View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3629_high_12 (Length: 412)

Name: NF3629_high_12
Description: NF3629
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3629_high_12
NF3629_high_12
[»] chr1 (115 HSPs)
chr1 (1-412)||(44221871-44222282)
chr1 (320-412)||(32564245-32564337)
chr1 (324-412)||(51692166-51692254)
chr1 (321-412)||(34279537-34279628)
chr1 (322-412)||(22584648-22584738)
chr1 (323-412)||(16267716-16267805)
chr1 (315-412)||(33753218-33753315)
chr1 (324-408)||(5117995-5118079)
chr1 (320-412)||(9881550-9881642)
chr1 (320-412)||(23281306-23281398)
chr1 (320-408)||(28112719-28112807)
chr1 (321-412)||(10923659-10923750)
chr1 (320-412)||(18793987-18794081)
chr1 (325-412)||(19885985-19886072)
chr1 (321-412)||(33753512-33753602)
chr1 (321-412)||(36657797-36657888)
chr1 (325-412)||(42607525-42607612)
chr1 (321-411)||(14775744-14775834)
chr1 (320-410)||(45305707-45305797)
chr1 (319-412)||(13944508-13944601)
chr1 (320-412)||(6181912-6182004)
chr1 (324-412)||(11394956-11395044)
chr1 (320-412)||(25088014-25088106)
chr1 (320-412)||(34029017-34029109)
chr1 (328-412)||(50574813-50574897)
chr1 (308-411)||(13944808-13944911)
chr1 (320-411)||(14118528-14118619)
chr1 (321-412)||(28970418-28970509)
chr1 (325-412)||(29256835-29256922)
chr1 (325-412)||(36884725-36884812)
chr1 (321-412)||(37198931-37199022)
chr1 (321-412)||(46949755-46949846)
chr1 (321-412)||(50921387-50921478)
chr1 (321-411)||(11788037-11788127)
chr1 (322-412)||(51691874-51691964)
chr1 (319-412)||(34028718-34028811)
chr1 (320-412)||(16267986-16268077)
chr1 (324-412)||(18793693-18793781)
chr1 (324-412)||(35986234-35986322)
chr1 (333-412)||(10654325-10654404)
chr1 (325-408)||(49291283-49291366)
chr1 (325-408)||(50118350-50118433)
chr1 (333-412)||(52412609-52412688)
chr1 (325-411)||(1831961-1832047)
chr1 (322-408)||(14776035-14776121)
chr1 (323-408)||(11797147-11797232)
chr1 (320-408)||(4045097-4045185)
chr1 (320-412)||(10654028-10654119)
chr1 (324-412)||(11787742-11787830)
chr1 (320-412)||(25088312-25088403)
chr1 (320-412)||(30293011-30293103)
chr1 (320-408)||(36077269-36077357)
chr1 (320-412)||(37199217-37199309)
chr1 (325-412)||(6181619-6181706)
chr1 (325-408)||(19886214-19886297)
chr1 (321-412)||(32563958-32564049)
chr1 (323-406)||(50921061-50921144)
chr1 (321-412)||(52412894-52412985)
chr1 (322-412)||(24590521-24590611)
chr1 (322-412)||(34279240-34279330)
chr1 (325-411)||(45305412-45305498)
chr1 (335-412)||(5463130-5463207)
chr1 (320-412)||(1831662-1831754)
chr1 (320-412)||(30611218-30611310)
chr1 (320-411)||(4550897-4550988)
chr1 (321-412)||(5463414-5463505)
chr1 (325-412)||(30293309-30293395)
chr1 (320-407)||(30792438-30792525)
chr1 (321-412)||(46739020-46739110)
chr1 (321-411)||(4045396-4045486)
chr1 (366-412)||(5118095-5118141)
chr1 (325-411)||(10923365-10923451)
chr1 (322-412)||(22584351-22584441)
chr1 (321-411)||(27209168-27209258)
chr1 (321-411)||(51810136-51810226)
chr1 (323-407)||(30611521-30611606)
chr1 (335-412)||(50574527-50574604)
chr1 (331-408)||(51810438-51810515)
chr1 (320-412)||(9119290-9119382)
chr1 (320-412)||(19986418-19986510)
chr1 (320-412)||(21385232-21385324)
chr1 (366-409)||(11797219-11797262)
chr1 (325-412)||(24655589-24655676)
chr1 (341-412)||(32517624-32517695)
chr1 (325-412)||(34621931-34622018)
chr1 (341-412)||(49291012-49291083)
chr1 (323-401)||(3569377-3569455)
chr1 (366-408)||(5118066-5118108)
chr1 (374-412)||(13831318-13831356)
chr1 (320-410)||(20260677-20260767)
chr1 (320-402)||(21384935-21385017)
chr1 (321-411)||(27209446-27209536)
chr1 (374-412)||(28112802-28112840)
chr1 (345-402)||(24590249-24590306)
chr1 (323-408)||(42607802-42607887)
chr1 (324-412)||(21035987-21036075)
chr1 (320-412)||(24655882-24655974)
chr1 (321-400)||(40703173-40703252)
chr1 (345-399)||(11394715-11394769)
chr1 (321-403)||(19269359-19269441)
chr1 (366-412)||(19886181-19886227)
chr1 (321-411)||(21036279-21036368)
chr1 (327-412)||(29257119-29257204)
chr1 (320-401)||(48702187-48702268)
chr1 (375-411)||(36885001-36885037)
chr1 (376-412)||(46950032-46950068)
chr1 (324-411)||(4054550-4054637)
chr1 (334-401)||(20260440-20260507)
chr1 (382-412)||(9119588-9119618)
chr1 (361-411)||(31126226-31126276)
chr1 (325-398)||(34621624-34621697)
chr1 (324-399)||(4550600-4550676)
chr1 (376-412)||(31125983-31126019)
chr1 (325-412)||(32517809-32517894)
chr1 (374-410)||(36657552-36657588)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (318-412)||(52914948-52915042)
chr4 (325-412)||(8247042-8247129)
chr4 (322-412)||(25593387-25593477)
chr4 (321-412)||(21217846-21217937)
chr4 (321-412)||(46200483-46200574)
chr4 (326-412)||(44710699-44710785)
chr4 (326-412)||(46620931-46621017)
chr4 (322-411)||(45683414-45683503)
chr4 (324-412)||(29864471-29864559)
chr4 (321-412)||(9010801-9010892)
chr4 (322-412)||(21218143-21218233)
chr4 (324-412)||(8751289-8751377)
chr4 (320-412)||(43969823-43969915)
chr4 (325-408)||(1157206-1157289)
chr4 (333-412)||(24504236-24504315)
chr4 (333-412)||(25218095-25218174)
chr4 (325-412)||(37515749-37515836)
chr4 (321-412)||(40067347-40067438)
chr4 (325-411)||(1157503-1157589)
chr4 (322-412)||(24503939-24504029)
chr4 (321-411)||(29864175-29864265)
chr4 (322-412)||(33626160-33626250)
chr4 (315-412)||(9010498-9010595)
chr4 (322-411)||(18862738-18862827)
chr4 (326-411)||(33625868-33625953)
chr4 (326-411)||(33882246-33882331)
chr4 (322-407)||(46535523-46535608)
chr4 (323-412)||(54191880-54191969)
chr4 (320-412)||(38866396-38866488)
chr4 (325-412)||(2738883-2738970)
chr4 (321-412)||(12381350-12381441)
chr4 (320-411)||(43316878-43316968)
chr4 (325-412)||(45911582-45911669)
chr4 (321-412)||(45911870-45911961)
chr4 (321-408)||(54136090-54136177)
chr4 (325-411)||(1205381-1205467)
chr4 (322-412)||(8246769-8246858)
chr4 (322-412)||(10014465-10014554)
chr4 (322-412)||(10021606-10021695)
chr4 (322-412)||(27347597-27347687)
chr4 (322-412)||(40067644-40067734)
chr4 (322-399)||(9657667-9657744)
chr4 (315-412)||(27347893-27347990)
chr4 (322-399)||(34958832-34958909)
chr4 (323-412)||(46535818-46535907)
chr4 (336-412)||(4965885-4965961)
chr4 (325-401)||(34959138-34959214)
chr4 (320-411)||(11102272-11102363)
chr4 (322-401)||(32384653-32384732)
chr4 (325-408)||(46621227-46621310)
chr4 (321-412)||(54136383-54136474)
chr4 (322-412)||(46200781-46200871)
chr4 (323-408)||(11242764-11242849)
chr4 (320-412)||(10014759-10014851)
chr4 (320-412)||(10021900-10021992)
chr4 (320-412)||(25058831-25058923)
chr4 (320-412)||(43317175-43317267)
chr4 (315-412)||(52915239-52915338)
chr4 (325-412)||(4793895-4793981)
chr4 (345-412)||(25218380-25218447)
chr4 (321-412)||(44432920-44433011)
chr4 (321-412)||(48209947-48210038)
chr4 (322-412)||(1205673-1205763)
chr4 (321-411)||(44169978-44170068)
chr4 (322-412)||(44710403-44710493)
chr4 (321-406)||(44428512-44428597)
chr4 (320-412)||(4966164-4966256)
chr4 (325-412)||(25977771-25977859)
chr4 (321-411)||(9657944-9658034)
chr4 (325-411)||(15985469-15985555)
chr4 (366-412)||(21051643-21051689)
chr4 (321-411)||(22830795-22830885)
chr4 (325-411)||(22831095-22831181)
chr4 (334-412)||(53645463-53645541)
chr4 (374-412)||(54191640-54191678)
chr4 (323-412)||(28570717-28570806)
chr4 (325-402)||(29970196-29970273)
chr4 (324-401)||(44170288-44170365)
chr4 (320-412)||(32385108-32385199)
chr4 (324-379)||(43969556-43969611)
chr4 (366-412)||(44428615-44428661)
chr4 (322-412)||(45683117-45683207)
chr4 (325-398)||(38866710-38866783)
chr4 (316-354)||(44957383-44957421)
chr4 (375-408)||(21885124-21885157)
chr4 (366-410)||(44428586-44428630)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (322-412)||(43899111-43899201)
chr3 (321-412)||(54081580-54081671)
chr3 (320-412)||(45171066-45171158)
chr3 (320-411)||(38911515-38911606)
chr3 (321-411)||(7950274-7950364)
chr3 (320-412)||(12123088-12123180)
chr3 (320-412)||(34521264-34521356)
chr3 (320-412)||(43899370-43899462)
chr3 (325-412)||(21169669-21169756)
chr3 (320-411)||(26332620-26332710)
chr3 (325-412)||(34629985-34630072)
chr3 (321-408)||(45871696-45871783)
chr3 (321-412)||(52606128-52606218)
chr3 (322-412)||(8846076-8846166)
chr3 (322-412)||(44069123-44069213)
chr3 (322-412)||(54107669-54107759)
chr3 (326-411)||(22354946-22355031)
chr3 (311-412)||(41208390-41208491)
chr3 (324-412)||(10756720-10756808)
chr3 (321-412)||(17102383-17102474)
chr3 (321-412)||(19124188-19124279)
chr3 (325-412)||(40410715-40410802)
chr3 (321-412)||(41997818-41997909)
chr3 (321-412)||(44069419-44069510)
chr3 (326-412)||(7274938-7275024)
chr3 (321-411)||(28691113-28691203)
chr3 (322-408)||(52609662-52609748)
chr3 (321-411)||(54108417-54108507)
chr3 (327-408)||(35753408-35753489)
chr3 (320-412)||(4846892-4846984)
chr3 (320-412)||(12123375-12123467)
chr3 (320-411)||(2829705-2829795)
chr3 (325-408)||(10757008-10757091)
chr3 (321-412)||(26332318-26332409)
chr3 (321-412)||(28688286-28688377)
chr3 (320-411)||(31514159-31514250)
chr3 (325-408)||(34521557-34521640)
chr3 (325-412)||(35580245-35580332)
chr3 (333-408)||(45871989-45872064)
chr3 (325-412)||(54081287-54081373)
chr3 (322-412)||(7937859-7937949)
chr3 (322-412)||(31513863-31513953)
chr3 (313-411)||(50819211-50819309)
chr3 (313-411)||(50856555-50856653)
chr3 (320-409)||(41208699-41208788)
chr3 (323-408)||(45171367-45171452)
chr3 (325-401)||(2829410-2829486)
chr3 (323-411)||(19124469-19124556)
chr3 (325-412)||(14353343-14353430)
chr3 (333-412)||(17273788-17273867)
chr3 (325-408)||(17274076-17274159)
chr3 (333-412)||(33812735-33812814)
chr3 (320-411)||(46766620-46766711)
chr3 (325-411)||(2078769-2078855)
chr3 (322-412)||(9028487-9028577)
chr3 (322-412)||(15862182-15862272)
chr3 (320-410)||(37133513-37133603)
chr3 (322-412)||(50819513-50819603)
chr3 (322-412)||(50856261-50856351)
chr3 (321-402)||(52268409-52268490)
chr3 (327-408)||(53841326-53841407)
chr3 (320-412)||(15862471-15862563)
chr3 (320-412)||(40639413-40639505)
chr3 (320-412)||(40926009-40926101)
chr3 (324-412)||(51170677-51170765)
chr3 (320-411)||(14353044-14353135)
chr3 (320-411)||(46766911-46767002)
chr3 (322-412)||(8846372-8846462)
chr3 (322-408)||(13866964-13867050)
chr3 (322-412)||(27940272-27940362)
chr3 (366-412)||(35753476-35753522)
chr3 (325-411)||(40639120-40639206)
chr3 (322-411)||(40969255-40969344)
chr3 (320-401)||(51885671-51885752)
chr3 (328-412)||(7742781-7742865)
chr3 (320-412)||(35753727-35753819)
chr3 (324-408)||(49529120-49529204)
chr3 (309-412)||(37133264-37133367)
chr3 (320-387)||(41998135-41998202)
chr3 (326-397)||(49222040-49222111)
chr3 (334-411)||(7743062-7743139)
chr3 (320-401)||(51311825-51311906)
chr3 (321-401)||(5348875-5348955)
chr3 (319-411)||(40969551-40969643)
chr3 (320-400)||(47891821-47891901)
chr3 (320-411)||(5348577-5348668)
chr3 (345-412)||(27254007-27254074)
chr3 (325-412)||(29248604-29248691)
chr3 (321-412)||(54247271-54247361)
chr3 (324-398)||(7937645-7937719)
chr3 (320-410)||(9028189-9028279)
chr3 (374-412)||(28688042-28688080)
chr3 (322-412)||(47891513-47891603)
chr3 (313-411)||(51883850-51883948)
chr3 (367-412)||(22444482-22444527)
chr3 (323-412)||(29248320-29248409)
chr3 (375-412)||(53310018-53310055)
chr3 (367-411)||(22444252-22444296)
chr3 (320-412)||(28691409-28691501)
chr3 (324-412)||(40926307-40926394)
chr3 (375-411)||(53841080-53841116)
chr3 (322-401)||(588458-588537)
chr3 (322-409)||(33812842-33812929)
chr3 (321-408)||(44316626-44316712)
chr3 (321-387)||(7274652-7274718)
chr3 (350-412)||(17102673-17102735)
chr3 (345-411)||(53678730-53678796)
chr3 (324-401)||(33773098-33773175)
chr3 (323-408)||(43844399-43844484)
chr3 (334-411)||(50394321-50394398)
chr3 (335-408)||(52705472-52705545)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (320-412)||(30872781-30872873)
chr8 (320-412)||(29027264-29027356)
chr8 (320-412)||(37393475-37393567)
chr8 (325-412)||(1826087-1826174)
chr8 (325-412)||(1860532-1860619)
chr8 (321-412)||(3869245-3869336)
chr8 (325-412)||(16645844-16645931)
chr8 (321-411)||(8653935-8654025)
chr8 (320-412)||(24456948-24457040)
chr8 (320-412)||(35224063-35224155)
chr8 (325-412)||(8654232-8654319)
chr8 (322-412)||(40040162-40040252)
chr8 (324-412)||(37393773-37393861)
chr8 (321-412)||(14920410-14920501)
chr8 (321-412)||(44678316-44678407)
chr8 (322-412)||(21515496-21515586)
chr8 (321-403)||(24456733-24456815)
chr8 (322-412)||(31230909-31230999)
chr8 (321-411)||(44255159-44255249)
chr8 (327-412)||(14920707-14920792)
chr8 (308-412)||(18017778-18017880)
chr8 (318-411)||(36343958-36344050)
chr8 (323-412)||(39240031-39240120)
chr8 (320-412)||(35223772-35223864)
chr8 (325-412)||(9495319-9495406)
chr8 (325-412)||(18018082-18018169)
chr8 (325-412)||(23244518-23244605)
chr8 (320-410)||(12873344-12873434)
chr8 (324-412)||(119119-119206)
chr8 (320-412)||(5416810-5416902)
chr8 (320-412)||(11198501-11198593)
chr8 (320-412)||(11639050-11639142)
chr8 (324-408)||(30568576-30568660)
chr8 (320-412)||(30650188-30650280)
chr8 (321-401)||(33542383-33542463)
chr8 (320-412)||(40094771-40094863)
chr8 (324-412)||(44254867-44254955)
chr8 (320-411)||(758641-758732)
chr8 (341-412)||(7041648-7041719)
chr8 (333-412)||(31230624-31230703)
chr8 (333-412)||(39912215-39912294)
chr8 (322-412)||(40032724-40032815)
chr8 (322-412)||(18622043-18622133)
chr8 (325-412)||(29026971-29027062)
chr8 (324-412)||(3868946-3869034)
chr8 (324-412)||(5417109-5417197)
chr8 (328-412)||(23244811-23244895)
chr8 (320-412)||(30873074-30873166)
chr8 (325-412)||(39240315-39240402)
chr8 (322-412)||(40032426-40032517)
chr8 (322-412)||(119412-119502)
chr8 (322-412)||(18914547-18914637)
chr8 (314-412)||(21512405-21512502)
chr8 (334-412)||(40094487-40094565)
chr8 (320-412)||(7041925-7042012)
chr8 (325-408)||(758347-758430)
chr8 (321-412)||(1825809-1825899)
chr8 (321-412)||(1860254-1860344)
chr8 (320-407)||(6843493-6843580)
chr8 (324-403)||(44678518-44678596)
chr8 (324-410)||(26217072-26217158)
chr8 (325-411)||(36344258-36344344)
chr8 (324-412)||(26736421-26736509)
chr8 (334-401)||(410669-410736)
chr8 (325-412)||(6844736-6844823)
chr8 (325-412)||(26736128-26736215)
chr8 (377-412)||(30568331-30568366)
chr8 (320-412)||(32733703-32733801)
chr8 (333-411)||(5525882-5525960)
chr8 (334-408)||(15740625-15740699)
chr8 (367-412)||(18914304-18914350)
chr8 (367-411)||(29769408-29769452)
chr8 (322-401)||(28206766-28206845)
chr8 (377-412)||(44678480-44678515)
chr8 (322-412)||(39911917-39912007)
chr8 (320-401)||(35485869-35485950)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (320-412)||(9034611-9034703)
chr7 (320-412)||(43726538-43726630)
chr7 (320-412)||(32706730-32706822)
chr7 (324-412)||(34568585-34568673)
chr7 (320-412)||(35085737-35085829)
chr7 (321-412)||(11678702-11678793)
chr7 (322-412)||(11678998-11679088)
chr7 (322-412)||(23472852-23472942)
chr7 (320-412)||(8769280-8769372)
chr7 (321-412)||(10625380-10625471)
chr7 (321-412)||(35086036-35086127)
chr7 (324-411)||(44447916-44448002)
chr7 (321-412)||(47250842-47250933)
chr7 (311-412)||(9230973-9231074)
chr7 (322-411)||(18731019-18731108)
chr7 (318-411)||(31715629-31715722)
chr7 (324-412)||(2357351-2357439)
chr7 (320-412)||(23472591-23472683)
chr7 (321-412)||(31715917-31716008)
chr7 (322-412)||(44485628-44485718)
chr7 (321-411)||(47251193-47251283)
chr7 (324-409)||(8769581-8769666)
chr7 (320-409)||(23437150-23437239)
chr7 (322-411)||(47305127-47305216)
chr7 (320-408)||(5238449-5238537)
chr7 (323-411)||(48704105-48704193)
chr7 (325-412)||(39118013-39118100)
chr7 (321-408)||(43050383-43050470)
chr7 (334-412)||(41758691-41758769)
chr7 (325-411)||(44448209-44448295)
chr7 (322-408)||(44486232-44486318)
chr7 (322-411)||(22338272-22338361)
chr7 (320-401)||(37144070-37144151)
chr7 (320-412)||(32707027-32707119)
chr7 (312-411)||(473182-473281)
chr7 (320-411)||(15326870-15326961)
chr7 (325-412)||(21522513-21522599)
chr7 (325-411)||(28349677-28349763)
chr7 (367-412)||(9230721-9230766)
chr7 (320-397)||(10625104-10625181)
chr7 (367-412)||(26920213-26920258)
chr7 (325-410)||(43140701-43140786)
chr7 (335-412)||(47250570-47250647)
chr7 (367-412)||(47250942-47250987)
chr7 (320-412)||(43726242-43726333)
chr7 (321-412)||(2357066-2357157)
chr7 (322-397)||(37143764-37143839)
chr7 (324-402)||(38842327-38842405)
chr7 (328-412)||(21522226-21522308)
chr7 (321-412)||(36507105-36507196)
chr7 (325-411)||(38676061-38676147)
chr7 (343-412)||(473476-473545)
chr7 (321-401)||(22338583-22338663)
chr7 (320-412)||(34568880-34568976)
chr7 (345-408)||(48703803-48703866)
chr7 (322-411)||(31623721-31623810)
chr7 (343-412)||(47305423-47305492)
chr7 (367-411)||(23437449-23437493)
chr7 (320-408)||(28263494-28263582)
chr7 (367-411)||(40263608-40263652)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (318-410)||(11524701-11524793)
chr6 (321-412)||(33329205-33329296)
chr6 (320-412)||(3338475-3338567)
chr6 (325-412)||(25551632-25551719)
chr6 (325-412)||(33544825-33544912)
chr6 (322-412)||(3289206-3289296)
chr6 (321-411)||(25551346-25551436)
chr6 (333-412)||(1158599-1158678)
chr6 (321-412)||(3338771-3338862)
chr6 (321-412)||(33346477-33346568)
chr6 (322-412)||(9173901-9173991)
chr6 (325-407)||(24604878-24604960)
chr6 (322-411)||(12903221-12903310)
chr6 (320-412)||(19135742-19135834)
chr6 (324-412)||(29009956-29010044)
chr6 (320-412)||(33545118-33545210)
chr6 (320-411)||(2949294-2949385)
chr6 (321-412)||(3288929-3289020)
chr6 (325-412)||(6220059-6220146)
chr6 (325-412)||(13155842-13155929)
chr6 (325-412)||(13160698-13160785)
chr6 (333-412)||(24605169-24605248)
chr6 (321-412)||(35132600-35132691)
chr6 (321-412)||(29010250-29010341)
chr6 (325-412)||(31029527-31029614)
chr6 (321-408)||(35119111-35119198)
chr6 (335-409)||(11524778-11524852)
chr6 (321-411)||(11525062-11525152)
chr6 (322-403)||(31029829-31029910)
chr6 (322-412)||(1860782-1860871)
chr6 (322-412)||(14336902-14336992)
chr6 (322-412)||(32283026-32283116)
chr6 (323-412)||(6220352-6220441)
chr6 (320-408)||(1158890-1158977)
chr6 (321-408)||(17245624-17245711)
chr6 (366-412)||(33972502-33972548)
chr6 (321-412)||(2814607-2814698)
chr6 (322-412)||(7537901-7537992)
chr6 (321-408)||(14337202-14337288)
chr6 (366-412)||(2949587-2949633)
chr6 (322-408)||(6229687-6229772)
chr6 (325-387)||(33971931-33971993)
chr6 (322-411)||(24548241-24548330)
chr6 (368-408)||(13156139-13156179)
chr6 (368-408)||(13160995-13161035)
chr6 (321-392)||(33548173-33548244)
chr6 (334-412)||(24548537-24548615)
chr6 (321-381)||(35132917-35132977)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (320-412)||(7399075-7399167)
chr5 (320-412)||(21750808-21750900)
chr5 (322-412)||(17861039-17861128)
chr5 (326-412)||(39706347-39706433)
chr5 (324-412)||(36751904-36751992)
chr5 (320-412)||(40589350-40589442)
chr5 (320-412)||(40589953-40590045)
chr5 (325-412)||(5624382-5624469)
chr5 (313-412)||(12593752-12593851)
chr5 (320-411)||(14051887-14051978)
chr5 (322-412)||(33763204-33763293)
chr5 (322-412)||(42710646-42710736)
chr5 (319-412)||(16353450-16353543)
chr5 (324-412)||(32272136-32272224)
chr5 (320-412)||(35263492-35263584)
chr5 (325-412)||(15670447-15670534)
chr5 (322-412)||(334296-334386)
chr5 (322-412)||(9692919-9693008)
chr5 (327-412)||(7210461-7210546)
chr5 (320-412)||(5088424-5088516)
chr5 (323-411)||(8418481-8418569)
chr5 (316-412)||(31909226-31909322)
chr5 (320-412)||(33699273-33699365)
chr5 (321-412)||(3878480-3878571)
chr5 (309-412)||(15267536-15267639)
chr5 (325-412)||(25923121-25923208)
chr5 (322-409)||(28392069-28392156)
chr5 (321-411)||(10656093-10656183)
chr5 (317-412)||(39706050-39706141)
chr5 (321-408)||(29023936-29024020)
chr5 (323-412)||(40774339-40774427)
chr5 (320-412)||(12694982-12695074)
chr5 (320-412)||(36752198-36752289)
chr5 (321-412)||(3879308-3879399)
chr5 (321-412)||(5087806-5087897)
chr5 (325-412)||(9693214-9693301)
chr5 (321-412)||(14143801-14143892)
chr5 (321-408)||(25923419-25923505)
chr5 (329-412)||(26289027-26289110)
chr5 (321-412)||(26289317-26289407)
chr5 (321-412)||(38416430-38416521)
chr5 (325-412)||(41372454-41372541)
chr5 (334-412)||(31656370-31656448)
chr5 (321-398)||(5460187-5460264)
chr5 (323-412)||(7210741-7210830)
chr5 (322-411)||(28391768-28391857)
chr5 (322-412)||(31908928-31909020)
chr5 (323-412)||(42710351-42710440)
chr5 (320-412)||(15267240-15267331)
chr5 (320-412)||(18514286-18514378)
chr5 (325-412)||(15476269-15476356)
chr5 (325-412)||(19205239-19205326)
chr5 (321-408)||(35263794-35263881)
chr5 (323-401)||(5152922-5153000)
chr5 (334-412)||(7399374-7399452)
chr5 (327-401)||(8418206-8418280)
chr5 (322-412)||(10656390-10656480)
chr5 (322-411)||(16353151-16353243)
chr5 (322-412)||(31656654-31656744)
chr5 (335-408)||(17736547-17736620)
chr5 (320-412)||(12593454-12593546)
chr5 (321-408)||(19185548-19185635)
chr5 (322-412)||(40589054-40589144)
chr5 (322-412)||(40589657-40589747)
chr5 (335-412)||(15476555-15476632)
chr5 (321-406)||(40774639-40774724)
chr5 (320-387)||(19204942-19205009)
chr5 (320-410)||(5152614-5152704)
chr5 (325-412)||(41859973-41860062)
chr5 (320-412)||(38416141-38416233)
chr5 (324-412)||(43570067-43570155)
chr5 (320-355)||(26288989-26289024)
chr5 (325-382)||(5460272-5460329)
chr5 (320-407)||(33762899-33762988)
[»] chr2 (98 HSPs)
chr2 (321-412)||(16736100-16736191)
chr2 (321-412)||(27476663-27476754)
chr2 (321-412)||(41377354-41377444)
chr2 (320-412)||(13354473-13354565)
chr2 (320-412)||(17856485-17856577)
chr2 (312-412)||(21470285-21470385)
chr2 (316-412)||(25642564-25642660)
chr2 (320-412)||(27132509-27132601)
chr2 (320-412)||(39150121-39150213)
chr2 (325-412)||(4121059-4121146)
chr2 (321-412)||(13354176-13354267)
chr2 (322-412)||(4104455-4104545)
chr2 (322-412)||(27883468-27883558)
chr2 (322-412)||(28202860-28202950)
chr2 (322-412)||(32933887-32933977)
chr2 (320-412)||(16655902-16655994)
chr2 (322-410)||(20297410-20297498)
chr2 (327-411)||(25642273-25642357)
chr2 (308-412)||(34820575-34820679)
chr2 (322-410)||(36211697-36211785)
chr2 (320-412)||(39454449-39454541)
chr2 (320-411)||(5720140-5720231)
chr2 (323-410)||(12303786-12303873)
chr2 (321-412)||(28203156-28203247)
chr2 (321-412)||(31450665-31450756)
chr2 (325-412)||(38275480-38275567)
chr2 (321-412)||(40694194-40694285)
chr2 (322-412)||(4104159-4104249)
chr2 (326-412)||(16655610-16655696)
chr2 (322-412)||(20908807-20908897)
chr2 (326-412)||(34820283-34820369)
chr2 (325-411)||(39912630-39912716)
chr2 (320-412)||(14877481-14877573)
chr2 (320-412)||(18565064-18565156)
chr2 (320-412)||(43183879-43183971)
chr2 (325-412)||(32503833-32503920)
chr2 (320-411)||(45389129-45389220)
chr2 (321-407)||(16261171-16261257)
chr2 (322-412)||(17856199-17856289)
chr2 (325-411)||(18565300-18565386)
chr2 (322-412)||(27132806-27132896)
chr2 (322-412)||(36211350-36211440)
chr2 (322-412)||(41377650-41377740)
chr2 (320-412)||(12304450-12304542)
chr2 (324-412)||(34127860-34127948)
chr2 (320-412)||(35408817-35408909)
chr2 (324-412)||(37412595-37412683)
chr2 (320-411)||(39912924-39913016)
chr2 (321-412)||(20908510-20908601)
chr2 (325-408)||(27476369-27476452)
chr2 (321-400)||(27914201-27914280)
chr2 (333-412)||(28631285-28631364)
chr2 (325-412)||(28631570-28631657)
chr2 (325-412)||(32503549-32503636)
chr2 (325-412)||(37744684-37744771)
chr2 (322-408)||(4120764-4120850)
chr2 (322-412)||(31450962-31451052)
chr2 (326-412)||(34127570-34127656)
chr2 (322-412)||(37412874-37412964)
chr2 (320-412)||(5921682-5921774)
chr2 (324-412)||(37744451-37744539)
chr2 (324-408)||(39454733-39454817)
chr2 (321-412)||(5961668-5961759)
chr2 (333-412)||(12304081-12304160)
chr2 (333-412)||(21470591-21470669)
chr2 (336-411)||(34484343-34484418)
chr2 (323-410)||(38275755-38275842)
chr2 (322-412)||(10833331-10833421)
chr2 (322-412)||(41659745-41659835)
chr2 (321-412)||(44612779-44612871)
chr2 (323-412)||(16260872-16260960)
chr2 (322-411)||(38073778-38073867)
chr2 (324-409)||(43183585-43183670)
chr2 (321-401)||(27246290-27246370)
chr2 (320-412)||(36442131-36442223)
chr2 (325-412)||(16350367-16350454)
chr2 (320-411)||(33819395-33819485)
chr2 (320-411)||(44915738-44915829)
chr2 (321-411)||(15137101-15137191)
chr2 (322-412)||(16736394-16736484)
chr2 (322-408)||(23992206-23992292)
chr2 (367-412)||(15829765-15829810)
chr2 (323-412)||(36442430-36442519)
chr2 (320-412)||(32933589-32933681)
chr2 (325-392)||(34484238-34484305)
chr2 (325-411)||(16350080-16350166)
chr2 (366-412)||(36211637-36211683)
chr2 (325-411)||(41660033-41660119)
chr2 (347-412)||(11943784-11943849)
chr2 (325-401)||(1580148-1580224)
chr2 (366-410)||(36211668-36211712)
chr2 (321-408)||(23991265-23991352)
chr2 (320-412)||(27883753-27883849)
chr2 (345-408)||(40694475-40694538)
chr2 (320-387)||(44610860-44610926)
chr2 (330-412)||(39149852-39149934)
chr2 (346-411)||(1580030-1580094)
chr2 (379-412)||(44612548-44612581)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (320-412)||(4614-4706)
scaffold0809 (325-412)||(4341-4428)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (325-412)||(13837-13924)
scaffold0188 (321-412)||(13541-13631)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (322-412)||(11783-11873)
scaffold0168 (320-412)||(11486-11578)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (322-412)||(40648-40738)
