View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3630_high_7 (Length: 451)

Name: NF3630_high_7
Description: NF3630
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3630_high_7
NF3630_high_7
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (20-441)||(40357762-40358183)
chr4 (20-441)||(21022370-21022791)
chr4 (20-441)||(50274904-50275326)
chr4 (10-441)||(51683360-51683794)
chr4 (20-428)||(30726236-30726643)
chr4 (20-441)||(55407268-55407694)
chr4 (20-428)||(1308609-1309016)
chr4 (26-440)||(50901657-50902070)
chr4 (20-428)||(1089079-1089486)
chr4 (20-441)||(48256052-48256475)
chr4 (119-441)||(37021559-37021887)
chr4 (20-353)||(67762-68094)
chr4 (20-353)||(46436415-46436747)
chr4 (20-408)||(21537975-21538364)
chr4 (126-392)||(14315650-14315927)
chr4 (47-366)||(10752983-10753312)
chr4 (47-366)||(10966752-10967081)
chr4 (236-408)||(11050037-11050210)
chr4 (126-372)||(14297401-14297658)
chr4 (20-366)||(11083562-11083918)
chr4 (236-350)||(41798568-41798682)
chr4 (236-366)||(50023099-50023230)
chr4 (236-353)||(9892838-9892955)
chr4 (236-366)||(50030217-50030348)
chr4 (236-353)||(6181360-6181477)
chr4 (236-353)||(49090806-49090923)
chr4 (236-353)||(49165419-49165536)
chr4 (246-353)||(30704419-30704526)
chr4 (20-106)||(8109563-8109649)
chr4 (236-353)||(31422083-31422201)
chr4 (236-353)||(44679645-44679762)
chr4 (236-353)||(50193864-50193982)
chr4 (238-366)||(41933179-41933308)
chr4 (236-351)||(3184342-3184457)
chr4 (236-351)||(3185456-3185571)
chr4 (236-351)||(3185664-3185779)
chr4 (128-352)||(4719949-4720163)
chr4 (20-196)||(41933352-41933524)
chr4 (75-108)||(37021903-37021936)
chr4 (74-102)||(1308567-1308595)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (20-434)||(8579994-8580408)
chr5 (20-441)||(28876813-28877234)
chr5 (20-441)||(7757494-7757916)
chr5 (13-440)||(19228154-19228582)
chr5 (27-441)||(42941968-42942383)
chr5 (20-428)||(28241294-28241701)
chr5 (20-366)||(14246-14592)
chr5 (20-441)||(38968265-38968690)
chr5 (20-441)||(512253-512675)
chr5 (24-441)||(42537317-42537741)
chr5 (20-427)||(8701719-8702126)
chr5 (20-441)||(17658493-17658914)
chr5 (126-353)||(40624484-40624720)
chr5 (121-363)||(20422210-20422463)
chr5 (236-353)||(19040687-19040804)
chr5 (236-366)||(5197359-5197490)
chr5 (236-352)||(27673224-27673340)
chr5 (236-353)||(30705522-30705639)
chr5 (74-102)||(28241252-28241280)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-428)||(17420719-17421145)
chr2 (20-441)||(28468811-28469232)
chr2 (20-441)||(45428760-45429182)
chr2 (20-397)||(21998360-21998737)
chr2 (20-441)||(39947769-39948192)
chr2 (20-441)||(32955840-32956258)
chr2 (20-338)||(25964982-25965308)
chr2 (20-302)||(7185198-7185481)
chr2 (20-244)||(45137111-45137335)
chr2 (259-441)||(45136784-45136956)
chr2 (319-441)||(22686849-22686970)
chr2 (236-366)||(29401160-29401291)
chr2 (236-353)||(20938282-20938399)
chr2 (20-102)||(42505582-42505664)
chr2 (236-353)||(45284558-45284675)
chr2 (236-353)||(45291921-45292038)
chr2 (236-366)||(10828581-10828712)
chr2 (236-366)||(36655906-36656037)
chr2 (236-353)||(3940299-3940416)
chr2 (236-353)||(5352351-5352468)
chr2 (236-353)||(15831514-15831631)
chr2 (236-353)||(30496517-30496634)
chr2 (236-353)||(43978906-43979023)
chr2 (236-366)||(25515366-25515496)
chr2 (236-353)||(43539308-43539425)
chr2 (129-218)||(31367308-31367397)
chr2 (129-214)||(35464313-35464398)
chr2 (126-191)||(25515543-25515606)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (20-441)||(3975876-3976298)
chr3 (20-441)||(4007804-4008226)
chr3 (20-441)||(42165333-42165754)
chr3 (20-441)||(50963124-50963545)
chr3 (20-441)||(44229885-44230305)
chr3 (20-441)||(47073688-47074112)
chr3 (20-441)||(42756323-42756743)
chr3 (20-441)||(30255483-30255905)
chr3 (20-338)||(3501477-3501797)
chr3 (20-441)||(49195928-49196350)
chr3 (20-441)||(20917496-20917919)
chr3 (20-441)||(20926458-20926881)
chr3 (20-401)||(50216399-50216783)
chr3 (20-441)||(48888906-48889326)
chr3 (20-353)||(596929-597261)
chr3 (13-441)||(48563105-48563519)
chr3 (116-441)||(42805742-42806061)
chr3 (20-294)||(51807139-51807413)
chr3 (236-366)||(16611463-16611594)
chr3 (236-366)||(22047659-22047790)
chr3 (236-353)||(52390966-52391083)
chr3 (236-367)||(17567619-17567751)
chr3 (236-355)||(41612753-41612872)
chr3 (236-353)||(2274484-2274601)
chr3 (236-353)||(29009245-29009362)
chr3 (236-353)||(36127822-36127939)
chr3 (236-353)||(42903760-42903877)
chr3 (236-353)||(46389347-46389464)
chr3 (236-353)||(50480354-50480471)
chr3 (236-353)||(54386509-54386626)
chr3 (236-366)||(20351030-20351161)
chr3 (236-353)||(49144033-49144149)
chr3 (128-352)||(31045165-31045388)
chr3 (236-353)||(34045762-34045878)
chr3 (236-353)||(46701595-46701712)
chr3 (246-352)||(4178199-4178305)
chr3 (246-352)||(4172201-4172307)
chr3 (392-441)||(54681980-54682029)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (20-441)||(15036209-15036631)
chr8 (20-441)||(45064411-45064822)
chr8 (20-441)||(39938697-39939119)
chr8 (20-441)||(43211676-43212097)
chr8 (20-441)||(43188219-43188641)
chr8 (20-423)||(39846485-39846892)
chr8 (20-441)||(39252179-39252594)
chr8 (20-441)||(41249570-41249976)
chr8 (20-428)||(489124-489531)
chr8 (20-428)||(42485024-42485440)
chr8 (20-441)||(40076740-40077153)
chr8 (20-441)||(34822497-34822923)
chr8 (134-441)||(5303702-5304010)
chr8 (120-390)||(39601985-39602256)
chr8 (20-254)||(25864609-25864842)
chr8 (118-408)||(2984390-2984681)
chr8 (126-366)||(24249759-24249999)
chr8 (126-353)||(37327080-37327286)
chr8 (236-366)||(35552051-35552182)
chr8 (20-108)||(39601873-39601961)
chr8 (236-366)||(20857671-20857802)
chr8 (236-353)||(25097-25214)
chr8 (236-353)||(1052910-1053027)
chr8 (236-353)||(23021891-23022008)
chr8 (236-353)||(26659832-26659949)
chr8 (20-108)||(35026657-35026745)
chr8 (272-366)||(34371450-34371545)
chr8 (236-361)||(45128135-45128261)
chr8 (20-84)||(5304009-5304073)
chr8 (236-366)||(5677456-5677587)
chr8 (47-183)||(45127946-45128082)
chr8 (147-191)||(35026740-35026784)
chr8 (238-352)||(22495305-22495419)
chr8 (159-215)||(22495216-22495272)
chr8 (74-102)||(489082-489110)
chr8 (368-408)||(24249992-24250032)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (20-441)||(17835247-17835668)
chr7 (20-441)||(27453100-27453522)
chr7 (20-418)||(10517151-10517549)
chr7 (20-441)||(34738534-34738958)
chr7 (20-441)||(47776503-47776926)
chr7 (20-441)||(39460698-39461120)
chr7 (20-441)||(47672566-47672988)
chr7 (20-428)||(15073723-15074130)
chr7 (20-428)||(42507522-42507929)
chr7 (20-441)||(36977766-36978190)
chr7 (20-441)||(9494277-9494709)
chr7 (20-441)||(37340474-37340896)
chr7 (47-427)||(14689553-14689933)
chr7 (236-353)||(41880876-41880993)
chr7 (126-352)||(17741019-17741255)
chr7 (236-353)||(35609986-35610103)
chr7 (236-353)||(48403743-48403860)
chr7 (236-352)||(556217-556333)
chr7 (236-353)||(45257374-45257490)
chr7 (236-353)||(46740117-46740234)
chr7 (236-366)||(5541096-5541227)
chr7 (250-366)||(16675186-16675303)
chr7 (250-366)||(17649554-17649671)
chr7 (236-353)||(9370960-9371073)
chr7 (236-316)||(17465328-17465408)
chr7 (236-316)||(17587806-17587886)
chr7 (318-353)||(17462864-17462899)
chr7 (318-353)||(17590315-17590350)
chr7 (128-183)||(41734441-41734496)
chr7 (20-106)||(556462-556547)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (20-418)||(233-625)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (20-441)||(15103-15525)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (20-440)||(52802300-52802722)
chr1 (20-441)||(35258354-35258775)
chr1 (20-428)||(30890232-30890639)
chr1 (20-441)||(23275585-23276011)
chr1 (13-441)||(47502478-47502895)
chr1 (68-440)||(31783210-31783587)
chr1 (13-441)||(45825050-45825469)
chr1 (57-441)||(19527024-19527409)
chr1 (20-441)||(51320884-51321305)
chr1 (20-428)||(19924927-19925320)
chr1 (20-242)||(29622105-29622327)
chr1 (126-407)||(49857461-49857740)
chr1 (20-353)||(22524297-22524636)
chr1 (20-218)||(11183348-11183549)
chr1 (236-366)||(47656256-47656386)
chr1 (73-366)||(2424924-2425224)
chr1 (236-353)||(2365622-2365739)
chr1 (236-353)||(19156401-19156518)
chr1 (236-366)||(21141413-21141544)
chr1 (236-366)||(50343525-50343656)
chr1 (236-353)||(3731951-3732068)
chr1 (236-353)||(13639593-13639710)
chr1 (236-353)||(26876043-26876160)
chr1 (118-214)||(11196148-11196244)
chr1 (236-366)||(97504-97635)
chr1 (236-352)||(17514267-17514383)
chr1 (277-353)||(38127052-38127128)
chr1 (20-81)||(2425528-2425589)
chr1 (236-324)||(8474171-8474259)
chr1 (389-441)||(19526837-19526889)
chr1 (389-434)||(19524674-19524719)
chr1 (389-434)||(19524861-19524906)
chr1 (389-434)||(19525522-19525567)
chr1 (389-434)||(19526657-19526702)
chr1 (20-52)||(31783587-31783619)
chr1 (128-183)||(38127223-38127278)
chr1 (74-102)||(30890653-30890681)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (27-441)||(31768877-31769297)
chr6 (20-441)||(24088263-24088687)
chr6 (118-441)||(6320044-6320368)
chr6 (236-353)||(6201534-6201651)
chr6 (236-353)||(11688501-11688618)
chr6 (236-353)||(22301566-22301683)
chr6 (236-353)||(30829222-30829339)
chr6 (236-352)||(21600990-21601106)
chr6 (236-366)||(24722314-24722445)
chr6 (237-366)||(26423384-26423514)
chr6 (236-353)||(27617101-27617218)
chr6 (236-366)||(3501555-3501686)
chr6 (47-392)||(3380971-3381315)
chr6 (20-80)||(6320371-6320431)
chr6 (129-214)||(30424143-30424228)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (20-353)||(7588-7921)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (20-233)||(8374-8586)
scaffold0155 (257-353)||(10761-10857)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (20-212)||(40746-40937)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (20-107)||(18111-18198)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (20-107)||(54646-54733)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (237-366)||(18489-18619)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (236-353)||(4224-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (168-351)||(251048-251230)
scaffold0007 (276-324)||(246180-246228)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40358183 - 40357762
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  40358183 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 40358084  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358083 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 40357984  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357983 ctatgttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 40357884  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357883 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 40357784  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||| |||||| |||| ||||||    
T  40357783 ttaagttacgagaattatgatg 40357762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21022791 - 21022370
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  21022791 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttttaaa 21022692  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21022691 aaaattgagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 21022592  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21022591 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 21022492  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21022491 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagt 21022392  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  21022391 ttaggttacgagaattatgatg 21022370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 50274904 - 50275326
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |       | ||    
T  50274904 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttaatttttaaaaaa 50275003  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50275004 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 50275103  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50275104 ctatgttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 50275203  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50275204 aatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttag 50275303  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    | ||||||||| |||| ||||||    
T  50275304 tgtaggttacgagaattatgatg 50275326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 441
Target Start/End: Original strand, 51683360 - 51683794
Alignment:
Q  10 accaaatcaatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgan 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |     
T  51683360 accaaaccattttcacgaattgcaagcaaatcaactacacattatcacaagtaagttatatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttat 51683459  T
Q  110 nnnnnnagaaaa--attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaa 207  Q
          | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  51683460 ttttaaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaa 51683559  T
Q  208 tgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttg 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51683560 tgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg 51683659  T
Q  308 ataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttga 406  Q
    || ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51683660 atcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattga 51683759  T
Q  407 ttttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51683760 ttttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 51683794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30726643 - 30726236
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  30726643 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttaaaaa 30726544  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  30726543 aaatt-gagtagtttgcatttggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcacgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgc 30726445  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30726444 ctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 30726345  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30726344 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatactttggttaagtttattttgattttttagttagt 30726245  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  30726244 ttaggttac 30726236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 55407694 - 55407268
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  55407694 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 55407595  T
Q  120 aaa----ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttg 215  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  55407594 aaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 55407495  T
Q  216 ttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  55407494 ttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcgaatg 55407395  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttag 414  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  55407394 cctcattgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttcgttaagtgtatattgattttttag 55407295  T
Q  415 ttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55407294 ttagtttaggttacgagaattatgatg 55407268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1309016 - 1308609
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  1309016 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaa 1308917  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  1308916 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 1308818  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1308817 atatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 1308718  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1308717 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 1308618  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  1308617 ttaggttac 1308609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 440
Target Start/End: Original strand, 50901657 - 50902070
Alignment:
Q  26 gaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||||||||    
T  50901657 gaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaa-aaaaatta 50901755  T
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50901756 gagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgt 50901855  T
Q  226 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 325  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50901856 tgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgac 50901955  T
Q  326 aattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttagg 424  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50901956 aattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 50902054  T
