View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3629_low_27 (Length: 253)

Name: NF3629_low_27
Description: NF3629
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3629_low_27
NF3629_low_27
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (1-188)||(41334571-41334758)
chr5 (1-192)||(2614553-2614744)
chr5 (1-188)||(18033987-18034174)
chr5 (1-190)||(5257000-5257189)
chr5 (1-189)||(7617138-7617326)
chr5 (1-163)||(22512310-22512472)
chr5 (1-192)||(33801474-33801665)
chr5 (1-182)||(38470584-38470765)
chr5 (1-189)||(25914903-25915082)
chr5 (4-132)||(39122397-39122524)
chr5 (83-198)||(39122254-39122369)
chr5 (1-95)||(32473395-32473489)
chr5 (1-71)||(33855068-33855138)
chr5 (1-95)||(17208079-17208173)
chr5 (1-95)||(30622720-30622813)
chr5 (116-188)||(30622627-30622699)
chr5 (116-187)||(32473303-32473374)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (1-191)||(11582771-11582961)
chr8 (1-191)||(36743388-36743578)
chr8 (1-189)||(30660649-30660837)
chr8 (1-184)||(29800862-29801045)
chr8 (1-187)||(42197344-42197530)
chr8 (1-182)||(29705367-29705548)
chr8 (1-187)||(26125640-26125825)
chr8 (1-190)||(45397321-45397509)
chr8 (1-189)||(20148765-20148953)
chr8 (1-189)||(30912469-30912657)
chr8 (1-188)||(2547001-2547188)
chr8 (4-188)||(31384672-31384856)
chr8 (1-188)||(42295200-42295386)
chr8 (4-182)||(2165877-2166055)
chr8 (4-189)||(1375550-1375735)
chr8 (38-188)||(9241594-9241744)
chr8 (1-160)||(5754908-5755067)
chr8 (12-188)||(3743787-3743963)
chr8 (5-188)||(40528542-40528726)
chr8 (1-92)||(42699262-42699353)
chr8 (1-95)||(35181521-35181615)
chr8 (1-95)||(34304793-34304887)
chr8 (1-95)||(18066719-18066813)
chr8 (1-95)||(33629994-33630088)
chr8 (1-89)||(16603633-16603721)
chr8 (116-190)||(35181636-35181710)
chr8 (1-90)||(16358839-16358929)
chr8 (116-189)||(34304908-34304980)
chr8 (1-40)||(19386626-19386665)
chr8 (37-95)||(10678153-10678211)
chr8 (116-161)||(18066653-18066698)
chr8 (45-98)||(32328815-32328868)
chr8 (116-188)||(10678060-10678132)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-191)||(24000917-24001107)
chr7 (1-182)||(42538345-42538526)
chr7 (1-189)||(5810831-5811019)
chr7 (1-188)||(41861679-41861868)
chr7 (1-188)||(26898310-26898497)
chr7 (1-189)||(44326183-44326371)
chr7 (1-184)||(5015400-5015583)
chr7 (12-182)||(27393174-27393344)
chr7 (1-190)||(44416840-44417029)
chr7 (1-189)||(4638106-4638294)
chr7 (1-193)||(42972857-42973049)
chr7 (1-188)||(10573754-10573941)
chr7 (1-188)||(43343532-43343719)
chr7 (5-182)||(32029731-32029908)
chr7 (2-189)||(45326026-45326213)
chr7 (1-189)||(35069726-35069914)
chr7 (1-188)||(43317448-43317635)
chr7 (1-189)||(16180264-16180451)
chr7 (1-188)||(5194139-5194326)
chr7 (19-164)||(38160511-38160656)
chr7 (1-182)||(9216307-9216487)
chr7 (1-188)||(24280504-24280691)
chr7 (76-189)||(47279631-47279744)
chr7 (1-84)||(40236924-40237007)
chr7 (1-95)||(31513292-31513386)
chr7 (1-95)||(31408634-31408728)
chr7 (1-95)||(27535232-27535326)
chr7 (1-95)||(33384875-33384970)
chr7 (1-63)||(39998413-39998475)
chr7 (116-190)||(40237039-40237113)
chr7 (116-189)||(31408540-31408613)
chr7 (116-189)||(31513407-31513480)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (1-182)||(9698247-9698428)
chr6 (1-184)||(7292752-7292935)
chr6 (1-189)||(26669916-26670104)
chr6 (1-187)||(13743130-13743316)
chr6 (1-187)||(13748630-13748816)
chr6 (1-190)||(21293583-21293772)
chr6 (1-189)||(3213405-3213593)
chr6 (1-189)||(26466804-26466992)
chr6 (1-182)||(7367554-7367735)
chr6 (1-194)||(24203889-24204082)
chr6 (1-189)||(7273242-7273430)
chr6 (1-189)||(21279934-21280122)
chr6 (1-188)||(30735987-30736174)
chr6 (1-187)||(30014348-30014534)
chr6 (1-95)||(27441547-27441641)
chr6 (1-95)||(31109223-31109317)
chr6 (1-95)||(33242408-33242502)
chr6 (1-95)||(33253918-33254012)
chr6 (116-189)||(27441662-27441735)
chr6 (116-188)||(33242523-33242595)
chr6 (116-199)||(33254034-33254118)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-189)||(36150135-36150323)
chr3 (1-189)||(54246055-54246243)
chr3 (1-188)||(54237101-54237288)
chr3 (1-190)||(46941058-46941247)
chr3 (1-189)||(42394326-42394514)
chr3 (1-188)||(53581766-53581953)
chr3 (1-188)||(24688310-24688497)
chr3 (1-188)||(40480754-40480941)
chr3 (1-188)||(40808870-40809057)
chr3 (1-188)||(45126836-45127023)
chr3 (1-199)||(25413686-25413886)
chr3 (1-180)||(42100693-42100872)
chr3 (1-189)||(47190933-47191120)
chr3 (1-188)||(27748568-27748746)
chr3 (38-190)||(52629870-52630022)
chr3 (11-187)||(51249323-51249499)
chr3 (1-189)||(1078232-1078411)
chr3 (8-189)||(11064629-11064810)
chr3 (1-135)||(53273645-53273779)
chr3 (98-189)||(29556866-29556956)
chr3 (1-95)||(4190266-4190360)
chr3 (1-95)||(9434129-9434223)
chr3 (1-98)||(29558232-29558329)
chr3 (1-95)||(10457893-10457987)
chr3 (1-84)||(25996273-25996356)
chr3 (4-95)||(51757601-51757692)
chr3 (1-95)||(34791834-34791928)
chr3 (1-95)||(52627978-52628072)
chr3 (116-189)||(4190172-4190245)
chr3 (116-188)||(9434244-9434316)
chr3 (39-90)||(19148822-19148873)
chr3 (110-185)||(19148882-19148957)
chr3 (120-168)||(45058584-45058632)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-188)||(5489781-5489968)
chr1 (1-188)||(43570994-43571181)
chr1 (1-188)||(23989431-23989619)
chr1 (1-188)||(48498870-48499057)
chr1 (1-187)||(37814783-37814969)
chr1 (1-189)||(24769406-24769594)
chr1 (5-190)||(4401336-4401522)
chr1 (1-194)||(2497464-2497657)
chr1 (1-190)||(50448166-50448355)
chr1 (1-189)||(7447831-7448018)
chr1 (1-189)||(750212-750400)
chr1 (46-192)||(4888093-4888238)
chr1 (1-95)||(44112682-44112776)
chr1 (1-95)||(48119633-48119727)
chr1 (1-95)||(35003299-35003393)
chr1 (1-95)||(38335923-38336017)
chr1 (1-95)||(41065158-41065252)
chr1 (1-95)||(46168388-46168482)
chr1 (1-95)||(45427746-45427840)
chr1 (1-89)||(38113202-38113290)
chr1 (1-95)||(45639733-45639827)
chr1 (116-189)||(44112797-44112870)
chr1 (1-95)||(35000114-35000208)
chr1 (1-95)||(45705830-45705924)
chr1 (118-168)||(47748463-47748513)
chr1 (116-188)||(35000021-35000093)
chr1 (1-43)||(14427352-14427394)
chr1 (116-189)||(35003414-35003487)
chr1 (116-188)||(45705945-45706017)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-189)||(112660-112848)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-189)||(19047162-19047350)
chr2 (1-189)||(43490308-43490496)
chr2 (1-188)||(1750419-1750606)
chr2 (1-189)||(30838637-30838825)
chr2 (1-188)||(16096752-16096940)
chr2 (1-191)||(4764631-4764821)
chr2 (1-182)||(12302167-12302348)
chr2 (38-200)||(42849754-42849916)
chr2 (1-188)||(43335671-43335858)
chr2 (1-189)||(34817683-34817871)
chr2 (1-155)||(13780676-13780830)
chr2 (1-135)||(8896544-8896678)
chr2 (1-164)||(42026772-42026937)
chr2 (38-193)||(39149197-39149350)
chr2 (1-95)||(43114562-43114656)
chr2 (1-95)||(11825655-11825749)
chr2 (1-95)||(41281975-41282069)
chr2 (1-95)||(12415461-12415555)
chr2 (1-95)||(12427521-12427615)
chr2 (1-95)||(16803973-16804067)
chr2 (1-95)||(16843255-16843349)
chr2 (5-90)||(33229310-33229396)
chr2 (2-95)||(34895742-34895835)
chr2 (1-89)||(18491710-18491798)
chr2 (1-95)||(966835-966929)
chr2 (1-81)||(6518484-6518563)
chr2 (11-78)||(14285691-14285758)
chr2 (38-95)||(4451951-4452008)
chr2 (1-81)||(4299435-4299515)
chr2 (1-85)||(7070421-7070505)
chr2 (116-189)||(34895648-34895721)
chr2 (116-188)||(11825562-11825634)
chr2 (116-188)||(16804088-16804160)
chr2 (116-188)||(16843370-16843442)
chr2 (116-188)||(43114677-43114749)
chr2 (116-189)||(6518401-6518474)
chr2 (116-198)||(18491825-18491907)
chr2 (116-188)||(4299328-4299400)
chr2 (116-189)||(41281881-41281954)
chr2 (116-188)||(966742-966814)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (1-189)||(690-878)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (1-188)||(27893750-27893937)
chr4 (1-189)||(27550314-27550502)
chr4 (1-189)||(27864569-27864757)
chr4 (1-189)||(55966253-55966441)
chr4 (1-189)||(1771173-1771361)
chr4 (1-190)||(23035985-23036174)
chr4 (1-188)||(23204686-23204873)
chr4 (1-188)||(43514594-43514781)
chr4 (1-189)||(28982729-28982917)
chr4 (1-188)||(25051698-25051885)
chr4 (1-188)||(33703146-33703333)
chr4 (1-185)||(48463361-48463545)
chr4 (1-188)||(35017738-35017924)
chr4 (5-188)||(43949709-43949893)
chr4 (1-190)||(31680907-31681096)
chr4 (1-189)||(28988478-28988665)
chr4 (4-189)||(43735750-43735935)
chr4 (1-189)||(41878411-41878592)
chr4 (1-189)||(21687011-21687199)
chr4 (1-191)||(27316617-27316808)
chr4 (1-182)||(12496961-12497142)
chr4 (1-190)||(41327449-41327638)
chr4 (5-164)||(39631109-39631269)
chr4 (1-184)||(45490225-45490408)
chr4 (38-188)||(51512173-51512323)
chr4 (1-183)||(41847976-41848158)
chr4 (37-190)||(56215804-56215956)
chr4 (1-95)||(711965-712059)
chr4 (49-176)||(46412389-46412516)
chr4 (1-95)||(17619153-17619247)
chr4 (1-95)||(55272377-55272471)
chr4 (1-90)||(3756252-3756341)
chr4 (2-95)||(48435580-48435673)
chr4 (1-76)||(960890-960965)
chr4 (1-84)||(35037010-35037093)
chr4 (1-95)||(32728362-32728456)
chr4 (116-189)||(19880074-19880147)
chr4 (1-81)||(46827721-46827801)
chr4 (116-188)||(55272284-55272356)
chr4 (116-192)||(3756156-3756232)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (1-188)||(14097-14283)
scaffold0187 (1-188)||(24425-24611)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (1-188)||(11256-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (1-182)||(23335-23516)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-95)||(45720-45814)
scaffold0003 (116-189)||(45626-45699)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-95)||(35457-35551)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41334758 - 41334571
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334758 atgttacatgaacaccctttattcatacacctcattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 41334659  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41334658 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 41334571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2614744 - 2614553
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614744 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 2614645  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatt 192  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2614644 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcattactctatt 2614553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 18033987 - 18034174
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18033987 atgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 18034086  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  18034087 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttatatgggtgtaaagggtgtattgccatatggggtggtacatgtatcatcactc 18034174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 5257000 - 5257189
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5257000 atgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaatttcatctcacaaccacactttatcttctatt 5257099  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5257100 tatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactcta 5257189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 7617138 - 7617326
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617138 atgttacatgaacaccctttattcatacactccattatacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 7617237  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||| || | |||| |||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  7617238 tatgtgggatctaagttgtcacatgtcagaattttgtgttggtgtaaaaggtgtattgccacatggggtgatacatgtatcatcactct 7617326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22512310 - 22512472
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512310 atgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 22512409  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccaca 163  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22512410 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccaca 22512472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 33801474 - 33801665
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801474 atgttacatgaacatcctttatttctacaccccattgtacactccatgtattagggatattttagtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 33801573  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatt 192  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||    
T  33801574 tgtgtgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattgccacatgggaaggtacatatatcatcactctatt 33801665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 38470584 - 38470765