scaffold0051 (319-408)||(40349-40438)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (337-412)||(11228-11303)
scaffold0236 (321-412)||(11510-11601)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (333-412)||(65750-65829)
scaffold0045 (333-412)||(73082-73161)
scaffold0045 (324-412)||(66035-66123)
scaffold0045 (324-412)||(73367-73455)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (322-411)||(93188-93277)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (322-412)||(45132-45222)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (321-406)||(11638-11723)
scaffold0444 (366-412)||(11712-11758)
[»] scaffold1436 (1 HSPs)
scaffold1436 (320-412)||(1474-1566)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (320-412)||(177361-177453)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (327-408)||(10920-11001)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (322-412)||(90805-90895)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 115)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 44221871 - 44222282
Alignment:
Q  1 tcataatgtttataaaataaaacaagaaatattactcagaatatgattgtctattactccatccatccttaacttggcaatctgcatatatacctttcag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44221871 tcataatgtttataaaataaaacaagaaatattactcagaatatgattgtctattactccatccatccttaacttggcaatctgtatatatacctttcag 44221970  T
Q  101 gttgattgggggcattacatgatctgattggtcccccacaatcacttgaacaactataactagaaagcaaatagacataaccatagctttttcactactc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44221971 gttgattgggggcattacatgatctgattggtcccccacaatcacttgaacaactataactagaaagcaaatagacataaccatagctttttcactactc 44222070  T
Q  201 aattatttatgtcactgggttggcttcaattatgctctcacaatcattgattatgtgaatgcggaaaaagggacttcacattgaaactttcatgtttcac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44222071 aattatttatgtcacagggttggcttcaattatgctctcacaatcattgattatgtgaatgcggaaaaagggacttcacattgaaactttcatgtttcac 44222170  T
Q  301 tatatattataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  44222171 tatatattataataatttgtaggttaaattgcatttttggtcctttaattatttatgtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttga 44222270  T
Q  401 tcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||    
T  44222271 tcccttaacttc 44222282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32564337 - 32564245
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32564337 taggctaaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 32564245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 51692254 - 51692166
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51692254 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 51692166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34279628 - 34279537
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279628 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 34279537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22584738 - 22584648
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584738 ggctaaattatatttttggtcccttaactaattaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 22584648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 16267716 - 16267805
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16267716 gctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 16267805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 412
Target Start/End: Original strand, 33753218 - 33753315
Alignment:
Q  315 atttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33753218 atttttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 33753315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 408
Target Start/End: Original strand, 5117995 - 5118079
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117995 ctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 5118079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 9881550 - 9881642
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9881550 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 9881642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23281398 - 23281306
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23281398 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccataacttc 23281306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Original strand, 28112719 - 28112807
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28112719 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaa 28112807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10923750 - 10923659
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10923750 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtggtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 10923659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18794081 - 18793987
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgta--atattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794081 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 18793987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 19885985 - 19886072
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19885985 taaattgcatttttggtcccttaactatttttgtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 19886072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33753602 - 33753512
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33753602 aggctaaattgtatttt-ggtcccataactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 33753512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36657888 - 36657797
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36657888 aggcaaaattgtatttttggtcccttaactatttatgcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 36657797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 42607525 - 42607612
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42607525 taaattgcatttttggtcccttaactatttagataatatcgttttggtcccttaatttaaattcgatttattttggtcccttaacttc 42607612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 14775744 - 14775834
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14775744 aggctaaattgtatttttgttcccttaattatttaggtagtattgttttgcttctttaattaaaattcgatttattttgctcccttaactt 14775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45305797 - 45305707
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45305797 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 45305707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 412
Target Start/End: Original strand, 13944508 - 13944601
Alignment:
Q  319 gtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13944508 gtaggttaaattgcatttttggtcctttaactatttagctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtcccttaacttc 13944601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6182004 - 6181912
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6182004 taggctaaattgtatttttggtctcataactatttatgtagtatcgctttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 6181912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11395044 - 11394956
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11395044 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagttttgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 11394956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 25088014 - 25088106
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25088014 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 25088106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34029109 - 34029017
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34029109 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 34029017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50574897 - 50574813
Alignment:
Q  328 attgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50574897 attgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 50574813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13944911 - 13944808
Alignment:
Q  308 tataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13944911 tataatactttattggctaaattgtatttttggtcccttaatcatttaggtagtatcgttttgatcccttaattagaattcgatttattttggtccctta 13944812  T
Q  408 actt 411  Q
    ||||    
T  13944811 actt 13944808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 14118528 - 14118619
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14118528 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggttccttaattaaaattcgatttattttggtactttaactt 14118619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 28970418 - 28970509
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28970418 aggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccatgaacttc 28970509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 29256835 - 29256922
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29256835 taaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 29256922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 36884725 - 36884812
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36884725 taaattgtatttttgttcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 36884812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 37198931 - 37199022
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37198931 aggctaaattgtatttttggtttcttaactatttaggcaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 37199022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 46949755 - 46949846
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949755 aggctaaattgcatttttaattcattaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 46949846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50921478 - 50921387
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50921478 aggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 50921387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11788127 - 11788037
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11788127 aggctaaattgcatttttggtcttttaattatttaagcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 11788037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 51691874 - 51691964
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51691874 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatctattttggtccattaacttc 51691964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 412
Target Start/End: Original strand, 34028718 - 34028811
Alignment:
Q  319 gtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34028718 gtaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 34028811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16268077 - 16267986
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16268077 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttc 16267986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 18793693 - 18793781
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793693 ctaaatttcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 18793781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 35986234 - 35986322
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35986234 ctaaattgcatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 35986322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10654404 - 10654325
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10654404 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 10654325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 49291366 - 49291283
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49291366 taaattgcatttttcgtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 49291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Original strand, 50118350 - 50118433
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50118350 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattacaattcgatttattttggtctcttaa 50118433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 52412609 - 52412688
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52412609 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 52412688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1832047 - 1831961
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1832047 taaattgtatttttggtcccttaactatatatgtagtatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaactt 1831961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14776121 - 14776035
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14776121 ggctaaattgcatttttggtcacttaactatttaggtagtatcgttttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaa 14776035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Original strand, 11797147 - 11797232
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11797147 gctaaattgcatttttggtcctttaattatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaa 11797232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Original strand, 4045097 - 4045185
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4045097 taggttaaattgtatttttagccccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaa 4045185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 10654028 - 10654119
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10654028 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtac-gctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 10654119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 11787742 - 11787830
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11787742 ctaaattgaatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgaattattttggtcccttaacttc 11787830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25088403 - 25088312
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25088403 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgg-tccttaactaaaattcgatttagttcggtcccttaacttc 25088312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 30293011 - 30293103
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30293011 taggttaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtctctttattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 30293103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Original strand, 36077269 - 36077357
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36077269 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaa 36077357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37199309 - 37199217
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37199309 taggttaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattctggtcccttaacttc 37199217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 6181619 - 6181706
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6181619 taaattgcatttttgatcccttaattatttagttagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 6181706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19886297 - 19886214
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19886297 taaattgtatttttggtcctttaattatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaa 19886214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 32563958 - 32564049
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |   |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32563958 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggctgtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 32564049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 406
Target Start/End: Original strand, 50921061 - 50921144
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 406  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50921061 gctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatccgatttattttggtccctt 50921144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 52412985 - 52412894
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||  |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52412985 aggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 52412894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24590611 - 24590521
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24590611 ggctaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttc 24590521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 34279240 - 34279330
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34279240 ggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttc 34279330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 45305412 - 45305498
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45305412 taaattgcatttttggtcagttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaagattcgatttattttggtcctttaactt 45305498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 412
Target Start/End: Original strand, 5463130 - 5463207
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5463130 ttttggttctttaattatttagataatatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 5463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 1831662 - 1831754
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| |||   ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831662 taggctaaattgaattttcggtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcttttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 1831754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 30611218 - 30611310
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||   |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30611218 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagatattatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 30611310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4550988 - 4550897
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  4550988 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 4550897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5463505 - 5463414
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5463505 aggctaaaatgcatttttagtcccttaactatttagctagtatcgctttggtccgttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 5463414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30293395 - 30293309
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30293395 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggt-ccttaacttc 30293309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 407
Target Start/End: Original strand, 30792438 - 30792525
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| | | | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30792438 taggctaaattgcatttttggtcccctaactatttaggtactgtcgctttgatcccttaaataaaattcgatttattttggtccctta 30792525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46739110 - 46739020
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46739110 aggctaaattgtatttttg-tcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttactttggtcgcttaacttc 46739020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4045486 - 4045396
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4045486 aggctaaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtctcttaattaaaattcgatttattttagtcctttaactt 4045396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Original strand, 5118095 - 5118141
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5118095 ttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 5118141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 10923365 - 10923451
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10923365 taaattatatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaactt 10923451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 22584351 - 22584441
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||| ||| |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584351 ggctatattgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcacattggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 22584441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 27209168 - 27209258
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  27209168 aggctaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 27209258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 51810136 - 51810226
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||||||||||| ||| |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51810136 aggcaaaattgcatttttagtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 51810226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30611606 - 30611521
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgattta-ttttggtccctta 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30611606 gctaaattgtatttttgatcccttaactatttaggttgtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttatttttggtccctta 30611521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 412
Target Start/End: Original strand, 50574527 - 50574604
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50574527 tttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 50574604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 51810515 - 51810438
Alignment:
Q  331 gtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51810515 gtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgttcctgaattaaaaattgatttattttggtcccttaa 51810438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 9119290 - 9119382
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9119290 taggttaaattatattttttatcccttaactacttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 9119382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19986510 - 19986418
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19986510 taggataaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtctcttaaataaaatttgatttattttggtcctttaacttc 19986418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21385324 - 21385232
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21385324 taggctaaattgcacttttaatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgatcccttaacttc 21385232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 409
Target Start/End: Original strand, 11797219 - 11797262
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11797219 ttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 11797262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 24655589 - 24655676
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||| ||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24655589 taaattgcatatttggtcccttaagtatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgattcattttggtctcttaacttc 24655676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 412
Target Start/End: Original strand, 32517624 - 32517695
Alignment:
Q  341 tcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32517624 tcctctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttc 32517695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34622018 - 34621931
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||  || ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  34622018 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 34621931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 412
Target Start/End: Original strand, 49291012 - 49291083
Alignment:
Q  341 tcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  49291012 tcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgttccttaacttc 49291083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 401
Target Start/End: Original strand, 3569377 - 3569455
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3569377 gctaaattatgtttttggtcccttaattatttaattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatatattttggt 3569455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 408
Target Start/End: Original strand, 5118066 - 5118108
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5118066 ttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 5118108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13831356 - 13831318
Alignment:
Q  374 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831356 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 13831318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20260767 - 20260677
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  20260767 taggctaaattgcatttttagtcccttaattatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaact 20260677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 21384935 - 21385017
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtc 402  Q
    |||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||| ||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21384935 taggctaaattacatctctggttctttaactatttatgtagtatcgcttttatcccttaattaaaattcgatttattttggtc 21385017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27209536 - 27209446
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  27209536 aggctaaattgcatttttggtcccttgacaatttaattagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 27209446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 412
Target Start/End: Original strand, 28112802 - 28112840
Alignment:
Q  374 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112802 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 28112840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 402
Target Start/End: Original strand, 24590249 - 24590306
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtc 402  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590249 ttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtc 24590306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42607887 - 42607802