Q  425 ttacgggaatgatgat 440  Q
    ||||| |||| |||||    
T  50902055 ttacgagaattatgat 50902070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1089486 - 1089079
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         ||    
T  1089486 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttttaaa 1089387  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  1089386 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcaagtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 1089288  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1089287 atatgtagtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 1089188  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1089187 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 1089088  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  1089087 ttaggttac 1089079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48256475 - 48256052
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| |       | ||    
T  48256475 tttcacgaattgcaaacaaatcaactgcacattatcacaagtaaattgtatcaatcattttaatgataatattagtttgcttaggtttatttttttaaaa 48256376  T
Q  120 aaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  48256375 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 48256276  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  48256275 cctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 48256176  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtta 417  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  48256175 caatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtta 48256076  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||| | |||| ||||||    
T  48256075 gtttaggttatgagaattatgatg 48256052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 119 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37021887 - 37021559
Alignment:
Q  119 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37021887 aaaattagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttg 37021788  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  37021787 catatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgctt 37021688  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtg-----tattttgatttttt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| || |||||||    
T  37021687 caatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattatattaatttttt 37021588  T
Q  413 agttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37021587 agttagtttaggttacgagaattatgatg 37021559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 67762 - 68094
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  67762 tttcacgaattgcaagaaaatcaaccgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatga-aatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 67860  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  67861 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttaatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgc 67960  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  67961 ctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctc 68060  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  68061 aatgaaaattatattgattatttagttagtttag 68094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 46436415 - 46436747
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |       |       
T  46436415 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatgttaatgttagtttgtttaggttaagtttttaattt 46436514  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
       || |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||    
T  46436515 ttttttgagtagtttgcacgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgc 46436613  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  46436614 ttatgctgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 46436713  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436714 aatggcaattttattgattatttagttagtttag 46436747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21538364 - 21537975
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |         ||    
T  21538364 tttcacgaattgcaagcaaatcaaccacacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttttaaa 21538265  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||| ||     |||||| |||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21538264 aatata-agtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgggtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 21538166  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 309  Q
    ||||||||||||||| ||          ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21538165 ctatgttgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgat 21538066  T
Q  310 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatt 408  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21538065 aaaatgcctcaatgataattatattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattgatt 21537975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 126 - 392
Target Start/End: Original strand, 14315650 - 14315927
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14315650 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14315749  T
Q  226 tgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  14315750 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatg 14315849  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgat 392  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14315850 cccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttgat 14315927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10753312 - 10752983
Alignment:
Q  47 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 146  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |       | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10753312 cacattatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttta-aaaaatatgagtagtttgcatgtggttag 10753214  T
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcat--------- 237  Q
    |||| ||     |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||             
T  10753213 ggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatga 10753114  T
Q  238 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 336  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10753113 taatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattga 10753014  T
Q  337 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10753013 ttatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10967081 - 10966752
Alignment:
Q  47 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 146  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |       | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10967081 cacattatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttta-aaaaatatgagtagtttgcatgtggttag 10966983  T
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcat--------- 237  Q
    |||| ||     |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||             
T  10966982 ggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatga 10966883  T
Q  238 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 336  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10966882 taatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattga 10966783  T
Q  337 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10966782 ttatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050037
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatt 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtatattgatt 11050037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 372
Target Start/End: Original strand, 14297401 - 14297658
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14297401 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14297500  T
Q  226 tgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  14297501 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatg 14297600  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaat 372  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14297601 cccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaat 14297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11083918 - 11083562
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  11083918 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatcttaatgttagtttgtttaggttaagttttgaaaaa 11083819  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  11083818 aaatt-gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgc 11083720  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 309  Q
    ||||| ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||     
T  11083719 ctatgctgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgac 11083620  T
Q  310 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||| |  ||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  11083619 aaaatgcccaaatgaaaattgtactgattattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798568
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  336 attatttagttagtt 350  Q
    |||||||||||||||    
T  41798582 attatttagttagtt 41798568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023099
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892838
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9892855 attatttagttagtttag 9892838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030217
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181360
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6181377 attatttagttagtttag 6181360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090923
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49090906 attatttagttagtttag 49090923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165536
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49165519 attatttagttagtttag 49165536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 353
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704526
Alignment:
Q  246 tttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 345  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  || | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  346 tagtttag 353  Q
    ||||||||    
T  30704519 tagtttag 30704526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 8109563 - 8109649
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8109563 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtt 8109649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422201
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttga-taaaatgtctcaatgacaattttatt 334  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  335 gattatttagttagtttag 353  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttag 31422201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679645
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44679662 attatttagttagtttag 44679645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193982
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaa-cacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||  |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  335 gattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttag 50193982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41933308 - 41933179
Alignment:
Q  238 aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgat 337  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||    
T  41933308 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgat 41933209  T
Q  338 tatttagttagtttag-ttatggaaatgat 366  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41933208 tattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 351
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184457
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  336 attatttagttagttt 351  Q
     |||||||||||||||    
T  3184442 tttatttagttagttt 3184457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185456
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  336 attatttagttagttt 351  Q
     |||||||||||||||    
T  3185471 tttatttagttagttt 3185456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185664
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  336 attatttagttagttt 351  Q
     |||||||||||||||    
T  3185679 tttatttagttagttt 3185664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4720163 - 4719949
Alignment:
Q  128 gtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | | |||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||             
T  4720163 gtagtttgcatgtggttagggtttacgtaagaattgacattttgatgattgcgtgtgtagtttatgaattggtaaatgaatgtaattgatg--------- 4720073  T
Q  228 tttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaa 327  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  4720072 tttaagt-agaatgtgattttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaa 4719974  T
Q  328 ttttattgattatttagttagttta 352  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||    
T  4719973 ttgcattgattatttacttagttta 4719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41933524 - 41933352
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |         ||    
T  41933524 tttcacgatttgcaagcaa-tcatctccacattatcacaagtaagtagaattaatcaatgtaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttttaaa 41933426  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaat 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  41933425 aaatt-gagtagtttgcatgtggatagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgca--tgtagtttataaat 41933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37021936 - 37021903
Alignment:
Q  75 cattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37021936 cattttaatgataatgttaatttgtttaggttga 37021903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1308595 - 1308567
Alignment:
Q  74 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308595 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 1308567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8580408 - 8579994
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  8580408 tttcacgaattgcaagcaaaccaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 8580309  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580308 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 8580209  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8580208 ctatgttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 8580109  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580108 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 8580009  T
Q  420 ttaggttacgggaat 434  Q
    |||||||||| ||||    
T  8580008 ttaggttacgagaat 8579994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 28876813 - 28877234
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  28876813 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtggccattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 28876912  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28876913 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgaattcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattaaatgtagttgttgc 28877012  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877013 ctatattgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 28877112  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877113 aatgacaattttattgattatttagttagtttggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 28877212  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  28877213 ttaggttacgagaattatgatg 28877234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 7757494 - 7757916
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  7757494 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 7757593  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7757594 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 7757693  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7757694 ctatgttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 7757793  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7757794 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 7757893  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  7757894 tttaggttacgagaattatgatg 7757916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19228582 - 19228154
Alignment:
Q  13 aaatcaatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnn 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |        
T  19228582 aaatcattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt 19228483  T
