-32094551)
chr5 (205-553)||(19059746-19060100)
chr5 (172-401)||(32096908-32097138)
chr5 (206-404)||(32094142-32094340)
chr5 (289-553)||(20499968-20500231)
chr5 (206-357)||(16215157-16215308)
chr5 (212-347)||(14610184-14610321)
chr5 (410-552)||(14610000-14610141)
chr5 (213-353)||(26316782-26316922)
chr5 (216-508)||(26509722-26510013)
chr5 (284-351)||(28542269-28542336)
chr5 (211-348)||(37896286-37896423)
chr5 (212-266)||(8706454-8706508)
chr5 (333-476)||(8706532-8706672)
chr5 (455-522)||(26318492-26318558)
chr5 (464-524)||(33753476-33753536)
chr5 (464-524)||(33849110-33849170)
chr5 (265-321)||(33753294-33753350)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (172-548)||(24287821-24288196)
chr4 (192-553)||(10739308-10739668)
chr4 (192-553)||(10953077-10953437)
chr4 (205-553)||(6257187-6257535)
chr4 (172-553)||(48160789-48161167)
chr4 (206-553)||(33458249-33458596)
chr4 (206-553)||(48167008-48167351)
chr4 (206-484)||(10733229-10733507)
chr4 (206-484)||(10946998-10947276)
chr4 (248-553)||(33461418-33461721)
chr4 (172-538)||(49976432-49976798)
chr4 (206-553)||(50168425-50168769)
chr4 (175-402)||(26963292-26963518)
chr4 (385-553)||(10733514-10733681)
chr4 (385-553)||(10947283-10947450)
chr4 (269-522)||(44831658-44831918)
chr4 (291-552)||(4632212-4632482)
chr4 (236-522)||(19686341-19686620)
chr4 (443-553)||(26957023-26957133)
chr4 (206-323)||(26956812-26956929)
chr4 (205-300)||(4632869-4632964)
chr4 (239-518)||(3769434-3769710)
chr4 (192-552)||(50155789-50156135)
chr4 (260-392)||(50427358-50427497)
chr4 (243-343)||(9237402-9237502)
chr4 (211-296)||(34308060-34308144)
chr4 (411-513)||(35177666-35177770)
chr4 (492-554)||(26971824-26971886)
chr4 (211-311)||(55473133-55473230)
chr4 (442-520)||(32284542-32284620)
chr4 (445-518)||(17627002-17627075)
chr4 (442-520)||(33045107-33045185)
chr4 (258-335)||(35177806-35177883)
chr4 (458-501)||(50427238-50427281)
chr4 (274-340)||(28704553-28704619)
chr4 (270-334)||(33045264-33045328)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (172-553)||(32890718-32891100)
chr8 (206-553)||(5542143-5542490)
chr8 (172-552)||(42992952-42993329)
chr8 (206-553)||(32896842-32897189)
chr8 (206-553)||(9935111-9935455)
chr8 (206-553)||(14417771-14418114)
chr8 (206-553)||(36818802-36819147)
chr8 (205-553)||(10705667-10706021)
chr8 (284-554)||(10699858-10700127)
chr8 (213-553)||(22219706-22220057)
chr8 (205-413)||(7771202-7771409)
chr8 (192-537)||(39735517-39735862)
chr8 (205-552)||(39727299-39727637)
chr8 (206-372)||(14799399-14799564)
chr8 (197-407)||(1882725-1882939)
chr8 (443-553)||(42033631-42033740)
chr8 (443-553)||(1883039-1883148)
chr8 (205-314)||(24250171-24250279)
chr8 (211-291)||(1171414-1171493)
chr8 (313-479)||(1171249-1171414)
chr8 (233-305)||(31399047-31399119)
chr8 (195-259)||(10700132-10700197)
chr8 (206-282)||(42033856-42033930)
chr8 (231-303)||(31379430-31379502)
chr8 (206-262)||(39689782-39689838)
chr8 (257-332)||(17954557-17954632)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (205-553)||(8650785-8651133)
chr6 (206-553)||(4580304-4580651)
chr6 (206-553)||(21190849-21191199)
chr6 (206-553)||(25354041-25354388)
chr6 (172-548)||(25343459-25343840)
chr6 (206-553)||(31756196-31756549)
chr6 (206-425)||(32035269-32035488)
chr6 (172-529)||(21196969-21197336)
chr6 (203-411)||(21782733-21782941)
chr6 (172-364)||(8662729-8662922)
chr6 (211-532)||(17581483-17581797)
chr6 (212-549)||(21770546-21770891)
chr6 (251-548)||(21783337-21783649)
chr6 (251-548)||(21789560-21789872)
chr6 (205-401)||(18778564-18778761)
chr6 (174-364)||(6097999-6098191)
chr6 (230-350)||(34603338-34603457)
chr6 (230-350)||(34724615-34724734)
chr6 (207-312)||(6102693-6102803)
chr6 (462-553)||(30905821-30905910)
chr6 (172-209)||(28721414-28721451)
chr6 (442-546)||(20745394-20745497)
chr6 (302-366)||(1106229-1106294)
chr6 (258-343)||(17900174-17900259)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (206-553)||(36750244-36750591)
chr2 (172-553)||(13455929-13456311)
chr2 (206-553)||(13461870-13462217)
chr2 (206-553)||(28682928-28683274)
chr2 (205-553)||(44716786-44717135)
chr2 (172-553)||(31002206-31002589)
chr2 (211-552)||(13149674-13150018)
chr2 (201-553)||(31008184-31008537)
chr2 (206-553)||(30965157-30965505)
chr2 (172-553)||(35090598-35090982)
chr2 (212-553)||(35084665-35085009)
chr2 (206-532)||(35438693-35439013)
chr2 (206-553)||(11048536-11048884)
chr2 (206-553)||(23343384-23343737)
chr2 (172-505)||(29833079-29833419)
chr2 (445-552)||(19879429-19879536)
chr2 (179-294)||(1387976-1388090)
chr2 (444-506)||(29034697-29034759)
chr2 (455-502)||(28765461-28765508)
chr2 (284-323)||(31651664-31651703)
chr2 (443-529)||(31651478-31651564)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (192-553)||(3817280-3817640)
chr7 (206-553)||(28420942-28421288)
chr7 (205-553)||(20238780-20239128)
chr7 (206-553)||(3811152-3811498)
chr7 (205-553)||(351617-351963)
chr7 (172-551)||(339212-339582)
chr7 (206-552)||(5979156-5979503)
chr7 (206-553)||(35147986-35148338)
chr7 (221-552)||(43539808-43540146)
chr7 (205-429)||(42767276-42767501)
chr7 (206-553)||(5849360-5849702)
chr7 (205-488)||(12803893-12804177)
chr7 (341-552)||(15843777-15843988)
chr7 (341-552)||(15860886-15861097)
chr7 (205-554)||(22741900-22742260)
chr7 (234-405)||(26383603-26383774)
chr7 (246-381)||(30219269-30219404)
chr7 (420-548)||(35150736-35150865)
chr7 (172-553)||(26380914-26381278)
chr7 (394-518)||(7608306-7608433)
chr7 (274-350)||(18666547-18666622)
chr7 (482-553)||(26383499-26383569)
chr7 (442-518)||(3677889-3677965)
chr7 (453-518)||(18656883-18656948)
chr7 (443-476)||(24690848-24690881)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (172-553)||(172838-173219)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (206-553)||(605-948)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (206-553)||(1176-1523)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (205-452)||(5465-5712)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (206-516)||(950-1261)
[»] scaffold0085 (2 HSPs)
scaffold0085 (210-378)||(38434-38600)
scaffold0085 (462-552)||(38257-38347)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (244-351)||(5954-6061)
scaffold0185 (443-501)||(5826-5884)


Alignment Details
Target: scaffold0208 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6352
Alignment:
Q  108 ggtttgaatcggagaaactatatcgacatatgaatattattcaatcaaaattttcaatcaaccaaataaatcaaacatgaagt-ggctctgataccactt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6798 ggtttgaatcggagaaactaaatcgacatatgaatattattcaatcaaaattttcaatcaacctaataaatcaaacatgaagacggctctgataccactt 6699  T
Q  207 gttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaatt-atgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6698 gttggaaatttagctcttaatataaaca-atttcataaaccatgttcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 6600  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
      | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  6599 ctgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 6500  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 6400  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6399 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 6352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12573 - 12225
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaatt-atgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12573 ttgttggaaatttagctcttaatataaaca-atttcataaaccatattcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataattat 12475  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||    
T  12474 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatatctggataaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacg 12375  T
Q  404 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 12275  T
Q  504 gatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12274 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 12225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6873 - 6842
Alignment:
Q  33 aataaatggttacggcatgtcggcaccgaatc 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873 aataaatggttacggcatgtcggcaccgaatc 6842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 553
Target Start/End: Original strand, 10244277 - 10244664
Alignment:
Q  167 aaccaaataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaa 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244277 aacctaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaa 10244376  T
Q  266 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10244377 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacc 10244476  T
Q  366 tggataaagctttcataga-agccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggtt 464  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10244477 tggataaagctttca-agacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggtt 10244575  T
Q  465 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10244576 cttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 10244664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 11839708 - 11840055
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839708 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcatgatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 11839807  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  11839808 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 11839907  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839908 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 11840007  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11840008 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 11840055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 42197110 - 42197492
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42197110 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaat 42197209  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42197210 agcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggat 42197309  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42197310 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcct 42197409  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42197410 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 42197492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 49151823 - 49151442
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49151823 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaat 49151724  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49151723 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggat 49151624  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49151623 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcct 49151524  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  49151523 caaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatag 49151442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 38455500 - 38455880
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38455500 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttcggtcttaatataaa--gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaat 38455597  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38455598 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 38455697  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    |||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455698 aaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 38455797  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38455798 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 38455880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 10238195 - 10238542
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238195 tgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 10238294  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcataga-agccctctaatcaacaacga 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  10238295 tcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttca-agacagccctctcatcaacaacga 10238393  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10238394 taaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcag 10238493  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10238494 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 10238542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 17055775 - 17056122
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055775 tgttcgaaatttaggtcttaataaaaaacagttttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 17055874  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17055875 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgg 17055974  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055975 taaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 17056074  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17056075 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgatgtattggggaccatag 17056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Original strand, 42191202 - 42191550
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42191202 ttgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatg 42191301  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |    
T  42191302 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacta 42191401  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191402 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 42191501  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42191502 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 42191550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 10760633 - 10760980
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10760633 tgttggaaatttaggtcttattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10760732  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  10760733 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10760832  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760833 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 10760932  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  10760933 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatag 10760980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 49157855 - 49157509
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157855 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 49157756  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  49157755 tcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 49157656  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49157655 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcaga 49157556  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  49157555 tggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatag 49157509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 38449048 - 38449393
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449048 tgttggaaatttcggtcttaatataaa--gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 38449145  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | |||||||| ||||||||||||    
T  38449146 tcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacgat 38449245  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449246 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 38449345  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38449346 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 38449393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8331963 - 8331617
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331963 tgttggaaatttagctcttaatataaatagattttataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 8331864  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  8331863 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacgat 8331764  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331763 aaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 8331664  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8331663 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacagtgtattggggaccatag 8331617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 30051085 - 30051431
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30051085 tgttgaaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataa 30051184  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||    
T  30051185 tcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctctaatcgacaacaat 30051284  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051285 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 30051384  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30051385 tgggcagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 30051431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 209 - 552
Target Start/End: Original strand, 55003398 - 55003737
Alignment:
Q  209 tggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55003398 tggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcg 55003497  T
Q  309 gatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataac 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55003498 gatctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgataac 55003597  T
Q  409 caaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 508  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003598 caaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttgg---ttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 55003694  T
Q  509 ggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  55003695 ggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccata 55003737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 192 - 499
Target Start/End: Original strand, 11846032 - 11846340
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846032 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaacagattttataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 11846131  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  11846132 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctc 11846231  T