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  || ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  42607887 gctaaattgtatttttgatcccttaattatttagatagtatcgttttggtctcttaattaaaatttgatttatttcggtcctttaa 42607802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 21035987 - 21036075
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||||||  || |||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21035987 ctaaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcactttggtccattaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 21036075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24655974 - 24655882
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||| ||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  24655974 taggctaaattgcatttttagtctcttaactatttaagtagtatcgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttgagccattaacttc 24655882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40703252 - 40703173
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttgg 400  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40703252 aggcaaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttagttaaaatttgatttattttgg 40703173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 11394715 - 11394769
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttg 399  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11394715 ttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttcttttg 11394769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 403
Target Start/End: Original strand, 19269359 - 19269441
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcc 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||   ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19269359 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatccagtatcactttggtctcttagttaaaattcggtttattttggtcc 19269441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19886227 - 19886181
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19886227 ttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 19886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21036368 - 21036279
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||||| |||  ||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21036368 aggctaaattgcattttttatc-tttaactatttaggtaccatcactttggttctttaattaaaatttgatttattttggtctcttaactt 21036279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29257204 - 29257119
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  || ||||  ||| || || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29257204 aattgcatttttggtctcttaactatttagctagtattaattttgtcccctaattaaaattcaatttattttggtccattaacttc 29257119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48702268 - 48702187
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||   || ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  48702268 taggctaaattgcatttttagtcccttaattattttgttagtatcgttttggtcctttaattaaaattggatttattttggt 48702187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36885037 - 36885001
Alignment:
Q  375 cttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36885037 cttaattaaaattcgatttattttggttccttaactt 36885001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46950068 - 46950032
Alignment:
Q  376 ttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46950068 ttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 46950032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 411
Target Start/End: Original strand, 4054550 - 4054637
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||  || ||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4054550 ctaaattgtatttttatccccttaactatttagatagtatcgatttaattctttaattaaaattcgatttattttggtctctttactt 4054637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 401
Target Start/End: Original strand, 20260440 - 20260507
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||  |||||||||||  || |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20260440 tttttggtctcttaactatttaattagtatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 20260507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9119618 - 9119588
Alignment:
Q  382 aaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9119618 aaaattcgatttattttggtcccttaacttc 9119588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31126276 - 31126226
Alignment:
Q  361 tattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31126276 tattgctttggtacattaattaaaatttgatttattttagtcccttaactt 31126226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 398
Target Start/End: Original strand, 34621624 - 34621697
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttatttt 398  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  34621624 taaattgcatttttgatcctttaattatttaattagtatcgttttggtctcttaattaaaattttatttatttt 34621697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 4550600 - 4550676
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaa-tattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttg 399  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| || | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4550600 ctaaattatcttttgggtcctttaactatttatttaattagtattttagtcccttaattaaaatttaatttattttg 4550676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 412
Target Start/End: Original strand, 31125983 - 31126019
Alignment:
Q  376 ttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31125983 ttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttc 31126019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32517894 - 32517809
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||   |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  32517894 taaattgcatttttgatcccttatctatttaggtagtatcactttggtt--ttaattaaaatttgatttattttgatccctcaacttc 32517809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 410
Target Start/End: Original strand, 36657552 - 36657588
Alignment:
Q  374 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36657552 ccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaact 36657588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 412
Target Start/End: Original strand, 52914948 - 52915042
Alignment:
Q  318 tgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52914948 tgtaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 52915042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8247129 - 8247042
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8247129 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatttctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 8247042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25593477 - 25593387
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25593477 ggctaaattgtattttttgtcccttaactatttagggagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 25593387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 21217846 - 21217937
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21217846 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 21217937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 46200483 - 46200574
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46200483 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 46200574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44710785 - 44710699
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44710785 aaattgcatttttgatcccttaagtatttatgtagtatcgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 44710699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Original strand, 46620931 - 46621017
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46620931 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 46621017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45683503 - 45683414
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45683503 ggctaaattgtatttttggttccttaactatttaggtaatattgctttggttccttaactaaaatttgatttattttggtcctttaactt 45683414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29864559 - 29864471
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29864559 ctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 29864471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9010892 - 9010801
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9010892 aggctaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 9010801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21218233 - 21218143
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21218233 ggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 21218143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 8751289 - 8751377
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8751289 ctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtataattttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 8751377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43969915 - 43969823
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43969915 taggctaaattttatttttggttcgttaactatttatgtagtatcgttttgatcccttgattaaaattcgatttactttggtcccttaacttc 43969823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Original strand, 1157206 - 1157289
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1157206 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatatcgctttggttccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaa 1157289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24504315 - 24504236
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504315 atttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 24504236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 25218095 - 25218174
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25218095 atttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 25218174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37515836 - 37515749
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37515836 taaattttatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 37515749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 40067347 - 40067438
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40067347 aggctaaattgtattttttgtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 40067438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1157589 - 1157503
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1157589 taaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 1157503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 24503939 - 24504029
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24503939 ggctaaattgcatttttaatcccttaattatttaggtagtattgttttggttctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 24504029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 29864175 - 29864265
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29864175 aggctaaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 29864265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33626250 - 33626160
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33626250 ggctaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 33626160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 412
Target Start/End: Original strand, 9010498 - 9010595
Alignment:
Q  315 atttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9010498 atttataggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 9010595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18862827 - 18862738
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862827 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 18862738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 33625868 - 33625953
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33625868 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaactt 33625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33882331 - 33882246
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33882331 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaactt 33882246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 407
Target Start/End: Original strand, 46535523 - 46535608
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46535523 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttcctta 46535608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54191969 - 54191880
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54191969 gctaaattgtatttttggtcccttaactatttagatagcatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttc 54191880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 38866396 - 38866488
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38866396 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaactaaaatttgatttattttggttccttaacttc 38866488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 2738883 - 2738970
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738883 taaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 2738970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12381441 - 12381350
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12381441 aggcttaattgtatttttggtccctaaactatttaggcaatatcgctttcatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 12381350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 43316878 - 43316968
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43316878 taggctaaattgtatttttggtcctt-aactattaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattttatttattttggtcccttaactt 43316968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 45911582 - 45911669
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45911582 taaattgcatttttggttcattaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 45911669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 45911961 - 45911870
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45911961 aggctaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttatcttc 45911870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 54136090 - 54136177
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  54136090 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaa 54136177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 1205381 - 1205467
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1205381 taaattgcacttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaactt 1205467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 8246769 - 8246858
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8246769 ggctaaattgtatttttggtcctt-aattatttagataatatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 8246858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 10014465 - 10014554
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10014465 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaa-tcgatttattttgatccattaacttc 10014554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 10021606 - 10021695
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10021606 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaa-tcgatttattttgatccattaacttc 10021695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 27347597 - 27347687
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||  || ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347597 ggctaaattatatttttggtcccttgactatttagatagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 27347687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40067734 - 40067644
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40067734 ggctaaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttc 40067644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 399
Target Start/End: Original strand, 9657667 - 9657744
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttg 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9657667 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttg 9657744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27347990 - 27347893
Alignment:
Q  315 atttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| ||||| |||||  || | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347990 atttataggcttaattgcattttatgttccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 27347893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 399
Target Start/End: Original strand, 34958832 - 34958909
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttg 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34958832 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttg 34958909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46535907 - 46535818
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  46535907 gctaaattgtatttttggtcacttaactatttaggtagtattgttttggtcctctaattaaaattctatttatcttggtcctttaacttc 46535818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 412
Target Start/End: Original strand, 4965885 - 4965961
Alignment:
Q  336 tttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4965885 tttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttgctcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 4965961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34959214 - 34959138
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34959214 taaattgcaattttggtcccttaactatttaggtattatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 34959138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11102363 - 11102272
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  11102363 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtatcttaactt 11102272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Original strand, 32384653 - 32384732
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32384653 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt 32384732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 46621310 - 46621227
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46621310 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcctttaa 46621227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54136474 - 54136383
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54136474 aggctaaattgcaatttttgtcctttaactatttaggtagaattgttttgatcctttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttc 54136383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46200871 - 46200781
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  46200871 ggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttc 46200781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11242849 - 11242764
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11242849 gctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcccttaa 11242764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10014851 - 10014759
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10014851 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttc 10014759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10021992 - 10021900
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10021992 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttc 10021900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 25058831 - 25058923
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25058831 taggttaaattgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttc 25058923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43317267 - 43317175
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||   |||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43317267 taggctaaattgcatttttagtctcctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 43317175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 52915338 - 52915239
Alignment:
Q  315 atttgtaggctaaattgtatttttg--gtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52915338 atttataggctaaattgcattttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 52915239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4793981 - 4793895
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||  || |||  |||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793981 taaattgtatttttgaccccttat-tatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 4793895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25218447 - 25218380
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25218447 ttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 25218380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44433011 - 44432920
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||   |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44433011 aggcaaaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcactttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 44432920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 48209947 - 48210038
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  48209947 aggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttc 48210038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1205763 - 1205673
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1205763 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgcttttctcccttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaccttc 1205673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 44169978 - 44170068
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  44169978 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttgattaaaatttgatttattttagtatcttaactt 44170068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 44710403 - 44710493
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||  |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44710403 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaacaaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 44710493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 406
Target Start/End: Original strand, 44428512 - 44428597
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 406  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44428512 aggctaaattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt 44428597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4966256 - 4966164
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| |||| | | || ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4966256 tagggtaaattgcatttcttgccccttaactatttaggtggtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtctcttaacttc 4966164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 25977771 - 25977859
Alignment:
Q  325 taaattgtattttt-ggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| | ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25977771 taaattgtattttttggtcccttaactatctaggtactatcgctttggtctctcaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 25977859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9658034 - 9657944
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  || ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  9658034 aggctaaattatatttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccctaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt 9657944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 15985469 - 15985555
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15985469 taaattgcatttttggtctcttaactattttgctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 15985555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21051689 - 21051643
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21051689 ttttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaacttc 21051643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 22830795 - 22830885
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22830795 aggctgaattggatttttggtcccttaactattttgctagtatagctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 22830885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22831181 - 22831095
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22831181 taaattggatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 22831095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 53645463 - 53645541
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53645463 ttttttgtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttc 53645541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 412
Target Start/End: Original strand, 54191640 - 54191678
Alignment:
Q  374 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54191640 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 54191678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28570806 - 28570717
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||  |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28570806 gctaaattgcatttttgatcacttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 28570717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 402
Target Start/End: Original strand, 29970196 - 29970273
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtc 402  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29970196 taaattgcatttttggtcccataactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtc 29970273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44170365 - 44170288
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44170365 ctaaattgcatttttgatcccttaactatttaattagtattgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggt 44170288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32385199 - 32385108