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38470584 atgttacataaacaccctttattcatacattccattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaatcacactttatcttctatt 38470683  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    | |||||||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38470684 tatgtggggtccagattaccacgtatcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccatatgaggtggtacatgtatca 38470765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25915082 - 25914903
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||        |||||||||||    
T  25915082 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacccaatgtattaga-atatttttgtaggttcatctcataa--------tatcttctatt 25914992  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25914991 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaatggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactct 25914903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39122524 - 39122397
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39122524 ttacatgaacaccttttattcatacatctaattagacaccc-atgtattaggaatattttggtaaattcatctcacaactacactttatcttctatttgt 39122426  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaat 132  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39122425 gtggggtttaggttgccacatgtcagaat 39122397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39122369 - 39122254
Alignment:
Q  83 cacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||   | ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39122369 cacactttatcttctatttgtgtggggtttaggttgccacatgtcagaatcttgtgtggatgtaaatgatatattgtcacatggggtggtacatgtatca 39122270  T
Q  183 ccactctattatatat 198  Q
    ||||||| | ||||||    
T  39122269 ccactctttaatatat 39122254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32473489 - 32473395
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32473489 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccacatgcattagggatattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 32473395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33855138 - 33855068
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagtt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  33855138 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccccatgtattaggaacattttggtaagtt 33855068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 17208079 - 17208173
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17208079 atgttacgtgaacaccctttaatcatacactttattgtacaccccatgcattaaggacattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 17208173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 30622813 - 30622720
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||  ||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  30622813 atgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgtaagccc-atgcattaaggatattttggtaaatttatctcacaaccatactttctctt 30622720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30622699 - 30622627
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  30622699 ttgccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 30622627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32473374 - 32473303
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  32473374 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggaggt-gtacatgtatcaccact 32473303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 11582771 - 11582961
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582771 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 11582870  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11582871 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcattactctat 11582961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36743578 - 36743388
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743578 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 36743479  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36743478 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctat 36743388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30660837 - 30660649
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30660837 atgttacatgaacaccctttatttctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacactttatcttctatt 30660738  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  30660737 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacataggatgatacatgtatcatcactct 30660649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29801045 - 29800862
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29801045 atgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 29800946  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacc 184  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29800945 tatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 29800862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42197530 - 42197344
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197530 atgttacatgaacaccatttattcctacaccccattgcacacactatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 42197431  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  42197430 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcact 42197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 29705367 - 29705548
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29705367 atgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 29705466  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29705467 tgtgcggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 29705548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26125640 - 26125825
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125640 atgttacataaacaccctttattcatacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 26125739  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  26125740 tatgt-gggtccagattgccacgtgtcagaattttatgcgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatatatcaccact 26125825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 45397321 - 45397509
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45397321 atgttacgtgaacaccctttattcctacaccccattctacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacaatttatcttctatt 45397420  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  45397421 tgtgtgggctccagattgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtgttgccacat-gggtggtacatgtatcatcactcta 45397509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20148765 - 20148953
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20148765 atgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacacctcatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatctatt 20148864  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  20148865 tatgtgggatccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactct 20148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30912657 - 30912469
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30912657 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacacttcatgtattaggggtattttggtaagttcatctcacaaccgcaccttatcttctatt 30912558  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30912557 tgtgtggggtctaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 30912469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2547001 - 2547188
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2547001 atgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttagtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 2547100  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2547101 tgtgtgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacatgtatcatcactc 2547188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Original strand, 31384672 - 31384856
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384672 ttacatgaacaccctttattcttacattctattgtacaccccatgtattaggaatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 31384771  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  31384772 gtggggtccaggttgctacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtatattgccacatggggtggtacatatatcatcactc 31384856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 42295200 - 42295386
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42295200 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 42295299  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  42295300 tatgt-gggtccaagttgccacatgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtatattgccacataggatggtacatttatcatcactc 42295386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2166055 - 2165877
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2166055 ttacatgaacaccatttattcctacaccccattgtataccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcataaccacactttatcttctatttgt 2165956  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  2165955 gtggggttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgtcacatgggatggtacatgtatca 2165877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 1375550 - 1375735
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1375550 ttacatgaacaccttttattcatacacccaattgtacaccccatatattagggatattttggtaaatttatctcacaactacactttatcttctatttgt 1375649  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||| || ||| ||||||| ||| ||||| || | |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1375650 gtggagttcagattgccacgtgttagaatcttgtgtgggtgtaaagaatgtattgtcacatagggtggtacatgtatcaccactct 1375735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Original strand, 9241594 - 9241744
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttat 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9241594 tacaccctatatattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 9241693  T
Q  138 atgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  9241694 gtgggtgcaaagggtgtgttgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 9241744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 5754908 - 5755067
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5754908 atgttacatgaacaccttttattcctacatcccattgtacatcccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 5755007  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgcc 160  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  5755008 tatgtgggatccaagttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgcc 5755067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 3743787 - 3743963
Alignment:
Q  12 acaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtc 111  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  3743787 acaccctttattcatccctcccattatacaccccatatattaagtatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtagggtt 3743886  T
Q  112 caggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  3743887 cagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgctacatggggtggtacatatatcatcactc 3743963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40528726 - 40528542
Alignment:
Q  5 tacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40528726 tacatgaacacccttttattcacaaaccccattgtacaccccatatattagggacattttgataaatttatctcacaaccacactttctcttctatttgt 40528627  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||   | ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  40528626 gtggggttcaagttgtcacatgtcataattttgtgtggatgtaaatgatatattgtcacatgagggtgcacatgtatcaccactc 40528542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 42699262 - 42699353
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42699262 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccttatgtattatggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttat 42699353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 35181521 - 35181615
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35181521 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 35181615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34304793 - 34304887
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34304793 atgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 34304887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18066813 - 18066719
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18066813 atgttacatgaacaccctttaatcatacattctattgtacatcccatgtattagggatattttagtaatttcatctcacaaccatactttctctt 18066719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33630088 - 33629994
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  33630088 atgttacacgaacaccctttaatcatacacctcattgtacaccctatgcattagggacattttagtaatttcatctcacaactatactttctctt 33629994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16603721 - 16603633
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 89  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16603721 atgttacatgcacaccctttaatcatacaccttattatacaccccatgcattaaagacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 16603633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 35181636 - 35181710