Q  392 taatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctga-tttggttcttcctcaaccggtacctttatgcct 490  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11846232 tcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaacctttatgccg 11846331  T
Q  491 caagttctc 499  Q
    |||||||||    
T  11846332 caagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 172 - 380
Target Start/End: Original strand, 10766819 - 10767028
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaag-tggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  10766819 aataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttattaaaaacaaatttcataatacatgttcaacaattataaatcaac 10766918  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10766919 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 10767018  T
Q  371 aaagctttca 380  Q
    ||||||||||    
T  10767019 aaagctttca 10767028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 553
Target Start/End: Original strand, 53069043 - 53069378
Alignment:
Q  212 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggat 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069043 aaatttaggtcttaataaaaacagattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggat 53069142  T
Q  312 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataacca 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||| | ||||||| | ||  |    
T  53069143 ctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaactttcatggtagtcatcttaacaacaacaacaaaga 53069242  T
Q  411 --aagagaggagatgatctgaaacacac--aatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 506  Q
      |  ||  | |||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  53069243 tgagaaggtgtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct----------agttctcttcagat 53069332  T
Q  507 ggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  53069333 ggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattgaggaccatag 53069378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 206 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13445227 - 13444888
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||          ||||    
T  13445227 tgttagaaatttaggtctaaataaaaatagatttgatagaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacatt----------atga 13445138  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||   ||| |||| |  |||||| ||    
T  13445137 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctcagtaacaaccat 13445038  T
Q  406 aaccaaagagagga---gatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 502  Q
    || |||||||  ||   ||||||||||| |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13445037 aaacaaagaggagatgtgatgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttc 13444938  T
Q  503 agatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  13444937 agatggggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccata 13444888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 48128030 - 48128369
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48128030 tgttggaaatttaggtctcaataaaaacagatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatga 48128129  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggta-ttaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||| | ||| |||    ||||||||     
T  48128130 tcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtattttggaatacct-gataaaactttcatggcagctctc---acaacaacgg 48128225  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |    ||| | | ||| ||||||| |||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48128226 t----aaaaaaatgaggtgatctggaacaaacaacaatgttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcag 48128321  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |  |||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48128322 acagggagaagagaatgt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 48128369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 10769131 - 10769299
Alignment:
Q  385 agccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769131 agccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 10769230  T
Q  485 atgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10769231 atgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 10769299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 17593250 - 17593481
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacat 290  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17593250 gctctgataacacttgtaggaaatttaggtcttaattaaaaatatatttcataatagatgttcaacaatcgtaaatcaatcgcggaagcaaacaaaacat 17593349  T
Q  291 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccct 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | ||||||    
T  17593350 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcgaggcagccct 17593449  T
Q  391 ctaatcaacaacgataaccaaagagaggagat 422  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593450 ctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 17593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28965043 - 28964710
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28965043 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaat---gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 28964947  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga-taaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |  |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||| |  | ||||    
T  28964946 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatatcaatagtta-gaaattaggaatacctggattgaagctttgatggaag-cctctcaaaagcaac 28964849  T
Q  403 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 501  Q
     || |  | ||| |||   |||||||||||| ||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||    
T  28964848 -atgaatagagaaagg---tgatctgaaacaaacataaagtgttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg--------atgcctcgagttctctt 28964761  T
Q  502 cagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28964760 cagatggggagaagagagagt-tttccgtgtacggtatattggggaccatag 28964710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 445 - 553
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429747
Alignment:
Q  445 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattgg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  545 ggaccatag 553  Q
    |||||||||    
T  26429739 ggaccatag 26429747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 270 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 34300609 - 34300350
Alignment:
Q  270 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34300609 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34300510  T
Q  370 taaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaa-agagaggagatgatctg------aaacacacaatcgagttagcggcggctgatttgg 462  Q
    | |||||||||| | | |||||| | || ||||  | |  || | ||||||| |||| ||      |||||||  | || |||||||||| || ||||||    
T  34300509 ttaagctttcatggcaaccctctcaacagcaacagtcagaaacacagaggaggtgatttgttatgaaaacacaagaacgggttagcggcgacttatttgg 34300410  T
Q  463 ttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  34300409 ttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagt 34300350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 13837632 - 13837534
Alignment:
Q  424 atctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837632 atctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 216 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 46656850 - 46656538
Alignment:
Q  216 ttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctac 315  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  46656850 ttaggtctaaataaaaacatatttcataaaacatgttcaataaatatgaattaatagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctac 46656751  T
Q  316 gacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat---aaccaaa 412  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||   | |||||| | ||||||||||   || |||     
T  46656750 gatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatgacaaccctctcaacaacaacgatctaaaacaag 46656651  T
Q  413 gagaggagatg-----atctgaaacaca-caatcga-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||     || ||||||||| |||   | |  |||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  46656650 gagaggagatgatataatatgaaacacatcaacatatgccagcggcgattgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcaga 46656551  T
Q  506 tggggagaagaga 518  Q
    |||||||||||||    
T  46656550 tggggagaagaga 46656538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 497
Target Start/End: Original strand, 12108716 - 12108945
Alignment:
Q  272 gcggaagcaaa-caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12108716 gcggaagcaaatcaaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaat 12108814  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcga-gttagcggcggctgatttggttct 466  Q
     ||||| | ||   | || ||| | ||  |||| |   || |  ||||| ||| |||| ||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||    
T  12108815 gaagctctaatgacaaccttctgaacatgaacggtctgaaacggagagatgaggtgatatgaaacacacaacataggttagcggcgactgatttggttct 12108914  T
Q  467 tcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 497  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12108915 tctttaaccggtacctttatgcctcaagttc 12108945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 485
Target Start/End: Original strand, 24643532 - 24643815
Alignment:
Q  204 cttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcata--aaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24643532 cttgttggaaatttaggtcttaata-aaacaaacttcatataaaacatgttcaacatttatgaatcaatagcggaagtaaataaaacattgaacatgatt 24643630  T
Q  302 atgat------cggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaat 395  Q
    |||||      ||||||||||| |||||| |||||          |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||   || |||||       
T  24643631 atgattatgatcggatctacgatatgttttatttac---------taagaaatagggtattagga-tacatggataaagctttcatgacagtcctctcga 24643720  T
Q  396 caacaacgataaccaaa----gagaggagatgatctgaaacacacaatcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttta 485  Q
    ||||||| | ||| | |    | |||||| |||| ||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643721 caacaacaacaacgataaggagggaggaggtgatttgaaacaaaca-tcaacggttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 456 - 522
Target Start/End: Original strand, 2982458 - 2982524
Alignment:
Q  456 gatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2982458 gatttggttcttcttcaataagtatctttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagt 2982524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 206
Target Start/End: Original strand, 13366835 - 13366869
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccactt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13366835 aataaaccaaacatgaagtggctctgataccactt 13366869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 167 - 553
Target Start/End: Original strand, 25387447 - 25387834
Alignment:
Q  167 aaccaaataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaa 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25387447 aacctaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatatagatcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaaatatgaa 25387546  T
Q  266 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25387547 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacc 25387646  T
Q  366 tggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttc 465  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25387647 tggataaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttc 25387746  T
Q  466 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25387747 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 25387834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 25381518 - 25381865
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381518 tgttggaaatataggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 25381617  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||    
T  25381618 tcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 25381717  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381718 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 25381817  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25381818 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 25381865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 210 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34740158 - 34739819
Alignment:
Q  210 ggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34740158 ggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 34740059  T
Q  310 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataacc 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  34740058 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataacc 34739959  T
Q  410 aaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 509  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34739958 aaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgg 34739859  T
Q  510 gagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggacca 550  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  34739858 gagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggacca 34739819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 50306365 - 50306027
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50306365 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattataa 50306266  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  50306265 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 50306167  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  50306166 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta-------gcctcaagttctcttcaga 50306074  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50306073 tggggagaagagagaat-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 50306027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31051760 - 31051374
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcata-----aaacatgttcaacaattatgaa 265  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||  | ||    
T  31051760 aatagatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttaggaatttaggtcttaatataaacagatttcatatcataatacatgttcaacaatcgtaaa 31051661  T
Q  266 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051660 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacc 31051562  T
Q  366 tggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttc 465  Q
    |||||||| ||||  ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31051561 tggataaaacttttgtagcaaccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttc 31051462  T
Q  466 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  31051461 ttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatag 31051374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31058221 - 31057874
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058221 ttgttagaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 31058122  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| | |||||| |||||||||||    
T  31058121 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacga 31058023  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058022 taaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 31057923  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31057922 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatag 31057874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1078401 - 1078074
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078401 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 1078302  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||            
T  1078301 atcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatc-------- 1078210  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
                 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078209 -------------gagatgatctgaaacacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 1078123  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1078122 atggtgagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 1078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 239 - 553
Target Start/End: Original strand, 8092862 - 8093175
Alignment:
Q  239 tcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggat 338  Q
    |||||| |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8092862 tcataatacatattcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggat 8092961  T
Q  339 attaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaa 438  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8092962 attaagaatttgggtatgaggaatacctggataaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaa 8093061  T
Q  439 tcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtg 538  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||     
T  8093062 ctaggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagt-ttgccgtgttcggta 8093160  T
Q  539 tattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||    
T  8093161 tattggggaccatag 8093175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 206 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44410186 - 44409831
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44410186 tgttggaaatttaggtcttactaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatga 44410087  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctct---aatcaacaac 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||    | |||||||    
T  44410086 acggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttttatggcagccctctcaacaacaacaac 44409989  T
Q  403 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--------atcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctca 492  Q
    |||||    ||||||||| |||||||||||| |||        ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44409988 gataa--ggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctca 44409891  T