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||  | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32385199 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttta-tcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttc 32385108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 43969556 - 43969611
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaa 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  43969556 ctaaattgtatttttggtcccttaattatttatgtagtattgctttggtcccttaa 43969611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Original strand, 44428615 - 44428661
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44428615 ttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 44428661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 45683117 - 45683207
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45683117 ggctaaattacatttttgatctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 45683207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38866783 - 38866710
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttatttt 398  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38866783 taaattgtatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtactctaattaaaattcgatttatttt 38866710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 354
Target Start/End: Original strand, 44957383 - 44957421
Alignment:
Q  316 tttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactattt 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44957383 tttgtaggctaaattatatttttggtcctctaactattt 44957421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21885157 - 21885124
Alignment:
Q  375 cttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21885157 cttaattaaaatttgatttattttggtcccttaa 21885124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 410
Target Start/End: Original strand, 44428586 - 44428630
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44428586 ttttggtcccttgactaaaatttgatttattttggtcccttaact 44428630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 43899111 - 43899201
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43899111 ggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtaacatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 43899201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54081671 - 54081580
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54081671 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 54081580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 45171066 - 45171158
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171066 taggctaaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtattgctttggccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 45171158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38911606 - 38911515
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38911606 taggctaaattgtattttttgtcctttaattatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggttcattaactt 38911515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 7950274 - 7950364
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7950274 aggctaaattgcatttttagtcccttaactatttatgtagtattgttttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcctttaactt 7950364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 12123088 - 12123180
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12123088 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 12123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 34521264 - 34521356
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34521264 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 34521356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43899462 - 43899370
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43899462 taggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 43899370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 21169669 - 21169756
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21169669 taaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 21169756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26332710 - 26332620
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26332710 taggctaaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 26332620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 34629985 - 34630072
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34629985 taaattatatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 34630072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 45871696 - 45871783
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45871696 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 45871783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 52606128 - 52606218
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52606128 aggctaaattgcatttt-ggtcccttaactatttatgtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 52606218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 8846076 - 8846166
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8846076 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaactaaaattcgattaattttggtcccttaacttc 8846166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 44069123 - 44069213
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44069123 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttc 44069213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 54107669 - 54107759
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54107669 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 54107759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 22354946 - 22355031
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22354946 aaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaactt 22355031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 41208390 - 41208491
Alignment:
Q  311 aataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41208390 aatagtttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaact 41208489  T
Q  411 tc 412  Q
    ||    
T  41208490 tc 41208491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 10756720 - 10756808
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756720 ctaaattgtatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 10756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 17102383 - 17102474
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17102383 aggctaaattgcatttttggtttcttaattatttaggtaatattgttttcttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 17102474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 19124188 - 19124279
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  19124188 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatattgctttggtcccctaattaaaattcgatctattttgatctcttaacttc 19124279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 40410715 - 40410802
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40410715 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 40410802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 41997818 - 41997909
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41997818 aggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttc 41997909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44069510 - 44069419
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44069510 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 44069419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7275024 - 7274938
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7275024 aaattgcatttttggtccgttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 7274938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 28691113 - 28691203
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28691113 aggctaaattgtatttttggtcccttaattatttaggtggtattgctttgttcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaactt 28691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 52609748 - 52609662
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52609748 ggctaaattccatttttggtcccttaactatttaggtactatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 52609662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 54108507 - 54108417
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108507 aggctaaattgcatttttggtcccttaattatttagctagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 54108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 408
Target Start/End: Original strand, 35753408 - 35753489
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35753408 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtttcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 35753489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4846984 - 4846892
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4846984 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctcataacttc 4846892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12123467 - 12123375
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12123467 taggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 12123375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2829795 - 2829705
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2829795 taggctaaattgcatttttgatcctt-aactatttatgtattattgatttggtcttttaattaaaatttgatttattttggtcccttaactt 2829705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10757091 - 10757008
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10757091 taaattgtattttttgtcctttaactatttaggcagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaa 10757008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 26332318 - 26332409
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26332318 aggctaaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaatttcaatttattttggtcccttaacttc 26332409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28688377 - 28688286
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28688377 aggctaaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 28688286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31514250 - 31514159
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31514250 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactt 31514159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34521640 - 34521557
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34521640 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaa 34521557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35580332 - 35580245
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35580332 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 35580245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45872064 - 45871989
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45872064 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaa 45871989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 54081287 - 54081373
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54081287 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgctttggt-ccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 54081373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7937949 - 7937859
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7937949 ggctaaatttcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgaattattttggtctcttaacttc 7937859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 31513863 - 31513953
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31513863 ggctaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttgattctttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 31513953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 411
Target Start/End: Original strand, 50819211 - 50819309
Alignment:
Q  313 taatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  || | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50819211 taatttttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 50819309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 50856653 - 50856555
Alignment:
Q  313 taatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  || | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50856653 taatttttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 50856555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41208788 - 41208699
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41208788 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaac 41208699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45171452 - 45171367
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171452 gctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 45171367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Original strand, 2829410 - 2829486
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2829410 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaattaacatttgatttattttggt 2829486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19124556 - 19124469
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  19124556 gctaaattatatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttgactt 19124469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14353430 - 14353343
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14353430 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaaataaaattcgatttatcttggtcctttaacttc 14353343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 17273788 - 17273867
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17273788 atttttggtcccttaactatttaggccgtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 17273867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17274159 - 17274076
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17274159 taaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaattcgaattattttggtctcttaa 17274076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 33812735 - 33812814
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  33812735 atttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttctttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttc 33812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 46766620 - 46766711
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  46766620 taggttaaattgcatttttggtccttttactattttgctaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 46766711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2078855 - 2078769
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2078855 taaattgtatttttagtcccttaactatttaattaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 2078769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9028577 - 9028487
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |  || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9028577 ggctaaattgcatttttggttcattaactattaagctagtattgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtcctttaacttc 9028487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 15862182 - 15862272
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862182 ggctaaattccattttaggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 15862272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37133603 - 37133513
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  37133603 taggctaaattatatttttggtcctttaattatttaattagtattgttttggtcccttacttaaaatatgatttattttggtatcttaact 37133513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50819603 - 50819513
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50819603 ggctaaattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttacttc 50819513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 50856261 - 50856351
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50856261 ggctaaattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttacttc 50856351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 52268490 - 52268409
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtc 402  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52268490 aggctaaattgcatttttggtccattaactatttagttagtatcgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtc 52268409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53841407 - 53841326
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53841407 aattgcatttttggtcccttaactatttagctagtattgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 53841326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15862563 - 15862471
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||   ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15862563 taggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatctcttttgtccctttattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 15862471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40639505 - 40639413
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  40639505 taggctaaattatgtttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtatcttaacttc 40639413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 40926009 - 40926101
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  40926009 taggttaaattgcatttttggtcttttaactatttatgtagtatcgctttgatctcttaattaaaatttgatttattttgatccattaacttc 40926101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 51170765 - 51170677
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51170765 ctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcatttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 51170677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 14353044 - 14353135
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14353044 taggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaactt 14353135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 46767002 - 46766911
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  46767002 taggctaaattgtatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgtatcttaactt 46766911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8846462 - 8846372
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  8846462 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttc 8846372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13867050 - 13866964
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13867050 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 13866964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 27940272 - 27940362
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27940272 ggctaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaatttaaatttgatttattttggtccctaaacttc 27940362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Original strand, 35753476 - 35753522
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35753476 ttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 35753522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 40639120 - 40639206
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  40639120 taaattgcatttttagttctttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 40639206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 40969255 - 40969344
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  40969255 ggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 40969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51885752 - 51885671
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  51885752 taggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggt 51885671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Original strand, 7742781 - 7742865
Alignment:
Q  328 attgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  7742781 attgcatttttagtcccttaactatttaggtaacattattttggttacttaattaaaatttgatttattttgttctcttatcttc 7742865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35753819 - 35753727
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35753819 taggttaaattacatttttggtaccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaatttaaattcgatttattttgatcccttaacttc 35753727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 49529204 - 49529120
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49529204 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 49529120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 412
Target Start/End: Original strand, 37133264 - 37133367
Alignment:
Q  309 ataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||  ||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37133264 ataataatttaaaggttaaattatgtttttggtcccttagctatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaa 37133363  T
Q  409 cttc 412  Q
    ||||    
T  37133364 cttc 37133367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41998202 - 41998135
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaatt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||    
T  41998202 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatt 41998135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 397
Target Start/End: Original strand, 49222040 - 49222111
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattt 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  49222040 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgcttcggtcttttaattaaaattcgatttattt 49222111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7743139 - 7743062
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  7743139 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtctcataactt 7743062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51311906 - 51311825
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51311906 taggctaaattacatttttggtctgttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 51311825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5348955 - 5348875
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  5348955 aggctaaattatgttttttgtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggt 5348875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40969643 - 40969551
Alignment:
Q  319 gtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  40969643 gtaggttaaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttagtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 40969551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47891901 - 47891821
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttgg 400  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  47891901 taggttaaattccatttttgttcctttaactatttaattagtattgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgg 47891821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 5348577 - 5348668
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5348577 taggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtccctcaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 5348668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 412
Target Start/End: Original strand, 27254007 - 27254074
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| | | ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27254007 ttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttc 27254074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29248691 - 29248604
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||  || ||||  ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29248691 taaattgtatttatgctcccttaactatttagatagtattactttagtcctttaattaaaatttgatctattttggtcccttaacttc 29248604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 54247271 - 54247361
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  || ||| | |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54247271 aggctaaattgcattttta-tcccttaactatttaaatagtatcgctttggtccattgattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 54247361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 398
Target Start/End: Original strand, 7937645 - 7937719
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttatttt 398  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7937645 ctaaattgcatttttggttgcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgattcatttt 7937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Original strand, 9028189 - 9028279
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  9028189 taggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtccctaagttaaaatttgatttattttgttctcttaact 9028279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 412
Target Start/End: Original strand, 28688042 - 28688080
Alignment:
Q  374 ccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28688042 ccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 28688080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 47891513 - 47891603
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||| |||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  47891513 ggctaaattatgtatttggtcccttaacaatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 47891603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 411
Target Start/End: Original strand, 51883850 - 51883948
Alignment:
Q  313 taatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  51883850 taattttttggctaaattgcatttttaatcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt 51883948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22444527 - 22444482
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22444527 tttggtcccttaattaaaattcgatttatttcggttccttaacttc 22444482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 29248320 - 29248409