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35181636 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgaaggt-gtacatgtatcaccactcta 35181710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16358929 - 16358839
Alignment:
Q  1 atgttacat-gaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 90  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16358929 atgttacattgaagaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattaagaatattttgataaattcatctcacaaccatacttt 16358839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 34304908 - 34304980
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  34304908 ttgccacatgtcaggattttgtttgggtgtaagaggtgtattgccacatggggt-gtacatgtatcaccactct 34304980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 19386665 - 19386626
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatac 40  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19386665 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattatac 19386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10678211 - 10678153
Alignment:
Q  37 atacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10678211 atacaccccatatattaaggacattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 10678153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18066698 - 18066653
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgcca 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  18066698 ttgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaagaggtgtattgcca 18066653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 32328868 - 32328815
Alignment:
Q  45 tatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 98  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||    
T  32328868 tatgcattaggaatattttggtaagtttatctcacaactatactttctcttcta 32328815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10678132 - 10678060
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  10678132 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 10678060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24001107 - 24000917
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001107 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 24001008  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24001007 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcattactctat 24000917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42538526 - 42538345
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538526 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 42538427  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42538426 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 42538345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5811019 - 5810831
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5811019 atgttacatgaccaccctttattcctacaccccattgtacaccctatatattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 5810920  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  5810919 tgtgtggggtccaagttgccacatgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 5810831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 41861679 - 41861868
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtatta--gggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41861679 atgttacatgaacaccctttattcatacacccaattatacaccctatgtattatagagatattttggtaagtttatctcacaaccacactttatcttcta 41861778  T
Q  99 tttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41861779 tttgtatggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactc 41861868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26898497 - 26898310
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26898497 atgttacatgaacaccttttattcatacacccaattgtacattccatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacactttatattctatt 26898398  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26898397 tgtgtggggtccaggttaccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaaaggtgtattgccacataggatggtacatgtatcaccactc 26898310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44326183 - 44326371
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44326183 atgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacacctcatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatctatt 44326282  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  44326283 tatgtgggatccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactct 44326371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 5015400 - 5015583
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015400 atgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 5015499  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacc 184  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5015500 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgagtgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 5015583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27393344 - 27393174
Alignment:
Q  12 acaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtc 111  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393344 acaccctttattcctacatcctattgtacactctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtc 27393245  T
Q  112 caggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27393244 caggttgcctcatgtcagaattttatgtgggtgtaaaggatgtattgccacatggggtggtacatgtatca 27393174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44417029 - 44416840
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44417029 atgttacatgaacatcatttatttctacaccctattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 44416930  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44416929 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaaatttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactcta 44416840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4638294 - 4638106
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4638294 atgttacatgaacaccttttattcatacactcaattgtacaccccatatattatggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatcttctatt 4638195  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4638194 tgtgtggggtctaggttaccacgtgtcagaatcttgtatggatgtaaagggtgtattgtcacgtagggtggtacatgtatcaccactct 4638106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 42972857 - 42973049
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42972857 atgttacctgaacatcctttattcctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatcttctatt 42972956  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatta 193  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||    
T  42972957 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaatggtgtattgccacataggatagtacatgtatcattactctatta 42973049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 10573754 - 10573941
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10573754 atgttacataaacaccctttattcatacatcctattgtacaccccatgtattaggaatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttctatt 10573853  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10573854 tatgtggggtcaagattgccacatatcagaattttatgtgggtgtaaaggatatattgtcacatgcggtggtacatgtatcaccactc 10573941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43343719 - 43343532
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43343719 atgttacatgaacatcatttatttctacaccctattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 43343620  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43343619 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaaatttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactc 43343532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32029908 - 32029731
Alignment:
Q  5 tacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtg 104  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32029908 tacataaacactttttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaaattcatctaacaaccacactttatcttctatttatg 32029809  T
Q  105 tggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32029808 tggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 32029731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 45326026 - 45326213
Alignment:
Q  2 tgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctattt 101  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45326026 tgttacataaacaccttttattcatacatcacattgtacaccccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatcttctattt 45326125  T
Q  102 gtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
     ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45326126 atgtggggtccagactaccacctgtcagaattttatgtgggtgtaaatggtgtattgtcacatggggtggtacatgtatcaccactct 45326213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 35069726 - 35069914
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35069726 atgttacatgaacactctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 35069825  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| | | | |||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  35069826 tatgtgaggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtagatgtaaaggatatattgccacataggatggtacatgtatcatcactct 35069914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 43317448 - 43317635
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  43317448 atgttacatgaacaccatttattcatacacctcattgtacatcctatgctttagggatattttgataaattcatctcacaatcacacttactcttctatt 43317547  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  43317548 tgtgtggggtctagattgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacacaagggtgtacatgtatcaccactc 43317635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16180451 - 16180264
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180451 atgttacatcaacaccatttattcctacaccc-attgtacaccccacgtattataaatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttctatt 16180353  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16180352 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 16180264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5194326 - 5194139
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  5194326 atgttacatgaacaccatttattcatacacctcattgtacaccctatgttttaaggatattttgataaattcatctcacaatcacacttactcttctatt 5194227  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  5194226 tgtgtggggtctagattgccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaagggttgtattgccacacaagggtgtacatgtatcactactc 5194139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38160656 - 38160511
Alignment:
Q  19 ttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttg 118  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38160656 ttattcttacactccattgtacaccccatgtattagggatattttagtaacttcatctcacaactacactttatcttctatttatgtggggtccaagttg 38160557  T
Q  119 ccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat 164  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  38160556 ccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacat 38160511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 9216307 - 9216487
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9216307 atgttacatgaacaccctttattcctatatcctattgtacaccc-atgcattagagatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatcttctatt 9216405  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9216406 tgtgtggggtttaagttgccgcatgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgtcacatggggtggtatatatatca 9216487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24280691 - 24280504
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24280691 atgttacgtgaacaccctttattcatacaccctattctacatcccatgcactagaaatattttggtaaattcatctcacaatcacactttctcttctatt 24280592  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |  | ||||||   |||||||  ||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  24280591 tgtgtggggtccaagttgccatatatcagaattttgtgcgagtgtaagaggtgtattatcacgtaaaggtgtacatgtatcaccactc 24280504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47279744 - 47279631
Alignment:
Q  76 tcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtaca 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | |||||||    
T  47279744 tcacaaccacactttatcttctatttatataggatccagattaccacatatcagaattttatgtgggtataaagggtgtattgtcagatgggatggtaca 47279645  T
Q  176 tgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||||    
T  47279644 tgtatcaccactct 47279631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 40236924 - 40237007
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 84  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  40236924 atgttacatgaacaccctttaatcatacatcctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaacca 40237007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 31513292 - 31513386