Q  493 agttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||    
T  44409890 agttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtattggggaccata 44409831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 205 - 522
Target Start/End: Original strand, 24926737 - 24927060
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  24926737 ttgttgaaaatttaggtcttaataaaaacagatt-cataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatg 24926835  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||||||  | | ||| ||||   |||||||    
T  24926836 aacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctgaagatgaagctttggtggcagcactctcgacaacaac 24926935  T
Q  403 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-----atcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 493  Q
    |||    ||||||||||| |||||||||||| |||     ||| |    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24926936 gat----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaa 24927031  T
Q  494 gttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927032 gttctcttcagatggggagaagagagagt 24927060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 522
Target Start/End: Original strand, 24963671 - 24964008
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963671 gctctaataccatttgttgaaaatttagatcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 24963770  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccc 389  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||||||  | | |||||    
T  24963771 gaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaagatgaagctttggtggtagccc 24963870  T
Q  390 tctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-----atcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtac 480  Q
    |||   ||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||     ||| |    ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24963871 tctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggaaactgatttggttcttcctcaaccagtac 24963966  T
Q  481 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24963967 atttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagt 24964008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 206 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 27955336 - 27954994
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955336 tgttagaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaataatcat-aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 27955238  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaag--ccctctaatcaacaacg 403  Q
    |||||||||| |||||||||||     |||||||| || || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||  | |||| | ||||||||    
T  27955237 tcggatctacaacatgtttgat-----aaggatataaataa-taaggtattaggaagacctggataaagctttcatgatagctctctctcaacaacaacg 27955144  T
Q  404 ataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacacaatcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttct 498  Q
    ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||   |  |||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27955143 ataaagaaagagaggatgtgatgatctgaaacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttagttattcctcaaccggtacctttatgtcttaagttct 27955044  T
Q  499 cttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||||| ||||    
T  27955043 c-tcagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtattggggatcata 27954994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 38151923 - 38152293
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaag--tggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38151923 aataaatcaaacatgaagactcgctctgataccacttgttagaaatccaagtcttaata-aaatagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaa 38152021  T
Q  270 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga 369  Q
     ||||||||||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38152022 cagcggaagcaaacaaaatattgaac------atgatcagatctacgacatgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 38152115  T
Q  370 taaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcga-gttagcggcggctgatttggttcttc 468  Q
    | || |||| ||   |  ||||| | |||||| |||       ||||    ||||||||||| ||||||   | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38152116 tgaaactttgatgacaatcctctcaacaacaatgat------ggagaaaccatgatctgaaatacacaacatacgttagcggcagctaatttggttcttc 38152209  T
Q  469 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  38152210 ttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaacgagt-ttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatag 38152293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 206 - 383
Target Start/End: Original strand, 12183562 - 12183743
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaat-----tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12183562 tgttggaaatttagttcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaacaatataattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaatattgaacataat 12183661  T
Q  301 tatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatag 383  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12183662 tatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagtattaggaatacctgaataaagctttcatag 12183743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 501
Target Start/End: Original strand, 12183816 - 12183867
Alignment:
Q  450 gcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 501  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183816 gcgactgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23254063 - 23254006
Alignment:
Q  468 cctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattg 526  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23254063 cctcaaccg-tacatttatgcatcaagttcttttcatatggggagaagagagtgtattg 23254006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 12692229 - 12692610
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagt-ggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12692229 aataaatcaaacatgaagacggctctgataccacttgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaat 12692328  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12692329 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggat 12692428  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692429 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 12692528  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12692529 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 12692610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 12686162 - 12686508
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686162 tgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 12686261  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  12686262 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 12686361  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686362 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 12686461  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12686462 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 12686508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 28531430 - 28531811
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28531430 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaat 28531529  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28531530 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggat 28531629  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  28531630 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcct 28531729  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  28531730 caaccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggagaccatag 28531811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 28525369 - 28525715
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525369 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28525468  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  28525469 tcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 28525568  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28525569 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcaga 28525668  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  28525669 tggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatag 28525715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 7389531 - 7389877
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389531 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 7389630  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||    
T  7389631 tcggatccacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgat 7389729  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389730 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 7389829  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  7389830 tggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatag 7389877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41297453 - 41297109
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41297453 tgttggaaatttgggtcttaatataaagagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatga 41297354  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||      |||||||  | | |||||| ||||||||||||    
T  41297353 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctg------gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat 41297260  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctca---agttctcttc 502  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  41297259 aaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtagttctcttc 41297160  T
Q  503 agatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41297159 agatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatag 41297109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 205 - 554
Target Start/End: Original strand, 30384358 - 30384715
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30384358 ttgttggaaatttaggttttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgatta 30384457  T
Q  303 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |   | | ||||   || ||||    
T  30384458 tgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttcgtgacaactctctcgccatcaac 30384556  T
Q  403 gat---aaccaaagagaggagatg-----atctgaaacacacaatcgag-ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 493  Q
    |||   || ||| |||||||||||     |||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  30384557 gatctaaaacaaggagaggagatgatctaatctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcga 30384656  T
Q  494 gttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatagt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30384657 gttctcttcagatggggagaagagaatgt-ttgccgtgtacggtgtatt-gggaccatagt 30384715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 203 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30772463 - 30772142
Alignment:
Q  203 acttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaa-cattgaacatgatt 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  30772463 acttgttggaaatttagttcttaataaaaataaatttcataaaacatgttcaataattatgaataaacagtggaagcaaacaaaaacaatgaacatgatt 30772364  T
Q  302 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaa 401  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||||   |||||||    
T  30772363 atgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatggcagccctc---tcaacaa 30772267  T
Q  402 cgataaccaa-ag-agaggagatgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 497  Q
    | |||| ||| || ||  | ||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772266 caataaacaagagaaggtgtgatgatctgaaacacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 30772167  T
Q  498 tcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30772166 tcttcagatggggagaagagagagt 30772142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 192 - 550
Target Start/End: Original strand, 19066076 - 19066438
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19066076 gctctgataccactagttggaaatttaagtcttaataaaaacatatttcataaaccatgttcaacgattataaatcattagcggaagcaaacaaaacatt 19066175  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccc 389  Q
     | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||| |||||||  | | ||| |    
T  19066176 aagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaataccaggagatgaagctttggtggcagctc 19066275  T
Q  390 tctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacac---aatcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct 482  Q
    |||   ||||||||||    |||||||| |  |||||||||||| ||    ||| |    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19066276 tctcgacaacaacgat----aaagagagaaagtgatctgaaacaaacccacatcaacacggttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacct 19066371  T
Q  483 ttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggacca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19066372 ttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtccggtgtattggggacca 19066438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 366 - 553
Target Start/End: Original strand, 32097165 - 32097352
Alignment:
Q  366 tggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttc 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32097165 tggataaagctttcatagcagccctttaatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 32097264  T
Q  466 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32097265 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatag 32097352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 192 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24054526 - 24054335
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaattt-aggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacat 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24054526 gctctgataccacttgttgaaaattttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatctatagcggaagcaaacaaaacat 24054427  T
Q  291 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggg-tattaagaatacctggataaagctttcat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24054426 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctggataaagctttcat 24054335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 366 - 553
Target Start/End: Original strand, 32094364 - 32094551
Alignment:
Q  366 tggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttc 465  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32094364 tggataaaggtttcatagcagccctttaatcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttc 32094463  T
Q  466 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32094464 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatag 32094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Original strand, 19059746 - 19060100
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||     
T  19059746 ttgttggaaatttaggtcttaataaaaacatatttcataaaacgtattcaacgattataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatata 19059845  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||  | | ||||||||   |||||||    
T  19059846 aacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatgaagctttggtggcagccctctcgacaacaac 19059945  T
Q  403 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-----atcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 493  Q
    |||    |||||||| || |||||||||||| |||     ||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19059946 gat----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacatccacatcaacacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaa 19060041  T
Q  494 gttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  19060042 gttctcttcatatcgggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatgtattggggaccatag 19060100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 172 - 401
Target Start/End: Original strand, 32096908 - 32097138
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  32096908 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaa 32097007  T
Q  270 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  32097008 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggattacctgaa 32097106  T
Q  370 taaagctttcatagaagccctctaatcaacaa 401  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  32097107 taaagctttcatagcagtcctctcaacaacaa 32097138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 206 - 404
Target Start/End: Original strand, 32094142 - 32094340
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094142 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagattttataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32094241  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  32094242 ataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaatacctgaataaagctttcatagcagccctctcaacaacaacga 32094340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 289 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20499968
Alignment:
Q  289 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagcc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| || | ||||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  389 ctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 488  Q
    |||| | || ||||||||| || |||||  ||  ||||||||||| ||||    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20500131 ctctcaacatcaacgataaacagagagaa-aggcgatctgaaacaaacaagaaggttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgc 20500033  T
Q  489 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20500032 ctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 20499968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Original strand, 16215157 - 16215308
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16215157 tgttagaaatttaggtctttataaaaacagatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatga 16215256  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtatta 357  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16215257 ttggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtatta 16215308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14610321 - 14610184