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| || |||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  29248320 gctaaagtgcatttttagttatttaactatttaggtggtatcgttttagtcccttaattaaaatttaatttattttggttccttaacttc 29248409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 53310055 - 53310018
Alignment:
Q  375 cttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53310055 cttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 53310018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Original strand, 22444252 - 22444296
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22444252 tttggtccattaattaaaattcgatttattttgctcccttaactt 22444296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28691501 - 28691409
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||| | ||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  28691501 taggttaaattgtattttttgtcccttaattatttaggtagtatcgcttttgtccctaaattaaaatttgatttattttgatcatttaacttc 28691409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40926394 - 40926307
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||   |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40926394 ctaaattgcatttttagtcccctaactatttaggtagtatcactttggtccattaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttc 40926307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 411
Target Start/End: Original strand, 53841080 - 53841116
Alignment:
Q  375 cttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53841080 cttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactt 53841116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 588537 - 588458
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  588537 ggctaaattgcatttttgatatcttaactatttaattaatatcgcttcggttccttaattaaaatttgatttgttttggt 588458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33812929 - 33812842
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||| |||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  33812929 ggctaaatttcatttttggtctcttaaatatttaggtagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaac 33812842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 44316626 - 44316712
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||| || || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44316626 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgattta-tttggtcccttaa 44316712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 387
Target Start/End: Original strand, 7274652 - 7274718
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaatt 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | ||||||  |||||||||||||    
T  7274652 aggctaaattgcatttttggtcccttaaatatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatt 7274718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17102735 - 17102673
Alignment:
Q  350 tatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17102735 tatttaggtagtatcgctttggtccattaaataaaattcgatttattttggtcctttaacttc 17102673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53678796 - 53678730
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  53678796 ttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 53678730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33773175 - 33773098
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |||   |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33773175 ctaaattgtgtttttggtcccttaactatttaattagtatcactttgatcccttgattaaaatttgatttattttggt 33773098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43844484 - 43844399
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  43844484 gctaaattatttttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaa 43844399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 50394398 - 50394321
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  | ||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  50394398 tttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtcccttaactaaattttgatttattttgatcccttaactt 50394321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 408
Target Start/End: Original strand, 52705472 - 52705545
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||| ||| |||||||||||  || ||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52705472 ttttgatcccttaactatttaattagtattggtttgatcccttaactaaaatttgatttattttgatcccttaa 52705545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 30872781 - 30872873
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30872781 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 30872873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29027356 - 29027264
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29027356 taggctaaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 29027264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 37393475 - 37393567
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37393475 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 37393567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1826174 - 1826087
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1826174 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 1826087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1860619 - 1860532
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860619 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 1860532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3869336 - 3869245
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3869336 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttttttttgtcccttaacttc 3869245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16645931 - 16645844
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16645931 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 16645844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 8653935 - 8654025
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8653935 aggctaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactt 8654025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24457040 - 24456948
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24457040 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgccttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 24456948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35224155 - 35224063
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224155 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 35224063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8654319 - 8654232
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8654319 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttgctcccttaacttc 8654232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 40040162 - 40040252
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40040162 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtaccttaattaaaattcgatttattttgttcccttaacttc 40040252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37393861 - 37393773
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37393861 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 37393773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 14920410 - 14920501
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14920410 aggcttaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtattgttttggtcatttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 14920501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 44678316 - 44678407
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44678316 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtttcttaacttc 44678407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21515586 - 21515496
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21515586 ggctaaattacatttttagtcttttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 21515496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 403
Target Start/End: Original strand, 24456733 - 24456815
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcc 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24456733 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 24456815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31230999 - 31230909
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31230999 ggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaacttc 31230909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44255249 - 44255159
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44255249 aggctaaaatgtatttttgatcctttaactatttaggtgggattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaactt 44255159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14920792 - 14920707
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14920792 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 14920707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 412
Target Start/End: Original strand, 18017778 - 18017880
Alignment:
Q  308 tataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18017778 tataataattt--aggctaaattgcatatttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcacttaattaaaattcaatttattttggtccttta 18017875  T
Q  408 acttc 412  Q
    |||||    
T  18017876 acttc 18017880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 411
Target Start/End: Original strand, 36343958 - 36344050
Alignment:
Q  318 tgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36343958 tgtaggctaaattgtatttttggttctt-aattatttaggtagtattattttggtcccttaattaaaattcgattaattttggtcctttaactt 36344050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 39240031 - 39240120
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39240031 gctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttc 39240120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 35223772 - 35223864
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223772 taggctaaattgcatttttggtccctttactatttaggtagtatcgctttggtcccttgactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 35223864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9495406 - 9495319
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9495406 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtccgttaattaaagtttgatttattttggtcccttaacttc 9495319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18018169 - 18018082
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18018169 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtattgctttgctcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 18018082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 23244518 - 23244605
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23244518 taaattgcatttttggtccactaaccatttatgtagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 23244605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12873434 - 12873344
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  12873434 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaact 12873344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 119119 - 119206
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119119 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggt-ccttaacttc 119206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 5416810 - 5416902
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  5416810 taggctaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcctctaattaaaattcgattgattttggtcttttaacttc 5416902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11198593 - 11198501
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11198593 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 11198501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 11639050 - 11639142
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||   | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11639050 taggctaaattgtattttttgtcccttaactatttaggtagcgtcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaacttc 11639142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30568660 - 30568576
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30568660 ctaaattgtatttttggtcccttaactatttagttagtatcgatttggtcccttatttaaaatttgatttattttggtcccttaa 30568576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 30650188 - 30650280
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30650188 taggctaaattgcatttttagtcctctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttc 30650280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Original strand, 33542383 - 33542463
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  33542383 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatctgatttattttggt 33542463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40094863 - 40094771
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094863 taggcaaaattacatttttggtcccttaactatttaattagtactgttttggtcctttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaacttc 40094771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 44254867 - 44254955
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44254867 ctaaattgcatttttggatccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 44254955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 758732 - 758641
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  758732 taggctaaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtccttaaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 758641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 412
Target Start/End: Original strand, 7041648 - 7041719
Alignment:
Q  341 tcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041648 tcctctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 7041719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 31230624 - 31230703
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31230624 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 31230703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 39912294 - 39912215
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39912294 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 39912215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40032815 - 40032724
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttg-gtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40032815 ggctaaattgtatttttttgtcccttagctatttatgtagtatcattttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 40032724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18622133 - 18622043
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||  || ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18622133 ggctaaattgcacttttggtctcttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 18622043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 29026971 - 29027062
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaacta----tttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    |||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29026971 taaattgcatttttggtcccttaactagctatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 29027062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 3868946 - 3869034
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3868946 ctaaattgcacttttgatcccttaactatttatgtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtctcttaacttc 3869034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5417197 - 5417109
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5417197 ctaaactgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttc 5417109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23244895 - 23244811
Alignment:
Q  328 attgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23244895 attgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttagttaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 23244811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30873166 - 30873074
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30873166 taggctaaattgcattttttgtcccttaattattttggtagtattagtttgattccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 30873074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 39240402 - 39240315
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  39240402 taaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgttttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtctcttaacttc 39240315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 40032426 - 40032517
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaa-ttaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| ||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032426 ggctaaattgcatttttggtcacttaattatttaggtagtatcgctttggtctcttaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 40032517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 119502 - 119412
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  119502 ggctaaattgcattgttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgctttattttggtcccttaacttc 119412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18914637 - 18914547
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||  || | | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914637 ggctaaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagcatcgctcttgtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 18914547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 412
Target Start/End: Original strand, 21512405 - 21512502
Alignment:
Q  314 aatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| | ||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21512405 aatttctaggctaaattgtatttttcgtcccttaactattta-ggagtatcgctttagtccattaattaaaatttgatttattttggccccttaacttc 21512502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 40094487 - 40094565
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40094487 ttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggttccttaacttc 40094565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7042012 - 7041925
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7042012 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatatagtatcgctttggtccctt-----aaatttgatttattttggtcccttaacttc 7041925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Original strand, 758347 - 758430
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  758347 taaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattaaatttattttgatcccttaa 758430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 1825809 - 1825899
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  || |||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1825809 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttga-ttattttagtcccttaacttc 1825899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 1860254 - 1860344
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  || |||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1860254 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttga-ttattttagtcccttaacttc 1860344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 407
Target Start/End: Original strand, 6843493 - 6843580
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6843493 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactatgatcccttaattaaaatttgatttattttggtccctta 6843580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44678596 - 44678518
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcc 403  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44678596 ctaaattgtatttttgttcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcc 44678518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Original strand, 26217072 - 26217158
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26217072 ctaaattatttttttggtcccttaactatttaagtagtatcattttggccctttaattaaaatttaatttattttggtcccttaact 26217158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36344344 - 36344258
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  36344344 taaattgcattttttatcctttaactatttaggtagtattgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttgatcctttaactt 36344258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26736509 - 26736421
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||||||  || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26736509 ctaaattacattttcgatcccttaactatttagatagtattgatttggtcctttaattaaaattcgatttattgtggtcctttaacttc 26736421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 410736 - 410669
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||| ||| ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  410736 tttttgatcccttaactattttattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatttattttggt 410669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6844823 - 6844736
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||  || | |||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6844823 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagcatcgctttgatctcttaattaaaaatcgatttatcttggtcccttaacttc 6844736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 26736128 - 26736215
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  26736128 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttttttaaaatttaatttattttggtcccttaccttc 26736215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 412
Target Start/End: Original strand, 30568331 - 30568366
Alignment:
Q  377 taattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30568331 taattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 30568366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 32733703 - 32733801
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttat------gtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||       ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32733703 taggttaaattgtatttttggtctcttaactatttagatttaggtaatattactttggttttttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 32733801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 411
Target Start/End: Original strand, 5525882 - 5525960
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  5525882 atttttagtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtccctttactt 5525960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 408
Target Start/End: Original strand, 15740625 - 15740699
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15740625 tttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 15740699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 18914304 - 18914350
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaa-ttcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914304 tttggttctttaattaaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 18914350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Original strand, 29769408 - 29769452
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29769408 tttggttccttaactaaattttgatttattttggtcccttaactt 29769452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Original strand, 28206766 - 28206845
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28206766 ggctaaattgaatttttggtcccataactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatgtattttggt 28206845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44678515 - 44678480
Alignment:
Q  377 taattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44678515 taattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 44678480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 39911917 - 39912007
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||  || |||   ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39911917 ggctaatttgcattttttgtcccttaattatttagatattatctctttggtcgcttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttc 39912007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Original strand, 35485869 - 35485950
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  |||||| | ||| || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  35485869 taggctaaattatgtttttgatcccttaactattcaattaatatcgctttagtcccttaattaaaatttgttttattttggt 35485950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9034703 - 9034611
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9034703 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 9034611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43726630 - 43726538
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43726630 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtggtattgttttagttccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 43726538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 32706730 - 32706822
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32706730 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttgacccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 32706822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 34568585 - 34568673
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34568585 ctaaattgtattttttgtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 34568673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 35085737 - 35085829
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085737 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 35085829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 11678702 - 11678793