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31513292 atgttacatgaacactctttaatcatacaccctattgtataccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 31513386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31408728 - 31408634
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31408728 atgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacatcccatgcattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccatactttctctt 31408634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27535326 - 27535232
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| | |||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  27535326 atgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacactccatgtgttaaagacattttggtaatttcatctcacaactatactttctctt 27535232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 33384875 - 33384970
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacacccc-attatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || || | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  33384875 atgttacatgaacatcatttaatcatacacccctattgtatactccatgcattagggacattttggtaaattcatctcacaaacatactttctctt 33384970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 39998413 - 39998475
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatatttt 63  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39998413 atgttacatgaacacattttaatcatacatcctattgtacaccccatgtattagggatatttt 39998475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 40237039 - 40237113
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  40237039 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactcta 40237113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31408613 - 31408540
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  31408613 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgtcacatgggggtgtacatgtatcaccactct 31408540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 31513407 - 31513480
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | | | |||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31513407 ttgccacatgtcaggattttgtgtagatgtaagaggtgtattgccacataagggtgtacatgtatcaccactct 31513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9698428 - 9698247
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698428 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 9698329  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9698328 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 9698247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 7292752 - 7292935
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292752 atgttacaagaacaccatttattcatacacctcattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 7292851  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacc 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7292852 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtttgtgtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 7292935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26670104 - 26669916
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670104 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 26670005  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  26670004 tgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatatatcaccgctct 26669916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13743316 - 13743130
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743316 atgttacatgaacaccttttattcatacatccaattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 13743217  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13743216 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaaggatatattgccacatagggtggtacatgtatcaccact 13743130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13748816 - 13748630
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748816 atgttacatgaacaccttttattcatacatccaattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 13748717  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13748716 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaaggatatattgccacatagggtggtacatgtatcaccact 13748630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21293772 - 21293583
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21293772 atgttacataaacaccctttattcatacatttcactgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccacactttatcttctatt 21293673  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21293672 tatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcaccactcta 21293583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3213405 - 3213593
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3213405 atgttacataaacaccctttattcatacatctcattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccatactttatcttctatt 3213504  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3213505 tatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 3213593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26466804 - 26466992
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466804 atgttacataaacaccctttattcctacaccccattgtacactccatgtattagggttattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 26466903  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  26466904 tgtttggggttcaggttgccacgtatcaggattttgtatgggtgtaaaaggtgtattgccacatagggtggtaaatgtatcatcactct 26466992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 7367554 - 7367735
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7367554 atgttatatgaacatcatttattcatacacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttattttctatt 7367653  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7367654 tatgtgggatccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 7367735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24204082 - 24203889
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24204082 atgttacatgaacaccatttattcctacaccctattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatattctatt 24203983  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctattat 194  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24203982 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgtcacatggagtggtacatgtatcatcactcaattat 24203889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7273430 - 7273242
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7273430 atgttacatgaacaccctttattcctacaccttattgtacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatcttctatt 7273331  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  7273330 tatgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattaccacatggggtggtacatgcatcatcactct 7273242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21279934 - 21280122
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21279934 atgttacatgaacaccctttatttctacattccattgcacatcccatgtattagggatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttctatt 21280033  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  21280034 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtatattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 21280122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 30735987 - 30736174
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30735987 atgttacatgaacactttttattcctacaccccattgtacacctcatgtattagtgatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatcttctatt 30736086  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  30736087 tatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactc 30736174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30014348 - 30014534
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30014348 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattatacatcccatgtattaggcatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatcttctatt 30014447  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    | | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  30014448 tatatggggtccaagttaccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtgatacatgtatcatcact 30014534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 27441547 - 27441641
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27441547 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcctatgtattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 27441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31109317 - 31109223
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| || || |||||| ||| ||||    
T  31109317 atgttacatgaacaccctttaatcatacatcccattatacaccccatgcactagggatattttgataaattcaacttacgaccacattttctctt 31109223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 33242408 - 33242502
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  33242408 atgttacatgaacaccatttaatcatacaccttattgtacaccccatgtattaaggacattttggtaaattcatctcacaaacatactttctctt 33242502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 33253918 - 33254012
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33253918 atgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttatctt 33254012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 27441662 - 27441735
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtg-gtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  27441662 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgccacat-gggtgtgtacatgtatcaccactct 27441735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 33242523 - 33242595
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  33242523 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 33242595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Original strand, 33254034 - 33254118
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactctat-tatatata 199  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33254034 ttgccacatgtccggattttgtgtgggtataaaaggtgtattgccacatggaggt-gtacatgtatcaccactctatatatatata 33254118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36150135 - 36150323
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150135 atgttacatgaataccctttattcatacaccccattatacaccctatgtatcagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 36150234  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36150235 tgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 36150323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54246243 - 54246055
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246243 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagagatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 54246144  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  54246143 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagaatgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 54246055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 54237101 - 54237288
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237101 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 54237200  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  54237201 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaatattgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 54237288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 46941058 - 46941247
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941058 atgttacatgaacaccctttattcctacatctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 46941157  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  46941158 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactcta 46941247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42394514 - 42394326
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394514 atgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 42394415  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  42394414 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 42394326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53581953 - 53581766
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581953 atgttacatgaacactctttattcatacactccattgtacatcctatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 53581854  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  53581853 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacaggtatcatcactc 53581766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24688497 - 24688310
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688497 atgttacatgaacaccctttatttctacactccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 24688398  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24688397 tatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggggtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 24688310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 40480754 - 40480941
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480754 atgttacatgaacaccctttattcatatgccccattgtacatcctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 40480853  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||    