Q  113 nnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 212  Q
         ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19228482 ttttaaaaaaatatagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtag 19228383  T
Q  213 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19228382 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaa 19228283  T
Q  313 atgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttt 411  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19228282 atgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttt 19228183  T
Q  412 tagttagtttaggttacgggaatgatgat 440  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19228182 tagttagtttaggttatgagaattatgat 19228154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42942383 - 42941968
Alignment:
Q  27 aattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaa-tta 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||||| |||    
T  42942383 aattgcaagcaaatcaaccgcacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaatta 42942284  T
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42942283 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 42942184  T
Q  226 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 325  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42942183 tgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgac 42942084  T
Q  326 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttagg 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42942083 aattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 42941985  T
Q  425 ttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  42941984 ttacgagaattatgatg 42941968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28241701 - 28241294
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  28241701 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtaccaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttaaaaa 28241602  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  28241601 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 28241503  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28241502 ctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 28241403  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28241402 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 28241303  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  28241302 ttaggttac 28241294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14592 - 14246
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  14592 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 14493  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  14492 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgaaaatttgatgattgcatgcgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgc 14393  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14392 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 14293  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgat 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14292 aatgataattttattgattatttagttagtttatgtatagaaatgat 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 38968265 - 38968690
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||         | ||    
T  38968265 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttctttttaaaaaa 38968364  T
Q  120 aa--attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38968365 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 38968464  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtt-tgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  38968465 gcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgc 38968564  T
Q  317 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagt 415  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  38968565 ctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgtttttttggt 38968664  T
Q  416 tagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38968665 tagtttaggttacgggaattatgatg 38968690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 512675 - 512253
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  512675 tttcatgaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 512576  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  512575 aaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgt 512476  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||    
T  512475 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctc 512376  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  512375 aatgaaaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtatattgattttttagttag 512276  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  512275 tttaggttatgagaattatgatg 512253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 24 - 441
Target Start/End: Original strand, 42537317 - 42537741
Alignment:
Q  24 acgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaa-- 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |       | ||||      
T  42537317 acgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagcaagttgtatcaatcattttaatgataatgttggtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaat 42537416  T
Q  122 ----attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42537417 aaaaattagagtagtttgcatgttgttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 42537516  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  42537517 gcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 42537616  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42537617 tcaatgaaatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 42537716  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||    
T  42537717 agttaaggttacgagaattatgatg 42537741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8702126 - 8701719
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||  | | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |       | ||    
T  8702126 tttcacgaattgcaagttaatcatccccacattatcacaagtaagtactattaatcattgcaatcttaatgttaatttgtttaggttaagtttttaa-aa 8702028  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8702027 aaatttgagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgc 8701928  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8701927 atatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 8701828  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8701827 aatgaaaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattgtttagttag 8701728  T
Q  419 tttaggtta 427  Q
    |||||||||    
T  8701727 tttaggtta 8701719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 17658493 - 17658914
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||    |||||||||||| ||||||    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |       | ||    
T  17658493 tttcacgaattgcaagacaatcatccccacattatcacaggtaagtaccattaatcattgcaatgttaatgttaatttgtttaggttaagtttttta-aa 17658591  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||    
T  17658592 aaatttgagtagtttgtatgtggttaggtttgataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggc 17658691  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  17658692 ctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctc 17658791  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17658792 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 17658891  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  17658892 tttaggttatgagaattatgatg 17658914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40624720 - 40624484
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40624720 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 40624622  T
Q  226 tgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40624621 tgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 40624522  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624521 ccttaataacaattttattgattatttagttagtttag 40624484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 363
Target Start/End: Original strand, 20422210 - 20422463
Alignment:
Q  121 aattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcc 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20422210 aatttgagtagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgacaatttgatgattggatgtgtagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtc 20422309  T
Q  221 tatgttgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgata 310  Q
    |||||| ||||||| ||          ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20422310 tatgttatttaaatgatgttctagtataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgata 20422409  T
Q  311 aaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaat 363  Q
    ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20422410 aaatgccccaatgacaattattttgattatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040687
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19040704 attatttagttagtttag 19040687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197490
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673224
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  336 attatttagttagttta 352  Q
    |||||||||||||||||    
T  27673240 attatttagttagttta 27673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705639
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  || | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30705622 attatttagttagtttag 30705639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28241280 - 28241252
Alignment:
Q  74 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241280 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 28241252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 17420719 - 17421145
Alignment:
Q  1 ccatttcctaccaaatcaatttcacgaattg-caagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420719 ccatttcctaccaaatccatttcacgaattctcaacct--tcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgt 17420816  T
Q  100 ttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattga 199  Q
    |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420817 ttaggttgatttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattga 17420916  T
Q  200 taattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacacca 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17420917 tcattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatca 17421016  T
Q  300 agtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17421017 agtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagttt 17421116  T
Q  400 attttgattttttagttagtttaggttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421117 attttgattttttagttagtttaggttac 17421145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 28468811 - 28469232
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  28468811 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttgaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 28468910  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28468911 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtaattgttgc 28469010  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28469011 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 28469110  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469111 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 28469210  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  28469211 ttaggttacgagaattatgatg 28469232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 45428760 - 45429182
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  45428760 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 45428859  T
Q  120 aa-attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428860 aaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaaatgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 45428959  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45428960 cctacgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtct 45429059  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45429060 caatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 45429159  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  45429160 tttaggttacgagaattatgatg 45429182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 21998360 - 21998737
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  21998360 tttcacgaattgcaagcaaatcaattgtacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 21998459  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||     
T  21998460 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagtaattgataattgaatttatttgttgt 21998559  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21998560 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 21998659  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21998660 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 39947769 - 39948192
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnn-aga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||        | |    
T  39947769 tttcacgaattgcaagcaaatcaacggcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatatgtttaggttgattttttttaaa 39947868  T
Q  119 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39947869 aaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttg 39947968  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39947969 cctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 39948068  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39948069 caatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtta 39948168  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  39948169 gtttaggttacgagaattatgatg 39948192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32956258 - 32955840
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  32956258 tttcacaaatagcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgccaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 32956159  T
Q  120 aaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  32956158 aaaattagagtagtttgtatgtggtttgggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttg 32956059  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  32956058 cctatgttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcct 32955959  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtta 417  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  32955958 caatgacaat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg-gtaagtgtatattgattttttagtta 32955864  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  32955863 gtttaggttacgagaattatgatg 32955840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 25964982 - 25965308
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  25964982 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 25965081  T
Q  120 aaat--------tagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgta 211  Q
    ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25965082 aaataaaaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgta 25965181  T
Q  212 gttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25965182 gttgtttcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataa 25965281  T
Q  312 aatgtctcaatgacaattttattgatt 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25965282 aatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Original strand, 7185198 - 7185481
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       | ||    
T  7185198 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaataattttaatgttaatgttgatttgtttaggttgatttttaaaaaa 7185297  T
Q  120 aaat-tagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7185298 aaaaatagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgtttaggaattgataaatgaatgtagttgttg 7185397  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7185398 cctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45137335 - 45137111
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |       | ||    
T  45137335 tttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgatagtgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 45137236  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45137235 aaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgc 45137136  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgg 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  45137135 ctatgttatttaaatcataatgtgg 45137111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136784
Alignment:
Q  259 aaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttat 357  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||| ||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt-----------tagtttaggttat 45136868  T