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11678702 aggctaaattgcatttttggtcctttaaatatttagataatatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 11678793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11679088 - 11678998
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11679088 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaacttc 11678998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23472942 - 23472852
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23472942 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 23472852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 8769280 - 8769372
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8769280 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtccctgaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 8769372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10625471 - 10625380
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10625471 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 10625380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35086127 - 35086036
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35086127 aggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattgtggtcccttaacttc 35086036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 411
Target Start/End: Original strand, 44447916 - 44448002
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44447916 ctaaattgcatttttggtccgttaactatttagatagtattgttttggt-ccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaactt 44448002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 47250933 - 47250842
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47250933 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 47250842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9231074 - 9230973
Alignment:
Q  311 aataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  9231074 aataatatataggctaagttgtatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaagatttgatttattttggtcacttaact 9230975  T
Q  411 tc 412  Q
    ||    
T  9230974 tc 9230973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 18731019 - 18731108
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731019 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 18731108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 411
Target Start/End: Original strand, 31715629 - 31715722
Alignment:
Q  318 tgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31715629 tgtaggctaaattgtattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttgaccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 31715722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2357439 - 2357351
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2357439 ctaaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgggcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 2357351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 23472591 - 23472683
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  23472591 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcttttaattaaaattcgattcattttggttctttaacttc 23472683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31716008 - 31715917
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31716008 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctataacttc 31715917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44485718 - 44485628
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44485718 ggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaagtattatcgctttggtcctttaattaatattcaatttattttgatcccttaacttc 44485628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47251283 - 47251193
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47251283 aggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgctttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtcccttaactt 47251193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8769666 - 8769581
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8769666 ctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaac 8769581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 409
Target Start/End: Original strand, 23437150 - 23437239
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23437150 taggctaaattgcatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaac 23437239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 47305127 - 47305216
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  47305127 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 47305216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Original strand, 5238449 - 5238537
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5238449 taggctaaattgcatttttgatccattaactgtttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaa 5238537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48704193 - 48704105
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48704193 gctaaatgatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcctttaactt 48704105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 39118013 - 39118100
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||    
T  39118013 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcccttaattaaatttcgatttattttgattccctaacttc 39118100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 43050383 - 43050470
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43050383 aggctaatttgtctttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcccttaa 43050470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 41758691 - 41758769
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| |||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41758691 ttttttgtcccttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 41758769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44448295 - 44448209
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44448295 taaattggatttttagtcctttaattatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaactt 44448209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44486318 - 44486232
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  44486318 ggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaatatttaatttattttggtcccttaa 44486232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 22338272 - 22338361
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22338272 ggctaaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtattgctttggtaccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 22338361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37144151 - 37144070
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37144151 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 37144070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32707119 - 32707027
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32707119 taggctaaattgtatttttagtcccttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaactcgatttcttttggtccattaacttc 32707027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 411
Target Start/End: Original strand, 473182 - 473281
Alignment:
Q  312 ataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | | ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  473182 ataatttaaaggctaaattgcatttttgatcgcttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttaactt 473281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 15326870 - 15326961
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15326870 taggctaaattgcatttttagttttttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 15326961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21522599 - 21522513
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21522599 taaattgtgtttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttc 21522513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28349763 - 28349677
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  28349763 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtattgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt 28349677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 9230721 - 9230766
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9230721 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 9230766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 397
Target Start/End: Original strand, 10625104 - 10625181
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattt 397  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10625104 taggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgtgttggtcccttaactaaaattcgatttattt 10625181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26920258 - 26920213
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26920258 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 26920213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Original strand, 43140701 - 43140786
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43140701 taaattgcatttttagtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaact 43140786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 412
Target Start/End: Original strand, 47250570 - 47250647
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47250570 tttttgtcccttaattatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 47250647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 47250942 - 47250987
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47250942 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 47250987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 43726242 - 43726333
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  43726242 taggttaaattgtatttttggtcccttaattatttaagtagtctcgctttggtcccttaattaaaatttgattta-tttggttccttaacttc 43726333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 2357066 - 2357157
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  || |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2357066 aggctaaattgcatttttgatctcttaactatttaaatagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 2357157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 397
Target Start/End: Original strand, 37143764 - 37143839
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattt 397  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37143764 ggctaaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattt 37143839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38842405 - 38842327
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtc 402  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||  || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38842405 ctaaattgtatttttgattccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtc 38842327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Original strand, 21522226 - 21522308
Alignment:
Q  328 attgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21522226 attgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattc--tttattttggtctcttaacttc 21522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36507196 - 36507105
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| | |||||||||  |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  36507196 aggctaaattatgtttttggtctcttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggtatcttaacttc 36507105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 38676061 - 38676147
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  | || | | |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  38676061 taaattatatttttggtcccttaactatttaattgatttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtctcttaactt 38676147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 473545 - 473476
Alignment:
Q  343 ctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | ||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  473545 ctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttcgtcccttaacttc 473476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22338663 - 22338583
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || ||| | ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22338663 aggctaaattgcatttttggtcccttaactaattaattagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttcatttattttggt 22338583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34568976 - 34568880
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttat----gtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||    ||| |||   |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34568976 taggctaaattatatttttggtctctttactatttatttatgtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttatttttgtcccttaacttc 34568880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 345 - 408
Target Start/End: Original strand, 48703803 - 48703866
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||    
T  48703803 ttaactattaaagtaatatcgttttggtcccttaattataatttgatttattttgatcacttaa 48703866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31623810 - 31623721
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| |||||| || | |||| |||| | ||| ||| |||||||  ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31623810 ggctaaattgcatttttagtaccttaattattcaggtagtatcgttttggaccctcaagtaaaatttgatttattttggtcccataactt 31623721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 47305492 - 47305423
Alignment:
Q  343 ctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  47305492 ctttaactatttaattagtatcgttttgctcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaacttc 47305423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23437493 - 23437449
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23437493 tttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcgtaactt 23437449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Original strand, 28263494 - 28263582
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||   |||||| ||| |||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28263494 taggctaaattacttttttgatcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaa 28263582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40263652 - 40263608
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40263652 tttggtcccttaactaaattttgatttattttggtcccttaactt 40263608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 410
Target Start/End: Original strand, 11524701 - 11524793
Alignment:
Q  318 tgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11524701 tgtatgctaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaact 11524793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 33329205 - 33329296
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33329205 aggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 33329296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 3338475 - 3338567
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3338475 taggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 3338567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25551719 - 25551632
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25551719 taaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 25551632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 33544825 - 33544912
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33544825 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 33544912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3289296 - 3289206
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3289296 ggctaaattgcatttttggtccctaaactatttaggtaatatcgctttggtgccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 3289206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 25551346 - 25551436
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25551346 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattgaaatttgatttattttagtcccttaactt 25551436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 1158599 - 1158678
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158599 atttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 1158678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3338862 - 3338771
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3338862 aggctaaattttatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttctttaacttc 3338771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 33346477 - 33346568
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33346477 aggctaaatttcattttggatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 33346568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 9173901 - 9173991
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9173901 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 9173991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 407
Target Start/End: Original strand, 24604878 - 24604960
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604878 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 24604960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 12903221 - 12903310
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12903221 ggctaaattgtatttttggttctttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactt 12903310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19135834 - 19135742
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19135834 taggctaaattgcatttttggtccattaagtatttaggtagtatcgttttgatctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 19135742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 29009956 - 29010044
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29009956 ctaaattgaatttttggtcccttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgaattatttcggtcccttaacttc 29010044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33545210 - 33545118
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33545210 taggctaaattatatttttggtgcattaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 33545118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 2949294 - 2949385
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2949294 taggctaaattgcattttttgtccgttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaactt 2949385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 3288929 - 3289020
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3288929 aggctaaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccctaacttc 3289020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 6220059 - 6220146
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6220059 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattaatatcgctttcgtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 6220146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 13155842 - 13155929
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13155842 taaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgcttaacttc 13155929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 13160698 - 13160785
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13160698 taaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgcttaacttc 13160785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24605248 - 24605169
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24605248 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 24605169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 35132600 - 35132691
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35132600 aggctaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtcccataattaaaattagatttattttggtcctttaacttc 35132691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29010341 - 29010250
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29010341 aggctaaattgcatttttggttccttgactatttatgtagtatcgctgtggtcccttaactaaaattcgatttattttggccccttaacttc 29010250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 31029527 - 31029614
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31029527 taaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 31029614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35119198 - 35119111
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35119198 aggctaaatttcattttggatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaa 35119111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Original strand, 11524778 - 11524852
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11524778 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaac 11524852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11525152 - 11525062
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11525152 aggctaaattgcatttttggtcccttaacaatttaggtagtatcggtttggtcccttatttaaaattcaatttattttggtctcttaactt 11525062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31029910 - 31029829
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcc 403  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31029910 ggctaaattgcatttttggtcccttaaccatttaaatagtattgttttagtcccttaactaaaattcgatttattttggtcc 31029829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1860871 - 1860782
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1860871 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtg-tatctctttggtcccttaattaaaattcgatttatttgggttccttaacttc 1860782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 14336902 - 14336992
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  || ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14336902 ggctaaattgcatttttgatcccttaattatttagctagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 14336992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 32283026 - 32283116
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  32283026 ggctaaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 32283116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6220441 - 6220352
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6220441 gctaaattgcatttttaatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccatcaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 6220352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1158977 - 1158890
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1158977 taggctaacttgcatttttggtaccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaatt-aaatttgatttattttggtcccttaa 1158890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17245711 - 17245624
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17245711 aggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 17245624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33972548 - 33972502
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33972548 ttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 33972502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2814698 - 2814607
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||| | |||||||||  |||||||||||  || ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  2814698 aggccaaattatgtttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtttcttaacttc 2814607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7537992 - 7537901
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttg-gtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||  ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7537992 ggctaaattgcatttttttgtcccttaactatttaagtggtatcgcttttgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccataacttc 7537901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14337288 - 14337202
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14337288 aggctaaattgcattttta-tcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttagttaaaatttgatttattttggtcccttaa 14337202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2949633 - 2949587
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2949633 ttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttc 2949587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6229772 - 6229687
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6229772 ggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtccct-aactaaaatttgatttattttggtcccttaa 6229687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 387
Target Start/End: Original strand, 33971931 - 33971993
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaatt 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  33971931 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttatcccttaattaaaatt 33971993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 24548241 - 24548330
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  24548241 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgcttttgagccttagttaaaatttgatttattttggtatcttaactt 24548330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13156179 - 13156139
Alignment:
Q  368 ttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13156179 ttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaa 13156139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13161035 - 13160995
Alignment:
Q  368 ttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13161035 ttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaa 13160995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33548244 - 33548173
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatt 392  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  33548244 aggctaaattgaatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggccccttaattaaaatttgatt 33548173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24548615 - 24548537