T  40480854 tgtgtagggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccgcatggggtgatacatgtatcatcactc 40480941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 40808870 - 40809057
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40808870 atgttacatcaacaccatttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 40808969  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40808970 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 40809057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45127023 - 45126836
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45127023 atgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttattttctatt 45126924  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  45126923 tatgtggggtccagattaccacatgccagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactc 45126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25413686 - 25413886
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413686 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccttatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 25413785  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct--attatatat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25413786 tgtgtggggtccaggttaccacgtgtcagagttttgtgtgggtgtaaagggtgtattgtcatatggggtggtacatgtatcatcactctggattatatat 25413885  T
Q  199 a 199  Q
    |    
T  25413886 a 25413886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 42100693 - 42100872
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42100693 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatcttttatt 42100792  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtat 180  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42100793 tgtgtggagttcaggttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgcattgccacatgaggtggtacatgtat 42100872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47191120 - 47190933
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47191120 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccc-atgtattagagatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 47191022  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||    
T  47191021 tgtgtggggtccaagttaccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggaatggtacatgtatcatcactct 47190933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27748568 - 27748746
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27748568 atgttacatgaacaccttttattcatacacctcattatacaccttatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacaatactttatcttctatt 27748667  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |         ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27748668 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttgtgtcg---------gtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 27748746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 52629870 - 52630022
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttat 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  52629870 tacaccctatgtattaaggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtagggtccaggttgctacgtgtcagaattttgt 52629969  T
Q  138 atgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  52629970 gtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactcta 52630022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 51249323 - 51249499
Alignment:
Q  11 aacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggt 110  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  51249323 aacaccctttattcacccaacccattatacacctcatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccacactttctcttctatttgtgtgggat 51249422  T
Q  111 ccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||  || || |||   ||||||||||||||||    
T  51249423 ccagattgccacatgtcagaattttgtatgaatgtaaggagtgtattatcatatgaggatatacatgtatcaccact 51249499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1078232 - 1078411
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||||    
T  1078232 atgttacatgaacaccctttattcctgcacctcattgtacacctaatgtattagg-atatttttgtaggttcatctcacaa--------tatcttctatt 1078322  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1078323 tgtgtggagttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactct 1078411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11064810 - 11064629
Alignment:
Q  8 atgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtgg 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||| | | ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  11064810 atgaacatcatttattcatacacctcattgtacaccctatgctttagagatattttgattaattcatctcataatcacacttactcttctatttgtgtgg 11064711  T
Q  108 ggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||| || || |||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||    
T  11064710 ggtctagattaccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgtcacacaagagtgtacatgtatcaccactct 11064629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 53273779 - 53273645
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| || ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  53273779 atgttatatgaacatcatttattcctatacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatcttttatt 53273680  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaatttt 135  Q
    | |||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  53273679 tatgtgggatccaggttaccacgtatcagaatttt 53273645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29556956 - 29556866
Alignment:
Q  98 atttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29556956 atttgtgtggggttcaggttgccacatgtcaga-ttttatatgggtgtaaattgtgtattgccacatgtagtggtacatgtatcaccactct 29556866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4190360 - 4190266
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4190360 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccttatgtattagagatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 4190266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 9434129 - 9434223
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9434129 atgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 9434223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29558329 - 29558232
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  29558329 atgttatatgaacaccctttattcatacatctcattgtacaccctatatattaggaatatattggtaaattcatctcacaatcacattttattttcta 29558232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10457987 - 10457893
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  10457987 atgttacatgaacaccttttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaatttatctcacaaccatactttctctt 10457893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 25996273 - 25996356
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 84  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25996273 atgttacatgaacaccctttaatcatacatcttattgtacaccccatatattaaggacattttggtaaattcatctcacaacca 25996356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 51757601 - 51757692
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51757601 ttacataaacaccctttaatcatacaccctattgtacacctcatgcattatggacattttagtaatttcatctcacaaccatactttctctt 51757692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34791834 - 34791928
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||  ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34791834 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccatattgtaaacctcatgcattagggacattttaataatttcatctcacaaccatactttctctt 34791928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52628072 - 52627978
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  52628072 atgttacgtgaacaccctttaatcatacatcctattgtacacctcatgcattaagtatattttggtaaattcatctcacaatcatactttctctt 52627978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4190245 - 4190172
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4190245 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacataagggtatacatgtatcaccactct 4190172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 9434244 - 9434316
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  9434244 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactc 9434316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Original strand, 19148822 - 19148873
Alignment:
Q  39 acaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  19148822 acaccctatgtattagggacattttagtaaatttatctcacaatcacacttt 19148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 19148882 - 19148957
Alignment:
Q  110 tccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacca 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||    
T  19148882 tccaggttgccatatgtcagaattttgtgtgggtgtaagtggtgtattgccacatgggggtgtacatgtgtcacca 19148957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 45058584 - 45058632
Alignment:
Q  120 cacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataagg 168  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  45058584 cacatgtcagatttttatgtgggtgtcaagggtgtattgccacctaagg 45058632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 5489781 - 5489968
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489781 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 5489880  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  5489881 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 5489968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43571181 - 43570994
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571181 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 43571082  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  43571081 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatatatcatcactc 43570994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23989619 - 23989431
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctat 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23989619 atgttacatgaacacccttttattcatacactcaattgtataccctatgtattagggatattttggtaaatttatctcacaaccacactttatcttctat 23989520  T
Q  100 ttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23989519 ttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaatcttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccatatagggtggtacatgtatcaccactc 23989431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48499057 - 48498870
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48499057 atgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 48498958  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  48498957 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 48498870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37814783 - 37814969
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37814783 atgttacataaacaccctttattcatacatctcattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccacactttatcttctatt 37814882  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccact 187  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37814883 tatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatatggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 37814969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24769594 - 24769406
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24769594 atgtttcatgaacaccttttatttctacactccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcttatcacaaccacactttatcttctatt 24769495  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  24769494 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 24769406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 4401336 - 4401522
Alignment:
Q  5 tacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4401336 tacatgaacactcttttattcctacacttcattgtacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 4401435  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4401436 gtggggtccaatatgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacatgtatcatcactcta 4401522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2497657 - 2497464
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2497657 atgttacataaacaccatttattcatacattccattgtacaccccatatattaaggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatctatt 2497558  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctattat 194  Q
    | |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  2497557 tatgtgggatccagattgtcacgtgtcagaattttatgtgggtataaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactctattat 2497464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50448355 - 50448166