Q  358 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 45136784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 441
Target Start/End: Original strand, 22686849 - 22686970
Alignment:
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22686849 caatgacaattt-agtgattatttagttagtttagttatggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 22686947  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  22686948 tttaggttacgagaattatgatg 22686970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401160
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  336 attatttagttagtttag-ttatggaaatgat 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29401191 attatttagttagtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938399
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20938382 attatttagttagtttag 20938399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 42505664 - 42505582
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505664 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 42505582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284675
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45284658 attatttagttagtttag 45284675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292038
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45292021 attatttagttagtttag 45292038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828581
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655906
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940299
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3940316 attatttagttagtttag 3940299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352468
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5352451 attatttagttagtttag 5352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831631
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15831614 attatttagttagtttag 15831631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496517
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30496534 attatttagttagtttag 30496517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979023
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43979006 attatttagttagtttag 43979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25515496 - 25515366
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25515496 ataatgtggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattg 25515398  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25515397 attattgagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539308
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43539325 attatttagttagtttag 43539308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Original strand, 31367308 - 31367397
Alignment:
Q  129 tagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||| | |||||||  |||| |||| ||||| || ||||||    
T  31367308 tagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatatatagtttatgaatttataaatgaatttatttgttg 31367397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35464398 - 35464313
Alignment:
Q  129 tagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||| || || |   |||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  35464398 tagtttgcatgtggttaggatttatgtatgaattgacattctgatgattgcatgtgtagtttatgaatttataaatgaatgtagtt 35464313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25515606 - 25515543
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagttta 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  25515606 gagtagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgaaattttgatgattgca--tgtagttta 25515543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 3975876 - 3976298
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  3975876 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 3975975  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3975976 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattggcaattgaatgtagttgttgc 3976075  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3976076 ctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 3976175  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3976176 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 3976275  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  3976276 tttaggttacgagaattatgatg 3976298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4008226 - 4007804
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  4008226 tttcacgaatagcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 4008127  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4008126 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 4008027  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4008026 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 4007927  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4007926 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 4007827  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||  |||| ||||||    
T  4007826 tttaggttacaagaattatgatg 4007804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 42165333 - 42165754
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  42165333 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtccatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgatttttaaa-aa 42165431  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42165432 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 42165531  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  42165532 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 42165631  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42165632 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 42165731  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  42165732 tttaggttacgagaattatgatg 42165754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 50963124 - 50963545
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  50963124 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgtacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 50963223  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50963224 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 50963323  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50963324 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgataaaatgcctc 50963423  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50963424 agtgacaattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 50963522  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  50963523 tttaggttacgagaattatgatg 50963545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 44229885 - 44230305
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  44229885 tttcacgaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttaa--aaaa 44229982  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44229983 aaatcagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 44230082  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  44230083 ctatgttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctc 44230182  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44230183 aatgacaattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 44230282  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  44230283 tttaggttacgagaattatgatg 44230305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47074112 - 47073688
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  47074112 tttcacgaatagcaagcaaatcaaccgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 47074013  T
Q  120 aa--attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47074012 aataaatagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgaatgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtt 47073913  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  47073912 gcctatattgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcc 47073813  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47073812 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 47073713  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  47073712 agtttaggttacgagaattatgatg 47073688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 42756323 - 42756743
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  42756323 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtcagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 42756422  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||     
T  42756423 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgt 42756522  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  42756523 ctatgttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 42756622  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42756623 aatgaaaa--ttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 42756720  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  42756721 tttaggttatgagaattatgatg 42756743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30255905 - 30255483
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |       | ||    
T  30255905 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataaggttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 30255806  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30255805 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaagttgacaatttgatgattgcatgtttagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgc 30255706  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  30255705 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 30255606  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30255605 aatgaaatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 30255506  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  30255505 tttaggttatgagaattatgatg 30255483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3501797 - 3501477
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  3501797 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 3501698  T
Q  120 aaa--ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501697 aaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 3501598  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3501597 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtc 3501498  T
Q  318 tcaatgacaattttattgatt 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3501497 tcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49196350 - 49195928
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  49196350 tttcacgaattgcaagaaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcactttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 49196251  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49196250 aaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 49196151  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  49196150 ctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttc 49196051  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49196050 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtatattgattttttagttag 49195951  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||| ||||  |||| ||||||    
T  49195950 tttagcttacaagaattatgatg 49195928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20917919 - 20917496
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |       | ||    
T  20917919 tttcacgaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatcttaatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 20917821  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20917820 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 20917721  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20917720 ctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 20917621  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaa--gtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20917620 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagtt 20917521  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  20917520 agtttaggttacgagaattatgatg 20917496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20926881 - 20926458
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |       | ||    
T  20926881 tttcacgaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatcttaatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 20926783  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20926782 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 20926683  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20926682 ctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 20926583  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaa--gtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20926582 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagtt 20926483  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  20926482 agtttaggttacgagaattatgatg 20926458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 50216783 - 50216399
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||       |       
T  50216783 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgtaaatttgtttaggttgatttttttattt 50216684  T
Q  120 --aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50216683 ttaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgtt 50216584  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||      
T  50216583 gcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgct 50216484  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50216483 tcaatgacaattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50216399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 48888906 - 48889326
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |       | ||    
T  48888906 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaagtttatttaaaaataa 48889005  T
Q  120 aa-------attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 212  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  48889006 aaataaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtag 48889105  T
Q  213 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48889106 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaa 48889205  T
Q  313 atgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttt 411  Q
    | | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48889206 aggcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttt 48889296  T
Q  412 tagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  48889297 tagttagtttaggttatgagaattatgatg 48889326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 596929 - 597261
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||          |    
T  596929 tttcacgaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgatttttttttta 597028  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  597029 aa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttaaatattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 597127  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  597128 ccatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 597227  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  597228 aatgacaattttattgattatttagttagcttag 597261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 441
Target Start/End: Original strand, 48563105 - 48563519
Alignment:
Q  13 aaatcaatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnn 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |        
T  48563105 aaatcattttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcataagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt 48563204  T
Q  113 nnnagaaaaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgta 211  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    || ||    
T  48563205 aaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtctatgaattgataa----atata 48563300  T
Q  212 gttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataa 311  Q
    ||||            ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  48563301 gttg------------tttaaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatca 48563388  T
Q  312 aatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatttt 410  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48563389 aatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttt 48563488  T
Q  411 ttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  48563489 ttagttagtttagattacaagaattatgatg 48563519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 116 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42806061 - 42805742
Alignment:
Q  116 agaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttg 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||        |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  42806061 agaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgataatt--------gcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 42805970  T
Q  216 ttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  42805969 ttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatg 42805870  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttga-tttttta 413  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  42805869 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaggtgtatattgattttttta 42805770  T
Q  414 gttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  42805769 gttagtttaggttatgagaattatgatg 42805742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 51807139 - 51807413
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |       | ||    
T  51807139 tttcacaaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgtcagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 51807238  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51807239 aaattagagtagtttgcatgtggttatgattgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttgttgt 51807338  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51807339 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611594
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047659
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390966
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52390983 attatttagttagtttag 52390966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567619
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgata 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgata 17567619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 355
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612872
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  336 attatttagttagtttagtt 355  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41612853 attatctagttagtttagtt 41612872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274484
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2274501 attatttagttagtttag 2274484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009362
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29009345 attatttagttagtttag 29009362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127939
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36127922 attatttggttagtttag 36127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903760
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42903777 attatttagttagtttag 42903760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389464
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46389447 attatttagttagtttag 46389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480354
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50480371 attatttagttagtttag 50480354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386626
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54386609 attatttagttagtttag 54386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351161
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat-aaaatgtctcaatgacaattttatt 334  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacacat-ttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  335 gattatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144033
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49144050 attatttagttagtttag 49144033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 31045388 - 31045165
Alignment:
Q  128 gtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||    || ||    
T  31045388 gtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttataaattgataaacgaatgtagttaatgtaattgatg 31045289  T
Q  228 tttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaa 327  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  31045288 tttaagtaa-aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaa 31045190  T
Q  328 ttttattgattatttagttagttta 352  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||    
T  31045189 ttgcatttattatttagttagttta 31045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045878
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34045861 attatttagttagtttag 34045878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701595
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||  ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46701612 attatttagttagtttag 46701595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 352
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178305
Alignment:
Q  246 tttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 345  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  346 tagttta 352  Q
    |||||||    
T  4178299 tagttta 4178305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 352
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172307
Alignment:
Q  246 tttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 345  Q
    |||||||||||  ||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  346 tagttta 352  Q
    |||||||    
T  4172301 tagttta 4172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Original strand, 54681980 - 54682029
Alignment:
Q  392 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  54681980 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 54682029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15036631 - 15036209
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | ||    
T  15036631 tttcgcgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaaataagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtttatttttttaaaa 15036532  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15036531 aaattagagtggtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttcaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 15036432  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15036431 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 15036332  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatga-tgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15036331 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 15036232  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  15036231 tttaggttacgagaattatgatg 15036209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 45064411 - 45064822
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  45064411 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 45064510  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064511 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 45064610  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45064611 ctatgttgtttaaatcttaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat----------ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 45064700  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064701 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 45064800  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||| | |||| ||||||    
T  45064801 ttaggttaggagaattatgatg 45064822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39939119 - 39938697
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  39939119 tttcacgaattgaaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaa 39939020  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39939019 aaattagagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattacatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 39938920  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39938919 ctatgttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctc 39938820  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39938819 aatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 39938720  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    | ||||||||| |||| ||||||    
T  39938719 tgtaggttacgagaattatgatg 39938697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 43211676 - 43212097
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||       | ||    
T  43211676 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattaccacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgttttggttgattttttta-aa 43211774  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43211775 aaattagagtagtttgtatgtgcttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 43211874  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43211875 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 43211974  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43211975 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 43212074  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  43212075 tttaggttacgagaattatgatg 43212097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 43188219 - 43188641
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  43188219 tttcaagaattgcaagcaaatcaactgcatattgtcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 43188318  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||     
T  43188319 aaattagagtagtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgt 43188418  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  43188419 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttc 43188518  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43188519 aatgacaattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 43188618  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  43188619 tttaggttacgagaattatgatg 43188641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39846892 - 39846485
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnn---a 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |          |    
T  39846892 tttcacaaattgcaagcaaaccaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttataaa 39846793  T
Q  117 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 216  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39846792 aaaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgt 39846693  T
Q  217 tgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  39846692 tgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgataaactgt 39846593  T
Q  317 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39846592 ctccatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagt 39846493  T
Q  416 tagtttag 423  Q
    ||||||||    
T  39846492 tagtttag 39846485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 39252179 - 39252594
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  39252179 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcgttatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 39252278  T
Q  120 aaa---ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 216  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  39252279 aaaaaattagagtagtttgtatgtggttagg-ttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgt 39252377  T
Q  217 tgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252378 tgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 39252477  T
Q  317 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  39252478 ctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtatattgattttttagt 39252568  T
Q  416 tagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  39252569 tagtttaggttacgagaattatgatg 39252594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41249976 - 41249570
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||    
T  41249976 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttttttaa 41249877  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41249876 aaattagagtagtttgcatgtggttagggtagattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 41249777  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||                | || | |    
T  41249776 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac----------------attgccgc 41249693  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41249692 aatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 41249593  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    | ||||||||| |||| ||||||    
T  41249592 tgtaggttacgagaattatgatg 41249570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 489531 - 489124
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  489531 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaaatttttaaaaa 489432  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |      |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  489431 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttacaaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 489333  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  489332 ctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 489233  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  489232 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 489133  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  489132 ttaggttac 489124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42485440 - 42485024
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  42485440 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaa 42485341  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  42485340 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 42485242  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42485241 ctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 42485142  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaa---------tgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42485141 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgatttt 42485042  T
Q  411 ttagttagtttaggttac 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42485041 ttagttagtttaggttac 42485024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40077153 - 40076740
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  40077153 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcagaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 40077054  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40077053 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattatatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgc 40076954  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  40076953 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 40076854  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||         | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40076853 aatgaaaattatattgattatttagttagtttag--------gttacagaaatgatgataattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagt 40076762  T
Q  420 ttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||| | |||| ||||||    
T  40076761 ttaggttatgagaattatgatg 40076740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34822923 - 34822497
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagta--agttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnag 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       |     
T  34822923 tttcacgaattgcaagcaaattaactgcacattatcacaagtataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaa 34822824  T
Q  118 aaaaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  34822823 aaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgt 34822724  T
Q  217 tgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||     
T  34822723 tgcctatgttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgc 34822624  T
Q  317 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttga-ttttttag 414  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  34822623 ctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttag 34822524  T
Q  415 ttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  34822523 ttagtttaggttatgagaattatgatg 34822497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 134 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5304010 - 5303702
Alignment:
Q  134 tgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5304010 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttcatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaa 5303911  T
Q  234 tcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttat 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  5303910 tcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatat 5303811  T
Q  334 tgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacggga 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5303810 tgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgaga 5303711  T
Q  433 atgatgatg 441  Q
    || ||||||    
T  5303710 attatgatg 5303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 120 - 390