Alignment:
Q  212 aaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 309  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14610321 aaatttaggtcttaacaaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcgg 14610222  T
Q  310 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 347  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610221 atttacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 14610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 410 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14610141 - 14610000
Alignment:
Q  410 aaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14610141 aaagagaggagatgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggg 14610042  T
Q  510 gagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14610041 gagaaaagaaagt-ttgccgtgttcggtgtattggggaccata 14610000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 353
Target Start/End: Original strand, 26316782 - 26316922
Alignment:
Q  213 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 312  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||    
T  26316782 aatttaggtctacataaaaacatatttcataaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatc 26316881  T
Q  313 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggt 353  Q
    || ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  26316882 taggacatgtttgatttatctacggtattaataattagggt 26316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26510013 - 26509722
Alignment:
Q  216 ttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctac 315  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||    
T  26510013 ttaggcctaaataaaaacagatttcataaaacatgttcaatcattatgaa---atagtggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactac 26509917  T
Q  316 gacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagag 415  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  || || ||||||| ||   || ||||| | || |||||||    ||||||    
T  26509916 gacatatttgattcatcaa-gatattaagaatta-ggtattaggaatatatgaatgaagctttgatgacagtcctctcaacatcaacgat-ctgaaagag 26509820  T
Q  416 aggagat---gatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 508  Q
      || ||   ||||||||| |||||  || ||||  | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26509819 gagaaatcgcgatctgaaatacacaacatagagtcggtggcggctgatttgatacttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagatgg 26509722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 284 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  284 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 348
Target Start/End: Original strand, 37896286 - 37896423
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 310  Q
    |||| |||||||||||   ||||  |||||||||| ||| || || ||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  37896286 gaaaattaggtcttaaataaaacgaatttcataaatcatatttaataatcatgaatcaacagcagaagtaaataaaatgttgaacatgattatgatcgga 37896385  T
Q  311 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37896386 tctacgacatgattgatttatcaagaatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Original strand, 8706454 - 8706508
Alignment:
Q  212 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaat 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8706454 aaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaacaattatgaat 8706508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 476
Target Start/End: Original strand, 8706532 - 8706672
Alignment:
Q  333 aaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||   | || ||| | || ||||    || |||||||||||||||||||||||    
T  8706532 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaacagcaac----acgaaagagaggagatgatctgaaac 8706627  T
Q  433 aca-caatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 476  Q
    | |   |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8706628 aaattgaaggggttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 522
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318558
Alignment:
Q  455 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagt 26318558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 524
Target Start/End: Original strand, 33753476 - 33753536
Alignment:
Q  464 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtat 524  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  33753476 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtat 33753536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 524
Target Start/End: Original strand, 33849110 - 33849170
Alignment:
Q  464 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtat 524  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  33849110 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtat 33849170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Original strand, 33753294 - 33753350
Alignment:
Q  265 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatg 321  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  33753294 atcattagcggaagcaaaaaaaactttgagcatgaatatgatcgaatctacaacatg 33753350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 172 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24288196 - 24287821
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288196 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaata--aatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 24288099  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24288098 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggat 24287999  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287998 aaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 24287899  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggac 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24287898 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggac 24287821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 192 - 553
Target Start/End: Original strand, 10739308 - 10739668
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10739308 gctctgataccacttgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacatt 10739407  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  10739408 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctc 10739507  T
Q  392 taatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctc 491  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10739508 tcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctc 10739607  T
Q  492 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10739608 aaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtgtattggggaccatag 10739668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 192 - 553
Target Start/End: Original strand, 10953077 - 10953437
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10953077 gctctgataccacttgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacatt 10953176  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  10953177 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctc 10953276  T
Q  392 taatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctc 491  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10953277 tcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctc 10953376  T
Q  492 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10953377 aaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtgtattggggaccatag 10953437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Original strand, 6257187 - 6257535
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257187 ttgttggaaatttaggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 6257286  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  6257287 atcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacga 6257386  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257387 taaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 6257486  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6257487 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 6257535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 48161167 - 48160789
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaag-tggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  48161167 aataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttagaaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaac---tatgaatcaat 48161071  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48161070 agcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaat 48160972  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48160971 aaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcct 48160872  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48160871 caaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 48160789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 33458249 - 33458596
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33458249 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatatatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 33458348  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  33458349 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcttagcagccctctcatcaacaacga 33458448  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33458449 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcag 33458548  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  33458549 atggggagaagagaaagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatag 33458596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 48167351 - 48167008
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48167351 tgttagaaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 48167255  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||    
T  48167254 tcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 48167156  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167155 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 48167056  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48167055 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 48167008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 206 - 484
Target Start/End: Original strand, 10733229 - 10733507
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10733229 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10733328  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  10733329 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10733428  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10733429 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 206 - 484
Target Start/End: Original strand, 10946998 - 10947276
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10946998 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10947097  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  10947098 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10947197  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10947198 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 248 - 553
Target Start/End: Original strand, 33461418 - 33461721
Alignment:
Q  248 atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 347  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33461418 atgttcaacaatcgtaaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaat 33461516  T
Q  348 tagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttag 447  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33461517 tagggtattaggaatatctggataaagcttttgcagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttag 33461616  T
Q  448 cggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattgggga 547  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  33461617 cggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtatattgggga 33461715  T
Q  548 ccatag 553  Q
    ||||||    
T  33461716 ccatag 33461721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 172 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 49976798 - 49976432
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtgg-ctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49976798 aataaatcaaacatgaagaccactctgataccacttgttagaaatttagattttaataaaaacaaatttcataaaacatattcaacaattatgaatcgat 49976699  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||| |||||||  |||    
T  49976698 agcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagga---taataattagagtattaggaatacc-agat 49976603  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacacaa---tcgagttagcggcggctgatttggtt 464  Q
     ||||||| |||  |  ||||| | |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||     | ||||||||||||||||||||||    
T  49976602 gaagctttgataacactcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctcaaacacacaaaataagggttagcggcggctgatttggtt 49976503  T
Q  465 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtg 538  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49976502 cttcctcaa-cggta-ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtg 49976432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 50168769 - 50168425
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168769 tgttggaaatttaggtcttaataaaaccagattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 50168670  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||| | || || || | ||||||| |     
T  50168669 tcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta-ggtataaggaatacctggttgaggctttcatggcag-ccactcaacaacaacaac 50168572  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgag--ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 503  Q
    || || ||||||||  |||||||||||| |||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168571 aatcagagagaggatgtgatctgaaacaaacaa-caaggattagcggcggttgatttagttcttcctcaa-cggtacctttatgcctcaagttctcttca 50168474  T
Q  504 gatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50168473 gatggagagaaaagagagttttg-cgtgtacggtgtattggggaccatag 50168425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 175 - 402
Target Start/End: Original strand, 26963292 - 26963518
Alignment:
Q  175 aaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagc 273  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26963292 aaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttggaaatttaggtcttaataaaaacaaatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagc 26963391  T
Q  274 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26963392 ggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaa 26963489  T
Q  374 gctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    ||||| || | |||||||| | |||||||    
T  26963490 gcttttatggtagccctctcaacaacaac 26963518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 10733514 - 10733681
Alignment:
Q  385 agccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10733514 agccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733613  T
Q  485 atgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10733614 atgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 10733681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 553
Target Start/End: Original strand, 10947283 - 10947450
Alignment:
Q  385 agccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10947283 agccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947382  T
Q  485 atgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10947383 atgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 10947450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 269 - 522
Target Start/End: Original strand, 44831658 - 44831918
Alignment:
Q  269 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgg 368  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44831658 atagcggaagcaaattaatcattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctag 44831757  T
Q  369 ataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagag-----gagatgatctgaaacacacaa--tcgagttagcggcggctgatttg 461  Q
    || ||||||| |||  | |||||| | |||||||||||| || ||||||     | |||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||| ||    
T  44831758 atgaagctttgataacaaccctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtg 44831857  T
Q  462 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44831858 gttcttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagagt 44831918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632212
Alignment:
Q  291 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccct 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||   | ||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  391 ctaatcaacaacgataaccaaa---gagaggagatgatctgaa-------acacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtac 480  Q
     | | ||||||| |||| ||||   |||| | |||||||||||       ||||| ||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  4632383 ttcaacaacaaccataaacaaataggagatgtgatgatctgaattctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtat 4632284  T
Q  481 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||||||||    
T  4632283 ctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatattggggaccata 4632212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 522
Target Start/End: Original strand, 19686341 - 19686620
Alignment:
Q  236 atttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19686341 atttcataaaacatgttcaataactataaatcaataacggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaag 19686440  T
Q  336 gatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaca 435  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||   || | | | | || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19686441 catattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaaagctttgatgacagacatttcaacagcaatgatcaccaaagagagaagatgatctgaaacaca 19686539  T
Q  436 caatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 522  Q
    |||      || | || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19686540 caa------tatcagcagctgatttggttcgttctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagt 19686620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 443 - 553