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50448355 atgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacaccttatgtattagggatatttttgtaagttcatcttacaaccacattttatcttctatt 50448256  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  50448255 tttgtgggttccatgttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactcta 50448166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 7447831 - 7448018
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7447831 atgttacatgaacatcctttattcctacatcccattgtacaccc-atgtattacagatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 7447929  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||    
T  7447930 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggaatggtacatgtatcatcactct 7448018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 750400 - 750212
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  750400 atgttacgtgaacacccttatttcctacaccccattgtacaccccatgtatcagggatattttgataaattcatctcaaaaccacactttatcttctatt 750301  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  750300 tgtgtggggtccatgttaccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactct 750212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Original strand, 4888093 - 4888238
Alignment:
Q  46 atgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||| | ||| |||    
T  4888093 atgtattagggatattttggtaagtttatctcacaaccacactttattttctatttgtgtggtgtccaaattgccatgtatcagaattttgtgtggatgt 4888192  T
Q  146 aaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatt 192  Q
    ||||  | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  4888193 aaaggatatattgccacat-gggtggtacatgtatcatcactctatt 4888238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 44112682 - 44112776
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44112682 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 44112776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 48119633 - 48119727
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48119633 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 48119727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 35003299 - 35003393
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35003299 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatacattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 35003393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 38335923 - 38336017
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38335923 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacatcccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 38336017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 41065158 - 41065252
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41065158 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctgttgtacaccccatgcattaggggcattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 41065252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 46168388 - 46168482
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46168388 atgttacatgaacaccctttaatcatatatcctattgtacacccaatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 46168482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 45427840 - 45427746
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45427840 atgttacatgaataccttttaatcatacaccctattgtacactccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 45427746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38113290 - 38113202
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 89  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38113290 atgttatatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaatgacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 38113202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 45639827 - 45639733
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  45639827 atgttacatgaacactctttaatcatacatcctattgtacaccccatacattaaggatattttggtaaattcatctcacaatcatactttctctt 45639733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 44112797 - 44112870
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44112797 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgaaggt-gtacatgtatcaccactct 44112870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 35000208 - 35000114
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| || ||   |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  35000208 atgttacatgaacaccttttaatcatacactctattgtatacttcatgtattagggacattttgataaatttatctcacaaccatactttctctt 35000114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 45705830 - 45705924
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  | ||| ||||| | ||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45705830 atgttatatgaacaccctttaatcatacattctattgtacactccatgcattatggacattttgataaattcatctcacaaccatactttctctt 45705924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47748513 - 47748463
Alignment:
Q  118 gccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataagg 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  47748513 gccacatgtcagatttttatatgggtgtcaagggtgtattgccacctaagg 47748463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35000093 - 35000021
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  35000093 ttgccacatgtcaggattttgtatgggtgtaagagatgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 35000021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 14427352 - 14427394
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacacc 43  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14427352 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacacc 14427394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 35003414 - 35003487
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||    
T  35003414 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtgcatgtatcaccactct 35003487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 45705945 - 45706017
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  45705945 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggaggt-gtacatgtatcaccactc 45706017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 112660 - 112848
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112660 atgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 112759  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  112760 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 112848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 19047162 - 19047350
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047162 atgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 19047261  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19047262 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 19047350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43490496 - 43490308
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43490496 atgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacactctatgtattagggatattttggtaagttcatctcataaccacactttatcttctatt 43490397  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  43490396 tatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtagcatcactct 43490308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 1750419 - 1750606
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750419 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 1750518  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||| |||||    
T  1750519 tgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtgtgagtgtaaagggtgtgttgccacatggggtggtacaaatatcatcactc 1750606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30838637 - 30838825
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838637 atgttacatgaacaccctttatttctacatcttattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 30838736  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30838737 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtaggtgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 30838825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 16096752 - 16096940
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16096752 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattatacaccccatgtattagggatattttggtgagttaatctcacaaccacactttatcttctact 16096851  T
Q  101 tgtgt-ggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16096852 tatgtgggggtctaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgatgtggtacatgtatcatcactc 16096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4764821 - 4764631
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764821 atgttacatcaacaccatttattcctacaccctattgtacaccccatgtattataaatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttctatt 4764722  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4764721 tgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactctat 4764631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12302348 - 12302167
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302348 atgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 12302249  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12302248 tatgtggggtccaggttaccatgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaggatgtattgccacatggggtgatacatgtatca 12302167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42849916 - 42849754
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttat 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  42849916 tacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttat-ttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgt 42849818  T
Q  138 atgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat-tatatatat 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  42849817 gtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactatatatatatatat 42849754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43335858 - 43335671
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43335858 atgttatatgaacatcatttattcctacacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaactacactttatcttctatt 43335759  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  43335758 tatgtgggatccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtatattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 43335671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34817871 - 34817683
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34817871 atgttacatgaacaccctttattcacacacctcattgtacaccccatgcactacgcacattttggtaaattcatctcacaaccacactttctcttctatt 34817772  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  34817771 tgtacgggatccaggttgccacatgtcagaattttgtatgggtgtaaggggagcattgccacatgggggtgtacatgtatcatcactct 34817683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13780830 - 13780676
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13780830 atgttacatcaacacattttattcacacacctcattgtacaccccatacattagggatattttgataaattcatctcacaaccacactttctcttctatt 13780731  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgta 155  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13780730 tatgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttgtataggtgtaaagggtgta 13780676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8896678 - 8896544
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  8896678 atgttacatgaacaccctttattcacacattccattgtacaccctatacaataggaatattttggtaaattcatctcacaatcacactttcttttctatt 8896579  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaatttt 135  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8896578 tgtgtgaggttcaggttgccacatgtcagaatttt 8896544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 42026772 - 42026937
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccc--tttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| ||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  42026772 atgttacatgaacacccaatttattcatacattccattgtacatcccgcgcattagggatattttggcaaattcatctcacaactacactttcttttcta 42026871  T
Q  99 tttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat 164  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  42026872 tttgtgtggggtctaggttgcaagatgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacat 42026937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39149350 - 39149197
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttat 137  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||| | ||| |||||| |    
T  39149350 tacatcctatgtattagagatattttggtaagttcatcccacaactacactttatcttttatttgtgt-gggtctaaattaccacgtctcataattttgt 39149252  T
Q  138 atgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatta 193  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39149251 gtgggtgtaaaaggtgtattaccacat-gggtggtacatgtatcatcactctatta 39149197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 43114562 - 43114656
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43114562 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 43114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11825749 - 11825655