Target Start/End: Original strand, 39601985 - 39602256
Alignment:
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39601985 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 39602084  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39602085 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 39602184  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39602185 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25864842 - 25864609
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  25864842 tttcacgaattgcaatcaaatcaactacacattatcacaagtaagttgtattaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 25864743  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25864742 atattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtag-ttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 25864644  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatgg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25864643 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 118 - 408
Target Start/End: Original strand, 2984390 - 2984681
Alignment:
Q  118 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || |||  |||||||| ||| |    
T  2984390 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgttaagatgtt-atagatgaatgtaattgat 2984488  T
Q  218 gcct--atgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
       |  ||| | ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2984489 ctttgaatgatttttaagt-ataatgtggttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 2984587  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatt 408  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2984588 cctcaacgacaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattgatt 2984681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 126 - 366
Target Start/End: Original strand, 24249759 - 24249999
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    ||     
T  24249759 gagtagtttgcatgtggttagggttgatataggaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 24249858  T
Q  226 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 325  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||     
T  24249859 tgtttaagt-ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgag 24249957  T
Q  326 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24249958 aattatattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 353
Target Start/End: Original strand, 37327080 - 37327286
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||                  
T  37327080 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgta-------------- 37327164  T
Q  226 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 325  Q
          ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37327165 ------aatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 37327258  T
Q  326 aattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327259 aattttattgattatttagttagtttag 37327286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552182
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 39601873 - 39601961
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39601873 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 39601961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857802
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25097
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25114 attatttagttagtttag 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053027
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1053010 attatttagttagtttag 1053027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021891
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23021908 attatttagttagtttag 23021891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659949
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26659932 attatttagttagtttag 26659949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 35026657 - 35026745
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35026657 tttcacgaattgcaagcaaattaactacacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttga 35026745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34371545 - 34371450
Alignment:
Q  272 ttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34371545 ttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggatatgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 361
Target Start/End: Original strand, 45128135 - 45128261
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||    
T  45128135 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattg 45128234  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaa 361  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  45128235 attattgagttagtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5304073 - 5304009
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5304073 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatg 5304009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  |||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Original strand, 45127946 - 45128082
Alignment:
Q  47 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 146  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |         ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  45127946 cacattatcacaagtaagtagcattaatcaatttaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttttaaaaaaattgagtagtttgcatgtggttat 45128045  T
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 183  Q
    ||||||| |   |||||| | ||||||||||||||||    
T  45128046 ggttgatgtaggaattgaaattttgatgattgcatgt 45128082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 191
Target Start/End: Original strand, 35026740 - 35026784
Alignment:
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagttta 191  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35026740 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttta 35026784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 352
Target Start/End: Original strand, 22495305 - 22495419
Alignment:
Q  238 aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgat 337  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||     | |||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||    
T  22495305 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgat 22495404  T
Q  338 tatttagttagttta 352  Q
    |||||| ||||||||    
T  22495405 tatttacttagttta 22495419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Original strand, 22495216 - 22495272
Alignment:
Q  159 aattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttg 215  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  22495216 aattgacattttgatggttgcatgtgtagtttacgaattgataaatgaatgtagttg 22495272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 489110 - 489082
Alignment:
Q  74 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  489110 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 489082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 408
Target Start/End: Original strand, 24249992 - 24250032
Alignment:
Q  368 gaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatt 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  24249992 gaaatgatgttaattttagtttgataaagtgtatattgatt 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 17835247 - 17835668
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       | ||    
T  17835247 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgt-tcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttgatttttttaaaa 17835345  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17835346 aaattagagtagtttgtatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 17835445  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17835446 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 17835545  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17835546 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 17835645  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  17835646 tttaggttacgagaattatgatg 17835668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27453522 - 27453100
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  27453522 tttcacaaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 27453423  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  27453422 aaattagagtagtttgcatgtggttagagttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttac 27453323  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27453322 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 27453223  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27453222 attgacaattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 27453123  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  27453122 tttaggttacgagaattatgatg 27453100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Original strand, 10517151 - 10517549
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  10517151 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagctgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaa-aa 10517249  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10517250 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 10517349  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10517350 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 10517449  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10517450 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 10517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 34738534 - 34738958
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  34738534 tttcacgaattgcaagcaaatcatctgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 34738633  T
Q  120 aa--attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34738634 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtt 34738733  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34738734 acctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtc 34738833  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34738834 tcgatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagtt 34738933  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||    
T  34738934 agtgtaagttacgagaattatgatg 34738958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 47776503 - 47776926
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  47776503 tttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaaggtgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 47776602  T
Q  120 aa-attagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47776603 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttg 47776702  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47776703 cctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtct 47776802  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtta 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  47776803 caatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagtta 47776902  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  47776903 gtttaggttacgagaattatgatg 47776926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 39460698 - 39461120
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  39460698 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 39460797  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39460798 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 39460897  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39460898 ctattttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 39460997  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39460998 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatgttttagttag 39461097  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||  |||| ||||||    
T  39461098 tttaggttacaagaattatgatg 39461120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47672988 - 47672566
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  47672988 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 47672889  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47672888 aaattatagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtataatctatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 47672789  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  47672788 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 47672689  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47672688 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttctagttag 47672589  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  47672588 tttaggttatgagaattatgatg 47672566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15074130 - 15073723
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |       | ||    
T  15074130 tttcacgaattgtaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatattaatttgtttatgttaagttttttaaaa 15074031  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  15074030 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgc 15073932  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15073931 ctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 15073832  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15073831 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 15073732  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  15073731 ttaggttac 15073723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42507929 - 42507522
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  42507929 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaacttgtgtcaaacattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaa 42507830  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| || ||     |||| | ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  42507829 aaatt-gactagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattaacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgc 42507731  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42507730 ctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 42507631  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42507630 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 42507531  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  42507530 ttaggttac 42507522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 36977766 - 36978190
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnn--ag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |         |     
T  36977766 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttttaaa 36977865  T
Q  118 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  36977866 aaaaatctgagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 36977965  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  36977966 gcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 36978065  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36978066 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 36978165  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||    
T  36978166 agtttaggttatgagaattatgatg 36978190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9494709 - 9494277
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  9494709 tttcacgaattccaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 9494610  T
Q  120 a-----------aattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaat 208  Q
    |           |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  9494609 ataaaataaaaaaattagagtagtttgcatgtggtttgggttgattttaaaattgaaaatttgatggttgcatgtgtaatttatgaattgataaatgaat 9494510  T
Q  209 gtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttga 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9494509 gtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttga 9494410  T
Q  309 taaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgat 407  Q
    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9494409 tcaaatgcgtcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgat 9494311  T
Q  408 tttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  9494310 tttttagttagtttaggttatgagaattatgatg 9494277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 37340474 - 37340896
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  37340474 tttcacgaattgcaagcaaatcaacagcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaacaataatgttagtttgtttaggtttatttttttaaaa 37340573  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||    
T  37340574 aaattatagtagtttggatgtggttaggattgattttaaaattgacaatttgatgatttcatgtgtagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgc 37340673  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  37340674 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 37340773  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||    