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957133
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtatt 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  543 ggggaccatag 553  Q
    |||||||||||    
T  26957123 ggggaccatag 26957133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 323
Target Start/End: Original strand, 26956812 - 26956929
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  26956812 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatga 26956911  T
Q  306 tcggatctacgacatgtt 323  Q
     |||||||||||||||||    
T  26956912 acggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4632964 - 4632869
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632964 ttgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 4632869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3769710 - 3769434
Alignment:
Q  239 tcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggat 338  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3769710 tcataaaatatgttcaataattatgaatcaataatttaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggat 3769611  T
Q  339 attaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggaga---tgatctgaaacaca 435  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| || || | ||||| ||    | ||||| | || |||||||   || ||||| || |   |||| ||||| |||    
T  3769610 attaataatta-ggtattaggaatacttgaatgaggctttgat---ggtcctctcaacagcaacgat---cacagagaagaaatcgtgatgtgaaataca 3769518  T
Q  436 caatcga-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 518  Q
    |||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769517 caacataggttagtggcggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 50156135 - 50155789
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||  | |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        
T  50156135 gctctgatatcacttgttaaaaatttaattgttaataaaaccagattatataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaacataa---- 50156040  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagcc-ct 390  Q
            ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| | |||||  ||| | | |||||||| |||||| ||    
T  50156039 --------ttaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattacg-tataaggaatatttggttgaggctttcatggaagccact 50155949  T
Q  391 ctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcct 490  Q
    | ||| | |||| | ||  | ||||||||  |||| ||||||| ||||     |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  50155948 c-aat-agcaacaacaattagagagaggatgtgatttgaaacaaacaacaatattagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgcct 50155851  T
Q  491 caagttctcttcagatggggag-aagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
     ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50155850 taagttcttttcagatgaggagaaagagagagttttg-cgtgtacggtgtattggggaccata 50155789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50427497 - 50427358
Alignment:
Q  260 tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttt--------gatttatcaaggatattaagaattagg 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||| | |||||||||||||    
T  50427497 tatgaattaatagtggaagcaatcaaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagg 50427399  T
Q  352 gtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctct 392  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  50427398 gtattaggaatacctggatatagcgttcatggaagccctct 50427358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9237502 - 9237402
Alignment:
Q  243 aaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatta 342  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9237502 aaaacatgttcaatgattatgaatgaatagtcgaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatatta 9237403  T
Q  343 a 343  Q
    |    
T  9237402 a 9237402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 296
Target Start/End: Original strand, 34308060 - 34308144
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaca 296  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34308060 gaaatttacgtcttaata-aaacagattttataaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcatacaaaatattgaaca 34308144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35177770 - 35177666
Alignment:
Q  411 aagagaggagatgatctgaaacacacaa--tcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35177770 aagagaggtgatgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatga 35177671  T
Q  509 ggaga 513  Q
    |||||    
T  35177670 ggaga 35177666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 492 - 554
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26971886
Alignment:
Q  492 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatagt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagt 26971886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Original strand, 55473133 - 55473230
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  55473133 gaaatttaggtcttaatagaaacaaatttcataaaatatgtt---caataataaatcaatagcggaagcaaataaaatattgaatatgattatgattgga 55473229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32284620 - 32284542
Alignment:
Q  442 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 520  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  32284620 agttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagaga 32284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627075
Alignment:
Q  445 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 518  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagaga 17627075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045107
Alignment:
Q  442 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 520  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagaga 33045107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35177883 - 35177806
Alignment:
Q  258 attatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 335  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  35177883 attatgaattaatagctgaaaaaaacaaaacattaaatatgattataatcggatatacaacatattagatttatcaag 35177806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 50427281 - 50427238
Alignment:
Q  458 tttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 501  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50427281 tttggttcttactcaaccggtacatttatgcctcaacttctctt 50427238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28704619 - 28704553
Alignment:
Q  274 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatat 340  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  28704619 ggaaacaaataaaatattgagcatgaatatgatcagatctacaacatgtttgatgtatcaaagatat 28704553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33045328 - 33045264
Alignment:
Q  270 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 334  Q
    |||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  33045328 tagcagaagcaaataaaaaactaaacatgattataatcggatctacaacttgtttgatctatcaa 33045264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32891100 - 32890718
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32891100 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaat 32891001  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32891000 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 32890901  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890900 aaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 32890801  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32890800 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 32890718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 5542143 - 5542490
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542143 tgttggaaatttaggttttaatataaatagattttataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 5542242  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  5542243 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 5542342  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542343 aaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 5542442  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542443 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 5542490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 172 - 552
Target Start/End: Original strand, 42992952 - 42993329
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992952 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccacttgatggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaat 42993051  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42993052 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaataccttgat 42993150  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||  |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993151 aaagcttttgtagccaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 42993250  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42993251 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccata 42993329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32897189 - 32896842
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897189 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 32897090  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcataga-agccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |    
T  32897089 tcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttca-agacaaccctctcatcaacaacaa 32896991  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896990 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 32896891  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32896890 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 32896842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9935455 - 9935111
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9935455 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatga 9935356  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9935355 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttcatagcagccctctaatcaacaacgtt 9935256  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935255 aaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 9935156  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9935155 tggggagaagagag---tttgtcgtgtacggtgtattggggaccatag 9935111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14418114 - 14417771
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418114 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 14418018  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14418017 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgat 14417918  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14417917 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcaga 14417818  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14417817 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 14417771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36819147 - 36818802
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36819147 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatctcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatga 36819048  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||    
T  36819047 tcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgccctctcatcaacaacgat 36818949  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36818948 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcaga 36818849  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36818848 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 36818802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10706021 - 10705667
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10706021 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaaatcaatagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattat 10705922  T
Q  304 gat------cggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatca 397  Q
    |||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  10705921 gattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcatca 10705823  T
Q  398 acaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10705822 acaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggcttaagttc 10705723  T
Q  498 tcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  10705722 tcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatag 10705667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 284 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10699858
Alignment:
Q  284 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatag 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||    
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaaacttttgtag 10700029  T
Q  384 aagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 483  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700028 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 10699929  T
Q  484 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatagt 554  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10699928 tatgcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagt 10699858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 213 - 553
Target Start/End: Original strand, 22219706 - 22220057
Alignment:
Q  213 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacatgattatgatcggat 311  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22219706 aatttaggtcttaataaaaagagatttcataaaacatgttcaatagttatgaatcaatagcagaagaaaaagaaaactttgaacatgattatgatcggat 22219805  T
Q  312 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga-taaagctttcatagaagccctct----------aatcaaca 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || | ||||||||           | |||||    
T  22219806 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatggcagccctctcaacaacaaccaacaaca 22219905  T
Q  401 acgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 500  Q
    ||||||| |||||| |  |  |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22219906 acgataaacaaaga-aaaaattgatctgaaacaaacaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 22220004  T
Q  501 tcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22220005 tcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 22220057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 205 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7771409 - 7771202
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7771409 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 7771310  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||| |||||||||||    
T  7771309 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat-aagcttttgtagcaaccctctcatcaacaacga 7771211  T
Q  405 taaccaaag 413  Q
    |||||||||    
T  7771210 taaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 192 - 537
Target Start/End: Original strand, 39735517 - 39735862
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtctt----aatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39735517 gctctgataccacttgttggaaatttaggtttttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaataaaa 39735616  T
Q  288 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagc 387  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||| | | |    
T  39735617 tattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctggataaa-atttcatggcaac 39735715  T
Q  388 cctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaa-tcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 486  Q
    ||||| | |||||||| |    |||||||| || |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  39735716 cctctcaacaacaacggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacaacaagggttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttat 39735811  T
Q  487 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggt 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  39735812 gcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacggt 39735862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 205 - 552
Target Start/End: Original strand, 39727299 - 39727637
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatat---aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727299 ttgttggaaatttaggtcttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 39727398  T
Q  302 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaa 401  Q
    ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| | | | |||||| | ||||||    
T  39727399 atgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttcttggcaaccctctcaacaacaa 39727489  T
Q  402 cgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 500  Q
    || |    |||||||| || |||||||||||| |||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39727490 cggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacagcaagggttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactct 39727585  T
Q  501 tcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  39727586 tgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatattggggaccata 39727637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 206 - 372
Target Start/End: Original strand, 14799399 - 14799564
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799399 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 14799498  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataa 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14799499 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Original strand, 1882725 - 1882939
Alignment:
Q  197 gataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1882725 gataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaaacagatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaac 1882824  T
Q  296 atgattatgatcggatct-acgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccctct 392  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||    
T  1882825 atgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagctttcatggcagccctct 1882924  T
Q  393 aatcaacaacgataa 407  Q
     | ||||||||||||    
T  1882925 caacaacaacgataa 1882939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 443 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033631