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  11825749 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaatcatactttctctt 11825655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41282069 - 41281975
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41282069 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctctt 41281975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12415555 - 12415461
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  12415555 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccccatgcattagggacattttggtaattttatctcacaaccatactttctctt 12415461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12427615 - 12427521
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  12427615 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccccatgcattagggacattttggtaattttatctcacaaccatactttctctt 12427521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16803973 - 16804067
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16803973 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctctt 16804067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16843255 - 16843349
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16843255 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctctt 16843349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 33229310 - 33229396
Alignment:
Q  5 tacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 90  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33229310 tacatgaacacccttttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatcatacaatcacacttt 33229396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 34895835 - 34895742
Alignment:
Q  2 tgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34895835 tgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttatctt 34895742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 18491710 - 18491798
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 89  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18491710 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacacctcatgcattaagaacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 18491798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 966929 - 966835
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  966929 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaagaacgttttggtaaattcatctcacaaacatactttctctt 966835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6518563 - 6518484
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 81  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6518563 atgttacatgaacacc-tttaatcatacactctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaa 6518484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 14285691 - 14285758
Alignment:
Q  11 aacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctca 78  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14285691 aacaccctttaatcatacaccctattgtacaccctatatattaaagatattttggtaaattcatctca 14285758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4452008 - 4451951
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4452008 tacaccatatgcattagggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 4451951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4299515 - 4299435
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 81  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  4299515 atgttatatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacactccatgcattaatgacattttggtaaattcatctcacaa 4299435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 7070421 - 7070505
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccac 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | || |||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7070421 atgttacatgaacaccctttattcatacatcccattgtaacctccatttattggggacattttgataaattcatcttacaaccac 7070505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34895721 - 34895648
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  34895721 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactct 34895648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11825634 - 11825562
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  11825634 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggggatgtacatgtatcaccactc 11825562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 16804088 - 16804160
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16804088 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgtcatataggggtgtacatgtatcaccactc 16804160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 16843370 - 16843442
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16843370 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgtcatataggggtgtacatgtatcaccactc 16843442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 43114677 - 43114749
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  43114677 ttgccacttgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgagggtgtacatgtatcaccactc 43114749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6518474 - 6518401
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  6518474 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaaaaggtgtattgacacatggaggt-gtacatgtatcaccactct 6518401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 18491825 - 18491907
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctattatatat 198  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  18491825 ttgccacatgttaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactcttttttatat 18491907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4299400 - 4299328
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat-aaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4299400 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtattgccacatgaaggtg-tacatgtatcaccactc 4299328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41281954 - 41281881
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||    
T  41281954 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccatatgggggtgtacatgtatcaccactct 41281881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 966814 - 966742
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  966814 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtatttccacatggggatgtacatgtatcaccactc 966742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 690 - 878
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  690 atgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 789  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  790 tgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatatatcaccgctct 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27893937 - 27893750
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27893937 atgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaatttcatctcacaaccacactttatcttctatt 27893838  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27893837 tatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 27893750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27550314 - 27550502
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27550314 atgttacatgaacaccctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacactttatcttctatt 27550413  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  27550414 tatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 27550502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27864569 - 27864757
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27864569 atgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttattttctatt 27864668  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27864669 tatgtggggttcagattaccacatgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 27864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 55966441 - 55966253
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55966441 atgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacaatttatcttctatt 55966342  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  55966341 tatgtggggtctagattgccacctgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactct 55966253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1771361 - 1771173
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1771361 atgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagagatattttgataagttcatctcacaaccacattttatcttctatt 1771262  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  1771261 tatgtggggtccaagttgccacgtctcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 1771173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 23035985 - 23036174
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23035985 atgttacatgaacctcctttattcctacaccctattgtacaccctatatattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 23036084  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23036085 tatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaaggatgtgttgccacatggggtggtacatgtatcatcactcta 23036174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23204873 - 23204686
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23204873 atgttacatgaacactctttattcctacatcccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatgtcacaaccacactttatcttctatt 23204774  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  | |||||| ||||||| |||||    
T  23204773 tatgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaaggatatattgccacatgggatggtacgtgtatcatcactc 23204686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43514781 - 43514594
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43514781 atgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacacttcatgtattagggttattttggtaagttcatctcacaaccacaccttatcttctatt 43514682  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  43514681 tgtgtggggtctaggttgccacgtgtcagaattttttgtggatgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 43514594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28982917 - 28982729
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28982917 atgttacatgaacaccctttatttctacaccctattgtacatcccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccgcactttatcttctatt 28982818  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  28982817 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 28982729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 25051698 - 25051885
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25051698 atgtcacatgaacacactttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatcttctatt 25051797  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  25051798 tatgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaatgatgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactc 25051885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 33703146 - 33703333
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703146 atgttacatgaacaccctttatttctacatcttattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 33703245  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  33703246 tgtgcgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccatatggggtggtacatgtatcatcactc 33703333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48463545 - 48463361
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  48463545 atgttacataaacaccatttattcatacatttcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttattttctatt 48463446  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacca 185  Q
    | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48463445 tatgtggggttcagattaccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagagtggtacatgtatcacca 48463361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 35017738 - 35017924
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017738 atgttacatgaacaccctttattcctatatctcattgtacaccccatgtat-agggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 35017836  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  35017837 tgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaagatgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 35017924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43949893 - 43949709
Alignment:
Q  5 tacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949893 tacatgaacacccttttattcctgcacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 43949794  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    | ||| ||||   |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  43949793 gcgggatccaatatgccacgtgtcagaattttgtatgggtataaagggtgtattgccaaatagggtggtacatgtatcatcactc 43949709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 31680907 - 31681096