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||  || |||   |||||| | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  24548615 tttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 24548537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35132977 - 35132917
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaatt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||||||    
T  35132977 aggctaaattgtattttcggtcccttaactatttaggtagtaccgctttggtcccttaatt 35132917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 7399075 - 7399167
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7399075 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 7399167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 21750808 - 21750900
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750808 taggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 21750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 17861039 - 17861128
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17861039 ggctaaattatatttttggtcctttaactatttaggtaatgttgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ccttaacttc 17861128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 39706433 - 39706347
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706433 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattcttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 39706347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 36751904 - 36751992
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36751904 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaacttc 36751992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40589442 - 40589350
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40589442 taggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 40589350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40590045 - 40589953
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40590045 taggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 40589953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 5624382 - 5624469
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5624382 taaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 5624469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12593851 - 12593752
Alignment:
Q  313 taatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593851 taatttttaggttaaattacatttttagtcctttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 12593752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 14051887 - 14051978
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14051887 taggttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtaatattgttttggttttttaattaaaattcgatttattttggttcctgaactt 14051978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33763293 - 33763204
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33763293 ggctaaattgcatttttggtcccttaactattta-gtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttatttcggtcccttaacttc 33763204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42710736 - 42710646
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42710736 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 42710646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16353543 - 16353450
Alignment:
Q  319 gtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353543 gtaggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 16353450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32272224 - 32272136
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32272224 ctaaattgcatttttggtctcttaactatttagataatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 32272136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 35263492 - 35263584
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35263492 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 35263584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15670534 - 15670447
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15670534 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttatttaattaaaattttatttattttggtcccttaacttc 15670447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 334296 - 334386
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  334296 ggctaaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 334386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 9692919 - 9693008
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9692919 ggctaaattgtatttttggtccct-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttc 9693008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 412
Target Start/End: Original strand, 7210461 - 7210546
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7210461 aattgcatttttggtcccttaaatatttaggtactatcgttttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 7210546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5088516 - 5088424
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5088516 taggctaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 5088424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8418569 - 8418481
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8418569 gctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccgttaattaaaattcgatttattttgatcccttaactt 8418481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31909322 - 31909226
Alignment:
Q  316 tttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31909322 tttgaaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgttttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 31909226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 33699273 - 33699365
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33699273 taggctaaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcggtttattttggtcccttaacttc 33699365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 3878480 - 3878571
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3878480 aggctaaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcgtttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 3878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15267639 - 15267536
Alignment:
Q  309 ataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15267639 ataatatttttttggcgaaattgcatttttgatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaa 15267540  T
Q  409 cttc 412  Q
    ||||    
T  15267539 cttc 15267536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 25923121 - 25923208
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25923121 taaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcggtttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 25923208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28392156 - 28392069
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28392156 ggctaaattctatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaac 28392069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Original strand, 10656093 - 10656183
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10656093 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttgctcctttaactt 10656183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 412
Target Start/End: Original strand, 39706050 - 39706141
Alignment:
Q  317 ttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||     | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706050 ttgtaggctaaattgcatttttggtctcttaactatttatgtac----gctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 39706141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 29023936 - 29024020
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29023936 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgat---ttttggtcccttaa 29024020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 40774339 - 40774427
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40774339 gctaaatttcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgttttagtcccttaattaaaa-tcgatttattttggtcccttaacttc 40774427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12695074 - 12694982
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12695074 taggccaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 12694982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36752289 - 36752198
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36752289 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatgtagtatcgcttcaat-ccttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 36752198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3879399 - 3879308
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3879399 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatgactttggttcattatttaaaatttgatttattttggtctcttaacttc 3879308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 5087806 - 5087897
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5087806 aggcgaaattgaatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttc 5087897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9693301 - 9693214
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9693301 taaattgcatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaaatcgatttatattggtcccttaacttc 9693214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14143892 - 14143801
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14143892 aggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaagtagtattactttggtctcttcattaaaatttaatttattttggtctcttaacttc 14143801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25923505 - 25923419
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25923505 aggctaaattgcatttttggttcaa-aactatttatgtagtattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaa 25923419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 412
Target Start/End: Original strand, 26289027 - 26289110
Alignment:
Q  329 ttgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26289027 ttgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 26289110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26289407 - 26289317
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  26289407 aggctagattgcatttttggtcctttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgattcattttgat-ccttaacttc 26289317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 38416521 - 38416430
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38416521 aggctaaattgtatttttggtctcttaattatttaggtagtatcgctttgctcacttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 38416430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41372541 - 41372454
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  41372541 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 41372454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 31656370 - 31656448
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31656370 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaacttc 31656448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 398
Target Start/End: Original strand, 5460187 - 5460264
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttatttt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5460187 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatttt 5460264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7210830 - 7210741
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7210830 gctaaattgcattcttggtcacttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcttttaacttc 7210741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 28391768 - 28391857
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28391768 ggctcaattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtattactttggtcccttaattaaagttcgatttattttgatcccttaactt 28391857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 31908928 - 31909020
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactat--ttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31908928 ggctaaattgtatttttggtgccttaactatatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 31909020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 42710351 - 42710440
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42710351 gctaaattgcatttttagtcatttaactatttcggtagtatcgctttagttctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 42710440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 15267240 - 15267331
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15267240 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatt-aggtagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggccccttaacttc 15267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 18514286 - 18514378
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||   ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18514286 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtatccctttggtcgcttagttaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 18514378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 15476269 - 15476356
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  15476269 taaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattttatttattttggtctcttaacttc 15476356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19205326 - 19205239
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19205326 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttgaccccttaacttc 19205239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35263881 - 35263794
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35263881 aggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatgactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccattaa 35263794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5153000 - 5152922
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5153000 gctaaattatgtttttggtcccttaactatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 5152922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7399452 - 7399374
Alignment:
Q  334 tttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7399452 ttttttgtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 7399374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 401
Target Start/End: Original strand, 8418206 - 8418280
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8418206 aattgcatttttggtccattaattatttaggtagtatcgttttggtcacttaattaaaattcgatttattttggt 8418280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10656480 - 10656390
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10656480 ggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttagtcccttaacttc 10656390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 16353151 - 16353243
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaacta---tttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||   |||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16353151 ggctaaattacatttttggtcccttaactactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaactt 16353243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31656744 - 31656654
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31656744 ggctaaattacatttttggtcccttaacttattaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccataacttc 31656654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17736620 - 17736547
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17736620 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtctcttaa 17736547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 12593454 - 12593546
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | ||  || |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12593454 taggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgcttcagtcccttaactaaaattcgatttatattggttccttaacttc 12593546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19185635 - 19185548
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19185635 aggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 19185548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 40589054 - 40589144
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40589054 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttc 40589144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 40589657 - 40589747
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40589657 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttc 40589747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15476632 - 15476555
Alignment:
Q  335 ttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15476632 ttttagtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttc 15476555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40774724 - 40774639
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 406  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||  || ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40774724 aggctaaattgcatttttgattccttaattatttagctagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 40774639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 387
Target Start/End: Original strand, 19204942 - 19205009
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaatt 387  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||    
T  19204942 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatt 19205009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Original strand, 5152614 - 5152704
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  || |||   |||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  5152614 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatgtaattagtatgactttggccccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaact 5152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41860062 - 41859973
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaa--tattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||   |||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41860062 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtatagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaacttc 41859973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 38416141 - 38416233
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||  ||  |||| |||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  38416141 taggctaaattgcatttttaatctcttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgttttcttaacttc 38416233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43570155 - 43570067
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||  || | |||| | |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  43570155 ctaaattgtattttttgtcccttaactatttagatagcatcgctttgttcccttaattaaaatttgatttattttgtcccattaacttc 43570067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 355
Target Start/End: Original strand, 26288989 - 26289024
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactattta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26288989 taggctaaattgtatttttggtcccttaactattta 26289024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5460329 - 5460272
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaatta 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||    
T  5460329 taaattgtatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaatta 5460272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 407
Target Start/End: Original strand, 33762899 - 33762988
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcct-ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaa-ttaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    ||||||||| || ||| |||||||  |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33762899 taggctaaaatgcattcttggtccccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaaattaaaattcgatttattttgatccctta 33762988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 98)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 16736100 - 16736191
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736100 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 16736191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27476754 - 27476663
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476754 aggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 27476663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 41377354 - 41377444
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41377354 aggctaaattgtatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 41377444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13354565 - 13354473
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13354565 taggctaaattgtaattttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 13354473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17856577 - 17856485
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17856577 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttc 17856485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 412
Target Start/End: Original strand, 21470285 - 21470385
Alignment:
Q  312 ataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21470285 ataatttttaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggcagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctcaactt 21470384  T
Q  412 c 412  Q
    |    
T  21470385 c 21470385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25642660 - 25642564
Alignment:
Q  316 tttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25642660 tttggaggctaaattgtatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 25642564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 27132509 - 27132601
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27132509 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 27132601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 39150213 - 39150121
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39150213 taggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgcttttgtaccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 39150121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4121146 - 4121059
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121146 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 4121059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 13354176 - 13354267
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13354176 aggctaaattgaattttcggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 13354267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4104545 - 4104455
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4104545 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttc 4104455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 27883468 - 27883558
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883468 ggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaagtaatatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 27883558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 28202860 - 28202950
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28202860 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatattggtcctttaacttc 28202950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32933977 - 32933887
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32933977 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaaataaaattcgatttattttggtcccttaacttc 32933887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16655994 - 16655902
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16655994 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 16655902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 322 - 410
Target Start/End: Original strand, 20297410 - 20297498
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297410 ggctaaatttcatttttggtcccttaactattcaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 20297498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 411
Target Start/End: Original strand, 25642273 - 25642357
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25642273 aattgtatttttagtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaactt 25642357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34820679 - 34820575
Alignment:
Q  308 tataataatttgtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34820679 tataatattttttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtctcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctta 34820580  T
Q  408 acttc 412  Q
    |||||    
T  34820579 acttc 34820575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 322 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36211785 - 36211697
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211785 ggctaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 36211697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 39454449 - 39454541
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39454449 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 39454541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 5720140 - 5720231
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5720140 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaatattgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 5720231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 410
Target Start/End: Original strand, 12303786 - 12303873