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtatt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagt-ttgccgtgtacaatgtatt 42033642  T
Q  543 ggggaccatag 553  Q
    |||||||||||    
T  42033641 ggggaccatag 42033631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 443 - 553
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883148
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtatt 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagt-ttgccgtgtattgtgtatt 1883137  T
Q  543 ggggaccatag 553  Q
    |||||||||||    
T  1883138 ggggaccatag 1883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24250279 - 24250171
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24250279 ttgttgaaaatttaggtcttaaaa-aaacatatttcataaaacatgttgaacaaatatgaatcaatagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatg 24250181  T
Q  305 atcggatcta 314  Q
    ||||||||||    
T  24250180 atcggatcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1171493 - 1171414
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1171493 gaaatttaggtcttaata-aaacagatttcatgaaacatattcaacaattatgattcaaccgcggaagcaaacaaaacatt 1171414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171249
Alignment:
Q  313 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaa 412  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || | ||| |||| | || ||||  ||| || |    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaag-ataacaagaattagg-tattaggaatacctggttaaagcttttatggcagctctctcaacagcaacagtaaacaga 1171317  T
Q  413 gagaggagatgatctgaaacacacaat--cgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 479  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171316 gagatgatgtgatctgaaacaaacaacaacg-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Original strand, 31399047 - 31399119
Alignment:
Q  233 cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31399047 cagatttaataacatatgttcaataattatgaatcaatagtggaggcaaacaatacattgaacatgattatga 31399119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10700197 - 10700132
Alignment:
Q  195 ctgataccacttgttggaaatttaggtcttaa-tataaacagatttcataaaacatgttcaacaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10700197 ctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacatatttcataatacatgtttaacaat 10700132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42033930 - 42033856
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaa 282  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42033930 tgttggaaatttaggtcttactaaaaatagatttcataaaaca--ttcaacaacaatgaatcaatagcagaagcaaa 42033856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Original strand, 31379430 - 31379502
Alignment:
Q  231 aacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31379430 aacaaatttcataacacatgtttaataattatgaatcaatgacggaggcaaataaaacattgaacatgattat 31379502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39689838 - 39689782
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattat 262  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39689838 tgttggagacttaggttttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattat 39689782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17954632 - 17954557
Alignment:
Q  257 aattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc 332  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  17954632 aattatgaatcattaacggaagcaaaaacaacattaaacatgaatatgattggatccacaacatgtttgatctatc 17954557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Original strand, 8650785 - 8651133
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650785 ttgttgtaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 8650884  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  8650885 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 8650984  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650985 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 8651084  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8651085 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 8651133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 4580304 - 4580651
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580304 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 4580403  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  | |||||| ||||||||||||    
T  4580404 tcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacgat 4580503  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580504 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 4580603  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4580604 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 4580651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 21190849 - 21191199
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21190849 tgttggaaatttaggtcttattataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 21190948  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  21190949 tcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 21191048  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcc---tcaagttctcttc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21191049 aaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcatcaagttctcttc 21191148  T
Q  503 agatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21191149 agatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatag 21191199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25354388 - 25354041
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25354388 tgttggaaatttagatcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatg 25354289  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  25354288 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 25354190  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354189 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 25354090  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25354089 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatag 25354041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 172 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25343840 - 25343459
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatg----ttcaacaattatgaa 265  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||    |||||||||  | ||    
T  25343840 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttatatcttaattaaaaacaaatttcataatacatgcatgttcaacaatcgtaaa 25343741  T
Q  266 tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25343740 tcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaag-atattaagaattagagtattaggaatacc 25343642  T
Q  366 tggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttc 465  Q
    | |||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25343641 tagataaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttc 25343542  T
Q  466 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggac 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25343541 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggac 25343459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 31756196 - 31756549
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756196 tgttggaaatttaggtcttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgattat 31756295  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   |||||||| | || ||||     
T  31756296 aatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatgacagccctctcaacagcaacc 31756395  T
Q  404 ataaccaaagagagga---gatgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttct 498  Q
    |||  || ||||||||   ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31756396 atacacagagagaggaggtgatgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttct 31756495  T
Q  499 cttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | | |||||||||||||||    
T  31756496 cttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtttgatatattggggaccatag 31756549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 206 - 425
Target Start/End: Original strand, 32035269 - 32035488
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035269 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 32035368  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  32035369 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 32035468  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgat 425  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32035469 aaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 172 - 529
Target Start/End: Original strand, 21196969 - 21197336
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21196969 aataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcatagtaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaat 21197068  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  21197069 agcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattatgaatacctggat 21197166  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctct---aatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--------atcga--gttagcggcggctga 457  Q
    ||| |||| || | ||||||||    | ||||||||||||    ||||||||| |||| || |||| |||        ||| |  |||||||||||||||    
T  21197167 aaatcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa--ggagagaggaggtgatatggaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctga 21197264  T
Q  458 tttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 529  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197265 tttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 21197336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 203 - 411
Target Start/End: Original strand, 21782733 - 21782941
Alignment:
Q  203 acttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782733 acttgttagaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 21782832  T
Q  303 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  21782833 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaac 21782932  T
Q  403 gataaccaa 411  Q
    |||||||||    
T  21782933 gataaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 172 - 364
Target Start/End: Original strand, 8662729 - 8662922
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662729 aataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttgtaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 8662828  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8662829 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17581797 - 17581483
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 310  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17581797 gaaatttagatctaaataaaaacataattcataaaacatgttcaactattatgaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattatagga 17581698  T
Q  311 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataacca 410  Q
    |||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||| |  || |    
T  17581697 tctacgacatgtttgatttacc---------aagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatgacagccctctcaacaacaacaacgacaa 17581607  T
Q  411 -aagagaggagatgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 507  Q
      ||||||||| ||||||||| || |||  | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17581606 ggagagaggaggtgatctgaagcaaacatcaacg-gttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatg 17581508  T
Q  508 gggagaagagagagtattgccgtgt 532  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  17581507 gggagaagagagagttttgtcgtgt 17581483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 549
Target Start/End: Original strand, 21770546 - 21770891
Alignment:
Q  212 aaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21770546 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgatcaacaatcgtaaattaatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacgga 21770645  T
Q  311 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctct---aatcaacaacgataa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||    | ||||||||||||    
T  21770646 tctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatatctgaataaagcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa 21770743  T
Q  408 ccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--------atcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 497  Q
        ||| ||||| |||||||||||| |||        ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770744 --ggagataggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 21770841  T
Q  498 tcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggacc 549  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21770842 tcttcagat--ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacc 21770891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 548
Target Start/End: Original strand, 21783337 - 21783649
Alignment:
Q  251 ttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 350  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21783337 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta- 21783435  T
Q  351 ggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--------at 439  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||| || | | |||||| | |||||||   |||||    ||||||||| |||| ||||||| |||        ||    
T  21783436 -gtattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaacaaagataa--ggagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcat 21783532  T
Q  440 cga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtg 531  Q
    | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21783533 caacggttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtg 21783632  T
Q  532 tgcggtgtattggggac 548  Q
    | |||||||||||||||    
T  21783633 tacggtgtattggggac 21783649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 548
Target Start/End: Original strand, 21789560 - 21789872
Alignment:
Q  251 ttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 350  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21789560 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta- 21789658  T
Q  351 ggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--------at 439  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||| || | | |||||| | |||||||   |||||    ||||||||| |||| ||||||| |||        ||    
T  21789659 -gtattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaacaaagataa--ggagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcat 21789755  T
Q  440 cga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtg 531  Q
    | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21789756 caacggttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtg 21789855  T
Q  532 tgcggtgtattggggac 548  Q
    | |||||||||||||||    
T  21789856 tacggtgtattggggac 21789872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 205 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18778761 - 18778564
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaa-catgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18778761 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaacaaatttcataaaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataattat 18778662  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaa 401  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||    
T  18778661 gatcggatctacgacgtatttgatttatcaa-tatattaagaattaggggttttaggaatacctggataaaactttcatggcagccctcttaacaacaa 18778564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6098191 - 6097999
Alignment:
Q  174 taaatcaaacatgaag-tggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaacatgttcaacaa---ttatgaatca 268  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6098191 taaatcaaacatgaagattgctctcataccacttgttgaaaacttaggtcttaataaaaaacaaatttcataaaacatgttcaacaacaattatgaatca 6098092  T
Q  269 a-tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatac 364  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6098091 aatagcggaagtagacaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaa-gatgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Original strand, 34603338 - 34603457
Alignment:
Q  230 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 329  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34603338 aaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgattt 34603436  T
Q  330 atcaaggatattaagaattag 350  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  34603437 atcaaggatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Original strand, 34724615 - 34724734
Alignment:
Q  230 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 329  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34724615 aaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgattt 34724713  T
Q  330 atcaaggatattaagaattag 350  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  34724714 atcaaggatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6102803 - 6102693
Alignment:
Q  207 gttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaacatgttcaacaa---ttatgaatcaa-tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  6102803 gttggaaatttaggtcttcataaaaaacatatttcataaaatatgttcaacaacaatcatgaatcaaatagcggaagcagacaaaacattgaacatcaat 6102704  T
Q  302 atgatcggatc 312  Q
    |||| ||||||    
T  6102703 atgaacggatc 6102693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 553
Target Start/End: Original strand, 30905821 - 30905910
Alignment:
Q  462 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||    
T  30905821 gttcttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagt-ttgtcgagtacggtgtattgggaaccatag 30905910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28721451 - 28721414
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccacttgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721451 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccacttgtt 28721414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745394
Alignment:
Q  442 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtat 541  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| || |||| ||| ||||||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatggaaataagtgagaata-tgccatgtacggtgtat 20745399  T