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680907 atgttacgtaaacaccatttattcatacattccattgtacaccccgtatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 31681006  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | ||||||||  || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  31681007 tatgtggggtttagattgccacgtgtcagaattttatgtaggtgtaaagggtgtattgccacatgggatgctacatgtatcaccactcta 31681096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 28988478 - 28988665
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28988478 atgttacatgaacaccctttattcatacacctcattgtacaccccatgcactagggacattttgataaattcatctcataaccacactttctcttctatt 28988577  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28988578 tgtgtggggtccaggttgccatatgtcagaattttgtatgag-gtaaggggtgtattgtcacatgagggtgtacatgtatcaccactct 28988665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 43735750 - 43735935
Alignment:
Q  4 ttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43735750 ttacatgaacatcctttattcctacatctcattatacattccatgtattagagatattttgataagttcatctcacaatcacactttatcttctatttgt 43735849  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  43735850 gtgggatccaagttgtcacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactct 43735935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 41878411 - 41878592
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  41878411 atgttacatgaacactctttattcatacacctcattgtacaccctatccattagggatattttgataagttcatctcacaaccaaaccttctcttctatt 41878510  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||       | ||||||||||||||||||||||||    
T  41878511 tgtgtggggtccagattgtcacgtgtcagaattttgtgttggtgtaaagagtgtat-------tcaggtggtacatgtatcaccactct 41878592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21687011 - 21687199
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21687011 atgttacatgaacatcctttatttttacaccccattatacatcttatgtattagaaatattttagtaagttcatctcataaccatactttatcttctatt 21687110  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  21687111 tgtctggagttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgaatgtaaagaatgtattgccacataggttggtacatatatcatcactct 21687199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27316808 - 27316617
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27316808 atgttaaacgaacaccctttattcctacacctcattatacaccccatgtattaaggatattttggtaagttcatctcataaccacactttatcttctatt 27316709  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaa-ttttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctat 191  Q
    | | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||| |||||  | || || |||||||| ||||||||    
T  27316708 tatttggagtccaagttgccacgtgtcagaatttttgtgtggatgtaaagggtgtattgtcacatgggatgataaatgtatcatcactctat 27316617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 12496961 - 12497142
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12496961 atgttatatgaacaccctttattcctacactccattgtacatcccatgtattagagatattttggtaagttcatcttacaatcacactttatcttctatt 12497060  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    |||||| ||| ||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  12497061 tgtgtgaggttcaatttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaaacgtgtattgtcacatggggtggtgcatgtatca 12497142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41327638 - 41327449
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  41327638 atgttacatagacaccctttattcacacaccccattgtacaccttatgcactacggacattttggtaaattcatctcacatccacactttctcttcaatt 41327539  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||| || | |  ||||||||||||| ||||||    
T  41327538 tgtgtggggtccaggttgccacatgttagaattttttgtgagtgtaaggggtgtattgccagattaagatgtacatgtatcactactcta 41327449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 39631109 - 39631269
Alignment:
Q  5 tacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 103  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631109 tacatgaacccccttttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgt 39631208  T
Q  104 gtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacat 164  Q
    ||||||| ||   || ||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||    
T  39631209 gtggggttcaatatgtcacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaaggatgtattgtcacat 39631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45490408 - 45490225
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45490408 atgttacatgaacacattttatttatacatccaattgtacacctcatgtattagggatactttagtaaattcatctcacaaccacactttatcttctatt 45490309  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcacc 184  Q
    |||  ||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||   | |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  45490308 tgtacgggatccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaatgatatattgccacatagggtactacatgtatcacc 45490225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51512323 - 51512173
Alignment:
Q  38 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttat 137  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51512323 tacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatcttataaccacactttatcttttatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 51512224  T
Q  138 atgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
     ||||| | ||   ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  51512223 gtgggtattaaagatgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactc 51512173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 41847976 - 41848158
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41847976 atgttacaagaacatccttttttcacacacctcattgtacaccccatgcattagagacattttggcaaattcatcgcacaaccacactttctcttctatt 41848075  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcac 183  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  41848076 tgtgtggggttcagattgtcacatgtcagaattttgcgtggatgtaaggggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcac 41848158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 56215956 - 56215804
Alignment:
Q  37 atacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaatttta 136  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  56215956 atacatcctatgcattagcgatattttggaaaatttatctcacaaccacactttctct-ctatttgtgtggggtctaggttgctatatgtcagaattttg 56215858  T
Q  137 tatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactcta 190  Q
    | |||||||||   |||||| |||||||   |  ||||||||||||||||||||    
T  56215857 tgtgggtgtaagaggtgtatggccacatggtggtgtacatgtatcaccactcta 56215804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 711965 - 712059
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  711965 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccctatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaacatactttctctt 712059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46412516 - 46412389
Alignment:
Q  49 tattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaa 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| |||||||||||| | | | ||||||    
T  46412516 tattagagatattttggtaagttcttctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtttaaattgccacgtgtcagaattttgtgtagatgtaaa 46412417  T
Q  149 gtgtgtattgccacataaggtggtacat 176  Q
      || ||||| || ||| ||||||||||    
T  46412416 aagtatattgtcatatagggtggtacat 46412389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17619247 - 17619153
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17619247 atgttacatgaacaccttttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 17619153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 55272471 - 55272377
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  55272471 atgttacatgaacatcctttaatcatacactctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 55272377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3756341 - 3756252
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  3756341 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttagtaaatttatctcacaatcatacttt 3756252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48435673 - 48435580
Alignment:
Q  2 tgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  48435673 tgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttatctt 48435580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 960965 - 960890
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatct 76  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  960965 atgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacaccctatacattagggacattttggtaaattcatct 960890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 35037010 - 35037093
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 84  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35037010 atgttacatgagcaccctttaaccatacactctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaacca 35037093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 32728362 - 32728456
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  32728362 atgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggacattttagtaaattcatctcacaatcatactttctctt 32728456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 19880074 - 19880147
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  19880074 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactct 19880147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 46827801 - 46827721
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||| | |  ||||||||| || |||||||||    
T  46827801 atgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacacccaatgcattaagaacgttttggtaaatttatctcacaa 46827721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 55272356 - 55272284
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  55272356 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 55272284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3756232 - 3756156
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaa-agtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactctatt 192  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  3756232 ttgccacatgtcatgattttatgtgggtgtaagagt-tgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactctatt 3756156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14097
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14283 atgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 14184  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14183 tgtgt-gggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 14097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24611 - 24425
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24611 atgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 24512  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24511 tgtgt-gggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 24425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 11256 - 11443
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256 atgtcacatgaacacactttattcatacaccccattgtacaccccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 11355  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatcaccactc 188  Q
      ||||||||||| ||||| || |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  11356 gatgtggggtccaagttgctacgtgtcagaattttgtgtaggtgtaaatagtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactc 11443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23516 - 23335
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23516 atgttatatgaacaccctttattcctacactccattgtacatcccatgtattagagatattttggtaagttcatcttacaatcacactttatcttctatt 23417  T
Q  101 tgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtggtacatgtatca 182  Q
    |||||| ||| ||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  23416 tgtgtgaggttcaatttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaaacgtgtattgtcacatggggtggtgcatgtatca 23335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 45814 - 45720
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45814 atgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcctatgtattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 45720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45699 - 45626
Alignment:
Q  116 ttgccacatgtcagaattttatatgggtgtaaagtgtgtattgccacataaggtg-gtacatgtatcaccactct 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  45699 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgccacat-gggtgtgtacatgtatcaccactct 45626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 35551 - 35457
Alignment:
Q  1 atgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 95  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35551 atgttacataaacaccatttaatcatacaccatattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 35457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University