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12303786 gctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 12303873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28203247 - 28203156
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28203247 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtcgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 28203156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 31450665 - 31450756
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31450665 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 31450756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 38275480 - 38275567
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  38275480 taaattgtatttttgatcccttaactatttatgtagtattgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttctttaacttc 38275567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 40694194 - 40694285
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40694194 aggctaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttagtcccttaattaacattcgatttattttagtcccttaacttc 40694285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 4104159 - 4104249
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4104159 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtatcttaacttc 4104249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Original strand, 16655610 - 16655696
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16655610 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 16655696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20908897 - 20908807
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20908897 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttc 20908807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Original strand, 34820283 - 34820369
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34820283 aaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattagatttattttggtcctttaacttc 34820369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 39912630 - 39912716
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39912630 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccgttaactt 39912716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 14877481 - 14877573
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14877481 taggctaaattgcatttttggtcccaaaactatttaggtagtatcgatttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 14877573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 18565064 - 18565156
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18565064 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggcagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 18565156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43183971 - 43183879
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43183971 taggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 43183879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32503920 - 32503833
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32503920 taaattgcattcttagtcctttaactatttaggtagtattgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 32503833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 45389129 - 45389220
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45389129 taggctaaattgcatttttggtccctgaactatttaggtagtgtcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccattaactt 45389220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16261257 - 16261171
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctta 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16261257 aggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttatttttgtccctta 16261171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 17856199 - 17856289
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17856199 ggctaaatttcattttcggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 17856289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18565386 - 18565300
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18565386 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttgggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaactt 18565300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27132896 - 27132806
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27132896 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtgtcgatttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 27132806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 36211350 - 36211440
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36211350 ggctaaattgcatttttggtcacttaactgtttaggttgtattgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttc 36211440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41377740 - 41377650
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41377740 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 41377650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12304542 - 12304450
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12304542 taggctaaattgcattttttgtcccttaacaatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 12304450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34127948 - 34127860
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34127948 ctaaattgtatttttggacccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaactaaagttcgatttattttgatcccttaacttc 34127860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35408909 - 35408817
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  35408909 taggctaaattatgtttttggtccattaactatttaattagtatcgctttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 35408817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 37412595 - 37412683
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37412595 ctaaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttc 37412683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39913016 - 39912924
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactattt-atgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39913016 taggctaaattgcatttttggtcccttaactattttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaactt 39912924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 20908510 - 20908601
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20908510 aggctaaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttagttccttaacttc 20908601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 408
Target Start/End: Original strand, 27476369 - 27476452
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476369 taaattgtatttttggtccctagactatttaggtagtatcgctttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 27476452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27914280 - 27914201
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttgg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27914280 aggctaaattgtatttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggttccttagttaaaatttgatttattttgg 27914201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 28631285 - 28631364
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28631285 atttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 28631364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28631657 - 28631570
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28631657 taaattgtatttttggtcccttaactatttgggtagtatcgctttgctctcttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 28631570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 32503549 - 32503636
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32503549 taaattgtatttttgatcgattaattatttaggtagtatcgttttgcttccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttc 32503636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37744771 - 37744684
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37744771 taaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 37744684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Original strand, 4120764 - 4120850
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4120764 ggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaatcaaaattcgatttattttggtcctttaa 4120850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31451052 - 31450962
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31451052 ggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatcctttaacttc 31450962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Original strand, 34127570 - 34127656
Alignment:
Q  326 aaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  34127570 aaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttatttttgtcgcttaacttc 34127656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37412964 - 37412874
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37412964 ggctaaattgcatttttggccccttaactatttaagtagtatcgcattggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccattaacttc 37412874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5921774 - 5921682
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  5921774 taggctaaattgtgtttttgatcccttaactatttatatagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttttttttgttccttaacttc 5921682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Original strand, 37744451 - 37744539
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37744451 ctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 37744539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 39454817 - 39454733
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39454817 ctaaattgcatttttggtcccttgactattcaggtagtatcgctttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaa 39454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 5961668 - 5961759
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||| | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5961668 aggctaaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccataattaaaaattgatttattttggtcccttaacttc 5961759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12304160 - 12304081
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12304160 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 12304081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21470669 - 21470591
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470669 atttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctt-ggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 21470591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34484418 - 34484343
Alignment:
Q  336 tttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34484418 tttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtatcttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 34484343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38275842 - 38275755
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38275842 gctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccgtaact 38275755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10833421 - 10833331
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10833421 ggctgaattgcatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttagtccctcaattaaaattcgatttattttggtccattaacttc 10833331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 41659745 - 41659835
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  41659745 ggctaaattatattttttgtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 41659835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44612871 - 44612779
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaa--tattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||   ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44612871 aggctaaattgcatgtttggtcctt-aactatttacgtatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttc 44612779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Original strand, 16260872 - 16260960
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16260872 gctaaatagcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgattt-ttttggtcctttaacttc 16260960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38073867 - 38073778
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||  || ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38073867 ggctaaattatatttttgatcatttaactatttagatagtatcgttttaattctttaattaaaattcgatttattttgatctcttaactt 38073778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 409
Target Start/End: Original strand, 43183585 - 43183670
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaac 409  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43183585 ctaaattacatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccataac 43183670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27246370 - 27246290
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27246370 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaggatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 27246290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 36442131 - 36442223
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36442131 taggctaaattgtatttttgttcccttcactatttaggtagtatcgttttggtctattaataaaaatttgatttattttggttcattaacttc 36442223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16350454 - 16350367
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  16350454 taaattatgtttttgttcccttaactatttaattattattgttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtatcttaacttc 16350367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 33819395 - 33819485
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33819395 taggttaaattgcacttttggtccattaactatttaggtagtaccgttttggtctcttaattaaaatttgattta-tttggtcccttaactt 33819485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 411
Target Start/End: Original strand, 44915738 - 44915829
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  44915738 taggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 44915829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15137191 - 15137101
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||  ||||||||||   |||||||||| ||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15137191 aggctaaattacatttttggtcacataactatttaggtagtaccgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaactt 15137101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16736484 - 16736394
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||  ||| | | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16736484 ggctaaattgcacttttggtcccttaactgtttaggttgtatcgctgtagtcccttaattaaaattcgatttatttcggtcccttaacttc 16736394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23992292 - 23992206
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23992292 ggctaaattgtctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 23992206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 15829765 - 15829810
Alignment:
Q  367 tttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15829765 tttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 15829810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36442519 - 36442430
Alignment:
Q  323 gctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  36442519 gctaaattatatttttggtcccttaactatttagatagtattgctttgatcctttaattaaaatttaatttattttgatcctttaacttc 36442430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 32933589 - 32933681
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  32933589 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttc 32933681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 392
Target Start/End: Original strand, 34484238 - 34484305
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||    
T  34484238 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatt 34484305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Original strand, 16350080 - 16350166
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||  || ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  16350080 taaattgcatttttggtctcttgactatttaattagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 16350166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36211683 - 36211637
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36211683 ttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 36211637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41660119 - 41660033
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||   ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  41660119 taaattgcatttttggtcctttaactatttaattagtatcactttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactt 41660033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11943849 - 11943784
Alignment:
Q  347 aactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11943849 aactatttaggtagtatcgctttggtactttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttc 11943784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1580224 - 1580148
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggt 401  Q
    |||||| | |||||||| | |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1580224 taaattatgtttttggttccttaactatttaaatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 1580148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36211712 - 36211668
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact 410  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36211712 ttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaact 36211668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 408
Target Start/End: Original strand, 23991265 - 23991352
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |  ||| | ||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  23991265 aggctaaattgtctttttagttccttaactatttatttggtatcggtttggttccttaactatattttaatttattttggtcccttaa 23991352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27883849 - 27883753
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttat----gtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||    ||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27883849 taggctaaattgcattttcgatcccttaactatatatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtgacttaacttc 27883753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 345 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40694538 - 40694475
Alignment:
Q  345 ttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||| |||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40694538 ttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattagatttattttggtcccttaa 40694475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 387
Target Start/End: Original strand, 44610860 - 44610926
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaatt 387  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  44610860 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgcttt-gtcccttaattaaaatt 44610926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 412
Target Start/End: Original strand, 39149852 - 39149934
Alignment:
Q  330 tgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  || |||   ||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39149852 tgtatttttggttttttaactatttaaatagtatcactttagtcctttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 39149934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Original strand, 1580030 - 1580094
Alignment:
Q  346 taactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  1580030 taactatttaattagtatcgttttggt-ccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 1580094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 412
Target Start/End: Original strand, 44612548 - 44612581
Alignment:
Q  379 attaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44612548 attaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 44612581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4706 - 4614
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4706 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 4614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Original strand, 4341 - 4428
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4341 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtactatcactttggttccttaattgaaatttgatttattttggtctcttaacttc 4428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13924 - 13837
Alignment:
Q  325 taaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13924 taaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 13837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Original strand, 13541 - 13631
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13541 aggctaaattgcatttttggtcctt-aactatttagttagaattgctttggtcccttagttaaaatccgatttattttggtcccttaacttc 13631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11873 - 11783
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11873 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 11783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 11486 - 11578
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11486 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagaaagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttc 11578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40738 - 40648
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40738 ggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttc 40648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 408
Target Start/End: Original strand, 40349 - 40438
Alignment:
Q  319 gtaggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40349 gtaggctaaattgtatttttggtcccttaattatttagatagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttatttcggtcccttaa 40438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Original strand, 11228 - 11303
Alignment:
Q  337 ttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228 ttggtcccttaactatttaggtagtattgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 11303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11601 - 11510
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11601 aggctaaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttc 11510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 65750 - 65829
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  65750 atttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 65829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 73082 - 73161
Alignment:
Q  333 atttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73082 atttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 73161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 66123 - 66035
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  66123 ctaaattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtcccttaacttc 66035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 73455 - 73367
Alignment:
Q  324 ctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  73455 ctaaattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtcccttaacttc 73367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 411
Target Start/End: Original strand, 93188 - 93277
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactt 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  93188 ggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttagtcacttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 93277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 45222 - 45132
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  45222 ggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtattatcgctttgctcccttaattaaaaattgatttattgtggtcccttaacttc 45132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 406
Target Start/End: Original strand, 11638 - 11723
Alignment:
Q  321 aggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 406  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11638 aggctaaattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 412
Target Start/End: Original strand, 11712 - 11758
Alignment:
Q  366 ttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11712 ttttggtcccttgactaaaatttgatttattttggtcccttaacttc 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Original strand, 1474 - 1566
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1474 taggctaagttgcattttttgtcacttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttc 1566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 177453 - 177361
Alignment:
Q  320 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||    | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  177453 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtattatcagatcgatcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttc 177361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11001 - 10920
Alignment:
Q  327 aattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaa 408  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11001 aattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaa 10920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 412
Target Start/End: Original strand, 90805 - 90895
Alignment:
Q  322 ggctaaattgtatttttggtcctttaactatttatgtaatattgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttc 412  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  90805 ggctacattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattgaaatttgatttattttggtaacttaacttc 90895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University