Q  542 tgggg 546  Q
    |||||    
T  20745398 tgggg 20745394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1106294 - 1106229
Alignment:
Q  302 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt-agggtattaagaatacct 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  1106294 atgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaatacct 1106229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 17900174 - 17900259
Alignment:
Q  258 attatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaa 343  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||| | |||| ||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  17900174 attatgaattattaggggaagcaaacaaaaaattgtacataaatatgttcgaatctacaacatgtttggtccatcaaggatattaa 17900259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36750591 - 36750244
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750591 tgttggaaatttaagtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 36750492  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36750491 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgat 36750392  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36750391 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcaga 36750292  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36750291 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatag 36750244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13456311 - 13455929
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13456311 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaat 13456212  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13456211 agcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggat 13456112  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13456111 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcct 13456012  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13456011 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 13455929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13462217 - 13461870
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13462217 tgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatga 13462118  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||    
T  13462117 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat 13462018  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462017 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 13461918  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13461917 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 13461870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 28682928 - 28683274
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28682928 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28683027  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcataga-agccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  28683028 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttca-agacaaccctctcatcaacaacga 28683126  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683127 taaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 28683226  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28683227 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 28683274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Original strand, 44716786 - 44717135
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44716786 ttgttagaaatttaggtcttaataaaaacagatatcataaaacatgttcaacggttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgattat 44716885  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||    
T  44716886 gatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacg 44716985  T
Q  404 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44716986 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 44717085  T
Q  504 gatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44717086 gatggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatag 44717135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31002589 - 31002206
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  31002589 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaa 31002490  T
Q  270 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31002489 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaa 31002390  T
Q  370 taaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcc 469  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  31002389 taaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 31002290  T
Q  470 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  31002289 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatag 31002206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 211 - 552
Target Start/End: Original strand, 13149674 - 13150018
Alignment:
Q  211 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149674 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 13149773  T
Q  311 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataacca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13149774 tctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctg-ataaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataacca 13149871  T
Q  411 aagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg- 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13149872 aagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgaga 13149971  T
Q  510 ----gagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
        ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13149972 tgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccata 13150018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 201 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31008537 - 31008184
Alignment:
Q  201 ccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31008537 ccacctgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatga 31008438  T
Q  300 ttatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaac 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  31008437 ttatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaac 31008338  T
Q  400 aacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 499  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31008337 aacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctc 31008238  T
Q  500 ttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  31008237 ttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatag 31008184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30965505 - 30965157
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30965505 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 30965406  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  30965405 atcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 30965306  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965305 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 30965206  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  30965205 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatag 30965157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 35090598 - 35090982
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090598 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttg-aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 35090696  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  35090697 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggat 35090796  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacac--------aatcgagttagcggcggctgatttgg 462  Q
    ||||||||||| | |||||||| | || |||| ||||  | |||||||   |||||||||||| ||        ||| | ||||||||||||||||||||    
T  35090797 aaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--acagagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttgg 35090891  T
Q  463 ttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35090892 ttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 35090982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 212 - 553
Target Start/End: Original strand, 35084665 - 35085009
Alignment:
Q  212 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35084665 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggat 35084764  T
Q  312 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||| ||||  |     
T  35084765 ctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--ac 35084862  T
Q  412 agagaggagatgatctgaaacacac--------aatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 503  Q
    |||||||   |||||||||||| ||        ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084863 agagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 35084959  T
Q  504 gatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35084960 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 35085009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 532
Target Start/End: Original strand, 35438693 - 35439013
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35438693 tgttggaaatttaggccttaata-aaacaaatttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 35438791  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||         || || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||   ||||||| |     
T  35438792 tcggatctacgacatgtttgatt---------tactaggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcatggcagccgtctcgacaacaacaac 35438882  T
Q  406 aacca----aagagaggagatgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 499  Q
    ||| |     ||||||||| |||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35438883 aacgataaggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacg-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 35438981  T
Q  500 ttcagatggggagaagagagagtattgccgtgt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35438982 ttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgt 35439013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 11048536 - 11048884
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048536 tgttggaaatttaggtcttattaaaaataaatttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 11048635  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    | |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||   ||||||| ||    
T  11048636 ttggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttttatgacagccctctcgacaacaacaat 11048735  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacaca---caatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 502  Q
         ||||||| || |||||||||||| |   |||   ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11048736 ----caagagagaaggtgatctgaaacaaatatcaacacagtta-cggcgactaatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttc 11048830  T
Q  503 agatggggagaagagagagt---attgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11048831 agatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattggggaccatag 11048884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23343737 - 23343384
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||| ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23343737 tgtttgaaatttagatcttgataagaagagatttcataaaacatgttcaacgattacgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatga 23343638  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctg--gataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||  ||| || ||||  | | ||||||||   |||||||     
T  23343637 acgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatacatggagatgaaactttggtggcagccctctcgacaacaaca 23343538  T
Q  404 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-----atcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 494  Q
    ||    ||| ||||||| |||||||||||| |||     ||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23343537 at----aaatagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaag 23343442  T
Q  495 ttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23343441 ttctcttcagatggggagaagagagagt-ttcccgtgtacggtgtattggggaccatag 23343384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29833419 - 29833079
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  29833419 aataaatcaaacatgaagactgctctgatactacttgttagaaatttaggtataaatataaagagatttcataatacatgtttaataattgtgaatcaat 29833320  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29833319 aacggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaa-gataacaataatta-ggtattaagaatacctggat 29833222  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat---aaccaaagagaggaga-----tgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggct-gatt 459  Q
     ||| ||| ||   | |||||| | ||||||||||   || |  ||||||||||     ||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||  |||    
T  29833221 gaag-tttgatgacaaccctctcaacaacaacgatctgaatc--agagaggagaaaccgtgatccgaaatacacaacatcgggttagcggcggctaaatt 29833125  T
Q  460 tggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  29833124 tggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctcttcaga 29833079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 445 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879429
Alignment:
Q  445 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattgg 544  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  545 ggaccata 552  Q
     |||||||    
T  19879436 cgaccata 19879429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Original strand, 1387976 - 1388090
Alignment:
Q  179 caaacatgaagtggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaag 278  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  1387976 caaacatgaagtgactctaatactatttgttgtaaatttaggtcaaaataaaaatatacttcataaaacat-ttcaataattatgaatcaataacggaaa 1388074  T
Q  279 caaacaaaacattgaa 294  Q
    ||||||||||||||||    
T  1388075 caaacaaaacattgaa 1388090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034697
Alignment:
Q  444 ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 506  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28765508 - 28765461
Alignment:
Q  455 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 502  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28765508 tgatttggttcttcctcaataggtaccttgatgcctcaaattctcttc 28765461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31651703 - 31651664
Alignment:
Q  284 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31651703 aaaacattgaacatgattatgatcggatttatgacatgtt 31651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 31651564 - 31651478
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccg 529  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||   ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31651564 gttagcggagggtgatttggttctttcttaactaatacctttaaatatcaagttatcttcagatggggagaagaaagagttttgccg 31651478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 192 - 553
Target Start/End: Original strand, 3817280 - 3817640
Alignment:
Q  192 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817280 gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 3817379  T
Q  292 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||    
T  3817380 gaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctc 3817479  T
Q  392 taatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctc 491  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3817480 tcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctc 3817579  T
Q  492 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3817580 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 3817640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 28420942 - 28421288
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28420942 tgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28421041  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  28421042 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 28421141  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421142 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 28421241  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28421242 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 28421288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20239128 - 20238780
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239128 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 20239029  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |    
T  20239028 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacaa 20238929  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238928 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 20238829  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20238828 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatag 20238780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 3811152 - 3811498
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811152 tgttggaaatgtaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 3811251  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||    
T  3811252 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat 3811351  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811352 aacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 3811451  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3811452 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatag 3811498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 205 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 351963 - 351617
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351963 ttgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 351864  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  351863 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 351764  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351763 taaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 351665  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  351664 atggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatag 351617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 172 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 339582 - 339212