T  37340774 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtatattaatttgttagttag 37340873  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  37340874 tttaggttatgagaattatgatg 37340896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14689933 - 14689553
Alignment:
Q  47 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 146  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |       | |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  14689933 cacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatggtaatgttaatttgtttaggttaagtttttaaaaaaaattt-agtagtttgtatgtggttaa 14689835  T
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggt 246  Q
    | |||||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |    
T  14689834 gtttgataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagct 14689735  T
Q  247 ttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 346  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14689734 ttgaatagtggcaaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 14689635  T
Q  347 agttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggtta 427  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14689634 agtttatgttatggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtatattgattatttagttagtttatgtta 14689553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880993
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41880976 attatttagttagtttag 41880993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17741255 - 17741019
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    ||     
T  17741255 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgaagattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 17741156  T
Q  226 tgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 315  Q
    | ||||||| ||          ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17741155 tatttaaatgatgtttaagtataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatt 17741056  T
Q  316 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta 352  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17741055 cccaaatgagaattatattgattatttagttagttta 17741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609986
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35610003 attatttagttagtttag 35609986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403860
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48403843 attatttagttagtttag 48403860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 556333 - 556217
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  556333 ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattt 556234  T
Q  336 attatttagttagttta 352  Q
    |||||||||||||||||    
T  556233 attatttagttagttta 556217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257490
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaa-aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45257473 attatttagttagtttag 45257490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740117
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    |||||||| |||||||||    
T  46740134 attatttaattagtttag 46740117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541096
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || |  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  250 aatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 349  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  350 tta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  250 aatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 349  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  350 tta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370960
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9370977 attatttagttagtttag 9370960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465328
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17465328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587886
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17587886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462864
Alignment:
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17462864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 353
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590350
Alignment:
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17590350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Original strand, 41734441 - 41734496
Alignment:
Q  128 gtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  41734441 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 41734496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 556547 - 556462
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtt 106  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| |  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  556547 tttcacgatttgcaagcaa-tcatctccacattatcacaggtaagtagcattaatcaatgtaatgttaatgttagtttgtttaggtt 556462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 625 - 233
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||         ||    
T  625 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaat------ttgtttaggttgattttttttaaa 532  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  531 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 432  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  431 ctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgtttgataaaatgtctc 332  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  331 aatgacaattttattaattatttagttagtttagttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15103
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  15525 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcataagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaa-aa 15427  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15426 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttattgc 15327  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15326 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 15227  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttga-ttttttagtta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15226 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttggtta 15127  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||  |||| ||||||    
T  15126 gtttaggttacaagaattatgatg 15103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 440
Target Start/End: Original strand, 52802300 - 52802722
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnn-aga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        | |    
T  52802300 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttaaa 52802399  T
Q  119 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  52802400 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttg 52802499  T
Q  219 cctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 318  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52802500 cttatgttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtct 52802599  T
Q  319 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtta 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  52802600 caatgacaattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttgtta 52802699  T
Q  418 gtttaggttacgggaatgatgat 440  Q
    |||||||||| | |||| |||||    
T  52802700 gtttaggttaagagaattatgat 52802722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35258775 - 35258354
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  35258775 tttcatgaattgcaagcatatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggtttatttttaaa-aa 35258677  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35258676 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgc 35258577  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  35258576 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 35258477  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttag 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35258476 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 35258377  T
Q  419 tttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  35258376 tttaggttatgagaattatgatg 35258354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Original strand, 30890232 - 30890639
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  30890232 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaa 30890331  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  30890332 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 30890430  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30890431 ctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 30890530  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30890531 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 30890630  T
Q  420 ttaggttac 428  Q
    |||||||||    
T  30890631 ttaggttac 30890639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23276011 - 23275585
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  23276011 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacgttatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 23275912  T
Q  120 aaa----ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttg 215  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23275911 aaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttttaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 23275812  T
Q  216 ttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaat-ggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23275811 ttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 23275712  T
Q  315 gtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatttttta 413  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23275711 gcctcaatgaaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgatttttta 23275613  T
Q  414 gttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23275612 gttagtttaggttacgagaattatgatg 23275585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 441
Target Start/End: Original strand, 47502478 - 47502895
Alignment:
Q  13 aaatcaatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnn 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |        
T  47502478 aaatcatttttacgaattgcaaacaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt 47502577  T
Q  113 nnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 212  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  47502578 ttaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtag 47502677  T
Q  213 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47502678 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttggtaaa 47502777  T
Q  313 atgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatttttt 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47502778 atgcctcaatgacaattttattgattatttagtta-----------gaggttatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttt 47502866  T
Q  413 agttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  47502867 agttagtttaggttacaagaattatgatg 47502895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 68 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31783587 - 31783210
Alignment:
Q  68 tgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnn----agaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31783587 tgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtttattttttataaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattg 31783488  T
Q  164 agaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatg 263  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31783487 acaatttgatgattgtatgtgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatg 31783388  T
Q  264 aacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttatggaaa 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31783387 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaa 31783288  T
Q  363 tgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaatgatgat 440  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31783287 tgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgat 31783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 441
Target Start/End: Original strand, 45825050 - 45825469
Alignment:
Q  13 aaatcaatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnn 112  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||   || |        
T  45825050 aaatcattttcacgaattgccagcaaatcaatcgcatattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttattt---ttaaa--- 45825143  T
Q  113 nnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 212  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45825144 -----aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtag 45825238  T
Q  213 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatac-tttgcacaccaagtgtttgataa 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  45825239 ttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtgtttgatca 45825338  T
Q  312 aatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgatttt 410  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45825339 aatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttt 45825438  T
Q  411 ttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  45825439 ttagttagtttaagttacgagaattatgatg 45825469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 57 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19527409 - 19527024
Alignment:
Q  57 caagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||       | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19527409 caagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaagttgattttaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttatggttgatttt 19527310  T
Q  157 aaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtg 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19527309 aaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtg 19527210  T
Q  257 gcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gtt 355  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  19527209 gcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaatttaggtt 19527110  T
Q  356 atggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  19527109 atgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatg 19527024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Original strand, 51320884 - 51321305
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtca--atcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnag 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       |     
T  51320884 tttcacgaattggaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgaataataatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttta--aa 51320981  T
Q  118 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51320982 aaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 51321081  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  51321082 gcctatattgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 51321181  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  51321182 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattga-tttttagtt 51321280  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||    
T  51321281 agtttaggttatgagaattatgatg 51321305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Original strand, 19924927 - 19925320
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||               ||    
T  19924927 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaagtttttta---------------aa 19925011  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19925012 aaaattgagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgc 19925111  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19925112 ctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctc 19925211  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19925212 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagt 19925311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29622327 - 29622105
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  29622327 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 29622228  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622227 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 29622128  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29622127 ctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 49857740 - 49857461
Alignment:
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49857740 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgataattttatcattgcatgtgtagtttatgttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 49857641  T
Q  226 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 325  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||   |     
T  49857640 tgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca---aa 49857544  T
Q  326 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgat 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49857543 aattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgat 49857461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 22524297 - 22524636
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | ||    
T  22524297 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcaaattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttaa-aa 22524395  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||  || |||  | ||||||||||||      
T  22524396 aaattagagtggtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgttgtaatgatgtt-atagattaatgtagttgttat 22524494  T
Q  220 ctatgttgtttaaat----------cataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 309  Q
       |||||||| |||           ||||||||| || |||||| | ||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22524495 aattgttgtttgaatgatttttaagtataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatttga--atgttttatactttgcacacaaagtgtttgat 22524592  T
Q  310 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22524593 aaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 22524636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 11183348 - 11183549
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnna--- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| |       |       
T  11183348 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaattattttaatgattatgttagtttgtttaggtttatttaaaaaaaa 11183447  T
Q  117 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  11183448 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagttgt 11183547  T
Q  217 tg 218  Q
    ||    
T  11183548 tg 11183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  336 attatttagttagtttagttatggaaatgat 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47656356 attatttagttagtttggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2425224 - 2424924
Alignment:
Q  73 atcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttga 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  2425224 atcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaa-aaaaattagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgataatttga 2425126  T
Q  173 tgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaat 262  Q
    |||||||||||||  ||  ||  || |||  |||||||||||||||    |||||||| ||| ||          ||||||| || |||||| | |||||    
T  2425125 tgattgcatgtgttattatgatgtt-atagatgaatgtagttgttgtaattgttgtttgaatgatttttaagtataatgtggtttggaatggagccaaat 2425027  T
Q  263 gaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaa 361  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  2425026 aaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatttatttagtttaggttatggat 2424929  T
Q  362 atgat 366  Q
    |||||    
T  2424928 atgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365739
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2365722 attatttagttagtttag 2365739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156518
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19156501 attatttagttagtttag 19156518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141544
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343525
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731951
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3731968 attatttagttagtttag 3731951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639593
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13639610 attatttagttagtttag 13639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876160
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26876143 attatttagttagtttag 26876160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 11196148 - 11196244
Alignment:
Q  118 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  11196148 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagtt 11196244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97504
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17514383 - 17514267
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | |||| |||||    
T  17514383 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaataaaaattatattg 17514284  T
Q  336 attatttagttagttta 352  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17514283 attatttagttaattta 17514267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38127128 - 38127052
Alignment:
Q  277 tatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38127128 tatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttagttagtttag 38127052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2425589 - 2425528
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2425589 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 2425528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 324  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19526889 - 19526837
Alignment:
Q  389 tgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  19526889 tgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatg 19526837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19524719 - 19524674
Alignment:
Q  389 tgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaat 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19524719 tgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaat 19524674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19524906 - 19524861
Alignment:
Q  389 tgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaat 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19524906 tgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaat 19524861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19525567 - 19525522
Alignment:
Q  389 tgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaat 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19525567 tgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaat 19525522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19526702 - 19526657
Alignment:
Q  389 tgattaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgggaat 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19526702 tgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaat 19526657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 31783619 - 31783587
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacatt 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783619 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacatt 31783587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38127278 - 38127223
Alignment:
Q  128 gtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  38127278 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 38127223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 102
Target Start/End: Original strand, 30890653 - 30890681
Alignment:
Q  74 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890653 tcattttaatgttaatgttaatttgttta 30890681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 441
Target Start/End: Original strand, 31768877 - 31769297
Alignment:
Q  27 aattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnag-aaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||||||    
T  31768877 aattgcaagcaaatagattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttttaaaaatta 31768976  T
Q  126 gagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgc----atgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| |    
T  31768977 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaatcgacaatttgatgattgcttgcatgtgtggtttaggaattgacaaatgaatgtagttgttgctt 31769076  T
Q  222 atgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31769077 atgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaa 31769176  T
Q  322 tgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagttagtt 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31769177 tgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtt 31769276  T
Q  421 taggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  31769277 taggttacgagaattatgatg 31769297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24088687 - 24088263
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  24088687 tttcacgaattgcaagcaaatcaaccgcaaattatcacaaataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 24088588  T
Q  120 aaat--tagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24088587 aaaaaatagagtagtttgcatgtggttagtgttgattttaaaattgacaatttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 24088488  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  24088487 gtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtc 24088388  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24088387 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtatattgattttttagtt 24088288  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||    
T  24088287 agtttaggttatgagaattatgatg 24088263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 118 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6320368 - 6320044
Alignment:
Q  118 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  6320368 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 6320269  T
Q  218 gcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  6320268 gcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcc 6320169  T
Q  318 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtattttgattttttagtt 416  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6320168 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 6320069  T
Q  417 agtttaggttacgggaatgatgatg 441  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  6320068 agtttaggttacgagaattatgatg 6320044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201651
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6201634 attatttagttagtttag 6201651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688618
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11688601 attatttagttagtttag 11688618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301683
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22301666 attatttagttagtttag 22301683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829222
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30829239 attatttagttagtttag 30829222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 352
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601106
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  336 attatttagttagttta 352  Q
    |||||||||||||||||    
T  21601090 attatttagttagttta 21601106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722445
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423514
Alignment:
Q  237 taatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 336  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  337 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26423484 ttatttagttagtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617218
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27617201 attatttagttagtttag 27617218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501686
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  336 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 392
Target Start/End: Original strand, 3380971 - 3381315
Alignment:
Q  47 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 146  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |       | ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3380971 cacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaattttaatgttaatttgtttaggttaagttttttaaaaaaatt-gagtaatttgcatgtggttag 3381069  T
Q  147 ggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggt 246  Q
    | || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| | |    
T  3381070 gttttataagtgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgcattgatgaatgaatatagttgttgcctatgctgtttcaatga--atgtagtt 3381167  T
Q  247 t-------------tgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttat 333  Q
    |             ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||                
T  3381168 tatgtattgataaatgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaa------------ 3381255  T
Q  334 tgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgat 392  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3381256 tgattatttaattagtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttgat 3381315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6320431 - 6320371
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6320431 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatttt 6320371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30424228 - 30424143
Alignment:
Q  129 tagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |   |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30424228 tagtgtgcatgtggttagagtttatgtatgaattgacattttgatgattgcatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagtt 30424143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7921
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  7588 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaa 7687  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7688 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 7787  T
Q  220 ctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  7788 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcctc 7887  T
Q  320 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7888 aatgacaattttattgattttttagttagtttag 7921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 8374 - 8586
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |       | ||    
T  8374 tttcgcgaattgcaagcaaatcaaccacacattatcacaagtaagttgcatcaattattttaatgataatgttagtttgtttaggtttaatttttaa-aa 8472  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8473 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 8572  T
Q  220 ctatgttgtttaaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  8573 ctatgttgtttaaa 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10857
Alignment:
Q  257 gcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttag 10857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40937 - 40746
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgannnnnnnagaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       | ||    
T  40937 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaa 40838  T
Q  120 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  40837 aaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtag 40746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18198 - 18111
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18198 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttg 18111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 54646 - 54733
Alignment:
Q  20 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54646 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttg 54733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18489
Alignment:
Q  237 taatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  337 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4224
Alignment:
Q  236 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 335  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  336 attatttagttagtttag 353  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4241 attattgagttagtttag 4224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 251230 - 251048
Alignment:
Q  168 tttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    || ||||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  251230 tttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgttt-aagaagaatgtggttttgaatggtgtcaaattaaca 251132  T
Q  268 caaattgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc-aatgacaattttattgattatttagttagttt 351  Q
    |||   |||||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  251131 caataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatg-ctcaaatgaaaattgcattgattatttacttagttt 251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 324
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  276 atatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 324  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University