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaag-tggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339582 aataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttagctcttaatataaagagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 339483  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  339482 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggat 339383  T
Q  371 aaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    |||||| ||  |         | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  339382 aaagctctctca---------tcaacaacaatgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcct 339292  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  339291 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccat 339212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 206 - 552
Target Start/End: Original strand, 5979156 - 5979503
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5979156 tgttgaaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatg 5979255  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||    
T  5979256 attggatctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacga 5979355  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5979356 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcag 5979455  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5979456 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccata 5979503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 35147986 - 35148338
Alignment:
Q  206 tgttggaaattt-aggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35147986 tgttggaaattttatgtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 35148085  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||     
T  35148086 atcggatctacgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagctttcatggtagccctcgtaacaacaaca 35148185  T
Q  404 ataacca--aagagaggagatgatctgaaacacac--aatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 499  Q
    | ||  |  |  ||  | |||||||||||||||||  |||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35148186 acaaatatgagaaggtgggatgatctgaaacacacaaaatatggtcagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctc 35148285  T
Q  500 ttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  35148286 ttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggatcatag 35148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 221 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 43540146 - 43539808
Alignment:
Q  221 tcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacat 320  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43540146 tcttaataaaaacagatttcatagaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacat 43540047  T
Q  321 gtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggag 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  |  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  43540046 gtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggag 43539947  T
Q  421 ---atgatctgaaacacacaatcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg---ggag 512  Q
       ||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  43539946 gtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggag 43539847  T
Q  513 aagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  43539846 aagagagagt-ttgccgtgcacggtatattggggaccata 43539808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 205 - 429
Target Start/End: Original strand, 42767276 - 42767501
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42767276 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattat 42767375  T
Q  304 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacg 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  42767376 gatcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacg 42767475  T
Q  404 ataaccaaagagaggagatgatctga 429  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42767476 ataatcaaagagagaagatgatctga 42767501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5849702 - 5849360
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaac-atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  5849702 tgttgcaaatttaggtcttaataaaaacaaattttataaaattatgttcaatgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatatg 5849603  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||   ||| |||| | |||||||||    
T  5849602 aacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctggatgaagctttaatgacagctctctcaacaacaacga 5849503  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcga-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 503  Q
    |       ||||    ||||||||||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5849502 t------ggagaaactatgatctgaaatacacaacatatgttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttca 5849409  T
Q  504 gatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  5849408 gatggggagaaaagagagt-ttgccgtgtacggtatattgaggaccatag 5849360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 205 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12804177 - 12803893
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  12804177 ttgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacatg 12804078  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacct--ggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||||||   |||||||    
T  12804077 aacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggggatgaagctttggtagcagccctctcgacaacaac 12803978  T
Q  403 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 488  Q
    |||    ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12803977 gat----aaagagaggaggtgatttgaaacaaac-atcaacatggttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 341 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 15843988 - 15843777
Alignment:
Q  341 taagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatc 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15843988 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15843889  T
Q  441 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgt-gcggtgt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  15843888 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagt-ttgccgtgtaccggtgt 15843790  T
Q  540 attggggaccata 552  Q
    ||||| |||||||    
T  15843789 attggagaccata 15843777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 341 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 15861097 - 15860886
Alignment:
Q  341 taagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatc 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15861097 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15860998  T
Q  441 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgt-gcggtgt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  15860997 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagt-ttgccgtgtaccggtgt 15860899  T
Q  540 attggggaccata 552  Q
    ||||| |||||||    
T  15860898 attggagaccata 15860886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 205 - 554
Target Start/End: Original strand, 22741900 - 22742260
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaat-------caatagcggaagcaaacaaaacattgaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22741900 ttgttggaaatttaggtctcaataagaacaggtttcataaaacatgttcaacaattatgaatgaatcaacaatagcggaagcaaactgaacattgaacat 22741999  T
Q  298 gattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatca 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   ||    
T  22742000 gattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattgaggattagg-tattaggaatacctggatgaagctatggtggcagccctcttgaca 22742097  T
Q  398 a-caacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca-----atcga----gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatg 487  Q
    | |||||||||    |||||||||||||||||||||| | |     ||| |    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22742098 aacaacgataa----agagaggagatgatctgaaacaaatatcaacatcaacacggttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatg 22742193  T
Q  488 cctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatagt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  22742194 cctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatattggagaccatagt 22742260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26383774 - 26383603
Alignment:
Q  234 agatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383774 agatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaacaacagaaacaaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 26383675  T
Q  334 aggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||| | ||||||||||    
T  26383674 agcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttgatggcagccctctcaacaacaacgat 26383603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Original strand, 30219269 - 30219404
Alignment:
Q  246 acatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaaga 345  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30219269 acatgttcaataattatgaatcattagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaaga 30219368  T
Q  346 attagggtattaagaatacctggataaagctttcat 381  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30219369 attatggtattaggaatatctggataaagctttcat 30219404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 420 - 548
Target Start/End: Original strand, 35150736 - 35150865
Alignment:
Q  420 gatgatctgaaacacacaatcga--gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 517  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150736 gatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 35150835  T
Q  518 agagtattgccgtgtgcggtgtattggggac 548  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  35150836 agagt-ttgccatgtacggtgtattggggac 35150865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26381278 - 26380914
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtggctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaata 271  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  26381278 aataaatcaaatatgaacacgctctgatatcactcattagaaatttaggtctaaata-aaatagatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaagg 26381180  T
Q  272 gcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggata 371  Q
    | | || |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| |         ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  26381179 gggaaaacaaacacaatattgaacatgatcatgatcagatctacta---------tttatcaagcatgctaagaattagggtattaggagtac-tggatg 26381090  T
Q  372 aagctttcatagaagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcga-gttagcggcggctgatttggttcttcct 470  Q
    ||||||| ||   | |||||| | |||||||||| |  |||        ||||| ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26381089 aagctttgatgacaaccctctcaacaacaacgatgaagaaacc------atgatatgaaatacacaacttacgttagcggcggctgatttggttcttcct 26380996  T
Q  471 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||| ||||||||||||    
T  26380995 caactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatgtactggggaccatag 26380914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7608433 - 7608306
Alignment:
Q  394 atcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacaca--atcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctc 491  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  7608433 atcaacaatgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacataagcggattagcggcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactc 7608334  T
Q  492 aagttctcttcagat-ggggagaagaga 518  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608333 aagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 18666547 - 18666622
Alignment:
Q  274 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  18666547 ggaagcaaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattag 18666622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383499
Alignment:
Q  482 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagt-ttgccgtgtccggtgtattagggaccatag 26383499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3677965 - 3677889
Alignment:
Q  442 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 518  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3677965 agttaccggcagttgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagaga 3677889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 518
Target Start/End: Original strand, 18656883 - 18656948
Alignment:
Q  453 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 518  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  18656883 gctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagaga 18656948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 172 - 553
Target Start/End: Original strand, 172838 - 173219
Alignment:
Q  172 aataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaat 270  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  172838 aataaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttgaaaatttaggtcttaatataaacaggtttcataaaacatgttctacaattatgaatcaat 172937  T
Q  271 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  172938 agcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaatacatggat 173037  T
Q  371 aaagctttcataga-agccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcc 469  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  173038 aaagctttca-agatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 173136  T
Q  470 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  173137 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtatacggtgtattggggaccatag 173219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 605 - 948
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 701  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  702 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgat 801  T
Q  406 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  802 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcaga 901  T
Q  506 tggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  902 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatag 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 206 - 553
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1523
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1176 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 1275  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||    
T  1276 atcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 1375  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1376 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcag 1475  T
Q  505 atggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccatag 553  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  | | |||||||||||||||    
T  1476 atggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatag 1523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 205 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5712 - 5465
Alignment:
Q  205 ttgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 304  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5712 ttgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 5613  T
Q  305 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  5612 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 5513  T
Q  405 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatcgagttagcggcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5512 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 206 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 950
Alignment:
Q  206 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    ||  | ||||||||||    
T  1261 tgttggaaattcagatcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaaccattatgaatcaatatcgaaagcaaacaat---ttagatatgattatga 1165  T
Q  306 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatagaagccctctaatcaacaacgat 405  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| | ||| |||| | || |||| ||    
T  1164 tcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaacatcaacaat 1065  T
Q  406 aaccaaagagagga---gatgatctgaaacacacaatc-gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 501  Q
    ||   |||||| |    ||||||| ||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1064 aaaacaagagaaggtgtgatgatcggaaacacacaccaagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctctt 965  T
Q  502 cagatggggagaaga 516  Q
    |||||||||||||||    
T  964 cagatggggagaaga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38600 - 38434
Alignment:
Q  210 ggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 309  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38600 ggaaatttaggattaaataaaaccagatttcataagacatgttcaatcattagaaatcaacagtggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcgg 38501  T
Q  310 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 378  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38500 atctacaacatgtttg-tttatcaagaatattaataatta-ggtattaggaatacctggatgaagcttt 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 462 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 38347 - 38257
Alignment:
Q  462 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtgcggtgtattggggaccata 552  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  | ||| ||||||||||| |||||||    
T  38347 gttcttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccata 38257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6061 - 5954
Alignment:
Q  244 aaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaa 343  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6061 aaacatgttcaataattattaatcaatagcggcattaaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattat 5962  T
Q  344 gaattagg 351  Q
     |||||||    
T  5961 taattagg 5954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5884 - 5826
Alignment:
Q  443 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 501  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5884 gttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University